##fileformat=VCFv4.2
##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele fractions of alternate alleles in the tumor">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)">
##FORMAT=<ID=F1R2,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F1R2 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=F2R1,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F2R1 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=PGT,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing haplotype information, describing how the alternate alleles are phased in relation to one another">
##FORMAT=<ID=PID,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing ID information, where each unique ID within a given sample (but not across samples) connects records within a phasing group">
##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for genotypes as defined in the VCF specification">
##FORMAT=<ID=PS,Number=1,Type=Integer,Description="Phasing set (typically the position of the first variant in the set)">
##FORMAT=<ID=SB,Number=4,Type=Integer,Description="Per-sample component statistics which comprise the Fisher's Exact Test to detect strand bias.">
##GATKCommandLine=<ID=Mutect2,CommandLine="Mutect2  --tumor-sample CAN3_R --panel-of-normals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/HPON.vcf --output /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/08_variant_calling/mutect2/CAN3_R.vcf --max-reads-per-alignment-start 500 --activity-profile-out CAN3_R_activity_profile --assembly-region-out CAN3_R_assembly_region --intervals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/seqCap_VCRome_V2_intervals_list.intervals --interval-set-rule UNION --interval-padding 100 --interval-exclusion-padding 0 --interval-merging-rule ALL --input /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/07_BQSR/BQSR/CAN3_R.bam --read-validation-stringency SILENT --reference /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Reference_genome/ucsc.hg19.fasta  --f1r2-median-mq 50 --f1r2-min-bq 20 --f1r2-max-depth 200 --genotype-pon-sites false --genotype-germline-sites false --af-of-alleles-not-in-resource -1.0 --mitochondria-mode false --tumor-lod-to-emit 3.0 --initial-tumor-lod 2.0 --pcr-snv-qual 40 --pcr-indel-qual 40 --max-population-af 0.01 --downsampling-stride 1 --callable-depth 10 --max-suspicious-reads-per-alignment-start 0 --normal-lod 2.2 --ignore-itr-artifacts false --gvcf-lod-band -2.5 --gvcf-lod-band -2.0 --gvcf-lod-band -1.5 --gvcf-lod-band -1.0 --gvcf-lod-band -0.5 --gvcf-lod-band 0.0 --gvcf-lod-band 0.5 --gvcf-lod-band 1.0 --minimum-allele-fraction 0.0 --genotype-filtered-alleles false --disable-adaptive-pruning false --dont-trim-active-regions false --max-disc-ar-extension 25 --max-gga-ar-extension 300 --padding-around-indels 150 --padding-around-snps 20 --kmer-size 10 --kmer-size 25 --dont-increase-kmer-sizes-for-cycles false --allow-non-unique-kmers-in-ref false --num-pruning-samples 1 --min-dangling-branch-length 4 --recover-all-dangling-branches false --max-num-haplotypes-in-population 128 --min-pruning 2 --adaptive-pruning-initial-error-rate 0.001 --pruning-lod-threshold 2.302585092994046 --max-unpruned-variants 100 --debug-assembly false --debug-graph-transformations false --capture-assembly-failure-bam false --error-correct-reads false --kmer-length-for-read-error-correction 25 --min-observations-for-kmer-to-be-solid 20 --likelihood-calculation-engine PairHMM --base-quality-score-threshold 18 --pair-hmm-gap-continuation-penalty 10 --pair-hmm-implementation FASTEST_AVAILABLE --pcr-indel-model CONSERVATIVE --phred-scaled-global-read-mismapping-rate 45 --native-pair-hmm-threads 4 --native-pair-hmm-use-double-precision false --bam-writer-type CALLED_HAPLOTYPES --dont-use-soft-clipped-bases false --min-base-quality-score 10 --smith-waterman JAVA --emit-ref-confidence NONE --max-mnp-distance 1 --min-assembly-region-size 50 --max-assembly-region-size 300 --assembly-region-padding 100 --active-probability-threshold 0.002 --max-prob-propagation-distance 50 --force-active false --seconds-between-progress-updates 10.0 --disable-sequence-dictionary-validation false --create-output-bam-index true --create-output-bam-md5 false --create-output-variant-index true --create-output-variant-md5 false --lenient false --add-output-sam-program-record true --add-output-vcf-command-line true --cloud-prefetch-buffer 40 --cloud-index-prefetch-buffer -1 --disable-bam-index-caching false --sites-only-vcf-output false --help false --version false --showHidden false --verbosity INFO --QUIET false --use-jdk-deflater false --use-jdk-inflater false --gcs-max-retries 20 --gcs-project-for-requester-pays  --disable-tool-default-read-filters false --max-read-length 2147483647 --min-read-length 30 --minimum-mapping-quality 20 --disable-tool-default-annotations false --enable-all-annotations false",Version="4.1.2.0",Date="March 1, 2022 4:34:34 PM CET">
##INFO=<ID=CONTQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to contamination">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth; some reads may have been filtered">
##INFO=<ID=ECNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of events in this haplotype">
##INFO=<ID=GERMQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not germline variants">
##INFO=<ID=MBQ,Number=R,Type=Integer,Description="median base quality">
##INFO=<ID=MFRL,Number=R,Type=Integer,Description="median fragment length">
##INFO=<ID=MMQ,Number=R,Type=Integer,Description="median mapping quality">
##INFO=<ID=MPOS,Number=A,Type=Integer,Description="median distance from end of read">
##INFO=<ID=NALOD,Number=A,Type=Float,Description="Negative log 10 odds of artifact in normal with same allele fraction as tumor">
##INFO=<ID=NCount,Number=1,Type=Integer,Description="Count of N bases in the pileup">
##INFO=<ID=NLOD,Number=A,Type=Float,Description="Normal log 10 likelihood ratio of diploid het or hom alt genotypes">
##INFO=<ID=OCM,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alt reads whose original alignment doesn't match the current contig.">
##INFO=<ID=PON,Number=0,Type=Flag,Description="site found in panel of normals">
##INFO=<ID=POPAF,Number=A,Type=Float,Description="negative log 10 population allele frequencies of alt alleles">
##INFO=<ID=ROQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to read orientation artifact">
##INFO=<ID=RPA,Number=.,Type=Integer,Description="Number of times tandem repeat unit is repeated, for each allele (including reference)">
##INFO=<ID=RU,Number=1,Type=String,Description="Tandem repeat unit (bases)">
##INFO=<ID=SEQQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not sequencing errors">
##INFO=<ID=STR,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is a short tandem repeat">
##INFO=<ID=STRANDQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality of strand bias artifact">
##INFO=<ID=STRQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles in STRs are not polymerase slippage errors">
##INFO=<ID=TLOD,Number=A,Type=Float,Description="Log 10 likelihood ratio score of variant existing versus not existing">
##INFO=<ID=UNIQ_ALT_READ_COUNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of ALT reads with unique start and mate end positions at a variant site">
##MutectVersion=2.2
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##filtering_status=Warning: unfiltered Mutect 2 calls.  Please run FilterMutectCalls to remove false positives.
##source=Mutect2
##tumor_sample=CAN3_R
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	CAN3_R
chr1	566130	.	C	T	.	.	DP=221;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=651.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,210:0.991:211:0,104:1,103:1,0,142,68
chr1	566371	.	A	G	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=420.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,117:0.992:117:0,59:0,55:0,0,10,107
chr1	866319	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr1	866511	.	C	CCCCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,34;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCCT;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,1:0,1:1,0,0,2
chr1	871334	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,2:0,0:0,0,0,4
chr1	876499	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	878314	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,8:0,0,10,8
chr1	880238	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	883625	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,8:0,20:0,0,9,19
chr1	887560	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=147.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,23:0,16:0,0,7,32
chr1	888639	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,57;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=215.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.984:62:0,28:0,32:0,0,29,33
chr1	888659	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=203.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,32:0,24:0,0,23,34
chr1	889158	.	GA	CC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	892196	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:6,0,5,0
chr1	892745	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	899408	.	TG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:15,1:8,2:18,7,3,0
chr1	906682	.	G	GGGGGGGGGGCCCCCCC	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,37;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.151:17:7,2:7,0:5,10,2,0
chr1	906683	.	A	ACCCC,C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=25,21,36;MFRL=148,145,132;MMQ=60,60,60;MPOS=14,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.67,3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,2:0.251,0.147:17:6,0,1:5,2,0:1,10,6,0
chr1	906688	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.218:16:6,1:6,2:0|1:906688_A_C:906688:2,11,3,0
chr1	906694	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.177:20:7,1:9,2:0|1:906688_A_C:906688:4,13,3,0
chr1	906698	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.167:21:8,1:8,1:0|1:906688_A_C:906688:4,14,3,0
chr1	907512	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:14,2:21,1:16,20,3,0
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chr1	908669	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:1,5:5,1:0,7,1,5
chr1	909073	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	909419	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	909527	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	914192	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,9,1
chr1	915633	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,235;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:5,14,0,2
chr1	916590	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:4,2:0,7:0,4,3,7
chr1	948846	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=90.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,5:0,13:0|1:948846_T_TA:948846:0,0,22,0
chr1	948870	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=108.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,8:0,16:0|1:948846_T_TA:948846:0,0,26,2
chr1	949925	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	970549	.	TGGG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=G;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.761:5:1,0:0,3:1,0,4,0
chr1	977330	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr1	977570	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	978603	.	CCT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,0,3
chr1	980460	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,3:0,12:0,0,15,0
chr1	981087	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,10,5
chr1	981601	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:5,1:4,6,0,2
chr1	982941	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=67.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,9:0,0,12,8
chr1	984147	.	CAAAAAAAAAAA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,244;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=22,11;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:984147_CAAAAAAAAAAA_C:984147:0,0,1,0
chr1	984171	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,244;MMQ=60,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:984147_CAAAAAAAAAAA_C:984147:0,0,1,0
chr1	985266	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,2:4,0,4,0
chr1	985446	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:985446_G_T:985446:0,0,2,1
chr1	985449	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:985446_G_T:985446:0,0,2,1
chr1	990380	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:2,2,0,3
chr1	1021415	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:1,4,0,6
chr1	1025672	.	GCA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CA;STR;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:6,0,4,1
chr1	1026801	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.580:15:3,2:3,5:5,1,6,3
chr1	1027007	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1103150	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=243,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.586:8:1,1:2,2:3,0,5,0
chr1	1103284	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:5,8:9,6:5,9,7,7
chr1	1114946	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	1115809	.	AT	CG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.455:4:1,0:1,0:0|1:1115809_AT_CG:1115809:0,2,2,0
chr1	1115815	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.456:4:1,2:1,0:0|1:1115809_AT_CG:1115809:0,2,2,0
chr1	1116304	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:1116304_C_G:1116304:0,2,0,1
chr1	1116305	.	CCCTG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:1116304_C_G:1116304:0,2,0,1
chr1	1117046	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:0,0:1,2,2,0
chr1	1117060	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=161,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:3,1:0|1:1117060_A_C:1117060:4,3,3,0
chr1	1117073	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=162,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:4,0:3,1:0|1:1117060_A_C:1117060:10,3,3,0
chr1	1153990	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=161,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:10,0:11,2:5,18,0,2
chr1	1168255	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	1201709	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,0;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:3,16,2,0
chr1	1221643	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1221643_A_T:1221643:0,1,0,1
chr1	1221647	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,11;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:1221643_A_T:1221643:0,1,0,1
chr1	1225612	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.508:12:3,0:2,3:0|1:1225612_G_A:1225612:5,1,3,3
chr1	1225641	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:3,4:3,5:0|1:1225612_G_A:1225612:2,4,4,5
chr1	1225959	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:2,4:9,4:6,5,4,4
chr1	1226221	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=155,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,1,2
chr1	1226304	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:8,3:3,4:6,5,6,1
chr1	1226348	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:3,7,3,3
chr1	1226423	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,4:4,6:5,1,5,5
chr1	1229680	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,0,12
chr1	1233811	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.276:21:8,2:4,0:8,7,0,6
chr1	1236173	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=181,150;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0,20,0,2
chr1	1238492	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:1,3,1,2
chr1	1243933	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:1243933_GA_G:1243933:0,0,2,0
chr1	1243946	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,17;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1243933_GA_G:1243933:0,0,1,0
chr1	1243948	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,17;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1243933_GA_G:1243933:0,0,1,0
chr1	1243953	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1243933_GA_G:1243933:0,0,1,0
chr1	1243955	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,11;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:1243933_GA_G:1243933:0,0,1,0
chr1	1247578	.	T	TGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=310,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=G;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.705:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr1	1247600	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.497:8:0,0:3,0:0|1:1247600_G_C:1247600:2,2,4,0
chr1	1247604	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.497:8:0,0:4,2:0|1:1247600_G_C:1247600:2,2,4,0
chr1	1247784	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=113,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:3,4:4,2:2,5,2,5
chr1	1254136	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr1	1262819	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1267684	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=19,18;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.484:4:1,0:0,0:2,0,2,0
chr1	1267686	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,0:3,1,2,0
chr1	1268847	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	1273278	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	1275129	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,1:3,1:1,9,0,2
chr1	1276948	.	GTG	ACA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=172,116;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:1276948_GTG_ACA:1276948:4,0,0,1
chr1	1276955	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=157,116;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:1276948_GTG_ACA:1276948:3,0,0,1
chr1	1276956	.	TGAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=121,116;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:1276948_GTG_ACA:1276948:4,0,0,1
chr1	1276964	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=121,116;MMQ=60,59;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:1276948_GTG_ACA:1276948:4,0,0,1
chr1	1276973	.	G	GACAC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AC;STR;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr1	1277987	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,36;MFRL=173,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0|1:1277987_A_C:1277987:2,0,1,0
chr1	1277989	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,12;MFRL=173,238;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:1277987_A_C:1277987:2,0,1,0
chr1	1277993	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=15,12;MFRL=173,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:1277987_A_C:1277987:2,0,1,0
chr1	1278237	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr1	1284490	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	1288583	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,4:0,6:0,0,13,0
chr1	1288823	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	1289367	.	CTG	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=124.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,22,7
chr1	1289911	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr1	1292121	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.121:30:12,0:11,0:0|1:1292121_A_C:1292121:1,26,3,0
chr1	1292127	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.121:30:11,1:16,1:0|1:1292121_A_C:1292121:0,27,3,0
chr1	1293764	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,14,0
chr1	1323078	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr1	1323143	.	CCT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr1	1361530	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,198;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.521:13:0,3:6,2:5,1,5,2
chr1	1374834	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1375810	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0,2,1,2
chr1	1387348	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,159;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.454:27:7,7:6,5:10,5,8,4
chr1	1387667	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=56.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,11:0,0,14,2
chr1	1387726	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.527:21:6,5:3,6:6,4,7,4
chr1	1387891	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,8:8,4:2,12,2,10
chr1	1387920	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:3,7:4,6:0,7,0,13
chr1	1389695	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,165;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:7,0,5,0
chr1	1389886	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,157;MMQ=40,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:2,7,0,2
chr1	1390997	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,170;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,2:5,2:0,12,0,4
chr1	1391304	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=155,142;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.339:13:4,4:3,0:0,9,0,4
chr1	1392413	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:0,1:3,1:4,0,2,0
chr1	1392432	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=211,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:1,2:3,1,3,0
chr1	1392439	.	AT	GC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,2,1
chr1	1392451	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:5,1,3,1
chr1	1394627	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=171,143;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,6:4,4:3,7,2,8
chr1	1403972	.	C	CG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=176,155;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.553:16:5,5:1,3:4,3,6,3
chr1	1407165	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	1407372	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,180;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,0,3
chr1	1413925	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=183,175;MMQ=60,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:0|1:1413925_C_T:1413925:9,2,0,3
chr1	1413948	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=192,182;MMQ=59,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.194:17:3,0:10,2:0|1:1413925_C_T:1413925:10,4,0,3
chr1	1417696	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	1417782	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=216,239;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,3:5,0:3,4,1,2
chr1	1420569	.	GCCCTC	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,184;MMQ=40,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.502:18:3,5:5,4:1,8,2,7
chr1	1421916	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,195;MMQ=40,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:15,2:14,1:11,18,2,1
chr1	1424695	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:0,12,0,9
chr1	1448100	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=164,172;MMQ=39,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.453:14:4,3:1,3:2,6,0,6
chr1	1451489	.	TG	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=15,36;MFRL=169,176;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:1,2:0,5:0,8,0,7
chr1	1452703	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=173,254;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,1:8,1:0,20,0,2
chr1	1452738	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=180,183;MMQ=34,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,0:3,3:0,10,0,3
chr1	1454412	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,142;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:14,5:9,4:0,23,1,8
chr1	1455503	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,197;MMQ=51,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:2,3:4,1:7,0,4,0
chr1	1458032	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr1	1458285	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=160,176;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:3,2:1,4:1,4,1,5
chr1	1459582	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=212,152;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.546:16:5,1:2,6:6,1,8,1
chr1	1463318	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,2:4,4:0|1:1463318_C_A:1463318:0,8,0,6
chr1	1463337	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:1463318_C_A:1463318:0,5,0,2
chr1	1469263	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=124,178;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:3,1,3,0
chr1	1469289	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=152,178;MMQ=52,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:4,1,5,0
chr1	1469546	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	1509825	.	A	G	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=254.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,35:0,40:0,0,45,33
chr1	1510035	.	GGC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr1	1560103	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	1562437	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr1	1563168	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	1574019	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,198;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:9,7:14,3:0,23,0,10
chr1	1575616	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	1575836	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,127;MMQ=27,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:8,5:9,0:0,17,2,3
chr1	1599940	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=166,168;MMQ=52,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:7,2:15,1:5,18,1,2
chr1	1599974	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=187,170;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:7,3:12,4:0,19,0,7
chr1	1607686	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	1607726	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=163,180;MMQ=27,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,4:4,0:2,7,0,4
chr1	1635619	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.456:35:14,8:5,7:14,5,12,4
chr1	1636274	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=187,173;MMQ=27,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,5:2,4:6,1,8,1
chr1	1639046	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=163,175;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:3,10,0,3
chr1	1639801	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=194,210;MMQ=57,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,0:3,3:0,11,0,3
chr1	1647729	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,25;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:11,0,2,0
chr1	1647745	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=27,29;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:4,2:8,2:0|1:1647745_G_A:1647745:12,0,5,0
chr1	1647753	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:4,3:7,2:0|1:1647745_G_A:1647745:11,1,5,0
chr1	1647778	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:11,4:8,4:12,8,8,0
chr1	1647814	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,14:0.283:51:23,7:14,7:18,19,11,3
chr1	1647871	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=7;MBQ=29,34;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,18:0.365:50:17,3:12,14:12,20,7,11
chr1	1647893	.	C	CTTTCTT	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTCTT;STR;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.348:38:14,4:11,8:10,15,5,8
chr1	1647968	.	C	CAT	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:6,6:2,4:0|1:1647968_C_CAT:1647968:1,7,2,8
chr1	1647971	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:7,5:2,4:0|1:1647968_C_CAT:1647968:1,8,2,7
chr1	1647983	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=169,160;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,3:3,1:0|1:1647983_T_A:1647983:1,9,0,4
chr1	1647990	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=169,160;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:9,3:3,1:0|1:1647983_T_A:1647983:1,11,0,4
chr1	1648002	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=169,167;MMQ=40,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,2:3,0:1,8,0,2
chr1	1648018	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=169,162;MMQ=40,38;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr1	1650920	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,19:0.488:39:11,10:9,8:0|1:1650920_G_A:1650920:3,17,2,17
chr1	1650938	.	CGG	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,13:0.500:26:5,8:6,4:0|1:1650920_G_A:1650920:2,11,0,13
chr1	1650942	.	A	AAG	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.519:25:5,7:5,4:0|1:1650920_G_A:1650920:2,10,0,13
chr1	1650960	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:5,5:6,5:0|1:1650920_G_A:1650920:1,10,0,10
chr1	1650967	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:4,5:4,5:0|1:1650920_G_A:1650920:1,7,0,10
chr1	1653004	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=130,142;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:3,2,2,1
chr1	1653028	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=170,170;MMQ=52,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,5:5,4:3,7,5,4
chr1	1653885	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,6:7,3:12,0,9,0
chr1	1654038	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=140,166;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.095:61:25,4:31,1:33,23,4,1
chr1	1654058	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=142,160;MMQ=40,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,6:0.115:59:24,5:27,1:0|1:1654058_C_T:1654058:27,26,5,1
chr1	1654064	.	A	T	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=140,160;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,6:0.117:58:23,5:26,1:0|1:1654058_C_T:1654058:26,26,5,1
chr1	1654065	.	AGCG	A	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=137,160;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,6:0.119:57:22,5:26,1:0|1:1654058_C_T:1654058:26,25,5,1
chr1	1663831	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=95.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,19:0,12:0,0,29,3
chr1	1664019	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,1,17
chr1	1666333	.	A	ATAGTATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=171,192;MMQ=33,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1666333_A_ATAGTATT:1666333:1,2,0,1
chr1	1666334	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=171,192;MMQ=33,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1666333_A_ATAGTATT:1666333:1,2,0,1
chr1	1666337	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=171,192;MMQ=33,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:1666333_A_ATAGTATT:1666333:1,2,0,1
chr1	1669734	.	G	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=190.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,27:0,35:0,0,54,10
chr1	1670570	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr1	1684347	.	CCCT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CCT;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:12,0:1,1:11,4,2,0
chr1	1686943	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:1686943_T_C:1686943:0,0,0,6
chr1	1686962	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:1686943_T_C:1686943:0,0,0,4
chr1	1687625	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr1	1688192	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	1688469	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,10:0,7:0,0,17,0
chr1	1688513	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=123.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,19:0,19:0,0,29,11
chr1	1689762	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=112,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=142.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,42:0.956:43:1,20:0,21:0,1,30,12
chr1	1696659	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,14:0,15:0,0,28,2
chr1	1858232	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,12;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.302:14:3,0:4,0:4,6,0,4
chr1	1858413	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=176,110;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:24,0:7,2:0|1:1858413_C_T:1858413:11,20,0,2
chr1	1858416	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=176,110;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:22,0:7,1:0|1:1858413_C_T:1858413:11,20,0,2
chr1	1890704	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,1:0,3,0,3
chr1	1895343	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.309:7:4,1:1,0:1,4,0,2
chr1	1900186	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,16:0,0,4,24
chr1	1900359	.	TAG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1900359_TAG_T:1900359:0,0,0,1
chr1	1900364	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1900359_TAG_T:1900359:0,0,0,1
chr1	1902023	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,5:1,0:2,0,5,0
chr1	1903357	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	1918488	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=126,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	1920434	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=9,32;MFRL=121,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.676:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr1	1922303	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,14:0,0,17,6
chr1	1991014	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.396:31:8,5:10,7:9,10,9,3
chr1	1991020	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:16,0:12,3:15,15,2,1
chr1	1991123	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,5:5,2:0,7,0,7
chr1	2005805	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=197,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	2075560	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0|1:2075560_T_G:2075560:0,0,14,0
chr1	2075570	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0|1:2075560_T_G:2075560:0,0,17,0
chr1	2077409	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	2082458	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:0,3:0,1,0,8
chr1	2082489	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	2106837	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=142,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0|1:2106837_T_C:2106837:0,3,0,1
chr1	2106839	.	TTCA	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=142,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:2106837_T_C:2106837:0,3,0,1
chr1	2106840	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.774:2:0,2:0,0:1|0:2106837_T_C:2106837:0,0,0,2
chr1	2106843	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:2106837_T_C:2106837:0,2,0,1
chr1	2106854	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,1:0,0:1|0:2106837_T_C:2106837:0,0,0,1
chr1	2118539	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=132.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,20:0,0,34,3
chr1	2121118	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,9:0,0,21,2
chr1	2286947	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,5:7,7:3,11,8,4
chr1	2328714	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=125.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,18:0,0,2,33
chr1	2332391	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:11,10:7,6:7,11,5,11
chr1	2338126	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.555:21:5,3:4,6:5,4,4,8
chr1	2409892	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr1	2411451	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr1	2418935	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	2420590	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	2420913	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	2422614	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,7,2
chr1	2426863	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=158,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.462:15:2,0:1,2:8,0,7,0
chr1	2428874	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	2430131	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,12;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.189:17:9,0:4,1:13,1,0,3
chr1	2443206	.	C	CACCTTGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2443206_C_CACCTTGGA:2443206:0,1,0,1
chr1	2443209	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2443206_C_CACCTTGGA:2443206:0,1,0,1
chr1	2446982	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:6,2:6,0:11,1,2,0
chr1	2492935	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.067:58:20,1:32,2:21,34,0,3
chr1	2522392	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,3:1,4:3,0,7,0
chr1	2523569	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=215,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	2528133	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	2529650	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,3:9,0:11,6,0,3
chr1	2535524	.	C	CTTGAACTCCTGGGCTCCAGTG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=117,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr1	2535554	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,10;MFRL=102,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:2535554_T_G:2535554:0,1,2,0
chr1	2535558	.	C	CGCGGG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=20,28;MFRL=102,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:2535554_T_G:2535554:0,1,2,0
chr1	2535561	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,13;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:2535554_T_G:2535554:1,1,2,0
chr1	2535566	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=21,16;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:0|1:2535554_T_G:2535554:1,1,2,0
chr1	2535570	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,36;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0|1:2535554_T_G:2535554:1,1,1,0
chr1	2541203	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,5:4,2:3,3,3,5
chr1	2939409	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=108,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.677:26:5,7:3,10:5,3,10,8
chr1	3329384	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr1	3334474	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,13:0.255:44:13,2:11,0:3,28,13,0
chr1	3334479	.	CACCA	C	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,14:0.182:76:17,4:16,5:9,53,14,0
chr1	3383665	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	3385330	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr1	3391408	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=181,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,0:11,3:0,23,0,3
chr1	3394640	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	3394674	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	3395229	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	3397188	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	3407007	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr1	3418565	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	3425093	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.258:24:4,1:7,0:14,4,6,0
chr1	3440647	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:1,9:1,6:2,0,14,2
chr1	3477414	.	GGGCT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCT;STR;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr1	3496328	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=71.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,18,2
chr1	3518944	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr1	3545175	.	GTTCTGGGAGCTCCTCCCCC	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCTGGGAGCTCCTCCCCC;STR;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.513:18:4,4:2,5:0,9,0,9
chr1	3563428	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=223,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.707:11:1,1:1,6:0,3,1,7
chr1	3566625	.	AGCAGGCTG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=195,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.401:23:7,5:7,4:0,14,0,9
chr1	3598900	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:0|1:3598900_G_A:3598900:3,3,7,1
chr1	3598910	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:4,3:2,6:0|1:3598900_G_A:3598900:3,3,8,2
chr1	3640134	.	TCTGC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	3644349	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=201,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	3645835	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=136,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:3645835_C_A:3645835:1,1,1,0
chr1	3645844	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:3645835_C_A:3645835:2,1,2,0
chr1	3647962	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	3673477	.	T	TG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.144:25:12,0:8,0:0|1:3673477_T_TG:3673477:5,17,3,0
chr1	3673489	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=175,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,1:6,1:0|1:3673477_T_TG:3673477:3,16,2,0
chr1	3673492	.	C	CACAAAAAG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=175,137;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.146:18:10,1:6,1:0|1:3673477_T_TG:3673477:0,16,2,0
chr1	3679139	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr1	3732782	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=199,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:7,1,4,0
chr1	3742434	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:1,9,2,0
chr1	3743109	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:8,2,4,0
chr1	3743391	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=179,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,7:3,2:0,8,3,6
chr1	3743433	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,2:3,1:0,6,0,4
chr1	3745787	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=134,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:3,1,4,0
chr1	3745924	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=131,97;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.553:27:4,6:7,8:5,7,1,14
chr1	3746254	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3746583	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=197,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:6,3:4,3:0|1:3746583_G_T:3746583:1,9,2,5
chr1	3746589	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=197,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:5,5:3,3:0|1:3746583_G_T:3746583:1,8,2,6
chr1	3747580	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,4:3,5:7,1,9,0
chr1	3747603	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:4,8:4,6:7,1,11,4
chr1	3756120	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,5:5,0:5,0,5,0
chr1	3765095	.	C	CAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,188;MMQ=46,50;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=A;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	3775454	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=261,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.385:8:5,2:0,1:0,5,1,2
chr1	3806643	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=182,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:5,8:8,4:3,10,1,11
chr1	3809423	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,24:0.424:57:17,13:16,11:26,7,20,4
chr1	4772582	.	GCCA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CCA;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:3,3,1,1
chr1	4829835	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,1:1,3:3,0,3,1
chr1	4834420	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,4:2,5:6,0,8,1
chr1	5925371	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5925371_G_A:5925371:0,0,0,1
chr1	5925378	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5925371_G_A:5925371:0,0,0,1
chr1	5925382	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5925371_G_A:5925371:0,0,0,1
chr1	5926507	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,28:0.731:38:4,9:5,19:6,4,10,18
chr1	5927031	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:3,2:0,4:3,0,6,1
chr1	5927738	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	5934490	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	5934837	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr1	5935162	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	5937091	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=111,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=168.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,47:0.962:48:0,23:1,23:1,0,42,5
chr1	5937391	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=104.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,22:0,10:0,0,6,27
chr1	5947308	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,6:5,4:8,1,7,3
chr1	5987696	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:3,7:2,4:5,0,11,1
chr1	5993309	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.101:37:15,0:18,3:0|1:5993309_A_G:5993309:15,19,0,3
chr1	5993315	.	C	CTGGTGACTTA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,37;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.102:37:16,0:16,3:0|1:5993309_A_G:5993309:15,19,0,3
chr1	5993317	.	G	GTGTGCTC	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:17,0:16,1:0|1:5993309_A_G:5993309:15,20,0,3
chr1	6027252	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:1,3:4,0:5,0,4,0
chr1	6029086	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,0:0,2:0,1,2,1
chr1	6046432	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=204,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:5,3:4,5:0,9,0,9
chr1	6145350	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:8,1:18,1:10,16,0,2
chr1	6145365	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,5:8,7:5,9,2,10
chr1	6148955	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr1	6155332	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:3,4:2,3:4,1,7,1
chr1	6157282	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=90,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr1	6157434	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=90,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr1	6170424	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=64,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:4,2:0,0:3,1,2,0
chr1	6171992	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=178,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:1,6,0,7
chr1	6184192	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,6:2,1:0,5,2,5
chr1	6185532	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.529:13:2,3:4,4:6,0,7,0
chr1	6188044	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=174,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr1	6188546	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:1,0:4,3:3,3,0,3
chr1	6195493	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,3:4,0:1,5,2,1
chr1	6195548	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=197,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:0,6,1,4
chr1	6196493	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=288,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	6196517	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,3:2,2:3,0,4,2
chr1	6204266	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=205,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	6206648	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.817:9:0,4:1,3:1,0,8,0
chr1	6228407	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=183,178;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:0,6,0,3
chr1	6246836	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,172;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.533:43:13,12:7,11:12,8,16,7
chr1	6253081	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=194,163;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:2,1:7,1:1,8,1,1
chr1	6257856	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,2:2,0:0,5,1,1
chr1	6257885	.	C	CTTGTTAAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=142,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	6270539	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,35;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6270539_G_GT:6270539:0,1,0,1
chr1	6270540	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,36;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6270539_G_GT:6270539:0,1,0,1
chr1	6270542	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,35;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6270539_G_GT:6270539:0,1,0,1
chr1	6270543	.	C	CTCCACTCATTAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,35;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6270539_G_GT:6270539:0,1,0,1
chr1	6270549	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,27;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6270539_G_GT:6270539:0,1,0,1
chr1	6270551	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,0:1,1:0|1:6270539_G_GT:6270539:0,1,0,1
chr1	6272137	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=184,223;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,2:7,1:1,10,1,2
chr1	6273330	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=188,156;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:10,1:0,18,0,2
chr1	6291918	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.445:13:5,1:2,4:6,1,5,1
chr1	6453520	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	6505818	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=166,147;MMQ=52,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.247:17:8,1:5,0:0|1:6505818_A_C:6505818:0,13,4,0
chr1	6505824	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=171,155;MMQ=52,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,1:0|1:6505818_A_C:6505818:0,14,2,0
chr1	6526093	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.289:12:3,2:5,1:3,6,2,1
chr1	6526249	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	6529182	.	TTCC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TCC;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr1	6530965	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,2:0,0,1,4
chr1	6535492	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:11,7,0,2
chr1	6579607	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr1	6586070	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,14:0,6:0,0,5,15
chr1	6591937	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	6602061	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:6602061_G_GAA:6602061:0,2,0,1
chr1	6602062	.	T	TGGGAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:6602061_G_GAA:6602061:0,2,0,1
chr1	6609559	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	6609851	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	6610366	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	6610382	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	6610743	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,209;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	6614391	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,2,8
chr1	6614415	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,2,4
chr1	6615690	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,0,4
chr1	6615695	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,0,4
chr1	6631319	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr1	6631352	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr1	6634847	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.116:23:11,1:10,1:9,12,1,1
chr1	6636461	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:2,2,4,1
chr1	6655444	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.323:19:8,2:5,3:9,4,3,3
chr1	6662676	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.748:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	6679848	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:7,7:10,9:13,4,8,8
chr1	6681375	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:3,0,7,0
chr1	6681744	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=177,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:1,5:4,6:0,5,0,12
chr1	6685442	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr1	6694513	.	GA	TT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=200,241;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:3,0,7,0
chr1	6694927	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=229,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr1	6695802	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:4,7:15,7:3,16,3,11
chr1	6700129	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=131,88;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.280:8:4,0:2,2:0|1:6700129_T_A:6700129:3,3,1,1
chr1	6700139	.	A	AGTTAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr1	6700152	.	C	CTCCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=174,88;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:6700129_T_A:6700129:0,4,0,1
chr1	6741127	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=203,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,2:1,4:0,3,1,5
chr1	6845577	.	CGAG	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAG;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:13,3:27,0:23,19,3,0
chr1	7151479	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr1	7527824	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.563:18:3,7:3,3:7,1,9,1
chr1	7527996	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.580:24:4,7:5,6:1,9,1,13
chr1	7737799	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:0,7,0,3
chr1	7807897	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	7811215	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,13:0,0,24,3
chr1	7845695	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:4,5:10,5:0,14,0,10
chr1	7861153	.	C	CT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.424:38:11,8:11,5:21,1,14,2
chr1	7861304	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,33:0.596:55:11,19:11,14:1,21,4,29
chr1	7861345	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:14,9:8,6:0,22,0,15
chr1	7863051	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=206,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.358:15:3,4:5,1:10,0,5,0
chr1	7869915	.	G	C	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=264.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.987:75:0,26:0,48:0,0,59,16
chr1	7870144	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=177.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,26:0,22:0,0,2,46
chr1	7880469	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=191,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,5:2,2:6,1,6,1
chr1	7887103	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,6:2,7:6,0,13,0
chr1	7889804	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,132;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	7890264	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:1,4,0,7
chr1	7907805	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:3,2:6,3,5,0
chr1	7907971	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:3,3:3,2:3,3,1,4
chr1	7997726	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:9,2:5,3:11,3,6,0
chr1	7998963	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	8029494	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.875:14:1,4:0,3:0|1:8029494_T_G:8029494:0,1,1,12
chr1	8029509	.	GG	AA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=12,26;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.840:10:0,4:0,5:0|1:8029494_T_G:8029494:0,1,1,8
chr1	8037898	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=168,180;MMQ=60,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:8037898_CA_TG:8037898:0,3,0,1
chr1	8037900	.	A	ACCTCCGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=168,180;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:8037898_CA_TG:8037898:0,3,0,1
chr1	8073929	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,25:0.565:44:8,11:11,14:5,14,6,19
chr1	8384268	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	8390246	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:2,5:7,4:9,0,10,0
chr1	8390495	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.475:11:0,3:4,2:2,4,1,4
chr1	8395441	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	8399585	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,0:8,2:19,5,2,0
chr1	8403713	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	8404093	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,6:2,1:2,3,0,7
chr1	8404169	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	8418219	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=223,245;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	8420770	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8420770_T_C:8420770:0,1,0,1
chr1	8420772	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8420770_T_C:8420770:0,1,0,1
chr1	8420774	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:8420770_T_C:8420770:0,1,0,1
chr1	8421990	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr1	8422676	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,2:1,5:6,0,7,0
chr1	8526142	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,4:0,7:0,0,0,13
chr1	8601207	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=137,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:8,0,3,0
chr1	8926285	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,0:2,2:4,0,2,0
chr1	8926329	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=185,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.412:7:2,0:2,1:3,1,1,2
chr1	8930561	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:4,9,1,1
chr1	9006104	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=195,139;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:0|1:9006104_T_TC:9006104:0,1,0,2
chr1	9006115	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=176,130;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:9006104_T_TC:9006104:0,2,0,1
chr1	9006121	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=176,130;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:9006104_T_TC:9006104:0,2,0,1
chr1	9009547	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=202,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:4,2:5,2:0,9,2,2
chr1	9034598	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	9034815	.	C	CAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	9063265	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	9063602	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,4,7
chr1	9063646	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,2:3,2:0,7,0,4
chr1	9074932	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=238,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,2:1,2:0,2,1,4
chr1	9075369	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=227,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	9188668	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.348:12:2,2:5,1:7,1,3,1
chr1	9416029	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:23,0:14,4:9,29,0,4
chr1	9633387	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.375:11:5,3:2,0:7,0,4,0
chr1	9658465	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,18,5
chr1	9658707	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr1	9661061	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	9770690	.	CAG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.505:10:3,5:2,0:1,4,1,4
chr1	9781412	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:1,3,0,3
chr1	9782556	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:5,3:3,1:5,3,3,2
chr1	9783405	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:8,5:5,4:0,13,0,9
chr1	9797485	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,1:13,1:25,1,2,0
chr1	9797719	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=190,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:3,0:7,2:0,12,0,2
chr1	9816620	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,5:5,0:2,6,3,2
chr1	9931404	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=185,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:9931404_G_C:9931404:0,3,0,1
chr1	9931406	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=185,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:9931404_G_C:9931404:0,3,0,1
chr1	9932090	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.503:36:10,10:7,8:11,7,11,7
chr1	10041298	.	AT	A,TT	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=25,27,28;MFRL=162,169,137;MMQ=60,60,48;MPOS=23,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.62,3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,2:0.279,0.115:16:7,2,2:1,1,0:5,5,1,5
chr1	10041453	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10041453_T_C:10041453:0,0,0,1
chr1	10041455	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10041453_T_C:10041453:0,0,0,1
chr1	10041459	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10041453_T_C:10041453:0,0,0,1
chr1	10041462	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10041453_T_C:10041453:0,0,0,1
chr1	10042552	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:7,4,1,1
chr1	10057208	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10057208_A_C:10057208:0,0,1,0
chr1	10057211	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10057208_A_C:10057208:0,0,1,0
chr1	10057221	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10057208_A_C:10057208:0,0,1,0
chr1	10067790	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=137,144;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:32,0:21,3:36,19,0,3
chr1	10067870	.	CA	TG	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=135,154;MMQ=60,38;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.104:26:12,1:12,1:0|1:10067870_CA_TG:10067870:2,22,0,2
chr1	10067873	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=135,154;MMQ=60,38;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.104:26:11,1:11,1:0|1:10067870_CA_TG:10067870:2,22,0,2
chr1	10067883	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=161,154;MMQ=60,38;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.097:28:13,1:11,1:0|1:10067870_CA_TG:10067870:0,26,0,2
chr1	10327366	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=195,177;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,1:11,1:15,0,2,0
chr1	10338204	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:9,8:9,5:3,15,1,12
chr1	10342352	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.391:16:4,1:5,5:8,2,3,3
chr1	10342629	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,3:3,2:0,6,0,5
chr1	10357206	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,28,31,30;MFRL=174,162,184,172;MMQ=60,60,60,60;MPOS=7,13,7;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,15,16,18;RU=T;STR;TLOD=7.93,10.29,10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,5,6,7:0.170,0.208,0.252:29:5,1,2,1:6,3,3,5:7,4,12,6
chr1	10399944	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=56.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:7,7:15,12:5,17,4,15
chr1	10408837	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=16,25;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:2,2:0,0:1,7,1,2
chr1	10408887	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=188,179;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:8,2:1,0:0,9,0,2
chr1	10412636	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr1	10425117	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr1	10431132	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,7:1,1:2,0,8,0
chr1	10435147	.	C	CCA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,1:4,1:0|1:10435147_C_CCA:10435147:6,11,0,2
chr1	10435148	.	T	TGGGTCTACATA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,1:5,1:0|1:10435147_C_CCA:10435147:6,11,0,2
chr1	10435441	.	TTTG	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=188,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTG;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.152:17:4,0:8,2:4,11,0,2
chr1	10479635	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:6,7:6,7:9,3,8,6
chr1	10502307	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr1	10523728	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=265,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	10529194	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:9,9:7,3:10,6,8,4
chr1	10555257	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,10:0,16:0,0,23,3
chr1	10596388	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=189.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.981:52:0,23:0,29:0,0,9,43
chr1	10699666	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:2,8,0,2
chr1	10702814	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	10713645	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:3,7,0,2
chr1	10714436	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,3:8,1:11,1,3,1
chr1	11008811	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:7,1:11,5,1,1
chr1	11009829	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=171,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,2:13,0:9,18,0,2
chr1	11080723	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	11095039	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	11105106	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=125.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,11:0,18:0|1:11105106_C_T:11105106:0,0,4,26
chr1	11105122	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=121.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.969:29:0,10:0,15:0|1:11105106_C_T:11105106:0,0,4,25
chr1	11128001	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.926:11:0,4:0,5:0,0,10,1
chr1	11128654	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr1	11129848	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	11132320	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11133956	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=181,139;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.796:9:0,4:2,3:2,0,2,5
chr1	11134157	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chr1	11137102	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr1	11137778	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,2:0,0,1,9
chr1	11139720	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=156,237;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,1:11,1:0|1:11139720_A_G:11139720:16,1,2,0
chr1	11139726	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=153,237;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:0|1:11139720_A_G:11139720:16,3,2,0
chr1	11140620	.	AACACAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,50;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=AC;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.825:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	11177249	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=175,166;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:0,9,0,2
chr1	11187893	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,1,9
chr1	11252447	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=166,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:11252447_T_A:11252447:4,4,1,1
chr1	11252455	.	C	CTCCTGAATCCAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:11252447_T_A:11252447:2,4,1,1
chr1	11276392	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=177,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0,5,0,2
chr1	11288633	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	11292666	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	11317320	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	11562878	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:10,0:16,2:12,16,0,2
chr1	11575375	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:9,7:6,4:10,5,10,1
chr1	11579362	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,14;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.416:5:0,0:1,0:3,0,2,0
chr1	11579367	.	AC	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=13,18;MFRL=162,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:0,0:4,0,1,0
chr1	11594400	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.356:20:5,0:8,6:10,3,6,1
chr1	11595038	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=206,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	11595203	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=206,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr1	11708736	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.407:32:9,3:10,9:14,5,7,6
chr1	11709052	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	11709119	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=22,13;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:1,0:2,0:0|1:11709119_T_A:11709119:5,1,2,0
chr1	11709122	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=11,18;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:0,1:1,0:0|1:11709119_T_A:11709119:5,1,2,0
chr1	11718560	.	AG	CC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:4,0:6,1:0|1:11718560_AG_CC:11718560:10,3,3,0
chr1	11718566	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:3,1:8,1:0|1:11718560_AG_CC:11718560:10,3,3,0
chr1	11718570	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=15,27;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:1,1:5,1:0|1:11718560_AG_CC:11718560:11,3,3,0
chr1	11718575	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=21,29;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:2,0:7,1:0|1:11718560_AG_CC:11718560:10,3,2,0
chr1	11718737	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.534:15:3,4:1,2:2,5,4,4
chr1	11731927	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=208,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:1,3:2,1:3,0,3,1
chr1	11735652	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.533:20:3,3:6,5:8,1,9,2
chr1	11735877	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=236,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,3:6,4:1,6,4,3
chr1	11737051	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr1	11740358	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr1	11766539	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,1:9,1:1,16,0,2
chr1	11779762	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,20:0.453:43:14,8:9,7:5,18,2,18
chr1	11796168	.	CGGGCG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCG;STR;TLOD=69.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,16,0
chr1	11807426	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,12,1
chr1	11808706	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	11832100	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:5,1:2,3:7,0,5,0
chr1	11832311	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,30:0.517:58:19,15:9,15:12,16,16,14
chr1	11836441	.	TG	CA,CG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35,33;MFRL=0,174,177;MMQ=60,60,60;MPOS=13,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.63,11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,3:0.500,0.400:7:0,3,2:0,1,1:0,0,7,0
chr1	11836450	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr1	11838646	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.632:14:3,4:1,4:5,0,9,0
chr1	11839157	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=183,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,5:5,3:0,7,2,6
chr1	11839850	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.522:19:4,4:5,6:6,3,2,8
chr1	11842144	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=181,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,5:3,1:3,0,6,0
chr1	11844214	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.580:31:6,7:6,11:6,7,9,9
chr1	11845169	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	11848139	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,3:4,4:4,2,1,6
chr1	11848879	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,8:0,0,1,10
chr1	11851003	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=192,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,5:5,4:0,10,0,10
chr1	11852300	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.302:21:7,2:8,4:12,3,5,1
chr1	11854153	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:11854153_G_A:11854153:0,3,0,1
chr1	11854158	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,22;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:11854153_G_A:11854153:0,3,0,1
chr1	11854217	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11854217_A_C:11854217:0,0,0,1
chr1	11854222	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11854217_A_C:11854217:0,0,0,1
chr1	11854671	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,6:2,1:2,2,5,2
chr1	11854755	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.535:26:4,6:8,8:9,3,10,4
chr1	11854938	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=185,115;MMQ=60,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,0:11,2:0,18,0,2
chr1	11860458	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=191,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:1,4,1,2
chr1	11879685	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:0,9,0,9
chr1	11886124	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=199,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.464:4:1,1:1,0:2,0,2,0
chr1	11888073	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,4:1,4:7,0,8,0
chr1	11897592	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,5:4,5:0,8,2,9
chr1	11982544	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,5:3,6:8,0,10,1
chr1	11983206	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=176,159;MMQ=60,27;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.414:44:16,7:9,11:9,17,8,10
chr1	12014921	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.060:63:30,1:29,2:31,29,1,2
chr1	12017980	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=160,81726603;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:12,1:10,1:6,17,0,2
chr1	12027204	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.799:18:1,6:2,7:0,3,0,15
chr1	12033113	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=184,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr1	12033120	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:1,4,0,2
chr1	12057541	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=176,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	12062205	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:7,9:3,7:0,10,0,16
chr1	12066799	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.803:3:0,0:0,1:0,0,0,3
chr1	12067044	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:8,2:3,1:11,0,4,0
chr1	12067157	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:7,11:12,5:9,10,10,6
chr1	12071680	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,3:6,4:0,10,0,7
chr1	12082538	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:0,8,0,6
chr1	12090032	.	GC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,2:7,0:15,0,2,0
chr1	12175818	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:7,5:2,1:1,9,0,7
chr1	12183245	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:2,1,8,0
chr1	12248942	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,7:1,3:0,2,3,8
chr1	12248965	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,1:1,4,1,6
chr1	12262298	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	12337114	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,3:6,5:6,6,3,5
chr1	12348380	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:2,7:9,6:0,11,2,11
chr1	12368705	.	GT	G,GTT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,35,29;MFRL=179,149,152;MMQ=60,60,60;MPOS=30,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.68,5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.297,0.306:10:2,0,2:0,2,0:2,2,1,5
chr1	12368796	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=177,158;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:12368796_T_TC:12368796:0,2,0,1
chr1	12368799	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=177,158;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12368796_T_TC:12368796:0,2,0,1
chr1	12416653	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=221,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr1	12418700	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,1,19
chr1	12460324	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:8,1:5,5:9,5,4,2
chr1	12463940	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:30,2:31,1:38,23,3,0
chr1	12516284	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=195,211;MMQ=60,44;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.260:6:1,0:4,1:0,5,0,1
chr1	12567232	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr1	12639018	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr1	12776218	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=59.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,17,0
chr1	12776344	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=113,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:10,7:6,9:8,8,10,6
chr1	12785093	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	12837634	.	T	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=159.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,29:0,21:0,0,27,23
chr1	12837840	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr1	12853750	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=258,196;MMQ=40,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr1	12854068	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=194,193;MMQ=25,23;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.169:25:9,1:11,2:21,0,3,1
chr1	12854090	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=169,186;MMQ=25,24;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,17:0.327:53:16,7:15,9:29,7,13,4
chr1	12854930	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,175;MMQ=32,32;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,2,2
chr1	12856146	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=157,169;MMQ=24,26;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:17,3:12,3:1,28,0,6
chr1	12856153	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=171,162;MMQ=27,26;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:5,12:4,6:0,9,0,18
chr1	12856174	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=173,193;MMQ=27,39;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:11,2:6,3:0,17,1,4
chr1	12907169	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=193,192;MMQ=40,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:6,0,2,0
chr1	12907199	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=179,170;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,6:3,1:10,0,7,0
chr1	12907212	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=175,170;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,6:3,1:11,0,7,0
chr1	12907282	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=151,158;MMQ=51,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:16,6:10,0:0|1:12907282_G_C:12907282:18,9,1,5
chr1	12907284	.	TG	CC	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=151,158;MMQ=51,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:14,6:9,0:0|1:12907282_G_C:12907282:18,9,1,5
chr1	12907316	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=148,174;MMQ=59,30;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:16,3:12,0:14,18,0,3
chr1	12907777	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=155,172;MMQ=52,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,14:0.259:56:17,4:24,8:0|1:12907777_T_C:12907777:27,15,14,0
chr1	12907781	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=153,172;MMQ=52,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,14:0.239:61:17,4:26,9:0|1:12907777_T_C:12907777:29,18,14,0
chr1	12907798	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=165,162;MMQ=52,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=84.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,23:0.364:64:17,11:17,9:0|1:12907777_T_C:12907777:25,16,21,2
chr1	12907800	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=152,180;MMQ=52,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,7:0.117:66:25,4:30,3:40,19,6,1
chr1	12907802	.	CC	TT	.	.	DP=76;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=163,165;MMQ=52,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,25:0.356:71:18,11:24,11:0|1:12907777_T_C:12907777:27,19,23,2
chr1	12907837	.	C	T	.	.	DP=97;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=153,150;MMQ=51,33;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,35:0.369:95:29,17:31,17:32,28,28,7
chr1	12908236	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=176,165;MMQ=40,33;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:0|1:12908236_G_T:12908236:4,7,3,4
chr1	12908243	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=172,217;MMQ=45,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,5:3,1:0|1:12908236_G_T:12908236:3,4,2,5
chr1	12908278	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=199,147;MMQ=40,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:9,2:2,0:3,8,1,1
chr1	12908333	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=197,245;MMQ=57,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:0,4,0,9
chr1	12921642	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,156;MMQ=27,26;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:10,3:9,3:3,16,6,0
chr1	12921716	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=189,184;MMQ=24,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.464:20:5,5:6,4:0,11,1,8
chr1	12942862	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,9:0,0,23,0
chr1	12954490	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=144,166;MMQ=25,25;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:8,4:14,4:16,6,5,3
chr1	13183012	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,167;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:16,1:18,2:0|1:13183012_G_C:13183012:18,17,2,1
chr1	13183014	.	TG	CC	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=168,167;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:16,1:18,2:0|1:13183012_G_C:13183012:18,17,2,1
chr1	13183213	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=141,166;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:3,1:12,2:6,11,3,0
chr1	13183225	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=179,171;MMQ=34,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:5,1:12,2:0|1:13183225_T_C:13183225:7,11,4,0
chr1	13183228	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=179,171;MMQ=34,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:5,1:10,3:0|1:13183225_T_C:13183225:7,11,4,0
chr1	13183237	.	CT	TC	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=153,175;MMQ=27,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:5,2:11,3:0|1:13183225_T_C:13183225:7,9,5,0
chr1	13183243	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=153,185;MMQ=27,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:5,2:9,4:0|1:13183225_T_C:13183225:8,7,6,0
chr1	13183248	.	TC	AA	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=153,175;MMQ=27,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:6,3:9,4:0|1:13183225_T_C:13183225:8,7,7,0
chr1	13183511	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=148,175;MMQ=52,48;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,30:0.517:58:12,16:14,13:0|1:13183511_T_C:13183511:15,13,6,24
chr1	13183528	.	A	C	.	.	DP=62;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=148,175;MMQ=52,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,28:0.453:62:16,16:17,12:0|1:13183511_T_C:13183511:17,17,4,24
chr1	13183530	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=150,206;MMQ=52,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,10:0.168:61:26,5:20,4:20,31,3,7
chr1	13183532	.	CC	TT	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=143,174;MMQ=52,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=94.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,25:0.433:58:15,14:16,10:0|1:13183511_T_C:13183511:16,17,4,21
chr1	13183567	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=149,200;MMQ=52,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,15:0.262:59:24,8:19,7:0|1:13183567_C_T:13183567:20,24,2,13
chr1	13183573	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=147,198;MMQ=52,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,12:0.203:62:27,7:21,5:0|1:13183567_C_T:13183567:22,28,0,12
chr1	13448180	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,37;MFRL=0,199;MMQ=60,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:13448180_A_G:13448180:0,0,3,0
chr1	13448184	.	CG	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,25;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:13448180_A_G:13448180:0,0,3,0
chr1	13448199	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,25;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	13448547	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,316;MMQ=60,26;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:13448547_TG_CA:13448547:0,0,0,2
chr1	13448551	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,316;MMQ=60,26;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:13448547_TG_CA:13448547:0,0,0,2
chr1	13719052	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,2,10
chr1	13933596	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=200,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:7,0,4,0
chr1	13933855	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:0,7,0,8
chr1	13936822	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,13:0,0,22,1
chr1	13937089	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	14057425	.	GA	G,GAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,35,34;MFRL=162,169,172;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=13.99,6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,8,6:0.409,0.287:19:2,8,5:3,0,1:5,0,14,0
chr1	14057466	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.150:26:7,1:9,0:18,4,4,0
chr1	14075793	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=12,18;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:1,1:1,0:15,0,3,0
chr1	14143112	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,0;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,0:2,0:3,5,0,2
chr1	14143118	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=13,28;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.277:9:1,1:1,1:2,5,0,2
chr1	14143126	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=21,12;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,0:2,0:0,4,0,2
chr1	14143130	.	TC	GG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=14,12;MFRL=172,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.222:7:0,0:2,0:0,6,0,1
chr1	14149601	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=155.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,19:0,18:0|1:14149601_C_T:14149601:0,0,29,10
chr1	14149622	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=151.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.975:37:0,17:0,14:0|1:14149601_C_T:14149601:0,0,28,9
chr1	15386862	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=13,27;MFRL=182,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.473:7:0,1:1,1:0,4,0,3
chr1	15390145	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:2,9,3,2
chr1	15427949	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=224,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	15427982	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,1:1,1:1,2,1,1
chr1	15497844	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.590:10:3,2:0,3:0,4,0,6
chr1	15545971	.	C	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.128:52:17,0:29,6:20,26,0,6
chr1	15578195	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,2:4,5:8,0,6,1
chr1	15599069	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.531:21:5,5:3,6:1,9,1,10
chr1	15616183	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=143,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr1	15635296	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:0,6,0,7
chr1	15651062	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=79.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,28:0.483:58:11,13:19,15:9,21,8,20
chr1	15653503	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=157,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:5,3:1,4:0,6,3,5
chr1	15654737	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=181,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:1,1:7,2,3,0
chr1	15654759	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=146,164;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:10,0:10,0:12,15,4,0
chr1	15769876	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,2:0,0,5,2
chr1	15783117	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr1	15802905	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:13,0,2,0
chr1	15813734	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=105,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.568:12:3,4:2,2:3,2,7,0
chr1	15813751	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,8:0,0,11,6
chr1	15892352	.	C	CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=124,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,4:8,2:15,1,7,0
chr1	15894325	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:8,0,4,1
chr1	15911427	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	16011005	.	G	GGGC	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GGC;STR;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.348:23:8,3:7,5:14,1,7,1
chr1	16047970	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr1	16051803	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=171,144;MMQ=60,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:10,2:3,0:0|1:16051803_T_G:16051803:11,2,2,0
chr1	16051808	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=174,144;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,2:3,0:0|1:16051803_T_G:16051803:10,2,2,0
chr1	16059243	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:16059243_A_C:16059243:0,2,0,1
chr1	16059246	.	CATT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:16059243_A_C:16059243:0,2,0,1
chr1	16059252	.	CC	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:16059243_A_C:16059243:0,2,0,1
chr1	16073524	.	C	CGA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,4:1,2:0|1:16073524_C_CGA:16073524:2,0,3,4
chr1	16073525	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:0,5:1,2:0|1:16073524_C_CGA:16073524:2,0,3,4
chr1	16073527	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:0,5:1,2:0|1:16073524_C_CGA:16073524:2,0,3,4
chr1	16101332	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,26:0.643:40:7,11:7,14:7,7,12,14
chr1	16101529	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,192;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	16134216	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:15,0:6,4:1,21,0,4
chr1	16134248	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=180,168;MMQ=60,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr1	16247558	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=176,180;MMQ=40,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:16247558_C_T:16247558:0,3,0,1
chr1	16247563	.	GT	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=176,180;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:16247558_C_T:16247558:0,3,0,1
chr1	16256491	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:15,1:10,1:8,18,1,1
chr1	16269290	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,104;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,2,0
chr1	16342350	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	16344730	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=13,28;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.926:16:0,6:0,9:0,1,0,15
chr1	16345619	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	16352937	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr1	16354280	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chr1	16354394	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=182,139;MMQ=40,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,3:14,0:28,1,3,0
chr1	16354433	.	A	AT	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=178,147;MMQ=40,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:19,3:14,1:0|1:16354433_A_AT:16354433:20,17,0,4
chr1	16354435	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=178,147;MMQ=40,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.115:41:19,3:14,1:0|1:16354433_A_AT:16354433:20,17,0,4
chr1	16354441	.	TC	T	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=177,147;MMQ=51,24;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:22,3:14,1:16,22,0,4
chr1	16356583	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,15:0,0,6,18
chr1	16358148	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	16358685	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr1	16359051	.	CA	AG	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=157.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,16:0,19:0,0,9,27
chr1	16359106	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr1	16359123	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr1	16370899	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	16372003	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	16372971	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	16373199	.	CCTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr1	16374330	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,17,0
chr1	16374622	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr1	16374994	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,168;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.949:37:0,22:1,14:1,0,20,16
chr1	16375838	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	16376191	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,19,0
chr1	16376230	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0|1:16376230_A_AT:16376230:0,0,13,1
chr1	16376232	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,5:0,7:0|1:16376230_A_AT:16376230:0,0,13,1
chr1	16376238	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr1	16376278	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=97.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,11:0,0,11,20
chr1	16376458	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	16382086	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:5,3:1,3:4,2,5,2
chr1	16382827	.	CTCT	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.527:17:4,3:4,5:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:8,0,9,0
chr1	16382831	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:4,2:3,5:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:8,0,9,0
chr1	16382834	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,3:3,5:8,0,9,0
chr1	16382877	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=142,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.439:28:6,4:8,8:11,5,9,3
chr1	16383329	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=141,146;MMQ=55,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.399:18:6,4:4,2:0|1:16383329_T_TC:16383329:0,11,0,7
chr1	16383336	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=135,146;MMQ=54,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:7,5:5,2:0|1:16383329_T_TC:16383329:1,11,0,7
chr1	16383448	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=96.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,14:0,0,13,16
chr1	16383605	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=203,190;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:12,2:5,7:16,1,6,3
chr1	16383668	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=119.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,12:0,0,26,3
chr1	16383682	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=167,161;MMQ=48,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,27:0.683:39:5,12:7,15:7,5,24,3
chr1	16384843	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=189,176;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr1	16384868	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=177,176;MMQ=46,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.481:4:1,1:1,0:2,0,2,0
chr1	16385248	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=173,161;MMQ=55,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:3,2:3,3:0|1:16385248_C_T:16385248:1,5,0,8
chr1	16385250	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=173,161;MMQ=55,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:2,3:3,2:0|1:16385248_C_T:16385248:1,5,0,8
chr1	16385954	.	G	GGC	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=32,36;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:9,0:7,17,2,0
chr1	16385958	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=27,13;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.191:29:11,1:10,0:6,18,5,0
chr1	16385964	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=32,35;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:14,2:14,0:10,21,2,0
chr1	16385969	.	CTG	C	.	.	DP=39;ECNT=10;MBQ=32,13;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:13,0:19,0:0|1:16385969_CTG_C:16385969:14,23,2,0
chr1	16385973	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=27,11;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:11,0:17,0:0|1:16385973_A_C:16385973:13,22,2,0
chr1	16385977	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=10;MBQ=30,11;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:13,0:18,0:0|1:16385973_A_C:16385973:14,22,2,0
chr1	16385979	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=10;MBQ=28,11;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:15,0:20,0:0|1:16385969_CTG_C:16385969:14,22,2,0
chr1	16385980	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=10;MBQ=33,26;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.230:37:10,5:17,2:14,15,2,6
chr1	16385986	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=10;MBQ=28,17;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:13,0:20,0:0|1:16385969_CTG_C:16385969:14,23,2,0
chr1	16386008	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.232:41:13,5:19,4:14,18,1,8
chr1	16386305	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16386305_G_GC:16386305:0,0,1,0
chr1	16386315	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:16386305_G_GC:16386305:0,0,1,0
chr1	16386325	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:16386305_G_GC:16386305:0,0,1,0
chr1	16386331	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=197,147;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:16386305_G_GC:16386305:2,0,1,0
chr1	16388556	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=149,143;MMQ=39,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:3,4:2,4:0|1:16388556_C_T:16388556:5,0,6,3
chr1	16388565	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=144,143;MMQ=46,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:4,5:2,4:0|1:16388556_C_T:16388556:6,0,6,3
chr1	16388709	.	G	C,T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,34,30;MFRL=0,228,131;MMQ=60,27,27;MPOS=23,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.56,27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,11:0.189,0.749:13:0,0,7:0,2,2:0,0,1,12
chr1	16388756	.	CACCCAT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=205,204;MMQ=46,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,3:1,3,1,5
chr1	16388766	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,52;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,4:0,0,3,6
chr1	16388875	.	G	GCCCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,18;RU=C;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.771:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	16389118	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=258,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:1,4:0,1,1,4
chr1	16456620	.	C	CTCCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=189,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:2,0:6,0,1,1
chr1	16460123	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,11;MFRL=158,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.320:10:3,0:3,1:2,5,0,3
chr1	16461723	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,18;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.272:12:3,0:4,1:2,7,0,3
chr1	16525056	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.562:28:9,7:3,7:10,2,11,5
chr1	16525549	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:7,0,6,1
chr1	16525819	.	G	GAATTGCAGACTACATATTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=242,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	16528218	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.640:8:2,1:1,4:3,0,5,0
chr1	16528233	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:4,0,4,1
chr1	16528823	.	GCCATGGGGACGGGGTGCCCA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=222,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.343:10:4,1:0,2:0|1:16528823_GCCATGGGGACGGGGTGCCCA_G:16528823:4,3,3,0
chr1	16528843	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,10:0.925:10:0,6:0,4:1|0:16528823_GCCATGGGGACGGGGTGCCCA_G:16528823:0,0,7,3
chr1	16529117	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,7:3,4:0,8,1,10
chr1	16534002	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.340:24:8,6:7,1:10,6,7,1
chr1	16534730	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,4:7,0:0,9,0,4
chr1	16543175	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	16621183	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:6,0,2,0
chr1	16730582	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:0,5,2,5
chr1	16731646	.	TG	CC,CG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32,27;MFRL=0,161,192;MMQ=60,60,60;MPOS=26,29;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.46,8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.444,0.444:6:0,2,3:0,1,0:0,0,0,6
chr1	16731653	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0|1:16731653_C_T:16731653:0,3,0,3
chr1	16731661	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=197,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:16731653_C_T:16731653:0,2,0,2
chr1	16736546	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,4:3,0:2,4,1,3
chr1	16775781	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=203,268;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:0,8,0,2
chr1	16778265	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=68.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,9:0,13:0,0,22,0
chr1	16890421	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=172,180;MMQ=51,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,13:0.193:69:24,4:30,8:51,5,12,1
chr1	16890428	.	T	A	.	.	DP=78;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=170,155;MMQ=52,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,8:0.118:74:24,5:42,3:58,8,7,1
chr1	16890441	.	C	T	.	.	DP=98;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=164,151;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,7:0.082:94:35,3:51,4:77,10,5,2
chr1	16890639	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=159,179;MMQ=48,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,28:0.249:114:44,15:41,13:44,42,11,17
chr1	16890644	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=162,163;MMQ=49,44;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,35:0.308:115:37,18:34,17:37,43,17,18
chr1	16890671	.	TG	CA	.	.	DP=113;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=157,167;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=218.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,58:0.522:111:28,32:25,25:26,27,26,32
chr1	16890760	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=169,157;MMQ=58,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.323:41:13,9:13,3:4,24,5,8
chr1	16890771	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=169,206;MMQ=59,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:18,2:15,1:7,29,1,2
chr1	16893598	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=174,155;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.076:55:29,2:20,1:47,4,4,0
chr1	16893841	.	C	T	.	.	DP=121;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=165,211;MMQ=40,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,3:0.033:120:64,2:49,1:10,107,0,3
chr1	16893854	.	A	C	.	.	DP=130;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=170,145;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,29:0.231:126:48,14:48,14:5,92,4,25
chr1	16893884	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=180,182;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,37:0.553:67:13,18:16,19:1,29,0,37
chr1	16907164	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=176,172;MMQ=60,44;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,13:0.188:72:28,5:30,8:49,10,9,4
chr1	16907165	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=175,166;MMQ=60,32;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,5:0.071:73:31,1:36,3:54,14,5,0
chr1	16907204	.	G	A	.	.	DP=87;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=166,173;MMQ=30,32;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,11:0.140:83:34,9:38,2:56,16,10,1
chr1	16907466	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=155,233;MMQ=20,22;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.169:39:14,1:19,5:0,33,0,6
chr1	16907547	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=221,276;MMQ=23,22;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,1,2
chr1	16908989	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=159,165;MMQ=40,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.144:39:13,1:21,4:15,19,4,1
chr1	16909000	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=162,155;MMQ=31,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:6,7:15,3:7,14,1,10
chr1	16909002	.	TG	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=157,134;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:10,1:10,2:1,19,0,3
chr1	16913470	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,164;MMQ=45,20;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:15,2:3,1:16,2,3,0
chr1	16913820	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=281,156;MMQ=27,20;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	16914117	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=162,165;MMQ=33,23;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.176:43:16,4:20,3:33,3,7,0
chr1	16914160	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=143,142;MMQ=52,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.199:38:11,5:17,1:0|1:16914160_G_A:16914160:23,8,7,0
chr1	16914168	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=149,162;MMQ=52,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,10:0.233:45:12,7:22,1:0|1:16914160_G_A:16914160:22,13,8,2
chr1	16914196	.	T	C	.	.	DP=133;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=151,154;MMQ=39,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:121,6:0.053:127:60,4:60,2:73,48,4,2
chr1	16914396	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,181;MMQ=60,26;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,3:1,6,0,4
chr1	16915609	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,20;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	16918255	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=205,178;MMQ=23,23;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,3:4,1:10,0,4,0
chr1	16918611	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=182,190;MMQ=34,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,4:4,6:0,6,1,9
chr1	17248689	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.351:12:2,0:1,0:0,8,0,4
chr1	17251055	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.637:26:5,4:4,10:1,8,0,17
chr1	17256821	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,0:3,2:5,4,1,1
chr1	17263034	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=212,160;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:17263034_G_A:17263034:3,0,1,0
chr1	17263039	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=212,160;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:17263034_G_A:17263034:3,0,1,0
chr1	17263052	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=139,160;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:17263052_C_CTG:17263052:2,0,1,0
chr1	17263054	.	ACG	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=139,160;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17263052_C_CTG:17263052:2,0,1,0
chr1	17263060	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=139,160;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17263052_C_CTG:17263052:2,0,1,0
chr1	17264090	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,169;MMQ=50,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.349:29:11,5:8,4:17,2,8,2
chr1	17264296	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=172,192;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.361:39:6,8:19,5:2,23,1,13
chr1	17264863	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,163;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,12:0.228:55:20,9:23,3:26,17,6,6
chr1	17265327	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:5,3:4,2:10,0,4,1
chr1	17265366	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:7,4:7,2:9,5,4,2
chr1	17270498	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=194,205;MMQ=57,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,3:3,1:9,1,4,0
chr1	17273493	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr1	17292938	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr1	17297289	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:2,2:2,4:1,4,1,5
chr1	17299013	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=188,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:0|1:17299013_CA_C:17299013:0,4,0,2
chr1	17299014	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,7:0.892:7:0,4:0,3:1|0:17299013_CA_C:17299013:0,0,0,7
chr1	17301672	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,4:8,3:8,2,7,0
chr1	17303589	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.513:33:6,11:10,6:8,8,10,7
chr1	17303792	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	17313654	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,2:7,4:7,4,3,3
chr1	17323449	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,0:2,0,3,0
chr1	17359676	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.498:22:5,7:6,4:1,10,1,10
chr1	17395480	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,3:2,3:5,1,6,0
chr1	17395521	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.387:21:8,2:4,5:11,2,7,1
chr1	17396498	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr1	17398066	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=141,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0|1:17398066_G_C:17398066:0,3,0,2
chr1	17398069	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=141,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:17398066_G_C:17398066:0,3,0,2
chr1	17402116	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr1	17402135	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:7,3:6,4,3,0
chr1	17402159	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.249:21:6,0:10,4:11,5,4,1
chr1	17402347	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:7,5:4,2:0,11,3,4
chr1	17402418	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=201,204;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	17405795	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:10,0:4,2:8,7,1,1
chr1	17405809	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,3:6,4:3,6,4,3
chr1	17405916	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:0,3:3,4:0,3,2,6
chr1	17405949	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr1	17410364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=88,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,1,2
chr1	17418883	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=207,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,14:0.682:20:1,5:5,9:0|1:17418883_A_G:17418883:6,0,9,5
chr1	17418894	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=215,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,13:0.644:20:1,5:5,6:0|1:17418883_A_G:17418883:6,1,7,6
chr1	17419066	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:2,6,0,5
chr1	17420088	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:22,1:27,2:24,26,3,0
chr1	17422302	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.386:11:3,3:4,1:6,1,4,0
chr1	17431618	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	17550225	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr1	17551034	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr1	17557039	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:7,3,4,0
chr1	17557178	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=191,202;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr1	17563967	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,15:0,7:0,0,6,16
chr1	17566369	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,2:1,5:0,4,1,6
chr1	17570466	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=113.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,20:0,10:0,0,25,5
chr1	17586010	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=192,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:4,2:3,5:6,1,8,0
chr1	17588689	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.468:21:8,3:3,4:1,10,6,4
chr1	17592324	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr1	17593144	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr1	17596980	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=249,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:1,1:2,0:0,5,0,2
chr1	17597721	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=169,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,5:2,4:0,6,2,7
chr1	17597745	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr1	17602987	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,2,1
chr1	17660697	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.441:34:13,8:6,6:19,0,14,1
chr1	17660802	.	A	AT,ATT,ATTT	.	.	DP=62;ECNT=7;MBQ=25,35,23,25;MFRL=123,150,141,133;MMQ=60,60,42,47;MPOS=20,16,29;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,14,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.96,14.67,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:19,4,9,3:0.132,0.281,0.109:35:7,3,5,2:9,0,1,1:3,16,6,10
chr1	17660890	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=34,26;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:0,6,0,6
chr1	17660943	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,25;MFRL=211,299;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:17660943_G_A:17660943:0,2,0,1
chr1	17660945	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=211,299;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17660943_G_A:17660943:0,2,0,1
chr1	17660948	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=211,299;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17660943_G_A:17660943:0,2,0,1
chr1	17660954	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,26;MFRL=211,299;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17660943_G_A:17660943:0,2,0,1
chr1	17660959	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,24;MFRL=211,299;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:17660943_G_A:17660943:0,2,0,1
chr1	17662541	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=204,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:7,0,8,0
chr1	17662751	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.384:37:11,9:12,5:7,16,3,11
chr1	17662804	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:0,5,0,8
chr1	17672730	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:0,6,0,4
chr1	17674402	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=236,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.547:11:3,1:1,5:5,0,6,0
chr1	17681277	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	17683041	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	17685469	.	A	AACATG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,2:12,0:2,22,0,2
chr1	17698725	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.555:23:5,5:4,5:8,2,9,4
chr1	17698891	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:5,5:0,8,0,8
chr1	17699463	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=216,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr1	17699509	.	G	GGTGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,0:5,1,5,0
chr1	17701903	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:6,5,2,0
chr1	17707739	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=179,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	17718671	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=77.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,9:0,16:0,0,8,17
chr1	17721407	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr1	17914057	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.482:33:7,5:9,9:6,11,4,12
chr1	17914846	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,6:7,7:12,1,13,0
chr1	17929972	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:0|1:17929972_G_T:17929972:6,1,4,0
chr1	17929990	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:2,0:0|1:17929972_G_T:17929972:5,0,2,1
chr1	17934319	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:3,2:4,7:6,2,8,1
chr1	17944983	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:6,2:1,8,0,2
chr1	17948305	.	G	GGGCCACAGCAGGTACT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=115.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,7:0,9:0,0,24,2
chr1	17949454	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:7,0,7,0
chr1	17953748	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:4,7:5,2:8,2,9,0
chr1	17953775	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=170,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:21,2:15,0:0|1:17953775_G_A:17953775:27,12,1,1
chr1	17953785	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=169,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.056:52:27,2:22,0:0|1:17953775_G_A:17953775:36,14,1,1
chr1	17959044	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr1	18023290	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,3:4,7:10,0,9,1
chr1	18702988	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	18703208	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	18703523	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=235,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:2,5,1,6
chr1	18703538	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=238,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,0,5
chr1	18704862	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr1	18809365	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:2,6,2,0
chr1	18812478	.	CA	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.496:24:7,3:4,6:10,2,9,3
chr1	18960722	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=224,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,4:0,0:3,0,3,1
chr1	19062572	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	19175797	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=9,12;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.337:4:0,0:0,0:3,0,1,0
chr1	19184087	.	G	GCC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=191,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:19184087_G_GCC:19184087:1,9,0,2
chr1	19184091	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=191,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:19184087_G_GCC:19184087:1,9,0,2
chr1	19184094	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=191,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:6,0:0|1:19184087_G_GCC:19184087:1,9,0,2
chr1	19185929	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,0:2,0:6,1,3,0
chr1	19199473	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr1	19200908	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	19202770	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	19203672	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,14:0.185:59:12,1:17,0:17,28,14,0
chr1	19204154	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	19208145	.	G	GGGTTGCCT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=90.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,9:0,0,14,7
chr1	19209543	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,13:0,0,22,2
chr1	19210018	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,0:0,3:1,2,0,3
chr1	19212881	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.556:28:6,6:6,6:10,2,15,1
chr1	19215834	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,12:0,0,20,6
chr1	19228971	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	19238529	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.658:36:5,13:7,11:8,4,12,12
chr1	19408294	.	G	GC	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.461:26:5,6:9,6:1,13,3,9
chr1	19408380	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=205,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:1,4,0,7
chr1	19419416	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.525:34:4,11:12,6:2,14,7,11
chr1	19420392	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,1:0,7:0,0,9,0
chr1	19426199	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,3,18
chr1	19426872	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,71;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:13,0:15,4:14,15,4,0
chr1	19430618	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:16,3:20,0:22,16,1,2
chr1	19437185	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:4,6:8,6:12,1,12,0
chr1	19440107	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=161,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr1	19441212	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	19446587	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	19448326	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr1	19448608	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	19450938	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr1	19454267	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,2:4,7:0,7,2,7
chr1	19464769	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=224,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:19464769_C_A:19464769:0,3,0,1
chr1	19464771	.	G	GAAAAAAAAAATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=224,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:19464769_C_A:19464769:0,3,0,1
chr1	19464773	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=174,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
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chr1	19499873	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:4,4,1,2
chr1	19500729	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	19510530	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.094:41:15,0:19,3:21,17,0,3
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chr1	19518659	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,0:3,5:5,0,3,2
chr1	19557281	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:5,0,4,0
chr1	19557713	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,15,2
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chr1	19557998	.	GCTCAA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=228,229;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19557992_ACTCC_A:19557992:0,1,0,1
chr1	19558006	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=228,229;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19557992_ACTCC_A:19557992:0,1,0,1
chr1	19558010	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=14,23;MFRL=228,229;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:19557992_ACTCC_A:19557992:0,1,0,1
chr1	19563635	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:11,6,1,1
chr1	19565175	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	19568972	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.462:20:4,6:5,3:2,9,4,5
chr1	19578053	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,28:0.439:64:13,19:23,9:2,34,2,26
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chr1	19581226	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr1	19581442	.	G	GA,GAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34,16;MFRL=0,215,186;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=5.54,6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.411,0.497:7:0,2,1:0,1,0:0,0,0,7
chr1	19582563	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr1	19583684	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,4:0,14:0,0,3,15
chr1	19583725	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr1	19584578	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr1	19595194	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.490:27:7,6:5,7:5,9,2,11
chr1	19611410	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,15,5
chr1	19612913	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=149,139;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.133:25:13,0:9,3:0,22,1,2
chr1	19612923	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=154,136;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,1:9,1:0,22,0,2
chr1	19612939	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=172,145;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:10,1:5,3:0,16,0,4
chr1	19612952	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=187,138;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:4,2:0,13,0,2
chr1	19651277	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=177,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:0,6,2,4
chr1	19651300	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=207,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,1,4
chr1	19651330	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=215,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	19652127	.	AGTT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:19652127_AGTT_A:19652127:0,0,0,1
chr1	19652135	.	G	GGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19652127_AGTT_A:19652127:0,0,0,1
chr1	19654024	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=191,178;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:1,1:0|1:19654024_T_TG:19654024:1,2,1,0
chr1	19654028	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,10;MFRL=191,178;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,0:0|1:19654024_T_TG:19654024:1,2,1,0
chr1	19654032	.	TC	CG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=191,178;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,0:0|1:19654024_T_TG:19654024:1,2,1,0
chr1	19669213	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr1	19746332	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=232,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr1	19948507	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=92.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,23,2
chr1	19972491	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:32,0:19,4:29,22,0,4
chr1	19972586	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:7,3:3,5:0,10,0,9
chr1	19981451	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	19981791	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,12,7
chr1	19992372	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=191,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:3,4,1,2
chr1	20020993	.	AC	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,10:0,0,10,8
chr1	20027404	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=169,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,9:6,2:0,9,2,9
chr1	20027423	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,7:3,1:0,6,2,6
chr1	20216860	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.474:36:11,10:8,7:14,5,13,4
chr1	20221013	.	TCTAAGTCAG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.473:15:4,2:4,5:0|1:20221013_TCTAAGTCAG_T:20221013:1,7,2,5
chr1	20221029	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:2,2:4,5:0|1:20221013_TCTAAGTCAG_T:20221013:0,7,2,5
chr1	20246974	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:1,8,0,2
chr1	20304691	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr1	20305065	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	20411300	.	G	GT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:20,1:15,2:21,14,1,2
chr1	20446071	.	A	C	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,9:0.122:66:25,0:26,2:0|1:20446071_A_C:20446071:2,55,9,0
chr1	20446075	.	AG	CC	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,7:0.105:61:22,0:25,3:0|1:20446071_A_C:20446071:2,52,7,0
chr1	20501442	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr1	20501682	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=185,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:3,11,2,0
chr1	20518889	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.069:56:28,3:22,0:26,27,3,0
chr1	20519205	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:22,4:19,0:31,10,4,0
chr1	20519959	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,0:9,3:9,13,0,3
chr1	20649814	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:4,3:2,2:5,1,6,0
chr1	20650097	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=232,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:20650097_C_T:20650097:0,2,0,1
chr1	20650103	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=232,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:20650097_C_T:20650097:0,2,0,1
chr1	20650104	.	A	ATTTTTAACATGTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=232,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:20650097_C_T:20650097:0,2,0,1
chr1	20657352	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.512:33:6,8:10,8:13,3,14,3
chr1	20672101	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.578:41:9,10:7,10:2,15,3,21
chr1	20674894	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,0:5,3:1,14,0,3
chr1	20680760	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	20680781	.	A	ATATATACGTATATAGGTATATGTGTAGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.374:5:2,1:0,0:0,4,0,1
chr1	20829808	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:9,2:9,1:1,23,0,3
chr1	20940258	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr1	20944877	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:11,1,2,0
chr1	20960230	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	20964328	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,11:0,0,14,4
chr1	20972048	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,8,12
chr1	20972304	.	GGTTTTGTGTTCTAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.814:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr1	20977221	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr1	20979307	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=53.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,7:0,0,12,5
chr1	20991273	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=144.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,21:0,25:0,0,8,39
chr1	21030902	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	21031301	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	21043913	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	21043926	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	21099846	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	21102502	.	CAAAA	C,CAAAAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=36,22,30;MFRL=164,75,163;MMQ=60,60,60;MPOS=21,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,15,21;RU=A;STR;TLOD=6.29,5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.190,0.341:11:2,1,0:3,0,2:1,4,0,6
chr1	21139803	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=144,229;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:21139803_T_TC:21139803:0,4,0,1
chr1	21139808	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=144,229;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:21139803_T_TC:21139803:0,4,0,1
chr1	21139823	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=149,229;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:21139803_T_TC:21139803:0,3,0,1
chr1	21139826	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=75,229;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:21139803_T_TC:21139803:0,2,0,1
chr1	21139831	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,16;MFRL=107,229;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:21139803_T_TC:21139803:0,2,0,1
chr1	21151751	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:21151751_AA_CC:21151751:0,3,0,1
chr1	21151755	.	A	ACTTCCACATGCTCTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:21151751_AA_CC:21151751:0,3,0,1
chr1	21155837	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=166,197;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:16,0:12,3:1,27,0,3
chr1	21175855	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr1	21175885	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=155,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:10,2:9,2:18,1,4,0
chr1	21179969	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr1	21180181	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,4:5,7:2,7,3,8
chr1	21180250	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=199,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,2:5,6:0,10,0,8
chr1	21181595	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:7,5:1,3:0,8,2,6
chr1	21188703	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=199,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.817:9:1,2:0,6:1,0,5,3
chr1	21188871	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=185,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr1	21188926	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=185,203;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr1	21268514	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=162,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:21,0:22,3:26,17,0,3
chr1	21299567	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=100,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,2:4,0:6,7,0,2
chr1	21307743	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:4,2:9,1:0,15,0,3
chr1	21327637	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr1	21377314	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,19,0
chr1	21437911	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:8,4:4,10:2,10,2,12
chr1	21494634	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.482:27:7,11:7,2:0|1:21494634_C_T:21494634:7,7,2,11
chr1	21494635	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,14:0.514:27:10,6:1,7:1|0:21494634_C_T:21494634:2,11,7,7
chr1	21560204	.	A	AGTGGTGCGATCTCAGTTCACTGCAACC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=185,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,2:6,0:0,9,1,1
chr1	21560253	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr1	21585329	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=165,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.086:55:26,3:24,1:12,39,2,2
chr1	21797996	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,13,3
chr1	21799489	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=83.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,10:0,0,3,25
chr1	21799823	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	21801346	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	21804815	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,2,13
chr1	21805978	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr1	21806447	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,3,2
chr1	21809861	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,255;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21809861_A_G:21809861:0,0,0,1
chr1	21809864	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,255;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21809861_A_G:21809861:0,0,0,1
chr1	21887290	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr1	21889506	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,2:2,4:6,0,6,0
chr1	21889784	.	CG	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,6:7,4:3,9,1,9
chr1	21890464	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	21896767	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:5,3:4,2:8,2,4,1
chr1	21902998	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.162:24:5,0:5,1:11,9,4,0
chr1	21903008	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,10;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.167:23:9,0:7,0:9,10,4,0
chr1	21904206	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	21929260	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	21932530	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	21934667	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=202,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:3,0,2,0
chr1	21936829	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.366:11:2,0:3,0:1,6,0,4
chr1	21938375	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:1,2,0,4
chr1	21938504	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,260;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:14,0,2,0
chr1	21939741	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.580:29:5,8:7,9:5,7,5,12
chr1	21940555	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=174,76;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:1,2,2,2
chr1	21944352	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	21945614	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=159,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:3,0:3,2:0,6,1,2
chr1	21946396	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=207,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr1	21946415	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	22013561	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=194,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr1	22016678	.	TA	T,TAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31,28;MFRL=187,153,170;MMQ=60,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=7.84,10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,6:0.313,0.435:13:2,0,3:1,4,2:0,3,0,10
chr1	22032570	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:7,10:6,3:12,1,12,2
chr1	22033152	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=192,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.741:21:2,7:3,9:3,2,11,5
chr1	22042003	.	T	TTTTCTTTGTTCCAAATTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,1:10,1:0,16,0,2
chr1	22079215	.	T	TAAGTAGTATGCGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr1	22084145	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.309:27:9,4:10,4:12,7,5,3
chr1	22150257	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,0,7
chr1	22157689	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,9,5
chr1	22158363	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr1	22160148	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr1	22168216	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr1	22168844	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,0:8,2:5,7,0,2
chr1	22174600	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr1	22176815	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=13,31;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:0,2:1,0:4,1,2,0
chr1	22183471	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr1	22183739	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,13:0,0,13,13
chr1	22186234	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr1	22198922	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:0,0:0,4,0,4
chr1	22199016	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	22199081	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	22199821	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,9:0,0,15,7
chr1	22200835	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	22205408	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	22205466	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr1	22207804	.	ACCCAGGGTGGCAG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,7:0,0,13,2
chr1	22208030	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,6:0,0,0,13
chr1	22211222	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr1	22213628	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.565:10:2,2:2,1:4,0,6,0
chr1	22215088	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr1	22307340	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,7,0
chr1	22307358	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr1	22307376	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=171,191;MMQ=40,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:5,1:3,3:7,2,2,2
chr1	22307538	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,19:0,13:0,0,23,10
chr1	22307568	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.316:33:13,4:8,6:14,9,6,4
chr1	22307743	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr1	22307757	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	22307766	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=205,197;MMQ=40,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.384:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	22310139	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=109.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,14:0,10:0|1:22310139_T_G:22310139:0,0,20,6
chr1	22310145	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=106.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,13:0,10:0|1:22310139_T_G:22310139:0,0,19,6
chr1	22310411	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,8:0,1:0|1:22310411_A_G:22310411:0,0,0,9
chr1	22310413	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,6:0,1:0|1:22310411_A_G:22310411:0,0,0,9
chr1	22310662	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=60.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,11:0,0,15,5
chr1	22310674	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,12:0,0,14,8
chr1	22313017	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,143;MMQ=52,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.523:32:7,10:8,5:7,8,13,4
chr1	22313161	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=141,154;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.945:34:1,15:0,16:1,0,7,26
chr1	22313197	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,0,22
chr1	22313249	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=193,191;MMQ=40,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:0,10,0,2
chr1	22324579	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=158,219;MMQ=40,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:20,3:21,2:30,13,0,5
chr1	22324660	.	A	G	.	.	DP=106;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,5:0.059:99:52,5:37,0:52,42,5,0
chr1	22329414	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,217;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,5,1
chr1	22331999	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=170,154;MMQ=57,38;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.161:41:16,2:19,4:0|1:22331999_C_T:22331999:20,15,1,5
chr1	22332008	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=173,156;MMQ=57,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.232:37:12,2:15,5:0|1:22331999_C_T:22331999:19,10,1,7
chr1	22333595	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=161,195;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.814:14:1,3:1,9:0|1:22333595_G_A:22333595:0,2,1,11
chr1	22333597	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=202,161;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.176:15:4,1:9,1:1|0:22333595_G_A:22333595:1,12,0,2
chr1	22336371	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=128.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,25:0,19:0,0,15,29
chr1	22408106	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	22417818	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:15,3:7,0:23,0,3,0
chr1	22447645	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	22832743	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,4,15
chr1	22837586	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:0,1:2,0,3,0
chr1	22837603	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:22837603_TA_T:22837603:3,0,1,0
chr1	22837606	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,15;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:22837603_TA_T:22837603:3,0,1,0
chr1	22849003	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	22913059	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:7,2:10,5,2,0
chr1	22915823	.	C	CTTGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=219,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:22915823_C_CTTGTT:22915823:0,4,0,1
chr1	22915829	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=201,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22915823_C_CTTGTT:22915823:0,3,0,1
chr1	22923718	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22923718_CA_C:22923718:0,0,1,0
chr1	22923723	.	CAGA	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22923718_CA_C:22923718:0,0,1,0
chr1	22923730	.	AT	CC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:22923718_CA_C:22923718:0,0,1,0
chr1	22923736	.	GG	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=208,272;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:22923718_CA_C:22923718:1,0,1,0
chr1	22925292	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	22970754	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:22970754_G_GT:22970754:1,0,0,1
chr1	22970756	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:22970754_G_GT:22970754:1,0,0,1
chr1	22987958	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	23101836	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:0,7,0,7
chr1	23108089	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=150,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	23191746	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,2:4,5:2,7,2,5
chr1	23232400	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	23232695	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=189,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:23232695_G_T:23232695:0,3,0,1
chr1	23232698	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=189,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:23232695_G_T:23232695:0,3,0,1
chr1	23236826	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=175,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr1	23236828	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=168,262;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr1	23239873	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr1	23240245	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.111:33:13,2:13,1:14,16,2,1
chr1	23280165	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	23289568	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,15,2
chr1	23380198	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=102.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,12:0,0,24,4
chr1	23382624	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,0:7,3:0,13,0,3
chr1	23399932	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	23418153	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr1	23420123	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:13,1:17,1:7,26,0,2
chr1	23650255	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=159,287;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:8,0:10,3:3,16,0,3
chr1	23664147	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,0;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:4,2:5,1:9,0,3,0
chr1	23667475	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:31,0:25,3:19,38,0,3
chr1	23710805	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:2,3,5,1
chr1	23713952	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,0:0,4:1,0,0,4
chr1	23724183	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:6,3:5,3:1,10,0,7
chr1	23735241	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:3,4:6,5:2,9,1,8
chr1	23758134	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr1	23836364	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=131.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.955:41:0,16:1,24:1,0,29,11
chr1	23848595	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,0:8,2:0,11,0,2
chr1	23850841	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=14,33;MFRL=140,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:0,4:2,2:0|1:23850841_A_C:23850841:3,3,8,0
chr1	23850846	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.505:16:0,3:4,3:0|1:23850841_A_C:23850841:3,5,8,0
chr1	23956161	.	AAATAAT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,244;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=AAT;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.806:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	23965517	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:7,0,3,0
chr1	23966837	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:10,5:3,2:13,0,7,0
chr1	23966894	.	T	TAAG	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=59.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.446:36:13,12:6,3:15,5,14,2
chr1	24020485	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr1	24022437	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.423:45:10,7:16,11:3,23,0,19
chr1	24082269	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,2:1,0,3,2
chr1	24106510	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	24124801	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	24140921	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=166,189;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:24140921_C_T:24140921:0,4,0,1
chr1	24140922	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=182,141;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:24140922_A_G:24140922:0,4,0,1
chr1	24140923	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=166,189;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:24140921_C_T:24140921:0,4,0,1
chr1	24140925	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=166,189;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:24140921_C_T:24140921:0,4,0,1
chr1	24140926	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=182,141;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:24140922_A_G:24140922:0,4,0,1
chr1	24143932	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,13,2
chr1	24151996	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:6,7:2,2:0,9,0,9
chr1	24175201	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,0:9,4:10,8,0,4
chr1	24175264	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=146,25;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:8,0:2,2:4,6,1,1
chr1	24186465	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=199,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr1	24192200	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=103,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	24288404	.	A	G	.	.	DP=97;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=175,155;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=131.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,45:0.470:96:27,24:24,21:17,34,16,29
chr1	24288432	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=185,174;MMQ=60,45;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,29:0.423:69:18,15:20,13:14,26,15,14
chr1	24288529	.	TAAAC	T	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,178;MMQ=52,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=151.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,40:0.437:92:25,19:22,21:26,26,26,14
chr1	24289891	.	ATGAATG	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:9,7:8,7:0,17,1,13
chr1	24294249	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=99.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,12,20
chr1	24294362	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:9,3:6,8:9,6,3,8
chr1	24294450	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=18,18;MFRL=130,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:0,0:0,3,0,2
chr1	24298263	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:6,1,3,2
chr1	24305397	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:3,1:0,3:0,4,0,4
chr1	24383819	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,6:6,5:9,1,8,3
chr1	24388371	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,5:2,8:5,1,10,3
chr1	24392781	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=66,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:24392781_A_C:24392781:0,2,0,1
chr1	24392786	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=66,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:24392781_A_C:24392781:0,2,0,1
chr1	24394688	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:8,0,0,2
chr1	24400584	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,18,0
chr1	24400633	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=147.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,19:0,21:0,0,24,17
chr1	24411213	.	G	GAGAGACACGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24411213_G_GAGAGACACGGA:24411213:0,1,0,1
chr1	24411215	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=154,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24411213_G_GAGAGACACGGA:24411213:0,1,0,1
chr1	24434595	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.548:40:6,11:12,11:4,14,6,16
chr1	24463854	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,4:1,2:0,3,0,7
chr1	24484441	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	24485512	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.213:46:5,3:10,1:29,7,10,0
chr1	24485518	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=168.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.980:44:0,19:0,24:0,0,35,9
chr1	24485941	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:6,8:7,8:8,5,12,4
chr1	24486216	.	G	GTTTTGTTTTTTTTGTTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=205,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,3:1,1:0,1,0,6
chr1	24507162	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:1,0:0|1:24507162_T_C:24507162:0,1,1,0
chr1	24507165	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:0,0:1,0:0|1:24507162_T_C:24507162:0,3,1,0
chr1	24507172	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:24507162_T_C:24507162:0,4,1,0
chr1	24661023	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=186,196;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chr1	24662928	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=9,15;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:1,0:0,0:0|1:24662928_A_T:24662928:4,0,2,0
chr1	24662934	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.254:9:1,0:1,0:0|1:24662928_A_T:24662928:6,1,2,0
chr1	24668842	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,254;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	24671464	.	ACCCTCCACACCTGTGCC	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCTCCACACCTGTGCC;STR;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.582:26:2,7:7,7:2,10,3,11
chr1	24673866	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=197,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr1	24695749	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:7,1,8,1
chr1	24706410	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=200,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.434:14:5,0:2,5:0,8,0,6
chr1	24746205	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,5:5,2:0,11,0,7
chr1	24768778	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=178,256;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr1	24779855	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.561:12:3,3:2,2:5,0,6,1
chr1	24784139	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=228,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	24784197	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:5,2,4,0
chr1	24795749	.	T	TATTTGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=319,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	24857657	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,3:3,5:11,2,6,3
chr1	24922056	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,0,5
chr1	24978892	.	CAAA	C,CAA,CAAAA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,35,34,32;MFRL=126,197,160,175;MMQ=60,60,60,60;MPOS=31,28,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,15,17;RU=A;STR;TLOD=6.25,10.41,9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,6,5:0.160,0.299,0.235:21:2,2,4,1:5,1,2,3:7,0,13,1
chr1	24978915	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=175,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.199:32:13,0:5,1:23,2,7,0
chr1	24978928	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:15,0:10,3:27,5,3,0
chr1	24987320	.	GG	AT	.	.	DP=120;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,5:0.054:109:51,0:49,5:21,83,0,5
chr1	24989762	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,5,21
chr1	24997869	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.121:36:13,0:14,0:31,0,5,0
chr1	25153692	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=55.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr1	25254317	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	25629724	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=269,231;MMQ=52,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25629724_T_G:25629724:1,0,1,0
chr1	25629728	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=269,231;MMQ=52,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25629724_T_G:25629724:1,0,1,0
chr1	25629734	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,10;MFRL=269,231;MMQ=52,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:25629724_T_G:25629724:1,0,1,0
chr1	25648349	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,148;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,9:0,12:1,0,18,3
chr1	25678002	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.704:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	25678146	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,1:4,1:8,7,1,1
chr1	25678238	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	25717139	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	25717365	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,127;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:8,7:7,6:7,8,7,6
chr1	25780912	.	T	TGTGTGTGTGCTTGAGA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=244,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.303:4:1,1:2,0:0|1:25780912_T_TGTGTGTGTGCTTGAGA:25780912:0,3,0,1
chr1	25780922	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=244,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:25780912_T_TGTGTGTGTGCTTGAGA:25780912:0,3,0,1
chr1	25780940	.	T	TAGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=254,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	25893242	.	TG	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr1	26085048	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:1,1:2,2,2,1
chr1	26098107	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.429:21:5,6:7,2:7,5,8,1
chr1	26098333	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=212,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,5:1,4:0,4,0,9
chr1	26107688	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=163,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:0,3:4,6:0,4,0,9
chr1	26109237	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:0,6,0,9
chr1	26110065	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	26110143	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	26135728	.	A	AAAGTGCTGGGAATACAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	26189546	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=211,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:1,13,0,2
chr1	26299050	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,3:8,7:9,5,7,3
chr1	26310394	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:3,2:5,8:7,1,9,2
chr1	26310836	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=217,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:8,0,3,0
chr1	26314625	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	26349967	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=83,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.765:11:1,4:1,3:0,2,0,9
chr1	26357855	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	26365549	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr1	26369297	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=163,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr1	26371788	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	26378258	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=13,12;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.564:9:0,0:0,0:0|1:26378258_A_C:26378258:3,1,5,0
chr1	26378267	.	GA	CC	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=9,12;MFRL=134,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.543:11:0,1:1,1:0|1:26378258_A_C:26378258:3,2,6,0
chr1	26378273	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=123,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.560:9:1,0:2,3:2,2,5,0
chr1	26378277	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=23,28;MFRL=166,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.361:12:3,1:2,2:0|1:26378258_A_C:26378258:5,3,4,0
chr1	26378280	.	CTGGG	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=181,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:4,1:3,3:0|1:26378258_A_C:26378258:5,3,4,0
chr1	26383645	.	CCAGGGGT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=114,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr1	26384259	.	T	TTAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	26392755	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:12,4,0,2
chr1	26504096	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.141:32:9,0:7,2:17,10,0,5
chr1	26504196	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=88,130;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:26504196_C_G:26504196:1,4,0,2
chr1	26504200	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=88,130;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,1:0|1:26504196_C_G:26504196:1,4,0,2
chr1	26508293	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,6:0,2:1,0,8,1
chr1	26508480	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	26508749	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:9,4:3,0:12,0,4,0
chr1	26511700	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr1	26515529	.	ACCAGACT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCAGACT;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	26524706	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:3,8:10,4:9,4,11,2
chr1	26527783	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:5,1,7,0
chr1	26527862	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:11,2:19,1:23,8,0,3
chr1	26529121	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:0,6,0,6
chr1	26583998	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr1	26594915	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:10,0:16,2:25,1,2,0
chr1	26597435	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,6:4,4:6,0,10,0
chr1	26597673	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=179,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	26601570	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=105.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,17:0,0,0,28
chr1	26603291	.	CCTT	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=79.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.525:40:12,9:6,12:1,18,0,21
chr1	26603850	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:13,1:19,1:0,33,0,2
chr1	26603883	.	G	GAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:2,7:7,3:0,9,0,10
chr1	26607447	.	T	TGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=171,161;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=6,29;RU=G;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.317:7:2,0:2,0:5,0,0,2
chr1	26607726	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr1	26609307	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,5:7,7:4,7,8,4
chr1	26612297	.	C	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=86.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,36:0.546:65:16,19:12,12:18,11,21,15
chr1	26620846	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:1,1:1,4,0,4
chr1	26644399	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=223,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr1	26648381	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:3,1:8,7:10,1,7,1
chr1	26648793	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=196,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,3:7,0:1,16,0,3
chr1	26648838	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	26650872	.	T	TCCGAAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26650872_T_TCCGAAC:26650872:0,0,0,1
chr1	26650874	.	T	TCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26650872_T_TCCGAAC:26650872:0,0,0,1
chr1	26650877	.	A	ACTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26650872_T_TCCGAAC:26650872:0,0,0,1
chr1	26655208	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=124,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:5,1:3,3:6,2,4,1
chr1	26655462	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr1	26662774	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.561:39:7,11:10,11:14,3,18,4
chr1	26665991	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,175;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.418:8:5,2:0,1:0,5,0,3
chr1	26669724	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1,2,0,1
chr1	26670401	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr1	26689659	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:1,4,0,7
chr1	26698884	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=184,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr1	26698938	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,3:3,2:6,1,5,1
chr1	26699103	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.535:30:3,11:10,5:3,11,2,14
chr1	26699157	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=137,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,1:3,3:0,6,0,4
chr1	26700631	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	26752992	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,162;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:8,5:4,10:0,12,3,13
chr1	26774308	.	ACTC	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=239,206;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:26774308_ACTC_A:26774308:0,2,0,1
chr1	26774316	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=239,206;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:26774308_ACTC_A:26774308:0,2,0,1
chr1	26774318	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=276,206;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26774308_ACTC_A:26774308:0,1,0,1
chr1	26774321	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=276,206;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26774308_ACTC_A:26774308:0,1,0,1
chr1	26774324	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=276,206;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26774308_ACTC_A:26774308:0,1,0,1
chr1	26774326	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=276,206;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26774308_ACTC_A:26774308:0,1,0,1
chr1	26800583	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=159,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:18,0:12,3:0|1:26800583_C_T:26800583:7,23,0,3
chr1	26800590	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=167,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:17,0:13,3:0|1:26800583_C_T:26800583:8,23,0,3
chr1	26801731	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=233,216;MMQ=46,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:2,2:2,0:1,4,0,2
chr1	26872554	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:2,5:5,5:1,7,1,9
chr1	26879792	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,7,0
chr1	26880989	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,5:4,3:6,1,7,1
chr1	26881806	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=171,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:1,5,1,4
chr1	26887150	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=124,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr1	26898142	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,3:3,2:1,6,1,4
chr1	26900708	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:3,2,1,1
chr1	26900735	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,1:0,5:1,0,4,2
chr1	26900805	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:4,1,7,0
chr1	27023752	.	T	TAC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27023752_T_TAC:27023752:0,0,1,0
chr1	27023756	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:27023752_T_TAC:27023752:0,1,1,0
chr1	27023762	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,13;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:27023752_T_TAC:27023752:0,1,1,0
chr1	27023765	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,32;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27023752_T_TAC:27023752:0,1,1,0
chr1	27023768	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27023752_T_TAC:27023752:0,1,1,0
chr1	27023774	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:27023752_T_TAC:27023752:0,1,1,0
chr1	27057621	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:6,6:11,4:17,0,10,0
chr1	27089446	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,3:3,3:2,7,6,0
chr1	27100181	.	CGCA	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCA;STR;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:16,3:11,1:3,24,2,2
chr1	27107262	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27107262_C_CG:27107262:0,0,0,1
chr1	27107263	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27107262_C_CG:27107262:0,0,0,1
chr1	27158844	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.495:22:5,5:6,5:11,0,11,0
chr1	27190665	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.137:28:6,2:8,0:14,11,3,0
chr1	27190821	.	G	GGTGT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=GT;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.665:11:2,1:1,4:3,0,5,3
chr1	27248283	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:4,0,8,0
chr1	27248440	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,4:4,7:0,6,0,11
chr1	27269653	.	GGGATTA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	27272600	.	A	ATCT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=51.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.535:26:5,8:7,6:7,5,10,4
chr1	27434223	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,2:14,0:15,4,1,1
chr1	27435968	.	G	GCGGCCGCCCCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	27609980	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr1	27620954	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,4:0,0:4,0,4,0
chr1	27658707	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=221,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0,4,0,1
chr1	27658709	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=237,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	27659965	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	27659989	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	27660568	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=101.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,14:0,0,9,22
chr1	27660731	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,22:0.590:37:8,11:7,11:9,6,12,10
chr1	27660733	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=171,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:16,2:15,0:21,14,0,2
chr1	27660742	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=139,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.593:32:6,11:6,8:7,6,10,9
chr1	27661037	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr1	27661231	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,22:0.675:32:4,8:6,13:4,6,7,15
chr1	27671967	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:10,5:5,0:6,9,4,1
chr1	27675858	.	GGCTC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,5:3,1:4,7,5,2
chr1	27676365	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	27678108	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:2,1:0,6,0,3
chr1	27679692	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=197,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr1	27682440	.	T	TG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:10,9:5,5:13,2,12,2
chr1	27683615	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.395:41:12,5:13,11:10,15,1,15
chr1	27686063	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0,0,2,12
chr1	27686314	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.517:29:8,8:6,7:13,1,15,0
chr1	27687366	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=61.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.522:40:11,10:8,10:10,9,8,13
chr1	27690644	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=211,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,1:0,2:1,3,1,2
chr1	27696011	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,0,12
chr1	27720954	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=173,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,2:10,0:12,9,2,0
chr1	27738969	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=170,189;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,2:11,0:14,2,2,0
chr1	27744812	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,168;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,37:0.594:62:12,21:13,16:18,7,24,13
chr1	27873845	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:5,1,9,0
chr1	27874690	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,2:5,0:2,14,0,2
chr1	27876876	.	AC	TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.196:23:6,1:12,0:9,10,4,0
chr1	27878650	.	G	GTCCTCTTGGGCAGGATGCAGGGCCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=205,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	27942155	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=199,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.521:27:6,6:6,8:7,6,6,8
chr1	27992800	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=23,24;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	27995077	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,9:0,0,6,19
chr1	28081859	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr1	28086955	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,19,1
chr1	28116061	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:4,1:10,0,2,1
chr1	28173667	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=146,115;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:19,0:9,2:0|1:28173667_T_G:28173667:4,24,1,1
chr1	28173673	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=146,115;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:18,0:8,2:0|1:28173667_T_G:28173667:3,25,1,1
chr1	28173675	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=147,115;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:18,0:7,2:0|1:28173667_T_G:28173667:2,26,1,1
chr1	28173687	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=160,115;MMQ=60,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.108:26:17,0:5,1:0|1:28173667_T_G:28173667:1,23,1,1
chr1	28206588	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.692:24:6,10:1,7:3,4,8,9
chr1	28212272	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,243;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr1	28218859	.	A	AAAGCCTCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	28220484	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,5:0,2:3,1,4,3
chr1	28224312	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	28233572	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=19,29;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:1,3:2,1:5,4,4,1
chr1	28241083	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,10:4,5:5,2,10,5
chr1	28261593	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=189,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:0|1:28261593_T_C:28261593:3,0,7,0
chr1	28261600	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:1,2:1,6:0|1:28261593_T_C:28261593:3,0,7,1
chr1	28261658	.	T	TG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:4,3:6,7:10,1,8,3
chr1	28268706	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,2:5,4:10,0,6,0
chr1	28268833	.	C	CG	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,15:0.457:33:6,8:11,7:0|1:28268833_C_CG:28268833:7,11,10,5
chr1	28268835	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,15:0.457:33:7,8:8,6:0|1:28268833_C_CG:28268833:7,11,10,5
chr1	28285133	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=170,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:16,4:24,0:26,15,3,1
chr1	28290231	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=90.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,8,18
chr1	28323718	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=250,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr1	28374836	.	G	GA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.184:37:9,7:13,0:20,10,6,1
chr1	28530167	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=127,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:5,1,6,0
chr1	28555426	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.426:22:4,4:6,5:10,3,7,2
chr1	28555579	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=199,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:0,6,0,5
chr1	28559574	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:3,3:5,2:1,7,0,5
chr1	28562676	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:1,1:2,5:4,0,6,0
chr1	28785729	.	G	GA	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.096:50:20,4:22,0:10,36,0,4
chr1	28858916	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:0,12,0,2
chr1	28898282	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=199,159;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:6,1,2,0
chr1	29016716	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:1,4,1,4
chr1	29063559	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,2:0,0,11,0
chr1	29064036	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,4:3,1:9,0,5,0
chr1	29064063	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:17,1:10,1:27,0,2,0
chr1	29069002	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,1:14,1:6,20,1,1
chr1	29342090	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.168:28:5,2:18,2:24,0,4,0
chr1	29345009	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr1	29345027	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	29439016	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,1,10
chr1	29475176	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:13,2:7,0:3,17,0,2
chr1	29475648	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,21:0,13:0,0,10,25
chr1	29476535	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,26;MFRL=264,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,0:1,0,1,1
chr1	29542435	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,1:0,0,6,0
chr1	29557224	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=101.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,15:0,16:0,0,28,8
chr1	29585374	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=160,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0|1:29585374_G_A:29585374:0,6,0,2
chr1	29585380	.	A	AATAAATGGATATT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=209,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:29585374_G_A:29585374:0,4,0,1
chr1	29585383	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=209,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:29585374_G_A:29585374:0,4,0,1
chr1	29602368	.	G	GGCAGGAATACCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=224,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	29631782	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	29651670	.	C	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.107:56:8,3:19,1:29,21,6,0
chr1	31196255	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:1,3:1,1:3,0,5,0
chr1	31196464	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:2,8:3,5:0,5,0,13
chr1	31208007	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=170,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:8,1,2,0
chr1	31214391	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,6,0
chr1	31230628	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:3,2:2,7:1,4,3,7
chr1	31413925	.	AATAAG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,6:3,6:10,1,12,0
chr1	31478638	.	AAGAGAGAGAG	A,AAGAG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32,31;MFRL=155,167,114;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,13;RU=AG;STR;TLOD=6.27,6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.187,0.270:9:3,1,0:1,1,2:4,1,3,1
chr1	31658202	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.353:43:9,2:10,6:13,15,0,15
chr1	31658209	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=147,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.143:40:9,0:11,1:13,20,0,7
chr1	31658216	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.097:38:8,1:9,0:12,23,0,3
chr1	31740668	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,9,8
chr1	31744168	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	31764693	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	31764713	.	C	CAAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,3:0,0,5,2
chr1	31764930	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr1	31765968	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	31840426	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	31897493	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=186.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,23:0,28:0,0,37,17
chr1	31898132	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=129.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,19:0,17:0,0,25,12
chr1	31898162	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=159.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,25:0,24:0,0,23,26
chr1	31898279	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,5:0,0,6,16
chr1	31898536	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	31899684	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,2,16
chr1	31899704	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr1	31901951	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,84;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:1,15,1,1
chr1	31905730	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	31905889	.	A	ACAG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CAG;STR;TLOD=72.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.867:20:1,5:1,8:2,0,15,3
chr1	31906882	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr1	31907102	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	32087245	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,22;MFRL=159,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.623:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr1	32098978	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,132;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:3,2:0,14,0,2
chr1	32098987	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=167,132;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:0,14,0,2
chr1	32118160	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,2:1,5:7,0,8,0
chr1	32119347	.	AACAC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=169,164;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AC;STR;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.601:6:0,0:0,3:2,0,0,4
chr1	32119431	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=171,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,2:7,1:9,1,2,1
chr1	32122164	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=176,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:0,10,0,6
chr1	32124104	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=160,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.117:27:7,0:15,0:22,2,0,3
chr1	32126135	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.449:38:10,8:11,8:17,4,13,4
chr1	32126898	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=229,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	32127908	.	G	GGGCCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:2,1:6,4,2,0
chr1	32127911	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=196,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,7:1,1:1,2,6,2
chr1	32128283	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:0,4,0,6
chr1	32133737	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:4,3:7,3:10,1,5,1
chr1	32134491	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.372:17:6,2:4,4:1,10,1,5
chr1	32136168	.	G	C,T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,31,25;MFRL=0,153,155;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=76.30,73.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,28,34:0.454,0.530:62:0,16,14:0,12,14:0,0,36,26
chr1	32138003	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:1,2:1,2:2,1,4,0
chr1	32140733	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=193,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,5:1,3:2,1,3,5
chr1	32145009	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	32154154	.	CA	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:14,0:16,3:4,26,0,3
chr1	32155284	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.470:13:2,4:4,2:5,2,6,0
chr1	32155911	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr1	32155929	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=135,243;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,1:4,2:6,5,2,1
chr1	32156722	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:7,1,1,1
chr1	32156869	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,6,14
chr1	32160918	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=211,244;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	32161786	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=199,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.286:8:1,0:2,1:1,5,0,2
chr1	32200891	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32200891_C_T:32200891:0,0,0,1
chr1	32200899	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,15;MFRL=119,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:32200891_C_T:32200891:0,1,0,1
chr1	32203969	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:1,16,0,2
chr1	32258805	.	AAG	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AG;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:7,2:11,0:17,2,3,0
chr1	32259707	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=26,9;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.218:31:5,0:14,0:0|1:32259707_T_G:32259707:12,12,7,0
chr1	32259711	.	GT	CG	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,7:0.198:34:6,2:11,0:0|1:32259707_T_G:32259707:13,14,7,0
chr1	32259719	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=28,10;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.118:36:11,0:14,0:0|1:32259707_T_G:32259707:14,18,4,0
chr1	32259723	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,8:0.215:34:7,0:11,1:0|1:32259707_T_G:32259707:8,18,8,0
chr1	32280150	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:7,3:6,0:8,6,3,0
chr1	32381592	.	TA	T,TAA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,29,31;MFRL=150,135,158;MMQ=60,60,60;MPOS=17,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.71,4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,4,4:0.136,0.154:29:9,1,1:11,2,3:2,19,0,8
chr1	32541440	.	GGT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=13,22;MFRL=150,252;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=GT;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:1,1:1,0:0,6,0,2
chr1	32566048	.	CT	AG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:12,2:6,0:15,3,2,0
chr1	32624000	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=149,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.098:28:15,0:11,2:0|1:32624000_A_T:32624000:8,18,1,1
chr1	32624003	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=153,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:16,0:8,2:0|1:32624000_A_T:32624000:8,18,1,1
chr1	32653581	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.106:54:21,0:26,5:19,30,0,5
chr1	32658058	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.238:17:4,1:5,1:2,11,0,4
chr1	32658062	.	G	GGT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.514:13:2,3:2,3:0,6,0,7
chr1	32658064	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.405:15:4,2:2,1:0,9,0,6
chr1	32670246	.	ATG	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=147,287;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.065:43:22,1:16,1:19,22,2,0
chr1	32692198	.	CT	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=171,202;MMQ=60,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	32692225	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=172,202;MMQ=58,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:32692225_T_G:32692225:0,2,0,1
chr1	32692229	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=172,202;MMQ=58,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:32692225_T_G:32692225:0,3,0,1
chr1	32692231	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=172,202;MMQ=58,30;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:32692225_T_G:32692225:0,3,0,1
chr1	32740999	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,6:0.088:75:43,5:26,1:34,35,3,3
chr1	32757682	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.396:10:0,0:5,1:6,0,4,0
chr1	32768162	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=115,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:7,0,0,2
chr1	32782245	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.340:45:16,5:13,10:24,6,11,4
chr1	33060879	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:8,1:2,1:0,10,0,2
chr1	33087578	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=190,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:33087578_A_C:33087578:0,3,0,1
chr1	33087580	.	AA	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=190,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:33087578_A_C:33087578:0,3,0,1
chr1	33117071	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=216.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,32:0,27:0,0,10,49
chr1	33134774	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=155.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,20:0,25:0,0,25,20
chr1	33134989	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=157.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,22:0,19:0,0,18,26
chr1	33135035	.	A	AT	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=166,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.169:33:16,2:11,3:15,13,3,2
chr1	33138516	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,9:0,0,5,19
chr1	33146113	.	CT	C,CTT	.	.	DP=130;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=135,139,196;MMQ=60,54,51;MPOS=9,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=21.75,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:88,17,6:0.147,0.045:111:53,11,3:32,6,3:54,34,16,7
chr1	33219795	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.390:15:2,1:3,1:0,9,0,6
chr1	33233323	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	33234153	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	33236852	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=230,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:2,6,2,7
chr1	33237885	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,12:0.361:34:10,1:7,1:0|1:33237885_A_C:33237885:2,20,12,0
chr1	33237889	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,12:0.333:37:13,3:8,6:0|1:33237885_A_C:33237885:3,22,12,0
chr1	33237892	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,12:0.333:37:13,0:9,3:0|1:33237885_A_C:33237885:3,22,12,0
chr1	33237897	.	CAGTTA	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,12:0.302:41:14,4:10,6:0|1:33237885_A_C:33237885:6,23,12,0
chr1	33252099	.	TCACATGCATGACTATTCCTAGCC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.358:13:1,2:6,2:0,9,0,4
chr1	33256884	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:4,4:4,7:2,7,3,8
chr1	33276424	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr1	33292522	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:13,0:13,2:14,12,0,2
chr1	33293748	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr1	33318634	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	33318847	.	GG	TA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=217,220;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:3,1:1,0:0|1:33318847_GG_TA:33318847:0,4,0,1
chr1	33318850	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=217,220;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	33318859	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=203,220;MMQ=50,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:33318847_GG_TA:33318847:0,4,0,1
chr1	33318863	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=219,220;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:33318847_GG_TA:33318847:0,3,0,1
chr1	33318866	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,23;MFRL=219,220;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:33318847_GG_TA:33318847:0,3,0,1
chr1	33318869	.	GT	AC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,21;MFRL=219,220;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:33318847_GG_TA:33318847:0,3,0,1
chr1	33330432	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr1	33409551	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=132,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:6,3:0,2:6,0,5,0
chr1	33409833	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:3,0:0,2:0,4,0,2
chr1	33409845	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:33409845_C_CTA:33409845:0,4,0,1
chr1	33409847	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:33409845_C_CTA:33409845:0,4,0,1
chr1	33414059	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=189,228;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:0,6,0,4
chr1	33476292	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=189,12810245;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,3:5,1:10,2,4,0
chr1	33476353	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=148,146;MMQ=60,29;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:11,4:16,1:21,8,2,3
chr1	33476385	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=152,2577;MMQ=60,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,6:0.143:47:18,4:20,1:0|1:33476385_C_G:33476385:26,15,3,3
chr1	33476387	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=151,2577;MMQ=60,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,6:0.140:48:18,4:21,2:0|1:33476385_C_G:33476385:26,16,3,3
chr1	33476396	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=152,2577;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,6:0.135:50:19,4:25,2:0|1:33476385_C_G:33476385:26,18,3,3
chr1	33476404	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=155,2577;MMQ=60,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,6:0.135:50:19,4:22,1:0|1:33476385_C_G:33476385:25,19,3,3
chr1	33478834	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=161,147;MMQ=60,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.103:56:25,2:25,3:43,8,5,0
chr1	33478854	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=10;MBQ=27,31;MFRL=155,150;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,6:0.114:59:29,3:22,3:39,14,6,0
chr1	33478872	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=155,147;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,5:0.107:54:23,3:22,2:0|1:33478872_G_A:33478872:33,16,5,0
chr1	33478878	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=10;MBQ=29,33;MFRL=156,135;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,6:0.117:58:23,4:25,1:0|1:33478872_G_A:33478872:33,19,5,1
chr1	33478888	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=10;MBQ=32,30;MFRL=151,143;MMQ=60,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,8:0.143:61:30,5:22,3:0|1:33478872_G_A:33478872:27,26,5,3
chr1	33478900	.	T	A	.	.	DP=62;ECNT=10;MBQ=28,26;MFRL=150,139;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,9:0.154:60:27,6:23,2:22,29,2,7
chr1	33478920	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=10;MBQ=33,29;MFRL=151,148;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,12:0.196:64:30,6:22,6:17,35,1,11
chr1	33478931	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=151,148;MMQ=60,33;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,16:0.232:71:30,9:25,7:16,39,3,13
chr1	33478959	.	C	G	.	.	DP=72;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=151,152;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,11:0.171:68:29,6:28,5:13,44,2,9
chr1	33478983	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=10;MBQ=32,27;MFRL=151,123;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.081:59:28,3:25,1:7,48,1,3
chr1	33487341	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.084:57:29,0:24,4:15,38,0,4
chr1	33560338	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=91.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,5,21
chr1	33563824	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=185,253;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:4,2:9,0:0|1:33563824_A_G:33563824:0,14,0,2
chr1	33563825	.	T	TGTG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=185,253;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:0|1:33563824_A_G:33563824:0,14,0,2
chr1	33741615	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=193,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr1	33760743	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=212.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,34:0,24:0,0,49,10
chr1	33778226	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:1,4,0,6
chr1	33778591	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	33794416	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	33796891	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.409:13:5,0:1,5:8,0,5,0
chr1	33799658	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.193:19:9,2:7,0:16,0,3,0
chr1	33820508	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.109:39:15,0:19,3:24,11,1,3
chr1	33836796	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	33954696	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:10,9:9,6:10,9,9,6
chr1	33959758	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:19,1:12,1:30,2,2,0
chr1	33961147	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,6:1,3:0,2,0,9
chr1	33985353	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,27:0.559:48:8,10:13,16:13,8,17,10
chr1	33987017	.	TCCCA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=102,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCA;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.283:5:1,0:1,1:2,2,1,0
chr1	34043169	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	34049507	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,37;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	34052605	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=231,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,2:2,3:5,0,5,0
chr1	34070826	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,21,3
chr1	34071434	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr1	34189831	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:2,3:9,10:9,2,4,9
chr1	34189917	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:1,3,0,7
chr1	34189957	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr1	34238146	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,9:0,0,20,3
chr1	34257961	.	A	ACCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,18;RU=C;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.414:7:1,1:2,0:0|1:34257961_A_ACCCCCCCCCCCCCC:34257961:1,3,3,0
chr1	34257966	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=126,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.586:8:2,1:1,0:0|1:34257961_A_ACCCCCCCCCCCCCC:34257961:0,3,5,0
chr1	34257971	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.318:7:3,1:1,1:0|1:34257961_A_ACCCCCCCCCCCCCC:34257961:2,3,2,0
chr1	34286218	.	G	GAGATTGGGTAGTAAGTGGAGTAAAGCTTTGCACAGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=206,122;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	34330459	.	TG	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=218,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0|1:34330459_TG_AT:34330459:0,1,0,1
chr1	34330467	.	T	TCATGCAACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34330459_TG_AT:34330459:0,0,0,1
chr1	34684463	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	35135315	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=132,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.579:31:4,9:8,9:4,9,8,10
chr1	35250703	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:13,10,2,0
chr1	35250720	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:2,9:8,6:5,5,9,6
chr1	35261044	.	CAG	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=107.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,16:0,0,8,17
chr1	35261405	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=137,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr1	35350573	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,3:6,1,2,5
chr1	35454604	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:1,12,0,2
chr1	35480506	.	CACAT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,1:9,2:5,15,2,1
chr1	35561401	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:5,2:19,1:22,4,3,0
chr1	35561510	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=128.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,18:0,21:0,0,14,27
chr1	35563206	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=77.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,3,18
chr1	35570453	.	G	GAAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	35576145	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	35578911	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.517:35:6,9:9,8:7,10,11,7
chr1	35790893	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:9,4:8,0:17,2,4,0
chr1	35826959	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=169,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,2:5,0:0,12,0,3
chr1	35858371	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=181,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:11,0:13,3:0|1:35858371_T_A:35858371:1,26,0,3
chr1	35858379	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:10,0:13,3:0|1:35858371_T_A:35858371:1,22,0,3
chr1	35879555	.	CT	C	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,4:0.071:67:24,1:37,3:55,8,4,0
chr1	35879693	.	AT	A,ATT	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=28,27,20;MFRL=153,138,104;MMQ=60,60,60;MPOS=22,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=4.51,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:46,4,5:0.083,0.081:55:25,2,2:20,2,2:19,27,2,7
chr1	35906751	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:22,0:11,2:6,28,0,2
chr1	35925861	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,19,3
chr1	35928179	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,1:1,6:1,0,7,1
chr1	36019913	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.282:14:3,2:7,2:10,0,3,1
chr1	36023659	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr1	36060128	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=141,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:12,1:11,2:11,14,1,2
chr1	36205166	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,5:0,1:0,0,0,8
chr1	36213712	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	36282399	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=148,167;MMQ=40,55;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.381:3:1,1:1,0:0|1:36282399_CA_C:36282399:2,0,1,0
chr1	36282417	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=173,167;MMQ=40,55;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.666:10:2,1:0,6:0|1:36282399_CA_C:36282399:3,0,6,1
chr1	36298033	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,10;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.490:8:0,0:2,0:0|1:36298033_C_A:36298033:3,1,4,0
chr1	36298045	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:4,1:3,0:0|1:36298033_C_A:36298033:4,3,2,0
chr1	36307412	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AT;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.822:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	36316400	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=19,27;MFRL=151,231;MMQ=57,38;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:0,0:1,2:0|1:36316400_AC_A:36316400:3,1,2,0
chr1	36316407	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=151,231;MMQ=60,38;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:0,0:4,1:0|1:36316400_AC_A:36316400:3,3,2,0
chr1	36316415	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=146,231;MMQ=60,38;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:3,0:0|1:36316400_AC_A:36316400:7,6,2,0
chr1	36316418	.	C	A,CA,CAA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,13,18,32;MFRL=205,217,73,73;MMQ=60,40,60,57;MPOS=5,8,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.35,17.27,4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,3,8,2:0.210,0.474,0.159:15:0,0,2,0:2,1,1,2:2,0,7,6
chr1	36319060	.	GT	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=138,156;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,1:7,1:0|1:36319060_GT_G:36319060:17,6,1,1
chr1	36319065	.	GC	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=138,156;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.130:30:11,2:10,1:0|1:36319060_GT_G:36319060:18,8,1,3
chr1	36319070	.	GT	G	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=130,156;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:16,1:13,1:0|1:36319060_GT_G:36319060:20,17,1,1
chr1	36319075	.	GT	G	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=138,156;MMQ=60,49;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:22,1:16,1:0|1:36319060_GT_G:36319060:20,21,1,1
chr1	36359631	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,0:7,3:10,2,0,3
chr1	36448146	.	TTC	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TC;STR;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.501:24:8,7:4,5:11,1,10,2
chr1	36551398	.	GAT	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=196,149;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:5,0:0|1:36551398_GAT_G:36551398:14,0,2,0
chr1	36551401	.	G	GCA	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=196,149;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:6,0:0|1:36551398_GAT_G:36551398:14,0,2,0
chr1	36551403	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=187,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,1:7,0:0|1:36551403_G_A:36551403:15,0,1,1
chr1	36551412	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,2:9,0:0|1:36551403_G_A:36551403:13,4,1,1
chr1	36551416	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=161,67;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:9,0:0|1:36551403_G_A:36551403:14,4,1,1
chr1	36556779	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:5,1,6,0
chr1	36563158	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,14,5
chr1	36565584	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,11:0,0,21,1
chr1	36565617	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=104.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,23,8
chr1	36602943	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,12:0,0,3,26
chr1	36640404	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=133,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:36640404_A_C:36640404:1,1,1,0
chr1	36640409	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=37,12;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,0:0|1:36640404_A_C:36640404:2,0,1,0
chr1	36640413	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,10;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,0:0|1:36640404_A_C:36640404:2,0,1,0
chr1	36641729	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	36762396	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr1	36767114	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=196,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:16,2:10,0:26,2,2,0
chr1	36773819	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr1	36824070	.	TTT	AGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr1	36824321	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:2,2:4,5:6,1,5,2
chr1	36884473	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=158,189;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr1	36884530	.	GA	G,AA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,32,30;MFRL=109,168,171;MMQ=60,60,60;MPOS=20,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.27,17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,8:0.242,0.434:17:4,0,3:1,4,4:5,0,9,3
chr1	36887702	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.504:20:4,5:5,5:8,2,9,1
chr1	36888302	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.337:19:4,3:6,3:9,4,6,0
chr1	36921371	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:6,9:7,7:10,3,12,4
chr1	36929673	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.381:27:10,5:6,5:16,1,9,1
chr1	36937878	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,5:9,7:7,8,8,4
chr1	36940880	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=203,198;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:17,0,2,0
chr1	37319212	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=165,260;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:13,0:4,3:15,3,3,0
chr1	37335458	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr1	37335485	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr1	37335494	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	37948212	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr1	37959450	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=33,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=163.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,53:0.949:55:0,26:2,24:2,0,10,43
chr1	37959470	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=143.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,20:0,19:0,0,7,34
chr1	37961613	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.401:18:5,4:6,3:1,10,0,7
chr1	38006359	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr1	38022452	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=185,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=149.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.957:44:1,21:0,22:1,0,43,0
chr1	38030696	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=74.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,7,14
chr1	38049373	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	38049552	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr1	38052867	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,176;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	38052881	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=171,147;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.313:13:3,1:5,1:8,1,3,1
chr1	38172822	.	G	GCCCAAAGTTAATGTCAACGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	38186130	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:16,6,1,1
chr1	38260061	.	CCCG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	38260503	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	38288417	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=230,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38288417_A_T:38288417:1,0,0,1
chr1	38288421	.	A	AATATGCTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=230,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0|1:38288417_A_T:38288417:1,0,0,1
chr1	38301250	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	38301476	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0|1:38301476_G_A:38301476:0,0,0,6
chr1	38301490	.	T	TTAGCCGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=232,158;MMQ=60,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:1,0:1,1:0|1:38301476_G_A:38301476:0,3,0,1
chr1	38301495	.	TC	CG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=205,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38301476_G_A:38301476:0,2,0,1
chr1	38327935	.	CAG	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,5:3,4:9,1,9,0
chr1	38327982	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0,0,13,9
chr1	38328154	.	GAC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	38334317	.	TC	AA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr1	38345896	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	38425724	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=207,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:1,1:2,1,2,1
chr1	38425895	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:9,1:2,5:2,9,1,5
chr1	38444333	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=182,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,5:6,5:10,0,8,2
chr1	38444749	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=129,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:3,7,1,5
chr1	38450506	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=149,145;MMQ=60,38;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,0:4,2:6,10,0,2
chr1	38450518	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=154,145;MMQ=60,38;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:3,10,0,2
chr1	38453576	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=206,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:4,3:1,6,1,4
chr1	38455389	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=189,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:1,3:7,3:1,7,1,6
chr1	38464639	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=132.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,19:0,0,22,14
chr1	39332608	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:4,10,1,1
chr1	39333118	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=218,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.439:9:4,3:1,1:5,0,4,0
chr1	39341955	.	T	TTTTTA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=176,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:11,1:6,1:0|1:39341955_T_TTTTTA:39341955:0,17,1,1
chr1	39341957	.	G	GTTTTTTT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=176,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,10;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:11,1:6,0:0|1:39341955_T_TTTTTA:39341955:0,17,1,1
chr1	39342038	.	CAG	TGA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39342038_CAG_TGA:39342038:0,0,0,1
chr1	39342045	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39342038_CAG_TGA:39342038:0,0,0,1
chr1	39352116	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:4,2,2,1
chr1	39381448	.	G	C,A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32,28;MFRL=210,154,182;MMQ=60,60,60;MPOS=8,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.286,0.428:4:0,0,2:1,1,0:0,1,1,2
chr1	39381452	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39381452_GC_G:39381452:1,1,0,1
chr1	39381454	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39381452_GC_G:39381452:1,1,0,1
chr1	39494707	.	T	TGTCTCCAAAAATAAAAAAAAAAAAAGACAGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,188;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.322:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr1	39550210	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	39715857	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=179,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr1	39748074	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=173,234;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,0:9,3:0,17,3,0
chr1	39753000	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,1:11,1:12,6,1,1
chr1	39763242	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:3,2,5,0
chr1	39765798	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,229;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:7,0,2,0
chr1	39766055	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:3,1:5,4:2,7,1,4
chr1	39775451	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:39775451_T_G:39775451:0,2,0,1
chr1	39775453	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:39775451_T_G:39775451:0,2,0,1
chr1	39797473	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=145,151;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.100:48:21,4:20,0:34,10,4,0
chr1	39798156	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,168;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.115:33:11,0:16,3:18,12,0,3
chr1	39812620	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr1	39824718	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:11,5:9,2:18,2,6,1
chr1	39878307	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=190,214;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.164:20:5,0:11,2:4,13,0,3
chr1	39879781	.	TC	AA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=170,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.258:17:5,0:6,1:8,5,4,0
chr1	39881006	.	AT	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.161:38:11,4:12,0:12,20,1,5
chr1	39881040	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,8:5,4:1,13,0,12
chr1	39881165	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=240,116;MMQ=60,37;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr1	39882001	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:6,1:14,6:8,12,1,6
chr1	39882158	.	A	AACTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	39889677	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:12,5:8,14:13,7,11,8
chr1	39889906	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.088:37:20,0:14,2:3,31,3,0
chr1	39893093	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.368:28:9,4:8,6:11,7,8,2
chr1	39894839	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=165.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,25:0,19:0,0,42,4
chr1	39895460	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.631:28:3,8:7,9:7,3,14,4
chr1	39914363	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,5:4,2:7,3,5,2
chr1	39919346	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.374:27:11,6:6,3:13,4,8,2
chr1	39923984	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,3:6,0:14,0,3,0
chr1	39927507	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr1	39929240	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:4,4:11,3:10,5,6,1
chr1	39977531	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=234,221;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	39988004	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=14,14;MFRL=197,166;MMQ=40,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.245:27:5,1:3,1:20,1,6,0
chr1	39988034	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=150,195;MMQ=52,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:18,4:6,1:22,6,5,0
chr1	40035290	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:17,3:29,0:21,26,2,1
chr1	40092089	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	40096053	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=196,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:1,8,1,6
chr1	40097136	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,3:5,0:9,1,3,0
chr1	40098484	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr1	40207169	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr1	40209408	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=212,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	40214525	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.429:21:6,5:6,3:12,0,8,1
chr1	40218843	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:6,1,2,0
chr1	40219065	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,5:2,2:0,8,2,6
chr1	40226046	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.590:10:2,2:1,2:3,1,6,0
chr1	40229297	.	A	AC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=230,223;MMQ=34,27;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=39.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.735:17:1,4:3,8:4,0,12,1
chr1	40229319	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=231,212;MMQ=40,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:1,5:2,11:3,0,14,2
chr1	40319587	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr1	40432897	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:1,1:3,4:0,5,1,4
chr1	40533266	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=178.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.978:44:0,25:0,17:0|1:40533266_T_G:40533266:0,0,7,37
chr1	40533287	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=145.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,18:0,15:0|1:40533266_T_G:40533266:0,0,1,33
chr1	40535645	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=193,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:16,17:4,4:0,21,0,22
chr1	40536074	.	C	CT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=150.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,16:0,20:0,0,31,8
chr1	40542665	.	C	CAAGGTGCTCTGACACTTTTGAGCACCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=225,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	40545964	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	40556922	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr1	40557656	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,5:0,0,11,0
chr1	40558256	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr1	40559555	.	CAAAA	C,CAA,CAAA	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=34,15,29,18;MFRL=149,135,164,124;MMQ=55,60,60,60;MPOS=9,12,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=21,17,19,20;RU=A;STR;TLOD=5.12,6.53,13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,3,6,12:0.115,0.224,0.467:26:2,0,3,3:1,0,1,2:3,2,8,13
chr1	40559686	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.358:37:11,4:13,9:0,24,0,13
chr1	40562993	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	40701378	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.486:27:5,5:8,8:13,1,13,0
chr1	40705427	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.520:48:9,11:14,13:15,8,18,7
chr1	40737516	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,20,2
chr1	40768739	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:10,2:21,0,2,0
chr1	40771973	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,0:0,0,0,5
chr1	40776498	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40776498_C_CA:40776498:0,0,0,1
chr1	40776501	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40776498_C_CA:40776498:0,0,0,1
chr1	40776504	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40776498_C_CA:40776498:0,0,0,1
chr1	40777842	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=189,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:6,5:7,4:0,13,0,9
chr1	40778377	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.417:34:10,8:10,6:13,7,9,5
chr1	40781185	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:4,1:3,5,2,0
chr1	40781191	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,1:3,5,3,0
chr1	40781199	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:7,0:5,0:7,5,2,0
chr1	40839899	.	G	A	.	.	DP=143;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=135.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,56:0.427:131:36,19:31,31:39,36,28,28
chr1	40840270	.	T	TGC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=154,123;MMQ=53,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	40840296	.	T	TGA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=221,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=GA;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.786:15:1,2:2,7:3,0,8,4
chr1	40840353	.	A	G	.	.	DP=84;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,34:0.422:81:22,20:24,14:24,23,14,20
chr1	40879808	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,19,2
chr1	40955156	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,4:6,3:10,0,7,0
chr1	40955375	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:0,6,0,7
chr1	40961706	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:4,2:15,0:0|1:40961706_G_GA:40961706:0,19,0,2
chr1	40961707	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:4,2:15,0:0|1:40961706_G_GA:40961706:0,19,0,2
chr1	41007403	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:8,2:4,5:3,9,0,8
chr1	41101572	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr1	41107360	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,9:0,0,3,15
chr1	41235177	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=89.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,1,23
chr1	41282919	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=149,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.249:26:7,4:13,2:0|1:41282919_C_T:41282919:15,5,2,4
chr1	41282921	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=149,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:7,4:13,2:0|1:41282919_C_T:41282919:15,5,2,4
chr1	41284366	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	41284406	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr1	41284509	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:41284509_C_G:41284509:0,0,8,1
chr1	41284520	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=56.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,2:0,8:0|1:41284509_C_G:41284509:0,0,12,1
chr1	41284527	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0|1:41284509_C_G:41284509:0,0,12,1
chr1	41285553	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.646:12:3,3:1,5:1,3,5,3
chr1	41296705	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,1:3,0:3,1,4,0
chr1	41298652	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,6:0,0:4,0,5,1
chr1	41300742	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=158,81;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.114:46:22,0:19,4:16,25,2,3
chr1	41303399	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,2:5,0:7,9,2,0
chr1	41456823	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.637:8:0,0:1,0:2,1,5,0
chr1	41466803	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.603:28:5,8:5,8:2,9,3,14
chr1	41474352	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:21,3:19,0:18,23,3,0
chr1	41475085	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:7,4:11,3:17,1,6,1
chr1	41494222	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.382:37:14,9:8,4:12,11,11,3
chr1	41540853	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,18:0.514:35:7,15:8,3:0|1:41540853_A_T:41540853:14,3,14,4
chr1	41540861	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,18:0.500:36:10,13:8,3:0|1:41540853_A_T:41540853:14,4,14,4
chr1	41618442	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=202,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr1	41848060	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	41949628	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr1	41949686	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,9;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.191:22:7,0:8,0:7,11,4,0
chr1	41950312	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:0,7:1,12:0,1,4,15
chr1	41976320	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=190,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:41976320_G_A:41976320:0,5,0,2
chr1	41976328	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.884:6:0,0:0,6:0|1:41976320_G_A:41976320:0,0,0,6
chr1	42046812	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,9:0,6:0,0,10,7
chr1	42049464	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:14,3,2,0
chr1	42049735	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:7,1:6,12,0,2
chr1	42629040	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr1	42693597	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:1,11:0,14:0,1,12,14
chr1	42776699	.	GA	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.090:46:16,3:21,1:37,5,4,0
chr1	42846786	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	42870338	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	42901082	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,1:5,5:6,7,1,5
chr1	42915753	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	43002199	.	AAG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:13,3:10,1:17,8,3,1
chr1	43002347	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:7,2:1,5:0|1:43002347_A_G:43002347:0,9,0,7
chr1	43002358	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:7,4:0,5:0|1:43002347_A_G:43002347:0,8,0,9
chr1	43021810	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,5:3,3:6,3,8,0
chr1	43054894	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=220,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.590:4:0,2:1,0:2,0,2,0
chr1	43055031	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:22,5:13,0:29,6,5,0
chr1	43055243	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=215,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr1	43076555	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=131,240;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr1	43108180	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=149,92;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:16,0:17,4:11,23,0,4
chr1	43110276	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	43111804	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,144;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:20,3:21,0:31,10,3,0
chr1	43124859	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.497:32:6,7:10,8:15,1,16,0
chr1	43124976	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,143;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,6:0.096:71:30,6:33,0:23,42,6,0
chr1	43131725	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,170;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:10,1:18,1:10,18,0,2
chr1	43132134	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=213,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	43200855	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:5,6:7,3:9,3,1,11
chr1	43205605	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=179,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:4,10,2,0
chr1	43213499	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:2,9,0,7
chr1	43213797	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=164,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr1	43220965	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:43220965_G_T:43220965:3,13,0,2
chr1	43220969	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:43220965_G_T:43220965:3,13,0,2
chr1	43228189	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	43239395	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,1:6,3:0,9,0,4
chr1	43240576	.	A	AAAAATTAAAACCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	43296354	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=303,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr1	43300663	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,2:2,6:5,1,6,2
chr1	43300921	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr1	43302971	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr1	43395314	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=197,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,1:8,1:5,11,2,0
chr1	43652281	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	43652369	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,8,8
chr1	43663376	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,3,15
chr1	43672636	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.895:7:0,1:0,5:0,0,2,5
chr1	43680855	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,12,2
chr1	43681184	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr1	43699935	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,11,6
chr1	43700140	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,10:0,0,9,8
chr1	43738829	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.431:11:3,0:3,2:3,3,5,0
chr1	43739323	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,0:12,2:9,10,1,1
chr1	43739714	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:43739714_A_G:43739714:0,4,0,1
chr1	43739717	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:43739714_A_G:43739714:0,4,0,1
chr1	43739718	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:43739714_A_G:43739714:0,4,0,1
chr1	43739720	.	C	CGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:43739714_A_G:43739714:0,4,0,1
chr1	43749030	.	GGC	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=178,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,2:10,0:0|1:43749030_GGC_G:43749030:0,18,0,2
chr1	43749035	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=184,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:5,1:10,0:0|1:43749030_GGC_G:43749030:0,18,0,2
chr1	43771016	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.487:35:8,9:10,8:9,9,8,9
chr1	43771090	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=190,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:3,2:0,8,0,6
chr1	43773033	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr1	43774878	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,1,4
chr1	43777852	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:0,3:6,2:1,5,0,5
chr1	43782846	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:1,4:2,2:2,1,6,1
chr1	43812075	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,3:1,8:4,0,8,4
chr1	43814864	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=132,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr1	43825583	.	T	TTGAG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAG;STR;TLOD=53.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.482:29:7,6:8,8:11,4,6,8
chr1	43826312	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.648:18:2,5:4,6:4,2,7,5
chr1	43828633	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=158,241;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.054:71:36,2:31,1:42,26,2,1
chr1	43828861	.	G	GT	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.128:41:12,1:22,3:0,36,0,5
chr1	43828873	.	A	ACTTTT	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:15,0:23,3:0|1:43828873_A_ACTTTT:43828873:0,41,0,3
chr1	43828875	.	T	TTTTAGGTTCTGGGGTA	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:14,0:26,3:0|1:43828873_A_ACTTTT:43828873:0,41,0,3
chr1	43855546	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=208,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr1	43855578	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=208,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:0,9,0,5
chr1	43869235	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,4:5,5:4,3,8,1
chr1	43893759	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,1:9,1:7,11,1,1
chr1	43895918	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:5,3:2,3:6,2,6,0
chr1	43901011	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,1:4,7:0,7,0,8
chr1	43903589	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.549:25:7,9:4,3:1,10,1,13
chr1	43904316	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:4,0,7,0
chr1	43905819	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,1:0,2:0,2,0,4
chr1	43906328	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:43906328_T_A:43906328:0,3,0,1
chr1	43906330	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:43906328_T_A:43906328:0,3,0,1
chr1	43906350	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43906350_CT_C:43906350:0,0,0,1
chr1	43906353	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43906350_CT_C:43906350:0,0,0,1
chr1	43906357	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43906350_CT_C:43906350:0,0,0,1
chr1	43909265	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:2,2,4,0
chr1	43912590	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=208,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	43915842	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.325:23:9,5:4,2:8,8,5,2
chr1	43917409	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.517:33:8,8:7,8:5,11,7,10
chr1	43917797	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=212,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:3,7:0,3:1,2,1,9
chr1	44035472	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr1	44070691	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr1	44071853	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	44071948	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,264;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:9,0:17,4,2,0
chr1	44072420	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	44072669	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr1	44075227	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,1,17
chr1	44078384	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=131.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,22:0,15:0,0,32,5
chr1	44078602	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr1	44079411	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,21:0,11:0,0,8,26
chr1	44083015	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr1	44083110	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,13:0,10:0,0,12,12
chr1	44085091	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,0:6,2:7,12,0,2
chr1	44085844	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.488:41:12,13:9,6:5,16,8,12
chr1	44086080	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,12,1
chr1	44087496	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	44157928	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,3:13,0:10,15,3,0
chr1	44386305	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,1:0,3:0,0,2,3
chr1	44386615	.	AT	GT,GG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34,36;MFRL=0,143,201;MMQ=60,60,60;MPOS=12,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=46.35,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,13,2:0.799,0.147:15:0,4,0:0,9,2:0,0,2,13
chr1	44395786	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,4:0,0,8,6
chr1	44415415	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,8,12
chr1	44423259	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:13,0:8,2:2,20,0,2
chr1	44425924	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:19,3:25,0:35,10,3,0
chr1	44426025	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,10:0,19:0,0,4,27
chr1	44426948	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,15:0,0,5,25
chr1	44432500	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr1	44447034	.	TCCCG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=107,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44447034_TCCCG_T:44447034:0,1,0,1
chr1	44447039	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=107,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44447034_TCCCG_T:44447034:0,1,0,1
chr1	44447046	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=107,162;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44447034_TCCCG_T:44447034:0,1,0,1
chr1	44457739	.	T	TC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=84.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,13:0,0,10,13
chr1	44457815	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=136,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.696:8:1,0:1,0:0|1:44457815_A_C:44457815:0,2,6,0
chr1	44457823	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,19;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.493:12:1,2:2,1:0|1:44457815_A_C:44457815:1,5,6,0
chr1	44457824	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,11;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.493:12:3,0:2,0:0|1:44457815_A_C:44457815:1,5,6,0
chr1	44457830	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.430:14:4,4:4,1:0|1:44457815_A_C:44457815:3,5,6,0
chr1	44461396	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:4,4:7,3:3,8,1,7
chr1	44595916	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,3:3,2:0,10,0,5
chr1	44679556	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=161.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,18:0,23:0,0,10,39
chr1	44684995	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:2,1,3,0
chr1	44687375	.	T	TAGTGATTTAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=170,263;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:44687375_T_TAGTGATTTAG:44687375:1,2,0,1
chr1	44687376	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=170,263;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:44687375_T_TAGTGATTTAG:44687375:1,2,0,1
chr1	44687386	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,36;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44687386_T_G:44687386:1,1,0,1
chr1	44687396	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=15,18;MFRL=207,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.530:2:0,0:0,0:0|1:44687386_T_G:44687386:0,1,0,1
chr1	45097922	.	T	G	.	.	DP=103;ECNT=5;MBQ=25,11;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,12:0.115:99:45,0:35,1:72,15,0,12
chr1	45097929	.	T	G	.	.	DP=92;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,8:0.077:90:36,0:31,0:0|1:45097929_T_G:45097929:69,13,0,8
chr1	45097931	.	C	G	.	.	DP=86;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,8:0.084:83:34,1:30,1:0|1:45097929_T_G:45097929:64,11,0,8
chr1	45097934	.	T	G	.	.	DP=85;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,9:0.100:80:35,0:31,1:0|1:45097929_T_G:45097929:61,10,0,9
chr1	45097936	.	CT	GG	.	.	DP=95;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,7:0.069:84:35,1:33,0:64,13,0,7
chr1	45190723	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=195,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.325:12:3,1:2,0:8,0,4,0
chr1	45205598	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.507:47:17,11:6,11:18,5,16,8
chr1	45212979	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,35,34,34;MFRL=153,90,139,150;MMQ=60,58,60,60;MPOS=23,16,3;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.36,3.31,5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:14,2,3,3:0.121,0.145,0.152:22:5,2,2,2:9,0,1,1:14,0,8,0
chr1	45213003	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=146,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.165:39:12,0:14,0:24,8,7,0
chr1	45213021	.	G	T	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.066:56:21,0:22,0:0|1:45213021_G_T:45213021:35,18,3,0
chr1	45213024	.	G	T	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=33,16;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,3:0.063:58:23,0:22,0:0|1:45213021_G_T:45213021:35,20,3,0
chr1	45216038	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,3:1,0,6,0
chr1	45223901	.	TATTAGCTG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTAGCTG;STR;TLOD=39.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	45241374	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:5,6:1,4:1,5,1,10
chr1	45266832	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:6,3:6,4:4,9,3,4
chr1	45267456	.	GGGGA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGGA;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.170:15:6,1:6,1:13,0,2,0
chr1	45268356	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:11,0,4,0
chr1	45268382	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.663:19:3,8:3,3:6,0,12,1
chr1	45271097	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.372:33:9,6:11,6:7,14,7,5
chr1	45271828	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=231,232;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,3:3,2:0,6,2,3
chr1	45271912	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=348,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:3,0:0,2:0,3,1,2
chr1	45291908	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.514:27:6,5:7,8:8,5,9,5
chr1	45294156	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,8:0,0,8,9
chr1	45296752	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,2:4,6:1,8,1,7
chr1	45297753	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:3,4,4,5
chr1	45307506	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=95.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,14:0,17:0,0,16,16
chr1	45340282	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr1	45345446	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,5:7,3:8,0,4,4
chr1	45362992	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr1	45407181	.	CT	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.114:42:16,2:19,2:26,12,3,1
chr1	45443894	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=1296,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr1	45469329	.	GA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:12,0:15,4:15,13,4,0
chr1	45470119	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=214,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:2,1:4,4:1,6,3,2
chr1	45470130	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr1	45472798	.	TTGTGTG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=225,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=TG;STR;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:1,4:1,2:1,1,7,1
chr1	45473316	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr1	45474157	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,11:0,0,20,4
chr1	45474859	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.141:40:15,0:18,5:13,22,2,3
chr1	45475566	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	45476069	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,4,9
chr1	45480544	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.105:36:16,1:11,0:26,6,0,4
chr1	45480733	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=143.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,22:0,18:0,0,2,39
chr1	45486272	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr1	45501868	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:13,0:19,3:16,16,3,0
chr1	45504524	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,2:0,1:0,0,5,0
chr1	45524213	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	45794426	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr1	45796269	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=102.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,12,17
chr1	45796354	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=152,175;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:1,10,0,2
chr1	45798555	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0,0,14,17
chr1	45805566	.	G	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=211.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,24:0,34:0,0,16,43
chr1	45806933	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.432:49:12,8:15,13:15,13,12,9
chr1	45811742	.	G	GGGACCCAAATGGGGGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=131,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45811742_G_GGGACCCAAATGGGGGTC:45811742:0,1,0,1
chr1	45811746	.	CT	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:45811742_G_GGGACCCAAATGGGGGTC:45811742:0,2,0,1
chr1	45813441	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=206,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:2,6,0,7
chr1	45962115	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=189,115;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr1	45965307	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.548:40:9,9:8,12:2,16,2,20
chr1	45965340	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,1,21
chr1	45981258	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=102,148;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	45981512	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr1	46065998	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=202.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,30:0,28:0,0,48,12
chr1	46074089	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=203,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46074089_TC_T:46074089:0,1,0,1
chr1	46074095	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=203,183;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:46074089_TC_T:46074089:0,1,0,1
chr1	46081035	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.117:49:21,5:23,0:27,17,5,0
chr1	46081940	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,11:0,0,15,7
chr1	46124663	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=88.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,11:0,14:0,0,15,12
chr1	46160260	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr1	46165875	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.901:7:0,0:0,3:0,0,1,6
chr1	46195211	.	TAAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=39.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr1	46195434	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:9,6:6,8:5,10,2,12
chr1	46206540	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr1	46290311	.	GTA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr1	46347910	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=205,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.766:11:2,3:0,3:2,0,8,1
chr1	46424964	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	46473902	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:7,1:4,4:11,0,5,0
chr1	46487560	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=175,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,1:3,4:7,1,5,0
chr1	46487739	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=174,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,2:15,0:5,18,1,1
chr1	46495434	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr1	46495942	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:0,1:7,1:1,6,0,2
chr1	46597496	.	CTTT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.142:23:7,2:8,1:18,2,1,2
chr1	46736558	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	46806429	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=199,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.651:28:1,9:6,9:9,1,18,0
chr1	46806480	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=196,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.571:33:3,6:11,13:10,4,17,2
chr1	46810405	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=214,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,0:4,6:6,0,7,0
chr1	46810842	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=193,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	46812519	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	46818442	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46818442_G_A:46818442:0,0,1,0
chr1	46818452	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46818442_G_A:46818442:0,0,1,0
chr1	46818479	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	46818508	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	46826587	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,1:2,1:0,2,0,3
chr1	46827214	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	46877180	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,0:3,5:4,0,5,0
chr1	46976209	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=174,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:8,2:8,6,1,1
chr1	47013364	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=116.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,21:0,10:0,0,28,3
chr1	47014821	.	A	AAAAAG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAG;STR;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,7:0,9:0,0,14,5
chr1	47014966	.	C	CACTCTCCTCCTCTATGTTAATTTTATTCT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.133:22:9,1:9,1:5,15,0,2
chr1	47024308	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.314:19:6,0:7,4:6,7,2,4
chr1	47037894	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.177:20:10,0:3,3:0,17,0,3
chr1	47059934	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	47108828	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr1	47110766	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	47123898	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.313:30:7,4:10,5:3,18,1,8
chr1	47138444	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	47264724	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,5:6,5:11,1,9,1
chr1	47276728	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,2:0,4:3,0,6,0
chr1	47276875	.	TCCCTG	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCTG;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:12,1:12,1:4,20,0,2
chr1	47279789	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:2,2,3,2
chr1	47280085	.	C	CCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=167,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,2:0,3,0,3
chr1	47280746	.	GAT	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=151,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,1:4,2,4,0
chr1	47280859	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:8,5:8,4:0|1:47280859_G_A:47280859:12,4,2,7
chr1	47280884	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,11:0.428:26:6,6:8,4:0|1:47280859_G_A:47280859:10,5,6,5
chr1	47282772	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.457:31:8,4:8,10:10,7,6,8
chr1	47282888	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,1:2,2:0,8,0,3
chr1	47398743	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:13,2:8,6:8,13,1,7
chr1	47400059	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chr1	47402487	.	T	TTG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=13,13;MFRL=145,182;MMQ=50,58;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=TG;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.493:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr1	47402521	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=182,133;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	47402543	.	C	CATGTTCCATAAATATCTATGAGGTCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	47403845	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=129,187;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,0:2,7,0,2
chr1	47497191	.	TCAAAGTCCCCTTTCCATAGTAGAGCATGC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=156,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.122:23:8,0:9,2:3,18,1,1
chr1	47512213	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,156;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:14,0:19,3:16,17,0,3
chr1	47548189	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=144,196;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,0:11,3:3,19,0,3
chr1	47560413	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=176,189;MMQ=57,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:47560413_A_G:47560413:0,17,0,2
chr1	47560415	.	TAG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=176,189;MMQ=57,59;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:6,2:0|1:47560413_A_G:47560413:0,17,0,2
chr1	47571943	.	CT	C,CTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=21,30,22;MFRL=111,155,155;MMQ=60,60,60;MPOS=23,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=11.46,11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,8,6:0.355,0.278:22:2,3,2:5,5,1:2,6,3,11
chr1	47581139	.	GA	G,GAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30,32;MFRL=174,153,253;MMQ=60,60,60;MPOS=18,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.27,4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,3:0.180,0.199:17:6,1,1:4,2,1:10,1,4,2
chr1	47689842	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	47726087	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.492:49:14,15:10,9:17,8,11,13
chr1	47735280	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=207,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr1	47753405	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:0,6,0,5
chr1	47765490	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr1	47767141	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	47770786	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=218,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	47770806	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=171,244;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	47841038	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=207,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	47905555	.	AG	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.752:22:3,12:1,2:3,2,8,9
chr1	47905798	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:5,5,3,0
chr1	47906425	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	49005335	.	G	GACCT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=170,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,0:13,2:0|1:49005335_G_GACCT:49005335:9,11,1,1
chr1	49005337	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=170,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:7,0:13,1:0|1:49005335_G_GACCT:49005335:9,11,1,1
chr1	49052933	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=239,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	49056695	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,1:1,1:0,6,0,2
chr1	49100115	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,152;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,3:13,0:17,6,3,0
chr1	49100332	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr1	49128720	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr1	50317117	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:19,0:23,3:20,22,0,3
chr1	50575570	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.177:32:16,1:10,4:17,10,4,1
chr1	50661138	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=192,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr1	50663196	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=178,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,3:0,2:0,4,1,4
chr1	50666906	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:0,5,0,5
chr1	50957509	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=65.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,24:0.568:42:12,9:6,15:1,17,2,22
chr1	51204626	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:16,0:19,6:6,29,0,6
chr1	51767248	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:7,1:7,9,1,1
chr1	51771780	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,18;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,0:0,3,0,2
chr1	51771790	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:51771790_G_T:51771790:0,0,0,1
chr1	51771797	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:51771790_G_T:51771790:0,0,0,1
chr1	51771799	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:51771790_G_T:51771790:0,0,0,1
chr1	51864916	.	G	GACGTAGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=264,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	51866587	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=154,68;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:18,4:21,0:29,11,3,1
chr1	52237922	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=166,150;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:16,0:6,2:0,23,0,2
chr1	52237925	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=167,150;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:15,0:6,2:0,22,0,2
chr1	52257425	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:52257425_C_T:52257425:0,2,0,1
chr1	52257433	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:52257425_C_T:52257425:0,2,0,1
chr1	52279650	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=131.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,23:0,17:0,0,29,11
chr1	52282078	.	A	G	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,4:0.053:91:46,0:40,4:25,62,0,4
chr1	52293570	.	G	A	.	.	DP=90;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=238.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,40:0,38:0,0,18,60
chr1	52293638	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,14:0,0,0,31
chr1	52306027	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,26:0.545:48:6,9:14,17:5,17,5,21
chr1	52306063	.	ATCT	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=120.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.972:30:0,9:0,21:0,0,6,24
chr1	52398911	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=178,293;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:52398911_A_C:52398911:1,0,1,0
chr1	52398913	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=178,293;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:52398911_A_C:52398911:1,0,1,0
chr1	52398916	.	C	CTTCCTCCAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=16,32;MFRL=178,293;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:0,1:0|1:52398911_A_C:52398911:1,0,1,0
chr1	52402956	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	52489322	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	52517412	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,12,4
chr1	52520783	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=130.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,50:0.579:86:20,17:16,31:7,29,5,45
chr1	52703448	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.556:41:7,9:11,13:10,8,10,13
chr1	52729432	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=12,32;MFRL=239,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.639:3:0,0:0,2:1,0,1,1
chr1	52810711	.	C	CAGTCTCAAGTAATAGTTGCTAACCTGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=186,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr1	52820226	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,16,6
chr1	52827212	.	TTCC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TCC;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:7,1:4,1:7,4,0,2
chr1	52830405	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	52876938	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=181,224;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.313:11:1,0:5,3:0,8,0,3
chr1	52878300	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.411:32:14,8:5,5:6,13,6,7
chr1	52882406	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=156,157;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=94.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,29:0.687:42:8,20:4,9:3,10,6,23
chr1	52889630	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=147,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:13,0:13,2:0|1:52889630_G_C:52889630:12,14,0,2
chr1	52889635	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=147,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:8,2:0|1:52889630_G_C:52889630:10,14,0,2
chr1	52889791	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=174,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	52912122	.	TA	T,TAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,28,25;MFRL=163,158,203;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.47,9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,6:0.152,0.278:22:2,2,2:8,0,2:7,6,4,5
chr1	52947350	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,26;MFRL=240,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.581:10:1,1:1,4:2,2,5,1
chr1	52947433	.	CTA	C,CTATA	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,32,36;MFRL=161,133,212;MMQ=60,60,60;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,5,7;RU=TA;STR;TLOD=6.44,3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,3,2:0.097,0.074:37:14,0,1:17,3,1:26,6,4,1
chr1	52956482	.	GA	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.084:44:17,1:17,2:0,41,1,2
chr1	52959245	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.203:16:7,0:5,3:13,0,2,1
chr1	52975383	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:20,3:24,0:20,25,0,3
chr1	53072327	.	CTTTGT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTGT;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:0,1:3,0,2,0
chr1	53308665	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr1	53323492	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	53333116	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	53364976	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,2,19
chr1	53373505	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=93,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.691:8:0,2:2,4:0|1:53373505_A_C:53373505:1,1,6,0
chr1	53373512	.	CTCCTCCA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.378:13:1,2:4,3:0|1:53373505_A_C:53373505:3,5,5,0
chr1	53387379	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	53407406	.	CA	C,CAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=162,159,135;MMQ=57,60,41;MPOS=29,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=5.88,10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,6:0.277,0.336:17:3,1,2:3,4,4:6,0,11,0
chr1	53504756	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr1	53513437	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,14,0
chr1	53537266	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=164.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,25:0,28:0,0,25,28
chr1	53540363	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.384:13:2,0:2,1:1,7,0,5
chr1	53543112	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	53555617	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,14;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:2,1:1,0:3,2,0,3
chr1	53559239	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53559239_G_T:53559239:0,0,0,1
chr1	53559244	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53559239_G_T:53559239:0,0,0,1
chr1	53571288	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	53608133	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=220,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr1	53662823	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	53684525	.	C	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,13:0.247:55:18,11:22,2:22,20,12,1
chr1	53686383	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,329;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	53692685	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.334:40:8,4:13,4:5,22,13,0
chr1	53692689	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.337:40:11,6:15,5:4,23,13,0
chr1	53746281	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,3:7,0:8,5,1,2
chr1	53755151	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=215,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:2,0,4,1
chr1	53972310	.	GG	CT	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=127,121;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:6,2:0|1:53972310_GG_CT:53972310:11,9,2,0
chr1	53972315	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=135,121;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:5,2:0|1:53972310_GG_CT:53972310:12,9,2,0
chr1	53972319	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=135,121;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:4,2:0|1:53972310_GG_CT:53972310:12,11,2,0
chr1	53972320	.	TGG	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=135,121;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:5,2:0|1:53972310_GG_CT:53972310:12,11,2,0
chr1	53972327	.	GG	AA	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=32,14;MFRL=140,121;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,0:6,0:0|1:53972310_GG_CT:53972310:11,11,2,0
chr1	53972330	.	AGTGGTC	A	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=140,121;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:7,2:0|1:53972310_GG_CT:53972310:12,12,2,0
chr1	53974987	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.377:24:5,5:10,3:3,12,2,7
chr1	54252939	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:54252939_GA_G:54252939:0,2,0,2
chr1	54252961	.	T	TAATGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:54252939_GA_G:54252939:0,3,0,1
chr1	54344282	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	54354658	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.677:19:1,7:4,5:0,6,0,13
chr1	54395673	.	CAAA	C,CAA,CAAAA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,32,32,35;MFRL=142,186,164,175;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,20,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,15,17,19;RU=A;STR;TLOD=3.73,7.34,4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,5,4:0.150,0.278,0.214:19:3,1,2,3:4,2,3,1:6,1,12,0
chr1	54395697	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.217:38:11,1:8,0:23,6,8,1
chr1	54477726	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	54483694	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,9:0,0,16,8
chr1	54502395	.	GA	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:12,2:21,2:12,23,1,3
chr1	54561916	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,20,3
chr1	54605319	.	G	GC	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=211,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=169.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,46:0.960:47:0,20:1,24:0,1,17,29
chr1	54607157	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=99.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,20:0,11:0,0,7,26
chr1	54618435	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,5:0,11:0,0,16,0
chr1	54656651	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:1,4:0,2,0,5
chr1	54675740	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,67;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:8,2:12,6,0,2
chr1	54682044	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,63;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:12,0:7,3:3,16,1,2
chr1	54704462	.	C	CCAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,5:0,10:0,0,6,9
chr1	54704567	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr1	54704965	.	T	TCAACTATCTCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=179,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:54704965_T_TCAACTATCTCC:54704965:0,4,0,1
chr1	54704966	.	A	ACATATACTTTAGACAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=179,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1|0:54704965_T_TCAACTATCTCC:54704965:0,4,0,1
chr1	54871566	.	ACCGC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=14,22;MFRL=200,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCGC;STR;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.788:7:0,2:0,1:1,0,6,0
chr1	54871709	.	T	TCGCCGC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=CGC;STR;TLOD=79.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,5:0,2:0,0,0,18
chr1	55014099	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,11:0,18:0,0,1,28
chr1	55058160	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.478:27:4,2:9,9:12,2,10,3
chr1	55058307	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.187:23:9,0:8,0:9,10,0,4
chr1	55058315	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.202:23:7,2:7,0:7,11,0,5
chr1	55069986	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	55072726	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	55074840	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr1	55080612	.	G	GGTGTGT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=GT;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.396:10:3,1:3,1:0|1:55080612_G_GGTGTGT:55080612:0,6,0,4
chr1	55080627	.	GCA	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,5:0.508:10:2,2:3,3:1|0:55080612_G_GGTGTGT:55080612:0,5,0,5
chr1	55080629	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.839:11:1,3:0,6:0|1:55080612_G_GGTGTGT:55080612:0,1,0,10
chr1	55085499	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	55118566	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,7,5
chr1	55119903	.	G	GATTTTCACAGTGCTTTTCCAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=112,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	55130931	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,6,14
chr1	55130946	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=54.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr1	55130972	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=206,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0,1,0,9
chr1	55134647	.	G	GGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:55134647_G_GGT:55134647:2,2,0,1
chr1	55134650	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:55134647_G_GGT:55134647:2,2,0,1
chr1	55134653	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=18,26;MFRL=242,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:55134647_G_GGT:55134647:2,1,0,1
chr1	55136067	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,12:0,0,17,2
chr1	55139618	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	55203413	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=186,208;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:55203413_G_T:55203413:0,3,0,1
chr1	55203421	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=165,208;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:55203413_G_T:55203413:0,2,0,1
chr1	55224457	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:7,0:15,2:9,13,2,0
chr1	55246883	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	55248117	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:4,15,0,2
chr1	55251689	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr1	55253433	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.460:37:10,11:9,5:13,7,11,6
chr1	55253575	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,7,13
chr1	55253594	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=205,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,4:9,1:5,9,1,4
chr1	55266845	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:1,5,1,7
chr1	55271774	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=201,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:1,1,2,1
chr1	55273422	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=252,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr1	55277430	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	55282847	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,17;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,0:2,0:0|1:55282847_A_C:55282847:0,3,0,2
chr1	55282856	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,0:0,1:0|1:55282847_A_C:55282847:0,0,0,2
chr1	55330966	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=110.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,14:0,15:0,0,19,11
chr1	55340938	.	GG	AA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=153,238;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr1	55446664	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0|1:55446664_G_C:55446664:3,0,3,0
chr1	55446671	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0|1:55446664_G_C:55446664:3,0,3,0
chr1	55457815	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=159,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	55473027	.	G	GAGTTTTGCCAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.469:2:1,1:0,0:0|1:55473027_G_GAGTTTTGCCAA:55473027:0,1,0,1
chr1	55473029	.	G	GAGCTTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55473027_G_GAGTTTTGCCAA:55473027:0,1,0,1
chr1	55505552	.	ACTG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=165,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTG;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:8,0:3,2:4,10,0,2
chr1	55505732	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr1	55517861	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr1	55517883	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,4,2
chr1	55518166	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,2:2,3,2,5
chr1	55518528	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr1	55524116	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,7:0,0,18,5
chr1	55524367	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=14,28;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:55524367_T_C:55524367:0,3,0,1
chr1	55524372	.	GT	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:55524367_T_C:55524367:0,3,0,1
chr1	55525400	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr1	55527323	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,10:0,0,0,21
chr1	55538385	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	55546895	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	55555285	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=124,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=114.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.945:34:1,18:0,15:1,0,24,9
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chr1	55567410	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:1,13:0,9:0,1,1,21
chr1	55572867	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr1	55600131	.	GT	CC	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.139:41:18,0:18,5:2,34,0,5
chr1	55614036	.	CAT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr1	55619422	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	55643837	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	57185818	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,3:6,5:6,4,4,4
chr1	57192353	.	TAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=207,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=A;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	57202872	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=135,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chr1	57216949	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=232,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr1	57219631	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:6,5:3,2:2,7,1,6
chr1	57224460	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,36;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr1	57224529	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57224529_C_CCA:57224529:0,0,0,1
chr1	57224532	.	TT	GG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57224529_C_CCA:57224529:0,0,0,1
chr1	57224537	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57224529_C_CCA:57224529:0,0,0,1
chr1	57340727	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,6,11
chr1	57373744	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,70;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:25,0:21,3:23,24,1,2
chr1	57395020	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:3,0,10,0
chr1	57395251	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,1:0,5,2,2
chr1	57411801	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=160,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr1	57411835	.	G	GAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	57417633	.	G	GGGATGTGTCCAAGGTCACACA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.468:15:4,2:4,3:8,0,6,1
chr1	57422484	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,13,5
chr1	57602334	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:3,3:9,1:4,8,2,2
chr1	57602383	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=215,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	57611144	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr1	58971940	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	58996203	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:2,2:1,4:3,0,6,0
chr1	58996427	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,1:2,3:2,6,1,3
chr1	59002460	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=200,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,2:2,5:0,2,0,7
chr1	59004438	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:9,6:8,7:9,8,10,3
chr1	59004979	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr1	59041809	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:3,5:5,2:6,2,7,1
chr1	59041836	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,0:4,0:5,7,3,0
chr1	59043453	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:0|1:59043453_G_C:59043453:0,8,0,8
chr1	59043457	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:4,5:4,2:0|1:59043453_G_C:59043453:0,8,0,8
chr1	59125860	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=33,34;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.140:21:5,1:11,2:0|1:59125860_C_G:59125860:1,17,1,2
chr1	59125867	.	AGT	A	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=27,28;MFRL=204,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.133:22:8,1:10,2:0|1:59125860_C_G:59125860:0,19,1,2
chr1	59125870	.	ATGAGGGTTTGC	A	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=26,28;MFRL=204,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.140:21:8,1:10,2:0|1:59125860_C_G:59125860:0,18,1,2
chr1	59125884	.	TACTA	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=204,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.171:17:6,1:4,2:0|1:59125860_C_G:59125860:0,14,1,2
chr1	59125891	.	AC	A	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=25,23;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=-95;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.207:14:3,1:5,2:0|1:59125860_C_G:59125860:0,11,1,2
chr1	59125894	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=148,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.347:13:4,2:5,2:0|1:59125894_A_G:59125894:1,8,0,4
chr1	59125896	.	TTCGTCCCTTTCCAGACCTCACATTTCCTAATGCTCAAATGAGAAACA	T	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.207:14:4,1:4,2:0|1:59125860_C_G:59125860:0,11,1,2
chr1	59125899	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=33,27;MFRL=171,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,1:2,2:0|1:59125894_A_G:59125894:0,5,0,4
chr1	59127024	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.449:27:7,6:8,6:9,6,8,4
chr1	59127193	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:10,3:8,7:6,12,1,10
chr1	59131311	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr1	59134586	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,30:0.535:56:12,15:14,15:21,5,26,4
chr1	59134607	.	C	CAG	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=306.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,31:0,36:0,0,51,23
chr1	59139223	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:6,5:5,5:7,4,7,4
chr1	59147420	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:14,7:8,8:18,4,14,1
chr1	59150941	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=97.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,39:0.931:41:1,19:1,19:0,2,8,31
chr1	59150997	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.736:17:3,7:1,5:0,5,0,12
chr1	59156155	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:7,6:4,6:0,11,0,13
chr1	59158632	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,9:7,5:2,11,4,10
chr1	59160724	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=197,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:2,1:4,1:7,0,2,1
chr1	59160735	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,1:4,5:5,2,6,0
chr1	59248813	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,20:0,14:0,0,18,16
chr1	60104108	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:2,0:9,2:0,11,0,2
chr1	60228310	.	T	TTC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:1,7:6,2:2,7,2,7
chr1	60280749	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	60324243	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:1,4,0,4
chr1	60331023	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0,16,0,3
chr1	60338452	.	G	GT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.163:28:10,2:14,2:22,2,4,0
chr1	60392271	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,22:0.365:60:18,10:20,10:21,17,12,10
chr1	60463327	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:4,8,2,0
chr1	60466814	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,12:0,0,5,14
chr1	60466840	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=10,13;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:0,0:1,1:0,5,0,4
chr1	60466911	.	ACAG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr1	60503568	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=221,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	60503594	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr1	60505578	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,12,5
chr1	60505783	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:5,2:8,4:3,10,3,3
chr1	60506744	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,20:0.437:46:11,8:13,10:0|1:60506744_G_A:60506744:14,12,10,10
chr1	60506762	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,23:0.490:47:7,11:15,12:1|0:60506744_G_A:60506744:13,11,14,9
chr1	61548344	.	TTCTC	T,TTC	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=27,26,29;MFRL=153,162,148;MMQ=60,60,60;MPOS=23,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=TC;STR;TLOD=7.54,22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,4,11:0.115,0.298:37:9,1,8:9,3,3:20,2,15,0
chr1	61872216	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,11;MFRL=84,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.727:12:0,1:2,2:1,3,2,6
chr1	61892301	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=50.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr1	62149067	.	CAT	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.156:36:14,2:16,3:31,0,5,0
chr1	62149237	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:10,11:11,11:1,20,0,22
chr1	62149270	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=174,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,3:12,0:0,24,0,3
chr1	62160525	.	T	TTA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=175,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.498:18:3,3:5,6:0|1:62160525_T_TTA:62160525:0,9,1,8
chr1	62160542	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=83.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0|1:62160525_T_TTA:62160525:0,0,1,20
chr1	62231924	.	T	TTGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=179,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGA;STR;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,2:5,1,4,0
chr1	62327170	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.270:13:2,1:5,0:5,5,3,0
chr1	62329885	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,4:4,2,5,3
chr1	62330365	.	C	CTCACTGTGTCTGTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=228,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:62330365_C_CTCACTGTGTCTGTCT:62330365:0,1,0,1
chr1	62330369	.	A	ATCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=228,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:62330365_C_CTCACTGTGTCTGTCT:62330365:0,1,0,1
chr1	62340855	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,7:7,4:11,1,10,1
chr1	62365217	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,10,1
chr1	62365428	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr1	62366878	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	62380223	.	G	T	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,25:0.420:60:19,10:15,14:16,19,14,11
chr1	62380270	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=194.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,25:0,34:0,0,24,37
chr1	62380298	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,23:0.397:58:11,9:24,13:12,23,4,19
chr1	62393394	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,15,7
chr1	62417951	.	A	AG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,11:0,18:0,0,28,1
chr1	62417952	.	A	AG,AGAGAGAG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,31,30;MFRL=0,249,165;MMQ=60,60,60;MPOS=30,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.78,3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.460,0.507:6:0,1,1:0,2,1:0,0,6,0
chr1	62456014	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=129,199;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:7,5:9,3:9,7,4,4
chr1	62456048	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:7,3:5,3:0,13,3,3
chr1	62545085	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr1	62579672	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,8,0
chr1	62579891	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=196,112;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.483:47:16,7:8,13:11,13,7,16
chr1	62587014	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,4:0,7:0,1,0,14
chr1	62594677	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,4:4,9:1,8,0,13
chr1	62673365	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=176,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:0,2,0,7
chr1	62675385	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,4:3,6:4,0,10,0
chr1	62675709	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,33:0.502:63:10,16:13,16:14,16,18,15
chr1	62677048	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=242,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,6:0,1:0|1:62677048_G_T:62677048:0,2,0,7
chr1	62677050	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=242,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,5:1,1:0|1:62677048_G_T:62677048:0,2,0,7
chr1	62677069	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=232,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	62677087	.	A	ATACTCT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,25;MFRL=232,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:62677087_A_ATACTCT:62677087:0,3,0,1
chr1	62677089	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=232,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:62677087_A_ATACTCT:62677087:0,3,0,1
chr1	62677092	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=249,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:62677087_A_ATACTCT:62677087:0,2,0,1
chr1	62713224	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,2,4
chr1	62713253	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:2,7,0,2
chr1	62729015	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:0,8,0,8
chr1	62912919	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=178,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	62939634	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.967:26:0,10:0,16:0,0,18,8
chr1	62953183	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	62961928	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr1	62970389	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,3:12,0:8,14,1,2
chr1	62973795	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr1	63001120	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=174,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:8,1,2,1
chr1	63027411	.	AG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=117.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,10:0,19:0,0,5,26
chr1	63044452	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=154,266;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:16,0:19,2:0|1:63044452_C_T:63044452:24,12,2,0
chr1	63044464	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:33,17:0.342:50:14,8:18,8:1|0:63044452_C_T:63044452:23,10,9,8
chr1	63044466	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=154,266;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:23,0:23,2:0|1:63044452_C_T:63044452:30,18,2,0
chr1	63044645	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,19;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.412:17:2,1:4,2:0,10,0,7
chr1	63049025	.	A	AGAAAGCAATATTAATCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	63050598	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,4:4,2:0,5,0,6
chr1	63064436	.	TT	AC	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,108;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,4:0.053:92:45,0:43,4:27,61,0,4
chr1	63070537	.	AGTTAATGTG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.652:18:3,5:3,7:0,6,0,12
chr1	63085483	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=196,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	63090858	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=220,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:5,0,6,0
chr1	63113511	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,3:2,4:0,8,1,6
chr1	63113689	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	63113719	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr1	63153805	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:63153805_G_C:63153805:0,0,1,0
chr1	63153808	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=156,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:63153805_G_C:63153805:1,0,1,0
chr1	63153810	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=19,12;MFRL=167,265;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:63153805_G_C:63153805:2,0,1,0
chr1	63153814	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=167,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:63153805_G_C:63153805:2,0,1,0
chr1	63269580	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=191,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,2:5,11:0,13,0,13
chr1	63270772	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.523:46:13,13:8,11:22,0,23,1
chr1	63270823	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=91;ECNT=2;MBQ=34,34,32,33;MFRL=161,123,151,129;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,15,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=8.60,19.80,10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:31,7,14,9:0.107,0.219,0.153:61:17,5,6,6:11,1,4,3:25,6,19,11
chr1	63271010	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=78.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,24:0.625:38:7,12:7,11:0,14,0,24
chr1	63285033	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,4:6,4:2,14,1,7
chr1	63307303	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,6:6,6:1,9,0,12
chr1	63871881	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr1	63872871	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	63876843	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:26,0:18,3:31,14,0,3
chr1	63894395	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:9,1,2,0
chr1	63902616	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=167,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.124:38:19,0:13,4:0|1:63902616_G_T:63902616:6,28,0,4
chr1	63902623	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=163,230;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:17,0:15,4:0|1:63902616_G_T:63902616:6,29,0,4
chr1	63912563	.	ACAATT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.501:22:5,7:6,4:0,11,1,10
chr1	63920515	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,1:7,4:12,0,4,1
chr1	63988904	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.417:24:10,6:4,3:0,14,0,10
chr1	63998326	.	GT	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.162:22:7,0:10,3:18,1,3,0
chr1	63999087	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,3:6,7:9,5,7,3
chr1	64015217	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,164;MMQ=55,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.658:33:9,14:2,8:1,10,5,17
chr1	64022708	.	CAA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:64022708_CAA_C:64022708:0,0,1,0
chr1	64022735	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:64022708_CAA_C:64022708:2,0,1,0
chr1	64059472	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	64100478	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.559:34:9,9:5,10:10,5,15,4
chr1	64102114	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.406:10:3,3:3,1:1,5,1,3
chr1	64117537	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=223,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:0,5,1,5
chr1	64125234	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:5,2:9,7:12,2,5,4
chr1	64125368	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,7:3,5:2,4,5,7
chr1	64125439	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,2:3,1:0,4,0,4
chr1	64515744	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64515744_C_G:64515744:0,1,0,1
chr1	64515745	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64515744_C_G:64515744:0,1,0,1
chr1	64515746	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64515744_C_G:64515744:0,1,0,1
chr1	64608059	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:3,3:6,2:9,0,6,0
chr1	64624612	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,13,3
chr1	64680682	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,0,17
chr1	64707243	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=202,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,4:5,2:8,0,6,0
chr1	64726384	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:4,3:3,5:0,8,4,4
chr1	64726414	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=173,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,4:3,0:0,8,0,4
chr1	65068638	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,8:0,0,0,18
chr1	65099701	.	GTT	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.157:21:8,0:6,3:0|1:65099701_GTT_G:65099701:12,6,3,0
chr1	65099716	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,10;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.453:23:3,0:7,0:0|1:65099701_GTT_G:65099701:2,10,11,0
chr1	65099978	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=100.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,17:0,15:0,0,7,25
chr1	65107409	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:6,0:1,2:8,0,2,0
chr1	65124602	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	65124631	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	65138787	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.263:20:9,4:5,1:14,1,5,0
chr1	65141676	.	TTAATAATAA	T,TTAA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,31,31;MFRL=168,151,149;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=TAA;STR;TLOD=12.66,28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,8:0.256,0.635:13:0,4,5:0,0,3:0,1,0,12
chr1	65311116	.	GC	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=205,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:4,0,6,0
chr1	65316675	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=200,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,3:1,6:0,5,0,9
chr1	65321388	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:10,12:9,8:4,15,1,19
chr1	65325970	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.620:24:6,7:2,7:2,7,2,13
chr1	65330682	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:8,3:6,8:1,13,0,11
chr1	65332694	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:14,3:11,0:8,19,0,3
chr1	65830297	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,9,2
chr1	65830299	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=247,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:0,6:1,2:1,0,7,2
chr1	65858088	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:3,6:7,4:10,1,9,1
chr1	65858256	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,5:0.088:66:27,4:29,0:0|1:65858256_G_A:65858256:35,26,5,0
chr1	65858258	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=155,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,5:0.087:66:29,5:32,0:0|1:65858256_G_A:65858256:35,26,5,0
chr1	65860687	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.540:39:7,13:10,8:7,11,6,15
chr1	65867391	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr1	66036501	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	66064293	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=195,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,6:4,0:9,0,6,0
chr1	66067639	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=145,146;MMQ=60,44;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.058:67:33,0:30,3:0|1:66067639_C_T:66067639:18,46,0,3
chr1	66067647	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=141,146;MMQ=60,44;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,3:0.066:58:30,0:22,3:0|1:66067639_C_T:66067639:13,42,0,3
chr1	66070626	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	66081600	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=277,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr1	66713250	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:10,0:20,3:9,21,1,2
chr1	66829262	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.633:39:10,11:4,13:1,13,2,23
chr1	66831256	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:5,0,6,0
chr1	66834595	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,22:0.697:31:6,11:3,11:5,4,8,14
chr1	67154730	.	CA	C,CAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32,33;MFRL=177,237,211;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=3.24,7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,4:0.300,0.509:7:1,0,1:0,2,3:1,0,6,0
chr1	67195184	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:67195184_C_G:67195184:0,0,1,8
chr1	67195192	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0|1:67195184_C_G:67195184:0,0,1,7
chr1	67288045	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:3,5:8,5:9,2,6,4
chr1	67288056	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:13,2:13,10,2,0
chr1	67292473	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:3,4:4,2:0|1:67292473_A_AT:67292473:7,0,5,2
chr1	67292478	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:4,7:2,1:0|1:67292473_A_AT:67292473:6,0,6,3
chr1	67303303	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.429:35:9,11:11,3:18,2,12,3
chr1	67306433	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	67337285	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr1	67359195	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	67396222	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr1	67423997	.	T	TTTCTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr1	67425311	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=195.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,30:0,20:0,0,47,5
chr1	67425476	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,16:0.364:45:16,7:10,9:2,27,1,15
chr1	67425494	.	A	AT	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=202,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=71.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,30:0.805:37:3,20:3,10:0,7,0,30
chr1	67425501	.	T	TTTTTAA	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:24,1:16,1:0|1:67425501_T_TTTTTAA:67425501:0,40,0,2
chr1	67425507	.	C	CTT	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=183,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:25,1:16,1:0|1:67425501_T_TTTTTAA:67425501:0,41,0,2
chr1	67438630	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:15,0:9,15,2,0
chr1	67450431	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:12,9:8,6:11,9,11,4
chr1	67474880	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:8,9:13,5:1,20,0,14
chr1	67487119	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:6,1,6,0
chr1	67487374	.	TCCAACA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=191,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.542:11:3,2:1,4:0|1:67487374_TCCAACA_T:67487374:0,5,2,4
chr1	67487393	.	CAGACACAG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=192,82;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:3,2:1,3:0|1:67487374_TCCAACA_T:67487374:0,4,2,4
chr1	67512903	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=168,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr1	67512920	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:3,0,5,2
chr1	67516191	.	GA	G,GAA	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,32,16;MFRL=155,140,141;MMQ=60,60,60;MPOS=12,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.67,4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:45,4,5:0.081,0.094:54:24,2,2:16,2,0:7,38,0,9
chr1	67560897	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=176,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:4,2,4,3
chr1	67562106	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,5:4,5:0,12,0,10
chr1	67568824	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	67577367	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:8,6:6,9:1,13,2,13
chr1	67591347	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=199,144;MMQ=40,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	67591672	.	A	ACTGTGCTTTCTGTGCTATTGCACTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=211,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr1	67648460	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=146,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,1:2,5:2,0,6,1
chr1	67666401	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:2,3:8,1:8,2,3,2
chr1	67685443	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr1	67702526	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,4:2,8:0,3,1,11
chr1	67705958	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.425:19:5,3:6,4:4,7,2,6
chr1	67792329	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	67796258	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=139,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.776:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr1	67861235	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,128;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:11,2,2,0
chr1	67878789	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:12,2:14,4:27,0,6,0
chr1	67890526	.	A	G	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=285.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,79:0.988:79:0,35:0,43:0,0,64,15
chr1	67895860	.	C	CGGGGT	.	.	DP=75;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.046:69:33,1:32,2:36,30,3,0
chr1	67895863	.	C	G	.	.	DP=79;ECNT=5;MBQ=32,17;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,5:0.067:72:27,1:27,0:33,34,5,0
chr1	67895864	.	TTC	T	.	.	DP=81;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,4:0.042:79:29,0:25,0:41,34,4,0
chr1	67895866	.	CT	GG	.	.	DP=80;ECNT=5;MBQ=32,18;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,10:0.116:77:30,0:24,2:33,34,10,0
chr1	67895873	.	C	G	.	.	DP=81;ECNT=5;MBQ=32,18;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,9:0.129:76:29,0:26,0:31,36,9,0
chr1	68151685	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=103.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.945:34:1,18:0,15:0,1,27,6
chr1	68151980	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,15:0,0,27,1
chr1	68615996	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:26,3:10,0:15,23,3,0
chr1	68624878	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,13:0,0,15,19
chr1	68943436	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0|1:68943436_G_A:68943436:0,0,13,5
chr1	68943442	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0|1:68943436_G_A:68943436:0,0,13,5
chr1	68943665	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:8,3:7,5:1,14,0,8
chr1	68947318	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr1	68952564	.	AAC	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=AC;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.452:15:2,3:2,4:8,0,7,0
chr1	68960476	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	70034370	.	C	CCAGCCGCGTG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,0,16
chr1	70225832	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,2:5,1:11,0,3,0
chr1	70226125	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr1	70397087	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	70587516	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.498:48:8,8:16,15:11,13,7,17
chr1	70621398	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:13,0:22,2:20,15,0,2
chr1	70644691	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.084:45:17,1:25,2:0|1:70644691_C_T:70644691:10,32,0,3
chr1	70644715	.	A	AG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=159,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:30,2:0.088:32:15,0:14,2:1|0:70644691_C_T:70644691:1,29,0,2
chr1	70654804	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:11,2,2,0
chr1	70654990	.	A	ACTAAGATGCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=109,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	70820988	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=224,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70820988_C_A:70820988:0,1,0,1
chr1	70820992	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=224,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70820988_C_A:70820988:0,1,0,1
chr1	70832053	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.500:40:12,12:7,8:20,0,20,0
chr1	71534879	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,108;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:16,0,2,0
chr1	72058405	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	72242039	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,5:0,0,0,15
chr1	74507711	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	74610233	.	T	TAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,55;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,21;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.484:12:2,4:3,2:0,6,4,2
chr1	74646514	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	74664149	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr1	74669973	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	74671519	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=131,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:2,5,0,6
chr1	74701295	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	74701950	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,6:7,3:0,13,0,9
chr1	74819077	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=106.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,6,23
chr1	74833674	.	ATAT	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:17,5:21,0:0|1:74833674_ATAT_A:74833674:7,35,1,4
chr1	74833678	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.128:45:17,5:22,0:0|1:74833674_ATAT_A:74833674:6,34,1,4
chr1	74835050	.	GATTTTCTGTTGCTGCC	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:8,0:14,2:20,13,1,1
chr1	74901739	.	CTTTT	C,CTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,26,32;MFRL=67,156,176;MMQ=60,60,60;MPOS=10,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,16,18;RU=T;STR;TLOD=3.60,8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.246,0.439:7:2,0,1:0,1,2:2,0,4,1
chr1	74937749	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,14,2
chr1	74946039	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:4,2:1,9,1,1
chr1	74946691	.	A	AGGTAGAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0,3,0,1
chr1	75006027	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=174,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:7,5:6,3:4,9,1,7
chr1	75006076	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,0,18
chr1	75036783	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	75036812	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr1	75072264	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.959:21:0,9:0,12:0|1:75072264_G_T:75072264:0,0,21,0
chr1	75072285	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:13,0:15,4:0|1:75072264_G_T:75072264:26,3,4,0
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chr1	75097426	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,18:0,14:0,0,25,8
chr1	75108863	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	75172756	.	TAA	T,TA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,25,29;MFRL=183,129,132;MMQ=60,60,60;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=28.50,4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,14,5:0.453,0.157:31:7,6,1:5,6,4:7,5,12,7
chr1	75188978	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,0:8,4:1,12,0,4
chr1	75190452	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,30:0.516:58:17,14:10,15:12,16,10,20
chr1	75199152	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,11:0,2:0,0,2,13
chr1	75214390	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:3,4:9,14:11,1,16,2
chr1	75614380	.	CTT	C,CT	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,26,24;MFRL=127,119,134;MMQ=60,60,60;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.25,52.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,27:0.141,0.698:39:3,1,9:2,5,13:3,3,8,25
chr1	75626420	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,4:0,1:0,0,5,1
chr1	75626631	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,6:7,5:0,10,0,11
chr1	75669619	.	T	TTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,272;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	75672376	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=137,83;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:1,6,2,4
chr1	75679294	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=184,219;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:4,2:7,0:13,0,2,0
chr1	75679307	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=177,219;MMQ=60,42;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:4,2:9,0:14,0,2,0
chr1	75679569	.	C	CT,CTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=175,188,168;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=6.14,13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,4,7:0.190,0.306:24:4,3,4:9,1,3:8,5,8,3
chr1	75681351	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:4,1,6,0
chr1	75685643	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=189,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr1	75693500	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,1:16,1:9,16,0,2
chr1	75699646	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.489:25:6,5:5,7:11,2,10,2
chr1	75699771	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.396:38:14,6:9,8:13,10,6,9
chr1	75699831	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:4,6:8,6:1,12,0,12
chr1	75702655	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:26,3:37,0:40,25,3,0
chr1	75707652	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:2,3:4,1:6,1,3,1
chr1	75708529	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr1	75766186	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	76007232	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr1	76190568	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.547:30:6,6:6,5:4,9,4,13
chr1	76190569	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:9,5:8,7:4,14,4,8
chr1	76194054	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:8,0,6,0
chr1	76194229	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr1	76198436	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.522:44:11,11:10,12:7,14,6,17
chr1	76199345	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.664:19:3,9:3,3:2,4,0,13
chr1	76205643	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.441:39:8,8:13,9:16,6,11,6
chr1	76216330	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr1	76228445	.	T	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.070:54:28,0:23,3:15,36,0,3
chr1	76252011	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,27:0.489:55:5,11:23,15:11,17,9,18
chr1	76255613	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:9,5:9,5:15,3,6,4
chr1	76257074	.	AT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,28,29,30;MFRL=160,156,161,161;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,12,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.98,23.03,6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,4,13,4:0.138,0.393,0.136:32:4,1,4,2:6,3,7,2:8,3,8,13
chr1	76262960	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=243,232;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	76269372	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:4,1,6,1
chr1	76272837	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=149,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:1,8,0,7
chr1	76344011	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=104.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0,0,12,22
chr1	76345640	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=104.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,20:0,13:0,0,33,0
chr1	76345884	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.618:32:5,9:7,10:0,12,1,19
chr1	76346920	.	C	CAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,3:0,0,7,4
chr1	76349534	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:3,6:2,6:0,5,1,11
chr1	76363505	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=46.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:7,8:4,6:11,0,13,1
chr1	76378357	.	ATAT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=187,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.643:9:1,4:1,1:0|1:76378357_ATAT_A:76378357:3,0,6,0
chr1	76378361	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=205,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.248:10:6,1:2,1:1|0:76378357_ATAT_A:76378357:7,1,2,0
chr1	76387748	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr1	77620035	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr1	77627096	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,5,17
chr1	77632514	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:17,0:15,4:11,22,0,4
chr1	77752544	.	TAATTA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AATTA;STR;TLOD=103.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.967:25:0,16:0,9:0,0,24,1
chr1	77949123	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0|1:77949123_G_A:77949123:0,5,0,4
chr1	77949129	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,0:2,3:0|1:77949123_G_A:77949123:0,5,0,4
chr1	78024345	.	C	CTAT	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=176.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,45:0.639:70:11,21:14,23:16,9,24,21
chr1	78033981	.	AAAATG	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATG;STR;TLOD=83.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,23:0.414:56:14,10:15,13:18,15,14,9
chr1	78045369	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,3:4,5:0,5,0,8
chr1	78178976	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,5:4,8:2,8,2,11
chr1	78184433	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:0,10,0,6
chr1	78193955	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:16,1,2,0
chr1	78200005	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.472:51:9,13:17,11:23,4,19,5
chr1	78248991	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,2:9,0:0|1:78248991_A_C:78248991:9,15,0,2
chr1	78248994	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,2:9,0:0|1:78248991_A_C:78248991:9,15,0,2
chr1	78281002	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr1	78383160	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:4,4:8,0,7,1
chr1	78383467	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,6,18
chr1	78399207	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,26:0.640:40:6,9:7,14:0|1:78399207_C_G:78399207:3,11,2,24
chr1	78399212	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,12:0.343:36:9,6:13,6:1|0:78399207_C_G:78399207:2,22,2,10
chr1	78414310	.	C	CA,CAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30,34;MFRL=0,119,172;MMQ=60,52,55;MPOS=12,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,19,20;RU=A;STR;TLOD=3.62,3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.319,0.381:10:2,1,2:1,1,1:3,0,7,0
chr1	78430689	.	A	AG	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=142.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,24:0,15:0,0,20,19
chr1	78432647	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:6,1:4,1:6,11,2,1
chr1	78433801	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=70.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,22:0.594:37:6,13:8,8:12,3,16,6
chr1	78435701	.	TAA	T,TA	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=28,31,24;MFRL=136,168,146;MMQ=60,60,60;MPOS=27,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=13.01,15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,7,10:0.145,0.202:51:9,2,1:12,5,5:5,29,1,16
chr1	78471060	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:1,5:1,3:0,2,1,8
chr1	78478675	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:5,0,4,0
chr1	78481640	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	79094593	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=136.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,24:0,17:0,0,30,11
chr1	79106870	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:0,12,0,3
chr1	79107543	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:7,8:9,6:3,14,4,10
chr1	79355596	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=137.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,19:0,18:0,0,9,28
chr1	79358832	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=89,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:11,2:6,17,0,2
chr1	79383300	.	CA	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=143.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,20:0,22:0,0,35,8
chr1	79383458	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,16:0,11:0,0,5,22
chr1	79401927	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr1	79403751	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=115.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,18:0,0,25,10
chr1	79411888	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	79472380	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:5,0:13,3:0,19,0,3
chr1	82402364	.	TAATC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=177,73;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:2,1:4,2,2,0
chr1	82415814	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0,0,15,0
chr1	82416220	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,6:8,6:0,14,1,11
chr1	82433929	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:4,6:2,3:0,6,2,8
chr1	82437670	.	ATTTGT	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=145,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,15:0.642:23:6,7:2,8:0|1:82437670_ATTTGT_A:82437670:1,7,0,15
chr1	82437682	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=145,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,15:0.696:21:4,6:2,8:0|1:82437670_ATTTGT_A:82437670:0,6,0,15
chr1	82450270	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:24,2:20,1:34,11,3,0
chr1	82452565	.	G	GT	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.083:33:16,1:12,1:0|1:82452565_G_GT:82452565:28,3,2,0
chr1	82452579	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.063:45:13,1:14,1:0|1:82452565_G_GT:82452565:34,9,2,0
chr1	84372060	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.439:39:12,7:10,10:12,10,13,4
chr1	84386709	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:8,0,8,0
chr1	84417585	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=124,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.489:33:10,7:6,9:8,9,6,10
chr1	84640834	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:7,7:7,9:0,14,0,16
chr1	84765340	.	G	GTATA,GTATATA,GTATATATA	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=35,32,33,33;MFRL=0,118,142,162;MMQ=60,60,41,40;MPOS=21,18,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,11,12,13;RU=TA;STR;TLOD=34.84,56.54,17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,16,23,9:0.307,0.476,0.188:49:0,7,8,2:1,9,12,7:0,1,2,46
chr1	84791239	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	84867610	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=123,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,6:6,7:5,5,8,5
chr1	84874242	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:3,3:2,6:2,4,1,8
chr1	84876711	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,1:1,6:0,5,0,7
chr1	84876731	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:0,5,0,6
chr1	84946745	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr1	84956161	.	CT	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,9:0.161:55:16,5:29,4:14,32,1,8
chr1	84961580	.	C	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,3:0.053:73:40,3:29,0:41,29,3,0
chr1	84963000	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=147,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:3,1,5,0
chr1	84967646	.	T	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=151,158;MMQ=60,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,6:0.104:64:29,0:26,6:11,47,0,6
chr1	84986213	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=119,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:1,6:0,0:1,0,5,1
chr1	85018771	.	G	GA	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.112:56:22,2:27,3:35,15,5,1
chr1	85031492	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:10,6:11,8:20,1,13,1
chr1	85040024	.	CAGCAGCGCT	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=129.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,35:0.560:63:10,21:14,14:1,27,1,34
chr1	85128262	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=93.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,10:0,15:0,0,2,23
chr1	85128280	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=89.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,14:0,0,1,24
chr1	85128305	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=188,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,3:4,6:0,9,0,9
chr1	85131982	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=60.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr1	85331462	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:9,9:12,7:7,14,9,7
chr1	85331691	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,143;MMQ=60,36;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,9:0.092:89:36,6:43,0:48,32,9,0
chr1	85331808	.	G	GAGA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=81.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.543:44:7,9:13,14:6,14,3,21
chr1	85397286	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,6:2,4:2,5,1,9
chr1	85406744	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:85406744_G_A:85406744:0,2,0,1
chr1	85406747	.	T	TAGAATGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:85406744_G_A:85406744:0,2,0,1
chr1	85406752	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=248,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:85406744_G_A:85406744:0,1,0,1
chr1	85418307	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	85422061	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=191,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,3:2,6:5,0,8,1
chr1	85424182	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr1	85424479	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	85462582	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:5,3:3,6,3,5
chr1	85462652	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:0,3,0,5
chr1	85462665	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr1	85488154	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr1	85537522	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	85538655	.	A	AAAG	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,141;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.875:30:0,9:4,9:4,0,8,18
chr1	85547945	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,13,2
chr1	85550156	.	A	AAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=259,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AT;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr1	85551468	.	A	ATCAGTTTTTCT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,8:0,0,17,2
chr1	85551664	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.171:39:19,0:13,6:8,25,0,6
chr1	85559118	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:4,4:9,0,5,0
chr1	85560335	.	T	TAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,0:0,1:0|1:85560335_T_TAGA:85560335:0,1,0,1
chr1	85560338	.	T	TTAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85560335_T_TAGA:85560335:0,1,0,1
chr1	85561546	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr1	85563444	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=222,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,1:3,2:0,13,0,5
chr1	85564138	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=207,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr1	85570157	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr1	85575892	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,158;MMQ=50,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:0,12,0,2
chr1	85589939	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr1	85595645	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=140.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,29:0,15:0,0,38,6
chr1	85598527	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,12,4
chr1	85647713	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=121.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,14:0,19:0,0,28,6
chr1	85648905	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:4,4:7,4:2,9,2,6
chr1	85736557	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=167,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:7,6,1,1
chr1	85736569	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=166,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:5,1:4,2:5,5,2,1
chr1	85741921	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr1	85787114	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0|1:85787114_A_T:85787114:0,0,16,5
chr1	85787118	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0|1:85787114_A_T:85787114:0,0,15,5
chr1	85787323	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr1	85787334	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr1	85790633	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr1	85816224	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:1,5,1,5
chr1	85817295	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr1	86046561	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	86146672	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=196,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr1	86167756	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,2:7,0:12,0,2,0
chr1	86167957	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=94.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,5,23
chr1	86171692	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26,28,28;MFRL=158,194,145,208;MMQ=60,60,60,60;MPOS=27,23,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.86,3.06,8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,2,4:0.175,0.188,0.318:12:2,0,1,2:2,2,1,2:4,0,8,0
chr1	86173298	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.417:29:6,7:10,4:15,2,12,0
chr1	86203249	.	C	CT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:4,0:8,2:0,19,0,4
chr1	86210546	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr1	86211267	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=199,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr1	86241399	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.162:22:5,2:8,0:0,19,0,3
chr1	86246849	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	86249063	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	86249911	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,12,7
chr1	86252025	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,2,2
chr1	86334316	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:4,5:1,5,3,6
chr1	86340262	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.496:26:10,7:2,5:11,2,11,2
chr1	86340880	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=153,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	86340892	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	86361802	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	86362210	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=222,195;MMQ=58,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	86375654	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,5,15
chr1	86375684	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:16,0:4,2:9,11,0,2
chr1	86435850	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.469:47:13,12:12,10:22,3,18,4
chr1	86435957	.	TA	T,TAA	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=29,28,29;MFRL=145,171,65;MMQ=60,60,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=16.41,5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,10,6:0.254,0.144:40:9,5,2:13,3,4:1,23,4,12
chr1	86453237	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:10,11:6,7:15,1,18,0
chr1	86482922	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:7,5:6,10:3,10,2,13
chr1	86487981	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,19:0,18:0,0,11,28
chr1	86487992	.	A	AACAG	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=120.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.970:28:0,13:0,14:0,0,3,25
chr1	86499432	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:13,0:13,5:26,0,5,0
chr1	86529539	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr1	86554813	.	G	GA,GAA	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=32,33,32;MFRL=123,127,134;MMQ=60,59,60;MPOS=12,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,9;RU=A;STR;TLOD=23.51,19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,12,12:0.250,0.246:51:11,7,7:12,4,5:24,3,23,1
chr1	86554821	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=110,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=99.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,28:0.474:59:14,17:17,11:27,4,26,2
chr1	86621992	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=194,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.514:13:5,3:1,1:3,3,3,4
chr1	86622189	.	A	ATCACCAATGTTAAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	86821194	.	A	ACT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,2:5,1:1,10,0,3
chr1	86890931	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,17:0.397:43:10,8:16,8:26,0,17,0
chr1	86891005	.	C	A	.	.	DP=112;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=97.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,40:0.387:104:26,20:36,20:43,21,24,16
chr1	86896488	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,23:0.426:54:21,8:10,14:28,3,19,4
chr1	86896706	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:7,7:3,7:0,10,1,13
chr1	86897970	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:2,5:6,2:0|1:86897970_T_A:86897970:8,0,7,0
chr1	86897973	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0|1:86897970_T_A:86897970:0,0,16,0
chr1	86900491	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	86904850	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr1	86905759	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr1	86939390	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=134.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,20:0,19:0,0,35,5
chr1	86959014	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	86959796	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	86960118	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=159,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,2:7,0:0,10,0,2
chr1	87012899	.	G	GAT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AT;STR;TLOD=73.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:5,7:11,13:13,4,8,12
chr1	87036746	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=118.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,20:0,16:0,0,23,13
chr1	87045335	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=78,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:87045335_TAA_T:87045335:1,1,0,1
chr1	87045339	.	G	GGGT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=78,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:87045335_TAA_T:87045335:1,1,0,1
chr1	87045347	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,16;MFRL=223,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:87045335_TAA_T:87045335:0,2,0,1
chr1	87045352	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=223,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:87045335_TAA_T:87045335:0,2,0,1
chr1	87045354	.	AA	TG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=223,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:87045335_TAA_T:87045335:0,2,0,1
chr1	87045360	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:87045335_TAA_T:87045335:0,3,0,1
chr1	87045842	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,71;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.135:49:21,0:22,6:23,20,1,5
chr1	87045896	.	TCCTACA	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.968:26:0,11:0,14:0,0,13,13
chr1	87458695	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr1	87538597	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:28,1:22,2:31,20,1,2
chr1	87549858	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=97.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,12:0,15:0,0,21,6
chr1	87563668	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr1	87570398	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	87633761	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,7,7
chr1	89236029	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.503:26:8,10:4,3:9,4,7,6
chr1	89287762	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	89289918	.	TTATTTTTTTAACTGTATAACCTACTGATTTCTTTGATTTTTTTTTTTCATGCTG	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.122:24:3,0:5,2:18,3,2,1
chr1	89289954	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=197,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,1:2,2:9,0,3,0
chr1	89322982	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,7:0,13:0,0,14,6
chr1	89414793	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,529;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:5,0:16,2:16,5,1,1
chr1	89427252	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:0,8,0,5
chr1	89430420	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,6:7,2:12,0,8,0
chr1	89448896	.	A	T	.	.	DP=78;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=167,193;MMQ=52,37;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,5:0.075:78:32,3:37,2:0|1:89448896_A_T:89448896:41,32,3,2
chr1	89448913	.	GA	CG	.	.	DP=85;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=173,193;MMQ=52,37;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,5:0.069:85:33,3:40,2:0|1:89448896_A_T:89448896:43,37,3,2
chr1	89448924	.	T	C	.	.	DP=80;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=169,193;MMQ=52,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,5:0.073:80:32,3:40,2:0|1:89448896_A_T:89448896:44,31,3,2
chr1	89448940	.	A	G	.	.	DP=77;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=168,193;MMQ=60,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,3:0.052:75:35,2:35,1:0|1:89448896_A_T:89448896:44,28,2,1
chr1	89449483	.	C	G	.	.	DP=133;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,150;MMQ=52,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,12:0.101:127:54,7:58,5:65,50,3,9
chr1	89449508	.	AT	A,ATT	.	.	DP=118;ECNT=2;MBQ=28,28,24;MFRL=171,145,165;MMQ=60,60,60;MPOS=24,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=14.80,4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:61,12,8:0.141,0.080:81:29,7,6:31,5,2:28,33,9,11
chr1	89473577	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,4:5,5:1,11,0,9
chr1	89475230	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:2,2:9,10:0,12,0,12
chr1	89478854	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,6:2,2:7,3,8,0
chr1	89520329	.	GAAAAAC	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,178;MMQ=52,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.573:19:4,6:4,5:7,1,11,0
chr1	89520574	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:1,7,1,7
chr1	89520636	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=213,238;MMQ=46,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:5,1:1,4:0|1:89520636_G_A:89520636:2,4,4,1
chr1	89520643	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=211,223;MMQ=40,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:5,1:0,3:0|1:89520636_G_A:89520636:2,3,3,1
chr1	89522512	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.457:31:9,6:7,8:13,4,13,1
chr1	89525080	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,24:0.438:55:16,7:14,16:14,17,14,10
chr1	89525966	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=96.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,34:0.467:73:21,13:17,19:19,20,10,24
chr1	89526099	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,5:3,4:1,9,0,9
chr1	89574026	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr1	89583544	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,13:0,0,0,20
chr1	89597755	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	89614879	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	89615979	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,19,5
chr1	89618472	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.797:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr1	89637454	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,27:0.480:56:14,14:14,11:16,13,24,3
chr1	89650850	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,2:5,3:8,0,5,0
chr1	89652071	.	TC	CT	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,11:0.353:32:8,4:13,6:0|1:89652071_TC_CT:89652071:13,8,10,1
chr1	89652078	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=28,25;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,10:0.344:30:7,4:10,6:0|1:89652071_TC_CT:89652071:12,8,9,1
chr1	89652087	.	CC	TG	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=149,164;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,11:0.364:31:8,7:8,2:0|1:89652071_TC_CT:89652071:10,10,8,3
chr1	89652090	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=148,167;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.333:31:9,8:9,2:0|1:89652071_TC_CT:89652071:11,10,7,3
chr1	89652094	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=146,164;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,11:0.324:35:9,6:12,2:0|1:89652071_TC_CT:89652071:11,13,8,3
chr1	89652097	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=148,160;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,10:0.297:35:10,7:15,3:0|1:89652071_TC_CT:89652071:10,15,7,3
chr1	89652102	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=146,157;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,11:0.308:37:10,7:15,4:0|1:89652071_TC_CT:89652071:11,15,7,4
chr1	89652846	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=165,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.623:14:3,3:2,5:1,4,0,9
chr1	89654567	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=95,233;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	89726592	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr1	89727870	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=134,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:12,7:7,8:12,7,9,6
chr1	89730723	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=138,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,3:2,5:0,3,0,8
chr1	89731959	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:1,6:4,7:5,0,12,1
chr1	89733273	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,2:5,3:0,10,0,6
chr1	89734313	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=194,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:3,1:16,1:19,0,2,0
chr1	89735314	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	89845926	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=73.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,12:0,0,22,3
chr1	89847153	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,3:5,3:11,0,6,0
chr1	89849201	.	C	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=206.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,24:0,31:0,0,42,14
chr1	89849350	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=152.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,23:0,26:0,0,10,39
chr1	89849574	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=74.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,13:0,8:0,0,21,0
chr1	90058242	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=221,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr1	90179532	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=131,183;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,3,2
chr1	90180443	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,177;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:19,3:21,0:38,4,3,0
chr1	90401405	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=216,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:1,3:2,1,3,4
chr1	90402042	.	G	GTGATTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=247,288;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:90402042_G_GTGATTTTT:90402042:0,1,0,1
chr1	90402044	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=247,288;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:90402042_G_GTGATTTTT:90402042:0,1,0,1
chr1	90470894	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,1:14,1:0,28,0,2
chr1	90475877	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:5,6:8,4:0,13,0,10
chr1	91404256	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,25:0.491:51:13,14:13,11:9,17,10,15
chr1	91447985	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr1	91727781	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:12,7:10,7:14,8,3,11
chr1	91727998	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,130;MMQ=60,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:12,4:16,0:21,9,4,0
chr1	91728202	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr1	91739208	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	91739414	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	91781304	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,9,0
chr1	91781644	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=137.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,19:0,0,24,14
chr1	91813148	.	T	TTAC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:0|1:91813148_T_TTAC:91813148:0,11,0,2
chr1	91813149	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:0|1:91813148_T_TTAC:91813148:0,11,0,2
chr1	91813156	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=199,127;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:6,0:0|1:91813148_T_TTAC:91813148:0,11,0,2
chr1	91841301	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=105.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,18:0,0,4,26
chr1	91846374	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	91846595	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=61.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,0,17
chr1	91846654	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr1	91973557	.	T	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=226.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,22:0,39:0,0,3,58
chr1	91978963	.	T	TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=A;STR;TLOD=57.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,8:0,0,0,15
chr1	91989572	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,13:0,8:0,0,19,2
chr1	92149278	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=220,249;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	92182143	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:20,2:19,0:23,17,0,2
chr1	92184814	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:6,7:6,6:12,0,13,0
chr1	92195601	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	92200593	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	92224347	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:4,9:7,8:2,9,3,14
chr1	92433877	.	G	GTGTGTGTGTGTGATATGAAAATAGTTAAGTTC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=191,134;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,1:0.234:8:2,1:4,0:0,7,0,1
chr1	92433891	.	C	CTAAGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0|1:92433891_C_CTAAGT:92433891:0,2,0,1
chr1	92433892	.	C	CTCTTTGTAGGTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0|1:92433891_C_CTAAGT:92433891:0,2,0,1
chr1	92446112	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	92446398	.	T	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=223.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,25:0,43:0,0,32,38
chr1	92446961	.	T	TTGTA	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TGTA;STR;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.426:16:1,5:8,2:2,7,2,5
chr1	92447004	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,9:0,0,4,17
chr1	92447080	.	CA	TG	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=195,193;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:11,1:16,0:22,5,1,1
chr1	92447084	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:9,3:18,0:0|1:92447084_C_A:92447084:23,4,1,2
chr1	92447087	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=196,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:8,2:17,0:0|1:92447084_C_A:92447084:24,4,1,2
chr1	92495744	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:6,6,0,2
chr1	92511117	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:8,8,2,0
chr1	92568263	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:6,2:6,8:1,11,0,10
chr1	92633373	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,1:2,8:4,1,9,0
chr1	92634570	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr1	92649335	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:3,1:3,0,3,1
chr1	92649472	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:29,0:22,3:23,30,0,3
chr1	92709689	.	T	TAC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=195,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,3:2,2:5,0,5,0
chr1	92710515	.	T	TAAATATTGACATGAATATCAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=184,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.483:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	92712266	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,5:0,12:0,0,1,17
chr1	92712529	.	A	AAGAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=173,192;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:92712529_A_AAGAT:92712529:3,0,1,0
chr1	92712532	.	ATC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=173,192;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:92712529_A_AAGAT:92712529:3,0,1,0
chr1	92712536	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=173,192;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:92712529_A_AAGAT:92712529:3,0,1,0
chr1	92763091	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,33,37,18;MFRL=164,157,239,152;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,8,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.14,6.63,3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:22,3,5,6:0.082,0.137,0.159:36:8,3,1,0:9,0,3,0:2,20,0,14
chr1	92765880	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr1	92852504	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr1	92941768	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=125,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.279:21:6,0:3,0:2,13,0,6
chr1	92979124	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	93142850	.	A	AACATGCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	93159821	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,1:5,2:8,2,3,1
chr1	93159927	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:4,10:14,10:4,14,3,17
chr1	93163385	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=231,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,4:1,2:2,0,5,2
chr1	93167610	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,3:7,8:12,0,10,1
chr1	93167854	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr1	93306189	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=179,60;MMQ=60,28;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:93306189_A_G:93306189:0,6,1,1
chr1	93306196	.	G	GATC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=179,60;MMQ=60,28;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:0|1:93306189_A_G:93306189:0,6,1,1
chr1	93306197	.	G	GGAAGAGTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=180,60;MMQ=60,28;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,1:0|1:93306189_A_G:93306189:0,5,1,1
chr1	93308853	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:10,3:12,5:22,0,8,0
chr1	93426866	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,8:0,11:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,22,0
chr1	93426869	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,9:0,12:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,22,0
chr1	93545157	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,5,15
chr1	93545199	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,0:1,0,0,2
chr1	93580992	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,12:0,9:0,0,18,5
chr1	93581024	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=149.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,19:0,22:0,0,30,13
chr1	93583818	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34,34;MFRL=136,92,220;MMQ=60,56,60;MPOS=16,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,16,18;RU=T;STR;TLOD=3.66,6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,4:0.303,0.522:7:1,2,2:0,0,2:1,0,6,0
chr1	93584870	.	CT	C,CTT	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,32,33;MFRL=152,181,151;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.95,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,6,6:0.120,0.172:38:10,2,3:10,4,3:20,6,9,3
chr1	93584885	.	C	G	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.275:39:9,1:9,0:13,16,10,0
chr1	93602194	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,18,2
chr1	93621483	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,15,0
chr1	93648816	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr1	93649003	.	C	CA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,254;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,0:16,2:14,17,0,2
chr1	93649732	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,3:0,0,0,12
chr1	93659350	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=83.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,0,26
chr1	93676314	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,17:0,0,23,4
chr1	93676478	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.494:45:12,6:9,16:9,14,15,7
chr1	93676578	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=209,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,3:0,7:0,1,0,10
chr1	93687528	.	CT	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.221:33:10,2:11,4:5,21,1,6
chr1	93691836	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=154,127;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:23,4:12,0:36,0,4,0
chr1	93691855	.	GT	G,GTT	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=35,35,20;MFRL=147,128,138;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=22.38,6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,14,9:0.320,0.207:42:12,10,2:4,4,4:15,4,16,7
chr1	93691873	.	C	G	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=26,18;MFRL=94,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,14:0.200:67:17,2:15,0:25,28,14,0
chr1	93692081	.	AAT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=202,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AT;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:3,2:1,0:0,5,0,2
chr1	93704793	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:24,1:9,2:33,1,2,1
chr1	93711782	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,18:0.365:50:19,7:13,11:5,27,3,15
chr1	93998640	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=126.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,17:0,18:0,0,6,29
chr1	94037220	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,6:8,3:10,2,7,2
chr1	94041787	.	G	GAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AC;STR;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr1	94057720	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=207,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr1	94312482	.	T	TC	.	.	DP=112;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=343.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,99:0.991:99:0,50:0,49:0,0,43,56
chr1	94312528	.	G	GC	.	.	DP=60;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=240.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,55:0.983:55:0,30:0,24:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,3,52
chr1	94312533	.	G	GC	.	.	DP=55;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=241.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,55:0.982:55:0,29:0,23:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,3,52
chr1	94312542	.	G	GC	.	.	DP=47;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=209.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,47:0.980:47:0,22:0,19:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,46
chr1	94312544	.	G	GC	.	.	DP=46;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=205.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.979:46:0,23:0,18:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,45
chr1	94312554	.	A	AG	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=169.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.975:38:0,20:0,11:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,37
chr1	94312558	.	G	GC	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=151.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,15:0,15:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,33
chr1	94312566	.	GT	TC	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=11,17;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.847:25:0,5:0,4:0,5,0,20
chr1	94312571	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=97.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,9:0,9:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,22
chr1	94312573	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,20
chr1	94312576	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,19
chr1	94344580	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,10:0,0,17,2
chr1	94360107	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	94367097	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.942:32:1,15:0,15:1,0,28,3
chr1	94476555	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr1	94481245	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=121,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:2,0:0,1:0|1:94481245_A_C:94481245:3,2,3,0
chr1	94481248	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=121,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:4,0:0,1:0|1:94481245_A_C:94481245:5,2,3,0
chr1	94481251	.	AG	CC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=121,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:6,0:1,0:0|1:94481245_A_C:94481245:5,2,3,0
chr1	94487285	.	AAC	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=117.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,30:0.660:45:10,18:4,11:4,11,8,22
chr1	94487354	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=179,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:6,10:10,8:10,6,7,11
chr1	94495930	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr1	94506716	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=183,173;MMQ=60,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:13,3,3,0
chr1	94512742	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=205,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:1,7,1,1
chr1	94522367	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:7,10,2,0
chr1	94528363	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr1	94528405	.	A	ACTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=255,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	94544100	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:94544100_A_C:94544100:0,0,1,0
chr1	94544102	.	CGCTT	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94544100_A_C:94544100:0,0,1,0
chr1	94544108	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94544100_A_C:94544100:0,0,1,0
chr1	94544109	.	T	TACGG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94544100_A_C:94544100:0,0,1,0
chr1	94544112	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:94544100_A_C:94544100:0,0,1,0
chr1	94544135	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=24,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.874:9:1,3:0,3:0,1,3,5
chr1	94544276	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,3:7,2:0,13,1,4
chr1	94544805	.	TCA	T,TCACA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,26,29;MFRL=140,164,157;MMQ=60,60,60;MPOS=19,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=CA;STR;TLOD=4.00,14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,7:0.129,0.365:19:2,0,5:8,2,0:9,1,9,0
chr1	94549029	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:0,8,0,8
chr1	94549083	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	94564483	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,2:10,0:1,15,0,2
chr1	94574053	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	94574342	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	94576893	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	94576968	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr1	94639337	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	94643759	.	T	TGGGGGG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=162,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:4,2:6,0:0|1:94643759_T_TGGGGGG:94643759:1,10,0,2
chr1	94643761	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=162,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:94643759_T_TGGGGGG:94643759:1,10,0,2
chr1	94667430	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,1:0,0,0,9
chr1	94668046	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	94670784	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.544:35:4,8:11,11:2,14,2,17
chr1	94674295	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=186,248;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:5,2:13,0:18,0,2,0
chr1	94674723	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:94674723_G_A:94674723:0,0,9,0
chr1	94674726	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0|1:94674723_G_A:94674723:4,0,5,0
chr1	94924046	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=204,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,3:1,5:4,0,9,0
chr1	94941376	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr1	94944128	.	CA	TG	.	.	DP=88;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,3:0.045:86:49,1:31,2:27,56,2,1
chr1	94944132	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,3:0.046:85:48,1:32,2:27,55,1,2
chr1	94944134	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=154,53;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,2:0.033:88:41,1:32,1:0|1:94944134_T_C:94944134:27,59,1,1
chr1	94944139	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=152,53;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,2:0.037:78:38,1:32,1:0|1:94944134_T_C:94944134:16,60,1,1
chr1	94948868	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:21,1:17,2:3,36,0,3
chr1	94964139	.	AT	A,ATT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,30,30;MFRL=164,186,166;MMQ=60,60,60;MPOS=14,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=17.58,7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,10,5:0.330,0.207:27:4,4,1:8,6,3:12,0,14,1
chr1	94964441	.	CT	AA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:20,5:12,0:26,8,5,0
chr1	94980671	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=96.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,23,4
chr1	95286658	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.556:27:8,9:3,6:0,12,0,15
chr1	95286675	.	GTCCCAAATGTAAA	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.605:18:5,7:2,4:0,7,0,11
chr1	95290003	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=209,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.576:26:7,6:3,9:11,0,15,0
chr1	95305440	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:3,9:8,4:9,3,12,1
chr1	95332814	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,3:6,4:10,0,7,0
chr1	95332864	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=193,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.668:36:3,10:7,14:10,2,18,6
chr1	95333068	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.408:12:3,1:4,2:0,7,0,5
chr1	95358096	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,0:0,6,0,3
chr1	95367136	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	95367416	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,2:4,2:0,5,0,5
chr1	95367649	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=202,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,3:0,2:5,0,5,0
chr1	95367669	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,8:3,2:6,1,9,1
chr1	95367894	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,35;MFRL=343,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr1	95609476	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:11,5:9,0:13,7,5,0
chr1	97189091	.	GG	AA,AG	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,20,30;MFRL=0,55,154;MMQ=60,58,60;MPOS=16,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.92,153.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,46:0.109,0.874:51:0,5,23:0,0,23:0,0,30,21
chr1	97250520	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	97278804	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=336,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=96.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.942:31:1,16:0,14:0,1,27,3
chr1	97544771	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,0,19
chr1	97547831	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	97700589	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:0,7,0,5
chr1	97770715	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,27;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:0,3:2,0:2,0,4,0
chr1	97839016	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,5:4,6:6,0,11,0
chr1	97847874	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:8,8:8,5:16,0,13,0
chr1	97915624	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:7,12:9,6:11,5,17,1
chr1	97981242	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr1	98039556	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,3;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:12,4:11,0:3,20,0,4
chr1	99127205	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	99150635	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=66.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,3,18
chr1	99161216	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:25,0:17,3:12,30,0,3
chr1	99358542	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:8,1,4,1
chr1	99358761	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:0,7,0,3
chr1	99380440	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,51770861;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:1,8,2,0
chr1	99387628	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,10;MFRL=173,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:3,0:2,1:1,4,0,3
chr1	99418929	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=220,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:99418929_G_A:99418929:0,1,0,2
chr1	99418931	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=220,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:99418929_G_A:99418929:0,1,0,2
chr1	99418933	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=220,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:99418929_G_A:99418929:0,1,0,2
chr1	99418939	.	G	GTATTATATA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=220,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:99418929_G_A:99418929:0,1,0,2
chr1	99771912	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,0:3,2:7,5,0,2
chr1	100152443	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=92.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,29:0.577:50:11,14:10,14:11,10,20,9
chr1	100155514	.	T	TTATCTTCTTCACTGTCTTCTGCCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=275,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	100159552	.	C	CT	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=60.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,34:0.521:65:17,14:14,17:14,17,15,19
chr1	100174876	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.360:29:10,3:6,7:2,17,0,10
chr1	100182884	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=214,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr1	100185282	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:0,3:2,2:0,2,0,6
chr1	100203571	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=123,164;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:1,7:0,11:1,0,18,0
chr1	100203597	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,17,4
chr1	100212831	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=153,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:19,3:22,0:23,19,2,1
chr1	100214391	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,0,16
chr1	100316765	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=204,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:2,3:4,2:0,6,0,6
chr1	100318112	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	100329889	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=156,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,1,1
chr1	100330212	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=163,128;MMQ=60,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,0:4,3:0,8,0,3
chr1	100330237	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=193,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	100340225	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:4,0,6,0
chr1	100366446	.	GTT	G,TTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=19,13,23;MFRL=178,182,139;MMQ=60,60,60;MPOS=25,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.34,4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.313,0.215:11:1,0,2:0,1,1:1,3,1,6
chr1	100381109	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:4,1:9,2:0,17,0,4
chr1	100465062	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=225,221;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:100465062_A_T:100465062:0,4,0,1
chr1	100465066	.	ATG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=259,214;MMQ=55,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:2,0:0,1:1|0:100465062_A_T:100465062:0,2,0,1
chr1	100465067	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=266,221;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0|1:100465062_A_T:100465062:0,2,0,1
chr1	100465069	.	CA	CATA,AT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,35,25;MFRL=296,214,221;MMQ=60,60,50;MPOS=9,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr1	100465072	.	C	G,A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32,25;MFRL=0,214,221;MMQ=60,60,50;MPOS=6,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr1	100481062	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	100503892	.	G	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=88.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,34:0.529:64:15,16:15,17:5,25,7,27
chr1	100524336	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:2,9:8,5:0,10,1,14
chr1	100542638	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:6,0,5,0
chr1	100542702	.	CTT	C,CT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=34,35,34;MFRL=161,141,189;MMQ=60,60,60;MPOS=26,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.90,6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,4:0.158,0.202:22:9,3,3:6,0,1:13,2,7,0
chr1	100542729	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:10,0:10,0:22,8,5,0
chr1	100572358	.	TG	CA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.078:47:10,0:32,3:43,0,4,0
chr1	100584746	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,5:5,4:0,8,0,9
chr1	100598299	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.310:31:7,4:10,5:19,3,7,2
chr1	100598435	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:4,11:2,6:0,6,1,16
chr1	100614259	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,35:0.513:68:15,11:18,23:16,17,16,19
chr1	100614419	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,2:6,4:0,11,0,6
chr1	100617887	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:2,6:3,3:6,0,8,1
chr1	100623922	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:2,6:7,6:1,8,4,8
chr1	100624023	.	TTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=192,236;MMQ=50,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr1	100715454	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.626:17:1,6:4,3:0,6,1,10
chr1	100731819	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=229,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0|1:100731819_C_CA:100731819:2,0,4,0
chr1	100731820	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=229,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0|1:100731819_C_CA:100731819:2,0,4,0
chr1	100733207	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,12;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:0,1:1,0:0,1,0,6
chr1	100740606	.	GAACTT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=221,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,0,2
chr1	100750733	.	AGTTTT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GTTTT;STR;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:1,3:0,1:3,2,3,1
chr1	100818464	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,7:0,0,17,2
chr1	100921053	.	G	GT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.116:40:21,1:14,3:7,29,0,4
chr1	101372607	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,3:0,0,0,9
chr1	101487373	.	AACACACACAC	A,AAC,AACAC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29,16,30;MFRL=0,182,157,137;MMQ=54,60,60,60;MPOS=25,29,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=21,16,17,18;RU=AC;STR;TLOD=4.30,6.26,12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,3,5:0.200,0.269,0.407:11:0,0,0,0:0,2,1,5:0,1,0,10
chr1	101704532	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=168,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,5:4,4:11,0,9,0
chr1	101706140	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.178:20:5,0:12,0:0|1:101706140_A_C:101706140:1,16,3,0
chr1	101706145	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.178:20:4,0:11,2:0|1:101706140_A_C:101706140:1,16,3,0
chr1	102271774	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=133,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:5,4:2,2:0,7,0,7
chr1	102296144	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr1	102296422	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:102296422_T_C:102296422:0,2,0,1
chr1	102296426	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,10;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:102296422_T_C:102296422:0,2,0,1
chr1	102296428	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:102296422_T_C:102296422:0,2,0,1
chr1	102296432	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:102296422_T_C:102296422:0,3,0,1
chr1	102296434	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:102296422_T_C:102296422:0,3,0,1
chr1	103356072	.	C	CA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:12,1:10,2:1,23,1,2
chr1	103356168	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=215,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr1	103363561	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:13,0:6,2:18,1,1,1
chr1	103364484	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.565:30:5,5:6,11:11,2,14,3
chr1	103379870	.	A	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,27:0.466:58:16,18:14,8:18,13,15,12
chr1	103380369	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=26,15;MFRL=149,128;MMQ=60,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:8,0:15,0:16,23,0,3
chr1	103380373	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=28,15;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.179:37:9,1:12,0:15,15,0,7
chr1	103380377	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=29,13;MFRL=141,187;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.133:35:6,0:10,0:0|1:103380377_G_T:103380377:14,17,0,4
chr1	103380379	.	T	TA,TAA	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=30,30,30;MFRL=170,177,177;MMQ=60,60,57;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=15.26,4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,7,3:0.412,0.115:18:3,4,1:4,3,1:3,5,1,9
chr1	103380392	.	AG	A	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=169,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.205:21:9,2:7,3:1,15,3,2
chr1	103380393	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=161,165;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.260:25:9,2:10,4:0|1:103380377_G_T:103380377:5,14,0,6
chr1	103381129	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:14,5:5,13:14,5,14,4
chr1	103399917	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=202,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr1	103400491	.	GA	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr1	103405793	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=202,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:5,0,4,0
chr1	103427381	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=143,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,4:7,2:9,2,3,3
chr1	103428389	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr1	103435935	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=190,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:0,5,0,6
chr1	103440497	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=139,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,26:0.551:47:9,11:12,15:5,16,4,22
chr1	103444497	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,23:0.422:55:13,7:18,16:13,19,6,17
chr1	103449598	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	103453379	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	103455020	.	AAT	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=149,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:9,2:18,0:28,2,2,0
chr1	103455217	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=55.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:4,6:3,11:0,7,0,17
chr1	103461508	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=130.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,21:0,20:0,0,19,22
chr1	103462547	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,5,0
chr1	103463976	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=113.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,14:0,17:0,0,0,31
chr1	103467615	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,0,21
chr1	103471456	.	CCAT	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CAT;STR;TLOD=75.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.811:23:2,8:2,11:0,4,5,14
chr1	103471734	.	AAAATAAAT	A,AAAATAAATAAATAAAT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,29,29;MFRL=0,150,137;MMQ=60,60,60;MPOS=25,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,5,9;RU=AAAT;STR;TLOD=68.10,33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,18,9:0.514,0.411:28:1,6,2:0,12,5:1,0,9,18
chr1	103483265	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:13,0,3,0
chr1	103483514	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:2,4:7,3:0,10,0,7
chr1	103487394	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.859:11:1,5:0,4:0,1,0,10
chr1	103488602	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=253,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	103491569	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=178,277;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:103491569_G_T:103491569:0,1,1,0
chr1	103491572	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=178,277;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:103491569_G_T:103491569:0,1,1,0
chr1	103496620	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr1	103544191	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,23:0.415:56:12,8:19,15:28,5,18,5
chr1	103544434	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=108,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.333:37:15,5:10,7:4,21,3,9
chr1	103548319	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:2,5:2,7:4,0,10,2
chr1	103573532	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.739:2:0,0:0,0:0|1:103573532_C_G:103573532:0,0,2,0
chr1	103573539	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.762:2:0,0:0,0:0|1:103573532_C_G:103573532:0,0,2,0
chr1	103573547	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.762:2:0,0:0,0:0|1:103573532_C_G:103573532:0,0,2,0
chr1	103573812	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=186,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr1	104203066	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=178,187;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:12,3:4,2:10,6,3,2
chr1	107867641	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	108023196	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=109,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.483:10:2,1:2,2:0|1:108023196_G_C:108023196:0,5,5,0
chr1	108023198	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=109,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.483:10:2,0:3,2:0|1:108023196_G_C:108023196:0,5,5,0
chr1	108023202	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:3,2:0|1:108023196_G_C:108023196:0,7,3,0
chr1	108023206	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,1:5,2:0|1:108023196_G_C:108023196:0,8,3,0
chr1	108023210	.	CTACCTT	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:3,1:6,2:0|1:108023196_G_C:108023196:1,9,3,0
chr1	108116051	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.416:24:9,6:5,3:4,10,3,7
chr1	108139003	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,4:7,7:1,11,0,11
chr1	108152630	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,5:2,1:1,5,2,4
chr1	108160260	.	GAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=16,21,20,16;MFRL=154,110,149,219;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,14,27;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=A;STR;TLOD=6.66,20.47,6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,5,11,4:0.153,0.340,0.145:31:2,1,2,1:3,3,5,0:4,7,2,18
chr1	108292260	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr1	108299775	.	ATG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=177,198;MMQ=50,57;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=TG;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	108299809	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	108307642	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,7:7,6:13,0,13,0
chr1	108315256	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr1	108315305	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr1	108507541	.	GGCC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=218,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCC;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.505:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	108697845	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=203,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr1	108703834	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.342:36:9,10:15,2:15,9,9,3
chr1	108724518	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,15:0.470:32:7,7:10,8:0|1:108724518_A_G:108724518:15,2,12,3
chr1	108724541	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,29:0.526:55:9,14:16,15:1|0:108724518_A_G:108724518:17,9,22,7
chr1	108724693	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=198,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,1:6,4:0,9,0,5
chr1	108766424	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr1	108771524	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=252,228;MMQ=27,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,1:3,5:5,0,6,0
chr1	108994925	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,153;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=115.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,41:0.934:43:1,22:1,18:0,2,15,26
chr1	108994952	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=144,147;MMQ=25,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,24:0.894:26:1,13:1,11:0,2,6,18
chr1	109170746	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=107.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,20:0,14:0,0,34,2
chr1	109187450	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=219,149;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:109187450_C_T:109187450:0,3,0,1
chr1	109187453	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=219,149;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:109187450_C_T:109187450:0,3,0,1
chr1	109187455	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=219,149;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:109187450_C_T:109187450:0,3,0,1
chr1	109255513	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,4:0,0,14,3
chr1	109255687	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=198,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:0,7,1,1
chr1	109260357	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	109261321	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=185,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	109270402	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.405:10:4,3:2,0:4,2,3,1
chr1	109273610	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr1	109289236	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:6,5:4,11:10,0,16,0
chr1	109289487	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:4,8:6,7:0,12,1,14
chr1	109299453	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.489:45:11,7:12,15:1,22,0,22
chr1	109301059	.	TAGTC	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=136.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,36:0.545:66:13,17:12,19:26,4,32,4
chr1	109301250	.	G	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,31:0.485:64:14,14:19,17:1,32,3,28
chr1	109315211	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,7:4,2:9,0,9,0
chr1	109321824	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,4:3,5:4,0,9,0
chr1	109325436	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:4,7:9,5:0,13,1,11
chr1	109339414	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=196,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,0:0,4:0,3,0,4
chr1	109339433	.	A	AGGTCTGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=196,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0,5,0,1
chr1	109340877	.	G	GT	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,26:0.513:50:15,16:9,10:6,18,11,15
chr1	109350209	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=179,114;MMQ=60,36;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:1,9,0,2
chr1	109350260	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,6:0,1:0,2,0,7
chr1	109363075	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=195,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr1	109363140	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:4,4:3,1:7,0,4,2
chr1	109365781	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,10:6,3:8,2,9,4
chr1	109365979	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:7,8:3,8:9,2,12,4
chr1	109369797	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:3,5:8,6:6,5,8,3
chr1	109377053	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:3,3,1,2
chr1	109377157	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,29;MFRL=108,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:0,2:0,2,0,4
chr1	109391486	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,12,9
chr1	109486240	.	TA	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.395:41:12,6:12,10:11,14,5,11
chr1	109490327	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=163,148;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.127:53:20,0:27,6:13,34,0,6
chr1	109493134	.	G	GTTA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTA;STR;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.585:15:2,4:4,4:0,6,0,9
chr1	109524438	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,2:0.047:61:31,0:28,2:36,23,0,2
chr1	109524584	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,6:2,3:0,8,0,9
chr1	109529322	.	T	TAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=115.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,13:0,12:0,0,4,24
chr1	109545046	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr1	109545089	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr1	109547351	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,0:6,1:4,5,0,2
chr1	109650484	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.354:9:5,1:0,1:5,1,2,1
chr1	109734541	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	109735298	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.420:41:16,9:7,8:16,8,10,7
chr1	109735504	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.386:42:15,9:11,6:11,15,1,15
chr1	109737132	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.415:29:9,6:8,5:7,10,5,7
chr1	109737138	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=169,53;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:18,0:13,3:0|1:109737138_T_C:109737138:12,20,1,2
chr1	109737140	.	TT	AG	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=169,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:18,0:13,3:0|1:109737138_T_C:109737138:12,20,1,2
chr1	109737148	.	G	GTGCAGTGTCGCGATTTC	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=170,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:18,0:9,2:0|1:109737138_T_C:109737138:8,20,1,2
chr1	109737172	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.373:27:10,5:7,4:3,14,2,8
chr1	109737314	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr1	109740310	.	AGT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=219,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=GT;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:0,1:0,3,0,4
chr1	109742452	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	109742485	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr1	109743622	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,0:0,0,0,4
chr1	109771046	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,1:7,2:4,15,0,3
chr1	109771063	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:8,3:6,2:2,12,1,4
chr1	109773705	.	ATT	A,AT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,28,26;MFRL=121,136,177;MMQ=60,60,60;MPOS=28,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.05,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,5:0.221,0.324:13:1,0,1:2,3,2:0,5,0,8
chr1	109773707	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.266:21:2,1:11,1:0,15,0,6
chr1	109778577	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=162,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,3:3,1:5,2,4,0
chr1	109779556	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,0,22
chr1	109792735	.	A	ACGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CGC;STR;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,2:2,0,2,1
chr1	109796053	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:109796053_C_T:109796053:0,0,0,1
chr1	109796055	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109796053_C_T:109796053:0,0,0,1
chr1	109808370	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,0:7,2:6,7,1,1
chr1	109815252	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.299:15:5,2:4,2:9,2,4,0
chr1	109816176	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0|1:109816176_A_C:109816176:0,0,10,3
chr1	109816178	.	G	GCCCCCCACCCCCC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.524:13:3,5:3,1:0|1:109816176_A_C:109816176:3,3,7,0
chr1	109816185	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.498:12:2,4:3,1:0|1:109816176_A_C:109816176:3,3,6,0
chr1	109822897	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:109822897_CAG_C:109822897:1,2,0,1
chr1	109822902	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,1:3,0:0|1:109822897_CAG_C:109822897:1,2,0,1
chr1	109838833	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,4:0,0,10,3
chr1	109839392	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=139.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.959:46:0,17:1,24:0,1,27,18
chr1	109839433	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,17:0,24:0,0,30,13
chr1	109839954	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:4,1,4,1
chr1	109883576	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	109944695	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=122,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:3,0:5,2:4,4,0,2
chr1	109958035	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr1	109968885	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,22:0.313:63:17,2:16,2:9,32,22,0
chr1	110018148	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr1	110029672	.	A	ACCC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,8;RU=C;STR;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.366:18:5,2:4,1:0|1:110029672_A_ACCC:110029672:3,8,7,0
chr1	110029678	.	A	ACCC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=C;STR;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.250:25:10,0:5,0:0|1:110029672_A_ACCC:110029672:9,10,6,0
chr1	110029681	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.170:21:10,2:8,1:0|1:110029672_A_ACCC:110029672:9,9,3,0
chr1	110031188	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=208,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr1	110091271	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=199,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:9,7:8,7:17,0,13,1
chr1	110129582	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=198,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr1	110141421	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,3:3,7:9,0,10,0
chr1	110153198	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	110155524	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=167,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:7,3:4,3:1,10,0,6
chr1	110155580	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110155580_G_GA:110155580:0,1,0,1
chr1	110155581	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110155580_G_GA:110155580:0,1,0,1
chr1	110155585	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110155580_G_GA:110155580:0,1,0,1
chr1	110162911	.	G	C	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.058:67:36,0:25,3:0|1:110162911_G_C:110162911:32,32,0,3
chr1	110162914	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,191;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,3:0.059:65:34,0:20,3:0|1:110162911_G_C:110162911:31,31,0,3
chr1	110168888	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:8,5:9,13:9,8,5,13
chr1	110169919	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:7,12,0,2
chr1	110169957	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:3,4:2,4:1,4,5,3
chr1	110171705	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:4,1:1,5:6,0,4,2
chr1	110172346	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,4:2,2:9,0,6,0
chr1	110172362	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:6,2:4,3:10,1,5,0
chr1	110200360	.	T	C	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,41:0.507:81:20,18:18,22:24,16,23,18
chr1	110201580	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=215.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,68:0.976:69:0,34:0,34:1,0,49,19
chr1	110210780	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,3,22
chr1	110211681	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=134,171;MMQ=25,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,2:7,1:0,10,0,3
chr1	110211835	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=159,260;MMQ=52,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:18,3:16,0:24,11,3,0
chr1	110212293	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=194,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:2,2:7,0:0,9,0,3
chr1	110233238	.	T	TGAGTTCAAGCAATTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,289;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	110254830	.	AG	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=188,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:15,0:3,1:21,1,2,0
chr1	110255167	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.371:38:13,9:11,4:20,4,12,2
chr1	110256029	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,218;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:13,1:16,2:18,11,3,0
chr1	110256220	.	A	C	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=163,146;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=129.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,48:0.515:93:21,25:23,21:23,22,28,20
chr1	110257528	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.477:46:12,8:12,13:18,6,17,5
chr1	110260040	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:4,7:9,5:6,7,9,3
chr1	110279821	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=152,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,5:4,3:1,10,1,7
chr1	110279862	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=203,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,0:8,3:0,16,0,3
chr1	110282972	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,19;MFRL=194,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.429:9:2,2:3,0:0,5,0,4
chr1	110293989	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,3:3,6:1,3,0,9
chr1	110294577	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:0,2:2,3:3,0,4,1
chr1	110295643	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	110295890	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=179,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:0,9,0,4
chr1	110300277	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr1	110301202	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:4,6,2,0
chr1	110301766	.	AGTGTGTGT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=232,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=GT;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.658:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr1	110466338	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.470:28:8,7:6,6:12,3,11,2
chr1	110467343	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=199,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:15,0:7,0:0|1:110467343_A_C:110467343:21,6,2,0
chr1	110467345	.	C	CG	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=199,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,1:10,0:0|1:110467343_A_C:110467343:21,7,2,0
chr1	110467354	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=196,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,1:5,0:0|1:110467343_A_C:110467343:16,8,2,0
chr1	110467356	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=196,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,1:6,0:0|1:110467343_A_C:110467343:16,8,2,0
chr1	110467358	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=194,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:6,0:0|1:110467343_A_C:110467343:15,8,2,0
chr1	110559377	.	C	T	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,6:0.067:102:55,0:41,6:19,77,0,6
chr1	110581963	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:12,1,2,0
chr1	110592076	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=96,159;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:6,0:2,11,2,0
chr1	110594218	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	110604204	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=212,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:110604204_G_A:110604204:0,2,0,1
chr1	110604211	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=212,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:110604204_G_A:110604204:0,2,0,1
chr1	110716511	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=202,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	110738164	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,18;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.229:19:7,2:3,0:12,3,4,0
chr1	110740688	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr1	110765535	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,6:4,2:4,0,8,0
chr1	110918133	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:19,0:23,3:16,26,0,3
chr1	110993739	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=212,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	111059812	.	C	CGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=GA;STR;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:6,0,4,0
chr1	111059825	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,7:4,1:7,0,7,1
chr1	111061011	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=179,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,1,2
chr1	111147530	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:4,2:2,3:0,6,1,5
chr1	111147668	.	C	CGCTCTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	111436857	.	TC	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,14,1
chr1	111437129	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	111492807	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr1	111739696	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=203,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.291:12:0,3:7,0:9,0,3,0
chr1	111770423	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,12:0,8:0,0,5,15
chr1	111773568	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,2,10
chr1	111773600	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=245,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr1	111773830	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=116.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,22:0,16:0,0,29,11
chr1	111778187	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	111778241	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,12,3
chr1	111778824	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,6:0,6:0,0,0,20
chr1	111783942	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.518:23:6,5:5,7:8,3,6,6
chr1	111784148	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr1	111833441	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=132,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	111833488	.	C	CCT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:3,2,3,1
chr1	111833517	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:4,1:0,1:3,2,1,1
chr1	111853174	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr1	111854207	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	111854223	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr1	111854755	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	111857276	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=188,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,3:6,3:1,8,1,5
chr1	111857951	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,136;MMQ=52,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.612:24:3,7:6,7:5,4,7,8
chr1	111860286	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:12,0:5,2:14,3,1,1
chr1	111861714	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,8:5,5:8,2,11,2
chr1	111890240	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	111890244	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=209,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	111891170	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:7,6:10,6:11,6,6,6
chr1	111957097	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.735:17:3,4:1,7:3,1,9,4
chr1	111969294	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,0:8,5:0,13,1,4
chr1	111969307	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,0:6,7:0,11,1,6
chr1	111969839	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=241,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:111969839_A_T:111969839:0,2,0,1
chr1	111969841	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=241,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:111969839_A_T:111969839:0,2,0,1
chr1	111984011	.	C	CTT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:13,0:9,2:1,22,0,2
chr1	111985229	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:6,0,5,1
chr1	111990265	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:2,4:2,3:0,5,0,7
chr1	111991845	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=177,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chr1	111992095	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.612:29:5,11:6,7:10,1,17,1
chr1	111998679	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,2:4,4:8,0,6,1
chr1	112020233	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr1	112020238	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	112028331	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,17;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0,4,1,0
chr1	112029193	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,12:0,0,12,9
chr1	112029325	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr1	112032347	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	112106444	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr1	112234068	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.348:41:14,7:13,7:4,23,2,12
chr1	112237915	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.470:45:9,12:14,9:23,1,20,1
chr1	112240038	.	CT	C,CTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,35,32;MFRL=180,145,147;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.47,4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,8,3:0.355,0.178:20:4,6,0:3,2,3:7,2,11,0
chr1	112251902	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:7,3:9,6:1,15,1,8
chr1	112269510	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:4,0,5,1
chr1	112302208	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.402:20:7,1:5,6:1,11,2,6
chr1	112302219	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:5,4:5,5:0,10,1,8
chr1	112303050	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,3:15,0:26,1,3,0
chr1	112303077	.	AT	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:17,2:14,3:28,5,5,0
chr1	112305406	.	TAA	T,TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,25,27;MFRL=180,226,171;MMQ=60,60,60;MPOS=29,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.73,3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.240,0.255:13:2,1,0:3,2,3:4,3,3,3
chr1	112308782	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,15:0.296:52:17,7:20,8:15,22,3,12
chr1	112329551	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=76,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.587:13:0,4:5,1:3,2,4,4
chr1	112524769	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=137,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:7,8,1,1
chr1	112991862	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr1	112999859	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:15,0:23,4:20,21,0,4
chr1	113052155	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	113140635	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:13,1:21,1:23,11,2,0
chr1	113159371	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.295:35:6,3:15,7:22,3,9,1
chr1	113159394	.	T	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=25,14;MFRL=151,165;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.078:57:24,0:19,0:43,9,5,0
chr1	113196179	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=201,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:2,1:7,0,0,2
chr1	113196197	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:0,3:3,2:3,0,5,2
chr1	113196203	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,19;MFRL=86,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.380:14:5,0:3,2:6,3,5,0
chr1	113202417	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,12:0,5:0,0,4,13
chr1	113232280	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,189;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,0:12,3:0,18,0,3
chr1	113234456	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,4:0,7:0,0,4,9
chr1	113239478	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr1	113240577	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:6,4:1,6:3,4,8,3
chr1	113242488	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=125.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,17:0,23:0,0,23,17
chr1	113244433	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr1	113245526	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:113245526_A_C:113245526:0,0,2,0
chr1	113245532	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:113245526_A_C:113245526:2,0,2,0
chr1	113245535	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:113245526_A_C:113245526:2,0,2,0
chr1	113245537	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,0:0|1:113245526_A_C:113245526:2,0,1,0
chr1	113246229	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,7:0,0,16,0
chr1	113254484	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	113464833	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=182,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:113464833_G_GA:113464833:0,1,0,1
chr1	113464839	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=193,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113464833_G_GA:113464833:0,2,0,1
chr1	113471629	.	C	CT,CTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32,33;MFRL=0,194,207;MMQ=60,60,60;MPOS=28,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.68,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.500,0.375:5:0,0,1:0,3,1:0,0,5,0
chr1	113636248	.	G	GGAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:113636248_G_GGAC:113636248:0,2,0,1
chr1	113636253	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113636248_G_GGAC:113636248:0,2,0,1
chr1	113636255	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,23;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:113636248_G_GGAC:113636248:0,2,0,1
chr1	113636924	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=76.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,7:0,0,21,1
chr1	113642815	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:9,11:10,10:14,5,15,6
chr1	113658887	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=99.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,21:0,11:0,0,20,12
chr1	113659065	.	ACT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=107.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,14:0,12:0,0,5,22
chr1	113666817	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=212,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:113666817_G_T:113666817:0,4,0,1
chr1	113666822	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=212,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:113666817_G_T:113666817:0,4,0,1
chr1	113666823	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=212,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:113666817_G_T:113666817:0,4,0,1
chr1	113933570	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=212,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.481:4:2,0:0,1:2,0,2,0
chr1	114092111	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=184,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.249:13:3,1:6,2:0|1:114092111_G_GT:114092111:10,0,3,0
chr1	114092124	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,15;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.201:16:2,1:7,0:0|1:114092111_G_GT:114092111:11,2,3,0
chr1	114133022	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=204,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	114137013	.	C	CAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,3:5,3:11,0,6,0
chr1	114189067	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:2,8:9,4:9,2,12,0
chr1	114191757	.	TTTA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=176,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr1	114196497	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:11,8:6,3:13,4,11,0
chr1	114240319	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=59.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:6,5:2,14:4,4,7,12
chr1	114249382	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:6,4:7,4:1,12,0,8
chr1	114255828	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=216,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	114267347	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:4,1,8,0
chr1	114339956	.	C	CTAAA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.463:39:12,12:9,5:17,4,13,5
chr1	114372528	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,3:5,7:13,1,10,0
chr1	114377093	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=149,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:6,6:6,6:4,8,2,10
chr1	114394572	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:5,0:7,0,2,0
chr1	114399058	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=188,172;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:5,4,2,0
chr1	114443035	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=130.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,13:0,21:0,0,0,37
chr1	114504860	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=71,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr1	114508685	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=174,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,6:5,8:9,0,14,0
chr1	114510560	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:14,3:4,0:6,12,3,0
chr1	114515565	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:8,0,3,0
chr1	114522052	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=232,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:0,2:1,0:2,0,3,0
chr1	114522057	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=18,9;MFRL=196,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.315:7:1,0:1,0:5,0,2,0
chr1	114641685	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:5,5:5,6:10,1,9,2
chr1	114940211	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=234,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:1,1:1,1:2,0,2,1
chr1	114940229	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=96,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:2,0:1,1:2,1,2,1
chr1	114940632	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=237,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.683:4:0,2:0,1:0,1,0,3
chr1	114942201	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:19,0:19,3:2,36,0,3
chr1	114947935	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	114968122	.	TG	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,2:0.041:72:33,0:31,2:38,32,1,1
chr1	115110683	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=179,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:3,9:2,4:4,1,13,0
chr1	115113480	.	A	ACGAGCAGTGTTTGGCCAAAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=218,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:115113480_A_ACGAGCAGTGTTTGGCCAAAGC:115113480:0,1,0,1
chr1	115113483	.	A	ATTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=218,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:115113480_A_ACGAGCAGTGTTTGGCCAAAGC:115113480:0,1,0,1
chr1	115124203	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,27:0.468:58:16,18:14,9:5,26,6,21
chr1	115128087	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=191,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:7,0,2,1
chr1	115138617	.	C	CTGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.321:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	115138619	.	C	CTGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=206,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:115138619_C_CTGT:115138619:0,1,0,1
chr1	115138621	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=206,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:115138619_C_CTGT:115138619:0,1,0,1
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chr1	115164619	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.137:35:12,3:14,1:18,13,3,1
chr1	115166350	.	ATTGT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=260,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGT;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.505:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	115238016	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:5,1:2,2:7,0,3,1
chr1	115256669	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=249,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr1	115276978	.	GA	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:20,1:10,2:32,0,3,0
chr1	115280009	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=164,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:27,3:16,0:42,1,3,0
chr1	115280193	.	CA	C,CAA	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=164,147,188;MMQ=60,60,60;MPOS=23,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.34,4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,6,4:0.149,0.118:38:10,4,2:13,1,1:5,23,1,9
chr1	115398044	.	GC	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=49.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,15,2
chr1	115398073	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:16,2,1,1
chr1	115399781	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,17;MFRL=158,123;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,1:3,0:4,0,2,0
chr1	115399940	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,7:4,3:4,5,5,5
chr1	115401136	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=217.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.985:66:0,37:0,28:0,0,55,11
chr1	115417175	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.528:30:8,9:6,6:7,7,7,9
chr1	115420905	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:1,3,0,7
chr1	115438047	.	AT	A	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,6:0.076:81:37,4:34,2:37,38,2,4
chr1	115455634	.	CTT	C,CT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,26,32;MFRL=168,162,152;MMQ=60,60,60;MPOS=19,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=T;STR;TLOD=3.76,3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,2,2:0.082,0.085:32:12,0,0:16,1,2:25,3,3,1
chr1	115456723	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:14,0:23,2:0,37,0,2
chr1	115488821	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr1	115524216	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	115537600	.	G	GA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,15;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.110:39:9,1:14,0:4,31,0,4
chr1	115601615	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr1	115604681	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:7,9:7,7:14,0,16,0
chr1	115631924	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,0:0,0,3,0
chr1	116206423	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,171;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.524:49:10,10:13,13:8,15,13,13
chr1	116224925	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr1	116224940	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr1	116225180	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr1	116228220	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr1	116247790	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.447:38:9,9:12,7:18,3,13,4
chr1	116260604	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,6:3,2:0,4,3,5
chr1	116280916	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=120,43;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:8,9,1,1
chr1	116283343	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	116283526	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	116287634	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	116311198	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	116383364	.	ATT	A,AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31,29;MFRL=201,163,183;MMQ=60,60,60;MPOS=20,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.46,3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.300,0.363:6:2,2,0:0,0,2:2,0,4,0
chr1	116386393	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:22,3:12,0:13,21,0,3
chr1	116534952	.	GC	TT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	116573942	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=210,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:6,0,6,0
chr1	116577981	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr1	116609126	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:5,3,7,1
chr1	116663724	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:0,5,1,7
chr1	116670774	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.375:20:5,6:4,1:8,5,4,3
chr1	116670990	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,0:0,2:0,4,0,2
chr1	116671061	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=270,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr1	116675909	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,18:0.324:57:16,7:21,11:18,21,12,6
chr1	116676035	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,3:3,3:0,10,0,6
chr1	116915991	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,13;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:116915991_C_CG:116915991:3,0,1,0
chr1	116915992	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,18;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:116915991_C_CG:116915991:3,0,1,0
chr1	116915996	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=14,36;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:116915991_C_CG:116915991:2,0,1,0
chr1	116916000	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,34;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.335:4:0,1:1,0:3,0,1,0
chr1	116916004	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,0:4,0,2,0
chr1	116940693	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=174,84;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:3,10,0,2
chr1	116941781	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=162,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,1:6,3:0,7,0,4
chr1	117120150	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:3,8:1,10:0,4,7,12
chr1	117131240	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=14,12;MFRL=164,198;MMQ=51,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:0,1:1,0:6,0,6,0
chr1	117131244	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=18,12;MFRL=159,205;MMQ=51,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.507:10:1,0:1,0:5,0,5,0
chr1	117131250	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=16,20;MFRL=162,198;MMQ=40,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:2,1:1,1:7,1,4,0
chr1	117131254	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=22,32;MFRL=150,212;MMQ=40,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:2,2:3,1:5,2,6,0
chr1	117142531	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=180,161;MMQ=40,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,8:0,2:1,0,9,1
chr1	117142583	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=172,180;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:15,2:5,1:17,3,3,0
chr1	117142613	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=169,190;MMQ=60,45;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:18,3:9,2:18,9,5,0
chr1	117142700	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,174;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,15:0.295:52:17,4:19,11:18,19,8,7
chr1	117142736	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=161,159;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,10:0.215:48:17,4:19,5:13,25,7,3
chr1	117142855	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.461:39:15,12:6,6:12,9,10,8
chr1	117142868	.	CA	TG	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=167,169;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.181:42:21,6:9,1:22,13,3,4
chr1	117142869	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=165,164;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.280:38:18,7:8,4:14,12,9,3
chr1	117142977	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,154;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,5:6,1:1,12,0,6
chr1	117143067	.	GA	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=235,204;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,1:0,4:0,4,0,5
chr1	117146504	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=196,141;MMQ=52,28;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.193:34:12,1:16,3:2,26,3,3
chr1	117146563	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=211,141;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,1:5,3:0,11,1,3
chr1	117146571	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=206,134;MMQ=60,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:5,1:0,10,0,2
chr1	117146585	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=201,134;MMQ=60,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,1:5,1:0|1:117146585_G_A:117146585:1,8,0,2
chr1	117146592	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=197,134;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:4,1:0|1:117146585_G_A:117146585:1,6,0,2
chr1	117149135	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,150;MMQ=57,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.188:28:4,2:19,2:6,17,0,5
chr1	117150736	.	C	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,201;MMQ=52,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,4:0.071:67:33,0:30,4:34,29,2,2
chr1	117150928	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=194,187;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,15:0.286:54:18,5:21,9:0|1:117150928_C_T:117150928:8,31,3,12
chr1	117150933	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=202,187;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,13:0.274:49:16,4:18,7:0|1:117150928_C_T:117150928:8,28,1,12
chr1	117150966	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=215,194;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:13,3:9,2:4,19,0,5
chr1	117156326	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=184,197;MMQ=52,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:10,1:10,3:0|1:117156326_C_T:117156326:23,1,4,0
chr1	117156333	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=181,252;MMQ=52,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,0:14,2:0|1:117156326_C_T:117156326:27,1,2,0
chr1	117156459	.	C	T	.	.	DP=112;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,138;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,25:0.238:106:40,11:40,12:41,40,11,14
chr1	117156490	.	T	C	.	.	DP=116;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=163,148;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,21:0.193:112:47,11:40,10:31,60,6,15
chr1	117156584	.	TG	CA	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=172,204;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,12:0.212:59:25,4:19,8:17,30,1,11
chr1	117156600	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=177,162;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,8:0.163:53:25,4:19,4:16,29,0,8
chr1	117158690	.	G	C	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,188;MMQ=45,26;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,10:0.130:82:28,8:42,2:47,25,1,9
chr1	117158857	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=167,173;MMQ=40,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,4:0.065:75:32,2:35,2:0|1:117158857_C_T:117158857:31,40,3,1
chr1	117158862	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=168,173;MMQ=40,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,4:0.068:71:31,2:32,2:0|1:117158857_C_T:117158857:30,37,3,1
chr1	117158898	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=7;MBQ=34,26;MFRL=163,150;MMQ=25,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,7:0.129:59:27,2:25,4:19,33,6,1
chr1	117158909	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=163,149;MMQ=25,24;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,7:0.118:65:33,2:24,5:23,35,7,0
chr1	117158934	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=7;MBQ=29,25;MFRL=173,147;MMQ=25,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,6:0.097:69:33,3:30,3:22,41,5,1
chr1	117158972	.	A	G	.	.	DP=83;ECNT=7;MBQ=29,35;MFRL=164,146;MMQ=36,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,11:0.145:80:32,5:36,5:29,40,4,7
chr1	117159024	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=164,146;MMQ=37,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:14,5:20,0:20,14,0,5
chr1	117248468	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=253,246;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	117487270	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,4:3,7:6,2,8,3
chr1	117603188	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=104.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,15:0,0,3,28
chr1	117605121	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=141,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.088:58:19,1:18,0:13,40,0,5
chr1	117605130	.	CT	C,CTT	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=20,33,19;MFRL=186,151,178;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=12.00,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,10,4:0.357,0.094:27:3,2,0:5,7,0:2,11,1,13
chr1	117618722	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	117619335	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.152:38:9,2:15,0:10,21,7,0
chr1	117622286	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=118.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,17:0,0,7,26
chr1	117631391	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr1	117635551	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:1,17,1,1
chr1	117638990	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=182,163;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,0:10,3:2,22,0,3
chr1	117660608	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,17,2
chr1	117663913	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	117690272	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,11,4
chr1	117696083	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=195,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.732:5:1,0:0,3:0,1,0,4
chr1	117957288	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr1	117984776	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	118065817	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:13,1:14,1:19,8,2,0
chr1	118166786	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.456:7:1,0:1,3:1,3,0,3
chr1	118167727	.	G	GT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.260:26:5,3:12,4:8,11,1,6
chr1	118168804	.	T	TC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,2:6,4:6,7,4,2
chr1	118169329	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=159,200;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:6,2:9,5,0,2
chr1	118170466	.	CTG	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:5,3:1,2:2,5,2,4
chr1	118171000	.	CATTT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:6,6:5,5:0,12,0,11
chr1	118491224	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:118491224_T_TGC:118491224:0,2,0,1
chr1	118491228	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:118491224_T_TGC:118491224:0,2,0,1
chr1	118497081	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=256,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	118502087	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=203,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:4,0:5,1:0,10,0,2
chr1	118568113	.	TTTTC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=237,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	118617274	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=82,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,2:0,2,2,5
chr1	118623681	.	TACACAC	T,TACACACAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27,25;MFRL=0,172,212;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,17;RU=AC;STR;TLOD=14.55,5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.361,0.509:6:0,3,0:0,1,2:0,0,5,1
chr1	118693217	.	T	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,41:0.546:75:11,15:22,25:18,16,19,22
chr1	119466275	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,2,16
chr1	119925464	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,4:2,4:4,0,8,0
chr1	119927680	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=195,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	120165234	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:120165234_T_A:120165234:0,0,1,0
chr1	120165238	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:120165234_T_A:120165234:0,0,1,0
chr1	120165242	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120165234_T_A:120165234:0,0,1,0
chr1	120165244	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:120165234_T_A:120165234:0,0,1,0
chr1	120166201	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	120286457	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=192,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,7:3,5:5,2,12,0
chr1	120293367	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.590:30:7,5:5,11:8,4,11,7
chr1	120380008	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,4,18
chr1	120387120	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,5,15
chr1	120437660	.	GC	TG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,262;MMQ=60,55;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:8,0:8,2:0|1:120437660_GC_TG:120437660:9,8,0,2
chr1	120437669	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=157,262;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:120437660_GC_TG:120437660:5,9,0,2
chr1	120462060	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,0:12,2:16,7,2,0
chr1	120466708	.	TCT	GAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=253,269;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	120469077	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=180.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,26:0,22:0,0,45,4
chr1	120478283	.	C	CACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=199,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	120478285	.	T	C,TATAGCTCTAAAGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27,28;MFRL=0,199,148;MMQ=60,60,60;MPOS=12,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.13,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.625,0.250:5:0,3,1:0,1,0:0,0,0,5
chr1	120480394	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	120502202	.	C	CTCATTTATCCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=233,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	120512104	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,21,0
chr1	120540045	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,195;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr1	120927081	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,19:0,9:0,0,29,0
chr1	143767943	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,160;MMQ=52,47;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.498:42:8,11:13,9:3,18,2,19
chr1	143768163	.	C	CCCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143768163_C_CCCA:143768163:0,0,0,1
chr1	143768164	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143768163_C_CCCA:143768163:0,0,0,1
chr1	144013853	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.416:53:21,11:10,10:24,7,20,2
chr1	144013865	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,25:0.406:62:23,15:14,10:25,12,22,3
chr1	144618009	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=170,138;MMQ=49,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,1:4,1:8,1,2,0
chr1	144618043	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=146,135;MMQ=20,20;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.284:30:9,3:10,5:21,1,8,0
chr1	144618070	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=139,155;MMQ=24,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.189:40:15,4:15,3:30,3,4,3
chr1	144618393	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=180,202;MMQ=41,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:14,2:9,1:3,20,0,3
chr1	144816724	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,134;MMQ=40,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,2:3,1:0,8,0,3
chr1	144828532	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,189;MMQ=29,38;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:10,1:4,1:9,6,0,2
chr1	144828764	.	GA	TT	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=159,128;MMQ=36,24;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:21,3:20,0:4,37,3,0
chr1	144828784	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=169,128;MMQ=31,24;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:17,3:24,0:4,37,2,1
chr1	144828860	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=156,212;MMQ=29,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:2,3:1,6,0,5
chr1	144852249	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=224,216;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:144852249_C_T:144852249:3,0,1,0
chr1	144852254	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=224,216;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:144852249_C_T:144852249:3,0,1,0
chr1	144852321	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=186,179;MMQ=50,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	144852390	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=192,165;MMQ=50,51;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:11,5:4,7:8,7,9,3
chr1	144852476	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=173,138;MMQ=25,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,4:1,4,1,8
chr1	144852545	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=210,207;MMQ=40,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr1	144852606	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,252;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	144854047	.	CCC	TGG	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=178,151;MMQ=52,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:14,3:10,3:25,2,6,0
chr1	144854052	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=176,167;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,22:0.637:34:7,11:5,10:10,2,22,0
chr1	144854083	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=149,166;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,25:0.456:55:20,11:9,14:29,1,24,1
chr1	144854087	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=162,140;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,17:0.290:60:17,12:18,4:0|1:144854087_A_G:144854087:39,4,16,1
chr1	144854095	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=161,140;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,17:0.295:59:19,13:23,4:0|1:144854087_A_G:144854087:38,4,16,1
chr1	144854245	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=164,144;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,10:0.171:62:26,5:26,5:2,50,0,10
chr1	144854277	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=77,187;MMQ=30,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=128.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,38:0.849:44:5,22:1,15:0,6,0,38
chr1	144854491	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=186,160;MMQ=46,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.346:24:10,4:6,2:0|1:144854491_T_G:144854491:13,3,7,1
chr1	144854497	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=183,160;MMQ=46,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:9,5:7,4:0|1:144854491_T_G:144854491:14,2,8,1
chr1	144854528	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=166,162;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,13:0.389:34:7,6:11,7:0|1:144854528_A_G:144854528:14,7,10,3
chr1	144854537	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=166,162;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,13:0.360:37:9,7:12,6:0|1:144854528_A_G:144854528:14,10,10,3
chr1	144854730	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=189,165;MMQ=60,38;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:3,1:6,2:0,9,0,4
chr1	144854750	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=205,165;MMQ=60,38;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:3,2:5,1:0,8,0,4
chr1	144855935	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,145;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,4:6,4:2,10,2,6
chr1	144857068	.	A	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=145,143;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,31:0.523:59:13,16:15,14:3,25,5,26
chr1	144859720	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=152.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,20:0,21:0,0,40,2
chr1	144860026	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:3,12:8,8:1,10,1,19
chr1	144863505	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=180,165;MMQ=60,31;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0,10,0,2
chr1	144866509	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=207,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr1	144868170	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.455:48:13,13:12,7:6,20,3,19
chr1	144868204	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.507:30:8,7:5,8:1,14,1,14
chr1	144871889	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.409:42:9,5:16,12:2,23,3,14
chr1	144873794	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:5,7:9,4:14,0,11,0
chr1	144873818	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=53.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.524:36:8,11:9,7:14,3,15,4
chr1	144873840	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,26:0.455:57:16,17:14,6:23,8,18,8
chr1	144873962	.	CT	C	.	.	DP=96;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,22:0.245:92:35,7:32,13:24,46,9,13
chr1	144874038	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=178,146;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:3,9:11,8:0,14,1,16
chr1	144874070	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=196,181;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.473:25:4,3:8,7:0,13,0,12
chr1	144874088	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=198,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.485:19:5,1:3,8:0,10,0,9
chr1	144874641	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=222,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.709:15:2,3:2,8:2,2,10,1
chr1	144874950	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=200,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.446:23:3,3:8,7:0,13,1,9
chr1	144877366	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=198,220;MMQ=56,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:0,2,0,6
chr1	144880693	.	G	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,18:0.312:59:22,11:16,7:38,3,18,0
chr1	144880864	.	T	A	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,28:0.399:71:17,13:24,15:10,33,4,24
chr1	144881389	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.530:49:9,12:14,14:23,0,24,2
chr1	144881666	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.285:33:9,3:14,6:0,24,0,9
chr1	144881711	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=196,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:7,3:10,2:0,17,0,5
chr1	144882823	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,30:0.435:69:18,15:21,14:9,30,8,22
chr1	144882912	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:3,2:10,1:0,14,0,3
chr1	144886063	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=127,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:3,4:6,8:6,3,10,2
chr1	144886092	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=129,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.513:21:4,1:6,8:8,2,7,4
chr1	144886350	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:16,2:3,5:8,11,2,5
chr1	144886409	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,2:4,6:1,10,1,7
chr1	144892089	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=194,199;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:5,5:5,0:10,0,5,0
chr1	144892149	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=194,165;MMQ=52,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.673:29:5,12:4,5:9,0,18,2
chr1	144892368	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:11,5:8,4:8,11,3,6
chr1	144905992	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=190,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:1,1:4,0,4,0
chr1	144915412	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,2:10,2:17,2,3,1
chr1	144915623	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=168,175;MMQ=52,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:4,0:9,3:3,10,0,3
chr1	144915624	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=173,167;MMQ=52,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.275:17:5,0:6,6:2,9,1,5
chr1	144916486	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=151,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:3,6:3,3:0|1:144916486_T_G:144916486:7,0,10,0
chr1	144916493	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=166,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.546:20:4,6:4,3:0|1:144916486_T_G:144916486:9,0,11,0
chr1	144917827	.	CA	C	.	.	DP=159;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=158,157;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=120.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,44:0.285:154:52,23:47,21:0|1:144917827_CA_C:144917827:65,45,33,11
chr1	144917841	.	T	C	.	.	DP=168;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=156,153;MMQ=47,44;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=289.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,88:0.566:155:35,46:31,39:0|1:144917827_CA_C:144917827:38,29,58,30
chr1	144919008	.	AC	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=176,152;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:10,6:10,3:3,19,2,7
chr1	144922109	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,4:5,5:1,6,3,6
chr1	144922171	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:5,0,5,3
chr1	144923728	.	GT	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,11:0.169:68:23,7:30,4:29,28,8,3
chr1	144923823	.	TAGGAAGAAACGGCA	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGAAGAAACGGCA;STR;TLOD=207.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.983:48:0,20:0,25:0,0,9,39
chr1	144930571	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=99.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,29:0.534:54:7,14:15,10:0|1:144930571_C_A:144930571:15,10,23,6
chr1	144930596	.	C	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,30:0.468:64:13,16:20,12:0|1:144930571_C_A:144930571:16,18,20,10
chr1	144931727	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,2:6,1:2,10,0,3
chr1	144946768	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,7:4,3:1,9,0,10
chr1	145016020	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=196.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,19:0,30:0,0,10,42
chr1	145016032	.	C	CA	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=36,33;MFRL=161,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.253:35:7,5:18,3:1,25,2,7
chr1	145016034	.	A	AC	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.183:36:14,1:16,5:3,27,0,6
chr1	145016035	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.210:36:10,4:18,3:3,26,0,7
chr1	145021024	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.439:39:6,5:16,11:22,0,17,0
chr1	145021034	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,13:0.293:45:9,5:22,7:32,0,13,0
chr1	145021089	.	G	A	.	.	DP=103;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,7:0.084:92:38,2:46,5:59,26,4,3
chr1	145021265	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=192,211;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,0:8,3:0,16,0,3
chr1	145074882	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.186:39:20,1:11,5:31,1,7,0
chr1	145074919	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.139:38:15,3:16,1:28,5,4,1
chr1	145074939	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.431:49:15,11:13,10:20,8,14,7
chr1	145075903	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr1	145103844	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:11,6:8,6:18,1,11,1
chr1	145104052	.	AGT	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=40.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:6,8:11,3:1,16,0,11
chr1	145104075	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.205:21:8,2:7,1:0,17,1,3
chr1	145109430	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=186,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:8,1:6,3:16,0,4,0
chr1	145109456	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.402:28:8,7:8,4:17,0,10,1
chr1	145109468	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=117.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,14:0,16:0,0,31,1
chr1	145109493	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=190,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:16,1:22,4:38,2,5,0
chr1	145112287	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=216,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:8,0,3,0
chr1	145112313	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=156,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:7,3:11,2:13,5,3,2
chr1	145115658	.	TATTTTTAA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=185,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:1,1:8,3:14,0,4,0
chr1	145248811	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=203,256;MMQ=27,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,2:11,1:0,15,0,3
chr1	145273473	.	T	C	.	.	DP=167;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=160,163;MMQ=51,45;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:149,13:0.085:162:82,9:66,4:25,124,1,12
chr1	145273520	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=184,186;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,21:0.354:60:26,10:13,11:2,37,0,21
chr1	145281361	.	TC	T	.	.	DP=135;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=157,154;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,12:0.103:124:48,5:63,7:77,35,10,2
chr1	145281780	.	T	A	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=180,162;MMQ=57,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,8:0.124:70:29,2:33,6:14,48,2,6
chr1	145282093	.	G	A	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,153;MMQ=57,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,15:0.150:105:46,5:40,10:6,84,0,15
chr1	145290317	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,12:0.149:85:29,6:39,6:71,2,11,1
chr1	145290320	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=8;MBQ=32,27;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,27:0.325:84:25,13:32,13:55,2,26,1
chr1	145290346	.	A	G	.	.	DP=120;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=164,160;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=121.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,40:0.376:107:34,18:33,19:46,21,33,7
chr1	145290351	.	A	G	.	.	DP=130;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=158,184;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,18:0.153:122:50,8:47,10:74,30,14,4
chr1	145290377	.	T	C	.	.	DP=171;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=160,162;MMQ=52,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=119.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,46:0.286:161:60,19:53,25:69,46,27,19
chr1	145290398	.	G	A	.	.	DP=198;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=156,161;MMQ=52,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:176,16:0.087:192:77,11:98,5:93,83,9,7
chr1	145290401	.	T	G	.	.	DP=199;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=160,153;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:178,17:0.091:195:81,6:92,10:0|1:145290401_T_G:145290401:98,80,6,11
chr1	145290409	.	G	A	.	.	DP=205;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=160,153;MMQ=52,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:185,17:0.088:202:86,6:91,10:0|1:145290401_T_G:145290401:103,82,6,11
chr1	145290498	.	T	G	.	.	DP=179;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=155,182;MMQ=52,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:147,20:0.124:167:77,10:68,10:44,103,6,14
chr1	145290535	.	C	T	.	.	DP=121;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=156,165;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:105,11:0.102:116:49,4:54,6:18,87,4,7
chr1	145290547	.	C	A	.	.	DP=100;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=159,167;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,6:0.074:92:40,3:44,3:11,75,3,3
chr1	145290553	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,11:0.146:80:29,6:38,5:7,62,0,11
chr1	145290570	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,12:0.205:61:23,6:25,5:3,46,0,12
chr1	145298070	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=202,151;MMQ=31,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:9,3,1,2
chr1	145298089	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=157,162;MMQ=24,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:5,3,1,1
chr1	145298095	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=161,190;MMQ=24,23;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:3,2,1,1
chr1	145415573	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=12,12;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.260:14:3,0:2,0:11,0,3,0
chr1	145438753	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:17,4:16,0:33,0,4,0
chr1	145456732	.	GAA	G,GA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=17,34,20;MFRL=158,166,173;MMQ=60,60,60;MPOS=26,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.28,7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,3,5:0.104,0.178:32:5,2,1:6,1,2:2,22,0,8
chr1	145475728	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=187,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr1	145507826	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=115.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,17:0,15:0,0,6,33
chr1	145508443	.	T	G	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,4:0.065:75:36,4:35,0:51,20,0,4
chr1	145510368	.	CAGAGCT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=189,251;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:0|1:145510368_CAGAGCT_C:145510368:0,1,0,1
chr1	145510376	.	ACCT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=189,251;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.512:2:1,0:0,1:0|1:145510368_CAGAGCT_C:145510368:0,1,0,1
chr1	145515087	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,14;MFRL=271,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:4,0,1,0
chr1	145522594	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:15,0:2,2:9,9,1,1
chr1	145538267	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:19,0:20,3:18,21,0,3
chr1	145539791	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.535:41:9,10:10,12:6,13,8,14
chr1	145549287	.	T	TC	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=25,17;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.426:22:1,0:2,1:9,3,10,0
chr1	145549293	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.584:17:3,2:1,3:0|1:145549293_T_C:145549293:5,2,10,0
chr1	145549299	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,9;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.484:21:4,0:4,0:0|1:145549293_T_C:145549293:9,2,10,0
chr1	145549308	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.485:17:3,1:3,1:6,3,8,0
chr1	145558565	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,14:0,0,10,15
chr1	145561008	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,6:4,4:0,9,2,8
chr1	145567705	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:15,2:5,0:10,10,2,0
chr1	145581640	.	T	TGGTGTGTTGTGG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=171,129;MMQ=46,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:3,2:0|1:145581640_T_TGGTGTGTTGTGG:145581640:0,10,0,2
chr1	145581644	.	C	CT,T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=19,21,33;MFRL=181,163,129;MMQ=53,38,60;MPOS=23,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.30,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.200,0.200:12:3,0,0:0,2,2:0,8,0,4
chr1	145581649	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=171,129;MMQ=50,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:145581640_T_TGGTGTGTTGTGG:145581640:0,11,0,2
chr1	145581663	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=198,163;MMQ=53,38;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0,8,0,2
chr1	145585317	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=160,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,5:1,2:1,0,7,1
chr1	145586780	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=199,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:8,4:8,4:12,5,6,2
chr1	145587631	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:145587631_G_C:145587631:0,0,2,0
chr1	145587634	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=198,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:145587631_G_C:145587631:1,0,2,0
chr1	145587640	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:0|1:145587631_G_C:145587631:3,0,2,0
chr1	145587644	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0|1:145587631_G_C:145587631:5,0,2,0
chr1	145588536	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,10:0,0,13,10
chr1	145589491	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	145597116	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	145598459	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr1	145601861	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=74.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,14:0,0,7,19
chr1	145682185	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:145682185_A_C:145682185:0,2,0,1
chr1	145682193	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=15,29;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:145682185_A_C:145682185:0,2,0,1
chr1	145682202	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:145682185_A_C:145682185:0,2,0,1
chr1	145682207	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:145682185_A_C:145682185:0,2,0,1
chr1	145747326	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:145747326_T_TG:145747326:0,2,0,1
chr1	145747333	.	T	TGAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:145747326_T_TG:145747326:0,2,0,1
chr1	145747337	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:145747326_T_TG:145747326:0,2,0,1
chr1	145826770	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=212,206;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,2:3,1:9,0,3,0
chr1	146466129	.	TT	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=130,119;MMQ=24,23;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr1	146466146	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,21;MFRL=119,130;MMQ=23,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr1	146633933	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=202,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:4,6:1,6:5,0,11,1
chr1	146643528	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=167,115;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:24,4:21,0:37,8,4,0
chr1	146643555	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,26:0.451:58:14,13:17,13:22,10,17,9
chr1	146656292	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,0,25
chr1	146673178	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,0,7
chr1	146685121	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	146687250	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	146696690	.	C	CTTGATGGAAGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.717:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	146714281	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=230,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	146728162	.	T	TA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=111.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,17,15
chr1	146739277	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,7:2,1:0,4,0,8
chr1	146740465	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=143,192;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:11,3:19,0:21,12,3,0
chr1	146740502	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,22:0.453:49:10,10:16,12:16,11,13,9
chr1	146740576	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr1	146747153	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,2,8
chr1	146747232	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=183,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr1	146748008	.	CAGCCA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=126,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	146756222	.	AAAAC	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAC;STR;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:7,6:5,4:0,15,0,10
chr1	146759306	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,6:1,4:3,1,7,3
chr1	146763089	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:7,6:9,2:13,3,8,0
chr1	146766069	.	C	CAT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=115.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,11:0,0,23,4
chr1	147085066	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=208,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr1	147086504	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=186,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	147087721	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=213,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr1	147091972	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:8,3:3,4:9,2,6,2
chr1	147096794	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr1	147096828	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	147131465	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=86.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,8:0,16:0,0,17,7
chr1	147131501	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.402:47:11,7:17,10:12,16,14,5
chr1	147131945	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	147230217	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	147381397	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=137,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.668:9:1,2:1,2:1,2,4,2
chr1	147580912	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=224,229;MMQ=24,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:147580912_T_TAC:147580912:0,1,0,1
chr1	147580914	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=224,229;MMQ=24,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:147580912_T_TAC:147580912:0,1,0,1
chr1	147955533	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=188,139;MMQ=25,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:147955533_T_C:147955533:0,3,0,1
chr1	147955536	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=195,139;MMQ=25,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:147955533_T_C:147955533:0,2,0,1
chr1	147955538	.	TT	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=195,139;MMQ=25,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:147955533_T_C:147955533:0,2,0,1
chr1	148004475	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=190,235;MMQ=40,23;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	148004525	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=174,194;MMQ=40,22;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.318:23:7,4:9,3:14,2,7,0
chr1	148004548	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=165,193;MMQ=40,23;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.326:28:11,6:8,2:17,2,9,0
chr1	148004567	.	CC	AA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=163,161;MMQ=40,24;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:15,3,2,0
chr1	148252164	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,165;MMQ=53,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.269:43:13,4:15,6:11,21,2,9
chr1	148341981	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=149,172;MMQ=24,25;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,16:0.235:69:25,8:28,7:24,29,4,12
chr1	148342066	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=150,142;MMQ=32,20;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,3:3,2:1,7,0,5
chr1	148594319	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=166,165;MMQ=27,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr1	148756363	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,23;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	148756384	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=129,148;MMQ=22,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:148756384_G_A:148756384:3,0,4,0
chr1	148756397	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=129,148;MMQ=22,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:1,2:0|1:148756384_G_A:148756384:3,0,4,0
chr1	148756432	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=145,126;MMQ=22,23;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,3:4,0:4,2,2,1
chr1	148756448	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=36,30;MFRL=165,179;MMQ=23,21;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,2:5,3:0,8,3,2
chr1	148756456	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=173,160;MMQ=23,23;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:6,2:3,7,0,3
chr1	149871539	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=214,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,1:1,5:3,0,6,1
chr1	149876776	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=139,77;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:5,16,1,1
chr1	149880650	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	149884675	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	149900985	.	CA	C,CAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,34,29;MFRL=149,195,145;MMQ=60,60,60;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=7.09,4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,5:0.260,0.272:18:6,3,3:1,2,1:7,1,8,2
chr1	149907175	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.215:14:5,0:3,3:2,9,1,2
chr1	149907259	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=190,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:10,8:6,12:5,11,8,12
chr1	149908404	.	T	TGGCCCGGGTGTGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:1,1,1,0
chr1	149922148	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=180,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr1	149939367	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=165,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,7:0.122:46:19,2:7,0:17,22,7,0
chr1	150044152	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:5,1:1,1:5,2,1,1
chr1	150055021	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=139,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:3,7:3,7:0,6,0,14
chr1	150122493	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	150128425	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,4,11
chr1	150129267	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,5:0,5:0,0,0,13
chr1	150131853	.	C	CTGAAGCTTGGTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:8,1:2,1:1,9,0,2
chr1	150199039	.	CTCCTCT	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCCTCT;STR;TLOD=80.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.961:20:0,10:0,8:0,0,3,17
chr1	150199123	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	150201636	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=150,136;MMQ=51,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150201636_T_C:150201636:0,1,0,1
chr1	150201641	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=150,136;MMQ=51,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150201636_T_C:150201636:0,1,0,1
chr1	150201646	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=150,136;MMQ=51,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150201636_T_C:150201636:0,1,0,1
chr1	150236107	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.450:31:8,4:9,9:9,8,8,6
chr1	150236312	.	TTC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=193,25958696;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:3,0:0|1:150236312_TTC_T:150236312:6,6,2,0
chr1	150236316	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=193,25958696;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.190:14:5,0:4,0:0|1:150236312_TTC_T:150236312:6,6,2,0
chr1	150241230	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.542:38:6,9:9,7:2,15,4,17
chr1	150249101	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	150255587	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	150258838	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=96.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,21,5
chr1	150259400	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr1	150266744	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=152,71;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.095:39:18,3:18,0:33,3,2,1
chr1	150315713	.	GAA	G,GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31,33;MFRL=155,120,139;MMQ=60,60,60;MPOS=7,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.49,8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,5:0.338,0.305:14:3,2,4:1,3,1:4,0,9,1
chr1	150418629	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	150469480	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr1	150484361	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=173,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0,13,0,2
chr1	150485331	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:6,10:5,8:1,10,4,14
chr1	150485984	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:7,0:2,2:0|1:150485984_A_C:150485984:0,10,5,0
chr1	150485987	.	CTG	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,2:3,1:0|1:150485984_A_C:150485984:0,11,5,0
chr1	150524848	.	TGGAAGTGAGGGAAAGGGGACCACTGGGAGGGGCAGG	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=127,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,2:0.056:52:14,0:10,1:26,24,0,2
chr1	150525555	.	G	C	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,9:0.223:37:14,0:10,2:0|1:150525555_G_C:150525555:5,23,9,0
chr1	150525562	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,8:0.217:35:13,2:13,1:0|1:150525555_G_C:150525555:5,22,8,0
chr1	150525573	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=26,11;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.094:39:21,0:13,0:8,28,3,0
chr1	150528090	.	G	GACAC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AC;STR;TLOD=67.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,9:0,0,0,16
chr1	150528118	.	T	TACAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=AC;STR;TLOD=56.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,7:0,0,0,13
chr1	150529322	.	T	TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,4,12
chr1	150531347	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	150531380	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	150550019	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=74.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,7:0,0,0,21
chr1	150595354	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=125,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.155:40:18,1:12,1:23,9,1,7
chr1	150671243	.	AC	A	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=133.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,42:0.468:90:24,19:24,22:11,37,8,34
chr1	150672550	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=183,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,2,1
chr1	150676485	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=216,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr1	150676674	.	TAA	T,TA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,28,28;MFRL=177,157,163;MMQ=60,60,60;MPOS=14,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=7.25,5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,7,4:0.320,0.231:20:2,4,3:6,3,1:3,6,3,8
chr1	150679358	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=189,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr1	150730279	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:5,7:2,7:7,0,14,0
chr1	150771746	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,0:7,6:4,11,0,6
chr1	150789961	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,1:2,6:0,5,1,6
chr1	150799125	.	CT	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.224:46:16,9:9,1:8,28,3,7
chr1	150799189	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:20,2:1,1:0,21,0,3
chr1	150804429	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr1	150808844	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:13,0:11,13,2,0
chr1	150849071	.	ACCC	A,AC,ACC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,26,27,25;MFRL=145,185,153,166;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,17,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,8,9,10;RU=C;STR;TLOD=3.29,14.64,19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,7,9:0.114,0.356,0.446:19:1,2,3,3:0,0,4,3:0,1,0,18
chr1	150917623	.	TG	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=14,24;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.500:42:3,6:5,7:4,17,3,18
chr1	150923774	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=170,247;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:6,0,3,2
chr1	150932977	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=198,172;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,1:5,0,2,0
chr1	150933381	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.180:18:5,0:7,0:0|1:150933381_A_C:150933381:0,15,3,0
chr1	150933388	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.142:23:10,0:9,0:0|1:150933381_A_C:150933381:4,16,3,0
chr1	150933390	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,21;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,1:9,0:0|1:150933381_A_C:150933381:5,18,2,0
chr1	150933391	.	T	TGGGGGG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,19;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,0:0|1:150933381_A_C:150933381:5,17,2,0
chr1	150935087	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,0:15,2:8,20,0,2
chr1	150938571	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:9,0,2,1
chr1	150938616	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,7:0,12:0,0,14,6
chr1	150939744	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,1:9,1:10,3,1,1
chr1	150940490	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=211,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	150940500	.	C	CCCCTCCTCTCCCCTTCCCTCCTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr1	150941381	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=197,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.446:20:4,2:6,5:11,0,6,3
chr1	150956647	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=203,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:4,5,0,2
chr1	150958977	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=178,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.633:22:2,10:5,4:8,0,9,5
chr1	150972538	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	150974162	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	150974311	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,3:5,6:6,5,3,6
chr1	150990466	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	150997940	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,15,6
chr1	150998221	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=252,196;MMQ=55,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr1	150999863	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr1	151001317	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:7,5,3,0
chr1	151006787	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,32;MFRL=209,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:151006787_C_CA:151006787:0,1,0,1
chr1	151006790	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,26;MFRL=209,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:151006787_C_CA:151006787:0,1,0,1
chr1	151006792	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=15,27;MFRL=209,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:151006787_C_CA:151006787:0,1,0,1
chr1	151019180	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,7,15
chr1	151026815	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr1	151028234	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=146.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,21:0,22:0,0,9,35
chr1	151039609	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	151070252	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,182;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:1,2:2,0,3,0
chr1	151104950	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,9:0,13:0,0,29,0
chr1	151109641	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	151111064	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,15;MFRL=147,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.432:4:1,0:1,0:0,2,2,0
chr1	151114882	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr1	151115186	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	151139082	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=180,169;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,0:4,3:0,4,0,3
chr1	151144057	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:5,3:5,1,1,3
chr1	151144894	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.258:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr1	151149601	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,12:0,0,3,16
chr1	151150513	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,30;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:8,0:11,11,1,1
chr1	151150678	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:151150678_C_A:151150678:0,2,0,1
chr1	151150682	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:151150678_C_A:151150678:0,2,0,1
chr1	151210789	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr1	151212399	.	C	CCTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,3:0,0,5,2
chr1	151237589	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	151239570	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,14:0,0,19,9
chr1	151263782	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	151314379	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	151317183	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=264,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr1	151337788	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr1	151339029	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,33;MFRL=166,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:151339029_A_T:151339029:0,1,0,1
chr1	151339030	.	T	TGCCAGGGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=166,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151339029_A_T:151339029:0,1,0,1
chr1	151339328	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:13,0:10,4:14,10,0,4
chr1	151341703	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.676:19:3,4:2,9:0,6,1,12
chr1	151341728	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,4:2,5:0,5,2,7
chr1	151373200	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=210.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,36:0,23:0,0,44,17
chr1	151373645	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,2:5,0:12,0,2,0
chr1	151377248	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	151380504	.	AAAAG	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=211,184;MMQ=50,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.480:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr1	151380508	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=181,212;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.372:10:5,0:2,2:0|1:151380508_G_A:151380508:7,0,3,0
chr1	151380511	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=181,212;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:4,0:0,2:0|1:151380508_G_A:151380508:11,0,3,0
chr1	151380514	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=181,212;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:6,0:1,2:0|1:151380508_G_A:151380508:11,0,3,0
chr1	151380517	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=160,220;MMQ=60,32;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:1,2:0|1:151380508_G_A:151380508:15,0,2,0
chr1	151380520	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=152,220;MMQ=60,32;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:3,2:0|1:151380508_G_A:151380508:16,0,2,0
chr1	151380523	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=150,220;MMQ=60,32;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:5,2:0|1:151380508_G_A:151380508:17,0,2,0
chr1	151380725	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:2,1:2,7,0,3
chr1	151381320	.	GA	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=68.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.964:23:0,6:0,17:0,0,1,22
chr1	151384338	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=195,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:3,2:6,1:0,10,0,3
chr1	151384711	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	151384733	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr1	151395782	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	151396037	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=68.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,3,20
chr1	151400942	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,1,20
chr1	151402045	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr1	151499635	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr1	151501737	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	151512802	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,12:0,0,21,4
chr1	151542099	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=92.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,13:0,0,27,3
chr1	151546657	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr1	151546931	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=102.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,11:0,17:0,0,0,29
chr1	151551320	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,10:0,0,2,12
chr1	151552301	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,4:0,15:0,0,0,19
chr1	151679900	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=190,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr1	151681635	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,1:6,4:3,5,3,3
chr1	151686983	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,1:2,2:5,0,3,0
chr1	151700189	.	C	CCTG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,7:0,0,1,11
chr1	151700214	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=107,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:0,0:3,3:1,2,0,4
chr1	151701345	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:1,5,2,3
chr1	151732700	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0|1:151732700_A_G:151732700:1,4,0,4
chr1	151732721	.	A	AATACTGGGGTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:151732700_A_G:151732700:0,2,0,1
chr1	151740479	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,9:0,0,18,1
chr1	151742588	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=203,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:7,1,1,1
chr1	151742798	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr1	151747043	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,5:5,5:2,8,1,9
chr1	151747733	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:8,4:0,6:0,8,6,4
chr1	151747799	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,7:1,2:6,1,9,0
chr1	151748425	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,5:2,6:0,8,0,11
chr1	151751081	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,3:3,7:0,3,2,8
chr1	151754112	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=189,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	151773335	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:5,0:9,1,2,0
chr1	151780177	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,0:1,10:0,3,0,10
chr1	151789588	.	C	CTG,CTGTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,27,34;MFRL=0,157,185;MMQ=60,49,40;MPOS=0,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=TG;STR;TLOD=3.23,6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,1,1:0,0,1:0,0,3,0
chr1	151789609	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:151789609_C_T:151789609:0,0,3,0
chr1	151789611	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,0:0|1:151789609_C_T:151789609:0,0,3,0
chr1	151789613	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=185,157;MMQ=40,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr1	151789647	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,36;MFRL=159,8863016;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:5,1:8,1,1,1
chr1	151798295	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=179,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr1	151810304	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr1	151881885	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	152009530	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	152083618	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=139,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,4:3,2:5,4,4,2
chr1	152185762	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=16,32;MFRL=1614,264;MMQ=57,58;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.788:12:0,5:0,3:0|1:152185762_C_G:152185762:2,0,6,4
chr1	152185768	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=19,30;MFRL=1614,202;MMQ=57,55;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:0,5:0,2:0|1:152185762_C_G:152185762:2,0,5,4
chr1	152185774	.	A	G,T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,23,19;MFRL=0,129,1614;MMQ=60,48,57;MPOS=0,6;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.24,6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.600,0.300:7:0,3,0:0,1,0:0,0,4,3
chr1	152185777	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,13;MFRL=101,1614;MMQ=48,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,0:1,0:1|0:152185762_C_G:152185762:1,1,2,0
chr1	152185779	.	C	CATCAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=101,1614;MMQ=48,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,0:0,2:1|0:152185762_C_G:152185762:1,1,2,0
chr1	152186955	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,155;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:20,3:21,0:38,3,3,0
chr1	152187633	.	G	T	.	.	DP=124;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=171,174;MMQ=24,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:114,7:0.050:121:48,2:61,3:40,74,6,1
chr1	152187640	.	C	T	.	.	DP=122;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=171,192;MMQ=24,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,5:0.046:122:54,1:61,3:43,74,2,3
chr1	152188998	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=180,147;MMQ=24,24;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,13:0.208:62:20,6:27,5:1,48,3,10
chr1	152190713	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=200,230;MMQ=24,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:0|1:152190713_C_T:152190713:6,0,4,0
chr1	152190720	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,24;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:152190713_C_T:152190713:0,0,10,0
chr1	152193544	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0|1:152193544_A_G:152193544:0,0,8,10
chr1	152193547	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,9:0,12:0|1:152193544_A_G:152193544:0,0,8,14
chr1	152193990	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,10:0,0,3,13
chr1	152195728	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr1	152278259	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,245;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0|1:152278259_C_T:152278259:0,0,0,1
chr1	152278284	.	TG	AT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,245;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152278259_C_T:152278259:0,0,0,1
chr1	152278289	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,245;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152278259_C_T:152278259:0,0,0,1
chr1	152278291	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,245;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152278259_C_T:152278259:0,0,0,1
chr1	152279002	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=145,159;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:31,3:24,0:26,29,2,1
chr1	152279237	.	CTGA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=244,230;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:152279237_CTGA_C:152279237:0,1,0,1
chr1	152279244	.	TG	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=244,230;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:152279237_CTGA_C:152279237:0,1,0,1
chr1	152279250	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=244,230;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:152279237_CTGA_C:152279237:0,1,0,1
chr1	152382802	.	T	G	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=129,95;MMQ=60,33;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,5:0.067:77:29,2:35,2:26,46,2,3
chr1	152384498	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:6,0,7,0
chr1	152484444	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:8,0:12,2:12,10,2,0
chr1	152538646	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=161,171;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,10:0.171:52:11,1:20,1:31,11,0,10
chr1	152552461	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.554:49:8,10:12,17:6,16,4,23
chr1	152671409	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.151:34:17,0:5,0:0|1:152671409_A_C:152671409:7,22,5,0
chr1	152671416	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.124:37:13,1:7,0:0|1:152671409_A_C:152671409:9,24,4,0
chr1	152681543	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=196.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,29:0,27:0,0,40,18
chr1	152681680	.	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=76.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.400:52:15,3:16,11:10,21,7,14
chr1	152682058	.	TTTTCTGA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	152691943	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=130,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:4,1:2,1:5,1,3,0
chr1	152692948	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:6,3:1,6:0|1:152692948_T_A:152692948:4,4,4,6
chr1	152692952	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:4,4:2,6:0|1:152692948_T_A:152692948:4,4,4,6
chr1	152759678	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=189,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.365:31:16,7:3,4:20,0,11,0
chr1	152816528	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:1,13,0,2
chr1	152957738	.	C	G	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=152,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.070:68:30,2:19,0:40,24,4,0
chr1	152957832	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=186,179;MMQ=52,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.479:43:10,7:10,10:4,18,6,15
chr1	152957887	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.652:24:5,7:3,8:4,4,7,9
chr1	153004721	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.438:41:13,6:10,10:23,0,18,0
chr1	153004778	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,24:0.363:67:26,13:15,11:38,5,21,3
chr1	153004809	.	T	C	.	.	DP=113;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=140.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,47:0.442:107:32,22:26,25:36,24,31,16
chr1	153004983	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,167;MMQ=52,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,25:0.535:47:6,13:12,9:6,16,8,17
chr1	153066262	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=203,250;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,2:7,1:1,11,1,2
chr1	153122310	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:10,2:6,6:15,1,7,1
chr1	153122620	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=185,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:1,3,0,5
chr1	153234602	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr1	153234689	.	A	ACTTTTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153234689_A_ACTTTTC:153234689:0,0,0,1
chr1	153234693	.	T	TTTTTA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153234689_A_ACTTTTC:153234689:0,0,0,1
chr1	153234699	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153234689_A_ACTTTTC:153234689:0,0,0,1
chr1	153270362	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,6:5,5:11,0,11,0
chr1	153271524	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	153271637	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=121,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,0:6,2:4,11,1,1
chr1	153277423	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,98;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:8,6:9,1:14,3,4,3
chr1	153279462	.	TAAG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=154,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:1,1:4,1,2,0
chr1	153283004	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:4,6:4,1:9,0,7,0
chr1	153314347	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=209,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	153315467	.	T	TAAG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=75.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,8:0,0,17,1
chr1	153315784	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	153317723	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,3:3,4:10,2,4,3
chr1	153320372	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,22:0.439:51:13,11:13,11:13,16,12,10
chr1	153320401	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,34:0.612:55:9,19:12,12:9,12,12,22
chr1	153333137	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=150,70;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,4:0.094:51:14,4:28,0:0|1:153333137_A_T:153333137:31,16,3,1
chr1	153333141	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=149,70;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.098:49:15,4:27,0:0|1:153333137_A_T:153333137:29,16,3,1
chr1	153431561	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr1	153509890	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.324:29:13,5:6,4:4,16,2,7
chr1	153514005	.	C	CTTCCACTGTCGCAGATTGCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,1:0.236:8:3,1:3,0:0,7,0,1
chr1	153516162	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:15,1:8,2:22,1,3,0
chr1	153516439	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:6,11:6,5:0,12,2,14
chr1	153587308	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	153588208	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=64.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,18,1
chr1	153591606	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	153598927	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:8,0:12,2:11,11,1,1
chr1	153604112	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.913:21:1,8:0,11:0,1,17,3
chr1	153609039	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,24,3
chr1	153635425	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,3:0,0,11,1
chr1	153636468	.	CTA	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0|1:153636468_CTA_C:153636468:0,0,19,0
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chr1	153636860	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,10:0,4:0,0,13,2
chr1	153637617	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	153640665	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	153642198	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=201,211;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,1:6,1:7,0,2,0
chr1	153656352	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	153656405	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	153660514	.	AC	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=106.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,11:0,17:0,0,22,14
chr1	153661374	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr1	153661414	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=178,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.342:12:3,0:3,0:3,5,4,0
chr1	153661591	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,14;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:4,0:0,10,0,2
chr1	153662423	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:0,3,0,6
chr1	153665919	.	T	TC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr1	153713100	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=162,146;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:0|1:153713100_T_A:153713100:13,3,2,0
chr1	153713102	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=162,146;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:0|1:153713100_T_A:153713100:13,3,2,0
chr1	153743317	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	153746462	.	G	GT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.209:21:5,0:8,2:6,11,0,4
chr1	153746474	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:1,1:4,6:0,6,2,7
chr1	153750207	.	C	CCTT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.618:19:3,4:4,6:0|1:153750207_C_CCTT:153750207:7,0,11,1
chr1	153750214	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=44.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.565:21:2,4:6,7:0|1:153750207_C_CCTT:153750207:9,0,11,1
chr1	153751799	.	CTG	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.515:33:5,8:11,8:6,10,8,9
chr1	153906397	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:3,4:11,9:1,13,2,11
chr1	153913140	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=214,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:7,0:7,4:0,15,0,4
chr1	153913684	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:14,1:8,5:16,6,5,1
chr1	153923863	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.381:13:6,1:1,2:5,3,0,5
chr1	153941390	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:3,8:3,9:5,1,15,2
chr1	153954674	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.692:37:5,16:6,10:1,10,2,24
chr1	153954816	.	TAC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=145,75;MMQ=60,47;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.191:14:6,1:5,1:9,3,2,0
chr1	153974545	.	T	TAGAAAACACCGTATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=208,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	154026642	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=215,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:6,0,6,0
chr1	154061855	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr1	154072647	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=169,257;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:13,0:9,3:0|1:154072647_A_T:154072647:6,17,1,2
chr1	154072653	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=169,257;MMQ=60,41;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:13,0:7,2:0|1:154072647_A_T:154072647:5,18,1,2
chr1	154072663	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=170,218;MMQ=60,41;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,1:8,2:2,16,0,3
chr1	154072680	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=171,195;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,1:7,1:1,15,0,2
chr1	154141908	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:6,2:3,3:0,9,0,6
chr1	154144681	.	A	T	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,28:0.407:69:20,14:21,14:19,22,10,18
chr1	154144693	.	A	G	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,6:0.089:76:29,6:37,0:33,37,6,0
chr1	154144959	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=200,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:4,3:2,3:0,6,0,7
chr1	154145532	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:8,10:7,7:11,4,12,5
chr1	154192429	.	T	TA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:11,4:9,13:2,18,0,18
chr1	154207834	.	AT	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=25,15;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:7,0:8,2:0,19,1,5
chr1	154227292	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr1	154243236	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=156,258;MMQ=60,34;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:154243236_T_TG:154243236:2,0,1,0
chr1	154243246	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=19,30;MFRL=156,258;MMQ=60,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:154243236_T_TG:154243236:2,0,1,0
chr1	154243262	.	T	TTTTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=143,258;MMQ=60,34;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:154243236_T_TG:154243236:1,0,1,0
chr1	154245142	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.470:47:17,11:8,11:19,6,19,3
chr1	154294560	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:7,8:11,2:5,13,2,8
chr1	154305010	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,2:7,4:8,1,6,0
chr1	154313232	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=198,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:1,0,1,4
chr1	154315170	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=194,596;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:154315170_TG_CA:154315170:3,1,1,0
chr1	154315173	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=194,596;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:154315170_TG_CA:154315170:3,1,1,0
chr1	154316996	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.496:24:10,7:2,4:2,10,0,12
chr1	154317418	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:6,5:5,4:10,1,9,0
chr1	154321072	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	154401972	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,6:1,3:0,2,0,9
chr1	154408676	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,0:12,3:0,20,0,3
chr1	154426947	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:6,1,4,0
chr1	154437896	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr1	154458932	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	154459197	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr1	154461840	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:8,1:3,10,0,2
chr1	154479657	.	C	CAT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=83.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0,0,17,3
chr1	154479670	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=170,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,3:6,4:6,4,6,1
chr1	154492702	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:9,0,5,0
chr1	154492759	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:9,4:13,0:16,6,4,0
chr1	154493721	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	154523562	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=189,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:2,1:1,5:0,4,1,5
chr1	154523588	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr1	154524973	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:10,7:8,1:8,10,5,3
chr1	154528053	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=146,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,3:3,5:1,9,0,8
chr1	154528086	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	154557685	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,20:0.437:46:18,8:8,11:18,8,15,5
chr1	154558379	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr1	154569347	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,133;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:8,2:16,0:12,12,2,0
chr1	154573419	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	154744937	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,5:0,0,0,13
chr1	154832290	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=185,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:0,6,0,4
chr1	154832322	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=162,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	154898981	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=182,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:1,2,0,3
chr1	154924015	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=81,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,2:1,1,1,7
chr1	154941180	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,17;MFRL=194,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.261:20:7,2:4,0:0|1:154941180_A_C:154941180:4,11,5,0
chr1	154941182	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:7,0:8,0:0|1:154941180_A_C:154941180:5,12,4,0
chr1	154941189	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=29,11;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:11,0:12,0:0|1:154941180_A_C:154941180:10,18,4,0
chr1	154990939	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=14,24;MFRL=186,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:0,0:4,0,1,0
chr1	154995503	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	155001929	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,2:2,7:0,4,0,9
chr1	155003954	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=180,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr1	155003991	.	T	TTTGGCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155003991_T_TTTGGCC:155003991:0,0,1,0
chr1	155003995	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=218,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:155003991_T_TTTGGCC:155003991:1,0,1,0
chr1	155004000	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:0,1:0|1:155003991_T_TTTGGCC:155003991:2,0,1,0
chr1	155028522	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=263,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,0,4
chr1	155034859	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=178,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.102:36:15,0:14,0:0|1:155034859_T_G:155034859:28,5,0,3
chr1	155034865	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=177,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.122:38:15,1:15,1:0|1:155034859_T_G:155034859:29,5,0,4
chr1	155057499	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.421:29:7,7:9,4:16,1,12,0
chr1	155057650	.	T	G	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,14:0.132:78:22,1:19,1:30,34,0,14
chr1	155058423	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:15,3:24,0:21,19,1,2
chr1	155106487	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:12,9:5,9:10,7,11,7
chr1	155106550	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=166,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.407:30:11,6:7,6:4,14,2,10
chr1	155108287	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.569:26:2,10:8,3:5,6,8,7
chr1	155108663	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,10:0,3:0,0,15,0
chr1	155142210	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=73.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,26:0.500:52:7,11:19,15:24,2,23,3
chr1	155142229	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=120.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,43:0.559:77:6,21:26,21:29,5,34,9
chr1	155148797	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155148797_G_A:155148797:0,0,0,1
chr1	155148799	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155148797_G_A:155148797:0,0,0,1
chr1	155160788	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=127,107;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,3:0.047:82:42,3:32,0:51,28,3,0
chr1	155160796	.	G	A	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,107;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,3:0.049:80:43,3:33,0:47,30,3,0
chr1	155161050	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=210,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	155167786	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.476:45:8,7:11,14:9,15,14,7
chr1	155181843	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,206;MMQ=48,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:4,0,7,0
chr1	155182164	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,163;MMQ=52,30;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.535:41:9,3:10,18:14,5,20,2
chr1	155184975	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=183,137;MMQ=36,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:2,6,1,7
chr1	155205669	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,6:0,0,0,15
chr1	155206341	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=213,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,1,4
chr1	155207464	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=192,190;MMQ=50,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:0,8,0,2
chr1	155209360	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=121,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,5:7,7:9,1,10,2
chr1	155255084	.	GA	CC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.169:23:8,0:6,0:0|1:155255084_GA_CC:155255084:10,9,0,4
chr1	155255089	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.163:24:7,0:7,1:0|1:155255084_GA_CC:155255084:10,10,0,4
chr1	155294772	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,5,14
chr1	155307488	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:16,1:6,2:12,10,2,1
chr1	155313047	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,13,1
chr1	155330258	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=65,223;MMQ=57,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:155330258_G_A:155330258:0,2,0,1
chr1	155330265	.	CC	GG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=130,223;MMQ=54,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155330258_G_A:155330258:0,1,0,1
chr1	155330269	.	CT	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=179,223;MMQ=57,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:155330258_G_A:155330258:0,2,0,1
chr1	155330277	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=179,223;MMQ=57,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:155330258_G_A:155330258:0,2,0,1
chr1	155385780	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,16;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.435:7:2,0:1,1:0|1:155385780_C_A:155385780:0,4,0,3
chr1	155385782	.	T	TAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.433:7:3,0:1,2:0|1:155385780_C_A:155385780:0,4,0,3
chr1	155686739	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=180,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.300:14:2,2:6,2:8,2,3,1
chr1	155686810	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:27,1:27,2:19,38,1,2
chr1	155686900	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=168,237;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:10,1:17,2:6,21,0,3
chr1	155720556	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.230:15:5,2:6,1:0,12,0,3
chr1	155720567	.	G	GTT	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=180,68159;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=T;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr1	155720578	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=185,68159;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:155720578_G_A:155720578:0,10,0,2
chr1	155720586	.	TC	AG	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=184,68159;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:155720578_G_A:155720578:0,9,0,2
chr1	155720591	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=185,68159;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:155720578_G_A:155720578:0,10,0,2
chr1	155720593	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=185,68159;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:155720578_G_A:155720578:0,10,0,2
chr1	155726655	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=215,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:9,0,2,0
chr1	155737385	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	155737425	.	AACAC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,15;MFRL=195,223;MMQ=33,33;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AC;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,0:0,2,0,3
chr1	155746340	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.877:13:1,4:0,5:0,1,0,12
chr1	155753676	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr1	155755239	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	155765028	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=189,221;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:155765028_A_T:155765028:0,3,0,1
chr1	155765040	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=189,221;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:155765028_A_T:155765028:0,3,0,1
chr1	155765043	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=101,221;MMQ=54,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:155765028_A_T:155765028:0,2,0,1
chr1	155783534	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.591:23:1,0:5,3:6,3,0,14
chr1	155785578	.	CAACT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr1	155790556	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:155790556_GA_G:155790556:0,3,0,1
chr1	155790558	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:155790556_GA_G:155790556:0,3,0,1
chr1	155822971	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	155823002	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	155823122	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:8,3:18,0:12,14,3,0
chr1	155837865	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,14,7
chr1	155838661	.	G	GTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=208,242;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	155870416	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,7:4,7:2,6,1,13
chr1	155880760	.	C	CA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.548:40:7,10:11,12:0,18,0,22
chr1	155887375	.	GGGGGCT	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGGGCT;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.093:29:11,0:13,2:27,0,2,0
chr1	155897046	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=173,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:155897046_A_T:155897046:0,3,0,1
chr1	155897048	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=173,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:155897046_A_T:155897046:0,3,0,1
chr1	155899020	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,6:3,6:7,0,11,1
chr1	155903408	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.513:29:6,8:8,6:10,4,9,6
chr1	155917880	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=199,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.431:28:8,8:7,3:0,16,1,11
chr1	155920077	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:5,3,1,1
chr1	155920117	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=119,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:5,3,0,2
chr1	155922124	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	155928232	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,1:4,4:0|1:155928232_T_C:155928232:2,8,1,4
chr1	155928242	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=192,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,0:4,3:0|1:155928232_T_C:155928232:1,5,0,4
chr1	155981489	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr1	155990612	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.189:23:8,0:6,0:18,1,4,0
chr1	156011444	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=145,208;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.449:27:9,3:6,9:6,9,3,9
chr1	156012511	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=230,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:6,1,4,0
chr1	156024970	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=255,293;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:156024970_G_C:156024970:1,1,1,0
chr1	156024979	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,16;MFRL=160,293;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:156024970_G_C:156024970:3,0,1,0
chr1	156024986	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,16;MFRL=160,293;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:0,0:0|1:156024970_G_C:156024970:3,0,1,0
chr1	156051862	.	A	AAATTAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,15;MFRL=227,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,0:0|1:156051862_A_AAATTAT:156051862:0,2,0,1
chr1	156051863	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=227,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:156051862_A_AAATTAT:156051862:0,2,0,1
chr1	156096387	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,21:0.381:55:19,7:14,11:21,13,7,14
chr1	156096417	.	T	G	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,23:0.408:57:19,14:14,9:14,20,3,20
chr1	156099630	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,24:0.477:50:14,11:12,11:15,11,12,12
chr1	156099669	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=141,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.456:42:13,9:9,10:9,14,9,10
chr1	156105028	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:10,6:8,14:11,7,10,10
chr1	156105676	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.763:2:0,0:0,0:0|1:156105676_T_G:156105676:0,0,2,0
chr1	156105680	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=112,291;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:1,0:0,0:0|1:156105676_T_G:156105676:1,0,2,0
chr1	156105687	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,13;MFRL=115,291;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,0:0,0:0|1:156105676_T_G:156105676:2,0,2,0
chr1	156105928	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:1,8:9,4:0,10,3,10
chr1	156106185	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.619:27:3,11:7,5:5,5,6,11
chr1	156106863	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.372:24:7,5:8,2:5,10,3,6
chr1	156108976	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr1	156109027	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=204,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	156130738	.	T	TGGG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=159,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,2:5,0:4,8,2,0
chr1	156142717	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=173,144;MMQ=60,28;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:9,3:9,0:0|1:156142717_G_A:156142717:13,5,3,0
chr1	156142722	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,144;MMQ=60,28;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,3:8,0:0|1:156142717_G_A:156142717:12,6,3,0
chr1	156146391	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:19,0:14,3:20,15,0,3
chr1	156146640	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:6,5:7,10:5,8,7,9
chr1	156169610	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=199,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:0,7:3,5:3,0,12,0
chr1	156182710	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.378:13:3,1:5,2:8,0,5,0
chr1	156182816	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.428:47:10,15:17,5:17,10,13,7
chr1	156203399	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:5,6:0,5:3,2,10,1
chr1	156203572	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=19,36;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.450:7:0,0:1,3:0,4,0,3
chr1	156206158	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.498:44:12,8:8,12:8,14,12,10
chr1	156213625	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=185,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:2,0:1,1:4,0,1,0
chr1	156214271	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=196,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:156214271_C_CT:156214271:1,1,0,1
chr1	156214276	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=226,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:156214271_C_CT:156214271:1,0,0,1
chr1	156214733	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=215,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr1	156215562	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,2:5,6:8,4,7,1
chr1	156219450	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:4,5:5,4:9,1,8,1
chr1	156230429	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,3:7,5:2,11,0,8
chr1	156233143	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:7,6:15,7:18,4,14,0
chr1	156237506	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.438:9:1,1:3,1:3,2,0,4
chr1	156244559	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=266,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	156246792	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,2:3,2:5,0,5,0
chr1	156252291	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:2,0:1,2:4,0,2,0
chr1	156255833	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr1	156256000	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,4,1
chr1	156263097	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:4,2:7,6:6,5,4,5
chr1	156265388	.	T	G	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.081:63:18,1:28,1:32,26,0,5
chr1	156265399	.	TG	GC	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.081:61:18,0:26,0:28,28,0,5
chr1	156265439	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,24:0.466:52:12,8:14,16:3,25,7,17
chr1	156269375	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=182,151;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:156269375_C_G:156269375:0,4,0,2
chr1	156269377	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=182,151;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:0|1:156269375_C_G:156269375:0,4,0,2
chr1	156269378	.	G	GGCA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=182,151;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,0:0|1:156269375_C_G:156269375:0,4,0,2
chr1	156269383	.	ACC	GTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=184,142;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156269375_C_G:156269375:0,3,0,1
chr1	156269413	.	CC	GT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156269413_CC_GT:156269413:0,0,0,1
chr1	156269420	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156269413_CC_GT:156269413:0,0,0,1
chr1	156280296	.	GATAA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=185,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATAA;STR;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,4:2,1:5,1,4,1
chr1	156280671	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,6:3,5:8,1,11,0
chr1	156281020	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,8:7,4:0,13,0,12
chr1	156287360	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,4:1,4:0,3,1,7
chr1	156294661	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.373:9:2,1:2,1:6,0,3,0
chr1	156304782	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=210,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:0,4,0,5
chr1	156308031	.	GGA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GA;STR;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.565:14:1,4:4,3:0,6,0,8
chr1	156351792	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:9,4:2,3:5,6,6,2
chr1	156352447	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=166,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	156352690	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=183,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:1,2:9,0:0,11,0,2
chr1	156374256	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=187,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,3:3,5:6,0,7,1
chr1	156374449	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:2,15,0,2
chr1	156399253	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=188,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chr1	156438071	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.220:42:10,1:9,0:17,14,0,11
chr1	156446242	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,19:0,7:0,0,18,9
chr1	156496188	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	156500180	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=237,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	156502972	.	C	CATATAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=154,177;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=AT;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:1,0:0|1:156502972_C_CATATAT:156502972:0,3,0,2
chr1	156502975	.	G	GGATATT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=154,144;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:156502972_C_CATATAT:156502972:0,3,0,1
chr1	156502977	.	A	AGGAACCAAATC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=154,144;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:156502972_C_CATATAT:156502972:0,3,0,1
chr1	156502993	.	T	TCATTATAATCTCAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=222,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	156503541	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=109.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,12:0,0,22,10
chr1	156504885	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:3,0:10,0,2,0
chr1	156509552	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	156520173	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	156526234	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	156530653	.	GC	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,13;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:4,0,1,0
chr1	156531871	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	156532344	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,12:0,11:0,0,18,6
chr1	156532908	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=89.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.969:27:0,15:0,12:0,0,15,12
chr1	156534525	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,19:0,10:0,0,5,24
chr1	156534539	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,13:0,8:0,0,3,19
chr1	156535721	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:2,0:7,0,2,0
chr1	156536123	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=106.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,24,0
chr1	156536133	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=119.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,28,0
chr1	156536353	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=100.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,15:0,12:0,0,0,27
chr1	156539154	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=110.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,9:0,22:0,0,23,9
chr1	156553762	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=78.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,12:0,0,0,22
chr1	156561557	.	G	GGGGCCGGGCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=GGGCC;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	156562008	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=96.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0,0,9,21
chr1	156562143	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,12:0,0,17,7
chr1	156562256	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=160,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,2:0.051:57:26,1:24,1:29,26,1,1
chr1	156562271	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=162,96;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:19,0:18,0:20,22,0,2
chr1	156562277	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:15,1:10,0:16,20,0,3
chr1	156563898	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,6,13
chr1	156564922	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,7,3
chr1	156565049	.	A	AAC	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=326.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,76:0.988:76:0,28:0,47:0,0,37,39
chr1	156565172	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,155;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,5:0.069:75:27,0:39,4:24,46,1,4
chr1	156566111	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=132,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:4,2:5,2:8,1,5,0
chr1	156594803	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,448;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156594803_G_A:156594803:0,0,1,0
chr1	156594805	.	G	GCCGCCTGGAAGTTTTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,448;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156594803_G_A:156594803:0,0,1,0
chr1	156617836	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:4,1:11,2:7,9,2,1
chr1	156626063	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:6,2:9,5,2,0
chr1	156626920	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	156639636	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=180,181;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,6:2,1:5,0,5,2
chr1	156640678	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,2,12
chr1	156670531	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=168,261;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,0:8,2:1,9,1,1
chr1	156670545	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr1	156693135	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:8,6:5,4:11,2,7,4
chr1	156696788	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.081:46:20,1:21,2:30,13,2,1
chr1	156706559	.	A	C,G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35,35;MFRL=0,195,157;MMQ=60,60,60;MPOS=21,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.21,10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.375,0.500:5:0,1,1:0,1,2:0,0,1,4
chr1	156707775	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=125.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,12:0,21:0,0,29,4
chr1	156721032	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.593:18:6,6:1,3:7,0,11,0
chr1	156752207	.	A	AGGATTCATTATTGGATTGTTGCTTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	156752223	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	156752231	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=202,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr1	156761618	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=118,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,3:3,3:2,4,1,5
chr1	156779382	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=22,10;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,0:2,0:0|1:156779382_T_G:156779382:3,0,2,0
chr1	156779385	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=22,10;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,0:3,0,2,0
chr1	156779388	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=21,10;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,0:2,0:0|1:156779382_T_G:156779382:3,0,2,0
chr1	156779393	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:0,0:3,0:0|1:156779382_T_G:156779382:4,0,2,0
chr1	156779408	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=26,13;MFRL=180,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,0:3,0:7,2,2,0
chr1	156785762	.	AG	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,14:0.384:37:13,6:10,6:0|1:156785762_AG_A:156785762:11,12,7,7
chr1	156785771	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,15:0.410:37:10,7:8,7:0|1:156785762_AG_A:156785762:11,11,8,7
chr1	156785779	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=184,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,16:0.447:36:11,5:8,7:0|1:156785762_AG_A:156785762:11,9,10,6
chr1	156815110	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,5:4,5:6,3,6,4
chr1	156823921	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=158,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:7,6,2,0
chr1	156838141	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	156874872	.	G	GGCCAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156874872_G_GGCCAA:156874872:0,0,0,1
chr1	156874873	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156874872_G_GGCCAA:156874872:0,0,0,1
chr1	156874876	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156874872_G_GGCCAA:156874872:0,0,0,1
chr1	156875092	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,5,2
chr1	156875097	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=43.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,8,2
chr1	156875107	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,8,1
chr1	156875985	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	156880621	.	G	GGATGACATTTCAACCTTTGCTCTATCAGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	156884365	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	156890787	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,4:8,8:1,11,0,12
chr1	156894354	.	G	GCGGGCCCC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.375:8:3,1:0,0:2,3,3,0
chr1	156894356	.	T	C,TG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,32,24;MFRL=182,192,228;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.15,5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.356,0.281:8:3,2,0:0,0,2:0,3,5,0
chr1	156894363	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=176,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,2:0,1:0|1:156894363_A_C:156894363:2,3,4,0
chr1	156894367	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=176,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:4,1:1,1:0|1:156894363_A_C:156894363:2,3,2,0
chr1	156894613	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:3,2,2,2
chr1	156894825	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.304:13:7,0:2,2:2,7,2,2
chr1	156899288	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,6:9,2:5,8,1,7
chr1	156899592	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:4,5:9,2:1,12,2,5
chr1	156901888	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:6,2:0,3:0,6,0,5
chr1	156902222	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:14,7:5,9:12,7,11,5
chr1	156902259	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,28:0,17:0,0,25,20
chr1	156906881	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:1,2,0,4
chr1	156907031	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:6,6:8,7:12,2,11,2
chr1	156914070	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=198,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,5:2,6:2,1,10,1
chr1	156914240	.	CCATTCATT	C,CCATT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,36,36;MFRL=0,199,169;MMQ=60,60,60;MPOS=17,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=CATT;STR;TLOD=10.61,22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,6:0.346,0.596:9:0,1,1:0,2,4:0,0,0,9
chr1	156915038	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=217,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:4,4:0,7,0,6
chr1	156916640	.	G	GCCTATCCCTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=209,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.432:14:2,1:6,4:6,2,3,3
chr1	156917343	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	156925435	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=132,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:5,5:5,4:8,2,9,0
chr1	156928776	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,25:0.604:41:7,11:7,11:11,5,14,11
chr1	156939175	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:3,6,0,3
chr1	156941412	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr1	156941421	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=172,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:9,0,2,0
chr1	156946898	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:2,3:1,2:1,2,0,6
chr1	156947928	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:2,3:5,3:7,0,7,0
chr1	156947953	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.537:39:5,11:12,9:13,5,18,3
chr1	156948956	.	CCCT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:3,3:5,7:5,3,6,4
chr1	156954267	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,2,23
chr1	156956057	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=96,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,2:1,0:0,2,0,2
chr1	157062575	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:6,3:2,4:6,3,6,1
chr1	157485561	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=197,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,1:3,4:7,0,3,3
chr1	157485601	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=189,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.353:14:6,1:3,2:8,1,0,5
chr1	157485720	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,13:0,0,12,15
chr1	157490710	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:6,0,3,0
chr1	157491173	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=211,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,4:0,5,0,7
chr1	157508801	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=214,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:5,5:0,4:5,0,9,0
chr1	157514034	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,33284011;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,1:3,1:6,2,1,1
chr1	157545231	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=160,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr1	157548669	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=113,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.593:30:2,8:10,10:2,10,6,12
chr1	157550066	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:8,3:7,14:11,5,13,5
chr1	157557957	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=208,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr1	157566019	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,5:8,0:11,0,5,0
chr1	157566211	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.614:29:6,8:5,10:2,9,0,18
chr1	157567751	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=262.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,73:0.987:73:0,30:0,41:0,0,29,44
chr1	157652929	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.618:19:3,7:4,5:7,0,12,0
chr1	157669580	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,4:3,4,0,6
chr1	157670290	.	C	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,33:0.454:73:24,14:15,19:18,22,15,18
chr1	157718283	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,25;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.921:15:0,5:0,9:1,0,12,2
chr1	157718430	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:4,2:6,7:3,8,1,9
chr1	157718645	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=123,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,4:5,2:4,1,5,1
chr1	157718780	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=122,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:3,5:4,0:3,4,1,5
chr1	157718835	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	157737504	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:1,2,0,5
chr1	157802979	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr1	157806006	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	157811392	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,17:0,0,21,6
chr1	157811585	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,4:3,5:0,9,0,9
chr1	158054379	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,5:4,4:0,10,0,9
chr1	158058109	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=111.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,19:0,0,18,17
chr1	158063551	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:6,5:7,7:4,10,4,8
chr1	158150826	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	158153996	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr1	158298679	.	T	TA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=168,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.143:32:18,1:7,2:24,4,4,0
chr1	158298837	.	T	TCC	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,115;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:23,0:11,6:4,30,0,6
chr1	158549189	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:1,7:7,10:6,2,5,12
chr1	158549502	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:13,2:9,16,0,2
chr1	158584091	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.479:13:2,2:3,4:1,6,2,4
chr1	158585230	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr1	158587784	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=126.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,20:0,0,23,13
chr1	158596027	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.654:33:5,9:6,11:3,8,8,14
chr1	158607788	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	158612548	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,5,0
chr1	158618223	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	158618480	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,7:2,3:1,3,1,9
chr1	158631257	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,5:3,1:0,3,0,6
chr1	158637865	.	GAAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.804:6:0,1:0,0:0,1,0,5
chr1	158647495	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,15:0,6:0,0,14,7
chr1	158647522	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,14,8
chr1	158647631	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.949:18:0,6:0,9:0,0,8,10
chr1	158647669	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr1	158654852	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr1	158655162	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr1	158656146	.	TTAAAAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,2:0,3:5,0,5,0
chr1	158656347	.	C	CAG,CAGAG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,33,36;MFRL=0,175,160;MMQ=60,60,60;MPOS=24,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=AG;STR;TLOD=7.01,24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,8:0.286,0.663:11:0,3,4:0,0,4:0,0,1,10
chr1	158656437	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=164,130;MMQ=33,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158656437_A_AG:158656437:0,1,0,1
chr1	158656441	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=164,130;MMQ=33,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158656437_A_AG:158656437:0,1,0,1
chr1	158669740	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,2:6,3:7,3,2,3
chr1	158735740	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:7,11:4,3:8,3,7,7
chr1	158736201	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:3,6:3,5:4,2,4,7
chr1	158736215	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.336:19:7,3:5,3:5,8,5,1
chr1	158747370	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.456:42:12,11:10,8:11,12,12,7
chr1	158817474	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	158818904	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,10:0.183:58:15,10:32,0:41,7,10,0
chr1	158909164	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=86.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0,0,21,6
chr1	158913525	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=119.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,15:0,15:0|1:158913525_A_G:158913525:0,0,27,4
chr1	158913532	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:8,6:12,6:0|1:158913525_A_G:158913525:15,5,11,1
chr1	158914566	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=214,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:3,0,6,0
chr1	158985652	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,19:0.394:49:12,9:17,10:27,3,18,1
chr1	158985831	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.407:37:11,6:11,8:1,21,1,14
chr1	158986561	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,21:0.393:54:15,9:18,12:2,31,3,18
chr1	159002301	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=213,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.614:29:2,9:9,9:11,0,17,1
chr1	159002557	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,5:4,7:0,12,0,12
chr1	159002577	.	TGGATTG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:7,1:2,8:0,9,0,9
chr1	159021445	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr1	159163119	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr1	159169463	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:7,7:2,4:9,0,11,0
chr1	159174824	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=121.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,19:0,0,10,25
chr1	159273791	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:4,5:3,4,4,4
chr1	159409533	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,15,1
chr1	159410340	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=189,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:5,2:4,2:1,8,2,3
chr1	159505356	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:13,1:3,1:12,5,2,0
chr1	159683438	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:7,12:11,4:11,7,9,7
chr1	159778699	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr1	159799599	.	C	CA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=75.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,12:0,11:0,0,18,6
chr1	159802627	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,6:0,0,12,1
chr1	159807822	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:8,17,0,2
chr1	159825916	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	159827456	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	159828128	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr1	159828746	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	159828781	.	CATATT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=208,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	159832395	.	G	GTTGCTGCTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	159832425	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	159842691	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	159846624	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=187,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.309:5:3,1:1,0:0|1:159846624_G_A:159846624:0,4,0,1
chr1	159846630	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=187,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.305:5:2,1:1,0:0|1:159846624_G_A:159846624:0,4,0,1
chr1	159854392	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr1	159869811	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=5;MBQ=28,10;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,7:0.109:56:20,0:20,0:20,29,7,0
chr1	159869820	.	A	C	.	.	DP=69;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,14:0.218:62:22,0:19,2:12,36,14,0
chr1	159869825	.	C	G	.	.	DP=72;ECNT=5;MBQ=32,18;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,7:0.110:67:24,0:25,0:17,43,7,0
chr1	159869836	.	G	GC	.	.	DP=78;ECNT=5;MBQ=32,9;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,7:0.091:74:35,1:30,1:0|1:159869836_G_GC:159869836:24,43,7,0
chr1	159869842	.	A	C	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,7:0.094:78:35,3:23,3:0|1:159869836_G_GC:159869836:25,46,7,0
chr1	159889686	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:0,8,1,3
chr1	159897126	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,33:0.515:64:18,17:12,16:21,10,24,9
chr1	159897388	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=180,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.540:24:3,4:7,8:0,11,1,12
chr1	159897681	.	TAAAAA	T,TAA,TAAA,TAAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,19,30,28,28;MFRL=0,230,170,228,221;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=28,24,24,3;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=15,10,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=5.89,3.72,5.35,5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:0,2,2,3,3:0.194,0.214,0.268,0.264:10:0,1,1,2,1:0,0,1,1,1:0,0,0,10
chr1	159902526	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	159906156	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,3:3,6:7,0,9,0
chr1	159912665	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=211,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr1	159922369	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	160057553	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	160062635	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=227,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	160064592	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:10,0,4,0
chr1	160090674	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr1	160090681	.	CCCTT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,19,1
chr1	160093222	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,8,13
chr1	160093911	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	160093927	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	160098927	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.526:19:3,4:6,6:4,5,2,8
chr1	160100264	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.503:28:5,9:8,5:10,4,5,9
chr1	160109626	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:6,2,3,0
chr1	160124875	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,14:0,0,12,12
chr1	160128994	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr1	160136225	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=205,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,4:3,1:8,1,5,0
chr1	160137300	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr1	160140950	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr1	160141196	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,13:0,0,10,19
chr1	160141268	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,4:7,6:3,9,4,7
chr1	160141286	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.635:20:4,6:3,6:3,4,5,8
chr1	160141636	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	160147502	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,4:3,0:2,5,1,3
chr1	160147517	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=145,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.376:14:5,4:4,1:0|1:160147517_A_G:160147517:1,8,0,5
chr1	160147521	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,4:3,1:0|1:160147517_A_G:160147517:0,8,0,5
chr1	160151450	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.543:29:7,5:6,9:8,5,12,4
chr1	160156258	.	C	CAATTTGTTATTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	160163446	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=186,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:2,4:6,5:0|1:160163446_C_T:160163446:8,1,10,0
chr1	160163449	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=186,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:3,3:6,6:0|1:160163446_C_T:160163446:8,1,10,0
chr1	160168918	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	160178356	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr1	160178376	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,4:3,3:8,1,7,1
chr1	160251792	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr1	160263124	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:9,9:9,9:12,8,11,8
chr1	160263147	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.080:47:23,0:20,3:29,15,3,0
chr1	160263286	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=181,181;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.230:15:5,1:5,1:2,10,0,3
chr1	160275434	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,16:0,9:0,0,25,2
chr1	160302354	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=16,35;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:0,0:0,4,1,1
chr1	160303542	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr1	160309664	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,3:3,5:4,3,6,2
chr1	160313330	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.544:44:9,11:10,12:6,14,4,20
chr1	160318940	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.483:21:7,5:3,5:1,10,2,8
chr1	160319274	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=152,141;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.139:27:6,0:15,3:15,9,0,3
chr1	160321656	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:5,3:4,5:1,8,2,7
chr1	160327865	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	160342162	.	C	CTTAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTAT;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.526:7:2,2:1,1:2,1,4,0
chr1	160388913	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:8,1:5,1:2,11,0,2
chr1	160390179	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,14;MFRL=183,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.654:4:1,1:0,0:1,0,3,0
chr1	160394140	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=193,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,2:11,0:0,19,0,2
chr1	160394173	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr1	160458782	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:160458782_A_G:160458782:0,0,2,0
chr1	160458788	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=157,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:160458782_A_G:160458782:2,0,1,0
chr1	160458790	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,21;MFRL=157,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:160458782_A_G:160458782:2,0,1,0
chr1	160461188	.	GA	G,GAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32,25;MFRL=159,216,72;MMQ=60,60,60;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.60,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.248,0.247:9:2,1,0:3,1,1:1,4,1,3
chr1	160519812	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:160519812_C_CA:160519812:0,0,0,9
chr1	160519815	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0|1:160519812_C_CA:160519812:0,0,0,9
chr1	160519839	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=187,128;MMQ=60,35;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:160519839_G_T:160519839:0,3,0,1
chr1	160519842	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=183,128;MMQ=60,35;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:160519839_G_T:160519839:0,4,0,1
chr1	160519844	.	T	TGTTAATC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=183,128;MMQ=60,35;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:160519839_G_T:160519839:0,4,0,1
chr1	160522634	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:160522634_G_T:160522634:1,2,0,1
chr1	160522640	.	TCGGAGG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:160522634_G_T:160522634:1,2,0,1
chr1	160582200	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=208,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr1	160607395	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:160607395_C_A:160607395:0,0,0,1
chr1	160607401	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160607395_C_A:160607395:0,0,0,1
chr1	160650913	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr1	160651253	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=184,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,0:11,3:5,19,1,2
chr1	160722064	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=174.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,22:0,27:0,0,11,39
chr1	160786670	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr1	160789196	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,5,10
chr1	160797514	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr1	160797684	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	160801046	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	160803776	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.126:30:11,3:14,0:21,6,3,0
chr1	160806019	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=90,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:3,8:9,5:5,7,5,8
chr1	160920813	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=163.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,17:0,26:0,0,37,7
chr1	160924426	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:3,1,5,1
chr1	160969585	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:8,2:4,4:5,7,3,3
chr1	160990875	.	TC	CA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,15:0.552:27:5,4:6,10:0|1:160990875_TC_CA:160990875:1,11,1,14
chr1	160990878	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,15:0.552:27:5,3:7,10:0|1:160990875_TC_CA:160990875:1,11,1,14
chr1	161008572	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:2,4:4,5:3,4,6,3
chr1	161008803	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:2,4:5,4:2,5,1,8
chr1	161010774	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=218,195;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr1	161012760	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:3,3:6,0:0,10,0,3
chr1	161022380	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:4,10:1,9:4,1,16,3
chr1	161022971	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=178,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr1	161026079	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,1:1,6:4,0,7,0
chr1	161049358	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr1	161089450	.	C	CTAAACT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,7:2,2:0,5,0,9
chr1	161126975	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.441:34:10,8:9,6:16,3,12,3
chr1	161131949	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,24;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.327:14:0,1:5,2:2,8,0,4
chr1	161133459	.	ACA	GAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=143,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:3,0:4,3,0,2
chr1	161134838	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:20,4:16,0:24,13,4,0
chr1	161136843	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:5,2,3,1
chr1	161138747	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr1	161141740	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,29:0.492:59:19,12:11,17:8,22,10,19
chr1	161143312	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=166,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:7,0,5,0
chr1	161143624	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=199,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,2:12,0:11,8,2,0
chr1	161160872	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,4:5,1:8,0,5,0
chr1	161163633	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=189,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,3:7,2:6,5,1,4
chr1	161167698	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=203,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:6,0,4,0
chr1	161167989	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.415:22:6,4:7,4:5,8,2,7
chr1	161176137	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:6,3:7,1,6,1
chr1	161179877	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.447:27:9,4:6,8:8,7,6,6
chr1	161200586	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:6,1,6,1
chr1	161201297	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,0:2,3:2,2,0,3
chr1	161254153	.	CGGA	C	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGA;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.075:63:33,3:24,1:33,26,2,2
chr1	161275628	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,0:0,0,4,0
chr1	161275633	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,10;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,0:0,0:1,1,5,0
chr1	161275635	.	A	ACC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=C;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:2,1:0,0:2,1,3,0
chr1	161276434	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=84.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,11:0,0,23,1
chr1	161276803	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,16;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr1	161332091	.	CT	C,CTT	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=138,144,174;MMQ=60,60,60;MPOS=21,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=13.26,5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,12,5:0.243,0.130:43:18,5,4:7,6,1:24,2,15,2
chr1	161480828	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=216,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.544:26:3,4:7,10:0,12,0,14
chr1	161519411	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr1	161559327	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=98.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,14:0,0,20,11
chr1	161561151	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=149,150;MMQ=25,35;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:0,6:1,6:1,0,6,6
chr1	161565479	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr1	161594226	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,9,3
chr1	161594246	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,10:0,0,9,6
chr1	161594525	.	GT	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	161600287	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	161600787	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	161600832	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,5:0,0,9,5
chr1	161644955	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=185,147;MMQ=33,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:11,3:6,3:16,1,4,2
chr1	161645010	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=161,178;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.426:37:14,9:7,4:11,10,11,5
chr1	161676904	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr1	161676970	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,16:0,8:0,0,19,5
chr1	161681626	.	G	GTTCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=234,91;MMQ=60,56;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr1	161696998	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	161721402	.	G	GT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.085:48:18,0:22,4:39,5,4,0
chr1	161722272	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,28:0.580:48:10,11:10,17:3,17,6,22
chr1	161722779	.	C	CAA,CAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,146,149;MMQ=60,60,60;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,12,13;RU=A;STR;TLOD=4.70,27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,12:0.245,0.702:15:0,1,5:0,2,6:0,0,15,0
chr1	161822959	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	161823197	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr1	161829973	.	CT	C,CTT	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=33,32,34;MFRL=177,126,140;MMQ=60,60,60;MPOS=15,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=16.73,6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,16,5:0.250,0.115:51:11,7,3:19,7,1:24,6,18,3
chr1	161953593	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:36,1:19,2:25,31,3,0
chr1	161976234	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr1	161976272	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,16;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.786:4:1,0:0,1:0,1,1,2
chr1	162313597	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=109.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,14:0,16:0,0,19,11
chr1	162326997	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=190,301;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:162326997_GG_AA:162326997:0,1,0,1
chr1	162326999	.	C	CTACCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=190,301;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:162326997_GG_AA:162326997:0,1,0,1
chr1	162327005	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=190,301;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:162326997_GG_AA:162326997:0,1,0,1
chr1	162345199	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=70.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.788:26:2,16:3,5:2,3,7,14
chr1	162345294	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=226,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr1	162348637	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,5:1,4:3,1,9,0
chr1	162348662	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,11:0,6:0,0,13,4
chr1	162351586	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,0:5,3:12,1,3,0
chr1	162351723	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,243;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.092:62:32,0:24,4:26,30,0,6
chr1	162352941	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,2:5,0:11,0,1,1
chr1	162470961	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,18;MFRL=199,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.686:10:2,2:1,0:0,3,0,7
chr1	162557211	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:12,0,2,0
chr1	162722846	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,11,3
chr1	162725361	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=175,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	162725655	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	162740513	.	GG	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:162740513_GG_TA:162740513:0,4,0,1
chr1	162740515	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:162740513_GG_TA:162740513:0,4,0,1
chr1	162742117	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:0,9,0,5
chr1	162743418	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,5,16
chr1	162748588	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	162760551	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,150;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,17:0.418:41:10,10:14,7:0|1:162760551_C_T:162760551:24,0,17,0
chr1	162760554	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=192,148;MMQ=27,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=157.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,40:0.955:41:0,20:1,20:0|1:162760551_C_T:162760551:1,0,39,1
chr1	162766476	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=136,143;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.523:21:7,5:3,6:4,6,2,9
chr1	162769510	.	C	CT	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,136;MMQ=45,39;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.113:52:18,1:24,3:43,4,5,0
chr1	162775316	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,156;MMQ=27,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,1:8,1:0,12,1,1
chr1	162822771	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr1	163038613	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr1	163038853	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=194,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,3:6,3:0,7,0,6
chr1	163117351	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	163122528	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,2,3
chr1	163187263	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr1	163297381	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=113,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,26:0.405:65:25,13:12,13:14,25,10,16
chr1	163297398	.	T	TA	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=135,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.071:51:26,3:21,0:0|1:163297398_T_TA:163297398:13,35,2,1
chr1	163297399	.	G	GATTCCTTGTAGACTTTGGATATTAGACC	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=135,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.071:51:22,1:20,0:0|1:163297398_T_TA:163297398:13,35,2,1
chr1	163298548	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr1	163298768	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:4,1:4,2:0,8,0,4
chr1	163307944	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:2,3:2,8:1,3,1,10
chr1	163309302	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	163315697	.	C	CATGAATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	163317811	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,1:2,1:0,4,1,2
chr1	164789444	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,8:0,0,3,17
chr1	165180089	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=215,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	165370400	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	165370475	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,5:4,3:7,0,7,1
chr1	165376043	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr1	165376227	.	C	CCG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:165376227_C_CCG:165376227:0,3,0,1
chr1	165376231	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:165376227_C_CCG:165376227:0,4,0,1
chr1	165377389	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	165378729	.	TAC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	165378992	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	165380073	.	A	AGGC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:0|1:165380073_A_AGGC:165380073:2,10,0,2
chr1	165380074	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:0|1:165380073_A_AGGC:165380073:2,10,0,2
chr1	165380075	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:6,2:0|1:165380073_A_AGGC:165380073:2,10,0,2
chr1	165380080	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,0:5,2:0|1:165380073_A_AGGC:165380073:2,8,0,2
chr1	165389285	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr1	165513463	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,4:0,0,5,0
chr1	165601365	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	165624799	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,11:0,0,0,21
chr1	165624837	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=192,173;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chr1	165630784	.	CAAAAAAAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=194,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,4;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:2,1:1,0:0|1:165630784_CAAAAAAAAAA_C:165630784:0,3,0,1
chr1	165630795	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=263,232;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:165630784_CAAAAAAAAAA_C:165630784:0,2,0,1
chr1	165630802	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=224,232;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:165630784_CAAAAAAAAAA_C:165630784:1,2,0,1
chr1	165634425	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:0,1,0,10
chr1	165636749	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr1	165648886	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0|1:165648886_G_A:165648886:0,0,0,6
chr1	165648894	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:165648886_G_A:165648886:0,0,0,4
chr1	165649715	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:9,6:4,8:10,3,10,4
chr1	165651502	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,2:2,5:1,8,1,6
chr1	165652445	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	165712479	.	T	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,34:0.466:73:19,16:19,17:21,18,19,15
chr1	165721223	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=265,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,2:5,0:5,0,2,0
chr1	165721489	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=13,15;MFRL=235,239;MMQ=40,58;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.626:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr1	165859630	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=57.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.951:16:0,11:0,4:0,0,5,11
chr1	165859649	.	G	GATCAGAGCAGGTGTAGGCTCTCTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=256,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.577:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr1	166124134	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr1	166827003	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=194,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,1:5,4:0,9,0,5
chr1	166888610	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,46;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:4,7,2,0
chr1	167059575	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:0,5,0,4
chr1	167082869	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr1	167097027	.	G	GGCATTGAATCTATAAATT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,154;MMQ=60,34;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	167345342	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.399:38:10,10:13,5:13,10,9,6
chr1	167515272	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	167599533	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=208,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr1	167666424	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,103;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:15,3:20,0:23,12,3,0
chr1	167778843	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,7:0,2:0,0,10,1
chr1	167787265	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.542:33:8,12:7,6:15,0,15,3
chr1	167787307	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.470:49:15,9:11,14:17,9,15,8
chr1	167793670	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:4,1,3,0
chr1	167805865	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=266,200;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	167806647	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	167815514	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:5,4:10,7:4,11,1,10
chr1	167817566	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,132;MMQ=52,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr1	167823512	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:4,1,6,0
chr1	167839679	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,2:1,5:0,3,2,5
chr1	167849318	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:5,5:7,7:0|1:167849318_A_G:167849318:10,2,12,0
chr1	167849327	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.533:28:5,5:8,10:0|1:167849318_A_G:167849318:11,2,15,0
chr1	167849658	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=175,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.463:7:2,1:0,2:4,0,3,0
chr1	167865740	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr1	167871297	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=15,16;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.748:18:0,0:0,4:0,4,1,13
chr1	167873320	.	CTTTTTTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=23,15;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	167887642	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:0,4:6,3:0,6,0,7
chr1	167889145	.	CA	C,CAA	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,33,35;MFRL=158,158,156;MMQ=60,60,60;MPOS=15,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.44,7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,6,6:0.114,0.138:47:20,1,4:15,5,0:35,0,11,1
chr1	167893759	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,32:0.454:72:21,12:12,20:17,23,13,19
chr1	167893778	.	G	GA	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.117:55:19,3:25,1:13,36,3,3
chr1	167944042	.	T	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=163,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,6:0.107:54:18,4:29,0:42,6,6,0
chr1	167984917	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,5:4,7:7,0,12,0
chr1	167992344	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,1:3,1:0,12,0,2
chr1	168013876	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.489:43:11,12:11,9:10,12,8,13
chr1	168034862	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=156,117;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:8,4:19,0:16,11,4,0
chr1	168056724	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=222,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	168057030	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,0:1,4:0,1,1,3
chr1	168057037	.	C	CTACTCCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:168057037_C_CTACTCCT:168057037:1,3,0,1
chr1	168057038	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:168057037_C_CTACTCCT:168057037:1,3,0,1
chr1	168074145	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=227,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,1:3,5:0,5,0,6
chr1	168160781	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:9,6:5,8:1,13,2,12
chr1	168161591	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	168165767	.	CTT	C,CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31,29;MFRL=166,199,177;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=7.53,10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,6:0.217,0.312:20:6,2,3:3,1,2:8,2,10,0
chr1	168165888	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.470:49:10,12:16,10:3,23,4,19
chr1	168168291	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=178,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:20,0:12,5:0,34,0,5
chr1	168200733	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.896:16:1,4:0,11:1,0,15,0
chr1	168206118	.	GTTTAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTAA;STR;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.910:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	168208308	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,9:0,0,10,6
chr1	168216563	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=256,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:168216563_G_GC:168216563:0,1,0,1
chr1	168216572	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=256,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:168216563_G_GC:168216563:0,1,0,1
chr1	168216575	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,26;MFRL=256,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:168216563_G_GC:168216563:0,1,0,1
chr1	168262289	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:168262289_A_G:168262289:0,0,2,0
chr1	168262299	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:168262289_A_G:168262289:0,0,3,0
chr1	168266830	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=191,211;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0|1:168266830_A_G:168266830:13,0,2,0
chr1	168266832	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=191,211;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:0|1:168266830_A_G:168266830:13,0,2,0
chr1	168274201	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,0:2,5:3,0,5,0
chr1	168510122	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=180,147;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.361:28:9,4:9,5:18,0,10,0
chr1	168511155	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.497:32:10,10:6,5:14,2,15,1
chr1	168513067	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,182;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:4,1:5,2:10,0,2,1
chr1	168513214	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=138,238;MMQ=60,33;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:5,0:18,3:5,19,1,2
chr1	168513228	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=151,238;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:2,1:17,2:2,17,1,2
chr1	168545758	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=177,178;MMQ=52,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:8,0,6,0
chr1	168545821	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,166;MMQ=57,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.267:42:14,5:16,5:27,4,8,3
chr1	168546011	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=154,152;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:2,1:1,8:0|1:168546011_A_T:168546011:0,3,1,8
chr1	168546016	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=154,142;MMQ=60,56;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,0:1,5:0|1:168546011_A_T:168546011:0,3,1,6
chr1	168549282	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=185,166;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:7,2:12,1:19,1,3,0
chr1	168549422	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,162;MMQ=52,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,16:0.350:46:16,8:14,7:10,20,4,12
chr1	168550535	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.611:29:5,10:6,7:0,11,0,18
chr1	169076212	.	G	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,25:0.432:58:18,11:14,13:1,32,0,25
chr1	169080837	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	169094100	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,21:0,0,21,11
chr1	169435027	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	169447008	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=13,10;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.380:14:0,1:0,0:0,9,0,5
chr1	169492418	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=169,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,3:13,0:24,5,2,1
chr1	169492676	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr1	169494196	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,3:2,1:0,7,0,4
chr1	169498834	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.396:33:10,7:10,5:15,5,10,3
chr1	169499951	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=211,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:4,0,5,0
chr1	169510524	.	A	G	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=117,126;MMQ=46,36;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,23:0.273:85:28,8:30,13:25,37,10,13
chr1	169515874	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=200,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,5:0,3:1,1,0,8
chr1	169530004	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,0:5,2:3,15,0,2
chr1	169555367	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=210,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	169560727	.	T	TA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.394:18:3,1:5,6:1,10,0,7
chr1	169564167	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:2,2:2,1:1,4,0,3
chr1	169580972	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=226,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr1	169581006	.	GGT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:169581006_GGT_G:169581006:0,4,0,1
chr1	169581011	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:169581006_GGT_G:169581006:0,4,0,1
chr1	169582132	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=230,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	169586330	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:6,9:7,7:12,1,8,8
chr1	169599254	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:12,6:5,11:14,3,9,8
chr1	169665632	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=128,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,1:6,6:6,4,5,2
chr1	169670868	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:6,11:6,6:2,10,0,17
chr1	169673838	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,5:5,6:4,6,3,8
chr1	169678024	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	169679472	.	G	GCT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=62.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:7,8:5,8:12,0,17,0
chr1	169697095	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=195,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:169697095_A_G:169697095:2,2,0,1
chr1	169697098	.	TT	GC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=195,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:169697095_A_G:169697095:2,2,0,1
chr1	169697117	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	169698825	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.337:16:5,4:5,1:1,10,0,5
chr1	169763046	.	GAAA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=10,15;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.294:7:0,0:0,1:0,5,0,2
chr1	169763128	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	169816784	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:4,2:11,0:13,3,2,0
chr1	169831690	.	CTCTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:2,3:6,1,6,0
chr1	169831993	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	169835950	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:12,5:3,6:15,0,11,0
chr1	169838278	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:2,2:2,3:0,4,0,6
chr1	169845236	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,1:3,2:3,11,2,2
chr1	169847683	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=281,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr1	169890933	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,10:0,0,0,15
chr1	169930432	.	GAC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169930432_GAC_G:169930432:0,3,0,1
chr1	169930434	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=186,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1|0:169930432_GAC_G:169930432:0,1,0,2
chr1	169930436	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:169930432_GAC_G:169930432:0,3,0,1
chr1	169941761	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=77.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,8:0,16:0,0,2,23
chr1	169947146	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.845:12:1,6:1,4:2,0,10,0
chr1	169951748	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr1	169952385	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0,0,11,3
chr1	169985796	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,4:4,4:0,5,2,6
chr1	169993762	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:1,5,0,10
chr1	170004508	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:8,0,8,0
chr1	170115156	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	170511604	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.533:24:6,9:4,2:8,3,9,4
chr1	170927615	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:10,6:10,8:12,8,9,6
chr1	170928516	.	A	AAAATAAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,146;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=AAAT;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	170931197	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:3,3:2,7:0,5,0,10
chr1	170984041	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,99;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:7,1,2,0
chr1	170985569	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=70,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	171033543	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	171071026	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr1	171076740	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=178,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:1,4:3,4:4,0,9,0
chr1	171076935	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,27:0.609:44:7,10:10,16:3,14,11,16
chr1	171077038	.	GTCT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:5,4:1,5:0,7,0,9
chr1	171077198	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.384:32:11,5:7,7:15,5,8,4
chr1	171236820	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:13,0:8,3:3,19,0,3
chr1	171236844	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:11,0:7,3:0|1:171236844_G_A:171236844:2,16,0,3
chr1	171236851	.	T	TAAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,37;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:0|1:171236844_G_A:171236844:0,15,0,3
chr1	171236852	.	G	GATAAAGTGCCAAATCATC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:7,0:8,1:0|1:171236844_G_A:171236844:0,15,0,3
chr1	171491264	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=140,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:9,4:3,3:12,0,7,0
chr1	171496825	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=201,186;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr1	171496895	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.716:19:1,4:4,10:5,0,13,1
chr1	171509058	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,2:5,2:7,1,3,1
chr1	171510683	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:17,1:22,1:15,26,0,2
chr1	171511442	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr1	171514731	.	C	G	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=116.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,42:0.386:109:32,21:33,20:50,17,32,10
chr1	171526570	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,23:0.435:54:11,6:15,14:10,21,6,17
chr1	171527322	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:0,4,0,6
chr1	171536061	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,369;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	171546833	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr1	171548617	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:3,1:2,5:1,4,1,5
chr1	171548868	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,0:1,2:2,0,3,0
chr1	171605936	.	G	GGGTCACTGTGGGAGCCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	171607702	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr1	171751051	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:2,5:8,1:8,2,6,0
chr1	171753039	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.594:42:8,11:8,14:9,8,13,12
chr1	171755170	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,31:0.582:53:11,17:11,14:9,13,13,18
chr1	171763458	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=148,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:10,0,2,0
chr1	171763522	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.571:35:11,10:3,10:10,5,14,6
chr1	171765591	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=68,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:5,1,6,2
chr1	171810960	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr1	171891061	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr1	172002197	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:16,0:20,2:37,0,2,0
chr1	172011059	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,1:3,1:7,2,2,0
chr1	172038079	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:0,5,2,6
chr1	172038146	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=201,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:4,2:0,5,0,2
chr1	172061865	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:9,2:3,0:11,1,2,0
chr1	172411496	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,10:0,16:0,0,18,10
chr1	172425529	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=102,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,1:1,1:1,1,3,0
chr1	172431210	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	172431435	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,3:3,1:0,9,0,4
chr1	172434375	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,18,7
chr1	172502041	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	172577864	.	CTT	C,CT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=137,151,142;MMQ=60,60,60;MPOS=22,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.83,16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,5,12:0.112,0.236:50:18,2,4:12,3,5:30,3,15,2
chr1	172634734	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	173157764	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,7:4,4:0,7,0,11
chr1	173457017	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,148;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.618:27:4,9:6,7:5,5,6,11
chr1	173470105	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,5:3,2:7,1,7,0
chr1	173475964	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:3,3,2,0
chr1	173490407	.	TAAAA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27,24,27;MFRL=154,177,188,190;MMQ=60,60,60,60;MPOS=29,6,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,15,16;RU=A;STR;TLOD=3.61,7.23,6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,4,5:0.180,0.332,0.322:13:1,1,1,3:1,1,2,2:2,0,11,0
chr1	173490547	.	GA	G,GAA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,35,18;MFRL=158,130,169;MMQ=60,60,60;MPOS=23,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.83,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,4,3:0.155,0.136:26:5,0,0:8,3,1:3,16,0,7
chr1	173490616	.	CTATATA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=TA;STR;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.936:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr1	173493312	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,2:3,5:0,6,0,7
chr1	173552783	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.594:33:5,11:7,6:3,10,5,15
chr1	173615965	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:3,3:8,4:11,0,7,0
chr1	173702764	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr1	173702784	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=158,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:10,0,2,0
chr1	173735290	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:9,0:16,4,1,1
chr1	173794587	.	C	CATTATTATTATT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,42;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=12,16;RU=ATT;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.648:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	173795803	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.539:7:0,4:3,0:2,1,3,1
chr1	173797447	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=133,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.206:18:1,1:5,2:2,13,0,3
chr1	173802433	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=191,246;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,0:1,0,3,0
chr1	173808677	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:7,2:9,7:2,14,0,9
chr1	173814258	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,4:7,2:11,1,6,0
chr1	173825692	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=187,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr1	173855298	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,5,11
chr1	173876561	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=119,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr1	173876705	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=105,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr1	173879004	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,18;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:7,0:2,0:9,2,0,4
chr1	173884115	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	173907812	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:1,5:4,6:5,0,8,3
chr1	173915599	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.675:26:5,4:3,12:8,0,15,3
chr1	173933901	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=203,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:6,0,3,0
chr1	173947571	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=178,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,5:6,5:8,2,10,0
chr1	173950205	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,0:5,3:0,6,0,3
chr1	173952068	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:4,3:2,8,1,6
chr1	173952539	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,13:0,0,19,12
chr1	173952836	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=176,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	173961807	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=232,158;MMQ=50,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=AC;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,1:2,0,2,0
chr1	173962216	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.789:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	174219799	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr1	174417231	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,15:0,5:0,0,17,3
chr1	174769514	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:15,0:23,3:30,9,0,3
chr1	174948082	.	ATT	A,AT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,29,25;MFRL=162,174,150;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.42,8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,5:0.147,0.341:15:4,0,2:3,2,2:0,8,0,7
chr1	174969271	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=156.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,25:0,26:0,0,44,7
chr1	174984069	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,2:0,1:0,0,0,6
chr1	174984074	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=175,212;MMQ=40,42;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:0,1:0,3,0,2
chr1	174992618	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=13,22;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:4,1:4,3:7,15,0,5
chr1	174992652	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=14,12;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.370:20:3,0:0,0:0,12,0,8
chr1	175046488	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,80;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,1:1,1:5,1,2,0
chr1	175052828	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=214,251;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:3,0,5,0
chr1	175053101	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=186,230;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr1	175054548	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,5:2,1:3,2,4,2
chr1	175067570	.	G	A	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,3:0.040:98:52,1:40,2:45,50,2,1
chr1	175067580	.	T	C	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=158.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,57:0.575:99:22,28:20,29:22,20,24,33
chr1	175086061	.	AT	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:19,1:15,2:30,6,3,0
chr1	175087606	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=148,238;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,0:0,2:5,0,2,0
chr1	175087677	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:10,2:9,8:16,3,9,2
chr1	175087683	.	AT	A,ATT	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,30,30;MFRL=177,150,149;MMQ=60,60,60;MPOS=14,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=4.38,19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,11:0.124,0.367:29:8,1,3:7,1,8:12,3,12,2
chr1	175097331	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=117,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,3:2,2:3,5,1,4
chr1	175097357	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	175105880	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=196,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr1	175105942	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,14:0,5:0,0,15,4
chr1	175113578	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,4:0,10:1,0,9,5
chr1	175116046	.	CTTT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:4,1:3,1:9,6,2,0
chr1	175116252	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.418:34:9,3:9,5:2,17,1,14
chr1	175129924	.	C	CCTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=149,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CTT;STR;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.596:8:2,2:1,2:0|1:175129924_C_CCTT:175129924:1,2,4,1
chr1	175129946	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,3:0.267:13:3,2:7,1:1|0:175129924_C_CCTT:175129924:8,2,1,2
chr1	175293424	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:3,0:1,2:4,0,3,0
chr1	175323446	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,1:2,2:4,0,3,0
chr1	175336292	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,2:3,3:0|1:175336292_C_A:175336292:8,0,5,0
chr1	175336305	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.468:13:6,2:0,3:0|1:175336292_C_A:175336292:5,2,6,0
chr1	175336530	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=214,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr1	175355128	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr1	175355152	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,3:6,3:7,4,5,1
chr1	175375721	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=159,130;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,0:7,3:9,13,0,3
chr1	175916267	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,16,4
chr1	176012807	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=93.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,26,3
chr1	176105710	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:6,1:4,3:3,15,1,4
chr1	176153658	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=137.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,21:0,17:0,0,34,4
chr1	176664842	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=198,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,3:4,7:7,1,6,4
chr1	176664858	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=166,75;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:13,0:11,4:20,5,2,2
chr1	176671913	.	G	GTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=184,174;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.473:3:1,0:0,1:0|1:176671913_G_GTTTTT:176671913:0,2,0,1
chr1	176671915	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=230,174;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176671913_G_GTTTTT:176671913:0,1,0,1
chr1	176671920	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=230,174;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176671913_G_GTTTTT:176671913:0,1,0,1
chr1	176679311	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,3:1,1:2,2,1,5
chr1	176681165	.	ATG	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TG;STR;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:6,2:1,3:0,7,0,5
chr1	176734756	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:3,2,5,0
chr1	176769358	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:4,4:2,3:1,6,0,7
chr1	176838042	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,2:15,0:20,11,2,0
chr1	176857347	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,2,15
chr1	176913204	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=102,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:3,0:5,2:0|1:176913204_C_T:176913204:2,8,1,1
chr1	176913209	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=125,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:4,2:0|1:176913204_C_T:176913204:1,8,1,1
chr1	176926763	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:6,1,8,1
chr1	176927709	.	C	CATTCTGCCATAGTTTCTGTTAGGGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=213,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	176984042	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=134,125;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:2,2:3,7,0,2
chr1	177198998	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=183.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,25:0,26:0,0,25,29
chr1	177225152	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:11,4:17,0:10,19,0,4
chr1	177247964	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=206,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr1	177250670	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	177901713	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:4,4,2,6
chr1	177901741	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,5:4,4:2,6,1,8
chr1	177902482	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,0:4,4:3,7,1,3
chr1	177902753	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,202;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,4:2,5:2,6,2,7
chr1	177906292	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=198,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	177906657	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.428:28:9,6:7,5:3,13,3,9
chr1	177909722	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:3,2:1,2:5,0,4,0
chr1	177915474	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:9,3:3,8:10,2,11,0
chr1	177915498	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.512:33:6,9:9,7:15,1,16,1
chr1	177916890	.	A	AAGGGACAGGGAGGGGAGGTGAGGGG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,3:0,0:0,0,11,0
chr1	177917479	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:3,0,5,1
chr1	177929379	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.421:42:10,10:14,6:23,1,18,0
chr1	177930894	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr1	177933443	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:4,7:3,2:3,5,0,9
chr1	178063551	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	178408780	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=213,206;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:1,2:4,1:0,6,1,2
chr1	178426060	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:1,4,0,4
chr1	178434963	.	AAAAGAAAGAAAGAG	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.537:44:7,12:4,11:19,2,22,1
chr1	178483231	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.619:30:6,9:5,7:9,2,14,5
chr1	178514165	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:3,3,2,4
chr1	178514560	.	A	AT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=44.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.499:34:9,8:8,9:3,14,2,15
chr1	178745798	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.700:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr1	178746031	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:3,2:8,5:1,10,0,8
chr1	178834108	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	178854162	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.535:26:3,6:9,8:12,0,14,0
chr1	178858711	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,6:2,4:8,2,9,1
chr1	179013430	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179013430_T_TGA:179013430:0,1,0,1
chr1	179013432	.	T	TGGCTTAAAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179013430_T_TGA:179013430:0,1,0,1
chr1	179041011	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=127.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,18:0,17:0,0,21,14
chr1	179052006	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr1	179054692	.	T	G	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=256.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,73:0.987:73:0,36:0,32:0,0,40,33
chr1	179066917	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=141,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:7,1:1,1:5,3,2,0
chr1	179067004	.	C	CTCCATGAAATAATT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=147,148;MMQ=58,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr1	179067067	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=193,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr1	179067071	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	179077450	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,7:0.107:55:19,1:14,2:32,16,0,7
chr1	179077454	.	G	GCC	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.055:54:20,0:16,1:30,21,0,3
chr1	179078169	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:14,0:9,0:0|1:179078169_A_C:179078169:0,25,3,0
chr1	179078173	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:16,0:9,0:0|1:179078169_A_C:179078169:0,25,3,0
chr1	179078178	.	CAGCAGTGCCACTG	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:15,0:8,3:0|1:179078169_A_C:179078169:1,25,3,0
chr1	179087934	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,4,21
chr1	179089475	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	179089491	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	179091103	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=241,272;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0,2,0,1
chr1	179095895	.	TA	T,TAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29,28;MFRL=195,176,247;MMQ=60,60,60;MPOS=14,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.25,5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.213,0.284:11:2,1,1:3,1,1:0,6,0,5
chr1	179198285	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=15,12;MFRL=228,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.746:5:0,0:0,0:1,0,4,0
chr1	179198296	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=14,12;MFRL=228,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.658:4:0,0:0,1:1,0,3,0
chr1	179198308	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:179198308_A_C:179198308:0,0,2,0
chr1	179198312	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:179198308_A_C:179198308:0,0,2,0
chr1	179198317	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,0:0|1:179198308_A_C:179198308:0,0,2,0
chr1	179271826	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,1:5,9:6,5,6,4
chr1	179304892	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=238,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	179312102	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=124,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:1,6,0,3
chr1	179319580	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.589:32:7,7:6,12:1,12,4,15
chr1	179320401	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:6,2:10,0:0|1:179320401_A_T:179320401:14,4,0,2
chr1	179320404	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:0|1:179320401_A_T:179320401:12,5,0,2
chr1	179348646	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:2,3:3,7:3,3,3,8
chr1	179354304	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	179364391	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:0,6,0,8
chr1	179380472	.	GT	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=94.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,32:0.946:34:0,14:2,18:0,2,1,31
chr1	179398563	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	179401379	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:1,5:3,7:4,0,11,2
chr1	179401526	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,28:0.632:44:7,11:7,15:9,7,10,18
chr1	179401559	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:2,8:8,5:1,10,1,12
chr1	179401564	.	CTT	C,CT	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=0,32,35;MFRL=0,172,170;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=5.85,43.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,14:0.166,0.791:17:0,2,5:0,1,9:0,0,1,16
chr1	179401578	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:7,2:1,16,0,2
chr1	179401581	.	C	CAG	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,1:7,2:0|1:179401581_C_CAG:179401581:0,16,0,3
chr1	179401582	.	GTT	G	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:8,1:7,2:0|1:179401581_C_CAG:179401581:0,18,0,3
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chr1	179462149	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	179494612	.	CTACA	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TACA;STR;TLOD=45.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.574:21:4,7:5,5:0,9,1,11
chr1	179494665	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,9:0,0,0,26
chr1	179503806	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=151,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:7,1,4,0
chr1	179504002	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=144,157;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:19,3:20,0:25,14,3,0
chr1	179504025	.	AAAG	A	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAG;STR;TLOD=70.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,19:0.489:39:11,9:7,10:0|1:179504025_AAAG_A:179504025:14,6,13,6
chr1	179504043	.	C	G	.	.	DP=60;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=118,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,31:0.542:57:15,14:11,17:0|1:179504025_AAAG_A:179504025:17,9,20,11
chr1	179504130	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,31:0.542:57:9,15:17,16:4,22,2,29
chr1	179520254	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:2,3:0,6:2,0,9,0
chr1	179528917	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:5,5:0,8,0,8
chr1	179528942	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=202,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr1	179562664	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,0:10,3:11,4,1,2
chr1	179631242	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=118,183;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:5,3,1,1
chr1	179660144	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179660144_A_T:179660144:0,0,0,1
chr1	179660145	.	A	AGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179660144_A_T:179660144:0,0,0,1
chr1	179660148	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179660144_A_T:179660144:0,0,0,1
chr1	179834060	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=122.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,39:0.513:76:12,12:25,27:19,18,17,22
chr1	179852165	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.491:43:13,10:8,11:2,20,0,21
chr1	179858333	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	179873065	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,151;MMQ=60,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:9,3:8,0:7,12,3,0
chr1	179877053	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=142,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr1	179983665	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,5:0,0,1,17
chr1	179989020	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=221,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	179992076	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	179993793	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	180010702	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	180010922	.	A	C	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,5:0.058:101:38,0:50,5:47,49,0,5
chr1	180022343	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=54.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr1	180059811	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	180080115	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,9:0,14:0,0,18,5
chr1	180124379	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	180155376	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:2,2:2,5:0,4,0,7
chr1	180155382	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=39.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	180158668	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr1	180159654	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,20:0.512:39:10,9:9,10:0|1:180159654_C_T:180159654:5,14,5,15
chr1	180159657	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,20:0.512:39:10,8:9,11:0|1:180159654_C_T:180159654:5,14,5,15
chr1	180159797	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	180163390	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.438:28:10,6:4,6:9,7,8,4
chr1	180240752	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	180257692	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,8:0,16:0,0,3,21
chr1	180757007	.	CT	C,CTT	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,32,32;MFRL=128,175,138;MMQ=60,60,60;MPOS=23,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=5.77,8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,4,5:0.126,0.180:31:13,2,1:8,2,4:1,21,1,8
chr1	180757056	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:7,3:9,5:0,16,0,8
chr1	180803922	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr1	180897521	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr1	180897792	.	ATGC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGC;STR;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	180905448	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:3,10:3,7:3,3,6,11
chr1	180907743	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:11,1:14,2:12,15,0,3
chr1	180991665	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=206,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,3:0,1:2,0,7,0
chr1	181018180	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,179;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.511:37:8,11:10,7:12,6,10,9
chr1	181022895	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.316:22:8,2:7,3:1,14,2,5
chr1	181058540	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:1,3,0,4
chr1	181058643	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	181060032	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	181480673	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:11,0:11,3:4,21,0,3
chr1	181680082	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,4:5,0:10,0,4,0
chr1	181684605	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	181686216	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr1	181701423	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	181719679	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:5,3:2,3:2,5,0,7
chr1	181727030	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr1	181727273	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=214,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,5:2,4:1,3,1,8
chr1	181731667	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:4,0:2,4:6,0,3,1
chr1	181732695	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:0,6,2,8
chr1	181750469	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:2,1:3,0,4,0
chr1	181752714	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=36,26;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0|1:181752714_C_T:181752714:3,0,3,0
chr1	181752735	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=35,25;MFRL=79,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0|1:181752714_C_T:181752714:2,0,5,0
chr1	181752769	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.408:14:4,4:3,2:8,0,5,1
chr1	181752795	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,19;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.178:21:5,0:5,0:11,7,3,0
chr1	181752923	.	AAGCTT	A	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCTT;STR;TLOD=132.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.972:30:0,17:0,12:0,0,9,21
chr1	181759614	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.430:33:8,7:10,7:10,9,5,9
chr1	181762760	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:0,7:2,1:1,1,6,2
chr1	182354850	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=188,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,34:0.617:55:13,17:7,17:20,1,31,3
chr1	182355046	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.509:45:14,13:8,9:3,19,3,20
chr1	182357654	.	A	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=16,15;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,7:0.105:63:12,1:15,2:48,8,7,0
chr1	182491107	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:10,0,5,0
chr1	182491181	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=162,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.107:40:17,3:17,0:23,13,4,0
chr1	182501933	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,2:5,2:2,3,1,3
chr1	182509598	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=80,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:1,0,0,8
chr1	182520362	.	TCA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.576:5:1,2:1,1:0|1:182520362_TCA_T:182520362:0,2,0,3
chr1	182520364	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,3:0.672:4:0,3:1,0:1|0:182520362_TCA_T:182520362:0,1,0,3
chr1	182522552	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.431:26:6,5:8,6:11,4,8,3
chr1	182522689	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:8,2:10,0:5,14,1,1
chr1	182522762	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=79,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0,2,0,7
chr1	182523794	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,1,1
chr1	182556036	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,4:5,0:0,7,0,4
chr1	182571003	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=187,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:5,1,4,0
chr1	182571277	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.452:38:12,8:8,9:6,15,4,13
chr1	182573227	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	182784022	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:7,3:1,2:1,7,3,2
chr1	182787908	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,2:8,0:16,3,2,0
chr1	182798041	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0,9,0,2
chr1	182812410	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=225,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,0:3,3:5,1,3,0
chr1	182852804	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:10,1:4,16,0,2
chr1	182854017	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr1	182920665	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.703:11:3,4:0,3:0,3,0,8
chr1	183077615	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=176,78506457;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:1,0:4,2:0|1:183077615_C_T:183077615:0,6,0,2
chr1	183077618	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,78506457;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:183077615_C_T:183077615:0,6,0,2
chr1	183079853	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.415:20:1,4:9,4:0,12,0,8
chr1	183084607	.	AC	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=199,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr1	183085611	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	183085696	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:1,0,6,0
chr1	183090892	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:7,2:16,0:18,6,0,2
chr1	183095185	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,28,26,26;MFRL=209,140,171,209;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,22,30;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.90,8.26,4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,3,4,3:0.200,0.251,0.202:16:4,3,1,0:2,0,3,3:6,0,10,0
chr1	183095234	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,26:0.577:45:10,8:8,17:17,2,18,8
chr1	183095270	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=118.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,44:0.577:76:17,17:15,27:23,9,28,16
chr1	183095477	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=189,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:6,5:6,3:1,12,0,8
chr1	183096582	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=207,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:4,6:6,5:1,9,1,11
chr1	183096634	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:0,3,1,5
chr1	183097956	.	G	GTTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr1	183099701	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.373:19:3,4:9,2:2,10,0,7
chr1	183100563	.	GGT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=GT;STR;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	183101471	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=481,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:1,4:1,4:2,0,9,0
chr1	183101582	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:5,9:6,6:6,5,9,7
chr1	183101686	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,4:6,6:1,8,1,9
chr1	183102468	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:3,2:3,0:6,0,3,0
chr1	183104013	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=189,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:7,4:1,3:0,8,0,8
chr1	183106739	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:9,0,4,0
chr1	183176970	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,37;MFRL=181,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	183177218	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.471:26:8,8:4,4:2,12,8,4
chr1	183184546	.	TTTC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=185,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTC;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:11,2:19,1,2,0
chr1	183204796	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,32:0.451:70:17,11:20,16:24,14,16,16
chr1	183205523	.	CAA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=193,172;MMQ=54,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.522:12:3,4:2,2:5,1,6,0
chr1	183205576	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,11;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.124:49:9,0:29,0:5,36,8,0
chr1	183230516	.	ATCCGC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr1	183253213	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr1	183253959	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.553:31:8,6:4,11:4,10,3,14
chr1	183496658	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.430:47:17,11:9,9:20,7,19,1
chr1	183515251	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:12,0:18,2:9,26,0,2
chr1	183515266	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:13,0:17,0:0|1:183515266_G_T:183515266:13,25,0,2
chr1	183515272	.	A	AAAAAAGAAGTGAAGAAC	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:17,0:22,2:0|1:183515266_G_T:183515266:13,26,0,2
chr1	183516440	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:1,8,0,6
chr1	183525452	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	183534935	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.654:27:5,6:4,11:0,9,3,15
chr1	183543653	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.112:47:19,4:23,0:21,21,5,0
chr1	183711483	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr1	183852886	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.539:26:5,9:6,5:9,3,13,1
chr1	183852914	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,8:0,0,14,6
chr1	183867085	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,5:2,1:0,8,2,4
chr1	183871637	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=285,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,8:1,7:1,0,12,3
chr1	183873898	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,6:4,6:7,0,13,0
chr1	183876287	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr1	183895178	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,8,0
chr1	183913540	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=115,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr1	183920338	.	AG	A,GG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27,34;MFRL=207,171,186;MMQ=60,60,60;MPOS=9,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.52,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.334,0.333:3:0,0,0:1,1,1:0,1,0,2
chr1	183920341	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=197,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	183938304	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=237,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr1	183938313	.	G	GTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=185,226;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=T;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.656:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	183942950	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	183944444	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	184476621	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:7,0,6,0
chr1	184537455	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=151,96;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:184537455_C_T:184537455:7,1,1,1
chr1	184537458	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=153,96;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:4,1:0|1:184537455_C_T:184537455:7,2,1,1
chr1	184537506	.	ACTC	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,5:5,2:7,3,6,1
chr1	184567463	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,6:6,4:9,2,10,0
chr1	184663643	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	184671909	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:4,3:4,1:8,1,4,0
chr1	184681065	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.447:5:1,1:2,1:0|1:184681065_AT_A:184681065:0,3,0,2
chr1	184681081	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:184681065_AT_A:184681065:0,0,0,6
chr1	184688237	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.461:17:4,5:5,3:8,1,8,0
chr1	184695571	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,10:0,0,0,15
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chr1	184706306	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.588:20:1,7:7,4:1,7,1,11
chr1	184718601	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,25:0.441:57:13,14:19,11:21,11,23,2
chr1	184718750	.	GAAAA	G,GA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,19,16;MFRL=0,162,153;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,14;RU=A;STR;TLOD=14.15,21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,21:0.299,0.675:30:0,2,1:0,2,1:0,0,2,28
chr1	184792391	.	T	TTA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=153,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:17,0:11,2:14,15,0,2
chr1	184868251	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,2:7,4:11,2,5,1
chr1	185094277	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=197,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr1	185094293	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=215,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:185094293_T_C:185094293:0,4,0,1
chr1	185094294	.	A	AGGCATTTGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=215,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:185094293_T_C:185094293:0,4,0,1
chr1	185114655	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,132;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.299:34:14,0:10,9:10,14,0,10
chr1	185120927	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.191:29:12,1:11,2:23,1,3,2
chr1	185135745	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:4,9:8,5:6,6,10,4
chr1	185137454	.	T	TAAATGATAGAC	.	.	DP=90;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=138.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,38:0.433:88:20,14:29,16:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:33,17,20,18
chr1	185137461	.	A	T	.	.	DP=87;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,30:0.347:87:20,14:30,15:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:36,21,15,15
chr1	185137464	.	T	TAA	.	.	DP=87;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=114.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,31:0.371:84:18,15:33,14:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:34,19,16,15
chr1	185137628	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,7:4,6:0,9,0,13
chr1	185153545	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,4:4,6:0,10,0,10
chr1	185240474	.	A	G	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=134.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,44:0.439:101:27,18:27,26:37,20,17,27
chr1	185259731	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=200,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr1	185269100	.	TA	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.148:31:13,1:10,3:0|1:185269100_TA_T:185269100:23,4,4,0
chr1	185269111	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=171,131;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:36,3:0.096:39:16,3:18,0:1|0:185269100_TA_T:185269100:29,7,3,0
chr1	185815335	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr1	185833565	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,5:5,2:6,0,6,1
chr1	185834847	.	GTTTC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:2,1:4,0,2,1
chr1	186014738	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=239,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:2,1,5,0
chr1	186022032	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,7:0,0,20,0
chr1	186030902	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	186039006	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	186047150	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:9,0,7,0
chr1	186055371	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=186,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:0,15:1,10:1,0,25,1
chr1	186055633	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	186057181	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=105.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,16:0,0,7,21
chr1	186081918	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,11,2
chr1	186086578	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,11,1
chr1	186088795	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,377;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,4:5,0:8,1,0,4
chr1	186089072	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:10,7:4,6:6,8,7,7
chr1	186089112	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=179,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.441:29:10,7:6,5:13,3,10,3
chr1	186089363	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:2,3:7,1:0,9,0,5
chr1	186092076	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr1	186101539	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,190;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.516:23:4,2:7,9:2,9,2,10
chr1	186113852	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr1	186141301	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,14:0,17:0,0,6,25
chr1	186151493	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,7:0,0,0,14
chr1	186265948	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	186281392	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.511:35:13,7:4,9:11,6,10,8
chr1	186287812	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:8,7:2,6:6,4,6,7
chr1	186313249	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr1	186321297	.	ATTAAGAT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=182,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:186321297_ATTAAGAT_A:186321297:0,1,0,1
chr1	186321310	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=224,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:186321297_ATTAAGAT_A:186321297:1,1,0,1
chr1	186321313	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=224,211;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:186321297_ATTAAGAT_A:186321297:1,1,0,1
chr1	186357523	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,16,1
chr1	186359750	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr1	186361022	.	T	TCATTTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:186361022_T_TCATTTGG:186361022:0,0,0,1
chr1	186361025	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:186361022_T_TCATTTGG:186361022:0,0,0,1
chr1	186370602	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=163,219;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:10,0:6,4:0|1:186370602_G_T:186370602:3,15,1,3
chr1	186370606	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=166,218;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:10,0:8,3:0|1:186370602_G_T:186370602:2,16,0,3
chr1	186370618	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=171,218;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,0:6,3:0|1:186370602_G_T:186370602:1,13,0,3
chr1	186644455	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:9,0:18,5:13,14,0,5
chr1	186645671	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,2:15,1:15,10,2,1
chr1	186645851	.	AAAAT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAT;STR;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.621:19:2,5:5,7:3,4,7,5
chr1	186919732	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	186925194	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	186925552	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr1	186946912	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=135.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,19:0,22:0,0,16,25
chr1	190067152	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr1	190423950	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:20,0:14,3:12,22,0,3
chr1	192321087	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	192335271	.	C	CTAAT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=207,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAT;STR;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr1	192335333	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:192335333_T_C:192335333:0,0,0,1
chr1	192335337	.	G	GCCAATATATATATAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:192335333_T_C:192335333:0,0,0,1
chr1	192545099	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,1,17
chr1	192547344	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=135,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.220:21:5,0:8,0:8,9,4,0
chr1	192778124	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.261:32:12,1:7,1:21,2,9,0
chr1	192778159	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=68.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.538:49:9,16:10,9:18,5,20,6
chr1	192780498	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.522:44:10,8:11,15:18,3,23,0
chr1	192997103	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,0:10,2:19,0,2,0
chr1	193051685	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,15:0,0,23,5
chr1	193094375	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,4,18
chr1	193104827	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	193181434	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:7,9:5,9:10,2,15,3
chr1	193202032	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:6,2:6,0:12,0,2,1
chr1	196251522	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	196254970	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr1	196392172	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,35:0.599:58:9,17:14,17:14,9,25,10
chr1	196395115	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=27,11;MFRL=137,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:14,0:21,0:8,30,0,2
chr1	196395143	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:16,2:0|1:196395143_G_C:196395143:2,22,0,2
chr1	196395146	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:16,2:0|1:196395143_G_C:196395143:2,22,0,2
chr1	196398619	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,5:6,1:8,0,6,0
chr1	196398974	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.360:17:7,3:3,2:1,10,0,6
chr1	196461513	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=176.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,25:0,26:0,0,8,44
chr1	196658497	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr1	196684625	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	196705926	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,6:0,0,8,2
chr1	196709774	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,20,4
chr1	196712577	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=163,208;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.166:34:15,2:11,2:0|1:196712577_T_C:196712577:23,6,4,1
chr1	196712586	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=159,164;MMQ=60,33;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,9:0.221:43:19,5:12,4:0|1:196712577_T_C:196712577:26,8,8,1
chr1	196743927	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=13,34;MFRL=246,191;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.868:9:0,5:0,3:1,0,8,0
chr1	196743964	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,8:0,0,15,1
chr1	196757258	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	196757502	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=128,176;MMQ=27,51;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:21,1:17,2:21,18,3,0
chr1	196763707	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,21;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	196763713	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=121,164;MMQ=21,21;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr1	196794519	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr1	196794867	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,1,10
chr1	196796184	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr1	196797123	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	196797357	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,232;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	196799556	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=203,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,5:0,3:3,0,8,0
chr1	196801190	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,1,23
chr1	196879661	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=172,5557231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr1	196879663	.	AGAAG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=209,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:196879663_AGAAG_A:196879663:0,4,0,1
chr1	196879668	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=209,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:196879663_AGAAG_A:196879663:0,4,0,1
chr1	196884074	.	A	AT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,168;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.370:33:5,7:14,5:13,8,10,2
chr1	196884258	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=134,143;MMQ=27,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.422:29:7,4:9,8:0,17,0,12
chr1	196884290	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=155,172;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:9,4:10,7:0,19,0,11
chr1	196887274	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=77.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,16:0,6:0,0,21,1
chr1	196920178	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=106.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,12:0,18:0,0,4,27
chr1	196926956	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	196926973	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,16,0
chr1	196946869	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0,0,5,16
chr1	196952268	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,2,13
chr1	196965275	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,335;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:15,3:8,0:7,16,0,3
chr1	197009631	.	CA	C,CAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,34,32;MFRL=150,249,147;MMQ=60,60,60;MPOS=16,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.96,9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,3,7:0.127,0.247:27:8,3,1:7,0,6:11,6,8,2
chr1	197009870	.	GAAC	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=51.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.485:29:3,3:12,11:2,13,2,12
chr1	197020093	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:197020093_C_A:197020093:0,0,0,1
chr1	197020096	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:197020093_C_A:197020093:0,0,0,1
chr1	197020101	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:197020093_C_A:197020093:0,0,0,1
chr1	197026672	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	197053373	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	197053561	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.630:11:0,5:3,2:1,3,0,7
chr1	197055925	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,13,7
chr1	197057622	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:197057622_C_CA:197057622:0,3,0,1
chr1	197057625	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:197057622_C_CA:197057622:0,3,0,1
chr1	197059221	.	G	GA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.180:40:7,3:12,1:6,27,4,3
chr1	197059878	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	197059892	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr1	197059928	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr1	197063352	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=105.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,20:0,10:0,0,2,28
chr1	197071830	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=203,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.538:28:2,6:10,9:6,7,1,14
chr1	197091808	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr1	197097891	.	AAAAT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=87,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,6:0,10:0,1,0,16
chr1	197101303	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=86.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,25,0
chr1	197102777	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:3,4:0,4:0,3,0,8
chr1	197104149	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	197109042	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,6:0,16:0,0,0,22
chr1	197113073	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=109.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,21:0,12:0,0,32,2
chr1	197141235	.	CTA	C	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TA;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.084:43:14,1:22,2:0|1:197141235_CTA_C:197141235:37,3,3,0
chr1	197141243	.	A	C	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=150.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,47:0.927:50:1,18:2,28:1|0:197141235_CTA_C:197141235:3,0,43,4
chr1	197141253	.	A	C	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,4:0.062:64:24,1:33,2:0|1:197141235_CTA_C:197141235:50,10,4,0
chr1	197141473	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=203,187;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.248:21:9,0:7,4:0,16,0,5
chr1	197147471	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,5:0,5:0,0,12,0
chr1	197297540	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=140.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,26:0,18:0,0,28,16
chr1	197316435	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	197316487	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.574:24:6,7:4,6:6,4,10,4
chr1	197325908	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	197482167	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	197510025	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=114.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,23:0,15:0,0,36,2
chr1	197515777	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,7:0,0,8,3
chr1	197515981	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:1,7,1,5
chr1	197576307	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,2,7
chr1	197741951	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=99.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,20:0,16:0,0,27,10
chr1	197742171	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr1	197890422	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,14,1
chr1	197898395	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,3:2,0:0,8,0,3
chr1	198682256	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:9,2:0,18,0,2
chr1	198711170	.	CA	C,CAA	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=19,26,19;MFRL=144,180,173;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=13.44,8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,8,6:0.188,0.160:41:6,2,2:7,3,0:5,22,2,12
chr1	198717218	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.561:21:5,8:3,2:5,4,10,2
chr1	198719603	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.392:29:8,7:10,4:13,5,11,0
chr1	198721421	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,127;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:18,3:14,0:14,18,3,0
chr1	200080462	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.567:5:1,0:0,1:0|1:200080462_A_AT:200080462:1,1,1,2
chr1	200080464	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.567:5:1,2:0,1:0|1:200080462_A_AT:200080462:1,1,1,2
chr1	200080483	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:0,0:1|0:200080462_A_AT:200080462:1,3,1,0
chr1	200080484	.	C	CAAAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,0:0,0:1|0:200080462_A_AT:200080462:1,3,1,0
chr1	200089872	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:6,0,3,0
chr1	200090120	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=204,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,0:2,7:0,4,0,7
chr1	200143064	.	CTT	C,CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35,32;MFRL=153,192,138;MMQ=60,60,60;MPOS=25,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=T;STR;TLOD=3.03,6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,5:0.238,0.425:12:3,2,1:1,1,4:4,0,8,0
chr1	200143281	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=121,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,3:5,4:0,6,1,6
chr1	200143382	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=198,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:200143382_G_C:200143382:0,2,1,0
chr1	200143386	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=198,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:200143382_G_C:200143382:0,2,1,0
chr1	200182654	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=200,260;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr1	200311910	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:3,4,2,4
chr1	200312546	.	CAA	C,CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=19,27,18;MFRL=164,215,191;MMQ=60,60,60;MPOS=17,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.18,9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,5:0.252,0.508:10:0,2,1:0,0,0:0,2,1,7
chr1	200378731	.	TGCC	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCC;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.095:38:17,2:11,1:10,25,0,3
chr1	200523514	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=194,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:2,4:8,4:10,0,8,0
chr1	200523518	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=194,239;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,2:6,4:11,0,6,0
chr1	200544650	.	TAC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:0,1:0,2:2,0,3,0
chr1	200549590	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:1,6:3,7:0,4,0,13
chr1	200558286	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	200567588	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=164,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr1	200567596	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=151,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr1	200569206	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=144,107;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,4:0.062:77:38,0:32,4:0|1:200569206_C_T:200569206:25,48,0,4
chr1	200569212	.	T	TATTTTTTCATTGTGTCTTGGC	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=29,37;MFRL=148,107;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,4:0.063:77:33,0:35,4:0|1:200569206_C_T:200569206:24,49,0,4
chr1	200569392	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr1	200575794	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=171,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,3:5,2:10,0,5,0
chr1	200578093	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,1,13
chr1	200583380	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:3,2,5,2
chr1	200587937	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:200587937_A_T:200587937:0,0,0,1
chr1	200587939	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:200587937_A_T:200587937:0,0,0,1
chr1	200587943	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:200587937_A_T:200587937:0,0,0,1
chr1	200594240	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	200619478	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr1	200619530	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,6,2
chr1	200816520	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=252,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0|1:200816520_TG_T:200816520:1,2,0,2
chr1	200816522	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=252,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0|1:200816520_TG_T:200816520:1,2,0,2
chr1	200816654	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=208,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:0|1:200816654_C_T:200816654:9,0,2,0
chr1	200816658	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0|1:200816654_C_T:200816654:0,0,13,0
chr1	200818311	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:16,3:11,0:22,6,3,0
chr1	200822378	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:11,0:12,3:0|1:200822378_G_A:200822378:24,1,3,0
chr1	200822380	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:12,0:12,3:0|1:200822378_G_A:200822378:24,1,3,0
chr1	200822550	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.083:58:33,0:21,4:21,33,0,4
chr1	200824108	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:4,0:1,6,0,2
chr1	200826395	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.469:28:8,5:6,8:14,1,9,4
chr1	200843305	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr1	200877786	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,21,0
chr1	200880978	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,0,7
chr1	200943793	.	CAGGA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGA;STR;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.889:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	200944840	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,1:0,5:0,0,0,8
chr1	200955885	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=171,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:4,0,7,0
chr1	201009897	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	201016296	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:7,4:13,4:10,10,3,5
chr1	201020105	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.460:22:4,3:6,6:9,3,7,3
chr1	201021668	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.175:37:14,0:16,1:29,2,0,6
chr1	201030626	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=171,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,0:2,2:0,7,0,2
chr1	201031307	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=97,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:1,1,0,6
chr1	201031655	.	AGAGG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=19,29;MFRL=216,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAGG;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:0,1:0,3,1,1
chr1	201031755	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	201042618	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,1:0,1:2,0,2,0
chr1	201043845	.	ACT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:0,4,0,6
chr1	201052199	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,4:0,1:4,0,5,0
chr1	201058692	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,293;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	201079235	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=152,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:4,3:2,3:4,2,5,2
chr1	201079458	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr1	201081283	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=14,30;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:1,0:1,2:4,2,1,1
chr1	201081293	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=142,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:1,0:4,0:4,3,4,0
chr1	201113118	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,6:0,0,3,14
chr1	201115822	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:9,7:5,1:9,5,7,1
chr1	201116018	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr1	201116080	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=178,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:201116080_CAA_C:201116080:1,3,0,1
chr1	201116085	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=176,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:201116080_CAA_C:201116080:1,2,0,1
chr1	201163191	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr1	201169554	.	TC	GC,GT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,33,34;MFRL=159,181,169;MMQ=60,60,60;MPOS=6,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.39,5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.299,0.299:7:0,2,1:3,0,1:0,3,1,3
chr1	201169582	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=157,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:201169582_CA_C:201169582:0,3,0,1
chr1	201169585	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:201169582_CA_C:201169582:0,4,0,1
chr1	201170772	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	201170824	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	201173104	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:4,2:2,2:1,5,0,4
chr1	201184097	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,4:2,6:8,0,9,1
chr1	201185908	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=195,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.485:6:1,0:1,1:1,2,0,3
chr1	201187828	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	201253119	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:0,6,0,6
chr1	201285863	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:2,11,0,2
chr1	201285909	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	201286614	.	GA	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:9,9:10,11:19,0,21,0
chr1	201286628	.	C	G	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,27:0.459:59:14,16:18,11:27,5,25,2
chr1	201288007	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,4:2,6:0,4,0,10
chr1	201288898	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr1	201289316	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:201289316_A_C:201289316:0,0,1,0
chr1	201289319	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=113,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:201289316_A_C:201289316:0,1,1,0
chr1	201289321	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=24,13;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:201289316_A_C:201289316:1,1,1,0
chr1	201289323	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,10;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:201289316_A_C:201289316:1,1,1,0
chr1	201289325	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,10;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:201289316_A_C:201289316:1,1,1,0
chr1	201289327	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,10;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:201289316_A_C:201289316:1,1,1,0
chr1	201289331	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=34,18;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:201289316_A_C:201289316:1,2,1,0
chr1	201289335	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,12;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:2,0:0|1:201289316_A_C:201289316:1,2,1,0
chr1	201289340	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=36,26;MFRL=154,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,1,0
chr1	201289545	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:2,5,1,6
chr1	201291066	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,7:6,2:10,2,7,2
chr1	201292110	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	201293512	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,3:6,2:7,0,5,0
chr1	201293970	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,7:0,0,16,0
chr1	201293985	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr1	201328824	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=103,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.511:45:14,13:7,9:12,10,9,14
chr1	201328913	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:3,4:0,7,0,5
chr1	201331664	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	201332487	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.083:51:24,0:22,3:16,31,0,4
chr1	201334382	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,11,10
chr1	201335899	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,8,5
chr1	201338553	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,7:0,0,2,18
chr1	201338586	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=133,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr1	201338896	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.587:22:2,5:6,7:7,2,8,5
chr1	201339043	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:1,6,1,5
chr1	201341175	.	CAGAAG	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAG;STR;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.452:18:3,6:7,2:7,3,7,1
chr1	201341339	.	C	CAAGTGGGATT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:4,2:2,0:0|1:201341339_C_CAAGTGGGATT:201341339:1,6,0,2
chr1	201341341	.	C	T,A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30,24;MFRL=0,151,167;MMQ=60,60,60;MPOS=12,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=22.91,6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,2:0.675,0.246:9:0,5,2:0,2,0:0,0,1,8
chr1	201341344	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=127,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:201341339_C_CAAGTGGGATT:201341339:1,5,0,2
chr1	201353827	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	201383616	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,0:1,2:0,1,3,0
chr1	201383643	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=19,32;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.583:5:0,0:1,2:1,1,3,0
chr1	201383811	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:3,10,1,1
chr1	201386916	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=157,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.478:46:17,12:6,9:9,15,10,12
chr1	201438087	.	G	GGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	201453952	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,0:8,3:7,9,0,3
chr1	201598554	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=195,160;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:6,2,1,1
chr1	201687451	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	201749520	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:8,8:14,6:12,10,12,2
chr1	201754396	.	T	TTC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=77,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TC;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr1	201754444	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=160,100;MMQ=60,50;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:3,1:4,3,2,0
chr1	201763029	.	G	GCCATCAGCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:2,2,0,1
chr1	201763499	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=200,198;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,1:4,7:6,0,8,0
chr1	201772863	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,1:0,0,0,11
chr1	201786508	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,15;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:201786508_A_T:201786508:0,1,0,1
chr1	201786512	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201786508_A_T:201786508:0,1,0,1
chr1	201786514	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,25;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:201786508_A_T:201786508:0,1,0,1
chr1	201816639	.	ATCTTTT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.654:21:4,7:2,7:6,1,11,3
chr1	201824390	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:0,4,0,5
chr1	201826340	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:1,7,0,4
chr1	201826409	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	201837934	.	CGT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=10,30;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.816:13:0,5:0,5:0,2,2,9
chr1	201840059	.	GTTATT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,334;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTATT;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.701:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	201840464	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=76.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,9,12
chr1	201844128	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr1	201861016	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,3:5,4:3,9,0,8
chr1	201926386	.	C	CT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.461:42:14,9:9,9:17,6,14,5
chr1	201952287	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=225,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:201952287_C_T:201952287:0,3,0,1
chr1	201952289	.	G	GCCCCTGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=225,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:201952287_C_T:201952287:0,3,0,1
chr1	201952755	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	201966355	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=187,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:3,1:1,4:4,0,6,0
chr1	201966774	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	201970986	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=166,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	201973387	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:201973387_C_T:201973387:3,0,1,0
chr1	201973391	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:201973387_C_T:201973387:3,0,2,0
chr1	202092046	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,2:0,0,7,2
chr1	202096815	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,8:0,0,14,1
chr1	202107422	.	AACACAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=222,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=AC;STR;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:1,2:0,0:1,0,3,0
chr1	202122783	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=167,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:4,3:0,3:4,0,7,0
chr1	202163621	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,5:3,5:6,2,10,0
chr1	202194441	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	202197161	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:7,3:5,1:1,12,2,2
chr1	202266547	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:3,1:5,3:9,0,4,0
chr1	202270431	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202270431_C_T:202270431:0,0,0,1
chr1	202270432	.	T	TAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202270431_C_T:202270431:0,0,0,1
chr1	202273872	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr1	202279261	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:10,0,2,0
chr1	202287156	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:9,5:3,7:5,7,5,7
chr1	202287754	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:5,4,4,2
chr1	202288293	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,6:3,1:7,4,2,5
chr1	202386075	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,3:0,12:0,0,5,10
chr1	202407105	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.097:38:12,2:22,1:15,20,1,2
chr1	202443000	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,159;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:3,4:3,3:6,1,5,2
chr1	202465881	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=175,51;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:0|1:202465881_C_G:202465881:13,7,1,1
chr1	202465895	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=172,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:202465881_C_G:202465881:11,9,1,1
chr1	202465897	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=172,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:202465881_C_G:202465881:11,9,1,1
chr1	202465902	.	T	TCTCC	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=170,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:202465881_C_G:202465881:11,8,1,1
chr1	202533516	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=168,177074;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,2,1
chr1	202572105	.	GCC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=147,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=C;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:0,1:5,1:4,5,0,2
chr1	202703053	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:1,2:10,2:0,11,0,5
chr1	202715244	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.792:22:3,7:1,11:2,2,18,0
chr1	202718028	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,2:2,4:4,3,6,0
chr1	202722277	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=203,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr1	202731986	.	C	CCTCAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.610:16:1,1:5,8:0,6,0,10
chr1	202736222	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.158:27:11,0:11,4:2,21,0,4
chr1	202736280	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:3,2:10,0:5,9,2,0
chr1	202743892	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:9,3:3,3:4,8,0,6
chr1	202894336	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,5:0.074:78:34,0:39,5:23,50,1,4
chr1	202911268	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:16,4:15,0:11,21,0,4
chr1	202914356	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,1,21
chr1	202978032	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=280,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	202987770	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:6,7:6,7:0,12,0,14
chr1	202987796	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=193,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.465:24:7,5:5,6:0,13,0,11
chr1	202990110	.	CTTT	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.830:8:0,2:1,5:0,1,0,7
chr1	202990155	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,0:0,1,0,4
chr1	203012705	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,1:1,5:0,2,0,8
chr1	203018190	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=194,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:6,4:8,4:0,14,0,8
chr1	203024766	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,239;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:19,0:11,2:11,20,2,0
chr1	203026167	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:0,19,1,1
chr1	203029017	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=114,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:0,2:3,6:1,2,0,9
chr1	203030207	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=201,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:0,3:6,7:1,7,5,5
chr1	203030685	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,5:2,1:6,0,5,1
chr1	203036757	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:8,0,5,0
chr1	203040740	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	203040816	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,16,2
chr1	203040922	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,5:5,1:3,9,2,4
chr1	203045583	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	203054523	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	203054555	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=262,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,0,2
chr1	203055101	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=103.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,10:0,19:0,0,11,18
chr1	203134135	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.639:23:3,5:5,10:7,1,12,3
chr1	203137784	.	A	ACT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=78.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,8:0,8:0,0,6,12
chr1	203138304	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=113,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:2,0,3,1
chr1	203148517	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr1	203155882	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=229,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	203188393	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:9,1:19,2:20,8,3,0
chr1	203194772	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=137,236;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.232:13:3,0:5,1:5,5,3,0
chr1	203452226	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=168,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr1	203456098	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr1	203465396	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:7,5:1,1:4,4,1,5
chr1	203469038	.	C	CAACT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=230,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0|1:203469038_C_CAACT:203469038:0,1,0,1
chr1	203469040	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=230,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:0,0:0|1:203469038_C_CAACT:203469038:0,1,0,1
chr1	203469046	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:203469038_C_CAACT:203469038:0,0,0,1
chr1	203667536	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:0,8,0,6
chr1	203669371	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:8,5:9,6:13,4,7,4
chr1	203670128	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=206,89;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	203679934	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:4,7:9,5:13,0,11,1
chr1	203682341	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.131:40:24,4:11,0:18,17,2,3
chr1	203709068	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	203742915	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	203786152	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,181;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:10,8:6,6:11,5,14,0
chr1	203797335	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.536:32:5,9:8,8:15,0,15,2
chr1	203797384	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=97.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,30:0.544:55:10,13:15,17:21,4,25,5
chr1	203799343	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.365:31:11,5:8,6:3,17,0,11
chr1	203800715	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,2:2,1:0|1:203800715_A_G:203800715:3,0,4,0
chr1	203800735	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,3:3,1:0|1:203800715_A_G:203800715:5,0,4,0
chr1	203803016	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr1	203807028	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,4:2,6:10,0,10,0
chr1	203807233	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:2,2:6,4:1,7,0,7
chr1	203807273	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=192,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr1	203809380	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:5,7:9,5:12,2,9,3
chr1	203817549	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,28:0.433:65:12,10:25,17:11,26,8,20
chr1	203817608	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:2,6:9,4:0,11,0,10
chr1	203817620	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:4,3:9,4:0,13,0,7
chr1	203819177	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.415:39:12,7:11,9:4,19,2,14
chr1	203819203	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.595:30:8,9:3,7:1,11,1,17
chr1	203821200	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,12:0,7:0,0,19,0
chr1	203831261	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.474:34:9,6:8,10:12,6,12,4
chr1	203832964	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,2:6,5:0,8,0,7
chr1	204082002	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,3:3,7:5,1,10,0
chr1	204082323	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=207,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr1	204083752	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.274:24:6,1:1,0:3,14,0,7
chr1	204085609	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=98.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,32:0.518:62:13,14:16,18:19,11,21,11
chr1	204091411	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,11;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.184:29:8,0:9,0:8,15,6,0
chr1	204103618	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,9,2
chr1	204118943	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:15,1:13,1:17,11,0,2
chr1	204121061	.	A	ACTGAGTGGGAAAGATTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	204124370	.	AC	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:2,5:1,8:0,3,0,13
chr1	204124865	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.650:6:0,1:1,3:2,0,4,0
chr1	204125089	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:2,3:2,4:0,5,1,6
chr1	204126378	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:6,4:9,2:13,2,6,0
chr1	204129671	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=186,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:2,8:3,6:4,1,13,1
chr1	204131060	.	TGA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:5,1:11,0,2,0
chr1	204131186	.	T	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,26:0.458:57:13,12:18,14:16,15,10,16
chr1	204159611	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=166,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:4,0,3,0
chr1	204162029	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:2,2:6,0:3,6,0,2
chr1	204171016	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=236,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	204192687	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.197:27:10,2:8,0:17,4,0,6
chr1	204210750	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	204210791	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,3:4,2:5,1,5,1
chr1	204210997	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=221,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,4:2,7:0,3,0,11
chr1	204216410	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	204216468	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr1	204216601	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	204219559	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	204219821	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:0,3,0,7
chr1	204219850	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	204234196	.	G	GGT	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GT;STR;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.383:16:5,3:5,1:1,9,2,4
chr1	204234222	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,6:0,12:0|1:204234222_T_C:204234222:0,0,2,18
chr1	204234225	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,5:0,11:0|1:204234222_T_C:204234222:0,0,1,18
chr1	204394731	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,11;MFRL=113,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.187:27:9,0:4,1:14,7,6,0
chr1	204409281	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=85.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,21,4
chr1	204413297	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=155.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,42:0.506:83:22,19:18,21:0|1:204413297_C_T:204413297:15,26,11,31
chr1	204413299	.	G	A	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=155.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,42:0.506:83:22,20:19,17:0|1:204413297_C_T:204413297:15,26,11,31
chr1	204416501	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,3:1,0:4,0,3,0
chr1	204416686	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=144,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:204416686_G_A:204416686:1,2,0,1
chr1	204416693	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=152,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:204416686_G_A:204416686:1,1,0,1
chr1	204416697	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=152,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:204416686_G_A:204416686:1,1,0,1
chr1	204418889	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=197,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:7,0,5,0
chr1	204418939	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:9,4:3,8:12,0,10,3
chr1	204429823	.	CTGGGGACTCAGTGGCAAGGGAGATACATACCTTAGCCT	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.083:35:9,2:16,0:5,28,1,1
chr1	204429838	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,10:0,12:0,0,4,18
chr1	204433093	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:5,4:3,4:6,3,5,3
chr1	204433511	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr1	204434277	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr1	204434325	.	C	CCT	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,14:0.535:26:4,7:6,6:0|1:204434325_C_CCT:204434325:5,7,7,7
chr1	204434326	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,14:0.535:26:4,7:6,5:0|1:204434325_C_CCT:204434325:5,7,7,7
chr1	204438334	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,7,14
chr1	204438687	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:28,1:31,2:36,23,3,0
chr1	204495595	.	GTTT	G,GT,TTTT,GTTTTTTT	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=34,14,29,26,14;MFRL=81,153,159,138,147;MMQ=60,60,60,41,60;MPOS=25,14,18,12;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=6.19,22.18,8.69,4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:2,4,11,12,3:0.119,0.349,0.215,0.171:32:0,0,6,3,1:2,1,2,4,0:1,1,3,27
chr1	204495652	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=174,182;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:15,3:2,1:0,17,0,4
chr1	204512100	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,4:1,5:0,6,0,9
chr1	204515863	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,3:4,2:4,0,5,0
chr1	204516025	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:4,6:3,3:1,7,3,6
chr1	204518842	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr1	204589066	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,6:2,0:6,0,5,1
chr1	204589844	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.150:25:14,0:6,3:9,13,0,3
chr1	204921258	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.386:11:3,0:4,4:1,6,1,3
chr1	204943285	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,7:0,13:0,0,16,4
chr1	204943947	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,4:7,6:5,9,4,6
chr1	204943991	.	CA	TG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:5,4:6,1:1,11,2,3
chr1	204943992	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=39,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.896:15:1,8:0,6:0,1,1,13
chr1	204951209	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=123,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:0,4,0,6
chr1	204954993	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=183,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.595:15:4,8:1,0:6,0,8,1
chr1	204955319	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:204955319_G_A:204955319:0,0,0,3
chr1	204955329	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:204955319_G_A:204955319:0,0,0,1
chr1	205028883	.	CAG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=65.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,4:0,9:0,0,0,15
chr1	205034852	.	A	ATGGCCTGCTGCACTGGTCAGGGCCGGTGGTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGGCCTGCTGCACTGGTCAGGGCCGGTGGTC;STR;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr1	205038731	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:205038731_C_T:205038731:0,0,0,4
chr1	205038733	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=198,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:205038731_C_T:205038731:0,2,0,1
chr1	205038739	.	C	CAGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=198,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:205038731_C_T:205038731:0,2,0,1
chr1	205038744	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=198,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:205038731_C_T:205038731:0,2,0,1
chr1	205039288	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr1	205041015	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	205053073	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:15,0:14,3:11,19,2,1
chr1	205053219	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr1	205063949	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,3:6,4:11,0,7,0
chr1	205065733	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,21,0
chr1	205083865	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=141.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,17:0,21:0,0,38,0
chr1	205084120	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,8:0,0,7,15
chr1	205090885	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr1	205129466	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:3,3:3,1:0,7,0,5
chr1	205139002	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=256,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:205139002_G_GA:205139002:0,1,0,1
chr1	205139005	.	C	CTTCTTTGTGATGATTGCATTCAACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=256,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:205139002_G_GA:205139002:0,1,0,1
chr1	205239031	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr1	205240913	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr1	205273100	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.585:27:3,6:8,9:5,6,5,11
chr1	205312767	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	205350771	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=151,119;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:5,5:7,0:11,2,0,5
chr1	205385498	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr1	205495392	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,5,10
chr1	205495521	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:6,8,0,2
chr1	205499577	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=212,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,1:3,1:1,2,1,2
chr1	205499660	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:6,0,5,2
chr1	205500450	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.361:36:9,6:13,5:10,13,5,8
chr1	205500543	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,31:0.640:48:10,13:7,18:10,7,17,14
chr1	205549757	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=15,32;MFRL=239,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:0,2:0|1:205549757_A_C:205549757:2,0,4,0
chr1	205549763	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=165,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:0,1:2,2:0|1:205549757_A_C:205549757:4,0,4,0
chr1	205549767	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=165,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:0,0:4,1:0|1:205549757_A_C:205549757:4,0,2,0
chr1	205555145	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=136,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.571:35:7,15:7,5:11,4,14,6
chr1	205561511	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr1	205566805	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,192;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:1,3:10,0:10,1,3,0
chr1	205568216	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,22:0.637:34:6,13:6,8:12,0,20,2
chr1	205568389	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=163,22378575;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:18,2:15,0:0|1:205568389_G_A:205568389:4,31,0,2
chr1	205568390	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,20:0.556:36:5,15:10,5:1|0:205568389_G_A:205568389:2,14,2,18
chr1	205590049	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:205590049_G_A:205590049:0,0,0,1
chr1	205590057	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:205590049_G_A:205590049:0,0,0,1
chr1	205687348	.	CTTTTTTCTTT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=95,197;MMQ=57,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTTTCTTT;STR;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.808:13:1,4:0,6:2,0,10,1
chr1	205689807	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,8:0,1:0,0,1,8
chr1	205739396	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	205744138	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.921:11:0,3:0,3:0,0,0,11
chr1	205764640	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=54.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,9:0,0,1,17
chr1	205766159	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,4:0,9:0,0,0,14
chr1	205812703	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=201,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr1	205814497	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,18:0,9:0,0,18,9
chr1	205814695	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=138,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:3,1:0,3:0,3,0,5
chr1	205816923	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=149,265;MMQ=27,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:14,0,2,0
chr1	205884646	.	CTGTG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=190,221;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=TG;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr1	205886381	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=163,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:5,0:4,3:6,3,3,1
chr1	205888143	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:0,4,0,5
chr1	205890679	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	205892482	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.112:24:12,1:9,1:15,7,1,1
chr1	205896293	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:4,1,5,1
chr1	205896475	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,10:0,0,2,10
chr1	205896948	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=87,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	205898529	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,271;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:1,15,0,2
chr1	205901047	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.115:50:27,5:18,0:27,18,5,0
chr1	205901788	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:4,1:4,4:9,0,6,0
chr1	205902242	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=207,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.716:19:2,8:3,6:1,4,1,13
chr1	206224635	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,5:8,3:8,5,7,1
chr1	206231152	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.469:47:16,10:9,12:9,16,3,19
chr1	206231203	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,3:6,4:0,15,0,7
chr1	206318211	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.806:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	206318218	.	CT	GG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,19;MFRL=163,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:206318218_CT_GG:206318218:1,0,1,0
chr1	206318222	.	TCTA	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:206318218_CT_GG:206318218:2,0,1,0
chr1	206318226	.	G	GGTT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,19;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:206318218_CT_GG:206318218:2,0,1,0
chr1	206318229	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,15;MFRL=189,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:206318218_CT_GG:206318218:3,0,1,0
chr1	206318237	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,15;MFRL=189,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:206318218_CT_GG:206318218:3,0,1,0
chr1	206318239	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,17;MFRL=189,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:206318218_CT_GG:206318218:3,0,1,0
chr1	206565975	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=171,223;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:18,2:9,1:0|1:206565975_T_G:206565975:27,0,3,0
chr1	206566000	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=192,232;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:32,5:0.142:37:19,3:13,1:1|0:206565975_T_G:206565975:32,0,5,0
chr1	206566860	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=183,161;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:6,1:10,2:15,2,3,0
chr1	206567100	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=200,233;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:10,1:6,3:0,17,0,4
chr1	206579936	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=162,168;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.365:39:10,8:15,5:25,0,14,0
chr1	206623685	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:4,5:10,4:10,4,8,1
chr1	206623866	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:2,3:3,3:0,6,1,5
chr1	206626779	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,9:0,6:0,1,0,15
chr1	206632356	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:0,12,0,2
chr1	206648378	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:2,3:2,3:1,4,0,7
chr1	206670827	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=225,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr1	206671122	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0,15,0,2
chr1	206758077	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr1	206760474	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	206769047	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=118.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,28,5
chr1	206772753	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	206776203	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr1	206810946	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr1	206821000	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:18,0:12,4:14,18,0,4
chr1	206904464	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=89.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,17:0,11:0,0,23,5
chr1	206904644	.	CGT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=193,227;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GT;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:4,0:4,3:0,9,0,3
chr1	206905287	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=176,165;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:5,0:6,0:0|1:206905287_A_T:206905287:12,0,0,2
chr1	206905292	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.246:14:4,0:6,1:0|1:206905287_A_T:206905287:11,0,0,3
chr1	206905296	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.232:15:4,0:5,0:0|1:206905296_A_T:206905296:12,0,0,3
chr1	206905299	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.236:19:6,1:4,1:0|1:206905296_A_T:206905296:14,1,0,4
chr1	206905308	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.212:23:10,0:7,0:16,2,0,5
chr1	206943351	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	206944233	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=123.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,19:0,15:0,0,25,10
chr1	206944645	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,14,5
chr1	206944861	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	207009910	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=207,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	207014472	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,5:5,6:0,11,0,11
chr1	207040659	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:3,1,7,0
chr1	207072959	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	207073619	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=158,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.224:24:6,0:7,0:13,6,5,0
chr1	207073624	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=156,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.177:25:7,0:6,0:14,7,4,0
chr1	207108816	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:11,0,2,0
chr1	207109167	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=179.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,31:0,24:0,0,23,33
chr1	207110363	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	207111121	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=107,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.621:16:5,6:0,4:1,5,1,9
chr1	207113755	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=130.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,20:0,0,33,3
chr1	207135546	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr1	207237277	.	T	TGTGTGTGGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=204,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	207238499	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,2:15,0:13,15,2,0
chr1	207241440	.	AGTGT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=GT;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.299:10:1,2:5,0:7,0,2,1
chr1	207243851	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	207288897	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr1	207297484	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=204,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr1	207300259	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:12,5:9,3:2,19,0,8
chr1	207304900	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:2,7:9,8:9,2,11,4
chr1	207504669	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:3,4:4,2:0,7,0,7
chr1	207510596	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,7:3,4:8,0,11,0
chr1	207640163	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:4,0:13,3:12,6,2,1
chr1	207641840	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=90,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:1,5:2,1:2,2,6,0
chr1	207642295	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=191,261;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:1,3,0,3
chr1	207653444	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:5,7:3,1:1,8,1,7
chr1	207700348	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,239;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	207739127	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=99.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,25,2
chr1	207753831	.	CTT	C	.	.	DP=54;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.118:30:7,2:13,1:16,11,1,2
chr1	207753838	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=182,156;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:17,3:23,0:18,22,3,0
chr1	207753846	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=32,18;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.125:44:11,0:18,0:17,22,5,0
chr1	207753849	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=32,19;MFRL=179,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.138:41:11,0:18,0:14,22,5,0
chr1	207753852	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=32,18;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.164:40:11,0:18,0:13,21,6,0
chr1	207784968	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr1	207881485	.	TA	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=157,163;MMQ=56,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,19:0.435:44:9,7:15,6:0|1:207881485_TA_T:207881485:19,6,12,7
chr1	207881489	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=144,168;MMQ=56,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,20:0.429:47:9,10:15,9:0|1:207881485_TA_T:207881485:19,8,13,7
chr1	207881491	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=144,168;MMQ=56,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,20:0.438:46:9,10:15,9:0|1:207881485_TA_T:207881485:18,8,13,7
chr1	207930537	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.511:18:3,1:4,8:1,8,0,9
chr1	207943832	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=194,226;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:15,1:2,1:0,17,0,2
chr1	207956559	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:3,0,7,0
chr1	207959122	.	CTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.883:5:0,3:0,1:0|1:207959122_CTTTT_C:207959122:0,0,0,5
chr1	207959136	.	T	TAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=A;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:207959122_CTTTT_C:207959122:0,0,0,5
chr1	207992546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr1	208062260	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:0,7,0,4
chr1	208062471	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.684:22:1,7:4,8:4,3,9,6
chr1	208063100	.	G	A,GA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,26,32;MFRL=136,161,147;MMQ=60,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.50,18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,9,11:0.258,0.470:26:2,3,4:3,3,3:5,1,7,13
chr1	208072470	.	T	A	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,3:0.052:75:36,3:34,0:38,34,3,0
chr1	208205139	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:208205139_G_GT:208205139:2,0,0,1
chr1	208205140	.	G	GCTCAGAGCTCAGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:208205139_G_GT:208205139:2,0,0,1
chr1	208206946	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=194,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:0,5,0,5
chr1	208211887	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,0,18
chr1	208212397	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	208213125	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,5,13
chr1	208219164	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	208252504	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:2,3:1,5:3,0,9,0
chr1	208255877	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:1,4,0,5
chr1	208257629	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,5:2,1:5,0,6,0
chr1	208270244	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=266,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr1	208276399	.	C	CCTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=CT;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	208390086	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr1	209605636	.	TAGC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AGC;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:5,2:3,1:0,10,0,3
chr1	209786078	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,0:0,2:0,0,2,2
chr1	209788514	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	209791488	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,1,3
chr1	209792015	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr1	209796267	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	209800638	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	209849002	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=78.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0,0,17,5
chr1	209849399	.	AG	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=240.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,55:0.983:55:0,28:0,24:0|1:209849399_AG_A:209849399:0,0,23,32
chr1	209849406	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=235.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,54:0.982:54:0,27:0,25:0|1:209849399_AG_A:209849399:0,0,22,32
chr1	209849714	.	TA	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=182.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,38:0,22:0,0,39,22
chr1	209880508	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=16,24;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.220:17:3,1:2,1:2,11,0,4
chr1	209950681	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=108.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,13:0,0,15,14
chr1	209951400	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:7,0,4,2
chr1	209952865	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:3,5:5,3:1,7,1,8
chr1	209965587	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:6,5:6,5:9,3,9,1
chr1	209969696	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=176,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:10,3,2,0
chr1	209969902	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.615:34:8,13:4,8:6,7,6,15
chr1	210001543	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:4,5:2,6:0,6,2,9
chr1	210001586	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr1	210003388	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=113,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,3:4,6:5,4,9,0
chr1	210003402	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,21,4
chr1	210006437	.	GC	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	210008367	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0|1:210008367_C_G:210008367:0,0,14,3
chr1	210008374	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.408:20:5,4:7,4:0|1:210008367_C_G:210008367:9,3,5,3
chr1	210012102	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr1	210015568	.	GCT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=46.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	210267893	.	TGAA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAA;STR;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:7,6:6,8:7,6,6,8
chr1	210273886	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,1:1,5:0,4,0,6
chr1	210411281	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=138,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.168:19:4,0:3,0:10,6,3,0
chr1	210411286	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,9;MFRL=141,239;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.193:23:6,0:10,0:11,8,4,0
chr1	210411504	.	TC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,1:10,1:1,20,0,2
chr1	210414879	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.161:27:6,1:5,3:9,14,3,1
chr1	210591742	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:2,1:0,7,0,4
chr1	210686570	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr1	210761462	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	210970823	.	T	TG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:9,3:8,6:15,2,6,3
chr1	211280737	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.807:14:1,4:1,7:0,2,1,11
chr1	211280741	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=145,99;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:0,11,0,2
chr1	211447435	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,12:0,0,19,0
chr1	211451393	.	TATC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:3,4:5,0,8,1
chr1	211452529	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,10:0,2:1,0,11,1
chr1	211452678	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.488:47:12,11:12,11:6,18,7,16
chr1	211452728	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:2,8:7,5:0,9,1,12
chr1	211533990	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,5:4,1:5,1,5,1
chr1	211534528	.	GC	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:2,2:8,5:2,8,2,6
chr1	211847646	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.431:42:15,7:9,10:15,9,11,7
chr1	212002654	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:16,3:14,0:9,22,2,1
chr1	212142054	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=16,22;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,0:0,4:1,5,1,6
chr1	212156097	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:19,1:27,1:26,20,1,1
chr1	212209367	.	T	TC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,7:7,6:0,13,1,12
chr1	212217944	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.285:14:4,1:6,3:10,0,4,0
chr1	212217971	.	C	CTT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:10,0:7,4:20,5,4,2
chr1	212220847	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=177,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,2:6,2:0,6,0,4
chr1	212236157	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,9:0,0,16,1
chr1	212240063	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:6,0,5,0
chr1	212241714	.	TAA	T,TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29,28;MFRL=153,198,214;MMQ=60,60,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.34,7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,4:0.299,0.507:7:0,1,4:1,1,0:0,1,0,6
chr1	212274500	.	A	AAGCTTCCAGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,28;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0,3,0,1
chr1	212274513	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,1:0,0:0|1:212274513_T_TG:212274513:0,0,0,1
chr1	212274515	.	T	TTTGCTTTGTTTTCATTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,1:0,0:0|1:212274513_T_TG:212274513:0,0,0,1
chr1	212521639	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr1	212530192	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,7:0,1:0,0,6,3
chr1	212530593	.	G	T	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=147,106;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,4:0.072:67:36,4:25,0:27,36,0,4
chr1	212530659	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=188,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:6,4:3,1:0,10,0,5
chr1	212587979	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,11;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.554:7:1,0:2,0:0|1:212587979_A_C:212587979:0,3,4,0
chr1	212587981	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.554:7:1,0:2,0:0|1:212587979_A_C:212587979:0,3,4,0
chr1	212587988	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.309:14:3,1:3,1:0|1:212587979_A_C:212587979:3,7,4,0
chr1	212587992	.	CGCAT	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,36;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.235:19:4,3:7,0:0|1:212587979_A_C:212587979:5,10,4,0
chr1	212588206	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	212615875	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,12,4
chr1	212616080	.	C	CATTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=ATTTT;STR;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.880:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	212860076	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr1	212870292	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.545:31:9,7:5,10:11,3,15,2
chr1	212900434	.	C	CG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,5:1,2:3,1,5,2
chr1	212912108	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=220,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	212960866	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.558:43:11,8:7,16:16,3,22,2
chr1	212961080	.	T	TAAAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=87,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.614:11:1,3:3,4:0,4,0,7
chr1	212969842	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32,32,35;MFRL=149,180,161,201;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,17,30;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.09,14.27,3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:16,3,9,3:0.103,0.281,0.114:31:7,1,2,2:7,2,5,1:13,3,13,2
chr1	212970375	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	213032568	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=178,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:10,1:7,6:0,17,0,7
chr1	213037306	.	G	GTGATC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=212,269;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:1,1:1,0:0|1:213037306_G_GTGATC:213037306:0,2,0,1
chr1	213037310	.	T	C,TTTTTCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28,31;MFRL=0,212,269;MMQ=60,60,60;MPOS=18,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.12,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,1,1:0,1,0:0,0,0,3
chr1	213037311	.	G	GATGGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=212,269;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:213037306_G_GTGATC:213037306:0,2,0,1
chr1	213046236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr1	213056819	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr1	213056892	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	213061362	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:9,5:10,9:6,13,2,12
chr1	213062017	.	T	TTTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TTG;STR;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	213068233	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr1	213068404	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:10,4:6,5:2,14,1,8
chr1	213068436	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:8,7:9,4:1,16,5,6
chr1	213068542	.	C	CTGAT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:6,5:8,4:9,5,6,3
chr1	213068591	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=173,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:14,1:11,1:9,18,0,2
chr1	213068595	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.574:31:8,10:5,7:4,9,6,12
chr1	213134407	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	213139748	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr1	213140362	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,7,2
chr1	213140398	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr1	213224719	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=98.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,10:0,18:0,0,26,2
chr1	213341188	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:9,3:7,0:14,3,3,0
chr1	213405414	.	GGCAACTGAGGAT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAACTGAGGAT;STR;TLOD=72.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,16,1
chr1	214454774	.	GGGC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,0:8,2:0,14,0,3
chr1	214478459	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=181,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:4,4:1,4:4,1,8,1
chr1	214488244	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=149,143;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:27,0:23,3:3,48,0,3
chr1	214503489	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=190,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.688:27:7,12:1,6:7,1,13,6
chr1	214505596	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=214,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	214543098	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,4:2,5:0,5,0,9
chr1	214551276	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.556:32:8,7:6,10:11,3,14,4
chr1	214558228	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=229,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr1	214564340	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.336:28:12,4:5,5:12,7,7,2
chr1	214564442	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:4,1:5,6:0,9,1,6
chr1	214637882	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,12:0,0,19,0
chr1	214638172	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=115.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,15:0,0,2,32
chr1	214795536	.	T	G	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=153,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,3:0.049:79:39,3:37,0:31,45,3,0
chr1	214825289	.	CTT	C,CT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32,36;MFRL=174,170,115;MMQ=60,60,60;MPOS=14,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=5.47,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,3,3:0.123,0.128:28:6,3,0:15,0,3:0,22,1,5
chr1	214826364	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=187,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,1:4,6:2,7,3,4
chr1	214828812	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:5,9:8,5:2,11,1,13
chr1	215345263	.	GTCTCTCTC	G,GTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,36,33;MFRL=169,143,152;MMQ=60,60,60;MPOS=18,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,7,8;RU=TC;STR;TLOD=5.25,9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.334,0.447:6:0,2,0:1,0,3:1,0,5,0
chr1	215368514	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	215749406	.	GT	G,GTT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,32,31;MFRL=159,199,153;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=10.77,14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,7,9:0.222,0.281:32:4,2,2:7,4,3:0,16,1,15
chr1	215753270	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=150,177;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:18,4:12,0:17,13,4,0
chr1	215753284	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=151,177;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:16,4:11,0:14,13,4,0
chr1	215824169	.	TCAAAAGCAAGATACCCTAAGGCTGGGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGGAAAAAAAACGAAATTGGCAAC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.163:24:6,5:7,1:3,14,2,5
chr1	215847976	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:3,9,0,3
chr1	215849044	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:1,1:2,2:0,3,0,4
chr1	215853748	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.829:11:1,4:1,3:0,2,1,8
chr1	215901775	.	CA	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr1	215901787	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:215901787_A_C:215901787:0,2,0,1
chr1	215901789	.	G	GTGCAAGTAGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:215901787_A_C:215901787:0,2,0,1
chr1	215914883	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,16;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:1,0:0,5,0,2
chr1	215916728	.	ATGTGTG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=218,187;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=TG;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,0:0,4,0,3
chr1	215916736	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=224,187;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	215953477	.	G	GAAACTTTTGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	216051172	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:3,1:3,3:6,3,2,3
chr1	216051287	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:0,2,1,3
chr1	216052540	.	A	AAAAAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	216062119	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:11,2:13,1:16,8,2,1
chr1	216062331	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:9,0:6,3:9,6,0,3
chr1	216246675	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr1	216370130	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr1	216373476	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=158,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,0:0,0:1,2,0,2
chr1	216390694	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr1	216495191	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:4,7:1,7:5,0,14,1
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chr1	216824505	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr1	217604777	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	217671771	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:1,8,0,3
chr1	217793938	.	T	TTAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAA;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	217822135	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr1	217856803	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=150,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,8:1,6:0,1,0,14
chr1	217975289	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,2:4,7:0,8,1,8
chr1	218036237	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr1	218458557	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=185,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:1,2:2,0,5,0
chr1	218578671	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:1,5:5,2:2,4,1,7
chr1	218610662	.	CTT	C,CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,32,34;MFRL=0,147,151;MMQ=60,60,60;MPOS=16,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.93,4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.400,0.410:7:1,1,3:0,2,0:1,0,6,0
chr1	218683417	.	CT	C,CTT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,35,36;MFRL=156,176,156;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=12.07,5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,7,4:0.286,0.177:25:7,5,3:7,2,1:14,0,11,0
chr1	219366400	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr1	219383848	.	A	ACTTTTT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=143.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,13:0,13:0,0,30,3
chr1	219383867	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=150.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.957:44:0,24:1,19:1,0,34,9
chr1	220089352	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	220101203	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:4,6,0,2
chr1	220145371	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=121.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,12:0,0,28,3
chr1	220153332	.	T	TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,9:0,1:0,0,10,0
chr1	220154246	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=202,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.727:16:1,9:2,3:0,4,0,12
chr1	220154659	.	TAAA	T,TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27,30;MFRL=0,174,173;MMQ=60,60,60;MPOS=17,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=A;STR;TLOD=6.89,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.572,0.334:6:0,2,2:0,1,0:0,0,6,0
chr1	220154768	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=135.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,23:0,18:0,0,19,23
chr1	220156090	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=162.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,28:0,15:0,0,39,5
chr1	220156704	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,16:0.531:30:5,7:9,9:0|1:220156704_T_C:220156704:6,8,4,12
chr1	220156729	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=195,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.539:24:2,4:7,8:0|1:220156704_T_C:220156704:3,8,3,10
chr1	220160433	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=95.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,9:0,17:0,0,25,1
chr1	220162106	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,0:16,2:8,16,0,2
chr1	220162195	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,1,10
chr1	220178717	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr1	220191932	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=187,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,0:3,0:0|1:220191932_G_T:220191932:0,3,0,1
chr1	220191946	.	ACTC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=178,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:220191932_G_T:220191932:0,2,0,1
chr1	220191952	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=178,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:220191932_G_T:220191932:0,2,0,1
chr1	220192495	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr1	220197545	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,14,1
chr1	220205943	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	220207017	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,20:0,17:0,0,8,29
chr1	220208154	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,15:0,7:0,0,19,3
chr1	220231304	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=175,187;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:16,4:4,0:0,20,0,4
chr1	220231316	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=190,228;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:17,2:1,0:0,18,0,2
chr1	220313530	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:5,0:5,5,2,0
chr1	220771630	.	GT	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.106:36:13,3:18,0:29,4,2,1
chr1	220771740	.	TTA	T,TTATA	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,31,31;MFRL=152,147,155;MMQ=60,60,60;MPOS=29,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=TA;STR;TLOD=6.48,48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,18:0.098,0.502:35:6,2,6:8,1,10:0,14,0,21
chr1	220771832	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,0:1,3:1,6,0,3
chr1	220789236	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr1	220789355	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:2,4:2,4,3,6
chr1	220789362	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr1	220808666	.	CTT	C,CT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,32,32;MFRL=204,136,149;MMQ=60,60,60;MPOS=25,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=6.17,14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,9:0.223,0.412:22:4,3,5:4,2,2:8,0,13,1
chr1	220808694	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=143,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.167:38:9,2:11,1:22,9,7,0
chr1	220808921	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,6:3,1:0,7,0,7
chr1	220824115	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,2:3,3:0,5,2,3
chr1	220825523	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.401:30:7,7:11,4:1,17,2,10
chr1	220955074	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:3,4:7,0:10,1,4,0
chr1	220978645	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,17:0.399:43:16,6:10,11:6,20,6,11
chr1	220982320	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=118,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:1,1:0,2:1,2,0,3
chr1	221053574	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=195,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.637:14:1,5:3,4:3,2,4,5
chr1	221055463	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.364:23:8,3:5,5:14,1,7,1
chr1	221058059	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=149,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	222697088	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,2:1,6:0,5,0,8
chr1	222700416	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,3:6,5:6,6,2,6
chr1	222705270	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:3,1,7,0
chr1	222713750	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=214,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	222713765	.	CTCAT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=201,149;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:222713765_CTCAT_C:222713765:0,5,0,1
chr1	222713773	.	TGATGCCAAGAGA	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=201,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:222713765_CTCAT_C:222713765:0,5,0,1
chr1	222736498	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.454:62:14,12:18,16:26,8,20,8
chr1	222737568	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,0,18
chr1	222750744	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.396:23:7,6:6,2:13,1,9,0
chr1	222751034	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	222791646	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=202,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.529:9:4,2:0,1:1,3,0,5
chr1	222794455	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,3:1,7:3,0,10,0
chr1	222802006	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,14:0,18:0,0,15,19
chr1	222805698	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:0,2:10,2:2,9,0,4
chr1	222806606	.	G	GT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.147:38:16,2:17,2:1,32,0,5
chr1	222823529	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	222823743	.	T	G	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=127.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,51:0.899:56:2,27:3,24:1,4,10,41
chr1	222825717	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=142.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,15:0,24:0,0,6,33
chr1	222825761	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,9:0,11:0,0,0,20
chr1	222826481	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=94.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,19:0,10:0,0,10,20
chr1	222835522	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:12,2:17,2:21,9,2,2
chr1	222846856	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,1:8,1:0,15,0,2
chr1	222846868	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=186,184;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,0:7,3:0,16,0,3
chr1	222867036	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,3:9,0:14,0,3,0
chr1	222867687	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=78.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.544:44:11,16:9,8:2,18,0,24
chr1	222923001	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,317;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	223152868	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,6,1
chr1	223156382	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=117.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,24:0,12:0,0,26,10
chr1	223156406	.	CT	C,CTT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=21,19,29;MFRL=169,173,150;MMQ=60,60,60;MPOS=14,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.39,4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,3:0.199,0.198:18:4,2,2:3,0,0:3,7,3,5
chr1	223532570	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,4:3,4:0,3,0,9
chr1	223711382	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=186,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,5:9,7:15,0,10,2
chr1	223717379	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr1	223718764	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	223814671	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=213,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr1	223814682	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=203,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr1	223816322	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	223816347	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=73.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,18,5
chr1	223816577	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr1	223853099	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.497:28:6,8:8,5:11,3,12,2
chr1	223853440	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr1	223949380	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=195,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.740:17:1,7:2,6:0,4,1,12
chr1	223949827	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=304,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr1	223980965	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.484:35:10,7:8,9:17,1,17,0
chr1	223980973	.	C	CA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.154:34:12,3:16,1:28,1,5,0
chr1	223994505	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:14,0,2,0
chr1	224302154	.	T	TGAG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=88.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,11:0,8:0,0,2,19
chr1	224318151	.	T	TTTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTG;STR;TLOD=67.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,5:0,0,12,4
chr1	224321984	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	224345012	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr1	224363682	.	TC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.256:20:4,2:11,3:5,10,2,3
chr1	224444628	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,20,0
chr1	224444737	.	C	CT	.	.	DP=118;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,5:0.063:88:32,1:48,4:31,52,2,3
chr1	224444901	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr1	224468986	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=94,200;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	224473917	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,88696970;MMQ=51,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	224473932	.	T	TGAGAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=218,192;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	224492381	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,9:0,0,19,6
chr1	224495852	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,26:0,14:0,0,22,18
chr1	224499387	.	GT	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=180,202;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:224499387_GT_TC:224499387:4,0,1,0
chr1	224499397	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=190,202;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:224499387_GT_TC:224499387:4,0,1,0
chr1	224499399	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=190,202;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:224499387_GT_TC:224499387:4,0,1,0
chr1	224505570	.	T	TAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=118.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,13:0,0,15,14
chr1	224505719	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	224514275	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	224517907	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=74.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,9:0,0,2,23
chr1	224544529	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr1	224586204	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=132.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,47:0.616:76:10,25:19,22:19,10,37,10
chr1	224926997	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=25,26;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.833:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr1	225140512	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.456:31:12,5:5,9:2,15,1,13
chr1	225142901	.	CAT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:0,5,0,6
chr1	225161877	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,25:0.483:52:10,10:16,14:4,23,4,21
chr1	225237850	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,4:0,12:0,0,17,0
chr1	225237950	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.463:50:15,8:11,15:18,9,12,11
chr1	225267317	.	G	GCCACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=235,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr1	225268343	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,6:0,15:0|1:225268343_A_G:225268343:0,0,14,8
chr1	225268346	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,8:0,15:0|1:225268343_A_G:225268343:0,0,15,8
chr1	225270455	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.647:26:4,8:4,8:1,8,1,16
chr1	225270466	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:2,6:5,8:0,7,0,14
chr1	225328430	.	T	TAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AG;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:6,0,5,1
chr1	225346975	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr1	225355570	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:7,3:4,1:11,0,4,0
chr1	225394645	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:5,7:6,5:9,2,9,4
chr1	225439988	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:5,3:14,1:13,7,4,0
chr1	225445589	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=213,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr1	225445652	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:2,6:10,3:7,5,8,1
chr1	225458432	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:7,0:6,4:9,4,1,3
chr1	225459871	.	A	AAAGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=779,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:225459871_A_AAAGCC:225459871:0,1,0,1
chr1	225459875	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=779,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:225459871_A_AAAGCC:225459871:0,1,0,1
chr1	225460626	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr1	225460916	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=229,159;MMQ=43,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0,3,0,1
chr1	225477869	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=182,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:0|1:225477869_A_G:225477869:0,2,0,3
chr1	225477871	.	A	ATACTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=224,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:225477869_A_G:225477869:0,4,0,1
chr1	225506262	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:11,3:7,6:14,4,9,0
chr1	225512402	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.479:27:7,4:7,9:7,7,10,3
chr1	225521282	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=69,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	225546172	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:7,1:1,9:5,3,8,3
chr1	225546419	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=158,125;MMQ=56,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:225546419_T_C:225546419:0,2,0,2
chr1	225546421	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=158,125;MMQ=56,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:225546419_T_C:225546419:0,2,0,2
chr1	225552624	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.355:20:5,2:8,4:1,12,0,7
chr1	225552650	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=199,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:4,2:2,5:0,6,0,8
chr1	225562385	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,12,15
chr1	225565217	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=153,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,1:5,2:0,14,0,3
chr1	225565233	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=158,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.163:16:7,2:4,0:0|1:225565233_G_T:225565233:0,14,0,2
chr1	225565235	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=158,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:10,1:3,0:0|1:225565233_G_T:225565233:0,14,0,2
chr1	225576058	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr1	225577648	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	225586274	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.347:32:15,4:5,6:19,2,7,4
chr1	225586737	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:0,1:2,0,3,0
chr1	225600351	.	T	TA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.275:19:7,1:6,2:1,13,1,4
chr1	225603103	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=69.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,9:0,12:0,0,0,23
chr1	225611845	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,5:0,13:0,0,0,18
chr1	225685621	.	TAAG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.827:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	225755185	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:225755185_C_T:225755185:0,0,0,1
chr1	225755187	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:225755185_C_T:225755185:0,0,0,1
chr1	225755194	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:225755185_C_T:225755185:0,0,0,1
chr1	225755198	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:225755185_C_T:225755185:0,0,0,1
chr1	225755204	.	CAACGA	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:225755185_C_T:225755185:0,0,0,1
chr1	225755213	.	GT	TA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:225755185_C_T:225755185:0,0,0,1
chr1	226016381	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,5:4,2:0|1:226016381_G_A:226016381:9,1,7,1
chr1	226016397	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=182,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:7,5:3,3:0|1:226016381_G_A:226016381:9,2,7,1
chr1	226026616	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,1:3,5:1,8,1,5
chr1	226043499	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=16,13;MFRL=168,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.308:16:3,1:2,0:11,0,5,0
chr1	226043502	.	CAT	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=173,184;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:9,0:5,1:0|1:226043502_CAT_C:226043502:14,0,2,0
chr1	226043505	.	C	CAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=173,184;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:5,0:2,0:0|1:226043502_CAT_C:226043502:14,0,2,0
chr1	226044489	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=54.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.953:17:0,8:0,9:0,0,10,7
chr1	226048744	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	226053626	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,1:10,1:8,6,0,2
chr1	226075410	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	226125543	.	G	GA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=183.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.983:53:0,29:0,23:0,0,7,46
chr1	226128563	.	CG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,0:6,2:12,7,2,0
chr1	226252232	.	C	T	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=316.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,97:0.990:97:0,39:0,55:0,0,4,93
chr1	226253316	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=116.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,31,6
chr1	226334578	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	226353521	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.480:40:13,6:6,12:16,5,14,5
chr1	226420722	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr1	226438449	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	226485327	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=221,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	226550924	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr1	226556094	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	226558065	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.509:8:1,0:1,0:4,0,4,0
chr1	226562112	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:1,9,0,3
chr1	226567172	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,3:8,3:14,1,6,0
chr1	226570840	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=159.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.980:49:0,23:0,23:0,0,18,31
chr1	226578099	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,16,5
chr1	226595433	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,256;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:226595433_G_C:226595433:0,0,1,0
chr1	226595437	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,10;MFRL=190,256;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:226595433_G_C:226595433:2,0,1,0
chr1	226595443	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,13;MFRL=185,256;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:226595433_G_C:226595433:3,0,1,0
chr1	226788224	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	226836276	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=214,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:11,0,2,0
chr1	227071364	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:7,5:6,13:13,0,18,0
chr1	227071377	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=105.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,17:0,0,29,2
chr1	227073410	.	G	T,C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32,33;MFRL=0,183,207;MMQ=60,60,60;MPOS=4,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.222,0.655:5:0,0,2:0,1,2:0,0,0,5
chr1	227073412	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=207,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	227078955	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,7:1,3:1,0,6,4
chr1	227081622	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=85.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,27,0
chr1	227081850	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.613:19:5,5:2,5:1,6,2,10
chr1	227165257	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.295:14:3,1:2,1:5,5,0,4
chr1	227170298	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr1	227170648	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,23:0.609:37:8,10:6,9:8,6,10,13
chr1	227170768	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.393:18:6,4:5,2:2,9,0,7
chr1	227171736	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.580:10:4,2:0,4:0|1:227171736_G_GT:227171736:4,0,5,1
chr1	227171738	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.577:10:4,2:0,4:0|1:227171736_G_GT:227171736:4,0,5,1
chr1	227171958	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr1	227172518	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:4,2,2,0
chr1	227172903	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	227172935	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=223,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,2:1,2:3,0,4,1
chr1	227174122	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=184,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,3:2,2:7,2,5,0
chr1	227174145	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=184,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,3:5,2:9,2,5,1
chr1	227181923	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=199,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,4:5,4:9,0,8,0
chr1	227182179	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,2:5,5:0,6,0,7
chr1	227192579	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,2:4,8:9,0,9,1
chr1	227198775	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:9,7:7,4:4,12,3,8
chr1	227210888	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr1	227218069	.	C	CAT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,11:0,0,22,0
chr1	227218085	.	CA	C,CAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,34,31;MFRL=152,159,180;MMQ=60,60,60;MPOS=14,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=12.58,4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,7,3:0.345,0.182:19:4,4,2:5,3,1:9,0,9,1
chr1	227221222	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr1	227222515	.	G	GACAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	227223367	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,5:5,4:0,10,0,9
chr1	227228037	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr1	227239739	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:4,4:6,7:0|1:227239739_T_A:227239739:0,10,0,11
chr1	227239746	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0|1:227239739_T_A:227239739:0,0,0,21
chr1	227247016	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,9:5,3:8,4,9,3
chr1	227259884	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:6,6:3,9:7,2,11,4
chr1	227288655	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,10:0,0,17,8
chr1	227299978	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,3:7,3:15,0,5,1
chr1	227300277	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr1	227327373	.	GAACATTAACATCAAGATCCAGTGAGGTGGGACCAGCCGTAACTCTTAAACAGCTCCGATCAGAAAGTACACTGAAGAAAAGAAAAAAAAATGTAGGTTCATACTGTGATAAAAAGCTTGAAGAAA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.144:30:9,1:7,4:11,13,3,3
chr1	227330759	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,4:3,4:1,6,2,6
chr1	227333141	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:10,4:7,2:16,1,6,0
chr1	227387361	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,4:7,5:3,8,2,7
chr1	227400792	.	A	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=178.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.985:60:0,23:0,36:0,0,50,10
chr1	227504613	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	227834233	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.427:17:4,4:6,3:7,3,7,0
chr1	227834400	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:2,4,1,6
chr1	227920061	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:6,8:7,7:11,2,10,6
chr1	227922640	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	227935355	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:7,2:2,8:9,0,10,0
chr1	227935762	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.361:22:5,4:9,2:5,9,1,7
chr1	228109180	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,1:4,1:5,6,2,0
chr1	228111808	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:228111808_C_CG:228111808:0,3,1,0
chr1	228111810	.	T	TACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,16;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:228111808_C_CG:228111808:0,3,1,0
chr1	228111814	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:228111808_C_CG:228111808:0,3,1,0
chr1	228112121	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.497:32:10,9:6,6:6,10,3,13
chr1	228285745	.	C	CA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=163,132;MMQ=60,28;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:17,0:15,3:6,30,0,3
chr1	228289854	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	228346558	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	228346574	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228346574_C_T:228346574:0,0,1,0
chr1	228346581	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228346574_C_T:228346574:0,0,1,0
chr1	228399482	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	228401071	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=19,19;MFRL=244,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.451:5:1,0:0,0:0|1:228401071_C_G:228401071:3,0,2,0
chr1	228401078	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=14,14;MFRL=226,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.517:4:0,0:0,0:0|1:228401071_C_G:228401071:2,0,2,0
chr1	228401081	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,2:0|1:228401081_A_C:228401081:0,0,4,0
chr1	228401086	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:228401081_A_C:228401081:0,0,3,0
chr1	228402121	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr1	228404340	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,1:10,1:3,11,0,2
chr1	228431930	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.443:23:5,6:7,4:13,0,10,0
chr1	228437603	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,4:8,8:12,3,11,1
chr1	228444318	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,4:6,3:11,4,7,0
chr1	228456147	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=193,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:6,1:9,7:14,1,8,0
chr1	228461408	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=45.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,5:0,9:0,0,14,0
chr1	228463433	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:7,2:2,2:7,3,4,0
chr1	228464842	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,2:3,0,3,1
chr1	228465370	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:10,3:6,6:15,1,9,0
chr1	228470995	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,3:2,0:0,4,0,3
chr1	228476060	.	C	CCA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=176,206;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,0:12,3:1,21,0,3
chr1	228497053	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=199,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,4:2,2:0,9,2,4
chr1	228506695	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,2:10,0:8,7,0,2
chr1	228520880	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:4,6:6,5:9,1,10,2
chr1	228522357	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=188,250;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:0,8,2,3
chr1	228523442	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.455:20:4,3:5,6:0|1:228523442_T_C:228523442:9,2,8,1
chr1	228523447	.	TG	CA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.434:21:5,2:4,5:0|1:228523442_T_C:228523442:10,2,8,1
chr1	228523618	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,4:1,3:0,4,1,6
chr1	228524005	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=142,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,0:9,3:7,17,0,3
chr1	228524919	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,1:5,1:5,1,1,1
chr1	228525627	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.620:9:1,2:2,1:2,1,5,1
chr1	228525898	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,4,0
chr1	228526486	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr1	228528412	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.493:26:7,4:6,7:10,3,9,4
chr1	228556788	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:6,5:5,3:9,3,6,2
chr1	228560139	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,5,8
chr1	228593779	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:228593779_A_C:228593779:0,0,1,0
chr1	228593784	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:228593779_A_C:228593779:0,0,1,0
chr1	228593788	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228593779_A_C:228593779:0,0,1,0
chr1	228613052	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr1	228645063	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=124.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,16:0,16:0,0,33,0
chr1	228646356	.	C	CGT	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=GT;STR;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,7:4,5:5,3,9,6
chr1	228646561	.	C	CTT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=14,26;MFRL=191,179;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,21;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.460:8:1,2:0,1:0,4,1,3
chr1	228647697	.	AT	A	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.218:39:16,4:10,4:9,22,1,7
chr1	228647775	.	CA	GC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=189,154;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.137:24:13,3:8,0:0|1:228647775_CA_GC:228647775:0,21,0,3
chr1	228647779	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=189,153;MMQ=60,35;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,1:7,0:0|1:228647775_CA_GC:228647775:0,21,0,2
chr1	229385407	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,6:7,4:4,6,6,4
chr1	229422193	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:11,10:8,10:15,4,15,6
chr1	229568231	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,5,2
chr1	229580596	.	AAAAAAACCC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,2:7,0:13,4,2,0
chr1	229606225	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	229623292	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,5:2,7:2,2,7,5
chr1	229623458	.	T	TGTGTATCTTGTTTGTTAGCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=269,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	229657220	.	GAA	G,GAAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34,35;MFRL=185,207,169;MMQ=60,60,60;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=A;STR;TLOD=5.22,5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.214,0.285:11:0,1,2:6,1,1:6,0,5,0
chr1	229662901	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29,35;MFRL=183,200,197;MMQ=60,60,60;MPOS=5,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,16;RU=A;STR;TLOD=4.03,7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,4:0.260,0.275:15:5,4,4:2,0,0:7,0,8,0
chr1	229663064	.	GAGGAA	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGGAA;STR;TLOD=166.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.978:38:0,24:0,14:0,0,4,34
chr1	229665945	.	CC	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,37;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:10,3,1,1
chr1	229667528	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:6,0:6,5:0|1:229667528_A_C:229667528:0,14,0,5
chr1	229667533	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:8,0:6,5:0|1:229667528_A_C:229667528:0,14,0,5
chr1	229746019	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=212,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,4:2,6:1,3,0,10
chr1	229781532	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:1,6:5,2:5,1,8,0
chr1	229781744	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,7:0,5:0,2,0,12
chr1	229783236	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:5,4:6,6:0|1:229783236_T_C:229783236:9,2,10,1
chr1	229783240	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,12:0.542:22:4,4:6,8:0|1:229783236_T_C:229783236:8,2,11,1
chr1	229795070	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:4,2:0,9,1,3
chr1	230415025	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,2:6,10:7,2,11,2
chr1	230415293	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	230497940	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,10,0
chr1	230498183	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=162,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:230498183_G_A:230498183:0,4,0,1
chr1	230498191	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=182,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:230498183_G_A:230498183:0,3,0,1
chr1	230503684	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,6:0,0,13,5
chr1	230778491	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.603:23:7,8:1,5:0,9,0,14
chr1	230795177	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,6:5,3:5,3,6,3
chr1	230798864	.	CT	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.119:53:31,2:10,3:36,11,3,3
chr1	230822607	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr1	230825942	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,2:5,1:0,7,0,3
chr1	230827340	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,0:12,2:1,17,0,2
chr1	230828987	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.538:28:7,10:4,4:10,3,10,5
chr1	230883466	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,4:0,0,7,11
chr1	230883484	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,2,14
chr1	230883499	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=64.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,2,16
chr1	230891248	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:1,2:4,1:0,5,1,3
chr1	230903234	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,2:0,10:0,0,13,1
chr1	230904911	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.598:23:3,7:6,6:6,3,6,8
chr1	230910477	.	CTTTCTTTCTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=217,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.340:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	230915827	.	CGTGTGT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=GT;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.778:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	230916501	.	T	TTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:230916501_T_TTC:230916501:0,0,0,1
chr1	230916502	.	A	AAACGTCAGAGTAGCCCCTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:230916501_T_TTC:230916501:0,0,0,1
chr1	230928351	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	230928512	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	231044702	.	TTTTTCCTGCTACTTC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:11,0:12,10,1,1
chr1	231047310	.	TAC	T	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=246.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,33:0,26:0,0,22,38
chr1	231047392	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,0,16
chr1	231057310	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=104.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,18:0,0,0,31
chr1	231060736	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	231064611	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=96,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.781:4:0,0:1,2:1,0,3,0
chr1	231067236	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,2,9
chr1	231067318	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	231069652	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	231081304	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr1	231094062	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,3:1,6:0,3,0,9
chr1	231298673	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	231377081	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,11:0,0,20,7
chr1	231386612	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	231401596	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,3,19
chr1	231408091	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,5,13
chr1	231409845	.	A	T,AACC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26,26;MFRL=153,122,114;MMQ=60,60,60;MPOS=-2,-2147483648;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:1,1,1:3,0,0:0,4,0,2
chr1	231480507	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,29:0.556:52:15,13:8,16:4,19,5,24
chr1	231486989	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:2,2,5,1
chr1	231487017	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=156,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:6,3:5,5:8,3,7,2
chr1	231502230	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=165,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,2:8,1:0,13,0,3
chr1	231502245	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,3:7,4:0,11,0,7
chr1	231509943	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=206,264;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr1	231557508	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=13,36;MFRL=220,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:1,0,0,1
chr1	231700227	.	TTGTG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TG;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,0:1,2:14,1,2,0
chr1	231936016	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.872:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr1	231953994	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:6,1,4,1
chr1	232002392	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr1	232172474	.	C	T	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,4:0.051:94:49,0:38,4:39,51,1,3
chr1	232535030	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	232561511	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:2,2:10,0:2,11,1,1
chr1	232568293	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	232581247	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,4:2,8:4,0,9,3
chr1	232601263	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=218,275;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	232607050	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=214,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,4:0,2:4,0,6,0
chr1	232607094	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.574:24:7,9:3,4:9,1,14,0
chr1	232629475	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:0,4,0,9
chr1	233113827	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr1	233120192	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:8,8:12,7:9,11,9,6
chr1	233135198	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=214,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:0,2:3,1:0,5,0,3
chr1	233152910	.	A	AAAAGCAAGATTTTGAGTCCTCACAGCTATTCT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.492:21:4,4:7,4:3,9,1,8
chr1	233225957	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.249:13:7,1:3,2:3,7,0,3
chr1	233295992	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:2,3:1,0:3,0,2,1
chr1	233337947	.	CT	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.077:62:21,1:30,3:26,32,1,3
chr1	233354017	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=178,201;MMQ=50,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:233354017_T_C:233354017:0,4,0,1
chr1	233354021	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=178,201;MMQ=50,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:233354017_T_C:233354017:0,4,0,1
chr1	233362930	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,2:4,0:7,0,2,0
chr1	233363211	.	T	TATCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=217,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0|1:233363211_T_TATCC:233363211:0,2,0,1
chr1	233363218	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=217,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:233363211_T_TATCC:233363211:0,2,0,1
chr1	233372789	.	TACACAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACACAA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	233397752	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr1	233397868	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:16,1:16,3:14,19,1,3
chr1	233398670	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:10,0,3,0
chr1	233398918	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:0|1:233398918_AG_A:233398918:0,3,0,4
chr1	233398927	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:0|1:233398918_AG_A:233398918:0,3,0,4
chr1	233398931	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:0|1:233398918_AG_A:233398918:0,3,0,4
chr1	233431241	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:2,12:2,4:0,4,0,16
chr1	233749855	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	233785703	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,16:0.323:50:17,7:17,8:16,18,10,6
chr1	233807374	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:233807374_A_C:233807374:0,1,0,1
chr1	233807377	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:233807374_A_C:233807374:0,1,0,1
chr1	234040742	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr1	234367549	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=169,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.278:19:7,2:7,3:1,13,0,5
chr1	234444761	.	TAA	T,TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28,26;MFRL=142,166,176;MMQ=60,60,60;MPOS=22,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.31,7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,5:0.215,0.468:11:0,1,1:4,1,4:4,0,7,0
chr1	234454405	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	234458668	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:7,0,7,0
chr1	234519452	.	C	CT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=44.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.568:37:8,11:8,7:13,3,15,6
chr1	234527575	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:5,2:9,5:1,14,0,7
chr1	234528373	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	234541622	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.491:22:4,4:7,5:10,1,7,4
chr1	234546319	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=170,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:13,0:16,2:1,28,0,2
chr1	234561590	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,4:3,6:0,4,1,9
chr1	234566121	.	T	TCACTGTGAAGGCATGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=203,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.478:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	234582457	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr1	234584231	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=111,151;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:2,6:5,3:4,4,6,3
chr1	234594947	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:1,0,3,1
chr1	234596202	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=241,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:0,2,0,8
chr1	234599523	.	TA	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.086:50:25,3:17,1:37,9,4,0
chr1	234744413	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr1	234744980	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=237,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:1,3:4,1:5,0,5,0
chr1	234745009	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=228,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:3,4:3,4:7,0,8,0
chr1	235285740	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.431:49:12,14:16,7:3,25,1,20
chr1	235295377	.	GTGTCAC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:235295377_GTGTCAC_G:235295377:0,1,0,1
chr1	235295389	.	CA	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=181,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0|1:235295377_GTGTCAC_G:235295377:0,1,0,1
chr1	235301496	.	CA	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.267:35:12,3:11,5:10,15,2,8
chr1	235357303	.	A	ATG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:1,4:3,0,8,0
chr1	235357314	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,6:1,5:3,0,11,0
chr1	235357393	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:15,0:14,2:0|1:235357393_G_C:235357393:25,6,0,2
chr1	235357399	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:17,0:16,2:0|1:235357393_G_C:235357393:27,7,0,2
chr1	235357543	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,5:4,6:1,11,0,11
chr1	235383351	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=208,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr1	235394541	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.557:19:4,7:4,4:1,7,0,11
chr1	235505313	.	A	AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.474:28:5,6:10,7:13,2,10,3
chr1	235506853	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=139,178;MMQ=60,54;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:6,7:6,8:9,3,11,5
chr1	235506865	.	C	CA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.574:28:5,7:6,8:9,3,8,8
chr1	235507466	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.361:6:0,1:3,0:2,2,1,1
chr1	235582718	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	235594182	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,4:7,8:0,11,0,12
chr1	235598973	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	235600022	.	T	TTCCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:235600022_T_TTCCCC:235600022:0,1,0,1
chr1	235600023	.	A	ACTTACTCCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:235600022_T_TTCCCC:235600022:0,1,0,1
chr1	235600025	.	A	ATAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:235600022_T_TTCCCC:235600022:0,1,0,1
chr1	235619047	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,224;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,0:9,3:1,14,0,3
chr1	235628908	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,40:0.547:73:14,21:18,19:27,6,32,8
chr1	235647631	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:8,4:5,8:10,3,12,0
chr1	235715523	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,0,4
chr1	235715556	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:2,6,0,2
chr1	235747005	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,6:2,0:3,0,5,1
chr1	235747154	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,3:2,6,2,6
chr1	235826382	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=129,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:1,3:1,6:0,3,0,9
chr1	235827443	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	235860340	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=100.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,15:0,19:0,0,32,2
chr1	235872665	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	235878750	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:235878750_C_T:235878750:0,3,0,1
chr1	235878758	.	T	TCTCTTCCTCCTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:235878750_C_T:235878750:0,3,0,1
chr1	235887276	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	235896726	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr1	235918688	.	CAAAAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AAAAG;STR;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.786:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	235922228	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr1	235940450	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=141.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,19:0,24:0,0,21,22
chr1	235945480	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	235971719	.	A	ACCCCCCCCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=25,14;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,25;RU=C;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.321:33:10,1:4,2:8,14,11,0
chr1	235971725	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:11,1:6,1:11,16,5,0
chr1	236193145	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr1	236201609	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,6:1,2:0,3,0,8
chr1	236205121	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	236208688	.	AT	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	236209024	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,1:0,10:0,0,2,10
chr1	236209081	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	236388460	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,3:11,0:2,18,1,2
chr1	236393637	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:0|1:236393637_C_T:236393637:0,9,1,9
chr1	236393654	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0|1:236393637_C_T:236393637:0,0,0,13
chr1	236399516	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,2:7,0:8,2,2,0
chr1	236433135	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,16,3
chr1	236572475	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=153.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,19:0,23:0,0,41,1
chr1	236590629	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr1	236590659	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,16,0
chr1	236590816	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=97.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,2,25
chr1	236700982	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr1	236702117	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=221,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:0,5:2,2:3,0,7,0
chr1	236702153	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:1,3:7,6:7,1,7,2
chr1	236702447	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.533:28:3,9:6,5:0|1:236702447_T_G:236702447:1,12,2,13
chr1	236702450	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.533:28:5,10:7,5:0|1:236702447_T_G:236702447:1,12,2,13
chr1	236702475	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=177,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,5:5,6:0,11,0,11
chr1	236703832	.	CG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=127,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.515:14:4,2:3,5:5,2,7,0
chr1	236704888	.	A	AACAGGT	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,14:0.454:31:5,2:11,9:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:15,2,14,0
chr1	236704891	.	TAAA	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=51.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,16:0.429:37:3,5:12,10:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:17,4,16,0
chr1	236704897	.	ATT	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=59.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,19:0.471:40:7,6:12,11:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:17,4,19,0
chr1	236706352	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.531:19:3,6:5,4:3,6,1,9
chr1	236706371	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:2,4:5,1:1,6,1,4
chr1	236706425	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=136,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr1	236706780	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr1	236707007	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:1,1:7,3:1,7,1,3
chr1	236707036	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:236707036_A_T:236707036:1,5,0,2
chr1	236707045	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=201,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:5,1:0|1:236707036_A_T:236707036:1,6,0,2
chr1	236708022	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=195,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:2,3:1,2:3,0,4,1
chr1	236708224	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.498:48:15,12:8,9:11,13,9,15
chr1	236708316	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=131,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:0,6,0,8
chr1	236711254	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=173,367;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:8,0:21,2:28,1,2,0
chr1	236711297	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,25:0.450:56:12,15:18,10:23,8,23,2
chr1	236711323	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,35:0.494:71:16,20:18,13:20,16,22,13
chr1	236714335	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr1	236717104	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:0,4,0,6
chr1	236718524	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=157,835;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	236718561	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,3:1,2:5,1,5,0
chr1	236718620	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:4,6:4,9:6,2,12,3
chr1	236719259	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,4:4,6:2,5,0,10
chr1	236722489	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=194,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:1,5,0,4
chr1	236723177	.	GC	AA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:6,6:9,4:0,15,0,10
chr1	236724605	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.365:47:14,9:15,7:7,23,4,13
chr1	236732198	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:0|1:236732198_C_A:236732198:2,0,2,0
chr1	236732199	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=178,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:0|1:236732198_C_A:236732198:2,0,2,0
chr1	236735939	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=176,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,2:5,4:6,1,2,4
chr1	236740039	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,2:2,5:4,1,5,2
chr1	236744712	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=219,131;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:0,0:0,4,2,2
chr1	236746275	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,4:5,1:8,1,4,1
chr1	236748570	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr1	236749022	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:5,0,3,1
chr1	236749026	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,1:5,3:6,0,4,0
chr1	236749451	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=155,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:4,7:8,6:13,1,13,0
chr1	236749817	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:5,1:3,4:0,9,0,6
chr1	236755427	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,7:3,4:1,4,3,8
chr1	236755814	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,19:0.488:39:6,8:11,11:0|1:236755814_G_A:236755814:14,6,15,4
chr1	236755837	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,23:0.511:45:9,9:13,12:0|1:236755814_G_A:236755814:14,8,14,9
chr1	236755937	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,5:7,2:0,12,2,5
chr1	236757229	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=213,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	236757507	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=149,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr1	236759060	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=202,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,6:6,4:4,5,5,5
chr1	236767176	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=205,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:5,2:0,2:5,0,4,0
chr1	236767178	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=207,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:6,1:0,2:6,0,3,0
chr1	236882110	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	236883564	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	236894647	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,5:6,4:2,9,0,9
chr1	236899042	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.701:28:3,9:5,11:1,7,2,18
chr1	236900597	.	G	GTATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	236900598	.	CAT	C,TAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,19,28;MFRL=0,141,203;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.19,6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.394,0.431:3:0,0,2:0,0,0:0,0,0,3
chr1	236902532	.	AT	A,ATT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,30,32;MFRL=186,189,61;MMQ=60,60,60;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.72,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,2:0.313,0.228:10:3,1,1:2,2,1:5,0,4,1
chr1	236902560	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.936:14:0,2:0,8:0,0,9,5
chr1	236902594	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,3:7,6:4,6,6,3
chr1	236902865	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:3,3:2,5:1,4,2,6
chr1	236910986	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:15,1:15,3:26,6,3,1
chr1	236924506	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,9:0,6:0,1,1,14
chr1	236972186	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	237016016	.	T	TGGTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=175,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:237016016_T_TGGTC:237016016:0,2,0,1
chr1	237016018	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=175,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:237016016_T_TGGTC:237016016:0,2,0,1
chr1	237024397	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=170,302;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	237038008	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:1,1:3,0,4,0
chr1	237038161	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,4,17
chr1	237205761	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=209,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	237540615	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,2:2,2:7,2,3,1
chr1	237586384	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,27:0.519:52:16,10:9,17:22,3,20,7
chr1	237620049	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=108,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:1,4:4,2:2,3,3,3
chr1	237670140	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:5,4:2,10:1,6,1,13
chr1	237675163	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,180;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:1,3,0,6
chr1	237711644	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	237729774	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	237730124	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,1,16
chr1	237730169	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	237732395	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,11:4,1:7,1,11,1
chr1	237753074	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.598:23:5,5:4,9:9,0,14,0
chr1	237753364	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=27,36;MFRL=182,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:0,4,0,5
chr1	237753390	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=224,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	237753394	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,25;MFRL=201,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:237753394_C_A:237753394:0,2,0,1
chr1	237753398	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=201,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:237753394_C_A:237753394:0,2,0,1
chr1	237753399	.	T	TGGATG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=189,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:237753394_C_A:237753394:0,1,0,1
chr1	237753402	.	A	ATTTTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=189,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:237753394_C_A:237753394:0,1,0,1
chr1	237754328	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=143,290;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:237754328_G_A:237754328:0,1,0,1
chr1	237754340	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237754328_G_A:237754328:0,0,0,1
chr1	237755188	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr1	237755203	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr1	237757027	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=191,358;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	237765470	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,8:5,5:0,9,2,11
chr1	237788862	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	237802558	.	A	AATCAGGAAAATATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:237802558_A_AATCAGGAAAATATC:237802558:0,3,0,1
chr1	237802559	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1|0:237802558_A_AATCAGGAAAATATC:237802558:0,1,0,3
chr1	237813126	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:3,2:3,0,6,0
chr1	237814898	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=215,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr1	237817514	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=218,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr1	237823256	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,8:6,3:5,6,10,1
chr1	237824332	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr1	237831103	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=109.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,15:0,0,30,1
chr1	237862164	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr1	237862436	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	237863439	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,14,0
chr1	237863790	.	G	GT	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=135,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.225:23:6,1:8,1:0|1:237863790_G_GT:237863790:7,11,0,5
chr1	237863813	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=159,229;MMQ=60,36;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,2:0.099:28:15,0:10,2:1|0:237863790_G_GT:237863790:5,21,0,2
chr1	237863818	.	G	GCATATATAAATTAAAACATTATTGCTTTC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=172,229;MMQ=60,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,2:0.115:24:12,0:10,2:1|0:237863790_G_GT:237863790:1,21,0,2
chr1	237865203	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,20,1
chr1	237872714	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.747:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr1	237890437	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,14:0,0,13,16
chr1	237893674	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,3:0,5:0,0,1,10
chr1	237923053	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chr1	237946964	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:13,2:15,7:17,11,6,3
chr1	237951451	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,20:0.438:46:8,10:18,10:7,19,3,17
chr1	237955682	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:237955682_C_T:237955682:0,0,0,1
chr1	237955687	.	G	GTATATATTAGATTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:237955682_C_T:237955682:0,0,0,1
chr1	238045995	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,0:1,3:5,0,3,0
chr1	238053524	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=222,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	238053970	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,1:8,1:4,20,0,2
chr1	240071567	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:6,2:19,0:15,10,2,0
chr1	240072721	.	G	A,GAA,GAAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,26,16,16;MFRL=0,162,174,166;MMQ=60,60,60,60;MPOS=8,22,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.30,4.54,11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,9,3,11:0.308,0.155,0.503:23:0,6,0,3:0,1,0,2:0,0,5,18
chr1	240073619	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=225,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.479:8:2,1:2,3:2,2,1,3
chr1	240073642	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=211,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.425:8:1,2:3,1:4,1,1,2
chr1	240073884	.	G	GA,GAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=151,138,151;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=35.66,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,19,3:0.507,0.100:37:7,11,1:8,8,2:15,0,17,5
chr1	240074554	.	G	GA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.144:32:10,1:9,3:10,18,2,2
chr1	240074847	.	TA	T,TAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,29,28;MFRL=180,175,164;MMQ=60,60,60;MPOS=25,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=9.58,25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,6,13:0.209,0.440:29:4,5,4:5,1,6:1,9,6,13
chr1	240075424	.	ATC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:8,1:4,2:4,9,2,1
chr1	240255203	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	240255568	.	GGGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,439;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	240351628	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr1	240408789	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=136,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:2,2:6,5:7,2,5,2
chr1	240601269	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	240939391	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,28;MFRL=201,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.763:5:0,2:0,2:1,0,4,0
chr1	240964079	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:8,0:1,3:0|1:240964079_C_T:240964079:2,9,0,3
chr1	240964088	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:8,0:1,3:0|1:240964079_C_T:240964079:0,9,0,3
chr1	240975213	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,3:5,4:6,3,6,1
chr1	240975435	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	240976878	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,5,0
chr1	240977964	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=37,28;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr1	240979803	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	241146322	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr1	241519098	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr1	241667244	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	241731956	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.552:25:8,6:3,7:2,9,5,9
chr1	241767863	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=119,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:10,5:2,0:4,8,2,3
chr1	241767930	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	241797473	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:18,2:19,1:14,23,1,2
chr1	241823930	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.503:34:11,3:5,14:6,11,6,11
chr1	241838057	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.384:24:9,7:6,2:0|1:241838057_C_T:241838057:5,10,3,6
chr1	241838065	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=128,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.364:20:5,5:5,1:0|1:241838057_C_T:241838057:4,9,1,6
chr1	241838126	.	CCCCT	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=204,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCCT;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0,10,0,2
chr1	241847018	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.484:37:11,6:8,11:1,18,2,16
chr1	241913062	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=150,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.895:16:0,3:1,12:0,1,1,14
chr1	241929734	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:241929734_TG_CA:241929734:0,3,0,1
chr1	241929739	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:241929734_TG_CA:241929734:0,3,0,1
chr1	241933876	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=98.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,13:0,14:0,0,17,10
chr1	241946766	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.748:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	241953994	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:0|1:241953994_C_T:241953994:2,4,1,1
chr1	241954017	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=164,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:241953994_C_T:241953994:0,2,0,1
chr1	241954027	.	ATGGC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=164,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:241953994_C_T:241953994:0,2,0,1
chr1	241964559	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr1	242016590	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	242016606	.	TC	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr1	242035444	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,25:0.510:49:13,10:11,14:14,10,14,11
chr1	242048514	.	G	GTAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TAAA;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.826:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	242162034	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.404:15:4,0:4,0:0|1:242162034_A_C:242162034:0,9,6,0
chr1	242162039	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.404:15:4,0:5,1:0|1:242162034_A_C:242162034:0,9,6,0
chr1	242162045	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.360:17:4,1:5,1:0|1:242162034_A_C:242162034:1,10,6,0
chr1	242162047	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.306:17:5,1:6,1:0|1:242162034_A_C:242162034:1,11,5,0
chr1	242264102	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=145,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.798:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr1	242428834	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,176;MMQ=59,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,1:2,4:0,2,0,5
chr1	242511556	.	AACAAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAAAG;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	243327520	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.458:18:2,3:6,5:10,0,8,0
chr1	243328887	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=178,209;MMQ=27,39;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:6,1:12,3:11,7,4,0
chr1	243332884	.	AAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=216,204;MMQ=30,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.619:11:3,1:1,6:3,1,7,0
chr1	243335940	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=201,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.584:14:3,3:2,5:6,0,8,0
chr1	243362331	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	243419429	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:10,9:6,7:12,5,14,2
chr1	243433648	.	GCT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:243433648_GCT_G:243433648:0,3,0,1
chr1	243433653	.	T	TCCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:243433648_GCT_G:243433648:0,3,0,1
chr1	243433658	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:243433648_GCT_G:243433648:0,3,0,1
chr1	243480230	.	C	CT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.143:25:10,1:11,2:4,18,0,3
chr1	243507680	.	C	CA	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=83.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,30:0.516:58:14,15:14,15:6,22,3,27
chr1	243507706	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.462:37:13,8:7,9:0,20,0,17
chr1	243777066	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=97.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,38:0.540:70:11,11:21,26:0|1:243777066_G_A:243777066:1,31,0,38
chr1	243777081	.	TG	T	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=164,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.045:64:22,1:39,1:0|1:243777066_G_A:243777066:1,61,0,2
chr1	243777084	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:22,1:38,1:0|1:243777066_G_A:243777066:1,60,0,2
chr1	244218691	.	AAT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=202,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,2:11,0:8,13,3,0
chr1	244219026	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.145:22:11,0:4,3:11,8,0,3
chr1	244219033	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.223:20:4,3:10,0:9,7,2,2
chr1	244219893	.	CTCTT	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:8,8:4,6:4,9,6,8
chr1	244219961	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=203,200;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:244219961_C_CT:244219961:0,4,0,1
chr1	244219964	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=197,200;MMQ=60,48;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:4,0:0,1:0|1:244219961_C_CT:244219961:0,5,0,1
chr1	244528127	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:0,7,0,5
chr1	244574520	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,0:3,3:4,0,2,1
chr1	244595962	.	CTT	C,CTTTTT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=13,16,30;MFRL=172,173,155;MMQ=40,40,40;MPOS=18,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,19,24;RU=T;STR;TLOD=3.61,13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,6:0.185,0.507:11:0,0,5:1,0,0:0,3,0,8
chr1	244595997	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=175,168;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.188:20:7,1:4,2:0,17,0,3
chr1	244601152	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	244624635	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=226,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr1	244624887	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr1	244715966	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.462:30:9,4:7,8:6,10,10,4
chr1	244723920	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr1	244735556	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=129.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,23:0,12:0,0,34,2
chr1	244747150	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:4,0:3,5:4,4,4,1
chr1	244747293	.	CG	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,2:6,1:2,7,0,3
chr1	244756818	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:16,1:21,2:23,17,2,1
chr1	244803205	.	CTT	C,CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29,32;MFRL=0,46277322,153;MMQ=60,60,60;MPOS=10,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.54,6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.379,0.513:5:0,1,1:0,1,2:0,0,5,0
chr1	245005424	.	AT	A,ATT	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=28,27,28;MFRL=165,155,181;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=T;STR;TLOD=3.75,8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:81,4,7:0.050,0.083:92:44,1,3:36,2,4:37,44,6,5
chr1	245009819	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=183,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.210:16:4,1:8,1:12,1,1,2
chr1	245021291	.	TA	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.140:47:18,4:22,2:28,13,6,0
chr1	245133539	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,13:0,0,0,20
chr1	245133549	.	GGC	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=194,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GC;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,3:6,2:0,9,0,5
chr1	245133623	.	T	TCCTCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=222,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCTCC;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	245180639	.	AT	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,8:0.154:55:25,1:18,7:17,30,1,7
chr1	245222634	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	245222839	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,0,11
chr1	245318688	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=233,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:6,2,3,1
chr1	245703990	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:7,5:1,3:7,1,7,1
chr1	245704130	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.467:41:11,9:9,10:13,9,12,7
chr1	245847755	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:245847755_T_TG:245847755:0,0,0,1
chr1	245847759	.	A	AGGTTGAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:245847755_T_TG:245847755:0,1,0,1
chr1	246022071	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=229,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	246027024	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.586:17:2,5:2,5:0|1:246027024_A_G:246027024:7,0,10,0
chr1	246027029	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:3,5:3,6:0|1:246027024_A_G:246027024:6,0,9,2
chr1	246027034	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=67.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.950:17:0,8:0,8:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,15,2
chr1	246490438	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0|1:246490438_T_C:246490438:0,0,15,0
chr1	246490442	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0|1:246490438_T_C:246490438:0,0,15,0
chr1	246490452	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=201,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,4:2,5:0|1:246490438_T_C:246490438:5,0,9,0
chr1	246498866	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr1	246670333	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr1	246704563	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=231,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr1	246707816	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:8,4:6,9:11,3,7,6
chr1	246711816	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=85,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.561:16:4,2:2,7:3,4,5,4
chr1	246714587	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.321:23:4,2:10,5:5,11,1,6
chr1	246714631	.	TG	AA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=186,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:0|1:246714631_TG_AA:246714631:2,10,0,3
chr1	246714636	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:6,1:4,2:0|1:246714631_TG_AA:246714631:2,8,0,3
chr1	246720581	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=189,211;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,2:15,0:21,0,2,0
chr1	246727558	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	246907356	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=118,210;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,3:13,0:19,2,3,0
chr1	246939746	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:4,3:2,2:5,1,5,1
chr1	246940790	.	TAAAGA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,3:0,2:0,4,0,5
chr1	246943547	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:7,5:3,7:7,3,11,2
chr1	247004210	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,121;MMQ=52,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.063:61:29,2:27,1:34,24,2,1
chr1	247006160	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	247007013	.	TAAATA	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATA;STR;TLOD=99.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.614:42:6,11:10,15:16,0,26,0
chr1	247007042	.	TAA	T,TA	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=26,25,25;MFRL=184,149,147;MMQ=60,60,60;MPOS=12,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=3.08,116.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,6,50:0.074,0.846:60:1,2,23:3,4,27:4,0,54,2
chr1	247013276	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=143,178;MMQ=56,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:17,0:16,2:12,22,0,2
chr1	247025531	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=213,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,2:4,5:0,8,0,7
chr1	247031194	.	CC	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	247031201	.	C	T,A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,29,22;MFRL=200,170,158;MMQ=60,60,60;MPOS=7,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,1:1,0,0:0,1,0,2
chr1	247031205	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:247031205_A_T:247031205:0,2,0,1
chr1	247031206	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:247031205_A_T:247031205:0,2,0,1
chr1	247054344	.	T	C	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=162.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,55:0.505:109:24,24:29,31:23,31,23,32
chr1	247109014	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.629:36:8,5:5,16:11,2,19,4
chr1	247109168	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:5,10:4,7:0,9,0,17
chr1	247150740	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=97,155;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,3:4,8:1,6,4,8
chr1	247151557	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=214,137;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,3:2,0:0,7,1,2
chr1	247151563	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=177,214;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:1,7,0,2
chr1	247163187	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,15,0
chr1	247171060	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:4,0,1,0
chr1	247171089	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	247201491	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:10,7,1,1
chr1	247202032	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,3:6,1:6,0,4,0
chr1	247202653	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=168,90;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:247202653_A_G:247202653:8,1,1,1
chr1	247202655	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=166,90;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:3,0:0|1:247202653_A_G:247202653:8,2,1,1
chr1	247202659	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=165,90;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,2:4,0:0|1:247202653_A_G:247202653:10,2,1,1
chr1	247241795	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:3,4:6,1:7,2,6,0
chr1	247264178	.	CG	TT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.121:24:10,1:12,1:8,14,1,1
chr1	247319774	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr1	247319830	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,8:7,4:13,0,12,0
chr1	247323195	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=88,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.674:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr1	247486421	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,7:3,5:8,0,9,3
chr1	247586487	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=72,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,2:0,3:2,1,4,1
chr1	247597365	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	247597629	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:7,8:9,4:3,13,2,10
chr1	247597656	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=191,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,2:4,4:0,6,0,7
chr1	247615340	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	247615358	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	247694885	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=163,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:0|1:247694885_C_A:247694885:11,7,2,0
chr1	247694891	.	TCTAA	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=169,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:0|1:247694885_C_A:247694885:12,6,2,0
chr1	247694897	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=171,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:247694885_C_A:247694885:11,6,2,0
chr1	247726822	.	CTTTT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=T;STR;TLOD=41.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:7,4:5,6:12,2,8,3
chr1	247729206	.	CT	C,CTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,32,16;MFRL=122,116,120;MMQ=60,60,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=5.90,10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,5,9:0.183,0.338:28:5,1,1:3,2,1:8,6,5,9
chr1	247737407	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,17941392;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,1:6,1:7,4,2,0
chr1	247752019	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,11:0,22:0,0,8,25
chr1	247835319	.	A	AACAAATGGCCACATAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,816;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	247835352	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	247902942	.	G	GTCTGTACGTAGCACTCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	247921717	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,8,16
chr1	247978087	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,14,2
chr1	247978541	.	AAGG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,9,6
chr1	248004775	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,10:0,0,14,9
chr1	248005213	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	248058797	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	248058845	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	248058879	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr1	248059856	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	248084303	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,257909;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:23,0:27,4:51,0,4,0
chr1	248084464	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,3:0,13:0,0,5,13
chr1	248084963	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=213,160;MMQ=25,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:3,1:0,0:0|1:248084963_CCT_C:248084963:0,3,0,1
chr1	248084966	.	ATGGT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=213,160;MMQ=25,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:248084963_CCT_C:248084963:0,3,0,1
chr1	248084973	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=215,160;MMQ=25,24;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:248084963_CCT_C:248084963:0,2,0,1
chr1	248085341	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	248098072	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	248112745	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,33;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr1	248112762	.	TG	CA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,6:0,5:0|1:248112762_TG_CA:248112762:0,0,11,3
chr1	248112771	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0|1:248112762_TG_CA:248112762:0,0,13,5
chr1	248112809	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,18:0,17:0,0,21,14
chr1	248185951	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,164;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.333:37:13,5:12,7:10,15,2,10
chr1	248224618	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,207;MMQ=49,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:18,2:22,3:33,9,3,2
chr1	248224633	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=146,202;MMQ=54,27;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:17,2:19,1:27,11,2,1
chr1	248343945	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,5:0,17:0,0,10,12
chr1	248343990	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,168;MMQ=40,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:0,1:1,14:0,1,11,6
chr1	248402217	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:9,3:8,2:14,4,5,0
chr1	248436316	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,189030;MMQ=55,44;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,5:0.091:64:33,5:25,0:36,23,5,0
chr1	248436805	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,29;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=188.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,52:0.982:52:0,34:0,18:0|1:248436805_T_G:248436805:0,0,20,32
chr1	248436809	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=179,176;MMQ=25,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,22:0.383:58:22,14:10,8:0|1:248436805_T_G:248436805:18,18,6,16
chr1	248436811	.	G	C	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=179,176;MMQ=25,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,22:0.383:58:22,14:11,8:0|1:248436805_T_G:248436805:18,18,6,16
chr1	248437140	.	A	AGTCTCCAGAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=166,150;MMQ=40,34;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:6,1:7,1:2,11,0,2
chr1	248458717	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr1	248458932	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=165,160;MMQ=52,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,3:5,4:0,9,1,6
chr1	248458974	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr1	248486895	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,16,1
chr1	248486913	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,12,4
chr1	248512064	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,9,7
chr1	248512094	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,7,11
chr1	248513023	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr1	248513088	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	248525638	.	CA	C	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=74,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=250.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,64:0.972:65:1,32:0,31:0,1,38,26
chr1	248569282	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	248570440	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,8:0,0,3,16
chr1	248617056	.	GTGATCAGGAAGGGCTAGCAGGGACTCCCACAGCATCAGAGTGGTGACTGTGATCGGGAAGGATTAGCGGGGACTCCCAGAGCATCAGGGGTGGTGAC	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,139;MMQ=57,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.086:38:6,2:6,2:9,24,4,1
chr1	248636641	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	248636947	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,213;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:18,0:11,2:16,14,2,0
chr1	248738133	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=166,134;MMQ=38,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:12,1:10,3:0,22,0,4
chr1	248757125	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=184,265;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:248757125_T_TAA:248757125:0,4,0,1
chr1	248757128	.	T	TTAAAGTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=184,265;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:248757125_T_TAA:248757125:0,4,0,1
chr1	248757129	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=37,28;MFRL=184,265;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:248757125_T_TAA:248757125:0,4,0,1
chr1	248789454	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,4:0,14:0,0,14,4
chr1	248801944	.	TCAGCACG	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=126.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,15:0,14:0,0,9,20
chr1	248813135	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,168;MMQ=27,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:0,8:1,2:1,0,11,0
chr1	248814052	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,141;MMQ=40,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:1,4:1,8:2,0,11,1
chr1	249110906	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:1,4:3,0,2,4
chr1	249214132	.	G	GAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=234,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	45895	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45895_A_G:45895:0,0,0,1
chr2	45904	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:45895_A_G:45895:0,0,0,1
chr2	224970	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=135.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,26:0,17:0,0,13,31
chr2	234130	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr2	234197	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:10,9,2,0
chr2	242732	.	T	TAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAC;STR;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	243567	.	T	TA,TAA	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=28,30,25;MFRL=161,146,139;MMQ=60,60,60;MPOS=17,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=92.41,6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,38,6:0.772,0.124:49:4,15,1:1,17,3:0,5,12,32
chr2	262553	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=126.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,17:0,18:0,0,32,3
chr2	264895	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=126.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,17:0,18:0,0,34,1
chr2	271842	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=187,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.439:12:3,0:2,1:5,2,5,0
chr2	271998	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=220,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,6:1,2:1,2,8,5
chr2	272051	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.562:39:8,13:8,7:10,7,17,5
chr2	272312	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,1:6,1:2,8,0,2
chr2	276908	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,6:0,16:0,0,21,1
chr2	276942	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=118.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,21:0,0,28,9
chr2	283231	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,1,15
chr2	669631	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,166;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.068:41:15,1:21,1:12,27,1,1
chr2	677213	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,8,0
chr2	905423	.	A	AGGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=142,109;MMQ=40,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	906044	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,0,11
chr2	1079143	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.753:9:1,4:0,3:2,0,6,1
chr2	1093965	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=111.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,21:0,0,15,22
chr2	1133188	.	G	GCACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=CA;STR;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.854:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	1241592	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	1437410	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=64.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0,0,2,17
chr2	1442551	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr2	1442569	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=183,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:4,0,1,0
chr2	1457364	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr2	1459806	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,13:0,0,18,2
chr2	1481231	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	1488427	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:17,2:11,1:10,19,1,2
chr2	1520844	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,26;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:1520844_G_T:1520844:0,1,0,1
chr2	1520847	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1520844_G_T:1520844:0,1,0,1
chr2	1544669	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:12,2:0|1:1544669_A_T:1544669:5,14,0,2
chr2	1544673	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:0|1:1544669_A_T:1544669:5,14,0,2
chr2	1639139	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,2:4,0:8,1,2,0
chr2	1642537	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:0,2:4,1:0|1:1642537_T_C:1642537:4,0,5,0
chr2	1642539	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:0,3:4,1:0|1:1642537_T_C:1642537:4,0,5,0
chr2	1642544	.	CC	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:0,4:4,1:0|1:1642537_T_C:1642537:4,0,5,0
chr2	1648570	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.490:49:14,12:11,12:2,23,1,23
chr2	1683923	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=212,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.478:8:3,1:1,1:3,1,2,2
chr2	1687481	.	CCGGTTGTT	C	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:28,1:21,1:0|1:1687481_CCGGTTGTT_C:1687481:20,36,0,2
chr2	1687490	.	ATGCAAAAAT	A	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.054:54:26,1:21,1:0|1:1687481_CCGGTTGTT_C:1687481:16,36,0,2
chr2	1687501	.	TGTTGAAA	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:22,1:18,1:0|1:1687481_CCGGTTGTT_C:1687481:9,32,0,2
chr2	1844692	.	T	TCTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=193,197;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:1844692_T_TCTC:1844692:0,3,0,1
chr2	1844694	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=193,197;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1844692_T_TCTC:1844692:0,3,0,1
chr2	1844710	.	CTGT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=246,193;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	1890401	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:2,16,0,2
chr2	1915986	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=117,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	3196413	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:3196413_A_C:3196413:0,4,0,1
chr2	3196420	.	C	CTGTAATCCCAGCACTTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:3196413_A_C:3196413:0,4,0,1
chr2	3212247	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	3217908	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,14,11
chr2	3278163	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,31:0.432:72:21,17:20,14:16,25,16,15
chr2	3356953	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,14:0,0,20,9
chr2	3358458	.	ATTATGAAGTTAGAT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=118.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.969:27:0,14:0,13:0,0,2,25
chr2	3460870	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,4:0,3:4,0,4,3
chr2	3469278	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr2	3470186	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.474:36:6,10:12,7:5,14,3,14
chr2	3470254	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:2,2:5,5:0,8,0,7
chr2	3481637	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:2,8:3,9:0,5,0,17
chr2	3481659	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=175,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.739:17:2,8:2,5:0,4,0,13
chr2	3482796	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=204,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr2	3482912	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:4,3:9,0,3,0
chr2	3502909	.	A	ACTT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,11:0.443:25:8,7:6,4:0|1:3502909_A_ACTT:3502909:0,14,0,11
chr2	3502910	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,11:0.443:25:8,7:5,4:0|1:3502909_A_ACTT:3502909:0,14,0,11
chr2	3504290	.	GTGTACCTGCCGCCGCA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	3504444	.	C	CATTTTTTTTAATTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3504444_C_CATTTTTTTTAATTG:3504444:0,0,0,1
chr2	3504446	.	C	CCTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3504444_C_CATTTTTTTTAATTG:3504444:0,0,0,1
chr2	3504450	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=154,256;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0|1:3504444_C_CATTTTTTTTAATTG:3504444:1,0,0,1
chr2	3518619	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=158,61;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,0:3,2:7,2,0,2
chr2	3518643	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:1,2,1,4
chr2	3523324	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	3597951	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:9,3:11,0:17,4,2,1
chr2	3599700	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:5,0,7,0
chr2	3605528	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=179,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:4,7:6,5:0|1:3605528_T_G:3605528:0,11,1,11
chr2	3605538	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=220,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:5,3:3,5:0|1:3605528_T_G:3605528:0,9,0,8
chr2	3623309	.	A	C	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=30,9;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,13:0.153:78:34,0:27,4:61,4,0,13
chr2	3623540	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=104.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,17:0,12:0,0,3,26
chr2	3624205	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=163,181;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.056:69:39,3:26,0:15,51,2,1
chr2	3627648	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,10:0,0,24,5
chr2	3661048	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=16,31;MFRL=176,174;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,0:0,2:0,7,0,2
chr2	3685046	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,11:0,0,16,3
chr2	3685074	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,13:0,0,14,11
chr2	3721692	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,87;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:22,4:20,0:24,20,3,1
chr2	3727363	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:7,5:1,2:8,0,7,0
chr2	3745145	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=181,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3745145_T_G:3745145:0,1,0,1
chr2	3745147	.	G	GTCAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=181,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3745145_T_G:3745145:0,1,0,1
chr2	3774519	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr2	3774766	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=189,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3774766_G_C:3774766:0,1,0,1
chr2	3774768	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=189,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3774766_G_C:3774766:0,1,0,1
chr2	3800496	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr2	3815250	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	3815532	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:0,0:2,2:0,2,0,5
chr2	3826324	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,3:1,0,4,1
chr2	3826387	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,8:4,3:8,0,8,3
chr2	5834249	.	G	GTGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=218,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TGA;STR;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:1,2:4,1:3,2,0,3
chr2	5834751	.	A	AT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:6,4:5,9:1,10,3,10
chr2	5835335	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.436:24:4,7:10,3:0|1:5835335_TA_T:5835335:5,9,3,7
chr2	5835352	.	C	CT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,13:0.448:30:4,6:11,3:0|1:5835335_TA_T:5835335:7,10,5,8
chr2	5835564	.	GAA	G,GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34,34;MFRL=161,165,136;MMQ=60,60,60;MPOS=28,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=A;STR;TLOD=3.32,21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,9:0.175,0.591:14:2,1,2:1,1,7:1,2,4,7
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chr2	5836615	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	5838161	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:0,1:3,3:3,0,2,2
chr2	5838489	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=154,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.193:29:11,1:12,2:23,0,0,6
chr2	5838683	.	TAAAA	T,TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,23,28;MFRL=167,152,199;MMQ=60,60,60;MPOS=19,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.05,17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,8:0.135,0.433:18:3,1,6:2,0,2:2,6,3,7
chr2	5839811	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,3:3,2:1,5,1,4
chr2	5839841	.	CTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=278,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=T;STR;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,2,0
chr2	5840552	.	C	CA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.372:22:6,3:5,4:8,6,3,5
chr2	5840564	.	AAAG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.418:29:6,6:11,3:8,9,7,5
chr2	7001233	.	ACG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:7001233_ACG_A:7001233:0,0,5,0
chr2	7001249	.	ACACACACACC	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.932:12:0,4:0,7:0|1:7001233_ACG_A:7001233:0,0,11,1
chr2	7005069	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr2	7017903	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,16,2
chr2	7027323	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,4:0,13:0,0,4,13
chr2	7033939	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7033939_T_A:7033939:0,1,0,1
chr2	7033941	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7033939_T_A:7033939:0,1,0,1
chr2	7033942	.	T	TACAAAGAGAAACAAAAGAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7033939_T_A:7033939:0,1,0,1
chr2	7164746	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	7170413	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7170413_T_G:7170413:0,1,0,1
chr2	7170417	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.417:3:0,1:1,0:0|1:7170413_T_G:7170413:0,2,0,1
chr2	8822892	.	CAAAA	C,CA	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=35,35,32;MFRL=188,163,200;MMQ=60,60,60;MPOS=32,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=25,21,22;RU=A;STR;TLOD=3.61,10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,5:0.206,0.436:13:3,2,1:0,1,4:4,1,8,0
chr2	8822912	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=14,19;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.735:21:2,3:0,5:5,0,12,4
chr2	8822924	.	CT	AA	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:9,0:11,0:25,6,4,0
chr2	8822927	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=32,13;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.134:35:11,0:13,0:0|1:8822927_C_A:8822927:25,6,4,0
chr2	8822932	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=32,18;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.115:41:8,1:15,1:0|1:8822927_C_A:8822927:29,8,4,0
chr2	8822936	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=33,19;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:10,1:22,0:0|1:8822927_C_A:8822927:29,8,2,0
chr2	8823086	.	TGC	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=147,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GC;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.066:42:14,0:21,2:8,32,0,2
chr2	8870814	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	8910717	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	8910987	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,1,8
chr2	8916847	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr2	8931377	.	CTTACA	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=200,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:5,0:2,5:0,7,0,5
chr2	8931437	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=158,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr2	8943291	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	9008502	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,5:6,6:11,0,10,1
chr2	9017284	.	GC	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,86;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:8,3:18,0:14,16,0,3
chr2	9143763	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	9419411	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:6,4:3,6:6,3,7,3
chr2	9419583	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=199,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr2	9419608	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	9437413	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:5,6:9,5:11,3,6,5
chr2	9458798	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,5:3,4:1,9,0,9
chr2	9475337	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:9,7:13,6:6,16,4,9
chr2	9484561	.	TAAAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,6;RU=A;STR;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	9496291	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=204.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,64:0.970:65:1,28:0,35:0,1,25,39
chr2	9515157	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	9520959	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:1,6,0,5
chr2	9533617	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,14;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,0:0|1:9533617_T_A:9533617:0,5,2,0
chr2	9533625	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=25,19;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,1:0|1:9533617_T_A:9533617:0,5,2,0
chr2	9533627	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,1:0|1:9533617_T_A:9533617:0,5,2,0
chr2	9533630	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,19;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,1:0|1:9533617_T_A:9533617:0,5,2,0
chr2	9533636	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:9533617_T_A:9533617:1,5,2,0
chr2	9533639	.	CGTTGCCAAGACG	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,1:0|1:9533617_T_A:9533617:1,5,2,0
chr2	9540849	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,3:1,6:1,2,8,1
chr2	9552379	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.583:8:1,4:2,1:0|1:9552379_C_T:9552379:3,0,5,0
chr2	9552383	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.583:8:1,3:2,1:0|1:9552379_C_T:9552379:3,0,5,0
chr2	9554255	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,18,3
chr2	9554280	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:10,6:7,9:13,4,12,3
chr2	9554461	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,0,17
chr2	9569972	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	9571054	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,0,9
chr2	9572888	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr2	9576553	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,11:0,0,0,14
chr2	9580540	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr2	9583822	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.521:15:4,5:3,3:1,6,2,6
chr2	9593027	.	AT	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:16,1:18,3:29,6,3,1
chr2	9614668	.	G	GCCCCCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,10;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:9614668_G_GCCCCCC:9614668:1,0,1,0
chr2	9614673	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:9614668_G_GCCCCCC:9614668:1,0,1,0
chr2	9614678	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,36;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:9614668_G_GCCCCCC:9614668:2,0,1,0
chr2	9614683	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr2	9616035	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,10:0,0,27,1
chr2	9630231	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	9630244	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	9630541	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,29:0.526:55:11,19:15,10:8,18,10,19
chr2	9631340	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=230,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,0,3
chr2	9633137	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=119.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.970:30:0,16:0,14:0|1:9633137_T_G:9633137:0,0,4,26
chr2	9633144	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,13:0.438:30:9,5:8,8:0|1:9633137_T_G:9633137:2,15,1,12
chr2	9637403	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,3:5,0:2,6,0,3
chr2	9642478	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	9650350	.	C	CATAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr2	9657947	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:11,6:8,6:19,0,11,1
chr2	9983591	.	A	AG	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=125.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,20:0,16:0,0,32,7
chr2	9985341	.	TC	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=42.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:10,10:6,6:11,6,9,7
chr2	9986102	.	ACT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,5:5,2:12,2,7,1
chr2	10044951	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:5,4:1,8:5,1,12,0
chr2	10045147	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,8:0,0,3,15
chr2	10059097	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,9,4
chr2	10094992	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,5:5,5:14,0,10,0
chr2	10126416	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,2:1,7:2,2,3,6
chr2	10133284	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.633:28:7,11:3,7:9,1,15,3
chr2	10133349	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=164,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:25,3:29,0:28,28,2,1
chr2	10140651	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:1,3:8,8:8,1,10,1
chr2	10225215	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:7,5:0,3:6,1,5,3
chr2	10225241	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,7:0,0,13,10
chr2	10226306	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr2	10264057	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr2	10281903	.	G	GC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=90.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.967:26:0,13:0,10:0,0,26,0
chr2	10282147	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=110.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,14:0,18:0,0,5,27
chr2	10563233	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,32:0.734:43:3,17:7,15:7,4,7,25
chr2	10563297	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,4:7,6:0,10,0,10
chr2	10717714	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:6,1:11,3:16,2,2,2
chr2	10729328	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:20,0:20,3:14,26,1,2
chr2	10729390	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=156,222;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,0:10,3:4,12,0,3
chr2	10729483	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:10729483_G_T:10729483:0,2,0,1
chr2	10729494	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:10729483_G_T:10729483:0,2,0,1
chr2	10729897	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,4:2,2:3,6,0,6
chr2	10741141	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=220,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,1:5,3:0,5,0,4
chr2	10743153	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:9,4:9,7:15,3,11,0
chr2	10743191	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.257:29:11,3:11,4:17,5,6,1
chr2	10747246	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr2	10747271	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:7,0,6,0
chr2	10762302	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=88.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,2,23
chr2	10808776	.	C	CAA	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=236.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,25:0,26:0,0,29,26
chr2	10813782	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,5:0,17:0,0,1,21
chr2	10822019	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr2	10912092	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr2	10924524	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,0,4
chr2	10927345	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,7:2,3:4,0,10,0
chr2	10928777	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=121,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.505:22:4,9:6,2:5,6,8,3
chr2	10928962	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:5,5:5,3:8,2,8,1
chr2	10929133	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:3,6:7,8:0,10,0,14
chr2	10929867	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.618:32:5,7:7,13:10,2,12,8
chr2	10930050	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,4:6,2:0,12,0,6
chr2	10930106	.	ATT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.787:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	10931001	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=198,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr2	10931038	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=147,245;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	10932082	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,3:3,7:1,4,0,10
chr2	10933195	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:3,6:8,11:9,2,17,0
chr2	10933421	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:1,6,0,7
chr2	10942567	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=190,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:0,1:7,6:7,0,7,0
chr2	10987581	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=222,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr2	10994418	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr2	10994937	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.456:18:5,5:4,3:5,5,5,3
chr2	10995129	.	ATTCT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10995129_ATTCT_A:10995129:0,2,0,1
chr2	10995136	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:10995129_ATTCT_A:10995129:0,2,0,1
chr2	10995140	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10995129_ATTCT_A:10995129:0,0,0,1
chr2	10995144	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10995129_ATTCT_A:10995129:0,0,0,1
chr2	11273407	.	GTC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=178,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	11273663	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,1,1
chr2	11273813	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	11280527	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,16;MFRL=188,128;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:11280527_A_T:11280527:3,0,1,0
chr2	11280531	.	AG	TT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=199,128;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:11280527_A_T:11280527:4,0,1,0
chr2	11280535	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,10;MFRL=199,128;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:11280527_A_T:11280527:4,0,1,0
chr2	11300732	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,11,11
chr2	11300854	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,1:2,6,2,4
chr2	11300869	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr2	11312181	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr2	11312224	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	11312974	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=213,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11312974_T_C:11312974:0,1,0,1
chr2	11312985	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=213,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11312974_T_C:11312974:0,1,0,1
chr2	11312986	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=213,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11312974_T_C:11312974:0,1,0,1
chr2	11348364	.	C	CTAACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,2:3,0,5,0
chr2	11348609	.	CAAAT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr2	11356190	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.394:26:11,5:4,5:14,2,9,1
chr2	11359031	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=116.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,17:0,23:0,0,35,5
chr2	11590067	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr2	11595746	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=222,148;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:0,7,2,0
chr2	11716433	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,3:6,0:9,1,3,0
chr2	11725241	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,10:0,0,19,3
chr2	11738765	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,16,6
chr2	11741193	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	11742458	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr2	11750756	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=194,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr2	11755443	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	11758707	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:2,4:4,2:4,2,3,4
chr2	11777757	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	11905636	.	GT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=83.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,24:0,7:0,0,26,5
chr2	11905876	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,9:0,12:0,0,3,18
chr2	11924950	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=66.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,11:0,0,18,4
chr2	11931931	.	A	AT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=128,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.530:26:4,6:8,8:2,10,3,11
chr2	11932173	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr2	11936798	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	14778337	.	CAA	C,CA,CAAAAA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=18,27,33,34;MFRL=103,156,111,155;MMQ=60,60,60,60;MPOS=11,16,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=21,19,20,24;RU=A;STR;TLOD=5.72,4.92,10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,4,3,6:0.263,0.275,0.345:14:0,0,2,2:0,2,0,2:0,1,6,7
chr2	14779227	.	TACAC	T,TAC,TACACAC	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,27,24,26;MFRL=157,155,156,167;MMQ=60,60,54,60;MPOS=19,8,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=AC;STR;TLOD=9.29,3.63,13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,4,2,6:0.128,0.094,0.301:22:6,2,0,5:3,2,2,1:9,1,11,1
chr2	15307070	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=284,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	15318181	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=157,40;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,1:11,0:0|1:15318181_A_T:15318181:14,2,1,1
chr2	15318183	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=157,40;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:11,0:0|1:15318181_A_T:15318181:14,2,1,1
chr2	15319070	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.584:19:2,5:6,6:7,1,10,1
chr2	15319284	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:20,0:30,3:6,44,0,3
chr2	15372731	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	15378822	.	G	GAATT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,11:0,6:0,0,2,16
chr2	15427173	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,2:3,7:6,1,7,2
chr2	15448311	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.487:31:6,6:9,9:14,2,12,3
chr2	15493881	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=170,60;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:0,3:2,1:0,3,0,4
chr2	15519992	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr2	15523266	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,22,0
chr2	15523307	.	TA	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.487:39:7,12:9,7:14,6,12,7
chr2	15533689	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:3,0:9,2:13,0,2,0
chr2	15533734	.	G	GAAATGAAAGCGTATGTCTACAC	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAATGAAAGCGTATGTCTACAC;STR;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.510:19:5,2:4,2:7,2,9,1
chr2	15533779	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=125,126;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,29:0.464:63:11,10:21,19:23,11,22,7
chr2	15533884	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=120,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,12:0.464:26:5,6:8,6:0|1:15533884_C_A:15533884:1,13,4,8
chr2	15533895	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:2,4:7,6:0|1:15533884_C_A:15533884:0,10,3,8
chr2	15533899	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:2,4:4,6:0|1:15533884_C_A:15533884:0,6,2,8
chr2	15536509	.	GA	G,GAA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=155,162,137;MMQ=60,60,60;MPOS=18,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=10.99,6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,8,6:0.173,0.149:42:10,2,3:15,5,1:24,4,12,2
chr2	15601287	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,3:5,4:9,0,6,1
chr2	15608013	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	15616013	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,21:0.449:47:16,13:10,8:3,23,3,18
chr2	15616030	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:11,10:10,4:1,20,1,13
chr2	15644401	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,1:3,6:0,5,0,7
chr2	15694164	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,5:4,5:5,5,7,5
chr2	15731998	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.397:21:6,3:5,5:12,1,6,2
chr2	15753307	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.171:25:12,2:9,2:17,4,4,0
chr2	15768876	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:30,2:16,2:28,21,4,0
chr2	15840505	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.665:19:3,6:3,6:3,3,10,3
chr2	15840522	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.348:24:9,2:6,6:12,4,5,3
chr2	15841288	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,5:1,1:6,0,6,0
chr2	16082110	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,12;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:1,0:1,1:4,0,3,0
chr2	16743453	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr2	16746847	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,4:7,0:10,3,4,0
chr2	17696620	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=76.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,26:0.542:48:11,13:10,13:7,15,11,15
chr2	17773524	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=108.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,11:0,24:0,0,8,28
chr2	17836743	.	C	CTTCCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	17899291	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,6:8,4:11,1,9,1
chr2	17922822	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:6,2,2,0
chr2	17941423	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr2	17954140	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,7:0,0,4,9
chr2	17954647	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,0,16
chr2	17962993	.	CAAGTT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:2,7:5,7:2,5,4,10
chr2	18113464	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:6,2:8,10,2,0
chr2	18113508	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,3:4,1:5,5,1,3
chr2	20131184	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,2,19
chr2	20233135	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr2	20251070	.	T	TGC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.787:2:0,1:0,0:0|1:20251070_T_TGC:20251070:0,0,2,0
chr2	20251075	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:20251070_T_TGC:20251070:0,0,2,0
chr2	20251080	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:20251070_T_TGC:20251070:0,0,2,0
chr2	20251083	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:0,0:0,0:0|1:20251070_T_TGC:20251070:1,1,2,0
chr2	20251087	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:20251070_T_TGC:20251070:1,1,1,0
chr2	20402798	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=214,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:5,0:6,9,3,0
chr2	20402803	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=193,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.197:20:8,0:4,1:6,10,4,0
chr2	20405050	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr2	20405241	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:1,7,0,2
chr2	20423045	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:20423045_A_AAC:20423045:1,3,0,1
chr2	20423047	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:20423045_A_AAC:20423045:1,3,0,1
chr2	20423059	.	C	CTTCAGTGGATAGAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:1,3,0,1
chr2	20455971	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:0,18,0,2
chr2	20462852	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr2	20648250	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=192,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:6,4,5,1
chr2	20648933	.	A	AT,ATT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=145,157,152;MMQ=60,60,60;MPOS=21,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=42.85,5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,20,5:0.631,0.155:32:3,6,2:4,10,2:6,1,13,12
chr2	20699625	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=210,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:5,7:5,4:10,0,12,0
chr2	20699667	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.560:30:6,7:7,9:11,2,11,6
chr2	20700900	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr2	20792087	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=142,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:1,0:0|1:20792087_T_G:20792087:0,2,3,0
chr2	20792093	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=36,12;MFRL=142,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:2,1:0|1:20792087_T_G:20792087:0,2,3,0
chr2	20792098	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,12;MFRL=142,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:2,1:0|1:20792087_T_G:20792087:0,2,3,0
chr2	20792103	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=34,12;MFRL=121,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:0,0:4,1:0|1:20792087_T_G:20792087:5,3,3,0
chr2	20792106	.	CATT	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=37,22;MFRL=121,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:0,0:8,1:0|1:20792087_T_G:20792087:5,3,3,0
chr2	20798023	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr2	20822218	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	20823612	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr2	20823850	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:20823850_T_C:20823850:0,0,0,5
chr2	20823858	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=214,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:20823850_T_C:20823850:0,2,0,3
chr2	20824691	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,5:2,0:0,6,1,6
chr2	20824708	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.396:16:6,3:2,2:0,10,0,6
chr2	20845273	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	20871190	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,14:0,3:0,0,3,14
chr2	20884550	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	20939708	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:5,2,4,0
chr2	21230687	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,275;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,1:9,1:9,13,2,0
chr2	21233069	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=209,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr2	21236482	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr2	21265141	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,4:2,7:4,0,11,0
chr2	21360583	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:9,2,1,2
chr2	21362874	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.447:27:8,3:6,8:6,9,9,3
chr2	21364564	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=197,76;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,1:10,7,1,1
chr2	23608319	.	A	AGCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GCC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:3,0,1,0
chr2	23608644	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	23746975	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:3,4,1,7
chr2	23862187	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,1:4,6:1,5,0,7
chr2	23925980	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr2	23977120	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:24,0:27,3:22,29,0,3
chr2	24009163	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=285,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr2	24042550	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	24103432	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr2	24110611	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr2	24110911	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.734:9:2,0:0,3:0,2,0,7
chr2	24194314	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr2	24246175	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	24246679	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	24255862	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr2	24283782	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=159,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:13,3:16,0:14,16,2,1
chr2	24387178	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,5,9
chr2	24395506	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,26:0,19:0,0,7,39
chr2	24398281	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	24402127	.	C	CAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=162.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,19:0,18:0,0,3,35
chr2	24406357	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,5:7,3:8,3,5,3
chr2	24428137	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,153;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:15,0:9,3:8,16,0,3
chr2	24432620	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	24432667	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,12,4
chr2	24475205	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=122.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,19:0,14:0,0,25,8
chr2	24484150	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr2	24484637	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,128;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:18,0:15,4:0,33,0,4
chr2	24521493	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr2	24550867	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=43559423,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.695:8:0,4:2,2:1,1,4,2
chr2	24952712	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.846:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr2	24952740	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr2	24962252	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	25038268	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	25054696	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	25057408	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:7,2:2,0:8,2,2,0
chr2	25061270	.	GGGGTGGGGT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGTGGGGT;STR;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.896:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	25062853	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.196:23:7,0:8,0:4,15,4,0
chr2	25062984	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=217,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,1:0,5,0,4
chr2	25170715	.	T	TGTGGTATTTTGTTTTTTGCTTTTGCATTAGTTTTCTGGAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=98,171;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.476:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr2	25359524	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:2,7,0,2
chr2	25376610	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:8,3:5,0:7,7,3,0
chr2	25458546	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=93.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,19:0,0,20,10
chr2	25466888	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,5,20
chr2	25469641	.	G	GCCAC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=202,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCAC;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0|1:25469641_G_GCCAC:25469641:0,1,0,1
chr2	25469648	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:25469641_G_GCCAC:25469641:0,2,0,1
chr2	25469650	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:25469641_G_GCCAC:25469641:0,2,0,1
chr2	25469653	.	GT	CC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:25469641_G_GCCAC:25469641:0,2,0,1
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chr2	25551692	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,1:1,5:0,3,1,5
chr2	25656880	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=157,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,23:0.675:34:3,7:6,14:1,10,2,21
chr2	25656889	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.161:22:7,1:10,0:1,18,0,3
chr2	25875401	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26,29;MFRL=0,133,168;MMQ=60,60,60;MPOS=30,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=A;STR;TLOD=6.73,9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,6:0.367,0.544:9:0,1,6:0,2,0:0,0,9,0
chr2	25965347	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.115:50:19,5:25,0:24,21,4,1
chr2	25973309	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:4,7:2,5:0,6,0,12
chr2	25990640	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,9:3,5:0,8,2,12
chr2	25994412	.	A	AG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:5,6:9,11:3,11,4,14
chr2	26068509	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.662:27:2,11:6,7:1,8,0,18
chr2	26350136	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=192.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.984:57:0,31:0,24:0,0,11,46
chr2	26357748	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,18:0,7:0,0,25,0
chr2	26405985	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,0,18
chr2	26407723	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	26410214	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=141,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,3:0,1:2,1,0,4
chr2	26410278	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:3,1:7,1:6,6,1,1
chr2	26410753	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,6:8,4:5,7,4,6
chr2	26411225	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26411225_G_A:26411225:0,0,0,1
chr2	26411227	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26411225_G_A:26411225:0,0,0,1
chr2	26415088	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	26417533	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,14:0,6:0,0,5,15
chr2	26420708	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr2	26454996	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,12,6
chr2	26477125	.	G	GACT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACT;STR;TLOD=222.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,23:0,26:0,0,27,27
chr2	26532491	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=55.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,3,13
chr2	26532735	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr2	26533023	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,9:0,0,8,15
chr2	26536555	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=207,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=61.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:0,6:1,11:1,0,17,0
chr2	26537499	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=147.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,25:0,14:0,0,11,28
chr2	26624803	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr2	26625042	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	26652671	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.909:13:0,5:0,7:0,1,2,10
chr2	26653836	.	T	TAACCATGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:26653836_T_TAACCATGG:26653836:0,4,0,1
chr2	26653839	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:26653836_T_TAACCATGG:26653836:0,4,0,1
chr2	26653842	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:26653836_T_TAACCATGG:26653836:0,4,0,1
chr2	26653844	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:26653836_T_TAACCATGG:26653836:0,4,0,1
chr2	26663187	.	T	TTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=182,138;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=TG;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.526:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	26671544	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=177,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:5,6:8,6:11,3,7,5
chr2	26676322	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,14:0,21:0,0,15,21
chr2	26702423	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=145,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:17,2:18,1:19,18,2,1
chr2	26705527	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:4,1:2,2:1,6,0,3
chr2	26707593	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=235,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chr2	26724725	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:5,4:6,4:3,9,2,6
chr2	26726752	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=112,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,5:1,8:1,2,3,10
chr2	26726774	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=168,163;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:0,12,0,2
chr2	26739247	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	26739407	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=183,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr2	26750645	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr2	26801586	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr2	26804122	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=75,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	26804143	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=75,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr2	26818006	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,5,3
chr2	26818021	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr2	26852190	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:26852190_CA_C:26852190:0,0,1,0
chr2	26852193	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:26852190_CA_C:26852190:0,0,1,0
chr2	26852196	.	A	AAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:26852190_CA_C:26852190:0,0,1,0
chr2	26852201	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:26852190_CA_C:26852190:0,0,1,0
chr2	26951449	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	26997031	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=175,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr2	26997128	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,2:13,0:21,5,2,0
chr2	27157396	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=207,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.696:8:1,2:1,3:0|1:27157396_G_A:27157396:2,0,5,1
chr2	27157400	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:27157396_G_A:27157396:0,0,7,1
chr2	27163044	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=212,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.796:8:1,3:0,2:0,1,1,6
chr2	27164806	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.393:31:9,8:10,4:14,5,6,6
chr2	27249245	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.495:24:6,3:6,8:3,9,3,9
chr2	27258251	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	27258761	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:4,4:4,7:8,1,10,1
chr2	27262763	.	GGGA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr2	27263122	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=214,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,1,1
chr2	27276202	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=195,286;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:1,0:5,3:6,1,1,2
chr2	27279013	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=282,254;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	27279416	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	27279739	.	T	C,TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33,32;MFRL=214,152,165;MMQ=60,60,60;MPOS=9,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,0,0:0,1,1:0,4,0,2
chr2	27279747	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=214,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr2	27280092	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	27280127	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr2	27280140	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=215,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,4:2,9:3,1,11,2
chr2	27291661	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,7:1,4:0,2,0,11
chr2	27291696	.	T	TACTTATG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	27292651	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.705:25:3,10:4,8:0,7,0,18
chr2	27293150	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.444:36:9,9:11,6:2,18,1,15
chr2	27302165	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=272,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr2	27307769	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,4:6,1:12,1,6,0
chr2	27308159	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=107.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,41:0.561:73:13,22:18,18:14,18,17,24
chr2	27353630	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,7:3,2:0,8,0,9
chr2	27354173	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	27354971	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:5,7:7,3:6,6,5,6
chr2	27355454	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,10,4
chr2	27356218	.	C	CAGATTAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,2:3,0:0|1:27356218_C_CAGATTAA:27356218:3,12,0,2
chr2	27356220	.	C	CAAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,2:3,0:0|1:27356218_C_CAGATTAA:27356218:3,12,0,2
chr2	27356278	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=197,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,3:3,3:5,3,3,3
chr2	27375532	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=150,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,0:10,3:7,7,2,1
chr2	27424496	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	27424911	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.109:62:28,0:27,6:30,26,0,6
chr2	27428147	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,23,0
chr2	27428815	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=110.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,29,0
chr2	27435374	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=204,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:2,9:3,6:0,5,0,15
chr2	27438710	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr2	27439404	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.074:65:35,4:26,0:52,9,4,0
chr2	27445315	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=168,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:3,4,4,4
chr2	27449293	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=231,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr2	27455154	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=202,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:27455154_AG_A:27455154:1,1,0,1
chr2	27455156	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=202,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:27455154_AG_A:27455154:1,1,0,1
chr2	27456053	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,4:4,6:1,4,3,7
chr2	27460722	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:3,8,0,2
chr2	27461555	.	T	TGGTTGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:27461555_T_TGGTTGGC:27461555:1,3,0,1
chr2	27461557	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:27461555_T_TGGTTGGC:27461555:1,3,0,1
chr2	27462405	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:2,3:5,1:2,5,1,4
chr2	27463091	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:2,2:8,1,3,0
chr2	27466258	.	CTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.300:11:3,2:4,1:7,1,3,0
chr2	27499763	.	CTTTCTGTATCTCTTTTGCTATCTGACTCTTTTTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=210,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,0:1,1:0|1:27499763_CTTTCTGTATCTCTTTTGCTATCTGACTCTTTTTTTT_C:27499763:0,3,0,1
chr2	27499805	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=206,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27499763_CTTTCTGTATCTCTTTTGCTATCTGACTCTTTTTTTT_C:27499763:0,2,0,1
chr2	27505782	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=157,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.415:15:7,3:1,3:1,8,2,4
chr2	27528692	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.503:32:7,13:7,2:5,11,3,13
chr2	27530638	.	GGGGCTCC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=230,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:27530638_GGGGCTCC_G:27530638:0,3,0,1
chr2	27530649	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=230,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:27530638_GGGGCTCC_G:27530638:0,3,0,1
chr2	27530669	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	27532870	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=124,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.387:24:3,5:11,4:6,9,3,6
chr2	27535311	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=75.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,10:0,0,6,17
chr2	27550157	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,80;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:15,3:4,0:9,11,2,1
chr2	27556721	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,4:4,2:5,5,5,1
chr2	27558252	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,26:0.504:52:16,12:10,12:12,14,15,11
chr2	27566520	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=267,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr2	27596266	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,127;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:15,1:11,1:0,28,0,2
chr2	27597190	.	AT	A,ATT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32,31;MFRL=128,140,119;MMQ=60,60,60;MPOS=20,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=10.39,13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,6,9:0.247,0.331:26:5,6,4:5,0,5:8,3,15,0
chr2	27598097	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,194;MMQ=50,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,1:0,2,0,5
chr2	27599132	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.488:41:11,12:9,7:7,14,13,7
chr2	27603267	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.250:19:5,0:5,0:0|1:27603267_T_A:27603267:4,10,5,0
chr2	27603270	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.203:23:4,1:4,1:0|1:27603267_T_A:27603267:4,14,5,0
chr2	27603274	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,11;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.172:23:7,0:7,0:0|1:27603267_T_A:27603267:4,15,4,0
chr2	27603278	.	CTG	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=168,5398372;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,1:6,1:0|1:27603267_T_A:27603267:2,15,2,0
chr2	27656456	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=181,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:4,0:0|1:27656456_C_G:27656456:14,2,2,0
chr2	27656461	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=180,220;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:0|1:27656456_C_G:27656456:14,1,2,0
chr2	27656822	.	G	GA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=52.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:6,6:10,8:9,7,12,5
chr2	27658187	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27658187_T_C:27658187:0,1,0,1
chr2	27658189	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27658187_T_C:27658187:0,1,0,1
chr2	27658191	.	G	GGCTCTAGGCAACAGATAGCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27658187_T_C:27658187:0,1,0,1
chr2	27659568	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:15,2,2,0
chr2	27659832	.	C	CT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.301:32:8,3:13,5:17,6,7,2
chr2	27660101	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:3,1:7,2:9,3,2,1
chr2	27663215	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:2,1:13,8:12,3,8,1
chr2	27663416	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:1,1,2,3
chr2	27665361	.	C	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=107.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,37:0.508:73:16,21:19,16:14,22,10,27
chr2	27666161	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=206,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,3:6,6:5,7,2,7
chr2	27667791	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=184,126;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:4,0:11,0,2,0
chr2	27667823	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,139;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:14,1:5,1:17,2,2,0
chr2	27670699	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:8,10,2,0
chr2	27680798	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,2:16,0:11,18,2,0
chr2	27684734	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:1,4:6,3:3,5,2,5
chr2	27688601	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.267:16:2,1:8,2:10,2,3,1
chr2	27695317	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	27700378	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,6:2,3:4,2,6,3
chr2	27700973	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.451:31:7,7:10,6:5,12,5,9
chr2	27704207	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=220,292;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27704207_T_C:27704207:0,1,0,1
chr2	27704208	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=220,292;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27704207_T_C:27704207:0,1,0,1
chr2	27707196	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.141:25:15,1:7,2:5,17,1,2
chr2	27709046	.	C	A	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,65;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,6:0.066:103:43,6:49,0:65,32,6,0
chr2	27716698	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=214,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr2	27717117	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=223,24671;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,6:3,0:3,1,6,0
chr2	27720554	.	TTA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=170,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,2:7,0:0|1:27720554_TTA_T:27720554:1,9,0,2
chr2	27720559	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=167,219;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:0|1:27720554_TTA_T:27720554:1,8,0,2
chr2	27721971	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,6:0,1:3,1,7,0
chr2	27726437	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:11,10:8,4:9,10,3,11
chr2	27745372	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,4:7,2:3,9,1,5
chr2	27746395	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	27799773	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:3,4:0,7,2,3
chr2	27823004	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,6:5,5:0,7,0,11
chr2	27824348	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=144,142;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,0:2,2:0,13,0,3
chr2	27824408	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=186,144;MMQ=52,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	27830990	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=226,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr2	27839107	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:6,5:5,9:6,5,11,3
chr2	27850013	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,186;MMQ=33,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.382:40:10,7:14,8:7,18,6,9
chr2	27852264	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.409:35:5,4:14,9:9,12,8,6
chr2	27857992	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,19:0.429:44:11,9:14,8:18,7,13,6
chr2	27858112	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,24:0.458:52:14,10:13,11:11,17,6,18
chr2	27858167	.	C	CTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.918:8:0,2:0,1:0,0,1,7
chr2	27861707	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,4:5,5:7,1,9,0
chr2	27864089	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.467:41:11,9:10,10:18,4,13,6
chr2	27865416	.	T	TA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.473:42:10,7:12,12:6,16,4,16
chr2	27876641	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:10,2:6,6:4,13,1,7
chr2	27878302	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:7,0:17,3:10,15,3,0
chr2	27878490	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:0,4,0,4
chr2	27883958	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,30:0.378:80:19,14:31,16:30,20,17,13
chr2	27886820	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=201,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.544:40:7,8:11,11:10,8,11,11
chr2	27907817	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:4,0,8,0
chr2	27907828	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:5,0,10,0
chr2	27997196	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr2	28066190	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=195,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,4,0
chr2	28071070	.	T	TTTA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.529:13:2,2:4,5:0,6,0,7
chr2	28093804	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28093804_C_T:28093804:0,1,0,1
chr2	28093806	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,21;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28093804_C_T:28093804:0,1,0,1
chr2	28113195	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.386:27:9,4:5,5:6,11,2,8
chr2	28460264	.	C	CTCAAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=231,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28460264_C_CTCAAAT:28460264:0,1,0,1
chr2	28460266	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=231,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28460264_C_CTCAAAT:28460264:0,1,0,1
chr2	28615573	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,11;MFRL=208,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:1,0:2,0,2,0
chr2	28718897	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	28748857	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=93.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,9,18
chr2	28748916	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr2	28752498	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	28752555	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr2	28752727	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,9
chr2	28752741	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,8
chr2	28761257	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=81.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,10:0,0,1,22
chr2	28761282	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr2	28771452	.	CTA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=278,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:0,1,1,8
chr2	28771624	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr2	28771897	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,4:3,9:1,5,1,12
chr2	28795962	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr2	28800894	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.720:15:2,8:1,3:3,1,9,2
chr2	28804835	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=88578773,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.824:9:0,3:0,5:1,0,8,0
chr2	28805410	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr2	28808539	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,23,1
chr2	28812285	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr2	28812531	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:11,8,0,2
chr2	28812982	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,3,11
chr2	28814683	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=137,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr2	28816814	.	C	CTT,CTTTT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32,34;MFRL=177,184,253;MMQ=60,60,60;MPOS=24,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,16,18;RU=T;STR;TLOD=7.16,4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,2:0.224,0.133:20:8,1,1:6,3,1:14,0,5,1
chr2	28816948	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,17:0.341:51:20,7:12,10:9,25,2,15
chr2	28821662	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,2:4,6:1,5,3,5
chr2	28828649	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,6:3,5:8,0,11,0
chr2	28836881	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.082:35:18,2:15,0:22,11,2,0
chr2	28847806	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:7,4:7,2:13,1,6,0
chr2	28847918	.	A	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,10:0.140:54:18,1:11,1:23,21,10,0
chr2	28849435	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,5:8,2:4,13,3,4
chr2	28849473	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr2	28851517	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,5:6,5:4,6,5,5
chr2	28855918	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr2	28865968	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:6,7:12,6:2,16,1,12
chr2	28975107	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,4:2,6:0,6,0,10
chr2	29001279	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.075:56:19,3:32,0:14,38,1,3
chr2	29041877	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:4,0,7,2
chr2	29045323	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,0,30
chr2	29052256	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	29063102	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:14,3:21,0:22,14,3,0
chr2	29087799	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=274,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr2	29140711	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:3,1,5,2
chr2	29145725	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,15:0,18:0,0,22,13
chr2	29169194	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	29222388	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:4,4:1,3:0,6,0,7
chr2	29225626	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr2	29226559	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=105.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0,0,12,22
chr2	29239942	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:6,9:7,6:13,0,14,1
chr2	29240005	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=78.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,25:0.448:56:16,10:15,15:18,13,19,6
chr2	29240582	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,5:3,4:8,0,9,0
chr2	29249903	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.342:21:7,4:6,2:1,13,1,6
chr2	29287708	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:4,1,2,1
chr2	29287926	.	C	CGCT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCT;STR;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:4,3:4,3:2,7,1,5
chr2	29295609	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,78;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:19,3:15,0:19,16,3,0
chr2	29297206	.	C	CATAGAAACCATTGTGGCTTTGTGATG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.486:3:0,1:1,0:0|1:29297206_C_CATAGAAACCATTGTGGCTTTGTGATG:29297206:0,2,0,1
chr2	29297210	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29297206_C_CATAGAAACCATTGTGGCTTTGTGATG:29297206:0,1,0,1
chr2	29366830	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.472:30:11,7:4,7:4,12,3,11
chr2	29366875	.	C	CACAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=79.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,9:0,0,0,19
chr2	29383374	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr2	29386646	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,6:3,8:7,1,13,1
chr2	29390299	.	AG	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=78.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,26:0.599:43:12,11:4,14:13,4,20,6
chr2	29416025	.	C	CATTG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATTG;STR;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,4:4,1:9,0,5,0
chr2	29419591	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:3,5:8,3:9,3,7,1
chr2	29420315	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=228,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:7,0,5,0
chr2	29446184	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,2:5,4:5,3,5,1
chr2	29456384	.	TG	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,4:5,2:8,5,5,1
chr2	29462520	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr2	29498210	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr2	29498226	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.157:21:9,0:5,0:0|1:29498226_T_G:29498226:16,2,0,3
chr2	29498229	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,2:9,1:13,5,3,0
chr2	29498233	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.156:21:10,0:6,1:0|1:29498226_T_G:29498226:16,2,0,3
chr2	29541104	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,4,1
chr2	29754721	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=151,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr2	29917940	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	30682470	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:10,7:12,7:9,13,11,3
chr2	30682630	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,5:3,3:1,8,0,8
chr2	30748373	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:6,0,4,0
chr2	30756196	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,4:4,6:2,4,1,9
chr2	30756265	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=208,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,5:1,2:0,3,0,7
chr2	30828792	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=93.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,18:0,8:0,0,28,0
chr2	30955527	.	C	CAACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=207,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	30959262	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,13,0
chr2	30977073	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	30986989	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=136,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,0:3,5:3,3,3,2
chr2	30998912	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,172;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:6,0:4,3:6,6,0,3
chr2	31000370	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:0,3:6,4:3,4,6,1
chr2	31009977	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:7,11:9,9:11,5,15,5
chr2	31133939	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=101.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,6,23
chr2	31189236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr2	31189251	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=169,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr2	31401290	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	31410708	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=147.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,15:0,30:0,0,4,41
chr2	31414313	.	AG	TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:1,2,0,1
chr2	31414317	.	GAGA	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=188,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:31414317_GAGA_G:31414317:0,3,0,1
chr2	31414323	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=201,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:31414317_GAGA_G:31414317:0,4,0,1
chr2	31414328	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=201,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31414317_GAGA_G:31414317:0,4,0,1
chr2	31414330	.	TT	AA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=201,122;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31414317_GAGA_G:31414317:0,4,0,1
chr2	31415967	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=234,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr2	31416213	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,37;MFRL=261,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	31420245	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:0,4,0,5
chr2	31422452	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=171,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr2	31422514	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=225,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:0,2,0,5
chr2	31423245	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	31424693	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:7,2,4,1
chr2	31424885	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:2,7,2,5
chr2	31425185	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=218,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:0,4,0,7
chr2	31426096	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:31426096_T_G:31426096:1,1,0,1
chr2	31426098	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:31426096_T_G:31426096:1,1,0,1
chr2	31467079	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	31467351	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	31484334	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	31488965	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr2	31567632	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=122,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:1,6:8,1:2,7,2,5
chr2	31570376	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.581:31:6,11:5,7:12,1,17,1
chr2	31571241	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,5:6,3:0,12,1,7
chr2	31572482	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=96,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr2	31588218	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=198,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:7,3:3,4:10,0,7,0
chr2	31600146	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,2,2
chr2	31609448	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr2	31611029	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.622:14:1,4:4,4:4,1,9,0
chr2	31621598	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:1,9,1,3
chr2	31751174	.	C	CATATATATATATATATAT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,1:1,4:0|1:31751174_C_CATATATATATATATATAT:31751174:3,0,7,0
chr2	31751175	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,2:1,5:0|1:31751174_C_CATATATATATATATATAT:31751174:3,0,7,0
chr2	31751178	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:2,2:1,3:0|1:31751174_C_CATATATATATATATATAT:31751174:3,0,6,0
chr2	31805880	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr2	32093572	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:40,3:20,0:21,40,0,3
chr2	32095023	.	TA	T,TAA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=13,12,15;MFRL=169,184,132;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=8.20,9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,8,7:0.284,0.259:27:1,0,0:0,2,1:1,11,0,15
chr2	32117217	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:2,0:3,0:1,23,0,3
chr2	32148619	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:5,1:5,2:10,0,3,0
chr2	32148636	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,2:8,4:12,0,6,0
chr2	32188138	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:4,0,6,0
chr2	32235188	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=208,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.357:11:1,0:3,0:7,0,4,0
chr2	32248479	.	C	CCATT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:8,5:5,4:8,6,7,3
chr2	32264440	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:25,0:12,2:26,12,1,1
chr2	32288999	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,12;MFRL=147,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:4,0,1,0
chr2	32312700	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,2:3,3:1,6,0,5
chr2	32362079	.	G	GTATA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TA;STR;TLOD=58.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,16:0.368:44:18,9:10,3:20,8,9,7
chr2	32368296	.	C	CA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:5,2:16,2:21,0,5,0
chr2	32368315	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=180,134;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:12,2:21,0:34,0,2,0
chr2	32369901	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr2	32369931	.	CA	TG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=169,179;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:7,0:12,2,2,0
chr2	32369940	.	CA	TG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=166,167;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,1:12,1:14,7,2,0
chr2	32372452	.	CAT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=166,144;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:32372452_CAT_C:32372452:0,2,0,1
chr2	32372455	.	G	GCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=166,144;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:32372452_CAT_C:32372452:0,2,0,1
chr2	32434701	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr2	32449871	.	ATTTT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,4;RU=T;STR;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,3:0,10,0,4
chr2	32449879	.	T	TAAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=A;STR;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,1:4,4:0,9,0,5
chr2	32461493	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr2	32466029	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	32481793	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=206,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:4,2:5,8:0|1:32481793_AT_A:32481793:5,4,5,5
chr2	32481795	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=206,148;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:3,2:4,8:0|1:32481793_AT_A:32481793:5,4,5,5
chr2	32655873	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=156,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.419:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr2	32667058	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,8,0
chr2	32667061	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,8,0
chr2	32690109	.	AT	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,12:0.221:53:24,8:14,4:36,5,10,2
chr2	32690221	.	G	A	.	.	DP=115;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=122,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:108,4:0.044:112:54,0:43,4:56,52,1,3
chr2	32690253	.	AT	A,ATT	.	.	DP=88;ECNT=3;MBQ=26,27,25;MFRL=146,166,142;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,18,20;RU=T;STR;TLOD=11.58,8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,10,13:0.220,0.319:38:7,6,3:6,3,6:4,11,6,17
chr2	32690317	.	ATT	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=106,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.582:5:0,0:0,0:0,2,0,3
chr2	32701237	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=156,97;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.101:47:22,4:19,0:34,9,4,0
chr2	32706579	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=350,157;MMQ=46,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=87.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.937:29:0,16:1,12:0,1,1,27
chr2	32706593	.	GG	TA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=183,105;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,2:11,0:0,23,0,2
chr2	32712875	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=105.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,13:0,0,1,28
chr2	32749880	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=121.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,15:0,13:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,27,2
chr2	32749890	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=150.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,15:0,15:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,30,4
chr2	32749893	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=162.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.974:37:0,14:0,18:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,33,4
chr2	32749903	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=149.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,15:0,18:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,31,4
chr2	32822729	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,0:0,6:0,0,7,0
chr2	32822957	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,4,17
chr2	32927863	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,3:6,4:4,5,5,2
chr2	32958838	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=181,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:3,2:0,2:3,0,3,1
chr2	32959024	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,7:5,4:1,8,0,11
chr2	32959075	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=227,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	32961691	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.701:14:1,5:2,5:4,0,10,0
chr2	32961745	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=74.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,11:0,0,25,0
chr2	33036324	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,4:5,3:1,11,0,7
chr2	33045867	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr2	33172900	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,3:3,6:0,3,4,5
chr2	33335847	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:8,4:8,9:2,14,4,9
chr2	33413640	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	33413949	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr2	33414003	.	CTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=198,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:1,4,0,1
chr2	33414009	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=198,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr2	33442549	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	33488521	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33488521_T_A:33488521:0,1,0,1
chr2	33488526	.	GT	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33488521_T_A:33488521:0,1,0,1
chr2	33488528	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=110,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:33488521_T_A:33488521:0,2,0,1
chr2	33488530	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=110,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:33488521_T_A:33488521:0,2,0,1
chr2	33500863	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:9,6:7,11:9,7,11,6
chr2	33534426	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=140,56;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	33540138	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	33540172	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr2	33622448	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr2	33623387	.	AT	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,9,1
chr2	33744958	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.513:27:6,9:7,4:11,2,8,6
chr2	33764141	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:7,0:6,3:11,2,1,2
chr2	36605417	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,2:7,1:12,5,3,0
chr2	36605585	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,5:5,4:2,11,2,7
chr2	36739553	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr2	36740643	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:5,9:10,7:13,2,15,1
chr2	36779144	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.289:26:10,3:7,4:16,3,6,1
chr2	36782964	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:5,6:8,5:6,7,8,3
chr2	36783215	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.500:48:9,13:15,11:6,18,9,15
chr2	36805676	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.546:33:8,10:6,8:15,0,17,1
chr2	36806021	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.388:32:7,5:10,7:0,20,0,12
chr2	36806051	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.270:23:8,3:9,2:1,16,1,5
chr2	36808350	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=187,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr2	36810408	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr2	36810473	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:6,1,4,1
chr2	36818109	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,22:0.562:39:7,16:10,6:0|1:36818109_T_C:36818109:9,8,12,10
chr2	36818118	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=149,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:39,3:0.091:42:23,3:15,0:1|0:36818109_T_C:36818109:19,20,3,0
chr2	36825137	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	36825170	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	36825330	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	36943419	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr2	36986260	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=115,86;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,0:9,2:5,11,0,2
chr2	37000873	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.551:25:3,6:8,7:0|1:37000873_A_T:37000873:9,2,13,1
chr2	37000877	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,9:0,13:0|1:37000873_A_T:37000873:0,0,20,3
chr2	37002321	.	C	CTTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	37002324	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,27;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr2	37010574	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr2	37028606	.	T	TGAAGTGAAAGGTTGTTAAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=214,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0|1:37028606_T_TGAAGTGAAAGGTTGTTAAC:37028606:0,1,0,1
chr2	37028610	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=214,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0|1:37028606_T_TGAAGTGAAAGGTTGTTAAC:37028606:0,1,0,1
chr2	37077015	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=81,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:1,4:0,4:0,1,0,8
chr2	37078095	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,2:3,0,8,0
chr2	37096970	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	37104946	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	37111045	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:9,7:11,8:18,2,13,2
chr2	37111239	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=171,176;MMQ=60,53;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.201:19:3,0:2,0:1,14,0,4
chr2	37113791	.	G	GA,GAAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,36,36;MFRL=151,178,0;MMQ=60,60,60;MPOS=25,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.61,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,3,3:0.112,0.103:33:15,3,1:12,0,0:26,1,4,2
chr2	37121277	.	G	GGGATGTTGTAGGGTGGTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	37234519	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,178;MMQ=42,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:0,6,0,6
chr2	37248015	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.400:20:7,2:5,6:0,12,1,7
chr2	37255015	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:12,10:6,10:14,4,17,3
chr2	37264935	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=137,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr2	37277000	.	A	ATTGACTCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,27;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:37277000_A_ATTGACTCT:37277000:0,1,0,1
chr2	37277005	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37277000_A_ATTGACTCT:37277000:0,1,0,1
chr2	37277007	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37277000_A_ATTGACTCT:37277000:0,1,0,1
chr2	37277072	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=209,265;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	37292890	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,20,1
chr2	37297329	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.912:20:1,9:0,9:1,0,15,4
chr2	37302556	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr2	37319467	.	TTA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TA;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.083:33:13,0:15,2:0,31,0,2
chr2	37373982	.	A	AT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=105.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,19:0,10:0,0,20,11
chr2	37402270	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.411:39:11,8:12,7:12,11,9,7
chr2	37402373	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:8,9:9,6:4,13,3,12
chr2	37414431	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,5:4,3:6,1,8,0
chr2	37415496	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,6,1
chr2	37428743	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=152.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,28:0,21:0,0,43,7
chr2	37438274	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:0,3:3,1:0,4,0,4
chr2	37438299	.	TAAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	37443576	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:5,0:10,2:3,13,0,2
chr2	37447463	.	A	AAG	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:7,7:7,4:14,0,11,0
chr2	37447464	.	A	AG	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=149,129;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.193:25:13,1:7,4:20,0,5,0
chr2	37447465	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=144,147;MMQ=58,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.291:32:11,6:12,3:22,1,9,0
chr2	37447472	.	ATAT	A	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,19:0.548:35:6,10:7,9:0|1:37447472_ATAT_A:37447472:15,1,17,2
chr2	37447473	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,17:0,16:0,0,32,2
chr2	37447475	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=15,31;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.951:34:0,17:0,16:1,0,31,2
chr2	37447477	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,19:0.548:35:8,10:4,9:0|1:37447472_ATAT_A:37447472:15,1,17,2
chr2	37454946	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,1:8,1:6,14,1,1
chr2	37458668	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.404:44:10,8:16,7:12,14,8,10
chr2	37459208	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.598:33:7,8:6,11:10,3,18,2
chr2	37474386	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.552:29:3,4:9,12:8,5,9,7
chr2	37480249	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:5,0,8,0
chr2	37487307	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:2,2:4,0,2,0
chr2	37487341	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,1:3,3:7,5,3,1
chr2	37494489	.	TA	T,TAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27,19;MFRL=176,207,161;MMQ=60,60,60;MPOS=24,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.27,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.393,0.301:7:2,2,1:0,1,0:2,0,4,1
chr2	37506939	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,5:6,6:3,8,5,6
chr2	37513586	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr2	37516481	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,5:4,3:7,0,7,1
chr2	37520476	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,138;MMQ=60,21;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:1,0:9,3:0,10,0,3
chr2	37543294	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,37;MFRL=216,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr2	37543371	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=126,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.567:12:2,3:3,3:5,0,6,1
chr2	37586681	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.620:22:4,6:4,6:8,0,14,0
chr2	37595696	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:8,5:7,4:11,4,7,2
chr2	37599688	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=191,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,0:2,6:1,2,0,6
chr2	37599963	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,4:6,2:2,12,1,5
chr2	37599988	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:0,7,0,5
chr2	38178362	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr2	38179373	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,6,12
chr2	38202502	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	38244818	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=121.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.969:29:0,14:0,14:0|1:38244818_A_C:38244818:0,0,0,29
chr2	38244824	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=121.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,14:0,13:0|1:38244818_A_C:38244818:0,0,0,29
chr2	38526324	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=111.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.975:36:0,17:0,18:0|1:38526324_A_T:38526324:0,0,36,0
chr2	38526333	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.152:30:10,2:16,2:0|1:38526324_A_T:38526324:25,1,4,0
chr2	38526547	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.976:36:0,20:0,14:0,0,1,35
chr2	38537626	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,5:0,0,3,13
chr2	38540474	.	A	AAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	38542422	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:29,1:31,2:35,26,1,2
chr2	38542573	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr2	38545614	.	AG	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:10,1:21,2:27,5,0,3
chr2	38570462	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,2:15,1:13,10,2,1
chr2	38796893	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:2,2:4,10:6,0,12,0
chr2	38916906	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.403:20:5,4:7,3:10,2,5,3
chr2	38975107	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=195,285;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:4,2:10,0,2,0
chr2	38975332	.	G	GT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=17,35;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.287:18:1,1:4,2:2,11,1,4
chr2	39042639	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	39043298	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=105,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,25:0.560:44:9,15:8,7:10,9,13,12
chr2	39043388	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=149,173;MMQ=40,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0,7,0,2
chr2	39043413	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=155,128;MMQ=46,35;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:0,6,0,2
chr2	39043459	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	39050061	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr2	39075356	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,9:8,4:9,3,11,2
chr2	39090696	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,1,15
chr2	39108773	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=207,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr2	39117117	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=75,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:0,2:3,4:1,2,1,5
chr2	39148393	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,229;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr2	39164749	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=79,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:39164749_A_C:39164749:0,4,0,1
chr2	39164758	.	TT	GA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:39164749_A_C:39164749:0,3,0,1
chr2	39164762	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:39164749_A_C:39164749:0,3,0,1
chr2	39198966	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=100.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,31:0.534:58:11,16:16,14:21,6,26,5
chr2	39214821	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=226,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	39224351	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:2,9:8,4:9,1,13,0
chr2	39224615	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.630:9:2,1:1,5:0,3,0,6
chr2	39233500	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,1:4,1:9,0,3,0
chr2	39239572	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	39240584	.	TA	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.138:31:7,2:11,2:26,1,4,0
chr2	39241841	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.148:45:14,6:25,0:38,1,6,0
chr2	39251375	.	T	TCAC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=171,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAC;STR;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:4,2:5,6:0,9,0,8
chr2	39262296	.	CA	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:14,0:14,4:28,6,4,0
chr2	39262303	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.134:42:16,5:21,0:30,7,5,0
chr2	39281730	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=195,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:5,3,7,0
chr2	39403235	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=121,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:3,17,1,1
chr2	39440727	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr2	39479122	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=217,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	39494469	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr2	39505516	.	TA	T,TAA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,25,28;MFRL=129,127,138;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.71,4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,4,5:0.128,0.155:33:7,0,2:17,3,2:17,7,6,3
chr2	39505521	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=151,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:13,0:19,5:21,11,5,0
chr2	39514136	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,37;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr2	39526842	.	A	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=238.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,35:0,28:0,0,49,16
chr2	39530136	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:9,0,7,0
chr2	39552837	.	AAT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,3:12,0:22,4,2,1
chr2	39553271	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.492:49:14,10:10,14:18,7,16,8
chr2	39564620	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:8,3:8,5:12,4,7,1
chr2	39570427	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.512:16:4,1:2,7:8,0,7,1
chr2	39570529	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,2:10,1:11,13,3,0
chr2	39944055	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=203,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,6:3,3:8,0,9,0
chr2	39964206	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:8,2:8,1:2,16,0,3
chr2	39993167	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,28:0.409:69:30,18:10,9:31,10,21,7
chr2	40402115	.	A	ACCAAATCCAGCAGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=288,249;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.482:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr2	40402275	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.628:17:3,6:3,4:6,0,11,0
chr2	40404839	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:4,0,3,2
chr2	42174777	.	A	ACG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42174777_A_ACG:42174777:0,2,0,1
chr2	42174779	.	T	TTAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42174777_A_ACG:42174777:0,2,0,1
chr2	42275726	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	42280324	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,18;MFRL=167,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:42280324_T_G:42280324:2,0,1,0
chr2	42280328	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=18,29;MFRL=167,241;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:42280324_T_G:42280324:2,0,1,0
chr2	42280330	.	TC	GG,TGGGCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,17,17;MFRL=0,241,167;MMQ=60,60,60;MPOS=10,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.59,3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.336,0.497:3:0,0,0:0,0,0:0,0,3,0
chr2	42280335	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=12,31;MFRL=241,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr2	42282632	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=206,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:1,1:5,2:0,7,0,3
chr2	42488198	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	42491751	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,25:0.553:45:10,14:10,11:15,5,17,8
chr2	42492191	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:3,3:2,4:0,6,0,8
chr2	42511903	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:5,6:5,4:2,8,1,9
chr2	42515388	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,14:0,6:0,0,10,10
chr2	42515437	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,4:3,1:3,6,1,4
chr2	42522756	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=14,32;MFRL=155,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.823:7:0,4:0,2:0,1,0,6
chr2	42553210	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:6,8:6,4:10,2,10,2
chr2	42556022	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=153,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,5:3,3:8,3,5,3
chr2	42588195	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:10,10:13,3:21,2,13,0
chr2	42671449	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:9,11,0,2
chr2	42836516	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr2	42909672	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=131,132;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:4,15,0,3
chr2	42922888	.	ATT	A,AT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,30,30;MFRL=125,131,195;MMQ=60,60,60;MPOS=26,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.50,14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,3,9:0.116,0.314:30:2,1,5:11,2,3:11,7,10,2
chr2	42935961	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.497:28:11,7:3,6:11,3,14,0
chr2	42935979	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:11,11:9,7:14,6,15,3
chr2	42996759	.	AAGAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AG;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	42996819	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:8,5:1,5:4,5,5,5
chr2	42997614	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:2,3:7,1,4,3
chr2	43015612	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr2	43015814	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.704:15:3,6:1,4:0,4,0,11
chr2	43019730	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr2	43451739	.	C	CCTGCTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=CTG;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr2	43452618	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,2:2,6:1,6,1,7
chr2	43514036	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,9:0,0,14,5
chr2	43514226	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=165,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr2	43571184	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=194,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,0:6,3:16,1,3,0
chr2	43754992	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:10,7:6,9:11,5,12,4
chr2	43768233	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:10,1:12,2:23,2,2,1
chr2	43778857	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.768:15:2,9:1,3:3,0,12,0
chr2	43787576	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,2:8,9:0,13,0,11
chr2	43793963	.	T	TA,TAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29,30;MFRL=221,212,205;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,17,18;RU=A;STR;TLOD=3.70,3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.318,0.292:11:3,2,2:2,1,1:0,5,0,6
chr2	43798792	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr2	43799070	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	43800174	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,2:2,4:0,7,1,5
chr2	43802261	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	43817950	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:4,7:10,3:10,5,6,4
chr2	43871983	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:4,14:11,7:2,13,1,20
chr2	43872032	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr2	43902511	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr2	43902585	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:19,0:14,4:18,15,0,4
chr2	43903066	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=144.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,23:0,18:0,0,19,24
chr2	43903483	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr2	43905898	.	G	GAGGTGGAGGTGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,2:0,0,9,0
chr2	43921489	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,5:2,0:6,0,5,0
chr2	43927807	.	TCTG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=202,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43927807_TCTG_T:43927807:0,1,0,1
chr2	43927815	.	GG	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=202,203;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43927807_TCTG_T:43927807:0,1,0,1
chr2	43937500	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:3,6:9,5:3,9,1,10
chr2	43937579	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=212,261;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:14,0:7,5:13,8,0,5
chr2	43937646	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=140,92;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.121:27:14,2:9,0:18,6,3,0
chr2	43939525	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:4,2:1,11,0,3
chr2	43947944	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,4:0,5:0,0,0,11
chr2	43953664	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr2	43965705	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr2	43985940	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	43991310	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:11,5:8,6:19,0,11,0
chr2	43991357	.	A	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=196.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,33:0,19:0,0,41,13
chr2	44001139	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr2	44004099	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.299:24:8,4:9,2:0,17,0,7
chr2	44010620	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=117,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,5:5,6:6,4,9,2
chr2	44022970	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:0,0:3,2:4,0,2,0
chr2	44071625	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,9,3
chr2	44071639	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr2	44071833	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	44079004	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr2	44079572	.	CG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:5,1:1,12,1,1
chr2	44079666	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:9,2:11,2,3,0
chr2	44101214	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	44101649	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.951:16:0,7:0,9:0,0,3,13
chr2	44101711	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr2	44102235	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=194,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:2,1:2,3:5,0,4,0
chr2	44104610	.	ACT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=220,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,1:4,0,3,0
chr2	44116836	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=77,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:1,4:4,8:4,1,12,0
chr2	44117575	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:26,0:23,2:9,41,1,2
chr2	44121612	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,3:12,0:20,1,3,0
chr2	44123672	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=125,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:7,0,4,1
chr2	44145374	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:4,4,4,2
chr2	44152180	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,0:4,1,3,0
chr2	44161854	.	G	GA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.542:34:7,6:8,12:12,3,14,5
chr2	44172444	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,5:4,9:4,3,12,2
chr2	44173422	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,1:5,5:1,6,0,6
chr2	44436529	.	TA	CG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	44445604	.	GTT	G,GT,GTTT,GTTTT	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=33,33,34,35,35;MFRL=146,163,163,153,147;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=8,10,14,11;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13,14;RU=T;STR;TLOD=9.11,18.87,9.36,3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:49,7,12,7,3:0.080,0.155,0.102,0.054:78:20,6,7,4,1:27,1,5,3,2:42,7,25,4
chr2	44471313	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,4:6,1:14,1,5,0
chr2	44512971	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	44531484	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,10:0,0,5,12
chr2	44548613	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.381:40:10,7:15,8:3,22,0,15
chr2	44556298	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=164,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:4,2:6,4:0,11,0,7
chr2	44569474	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=237,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr2	44569700	.	AAAT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=173,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:10,4:4,4:3,11,1,7
chr2	44570804	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=213,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	44573624	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr2	44617324	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,5,0
chr2	44934524	.	CT	C,CTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=144,158,143;MMQ=60,60,60;MPOS=7,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=7.29,5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,4,4:0.142,0.141:32:15,1,1:9,3,3:16,8,6,2
chr2	44999273	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=172,213834;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,4:8,0:1,12,1,3
chr2	45773816	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.518:10:1,2:2,3:4,1,5,0
chr2	45774050	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chr2	45801952	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=223,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45801952_G_T:45801952:0,1,0,1
chr2	45801954	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=223,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45801952_G_T:45801952:0,1,0,1
chr2	45801957	.	A	ATTTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=223,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45801952_G_T:45801952:0,1,0,1
chr2	45806963	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.374:11:5,0:2,4:7,0,3,1
chr2	45826526	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:7,0,7,0
chr2	45826738	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,106;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:29,0:30,3:32,27,0,3
chr2	45829286	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=225,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr2	45879217	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,18;MFRL=189,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:2,1:0,4,2,0
chr2	45879610	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr2	46583923	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:9,11,1,1
chr2	46603671	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,12,9
chr2	46605954	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr2	46739157	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,1:3,2:4,1,3,1
chr2	46808243	.	GGA	G	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=125,153;MMQ=36,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=95.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,27:0.518:52:10,14:14,12:8,17,10,17
chr2	46808285	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=152,123;MMQ=40,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:18,1:25,0:7,36,0,2
chr2	46818992	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,3:5,6:7,1,7,2
chr2	46819815	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr2	46839477	.	T	C	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,37:0.414:86:19,15:26,15:0|1:46839477_T_C:46839477:23,26,10,27
chr2	46839487	.	GA	G	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=17,31;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:61,7:0.108:68:13,2:10,3:1|0:46839477_T_C:46839477:17,44,1,6
chr2	46845849	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:7,4:1,6:8,0,11,0
chr2	46851183	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr2	46985572	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=190,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	46987544	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.544:35:7,14:8,5:11,5,11,8
chr2	46988726	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,151;MMQ=40,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.420:29:6,5:11,7:13,4,7,5
chr2	46990012	.	TAC	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=190,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.447:16:4,0:5,7:9,0,7,0
chr2	47045267	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.546:27:5,5:7,8:10,2,12,3
chr2	47049409	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr2	47081092	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr2	47083030	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,3,0
chr2	47083041	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:3,7:0,1:0|1:47083041_TA_T:47083041:5,0,7,2
chr2	47083044	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:5,7:0,2:0|1:47083041_TA_T:47083041:5,0,7,2
chr2	47085398	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=192,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:3,3:4,1:0,8,1,4
chr2	47132834	.	TAAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=9,28;MFRL=254,297;MMQ=47,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.404:3:0,1:0,0:0,2,0,1
chr2	47184192	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:1,15,0,2
chr2	47233090	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:16,4:7,5:16,7,7,2
chr2	47251555	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,7:3,5:0,10,0,12
chr2	47277207	.	CA	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:5,2:1,3:2,5,1,4
chr2	47288179	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr2	47314052	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	47357458	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,5,19
chr2	47380203	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,9:0,0,2,19
chr2	47382214	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr2	47388765	.	CA	GG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,20,0
chr2	47600581	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	47612224	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:6,0,5,0
chr2	47613699	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,21:0.370:57:19,11:17,9:16,20,9,12
chr2	47630550	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=12,32;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=107.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.966:32:0,16:0,15:1,0,6,25
chr2	47630639	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,10:0,0,0,14
chr2	47635523	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	47693706	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=37,25;MFRL=204,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,5:0,2:4,0,7,0
chr2	47693788	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:11,10:13,7:16,8,10,7
chr2	47693959	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.316:39:13,7:14,5:8,19,1,11
chr2	47703731	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:9,0:11,3:4,17,0,3
chr2	48010488	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:8,4:10,5:2,16,2,8
chr2	48018081	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:10,4:6,10:13,3,8,6
chr2	48018164	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=62.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.513:39:9,10:10,10:12,7,10,10
chr2	48018314	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:2,4:4,1:3,3,1,4
chr2	48022981	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=165,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr2	48030458	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	48032740	.	A	AT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=57.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,26:0.790:33:3,12:4,10:7,0,20,6
chr2	48032874	.	ACTAT	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTAT;STR;TLOD=164.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.977:37:0,16:0,19:0,0,5,32
chr2	48032937	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,9:0,0,1,20
chr2	48033551	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=177.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,22:0,26:0,0,25,23
chr2	48033890	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=94,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.528:10:2,4:2,1:3,2,5,0
chr2	48040904	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,5:0,10:0,0,14,3
chr2	48046012	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,28,31,28;MFRL=179,199,176,190;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,26,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.05,6.93,6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:17,2,5,4:0.081,0.170,0.157:28:6,1,1,3:10,1,4,1:6,11,5,6
chr2	48066232	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=211,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,1:5,2:0,9,0,3
chr2	48132690	.	GGCT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	48589683	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:2,3:6,4:8,0,7,0
chr2	48688258	.	ATT	A,AT	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=31,27,28;MFRL=161,66,135;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.49,26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,4,16:0.097,0.330:48:17,2,8:4,1,7:24,4,18,2
chr2	48734576	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	48738388	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr2	48738687	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr2	48807717	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.228:16:5,3:7,0:12,1,3,0
chr2	48818752	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=198,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:3,3:5,3,5,3
chr2	48819091	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:48819091_A_T:48819091:0,4,0,1
chr2	48819093	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:48819091_A_T:48819091:0,4,0,1
chr2	48844968	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,17,3
chr2	48873512	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:2,1:9,0,2,0
chr2	48906625	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,7:0,0,2,14
chr2	48925746	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	48952701	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	48956417	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=109,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	48982622	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=78,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.431:9:2,1:3,1:2,3,2,2
chr2	48982758	.	TGCA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=219,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCA;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,1:0,0:2,1,1,0
chr2	49191105	.	G	GTCTTCCCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	49191124	.	A	ATCAATTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	49191192	.	GA	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=249,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:49191192_GA_TT:49191192:0,1,0,1
chr2	49191196	.	T	TTATTGCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=249,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49191192_GA_TT:49191192:0,1,0,1
chr2	49244559	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,37;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,4:6,2:12,0,6,0
chr2	50246249	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr2	50280338	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,2:6,3:7,0,5,0
chr2	50280771	.	AA	TC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:7,0:0,13,0,2
chr2	50434759	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:50434759_C_G:50434759:3,1,1,1
chr2	50434761	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:50434759_C_G:50434759:3,1,1,1
chr2	50464117	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr2	50693504	.	AAC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:4,2:7,0,2,1
chr2	50755683	.	GCT	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CT;STR;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:10,1:13,3:20,4,3,1
chr2	50758309	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=208,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,4,1
chr2	50758657	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=251,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	50765297	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=216,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:4,2,4,0
chr2	50780219	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	50858107	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,14,1
chr2	51149072	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=177,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.503:38:9,7:9,12:5,14,7,12
chr2	51149102	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,6:6,5:3,9,0,11
chr2	53832076	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,120;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:4,9,0,2
chr2	53927742	.	G	GGTCCAAAGAGTCCTTCTACCTACCCATCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=261,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr2	53994929	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=176,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:5,3:3,6:9,0,10,0
chr2	54024626	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,3:5,3:8,5,5,1
chr2	54024957	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,5:4,1:3,3,1,5
chr2	54035374	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chr2	54041944	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:13,1,1,1
chr2	54042132	.	CTTT	C,CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20,19;MFRL=0,176,165;MMQ=60,60,49;MPOS=26,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,18,42;RU=T;STR;TLOD=3.82,14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,6:0.279,0.635:8:0,0,0:0,1,0:0,0,0,8
chr2	54114967	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,5:5,8:12,1,8,5
chr2	54116003	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,2:2,6:0,10,2,6
chr2	54122956	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,3:0,14:0,0,1,17
chr2	54125185	.	GA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,236;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,2:11,1:2,20,0,3
chr2	54126941	.	CA	TG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=184,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:5,1:14,1,1,1
chr2	54126942	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=190,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.208:16:6,3:5,0:12,1,2,1
chr2	54126947	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=182,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:13,1,1,1
chr2	54135429	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,1:6,5:9,1,5,1
chr2	54135871	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:27,3:24,0:43,8,3,0
chr2	54146387	.	GAA	G,GA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=16,25,15;MFRL=171,66,126;MMQ=60,60,60;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.34,3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,2,5:0.101,0.203:26:0,1,0:1,0,0:0,19,0,7
chr2	54152927	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=215,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	54155240	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:8,2:3,3:8,3,4,2
chr2	54158957	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:4,5:5,10:6,3,12,3
chr2	54161885	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.342:10:2,0:3,3:0,7,0,3
chr2	54163854	.	G	GA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=143,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:24,3:12,1:36,1,4,1
chr2	54483443	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:5,6:4,6:2,7,2,10
chr2	54494370	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=136.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,20:0,16:0,0,25,12
chr2	54562101	.	T	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,113;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,4:0.065:74:30,4:39,0:26,44,4,0
chr2	54839276	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.474:36:9,9:10,7:16,3,11,6
chr2	54850559	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:3,8:8,4:9,2,9,3
chr2	54855137	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=231,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr2	54894649	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,5:6,1:6,0,6,0
chr2	55044108	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.417:12:5,3:2,1:0,7,0,5
chr2	55071101	.	T	TTGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=162,216;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=20,23;RU=TG;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	55091029	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:13,5:6,3:6,13,2,6
chr2	55181351	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.424:17:3,3:6,3:0,10,0,7
chr2	55181382	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=165,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr2	55186229	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:4,3:3,4:5,3,4,3
chr2	55187295	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=217,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:55187295_G_A:55187295:1,0,3,0
chr2	55187297	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=217,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,2:0|1:55187295_G_A:55187295:1,0,3,0
chr2	55187310	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:55187295_G_A:55187295:3,0,1,0
chr2	55189931	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:0,4,0,6
chr2	55191321	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,1:2,4:0,8,0,5
chr2	55200800	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:8,3:7,12:6,9,3,12
chr2	55201038	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,1:3,4:0,11,0,5
chr2	55214618	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:5,2:3,6:6,2,6,3
chr2	55214912	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.699:18:5,3:0,9:0,5,2,11
chr2	55276923	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,337;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55276923_T_G:55276923:0,0,0,1
chr2	55276926	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,337;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55276923_T_G:55276923:0,0,0,1
chr2	55276935	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,337;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55276923_T_G:55276923:0,0,0,1
chr2	55404925	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr2	55407754	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,17,5
chr2	55407785	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=166,151;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:11,0:21,2:0|1:55407785_G_T:55407785:21,11,0,2
chr2	55407788	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=166,151;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:10,0:20,2:0|1:55407785_G_T:55407785:21,11,0,2
chr2	55407935	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr2	55436488	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:7,3:9,1,3,0
chr2	55439963	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,2,17
chr2	55460605	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,5,18
chr2	55461369	.	TA	T,TAA	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=28,31,28;MFRL=172,128,142;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=6.37,5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:45,5,5:0.097,0.102:55:20,1,5:22,4,0:11,34,2,8
chr2	55463694	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr2	55471407	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr2	55473371	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=185,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr2	55473386	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,4:0,8:0,0,13,0
chr2	55473681	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	55476591	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,6:3,3:2,4,2,7
chr2	55489629	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	55490745	.	CAA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=106,74;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.433:5:2,1:0,1:2,1,2,0
chr2	55518742	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr2	55523309	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	55527108	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr2	55528257	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	55528514	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	55559671	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=20,19;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,0:3,1:0|1:55559671_C_A:55559671:8,1,2,0
chr2	55559674	.	CTG	AAT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:2,0:4,0:0|1:55559671_C_A:55559671:9,1,2,0
chr2	55559680	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:5,0:5,0:0|1:55559671_C_A:55559671:8,2,2,0
chr2	55566531	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:0,3:2,3:0|1:55566531_A_C:55566531:3,0,7,0
chr2	55566538	.	CTATT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:0,2:3,4:0|1:55566531_A_C:55566531:4,0,7,0
chr2	55576634	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,4:5,1:1,6,3,2
chr2	55582684	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=233,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,5:2,4:5,0,9,0
chr2	55589364	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:4,4:11,8:15,0,11,1
chr2	55589434	.	T	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,26:0.451:58:14,12:17,14:24,8,19,7
chr2	55747471	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:7,10:5,1:11,1,11,0
chr2	55760940	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr2	55764754	.	AATATGAATAC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.433:19:4,3:6,5:2,9,0,8
chr2	55771050	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.423:45:10,8:16,10:20,6,13,6
chr2	55771161	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=188.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,24:0,29:0,0,19,35
chr2	55791561	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,209;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:24,0:26,4:18,33,0,4
chr2	55795557	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=209,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:2,4:0,6,0,8
chr2	55800992	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:0,4:3,3:0,3,0,8
chr2	55844445	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:14,4:3,10:2,15,1,14
chr2	55863360	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr2	55867845	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr2	55871932	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:1,2:0,3,1,2
chr2	55873301	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,3:5,9:9,0,12,0
chr2	55883509	.	TA	T,TAA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,30,30;MFRL=159,164,178;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=11.13,5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,8,5:0.199,0.134:39:11,4,3:13,4,2:0,26,4,9
chr2	55887176	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:5,3:10,3:15,0,6,0
chr2	55889062	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=207.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,26:0,36:0,0,41,22
chr2	55889218	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=184,219;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,0:6,5:0,13,0,5
chr2	55894247	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=111,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:5,1:4,3:2,8,0,4
chr2	55899228	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,1,17
chr2	55900231	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=16,16;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,1:0,0:0,6,0,6
chr2	55900283	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=203,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr2	55913598	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=151,304712;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:4,14,1,1
chr2	56097778	.	CACA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=184,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=ACA;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	56102061	.	G	GA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:18,3:13,1:30,5,4,0
chr2	56149475	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,4:4,4:9,3,4,4
chr2	56216052	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	58381785	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:5,3:5,7:10,1,10,0
chr2	58387000	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	58390218	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=165,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.349:9:3,1:2,1:0,6,0,3
chr2	58390538	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,25:0.461:54:19,13:10,11:0|1:58390538_T_C:58390538:24,5,21,4
chr2	58390547	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=96.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,29:0.473:61:20,17:11,11:0|1:58390538_T_C:58390538:25,7,22,7
chr2	58390631	.	A	T	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.059:65:29,3:33,0:22,40,0,3
chr2	58421235	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	58453843	.	G	GA,GAA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,32,30;MFRL=140,121,140;MMQ=60,60,60;MPOS=26,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=25.14,8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,15,7:0.353,0.158:44:12,8,1:10,5,4:21,1,19,3
chr2	58453930	.	A	G	.	.	DP=106;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=160.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,52:0.520:100:20,26:28,26:23,25,18,34
chr2	58453950	.	T	C	.	.	DP=87;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=139,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,2:0.034:86:40,0:38,2:0|1:58453950_T_C:58453950:30,54,0,2
chr2	58453955	.	CAAT	C	.	.	DP=87;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,2:0.034:87:38,0:40,2:0|1:58453950_T_C:58453950:29,56,0,2
chr2	58453962	.	T	G	.	.	DP=80;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,2:0.037:80:35,0:35,2:0|1:58453950_T_C:58453950:22,56,0,2
chr2	58453972	.	A	T	.	.	DP=70;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=138,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,7:0.116:67:33,0:24,7:0|1:58453972_A_T:58453972:16,44,0,7
chr2	58453974	.	T	A	.	.	DP=66;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=141,179;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,7:0.119:65:30,0:25,7:0|1:58453972_A_T:58453972:16,42,0,7
chr2	58468267	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=181,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:58468267_C_T:58468267:11,0,2,0
chr2	58468275	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=177,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:58468267_C_T:58468267:14,0,2,0
chr2	58468395	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:22,0:24,3:24,23,0,3
chr2	59482217	.	T	TGACTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTC;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.816:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr2	59504776	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=158,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.483:21:7,6:3,4:1,10,2,8
chr2	60687959	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr2	60768978	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,26:0.380:69:24,12:18,14:36,7,21,5
chr2	60995514	.	AG	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=203,135;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:9,0,2,0
chr2	60997770	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	61007782	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr2	61009813	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.253:26:6,2:5,4:17,3,5,1
chr2	61009909	.	C	T	.	.	DP=104;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=85,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=313.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,95:0.979:97:0,45:1,47:0,2,23,72
chr2	61009938	.	AT	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.193:36:0,3:16,2:3,26,1,6
chr2	61020956	.	G	GAAT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:1,17,0,2
chr2	61021349	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,0,21
chr2	61121492	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=128.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,32,5
chr2	61128284	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr2	61145498	.	AT	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=187,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.166:27:8,1:13,3:11,12,0,4
chr2	61147617	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,187;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,1:14,1:26,0,2,0
chr2	61180288	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.572:33:4,11:10,8:1,13,0,19
chr2	61235855	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr2	61236167	.	A	ACCTAAATGCCTTATTTTCTTCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	61238897	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:4,1:10,3,2,0
chr2	61300556	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,3:10,0:20,3,3,0
chr2	61304002	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr2	61308517	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr2	61308569	.	AT	A,ATT	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=171,151,132;MMQ=60,60,60;MPOS=18,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=7.74,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,3:0.242,0.159:22:8,2,1:5,4,2:11,2,8,1
chr2	61336523	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,4:3,2:0,4,0,6
chr2	61389799	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=227,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,2:4,5:1,4,0,7
chr2	61412559	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,18,2
chr2	61413723	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:1,11:0,7:0,1,8,10
chr2	61415492	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:8,4:2,4:7,3,8,1
chr2	61417617	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=120.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,13:0,0,23,11
chr2	61433933	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,0:10,2:12,8,2,0
chr2	61468854	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=170,127;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:22,4:17,0:30,9,4,0
chr2	61510709	.	TGAGTGA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=221,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAGTGA;STR;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.717:8:0,4:2,1:0,2,1,5
chr2	61522123	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=112,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.945:33:0,15:1,17:0,1,20,12
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chr2	61566822	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,9;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.267:17:3,0:5,0:6,7,0,4
chr2	61566824	.	GAAA	G,TAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,15,9;MFRL=150,180,125;MMQ=60,60,60;MPOS=17,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.42,4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,4:0.271,0.275:13:2,0,0:1,1,1:3,2,0,8
chr2	61576517	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr2	61577667	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.196:28:13,0:8,5:21,2,5,0
chr2	61605379	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,4:5,0,7,0
chr2	61605614	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:3,7:8,4:0,11,0,11
chr2	61607510	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:0,6,1,4
chr2	61622251	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.410:42:9,7:15,10:21,4,13,4
chr2	61622374	.	TA	T,TAA	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,30,31;MFRL=142,158,157;MMQ=60,60,60;MPOS=19,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=16.02,6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,10,5:0.239,0.142:40:10,4,0:15,6,4:7,18,1,14
chr2	61697840	.	G	GC	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:14,1:8,2:9,13,0,3
chr2	61709747	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=224,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:0,3:1,1:0,2,0,6
chr2	61710320	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr2	61711008	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr2	61722519	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr2	61729258	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,6,14
chr2	61729268	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=10,33;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.943:20:0,8:0,11:0,1,5,14
chr2	61749690	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	61749716	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,12:0,0,18,3
chr2	62053546	.	CGCT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=99.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,22,1
chr2	62063093	.	TAA	T,TA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,28,25;MFRL=147,134,150;MMQ=60,60,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=10.05,10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,8,7:0.313,0.313:24:3,5,2:5,3,4:7,2,10,5
chr2	62066561	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:16,0:13,3:20,10,0,3
chr2	62066927	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,16,6
chr2	62081217	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,7:0,12:0,0,0,19
chr2	62099156	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,10,1
chr2	62104660	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,1:0,8:0,0,1,10
chr2	62107376	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr2	62362995	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=71,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr2	62729747	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=45.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr2	62729979	.	CTA	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.149:36:16,4:14,1:2,29,1,4
chr2	63170905	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=99.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,32:0.459:70:20,12:18,20:21,17,23,9
chr2	63176139	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.530:49:10,12:13,14:13,10,13,13
chr2	63182611	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.573:24:4,8:6,6:9,1,13,1
chr2	63182638	.	TCTTTG	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:16,0:13,1:30,7,3,0
chr2	63220992	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:18,2:10,2:28,1,4,0
chr2	63281140	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:4,1:2,9,1,1
chr2	63380809	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	63486429	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:3,3:6,0,4,2
chr2	63540324	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,6:6,3:12,0,9,0
chr2	63540523	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	63605430	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	63609017	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.645:20:2,5:4,8:7,0,10,3
chr2	63719887	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:6,7:11,7:17,0,14,0
chr2	64085114	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr2	64126765	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:0|1:64126765_A_G:64126765:0,5,0,4
chr2	64126775	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,5:0.545:9:1,3:3,2:1|0:64126765_A_G:64126765:0,4,0,5
chr2	64139831	.	TA	T,TAA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=12,29,14;MFRL=178,163,184;MMQ=60,60,60;MPOS=15,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=12.69,4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,10,4:0.230,0.109:42:4,3,1:5,4,0:2,26,1,13
chr2	64140301	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=113.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,15:0,0,32,5
chr2	64195997	.	C	CA,CAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=145,138,146;MMQ=60,60,60;MPOS=24,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=A;STR;TLOD=5.25,5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,4:0.250,0.216:20:6,2,3:5,2,1:10,1,8,1
chr2	64196186	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,0:14,2:0|1:64196186_A_G:64196186:0,22,0,2
chr2	64196191	.	T	TG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:11,2:0|1:64196186_A_G:64196186:0,20,0,2
chr2	64196194	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:11,2:0|1:64196186_A_G:64196186:0,19,0,2
chr2	64196199	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:8,2:0|1:64196186_A_G:64196186:0,16,0,2
chr2	64210979	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:8,1,3,0
chr2	64331815	.	CTT	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,6:3,2:6,0,8,0
chr2	64331834	.	CC	AA	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.143:25:7,0:6,0:19,3,3,0
chr2	64331842	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:12,0:8,0:19,4,3,0
chr2	64682364	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	64794812	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=143,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:15,0:23,2:0|1:64794812_G_C:64794812:18,23,1,1
chr2	64794815	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=143,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:17,0:22,2:0|1:64794812_G_C:64794812:18,23,1,1
chr2	65231063	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.670:19:2,6:2,7:5,1,8,5
chr2	65298646	.	GAAC	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAC;STR;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.306:30:9,3:11,4:13,8,4,5
chr2	65315880	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=154,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:1,2,1,3
chr2	65315903	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=199,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr2	65473930	.	AAAATTTTC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=165,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,4:1,2:1,2,0,6
chr2	65481008	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,0,20
chr2	65488538	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,3,26
chr2	65495887	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=127.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,17:0,24:0,0,7,35
chr2	65559027	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=215,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,4:1,8:4,0,11,1
chr2	65604914	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=99,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,0,4
chr2	66662875	.	CTTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=36,22;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=24,21;RU=T;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.805:7:1,2:0,1:1,0,5,1
chr2	66665146	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	66667180	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=262,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0|1:66667180_C_T:66667180:0,3,0,3
chr2	66667186	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.874:6:0,0:0,2:0|1:66667180_C_T:66667180:0,0,0,6
chr2	66667788	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=157,177;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:19,0:13,4:0,32,0,4
chr2	66796098	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=152,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.191:22:13,1:5,3:13,5,2,2
chr2	66798282	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	67637059	.	T	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=148,150;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:31,3:25,0:40,17,3,0
chr2	67637196	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=159.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,25:0,25:0,0,11,40
chr2	68273283	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:18,0:19,3:8,29,0,3
chr2	68274510	.	C	CA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=159,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.189:24:8,2:12,2:0,20,0,4
chr2	68358329	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:11,3,1,1
chr2	68366070	.	A	AGTAGAGAAATGAATGAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=249,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:68366070_A_AGTAGAGAAATGAATGAC:68366070:0,1,0,1
chr2	68366073	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=249,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:68366070_A_AGTAGAGAAATGAATGAC:68366070:0,1,0,1
chr2	68366078	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=216,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:68366070_A_AGTAGAGAAATGAATGAC:68366070:0,2,0,1
chr2	68366087	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	68389276	.	GA	G,GAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=165,193,214;MMQ=60,60,60;MPOS=9,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.20,3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,2:0.198,0.214:11:4,2,2:3,0,0:7,0,4,0
chr2	68389557	.	TTA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=186,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,1:7,1:5,11,2,0
chr2	68402012	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,267;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr2	68402049	.	C	CCCCACCTCCCATCTATAGTACAGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=207,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	68415563	.	CTT	C,CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32,34;MFRL=140,144,170;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=6.30,13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,7:0.268,0.456:15:0,1,6:4,3,1:3,1,11,0
chr2	68444143	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=27,26,25;MFRL=156,172,166;MMQ=60,60,60;MPOS=10,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=AC;STR;TLOD=6.09,43.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,4,15:0.100,0.458:38:11,2,6:4,2,8:18,1,19,0
chr2	68444168	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,31:0.462:68:21,10:12,16:32,5,27,4
chr2	68444171	.	C	G	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,41:0.581:71:13,18:8,22:25,5,34,7
chr2	68546304	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	68592584	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,10:0,18:0,0,5,24
chr2	68615654	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=121.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.947:35:1,17:0,17:0,1,6,28
chr2	68620199	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=104,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	68620410	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,3,20
chr2	68621338	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,4,18
chr2	68622952	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=145.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,22:0,18:0,0,15,25
chr2	68772281	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.463:13:3,2:3,4:4,3,4,2
chr2	68805241	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	68962266	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=188,258;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:18,3:13,0:31,2,3,0
chr2	69002281	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,1:6,1:9,3,3,1
chr2	69009304	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:4,4:4,2:6,2,6,1
chr2	69043539	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	69045158	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,17:0,0,3,25
chr2	69201894	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:0,12,1,7
chr2	69351608	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,3:6,0:0|1:69351608_G_A:69351608:11,0,3,0
chr2	69351611	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:0|1:69351608_G_A:69351608:11,0,3,0
chr2	69409029	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,10:0,0,9,19
chr2	69420596	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,5:0,0,0,12
chr2	69475343	.	GT	G,GTTT	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=145,133,178;MMQ=60,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,13;RU=T;STR;TLOD=4.96,6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,5,3:0.100,0.085:44:17,2,2:15,3,1:9,27,4,4
chr2	69553375	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=10,19;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,1:0,0:0,1,1,3
chr2	69573029	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=134.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,20:0,0,31,6
chr2	69586293	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,17,1
chr2	69586370	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=165.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,19:0,26:0,0,36,10
chr2	69614161	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	69642513	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,31,20;MFRL=196,209,178;MMQ=60,41,60;MPOS=7,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.67,6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,4:0.249,0.248:17:7,3,2:2,1,1:0,9,0,8
chr2	69754549	.	AA	CC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr2	70031797	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:5,7:14,4:0,19,1,10
chr2	70033711	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,3:4,6:0,7,0,9
chr2	70037841	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=116,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.132:21:12,1:5,1:8,11,0,2
chr2	70066521	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:10,0:18,0,3,0
chr2	70066571	.	CT	C,CTT	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=34,32,32;MFRL=161,145,143;MMQ=60,60,60;MPOS=12,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=8.45,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,6,3:0.180,0.096:33:15,4,0:8,1,3:22,2,8,1
chr2	70068258	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=205,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:8,2:2,3:0,10,0,5
chr2	70070184	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=171,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:1,1:6,0,2,1
chr2	70076954	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=198,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.595:23:1,6:8,6:0,9,0,14
chr2	70098983	.	TGG	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=159,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:0|1:70098983_TGG_T:70098983:4,14,0,2
chr2	70098989	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:0|1:70098983_TGG_T:70098983:3,14,0,2
chr2	70098990	.	T	TTC	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:0|1:70098983_TGG_T:70098983:3,14,0,2
chr2	70098994	.	CATAA	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=159,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:0|1:70098983_TGG_T:70098983:3,15,0,2
chr2	70099000	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=156,124;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:0|1:70098983_TGG_T:70098983:2,13,0,2
chr2	70121197	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,31:0.403:77:23,15:21,14:14,32,5,26
chr2	70131320	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.506:26:6,6:6,5:12,1,13,0
chr2	70189331	.	GACACACACAC	G,GACAC,GACACAC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35,30,31;MFRL=0,179,162,164;MMQ=60,60,60,60;MPOS=29,25,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,11,13,14;RU=AC;STR;TLOD=6.22,10.20,10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,4,4:0.166,0.282,0.483:10:0,1,2,1:0,1,1,2:0,0,3,7
chr2	70396811	.	A	AGGAAGTGAATGTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70396811_A_AGGAAGTGAATGTC:70396811:0,4,0,1
chr2	70396814	.	CA	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70396811_A_AGGAAGTGAATGTC:70396811:0,4,0,1
chr2	70402770	.	A	AC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=127,168;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:7,3:10,0:15,6,4,0
chr2	70456248	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:23,2:14,1:8,30,1,2
chr2	70457809	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,15;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.348:27:5,0:6,0:16,1,10,0
chr2	70463334	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,179;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.586:10:1,5:3,0:0,4,1,5
chr2	70486407	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=204,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,4:6,1:8,0,5,0
chr2	70486475	.	G	GT	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=119,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:8,8:8,6:13,3,14,3
chr2	70502811	.	T	TTCTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,4:6,5:1,7,2,7
chr2	70520846	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:9,3:3,6:1,11,0,9
chr2	70520875	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:0,10,0,6
chr2	70524681	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=206,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	70529242	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=167,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,3:3,1:1,5,0,4
chr2	70905099	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:0,5,0,7
chr2	70906115	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.554:32:9,8:4,8:2,12,5,13
chr2	70915134	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=112,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.673:28:3,10:5,9:7,2,16,3
chr2	70915320	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:2,2:4,4:0|1:70915320_T_A:70915320:0,7,0,6
chr2	70915323	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:0|1:70915320_T_A:70915320:0,7,0,6
chr2	70915347	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=197,262;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.251:6:2,0:1,1:0|1:70915347_C_CT:70915347:0,5,0,1
chr2	70915353	.	A	ACCTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=208,262;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:70915347_C_CT:70915347:0,3,0,1
chr2	71004368	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=159,173;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:5,7:9,13:14,0,20,0
chr2	71004413	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=34,25,32;MFRL=166,156,104;MMQ=60,53,60;MPOS=22,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=A;STR;TLOD=3.68,10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,9:0.093,0.357:22:6,0,3:4,1,2:10,1,5,6
chr2	71004492	.	T	C	.	.	DP=120;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,61:0.519:118:26,21:29,38:0|1:71004492_T_C:71004492:18,39,26,35
chr2	71004494	.	A	T	.	.	DP=119;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,61:0.519:118:24,23:27,38:0|1:71004492_T_C:71004492:18,39,26,35
chr2	71004891	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr2	71017516	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,1:2,3:5,0,3,1
chr2	71039828	.	C	CTGTAGCCG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	71046935	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:20,2:20,1:26,14,2,1
chr2	71062535	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=195,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr2	71062833	.	G	GC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=139.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,21:0,21:0,0,23,19
chr2	71160421	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,5:3,3:0,3,0,8
chr2	71162996	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	71163225	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.355:23:5,3:8,2:1,14,1,7
chr2	71185581	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	71205976	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:11,3:6,6:1,16,0,9
chr2	71206267	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.587:8:3,2:0,1:3,0,5,0
chr2	71215898	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=194,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.216:15:4,2:8,0:3,9,0,3
chr2	71215941	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=206,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,3:4,3,6,1
chr2	71297695	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.548:40:9,14:9,8:8,10,12,10
chr2	71297982	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=160.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,22:0,25:0,0,16,36
chr2	71357417	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=9,29;MFRL=265,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=165.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,50:0.979:51:0,19:0,29:0,1,27,23
chr2	71357710	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	71360723	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=170.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,20:0,20:0|1:71360723_A_G:71360723:0,0,0,42
chr2	71360735	.	T	TTCC	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCC;STR;TLOD=154.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,16:0,16:0|1:71360723_A_G:71360723:0,0,0,36
chr2	71361332	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,7:0,0,0,20
chr2	71366876	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr2	71375065	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr2	71417134	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,4:2,3:5,4,2,5
chr2	71429725	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=179,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:3,7:7,7:2,8,1,13
chr2	71429750	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:0,6,1,7
chr2	71582741	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:15,0,2,0
chr2	71607539	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:8,12:7,8:6,9,14,6
chr2	71620818	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	71626679	.	CT	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=54.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.487:43:8,6:14,15:14,8,13,8
chr2	71626824	.	TT	CC	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=161,93;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.059:49:25,0:17,2:14,33,1,1
chr2	71626828	.	CT	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=161,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:24,0:11,3:7,28,1,2
chr2	71627539	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.447:45:16,9:9,11:24,1,20,0
chr2	71635931	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,13:0,0,6,18
chr2	71645628	.	G	GTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=243,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=T;STR;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.694:8:0,3:2,1:2,0,6,0
chr2	71645828	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=142,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,6:5,5:1,9,1,10
chr2	71645854	.	TGTA	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:0,8,0,7
chr2	71645890	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	71651691	.	G	GT	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=157,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:31,3:17,1:44,4,4,0
chr2	71651939	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:8,7:10,11:2,16,0,18
chr2	71658499	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=170,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.058:67:25,0:35,3:0|1:71658499_A_G:71658499:37,27,0,3
chr2	71658502	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=163,84;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,4:0.072:67:24,0:35,4:0|1:71658499_A_G:71658499:39,24,0,4
chr2	71658617	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=179,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:18,0:19,1:1,38,0,2
chr2	71658627	.	AG	CA,CG	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=26,35,29;MFRL=182,179,188;MMQ=60,50,60;MPOS=22,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.35,6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,2,3:0.069,0.092:40:19,1,0:15,1,3:1,34,0,5
chr2	71658647	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=202,195;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,1:9,2:0,21,0,3
chr2	71661855	.	C	CA	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=105.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,41:0.560:73:12,19:18,21:24,8,35,6
chr2	71738977	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.658:15:2,3:2,7:1,4,6,4
chr2	71747235	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,3:3,6:6,0,8,1
chr2	71747899	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:5,7:7,5:10,2,13,0
chr2	71755380	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	71755433	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:3,2:9,0:10,3,2,0
chr2	71762310	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:3,5:9,7:6,6,9,3
chr2	71796865	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr2	71797712	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:6,0,4,1
chr2	71797762	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.575:19:4,6:2,4:6,2,10,1
chr2	71801267	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=193,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr2	71801564	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=212,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr2	71829821	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr2	71838296	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:5,2,3,0
chr2	71838443	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.450:31:8,7:9,6:6,11,4,10
chr2	71838463	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:7,6:7,5:2,12,3,8
chr2	71838852	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	71871039	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,2:0,0,8,2
chr2	71871188	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.468:45:9,12:15,9:15,9,9,12
chr2	71871236	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=98.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,9,18
chr2	71883203	.	TT	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=215,263;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:71883203_TT_GA:71883203:3,0,1,0
chr2	71883207	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=210,263;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:71883203_TT_GA:71883203:2,0,1,0
chr2	71891361	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr2	71896891	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,2:3,0:1,7,0,2
chr2	71901286	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,2:1,2:2,1,3,2
chr2	71906171	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr2	71909822	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,2,7
chr2	72359312	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:2,3:2,1:4,0,5,0
chr2	72361865	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:6,1,4,1
chr2	72692272	.	A	AAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=75.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,16,1
chr2	72725735	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0,2,0,2
chr2	72740261	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:23,2:32,1:38,18,1,2
chr2	72741728	.	TAAATAA	T,TATAA	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=27,25,25;MFRL=142,169,171;MMQ=60,60,40;MPOS=33,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.62,38.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,10:0.146,0.738:14:1,1,3:0,2,7:1,0,13,0
chr2	72741732	.	TAA	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=159,147;MMQ=41,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.230:15:9,0:3,3:12,0,3,0
chr2	72741734	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=149,159;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.780:22:4,8:3,7:7,0,15,0
chr2	72742069	.	AAC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr2	72742083	.	GACAC	G,GAC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32,32;MFRL=0,176,138;MMQ=60,60,60;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=AC;STR;TLOD=7.04,27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,9:0.237,0.700:12:0,0,5:0,3,4:0,0,12,0
chr2	72786528	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:8,6:3,12:9,2,16,2
chr2	72958022	.	T	TAAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=60.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,14,0
chr2	73188192	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=210,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr2	73249726	.	G	GCCTGTTACAATCATGGCCAT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=79,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:11,9,0,2
chr2	73249755	.	GG	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73249755_GG_AT:73249755:0,0,0,1
chr2	73249759	.	A	AGGTTGCAGTGAGCCTCG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73249755_GG_AT:73249755:0,0,0,1
chr2	73339430	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	73471193	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.684:4:1,0:0,2:1,0,2,1
chr2	73478600	.	G	GTGCTGTGCGTCCAGAACAAAATCATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=226,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:73478600_G_GTGCTGTGCGTCCAGAACAAAATCATT:73478600:0,2,0,1
chr2	73478606	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=226,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:73478600_G_GTGCTGTGCGTCCAGAACAAAATCATT:73478600:0,2,0,1
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chr2	73650122	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:3,4:4,9:0,7,2,11
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chr2	73675227	.	T	TCTC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTC;STR;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.420:24:10,3:4,5:5,9,3,7
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chr2	73677548	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:8,5:5,5:6,7,7,3
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chr2	73928098	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.468:49:12,13:14,9:20,6,13,10
chr2	73957227	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.415:15:5,2:3,4:1,8,0,6
chr2	73994074	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	74041431	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=223,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0|1:74041431_T_TA:74041431:0,1,0,1
chr2	74041433	.	C	CTACTCAAAGAGGGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=223,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74041431_T_TA:74041431:0,1,0,1
chr2	74041437	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=223,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74041431_T_TA:74041431:0,1,0,1
chr2	74057932	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:12,2,2,0
chr2	74076622	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,12;MFRL=158,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:3,0:1,0:0,10,0,2
chr2	74089266	.	GA	G,GAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34,33;MFRL=136,118,141;MMQ=60,60,60;MPOS=16,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.90,6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,4:0.220,0.201:22:9,4,3:2,0,1:11,2,8,1
chr2	74128361	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,37;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,1,0
chr2	74128369	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,1,0
chr2	74128391	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	74128433	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,12,4
chr2	74129389	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=178,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	74129474	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,3:5,5:5,4,8,0
chr2	74129664	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,3:5,5:7,4,2,6
chr2	74129712	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,3:5,6:8,3,6,3
chr2	74129849	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.185:19:11,0:5,3:4,12,1,2
chr2	74129895	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:4,3:1,3:0,6,1,5
chr2	74135380	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:4,2,1,4
chr2	74135732	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr2	74135797	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0,0,16,4
chr2	74140581	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,22,0
chr2	74140789	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	74143990	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr2	74184365	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:9,2:3,12,0,2
chr2	74392244	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=237,186;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.454:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	74491447	.	C	CACACACACACACACACACACACA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:12,0:2,2:1,13,0,2
chr2	74491507	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,37;MFRL=195,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	74595883	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,1:9,1:7,6,2,0
chr2	74597796	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,2:12,0:11,6,2,0
chr2	74598943	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74598943_A_AG:74598943:1,0,1,0
chr2	74598947	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74598943_A_AG:74598943:1,0,1,0
chr2	74601371	.	G	GCCCCCCCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,14;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCC:74601371:0,0,1,0
chr2	74601377	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCC:74601371:3,0,1,0
chr2	74601383	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:2,0:1,0:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCC:74601371:3,0,1,0
chr2	74649921	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,143;MMQ=42,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.773:7:0,4:1,1:1,0,4,2
chr2	74690611	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=613,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	74717122	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=13,13;MFRL=167,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.394:8:1,0:1,0:0|1:74717122_A_C:74717122:5,0,3,0
chr2	74717126	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=23,13;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.547:9:1,0:1,0:0|1:74717126_T_A:74717126:4,0,5,0
chr2	74717131	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=12,12;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:0,1:0,1:0|1:74717122_A_C:74717122:4,0,5,0
chr2	74717136	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.460:11:0,0:2,1:0|1:74717122_A_C:74717122:6,0,5,0
chr2	74717141	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:2,0:4,1:0|1:74717122_A_C:74717122:8,2,5,0
chr2	74717146	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=26,12;MFRL=143,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.273:16:4,0:6,0:0|1:74717126_T_A:74717126:9,3,4,0
chr2	74720002	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,15,4
chr2	74742388	.	T	TAAAATGGAGAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	74763574	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,2:5,0:3,8,0,2
chr2	74787501	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	74787507	.	G	GATACTCAGGCTCCATATGGTGTGGCAACT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=106,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	74885063	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:19,2:13,1:13,20,0,3
chr2	74900495	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,0:0,0,8,0
chr2	74901712	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=159,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.107:35:17,1:14,0:0|1:74901712_C_A:74901712:18,14,2,1
chr2	74901718	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=162,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.110:34:13,3:14,0:0|1:74901712_C_A:74901712:16,15,2,1
chr2	74903100	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	75061873	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=215,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,6:1,1:0,6,0,7
chr2	75101639	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.343:25:0,0:5,0:1,15,0,9
chr2	75105798	.	A	G	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=128.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,41:0.575:71:14,19:16,21:15,15,22,19
chr2	75113555	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=181,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:13,2:17,0:17,13,0,2
chr2	75113572	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:6,4:9,6:11,4,3,7
chr2	75425623	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	75874390	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:9,4:1,5:2,8,0,9
chr2	75879342	.	T	A	.	.	DP=114;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=152,97;MMQ=60,31;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,3:0.036:106:52,3:47,0:58,45,3,0
chr2	75879351	.	G	A	.	.	DP=116;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,97;MMQ=60,31;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,4:0.044:110:55,4:51,0:58,48,3,1
chr2	75881828	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr2	75882156	.	CTTTTT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,22,32,32;MFRL=142,188,191,195;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,28,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=21,16,18,19;RU=T;STR;TLOD=6.15,3.12,5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,2,3,6:0.158,0.215,0.342:16:2,0,1,3:1,1,2,3:3,2,10,1
chr2	75882181	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.224:29:10,0:8,0:9,14,6,0
chr2	75897176	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=226,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:0,0:2,2:3,0,2,0
chr2	75928300	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,7:5,5:6,4,11,1
chr2	75933590	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=177,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	75933830	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:0,5,0,6
chr2	75933858	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=189,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr2	76975776	.	TC	GG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,9;MFRL=200,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr2	79253150	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,2:5,4:11,1,6,0
chr2	79253375	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=190,159;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr2	79253386	.	G	GTGCTTGAATGTATGTTATATAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=146,177;MMQ=51,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:79253386_G_GTGCTTGAATGTATGTTATATAAA:79253386:0,4,0,1
chr2	79253388	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=146,177;MMQ=51,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:79253386_G_GTGCTTGAATGTATGTTATATAAA:79253386:0,4,0,1
chr2	79253777	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=13,18;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:1,1:5,0,2,0
chr2	79253818	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.317:14:4,2:3,2:10,0,3,1
chr2	79254065	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=172,195;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,2:4,4:5,2,3,3
chr2	79254101	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=179,174;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:4,2:2,4:6,1,4,2
chr2	79254313	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=144,63;MMQ=60,32;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,1:0|1:79254313_C_T:79254313:7,15,1,1
chr2	79254321	.	T	TAA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=144,63;MMQ=59,32;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:79254313_C_T:79254313:7,11,1,1
chr2	79254322	.	G	GTTCTGGAAATTT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=144,63;MMQ=59,32;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,1:0|1:79254313_C_T:79254313:7,11,1,1
chr2	79255101	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,255;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:8,0:5,2:0,14,0,2
chr2	79314081	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:2,7:3,0:0,6,0,7
chr2	79314094	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,6:4,0:0,7,0,6
chr2	79385758	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.268:20:6,2:5,2:14,1,4,1
chr2	79385946	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=13,13;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.415:3:0,0:0,0:0,2,0,1
chr2	79385953	.	T	TCGGGTTCACTACATCAATGGCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=214,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr2	79878664	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:1,2:2,2:2,2,4,1
chr2	80801508	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=18337981,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	84676163	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=107.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,18:0,17:0,0,6,29
chr2	84676886	.	TAAAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,23,29,31;MFRL=162,124,148,158;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,7,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=25,20,21,22;RU=A;STR;TLOD=6.75,4.15,6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,5,4,5:0.301,0.272,0.325:15:0,3,1,2:0,1,2,3:0,1,2,12
chr2	84755996	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:0,5:1,2:1,0,8,0
chr2	84756341	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	84804445	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=177,60;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:7,0:7,6,1,1
chr2	84804464	.	G	GGGACAATTCCA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=160,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.121:24:9,2:9,0:11,11,1,1
chr2	84806553	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr2	84822715	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	84831767	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	84834063	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=73.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:0,12:1,10:1,0,16,6
chr2	84834237	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr2	84846903	.	T	TCCTTTGC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,2:9,0:0|1:84846903_T_TCCTTTGC:84846903:9,12,0,2
chr2	84846906	.	A	ATTT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=T;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:11,2:10,0:0|1:84846903_T_TCCTTTGC:84846903:9,12,0,2
chr2	84896385	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:8,3,2,0
chr2	84897361	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,13,0
chr2	84897517	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=167.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,20:0,25:0,0,28,18
chr2	84897536	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,0:17,2:15,23,0,2
chr2	84897672	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=231,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	84899360	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	84912420	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr2	85023554	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.503:36:10,7:7,11:4,14,5,13
chr2	85024731	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=104,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:5,9:4,3:4,5,7,5
chr2	85041295	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:0,8,1,2
chr2	85041316	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=192,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:1,3:6,1:0,7,0,4
chr2	85042903	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:9,2,2,0
chr2	85051122	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,3:10,5:11,6,6,2
chr2	85066245	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.321:16:8,1:3,3:9,2,5,0
chr2	85069212	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	85108252	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.906:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	85133216	.	G	A	.	.	DP=132;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=149.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,57:0.466:122:35,35:29,20:39,26,36,21
chr2	85133320	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,25:0.481:52:15,11:12,14:1,26,0,25
chr2	85198503	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,12;MFRL=177,240;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:0,1:3,0,3,0
chr2	85360828	.	GGGC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	85529595	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,1:12,2:14,8,3,0
chr2	85550124	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=149,121;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.064:45:29,0:14,2:10,33,1,1
chr2	85550131	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=158,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:28,0:9,2:6,31,1,1
chr2	85550139	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=162,92;MMQ=49,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:24,0:8,2:2,30,1,1
chr2	85550189	.	CTCCGAAGT	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=184,186;MMQ=51,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:5,0:0,14,0,2
chr2	85554255	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.126:42:8,2:12,0:16,21,3,2
chr2	85577349	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=148,275524;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:16,0:21,3:17,20,3,0
chr2	85577373	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,275524;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:11,0:16,3:7,20,3,0
chr2	85596739	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:7,13:8,8:11,4,11,10
chr2	85614101	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,3:5,0:4,1,3,0
chr2	85614113	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.218:12:1,2:7,0:6,4,2,0
chr2	85617006	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:1,10,0,2
chr2	85626479	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr2	85662017	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=154.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,25:0,21:0,0,43,5
chr2	85662095	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=7;MBQ=25,14;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,13:0.270:49:20,1:13,0:0|1:85662095_A_G:85662095:1,35,13,0
chr2	85662102	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,11:0.239:47:17,4:14,3:0|1:85662095_A_G:85662095:0,36,11,0
chr2	85662108	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=32,19;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,8:0.191:45:17,2:18,1:0|1:85662095_A_G:85662095:0,37,8,0
chr2	85662109	.	CAGCTGT	C	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=33,12;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,8:0.184:47:14,2:17,0:0|1:85662095_A_G:85662095:0,39,8,0
chr2	85662119	.	CTA	C	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=33,11;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:13,0:18,0:0|1:85662095_A_G:85662095:0,33,4,0
chr2	85662123	.	AA	GG	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=27,18;MFRL=156,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:13,1:19,0:0|1:85662095_A_G:85662095:0,32,3,0
chr2	85662650	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,16,1
chr2	85766545	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=111.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,20:0,11:0,0,2,41
chr2	85769246	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr2	85769975	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr2	85777270	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr2	85778278	.	T	TCATTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=163,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.485:2:1,0:0,1:0|1:85778278_T_TCATTA:85778278:0,1,0,1
chr2	85778284	.	T	TTTCTTTTCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:85778278_T_TCATTA:85778278:0,0,0,1
chr2	85778285	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:85778278_T_TCATTA:85778278:0,0,0,1
chr2	85788175	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	85788389	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	85806068	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,4:7,6:13,0,10,0
chr2	85807082	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.726:15:2,5:2,6:0,4,0,11
chr2	85808871	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,3:5,5:0,12,0,8
chr2	85818797	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=101.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,12:0,19:0,0,28,4
chr2	85820027	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr2	85820301	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:4,5:1,4:1,4,0,10
chr2	85824084	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=119.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,20:0,13:0,0,13,20
chr2	85826132	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,23,2
chr2	85826721	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=169.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,21:0,29:0,0,36,16
chr2	85848747	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.869:12:0,6:1,3:0,1,1,10
chr2	85858144	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr2	85863116	.	GTT	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:3,4:6,4:0|1:85863116_GTT_G:85863116:7,2,7,2
chr2	85863119	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:3,5:6,4:0|1:85863116_GTT_G:85863116:7,2,7,2
chr2	85863120	.	AAG	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:3,5:6,4:0|1:85863116_GTT_G:85863116:7,2,7,2
chr2	85890758	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,5:0,3:0|1:85890758_T_C:85890758:0,0,8,2
chr2	85890771	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,8:0,5:0|1:85890758_T_C:85890758:0,0,12,3
chr2	85981750	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=203,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	86075582	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=187,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	86258784	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.463:20:5,3:4,6:1,10,0,9
chr2	86269301	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr2	86275985	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=200,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:8,0,2,0
chr2	86292656	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr2	86302103	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	86305123	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,9,12
chr2	86310110	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr2	86332809	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=114.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,13:0,21:0,0,30,8
chr2	86334199	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=155.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,22:0,0,39,6
chr2	86335718	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=137.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,26:0,20:0,0,8,38
chr2	86344095	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.501:40:9,10:9,9:20,0,20,0
chr2	86344367	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:0,13:0,13:0,1,0,26
chr2	86344393	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0,18,0,2
chr2	86352010	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	86352477	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=172,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:16,0,2,0
chr2	86352825	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr2	86359405	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,14,0
chr2	86360225	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.621:16:3,4:2,6:6,0,10,0
chr2	86362204	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr2	86364706	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=62.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr2	86385668	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=147,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:5,2,2,0
chr2	86385683	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=147,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,2:4,0:4,3,1,1
chr2	86385886	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr2	86398291	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,7:3,2:6,1,8,1
chr2	86408385	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,5:6,5:8,1,8,2
chr2	86422416	.	T	C	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=133.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,37:0.373:100:26,13:28,22:0|1:86422416_T_C:86422416:31,32,16,21
chr2	86422421	.	T	G	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=136.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,38:0.386:99:24,13:30,21:0|1:86422416_T_C:86422416:28,33,16,22
chr2	86433182	.	G	GA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:20,3:31,0:46,5,3,0
chr2	86437551	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr2	86478980	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,3:0,3:5,0,6,0
chr2	86479035	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,4:7,3:10,1,8,0
chr2	86479163	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.184:30:10,0:15,5:9,16,2,3
chr2	86491245	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=132,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr2	86509267	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:5,8:7,6:9,3,12,2
chr2	86509388	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,3:7,6:1,10,2,7
chr2	86683539	.	AT	A,ATT,ATTTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32,31,33;MFRL=135,147,161,161;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,28,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=22,21,23,25;RU=T;STR;TLOD=3.24,8.13,3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,5,6,4:0.248,0.324,0.222:19:0,3,4,3:3,2,2,1:3,1,15,0
chr2	86683901	.	G	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,27:0.461:58:20,11:11,13:23,8,24,3
chr2	86702195	.	GGG	TTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:1,5,0,2
chr2	86707504	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=114.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,20:0,15:0,0,8,27
chr2	86712820	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,4:5,5:9,1,8,1
chr2	86716808	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:3,9,1,1
chr2	86717927	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,1,1
chr2	86737397	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=173,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,2:0|1:86737397_A_C:86737397:2,0,2,0
chr2	86737401	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,19;MFRL=173,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0|1:86737397_A_C:86737397:2,0,2,0
chr2	86737649	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,0:1,2:0,4,1,2
chr2	86756280	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr2	86756362	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=165,214;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:14,2,2,0
chr2	86756381	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:1,7:9,4:9,1,8,3
chr2	86850022	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,4,21
chr2	86947783	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	86992337	.	T	TAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=102.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,12:0,9:0,0,3,21
chr2	86998659	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	87015633	.	T	TGA	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=224.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,21:0,32:0,0,36,19
chr2	87073743	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,213;MMQ=52,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,3:6,1:15,1,3,1
chr2	87073921	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=145,144;MMQ=57,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.471:51:16,12:11,12:6,21,5,19
chr2	87141072	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,123;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,1:0,0:0,0,1,2
chr2	88081856	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,368;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	88082149	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,368;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	88387450	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.050:77:28,3:46,0:46,28,3,0
chr2	88396080	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:3,8:7,3:8,2,10,2
chr2	88396348	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:88396348_G_A:88396348:0,3,0,2
chr2	88396358	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=208,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:88396348_G_A:88396348:0,4,0,1
chr2	88410102	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=153,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	88427407	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=163,105;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:0|1:88427407_T_A:88427407:10,3,3,0
chr2	88427412	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,105;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:0|1:88427407_T_A:88427407:12,4,3,0
chr2	88474370	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=94.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,15:0,0,4,23
chr2	88482605	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=148,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:6,10,0,2
chr2	88485392	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr2	88825026	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=125,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr2	88825315	.	GTT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=155,81;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:0,0:0,2,0,2
chr2	88857154	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,2:4,0:9,0,2,0
chr2	88870632	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=176,245;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,5:2,3:0,3,0,8
chr2	88874162	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,1:2,6:3,0,7,0
chr2	88876196	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:4,0:11,2:7,9,0,2
chr2	88999476	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:10,0,4,0
chr2	88999639	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,1:11,1:2,24,0,2
chr2	89160889	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,2:3,2:6,0,1,3
chr2	89161322	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=240,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,7:1,2:1,0,7,2
chr2	89185056	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,4:2,8:5,3,7,5
chr2	89185654	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:8,4:3,6:4,7,8,2
chr2	89196757	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,6:2,3:7,1,9,0
chr2	89196906	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.641:12:3,3:1,4:0,4,2,6
chr2	89292476	.	T	TTGTGCCCTGGGAACATGCAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,2:0,5:0,0,1,8
chr2	89309424	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.347:30:10,5:8,5:16,4,10,0
chr2	89399776	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=153,154;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.561:25:3,6:7,8:7,4,8,6
chr2	89399858	.	C	CAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,199;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,1:0,0,5,1
chr2	89416764	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=142,147;MMQ=45,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.588:32:7,9:6,10:8,5,14,5
chr2	89417346	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,176;MMQ=52,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:8,12:8,6:4,12,6,12
chr2	90078373	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=139,204;MMQ=31,34;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:2,0,1,1
chr2	90108416	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	90108778	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,11,7
chr2	90121926	.	G	T	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,139;MMQ=52,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,15:0.207:73:26,4:32,10:20,38,9,6
chr2	95783701	.	GA	G,GAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=161,143,200;MMQ=60,60,60;MPOS=12,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.73,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,3,3:0.127,0.141:25:10,2,1:8,0,2:2,17,0,6
chr2	95847040	.	TGCG	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCG;STR;TLOD=145.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,22:0,13:0,0,20,15
chr2	95847889	.	A	AGGGGATTCTGATG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0|1:95847889_A_AGGGGATTCTGATG:95847889:0,1,0,1
chr2	95847891	.	A	AAGCAAATC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0|1:95847889_A_AGGGGATTCTGATG:95847889:0,1,0,1
chr2	95944902	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0,0,3,5
chr2	95945568	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,13,5
chr2	95947165	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	95952177	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,16:0,0,24,3
chr2	96012907	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,2:0,12:0,0,1,13
chr2	96076409	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr2	96260979	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr2	96261862	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=180,109;MMQ=27,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:16,1:8,0:23,1,1,1
chr2	96698185	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=215,200;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr2	96780986	.	C	CTCCTCCTCT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCTCCTCT;STR;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.498:16:3,6:5,1:7,1,6,2
chr2	96781986	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=246,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,1:1,4:0,2,0,6
chr2	96795714	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:8,3:10,6:7,11,3,6
chr2	96795944	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr2	96798426	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=191,227;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:4,2:6,4,0,2
chr2	96798510	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=126,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,2:0,6:0,3,0,8
chr2	96920499	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=14,13;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.325:18:2,0:1,0:12,0,6,0
chr2	96943473	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=217,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,6:3,4:4,3,4,6
chr2	96944354	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:14,3:8,0:14,8,3,0
chr2	96955480	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=142,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.436:19:5,6:4,2:9,2,8,0
chr2	96956315	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,5,12
chr2	96962859	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=259,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,6:4,0:0,8,0,6
chr2	96966661	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,8:8,2:9,4,10,0
chr2	96991492	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,14:0,0,24,5
chr2	97020170	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:7,2:2,1:0,9,0,3
chr2	97030236	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,3:14,0:19,4,3,0
chr2	97030247	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.592:30:6,6:6,11:11,1,11,7
chr2	97216564	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	97285256	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,3:14,0:9,20,1,2
chr2	97285604	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=207,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:3,0:2,4:0,6,0,4
chr2	97329109	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,3:6,0:15,3,3,0
chr2	97334417	.	TTC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,18;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:3,0,1,0
chr2	97353725	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=204,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,3:3,6:1,8,0,9
chr2	97357756	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=246,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr2	97360079	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr2	97377857	.	C	CACCTCCACCAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=191,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.380:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	97400324	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=263,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr2	97523564	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:97523564_C_T:97523564:3,0,1,0
chr2	97523582	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97523564_C_T:97523564:1,0,1,0
chr2	97531269	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:5,7,0,2
chr2	97587049	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr2	97595109	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,15:0,16:0,0,4,27
chr2	97617227	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=80.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,8:0,15:0,0,9,15
chr2	97637789	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.221:44:10,0:12,0:16,18,10,0
chr2	97637792	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=22,29;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.090:46:7,1:14,2:26,16,4,0
chr2	97637794	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.165:44:7,0:14,0:21,16,7,0
chr2	97637798	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.229:44:8,1:12,1:17,17,10,0
chr2	97637802	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=25,19;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.192:40:6,2:13,2:17,15,8,0
chr2	97749481	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=153,144;MMQ=40,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:10,0:8,6:13,5,4,2
chr2	97751782	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,31;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:97751782_TG_CA:97751782:0,0,4,1
chr2	97751786	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,31;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:97751782_TG_CA:97751782:0,0,4,1
chr2	97757509	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr2	97784177	.	T	C	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,141;MMQ=50,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=148.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,51:0.465:110:36,27:23,24:18,41,14,37
chr2	97784295	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	98128150	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=34,28;MFRL=190,177;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr2	98128172	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=191.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,43:0.978:43:0,20:0,19:0|1:98128172_C_A:98128172:0,0,43,0
chr2	98128183	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=162,170;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,9:0.178:54:25,4:19,5:45,0,9,0
chr2	98128194	.	GGT	CAC	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=245.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,55:0.982:55:0,31:0,22:0|1:98128172_C_A:98128172:0,0,54,1
chr2	98128228	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=153,139;MMQ=25,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.168:43:21,3:13,3:31,5,6,1
chr2	98128234	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=10;MBQ=27,28;MFRL=147,138;MMQ=25,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.166:39:19,2:13,4:27,6,4,2
chr2	98128256	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,12:0,9:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,23
chr2	98128258	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,12:0,10:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,23
chr2	98128300	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=10;MBQ=25,32;MFRL=163,170;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:10,11:7,10:0,17,0,21
chr2	98128313	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=34,26;MFRL=188,175;MMQ=25,25;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,24:0.782:30:3,12:3,12:0,6,0,24
chr2	98128421	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=205,222;MMQ=25,25;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr2	98128449	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=205,207;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr2	98128515	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=161,169;MMQ=25,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:0|1:98128515_C_T:98128515:7,0,3,0
chr2	98128520	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=157,169;MMQ=25,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,3:4,0:0|1:98128515_C_T:98128515:5,0,3,0
chr2	98128531	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=147,169;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr2	98128574	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=36,31;MFRL=174,222;MMQ=25,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,3:5,2:0,6,0,5
chr2	98129631	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=179,179;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.244:43:14,4:19,6:21,12,10,0
chr2	98129670	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=10;MBQ=33,26;MFRL=165,158;MMQ=25,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,14:0.212:67:19,4:34,9:33,20,14,0
chr2	98129682	.	TG	CA	.	.	DP=72;ECNT=10;MBQ=29,32;MFRL=161,146;MMQ=25,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,26:0.370:71:17,10:24,15:0|1:98129682_TG_CA:98129682:24,21,26,0
chr2	98129690	.	TG	CA	.	.	DP=61;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=157,128;MMQ=25,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,23:0.381:61:11,8:24,15:0|1:98129682_TG_CA:98129682:22,16,23,0
chr2	98129707	.	G	T	.	.	DP=72;ECNT=10;MBQ=33,26;MFRL=140,115;MMQ=25,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=126.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,33:0.459:72:13,13:24,16:0|1:98129682_TG_CA:98129682:23,16,33,0
chr2	98129716	.	AC	GT	.	.	DP=88;ECNT=10;MBQ=30,27;MFRL=135,114;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=157.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,41:0.467:88:10,14:24,16:0|1:98129682_TG_CA:98129682:27,20,33,8
chr2	98129731	.	C	T	.	.	DP=135;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=132,124;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=305.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,77:0.569:135:23,31:29,36:0|1:98129682_TG_CA:98129682:28,30,39,38
chr2	98129733	.	AT	CC	.	.	DP=159;ECNT=10;MBQ=25,32;MFRL=132,124;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=355.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,96:0.602:159:25,30:31,43:0|1:98129682_TG_CA:98129682:30,33,42,54
chr2	98129744	.	C	T	.	.	DP=189;ECNT=10;MBQ=32,30;MFRL=138,122;MMQ=25,25;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=390.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,114:0.608:187:31,45:40,67:0|1:98129682_TG_CA:98129682:30,43,49,65
chr2	98129817	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=134,130;MMQ=25,25;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.472:49:16,11:9,12:3,23,7,16
chr2	98129879	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=163,176;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:11,1:14,2:0,26,0,3
chr2	98129924	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=197,208;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,1:1,6:0,4,0,7
chr2	98148819	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=192,217;MMQ=40,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:98148819_C_T:98148819:1,0,1,0
chr2	98148827	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=192,217;MMQ=40,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:98148819_C_T:98148819:1,0,1,0
chr2	98148950	.	CT	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=192,217;MMQ=40,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:98148950_CT_TG:98148950:0,1,0,1
chr2	98148956	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=192,217;MMQ=40,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:98148950_CT_TG:98148950:0,1,0,1
chr2	98148960	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=217,192;MMQ=25,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	98154551	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	98164084	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=159.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,21:0,27:0,0,53,1
chr2	98169519	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr2	98169544	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,6:0,6:0,0,13,0
chr2	98169583	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,22,0
chr2	98169742	.	A	C	.	.	DP=92;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=225,150;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=278.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,82:0.966:84:0,43:2,39:2,0,50,32
chr2	98169803	.	T	G	.	.	DP=123;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=148,316740;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:115,4:0.041:119:64,0:49,4:0|1:98169803_T_G:98169803:53,62,0,4
chr2	98169810	.	A	ATTCAAAGTTGTAGTTTTTGC	.	.	DP=109;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=150,316740;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,4:0.045:109:55,0:37,4:0|1:98169803_T_G:98169803:39,66,0,4
chr2	98169813	.	G	T	.	.	DP=95;ECNT=5;MBQ=32,17;MFRL=146,950502;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,2:0.031:95:51,0:35,0:0|1:98169803_T_G:98169803:33,60,0,2
chr2	98169817	.	G	T	.	.	DP=89;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=146,950502;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,2:0.033:89:46,0:35,2:0|1:98169803_T_G:98169803:30,57,0,2
chr2	98169901	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,1,19
chr2	98171480	.	T	TAA	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=159,52;MMQ=50,25;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,10:0.224:47:20,3:14,7:0|1:98171480_T_TAA:98171480:34,3,9,1
chr2	98171482	.	TCTG	T	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=159,52;MMQ=50,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,10:0.216:49:21,3:16,7:0|1:98171480_T_TAA:98171480:35,4,9,1
chr2	98171488	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=159,52;MMQ=50,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,10:0.208:51:21,3:15,7:0|1:98171480_T_TAA:98171480:32,9,9,1
chr2	98171493	.	C	A	.	.	DP=58;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=150,52;MMQ=50,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,10:0.193:55:22,3:20,6:0|1:98171480_T_TAA:98171480:35,10,9,1
chr2	98171496	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=148,26;MMQ=50,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,6:0.115:58:27,0:22,6:39,13,5,1
chr2	98171807	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,3,16
chr2	98173368	.	CA	TG	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=316.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,72:0.987:72:0,35:0,36:0,0,47,25
chr2	98192743	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:98192743_A_AAC:98192743:0,0,5,0
chr2	98192749	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0|1:98192743_A_AAC:98192743:0,0,8,0
chr2	98195581	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=220,260;MMQ=25,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.724:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chr2	98196849	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=223.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,52:0.981:52:0,28:0,23:0|1:98196849_G_A:98196849:0,0,51,1
chr2	98196859	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=224.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,52:0.982:52:0,31:0,21:0|1:98196849_G_A:98196849:0,0,51,1
chr2	98205924	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	98206188	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=152.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,21:0,20:0,0,12,31
chr2	98273290	.	C	G,T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,9,20;MFRL=147,77,213;MMQ=60,60,60;MPOS=21,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.58,4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.448,0.333:7:0,0,0:1,0,2:0,1,6,0
chr2	98273297	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=187,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.486:8:0,0:3,0:3,1,4,0
chr2	98273307	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=19,13;MFRL=166,118;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.224:10:2,0:2,0:6,2,2,0
chr2	98276014	.	CCCTCACCTGCCCTGACCAGAA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTCACCTGCCCTGACCAGAA;STR;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.871:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	98354139	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=213,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,2:2,6:2,2,4,4
chr2	98355990	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,2:2,6:0,4,0,8
chr2	98373460	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=17,17;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:98373460_T_A:98373460:1,0,1,0
chr2	98373463	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,19;MFRL=166,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:98373460_T_A:98373460:2,0,1,0
chr2	98373469	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=166,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:98373460_T_A:98373460:2,0,1,0
chr2	98376989	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	98382886	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,5:7,3:8,0,8,0
chr2	98392302	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:10,6:14,5:18,6,6,5
chr2	98410079	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:98410079_C_A:98410079:0,0,0,1
chr2	98410081	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:98410079_C_A:98410079:0,0,0,1
chr2	98413781	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,4:8,4:9,7,7,1
chr2	98418812	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,245;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr2	98449796	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=113.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,25:0,12:0,0,26,12
chr2	98451036	.	TA	T,TAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27,28;MFRL=129,149,148;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=12.10,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,8,3:0.483,0.224:15:2,3,1:2,4,1:3,1,7,4
chr2	98458430	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:1,18,0,2
chr2	98460742	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:12,5:9,7:3,18,0,12
chr2	98475979	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,1:2,2:1,3,0,4
chr2	98544058	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:5,8:4,6:0,9,0,14
chr2	98709755	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:2,13,0,3
chr2	98795873	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr2	98797744	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:3,5:5,3:0,8,0,9
chr2	98853173	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,3:7,6:3,8,2,7
chr2	98872735	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=202,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:98872735_A_AC:98872735:0,1,0,1
chr2	98872737	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=202,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:98872735_A_AC:98872735:0,1,0,1
chr2	98872742	.	AAAT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=202,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:98872735_A_AC:98872735:0,1,0,1
chr2	98907089	.	G	GT	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,10:0.185:50:11,4:17,5:18,22,5,5
chr2	99155933	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,175;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,3:5,0:7,2,3,0
chr2	99160508	.	GCA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr2	99232873	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.622:35:6,7:7,15:10,3,14,8
chr2	99234586	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.881:10:0,3:1,3:1,0,9,0
chr2	99272057	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:0,9,0,4
chr2	99272802	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.520:29:7,7:6,8:10,4,11,4
chr2	99294890	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,289;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,0:7,2:7,5,0,2
chr2	99342865	.	G	GAATGGGTCACCCTACAACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99342865_G_GAATGGGTCACCCTACAACA:99342865:0,0,0,1
chr2	99342870	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99342865_G_GAATGGGTCACCCTACAACA:99342865:0,1,0,1
chr2	99443369	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr2	99443710	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=122,282;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:99443710_T_TC:99443710:0,1,0,1
chr2	99443712	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=122,282;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99443710_T_TC:99443710:0,1,0,1
chr2	99449536	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr2	99454558	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:15,5,2,0
chr2	99614595	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.291:18:3,2:8,3:12,1,5,0
chr2	99685333	.	GA	G,TA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,33,23;MFRL=136,131,125;MMQ=60,60,60;MPOS=6,32;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.61,5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,4,4:0.088,0.116:38:10,4,1:17,0,3:22,8,7,1
chr2	99697839	.	TT	CC	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,133;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,3:0.058:66:30,0:31,3:24,39,0,3
chr2	99721804	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=83,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,1:4,0,2,1
chr2	99725223	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr2	99725479	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr2	99779642	.	C	CA	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=22,18;MFRL=123,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:2,0:1,5,3,2
chr2	99779654	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=123,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.347:12:2,3:5,1:4,4,0,4
chr2	99779655	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,5,11
chr2	99779660	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=34,13;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.188:19:6,1:9,0:0|1:99779660_C_A:99779660:1,15,3,0
chr2	99779662	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=34,13;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.188:19:6,1:8,0:0|1:99779660_C_A:99779660:1,15,3,0
chr2	99779665	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=35,13;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.179:20:7,0:9,0:0|1:99779660_C_A:99779660:1,16,3,0
chr2	99785903	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=34,16;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.147:36:18,0:10,1:22,9,0,5
chr2	99785923	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.158:27:13,0:7,0:16,7,0,4
chr2	99785927	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.122:37:12,2:9,0:18,15,0,4
chr2	99802820	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,191;MMQ=40,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,13:1,2:0,1,0,15
chr2	99977041	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:12,0:11,3:2,21,0,3
chr2	99992976	.	G	A	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,4:0.050:98:45,4:44,0:31,63,3,1
chr2	99995458	.	AT	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.204:46:14,4:21,5:34,2,9,1
chr2	100006890	.	GTT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=162,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.207:12:2,1:3,1:2,8,0,2
chr2	100035428	.	A	AAACC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,2:14,0:0,21,0,2
chr2	100046209	.	A	AAATCACTGGCCTGACTGGCAGGTCTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,2:2,3:6,0,7,0
chr2	100050921	.	AATAT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:0,14,0,2
chr2	100081461	.	GA	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,6:0.107:63:30,6:24,0:12,45,1,5
chr2	100176775	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,5:1,4:7,0,8,1
chr2	100218010	.	CGCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCT;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr2	100247334	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:15,0,2,0
chr2	100288931	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr2	100368868	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=152,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100368868_G_T:100368868:0,1,0,1
chr2	100368870	.	T	TTCATGGAACCTCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=152,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:100368868_G_T:100368868:0,1,0,1
chr2	100454072	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	100623966	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,29;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:100623966_G_A:100623966:0,2,0,1
chr2	100623970	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=35,29;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:100623966_G_A:100623966:0,2,0,1
chr2	100623972	.	CC	GA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:100623966_G_A:100623966:0,2,0,1
chr2	100623977	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,28;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:100623966_G_A:100623966:0,2,0,1
chr2	100623978	.	A	AATTATTCCT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,28;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	100623981	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=204,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:2,1:0|1:100623981_AT_A:100623981:0,2,0,1
chr2	100623983	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=204,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:100623981_AT_A:100623981:0,2,0,1
chr2	100623988	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=226,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	100721050	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	100901038	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=207,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,0:10,4:0,20,0,4
chr2	101023163	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=193,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,0:6,4:2,11,0,4
chr2	101185539	.	G	GT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.186:29:14,0:8,5:3,21,0,5
chr2	101521173	.	AT	A,ATT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=173,129,112;MMQ=60,60,60;MPOS=25,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=7.15,4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,5,5:0.224,0.238:22:8,2,2:4,2,3:11,1,7,3
chr2	101541798	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,8,10
chr2	101564628	.	A	C,G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,97,175;MMQ=60,60,60;MPOS=10,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=22.35,16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,6:0.501,0.438:13:0,6,2:0,1,4:0,0,12,1
chr2	101581246	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	101581294	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=80,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	101609827	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,36:0.610:59:12,13:10,23:13,10,18,18
chr2	101611902	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=168,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:15,7,1,1
chr2	101611912	.	C	CTGGTCATCT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,2:10,0:14,11,1,1
chr2	101619283	.	C	G	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=15,32;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=239.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,65:0.984:66:0,36:0,28:1,0,8,57
chr2	101619321	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=136.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,12:0,24:0,0,0,36
chr2	101622728	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:5,9:7,7:7,5,12,4
chr2	101635369	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:4,5:4,9:8,0,13,1
chr2	101635538	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.397:28:8,3:8,7:7,10,2,9
chr2	101640086	.	G	GT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.154:43:17,4:17,2:26,11,5,1
chr2	101767526	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:101767526_C_G:101767526:1,0,1,0
chr2	101767529	.	GCCC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:101767526_C_G:101767526:2,0,1,0
chr2	101874442	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:7,2:9,6:4,12,2,6
chr2	101879023	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=83.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,30:0.494:61:18,14:12,16:21,10,18,12
chr2	101881549	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.636:23:5,4:3,9:0,8,2,13
chr2	101883046	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=219,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	101885656	.	AT	A,ATT	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=25,29,28;MFRL=170,168,223;MMQ=60,60,60;MPOS=8,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.64,4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,4,4:0.107,0.126:36:19,1,3:7,3,1:9,19,6,2
chr2	101885724	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=164,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:18,2:19,1:21,21,2,1
chr2	101911385	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:4,7:10,7:13,1,12,2
chr2	101967346	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,4:4,6:8,0,9,1
chr2	101971618	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,5:5,6:6,1,11,0
chr2	102014202	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:4,3:4,5:0,8,1,8
chr2	102031489	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	102034017	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:7,8:15,11:12,10,5,14
chr2	102035358	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=158,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:20,0:12,3:15,17,0,3
chr2	102083183	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,8:5,5:11,2,12,1
chr2	102083393	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=199,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0|1:102083393_T_C:102083393:0,4,0,3
chr2	102083406	.	T	TGTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=221,205;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1|0:102083393_T_C:102083393:0,3,0,1
chr2	102314437	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,13:0,0,26,0
chr2	102314618	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.446:34:10,6:8,7:0,19,0,15
chr2	102314633	.	G	GGGCAGCC	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GGCAGCC;STR;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.625:17:3,7:2,4:0,6,0,11
chr2	102315057	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.565:37:8,10:8,11:1,15,0,21
chr2	102440579	.	G	GCGTTTTGTTCTTGTTGTCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0|1:102440579_G_GCGTTTTGTTCTTGTTGTCCA:102440579:0,0,0,1
chr2	102440582	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102440579_G_GCGTTTTGTTCTTGTTGTCCA:102440579:0,0,0,1
chr2	102440586	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102440579_G_GCGTTTTGTTCTTGTTGTCCA:102440579:0,0,0,1
chr2	102486347	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr2	102503480	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=192,161;MMQ=40,36;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:102503480_C_G:102503480:4,0,1,0
chr2	102503482	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=192,161;MMQ=40,36;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:102503480_C_G:102503480:4,0,1,0
chr2	102503486	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=192,161;MMQ=40,36;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:102503480_C_G:102503480:4,0,1,0
chr2	102632574	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.525:11:1,2:4,2:1,4,0,6
chr2	102632582	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0,0,1,11
chr2	102636030	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,3:6,2:8,0,5,0
chr2	102636348	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr2	102642495	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:4,3:5,6:9,0,10,0
chr2	102785158	.	G	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,17:0.291:58:16,9:24,8:12,29,4,13
chr2	102788409	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,0,10
chr2	102792760	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr2	102793014	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=191,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:13,3:6,0:10,9,1,2
chr2	102793053	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=191,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:13,0:9,4:13,10,0,4
chr2	102851496	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.342:39:14,8:11,5:11,15,7,6
chr2	102954653	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,4:4,8:9,0,10,2
chr2	102957348	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.376:19:7,2:4,3:0,12,0,7
chr2	102967928	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:1,4:7,3:8,0,7,0
chr2	102979028	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:2,4:4,3:7,0,7,0
chr2	102984279	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,5:6,3:7,3,8,0
chr2	102984624	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,4:2,2:0,4,0,6
chr2	103003265	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=220,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:0,3:3,8:3,0,9,2
chr2	103006448	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=206,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr2	103010912	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,29:0.534:54:13,13:12,15:20,5,24,5
chr2	103013388	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr2	103039873	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:6,6:6,6:0,12,0,12
chr2	103040177	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:0,4:3,2:0|1:103040177_A_T:103040177:3,0,7,0
chr2	103040182	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:0,5:3,2:0|1:103040177_A_T:103040177:3,0,7,0
chr2	103040247	.	T	TG	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=154.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,19:0,14:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,32,3
chr2	103040249	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=154.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,20:0,15:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,32,3
chr2	103040945	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	103057892	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr2	103059613	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,10:0,4:0,0,13,2
chr2	103061894	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr2	103063520	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.523:15:0,2:6,5:4,3,6,2
chr2	103090127	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=224,223;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	103120232	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	103121654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,1:2,5:2,0,6,0
chr2	103125457	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,11
chr2	103125466	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,11
chr2	103136309	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=167.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,23:0,24:0,0,32,16
chr2	103136446	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=131.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,14:0,0,8,29
chr2	103141447	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr2	103141651	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=105.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,10:0,0,5,24
chr2	103149162	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,1,16
chr2	103149182	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr2	103281540	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,1:5,2:14,0,3,0
chr2	103300506	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=193,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	103343275	.	GAA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=142,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,1:3,0:4,2,1,1
chr2	103375056	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr2	103378857	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=93.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.966:28:0,9:0,16:0,0,0,28
chr2	103379228	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr2	105471878	.	C	CGCG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GCG;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	105473538	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	105665534	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	105696538	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:3,4:9,5:2,10,1,10
chr2	105713868	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0|1:105713868_A_G:105713868:0,0,0,16
chr2	105713877	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0|1:105713868_A_G:105713868:0,0,0,14
chr2	105716266	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,4:0,7:0,1,1,10
chr2	105883845	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=170,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:9,1:13,5,1,1
chr2	105886219	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	105897002	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,201;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:15,1:15,1:19,11,2,1
chr2	105897261	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	105961703	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,9:0,0,22,1
chr2	105977903	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,5:5,3:1,6,1,7
chr2	105979730	.	C	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=93.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,35:0.479:73:20,14:18,20:18,20,26,9
chr2	105994564	.	C	CATCAA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,24:0.567:42:8,14:10,6:8,10,13,11
chr2	106013216	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=120,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:9,6:4,6:3,11,1,11
chr2	106013248	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,2:5,4:0,13,1,5
chr2	106471825	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.712:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr2	106682306	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=164,0;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:106682306_G_A:106682306:0,1,0,1
chr2	106682310	.	CGA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=164,0;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:106682306_G_A:106682306:0,1,0,1
chr2	106682317	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=164,0;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:106682306_G_A:106682306:0,1,0,1
chr2	106690542	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=196,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.457:29:7,8:7,5:2,14,2,11
chr2	106715342	.	G	A,T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25,32;MFRL=0,178,209;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=22.14,16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,6:0.557,0.389:15:0,7,0:0,2,6:0,0,0,15
chr2	106717656	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,12:0,0,0,25
chr2	106742177	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,11:0,0,2,17
chr2	106761815	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.268:30:12,2:8,4:8,14,4,4
chr2	106780015	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=53.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,18,0
chr2	106780055	.	C	CTG	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=176.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,20:0,18:0,0,37,3
chr2	106782398	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,24,0
chr2	107032279	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,153;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,12:0.266:47:18,3:16,9:22,13,12,0
chr2	107039855	.	GACA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=198,186;MMQ=21,21;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr2	107041640	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,152;MMQ=24,22;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,21:0.437:48:11,4:16,16:7,20,9,12
chr2	107051472	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,262;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:107051472_TA_T:107051472:0,0,1,0
chr2	107051476	.	TTCATAAAG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,262;MMQ=60,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:107051472_TA_T:107051472:0,0,1,0
chr2	107051489	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,262;MMQ=60,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:107051472_TA_T:107051472:0,0,1,0
chr2	107446430	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	108443511	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=174,167;MMQ=52,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:6,2:9,8:7,8,3,7
chr2	108443512	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=166,220;MMQ=49,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,0:15,2:8,15,2,0
chr2	108618540	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:3,3:0,4,0,9
chr2	108863758	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,28:0.462:61:18,18:14,10:0|1:108863758_G_A:108863758:13,20,11,17
chr2	108863767	.	A	C	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=243.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,62:0.984:62:0,37:0,21:0|1:108863758_G_A:108863758:0,0,25,37
chr2	108868736	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	108875244	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.493:29:7,9:5,5:2,13,3,11
chr2	108875267	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.426:22:4,6:6,3:1,12,0,9
chr2	109092162	.	T	TA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=173,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:14,2:23,2:19,19,4,0
chr2	109113642	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=167,151;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:19,0:16,2:4,33,0,2
chr2	109113659	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=181,151;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:16,0:12,2:0,28,0,2
chr2	109123988	.	CT	C,CTT	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=32,32,28;MFRL=139,134,80;MMQ=60,60,54;MPOS=14,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.96,8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:55,7,7:0.088,0.111:69:28,3,1:21,3,3:42,13,11,3
chr2	109292280	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,259;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr2	109370262	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,157;MMQ=52,22;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:10,3:22,1:23,9,4,0
chr2	109382936	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=176,193;MMQ=27,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.572:33:7,9:7,9:4,10,2,17
chr2	109389596	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=169,149;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:0|1:109389596_A_G:109389596:0,17,0,2
chr2	109389599	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=173,149;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:6,2:0|1:109389596_A_G:109389596:0,19,0,2
chr2	109393522	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr2	109404474	.	CT	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,6:0.118:57:27,4:18,2:43,8,6,0
chr2	109407894	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:1,1,5,0
chr2	109411248	.	GAATAT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATAT;STR;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	109463124	.	CTG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,218;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:18,0,2,0
chr2	109490104	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr2	109490146	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	109513321	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,13,2
chr2	109513786	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	109522720	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,5:0,0,12,5
chr2	109527087	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	109988215	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr2	110015337	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0,8,1,1
chr2	110303567	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,2:7,0:18,2,2,0
chr2	110310843	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr2	110310871	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:110310871_C_A:110310871:0,4,0,1
chr2	110310873	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:110310871_C_A:110310871:0,4,0,1
chr2	110372192	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	110375592	.	CAA	C,CA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,32,32;MFRL=164,155,157;MMQ=60,44,60;MPOS=27,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=A;STR;TLOD=15.60,8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,7,7:0.264,0.286:26:3,2,3:4,5,3:5,7,14,0
chr2	110922064	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.476:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	111397237	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=173,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.565:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	111399424	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=37,27;MFRL=357,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:111399424_G_A:111399424:1,0,0,1
chr2	111399430	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=357,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:111399424_G_A:111399424:1,0,0,1
chr2	111399433	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=357,205;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:111399424_G_A:111399424:1,0,0,1
chr2	111406724	.	T	TCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=212,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=CA;STR;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.733:9:1,2:1,5:2,0,7,0
chr2	111406981	.	A	ATATT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:0|1:111406981_A_ATATT:111406981:2,9,0,2
chr2	111406983	.	AGGG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:5,0:6,2:0|1:111406981_A_ATATT:111406981:2,11,0,2
chr2	111406988	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=-1073741825;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:111406981_A_ATATT:111406981:1,12,0,2
chr2	111419446	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=169,347;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,0:7,4:2,14,0,4
chr2	111559404	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=278,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111559404_C_CA:111559404:0,1,0,1
chr2	111559405	.	T	TGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,28;MFRL=278,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:111559404_C_CA:111559404:0,1,0,1
chr2	111721142	.	ATGTGTGTG	A,ATG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29,34;MFRL=0,138,195;MMQ=60,60,53;MPOS=6,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,15,16;RU=TG;STR;TLOD=5.90,8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.364,0.530:6:0,1,2:0,2,1:0,0,6,0
chr2	111753449	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:1,7:6,6:5,2,12,1
chr2	111851198	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=179,130;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:10,2:0,19,0,2
chr2	111851205	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=179,130;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,1:0,22,0,2
chr2	111881263	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:18,2:10,2:27,1,4,0
chr2	111921652	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=107,220;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:0,1:0|1:111921652_A_C:111921652:1,0,4,0
chr2	111921657	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=145,220;MMQ=60,56;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:0,2:1,1:0|1:111921652_A_C:111921652:4,1,4,0
chr2	111921662	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=150,214;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:0|1:111921652_A_C:111921652:5,1,3,0
chr2	112551800	.	TA	AG	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=151,114;MMQ=47,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:25,1:19,0:33,15,3,0
chr2	112582523	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,147;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,29:0.525:55:12,16:14,12:16,10,23,6
chr2	112590989	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=183,205;MMQ=60,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,1,3
chr2	112605465	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,11:0,0,0,26
chr2	112615801	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,172;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:17,2:8,1:25,0,3,0
chr2	112616059	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=179,197;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,7:4,2:0,11,0,9
chr2	112625575	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,25:0.439:57:15,14:17,10:21,11,17,8
chr2	112631348	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=173,231;MMQ=52,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:16,0:21,3:0|1:112631348_T_C:112631348:1,36,0,3
chr2	112631351	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=172,231;MMQ=52,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.098:39:15,0:18,3:0|1:112631348_T_C:112631348:1,35,0,3
chr2	112656269	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=173,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,0:6,3:11,6,2,1
chr2	112702647	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,4:5,4:0,10,1,7
chr2	112705157	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,3,17
chr2	112705185	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=195,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:0,8,0,4
chr2	112725684	.	A	ATGTGTG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=TG;STR;TLOD=56.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,3:0,8:0,0,12,2
chr2	112740373	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr2	112754828	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,3:6,2:9,0,5,0
chr2	112754880	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.497:30:6,7:9,7:11,4,13,2
chr2	112761653	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,0,7
chr2	112776913	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:4,1:11,0,2,0
chr2	112813163	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=247,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr2	112813190	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=179,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,5:2,0:6,0,5,0
chr2	112813391	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=156.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,23:0,20:0,0,7,37
chr2	112817458	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,26:0.551:47:10,14:11,12:20,1,26,0
chr2	112832535	.	CAAT	C	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,28:0.354:80:23,14:27,13:24,28,12,16
chr2	112847164	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:5,8:4,1:10,0,6,3
chr2	112854563	.	GT	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.175:39:19,3:10,4:25,7,5,2
chr2	112854931	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=228,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	112856165	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=147.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,24:0,21:0,0,36,13
chr2	112858122	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:8,0,6,0
chr2	112865517	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	112896139	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=193,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:0,0:5,1:6,0,4,0
chr2	112896367	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=198,183;MMQ=27,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,2:3,0:0,5,0,2
chr2	112945188	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=178,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr2	112995810	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr2	113074775	.	C	CT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.276:37:17,5:7,1:22,5,8,2
chr2	113082250	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.523:29:4,6:8,9:4,10,1,14
chr2	113089267	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,3:6,3:6,4,3,3
chr2	113089280	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=162,308;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.210:25:11,4:9,0:15,5,4,1
chr2	113127809	.	GA	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=125,122;MMQ=25,37;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:5,0:8,3:4,21,0,5
chr2	113127820	.	GAA	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=139,189;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=A;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:12,3:14,0:0|1:113127820_GAA_G:113127820:2,26,0,3
chr2	113127830	.	AGTATT	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=139,189;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:13,3:12,0:0|1:113127820_GAA_G:113127820:2,24,0,3
chr2	113300330	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,3:0,6:0,0,1,10
chr2	113305150	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=76.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,15:0,7:0,0,3,19
chr2	113307023	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=110,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,2:1,0:0,3,0,2
chr2	113308622	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,0,18
chr2	113310197	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	113315735	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr2	113317236	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=186,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,3:5,0:0|1:113317236_G_C:113317236:0,13,0,3
chr2	113317238	.	TG	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=186,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,2:5,0:0|1:113317236_G_C:113317236:0,13,0,3
chr2	113321900	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.926:24:0,10:1,13:1,0,14,9
chr2	113326281	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr2	113326471	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=156,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,3:10,0:3,16,1,2
chr2	113326502	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,10:0,0,3,17
chr2	113326562	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=225,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	113332536	.	GG	AA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=141,166;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:11,3:16,0:9,20,3,0
chr2	113332768	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:14,1,1,1
chr2	113343488	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,19,3
chr2	113346480	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,5,11
chr2	113346512	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr2	113479614	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,7:0,0,4,13
chr2	113479745	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,4,3
chr2	113480214	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,0:9,2:5,11,0,2
chr2	113480906	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,19;MFRL=168,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:113480906_T_G:113480906:2,0,1,0
chr2	113480912	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,11;MFRL=168,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:113480906_T_G:113480906:2,0,1,0
chr2	113480914	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=168,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:113480906_T_G:113480906:2,0,1,0
chr2	113480918	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,11;MFRL=145,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:113480906_T_G:113480906:3,0,1,0
chr2	113480923	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,18;MFRL=145,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:113480906_T_G:113480906:3,0,1,0
chr2	113480938	.	G	GCACACA	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=CA;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.850:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr2	113481439	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	113481547	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	113484319	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=165.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,21:0,27:0,0,21,31
chr2	113484353	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=132.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,18:0,21:0,0,11,30
chr2	113487346	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr2	113513504	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=96.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,10:0,0,26,0
chr2	113532885	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:2,8,0,6
chr2	113537339	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr2	113540177	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:2,3:2,5:4,0,9,0
chr2	113540205	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,1:3,8:4,0,8,1
chr2	113588793	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:4,5:5,0:10,0,5,0
chr2	113671303	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=117,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=160.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,44:0.958:45:0,24:1,20:1,0,43,1
chr2	113671477	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.234:31:15,1:3,1:14,9,0,8
chr2	113671518	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,14:0,4:0,0,0,18
chr2	113785727	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr2	113816940	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:8,4:4,4:0|1:113816940_C_G:113816940:8,4,8,1
chr2	113816942	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:7,4:4,5:0|1:113816940_C_G:113816940:8,4,8,1
chr2	113819614	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:3,2:0,1:3,0,4,0
chr2	113830201	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=187,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,4:2,5:3,0,9,0
chr2	113832981	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:7,6:3,3:3,8,3,7
chr2	113875509	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.327:31:10,4:10,5:19,2,7,3
chr2	113877538	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:7,4:9,5:16,0,9,0
chr2	113887262	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.344:23:10,4:5,2:4,11,3,5
chr2	113887273	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,5:4,5:2,9,2,8
chr2	113887294	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:0,7,0,7
chr2	113887338	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:0,6,0,5
chr2	113888557	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0|1:113888557_G_A:113888557:4,0,3,0
chr2	113888579	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:6,1:1,1:0|1:113888557_G_A:113888557:6,1,3,0
chr2	113888793	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr2	113942903	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:6,2:4,3:10,1,4,1
chr2	113950928	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:7,0:7,2:6,9,1,1
chr2	113953401	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,8:0,0,0,11
chr2	113953657	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=199,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.346:21:8,1:6,6:14,0,6,1
chr2	113953952	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,4:4,7:0,9,1,10
chr2	113953973	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:7,2:4,3:0|1:113953973_A_AT:113953973:0,11,0,5
chr2	113953974	.	GACA	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,2:4,3:0|1:113953973_A_AT:113953973:0,11,0,5
chr2	113953984	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.684:14:1,6:2,3:0,4,0,10
chr2	113955074	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:7,6:2,5:5,4,9,2
chr2	113955233	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.553:25:7,4:4,9:3,8,8,6
chr2	113956371	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr2	113956821	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr2	113977862	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr2	114000458	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	114004237	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	114004577	.	GGT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr2	114195384	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=187,182;MMQ=23,23;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:8,10:14,4:21,1,12,2
chr2	114212437	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=178,187;MMQ=22,22;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114212437_G_GT:114212437:0,1,0,1
chr2	114212439	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=178,187;MMQ=22,22;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:114212437_G_GT:114212437:0,1,0,1
chr2	114212441	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=178,187;MMQ=22,22;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:114212437_G_GT:114212437:0,1,0,1
chr2	114212445	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,22;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:114212437_G_GT:114212437:0,0,0,1
chr2	114212451	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,22;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:114212437_G_GT:114212437:0,0,0,1
chr2	114212453	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,187;MMQ=60,22;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:114212437_G_GT:114212437:0,0,0,1
chr2	114258779	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,169;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.523:46:10,7:11,17:16,6,15,9
chr2	114340450	.	AGAG	A	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=171,147;MMQ=22,22;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.119:56:17,0:25,5:45,5,6,0
chr2	114340469	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=165,154;MMQ=22,22;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,9:0.148:65:21,6:33,3:51,5,9,0
chr2	114340494	.	G	A	.	.	DP=111;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=154,165;MMQ=22,22;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,31:0.291:107:32,14:43,16:67,9,28,3
chr2	114340511	.	G	A	.	.	DP=147;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=158,121;MMQ=22,22;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,21:0.158:133:50,6:61,14:84,28,13,8
chr2	114340663	.	G	A	.	.	DP=141;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=151,161;MMQ=43,23;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,43:0.316:137:48,22:45,21:39,55,10,33
chr2	114340677	.	C	A	.	.	DP=127;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=159,155;MMQ=40,22;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,23:0.200:117:49,12:45,11:33,61,4,19
chr2	114340706	.	A	G	.	.	DP=107;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=151,191;MMQ=47,22;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,22:0.226:97:36,14:37,6:17,58,1,21
chr2	114386338	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=201,195;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr2	114399145	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,183;MMQ=57,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:0,5,1,7
chr2	114399536	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=199,187;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:2,2:8,0,3,0
chr2	114480812	.	A	AAAC	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=135.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.973:32:0,14:0,17:0,0,3,29
chr2	114486880	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.581:17:5,4:2,6:7,0,10,0
chr2	114486907	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:6,6:4,5:10,0,11,0
chr2	114492135	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:7,9:15,10:20,2,17,2
chr2	114493260	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,7:4,3:8,1,9,1
chr2	114493509	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:7,5:2,5:0,9,1,9
chr2	114493524	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:4,6:5,2:1,8,0,9
chr2	114501242	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,6:2,2:3,3,6,2
chr2	114513386	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,34:0.540:63:15,12:13,22:26,3,31,3
chr2	114513901	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,1:1,1:2,5,1,1
chr2	114689047	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.257:13:7,0:2,2:0,10,0,3
chr2	114708994	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=162,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:28,1:16,1:44,0,2,0
chr2	115919677	.	CT	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr2	116066984	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr2	116497479	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,6,19
chr2	116497528	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr2	116548820	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=145.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,29:0,19:0,0,34,14
chr2	116593675	.	ATG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=129,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.880:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr2	116593695	.	GATAT	G,GAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32,32;MFRL=0,148,174;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=AT;STR;TLOD=14.13,8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,3:0.504,0.406:8:0,2,2:0,3,1:0,0,7,1
chr2	116598405	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=52,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:2,4,1,1
chr2	116599927	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr2	118572471	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.575:40:6,14:10,9:4,13,5,18
chr2	118578691	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=119.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,23:0,19:0,0,31,12
chr2	118582936	.	A	ATAAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	118688754	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,2,15
chr2	118694393	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:118694393_C_G:118694393:0,0,0,9
chr2	118694411	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=224,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:118694393_C_G:118694393:0,2,0,1
chr2	118694415	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=224,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:118694393_C_G:118694393:0,2,0,1
chr2	118694416	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=224,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:118694393_C_G:118694393:0,2,0,1
chr2	118698699	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr2	118704478	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,4,16
chr2	118705570	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	118706879	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=85,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,6:1,10:1,0,14,2
chr2	118709122	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	118732484	.	AGGAAT	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.489:45:7,11:12,11:11,12,6,16
chr2	118732557	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=193,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,5:8,5:1,12,3,7
chr2	118735506	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,2:5,6:8,3,6,2
chr2	118735590	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:9,0:8,8:10,7,2,6
chr2	118753148	.	A	ATC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,0,12
chr2	118766024	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	118771663	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,6:0,2:0,0,0,9
chr2	118771682	.	TGCC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GCC;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.837:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	118865814	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=116.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,41:0.494:83:23,22:19,19:21,21,30,11
chr2	119732042	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.651:21:2,6:5,7:4,3,10,4
chr2	119739127	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:5,1:6,1:9,4,2,1
chr2	119739269	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:11,6:6,3:3,14,2,7
chr2	119748135	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=158,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:1,2:2,2:1,6,0,4
chr2	119749477	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=139.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,20:0,19:0,0,3,36
chr2	119915132	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,11,1
chr2	120003642	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	120012171	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=191,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.482:10:2,1:3,2:5,0,5,0
chr2	120014985	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr2	120125936	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr2	120125973	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=212,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr2	120128470	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.204:13:4,0:4,2:0,11,0,2
chr2	120194651	.	A	AGTGTGC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=97.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,9:0,0,10,12
chr2	120197670	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr2	120204460	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.493:28:5,7:9,5:7,7,5,9
chr2	120209689	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	120230998	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,8:0,5:0,0,9,5
chr2	120231165	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=55.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,9:0,0,3,16
chr2	120362407	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=88.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,10,18
chr2	120362897	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,3:0,0,0,12
chr2	120366057	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.762:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr2	120373237	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:24,0:16,4:23,17,0,4
chr2	120383138	.	CATT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:3,3:7,2,4,1
chr2	120387637	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	120388319	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=141,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:5,4:2,4:7,2,7,2
chr2	120404629	.	ATT	A,AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,21,29;MFRL=0,128,157;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.25,13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,7:0.358,0.574:11:0,1,2:0,1,3:0,0,3,8
chr2	120439702	.	GTT	G,GT,GTTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=12,35,23,32;MFRL=174,163,143,157;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,19,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,18;RU=T;STR;TLOD=3.13,7.30,6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,2,4,3:0.165,0.275,0.224:14:0,0,0,1:1,2,2,1:0,5,0,9
chr2	120620092	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.374:13:4,3:3,2:7,1,5,0
chr2	120689905	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr2	120692545	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,0:6,5:1,9,0,5
chr2	120703842	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	120704164	.	A	AT	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=224.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,53:0.982:53:0,30:0,21:0|1:120704164_A_AT:120704164:0,0,20,33
chr2	120704166	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=224.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,53:0.982:53:0,30:0,21:0|1:120704164_A_AT:120704164:0,0,20,33
chr2	120704218	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=161,250;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,0:9,2:0,18,0,2
chr2	120712718	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=185,213;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:0,1:2,0:2,1,1,0
chr2	120712733	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=164,213;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:2,2,1,0
chr2	120718322	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,1:0,0,5,1
chr2	120831654	.	CT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,2:6,3:11,4,4,1
chr2	120889146	.	GACAGCCTGGCAGAC	G	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:7,2:0|1:120889146_GACAGCCTGGCAGAC_G:120889146:20,0,2,0
chr2	120889163	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:120889146_GACAGCCTGGCAGAC_G:120889146:18,0,2,0
chr2	120889166	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:120889146_GACAGCCTGGCAGAC_G:120889146:17,0,2,0
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chr2	121713022	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	121713030	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=237,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,0:2,2:0,4,0,2
chr2	121729490	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=114.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,18:0,19:0,0,30,8
chr2	121729686	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,2,16
chr2	121732588	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.106:36:18,0:13,3:18,15,0,3
chr2	121732710	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:1,7,1,6
chr2	121740190	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,3,0
chr2	121740194	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,3,0
chr2	121740505	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=208,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:2,1:0,4,0,4
chr2	121744225	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	121989537	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:6,5,0,2
chr2	121991702	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:6,0,5,4
chr2	121997330	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,1,2
chr2	122004596	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr2	122006700	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.446:29:8,5:8,7:4,12,1,12
chr2	122215374	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:13,0:18,3:9,23,0,3
chr2	122220032	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.478:25:6,6:7,5:12,1,12,0
chr2	122514326	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=190,198;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:0,14,0,2
chr2	122520553	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr2	125000056	.	GATT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=220,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,1:1,0:0|1:125000056_GATT_G:125000056:0,2,0,1
chr2	125000060	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=220,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:125000056_GATT_G:125000056:0,2,0,1
chr2	125000064	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=220,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:125000056_GATT_G:125000056:0,2,0,1
chr2	127447763	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,12,1
chr2	127808532	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,9:0,0,7,20
chr2	127818131	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:7,1:12,0,2,0
chr2	127821085	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,13,0
chr2	127821453	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,8:0,0,14,0
chr2	127821499	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=216,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=109.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.940:31:1,17:0,13:1,0,29,1
chr2	127826632	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	127834136	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,3:0,4:5,0,6,1
chr2	127834359	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:127834359_A_C:127834359:1,2,0,1
chr2	127834362	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:127834359_A_C:127834359:1,2,0,1
chr2	127834369	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:127834369_C_T:127834369:0,1,1,0
chr2	127834384	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127834369_C_T:127834369:0,0,1,0
chr2	127944781	.	A	AC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:4,7:5,3:7,2,9,1
chr2	128029065	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.655:18:3,5:3,6:0,6,2,10
chr2	128050134	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,1:5,4:9,3,4,1
chr2	128075399	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:0,4,0,7
chr2	128087651	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:1,2:5,1:1,5,0,4
chr2	128181028	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	128253571	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.412:44:15,6:11,12:19,7,14,4
chr2	128324125	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=204,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	128327569	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=181,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr2	128334160	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=173,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:128334160_T_C:128334160:3,0,1,0
chr2	128334162	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=173,229;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:128334160_T_C:128334160:3,0,1,0
chr2	128339456	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr2	128341603	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr2	128342547	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:2,1:1,1,0,4
chr2	128345960	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:3,3:0,6:3,0,7,2
chr2	128346228	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	128350578	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	128363530	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr2	128364827	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:17,3:16,0:19,14,2,1
chr2	128366272	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,3:5,5:6,0,8,0
chr2	128367092	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=194,167;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,6:5,4:8,2,7,3
chr2	128367359	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,6:6,5:4,6,6,5
chr2	128377833	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=70,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:0|1:128377833_C_G:128377833:5,1,5,0
chr2	128377842	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=70,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:0|1:128377833_C_G:128377833:5,1,6,0
chr2	128378136	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=224,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr2	128382859	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,1:2,5:2,0,6,0
chr2	128388489	.	CCCCAGCCCCGCTCCGCCTCATTGCACCCCCACCTCCCAGCCCCACCTCACCTCATTGCACCCCCTGCT	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.122:27:10,0:10,1:3,22,1,1
chr2	128389422	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	128392688	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr2	128393261	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:4,0,5,0
chr2	128394877	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=124,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:5,7:6,4:4,7,7,4
chr2	128396807	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr2	128408550	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.595:23:6,3:3,9:6,3,6,8
chr2	128409601	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:9,1,2,0
chr2	128410253	.	G	GGCTGGAGTGCAGTGGTGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:128410253_G_GGCTGGAGTGCAGTGGTGC:128410253:0,3,0,1
chr2	128410255	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:128410253_G_GGCTGGAGTGCAGTGGTGC:128410253:0,3,0,1
chr2	128411934	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr2	128411950	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,12,2
chr2	128480973	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=82,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	128522256	.	A	AG	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.078:62:20,0:38,4:14,44,0,4
chr2	128526579	.	TTAAA	T,TTAAATAAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,35,32;MFRL=131,150,163;MMQ=60,60,60;MPOS=16,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=TAAA;STR;TLOD=15.60,5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.515,0.293:7:0,0,1:1,3,1:0,1,0,6
chr2	128528266	.	AAAATAAAT	A,AAAAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33,29;MFRL=179,226,159;MMQ=60,51,33;MPOS=22,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=AAAT;STR;TLOD=3.26,7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.292,0.460:4:0,1,1:0,0,1:1,0,3,0
chr2	128615500	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,0:0,2:3,0,2,0
chr2	128699782	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr2	128699833	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,2,3
chr2	128708063	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	128744580	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr2	128753854	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	128757804	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,2:0,10:0,0,8,4
chr2	128872595	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr2	128877837	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr2	128880899	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,2,16
chr2	128890878	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr2	128914748	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.695:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr2	128935977	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=177,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:8,1:12,2,1,1
chr2	128936000	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:5,2:13,4:13,5,4,2
chr2	128936171	.	TATG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=117,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATG;STR;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:0,3,0,8
chr2	128939606	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=114,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	128944424	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.426:22:5,5:5,4:1,12,0,9
chr2	128947302	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:20,0:17,2:12,26,0,2
chr2	129025705	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,218;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,1:0,1:0,0,4,0
chr2	130739444	.	TGAAGACG	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGACG;STR;TLOD=193.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.982:45:0,16:0,29:0,0,27,18
chr2	130739646	.	TTAAC	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=225.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,26:0,25:0,0,14,37
chr2	130739712	.	CT	C,CTT	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=33,28,34;MFRL=170,162,184;MMQ=60,60,60;MPOS=1,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.21,8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,5,6:0.155,0.192:33:15,0,4:5,5,1:13,9,9,2
chr2	130832086	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,246;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	130832292	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,24;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr2	130872658	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	130897055	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr2	130898850	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,191;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,0:15,2:7,19,0,2
chr2	130899642	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=138,164;MMQ=29,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:8,0,5,0
chr2	130910847	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:4,2,7,0
chr2	130914797	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=170,126;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,3,1
chr2	130918940	.	G	GCATCTGGGGGAGGGCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,222;MMQ=21,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	130930819	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=158,173;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.376:30:8,3:10,8:11,8,5,6
chr2	130934311	.	CA	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=207,154;MMQ=53,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr2	130939288	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.514:35:9,10:8,8:5,12,10,8
chr2	130940090	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=207,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,7:8,2:12,0,7,2
chr2	130948314	.	G	GTTTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=185,158;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,16;RU=T;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,1:0,0:0|1:130948314_G_GTTTT:130948314:0,2,0,2
chr2	130948327	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=183,158;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:130948314_G_GTTTT:130948314:0,3,0,2
chr2	130949303	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=190,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:7,0,7,0
chr2	130949411	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,4,11
chr2	130951629	.	GT	CC	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=155,164;MMQ=49,29;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.144:30:13,0:10,0:18,8,0,4
chr2	130952038	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=141,170;MMQ=52,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:13,0:12,5:14,11,1,4
chr2	130952053	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=146,198;MMQ=52,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.211:31:11,1:14,5:12,13,1,5
chr2	130952111	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=164,211;MMQ=40,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,3:7,3:0,13,1,5
chr2	131116404	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=75,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,4:2,3:2,0,7,0
chr2	131130588	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,2:6,2:3,9,0,4
chr2	131130678	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:7,2,6,2
chr2	131221445	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=269,239;MMQ=25,24;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,1,2
chr2	131232617	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,155;MMQ=24,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:1,6:0,5:0,1,4,7
chr2	131297727	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,182;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr2	131331872	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=186,173;MMQ=27,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,2:7,0:13,0,2,0
chr2	131403183	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=200,131;MMQ=58,26;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.350:21:4,3:9,4:10,4,3,4
chr2	131403374	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=261,252;MMQ=21,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131403374_T_C:131403374:0,1,0,1
chr2	131403379	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=261,252;MMQ=21,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131403374_T_C:131403374:0,1,0,1
chr2	131414061	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=184,165;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:9,2:7,3:16,0,5,0
chr2	131414073	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=185,141;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:11,4:8,2:19,0,6,0
chr2	131522810	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,141;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,3:0.057:67:33,0:31,3:34,30,0,3
chr2	131523712	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=190,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:7,1:5,9,1,1
chr2	131524150	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=100,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:131524150_G_A:131524150:0,3,0,1
chr2	131524155	.	TA	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=100,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:131524150_G_A:131524150:0,3,0,1
chr2	131802216	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=167,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr2	131805979	.	CG	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=166,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:13,2:13,1:4,25,0,3
chr2	131810441	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,28:0.460:61:17,16:16,12:23,10,18,10
chr2	131810546	.	T	G	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,21:0.184:95:18,3:31,3:46,28,0,21
chr2	131890627	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=161,151;MMQ=60,22;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.103:36:15,0:15,3:0|1:131890627_G_A:131890627:1,32,0,3
chr2	131890632	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=163,151;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.103:37:17,0:16,3:0|1:131890627_G_A:131890627:1,33,0,3
chr2	131890639	.	T	TTG	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=29,37;MFRL=163,151;MMQ=60,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:13,0:12,3:0|1:131890627_G_A:131890627:1,26,0,3
chr2	131890641	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=164,151;MMQ=60,22;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.132:28:12,0:12,1:0|1:131890627_G_A:131890627:1,24,0,3
chr2	131995700	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,248;MMQ=24,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:13,1:27,3:29,11,3,1
chr2	132120501	.	C	CT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,158;MMQ=57,57;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:7,7:12,7:17,3,10,4
chr2	132121710	.	C	CTCGGCTTCCCCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=220,180;MMQ=52,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0|1:132121710_C_CTCGGCTTCCCCA:132121710:0,3,0,2
chr2	132121713	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=220,185;MMQ=52,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,1:2,0:0|1:132121710_C_CTCGGCTTCCCCA:132121710:0,3,0,1
chr2	132237643	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,96;MMQ=52,27;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,7:0.122:62:21,4:33,3:30,25,3,4
chr2	132238051	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,18;MFRL=170,125;MMQ=46,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.225:23:7,0:8,0:2,16,5,0
chr2	132240386	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=159,214;MMQ=52,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:20,0:23,3:19,24,0,3
chr2	132240509	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=197,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,0:5,4:0,10,0,4
chr2	132243695	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=150,143;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,25:0.508:49:15,9:9,15:17,7,13,12
chr2	132249600	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=183,188;MMQ=34,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.688:14:2,4:2,6:0|1:132249600_G_A:132249600:3,1,9,1
chr2	132249605	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=174,190;MMQ=27,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:2,3:2,4:0|1:132249600_G_A:132249600:3,2,6,1
chr2	132249668	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,9;MFRL=178,172;MMQ=27,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.288:18:6,0:4,0:0,13,0,5
chr2	132286155	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=196,196;MMQ=51,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,6:4,4:0,8,0,10
chr2	132290399	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=182,175;MMQ=52,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.498:44:11,13:11,8:10,12,6,16
chr2	132905660	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=163,155;MMQ=26,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:18,3:24,1:27,15,4,0
chr2	132905664	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=154,149;MMQ=29,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,11:0.235:49:16,5:22,4:0|1:132905664_G_T:132905664:22,16,11,0
chr2	132905682	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=7;MBQ=26,32;MFRL=138,149;MMQ=25,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,11:0.222:52:16,6:25,5:0|1:132905664_G_T:132905664:22,19,11,0
chr2	132905693	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=154,149;MMQ=31,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,11:0.214:54:16,6:24,5:0|1:132905664_G_T:132905664:26,17,11,0
chr2	132905703	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=32,35;MFRL=156,149;MMQ=31,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,9:0.196:49:18,4:20,4:0|1:132905664_G_T:132905664:23,17,9,0
chr2	132905706	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=28,35;MFRL=156,144;MMQ=31,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,8:0.187:46:16,4:18,4:0|1:132905664_G_T:132905664:21,17,8,0
chr2	132905741	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=159,144;MMQ=37,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:9,5:13,3:10,13,0,8
chr2	132905792	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=159,149;MMQ=40,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.357:26:7,3:10,6:0|1:132905792_G_C:132905792:1,16,0,9
chr2	132905814	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=157,163;MMQ=40,38;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:7,1:8,2:0|1:132905792_G_C:132905792:1,16,0,4
chr2	132911348	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=196,168;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	132912142	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=206,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,4:2,6:7,0,9,1
chr2	132912217	.	T	TA	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=159,160;MMQ=50,52;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.445:32:11,6:7,7:18,0,12,2
chr2	132912398	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=178,208;MMQ=40,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:11,3:11,1:2,20,0,4
chr2	132912419	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=189,210;MMQ=40,23;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:11,3:11,2:0|1:132912419_C_T:132912419:2,21,0,5
chr2	132912427	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=192,215;MMQ=40,23;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,2:9,1:0|1:132912419_C_T:132912419:1,19,0,3
chr2	132912436	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=198,215;MMQ=38,23;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,1:7,1:0|1:132912419_C_T:132912419:1,15,0,3
chr2	133014537	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,18;MFRL=0,159;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:133014537_G_C:133014537:0,0,0,1
chr2	133014554	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133014537_G_C:133014537:0,0,0,1
chr2	133014580	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133014580_C_T:133014580:0,0,0,1
chr2	133014583	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133014580_C_T:133014580:0,0,0,1
chr2	133014591	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133014580_C_T:133014580:0,0,0,1
chr2	133402607	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,4:2,7:5,1,10,1
chr2	133425912	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	133426183	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	133483101	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:11,0,2,0
chr2	133483430	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:133483430_A_C:133483430:0,1,0,1
chr2	133483433	.	T	TTTTATTAGTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:133483430_A_C:133483430:0,1,0,1
chr2	133538880	.	T	TAGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=255,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:133538880_T_TAGC:133538880:0,4,0,1
chr2	133538882	.	TTTA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=255,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:133538880_T_TAGC:133538880:0,4,0,1
chr2	133538887	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=255,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:133538880_T_TAGC:133538880:0,2,0,1
chr2	133538894	.	T	TTCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=255,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:133538880_T_TAGC:133538880:0,2,0,1
chr2	133539460	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:4,0,9,0
chr2	133618220	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:1,4:7,3:0,8,1,6
chr2	133881425	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,6:3,5:1,4,4,8
chr2	135170633	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=162,239;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,1:8,0:1,15,0,2
chr2	135186057	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr2	135214418	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=158,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:2,2:1,3,0,3
chr2	135215788	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=169,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:4,3:0,9,0,3
chr2	135596397	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=179,43;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr2	135694379	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr2	135705558	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr2	135710322	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=167.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.980:44:0,21:0,23:0,0,2,42
chr2	135757614	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:0,7,0,6
chr2	135870693	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:4,3:11,0:9,6,3,0
chr2	135881663	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:5,3:13,0:17,1,3,0
chr2	135884302	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,170;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,0:5,3:0,14,0,3
chr2	135887514	.	AT	A,ATT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,30,32;MFRL=146,165,116;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=18.48,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,12,3:0.280,0.095:40:11,7,2:11,5,1:23,2,14,1
chr2	135888078	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=198,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:10,4:2,6:11,1,10,1
chr2	135890608	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:1,2,2,3
chr2	135920091	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:1,7:7,3:9,0,9,1
chr2	135920108	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.493:30:5,9:10,4:14,1,12,3
chr2	135960553	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=122,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,2:1,5,1,6
chr2	135960616	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=224,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	135976740	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=63.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.489:41:15,9:6,11:4,17,4,16
chr2	136026730	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=140,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	136029499	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=214,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:2,0:1,1:0|1:136029499_T_C:136029499:0,3,0,1
chr2	136029505	.	C	CAGCTGATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=231,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:136029499_T_C:136029499:0,2,0,1
chr2	136071271	.	T	TGATTCTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	136103305	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=189,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	136107839	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	136148528	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=236,219;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	136261801	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=277,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr2	136362399	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,0:2,2:10,2,1,1
chr2	136379133	.	A	T	.	.	DP=145;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:138,5:0.040:143:76,5:62,0:58,80,5,0
chr2	136379194	.	GT	G	.	.	DP=121;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=256,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=177.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,74:0.952:77:1,42:2,28:2,1,19,55
chr2	136393658	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,14:0.319:45:14,8:17,6:20,11,9,5
chr2	136407445	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.509:41:11,12:9,8:16,4,17,4
chr2	136407479	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=151.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,23:0,24:0,0,33,14
chr2	136467119	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,25:0.456:55:16,14:14,11:9,21,4,21
chr2	136467164	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=124.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,24:0,17:0,0,1,40
chr2	136467559	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr2	136480032	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.137:24:14,2:6,0:15,6,0,3
chr2	136499458	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.481:46:12,12:11,10:23,1,19,3
chr2	136511874	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.393:23:5,6:9,2:1,13,3,6
chr2	136511898	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=182,133;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:2,2:2,0:0,5,0,4
chr2	136511931	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=182,148;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:136511931_G_A:136511931:0,3,0,1
chr2	136511934	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=182,148;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:136511931_G_A:136511931:0,3,0,1
chr2	136537911	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,33:0.540:61:12,22:15,10:13,15,10,23
chr2	136545844	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	136548169	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.922:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr2	136548192	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,17,2
chr2	136565028	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	136567633	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr2	136570613	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:1,1:5,5:0,7,0,6
chr2	136594465	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:16,3:7,0:14,10,3,0
chr2	136609034	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,0:9,2:10,6,1,1
chr2	136614334	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:9,1:9,1:16,4,1,1
chr2	136615660	.	CA	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=138,146;MMQ=50,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:136615660_CA_TC:136615660:0,2,0,1
chr2	136615670	.	A	AATCACCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,1:0,0:1|0:136615660_CA_TC:136615660:0,0,0,1
chr2	136615671	.	G	GAGGTCAAGTGTTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,1:0,0:1|0:136615660_CA_TC:136615660:0,0,0,1
chr2	136622543	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:1,4:2,4:3,0,7,1
chr2	136622825	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	136633771	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	136633962	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,3:1,1:0,3,0,4
chr2	136634001	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	136674028	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:1,6,0,5
chr2	136680534	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:0,5,1,3
chr2	136690414	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=44.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.944:13:0,3:0,5:0,0,2,11
chr2	136690425	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.356:20:5,3:8,3:4,9,1,6
chr2	136740900	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,12,2
chr2	136743143	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:3,14:6,5:0,9,2,17
chr2	137814477	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:9,5:6,6:5,11,7,4
chr2	137999979	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr2	138000226	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	138030234	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.478:25:7,6:6,5:4,9,1,11
chr2	138030271	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:0,8,0,8
chr2	138163391	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,2,18
chr2	138169158	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,11,5
chr2	138208631	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr2	138417161	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:9,1:18,0,2,0
chr2	138417418	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=227,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:0,9,0,5
chr2	138759813	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,4:5,5:0,7,0,9
chr2	138762873	.	C	CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=61.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,5:0,0,0,15
chr2	138771760	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	139308512	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,3:0.050:78:36,3:38,0:34,41,0,3
chr2	139316934	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=104.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,21:0,12:0,0,9,24
chr2	139318315	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=147.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,17:0,23:0,0,40,0
chr2	139318332	.	CT	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.193:41:11,5:18,3:31,2,7,1
chr2	139429158	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=169,53144019;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,0:12,2:12,14,0,2
chr2	140992337	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:4,4:4,3:0|1:140992337_C_A:140992337:8,1,6,1
chr2	140992340	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,9:0.526:17:4,4:3,5:1|0:140992337_C_A:140992337:7,1,8,1
chr2	140997197	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr2	141027926	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.500:42:11,9:10,12:6,15,8,13
chr2	141032220	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr2	141108531	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:1,3:9,2:5,5,2,5
chr2	141110440	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr2	141110677	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=56,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:1,3,0,3
chr2	141130548	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:10,0,4,0
chr2	141130695	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=112,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,4:6,5:4,8,4,6
chr2	141135765	.	G	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,130;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,3:0.052:74:33,3:36,0:51,20,3,0
chr2	141135863	.	T	TA	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=65.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,30:0.534:56:13,15:13,14:10,16,13,17
chr2	141208313	.	T	TCTAGGAATAAAGGATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	141274665	.	A	AAACACC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=240,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141274665_A_AAACACC:141274665:0,1,0,1
chr2	141274668	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=240,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141274665_A_AAACACC:141274665:0,1,0,1
chr2	141274670	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=240,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141274665_A_AAACACC:141274665:0,1,0,1
chr2	141274672	.	T	TGGCAAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=240,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141274665_A_AAACACC:141274665:0,1,0,1
chr2	141283603	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=40,32;MFRL=163,197;MMQ=50,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:0,1,2,5
chr2	141291498	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	141294050	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr2	141294285	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=15,19;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.540:9:0,1:0,0:0,4,0,5
chr2	141298682	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,6,14
chr2	141299317	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=74.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,14:0,6:0,0,20,0
chr2	141356125	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr2	141459964	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:7,3:7,6:14,0,8,1
chr2	141474402	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=100,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	141533573	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:5,0,6,0
chr2	141533662	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:10,4:7,3:11,6,4,3
chr2	141598473	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,2:0,13:0,0,13,3
chr2	141598681	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,3:3,0:0,4,1,2
chr2	141625410	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,4:1,7:0,3,0,11
chr2	141625822	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=26,9;MFRL=163,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:14,0:10,0:14,17,0,4
chr2	141625823	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.179:36:12,0:8,0:13,16,0,7
chr2	141625828	.	G	C,T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,19,10;MFRL=165,124,186;MMQ=60,60,60;MPOS=26,12;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.23,8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,5,7:0.176,0.196:33:11,0,0:7,0,0:13,8,0,12
chr2	141625834	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=25,10;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.386:30:8,1:4,0:11,7,0,12
chr2	141708021	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr2	141709406	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:4,5:5,3:9,1,8,1
chr2	141709419	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.552:22:4,7:4,5:9,1,9,3
chr2	141747249	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:2,3,0,3
chr2	141762830	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:4,0,2,1
chr2	141763087	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=194,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr2	141771058	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=202,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:1,4:8,4:9,0,8,0
chr2	141819885	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:141819885_G_A:141819885:0,3,0,1
chr2	141819886	.	G	GTCACATGCTTTTACATCCTTACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,32;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:0,0:0|1:141819885_G_A:141819885:0,3,0,1
chr2	141945949	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,14,3
chr2	142012027	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=211,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:0|1:142012027_G_T:142012027:5,0,7,1
chr2	142012036	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,5:0.333:16:4,3:6,2:1|0:142012027_G_T:142012027:10,1,5,0
chr2	142237868	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	142888376	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=196,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr2	143676141	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=28,29,30,29;MFRL=146,148,160,156;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,21,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,15,16,18;RU=T;STR;TLOD=7.00,18.07,13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:17,6,12,10:0.122,0.276,0.231:45:9,3,11,5:7,3,1,4:16,1,26,2
chr2	143676169	.	C	G	.	.	DP=93;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,10:0.133:80:19,0:31,0:39,31,10,0
chr2	143676293	.	CA	TC	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,91;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,4:0.051:95:38,0:48,4:27,64,0,4
chr2	143787161	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr2	143787274	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=103.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,11:0,18:0,0,5,26
chr2	143913004	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr2	143973860	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,17:0,10:0,0,27,0
chr2	144245040	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:0|1:144245040_C_G:144245040:8,13,0,2
chr2	144245045	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:0|1:144245040_C_G:144245040:8,13,0,2
chr2	144710295	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=83.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,31:0.570:54:15,18:8,12:15,8,26,5
chr2	145146457	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=194,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:0,0:1,0:0,7,0,3
chr2	145153999	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:16,2:8,1:14,10,2,1
chr2	145155789	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,256;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,2,1
chr2	145156236	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=183,238;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:21,0:11,4:18,16,0,4
chr2	145255210	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr2	145274908	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:4,7:12,11:3,13,8,10
chr2	148712819	.	CT	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.097:44:15,2:25,1:38,2,4,0
chr2	148733548	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:6,2:3,3:2,7,2,3
chr2	149220318	.	TC	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	149240657	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	149520214	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=104.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,15:0,0,25,8
chr2	149526832	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,125;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.170:15:4,1:9,1:2,11,0,2
chr2	149542570	.	GGT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GT;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:7,1:9,2:4,12,1,2
chr2	149639294	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=87.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,30:0.818:36:3,17:3,13:4,2,28,2
chr2	149639328	.	T	C	.	.	DP=192;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=182,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=593.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,177:0.953:185:2,76:6,99:5,3,139,38
chr2	149853960	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr2	150320627	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,26,27,27;MFRL=135,91,141,67;MMQ=60,60,60,60;MPOS=7,23,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.76,21.04,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,3,11,2:0.119,0.396,0.096:27:6,0,7,1:4,3,4,1:10,1,16,0
chr2	150426399	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr2	150427516	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.428:21:4,5:8,3:12,0,9,0
chr2	150432377	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:9,10:10,10:1,18,0,20
chr2	150433128	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=203,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:0,7,0,5
chr2	150435889	.	C	CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:4,6:0,3:4,0,9,0
chr2	150443689	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=130.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,19:0,0,6,30
chr2	151328284	.	GAA	G,GA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,34,16;MFRL=141,113,164;MMQ=60,60,60;MPOS=16,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.96,17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,13:0.200,0.625:20:0,1,2:2,2,3:1,2,5,12
chr2	151343988	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=139,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:1,3:1,4:0,3,0,7
chr2	151857799	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,5:5,4:9,1,7,2
chr2	151890508	.	A	ACAATTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:151890508_A_ACAATTG:151890508:0,0,0,1
chr2	151890511	.	A	ACACATGTGAATGAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:151890508_A_ACAATTG:151890508:0,0,0,1
chr2	151900223	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,18:0,10:0,0,24,4
chr2	151900390	.	TAAAAACAAAAAC	T,TAAAAAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,112,141;MMQ=60,53,60;MPOS=26,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,4,5;RU=AAAAAC;STR;TLOD=6.89,12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.305,0.588:5:0,0,0:0,2,3:0,0,0,5
chr2	152107605	.	T	TGCTCTATAAAAAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=193,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.260:13:3,3:7,0:3,7,1,2
chr2	152108261	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr2	152117780	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,13:0,0,24,6
chr2	152118271	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,13:0,12:0|1:152118271_G_A:152118271:0,0,10,15
chr2	152118275	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0|1:152118271_G_A:152118271:0,0,9,15
chr2	152118338	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.934:11:0,5:0,5:0,0,1,10
chr2	152127169	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,6:1,5:3,0,11,0
chr2	152128155	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.089:31:17,2:12,0:15,14,2,0
chr2	152139271	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr2	152139493	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=169.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,16:0,31:0,0,10,37
chr2	152236045	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=9,14,11,16;MFRL=150,169,238,227;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,21,29;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.60,5.55,5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,3,3:0.199,0.325,0.324:9:0,0,0,1:0,0,1,0:0,1,0,8
chr2	152267072	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=162.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,24:0,20:0,0,6,38
chr2	152267672	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,11:0,12:0,0,24,0
chr2	152267721	.	ATT	A,AT	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=27,29,28;MFRL=87,195,156;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.84,171.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,67:0.065,0.910:72:1,2,34:0,2,31:1,0,65,6
chr2	152267897	.	G	GT,GTT	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=200,144,156;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=93.99,7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,40,7:0.775,0.138:51:2,24,4:2,14,2:0,4,0,47
chr2	152289767	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr2	152292169	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	152293320	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:2,2:2,2,4,0
chr2	152296510	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=135,150;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0|1:152296510_G_A:152296510:5,5,2,0
chr2	152296512	.	ACTATACCCTTCTTTTTGCTTTTTGATAGGT	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=128,150;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:4,1:5,1:0|1:152296510_G_A:152296510:9,15,2,0
chr2	152296545	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=129,150;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:12,1:0|1:152296510_G_A:152296510:9,16,2,0
chr2	152298562	.	T	TTTTTATTTTATTTTA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=TTTTA;STR;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.866:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr2	152303171	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr2	152314547	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	152346401	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=196,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr2	152348842	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr2	152349026	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr2	152350462	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr2	152353395	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr2	152359982	.	A	AGG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:0|1:152359982_A_AGG:152359982:0,17,0,2
chr2	152359983	.	A	ACATTTAAAAC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:0|1:152359982_A_AGG:152359982:0,17,0,2
chr2	152359987	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=163,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:0|1:152359982_A_AGG:152359982:0,16,0,2
chr2	152362681	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=95,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:14,5:6,11:10,10,13,3
chr2	152364589	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=111,160;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:2,1:11,6:4,9,2,5
chr2	152374800	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=57.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,6:0,0,15,2
chr2	152382454	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,9:0,0,12,5
chr2	152383913	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	152388228	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,8,1
chr2	152388415	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=39.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr2	152394534	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,10:0,0,3,22
chr2	152402878	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,0:8,2:7,5,1,1
chr2	152403014	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=115,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,1,5
chr2	152404294	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr2	152410043	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:1,0:3,1:1,5,0,2
chr2	152417311	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr2	152421937	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr2	152437986	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=227,256;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr2	152475938	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr2	152481977	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	152521212	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:0|1:152521212_G_A:152521212:11,6,2,0
chr2	152521235	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,2:0.106:26:13,2:11,0:1|0:152521212_G_A:152521212:18,6,2,0
chr2	152536175	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,0:0,0,6,0
chr2	152536179	.	CAAG	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,1:0,2:4,1,6,0
chr2	152536186	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,0:2,2:4,1,6,0
chr2	152536190	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.496:10:2,1:3,3:3,2,5,0
chr2	152537351	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:13,7:4,10:4,13,1,16
chr2	152551210	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,2:1,2:0,4,0,4
chr2	152552062	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:4,1,6,1
chr2	152573902	.	A	AGGC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGC;STR;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.417:24:7,4:6,4:8,6,6,4
chr2	152581866	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	152584153	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr2	152684704	.	A	AC	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.571:33:3,4:10,3:2,12,5,14
chr2	152698349	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,0:5,2:11,1,2,0
chr2	152725790	.	CAG	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.093:29:13,2:12,0:5,22,0,2
chr2	152726934	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:10,0,2,0
chr2	152988610	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:2,2:10,6:8,4,5,3
chr2	153000337	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:1,3,7,0
chr2	153001330	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=151,164;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:9,4,2,0
chr2	153001359	.	GAT	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=97,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,6:4,4:3,3,5,5
chr2	153004816	.	T	TA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:8,2:11,2:2,22,0,4
chr2	153192324	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,6:6,2:0,9,0,8
chr2	153378574	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.684:30:3,14:6,4:1,8,1,20
chr2	153415170	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=244,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr2	153415234	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,0:1,3:6,0,3,0
chr2	153415244	.	T	C,TC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,21,15;MFRL=0,184,166;MMQ=60,60,60;MPOS=12,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.65,7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.451,0.449:6:0,1,1:0,1,0:0,0,6,0
chr2	153415376	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,3,10
chr2	153417325	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr2	153463984	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30,30;MFRL=0,176,193;MMQ=60,60,60;MPOS=27,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=AC;STR;TLOD=9.99,8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,4:0.535,0.404:10:0,2,2:0,3,2:0,0,0,10
chr2	153473521	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=184,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,4:0,2:4,0,6,0
chr2	153473794	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=191,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:2,5:0,3:0,2,0,8
chr2	153475519	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:37,0:28,3:37,28,2,1
chr2	153476066	.	G	GCCA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,6:0,12:0,0,1,21
chr2	153481943	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr2	153483257	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:0,8:3,6:0,3,0,14
chr2	153492910	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:5,1,7,0
chr2	153514583	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	153515631	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=177,141;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:12,0:15,3:17,10,3,0
chr2	153515642	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=158,141;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,1:16,2:17,10,3,0
chr2	153519524	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,7:2,4:3,2,9,2
chr2	153519768	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr2	153520782	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.520:39:8,5:8,14:4,15,3,17
chr2	153520819	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:6,5:9,6:0,15,0,11
chr2	153535670	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=136.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,18:0,25:0,0,13,32
chr2	153572438	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,17,1
chr2	153576304	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,16;MFRL=181,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,0:14,0,2,0
chr2	153577013	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:5,5:7,9:10,2,7,7
chr2	155265623	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=208,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr2	155306885	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,14:0,6:0,0,16,4
chr2	157183211	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=48.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	157370018	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=14,35;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:1,2:3,1:2,7,1,2
chr2	157406296	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=165.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,28:0,18:0,0,8,38
chr2	157425502	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,1:1,0:0,1,0,5
chr2	157425801	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr2	157426114	.	ACTGGCAGCAAT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.881:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	157427593	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	157427837	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,7:0,0,1,18
chr2	157427850	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr2	158165004	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,19,0
chr2	158275111	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.522:13:3,1:2,3:3,3,1,6
chr2	158286972	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr2	158291107	.	T	TAG	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=115,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AG;STR;TLOD=48.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.593:30:6,8:2,4:12,0,13,5
chr2	158291118	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=163,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.084:57:29,4:23,0:38,15,4,0
chr2	158291173	.	A	AT	.	.	DP=117;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=145,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,4:0.050:96:46,0:46,4:43,49,4,0
chr2	158291188	.	A	C	.	.	DP=124;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=441.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,119:0.992:119:0,60:0,57:0,0,58,61
chr2	158291324	.	ATCTCTC	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=250,188;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=TC;STR;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.867:9:1,2:0,5:0,1,0,8
chr2	158395079	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=110.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,13:0,0,23,7
chr2	158400908	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,15,3
chr2	158401137	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,15:0,0,8,26
chr2	158406809	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=128,161;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:19,0:23,3:18,25,0,3
chr2	158412701	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,1:7,5:8,4,2,4
chr2	158443999	.	G	GCTAACATTTTTGACTGTAGGTCAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=83,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:158443999_G_GCTAACATTTTTGACTGTAGGTCAT:158443999:0,2,0,1
chr2	158444002	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=83,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:158443999_G_GCTAACATTTTTGACTGTAGGTCAT:158443999:0,2,0,1
chr2	158637136	.	GAA	G,GA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,34,35;MFRL=154,174,137;MMQ=60,60,60;MPOS=16,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.92,4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,3:0.174,0.206:17:3,0,1:5,2,2:1,10,0,6
chr2	158637137	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,2:1,3:1,0,0,14
chr2	158637138	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.341:17:4,0:7,2:1,10,0,6
chr2	158655883	.	C	CA,CAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33,34;MFRL=0,78,170;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=10.17,31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,16:0.281,0.680:22:0,3,11:0,3,5:0,0,20,2
chr2	158978178	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,9:2,4:0,6,1,12
chr2	159028800	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,2,17
chr2	159077019	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	159195225	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,5:6,5:7,2,9,1
chr2	159434802	.	ATC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TC;STR;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,6:5,5:1,7,1,10
chr2	159477439	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=229,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=T;STR;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:3,3:6,0,6,0
chr2	159498940	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr2	159519368	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.477:42:17,11:5,8:17,5,17,3
chr2	159683021	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=119,146;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.293:18:7,3:6,2:10,3,2,3
chr2	160005600	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.586:39:7,16:9,7:16,0,22,1
chr2	160027228	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,3:0.052:74:26,0:45,3:27,44,1,2
chr2	160055448	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,7:3,4:7,1,8,3
chr2	160075886	.	G	GC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=82.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,12:0,14:0,0,3,23
chr2	160082354	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,7:0,0,0,9
chr2	160082364	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr2	160082384	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr2	160084263	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	160084534	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	160084570	.	C	CATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	160086402	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:11,3:17,0:13,15,2,1
chr2	160087535	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=156.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,20:0,22:0,0,3,40
chr2	160092703	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.368:20:3,2:6,5:0,13,0,7
chr2	160116281	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=171.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,52:0.964:53:0,29:1,23:1,0,31,21
chr2	160132196	.	A	AC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,8:0,12:0,0,0,21
chr2	160176943	.	A	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=203.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,17:0,35:0,0,17,38
chr2	160182074	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr2	160203934	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr2	160204189	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:0,6,0,3
chr2	160204220	.	TTCC	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:3,1:0,0:0|1:160204220_TTCC_T:160204220:0,3,0,1
chr2	160204224	.	A	AAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:160204220_TTCC_T:160204220:0,2,0,1
chr2	160206607	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=150,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:13,3:13,0:19,8,3,0
chr2	160206637	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:16,3:9,0:15,10,3,0
chr2	160231108	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	160239378	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=237,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,6:0,1:0,2,0,7
chr2	160241936	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=199,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:2,1:5,4:0,8,0,5
chr2	160243183	.	TA	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	160253692	.	A	AAAC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:11,0:9,14,1,1
chr2	160253804	.	G	A	.	.	DP=103;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,11:0.120:97:42,7:43,4:61,25,10,1
chr2	160261721	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=208,179;MMQ=43,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:1,2:0,0:0|1:160261721_T_C:160261721:0,1,0,3
chr2	160261729	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:160261721_T_C:160261721:0,0,0,3
chr2	160285660	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:6,9:5,7:11,0,16,0
chr2	160289911	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=218,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr2	160294779	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:1,7:4,2:4,1,7,2
chr2	160295297	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,380;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	160295732	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.444:41:13,6:9,12:7,16,4,14
chr2	160304741	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.350:38:12,6:13,7:9,16,6,7
chr2	160585740	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:2,6:6,8:0,8,0,14
chr2	160599493	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:5,0,6,0
chr2	160604514	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.447:45:12,11:13,9:15,10,8,12
chr2	160604541	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,26:0.521:50:9,13:14,13:9,15,15,11
chr2	160634564	.	ACC	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=198,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:5,4:4,8:0,11,0,12
chr2	160634582	.	TAATATC	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=204,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.554:18:6,5:2,4:0,8,0,10
chr2	160637324	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr2	160663678	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,7:6,3:3,10,4,6
chr2	160664907	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,5:4,2:4,2,6,1
chr2	160667004	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:5,3,3,0
chr2	160672076	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,244;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:11,0:13,4:5,20,0,4
chr2	160676427	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,4:6,5:4,7,2,7
chr2	160676445	.	A	ATT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=117,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=T;STR;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,2:4,3:2,6,0,6
chr2	160690656	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,7:6,5:8,5,6,7
chr2	160698700	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,2:5,2:5,0,4,0
chr2	160698866	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,167;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.067:58:23,0:30,3:25,30,0,3
chr2	160708933	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=189,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,1:1,0:0,2,0,2
chr2	160708951	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=212,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	160710314	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr2	160711556	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	160729134	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,10:0,0,0,15
chr2	160729186	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	160735008	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.284:21:6,4:9,0:7,8,1,5
chr2	160737495	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	160737560	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,10,2
chr2	160742862	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=37,30;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	160840370	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:0,2:3,0,2,0
chr2	160843623	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,6:3,2:8,0,7,1
chr2	160873062	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:12,1,2,0
chr2	160884892	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,7:0.115:59:30,0:21,5:14,38,0,7
chr2	160884903	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,7:0.139:55:24,0:24,6:9,39,0,7
chr2	160885442	.	T	C	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,48:0.577:83:19,21:16,26:11,24,13,35
chr2	160889673	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,2:2,4:0,7,0,6
chr2	160918889	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0,18,0,2
chr2	160958349	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.877:22:0,10:2,6:0,2,0,20
chr2	160968743	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:6,3:5,4:2,10,0,8
chr2	161028992	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=205,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr2	161056398	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=191,232;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:0|1:161056398_C_A:161056398:13,0,3,0
chr2	161056405	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=191,232;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:0|1:161056398_C_A:161056398:13,0,3,0
chr2	161138652	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,5:2,2:3,0,7,0
chr2	161157303	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=78.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,28:0.725:38:4,15:6,13:0,10,0,28
chr2	161223688	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=192,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.474:36:13,10:6,7:19,0,16,1
chr2	162059969	.	A	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=196.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,38:0,24:0,0,54,9
chr2	162081128	.	AT	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.117:45:20,4:19,1:38,2,5,0
chr2	162087898	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=147,116;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:22,0:17,4:13,27,0,4
chr2	162091836	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=130.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,17:0,21:0,0,30,10
chr2	162091931	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.420:41:11,8:12,9:10,14,8,9
chr2	162175290	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=83.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,8:0,0,18,6
chr2	162224193	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=64.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,10:0,10:0,0,17,4
chr2	162224455	.	TC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,117;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:13,0:17,3:3,27,0,3
chr2	162247772	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr2	162251513	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:0,0:0|1:162251513_G_T:162251513:7,0,2,0
chr2	162251525	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=16,14;MFRL=156,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:0,0:1,0:0|1:162251513_G_T:162251513:6,0,2,0
chr2	162280748	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.967:29:0,10:0,9:0,0,10,19
chr2	162813417	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	162821515	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,4:5,3:8,0,7,0
chr2	162849944	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:5,1:1,2:0,7,0,3
chr2	162865826	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,0:15,3:9,17,0,3
chr2	162873188	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,1:1,4:7,0,5,0
chr2	162875333	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,0:10,3:10,6,2,1
chr2	162876825	.	T	TAAGAATGCTGAATATAGGCCCCTAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,0,1
chr2	162876921	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=178,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	162877041	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=143,139,164;MMQ=60,60,60;MPOS=17,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=A;STR;TLOD=4.12,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,2,3:0.106,0.136:25:11,1,2:7,1,1:18,2,4,1
chr2	162890175	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.606:23:3,7:4,5:1,8,1,13
chr2	162891848	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:8,8:11,7:5,14,3,12
chr2	162895359	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr2	163055209	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=184,145;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:0|1:163055209_A_C:163055209:17,1,2,0
chr2	163055218	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=167,145;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:8,2:19,0:0|1:163055209_A_C:163055209:23,5,2,0
chr2	163074587	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.091:53:25,4:22,0:23,26,3,1
chr2	163174342	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:4,0,8,0
chr2	163250987	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:4,7:8,3:5,7,0,10
chr2	163374577	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,22:0.638:34:5,13:7,9:4,8,12,10
chr2	163694878	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:163694878_C_G:163694878:0,0,7,0
chr2	163694886	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0|1:163694878_C_G:163694878:0,0,6,1
chr2	164466039	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	164468414	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	165349459	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	165358672	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr2	165365365	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.216:16:5,2:8,1:0,13,0,3
chr2	165383661	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=181,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	165552353	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,3:0,2:0,5,0,5
chr2	165556076	.	GAC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr2	165557318	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,2:0,0,0,9
chr2	165560236	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,29:0.653:44:7,17:8,12:3,12,4,25
chr2	165578581	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:6,9:9,6:14,1,14,1
chr2	165584407	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:2,4:4,0,6,0
chr2	165584793	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=199,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,0:3,4:1,10,0,4
chr2	165636332	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr2	165694012	.	CA	C,CAA	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=33,33,35;MFRL=162,167,159;MMQ=60,60,60;MPOS=27,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=5.96,11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:60,5,8:0.077,0.118:73:36,3,3:19,2,5:21,39,2,11
chr2	165765267	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:23,1:22,3:17,28,0,4
chr2	165809158	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,3:4,0:8,2,2,1
chr2	165949121	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165949121_T_A:165949121:0,0,0,1
chr2	165949122	.	A	AAAGAGTGTTTGAAAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165949121_T_A:165949121:0,0,0,1
chr2	165949124	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165949121_T_A:165949121:0,0,0,1
chr2	165972143	.	GG	TT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,197;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:4,0:13,6:0,17,0,6
chr2	165988022	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=196,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr2	166003573	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr2	166012203	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,227;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr2	166153499	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,24:0.367:66:16,16:26,8:36,6,15,9
chr2	166170127	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:10,3:5,8:10,5,8,3
chr2	166172317	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:1,7,1,7
chr2	166221569	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=196,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.385:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr2	166221582	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.527:9:2,1:2,0:4,0,5,0
chr2	166223900	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=196,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,3:2,8:1,3,3,8
chr2	166229922	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr2	166231195	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=156,143;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:166231195_G_A:166231195:9,6,2,0
chr2	166231198	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=155,143;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,1:9,0:0|1:166231195_G_A:166231195:10,6,2,0
chr2	166234076	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,7:0,2:1,0,5,4
chr2	166237768	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,0:12,2:0,17,0,2
chr2	166514594	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:0,6,0,5
chr2	166611086	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,3:1,1:7,0,3,1
chr2	166621354	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,13:0,0,19,2
chr2	166626606	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=212,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr2	166758447	.	TA	T,TAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=17,29,19;MFRL=170,161,168;MMQ=60,60,60;MPOS=21,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=8.71,4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,6,4:0.211,0.155:27:4,2,1:4,3,1:3,14,0,10
chr2	166786973	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	166797444	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.404:10:4,2:2,1:0|1:166797444_T_A:166797444:6,0,4,0
chr2	166797450	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0|1:166797444_T_A:166797444:0,0,12,0
chr2	166799893	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,7:0,0,2,17
chr2	166810150	.	T	TCCGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CCGC;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	166893081	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.383:16:4,1:5,4:0,10,1,5
chr2	166894230	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:7,4:7,4:14,0,9,0
chr2	166895913	.	CTTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34,35,35;MFRL=124,153,181,194;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,19,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,14,15;RU=T;STR;TLOD=10.57,20.83,4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,7,10,3:0.288,0.450,0.190:21:0,5,6,2:0,1,3,1:0,1,19,1
chr2	166896143	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:9,5:4,4:0,13,1,8
chr2	166896178	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:8,2:2,3:1,9,0,5
chr2	166898045	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=191,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:166898045_A_T:166898045:0,2,0,1
chr2	166898047	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=191,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:166898045_A_T:166898045:0,2,0,1
chr2	166898050	.	CA	TT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=37,31;MFRL=188,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:166898045_A_T:166898045:0,1,0,1
chr2	166898055	.	AAC	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=188,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:166898045_A_T:166898045:0,1,0,1
chr2	166898059	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=188,109;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:166898045_A_T:166898045:0,1,0,1
chr2	166900606	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	166903188	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	166904346	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr2	166905480	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.613:42:9,11:7,15:5,11,8,18
chr2	166913094	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=187,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:4,3:0,9,0,3
chr2	166915014	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:7,6:8,4:14,1,10,1
chr2	166930214	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr2	167060449	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,7,3
chr2	167060980	.	GAAAC	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=94.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,4,19
chr2	167082978	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=98.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,11:0,0,27,0
chr2	167085124	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	167085141	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr2	167090042	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	167129466	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=221,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	167134578	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=192,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr2	167136962	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:2,2:4,4:2,5,2,4
chr2	167137119	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,1:0,0,3,8
chr2	167138320	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.558:16:1,3:5,5:0,7,1,8
chr2	167138389	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	167140955	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:2,1:3,3:6,0,4,0
chr2	167149693	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,9:0,0:0|1:167149693_G_A:167149693:0,0,8,1
chr2	167149700	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=116,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:3,6:0,0:0|1:167149693_G_A:167149693:3,0,5,1
chr2	167151290	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=192,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr2	167162277	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.559:34:9,10:5,9:15,0,17,2
chr2	167163199	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr2	167163372	.	TC	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=186,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:3,3:6,0,5,0
chr2	167163663	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=208,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,3:4,1:0,11,0,4
chr2	167284520	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=171,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,1,2
chr2	167284532	.	C	CACT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=214,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:167284532_C_CACT:167284532:0,4,0,1
chr2	167284536	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=214,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:167284532_C_CACT:167284532:0,4,0,1
chr2	167284538	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=214,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:167284532_C_CACT:167284532:0,4,0,1
chr2	167289363	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	167313313	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=251,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	167313337	.	T	TATAGATAGATAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,0;MFRL=0,172;MMQ=60,52;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=ATAG;STR;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.840:4:0,0:0,0:0,0,4,0
chr2	167327064	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:2,9:10,5:12,0,12,2
chr2	167328750	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=232,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:5,6:2,6:7,0,12,0
chr2	167759948	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=109048920,250;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	168114567	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,2:5,1:4,4,0,3
chr2	168986154	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=138.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,16:0,21:0,0,18,19
chr2	168986330	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,3:8,2:0,12,0,5
chr2	168986358	.	C	CCCTCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=177,384;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	168986373	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=224,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:168986373_TA_T:168986373:0,2,0,1
chr2	168986376	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=142,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	168986377	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=224,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:168986373_TA_T:168986373:0,2,0,1
chr2	168996775	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,5:0,9:0,0,13,2
chr2	168997097	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=216,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=114.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.949:37:0,20:1,16:1,0,35,1
chr2	169487610	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=12,32;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.867:12:0,6:0,4:0,1,1,10
chr2	169487668	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	169571414	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,5,0
chr2	169622332	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.628:14:2,2:2,7:1,4,0,9
chr2	169622337	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=177,192;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:1,9,0,2
chr2	169681278	.	T	TTTTGTTTG,TTTTGTTTGTTTG	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,33,31;MFRL=92,174,136;MMQ=60,40,40;MPOS=15,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,7,8;RU=TTTG;STR;TLOD=24.33,6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,2:0.647,0.239:9:0,3,2:1,3,0:0,1,0,8
chr2	169690729	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:5,3,2,2
chr2	169699592	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,3:0.057:68:33,0:32,3:0|1:169699592_C_A:169699592:27,38,0,3
chr2	169699594	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,3:0.057:68:33,0:31,3:0|1:169699592_C_A:169699592:27,38,0,3
chr2	169707552	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chr2	169727879	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:4,2:6,4:9,1,7,0
chr2	169728069	.	GAAA	G,GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,16,23;MFRL=115,174,160;MMQ=60,60,60;MPOS=21,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=A;STR;TLOD=12.07,3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,2:0.474,0.231:11:0,0,1:2,0,0:1,2,1,7
chr2	169733857	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:19,0:16,4:13,22,0,4
chr2	169763148	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,10,1
chr2	169780101	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:15,1:14,2:23,7,1,2
chr2	169780366	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=233,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:4,4:1,3:0,6,1,7
chr2	169788825	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,161;MMQ=40,28;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:7,0,2,0
chr2	169801488	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=173.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,26:0,22:0,0,11,38
chr2	169814655	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,240;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr2	169820618	.	AT	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr2	169826462	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=112,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:169826462_C_G:169826462:1,0,2,0
chr2	169826463	.	CCATCCCT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.505:4:0,1:0,0:0|1:169826462_C_G:169826462:2,0,2,0
chr2	169828277	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,7:0,0,14,0
chr2	169828325	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,12:0,0,24,3
chr2	169830155	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr2	169836321	.	G	GGC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,37;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.498:8:4,4:0,0:0|1:169836321_G_GGC:169836321:0,4,4,0
chr2	169836326	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,2:1,0:0|1:169836321_G_GGC:169836321:1,5,3,0
chr2	169836332	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,0:2,0:0|1:169836321_G_GGC:169836321:3,5,3,0
chr2	169836472	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:7,6,0,2
chr2	169842809	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,1,15
chr2	169994021	.	A	AAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,16;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AG;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.263:9:3,0:2,0:1,6,0,2
chr2	170003432	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,11:0,0,8,16
chr2	170019195	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=147,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	170026211	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,3:10,0:14,6,2,1
chr2	170029800	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	170038904	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:170038904_A_C:170038904:0,0,0,1
chr2	170038908	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:170038904_A_C:170038904:0,0,0,1
chr2	170038912	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:170038904_A_C:170038904:0,0,0,1
chr2	170058237	.	C	CGGCTGGG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:8,0:8,2:10,6,0,2
chr2	170063783	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,2:6,5:1,9,1,6
chr2	170077133	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:170077133_G_T:170077133:0,3,0,1
chr2	170077135	.	TG	AA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:170077133_G_T:170077133:0,3,0,1
chr2	170077165	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	170082013	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=258,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr2	170089824	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=72,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr2	170089851	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=143,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:4,0,4,1
chr2	170096018	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.674:19:3,8:2,4:3,3,11,2
chr2	170099446	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,4:6,5:9,1,6,3
chr2	170099473	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.514:27:4,5:9,8:4,9,7,7
chr2	170099895	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:0|1:170099895_A_C:170099895:7,0,6,1
chr2	170099899	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:0|1:170099895_A_C:170099895:7,0,6,1
chr2	170129636	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	170134191	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	170139346	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr2	170147266	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=179,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:5,0,2,0
chr2	170148745	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,2:7,1:7,6,1,2
chr2	170163768	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:2,10:2,4:4,0,9,5
chr2	170218816	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr2	170218847	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr2	170336024	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,16,7
chr2	170355944	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:5,3:3,4:8,0,8,0
chr2	170359758	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=197,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,0:2,4:0,3,0,4
chr2	170366500	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:11,3:15,0:15,11,3,0
chr2	170371545	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=165,173;MMQ=53,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.528:17:3,1:2,3:0,8,1,8
chr2	170394487	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,7:5,5:10,2,8,4
chr2	170413601	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	170413860	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=254,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	170428127	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.646:29:6,13:4,6:6,4,12,7
chr2	170463551	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr2	170488454	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr2	170489566	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,154;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr2	170492567	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:13,7:11,11:20,4,17,3
chr2	170492584	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=86.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,29:0.462:63:16,12:17,17:23,11,22,7
chr2	170493103	.	T	A	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=112,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=139.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,48:0.564:85:19,25:17,22:21,16,34,14
chr2	170502343	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:7,0,3,1
chr2	170505684	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.517:33:12,11:3,6:12,4,15,2
chr2	170531010	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	170531572	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,22:0.366:61:18,11:20,11:8,31,5,17
chr2	170531614	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:11,4:15,4:0,26,0,8
chr2	170597835	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.374:12:3,2:4,2:7,1,4,0
chr2	170632896	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,29:0.484:60:7,11:24,18:25,6,21,8
chr2	170632960	.	C	CA	.	.	DP=66;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,23:0.433:54:8,13:21,8:13,18,10,13
chr2	170632969	.	C	A	.	.	DP=69;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,32:0.503:65:10,19:22,13:13,20,14,18
chr2	170633023	.	T	TA	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=70.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.602:38:3,9:12,12:2,13,4,19
chr2	170633067	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=191,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,3:6,8:1,8,0,11
chr2	170633103	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	170661988	.	A	AT	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=152,72;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.097:53:24,5:20,0:33,15,4,1
chr2	170662012	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=151,72;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.120:56:23,5:26,1:31,19,5,1
chr2	170665108	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr2	170668106	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=126.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,19:0,0,34,2
chr2	170676227	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr2	170677855	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=196,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr2	170735082	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,247;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.075:64:32,4:28,0:17,43,0,4
chr2	170762487	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,14:0,9:0,0,17,6
chr2	170780532	.	CT	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,5:0.100:55:29,3:18,2:23,27,4,1
chr2	170782037	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr2	170782338	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr2	170783092	.	CAAAAACA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAACA;STR;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.912:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr2	170850738	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=299,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,8,0
chr2	170857874	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=149,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:6,6,2,0
chr2	170871976	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	170873473	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=179,184;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:23,0:17,3:0,40,0,3
chr2	170917983	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=158,169;MMQ=56,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.734:16:0,1:3,9:0,4,0,12
chr2	171070810	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	171071206	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:17,1:16,2:25,10,1,2
chr2	171071369	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	171074008	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,0,16
chr2	171092445	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=183,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:6,0,6,2
chr2	171242761	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,24:0.567:42:8,13:10,10:10,8,8,16
chr2	171248017	.	C	CT	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.083:57:32,3:21,0:35,18,3,1
chr2	171256597	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=198,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr2	171259308	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr2	171260708	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr2	171300575	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=113,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:2,8,1,4
chr2	171300648	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr2	171319997	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr2	171323280	.	CTGTGTCCTAAGAT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,62308385;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	171358211	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	171503526	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:11,0:6,2:2,16,0,2
chr2	171508490	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	171654663	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr2	171704100	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=213,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	171786169	.	A	G	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,23:0.400:58:17,9:17,14:34,1,19,4
chr2	171786239	.	C	T	.	.	DP=125;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=116.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,47:0.410:115:40,21:27,25:34,34,25,22
chr2	171818092	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=180,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:2,0:7,2:8,1,2,0
chr2	171818289	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,2,17
chr2	171862578	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr2	171862954	.	TAAAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,4;RU=A;STR;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:1,1,8,0
chr2	171902604	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,8:0,0,12,0
chr2	171910256	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.603:28:7,4:2,12:5,6,10,7
chr2	171911712	.	G	C	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=17,17;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,7:0.109:58:11,0:10,0:15,36,0,7
chr2	171911713	.	C	CA	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.346:37:3,1:9,3:1,23,0,13
chr2	171912911	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:1,7:7,0:9,0,8,0
chr2	171916371	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=216,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr2	171938279	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,6:5,2:4,6,3,5
chr2	171938290	.	G	GAAAC	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=165,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.219:16:7,2:6,1:0|1:171938290_G_GAAAC:171938290:4,9,2,1
chr2	171938294	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=171,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:7,2:7,0:0|1:171938290_G_GAAAC:171938290:4,10,2,1
chr2	171938297	.	A	AGG	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=165,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,1:7,0:0|1:171938290_G_GAAAC:171938290:4,11,1,1
chr2	171938298	.	C	CAGCT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=165,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,1:7,0:0|1:171938290_G_GAAAC:171938290:4,11,1,1
chr2	172016718	.	C	CGGGGGGGGCG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGGGGGCG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr2	172187261	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=18,29;MFRL=156,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:3,1:1,2:1,8,0,3
chr2	172188413	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=155,87;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:14,0:6,2:0|1:172188413_G_T:172188413:3,17,1,1
chr2	172188421	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=155,87;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:5,1:0|1:172188413_G_T:172188413:1,17,1,1
chr2	172188429	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=182,132;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,0:2,2:0,12,0,2
chr2	172188442	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=31,34;MFRL=187,132;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,0:1,2:0,8,0,2
chr2	172188450	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=208,145;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:172188450_T_C:172188450:0,5,0,2
chr2	172188453	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=27,33;MFRL=208,145;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,0:0|1:172188450_T_C:172188450:0,5,0,2
chr2	172188459	.	G	GTA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=160,123;MMQ=60,28;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:172188450_T_C:172188450:0,3,0,1
chr2	172188461	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=160,123;MMQ=60,28;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:172188450_T_C:172188450:0,3,0,1
chr2	172188464	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,30;MFRL=204,123;MMQ=60,28;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:172188450_T_C:172188450:0,2,0,1
chr2	172305177	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,2:6,2:14,0,4,0
chr2	172379649	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:1,1:5,3:6,0,5,0
chr2	172398311	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.382:19:5,2:7,5:4,8,1,6
chr2	172398371	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=192,134;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:2,1:0|1:172398371_CT_C:172398371:0,3,0,1
chr2	172398381	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,36;MFRL=192,134;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:172398371_CT_C:172398371:0,3,0,1
chr2	172398398	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=206,134;MMQ=60,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:172398371_CT_C:172398371:0,3,0,1
chr2	172546856	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=213,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0,13,0,2
chr2	172549248	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=149.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,17:0,24:0,0,34,7
chr2	172582108	.	GTTT	G,GTT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,12,15;MFRL=157,0,159;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.39,7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,3,6:0.112,0.311:25:6,0,0:4,0,1:6,10,1,8
chr2	172582281	.	A	ATTAC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,8:0,0,3,17
chr2	172582344	.	AAC	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=93.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,12:0,9:0,0,19,2
chr2	172644229	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,8,11
chr2	172666735	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:20,2:17,0:19,19,2,0
chr2	172712480	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=67.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,9:0,0,0,19
chr2	172725301	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,7:0,0,6,12
chr2	172865009	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,6:0,0,2,14
chr2	172926409	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,0:7,2:2,18,0,2
chr2	172967302	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.481:41:6,6:15,11:6,15,3,17
chr2	173344474	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.491:43:8,10:13,11:7,15,9,12
chr2	173344893	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=177,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:173344893_G_A:173344893:0,1,0,1
chr2	173344895	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,21;MFRL=177,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:173344893_G_A:173344893:0,1,0,1
chr2	173368989	.	TA	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,244;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.169:31:7,2:15,3:5,21,0,5
chr2	173427053	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:9,7:8,9:3,15,6,11
chr2	173428874	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr2	173435374	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=207,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,0:1,0,3,0
chr2	173435578	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.152:26:12,0:8,2:7,15,0,4
chr2	173600783	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	173659913	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr2	173686798	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr2	173831934	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=222,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr2	173861105	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.509:12:3,4:3,2:6,0,6,0
chr2	173861340	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.560:25:5,6:5,8:0,11,0,14
chr2	173866110	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,17560212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:5,0:13,2:2,16,1,1
chr2	174055731	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=124.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,17:0,17:0,0,17,18
chr2	174074375	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	174074407	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr2	174097262	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:18,1:3,1:0,21,0,2
chr2	174104037	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr2	174123399	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	174131511	.	T	TAAA,TAAAA,TAAAAAAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,28,27,30;MFRL=178,157,152,147;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,13,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,20,21,24;RU=A;STR;TLOD=5.50,3.44,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,5,3,2:0.415,0.272,0.193:11:1,2,1,2:0,2,1,0:0,1,1,9
chr2	174224310	.	T	G,TCACAGAGTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31,30;MFRL=173,216,151;MMQ=60,60,60;MPOS=7,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.41,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.285,0.282:4:0,1,1:2,0,0:0,2,0,2
chr2	174224313	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=156,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:174224313_G_T:174224313:0,2,0,1
chr2	174224315	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=160,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:174224313_G_T:174224313:0,1,0,1
chr2	174227876	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,6:8,6:12,0,12,0
chr2	174229810	.	C	CACGGACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=233,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	174230153	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=153,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:4,2:8,4:8,4,5,1
chr2	174230974	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:0|1:174230974_G_T:174230974:4,0,6,1
chr2	174230983	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,4:0.335:13:4,2:5,2:1|0:174230974_G_T:174230974:6,3,4,0
chr2	174232076	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:1,4:6,8:0,7,0,12
chr2	174828657	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.330:18:2,1:3,2:3,9,0,6
chr2	174829845	.	AGCG	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCG;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,2:0.048:59:25,1:25,1:44,13,2,0
chr2	174943685	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.527:53:14,15:11,13:16,9,22,6
chr2	174946760	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=147,148;MMQ=57,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,7:7,4:6,6,5,6
chr2	175094190	.	T	A	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,7:0.145:53:29,0:17,7:14,32,0,7
chr2	175094198	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=149,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:27,0:18,3:10,36,0,3
chr2	175213774	.	AGAG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAG;STR;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,2:5,1:12,9,3,0
chr2	175215287	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=233,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	175245627	.	TATC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=215,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	175246386	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.150:30:4,2:14,2:19,7,4,0
chr2	175262970	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,4:5,2:5,0,6,0
chr2	175263218	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=197,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr2	175264627	.	CTTTTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33,32,35;MFRL=68,104,70,84598521;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,13,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.23,8.59,4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,4,4,2:0.277,0.311,0.207:12:2,0,0,2:0,4,4,0:2,0,9,1
chr2	175264768	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.065:61:33,0:20,3:23,35,0,3
chr2	175265666	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:5,8:7,7:12,0,14,1
chr2	175268763	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:7,0,2,2
chr2	175287778	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:9,7:6,7:1,14,4,10
chr2	175289144	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,3:4,4:6,0,6,1
chr2	175289259	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.480:48:11,12:14,11:14,11,12,11
chr2	175292364	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,1:0,6:5,0,7,0
chr2	175292580	.	TTCAAATTTATCAG	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCAAATTTATCAG;STR;TLOD=88.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.519:45:9,14:5,9:8,14,10,13
chr2	175306804	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.380:40:11,7:14,8:11,14,4,11
chr2	175309792	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=23326528,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.782:12:0,4:2,4:2,0,7,3
chr2	175318590	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=46,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.682:13:3,7:0,2:1,3,1,8
chr2	175324882	.	ATTT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,137;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=24,21;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr2	175335076	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr2	175335258	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=225,56;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr2	175426750	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,6:1,1:5,0,7,0
chr2	175431990	.	AAGAG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=AG;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.563:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr2	175432855	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=201,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,1:6,4:0,7,0,5
chr2	175436234	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	175439512	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,19,0
chr2	175439681	.	TA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,31,30,25;MFRL=153,185,156,145;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,17,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,12,14,15;RU=A;STR;TLOD=8.34,9.40,8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:14,6,6,5:0.175,0.215,0.181:31:5,1,0,2:6,5,4,2:3,11,3,14
chr2	175613059	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=92,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	175613600	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	175614905	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=202,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:1,0:3,2,0,2
chr2	175614908	.	CAAAA	C,CAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,32,28;MFRL=0,101,187;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.94,8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.333,0.394:6:1,2,1:0,0,1:1,0,1,4
chr2	175622788	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=132.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,20:0,22:0,0,11,31
chr2	175624107	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.583:19:2,3:3,6:3,5,5,6
chr2	175629021	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,24:0.613:39:10,12:4,12:14,1,21,3
chr2	175677022	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,7:4,3:7,2,9,1
chr2	175686571	.	C	CTGAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	175939604	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=177,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:1,3,1,4
chr2	175945338	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,1:0,5:0,0,7,0
chr2	175945502	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,2:3,3:4,4,1,4
chr2	175978826	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:28,0:28,3:18,38,0,3
chr2	176043000	.	G	C	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,122;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,3:0.052:74:34,3:35,0:51,20,3,0
chr2	176043906	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:3,10:4,6:6,1,12,4
chr2	176044008	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,3,22
chr2	176795003	.	AACACACACACACACACACACACAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=21,9;RU=AC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	176804220	.	T	TAC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.469:32:9,5:8,9:17,0,15,0
chr2	176844508	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.364:42:15,9:12,6:21,6,15,0
chr2	176844644	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,21:0.455:46:14,7:10,12:5,20,5,16
chr2	176996023	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.758:10:0,3:1,5:1,1,8,0
chr2	177033779	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:9,0,5,0
chr2	177054411	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,7:5,3:4,7,2,8
chr2	178129390	.	TGGC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:3,0:1,2:0,7,0,5
chr2	178301428	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr2	178326838	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,259;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:178326838_C_G:178326838:0,0,0,2
chr2	178326847	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,259;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:178326838_C_G:178326838:0,0,0,2
chr2	178358011	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,0:5,3:0,11,0,3
chr2	178362572	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,15:0,0,0,25
chr2	178364328	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,2:2,1:9,0,3,0
chr2	178364470	.	A	AAGCCATT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,2:10,0:8,13,0,2
chr2	178378452	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	178416162	.	C	CTGGTACTCAGTACTCCTTTA	.	.	DP=159;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,32970;MMQ=27,26;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:150,2:0.019:152:69,2:71,0:52,98,0,2
chr2	178417835	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr2	178494173	.	G	GGGA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=115,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGA;STR;TLOD=206.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,50:0.982:51:0,24:1,22:1,0,25,25
chr2	178528703	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr2	178534110	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	178534324	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	178540293	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=109.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,15,17
chr2	178545713	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	178565913	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.556:38:11,8:4,13:7,10,8,13
chr2	178576681	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	178592972	.	C	CAACTTCAACTCCTCTCTAAATCTT	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,36;MFRL=203,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.276:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	178592974	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	178592982	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=185,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:178592982_G_C:178592982:0,2,0,1
chr2	178592991	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=200,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:178592982_G_C:178592982:0,1,0,1
chr2	178592994	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=200,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:178592982_G_C:178592982:0,1,0,1
chr2	178592997	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=200,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:178592982_G_C:178592982:0,1,0,1
chr2	178633945	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:2,2:2,5:4,1,7,0
chr2	178681534	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,4:3,3:2,1,5,2
chr2	178681716	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr2	178684897	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,19:0.391:49:17,5:13,14:21,9,17,2
chr2	178685129	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,9:3,6:0,6,0,15
chr2	178704882	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	178764364	.	A	AATAT,AATATAT,AATATATAT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,27,15,30;MFRL=173,236,182,166;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,15,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,11,12,13;RU=AT;STR;TLOD=7.82,10.71,4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,4,2:0.189,0.268,0.156:16:2,0,1,0:5,2,0,2:0,7,0,9
chr2	178769992	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	178936272	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,5:4,5:5,6,6,4
chr2	178986132	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=208,190;MMQ=49,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	178990941	.	CAT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:8,3:3,2:1,12,0,5
chr2	179204421	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=179,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.193:13:8,1:1,0:0|1:179204421_AG_A:179204421:7,4,1,1
chr2	179204423	.	AAAG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=179,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.193:13:9,2:2,0:0|1:179204421_AG_A:179204421:7,4,1,1
chr2	179209007	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:18,2:37,1:37,22,1,2
chr2	179236831	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=60.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr2	179238841	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	179247665	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,39973;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:10,0,2,0
chr2	179248058	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=209,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,1:0|1:179248058_T_A:179248058:0,2,0,1
chr2	179248060	.	G	GCTTTTCCCTCATTCCTTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=209,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:179248058_T_A:179248058:0,2,0,1
chr2	179248061	.	G	GCTTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=209,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:179248058_T_A:179248058:0,2,0,1
chr2	179253796	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:2,4:2,4:4,1,3,5
chr2	179260382	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=210,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	179345690	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.314:18:6,0:6,0:8,4,0,6
chr2	179363909	.	AT	A,ATT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,33,31;MFRL=146,126,157;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=9.98,5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,10,6:0.275,0.179:34:10,6,3:7,3,3:17,1,13,3
chr2	179395851	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:18,3:13,0:25,7,3,0
chr2	179399576	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=36872348,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr2	179400592	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=187,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:179400592_A_G:179400592:0,2,0,1
chr2	179400596	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=187,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:179400592_A_G:179400592:0,2,0,1
chr2	179411771	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:11,5,2,0
chr2	179425677	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:5,6:7,8:4,8,8,6
chr2	179439798	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.072:40:21,0:15,2:21,17,1,1
chr2	179444209	.	A	AGGCAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=169,248;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr2	179444768	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,8,10
chr2	179452032	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:27,1:14,2:16,25,0,3
chr2	179453824	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,323;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,2:3,0:4,0,0,2
chr2	179456940	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.429:21:4,4:8,4:8,4,2,7
chr2	179473684	.	T	TACTCAAATAACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=14,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr2	179497291	.	GCTTCAAACATGTATTTTGCTTCAT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.089:32:12,2:12,0:13,17,1,1
chr2	179499288	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:9,11,1,1
chr2	179499958	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:5,6:11,11:7,9,7,10
chr2	179511767	.	GTATA	G,GTA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=151,151,184;MMQ=60,60,60;MPOS=9,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=TA;STR;TLOD=20.16,18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,8,9:0.265,0.297:30:4,1,4:7,7,4:10,3,16,1
chr2	179547455	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=121.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,40:0.592:68:7,16:18,24:8,20,17,23
chr2	179548695	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:4,4:4,1:8,2,5,0
chr2	179560229	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=178,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:1,4,0,4
chr2	179566146	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr2	179584804	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:8,7,1,1
chr2	179586648	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:21,0:10,3:17,15,0,3
chr2	179605725	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=100,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:2,4:4,6:3,3,9,1
chr2	179615595	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,7:4,4:2,6,5,6
chr2	179618019	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	179623939	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr2	179632710	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr2	179633298	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	179634376	.	GTA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr2	179635882	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr2	179639297	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179642283	.	A	ACCACGACCAGTTTTTATAACCTGTATC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=158,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:4,2:5,0:4,5,1,1
chr2	179642425	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr2	179643886	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr2	179643934	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr2	179647078	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,4:6,1:5,4,0,5
chr2	179650954	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	179656993	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	179660076	.	G	GGTGGGAGGAGGCAGTGAAGAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	179667090	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.555:34:8,10:7,9:2,13,4,15
chr2	179669261	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:12,2:5,0:12,6,2,0
chr2	179714675	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=253,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	179732908	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:9,12,0,2
chr2	179732980	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:2,1:3,0:0,5,0,1
chr2	179732981	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=197,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	179732997	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=189,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0,4,0,2
chr2	179753245	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,3:6,7:10,1,6,4
chr2	179912178	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,0:11,4:0,23,0,4
chr2	179980070	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	179988395	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.676:19:2,9:4,4:6,0,12,1
chr2	179989039	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,2:0,4:6,0,6,0
chr2	180011263	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=164,86;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:180011263_A_C:180011263:0,9,0,2
chr2	180011268	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=164,86;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:180011263_A_C:180011263:0,9,0,2
chr2	180039068	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=107.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,19:0,17:0,0,30,6
chr2	180047746	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=78.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,20,1
chr2	180307879	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	180610350	.	GG	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,2:2,0,4,0
chr2	180725481	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr2	180810264	.	A	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,20:0.328:62:20,13:22,6:26,16,15,5
chr2	180830789	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,142;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:0,3,0,3
chr2	180835589	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,9,14
chr2	180835792	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.503:30:7,6:6,9:3,12,4,11
chr2	180835822	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:5,4:6,8:0,11,2,10
chr2	180837806	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:6,0:1,4:7,0,5,0
chr2	180843126	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:0,4,0,6
chr2	180846743	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=117,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.303:27:12,2:7,5:5,14,1,7
chr2	181851996	.	TT	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,5:2,4:7,1,8,2
chr2	181927565	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.080:52:22,0:16,0:24,24,0,4
chr2	181927568	.	G	C	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=147,143;MMQ=57,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:19,0:14,0:21,22,0,5
chr2	181927570	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=26,17;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.060:53:23,0:12,0:21,29,0,3
chr2	182343385	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:4,4:0,8:5,0,12,0
chr2	182344846	.	G	GT	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,26:0.392:65:20,13:17,8:27,12,21,5
chr2	182350743	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:8,2:4,5:3,9,3,4
chr2	182359613	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr2	182376546	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=103.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,14:0,14:0,0,3,28
chr2	182387133	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr2	182399497	.	A	ATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,2:0,0,11,0
chr2	182402790	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,20,0
chr2	182403792	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr2	182412633	.	G	GACACACACACACAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,11;RU=AC;STR;TLOD=43.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,2:0,5:0,0,0,10
chr2	182413602	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	182521578	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,1:1,4,1,2
chr2	182766643	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:17,0:21,3:16,22,0,3
chr2	182774685	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=162,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:11,0:18,3:14,15,2,1
chr2	182774711	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.480:29:7,5:8,8:4,11,5,9
chr2	182775258	.	GCAA	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CAA;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:16,2:15,1:34,2,2,1
chr2	182780796	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.549:27:10,8:2,6:6,6,7,8
chr2	182850909	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:5,9,0,2
chr2	182852729	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=207,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	182928555	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,4,19
chr2	182981846	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:7,6:5,4:12,0,11,0
chr2	183033020	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:1,0:2,1:2,6,0,3
chr2	183066377	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.898:6:0,4:0,1:0,0,5,1
chr2	183070619	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:2,5:8,0,6,2
chr2	183088584	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.581:41:13,12:4,12:16,1,18,6
chr2	183129242	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=179,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:0,3,0,4
chr2	183593451	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr2	183594724	.	T	TTG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:6,0:9,2:1,14,0,2
chr2	183597318	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,6:0,5:1,0,1,10
chr2	183616592	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.845:4:0,2:0,2:0|1:183616592_C_T:183616592:0,0,0,4
chr2	183616596	.	ATC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=205,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:183616592_C_T:183616592:0,3,0,1
chr2	183616599	.	ATTAGTACAAAAACTGTGTCATTC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=217,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:183616592_C_T:183616592:1,3,0,1
chr2	183616748	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr2	183622319	.	AATAAT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAAT;STR;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,8:0,0:0,0,8,0
chr2	183627619	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr2	183702670	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,5:6,4:7,5,8,2
chr2	183817724	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,1:1,5:0,5,3,3
chr2	183817957	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:13,5:4,13:11,6,13,5
chr2	183827018	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,5:4,1:2,7,1,5
chr2	183829635	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=206,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr2	183832100	.	CA	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=19,26;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.331:24:5,2:2,2:0,16,0,8
chr2	183832180	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:4,0:10,2:0|1:183832180_TA_T:183832180:1,13,0,2
chr2	183832182	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,0:10,2:0|1:183832180_TA_T:183832180:1,13,0,2
chr2	183841691	.	GA	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.172:36:5,1:7,2:8,22,1,5
chr2	183843744	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=205,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:12,3:6,6:1,17,0,9
chr2	183848114	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=132,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:3,3:4,9:3,4,4,8
chr2	183851058	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr2	183995134	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,16;MFRL=151,162;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:1,0:5,1,2,0
chr2	183998366	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.805:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	184023000	.	A	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,50;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.073:52:29,3:20,0:42,7,3,0
chr2	184024143	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:5,0,6,0
chr2	185463815	.	C	CCT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.457:11:2,1:4,2:2,4,0,5
chr2	185798504	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,4:2,4,2,6
chr2	185802211	.	C	CACA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:5,5:3,3:5,3,4,4
chr2	185802243	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:4,4,2,2
chr2	186671256	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=174,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.436:28:10,10:5,2:4,12,6,6
chr2	186678241	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:3,6:4,10:7,0,16,0
chr2	186680041	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.405:17:5,2:5,3:9,1,7,0
chr2	186689258	.	GT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.213:21:6,2:11,2:0,17,0,4
chr2	186692859	.	CT	C,CTT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32,30;MFRL=156,142,201;MMQ=60,60,60;MPOS=21,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.31,3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,3:0.207,0.162:21:9,1,2:5,3,0:13,1,6,1
chr2	187364811	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr2	187364878	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.359:37:17,9:7,4:19,5,12,1
chr2	187369013	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr2	187455278	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=91.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,13:0,0,0,27
chr2	187487160	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,15:0,8:0,0,5,19
chr2	187490362	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=123,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.115:33:18,0:10,3:6,24,0,3
chr2	187490371	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=108.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,16:0,8:0,0,3,24
chr2	187490389	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,6:0,0,0,23
chr2	187501682	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr2	187503226	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=141,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,3:7,4:2,8,1,6
chr2	187529461	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=192,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,2:6,0:0,8,0,2
chr2	187529823	.	ATT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	187531856	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:9,2:5,3:12,2,5,0
chr2	187532010	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,5:8,7:1,14,0,12
chr2	187532417	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,9,11
chr2	187533741	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=210,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr2	187540732	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=222,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,5:2,1:0,2,0,6
chr2	187559029	.	A	ACAGCAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=CAG;STR;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.575:10:2,3:2,2:3,1,5,1
chr2	187559047	.	G	GCAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CAA;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.296:14:8,1:2,2:9,1,2,2
chr2	187559222	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr2	187605209	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,0:11,3:5,19,0,3
chr2	187611748	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr2	187626185	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:12,2:14,6,2,0
chr2	187627024	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:13,0:22,2:25,12,2,0
chr2	187692971	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:17,0:21,3:23,18,0,3
chr2	187698037	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	187709405	.	T	TA	.	.	DP=111;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,6:0.054:93:38,3:39,3:59,28,6,0
chr2	187709416	.	C	T	.	.	DP=129;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,5:0.048:120:54,4:58,1:84,31,5,0
chr2	188216783	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=93.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,9,19
chr2	188216807	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,14,9
chr2	188224057	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr2	188332692	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr2	189434711	.	G	GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:11,2:8,1:19,1,3,0
chr2	189448896	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,16,0
chr2	189448931	.	TATTTAGCATTACA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,19,0
chr2	189849966	.	G	C	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,131;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,5:0.080:73:30,0:37,5:26,42,0,5
chr2	189859434	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.156:27:10,2:9,1:18,5,2,2
chr2	189860996	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=187,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.182:14:9,1:3,1:0|1:189860996_G_T:189860996:2,10,0,2
chr2	189860998	.	AT	TG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=187,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:3,1:0|1:189860996_G_T:189860996:2,10,0,2
chr2	189861031	.	T	TAC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=200,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AC;STR;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:3,1,2,3
chr2	189862203	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr2	189867605	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:5,0:4,2:10,0,2,0
chr2	189870246	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:2,4:5,2:0,8,0,6
chr2	189874873	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,11,2
chr2	189899541	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=181,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	189899572	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	189901295	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=225,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	189910066	.	ATG	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=186,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TG;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.225:16:7,0:5,3:0,13,0,3
chr2	189918787	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:4,4:6,4:7,4,7,1
chr2	189923104	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,14:0,6:0,0,21,0
chr2	189923630	.	ATT	A,AT	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=25,29,28;MFRL=120,173,143;MMQ=60,60,60;MPOS=26,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=5.42,47.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,5,24:0.097,0.494:50:12,3,11:8,2,12:7,14,7,22
chr2	189925548	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=111.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,14:0,19:0,0,11,23
chr2	189926229	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,2:2,4:3,1,6,1
chr2	189927506	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,18,0
chr2	189928834	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=217,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,5:3,1:0,4,1,5
chr2	189933686	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=222,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr2	189936687	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=55.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.514:35:7,7:10,11:13,4,13,5
chr2	189943121	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	189945654	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:0,4:6,6:6,0,8,2
chr2	189948651	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:1,4:6,3:8,0,6,1
chr2	189949786	.	TG	AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:9,6:4,7:13,0,13,0
chr2	189950556	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=268,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr2	189953551	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:8,5:8,6:1,15,0,11
chr2	189964747	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:9,5:6,6:11,4,9,2
chr2	189964970	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.649:26:3,11:5,6:0,9,2,15
chr2	190313235	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:24,3:19,0:13,30,1,2
chr2	190313396	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr2	190319966	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=0,208;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	190319990	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	190322196	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	190323515	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=148,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,3:14,0:22,5,3,0
chr2	190323530	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,17:0,22:0,0,26,14
chr2	190327126	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr2	190443304	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr2	190444630	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=101.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,12:0,0,8,22
chr2	190445076	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=76.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,15,6
chr2	190535538	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	190554759	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=209,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr2	190556898	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=193,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	190570001	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=51.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,8:0,9:0,0,1,18
chr2	190593168	.	ATTTTT	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.453:62:19,18:15,8:13,21,16,12
chr2	190593311	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,6:0,1:0,0,6,2
chr2	190603201	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=242,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:0,1:2,0,2,0
chr2	190611084	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,25:0.419:60:16,12:17,12:23,12,18,7
chr2	190611414	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,13:0,0,0,19
chr2	190636411	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:9,0,3,0
chr2	190636664	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:10,0:7,5:0,18,0,5
chr2	190640475	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:4,4:9,6:0,13,0,10
chr2	190647108	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,9:0,1:0,0,9,1
chr2	190670539	.	TA	T,TAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,27,27;MFRL=152,199,124;MMQ=60,60,60;MPOS=10,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.74,18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,14:0.128,0.476:28:4,3,8:7,0,6:8,3,15,2
chr2	190742249	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=261,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:190742249_A_C:190742249:0,2,0,1
chr2	190742251	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=261,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:190742249_A_C:190742249:0,2,0,1
chr2	190742261	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=261,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:190742249_A_C:190742249:0,2,0,1
chr2	190742262	.	T	TCTCG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=261,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:190742249_A_C:190742249:0,2,0,1
chr2	190925030	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:17,0:16,4:10,24,0,4
chr2	191159232	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=89.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,21,3
chr2	191161622	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=194.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,28:0,30:0,0,23,38
chr2	191161628	.	CT	C	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=138,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.085:57:22,1:26,3:19,34,1,3
chr2	191175639	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.733:9:0,3:2,4:0,2,0,7
chr2	191184524	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.473:51:13,13:13,11:11,16,12,12
chr2	191334424	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:1,8:2,2:4,0,10,0
chr2	191334459	.	A	ATTTTTAT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTTAT;STR;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.902:17:1,8:0,3:1,0,13,3
chr2	191353569	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:24,0:27,3:10,41,0,3
chr2	191354491	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.566:35:11,13:4,5:13,2,14,6
chr2	191354658	.	C	CCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr2	191364708	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:4,8:13,4:10,7,8,5
chr2	191375349	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=147,240;MMQ=60,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	191375355	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=147,240;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	191390126	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,6:0,14:0,0,3,18
chr2	191523862	.	CT	C,CTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=156,179,206;MMQ=60,60,60;MPOS=25,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=8.40,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.503,0.299:7:0,1,1:1,3,1:1,0,6,0
chr2	191552121	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:2,1:1,4,0,1
chr2	191552132	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:191552132_A_C:191552132:1,3,0,1
chr2	191552139	.	A	ACACCG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:191552132_A_C:191552132:1,3,0,1
chr2	191552143	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:191552132_A_C:191552132:1,3,0,1
chr2	191765206	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	191818243	.	ATG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=115,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:2,5:7,4:6,4,7,2
chr2	191835392	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=117,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:9,2:2,0:10,1,2,0
chr2	191839464	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,2:2,1:5,0,4,0
chr2	191841470	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,276;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,2:3,0:7,0,2,0
chr2	191844608	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=156,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,0:8,3:2,14,0,3
chr2	191848312	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr2	191899344	.	G	GGGAGAAAAAGTTTGC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,2:11,0:6,15,0,2
chr2	191923026	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=224,199;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:3,7:0,1:0,3,0,8
chr2	191923064	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr2	191941112	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,163;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:0,14,0,2
chr2	191996518	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr2	192011485	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,1:5,2:1,16,0,3
chr2	192160970	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,7:5,4:2,6,3,8
chr2	192214833	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,8:3,3:9,1,10,1
chr2	192225294	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,2:5,8:9,0,9,1
chr2	192225477	.	G	GTGTTGTTGT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=145,167;MMQ=60,45;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=TGT;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.386:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	192226908	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,4:1,6:3,0,10,0
chr2	192246149	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,1:10,1:18,7,1,1
chr2	192250543	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,24,0
chr2	192250568	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=129.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,18:0,0,31,6
chr2	192279402	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,1:6,1:3,15,2,0
chr2	192283457	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	192547290	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:19,0:14,3:13,21,0,3
chr2	192701249	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:11,7,0,2
chr2	192711162	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=102.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,11:0,0,22,6
chr2	192818623	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=170,144;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:192818623_T_TA:192818623:0,3,0,1
chr2	192818628	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=201,144;MMQ=40,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:192818623_T_TA:192818623:0,4,0,1
chr2	192818646	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=201,192;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:2,2:0,4,0,3
chr2	192818654	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=170,212;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	192820898	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=164,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr2	196578313	.	CT	C	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.241:42:7,4:19,5:3,29,1,9
chr2	196578323	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=133,134;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.137:49:19,0:22,6:8,35,0,6
chr2	196581295	.	T	TGTCTAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr2	196636662	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	196663997	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:4,3:4,7:5,4,9,2
chr2	196681284	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,2:3,5:9,0,6,1
chr2	196698879	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,68;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:10,1,1,1
chr2	196726712	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,1:8,1:0,10,0,2
chr2	196729374	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=201,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:8,5,1,1
chr2	196738365	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,2:7,4:4,5,4,2
chr2	196749544	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=206,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr2	196750840	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:4,0:3,3:6,1,2,1
chr2	196756535	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=54.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,7:0,11:0,0,0,20
chr2	196762491	.	TA	T,TAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,10,10;MFRL=208,195,194;MMQ=60,60,60;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=8.47,6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,6,5:0.386,0.328:15:0,1,0:2,0,1:0,4,1,10
chr2	196765294	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=206,270;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	196771780	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr2	196799297	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:6,2:10,3:16,0,4,1
chr2	196836945	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=110,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:1,5:8,0:5,4,3,2
chr2	196837129	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.618:29:5,8:5,10:1,10,7,11
chr2	196837268	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=177,257;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:196837268_A_C:196837268:0,2,0,1
chr2	196837270	.	A	ATCAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=177,257;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:196837268_A_C:196837268:0,2,0,1
chr2	196837273	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=177,257;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:196837268_A_C:196837268:0,2,0,1
chr2	196891449	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=200,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:0,6:3,4:2,1,8,2
chr2	196912067	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,10:0,0,15,4
chr2	196933462	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.523:42:10,13:10,9:9,11,8,14
chr2	196933558	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr2	197010823	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr2	197021086	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:5,1,8,0
chr2	197021141	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=169,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.390:39:9,8:15,7:19,5,14,1
chr2	197065964	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.554:34:8,7:6,10:12,3,14,5
chr2	197066175	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:3,3:2,1:1,6,0,7
chr2	197106759	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,7:0,0,16,5
chr2	197122493	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,13,1
chr2	197138653	.	GC	AA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=207,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:5,0,8,0
chr2	197143469	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:0,5,0,8
chr2	197171175	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0|1:197171175_C_T:197171175:0,0,12,2
chr2	197171183	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.448:16:6,3:2,4:0|1:197171175_C_T:197171175:7,2,5,2
chr2	197172816	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,2,15
chr2	197185251	.	T	TCTCCTTTGTCATCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=187,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.193:13:7,1:3,1:1,10,0,2
chr2	197208538	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:7,0:0,11,0,2
chr2	197298222	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,5:0,11:0|1:197298222_T_C:197298222:0,0,0,18
chr2	197298232	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,5:0,11:0|1:197298222_T_C:197298222:0,0,0,17
chr2	197531518	.	CA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.281:38:14,4:10,7:14,13,1,10
chr2	197534692	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr2	197536994	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=174,143;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.285:26:13,7:6,0:0|1:197536994_C_T:197536994:16,3,7,0
chr2	197537001	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=180,143;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.276:27:12,6:8,0:0|1:197536994_C_T:197536994:17,3,7,0
chr2	197541087	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,0;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr2	197584453	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:197584453_G_A:197584453:0,3,0,1
chr2	197584460	.	A	ATCGTAATCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:197584453_G_A:197584453:0,2,0,1
chr2	197594203	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	197595762	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,7:0,0,1,11
chr2	197640051	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=209,232;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:197640051_CT_C:197640051:0,2,0,1
chr2	197640061	.	AT	TC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=228,211;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:197640051_CT_C:197640051:0,1,0,2
chr2	197640064	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=228,211;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:197640051_CT_C:197640051:0,1,0,2
chr2	197640073	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,34;MFRL=228,232;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:197640051_CT_C:197640051:0,1,0,1
chr2	197640075	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=228,232;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:197640051_CT_C:197640051:0,1,0,1
chr2	197643854	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:0,1:4,1:0,7,0,2
chr2	197645397	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,1:0,5:2,3,0,6
chr2	197654578	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=215,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr2	197657763	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,2:0.034:87:41,0:42,2:30,55,1,1
chr2	197664521	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	197709173	.	T	TA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.171:42:17,4:16,3:23,12,6,1
chr2	197710787	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=204,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.509:22:7,7:2,4:0,11,0,11
chr2	197762941	.	CA	C,CAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=139,174,135;MMQ=60,60,60;MPOS=10,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.43,7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,6,6:0.197,0.225:27:6,5,1:9,1,2:15,0,8,4
chr2	197777589	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,11:0,0,14,6
chr2	197791434	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr2	197832281	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=198,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:197832281_G_T:197832281:0,2,0,1
chr2	197832294	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=196,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:197832281_G_T:197832281:0,1,0,1
chr2	197854233	.	T	TAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=227,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.761:6:0,3:0,2:1,0,4,1
chr2	197863214	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,1,36
chr2	197863851	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,7:0,0,0,15
chr2	197872608	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:3,2:5,4,2,1
chr2	197872727	.	T	TTCTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TC;STR;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,2:0,0,0,6
chr2	197873563	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	197873839	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=158,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	197873849	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=158,153;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:197873849_C_T:197873849:0,3,0,1
chr2	197873855	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=158,153;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:197873849_C_T:197873849:0,1,0,1
chr2	197873856	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=158,153;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:197873849_C_T:197873849:0,1,0,1
chr2	197943382	.	ATG	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.148:27:12,1:7,3:13,10,2,2
chr2	197953372	.	TAAGTC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGTC;STR;TLOD=73.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,7:0,8:0,0,17,0
chr2	197954780	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr2	197954860	.	G	GATTTCAGATTTTTAGCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,239;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	197986048	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr2	197990509	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	198001443	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,0,14
chr2	198011904	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,0,29
chr2	198051804	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,0:10,3:9,11,2,1
chr2	198257652	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.417:17:5,4:4,3:10,0,7,0
chr2	198264715	.	G	GA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.122:38:13,2:20,2:34,0,4,0
chr2	198265173	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.523:35:9,7:6,11:1,16,1,17
chr2	198265350	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=313,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr2	198266943	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	198267243	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr2	198267770	.	G	GAA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=85.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,25:0.619:40:4,10:10,14:4,11,9,16
chr2	198273267	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,2:11,1:3,14,2,1
chr2	198351804	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=182,181;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,1:5,10:10,0,11,0
chr2	198358785	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,19:0.416:46:12,14:15,5:27,0,19,0
chr2	198365043	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.457:48:15,10:11,11:26,0,21,1
chr2	198400383	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=152,109;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:8,0:18,2:6,20,0,2
chr2	198413210	.	AGGG	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=204,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=G;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:198413210_AGGG_A:198413210:0,3,0,1
chr2	198413214	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=204,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:198413210_AGGG_A:198413210:0,3,0,1
chr2	198413216	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=205,227;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:198413210_AGGG_A:198413210:0,2,0,1
chr2	198413219	.	G	GCCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=206,227;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:198413210_AGGG_A:198413210:0,1,0,1
chr2	198508951	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.414:39:11,7:12,9:9,14,10,6
chr2	198563505	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,1,0
chr2	198572076	.	A	ATTC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTC;STR;TLOD=70.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.525:36:4,10:13,7:12,5,10,9
chr2	198621104	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:10,4:12,0:21,1,4,0
chr2	198643631	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=160,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:0|1:198643631_G_A:198643631:4,1,2,4
chr2	198643651	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:2,1:3,4:0|1:198643631_G_A:198643631:3,3,0,5
chr2	198950756	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,0:9,2:7,14,2,0
chr2	198950968	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,3:0,8,0,8
chr2	198953816	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:6,1:1,2:1,6,0,3
chr2	198953848	.	GA	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=214,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	200137083	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:21,2:8,1:20,9,3,0
chr2	200173545	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:19,2:14,0:25,12,1,1
chr2	200173684	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,3,17
chr2	200245245	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	200298313	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	200820505	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,11:0,4:0,0,15,0
chr2	201194095	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=165,82;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:13,4:9,0:11,12,3,1
chr2	201254049	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,2,17
chr2	201277011	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.363:13:6,3:2,1:8,0,5,0
chr2	201281018	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,14;MFRL=138,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:2,0:2,0:3,2,3,0
chr2	201281022	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=136,167;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:4,0:4,4,2,0
chr2	201371768	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:6,4:12,5:1,17,3,6
chr2	201397647	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=166.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,21:0,23:0,0,45,1
chr2	201457954	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=129,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:11,0:13,4:8,17,0,4
chr2	201462068	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr2	201464295	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=100,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,1:3,1:3,0,3,0
chr2	201469496	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:20,2:14,0:10,25,0,2
chr2	201470233	.	ATTT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.604:13:1,5:3,3:5,0,7,1
chr2	201473674	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:6,4:12,9:12,6,7,6
chr2	201474237	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:0,4,0,8
chr2	201485368	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,84739999;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:10,1:11,1:17,5,2,0
chr2	201485572	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:7,6:3,6:0,11,0,12
chr2	201485747	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=37,23;MFRL=200,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr2	201485830	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,8:6,1:8,0,9,0
chr2	201488758	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr2	201515780	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.096:49:19,0:26,4:30,15,1,3
chr2	201515939	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:1,12:0,11:1,0,1,23
chr2	201533311	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,2:6,0:7,1,2,0
chr2	201677454	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.515:37:8,8:9,11:14,4,14,5
chr2	201683695	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:7,3:8,11:0,15,0,14
chr2	201718559	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:2,0,5,1
chr2	201719258	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=157,178;MMQ=50,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:0,2:2,0,4,0
chr2	201722666	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:5,2,3,4
chr2	201778717	.	TA	T,TAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=15,10,13;MFRL=166,157,148;MMQ=60,60,60;MPOS=24,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=10.47,6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,4:0.274,0.275:16:1,0,0:1,0,0:0,7,0,9
chr2	201791717	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:201791717_A_C:201791717:0,3,0,1
chr2	201791723	.	A	ACTGGGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:201791717_A_C:201791717:0,3,0,1
chr2	201802625	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,244;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,4:0.065:74:37,0:33,4:40,30,0,4
chr2	201994906	.	GA	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,9;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.549:7:1,0:2,0:0|1:201994906_GA_TG:201994906:1,2,0,4
chr2	201994910	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.620:6:1,0:1,0:0|1:201994906_GA_TG:201994906:1,1,0,4
chr2	202010041	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:22,3:25,0:33,15,3,0
chr2	202013854	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:6,3:10,2:0,16,0,5
chr2	202073781	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=103,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.399:23:4,3:8,0:4,9,10,0
chr2	202139698	.	CT	C	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.089:53:26,1:22,3:22,27,0,4
chr2	202139739	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=19,23,20,30;MFRL=0,247,150,139;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,19,30;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.95,10.30,6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,3,6,4:0.172,0.333,0.234:18:1,1,1,1:1,1,2,1:0,5,1,12
chr2	202151163	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr2	202151344	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=140,102;MMQ=60,28;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.109:25:15,0:8,2:0|1:202151344_G_A:202151344:10,13,0,2
chr2	202151348	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=138,102;MMQ=60,28;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:0|1:202151344_G_A:202151344:10,12,0,2
chr2	202151349	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=138,102;MMQ=60,28;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:6,2:0|1:202151344_G_A:202151344:10,12,0,2
chr2	202173926	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=154,53;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:12,2:7,1:0|1:202173926_C_T:202173926:8,11,1,2
chr2	202173950	.	T	TGTCTTTCTCTG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=162,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:7,0:0|1:202173926_C_T:202173926:8,12,1,1
chr2	202211443	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr2	202211469	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:202211469_T_TC:202211469:0,1,0,1
chr2	202211470	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:202211469_T_TC:202211469:0,1,0,1
chr2	202211474	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:202211469_T_TC:202211469:0,1,0,1
chr2	202211478	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:202211469_T_TC:202211469:0,1,0,1
chr2	202213061	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,6:0,1:0,1,1,6
chr2	202215409	.	C	CAAAACAAAACAAAACAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAACAAAACAAAACAA;STR;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.597:13:1,0:4,1:4,1,4,4
chr2	202216069	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,2:10,0:15,6,1,1
chr2	202245244	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:4,13:3,1:7,0,12,2
chr2	202245944	.	TAA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=207,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.647:12:2,3:1,5:0,4,1,7
chr2	202245955	.	AA	GA,TT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,34,31;MFRL=173,149,230;MMQ=60,60,60;MPOS=14,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=34.90,6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,9,2:0.625,0.187:13:2,3,1:0,6,1:0,2,1,10
chr2	202248788	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.500:44:12,8:10,14:20,2,18,4
chr2	202248898	.	A	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=153,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:36,0:23,3:23,36,0,3
chr2	202248979	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.445:38:9,8:12,7:2,19,0,17
chr2	202254288	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=208,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr2	202263164	.	T	TAATGCCCTCTCTGTTGTTTAAATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=214,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:0,1:3,1:0|1:202263164_T_TAATGCCCTCTCTGTTGTTTAAATA:202263164:0,3,1,1
chr2	202263168	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,13;MFRL=214,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:202263164_T_TAATGCCCTCTCTGTTGTTTAAATA:202263164:0,3,0,1
chr2	202272032	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=232,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr2	202285100	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.651:21:6,4:1,9:6,1,10,4
chr2	202323618	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=138,79;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,2:0.047:62:38,0:20,2:0|1:202323618_T_C:202323618:28,32,1,1
chr2	202323623	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=137,79;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.050:57:35,0:16,1:0|1:202323618_T_C:202323618:24,31,1,1
chr2	202342737	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.426:15:7,5:2,1:8,1,5,1
chr2	202342802	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,29:0.589:49:9,19:11,9:14,6,20,9
chr2	202344179	.	GT	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=108.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,42:0.930:45:1,19:2,23:2,1,27,15
chr2	202352649	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=127,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr2	202402225	.	TATTTTATTTTACATAAAAACAATAAACACATATGTATGTACATTAATAAAATACTATTAC	T	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,17:0.050:98:27,6:29,9:21,60,2,15
chr2	202402250	.	AAC	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=161.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.980:40:0,20:0,20:0,0,8,32
chr2	202410377	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=182,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:4,0:9,3:0,15,3,0
chr2	202410395	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,11:0,0,0,21
chr2	202447009	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	202469472	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	202491995	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,6:3,3:8,0,8,1
chr2	202503797	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,48;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,3:15,0:1,22,0,3
chr2	202505545	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,29:0.566:51:13,16:9,13:14,8,22,7
chr2	202505740	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,0,20
chr2	202507982	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,3:0,5:0|1:202507982_T_C:202507982:0,0,8,2
chr2	202507999	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.245:9:4,0:3,0:0|1:202507982_T_C:202507982:0,7,2,0
chr2	202509885	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,5:5,4:5,2,9,0
chr2	202512647	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=1156,262;MMQ=50,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	202523347	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	202528830	.	A	AT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=96.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,13:0,18:0,0,13,18
chr2	202528906	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=175,109;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,0:13,2:10,18,0,2
chr2	202529786	.	C	CTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=230,163;MMQ=50,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=20,22;RU=T;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.639:6:1,2:0,2:1,1,2,2
chr2	202531136	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr2	202546113	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr2	202566741	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr2	202569992	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,3,13
chr2	202570232	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,2,22
chr2	202574825	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	202575907	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	202580370	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=69.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,13:0,8:0,0,18,4
chr2	202587857	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,129;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,0:14,3:1,22,0,3
chr2	202588182	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:10,3:1,18,0,3
chr2	202606639	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	202633725	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29,31;MFRL=242,211,65;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.28,5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.277,0.309:7:1,1,1:1,1,1:0,3,1,3
chr2	202688293	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr2	202712095	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=91.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,15:0,0,18,7
chr2	202736953	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,8:6,1:11,3,8,1
chr2	202737083	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:7,7:8,4:5,10,0,11
chr2	202902385	.	TA	T	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,10:0.109:93:30,5:44,5:51,32,6,4
chr2	202939804	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.324:29:14,4:5,5:7,13,5,4
chr2	202955454	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0,0,21,2
chr2	202962358	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=212,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,6:1,0:0,4,0,6
chr2	202964528	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr2	202964986	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.470:13:5,4:2,2:6,1,6,0
chr2	202965222	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:1,4,0,9
chr2	202970722	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=190,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr2	202978198	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=207,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:2,2:0,3,0,2
chr2	202979369	.	G	GACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr2	202979791	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,3:2,1:1,6,1,3
chr2	203003066	.	G	GGTGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=GT;STR;TLOD=56.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,7:0,3:0|1:203003066_G_GGTGT:203003066:0,0,12,1
chr2	203003085	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:4,7:2,1:0|1:203003066_G_GGTGT:203003066:5,1,7,1
chr2	203029951	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:5,0,6,0
chr2	203051886	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	203079025	.	TA	T,TAA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=25,27,27;MFRL=147,177,172;MMQ=60,60,60;MPOS=14,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=9.95,6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,9,7:0.221,0.194:35:10,4,4:7,4,3:16,3,12,4
chr2	203096235	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=195,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:203096235_G_A:203096235:1,0,1,0
chr2	203096241	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=195,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:203096235_G_A:203096235:1,0,1,0
chr2	203139738	.	A	AC	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=132.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,18:0,17:0,0,34,2
chr2	203152355	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=122,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:6,11:3,4:8,1,13,2
chr2	203165101	.	AT	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:20,2:20,2:8,34,1,3
chr2	203168235	.	C	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=110.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,34:0.614:55:10,13:11,21:0,21,2,32
chr2	203384776	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:1,3:1,6:1,2,10,1
chr2	203624164	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=202,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,2:4,0:0|1:203624164_C_G:203624164:0,11,0,2
chr2	203624166	.	G	GTAGTGGCATGAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=202,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:3,0:0|1:203624164_C_G:203624164:0,11,0,2
chr2	203630102	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=89,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr2	203650558	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=161,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr2	203676415	.	C	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,5:0.094:55:17,0:30,3:20,30,5,0
chr2	203680554	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr2	203684507	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,47;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:15,0:14,3:10,19,0,3
chr2	203690387	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr2	203693559	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,11:0,15:0,0,22,6
chr2	203748544	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	203759227	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.054:53:23,2:27,0:35,16,2,0
chr2	203807441	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.178:22:7,1:10,2:15,3,3,1
chr2	203817257	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.223:14:3,1:8,2:0|1:203817257_A_AT:203817257:11,0,3,0
chr2	203817274	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.184:17:5,0:4,0:0|1:203817257_A_AT:203817257:13,1,3,0
chr2	203880992	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,5:0,0,7,0
chr2	203921270	.	A	G	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=293.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,82:0.989:82:0,49:0,32:0,0,23,59
chr2	203964456	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:9,3:8,0:8,10,3,0
chr2	203972634	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,2:8,0:5,14,0,2
chr2	203996835	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.109:53:22,0:25,5:12,36,0,5
chr2	203996870	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=123.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,21:0,13:0,0,2,34
chr2	204002809	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,18,3
chr2	204047950	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=166,103;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:6,3:11,0:15,2,2,1
chr2	204073267	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=160,118;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,1:6,1:15,0,2,0
chr2	204111443	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,14:0,6:0,0,20,2
chr2	204111705	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr2	204116660	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,17,0
chr2	204116690	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,8:0,0,22,3
chr2	204116887	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=103.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,2,26
chr2	204137574	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=192,235;MMQ=40,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,0:0,2:0,1,0,3
chr2	204144675	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr2	204144951	.	GC	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=11,14;MFRL=162,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:204144951_GC_TG:204144951:0,1,0,1
chr2	204144956	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=162,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:204144951_GC_TG:204144951:0,1,0,1
chr2	204154686	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,0,18
chr2	204305093	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=162,78;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.490:29:7,11:5,2:7,8,9,5
chr2	204305100	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=162,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.146:24:13,3:8,0:0|1:204305100_G_GT:204305100:12,9,2,1
chr2	204305101	.	G	GTCATTCATCCTAAGAGCACGA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=162,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.146:24:12,3:7,0:0|1:204305100_G_GT:204305100:12,9,2,1
chr2	204305103	.	G	GCAGTC	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=162,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.154:23:13,1:6,0:0|1:204305100_G_GT:204305100:11,9,2,1
chr2	204355912	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:5,2:2,5:5,3,6,1
chr2	204732850	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=68.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,0,19
chr2	204821494	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.459:35:13,8:6,8:5,14,2,14
chr2	204824178	.	AGT	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.725:5:1,2:0,1:0|1:204824178_AGT_A:204824178:1,0,3,1
chr2	204824200	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=98,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.548:9:1,3:3,2:0|1:204824178_AGT_A:204824178:2,2,4,1
chr2	204824213	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=117,183;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,2:8,0:13,7,2,0
chr2	204824283	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,18:0,0,15,21
chr2	205912210	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	205990261	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,2:5,0:11,0,2,0
chr2	206036918	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=178,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:4,3:4,4:7,1,5,2
chr2	206041366	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,17;MFRL=222,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.815:9:0,1:1,2:0,1,0,8
chr2	206166312	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,3:0.046:74:44,1:25,2:35,36,2,1
chr2	206364791	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	206418032	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,11,7
chr2	206562250	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,16:0,0,21,9
chr2	206592525	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr2	206592695	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:1,10:0,8:0,1,11,7
chr2	206614646	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,3:1,10:0,1,0,13
chr2	206884595	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=55.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,9:0,0,2,17
chr2	206911191	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=209,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.683:13:2,3:2,5:4,0,7,2
chr2	206921763	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	206927787	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:206927787_A_G:206927787:1,3,0,1
chr2	206927794	.	AACCC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=157,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:206927787_A_G:206927787:0,3,0,1
chr2	206927800	.	A	ATGAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=548,103;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:206927787_A_G:206927787:0,2,0,1
chr2	207003438	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr2	207006825	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:0,5,0,6
chr2	207011843	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,0:13,3:0,18,0,3
chr2	207012647	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.512:4:1,0:0,1:1,1,0,2
chr2	207024886	.	G	GC	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=129.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,23:0,17:0,0,0,40
chr2	207025444	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=80.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,27:0.508:53:14,13:11,12:6,20,6,21
chr2	207026233	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,173;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,0:10,2:4,15,0,2
chr2	207027356	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:9,3:2,2:4,8,3,2
chr2	207027407	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:7,3,2,6
chr2	207041441	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:6,3,3,3
chr2	207041527	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=130,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:18,3:9,0:15,12,0,3
chr2	207041933	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=51,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:3,3:5,6:7,1,7,3
chr2	207172772	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:9,10,0,2
chr2	207173067	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=158,453;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:12,3:9,0:0|1:207173067_A_T:207173067:7,15,0,3
chr2	207173069	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=158,453;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:12,3:9,0:0|1:207173067_A_T:207173067:7,15,0,3
chr2	207406838	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:33,0:20,3:13,40,0,3
chr2	207408136	.	C	CTCTTTTCTCCTTTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=234,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:207408136_C_CTCTTTTCTCCTTTA:207408136:0,1,0,1
chr2	207408140	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=234,240;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:207408136_C_CTCTTTTCTCCTTTA:207408136:0,1,0,1
chr2	207408142	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=234,240;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:207408136_C_CTCTTTTCTCCTTTA:207408136:0,1,0,1
chr2	207431870	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:12,0,2,0
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chr2	207516686	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,2:9,0:5,18,0,2
chr2	207569715	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=163,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:2,4:3,2:0,6,0,6
chr2	207570705	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr2	207583039	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:6,10,1,1
chr2	207605942	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	207613843	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,1:12,1:11,14,1,1
chr2	207613980	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr2	207814273	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:0,4:1,6:1,0,10,0
chr2	207824548	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr2	207833848	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr2	208030358	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,4:4,0:0,12,0,4
chr2	208133995	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=196,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=261.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,83:0.977:84:0,38:1,42:0,1,40,43
chr2	208432346	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=135,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,7:5,0:0,6,0,7
chr2	208461621	.	TC	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,13:0.260:52:16,8:23,5:21,18,8,5
chr2	208489101	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:6,5:3,6:2,7,2,10
chr2	208811330	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	208842394	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=232,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	208986385	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,13:0,0,17,7
chr2	208993252	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,2:7,0:1,19,0,2
chr2	209010530	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,95;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:12,0:17,6,2,0
chr2	209025740	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:6,3:4,8:3,7,5,6
chr2	209035658	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,15:0,0,23,3
chr2	209035849	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,0,10
chr2	209036605	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	209049829	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,2:2,3:0|1:209049829_T_TC:209049829:0,4,0,6
chr2	209049830	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,2:1,4:0|1:209049829_T_TC:209049829:0,4,0,6
chr2	209049840	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=192,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:4,2:0,6,0,2
chr2	209051586	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,3:2,3:6,0,6,0
chr2	209101905	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.851:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr2	209110006	.	T	TA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:13,3:8,0:22,0,2,1
chr2	209163556	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,8:0,13:0,0,2,20
chr2	209168853	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	209189664	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.106:50:20,4:20,0:22,23,5,0
chr2	209189912	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr2	209194696	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr2	209195491	.	G	GAGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr2	209199945	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,13,0
chr2	209201739	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,0,23
chr2	209203122	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	209204714	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=80.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,30:0.469:64:16,17:18,13:26,8,23,7
chr2	209209997	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=100.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,0,31
chr2	209210910	.	AC	A	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=133.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,43:0.564:76:14,13:16,28:4,29,5,38
chr2	209215448	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,17,1
chr2	209219190	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	209315573	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,3,22
chr2	209345944	.	CTT	C,CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=19,32,20;MFRL=192,183,172;MMQ=60,60,50;MPOS=34,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=3.48,6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.298,0.397:10:0,1,1:0,1,1:0,3,0,7
chr2	209353656	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	210517915	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=100,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.535:28:8,9:3,5:8,5,11,4
chr2	210557542	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.458:18:4,3:4,5:5,5,6,2
chr2	210558044	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,114;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:9,3:16,0:19,6,3,0
chr2	210560189	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.563:37:12,12:4,8:7,9,14,7
chr2	210569141	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,19:0.400:48:13,8:16,11:22,7,16,3
chr2	210590507	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,4:0.061:75:38,0:33,4:22,49,1,3
chr2	210594540	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:3,10:6,5:6,3,14,1
chr2	210594717	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=168,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.597:8:3,4:0,1:0,3,0,5
chr2	210594722	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=220,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0,6,0,2
chr2	210594768	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	210690624	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=210,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,4:3,1:6,1,5,0
chr2	210699742	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=120,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr2	210704200	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,1,2
chr2	210714162	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,1:8,3:10,2,2,2
chr2	210742895	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:210742895_T_TCC:210742895:0,1,0,1
chr2	210742896	.	T	TCTCCTTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:210742895_T_TCC:210742895:0,1,0,1
chr2	210742898	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:210742895_T_TCC:210742895:0,1,0,1
chr2	210742900	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:210742895_T_TCC:210742895:0,1,0,1
chr2	210745681	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0,0,20,3
chr2	210786137	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	210846867	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	210849524	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,2:6,1:10,0,2,1
chr2	210860277	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:9,8:11,13:7,13,9,12
chr2	210880964	.	AG	CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,73;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:4,16,0,2
chr2	210882171	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,7,11
chr2	210887826	.	CT	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.087:43:24,2:14,1:14,26,0,3
chr2	210940528	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=167,170;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.306:24:7,0:10,7:3,14,0,7
chr2	211069438	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,3:0,2:0,0,2,5
chr2	211070402	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,6:3,6:3,4,6,6
chr2	211070497	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=71,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,5:5,3:7,4,5,3
chr2	211167132	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:4,1,4,4
chr2	211168181	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=179,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:0,1:5,2:0|1:211168181_T_TC:211168181:6,0,3,0
chr2	211168202	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,8:0.600:13:1,3:4,5:1|0:211168181_T_TC:211168181:4,1,8,0
chr2	211168346	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chr2	211179681	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,3:0.050:78:31,3:32,0:0|1:211179681_G_A:211179681:30,45,3,0
chr2	211179686	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,3:0.049:79:33,3:38,0:0|1:211179681_G_A:211179681:28,48,3,0
chr2	211302627	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,8:4,3:1,6,2,9
chr2	211340937	.	A	AT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.539:37:8,10:9,10:16,1,19,1
chr2	211341204	.	G	GC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=84.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,15:0,8:0,0,0,23
chr2	211421452	.	A	ATCT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=155.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,21:0,0,21,16
chr2	211457713	.	CAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:5,1:1,9,0,2
chr2	211464183	.	T	TCCCTGTC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:9,0:13,2:0|1:211464183_T_TCCCTGTC:211464183:14,8,0,2
chr2	211464184	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:9,0:13,2:0|1:211464183_T_TCCCTGTC:211464183:14,8,0,2
chr2	211464187	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:11,2:0|1:211464183_T_TCCCTGTC:211464183:13,7,0,2
chr2	211513118	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	211513181	.	TGTTTCTATTAATTAG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=161,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:4,2:3,4,1,1
chr2	211521227	.	CTT	C,CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=150,154,146;MMQ=60,60,60;MPOS=23,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=8.30,9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,8:0.220,0.362:22:4,4,2:4,1,6:9,0,10,3
chr2	211521417	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=253,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.708:8:0,0:1,5:0,2,0,6
chr2	211525420	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr2	211527827	.	GT	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.730:23:5,6:1,10:5,1,12,5
chr2	212252784	.	AGAAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	212285103	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=172,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,5,0
chr2	212295590	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	212295875	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	212488870	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	212543912	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=136,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:8,3:13,0:1,20,0,3
chr2	212543924	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,1,20
chr2	212569983	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,3:4,3:11,1,6,0
chr2	212578379	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.388:10:3,1:3,1:0,6,0,4
chr2	212587321	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:0,1:6,1:1,5,0,3
chr2	212589986	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr2	212615516	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	212812060	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	212812097	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=78,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr2	213872812	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=125,147;MMQ=60,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:24,0:10,3:21,15,0,3
chr2	213872852	.	ATAC	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,2:6,0:1,9,2,0
chr2	213872853	.	TACA	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ACA;STR;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.363:11:2,2:3,2:0,7,2,2
chr2	213872868	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,2:0,5,1,3
chr2	213914343	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr2	214012405	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,15,3
chr2	214228959	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr2	214727448	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=96,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:214727448_T_TG:214727448:0,2,0,1
chr2	214727449	.	T	TCTGGATAACCTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=96,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:214727448_T_TG:214727448:0,2,0,1
chr2	215013777	.	GTA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=369,95;MMQ=60,47;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TA;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr2	215013801	.	G	GTATA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=143,226;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=TA;STR;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr2	215274832	.	TTC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=197,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:7,1,1,1
chr2	215609693	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.448:29:6,6:10,6:16,0,13,0
chr2	215632124	.	ATT	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=147,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:2,1:4,0,4,0
chr2	215632155	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr2	215632192	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,4:6,6:12,2,10,0
chr2	215632255	.	CA	TG	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:10,9:9,12:12,8,13,8
chr2	215632256	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=110,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,38:0.929:40:0,18:2,20:1,1,22,16
chr2	215634055	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.363:34:10,5:11,7:1,21,0,12
chr2	215674090	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,0:2,9:4,2,7,2
chr2	215674323	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=190,252;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:215674323_C_G:215674323:0,1,0,1
chr2	215674341	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:215674323_C_G:215674323:0,0,0,1
chr2	215797332	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,10:0,0,15,4
chr2	215797527	.	AATTC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTC;STR;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr2	215798724	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	215802201	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,153;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,2:8,0:13,2,2,0
chr2	215812297	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,3,12
chr2	215813219	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	215820155	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=146,216;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:215820155_T_C:215820155:0,9,0,2
chr2	215820157	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=146,216;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:0|1:215820155_T_C:215820155:0,9,0,2
chr2	215821549	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=223,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:4,0:3,2:1,8,0,3
chr2	215821580	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr2	215833415	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr2	215833622	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	215840414	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	215840829	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,0,22
chr2	215847177	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	215851246	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,14:0,5:0,0,13,7
chr2	215851459	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,0:12,3:4,17,0,3
chr2	215855780	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,2,14
chr2	215862383	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=189.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,35:0,20:0,0,43,12
chr2	215862633	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,2,8
chr2	215874965	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	215875251	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	215883988	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,2:0,5:0,0,9,0
chr2	215884500	.	C	CATTACCAATATACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=189,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.479:2:0,1:1,0:0|1:215884500_C_CATTACCAATATACT:215884500:0,1,0,1
chr2	215884503	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=189,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:215884500_C_CATTACCAATATACT:215884500:0,1,0,1
chr2	215890312	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=186,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:0,3:1,0,6,0
chr2	215890324	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=186,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,2:1,0,6,0
chr2	215890352	.	GTT	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,6:0,0,11,0
chr2	215928972	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,1,15
chr2	215929028	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=35.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr2	215976231	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,32,1
chr2	216182769	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr2	216190654	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:5,1,5,0
chr2	216190691	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,8:0,0,11,3
chr2	216191515	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:6,7:5,8:6,5,13,2
chr2	216197971	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr2	216198049	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:4,7:5,8:7,2,10,5
chr2	216200907	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:3,4:13,8:3,13,2,10
chr2	216209472	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:11,3:4,6:12,3,5,4
chr2	216211712	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr2	216226642	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr2	216232556	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:6,2:3,1:9,1,2,1
chr2	216234981	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,7:3,2:7,1,7,2
chr2	216235233	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=68,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:216235233_C_T:216235233:1,1,0,1
chr2	216235254	.	AAAG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:216235233_C_T:216235233:1,2,0,1
chr2	216243832	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,16,3
chr2	216248305	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	216253039	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	216258001	.	G	GGTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	216259530	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:216259530_G_GC:216259530:0,1,0,1
chr2	216259532	.	G	GGTTCAGGTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:216259530_G_GC:216259530:0,1,0,1
chr2	216262008	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=159,147;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:1,11,0,2
chr2	216262009	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=147,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:0,11,1,1
chr2	216269030	.	T	TTTTTTG,TTTTTTTG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,27,26;MFRL=145,231,230;MMQ=53,60,60;MPOS=17,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.63,4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.466,0.356:6:0,2,0:1,1,2:1,0,5,0
chr2	216269046	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	216269095	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,16,5
chr2	216271763	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr2	216271812	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=123,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,7:0,7:1,0,14,0
chr2	216274853	.	A	AAC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=215,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AC;STR;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,2:4,6:0,6,0,10
chr2	216288841	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,1:7,3:8,2,3,1
chr2	216296730	.	AT	A,ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27,28;MFRL=162,181,174;MMQ=60,60,60;MPOS=19,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.27,5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.210,0.283:11:1,1,0:3,1,2:0,6,0,5
chr2	216299629	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr2	216300449	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:6,3,0,2
chr2	216300482	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.307:8:3,1:1,1:0,6,1,1
chr2	216810468	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.307:21:6,2:8,4:2,13,0,6
chr2	216811707	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:2,9:5,3:6,1,12,0
chr2	217001866	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:19,4:19,0:20,21,4,0
chr2	217024697	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,4,0
chr2	217069151	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=176,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.474:36:8,4:11,13:2,17,1,16
chr2	217123958	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	217142659	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:217142659_G_C:217142659:0,2,0,1
chr2	217142666	.	C	CTCTAGACTTCAAAAATGCCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:217142659_G_C:217142659:0,2,0,1
chr2	217234654	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:5,12,0,2
chr2	217235049	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=231,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:217235049_G_T:217235049:0,1,0,1
chr2	217235056	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=231,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:217235049_G_T:217235049:0,1,0,1
chr2	217280261	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=196,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0,2,0,2
chr2	217285285	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=178,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr2	217724544	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:4,6:6,2:11,0,6,2
chr2	218674484	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.644:20:2,9:4,4:6,1,8,5
chr2	218675144	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,1:2,4:0,2,0,5
chr2	218677279	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr2	218678582	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:5,7:2,2:0,7,0,9
chr2	218679712	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,0:3,2:9,6,0,2
chr2	218694510	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=88.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0|1:218694510_CT_C:218694510:0,0,14,6
chr2	218694512	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0|1:218694510_CT_C:218694510:0,0,14,6
chr2	218694551	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0,0,19,15
chr2	218694962	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	218712886	.	GGCT	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=233,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GCT;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:6,1:1,1:0|1:218712886_GGCT_G:218712886:4,3,1,1
chr2	218712918	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.706:15:2,10:2,1:0|1:218712886_GGCT_G:218712886:4,0,7,4
chr2	218712936	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=198,186;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,14:0.714:19:3,11:2,3:0|1:218712886_GGCT_G:218712886:4,1,10,4
chr2	218750453	.	A	AG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,8:4,5:9,0,13,0
chr2	218758123	.	GCA	G,GCACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30,27;MFRL=182,113,186;MMQ=60,60,60;MPOS=29,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=CA;STR;TLOD=8.33,7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.364,0.364:8:1,1,1:1,2,2:1,1,5,1
chr2	218938244	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=205,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,6:2,2:0,5,0,8
chr2	218941095	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=120.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,12:0,20:0,0,23,9
chr2	219000187	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:11,2:19,1:14,18,3,0
chr2	219000966	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.382:42:15,10:10,5:9,17,6,10
chr2	219000992	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=20,18;MFRL=187,157;MMQ=51,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:2,1:4,1:2,9,0,5
chr2	219001011	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=187,76232;MMQ=60,41;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,3:6,0:1,12,0,3
chr2	219082119	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,27:0.523:52:8,10:15,16:23,2,26,1
chr2	219082330	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=230,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:3,2:4,2:0,7,0,5
chr2	219103313	.	CTTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.732:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	219103580	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:11,10:6,5:1,16,4,11
chr2	219137259	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=24,9;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.212:34:7,1:11,0:18,7,9,0
chr2	219137264	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.292:34:6,2:10,1:15,8,11,0
chr2	219142023	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,7:0,4:0,0,13,1
chr2	219142491	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=187,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0|1:219142491_C_T:219142491:2,4,2,2
chr2	219142492	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=226,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,6:0.584:10:2,3:2,3:1|0:219142491_C_T:219142491:2,2,2,4
chr2	219142594	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.332:34:12,5:11,5:16,7,8,3
chr2	219142773	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	219143327	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.533:32:8,9:6,8:3,12,5,12
chr2	219144149	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:0,7,0,7
chr2	219144815	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,20:0,18:0,0,22,16
chr2	219146607	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.425:38:14,8:8,8:15,7,13,3
chr2	219146844	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,9:0.150:49:13,0:16,0:21,19,0,9
chr2	219146868	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.569:39:5,11:9,10:8,9,5,17
chr2	219146882	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:6,10:4,8:4,6,2,16
chr2	219187901	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=207,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr2	219204807	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,211;MMQ=60,46;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,2:5,0:4,12,1,1
chr2	219206435	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=236,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,5:1,8:0,1,0,13
chr2	219206645	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr2	219209393	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr2	219209796	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	219221982	.	G	GTCTCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,148;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=TC;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.771:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	219222703	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=154,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:8,0:17,1,2,0
chr2	219222733	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,6:0,17:0,0,21,3
chr2	219250003	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.426:26:8,5:6,4:3,12,5,6
chr2	219252377	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:11,5:5,6:4,12,3,8
chr2	219254667	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,1:11,1:16,7,0,2
chr2	219254842	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr2	219257688	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,4,2
chr2	219259844	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=165,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	219266204	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,4,1
chr2	219267706	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,0:0|1:219267706_A_C:219267706:0,0,4,0
chr2	219267712	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=90,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:1,1:0|1:219267706_A_C:219267706:2,0,4,0
chr2	219267714	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=26,19;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:0,1:2,1:0|1:219267706_A_C:219267706:2,1,4,0
chr2	219267716	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=23,9;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:0,0:2,0:0|1:219267706_A_C:219267706:2,1,4,0
chr2	219267718	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=158,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,0:0|1:219267706_A_C:219267706:2,1,2,0
chr2	219267722	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=26,12;MFRL=150,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,0:0|1:219267706_A_C:219267706:3,3,2,0
chr2	219267913	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,5:6,2:4,7,5,3
chr2	219297658	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,45293647;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:3,8,1,1
chr2	219305373	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr2	219305404	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr2	219319818	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=122,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:219319818_A_AC:219319818:0,1,0,1
chr2	219319819	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=122,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:219319818_A_AC:219319818:0,1,0,1
chr2	219319820	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=122,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:219319818_A_AC:219319818:0,1,0,1
chr2	219320207	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	219320233	.	GAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	219339283	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,5:0,0,17,0
chr2	219341717	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=16,33;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.273:19:1,2:3,3:0,14,0,5
chr2	219350358	.	CAAAA	C,CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,35,35;MFRL=186,180,201;MMQ=60,60,60;MPOS=23,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,20,21;RU=A;STR;TLOD=9.29,6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,8,5:0.445,0.380:15:0,5,4:1,3,1:2,0,12,1
chr2	219353195	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr2	219362366	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:219362366_C_T:219362366:4,0,1,0
chr2	219362371	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:219362366_C_T:219362366:4,0,1,0
chr2	219423286	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:14,0:7,2:13,9,0,2
chr2	219433597	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=203.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,33:0,28:0,0,60,4
chr2	219457379	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:13,1:16,2:11,21,0,3
chr2	219480804	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr2	219487299	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	219492725	.	CC	TT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=147,35;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:1,1:0|1:219492725_CC_TT:219492725:4,2,1,1
chr2	219492734	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=147,35;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0|1:219492725_CC_TT:219492725:4,2,1,1
chr2	219498759	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	219501133	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,8:0,0,15,9
chr2	219501328	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,4,13
chr2	219508200	.	TGTGGGTGAGGAGTTTCCTGCAGGAGGGACTGGGTCAAGGTGGTGCTTCTTAGGGGCCTCC	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=142,186;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.157:35:3,1:2,1:13,18,2,2
chr2	219533114	.	G	GGTCTGGCTATGTTGCTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219533114_G_GGTCTGGCTATGTTGCTCA:219533114:1,0,0,1
chr2	219533120	.	G	GTCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219533114_G_GGTCTGGCTATGTTGCTCA:219533114:1,0,0,1
chr2	219533165	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,1,2
chr2	219537606	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:21,3:21,0:21,22,3,0
chr2	219538311	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:14,0,2,0
chr2	219602754	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,6:4,5:5,2,7,4
chr2	219614203	.	TTTC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.349:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	219676858	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=234,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:219676858_G_A:219676858:2,0,1,0
chr2	219676860	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=234,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:219676858_G_A:219676858:2,0,1,0
chr2	219677348	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=169,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:5,0:7,8,2,0
chr2	219689192	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.183:22:2,0:11,0:10,8,4,0
chr2	219689198	.	G	GCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.485:18:4,3:5,4:0,9,9,0
chr2	219691566	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr2	219692527	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr2	219692686	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.222:21:8,0:8,1:10,6,5,0
chr2	219692790	.	A	AG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.951:16:0,7:0,8:0,0,7,9
chr2	219696014	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=120.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,20:0,14:0,0,31,6
chr2	219855692	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:10,3:5,8:8,7,5,6
chr2	219857902	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	219868704	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=155,65;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,0:13,2:18,6,0,2
chr2	219903787	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	219922073	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	219924910	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,1:10,1:7,7,1,1
chr2	220012576	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	220022176	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,4:0,8:0,0,10,4
chr2	220022435	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,1:0,0,1,9
chr2	220026911	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:5,2:9,0:5,9,0,2
chr2	220028900	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr2	220033559	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=221,949;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:2,11,0,2
chr2	220033956	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:4,3,6,1
chr2	220040216	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.272:22:9,3:6,3:16,0,6,0
chr2	220040330	.	A	G	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=135.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,48:0.499:96:20,19:27,27:26,22,22,26
chr2	220040938	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=164,3462;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:13,2:0|1:220040938_G_C:220040938:16,7,2,0
chr2	220040941	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=165,3462;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,0:14,2:0|1:220040938_G_C:220040938:15,7,2,0
chr2	220041091	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:2,6:8,6:1,9,1,11
chr2	220041428	.	CAGGCCGGGAGGGGCGCGCCGGG	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=180,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=69.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.658:27:2,14:4,4:7,2,17,1
chr2	220041433	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=228,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.675:9:1,2:2,3:3,0,6,0
chr2	220041455	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=193,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.312:26:14,4:4,2:17,1,6,2
chr2	220044451	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,186;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,0:8,2:4,17,1,1
chr2	220046349	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,8:0,0,15,1
chr2	220047393	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=231,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr2	220071803	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=197,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:0,10,1,7
chr2	220071822	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=217,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,1:5,1:1,9,0,2
chr2	220071879	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=200,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:2,4:4,0,5,0
chr2	220072766	.	G	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=265.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,76:0.987:76:0,38:0,38:0,0,12,64
chr2	220077291	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=212,198;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:220077291_CTG_C:220077291:0,3,0,1
chr2	220077294	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,36;MFRL=212,198;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:220077291_CTG_C:220077291:0,3,0,1
chr2	220077301	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=212,198;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	220077314	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=248,198;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	220078496	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=102.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,23,5
chr2	220082365	.	CA	C,CAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=140,200,166;MMQ=60,54,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.60,22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,12:0.085,0.448:27:8,0,5:4,2,6:8,5,10,4
chr2	220083453	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr2	220087354	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=190,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.592:12:1,5:2,2:4,1,5,2
chr2	220087659	.	G	GAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr2	220088248	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr2	220090147	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:1,5:4,8:5,0,8,5
chr2	220096903	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,1:5,8:8,1,5,4
chr2	220097449	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=202,137;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr2	220097807	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:20,0:9,2:22,8,0,2
chr2	220100683	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:9,7:9,8:3,15,8,7
chr2	220101783	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,176;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:2,4:3,5:5,0,8,2
chr2	220116509	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	220118672	.	CG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=12,20;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:1,2:0,0:1,6,1,2
chr2	220145286	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.578:29:3,11:9,5:3,9,9,8
chr2	220146402	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:6,7:3,1:6,3,8,1
chr2	220146609	.	C	CG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=191,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,3:2,4,3,2
chr2	220146651	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,3:3,3:8,1,5,1
chr2	220147732	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,5:7,3:10,3,3,5
chr2	220155097	.	G	GTCGCGAGTTCCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	220161306	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=206,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:5,6:7,6:1,12,3,9
chr2	220168607	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:220168607_C_T:220168607:0,3,0,3
chr2	220168616	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=82,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0|1:220168607_C_T:220168607:0,2,0,4
chr2	220194247	.	A	AATT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATT;STR;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr2	220194531	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:1,3:1,2,1,2
chr2	220195446	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:1,3,1,2
chr2	220197207	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,2,1
chr2	220197492	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr2	220197835	.	ATAATATTATATATTAT	A	.	.	DP=104;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=113.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,38:0.482:79:12,14:15,17:34,7,36,2
chr2	220197929	.	CT	C	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=114,111;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.393:37:4,1:7,5:14,8,1,14
chr2	220239534	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr2	220239561	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,14,7
chr2	220246218	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=85.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,18,5
chr2	220250322	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,7:0,0,14,5
chr2	220250826	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr2	220250897	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=58.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,12,5
chr2	220251178	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,1,17
chr2	220251208	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:0,7,3,3
chr2	220264543	.	C	CAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr2	220283699	.	AGC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=189,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GC;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	220284779	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.580:28:5,8:4,8:6,6,13,3
chr2	220288418	.	TT	CC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=135,139;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,2:11,0:17,7,2,0
chr2	220306413	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	220306681	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,9;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:220306681_T_G:220306681:0,0,1,0
chr2	220306686	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220306681_T_G:220306681:0,0,1,0
chr2	220316039	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,3:1,5:0,4,0,8
chr2	220316579	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	220330724	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:3,2,1,3
chr2	220330901	.	G	GAGTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	220330925	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=224,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220330925_C_A:220330925:0,1,0,1
chr2	220330932	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=224,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220330925_C_A:220330925:0,1,0,1
chr2	220341797	.	C	CACCTCTTATTTTAGTCTGTGCGTATGTTTTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=190,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1,1,0,1
chr2	220353104	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=179,245;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:0,0:0,1,2,0
chr2	220353440	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:2,2:1,9:1,2,7,5
chr2	220354155	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:3,1:10,1:0|1:220354155_A_C:220354155:0,13,3,0
chr2	220354160	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:3,1:9,0:0|1:220354155_A_C:220354155:0,14,3,0
chr2	220354757	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=243,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	220355529	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,2:6,6:11,5,3,5
chr2	220356699	.	ATC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:1,2,0,1
chr2	220356806	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr2	220361265	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	220361486	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=203,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr2	220361520	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=202,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr2	220371181	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr2	220402042	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=176,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:220402042_AG_A:220402042:3,9,1,1
chr2	220402045	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=176,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:220402042_AG_A:220402042:3,9,1,1
chr2	220402624	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr2	220406239	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr2	220416164	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	220416570	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	220416591	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	220416803	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=131.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,18:0,22:0,0,28,12
chr2	220416967	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,10:0,0,4,22
chr2	220422313	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr2	220426520	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=213,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr2	220427996	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:1,8:0,9:1,0,17,0
chr2	220428381	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=95.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,16:0,0,3,25
chr2	220431458	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=439,247;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	220431919	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,7,12
chr2	220432709	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.635:31:4,12:7,7:3,8,9,11
chr2	220440343	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	220462814	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=180,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.261:24:6,2:9,0:3,14,7,0
chr2	220466344	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,3:0,0,5,3
chr2	220471116	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr2	220476645	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr2	220478667	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,55;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:10,0:14,8,1,1
chr2	220479055	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,3:6,8:0,8,0,11
chr2	220480693	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr2	220492826	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,14;MFRL=185,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.650:4:0,0:1,1:0,1,0,3
chr2	220502367	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.411:22:6,6:7,1:8,5,3,6
chr2	220505421	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,219;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:1,3,2,1
chr2	220506522	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:5,3:11,1:0,16,0,4
chr2	222290902	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,2,12
chr2	222301357	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	222301377	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:222301377_T_TG:222301377:0,3,0,1
chr2	222301379	.	AT	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:222301377_T_TG:222301377:0,3,0,1
chr2	222301382	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:222301377_T_TG:222301377:0,3,0,1
chr2	222301713	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr2	222307534	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:10,4:1,3:9,2,6,1
chr2	222307778	.	CAAGATGA	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=181,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:1,1:2,3:1,4,0,4
chr2	222307831	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:222307831_T_C:222307831:0,2,0,1
chr2	222307834	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:222307831_T_C:222307831:0,2,0,1
chr2	222320427	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=73.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,10:0,0,3,21
chr2	223065870	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:6,3:10,12:9,7,9,6
chr2	223066017	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:3,0:7,0:0,10,2,0
chr2	223096709	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	223158424	.	ACT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=126,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CT;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:7,0:11,2:8,11,1,1
chr2	223159119	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=218,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	223161624	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=224,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr2	223161997	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=183,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,5:3,2:0,8,0,7
chr2	223162024	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	223169282	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,67;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:21,0:20,3:17,24,1,2
chr2	223386683	.	T	TCTCTCTCTC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=186,217;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.141:22:9,2:8,0:4,16,0,2
chr2	223436761	.	A	T	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=170,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,4:0.075:66:24,0:34,4:0|1:223436761_A_T:223436761:10,52,0,4
chr2	223436766	.	A	ATCTCATCTAAGCAACTTGTAAAATGAAAG	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=26,37;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,4:0.075:65:24,0:32,4:0|1:223436761_A_T:223436761:7,54,0,4
chr2	223493435	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:223493435_G_A:223493435:0,0,5,0
chr2	223493440	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=226,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0|1:223493435_G_A:223493435:2,0,3,0
chr2	223499077	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:9,1,5,0
chr2	223499256	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:13,0:14,3:8,19,0,3
chr2	223505729	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,2:3,5:0,8,0,7
chr2	223520905	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,0,24
chr2	223536428	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=227,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,2:1,0:2,0,2,1
chr2	223553284	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,4:1,2:0,3,0,7
chr2	223554275	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,3:1,0:0,2,0,4
chr2	223574708	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=215,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	223781018	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=104.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,20:0,11:0,0,25,7
chr2	223785846	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,4,14
chr2	223787559	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,14:0,0,3,17
chr2	223787691	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,26,1
chr2	223789080	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	223793480	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,11,0
chr2	223799207	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr2	223806194	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr2	223919493	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=105.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,38:0.632:60:7,18:14,20:13,9,20,18
chr2	223919674	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	223919877	.	C	CTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=136,117;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,18;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:223919877_C_CTTTTT:223919877:2,0,1,0
chr2	223919894	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,14;MFRL=130,117;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:1,0:0|1:223919877_C_CTTTTT:223919877:2,1,1,0
chr2	223920441	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	224462056	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:5,0,3,0
chr2	224463164	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.497:28:6,6:8,7:7,7,6,8
chr2	224629876	.	C	CCATCAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=CAT;STR;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,1:1,4:3,0,6,0
chr2	224640803	.	C	CAA	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,15:0.290:53:21,7:17,8:14,24,5,10
chr2	224640841	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,68;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.100:37:19,1:14,2:6,28,2,1
chr2	224743516	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.237:30:10,0:7,0:3,20,1,6
chr2	224743524	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,18;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.300:25:6,0:6,0:1,17,0,7
chr2	224743527	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=184,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:10,2:1,22,0,2
chr2	224745015	.	TTTTAGCAACATAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	224758906	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,18,1
chr2	224763816	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	224765894	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,9:0,4:0,0,12,2
chr2	224770780	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	224777094	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=188.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,48:0.981:48:0,19:0,29:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,11,37
chr2	224777105	.	G	GTGAT	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=184.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,43:0.978:43:0,15:0,23:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,3,40
chr2	224862821	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=100,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:3,4,3,0
chr2	224862842	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,2:8,2:8,7,4,0
chr2	224863090	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:1,5,0,3
chr2	225368321	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,7:4,3:9,1,10,0
chr2	225376032	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,4:6,8:4,4,9,3
chr2	225378382	.	ATAAT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.442:32:7,9:8,5:3,15,0,14
chr2	225422596	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0|1:225422596_G_A:225422596:2,3,0,2
chr2	225422598	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0|1:225422596_G_A:225422596:2,3,0,2
chr2	225664782	.	TAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,5;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:2,0,2,0
chr2	225665074	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	225695334	.	TG	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=58.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.480:48:10,7:14,15:10,15,9,14
chr2	225699079	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	225702565	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:2,3,0,5
chr2	225709636	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr2	225729224	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=153,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:11,1:8,2:15,5,3,0
chr2	225750348	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.459:24:5,5:6,6:9,4,8,3
chr2	225750753	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.420:29:11,3:6,9:14,3,9,3
chr2	225751256	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr2	225760977	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:17,2,2,0
chr2	225796458	.	ATC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=205,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	225848390	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:0,4:2,2:3,0,6,0
chr2	225848579	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,8,16
chr2	226446723	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:23,1:24,2:30,18,1,2
chr2	226491811	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:13,0:13,6:4,22,0,6
chr2	227890621	.	A	ATT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,1:0.200:8:3,1:3,0:0|1:227890621_A_ATT:227890621:0,7,0,1
chr2	227890622	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=175,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.222:7:3,1:3,0:0|1:227890621_A_ATT:227890621:0,6,0,1
chr2	227895075	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	227907809	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:16,1:7,1:15,10,2,0
chr2	227912331	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:5,6:7,6:0,12,0,13
chr2	227915601	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:9,0,6,0
chr2	227915924	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr2	227920736	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:16,3:13,0:21,10,3,0
chr2	227922104	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:227922104_T_C:227922104:0,0,1,0
chr2	227922109	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:227922104_T_C:227922104:0,0,1,0
chr2	227922291	.	TAGGAATCC	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=153,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:6,2:6,10,1,1
chr2	227922321	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=112,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,4:5,1:2,5,1,4
chr2	227924193	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:28,4:13,0:0|1:227924193_C_T:227924193:31,12,4,0
chr2	227924195	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:26,4:14,0:0|1:227924193_C_T:227924193:31,12,4,0
chr2	227924817	.	G	GAAAAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=24,30;RU=A;STR;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	227924976	.	A	ATGCATTCTAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr2	227927189	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=127,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:1,4:0,1:1,0,6,0
chr2	227966148	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,6:7,2:13,0,7,1
chr2	227966298	.	T	TA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:5,6:9,5:4,12,4,7
chr2	227967601	.	ACAATATTTCAGCAATAGGGAAAG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.609:14:4,5:1,3:1,5,3,5
chr2	227967830	.	GA	G	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=63.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,36:0.569:63:9,17:13,15:22,5,23,13
chr2	227973410	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,3:5,4:3,7,4,3
chr2	227973623	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:6,1:11,11:2,15,2,10
chr2	227974113	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=202,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.662:7:1,1:1,3:0,2,0,5
chr2	228109624	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:8,2:3,1:10,1,3,0
chr2	228111539	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:12,0:12,6:0,24,0,6
chr2	228118403	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.417:17:8,2:1,4:2,8,1,6
chr2	228122467	.	A	AGTAGCAATGGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:228122467_A_AGTAGCAATGGCT:228122467:0,2,0,1
chr2	228122469	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:228122467_A_AGTAGCAATGGCT:228122467:0,2,0,1
chr2	228144706	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	228145543	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,17:0,0,27,0
chr2	228146991	.	AATATAT	A,AATAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32,29;MFRL=184,169,157;MMQ=60,60,60;MPOS=14,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=AT;STR;TLOD=13.88,5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.434,0.364:7:0,2,0:1,2,2:1,0,6,0
chr2	228149107	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,4:0,0,2,10
chr2	228158418	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=97.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,18,10
chr2	228175681	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:18,0:5,2:5,18,0,2
chr2	228194570	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,17:0,17:0,0,7,27
chr2	228197368	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr2	228204929	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	228204982	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr2	228207625	.	G	A,T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27,31;MFRL=0,177,158;MMQ=60,60,60;MPOS=9,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.85,27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,9:0.421,0.527:16:0,3,5:0,4,4:0,0,0,16
chr2	228210900	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,13:0,0,24,6
chr2	228211074	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,15:0,7:0,0,0,22
chr2	228220528	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr2	228356364	.	GTTT	G,GTT,GT,GTTTT	.	.	DP=124;ECNT=1;MBQ=33,32,35,35,35;MFRL=142,115,151,166,144;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=23,24,25,26;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,14,13,16;RU=T;STR;TLOD=9.16,62.57,6.35,11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:28,6,33,6,12:0.071,0.382,0.075,0.137:85:13,2,16,3,6:8,4,15,3,4:8,20,18,39
chr2	228373404	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,17;MFRL=123,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:0,0:1,1:0,1,0,3
chr2	228399480	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	228560800	.	GA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=74.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.968:26:0,13:0,13:0,0,6,20
chr2	228763051	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.089:42:27,0:11,3:5,34,2,1
chr2	228767618	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	228767631	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr2	228776996	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,20,0
chr2	228783479	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,14,3
chr2	228783653	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=200,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr2	228973727	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:228973727_T_C:228973727:0,2,0,1
chr2	228973733	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=180,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:228973727_T_C:228973727:0,1,0,1
chr2	228973738	.	T	TTTTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=180,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:228973727_T_C:228973727:0,1,0,1
chr2	230096587	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,16,1
chr2	230135711	.	G	GC	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=263.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,42:0,33:0,0,31,46
chr2	230223451	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,9:3,4:0,5,0,13
chr2	230231889	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=201,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr2	230341979	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:1,4:1,5,0,6
chr2	230453214	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.833:3:0,1:0,0:0,0,1,2
chr2	230653669	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29,31,31;MFRL=205,154,172,148;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,21,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.95,3.03,5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,2,2,3:0.166,0.166,0.241:13:4,0,1,0:2,2,1,2:0,6,1,6
chr2	230663978	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.115:42:16,4:17,0:32,6,4,0
chr2	230666898	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr2	230668968	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,5,26
chr2	230705516	.	TA	T,TAA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,27,17;MFRL=147,169,163;MMQ=60,60,60;MPOS=14,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.05,5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,4,6:0.132,0.150:34:11,2,2:7,2,1:17,7,6,4
chr2	230875311	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=185,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr2	230910276	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr2	230911501	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	231050791	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,12:0.204:52:10,2:19,0:0|1:231050791_C_G:231050791:18,22,12,0
chr2	231050795	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,9:0.168:50:11,0:16,0:0|1:231050791_C_G:231050791:19,22,9,0
chr2	231076289	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,5:3,1:3,9,3,3
chr2	231076316	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=158,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:4,2:1,0:1,5,0,2
chr2	231077636	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:13,0:6,1:18,4,0,6
chr2	231077683	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.425:45:16,13:10,6:4,22,4,15
chr2	231103185	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	231110699	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=158,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:0,7,2,0
chr2	231110737	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0,4,0,3
chr2	231120255	.	CG	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=60.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.948:15:0,9:0,4:0|1:231120255_CG_C:231120255:0,0,6,9
chr2	231120259	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=194,123;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,14:0.755:18:3,10:1,4:0|1:231120255_CG_C:231120255:1,3,5,9
chr2	231149097	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=141,149;MMQ=60,51;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,48:0.613:78:10,23:20,25:19,11,17,31
chr2	231149108	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=125,151;MMQ=60,54;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=223.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,72:0.974:73:0,31:1,39:0,1,31,41
chr2	231157527	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,10:0,25:0,0,3,32
chr2	231175763	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,157;MMQ=57,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:8,0,5,0
chr2	231176040	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,191;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=51.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.493:43:10,6:9,14:11,11,9,12
chr2	231222499	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.489:43:10,7:12,13:16,6,17,4
chr2	231253183	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,18,0
chr2	231253216	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=117.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,19:0,18:0,0,31,6
chr2	231257003	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=103.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,11:0,0,1,25
chr2	231258218	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr2	231261620	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr2	231266526	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=150,149;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=79.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:1,12:0,15:1,0,18,9
chr2	231307584	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=113.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,22:0,0,34,3
chr2	231307860	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	231309139	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,0,13
chr2	231314134	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.544:35:3,6:12,13:5,11,2,17
chr2	231326188	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr2	231326201	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,1,11
chr2	231331799	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	231334495	.	TA	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,10:0.219:45:18,5:17,5:24,11,7,3
chr2	231337960	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr2	231363252	.	TAA	T,TA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,28,28;MFRL=179,156,135;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=8.11,48.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,23:0.205,0.738:30:0,3,13:1,2,8:0,1,6,23
chr2	231406831	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	231406846	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	231407519	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=87.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,10:0,19:0,0,22,7
chr2	231407663	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=125.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,18:0,21:0,0,16,23
chr2	231738038	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=223,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	231738318	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:0,5,0,3
chr2	231740276	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr2	231742711	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=138,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,5:3,3:5,4,6,3
chr2	231774734	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,9:6,2:2,8,6,5
chr2	231860848	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	231861032	.	TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCACAGCAGCCTAGTCCTGAATCCACACCA	T	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=28,17;MFRL=140,99;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,2:0.046:72:15,0:6,1:49,21,0,2
chr2	231864600	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,2233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	231865018	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr2	231865047	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,12,6
chr2	231865269	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,8:0,0,3,17
chr2	231867560	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.342:22:8,0:3,7:1,14,0,7
chr2	231937001	.	T	G	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.063:61:34,3:24,0:35,23,3,0
chr2	231940295	.	CT	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,12:0.245:50:11,5:17,6:15,23,4,8
chr2	231941723	.	AT	A,ATT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,29,30;MFRL=152,0,151;MMQ=60,60,60;MPOS=6,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.40,5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,3,4:0.082,0.105:44:19,0,2:18,2,2:32,5,2,5
chr2	231944373	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,27:0.500:54:16,12:11,15:4,23,1,26
chr2	231948178	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr2	232011029	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=148,162;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:12,0:11,3:0|1:232011029_G_T:232011029:11,14,0,3
chr2	232011034	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,162;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:13,0:11,3:0|1:232011029_G_T:232011029:10,14,0,3
chr2	232030555	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:9,1,4,0
chr2	232035429	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.459:33:7,10:10,5:6,12,1,14
chr2	232072796	.	ATTTG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,1:3,4:10,2,6,0
chr2	232087474	.	AT	GA	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=250.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,23:0,35:0,0,28,30
chr2	232121172	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.285:18:7,4:5,0:10,3,5,0
chr2	232135541	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:1,3,0,6
chr2	232196472	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,7:3,3:6,0,9,1
chr2	232262625	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=142,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:2,0:8,2:3,7,0,2
chr2	232317332	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,2:16,0:0|1:232317332_C_A:232317332:24,1,2,0
chr2	232317341	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,2:14,0:0|1:232317332_C_A:232317332:21,4,2,0
chr2	232319853	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=138,176;MMQ=52,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,3:9,0:13,3,3,0
chr2	232324780	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr2	232390166	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:18,2:21,1:12,29,1,2
chr2	232393720	.	G	GGTTTTATACCCCTCCGTTGGCCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=197,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	232393722	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=214,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:232393722_G_C:232393722:0,2,0,1
chr2	232393725	.	GA	TT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=214,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:232393722_G_C:232393722:0,2,0,1
chr2	232645701	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.266:12:1,0:4,1:0|1:232645701_G_C:232645701:9,0,3,0
chr2	232645707	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.265:12:1,1:4,0:0|1:232645701_G_C:232645701:9,0,3,0
chr2	232673378	.	A	ATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=197,90;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.421:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr2	232790053	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	233028070	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=108,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr2	233198997	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=192,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,0:0|1:233198997_A_C:233198997:2,0,1,0
chr2	233199014	.	CC	GG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:233198997_A_C:233198997:0,0,1,0
chr2	233199540	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=207,185;MMQ=40,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr2	233243528	.	ATGC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,188;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TGC;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:1,2:6,0:6,4,1,1
chr2	233243660	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,7:0,0,5,8
chr2	233245090	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=167,164;MMQ=59,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,6:3,5:6,2,11,0
chr2	233245958	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,164;MMQ=27,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:10,2:7,6:13,5,8,0
chr2	233271697	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,23,28;MFRL=162,118,177;MMQ=60,39,51;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,8;RU=AC;STR;TLOD=4.78,11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.248,0.421:9:2,1,2:0,0,2:0,3,4,2
chr2	233272162	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=187,182;MMQ=43,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,2:2,4:3,1,4,3
chr2	233272925	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,166;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.418:17:6,2:3,4:7,3,5,2
chr2	233274145	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=170,193;MMQ=51,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,3:0,5:1,0,9,0
chr2	233274169	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=191,170;MMQ=45,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.217:12:4,0:4,2:9,1,2,0
chr2	233323177	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	233344991	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,3:6,5:1,10,1,7
chr2	233345249	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:0,4,2,3
chr2	233346629	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=167,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:233346629_C_T:233346629:0,7,1,1
chr2	233346631	.	CAGA	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=36,20;MFRL=167,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:233346629_C_T:233346629:0,7,1,1
chr2	233346636	.	G	GCT	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=172,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:233346629_C_T:233346629:0,8,1,1
chr2	233346638	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=34,19;MFRL=172,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,0:0|1:233346629_C_T:233346629:0,8,1,1
chr2	233346641	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=172,46;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0|1:233346629_C_T:233346629:0,8,1,1
chr2	233346662	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	233347919	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.532:26:5,6:7,7:1,11,2,12
chr2	233348647	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:2,4:6,4:7,1,9,0
chr2	233350000	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,0,2
chr2	233350548	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	233391463	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,4:5,2:0,9,0,6
chr2	233392988	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:5,3:4,1:9,1,2,2
chr2	233394909	.	C	CCCCCGGGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,0:0,1:0|1:233394909_C_CCCCCGGGG:233394909:0,1,0,1
chr2	233394915	.	C	CAGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:233394909_C_CCCCCGGGG:233394909:0,1,0,1
chr2	233394916	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:233394909_C_CCCCCGGGG:233394909:0,1,0,1
chr2	233394921	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:233394909_C_CCCCCGGGG:233394909:0,1,0,1
chr2	233394930	.	T	TAGTCATAGAAAGAAAATGCAGCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	233398566	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:233398566_A_ACT:233398566:1,0,1,0
chr2	233398569	.	GAA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:233398566_A_ACT:233398566:1,0,1,0
chr2	233404590	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:3,2:1,2,2,4
chr2	233407120	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,4:3,4:9,0,8,0
chr2	233407516	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr2	233408190	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,15;MFRL=197,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:1,0:1,2,1,2
chr2	233408220	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,4:0,0,5,5
chr2	233408239	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr2	233408283	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=61,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr2	233414088	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,328;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233414088_A_G:233414088:0,0,0,1
chr2	233414090	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,328;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233414088_A_G:233414088:0,0,0,1
chr2	233414480	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=105.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,36:0.488:74:18,18:19,18:18,20,10,26
chr2	233416068	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,7:2,1:0,8,0,8
chr2	233421284	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,4:8,5:0,12,0,9
chr2	233428927	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=83.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,27:0.438:62:20,18:15,9:21,14,23,4
chr2	233429144	.	GTATTTTATTT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=255,205;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=TATTT;STR;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.754:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr2	233470900	.	TC	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=92.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,18:0,9:0,0,13,15
chr2	233470931	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=110.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,11:0,0,9,22
chr2	233536926	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	233599904	.	A	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,27:0.439:62:22,11:12,15:21,14,15,12
chr2	233620907	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,22;RU=T;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.833:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	233641010	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:4,0,5,0
chr2	233641083	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=19,33;MFRL=47025732,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.923:23:0,14:0,8:1,0,17,5
chr2	233652094	.	T	TAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,2:11,0:0,19,0,2
chr2	233652137	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=207,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:0,5,0,5
chr2	233656007	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,97;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:14,0:16,2:15,15,2,0
chr2	233660704	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:5,1,5,0
chr2	233677041	.	CTT	C,CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35,34;MFRL=172,196,108;MMQ=60,60,60;MPOS=22,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.08,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.250,0.252:9:1,2,2:3,0,0:5,0,4,0
chr2	233684499	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,1:1,1:0,3,2,1
chr2	233708806	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,28:0.434:65:21,13:14,14:23,14,12,16
chr2	233711987	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,1:5,1:9,1,2,0
chr2	233712049	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.544:44:11,15:9,9:14,6,20,4
chr2	233712226	.	CACA	C	.	.	DP=66;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=180,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=123.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,35:0.589:59:12,19:9,14:0|1:233712226_CACA_C:233712226:2,22,3,32
chr2	233712227	.	ACAG	A	.	.	DP=64;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CAG;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.173:23:7,2:8,2:2,17,0,4
chr2	233712248	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,31:0.561:55:12,15:11,15:0|1:233712226_CACA_C:233712226:2,22,1,30
chr2	233712296	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=217,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:9,3:6,7:0,15,0,10
chr2	233721455	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:7,6:8,7:10,5,7,6
chr2	233740055	.	AAGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=AG;STR;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr2	233750118	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,2:7,1:1,8,0,3
chr2	233752639	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:5,0,6,0
chr2	233759362	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=215,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	233785143	.	GCTC	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CTC;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.145:18:8,1:8,1:5,11,2,0
chr2	233897447	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=161,63;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.108:26:11,0:12,2:0|1:233897447_C_T:233897447:10,14,1,1
chr2	233897457	.	C	CTTCTTAAT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=169,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:233897447_C_T:233897447:8,11,1,1
chr2	233925166	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.396:33:12,5:8,7:19,1,13,0
chr2	233925406	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,5:3,5:0,8,0,10
chr2	233990412	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:12,10:9,4:14,7,13,1
chr2	234072626	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr2	234078056	.	AC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,5:4,3:1,9,5,4
chr2	234078623	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:14,4,2,0
chr2	234078768	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:22,3:15,0:16,21,3,0
chr2	234079325	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,198;MMQ=50,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:17,0:9,2:0,28,0,2
chr2	234091158	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:6,7:6,7:4,8,4,10
chr2	234104029	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=178,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:6,1,1,1
chr2	234107070	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	234160616	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,13;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.355:9:3,1:0,0:1,5,0,3
chr2	234178624	.	CTT	C,CT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32,34;MFRL=128,153,184;MMQ=60,60,60;MPOS=19,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.94,10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,8:0.164,0.348:23:5,2,5:5,2,1:9,2,11,1
chr2	234178781	.	AT	A	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.118:55:21,5:22,1:8,41,0,6
chr2	234181556	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:10,2,8,1
chr2	234181593	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:9,10:6,11:11,4,15,6
chr2	234198852	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.420:15:4,3:3,3:9,0,6,0
chr2	234200977	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=74.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,25:0.565:44:8,14:11,11:15,4,20,5
chr2	234200999	.	T	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=61.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,31:0.560:54:13,12:10,11:15,8,18,13
chr2	234224681	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:2,3:4,6:2,5,7,2
chr2	234227699	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=138,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:0,7,0,4
chr2	234229320	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:9,7:11,12:9,11,14,5
chr2	234231736	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=180,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	234231754	.	G	GGATTATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=183,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	234238254	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=145,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr2	234243728	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:20,0:30,3:24,27,0,3
chr2	234294561	.	T	TTC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=61.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr2	234347091	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr2	234354245	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.605:42:9,8:7,12:14,2,20,6
chr2	234368821	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:6,2:5,8:10,2,8,2
chr2	234372985	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:4,10:1,3:1,4,2,11
chr2	234396566	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:4,9:6,11:7,4,15,5
chr2	234402060	.	T	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,4:0.071:67:27,4:35,0:39,24,4,0
chr2	234405374	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,0:5,5:6,1,5,0
chr2	234408503	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:21,4:17,0:30,9,4,0
chr2	234429659	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:19,0:18,3:25,15,0,3
chr2	234433081	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.424:26:4,4:11,6:10,5,9,2
chr2	234442437	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=237,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,2:0,1,0,5
chr2	234449462	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	234457900	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.412:37:9,5:12,10:0,22,0,15
chr2	234469974	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr2	234580678	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.384:42:10,9:15,6:9,17,6,10
chr2	234590970	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=159,169;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,15:0.432:35:11,7:9,7:0|1:234590970_T_G:234590970:7,13,9,6
chr2	234590974	.	CG	AA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=160,169;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,14:0.417:34:10,7:8,7:0|1:234590970_T_G:234590970:6,14,8,6
chr2	234638522	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=168,112;MMQ=60,37;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.089:53:22,2:26,2:24,25,2,2
chr2	234638547	.	G	C	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=160,130;MMQ=60,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,3:0.061:63:28,1:28,2:0|1:234638547_G_C:234638547:29,31,0,3
chr2	234638555	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=160,130;MMQ=60,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,3:0.067:58:26,1:24,2:0|1:234638547_G_C:234638547:28,27,0,3
chr2	234688036	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=136.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,22:0,20:0,0,24,18
chr2	234704495	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr2	234704746	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr2	234707341	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:5,4:0,7:5,0,10,1
chr2	234708428	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:6,3:3,2:6,3,4,2
chr2	234708570	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,5:0,2:0,3,0,7
chr2	234708628	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:234708628_C_CA:234708628:0,4,0,1
chr2	234708629	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr2	234708630	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:234708628_C_CA:234708628:0,4,0,1
chr2	234712921	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr2	234722237	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr2	234737769	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=231,112;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:5,4:3,0:1,8,4,0
chr2	234738472	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr2	234740797	.	C	CAAAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=128,3029931;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:3,0:0|1:234740797_C_CAAAA:234740797:3,3,2,0
chr2	234740798	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=128,3029931;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:234740797_C_CAAAA:234740797:3,3,2,0
chr2	234741022	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	234752908	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:6,13,0,2
chr2	234754273	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	234754506	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=187,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,0:2,7:0,3,1,6
chr2	234761355	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=138,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr2	234763226	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr2	234846198	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr2	234846228	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:234846228_T_TA:234846228:0,1,0,1
chr2	234846229	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:234846228_T_TA:234846228:0,1,0,1
chr2	234846232	.	CT	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,25;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:234846228_T_TA:234846228:0,1,0,1
chr2	234846236	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:234846228_T_TA:234846228:0,0,0,1
chr2	234916771	.	ATT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=15,22;MFRL=110,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:2,0:0,2:2,5,1,3
chr2	234916831	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=75,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr2	234967410	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr2	234969154	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.567:30:8,9:4,8:6,7,5,12
chr2	234975339	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=212,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr2	235943669	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=139,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:5,1:6,6,2,0
chr2	235962210	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0,0,11,1
chr2	236433331	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:1,3:5,1:0,7,0,4
chr2	236626105	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:9,0,2,0
chr2	236817336	.	CT	C,CTT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,33,32;MFRL=197,197,228;MMQ=60,60,60;MPOS=17,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=20.10,6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,10,3:0.602,0.186:16:1,6,1:2,4,2:3,0,12,1
chr2	236817351	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=24,15;MFRL=197,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.137:24:5,0:5,0:0|1:236817351_A_T:236817351:19,2,3,0
chr2	236817353	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=16,19;MFRL=197,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:3,0:5,0:0|1:236817351_A_T:236817351:19,2,2,0
chr2	236817355	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=16,18;MFRL=197,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.112:25:5,0:4,0:0|1:236817351_A_T:236817351:21,2,2,0
chr2	236817357	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=16,18;MFRL=197,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.112:25:4,0:5,0:0|1:236817351_A_T:236817351:21,2,2,0
chr2	236817629	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=213,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:0,8,0,5
chr2	236877066	.	AT	A,ATT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,31,32;MFRL=147,144,140;MMQ=60,60,60;MPOS=11,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=8.86,10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,8,7:0.299,0.289:25:3,6,5:6,2,2:8,2,13,2
chr2	236923361	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:4,4:3,6:8,0,10,0
chr2	236957964	.	G	GCCTCTCTTGGTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,2:6,0:0,16,0,2
chr2	237105101	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,0,2
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chr2	238253930	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.403:10:2,2:4,1:0,6,0,4
chr2	238255120	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:7,3,4,1
chr2	238257127	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,4:1,5:3,2,6,3
chr2	238257213	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.678:29:5,12:4,8:8,1,16,4
chr2	238257353	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.726:20:2,10:3,4:1,4,1,14
chr2	238259675	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=236,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr2	238262021	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:2,3,1,3
chr2	238266146	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	238269871	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=100,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.384:21:6,2:7,5:7,6,2,6
chr2	238271882	.	T	TA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.390:31:5,7:14,4:17,2,10,2
chr2	238277254	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:16,1:14,1:18,12,1,1
chr2	238303381	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,1:13,1:15,10,2,0
chr2	238303906	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:9,4:3,4:0,12,0,8
chr2	238451167	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,4:7,8:9,5,8,4
chr2	238475395	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:238475395_G_C:238475395:0,2,0,1
chr2	238475397	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:238475395_G_C:238475395:0,2,0,1
chr2	238483283	.	GCCC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=C;STR;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:1,3:2,6:0,4,0,9
chr2	238483654	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:7,3:0,4:7,1,7,0
chr2	238483671	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:10,4:0,5:8,2,9,0
chr2	238499727	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=238,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
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chr2	238499866	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=127,96;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,19:0.476:40:6,7:14,8:0|1:238499863_A_AAATTCTTCAGGAGACTCT:238499863:12,9,6,13
chr2	238499874	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,22:0.458:48:10,13:16,9:0|1:238499863_A_AAATTCTTCAGGAGACTCT:238499863:13,13,7,15
chr2	238499997	.	TA	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:1,2:0,5,0,4
chr2	238500733	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=237,248;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.564:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr2	238500771	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=270,248;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238500771_A_T:238500771:0,1,0,1
chr2	238500774	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=270,248;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238500771_A_T:238500771:0,1,0,1
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chr2	238503473	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=35,25;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:4,4:2,3:0|1:238503463_A_G:238503463:6,0,8,0
chr2	238503482	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=144,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:6,5:3,3:0|1:238503463_A_G:238503463:6,3,8,0
chr2	238503502	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:6,6:7,5:8,5,10,1
chr2	238503559	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,18:0.487:37:7,10:10,8:0|1:238503559_C_G:238503559:11,8,11,7
chr2	238503561	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,18:0.487:37:7,9:11,8:0|1:238503559_C_G:238503559:11,8,11,7
chr2	238629501	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,13:0.318:42:14,3:15,10:12,17,2,11
chr2	238632170	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,9;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.169:29:8,0:5,1:19,5,5,0
chr2	238641122	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,0:16,2:0,29,0,2
chr2	238647889	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:7,12,1,1
chr2	238659963	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:6,1:0,2:1,5,0,3
chr2	238667501	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,15;MFRL=117,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.516:6:0,0:3,1:1,2,0,3
chr2	238688244	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	238688274	.	C	CACTAATGCATGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=249,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	238726662	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.057:50:21,2:26,0:12,36,1,1
chr2	238726817	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.368:22:5,5:9,2:7,7,5,3
chr2	238896494	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=170,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr2	238896522	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=139,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:5,0:7,0:0|1:238896522_C_G:238896522:14,4,2,0
chr2	238896524	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,15;MFRL=139,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:8,0:0|1:238896522_C_G:238896522:14,5,2,0
chr2	238896536	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:11,0:0|1:238896522_C_G:238896522:18,7,2,0
chr2	238899045	.	C	CTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:2,3:1,2,0,3
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chr2	239010577	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,3:0,1:2,3,2,2
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chr2	239033937	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=133,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:8,0:0|1:239033934_A_C:239033934:3,14,2,0
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chr2	239056433	.	TCT	AAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=9,13;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:239056428_T_A:239056428:1,0,1,0
chr2	239056438	.	TC	AA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=12,13;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:239056428_T_A:239056428:1,0,1,0
chr2	239056746	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:0,12,0,3
chr2	239082166	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr2	239092474	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=272,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr2	239092618	.	C	CCACA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=222,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=CA;STR;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,4,1
chr2	239093788	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,19,1
chr2	239102856	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.367:22:7,3:7,4:14,0,7,1
chr2	239103574	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,3:5,4:0,12,2,5
chr2	239103603	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=198,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0,9,1,1
chr2	239148401	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	239148970	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=202,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:3,4:4,6:6,1,10,1
chr2	239148996	.	CCCGT	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCGT;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:21,1:13,0:25,11,1,1
chr2	239165698	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:3,14,1,1
chr2	239184581	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:1,6:5,6:0,6,1,11
chr2	239237713	.	GGA	G	.	.	DP=141;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GA;STR;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,5:0.050:118:54,3:50,2:57,56,1,4
chr2	239241445	.	AT	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.201:40:11,0:18,8:27,5,6,2
chr2	239242652	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,32:0.421:76:22,9:21,22:22,22,12,20
chr2	239242719	.	G	GT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=13,13;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.594:20:1,3:2,1:1,7,4,8
chr2	239261866	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:10,11:11,2:4,17,5,8
chr2	239342261	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=170,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:7,2:8,0:12,6,2,0
chr2	239976632	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:239976632_T_A:239976632:0,0,0,1
chr2	239976636	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=244,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:239976632_T_A:239976632:0,1,0,1
chr2	240003732	.	C	CCGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr2	240029736	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=168,59;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:3,0:1,1:4,0,1,1
chr2	240055893	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:240055893_C_T:240055893:0,0,1,0
chr2	240055901	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:240055893_C_T:240055893:0,0,1,0
chr2	240066417	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,2,18
chr2	240078488	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:3,4,0,6
chr2	240085403	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	240085674	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,0:0,3:2,1,0,3
chr2	240085709	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:240085709_G_C:240085709:0,1,0,1
chr2	240085713	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:240085709_G_C:240085709:0,1,0,1
chr2	240085718	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:240085709_G_C:240085709:0,1,0,1
chr2	240085720	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:240085709_G_C:240085709:0,1,0,1
chr2	240111477	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	240500413	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,22:0,11:0,0,15,20
chr2	240504878	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr2	240702215	.	TC	GG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.313:13:2,0:5,1:1,8,0,4
chr2	240702216	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.368:13:3,1:5,4:1,7,0,5
chr2	240721598	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:5,4:9,6:5,9,0,10
chr2	240721665	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=172,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr2	240951071	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,8:8,4:7,7,4,8
chr2	240954090	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:9,2:1,1:8,2,4,0
chr2	240958129	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	240969585	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,157;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.439:39:10,13:12,4:19,3,15,2
chr2	240981179	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	240982443	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:240982443_C_T:240982443:0,0,1,5
chr2	240982449	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:240982443_C_T:240982443:0,0,1,5
chr2	240984920	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,198;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.056:69:36,2:28,1:22,44,0,3
chr2	240985511	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr2	241073450	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,5:6,7:3,7,2,10
chr2	241075809	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:1,2,1,4
chr2	241390516	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,6:0,6:0,0,10,4
chr2	241395558	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	241401566	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr2	241403955	.	GTGACGCCTGCGTGTGCGTGTCAACGCCTGTGTGCGCGCGT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,6:0,3:0,0,9,1
chr2	241404213	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=109.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,11:0,20:0,0,18,15
chr2	241405400	.	C	CGTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	241420390	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=197,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.193:14:5,1:3,1:10,2,2,0
chr2	241446879	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:241446879_G_C:241446879:1,0,1,0
chr2	241446883	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:241446879_G_C:241446879:0,0,1,0
chr2	241446892	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:241446879_G_C:241446879:0,0,1,0
chr2	241446896	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:241446879_G_C:241446879:0,0,1,0
chr2	241513866	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr2	241531391	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:8,9,1,1
chr2	241534381	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr2	241538229	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,0,20
chr2	241555784	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	241555991	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=220,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr2	241569329	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=14,29;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,4:0,3:3,0,7,0
chr2	241570483	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=224,124;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:10,6,2,0
chr2	241570736	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr2	241631267	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,165;MMQ=54,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,5:5,0:10,0,5,0
chr2	241660256	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,3:4,0:11,0,3,0
chr2	241661112	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241663019	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,0,18
chr2	241674061	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,2:4,0:8,1,2,0
chr2	241680802	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=204,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,0,5
chr2	241696840	.	ATCC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TCC;STR;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:4,1:1,2:3,4,2,1
chr2	241697082	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,1:1,1:1,0,0,3
chr2	241700185	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.382:29:9,5:9,5:12,6,8,3
chr2	241702561	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241705188	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=136,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,1:3,1:6,6,1,1
chr2	241726646	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:9,0,3,1
chr2	241736964	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=199,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:241736964_G_A:241736964:2,0,1,0
chr2	241736970	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:241736964_G_A:241736964:3,0,1,0
chr2	241815307	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:3,3:2,4:2,3,11,2
chr2	241815473	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.642:29:2,7:8,10:2,8,3,16
chr2	241827696	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.609:8:1,2:1,2:1,2,4,1
chr2	241831264	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:4,2,2,1
chr2	241831296	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:4,4,2,2
chr2	241861904	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241889171	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.352:21:7,3:5,3:4,10,2,5
chr2	241889937	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.495:36:6,6:12,10:8,10,4,14
chr2	241898947	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=218,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:1,4,1,2
chr2	241928074	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	241974242	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,29;MFRL=202,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.389:6:1,1:1,1:0,4,0,2
chr2	241980234	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:4,3:4,5:3,5,6,2
chr2	242003558	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=225,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr2	242004199	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=139,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.580:10:4,1:0,4:3,1,6,0
chr2	242004219	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=51.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,4:0,0,10,4
chr2	242009273	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=191,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr2	242011084	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=144,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	242011151	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	242011330	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:0,8,1,5
chr2	242038754	.	AT	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=202,144;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr2	242040669	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,4:0.044:93:39,1:46,2:36,53,1,3
chr2	242046883	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.113:33:12,0:18,3:0|1:242046883_C_G:242046883:9,21,0,3
chr2	242046888	.	G	GAGTCCGTTAAGAAGGGGGAT	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=34,37;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:13,0:18,3:0|1:242046883_C_G:242046883:9,22,0,3
chr2	242046890	.	A	ATCT	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:10,0:18,1:0|1:242046883_C_G:242046883:9,22,0,3
chr2	242062130	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.647:32:6,12:5,9:8,3,14,7
chr2	242065601	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,3:8,1:8,3,1,3
chr2	242072280	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:5,3,7,1
chr2	242075192	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	242078990	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.413:32:6,5:12,8:11,8,8,5
chr2	242079007	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=159,117;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.295:32:8,4:14,5:9,14,5,4
chr2	242082222	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=264,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:0,9:2,5:2,0,14,0
chr2	242097935	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=162,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:12,3:12,0:11,13,3,0
chr2	242099961	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,5:0,13:0,0,1,21
chr2	242135017	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	242139491	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	242142737	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr2	242143011	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=186,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr2	242149073	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	242162573	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:4,2:15,1:17,2,2,1
chr2	242192916	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:8,8:10,8:6,12,5,11
chr2	242195038	.	G	GTTAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:242195038_G_GTTAA:242195038:0,7,1,1
chr2	242195039	.	G	GTCCAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:242195038_G_GTTAA:242195038:0,7,1,1
chr2	242259614	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=107.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,19:0,13:0,0,27,5
chr2	242274749	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.059:65:34,3:27,0:31,31,3,0
chr2	242275579	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,5,15
chr2	242283071	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	242283094	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	242287487	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,7,6
chr2	242289663	.	C	CATT	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATT;STR;TLOD=250.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.985:58:0,25:0,33:0,0,0,58
chr2	242352835	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:2,7,0,2
chr2	242396087	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=85.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,21:0,7:0,0,28,0
chr2	242402062	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr2	242407467	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	242432704	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=107.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,19:0,9:0,0,18,11
chr2	242433348	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=107,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,8:1,7:1,0,14,1
chr2	242435050	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,3:4,3:9,2,5,1
chr2	242542298	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	242556732	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr2	242572262	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,3,1
chr2	242577022	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=198,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:4,3:4,0:9,0,3,0
chr2	242590338	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr2	242590774	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=145,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:19,3:10,0:8,21,1,2
chr2	242592728	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:9,7:8,13:12,5,13,7
chr2	242593114	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	242594622	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:7,1,5,3
chr2	242605942	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=196,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr2	242606079	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,1:11,1:10,15,0,2
chr2	242607483	.	GC	TT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr2	242615462	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=195,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr2	242617792	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=147,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,2:1,0:0|1:242617792_A_G:242617792:3,1,2,0
chr2	242617802	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,2:0.232:11:5,2:3,0:1|0:242617792_A_G:242617792:6,3,2,0
chr2	242626045	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	242648545	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:0|1:242648545_C_T:242648545:5,0,5,0
chr2	242648549	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:0|1:242648545_C_T:242648545:5,0,5,0
chr2	242662761	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:5,6:2,5:0,8,1,10
chr2	242674959	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	242680366	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0|1:242680366_A_G:242680366:0,0,5,3
chr2	242680375	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=82,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.666:7:2,2:0,3:0|1:242680366_A_G:242680366:1,1,3,2
chr2	242682029	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.559:16:2,4:4,4:1,6,0,9
chr2	242684115	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,16,0
chr2	242688203	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,7:0,2:0,0,7,2
chr2	242688366	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	242688434	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	242688442	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	242690675	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.567:33:7,9:7,8:7,7,10,9
chr2	242694630	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:3,1:0,2:0,4,0,4
chr2	242695497	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,0,3
chr2	242707101	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=139,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.429:31:7,5:9,8:10,8,7,6
chr2	242743535	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:18,1:16,1:22,12,1,1
chr2	242743651	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr2	242755599	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr2	242756223	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	242794249	.	AGGTGG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTGG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr2	242794588	.	G	GATAAAGAACTGCTGTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=210,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	242813241	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,0,2
chr2	242813276	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=194,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr3	403288	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,0:0,3:0|1:403288_G_A:403288:0,0,6,0
chr3	403297	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0|1:403288_G_A:403288:0,0,7,0
chr3	403308	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,0:0,7:0,0,7,1
chr3	403345	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,1:0,10:0,0,10,1
chr3	440088	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,0,7
chr3	443258	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	1320271	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	1337203	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	1415441	.	CT	AA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,77;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:17,0:20,6:14,23,1,5
chr3	1427204	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:1,2:5,1:7,0,3,0
chr3	1444243	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,5:2,0:0,5,0,5
chr3	2908335	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	2908694	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=173,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr3	2944725	.	A	ATCAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=141,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr3	3076284	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr3	3076401	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,4:0,8:1,0,7,5
chr3	3080527	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:2,9:1,1:3,0,11,0
chr3	3116438	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,1:4,5:5,1,4,2
chr3	3118142	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,8:0,1:0,0,9,0
chr3	3133896	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=170,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:3,3,3,1
chr3	3170792	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,12,11
chr3	3170910	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0,0,2,18
chr3	3171502	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr3	3171713	.	G	GCCTGACT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.809:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr3	3188362	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr3	3189059	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,12:0,0,20,1
chr3	3189398	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=121.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,20:0,12:0,0,9,23
chr3	3192524	.	A	ATAAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAC;STR;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,16,1
chr3	3194107	.	GA	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.092:53:16,3:20,2:34,14,4,1
chr3	3197871	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=166.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,16:0,29:0,0,29,16
chr3	3215954	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr3	3216976	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=16,32;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.231:21:0,3:2,0:2,14,1,4
chr3	3221430	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,7:0,0,2,15
chr3	3889036	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.183:18:7,0:6,2:9,6,0,3
chr3	3889067	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32,32;MFRL=0,150,173;MMQ=60,60,60;MPOS=26,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=26.29,6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,3:0.683,0.262:12:0,3,0:0,5,3:0,0,10,2
chr3	4345170	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.384:18:5,0:3,0:1,10,0,7
chr3	4345178	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.370:15:4,0:2,1:1,8,0,6
chr3	4345849	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr3	4358066	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=157,173;MMQ=55,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr3	4358210	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=104,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:0,7:5,6:2,3,7,6
chr3	4461698	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr3	4461862	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:4,7,1,2
chr3	4562667	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=105.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,16:0,12:0,0,24,5
chr3	4687470	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	4693937	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,4,13
chr3	4700060	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=187,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:4700060_A_T:4700060:0,3,0,1
chr3	4700062	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=187,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:4700060_A_T:4700060:0,3,0,1
chr3	4712710	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	4716672	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	4726947	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	4738774	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=219,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,1:2,1,4,2
chr3	4739016	.	G	GGTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=84,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr3	4856993	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,10:0,0,1,19
chr3	4859725	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,10:0,14:0,0,19,7
chr3	4878419	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=15,34;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=24,21;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,1:0,0:0|1:4878419_CTTT_C:4878419:1,0,1,0
chr3	4878447	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=148,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.219:7:4,0:2,0:0|1:4878419_CTTT_C:4878419:1,5,1,0
chr3	5213822	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.333:37:15,7:9,5:17,8,11,1
chr3	5213916	.	G	GT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.113:41:25,3:12,1:6,31,0,4
chr3	5241223	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr3	5248829	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=234,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,3:3,4:3,1,6,1
chr3	6903601	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr3	7188072	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr3	7188116	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,4:6,2:11,2,6,0
chr3	7340585	.	T	TTATTTCAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,292;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	7456675	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,11,4
chr3	7494245	.	TTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TG;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:1,1,3,0
chr3	7503487	.	TTC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=198,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,0:1,1:0|1:7503487_TTC_T:7503487:0,2,0,1
chr3	7503492	.	G	GGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=198,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7503487_TTC_T:7503487:0,2,0,1
chr3	7503494	.	T	TTTGGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=198,136;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7503487_TTC_T:7503487:0,2,0,1
chr3	8543713	.	G	GT	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=133.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,24:0,16:0,0,4,36
chr3	8543757	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=70.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,0,22
chr3	8665360	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=185,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:3,7,0,2
chr3	8667896	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,5:1,5:2,1,7,3
chr3	8669367	.	TG	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=68.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.632:36:6,16:5,7:6,7,13,10
chr3	8675318	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr3	8787123	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=178,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr3	8787164	.	AAGCGGGTGGCTTCTGTG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr3	8787220	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,4:0,2,6,2
chr3	8923025	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:16,2,2,0
chr3	8931984	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr3	8932189	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,3:0,0,3,7
chr3	8943988	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	8955240	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	8988809	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	9000722	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=163,223;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:8,2:0|1:9000722_A_G:9000722:3,19,0,2
chr3	9000726	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,223;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:0|1:9000722_A_G:9000722:3,17,0,2
chr3	9032159	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:10,0,2,0
chr3	9034558	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:6,3,4,1
chr3	9055293	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	9066853	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	9069747	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=108.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,14:0,18:0,0,15,18
chr3	9069873	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=247,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,0:0,3:1,1,0,4
chr3	9106053	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:6,1:10,2,2,0
chr3	9406661	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr3	9407022	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr3	9425008	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:1,12,0,2
chr3	9477496	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,71;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.054:71:34,0:34,3:38,30,1,2
chr3	9488787	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:7,0:0|1:9488787_G_C:9488787:8,8,0,2
chr3	9488792	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:9,0:0|1:9488787_G_C:9488787:10,11,0,2
chr3	9488796	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,0:0|1:9488787_G_C:9488787:9,11,0,2
chr3	9489767	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	9495385	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,17,4
chr3	9547950	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0|1:9547950_G_C:9547950:1,4,0,2
chr3	9547959	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0|1:9547950_G_C:9547950:0,3,0,3
chr3	9724941	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,189;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.098:39:24,0:11,3:11,25,0,3
chr3	9743398	.	TGGAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=216,267;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGAG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr3	9746561	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.233:20:2,4:7,0:13,3,4,0
chr3	9757086	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:3,9:1,6:3,1,7,9
chr3	9757287	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=74,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:9757287_G_A:9757287:0,2,0,2
chr3	9757296	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:9757287_G_A:9757287:0,3,0,1
chr3	9757300	.	G	GGGACTAGGAAAGCTGAGATCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:9757287_G_A:9757287:0,3,0,1
chr3	9757754	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.590:20:6,7:2,5:1,7,1,11
chr3	9783147	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,36;MFRL=193,248;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	9785855	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:1,1:6,1:8,0,2,0
chr3	9799113	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=194,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,4:0,1:4,0,4,1
chr3	9803126	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=113.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,13:0,20:0,0,21,14
chr3	9807704	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:4,10:2,7:1,5,6,11
chr3	9821979	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:3,0,7,1
chr3	9831112	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=194,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:7,0,1,1
chr3	9831680	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,0:3,2:0,3,0,3
chr3	9841989	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:1,3:2,3:0,3,2,4
chr3	9854865	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr3	9854913	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=196,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:4,4,2,2
chr3	9859456	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:2,5:3,5:1,4,2,9
chr3	9860688	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=227,0;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:9860688_T_C:9860688:0,2,1,0
chr3	9860691	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=227,0;MMQ=60,35;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:9860688_T_C:9860688:0,2,1,0
chr3	9876301	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	9908749	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:3,0,5,1
chr3	9911478	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=163,276;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	9918954	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:1,2,0,2
chr3	9932337	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=194,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:6,8:1,5:7,0,12,1
chr3	9944937	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr3	9947997	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,4:4,6:5,3,6,4
chr3	9948241	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,358;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	9956546	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=198,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9956546_T_TC:9956546:0,1,0,1
chr3	9956548	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=198,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9956546_T_TC:9956546:0,1,0,1
chr3	9956868	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9956868_G_A:9956868:0,0,1,0
chr3	9956872	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9956868_G_A:9956868:0,0,1,0
chr3	9958947	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=14,29;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.822:7:0,5:0,1:1,0,6,0
chr3	9962157	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=136,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,4:1,0:0,1,4,0
chr3	9962767	.	TATTC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=ATTC;STR;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.812:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	9965745	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	9972493	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.729:13:0,7:3,1:2,1,8,2
chr3	9976363	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=234,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:3,5:5,0:2,7,1,4
chr3	10088239	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=165,171;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,7:0.228:33:12,2:12,4:0|1:10088239_G_A:10088239:20,6,7,0
chr3	10088242	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=165,168;MMQ=60,58;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,8:0.250:34:13,3:10,5:0|1:10088239_G_A:10088239:20,6,8,0
chr3	10088266	.	G	T	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=167,155;MMQ=60,51;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,18:0.333:55:19,6:18,12:24,13,15,3
chr3	10088404	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=168,157;MMQ=40,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,14:0.375:38:12,3:12,10:0|1:10088404_C_T:10088404:8,16,0,14
chr3	10088407	.	AG	A	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=169,157;MMQ=40,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,14:0.366:39:12,4:12,10:0|1:10088404_C_T:10088404:8,17,0,14
chr3	10088409	.	TAAG	T	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=169,157;MMQ=40,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,14:0.366:39:12,4:12,10:0|1:10088404_C_T:10088404:8,17,0,14
chr3	10088422	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=173,158;MMQ=40,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,11:0.353:32:9,3:12,7:0|1:10088404_C_T:10088404:7,14,0,11
chr3	10088443	.	CA	AG	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=176,158;MMQ=40,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,4:7,3:5,10,0,7
chr3	10088461	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=179,195;MMQ=40,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.384:21:6,5:7,2:2,11,0,8
chr3	10089549	.	TACTA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=167,167;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:8,0:1,2:8,1,2,0
chr3	10091035	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=160,167;MMQ=51,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:17,1:14,3:19,12,3,1
chr3	10091252	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=190,161;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.638:9:1,3:2,2:0|1:10091252_A_C:10091252:0,3,0,6
chr3	10091261	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=190,153;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,3:1,2:0|1:10091252_A_C:10091252:0,5,0,5
chr3	10102153	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,101;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:5,2:1,13,1,1
chr3	10103931	.	CT	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.260:35:8,4:8,6:1,24,2,8
chr3	10116352	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=202,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,2,1
chr3	10122927	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,99;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1,2,1,1
chr3	10241987	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,2:6,1:11,1,2,1
chr3	10242243	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:8,3:5,1:0,15,0,4
chr3	10251196	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:3,3:4,0:8,0,3,0
chr3	10264299	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.794:22:4,10:0,8:3,1,16,2
chr3	10268017	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,6:6,5:7,1,9,2
chr3	10280749	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=158,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:10280749_G_GAA:10280749:0,3,0,1
chr3	10280751	.	ATGCTCATGT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=158,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:10280749_G_GAA:10280749:0,3,0,1
chr3	10280753	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,3:0.811:3:0,1:0,2:1|0:10280749_G_GAA:10280749:0,0,0,3
chr3	10280765	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,21;MFRL=158,238;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:10280749_G_GAA:10280749:0,3,0,1
chr3	10302045	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.513:29:6,7:8,7:0|1:10302045_C_T:10302045:6,8,6,9
chr3	10302056	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=173,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:5,6:8,6:0|1:10302045_C_T:10302045:6,8,5,9
chr3	10302369	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr3	10302395	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	10312507	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,9,10
chr3	10318230	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr3	10342876	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=98.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,9:0,22:0,0,14,18
chr3	10359628	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	10382111	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr3	10382148	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr3	10429902	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,1:13,1:16,2,2,0
chr3	10442539	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr3	10442779	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.518:15:3,4:4,2:1,6,1,7
chr3	10452231	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:8,0,5,0
chr3	10858249	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=155,102;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.327:7:4,1:0,0:0|1:10858249_C_G:10858249:2,3,0,2
chr3	10858252	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=169,102;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:1,0:0,0:0|1:10858249_C_G:10858249:1,3,0,2
chr3	10975745	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,8,9
chr3	11060430	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:1,3,0,4
chr3	11075503	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	11300707	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0,0,14,6
chr3	11301138	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,1:9,1:9,10,1,1
chr3	11301597	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:10,8,1,1
chr3	11303437	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	11744544	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr3	11831953	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=115,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:4,4,1,1
chr3	11858896	.	C	CTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=237,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11858896_C_CTGCT:11858896:0,1,0,1
chr3	11858897	.	A	AACCCCATACCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=237,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11858896_C_CTGCT:11858896:0,1,0,1
chr3	11880816	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:1,5,0,4
chr3	12045986	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	12046013	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,5,2
chr3	12046124	.	AG	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,2
chr3	12046131	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,3
chr3	12046148	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,3
chr3	12208652	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	12208671	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	12209791	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:3,0:0|1:12209791_A_T:12209791:9,0,2,0
chr3	12209793	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:0|1:12209791_A_T:12209791:9,0,2,0
chr3	12228960	.	CTCTTCCTCCTCT	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=105.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,27:0.723:37:5,14:4,11:3,7,8,19
chr3	12229015	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=138.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,20:0,20:0,0,22,21
chr3	12232208	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr3	12458714	.	G	GCCTGACTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	12475558	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,0:7,2:5,9,1,1
chr3	12571420	.	GTT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:3,1:5,0:2,7,0,2
chr3	12616533	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.360:20:4,4:9,3:0,13,3,4
chr3	12641923	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.089:31:11,2:17,0:11,18,1,1
chr3	12650482	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr3	12650910	.	T	TCTCG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=165,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.338:4:0,1:3,0:0|1:12650910_T_TCTCG:12650910:0,3,0,1
chr3	12650912	.	T	TTTCTCTTTTCTTCCCTCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,221;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:12650910_T_TCTCG:12650910:0,3,0,1
chr3	12660291	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	12791172	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,2:8,1:12,2,3,0
chr3	12868857	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,214;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr3	12954868	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,1:4,2:11,0,3,0
chr3	12956531	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,2:5,1:9,1,3,0
chr3	12963736	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:5,7,1,1
chr3	13008814	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	13361238	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,3:6,3:12,0,4,2
chr3	13368892	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:2,8:8,10:4,6,11,7
chr3	13373958	.	T	TGCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13373958_T_TGCCC:13373958:0,1,0,1
chr3	13373962	.	AG	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13373958_T_TGCCC:13373958:0,1,0,1
chr3	13378511	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=176,120;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,2,0
chr3	13383649	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	13393427	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=128,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:4,3,0,2
chr3	13407653	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=220,181;MMQ=60,46;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:13407653_G_A:13407653:0,2,0,1
chr3	13407663	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=165,181;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13407653_G_A:13407653:0,1,0,1
chr3	13407667	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=165,181;MMQ=60,46;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13407653_G_A:13407653:0,1,0,1
chr3	13415146	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr3	13421024	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:1,7:4,11:4,1,13,5
chr3	13421320	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr3	13438830	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=110,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,4:2,5:3,0,8,1
chr3	13538370	.	GCA	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=12,32;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,4:0,2:0|1:13538370_GCA_G:13538370:1,2,0,6
chr3	13538373	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=15,32;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,3:0,2:0|1:13538370_GCA_G:13538370:1,2,0,6
chr3	13538376	.	CT	GG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:2,3:0,1:0|1:13538370_GCA_G:13538370:1,2,0,6
chr3	13538381	.	C	CCCGGGGGGGGG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:2,3:0,1:0|1:13538370_GCA_G:13538370:1,1,0,6
chr3	13538382	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=22,32;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,3:0,2:0|1:13538370_GCA_G:13538370:1,1,0,6
chr3	13545980	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr3	13671273	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:5,5:1,8:4,2,7,6
chr3	13672400	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=218,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	13679044	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	13679203	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,1:2,7:2,3,5,3
chr3	13679305	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:1,2:8,1:6,3,3,0
chr3	13679335	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:5,2:2,6:5,2,6,3
chr3	13860957	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	14175149	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr3	14180633	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:6,2:2,1:5,3,3,1
chr3	14187345	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=232,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chr3	14188700	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=185,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,5,0
chr3	14188762	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:6,3:11,8:13,5,10,1
chr3	14190237	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.327:26:7,1:8,7:8,10,4,4
chr3	14190268	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:6,0:11,4:10,8,2,2
chr3	14220095	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=158,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,2:4,0:3,8,2,0
chr3	14526538	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=9,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.876:10:0,3:0,4:1,0,1,8
chr3	14537867	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,5:0,0,13,2
chr3	14538072	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr3	14548208	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	14548494	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.899:17:0,7:1,8:0,1,8,8
chr3	14551444	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,9,14
chr3	14555367	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr3	14555409	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:14555409_T_C:14555409:0,0,0,2
chr3	14555411	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:14555409_T_C:14555409:0,0,0,2
chr3	14555739	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	14555758	.	C	CAGTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,6:0,0,9,4
chr3	14559335	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:8,0:10,2:7,11,1,1
chr3	14561627	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=52.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,8:0,0,8,7
chr3	14565017	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	14565215	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,168;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:5,11,0,2
chr3	14702982	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr3	14708918	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,14:0,0,25,4
chr3	14709058	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=122,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:0,4:4,12:0,4,3,13
chr3	14724337	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,0:5,2:7,3,2,0
chr3	14725668	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	14756730	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	14763381	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=188,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:0,5,0,7
chr3	14768554	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr3	14801550	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=78,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:1,1,0,5
chr3	14862121	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.869:21:1,10:1,8:1,1,9,10
chr3	14939198	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr3	14942024	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:1,0:8,8:0,9,0,8
chr3	14949268	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,3:7,3:0,10,0,6
chr3	14958865	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.706:12:2,4:1,2:1,2,1,8
chr3	14960170	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	14965466	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr3	14965507	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr3	14965743	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=248,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	14967747	.	G	GTTACATCCCTGATTCCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=256,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.317:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr3	15057584	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=172,138;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:0|1:15057584_T_C:15057584:14,0,2,0
chr3	15057587	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=172,138;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:3,1:8,0:0|1:15057584_T_C:15057584:14,0,2,0
chr3	15259865	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=228,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	15288742	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:8,4:1,3:10,0,7,0
chr3	15311464	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=191,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr3	15373832	.	TTCC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCC;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr3	15471528	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,1:4,1:0,6,0,2
chr3	15498118	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	15507761	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,9:0,16:0,0,26,2
chr3	15515695	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,1:0,10:0,0,9,2
chr3	15515859	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=200,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15515859_C_T:15515859:0,1,0,1
chr3	15515872	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=200,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15515859_C_T:15515859:0,1,0,1
chr3	15516910	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,8,4
chr3	15517025	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	15518731	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr3	15520639	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr3	15563178	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=112,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr3	15604816	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=172,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:11,1,2,0
chr3	15628149	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=156,448;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0,18,1,1
chr3	15632999	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:7,1:1,3:8,0,3,1
chr3	15643043	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0,0,1,9
chr3	15643419	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=16,12;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.236:26:3,0:6,1:5,15,0,6
chr3	15643429	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,10;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.245:25:5,0:6,0:5,14,0,6
chr3	15643435	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.437:21:3,0:4,0:4,7,0,10
chr3	15685759	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=167,167;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:0|1:15685759_A_G:15685759:9,2,2,0
chr3	15685768	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=167,167;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:3,2:9,0:0|1:15685759_A_G:15685759:9,3,2,0
chr3	15686693	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.702:25:5,8:2,9:4,3,12,6
chr3	15711816	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=139,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:6,0:14,4:7,15,1,3
chr3	15718652	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr3	15719049	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.635:20:5,4:2,8:4,3,6,7
chr3	15727008	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr3	15736279	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.712:19:4,8:1,4:3,2,7,7
chr3	15736385	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,12:0,3:0,0,2,13
chr3	15737610	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:5,0,4,1
chr3	15749352	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:4,3:4,1:9,0,5,0
chr3	15752667	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:22,4:20,0:30,12,4,0
chr3	15752830	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=168,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.560:25:7,5:3,9:1,10,0,14
chr3	15753682	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:26,1:33,2:29,31,2,1
chr3	15756039	.	G	GAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=197,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.628:12:2,5:2,3:4,0,8,0
chr3	15756215	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,22:0.451:49:16,10:11,12:1,26,3,19
chr3	15807725	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:5,5:1,3:5,1,8,1
chr3	16264037	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=227,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr3	16269066	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:4,0:0,2:0,5,0,2
chr3	16343092	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=94.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,23,2
chr3	16358482	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=179,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.326:28:8,0:2,2:10,8,9,1
chr3	16358513	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=172,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.133:25:14,1:4,0:10,12,3,0
chr3	16419708	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:0,8,0,6
chr3	16450872	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:8,6:5,5:6,7,7,4
chr3	16535229	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:3,1:1,1:3,1,3,0
chr3	16636093	.	TA	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.408:31:8,5:7,5:3,15,3,10
chr3	16636203	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:0,3:5,1:0|1:16636203_T_C:16636203:1,4,0,4
chr3	16636211	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=183,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,3:5,0:0|1:16636203_T_C:16636203:1,4,0,3
chr3	16639754	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:1,6,0,3
chr3	16640100	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,21;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,0:0,1:0|1:16640100_A_AGG:16640100:0,0,0,1
chr3	16640102	.	T	TGAACTTGATGTATAATTAATC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,21;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16640100_A_AGG:16640100:0,0,0,1
chr3	16646740	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.641:31:7,3:3,17:3,8,4,16
chr3	16646745	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:3,5:14,3:4,15,2,6
chr3	16646800	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:2,4:8,3:2,8,1,6
chr3	17053001	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,6:6,0:10,2,4,2
chr3	17131421	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr3	17300133	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr3	17469887	.	ATG	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:5,8:2,5:8,3,12,1
chr3	17469901	.	GTGTA	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.150:30:12,3:13,2:19,6,4,1
chr3	17470114	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,0,14
chr3	18419859	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=204,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr3	18436448	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	19436587	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,13,4
chr3	19556990	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=151,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr3	19557003	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=226,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:19557003_T_TC:19557003:0,3,0,1
chr3	19557004	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=226,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:19557003_T_TC:19557003:0,3,0,1
chr3	19557005	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=212,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:19557005_C_T:19557005:0,3,0,1
chr3	19557009	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=212,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:19557005_C_T:19557005:0,3,0,1
chr3	19959707	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=213,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:3,2:7,1,2,1
chr3	19974700	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=180,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,0:4,2:7,1,1,1
chr3	20017489	.	GG	CC,CG	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32,31;MFRL=0,164,144;MMQ=60,60,60;MPOS=18,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=86.49,39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,27,16:0.609,0.369:43:0,10,9:0,17,6:0,0,36,7
chr3	20113779	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=117,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,5:7,1:8,1,5,1
chr3	20113989	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=302,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,0:1,4:0,2,0,5
chr3	20114044	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20114044_T_C:20114044:0,0,0,1
chr3	20114048	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20114044_T_C:20114044:0,0,0,1
chr3	20141251	.	AAG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=190,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:5,1:0,2:5,0,3,0
chr3	20141301	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,6:0,10:0,0,16,0
chr3	20143020	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	20156302	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	20168875	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr3	20189528	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.212:25:2,2:11,3:0,20,1,4
chr3	20193845	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=194,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:5,0:7,3,2,0
chr3	20212189	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr3	20212754	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:6,1:9,3:0,15,0,4
chr3	20212796	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr3	20216026	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.067:58:22,0:29,3:38,17,1,2
chr3	20219787	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=150,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,0:14,2:16,11,0,2
chr3	20219885	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,1,10
chr3	21552486	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=111,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,3:9,7:2,14,1,9
chr3	21606027	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr3	23932177	.	GGGA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=216,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23932177_GGGA_G:23932177:1,0,0,1
chr3	23932183	.	T	TATA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=216,100;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23932177_GGGA_G:23932177:1,0,0,1
chr3	23932185	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=216,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23932177_GGGA_G:23932177:1,0,0,1
chr3	23932190	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=224,100;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:23932177_GGGA_G:23932177:1,1,0,1
chr3	23987002	.	A	AGGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=133,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GGC;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	24001078	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=241,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr3	24009279	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	24018824	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,0:14,3:10,18,0,3
chr3	24270412	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.157:25:11,4:10,0:15,6,4,0
chr3	25611501	.	A	ATTTAACC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=209,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	25662081	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=206,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,0:4,2:7,0,2,0
chr3	25668386	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,5712;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,0:0,5:0|1:25668386_T_A:25668386:0,2,5,0
chr3	25668391	.	AAT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=162,5712;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,0:0,5:0|1:25668386_T_A:25668386:0,2,5,0
chr3	25773856	.	G	GCCAAAAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=147,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,2:10,0:15,10,1,1
chr3	25775356	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	25805879	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr3	25824710	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.391:28:6,2:8,3:4,13,11,0
chr3	25824714	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.245:30:7,3:10,3:9,14,7,0
chr3	25836023	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	26752237	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=219,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,3:1,1:0,1,0,5
chr3	27257491	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27257491_T_C:27257491:0,0,0,1
chr3	27257492	.	TCAACATGAAATTTAG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27257491_T_C:27257491:0,0,0,1
chr3	27332241	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,193;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:2,9,0,2
chr3	27332674	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=190,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:9,0,3,0
chr3	27333151	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=177,175;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27333151_TG_T:27333151:0,3,0,1
chr3	27333153	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=177,175;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27333151_TG_T:27333151:0,3,0,1
chr3	27333159	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=104,175;MMQ=60,24;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27333151_TG_T:27333151:0,2,0,1
chr3	27333164	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=104,175;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27333151_TG_T:27333151:0,2,0,1
chr3	27333168	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=104,175;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27333151_TG_T:27333151:0,2,0,1
chr3	27353716	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr3	27424799	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=184,1439;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,1,1
chr3	27427601	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,2:9,1:0,15,0,4
chr3	27433397	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,5:0,7:0,1,0,12
chr3	27446285	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,14,3
chr3	27451106	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,1:3,3:0,3,0,5
chr3	27463351	.	T	TAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.688:1:0,0:0,1:0|1:27463351_T_TAG:27463351:0,0,0,1
chr3	27463353	.	T	TCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:27463351_T_TAG:27463351:0,0,0,1
chr3	27473016	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=136,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:15,0:20,2:0|1:27473016_C_T:27473016:15,24,1,1
chr3	27473024	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=137,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:18,0:22,2:0|1:27473016_C_T:27473016:16,28,1,1
chr3	27473027	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=137,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:19,0:20,2:0|1:27473016_C_T:27473016:15,28,1,1
chr3	27473031	.	G	GCTTTCTGA	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=137,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:18,0:19,1:0|1:27473016_C_T:27473016:12,27,1,1
chr3	27473066	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:15,2:11,3:10,16,1,4
chr3	27763405	.	CGCG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCG;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	27763480	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	28373462	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=170,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:1,3:1,2,0,4
chr3	28373503	.	G	GCAAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=122,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:28373503_G_GCAAT:28373503:1,1,0,1
chr3	28373504	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=122,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:28373503_G_GCAAT:28373503:1,1,0,1
chr3	28381887	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,24:0.695:34:4,11:6,13:10,0,21,3
chr3	28557206	.	CTG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=TG;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.821:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr3	29476428	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:8,6:6,3:1,13,0,9
chr3	29529829	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,818;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	29529907	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0|1:29529907_G_A:29529907:0,0,11,1
chr3	29529913	.	TTC	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TC;STR;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0|1:29529907_G_A:29529907:0,0,11,1
chr3	29925680	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=140,134;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:3,12,0,2
chr3	29977739	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr3	30686414	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=145.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,19:0,22:0,0,12,30
chr3	30691871	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.267:21:7,3:7,0:7,9,3,2
chr3	30713126	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,19,5
chr3	30732821	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	30769948	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	30842597	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr3	30903008	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	30903304	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	30936011	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:17,3:11,0:18,12,3,0
chr3	31621228	.	T	TAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr3	31642037	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	31663515	.	A	AGTGTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,5:0,1:0,0,7,0
chr3	31677395	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,11:0,0,24,2
chr3	31705675	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=149,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:6,14,0,2
chr3	31705783	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,309;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	31774704	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:10,2:7,3:15,2,5,0
chr3	32200972	.	AG	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=129,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,2:7,0,6,1
chr3	32490894	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.645:23:4,6:3,8:8,0,14,1
chr3	32491084	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:4,6:1,5:1,4,1,10
chr3	32571821	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.194:28:7,0:10,0:6,17,0,5
chr3	32571823	.	GA	G,AA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=10,16,29;MFRL=207,215,150;MMQ=60,60,60;MPOS=24,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.25,10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,6:0.392,0.243:15:0,2,0:1,0,5:0,4,2,9
chr3	32745475	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,4:8,3:3,14,3,4
chr3	32746288	.	GT	G,GTT	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=126,72,167;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.81,20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,6,13:0.156,0.331:39:8,5,5:12,1,8:14,6,15,4
chr3	32746522	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:2,6:6,9:0,8,0,15
chr3	32757897	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr3	32758763	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:2,3,0,6
chr3	32766860	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr3	32779059	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=174,184;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:5,1:0|1:32779059_C_G:32779059:0,11,0,2
chr3	32779067	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=184,184;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:6,1:0|1:32779059_C_G:32779059:0,14,0,2
chr3	32779069	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=184,184;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,1:0|1:32779059_C_G:32779059:0,14,0,2
chr3	32800976	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:6,2:3,1:6,3,1,3
chr3	32804185	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,2:2,3:6,1,4,1
chr3	32806307	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=190,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:4,2:2,1:2,4,0,3
chr3	32811269	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=214,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr3	32811523	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=151,166;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr3	32811530	.	CTG	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=33,36;MFRL=190,159;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.276:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	32811532	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=204,176;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.321:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr3	32811536	.	TG	CA,CT	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=31,35,34;MFRL=182,156,176;MMQ=60,60,40;MPOS=-2147483648,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:2,1,1:0,4,0,2
chr3	32811561	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=140,159;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32811561_C_A:32811561:0,1,0,1
chr3	32811566	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=140,159;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32811561_C_A:32811561:0,1,0,1
chr3	32915214	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	32933360	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.599:4:2,2:0,0:0|1:32933360_C_CTT:32933360:0,2,0,2
chr3	32933370	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.602:4:2,2:0,0:0|1:32933360_C_CTT:32933360:0,2,0,2
chr3	32996983	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:1,0:9,4:10,0,4,0
chr3	32997029	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=18,29,15;MFRL=139,146,118;MMQ=60,60,60;MPOS=17,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,20;RU=A;STR;TLOD=4.66,5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,11:0.163,0.562:22:0,2,1:1,2,0:0,5,3,14
chr3	32997096	.	G	GTTT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=100,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=23,26;RU=T;STR;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.747:16:2,8:1,2:3,1,10,2
chr3	33065801	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=133,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:6,8,0,2
chr3	33093190	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,10,1
chr3	33135592	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,24:0.676:35:5,12:6,12:8,3,12,12
chr3	33171659	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	33175793	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,2,13
chr3	33175854	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr3	33194138	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	33216357	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr3	33414468	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,0:3,5:4,0,5,0
chr3	33414923	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr3	33437600	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:8,3:4,0:12,1,2,1
chr3	33444286	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:7,8:5,7:9,3,11,5
chr3	33552004	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:4,1,3,0
chr3	33552351	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=193,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr3	33558407	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	33558606	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=117,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:11,0:8,2:10,9,0,2
chr3	33612222	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,93;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:13,0:23,2:22,15,2,0
chr3	33612364	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=208,207;MMQ=24,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr3	33612388	.	TT	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=18,35;MFRL=217,208;MMQ=60,24;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:33612388_TT_CC:33612388:0,4,0,1
chr3	33612395	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=207,208;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:33612388_TT_CC:33612388:0,3,0,1
chr3	33612396	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,29;MFRL=206,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr3	33653622	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr3	33668662	.	ATTAAGT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=162,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:1,5:0,5:0,1,0,10
chr3	33866868	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:0,8,0,3
chr3	33877626	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=186,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:2,2:6,2:5,4,3,1
chr3	33879602	.	CTA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,1:7,1:14,1,2,0
chr3	33887102	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,186;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,3:7,3:1,11,0,6
chr3	33893929	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=154,241;MMQ=58,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr3	33894073	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=171,196;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,2:14,0:0|1:33894073_G_A:33894073:7,17,0,2
chr3	33894093	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=170,196;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:12,2:15,0:0|1:33894073_G_A:33894073:14,13,0,2
chr3	33907835	.	T	TCTCC	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.169:45:20,6:18,1:21,17,6,1
chr3	35756952	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:8,0:9,6,0,3
chr3	35785296	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:11,1:7,4:17,2,4,1
chr3	35785534	.	G	GCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr3	36422064	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=223,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr3	36422126	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:0,4:3,3:0|1:36422126_C_T:36422126:3,0,5,3
chr3	36422135	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=157,174;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:0|1:36422126_C_T:36422126:2,0,7,3
chr3	36484823	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr3	36570259	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.297:22:7,3:8,3:3,13,0,6
chr3	36779475	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:11,0:11,12,2,0
chr3	36871101	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:6,2:3,8,0,2
chr3	36872913	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=145,168;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:12,5,2,0
chr3	36896653	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr3	37048633	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=158,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr3	37053468	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,2:12,0:9,9,0,3
chr3	37062040	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=262,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,2:2,2:0,4,1,3
chr3	37067050	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr3	37067075	.	CTATA	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=TA;STR;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.837:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	37067120	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=21,25;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.597:5:0,1:1,2:0,2,1,2
chr3	37070437	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:1,3,0,5
chr3	37096024	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,5:2,4:0,4,1,8
chr3	37116619	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,1:2,6:0,4,0,7
chr3	37133064	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=125,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:5,0:8,2:5,9,1,1
chr3	37144535	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:0,4:11,0:2,9,1,3
chr3	37150988	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=142.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,18:0,19:0,0,23,16
chr3	37162864	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,5:1,1:1,0,6,0
chr3	37163039	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.972:33:0,21:0,11:0|1:37163039_G_A:37163039:0,0,16,17
chr3	37163044	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=134,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:20,2:14,0:0|1:37163039_G_A:37163039:16,19,0,2
chr3	37163048	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=134,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:17,2:13,0:0|1:37163039_G_A:37163039:16,19,0,2
chr3	37163049	.	ACAGT	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=135,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:17,2:13,0:0|1:37163039_G_A:37163039:16,19,0,2
chr3	37170717	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=188,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	37285152	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.256:40:10,6:20,3:7,23,4,6
chr3	37292901	.	TCAACAC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=124,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,0:8,2:11,2,1,1
chr3	37360696	.	AT	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:10,2:10,2:3,22,0,4
chr3	37376500	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=76.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,12:0,15:0,0,27,0
chr3	37378670	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=169,75723053;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.435:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr3	37459334	.	T	TACACACACACAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=215,185;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,22;RU=AC;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	37459875	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=171,59;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:0|1:37459875_C_T:37459875:3,14,1,1
chr3	37459881	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=171,68;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,2:0.142:19:9,1:8,1:1|0:37459875_C_T:37459875:4,13,0,2
chr3	37459898	.	CT	GA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=169,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:5,2:3,17,1,1
chr3	37512646	.	TG	CC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,4,12
chr3	37514975	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,12;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:2,2,0,1
chr3	37514979	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=15,33;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.352:6:0,1:0,0:0|1:37514979_A_C:37514979:2,2,0,2
chr3	37514986	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=159,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.406:5:0,0:0,0:0|1:37514979_A_C:37514979:1,2,0,2
chr3	37560676	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr3	37670876	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=205,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr3	37774304	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:3,4:0,4:0,3,1,7
chr3	37774327	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.721:9:2,3:0,2:0,2,0,7
chr3	37845264	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	38061897	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=12948910,85;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38061897_C_T:38061897:1,1,0,1
chr3	38061906	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=12948910,85;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38061897_C_T:38061897:1,1,0,1
chr3	38061908	.	A	ACCCACCATGTCAGTCTCTTATGTGGCTCTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=12948910,85;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:38061897_C_T:38061897:1,1,0,1
chr3	38061940	.	C	CTGCCCTCCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=208,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	38087024	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr3	38104350	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=140,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	38129690	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	38134438	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr3	38136560	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,0:6,2:0|1:38136560_G_GA:38136560:6,8,0,2
chr3	38136563	.	G	GCCCCACACTCAGGACC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:0|1:38136560_G_GA:38136560:6,8,0,2
chr3	38137959	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	38139023	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:13,4:7,0:10,10,4,0
chr3	38159226	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:38159226_T_A:38159226:0,4,1,0
chr3	38159231	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=229,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:38159226_T_A:38159226:0,4,1,0
chr3	38159233	.	GA	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,13;MFRL=229,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:38159226_T_A:38159226:0,4,1,0
chr3	38159239	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,19;MFRL=229,160;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:38159226_T_A:38159226:0,4,1,0
chr3	38163485	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=210,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	38164081	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=238,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:38164081_CT_C:38164081:0,5,0,2
chr3	38164085	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=238,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:38164081_CT_C:38164081:0,5,0,2
chr3	38240147	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=159,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.702:8:2,6:0,0:0|1:38240147_T_C:38240147:2,0,6,0
chr3	38240151	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=159,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:2,6:0,0:0|1:38240147_T_C:38240147:2,0,6,0
chr3	38257567	.	CT	C,CTT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,32,30;MFRL=140,134,147;MMQ=60,60,60;MPOS=17,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=9.08,4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,7,4:0.207,0.142:32:12,4,1:8,3,2:19,2,9,2
chr3	38348949	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=194,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr3	38350630	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,1,15
chr3	38354839	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,6:0,0,7,1
chr3	38355184	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	38355509	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr3	38390020	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr3	38401918	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr3	38402007	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	38406648	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	38406773	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,4,10
chr3	38406793	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr3	38408248	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,9,6
chr3	38408459	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr3	38409600	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,10:0,6:0,0,15,2
chr3	38436974	.	AC	GT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:0|1:38436974_AC_GT:38436974:4,3,1,1
chr3	38436980	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=155,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:38436974_AC_GT:38436974:3,3,1,1
chr3	38442490	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=145,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:3,2:9,1:1,13,0,3
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chr3	38524742	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=170,195;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,2:6,5:3,7,2,5
chr3	38539095	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=87,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:0,2:1,1,1,1
chr3	38565946	.	AAAAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38565946_AAAAAG_A:38565946:0,1,0,1
chr3	38565954	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:38565946_AAAAAG_A:38565946:0,1,0,1
chr3	38592331	.	A	ATATAAGGCCTGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=179,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr3	38597893	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.553:7:2,0:0,1:0|1:38597893_A_C:38597893:0,3,4,0
chr3	38597897	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:1,0:0|1:38597893_A_C:38597893:1,3,3,0
chr3	38597902	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:1,1:0|1:38597893_A_C:38597893:1,3,3,0
chr3	38598606	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	38601556	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	38627153	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,17;RU=GT;STR;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,1:0,0,9,2
chr3	38627629	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	38646423	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,4:1,3:0,1,0,7
chr3	38763933	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38763933_A_C:38763933:0,1,0,1
chr3	38763936	.	GC	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38763933_A_C:38763933:0,1,0,1
chr3	38770059	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:11,8,2,0
chr3	38798178	.	CG	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=197,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,0:1,0,1,1
chr3	38812708	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=126,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:0,3:2,1:1,1,4,0
chr3	38812915	.	AAAAGGAG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=118,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:0|1:38812915_AAAAGGAG_A:38812915:0,1,0,1
chr3	38812924	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=118,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38812915_AAAAGGAG_A:38812915:0,1,0,1
chr3	38926912	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:0,4:1,4:0,1,1,8
chr3	38927700	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=159,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:38927700_C_T:38927700:7,10,1,1
chr3	38927711	.	CC	TG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:4,2:0|1:38927700_C_T:38927700:7,7,1,1
chr3	38927715	.	A	ATAGTGAG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:38927700_C_T:38927700:6,6,1,1
chr3	38938299	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.591:5:1,0:1,1:2,0,2,1
chr3	38938728	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=146,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:38938728_G_A:38938728:3,13,1,1
chr3	38938730	.	C	CTATAAAACTCTGATG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=146,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:38938728_G_A:38938728:3,13,1,1
chr3	38946872	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr3	38949363	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr3	38950592	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,0:5,2:2,5,2,0
chr3	38951746	.	A	ATCAATTTTAAACTTGAACGAAAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr3	38951753	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	38961537	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr3	38967042	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=54,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,2:2,6:1,1,3,5
chr3	39093638	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,14:0.282:51:13,6:24,7:0,37,0,14
chr3	39107993	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=116,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:3,1,5,0
chr3	39111140	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=117,182;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:1,9:2,5:1,3,11,3
chr3	39118745	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=195,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr3	39121119	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=200,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr3	39129742	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=76,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:1,10:0,0:1,0,3,7
chr3	39133085	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=115,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=82.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,28:0.726:38:4,12:6,15:9,1,23,5
chr3	39149489	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	39152248	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,4:1,0,6,0
chr3	39152572	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=201,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:39152572_T_G:39152572:0,2,0,1
chr3	39152575	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=201,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:39152572_T_G:39152572:0,2,0,2
chr3	39166743	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr3	39178899	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=227,271;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr3	39179902	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:4,1:6,1:3,8,0,2
chr3	39179909	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=188,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,0:4,2:3,7,0,2
chr3	39180162	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.176:30:14,2:11,2:12,13,2,3
chr3	39229858	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:7,2,0,2
chr3	39433147	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,8:0,17:0,0,6,19
chr3	39435865	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:12,5:4,4:13,3,7,2
chr3	39437800	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	39450065	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.273:30:9,5:13,2:15,7,5,3
chr3	39450276	.	C	CAT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:2,1:8,3:0,12,1,4
chr3	39453057	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr3	39453610	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=210,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:1,2,2,1
chr3	39554786	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	40192734	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40192734_G_T:40192734:0,3,0,1
chr3	40192742	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40192734_G_T:40192734:0,3,0,1
chr3	40192746	.	T	TGGCTCTGGCAAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=207,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:40192734_G_T:40192734:0,2,0,1
chr3	40204178	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=77,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:1,2:3,5:3,1,8,0
chr3	40251282	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr3	40251628	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	40352355	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.549:21:4,3:4,7:8,1,10,2
chr3	40352640	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=132.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.950:37:1,20:0,16:0,1,0,36
chr3	40457484	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:6,1:6,1:4,8,0,2
chr3	40464630	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:1,12,0,2
chr3	40503227	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:2,4,0,2
chr3	40503520	.	A	ACTGCTGCTG,ACTGCTGCTGCTGCTG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28,30;MFRL=0,144,155;MMQ=60,40,27;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,13,15;RU=CTG;STR;TLOD=11.40,11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.484,0.446:6:0,2,3:0,1,0:0,0,5,1
chr3	40503809	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr3	40557271	.	TTGTGTGTGTGTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,14;RU=TG;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:1,1:3,0,1,0
chr3	41274764	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr3	41291081	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.616:21:3,5:3,8:2,6,5,8
chr3	41291105	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=133,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:4,10,0,2
chr3	41607701	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	41705243	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=213,216;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,0:5,3:0,7,0,3
chr3	41723151	.	GAA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.107:25:8,0:11,2:15,8,0,2
chr3	41860998	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=15,32;MFRL=80,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:1,2:0|1:41860998_C_T:41860998:2,1,0,2
chr3	41860999	.	C	CTTTTTTAACTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=80,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:41860998_C_T:41860998:2,1,0,2
chr3	41877473	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.267:16:4,1:5,3:0,12,0,4
chr3	41925260	.	CAGAGAAAAAACAAGTGA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr3	41925301	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,19,1
chr3	41925503	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:11,0:14,2:4,23,0,2
chr3	41938500	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr3	41942199	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr3	41952781	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=82.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,18:0,7:0,0,14,11
chr3	41960100	.	T	TCTGGTATCAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,189;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	41977214	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	41977488	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	41996136	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,12,6
chr3	41996275	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr3	42133149	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	42202061	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,2:1,3:0,7,0,5
chr3	42226151	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.617:19:3,8:4,3:7,0,9,3
chr3	42230516	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,5:9,0:9,12,5,0
chr3	42234758	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=85,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	42251577	.	C	CGGAGGA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=GGA;STR;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.529:13:1,4:2,0:4,2,6,1
chr3	42265313	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=167,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr3	42305131	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=80.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,8,14
chr3	42448296	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=213,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr3	42560882	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:1,7:0,3:0,1,1,10
chr3	42598980	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=217,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	42599049	.	TA	T,TAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,26,27;MFRL=159,170,152;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=6.26,4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,4:0.212,0.260:16:5,1,2:4,2,2:9,0,7,0
chr3	42599091	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.669:35:3,13:5,10:8,4,18,5
chr3	42599234	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:2,7:6,3:0,8,1,10
chr3	42660489	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32,34;MFRL=210,183,166;MMQ=60,60,60;MPOS=25,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,19;RU=T;STR;TLOD=3.60,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.214,0.219:10:4,0,1:2,2,1:6,0,4,0
chr3	42660508	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=18,10;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.161:16:3,0:4,0:9,5,2,0
chr3	42684788	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:8,1,2,0
chr3	42732452	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=83,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,0,3
chr3	42738297	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr3	42738470	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=202,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:4,3:8,1,5,0
chr3	42739008	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,139;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,3:12,0:0|1:42739008_C_G:42739008:10,15,3,0
chr3	42739011	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=163,139;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,3:10,0:0|1:42739008_C_G:42739008:10,15,3,0
chr3	42799858	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,3,6
chr3	42827437	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,21,2
chr3	42907411	.	TCTCC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,37235180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CTCC;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr3	42907518	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,29;MFRL=111,207;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42907518_G_A:42907518:0,2,0,1
chr3	42907520	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=111,207;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42907518_G_A:42907518:0,2,0,1
chr3	42907529	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=0,207;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42907518_G_A:42907518:0,1,0,1
chr3	42907531	.	A	AACAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=0,207;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42907518_G_A:42907518:0,1,0,1
chr3	42907532	.	GATCTCC	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=0,207;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42907518_G_A:42907518:0,1,0,1
chr3	42907542	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:42907518_G_A:42907518:0,1,0,1
chr3	42908370	.	AT	A,ATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,28,22;MFRL=176,134,144;MMQ=60,60,50;MPOS=31,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.20,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,2:0.290,0.234:10:2,1,0:1,2,1:0,5,0,5
chr3	42947776	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	43345175	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,9:2,5:2,2,8,6
chr3	43385056	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	43591142	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr3	43607224	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.931:10:0,5:0,3:0,0,7,3
chr3	43642126	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr3	43756577	.	C	CTG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=260,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=TG;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.683:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr3	44332176	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr3	44345646	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=174,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,3:1,4:0,3,1,6
chr3	44364825	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=187,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,1:3,6:0,3,0,7
chr3	44434311	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.666:28:5,12:4,7:6,3,11,8
chr3	44437870	.	A	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=203.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,28:0,30:0,0,33,27
chr3	44489880	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=113,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.723:27:5,8:2,10:3,4,7,13
chr3	44612895	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=193,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr3	44684544	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,117;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.153:28:14,3:9,0:13,11,4,0
chr3	44763037	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.251:26:10,3:9,3:5,15,2,4
chr3	44778076	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:0|1:44778076_G_C:44778076:6,8,0,2
chr3	44778079	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=163,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:0|1:44778076_G_C:44778076:5,8,0,2
chr3	44778138	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=164,130;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:6,3,1,1
chr3	44778458	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,83;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:20,3:12,0:14,18,3,0
chr3	44795629	.	A	AACACACCACACATGAACAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:8,2:12,0,3,0
chr3	44803108	.	AAAGACAG	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGACAG;STR;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:4,2:9,3:3,12,1,4
chr3	44815871	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.241:22:8,4:9,1:15,2,4,1
chr3	44816725	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	44819736	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,2:9,1:2,20,1,2
chr3	44826315	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=203,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:6,1,4,1
chr3	44827793	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:3,2:6,0,3,0
chr3	44844444	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:14,0:7,2:7,15,0,2
chr3	44854563	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,1,2
chr3	44869815	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=178,1722;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:44869815_T_A:44869815:3,8,0,2
chr3	44869818	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=178,1722;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:7,0:0|1:44869815_T_A:44869815:3,8,0,2
chr3	44871505	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:7,8:4,9:6,5,5,13
chr3	44882578	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,1:5,1:0|1:44882578_C_CA:44882578:13,5,0,2
chr3	44882581	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,1:5,1:0|1:44882578_C_CA:44882578:13,5,0,2
chr3	44882583	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,1:5,1:0|1:44882578_C_CA:44882578:13,5,0,2
chr3	44882586	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,1:5,1:0|1:44882578_C_CA:44882578:14,9,0,2
chr3	44882589	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=28,24;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,1:7,1:0|1:44882578_C_CA:44882578:14,8,0,2
chr3	44882592	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,1:6,1:0|1:44882578_C_CA:44882578:14,7,0,2
chr3	44968394	.	G	GACTCTCTTACTGTCTCTGGAGATGGCTCACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,250;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr3	45000993	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:0,2,0,7
chr3	45132637	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr3	45187671	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,17,0
chr3	45267058	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr3	45461102	.	G	GT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=127.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,22:0,14:0,0,29,8
chr3	45500174	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	45515648	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr3	45527099	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	45527218	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,12:1,13:0,1,14,11
chr3	45530401	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	45559621	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=236,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr3	45583297	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,3:5,3:9,0,6,0
chr3	45637830	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=142,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,4:7,4:3,13,1,7
chr3	45677635	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=92.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,9:0,8:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,14,8
chr3	45677638	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=97.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,13:0,10:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,16,8
chr3	45677782	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=116,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.628:25:5,6:4,9:5,4,3,13
chr3	45677815	.	G	GAGA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=51.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,4:4,9:0,8,0,13
chr3	45715767	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:2,2:4,0:3,5,2,0
chr3	45748429	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.956:20:0,7:0,8:0|1:45748429_G_A:45748429:0,0,1,19
chr3	45748435	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0|1:45748429_G_A:45748429:0,0,0,19
chr3	45754749	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	45761115	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,9:0,16:0,0,6,20
chr3	45763635	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr3	45764544	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr3	45765132	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,3:2,6:0,7,0,9
chr3	45772742	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=94.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,23,2
chr3	45772772	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,13:0,0,20,5
chr3	45773732	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr3	45776875	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.335:13:4,3:3,1:0|1:45776875_CT_C:45776875:3,6,0,4
chr3	45776900	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,3:0|1:45776875_CT_C:45776875:0,0,1,11
chr3	45784963	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:45784963_T_C:45784963:0,0,9,0
chr3	45784972	.	GGT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0|1:45784963_T_C:45784963:0,0,9,0
chr3	45801487	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,1:9,1:4,9,0,2
chr3	45804391	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:5,3:7,2:10,3,5,0
chr3	45813025	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	45814094	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=254,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,2,3
chr3	45821624	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:1,3,0,5
chr3	45821687	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	45972492	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:5,3:7,2:12,0,6,0
chr3	45977866	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=143,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,2:3,6:3,0,8,0
chr3	45977899	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,7,4
chr3	45989044	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.663:25:5,7:3,8:4,4,10,7
chr3	46001063	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=203,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,1,1
chr3	46006677	.	C	CTTGCTGCCGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	46007702	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	46008893	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:7,3,2,0
chr3	46016851	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,4:4,6:0,6,2,8
chr3	46021218	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,7:0,0,14,5
chr3	46026259	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.652:18:2,5:4,7:5,1,11,1
chr3	46414943	.	TACAGTCAGTATCAATTCTGGAAGAATTTCCAG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.531:21:4,6:2,5:10,0,5,6
chr3	46449864	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:4,6:3,4:3,4,10,1
chr3	46477826	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=233,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:46477826_C_T:46477826:0,1,0,2
chr3	46477830	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=233,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:46477826_C_T:46477826:0,1,0,2
chr3	46479668	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr3	46480958	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=197,133;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.453:20:7,2:4,6:0,11,2,7
chr3	46480994	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=201,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	46484898	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,17,3
chr3	46495873	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,0:10,3:2,14,0,3
chr3	46501284	.	C	CCTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,8:0,0,5,14
chr3	46539523	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,22:0.791:27:3,9:2,10:4,1,16,6
chr3	46569158	.	A	AGGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=227,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46569158_A_AGGTG:46569158:0,1,0,1
chr3	46569160	.	G	GCAGTGGGAGAGCAAGAACAGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=227,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46569158_A_AGGTG:46569158:0,1,0,1
chr3	46574256	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:5,3:10,1:13,2,3,1
chr3	46574418	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=193,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:2,6,0,3
chr3	46593147	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr3	46717931	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr3	46717957	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr3	46718298	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=203,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,5:1,4:0,2,1,8
chr3	46722692	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr3	46723644	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,1:12,1:0|1:46723644_A_T:46723644:0,24,0,2
chr3	46723646	.	C	CCAAAG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:13,1:0|1:46723644_A_T:46723644:0,24,0,2
chr3	46723663	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:2,7:2,9:0,4,0,16
chr3	46750553	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=216,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:0,0:2,4:3,0,3,1
chr3	46751073	.	TAAGAAG	T,TAAG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,27,25;MFRL=74,0,126;MMQ=60,60,60;MPOS=3,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,8;RU=AAG;STR;TLOD=8.18,37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,11:0.189,0.575:18:2,3,5:2,0,5:3,1,13,1
chr3	46753976	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.623:25:4,6:5,7:4,5,3,13
chr3	46963502	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr3	46965197	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.703:21:3,7:2,7:3,3,2,13
chr3	46967011	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=176,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:7,2:11,0:5,14,2,0
chr3	46967040	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.752:17:3,7:0,6:0,4,3,10
chr3	47033937	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:6,0,7,1
chr3	47038135	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,11,7
chr3	47043386	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=141,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:1,4,1,2
chr3	47044122	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr3	47045739	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,5:6,6:5,5,4,7
chr3	47045768	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:6,2:8,0:2,12,3,1
chr3	47046896	.	CT	GG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr3	47047176	.	A	AG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=225,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=44.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.775:20:1,6:2,9:2,2,9,7
chr3	47047358	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:2,3:3,1:3,3,3,1
chr3	47050908	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	47059323	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr3	47079112	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=152,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,2:1,8:2,0,7,3
chr3	47103848	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:18,3:17,0:11,30,0,3
chr3	47103861	.	GTTT	G,GT,GTT,GTTTT	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,33,31,33,35;MFRL=138,140,127,74,158;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=15,21,26,22;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.49,21.94,5.92,4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:3,5,13,4,3:0.163,0.442,0.154,0.120:28:0,1,6,4,1:2,3,5,0,1:1,2,4,21
chr3	47125915	.	A	AACTCCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=155,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:2,1,0,1
chr3	47142907	.	TCC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=50.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:0,8:2,4:2,0,12,0
chr3	47143087	.	AGT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=GT;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.742:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	47144883	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=152,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.152:24:13,0:6,2:0|1:47144883_A_T:47144883:8,13,0,3
chr3	47144885	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=152,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:15,0:6,3:0|1:47144883_A_T:47144883:8,13,0,3
chr3	47205502	.	CGCGGCGGCG	C,CGCG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30,31;MFRL=0,215,194;MMQ=60,60,60;MPOS=26,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,7,8;RU=GCG;STR;TLOD=11.55,3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,1:0.603,0.278:4:0,1,0:0,2,1:0,0,0,4
chr3	47276968	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:0,7:3,3:3,0,8,2
chr3	47277458	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr3	47277885	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,4,1
chr3	47282190	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47282190_C_T:47282190:0,0,1,0
chr3	47282194	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47282190_C_T:47282190:0,0,1,0
chr3	47286227	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr3	47287603	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr3	47289691	.	T	TTATTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=199,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	47305928	.	TTTTTA	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=156,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.554:7:0,1:3,3:0|1:47305928_TTTTTA_T:47305928:0,3,0,4
chr3	47305945	.	GAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=224,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1|0:47305928_TTTTTA_T:47305928:0,3,0,1
chr3	47305949	.	CAGGGT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,34;MFRL=224,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1|0:47305928_TTTTTA_T:47305928:0,3,0,1
chr3	47305955	.	CTCACTA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=285,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:47305928_TTTTTA_T:47305928:0,2,0,1
chr3	47312635	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAAG;STR;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.868:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	47316725	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	47318747	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,5,4
chr3	47361082	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:2,1:6,1,2,0
chr3	47363956	.	AAGGGCCTGGGCTAAGTAATGTCAGTTCAGTT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.299:5:0,1:2,0:0|1:47363956_AAGGGCCTGGGCTAAGTAATGTCAGTTCAGTT_A:47363956:4,0,1,0
chr3	47363971	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.764:2:0,0:0,2:1|0:47363956_AAGGGCCTGGGCTAAGTAATGTCAGTTCAGTT_A:47363956:0,0,2,0
chr3	47376095	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr3	47385244	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:4,6,1,1
chr3	47451411	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:7,3,0,2
chr3	47451979	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,0:0|1:47451979_A_C:47451979:0,0,1,0
chr3	47451992	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47451979_A_C:47451979:0,0,1,0
chr3	47451996	.	C	CCGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47451979_A_C:47451979:0,0,1,0
chr3	47451997	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,0;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47451979_A_C:47451979:0,0,1,0
chr3	47452118	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:5,2:11,3:11,6,2,3
chr3	47452155	.	AG	CC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:4,0:6,1:0,10,2,0
chr3	47452362	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,12;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,0:2,1,2,0
chr3	47452372	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,34;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:3,1,1,0
chr3	47452401	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,12;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:47452401_G_C:47452401:1,0,1,0
chr3	47452405	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=19,13;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,0:0|1:47452405_T_A:47452405:1,0,1,0
chr3	47452408	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=36,32;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47452401_G_C:47452401:1,0,1,0
chr3	47452413	.	CTCAG	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,12;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:47452405_T_A:47452405:0,2,1,0
chr3	47452420	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,12;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:47452401_G_C:47452401:0,3,1,0
chr3	47452424	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=36,26;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:47452401_G_C:47452401:0,3,1,0
chr3	47453216	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,4:3,1:9,0,5,0
chr3	47454399	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr3	47456225	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,11,6
chr3	47462587	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=110.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,1,29
chr3	47464122	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr3	47539751	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr3	47539969	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=208,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,1,3
chr3	47543389	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	47555142	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=221,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:0,5,0,6
chr3	47614413	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr3	47676902	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	47677584	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:5,13,0,2
chr3	47680119	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,4:0,0,12,0
chr3	47704075	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:7,9,0,2
chr3	47734635	.	AC	GG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=126,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:4,0,1,0
chr3	47747803	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr3	47770642	.	ATTC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=117,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	47777712	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=166,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	47882720	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=211,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47882720_G_A:47882720:0,3,0,1
chr3	47882727	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=211,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:47882720_G_A:47882720:0,1,0,1
chr3	47888362	.	CCGA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47888362_CCGA_C:47888362:0,1,0,1
chr3	47888367	.	AC	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47888362_CCGA_C:47888362:0,1,0,1
chr3	47956390	.	G	GCCTC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:7,0:0|1:47956390_G_GCCTC:47956390:8,14,0,2
chr3	47956393	.	GGC	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,1:8,0:0|1:47956390_G_GCCTC:47956390:8,14,0,2
chr3	48019258	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr3	48209486	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr3	48215946	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:48215946_TC_T:48215946:3,18,0,2
chr3	48215951	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:0|1:48215946_TC_T:48215946:3,18,0,2
chr3	48219320	.	AAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr3	48266252	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr3	48414197	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr3	48415007	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr3	48416756	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	48423471	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=131,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:18,1:6,1:21,3,2,1
chr3	48453787	.	AG	CC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,0:7,1:4,8,2,0
chr3	48461323	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=149,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,0:5,3:6,2,2,1
chr3	48465462	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,0,2
chr3	48488192	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:2,1,4,2
chr3	48491350	.	GA	G,GAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,36,32;MFRL=164,190,184;MMQ=60,60,52;MPOS=26,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.22,4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.271,0.270:8:3,2,0:1,0,2:4,0,4,0
chr3	48491386	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=179,164;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:1,0:15,0,2,0
chr3	48501305	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,1:6,1:4,9,1,1
chr3	48505330	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,17;MFRL=215,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:3,0:0|1:48505330_A_C:48505330:3,4,0,2
chr3	48505335	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=221,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:1,1:3,1:0|1:48505330_A_C:48505330:4,3,0,2
chr3	48505340	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=221,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.438:9:1,0:3,0:0|1:48505330_A_C:48505330:4,1,0,4
chr3	48510522	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,0:4,5:3,7,2,3
chr3	48538623	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=153,130;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:16,2:17,1:19,14,3,0
chr3	48587408	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=182,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:0,6:2,4:1,1,4,6
chr3	48594042	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=11,13;MFRL=265,179;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:48594042_A_C:48594042:1,0,1,0
chr3	48594048	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=16,25;MFRL=219,179;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:48594042_A_C:48594042:2,0,1,0
chr3	48594053	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=25,13;MFRL=219,179;MMQ=60,56;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:48594042_A_C:48594042:2,0,1,0
chr3	48594057	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=18,13;MFRL=219,179;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:48594042_A_C:48594042:2,0,1,0
chr3	48594061	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=15,13;MFRL=219,179;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:0,0:1,0:0|1:48594061_T_C:48594061:2,0,1,0
chr3	48594066	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=14,36;MFRL=172,179;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:0,1:0,0:0|1:48594061_T_C:48594061:3,0,1,0
chr3	48594069	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=30,36;MFRL=167,179;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:48594042_A_C:48594042:2,1,1,0
chr3	48594074	.	C	CCCCCG	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=31,12;MFRL=167,179;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:48594042_A_C:48594042:2,1,1,0
chr3	48594077	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=25,11;MFRL=167,179;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:48594042_A_C:48594042:2,1,1,0
chr3	48594080	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=29,12;MFRL=167,179;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:48594042_A_C:48594042:2,1,1,0
chr3	48594083	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=26,34;MFRL=167,179;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:0|1:48594042_A_C:48594042:2,1,1,0
chr3	48602523	.	G	GGGC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,8:0,0,8,8
chr3	48605570	.	GG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=187,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:3,1:0,0:0|1:48605570_GG_CA:48605570:1,2,0,1
chr3	48605574	.	A	AGGCCCCAGTGTGTGTTGTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=187,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:48605570_GG_CA:48605570:1,2,0,1
chr3	48624611	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:6,9:5,9:3,8,12,6
chr3	48628014	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,10:4,4:2,5,6,8
chr3	48629320	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,156;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,0:8,4:16,1,0,4
chr3	48632657	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:48632657_C_T:48632657:0,3,0,1
chr3	48632681	.	AG	CT,ACAAGATCG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30,27;MFRL=0,126,105;MMQ=60,60,60;MPOS=6,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.97,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.457,0.333:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr3	48632685	.	CGAG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=105,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:48632657_C_T:48632657:0,1,0,1
chr3	48632686	.	GA	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:48632657_C_T:48632657:0,0,0,1
chr3	48638633	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=206,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,0:3,2:2,9,0,2
chr3	48641779	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,0:8,3:9,7,1,2
chr3	48658467	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:2,5:1,4,0,7
chr3	48668170	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:1,12,0,2
chr3	48678004	.	A	ATCTTAGGTTGGCCACTTTCTAGTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr3	48689571	.	T	TCAAACAACAAAACAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=465,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr3	48692885	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=180,84440;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr3	48719638	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	48726085	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:6,8,1,1
chr3	48728997	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=206,143;MMQ=57,24;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:48728997_C_T:48728997:0,2,0,1
chr3	48729006	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=206,143;MMQ=57,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48728997_C_T:48728997:0,2,0,1
chr3	48729015	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=201,143;MMQ=53,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48728997_C_T:48728997:0,1,0,1
chr3	48897078	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr3	48956862	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	49004723	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:3,6:2,12:0,5,1,17
chr3	49044767	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,5:4,6:7,0,11,0
chr3	49050939	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,1:7,1:2,8,1,1
chr3	49053219	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:4,9:0,5:3,1,3,11
chr3	49070499	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:7,1,5,1
chr3	49114544	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	49135961	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,2,3
chr3	49137904	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,3,2
chr3	49138810	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,2:2,7:3,1,4,5
chr3	49148890	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=201,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr3	49161973	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=171,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.234:19:7,0:8,4:0|1:49161973_C_T:49161973:4,11,2,2
chr3	49161979	.	T	TCCCTGG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=172,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:5,0:6,4:0|1:49161973_C_T:49161973:3,9,2,2
chr3	49161981	.	A	ACCTC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=172,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:5,0:7,1:0|1:49161973_C_T:49161973:3,9,2,2
chr3	49163458	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,1:13,1:10,7,0,2
chr3	49166069	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:4,2:3,2:5,3,2,2
chr3	49168726	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=190,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:5,2:3,3:8,0,6,0
chr3	49249359	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=163,210;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,1:0|1:49249359_G_A:49249359:0,8,0,2
chr3	49249377	.	C	CCTGAGGTCG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=200,174;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr3	49249381	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=178,223;MMQ=50,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:49249359_G_A:49249359:0,2,0,3
chr3	49365269	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr3	49395673	.	GGCCGCC	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,180;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=GCC;STR;TLOD=50.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:4,10:8,3:2,10,3,10
chr3	49406080	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	49459114	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=144,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr3	49459732	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.230:14:4,0:5,0:0|1:49459732_A_C:49459732:2,9,3,0
chr3	49459740	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,14;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.266:12:4,0:4,0:0|1:49459732_A_C:49459732:1,8,3,0
chr3	49459747	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=176,161;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:3,0:0|1:49459732_A_C:49459732:1,8,2,0
chr3	49459749	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=193,161;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,0:0|1:49459732_A_C:49459732:1,6,2,0
chr3	49463926	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	49548294	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	49691255	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:11,5,2,0
chr3	49691598	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:8,3,2,0
chr3	49692814	.	A	AACACCTGCTTCCCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=113,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr3	49698506	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:49698506_AG_CC:49698506:0,0,2,0
chr3	49698511	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:49698506_AG_CC:49698506:0,0,2,0
chr3	49698514	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=167,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,0:0|1:49698506_AG_CC:49698506:1,0,2,0
chr3	49701414	.	T	TTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=235,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49701414_T_TTTC:49701414:0,1,0,1
chr3	49701415	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=235,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49701414_T_TTTC:49701414:0,1,0,1
chr3	49701419	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=235,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49701414_T_TTTC:49701414:0,1,0,1
chr3	49713753	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr3	49720393	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chr3	49722761	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,164;MMQ=60,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,23:0.665:34:8,9:3,13:8,3,15,8
chr3	49723147	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.647:23:3,9:4,6:1,7,4,11
chr3	49723399	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=182,173;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:4,2:5,1:5,5,0,3
chr3	49723720	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=216,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:1,1:0,0:0|1:49723720_A_C:49723720:1,0,2,0
chr3	49723721	.	C	CGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=216,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,14;RU=G;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:0,0:0,0:0|1:49723720_A_C:49723720:1,0,2,0
chr3	49723916	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,192;MMQ=50,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,1:11,2:0,19,0,3
chr3	49724048	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=202,169;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,6:1,3:6,0,8,1
chr3	49725948	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,204;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.350:41:11,12:15,2:25,2,14,0
chr3	49739086	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:4,3:7,2:4,7,2,4
chr3	49739362	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:4,2:11,0:1,15,0,2
chr3	49744392	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,1:2,2:0,6,0,3
chr3	49750188	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=192,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr3	49753003	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=172,102;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,1:7,4:8,3,4,1
chr3	49753788	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,14:0,0,16,7
chr3	49758181	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=153,82;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:15,0,3,0
chr3	49758764	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:6,7:2,11:3,5,4,14
chr3	49759361	.	C	CCCCCCCCGG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.241:17:8,2:4,1:0|1:49759361_C_CCCCCCCCGG:49759361:3,10,4,0
chr3	49759367	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,1:4,1:0|1:49759361_C_CCCCCCCCGG:49759361:2,11,3,0
chr3	49759369	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,1:4,0:0|1:49759361_C_CCCCCCCCGG:49759361:0,11,2,0
chr3	49759842	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:1,1:4,1:4,4,2,0
chr3	49765483	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr3	49828911	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=98,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.408:12:3,1:3,4:0,7,0,5
chr3	49833029	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:1,5:1,0:3,0,5,0
chr3	49842881	.	T	TG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=117,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=47.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.687:23:1,7:5,9:3,4,7,9
chr3	49847623	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=227,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr3	49848470	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.318:25:5,4:12,2:10,7,5,3
chr3	49849723	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=223,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.722:9:1,3:1,2:0,2,3,4
chr3	49881134	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=197,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	49884913	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.719:15:3,7:0,3:4,0,11,0
chr3	49897830	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=133,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,8:1,0:3,0,7,1
chr3	49898000	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,7:3,6:2,6,3,10
chr3	49898392	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=115,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:13,0:3,3:10,7,0,3
chr3	49899444	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=181,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:3,1,2,0
chr3	49899447	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=14,21;MFRL=197,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,0:0,1:2,1,3,0
chr3	49927503	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=70,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:2,8:0,8:0,2,1,16
chr3	49928018	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,1,0
chr3	49929025	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=94,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,6:1,5:0,2,1,10
chr3	49936715	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.782:21:1,4:3,12:0,4,3,14
chr3	49946812	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.759:23:3,9:2,8:1,4,4,14
chr3	50099449	.	G	GA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=96,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:8,1:15,1:13,11,1,1
chr3	50103987	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=191,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:50103987_T_G:50103987:0,2,0,1
chr3	50103989	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=191,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:50103987_T_G:50103987:0,2,0,1
chr3	50103995	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=191,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:50103987_T_G:50103987:0,2,0,1
chr3	50103997	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:50103987_T_G:50103987:0,2,0,1
chr3	50103998	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=191,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:50103987_T_G:50103987:0,2,0,1
chr3	50104000	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:50103987_T_G:50103987:0,2,0,1
chr3	50107895	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=148,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:15,3:24,0:16,23,3,0
chr3	50112585	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=171,160;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,6:3,8:8,0,13,1
chr3	50112589	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,34,32;MFRL=148,150,148;MMQ=51,60,40;MPOS=16,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=A;STR;TLOD=7.36,3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,3:0.287,0.172:18:5,3,1:4,2,2:9,1,8,0
chr3	50112619	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=137,148;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.134:35:11,0:10,0:0|1:50112619_C_G:50112619:19,12,4,0
chr3	50112625	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,9;MFRL=137,148;MMQ=60,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.138:34:9,0:12,0:0|1:50112619_C_G:50112619:18,12,4,0
chr3	50128005	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,5:3,8:0,9,0,13
chr3	50155887	.	TGAGA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=GA;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,2:2,0:0,8,0,2
chr3	50212475	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.312:17:3,0:6,0:0|1:50212475_G_C:50212475:3,9,5,0
chr3	50212477	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,11;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.312:17:3,0:6,0:0|1:50212475_G_C:50212475:3,9,5,0
chr3	50212483	.	AG	CC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.264:17:5,0:7,3:0|1:50212475_G_C:50212475:2,11,4,0
chr3	50223977	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,20,3
chr3	50224225	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr3	50225324	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=210,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:1,3,1,0
chr3	50251833	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=43.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,6:0,6:0,0,6,7
chr3	50293597	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0|1:50293597_A_C:50293597:0,0,2,0
chr3	50293601	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50293597_A_C:50293597:0,0,1,0
chr3	50306752	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr3	50308718	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr3	50313337	.	CCCG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50313337_CCCG_C:50313337:0,0,0,1
chr3	50313342	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50313337_CCCG_C:50313337:0,0,0,1
chr3	50334142	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=177,153;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:10,5,0,2
chr3	50368092	.	GCTC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CTC;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:11,2:4,0:5,10,0,2
chr3	50403902	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,228;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:4,0:6,2:9,2,0,2
chr3	50413534	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,1:11,1:15,8,2,0
chr3	50602799	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	50609123	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=77.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,13:0,0,16,5
chr3	50645635	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr3	50645640	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=162,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	50645793	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,6:0,0,13,1
chr3	50645827	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:8,0:14,4,1,1
chr3	50678001	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr3	50682056	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	50684489	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr3	50685574	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=162,237;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:0,7,0,3
chr3	51246360	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	51273711	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr3	51393706	.	C	CAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=59.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,3:0,12:0,0,1,14
chr3	51395571	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:51395571_C_T:51395571:0,0,0,6
chr3	51395589	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:51395571_C_T:51395571:0,2,0,1
chr3	51433402	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.200:16:5,2:8,0:7,6,1,2
chr3	51450604	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,139;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,6:6,0:2,11,0,6
chr3	51457752	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,176;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:13,4:21,0:20,15,3,1
chr3	51474901	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=134,158;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:7,1:11,1:19,0,2,0
chr3	51474927	.	T	TA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=125,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=53.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,26:0.843:31:3,8:1,13:4,1,18,8
chr3	51694084	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:9,2:9,8,1,1
chr3	51697493	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,8:0,0,0,12
chr3	51697530	.	TG	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=169,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr3	51718685	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,74;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,0:5,3:1,12,1,2
chr3	51733333	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	51863855	.	G	GTTTTGAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=73861470,282;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr3	51895850	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr3	51907736	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	51908226	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	51929360	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,8:0,0,4,14
chr3	51930729	.	GCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CA;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:0,2:1,0:2,0,2,0
chr3	51936949	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr3	51975569	.	GC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:2,3:1,3:1,3,0,6
chr3	51991529	.	C	CAGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51991529_C_CAGCA:51991529:0,1,0,1
chr3	51991531	.	G	GTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51991529_C_CAGCA:51991529:0,1,0,1
chr3	52019951	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.158:27:8,3:15,0:7,16,0,4
chr3	52020436	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:3,1,0,1
chr3	52029541	.	GC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,3:7,0:0,20,0,3
chr3	52109818	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr3	52236762	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.547:49:12,10:10,16:6,16,8,19
chr3	52238656	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	52238677	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr3	52240856	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=163,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr3	52258111	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=179,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:4,5:13,0:13,4,4,1
chr3	52258115	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=180,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:4,4:14,0:0|1:52258115_T_G:52258115:13,5,4,0
chr3	52258120	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=180,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:4,4:14,0:0|1:52258115_T_G:52258115:13,5,4,0
chr3	52258372	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr3	52269080	.	CCAGCCCGTGCCTTGGCAAAGAATTCCTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=150,44;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:4,2:3,0:6,3,1,1
chr3	52325759	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:6,5:1,6:6,1,5,6
chr3	52380753	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=161,74;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:4,3:4,9,1,2
chr3	52386808	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	52394393	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=164,242;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr3	52415865	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	52430698	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr3	52432213	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:52432213_C_G:52432213:0,2,0,1
chr3	52432217	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:52432213_C_G:52432213:0,2,0,1
chr3	52432219	.	CT	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:52432213_C_G:52432213:0,2,0,1
chr3	52432222	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:52432213_C_G:52432213:0,2,0,1
chr3	52437572	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=172,33;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:4,0:11,2:0|1:52437572_A_C:52437572:16,4,1,1
chr3	52437580	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=167,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,0:14,1:0|1:52437572_A_C:52437572:18,4,1,1
chr3	52456973	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:2,4,2,4
chr3	52476361	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52476361_G_C:52476361:0,0,0,1
chr3	52476371	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52476361_G_C:52476361:0,0,0,1
chr3	52478914	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.482:16:5,1:3,4:3,5,4,4
chr3	52489564	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52489564_A_T:52489564:0,0,1,0
chr3	52489577	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52489564_A_T:52489564:0,0,1,0
chr3	52504808	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=170,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,2:10,1:17,1,2,1
chr3	52505758	.	G	GAT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=94.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,10:0,0,20,2
chr3	52506282	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr3	52506393	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=181,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:1,6,0,3
chr3	52506426	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	52506491	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52507719	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:3,0,7,0
chr3	52510592	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,7:0,0,8,9
chr3	52510697	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	52510705	.	AC	CG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,10;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:52510705_AC_CG:52510705:0,4,0,1
chr3	52510710	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,10;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:52510705_AC_CG:52510705:0,3,0,1
chr3	52510716	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,14;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:52510705_AC_CG:52510705:0,3,0,1
chr3	52512264	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,1:9,1:7,9,0,2
chr3	52512318	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr3	52513940	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr3	52521522	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,1:3,2:3,2,0,4
chr3	52522659	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	52523405	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,4,11
chr3	52536308	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	52537191	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	52537969	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr3	52540773	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:3,3:4,0:3,5,1,2
chr3	52543317	.	A	ACCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:52543317_A_ACCT:52543317:1,3,0,1
chr3	52543318	.	TGGAG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:52543317_A_ACCT:52543317:1,3,0,1
chr3	52543325	.	CAATGCCAGGAAGG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,1:0|1:52543317_A_ACCT:52543317:0,4,0,1
chr3	52546487	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr3	52549979	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52549979_C_G:52549979:0,0,1,0
chr3	52549983	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52549979_C_G:52549979:0,0,1,0
chr3	52549985	.	GAT	CCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52549979_C_G:52549979:0,0,1,0
chr3	52551265	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=218,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr3	52553625	.	TGTAA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:0,2,1,6
chr3	52556890	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:4,6:2,6:4,2,5,7
chr3	52557038	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=223,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,4:3,2:0,6,4,3
chr3	52559167	.	CGGGG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=G;STR;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	52561779	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,3:1,2:0,1,2,4
chr3	52584431	.	T	TCTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=135,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,2:3,1,5,0
chr3	52584715	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=198,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,7:1,5:2,0,5,7
chr3	52620723	.	AT	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=62765509,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52620723_AT_TG:52620723:1,1,0,1
chr3	52620727	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=62765509,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:52620723_AT_TG:52620723:1,1,0,1
chr3	52620733	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52620723_AT_TG:52620723:0,0,0,1
chr3	52620734	.	A	AACTGCAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52620723_AT_TG:52620723:0,0,0,1
chr3	52621627	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52637486	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=299,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,1:1,7:2,0,6,2
chr3	52637631	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,1:8,3:0,13,2,2
chr3	52643307	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,4:6,1,6,1
chr3	52659027	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=179,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:4,2:0,10,0,2
chr3	52678911	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52692124	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr3	52692359	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr3	52722266	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=196,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	52725717	.	GA	TT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:2,1:0,0:0,3,0,2
chr3	52728312	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=157,179;MMQ=45,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.402:20:9,4:3,3:1,11,0,8
chr3	52728323	.	A	ATTGAG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=169,153;MMQ=43,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:13,0:5,2:1,17,0,2
chr3	52728804	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr3	52728944	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=161,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:11,0:9,2:11,9,0,2
chr3	52778347	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=224,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr3	52814255	.	TT	AA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:2,9:7,4:6,5,10,3
chr3	52815905	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr3	52818579	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	52819327	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr3	52821992	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.502:22:9,6:2,5:8,3,9,2
chr3	52825462	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	52825528	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:1,1,4,2
chr3	52825912	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=195,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:2,6:3,4:2,3,6,5
chr3	52837855	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:4,2,3,0
chr3	52847601	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=86,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0|1:52847601_C_T:52847601:0,1,0,4
chr3	52847604	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=147,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:52847601_C_T:52847601:0,3,0,1
chr3	52847607	.	G	GAAAAAACAAAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=147,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:52847601_C_T:52847601:0,3,0,1
chr3	52847610	.	CT	TA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52847601_C_T:52847601:0,1,0,1
chr3	52847613	.	GC	AT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52847601_C_T:52847601:0,1,0,1
chr3	52847617	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52847601_C_T:52847601:0,1,0,1
chr3	52848207	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:4,2:7,3:8,4,5,0
chr3	52853340	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr3	52853401	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=98.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,14:0,0,27,6
chr3	52867288	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,13,3
chr3	52867595	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.932:13:0,4:0,5:0,0,12,1
chr3	52867811	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr3	52874446	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr3	52877647	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,3,0
chr3	52877649	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,3,0
chr3	52877720	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr3	52878746	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	52878825	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	52950332	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52950332_G_C:52950332:0,1,0,1
chr3	52950335	.	C	CCAAGAGTGGCTAATGAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52950332_G_C:52950332:0,1,0,1
chr3	52960013	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,14,0
chr3	52968726	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	52968801	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	53003021	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	53126672	.	TTGCCCTGGACAAGGC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr3	53140884	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=132,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:35,0:26,3:31,30,1,2
chr3	53154132	.	ATTAACT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.865:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	53164412	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,15:0.272:56:14,8:25,6:4,37,0,15
chr3	53212574	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	53213538	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	53213815	.	C	CGT,CGTGT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29,29;MFRL=228,179,150;MMQ=60,60,60;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=GT;STR;TLOD=4.60,17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,6:0.249,0.604:9:0,1,2:1,1,3:0,1,0,8
chr3	53215875	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	53217413	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,2:1,6:2,0,7,1
chr3	53220444	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	53220569	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:0,6:3,6:2,1,8,4
chr3	53220763	.	GCTCAGAGC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	53260738	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,8:1,1:2,1,8,1
chr3	53260903	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.764:18:1,7:2,5:0,4,2,12
chr3	53262000	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,2:1,7:3,1,8,1
chr3	53262400	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=215,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr3	53263279	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.528:17:6,5:1,3:6,2,8,1
chr3	53267100	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr3	53267133	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr3	53267296	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=124,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,7:0,4:1,0,3,8
chr3	53267342	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	53269242	.	C	CGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=210,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.307:14:7,0:3,2:0|1:53269242_C_CGGGGGGGGGGGG:53269242:0,10,4,0
chr3	53269243	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=210,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.309:14:7,0:2,0:0|1:53269242_C_CGGGGGGGGGGGG:53269242:0,10,4,0
chr3	53269275	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=144,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,8:1,3:0,1,0,11
chr3	53276052	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=219,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,5:1,2:1,0,8,0
chr3	53324819	.	ATGGCAC	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=0,137;MMQ=56,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGCAC;STR;TLOD=134.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,38:0.930:40:2,18:0,20:0,2,9,29
chr3	53324915	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,22:0.717:30:2,9:6,11:0,8,1,21
chr3	53685003	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr3	53685039	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=214,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	53694272	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:7,8,1,1
chr3	53707768	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=114,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.136:39:20,4:13,0:22,12,5,0
chr3	53752484	.	C	CAACACCAGAATCCCATAAGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=243,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	53753728	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=150,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:8,1,2,0
chr3	53758049	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=203,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr3	53766212	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,1,11
chr3	53774485	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=224,194;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,4:1,2,0,4
chr3	53776995	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr3	53779580	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr3	53783335	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,0:10,2:9,14,1,1
chr3	53783590	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=207,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53783590_C_CA:53783590:1,0,0,1
chr3	53783592	.	C	CAGTAAGCTGGGGATTTATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=207,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53783590_C_CA:53783590:1,0,0,1
chr3	53806803	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,0:10,2:12,2,2,0
chr3	53845161	.	G	GACTGCCAGCCA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=148,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:5,9,1,1
chr3	53845490	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:53845490_GA_G:53845490:0,3,0,1
chr3	53845495	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:53845490_GA_G:53845490:0,3,0,1
chr3	53845500	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:53845490_GA_G:53845490:0,2,0,1
chr3	53853104	.	A	AGAATTGTGAGAACATAAGTATCTTTTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.668:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	53880789	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	53882663	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:0,13:1,7:0,1,12,9
chr3	53882673	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=53.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,10:0,9:0,0,8,11
chr3	53883910	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	53904239	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=163,166;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	53905576	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:1,9,0,2
chr3	53910118	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=198,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:1,1:5,0:0|1:53910118_A_G:53910118:1,6,0,2
chr3	53910121	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.358:9:1,3:5,0:0|1:53910118_A_G:53910118:1,5,0,3
chr3	53912341	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr3	53915930	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=212,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:2,2:0|1:53915930_C_T:53915930:4,0,4,0
chr3	53915937	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=156,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,0:4,2:0|1:53915930_C_T:53915930:5,0,4,0
chr3	53916130	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.351:41:9,8:16,6:8,19,4,10
chr3	53921022	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=127,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:2,5,0,2
chr3	53925942	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=217,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:2,0:3,1:0,5,0,1
chr3	54420834	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,3:3,0:3,4,0,3
chr3	54913354	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:1,1:3,1,2,0
chr3	54919272	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:9,5:4,0:11,2,6,0
chr3	54962013	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=107,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:1,4,0,2
chr3	55003733	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	55018520	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	55018619	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr3	55041722	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=225,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	55108055	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	55514766	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,1:6,3:9,5,2,2
chr3	55733390	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,23,4
chr3	56041192	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,2:0,6:0,1,7,1
chr3	56330063	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,0:4,2:6,2,2,0
chr3	56591178	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	56591278	.	T	TGGGGTAAGCA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGTAAGCA;STR;TLOD=65.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.908:19:1,6:0,8:1,0,13,5
chr3	56593543	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=120.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,19:0,17:0,0,28,8
chr3	56593680	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=106.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,13:0,0,10,22
chr3	56597688	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr3	56600531	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	56601175	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,44;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	56601182	.	AG	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=89,156;MMQ=43,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	56605404	.	TA	T,TAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,28,28;MFRL=208,176,176;MMQ=45,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=28.41,6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,12,4:0.592,0.252:18:0,10,3:1,2,1:0,2,0,16
chr3	56647845	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=166,188;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:6,2:0|1:56647845_T_G:56647845:0,15,0,2
chr3	56647855	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=162,188;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:6,2:0|1:56647845_T_G:56647845:0,15,0,2
chr3	56650051	.	A	ACTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.330:31:10,3:9,6:8,13,7,3
chr3	56650178	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=170,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:0,7,0,7
chr3	56651644	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:56651644_T_C:56651644:0,17,0,2
chr3	56651650	.	T	TGCTTCAGTTCTATCGTCGTATCTA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:56651644_T_C:56651644:0,18,0,2
chr3	56651667	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,1:6,1:0,11,0,2
chr3	56654002	.	GTTTGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=226,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	56658515	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:13,2,2,0
chr3	56674190	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr3	56681302	.	A	AACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=379,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=AC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56681302_A_AACAC:56681302:1,0,0,1
chr3	56681305	.	T	TCCAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=379,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56681302_A_AACAC:56681302:1,0,0,1
chr3	56694664	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	56695060	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=144,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:7,5:3,2:0,10,1,6
chr3	56787451	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,10,1
chr3	56787692	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	56808957	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	56835920	.	GGGC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGC;STR;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,1:4,2:0,10,0,3
chr3	57131529	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr3	57137090	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr3	57138491	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:57138491_G_T:57138491:0,3,0,1
chr3	57138492	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:57138491_G_T:57138491:0,3,0,1
chr3	57138495	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:57138491_G_T:57138491:0,3,0,1
chr3	57139833	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr3	57140108	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,12,11
chr3	57264872	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.694:24:5,8:2,9:0,7,0,17
chr3	57283652	.	T	TTTTAACAGGGGTCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=189,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	57287672	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.863:20:0,9:1,9:0,2,15,3
chr3	57293219	.	T	TGTTAGAAAATAGTAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57293219_T_TGTTAGAAAATAGTAGC:57293219:0,1,0,1
chr3	57293221	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57293219_T_TGTTAGAAAATAGTAGC:57293219:0,1,0,1
chr3	57303684	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:6,3:10,3:4,12,1,5
chr3	57327763	.	GTTTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=193,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr3	57335747	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.518:15:2,2:4,4:6,1,5,3
chr3	57336026	.	CAGA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=133,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGA;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,0,2
chr3	57343922	.	G	GTCTTTCTTCAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:57343922_G_GTCTTTCTTCAA:57343922:0,2,0,1
chr3	57343924	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:57343922_G_GTCTTTCTTCAA:57343922:0,2,0,1
chr3	57343926	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	57348685	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=56.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,10:0,9:0,0,0,19
chr3	57356328	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,6,0
chr3	57388255	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=246,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr3	57391278	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:3,2:0,4:3,0,7,0
chr3	57394309	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr3	57399653	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr3	57399719	.	CA	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=184,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:57399719_CA_AT:57399719:0,4,0,1
chr3	57399732	.	C	CACTGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=201,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:57399719_CA_AT:57399719:0,4,0,1
chr3	57404995	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	57414200	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,5,15
chr3	57414585	.	T	TGTATTTCTTAA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.245:6:2,0:3,1:0|1:57414585_T_TGTATTTCTTAA:57414585:0,5,0,1
chr3	57414586	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr3	57414588	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0|1:57414585_T_TGTATTTCTTAA:57414585:0,5,0,1
chr3	57430607	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,13:0.823:15:1,8:1,5:0|1:57430607_T_TC:57430607:0,2,0,13
chr3	57430611	.	C	CACACTGTTGTTCAAACAGGA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=155,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.176:15:8,1:5,1:1|0:57430607_T_TC:57430607:0,13,0,2
chr3	57431721	.	AAAATAAAT	A,AAAAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31,25;MFRL=152,151,149;MMQ=60,60,60;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,5,6;RU=AAAT;STR;TLOD=3.13,11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,3:0.247,0.514:5:1,1,1:0,0,2:1,0,3,1
chr3	57432036	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=225,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:57432036_G_T:57432036:0,3,0,1
chr3	57432042	.	AT	CA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=237,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:57432036_G_T:57432036:0,2,0,1
chr3	57432048	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,24;MFRL=237,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:57432036_G_T:57432036:0,2,0,1
chr3	57432050	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,23;MFRL=237,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:57432036_G_T:57432036:0,2,0,1
chr3	57432054	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=248,161;MMQ=60,60;MPOS=-17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57432036_G_T:57432036:0,1,0,1
chr3	57432073	.	T	TAACTTTCAATTC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	57432330	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,128;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,22:0.719:30:1,14:7,8:4,4,11,11
chr3	57443817	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=190,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.688:30:3,9:6,12:8,1,18,3
chr3	57456371	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=154,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,3:6,3:2,6,2,4
chr3	57457123	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr3	57469053	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	57469097	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr3	57469272	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	57493643	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=188,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57493643_CG_C:57493643:0,1,0,1
chr3	57493645	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=188,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57493643_CG_C:57493643:0,1,0,1
chr3	57493647	.	GGTTCACA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=188,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57493643_CG_C:57493643:0,1,0,1
chr3	57493664	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57493643_CG_C:57493643:0,0,0,1
chr3	57545169	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr3	57557834	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=228,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:1,0,6,0
chr3	57570285	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	57618926	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:5,0:8,2:11,2,1,1
chr3	57627500	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=68,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,0,6
chr3	57632004	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=191,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,4:1,7:3,0,11,1
chr3	57643362	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=115.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,43:0.656:65:9,25:13,17:13,9,30,13
chr3	57647122	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,5:1,4:1,0,9,0
chr3	57657853	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	57658196	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:21,0:22,3:14,29,0,3
chr3	57658222	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=189,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=60.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.742:25:3,10:3,9:0,6,4,15
chr3	57678429	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:57678429_C_A:57678429:3,0,1,0
chr3	57678433	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:57678429_C_A:57678429:3,0,1,0
chr3	57678460	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr3	57846577	.	CA	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:10,2:18,1:5,26,0,3
chr3	57850505	.	CT	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,10:0.198:51:15,8:20,2:29,12,8,2
chr3	58080505	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:5,1,6,0
chr3	58089594	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:2,12:0,1:2,0,13,0
chr3	58089851	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,7:2,4:1,2,0,11
chr3	58089877	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr3	58092346	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=88,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,4:0,6:0,1,9,1
chr3	58094157	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,3:4,1:8,2,4,0
chr3	58094852	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:5,1,4,2
chr3	58109430	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.804:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr3	58111285	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:9,3:1,1:6,5,2,2
chr3	58112251	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr3	58116369	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,0:3,3:7,0,3,0
chr3	58118700	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,5:6,1:2,11,2,4
chr3	58121626	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,5:0,0,12,0
chr3	58132808	.	GC	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=184,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,4:0,4:0,2,0,8
chr3	58133988	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:7,11,0,2
chr3	58145263	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,5,3
chr3	58155230	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr3	58155555	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=191,52786204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,1,0
chr3	58179028	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=112,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:0,0:4,3:2,2,3,0
chr3	58186911	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr3	58194051	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.828:25:2,14:1,7:1,3,6,15
chr3	58196639	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=204,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,3:0,1,1,5
chr3	58270963	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,6,9
chr3	58351660	.	C	CT,CTT,CTTT	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=20,20,26,26;MFRL=138,155,140,158;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,22,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,16,17,18;RU=T;STR;TLOD=10.24,21.69,4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,7,12,5:0.248,0.439,0.188:27:2,2,5,1:0,4,1,3:0,3,10,14
chr3	58351686	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,2:11,0:8,17,0,2
chr3	58355310	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=205,221;MMQ=50,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:58355310_G_T:58355310:0,2,0,1
chr3	58355317	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=214,221;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58355310_G_T:58355310:0,3,0,1
chr3	58355319	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=232,205;MMQ=50,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:58355319_A_G:58355319:0,2,0,2
chr3	58355321	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=242,214;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr3	58355324	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,26;MFRL=228,221;MMQ=50,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58355310_G_T:58355310:0,2,0,1
chr3	58355325	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,26;MFRL=232,214;MMQ=50,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:58355319_A_G:58355319:0,2,0,1
chr3	58355327	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,23;MFRL=228,221;MMQ=50,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58355310_G_T:58355310:0,2,0,1
chr3	58395962	.	T	TAGCATTTTACTCCAATATTTTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	58487415	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:14,2:12,0:0,26,0,3
chr3	58512285	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:9,3:7,4:8,8,3,4
chr3	58516383	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.751:16:1,6:1,5:1,3,3,9
chr3	58520194	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=120,47227413;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:6,1:7,1:3,10,2,0
chr3	58520306	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr3	58520327	.	T	TATAACAGAATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	58520859	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr3	58555386	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=162,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	58621935	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	58625975	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr3	58631184	.	G	GAAATA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AAATA;STR;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr3	58635197	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	58728368	.	GA	AT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=187,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58728368_GA_AT:58728368:0,2,0,1
chr3	58728372	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=187,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58728368_GA_AT:58728368:0,2,0,1
chr3	58728377	.	AT	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:58728368_GA_AT:58728368:0,3,0,1
chr3	58728380	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58728368_GA_AT:58728368:0,3,0,1
chr3	58849242	.	A	AAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=264,247;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58849242_A_AAAT:58849242:1,0,1,0
chr3	58849245	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=264,247;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58849242_A_AAAT:58849242:1,0,1,0
chr3	59996969	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,0:0,7:0,0,7,0
chr3	59999690	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,4:5,6:8,1,8,2
chr3	62153600	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,97;MMQ=60,52;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:14,0,2,0
chr3	62267213	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=93,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.552:7:2,3:1,0:3,0,4,0
chr3	62267226	.	TGGA	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=106,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:6,1:3,2:7,3,2,1
chr3	62267229	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=93,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,0:4,0:3,4,4,0
chr3	62318916	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=165,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.386:8:0,1:4,2:3,2,2,1
chr3	62355666	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=205,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr3	62357294	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=199,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:7,2:9,0:12,7,0,2
chr3	62358039	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=115,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	62358427	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:1,9,0,2
chr3	62431402	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=167,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.424:15:3,3:2,2:9,0,3,3
chr3	62431415	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,14,4
chr3	62464145	.	A	ATATGGCTTTTCATGGACTCGGTTGAGATCTTCATG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=96,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:62464145_A_ATATGGCTTTTCATGGACTCGGTTGAGATCTTCATG:62464145:0,2,0,1
chr3	62464148	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=96,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:62464145_A_ATATGGCTTTTCATGGACTCGGTTGAGATCTTCATG:62464145:0,2,0,1
chr3	62477223	.	C	CCTCAGAAGTCAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=38,32;MFRL=213,205;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	62477233	.	A	AACAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=AC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	62477933	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=101,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,5:0,4:1,0,9,0
chr3	62478194	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=293,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr3	62498378	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=114.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,19:0,0,27,9
chr3	62535819	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=153,242;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:0,1,0,8
chr3	62535870	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=178,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62535870_T_A:62535870:0,1,0,1
chr3	62535873	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=178,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:62535870_T_A:62535870:0,1,0,1
chr3	62570956	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:7,0:14,4:9,12,0,4
chr3	62571037	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.617:16:2,6:3,3:1,5,2,8
chr3	62631553	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,1:1,6:0,2,1,7
chr3	62636826	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	62739092	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=103,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr3	63640534	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=182,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:1,5,0,4
chr3	63645575	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:0,6,0,5
chr3	63821914	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr3	63822138	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=230,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:0,2,0,4
chr3	63898243	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:3,1:4,3,1,1
chr3	63898360	.	G	GGCAGCA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=GCA;STR;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,0:0,2:0,2,2,2
chr3	63937992	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=210,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.725:8:1,3:0,3:2,0,5,1
chr3	63999322	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr3	64004409	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:4,7:4,6:2,6,4,10
chr3	64004698	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:23,3:25,0:14,34,3,0
chr3	64005110	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,203;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:15,0:2,3:4,14,0,3
chr3	64085478	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:8,12,1,1
chr3	64145759	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,0,18
chr3	64518994	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr3	64526717	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,5:3,8:5,0,12,1
chr3	64526942	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:1,7:2,3:1,2,4,8
chr3	64527316	.	A	AGAGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=156,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr3	64527321	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr3	64527336	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr3	64527378	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr3	64527465	.	C	A,T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31,27;MFRL=0,135,181;MMQ=60,60,60;MPOS=9,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.62,27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,11:0.435,0.522:20:0,3,9:0,6,2:0,0,20,0
chr3	64532606	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,43;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,0:7,2:3,9,1,1
chr3	64553963	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	64554254	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr3	64589851	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,3:2,0:3,5,2,1
chr3	64617699	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=248,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr3	64640206	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=71.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,17:0.784:21:3,6:1,11:0|1:64640206_TA_T:64640206:3,1,12,5
chr3	64640212	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,18:0.761:23:3,7:2,11:0|1:64640206_TA_T:64640206:4,1,12,6
chr3	64641150	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr3	64667059	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:8,3:2,1:1,9,1,3
chr3	64672288	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=149,389;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:9,2:17,0:11,15,2,0
chr3	65361383	.	AAG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AG;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	65416648	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr3	65464522	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr3	65479199	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:3,3,2,0
chr3	65607637	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,7,9
chr3	65607853	.	G	GTTGCAGTCTGGGGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	66023592	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr3	66293688	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:2,9:4,6:4,2,7,8
chr3	66293786	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr3	66396845	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,14:0,0,9,20
chr3	66396898	.	G	GAAGAGTAGA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=170,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGAGTAGA;STR;TLOD=37.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,3:1,5:0,2,2,7
chr3	66431187	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.271:13:2,2:6,1:5,5,1,2
chr3	66432680	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,14,0
chr3	66433312	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	66444697	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,5:3,6:0,7,1,10
chr3	66449481	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.204:21:10,0:5,3:10,7,0,4
chr3	66463251	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr3	66465259	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	66467769	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,28;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:66467769_C_A:66467769:0,3,0,1
chr3	66467773	.	C	CATGTTACTCT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:66467769_C_A:66467769:0,3,0,1
chr3	66467774	.	C	CTCAAA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=160,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.394:3:0,0:2,1:1|0:66467769_C_A:66467769:0,2,0,1
chr3	66467775	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:66467769_C_A:66467769:0,2,0,1
chr3	66467777	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:66467769_C_A:66467769:0,2,0,1
chr3	66467781	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:66467769_C_A:66467769:0,1,0,1
chr3	66467787	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:66467769_C_A:66467769:0,0,0,1
chr3	66513022	.	A	AGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:66513022_A_AGGG:66513022:0,1,0,1
chr3	66513023	.	C	CTGGCACCACTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:66513022_A_AGGG:66513022:0,1,0,1
chr3	67426125	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	67559216	.	CT	C,CTT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,32,32;MFRL=151,164,148;MMQ=60,60,60;MPOS=14,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.45,7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,6,3:0.242,0.142:25:9,2,0:6,4,3:16,0,8,1
chr3	67559231	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,14;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:8,0:7,0:24,3,4,0
chr3	68587884	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr3	68782213	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr3	68782413	.	T	TTTGTTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:68782413_T_TTTGTTTC:68782413:0,3,0,1
chr3	68782414	.	A	AATTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:68782413_T_TTTGTTTC:68782413:0,3,0,1
chr3	68788363	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	68801921	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	69036707	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,4:1,4:1,2,3,5
chr3	69053447	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	69074930	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=226,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr3	69082657	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=185,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,1:2,0,4,0
chr3	69088918	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	69093598	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:4,11:3,4:4,3,14,1
chr3	69104695	.	T	A	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=225.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,24:0,46:0,0,19,52
chr3	69104752	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=143.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,19:0,23:0,0,0,43
chr3	69106304	.	CC	TG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.829:27:2,6:1,15:4,0,23,0
chr3	69111097	.	GGA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=216,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GA;STR;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:2,2:3,0:6,2,1,2
chr3	69112049	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=188,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:3,5:9,1:12,0,6,0
chr3	69113153	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:8,1:9,3:17,2,4,0
chr3	69153854	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	69225588	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	69225875	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr3	69229976	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	69230026	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr3	69230061	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,12:0,0,20,5
chr3	69242770	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr3	69244162	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr3	69245334	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=175,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,2:4,0:11,1,2,0
chr3	69245949	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	69246274	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	69265371	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,7,10
chr3	69267578	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,5:0,0,0,17
chr3	69273656	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	69362706	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,1:2,2:0,4,0,3
chr3	69362722	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=289,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	71037127	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.116:45:23,4:17,0:20,20,3,2
chr3	72427844	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=193,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr3	72495777	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,13:0,0,8,18
chr3	72890219	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:18,1:22,1:26,14,2,0
chr3	73004157	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	73004291	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:5,12,2,0
chr3	73016635	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	73016814	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:8,1:11,9,2,0
chr3	73024350	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,13:0,18:0,0,6,26
chr3	73096591	.	A	ATAAT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=107.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,10:0,0,0,25
chr3	73110076	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	73112489	.	A	AAAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.806:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	73112545	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=195,245;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73112545_T_C:73112545:0,2,0,1
chr3	73112549	.	CC	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=195,245;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73112545_T_C:73112545:0,2,0,1
chr3	73112566	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73112566_TG_AA:73112566:0,1,0,1
chr3	73112570	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73112566_TG_AA:73112566:0,1,0,1
chr3	73112919	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=84.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,14:0,0,10,15
chr3	73112974	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr3	73434086	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=191,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,2:8,1:0,10,2,1
chr3	73440108	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.351:9:2,1:4,0:6,0,1,2
chr3	73651469	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr3	73651621	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	74315580	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,14,0
chr3	74351050	.	T	TATTTCATTAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:74351050_T_TATTTCATTAGC:74351050:0,0,0,1
chr3	74351055	.	C	CATCCATGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74351050_T_TATTTCATTAGC:74351050:0,0,0,1
chr3	74413710	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=117,77;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:2,0:3,5,0,2
chr3	74570373	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.530:9:3,2:0,2:0,4,0,5
chr3	75679820	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=15;MBQ=36,29;MFRL=165,177;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,2:3,2:8,1,3,1
chr3	75679824	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=15;MBQ=34,28;MFRL=200,173;MMQ=25,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:6,4:3,1:8,1,5,1
chr3	75679863	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=15;MBQ=33,35;MFRL=176,159;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,4:8,1:13,3,6,2
chr3	75679867	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=15;MBQ=33,30;MFRL=176,159;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.346:24:8,6:7,2:0|1:75679867_G_A:75679867:13,3,6,2
chr3	75679876	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=164,173;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:9,7:3,9:8,4,15,1
chr3	75679891	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=32,31;MFRL=169,173;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,10:0.344:30:11,7:9,2:0|1:75679867_G_A:75679867:17,3,7,3
chr3	75679893	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=170,168;MMQ=25,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.472:30:6,9:8,3:13,3,11,3
chr3	75679899	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=28,30;MFRL=165,163;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:10,6:9,3:0|1:75679867_G_A:75679867:15,4,6,3
chr3	75679930	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=15;MBQ=29,33;MFRL=149,161;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,16:0.500:32:7,8:7,7:0|1:75679930_A_C:75679930:10,6,11,5
chr3	75679938	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=15;MBQ=24,32;MFRL=150,159;MMQ=25,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,15:0.470:32:9,7:8,7:0|1:75679930_A_C:75679930:11,6,11,4
chr3	75679944	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=32,30;MFRL=149,156;MMQ=25,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:13,2:15,1:19,11,1,2
chr3	75679965	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=15;MBQ=32,29;MFRL=157,151;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,21:0.468:45:7,9:11,9:0|1:75679965_C_A:75679965:8,16,11,10
chr3	75679975	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=15;MBQ=33,28;MFRL=152,151;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,19:0.435:44:11,10:14,8:0|1:75679965_C_A:75679965:9,16,9,10
chr3	75679988	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=15;MBQ=27,32;MFRL=154,142;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,15:0.372:41:12,7:12,7:0|1:75679965_C_A:75679965:9,17,5,10
chr3	75679997	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=168,139;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,16:0.436:37:11,8:9,7:0|1:75679965_C_A:75679965:6,15,4,12
chr3	75680037	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=150,159;MMQ=49,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:7,4:5,2:0|1:75680037_G_T:75680037:2,10,0,7
chr3	75680045	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=150,159;MMQ=49,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:7,4:4,3:0|1:75680037_G_T:75680037:1,11,0,7
chr3	75680088	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=214,150;MMQ=39,38;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:75680088_C_T:75680088:0,2,0,2
chr3	75680109	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=217,132;MMQ=49,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75680088_C_T:75680088:0,1,0,1
chr3	75713444	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=168,253;MMQ=40,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,2:5,1:10,0,2,1
chr3	75713466	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=28,35;MFRL=136,238;MMQ=36,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,3:10,3:18,0,5,1
chr3	75713472	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=136,222;MMQ=40,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:9,2:12,3:19,2,4,1
chr3	75713496	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=138,204;MMQ=55,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,10:0.233:45:17,5:18,5:28,7,10,0
chr3	75713507	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=9;MBQ=32,26;MFRL=139,217;MMQ=49,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.137:49:19,3:24,3:36,7,6,0
chr3	75713561	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=148,202;MMQ=50,38;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,8:0.191:45:19,5:18,3:0|1:75713561_C_T:75713561:19,18,8,0
chr3	75713563	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=148,202;MMQ=50,38;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,8:0.184:47:18,5:17,3:0|1:75713561_C_T:75713561:19,20,8,0
chr3	75713564	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=9;MBQ=28,29;MFRL=159,163;MMQ=44,46;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.187:46:21,4:17,4:25,13,2,6
chr3	75713566	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=141,202;MMQ=51,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,13:0.292:46:18,6:15,5:14,19,13,0
chr3	75713720	.	G	C	.	.	DP=101;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=149,153;MMQ=45,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,25:0.262:96:33,14:37,10:26,45,13,12
chr3	75713725	.	C	T	.	.	DP=97;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=150,149;MMQ=49,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,35:0.367:96:35,13:21,22:24,37,13,22
chr3	75713738	.	T	G	.	.	DP=74;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=154,149;MMQ=48,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,21:0.307:70:28,7:17,14:11,38,4,17
chr3	75713748	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=9;MBQ=32,25;MFRL=151,168;MMQ=47,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,11:0.178:65:26,6:25,5:10,44,1,10
chr3	75713751	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=9;MBQ=32,26;MFRL=153,154;MMQ=48,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,22:0.343:65:19,12:21,10:6,37,5,17
chr3	75713757	.	AGG	A	.	.	DP=62;ECNT=9;MBQ=27,28;MFRL=154,147;MMQ=47,45;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=72.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,20:0.339:60:22,8:17,12:0|1:75713757_AGG_A:75713757:7,33,3,17
chr3	75713762	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=154,147;MMQ=48,45;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=72.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,20:0.344:59:21,8:17,11:0|1:75713757_AGG_A:75713757:6,33,3,17
chr3	75713782	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=156,161;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=90.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,31:0.667:46:8,14:7,17:3,12,4,27
chr3	75713794	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=154,187;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.431:38:8,6:12,10:4,18,2,14
chr3	75713858	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,4,12
chr3	75713879	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=190,182;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:9,1:2,1:7,4,0,2
chr3	75713948	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=151,158;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:4,11:2,5:6,0,14,2
chr3	75713958	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=148,203;MMQ=60,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.191:24:11,3:9,0:0|1:75713958_C_T:75713958:16,4,4,0
chr3	75713963	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=148,199;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:8,3:7,0:0|1:75713958_C_T:75713958:14,4,3,0
chr3	75714095	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=135,161;MMQ=31,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.163:41:17,2:16,4:0|1:75714095_G_A:75714095:14,21,1,5
chr3	75714102	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=133,192;MMQ=39,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:14,2:15,2:0|1:75714095_G_A:75714095:10,20,1,4
chr3	75714118	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=145,65;MMQ=25,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,1:10,1:0|1:75714118_G_A:75714118:4,17,0,2
chr3	75714127	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=145,65;MMQ=28,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,1:8,1:0|1:75714118_G_A:75714118:2,16,0,2
chr3	75714139	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=136,149;MMQ=50,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:0,5,1,5
chr3	75714185	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=196,213;MMQ=50,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:5,6,5,0
chr3	75714242	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=168,191;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,12:0.302:41:11,7:16,5:0|1:75714242_G_T:75714242:23,6,10,2
chr3	75714251	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=167,187;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,12:0.317:39:10,8:15,3:0|1:75714242_G_T:75714242:23,4,10,2
chr3	75714263	.	CA	TT	.	.	DP=56;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=163,168;MMQ=40,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,9:0.188:51:21,2:21,7:34,8,8,1
chr3	75714298	.	A	G	.	.	DP=72;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=140,127;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,32:0.478:67:18,22:17,10:22,13,31,1
chr3	75714337	.	T	G	.	.	DP=205;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=108,121;MMQ=60,50;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=509.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,148:0.742:199:32,86:19,59:34,17,100,48
chr3	75714345	.	G	T	.	.	DP=223;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=109,123;MMQ=57,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:153,61:0.286:214:89,37:57,23:97,56,37,24
chr3	75714379	.	T	G	.	.	DP=201;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=122,102;MMQ=55,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:167,31:0.155:198:84,18:78,11:87,80,16,15
chr3	75714382	.	G	C,T	.	.	DP=200;ECNT=13;MBQ=32,32,26;MFRL=125,124,122;MMQ=55,60,47;MPOS=19,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=186.08,155.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:80,62,54:0.316,0.274:196:36,27,28:39,31,23:40,40,56,60
chr3	75714388	.	G	T	.	.	DP=177;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=125,122;MMQ=55,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=140.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:131,45:0.258:176:61,16:64,22:57,74,19,26
chr3	75714391	.	G	T	.	.	DP=159;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=124,122;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=190.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:103,55:0.347:158:50,22:50,26:0|1:75714391_G_T:75714391:41,62,24,31
chr3	75714394	.	G	T	.	.	DP=153;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=124,122;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=183.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:100,53:0.346:153:42,19:50,26:0|1:75714391_G_T:75714391:38,62,22,31
chr3	75714396	.	T	TG	.	.	DP=143;ECNT=13;MBQ=30,30;MFRL=126,123;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=161.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,46:0.328:140:40,19:48,24:0|1:75714391_G_T:75714391:34,60,19,27
chr3	75714422	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=13;MBQ=34,26;MFRL=138,123;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=86.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,31:0.409:76:17,11:27,20:6,39,5,26
chr3	75714423	.	G	T	.	.	DP=79;ECNT=13;MBQ=33,32;MFRL=138,128;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=69.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,22:0.299:75:20,7:30,15:8,45,2,20
chr3	75714447	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=13;MBQ=28,30;MFRL=164,149;MMQ=45,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=191.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,47:0.696:67:9,23:11,22:0,20,3,44
chr3	75714459	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=175,165;MMQ=42,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,20:0.375:54:21,9:13,10:1,33,2,18
chr3	75714465	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=161,181;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,19:0.370:52:15,14:17,4:2,31,1,18
chr3	75714608	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=213,188;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,1:4,2:9,2,1,2
chr3	75714648	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=195,172;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:12,3:11,3:18,7,4,2
chr3	75714663	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=166,141;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.206:32:11,4:14,2:16,10,5,1
chr3	75714674	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=181,155;MMQ=55,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.347:38:14,5:10,7:18,7,8,5
chr3	75714702	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=166,181;MMQ=60,55;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,37:0.692:53:7,17:9,20:9,7,24,13
chr3	75714709	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=175,212;MMQ=57,41;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.129:52:21,2:21,4:29,17,4,2
chr3	75714771	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=13;MBQ=29,32;MFRL=171,175;MMQ=52,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,7:0.106:73:27,3:36,4:40,26,6,1
chr3	75714788	.	A	C	.	.	DP=78;ECNT=13;MBQ=30,32;MFRL=168,206;MMQ=52,25;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,4:0.062:77:33,1:39,3:42,31,3,1
chr3	75714805	.	TG	T	.	.	DP=76;ECNT=13;MBQ=28,28;MFRL=164,171;MMQ=52,49;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=109.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,31:0.432:72:14,15:21,15:0|1:75714805_TG_T:75714805:26,15,18,13
chr3	75714807	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=166,171;MMQ=52,49;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,31:0.426:73:16,15:23,16:0|1:75714805_TG_T:75714805:27,15,18,13
chr3	75714809	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=13;MBQ=32,25;MFRL=169,172;MMQ=52,25;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,16:0.205:81:26,4:33,8:0|1:75714809_C_T:75714809:38,27,9,7
chr3	75714819	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=13;MBQ=30,29;MFRL=164,172;MMQ=52,25;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,19:0.238:82:30,8:31,11:0|1:75714809_C_T:75714809:35,28,11,8
chr3	75714824	.	AG	A	.	.	DP=86;ECNT=13;MBQ=28,28;MFRL=172,168;MMQ=49,25;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,7:0.092:85:35,2:42,5:42,36,5,2
chr3	75714825	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=174,159;MMQ=52,47;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,25:0.301:86:24,13:35,12:35,26,13,12
chr3	75714831	.	G	A	.	.	DP=90;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=164,174;MMQ=52,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=76.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,22:0.253:89:27,9:36,12:0|1:75714831_G_A:75714831:34,33,13,9
chr3	75714835	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=161,175;MMQ=57,25;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,23:0.258:91:27,8:35,12:0|1:75714831_G_A:75714831:33,35,13,10
chr3	75714840	.	A	G	.	.	DP=91;ECNT=13;MBQ=30,32;MFRL=162,170;MMQ=60,37;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=204.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,52:0.596:87:11,27:23,23:17,18,26,26
chr3	75714843	.	T	A	.	.	DP=93;ECNT=13;MBQ=28,25;MFRL=170,159;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=102.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,29:0.316:93:25,13:36,9:0|1:75714843_T_A:75714843:34,30,14,15
chr3	75714853	.	G	A	.	.	DP=103;ECNT=13;MBQ=30,29;MFRL=172,159;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,28:0.287:99:28,13:41,15:0|1:75714843_T_A:75714843:37,34,14,14
chr3	75715173	.	CT	TG	.	.	DP=50;ECNT=9;MBQ=32,25;MFRL=178,140;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,11:0.231:50:24,4:14,7:0|1:75715173_CT_TG:75715173:8,31,5,6
chr3	75715181	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=181,144;MMQ=60,47;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,9:0.208:46:23,3:12,6:0|1:75715173_CT_TG:75715173:9,28,4,5
chr3	75715199	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=178,168;MMQ=49,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,12:0.406:30:10,6:8,6:0|1:75715199_T_G:75715199:7,11,4,8
chr3	75715202	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=178,159;MMQ=49,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,11:0.387:29:10,5:7,4:0|1:75715199_T_G:75715199:7,11,4,7
chr3	75715205	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=184,140;MMQ=50,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:12,1:6,5:7,13,3,4
chr3	75715222	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=9;MBQ=27,32;MFRL=168,177;MMQ=46,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,3:6,4:3,12,2,5
chr3	75715261	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=200,150;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:0,5,0,8
chr3	75715264	.	CC	TG	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=175,157;MMQ=43,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:0,10,0,3
chr3	75715268	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=193,154;MMQ=50,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,2:5,2:0,10,0,4
chr3	75785936	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=18;MBQ=32,25;MFRL=217,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:9,0,4,0
chr3	75785942	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=18;MBQ=32,31;MFRL=203,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:4,3:7,2:0|1:75785942_G_A:75785942:12,0,5,0
chr3	75785959	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=18;MBQ=33,27;MFRL=204,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.308:24:8,4:8,3:0|1:75785942_G_A:75785942:17,0,7,0
chr3	75785962	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=18;MBQ=25,35;MFRL=205,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:21,0,2,0
chr3	75785996	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=18;MBQ=33,29;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=198.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,49:0.735:66:6,26:10,23:16,1,49,0
chr3	75785999	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=18;MBQ=31,32;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=73.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,21:0.314:68:20,11:26,9:0|1:75785999_A_G:75785999:46,1,21,0
chr3	75786007	.	CA	TG	.	.	DP=73;ECNT=18;MBQ=32,27;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,22:0.328:68:21,11:24,8:0|1:75785999_A_G:75785999:45,1,22,0
chr3	75786013	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=18;MBQ=32,35;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,8:0.112:78:31,6:34,2:0|1:75786013_G_C:75786013:68,2,8,0
chr3	75786019	.	GG	CG,CA	.	.	DP=89;ECNT=18;MBQ=33,33,32;MFRL=161,163,173;MMQ=60,60,60;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=55.89,22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:63,17,8:0.203,0.101:88:34,8,2:25,7,6:61,2,25,0
chr3	75786031	.	A	C	.	.	DP=97;ECNT=18;MBQ=30,34;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,10:0.111:97:40,8:45,2:0|1:75786013_G_C:75786013:84,3,9,1
chr3	75786035	.	G	GA	.	.	DP=106;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,12:0.121:105:43,3:39,8:88,5,12,0
chr3	75786036	.	A	C,G	.	.	DP=106;ECNT=18;MBQ=30,34,32;MFRL=164,152,152;MMQ=60,60,60;MPOS=9,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=26.08,64.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:74,10,20:0.103,0.193:104:34,7,9:37,2,10:72,2,28,2
chr3	75786042	.	G	A	.	.	DP=110;ECNT=18;MBQ=32,31;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=312.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,77:0.696:110:15,37:17,34:28,5,75,2
chr3	75786059	.	CA	TG,TA	.	.	DP=144;ECNT=18;MBQ=32,26,26;MFRL=150,160,160;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=174.65,222.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,49,59:0.344,0.408:143:17,21,28:15,21,26:27,8,99,9
chr3	75786071	.	C	A	.	.	DP=161;ECNT=18;MBQ=32,30;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=232.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,63:0.393:161:42,31:49,28:0|1:75786071_C_A:75786071:74,24,57,6
chr3	75786073	.	C	G	.	.	DP=175;ECNT=18;MBQ=32,33;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:164,7:0.037:171:71,4:78,2:136,28,4,3
chr3	75786079	.	CG	TA	.	.	DP=193;ECNT=18;MBQ=32,26;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=245.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,72:0.396:182:52,35:51,30:0|1:75786071_C_A:75786071:86,24,63,9
chr3	75786080	.	G	A	.	.	DP=192;ECNT=18;MBQ=29,30;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=230.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,85:0.681:124:23,40:13,43:29,10,69,16
chr3	75786132	.	T	C	.	.	DP=233;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=264.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,99:0.451:219:58,58:62,39:54,66,54,45
chr3	75786163	.	C	T	.	.	DP=224;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=238.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,94:0.453:207:49,47:62,46:37,76,35,59
chr3	75786175	.	C	A	.	.	DP=211;ECNT=18;MBQ=32,25;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:194,9:0.048:203:75,5:114,4:76,118,5,4
chr3	75786202	.	TG	CA	.	.	DP=188;ECNT=18;MBQ=30,33;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:180,7:0.037:187:73,2:96,4:62,118,2,5
chr3	75786211	.	A	G	.	.	DP=177;ECNT=18;MBQ=27,32;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=196.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,70:0.421:166:44,27:49,41:31,65,21,49
chr3	75786225	.	G	A	.	.	DP=155;ECNT=18;MBQ=32,28;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=166.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,56:0.384:147:38,32:50,22:28,63,21,35
chr3	75786243	.	C	T	.	.	DP=121;ECNT=18;MBQ=33,28;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=164.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,47:0.400:118:37,22:33,20:0|1:75786243_C_T:75786243:16,55,10,37
chr3	75786244	.	A	T	.	.	DP=121;ECNT=18;MBQ=27,30;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:90,30:0.238:120:43,12:38,17:0|1:75786244_A_T:75786244:22,68,5,25
chr3	75786245	.	T	A	.	.	DP=120;ECNT=18;MBQ=30,26;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=168.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,48:0.401:120:38,18:32,21:0|1:75786243_C_T:75786243:16,56,11,37
chr3	75786251	.	GG	AT	.	.	DP=118;ECNT=18;MBQ=32,28;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:110,6:0.059:116:49,2:44,3:28,82,0,6
chr3	75786252	.	G	T	.	.	DP=117;ECNT=18;MBQ=34,30;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=178.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,48:0.428:113:27,20:28,21:0|1:75786243_C_T:75786243:16,49,13,35
chr3	75786256	.	T	A	.	.	DP=109;ECNT=18;MBQ=31,28;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=168.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,45:0.414:109:30,19:31,21:0|1:75786243_C_T:75786243:15,49,12,33
chr3	75786261	.	C	T	.	.	DP=102;ECNT=18;MBQ=32,30;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=75.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,26:0.244:101:28,12:39,13:0|1:75786244_A_T:75786244:20,55,5,21
chr3	75786278	.	A	C	.	.	DP=81;ECNT=18;MBQ=28,32;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=210.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,53:0.649:81:9,21:17,26:0|1:75786278_A_C:75786278:7,21,12,41
chr3	75786288	.	A	G	.	.	DP=81;ECNT=18;MBQ=27,32;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=64.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,21:0.271:79:23,9:31,10:0|1:75786288_A_G:75786288:15,43,3,18
chr3	75786298	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=18;MBQ=30,32;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=57.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,17:0.250:70:21,10:26,6:0|1:75786288_A_G:75786288:7,46,0,17
chr3	75786302	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=18;MBQ=32,27;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=84.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,23:0.375:62:17,12:21,11:2,37,3,20
chr3	75786314	.	CCTACATTCT	C	.	.	DP=48;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=118.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,30:0.620:48:5,15:12,11:0|1:75786278_A_C:75786278:2,16,3,27
chr3	75786337	.	G	A,T	.	.	DP=38;ECNT=18;MBQ=33,25,31;MFRL=180,201,135;MMQ=60,60,59;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.41,19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,6,7:0.170,0.195:38:12,4,4:13,2,3:4,21,1,12
chr3	75786354	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=18;MBQ=33,25;MFRL=188,180;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.300:38:13,4:12,5:8,19,1,10
chr3	75786379	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=32;MBQ=28,34;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,13:0.584:22:5,2:4,9:0|1:75786379_T_C:75786379:7,2,7,6
chr3	75786385	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=32;MBQ=34,33;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.593:25:6,4:4,11:0|1:75786379_T_C:75786379:8,2,8,7
chr3	75786417	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=32;MBQ=28,33;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,19:0.606:31:5,7:6,10:0|1:75786417_T_C:75786417:8,4,15,4
chr3	75786421	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=32;MBQ=35,27;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,7:0.229:33:8,4:17,2:0|1:75786421_G_T:75786421:18,8,7,0
chr3	75786423	.	T	TTC	.	.	DP=34;ECNT=32;MBQ=29,28;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TC;STR;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,7:0.222:34:8,5:17,2:0|1:75786421_G_T:75786421:19,8,7,0
chr3	75786430	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=32;MBQ=32,26;MFRL=172,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.210:36:13,3:16,4:22,7,6,1
chr3	75786438	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=32;MBQ=33,31;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=134.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,33:0.680:48:8,14:7,16:0|1:75786417_T_C:75786417:10,5,27,6
chr3	75786440	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=32;MBQ=32,28;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=139.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,34:0.686:49:8,15:7,18:0|1:75786417_T_C:75786417:10,5,28,6
chr3	75786450	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=32;MBQ=30,30;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=146.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,36:0.673:53:7,16:9,17:0|1:75786417_T_C:75786417:10,7,30,6
chr3	75786453	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=32;MBQ=32,25;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=138.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,34:0.660:51:6,15:6,17:0|1:75786417_T_C:75786417:10,7,29,5
chr3	75786469	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=32;MBQ=33,28;MFRL=155,178;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,12:0.241:52:17,7:23,5:0|1:75786469_G_A:75786469:31,9,10,2
chr3	75786476	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=32;MBQ=32,31;MFRL=158,175;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,13:0.250:54:17,7:21,5:0|1:75786469_G_A:75786469:30,11,11,2
chr3	75786483	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=32;MBQ=32,32;MFRL=155,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,6:0.124:54:24,4:22,2:38,10,6,0
chr3	75786490	.	C	G	.	.	DP=65;ECNT=32;MBQ=33,34;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,19:0.298:65:25,8:19,9:0|1:75786469_G_A:75786469:34,12,15,4
chr3	75786500	.	AT	GA,GT	.	.	DP=66;ECNT=32;MBQ=30,28,27;MFRL=141,143,160;MMQ=60,53,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=63.57,116.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,18,31:0.275,0.483:64:9,8,12:5,9,15:10,5,38,11
chr3	75786506	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=32;MBQ=25,32;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=121.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,32:0.485:66:16,16:14,12:0|1:75786506_T_C:75786506:24,10,23,9
chr3	75786515	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=32;MBQ=30,30;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=205.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,50:0.750:66:10,24:6,21:10,6,36,14
chr3	75786518	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=32;MBQ=28,35;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,21:0.319:67:26,10:16,11:0|1:75786469_G_A:75786469:29,17,16,5
chr3	75786521	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=32;MBQ=32,30;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,21:0.333:64:24,10:15,11:0|1:75786469_G_A:75786469:25,18,16,5
chr3	75786533	.	T	G	.	.	DP=80;ECNT=32;MBQ=27,33;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=115.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,33:0.420:79:25,18:18,11:0|1:75786506_T_C:75786506:30,16,15,18
chr3	75786555	.	C	CTG	.	.	DP=96;ECNT=32;MBQ=33,34;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=228.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,58:0.609:95:18,26:16,24:22,15,25,33
chr3	75786572	.	T	C	.	.	DP=98;ECNT=32;MBQ=29,30;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=110.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,35:0.358:97:29,14:27,19:32,30,16,19
chr3	75786586	.	G	T	.	.	DP=97;ECNT=32;MBQ=34,28;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,5:0.060:97:43,2:44,2:0|1:75786586_G_T:75786586:50,42,2,3
chr3	75786593	.	C	A	.	.	DP=98;ECNT=32;MBQ=33,27;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,6:0.069:98:40,1:45,3:0|1:75786586_G_T:75786586:51,41,2,4
chr3	75786597	.	C	T	.	.	DP=108;ECNT=32;MBQ=29,29;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=107.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,32:0.294:108:30,10:33,18:0|1:75786597_C_T:75786597:41,35,18,14
chr3	75786598	.	G	A	.	.	DP=109;ECNT=32;MBQ=32,20;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,8:0.081:109:42,1:49,2:0|1:75786586_G_T:75786586:57,44,3,5
chr3	75786607	.	C	T	.	.	DP=108;ECNT=32;MBQ=32,29;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=102.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,30:0.276:108:33,12:35,14:0|1:75786597_C_T:75786597:45,33,17,13
chr3	75786608	.	C	T	.	.	DP=107;ECNT=32;MBQ=32,31;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:103,4:0.046:107:42,2:46,2:0|1:75786586_G_T:75786586:60,43,2,2
chr3	75786610	.	T	G	.	.	DP=106;ECNT=32;MBQ=29,34;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=93.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,27:0.259:106:35,11:31,13:0|1:75786597_C_T:75786597:46,33,14,13
chr3	75786619	.	T	C	.	.	DP=104;ECNT=32;MBQ=29,31;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=102.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,31:0.306:102:36,14:30,15:0|1:75786597_C_T:75786597:41,30,15,16
chr3	75786620	.	G	A	.	.	DP=104;ECNT=32;MBQ=33,30;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:100,4:0.047:104:49,2:42,2:0|1:75786586_G_T:75786586:54,46,2,2
chr3	75786623	.	G	T	.	.	DP=110;ECNT=32;MBQ=32,27;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=107.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,43:0.427:101:28,26:29,17:27,31,28,15
chr3	75786662	.	A	T	.	.	DP=135;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=147,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:119,8:0.069:127:63,6:51,2:58,61,5,3
chr3	75786670	.	G	A	.	.	DP=125;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=141.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,55:0.465:118:35,28:25,26:31,32,25,30
chr3	75786672	.	C	T	.	.	DP=120;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=153,182;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:114,6:0.057:120:57,3:49,1:53,61,4,2
chr3	75786681	.	G	A	.	.	DP=116;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=328.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,88:0.795:110:11,40:11,39:9,13,39,49
chr3	75786684	.	G	T	.	.	DP=114;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=156,204;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,4:0.044:110:51,3:50,1:45,61,2,2
chr3	75786687	.	A	T	.	.	DP=111;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,10:0.094:109:50,5:46,4:45,54,4,6
chr3	75786737	.	A	C,T	.	.	DP=97;ECNT=27;MBQ=28,33,30;MFRL=158,160,152;MMQ=60,60,60;MPOS=14,18;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=47.26,198.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,15,52:0.168,0.556:92:16,6,26:8,7,20:13,12,31,36
chr3	75786740	.	CA	GG	.	.	DP=94;ECNT=27;MBQ=33,33;MFRL=152,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,22:0.240:94:43,9:24,12:0|1:75786740_CA_GG:75786740:37,35,7,15
chr3	75786741	.	A	G	.	.	DP=92;ECNT=27;MBQ=27,31;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=154.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,42:0.597:70:18,24:8,17:0|1:75786741_A_G:75786741:13,15,22,20
chr3	75786743	.	TA	T	.	.	DP=93;ECNT=27;MBQ=28,30;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,13:0.147:93:44,7:31,5:40,40,4,9
chr3	75786748	.	C	T	.	.	DP=93;ECNT=27;MBQ=34,30;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,9:0.096:93:45,4:33,5:0|1:75786748_C_T:75786748:39,45,4,5
chr3	75786753	.	C	T	.	.	DP=93;ECNT=27;MBQ=31,29;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,13:0.149:92:39,11:35,2:39,40,7,6
chr3	75786754	.	G	T	.	.	DP=92;ECNT=27;MBQ=31,30;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,17:0.191:92:42,7:28,9:0|1:75786740_CA_GG:75786740:39,36,8,9
chr3	75786759	.	T	C	.	.	DP=91;ECNT=27;MBQ=29,32;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=215.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,54:0.591:91:22,28:11,25:19,18,26,28
chr3	75786760	.	TC	T	.	.	DP=93;ECNT=27;MBQ=30,28;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,10:0.116:91:46,5:33,4:0|1:75786748_C_T:75786748:40,41,5,5
chr3	75786764	.	C	CT	.	.	DP=96;ECNT=27;MBQ=30,33;MFRL=153,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,17:0.185:96:43,6:28,7:0|1:75786740_CA_GG:75786740:40,39,9,8
chr3	75786773	.	T	A	.	.	DP=90;ECNT=27;MBQ=28,27;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=139.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,37:0.425:90:23,19:23,15:0|1:75786741_A_G:75786741:29,24,17,20
chr3	75786784	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=27;MBQ=29,31;MFRL=158,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,13:0.172:80:34,4:27,7:0|1:75786740_CA_GG:75786740:31,36,9,4
chr3	75786802	.	G	C,A	.	.	DP=87;ECNT=27;MBQ=30,32,28;MFRL=154,218,178;MMQ=60,60,60;MPOS=12,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.46,104.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:52,6,29:0.078,0.333:87:27,1,16:22,4,9:32,20,14,21
chr3	75786817	.	C	A	.	.	DP=96;ECNT=27;MBQ=33,29;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,9:0.103:95:46,3:32,6:52,34,7,2
chr3	75786827	.	A	T	.	.	DP=106;ECNT=27;MBQ=28,28;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=229.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,60:0.575:104:23,30:19,25:28,16,40,20
chr3	75786832	.	C	T	.	.	DP=112;ECNT=27;MBQ=32,28;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=236.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,65:0.608:107:21,35:18,24:30,12,42,23
chr3	75786833	.	G	A	.	.	DP=112;ECNT=27;MBQ=33,30;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,11:0.105:112:52,6:38,5:68,33,9,2
chr3	75786845	.	T	C	.	.	DP=117;ECNT=27;MBQ=29,33;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=362.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,88:0.748:117:15,46:11,37:18,11,64,24
chr3	75786854	.	A	T	.	.	DP=127;ECNT=27;MBQ=30,27;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=144.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,49:0.396:123:35,26:33,20:53,21,33,16
chr3	75786866	.	G	T	.	.	DP=118;ECNT=27;MBQ=32,27;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=117.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,33:0.283:118:40,19:38,12:0|1:75786866_G_T:75786866:59,26,24,9
chr3	75786888	.	C	T	.	.	DP=140;ECNT=27;MBQ=31,28;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:124,14:0.107:138:53,7:54,7:0|1:75786888_C_T:75786888:76,48,10,4
chr3	75786892	.	A	C	.	.	DP=145;ECNT=27;MBQ=30,31;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=125.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:109,36:0.252:145:44,15:50,15:0|1:75786866_G_T:75786866:70,39,21,15
chr3	75786894	.	GT	G	.	.	DP=145;ECNT=27;MBQ=32,32;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:124,16:0.116:140:53,6:60,8:0|1:75786888_C_T:75786888:76,48,10,6
chr3	75786899	.	T	C	.	.	DP=152;ECNT=27;MBQ=28,32;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=144.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:111,41:0.273:152:46,15:59,18:0|1:75786866_G_T:75786866:64,47,22,19
chr3	75786916	.	C	A	.	.	DP=175;ECNT=27;MBQ=33,29;MFRL=132,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=224.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:114,61:0.350:175:42,24:66,28:0|1:75786866_G_T:75786866:59,55,37,24
chr3	75786919	.	A	T	.	.	DP=181;ECNT=27;MBQ=28,28;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=215.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:114,61:0.350:175:43,26:67,31:0|1:75786866_G_T:75786866:59,55,35,26
chr3	75786921	.	G	A	.	.	DP=187;ECNT=27;MBQ=32,29;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:146,33:0.187:179:58,14:82,18:79,67,16,17
chr3	75786965	.	C	T	.	.	DP=200;ECNT=19;MBQ=32,31;MFRL=150,141;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=246.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:118,79:0.400:197:52,34:63,37:0|1:75786965_C_T:75786965:48,70,23,56
chr3	75786991	.	C	T	.	.	DP=148;ECNT=19;MBQ=33,28;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=209.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,64:0.434:147:39,24:38,29:0|1:75786965_C_T:75786965:24,59,18,46
chr3	75786993	.	T	A	.	.	DP=138;ECNT=19;MBQ=31,28;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:116,21:0.158:137:53,7:53,14:34,82,4,17
chr3	75787015	.	C	T	.	.	DP=105;ECNT=19;MBQ=34,28;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=118.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,35:0.339:104:29,10:30,24:0|1:75787015_C_T:75787015:20,49,10,25
chr3	75787032	.	T	C	.	.	DP=95;ECNT=19;MBQ=30,28;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=107.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,33:0.365:91:23,9:30,18:0|1:75787032_T_C:75787032:16,42,9,24
chr3	75787042	.	G	GAAAT	.	.	DP=96;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=130.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,37:0.388:96:23,16:30,17:0|1:75787032_T_C:75787032:18,41,15,22
chr3	75787043	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=19;MBQ=33,29;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=107.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,30:0.320:95:26,11:24,16:0|1:75787015_C_T:75787015:23,42,10,20
chr3	75787044	.	A	ACTT	.	.	DP=96;ECNT=19;MBQ=30,28;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=131.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,37:0.388:96:23,17:28,12:0|1:75787032_T_C:75787032:19,40,15,22
chr3	75787047	.	G	GACTTATA	.	.	DP=97;ECNT=19;MBQ=34,33;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=120.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,33:0.343:97:26,11:27,15:0|1:75787015_C_T:75787015:24,40,14,19
chr3	75787049	.	C	A	.	.	DP=97;ECNT=19;MBQ=32,28;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,10:0.112:95:38,4:41,5:33,52,3,7
chr3	75787057	.	G	A	.	.	DP=105;ECNT=19;MBQ=34,28;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=320.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,81:0.796:101:10,32:10,38:5,15,34,47
chr3	75787081	.	A	T	.	.	DP=104;ECNT=19;MBQ=28,28;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=114.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,32:0.311:104:35,11:32,18:0|1:75787015_C_T:75787015:30,42,17,15
chr3	75787098	.	CCT	C	.	.	DP=101;ECNT=19;MBQ=32,30;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=112.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,34:0.361:95:27,17:25,15:32,29,17,17
chr3	75787116	.	T	G	.	.	DP=98;ECNT=19;MBQ=28,32;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=91.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,26:0.270:98:35,13:27,12:0|1:75787015_C_T:75787015:35,37,16,10
chr3	75787127	.	G	T	.	.	DP=90;ECNT=19;MBQ=32,27;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,24:0.278:88:38,12:22,11:0|1:75787015_C_T:75787015:35,29,16,8
chr3	75787145	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=19;MBQ=28,31;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=153.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,42:0.507:83:20,21:16,18:0|1:75787145_T_C:75787145:25,16,20,22
chr3	75787159	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=19;MBQ=32,30;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=161.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,44:0.505:87:25,22:16,15:0|1:75787145_T_C:75787145:28,15,17,27
chr3	75787169	.	G	A	.	.	DP=87;ECNT=19;MBQ=30,27;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=209.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,53:0.607:87:20,33:14,18:23,11,19,34
chr3	75787174	.	G	T	.	.	DP=86;ECNT=19;MBQ=33,31;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,19:0.234:83:39,10:22,9:38,26,5,14
chr3	75787186	.	C	T	.	.	DP=88;ECNT=32;MBQ=33,28;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=180.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,48:0.570:84:21,28:10,17:24,12,23,25
chr3	75787199	.	A	C	.	.	DP=85;ECNT=32;MBQ=29,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,9:0.116:84:46,6:23,3:0|1:75787199_A_C:75787199:42,33,4,5
chr3	75787218	.	T	A	.	.	DP=85;ECNT=32;MBQ=30,27;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,15:0.186:84:40,9:24,6:0|1:75787218_T_A:75787218:36,33,6,9
chr3	75787221	.	CA	TG,TA	.	.	DP=85;ECNT=32;MBQ=33,28,28;MFRL=148,115,154;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=49.73,34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:58,16,11:0.193,0.136:85:33,7,7:23,6,3:32,26,11,16
chr3	75787222	.	A	G	.	.	DP=85;ECNT=32;MBQ=29,31;MFRL=144,161;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,24:0.362:67:24,14:16,10:0|1:75787222_A_G:75787222:22,21,13,11
chr3	75787224	.	C	T,G	.	.	DP=83;ECNT=32;MBQ=31,28,32;MFRL=147,143,154;MMQ=60,60,60;MPOS=12,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=141.04,34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,37,11:0.442,0.140:83:14,21,6:14,15,4:18,17,24,24
chr3	75787236	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=32;MBQ=32,30;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,13:0.163:84:36,8:27,5:0|1:75787199_A_C:75787199:35,36,5,8
chr3	75787240	.	A	G	.	.	DP=83;ECNT=32;MBQ=28,28;MFRL=131,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=114.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,31:0.376:83:30,12:17,15:0|1:75787240_A_G:75787240:21,31,18,13
chr3	75787244	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=32;MBQ=28,27;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,12:0.155:82:38,6:29,6:0|1:75787218_T_A:75787218:29,41,8,4
chr3	75787264	.	CC	TG	.	.	DP=73;ECNT=32;MBQ=32,30;MFRL=126,133;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,16:0.227:73:27,2:24,8:0|1:75787222_A_G:75787222:22,35,4,12
chr3	75787265	.	C	G	.	.	DP=72;ECNT=32;MBQ=32,27;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,8:0.137:58:26,1:18,6:0|1:75787218_T_A:75787218:18,32,4,4
chr3	75787266	.	CCT	C	.	.	DP=74;ECNT=32;MBQ=32,32;MFRL=126,182;MMQ=60,58;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,9:0.132:74:27,3:30,4:0|1:75787199_A_C:75787199:24,41,2,7
chr3	75787269	.	G	T,A	.	.	DP=73;ECNT=32;MBQ=33,20,28;MFRL=128,125,182;MMQ=60,60,58;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=20.69,27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:57,7,9:0.105,0.132:73:31,1,4:22,4,4:19,38,6,10
chr3	75787276	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=32;MBQ=29,32;MFRL=136,120;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,14:0.191:75:31,4:27,8:0|1:75787222_A_G:75787222:24,37,3,11
chr3	75787279	.	A	T	.	.	DP=75;ECNT=32;MBQ=25,31;MFRL=132,136;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=116.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,31:0.416:75:22,8:15,22:0|1:75787279_A_T:75787279:16,28,10,21
chr3	75787288	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=32;MBQ=27,35;MFRL=126,136;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=101.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,27:0.412:66:23,4:12,16:0|1:75787279_A_T:75787279:15,24,6,21
chr3	75787298	.	TG	CG,CA	.	.	DP=63;ECNT=32;MBQ=28,30,32;MFRL=139,129,187;MMQ=60,49,53;MPOS=26,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=51.84,24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:40,15,8:0.242,0.136:63:21,3,1:13,11,5:18,22,6,17
chr3	75787302	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=32;MBQ=30,32;MFRL=136,188;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,7:0.125:62:29,1:22,6:0|1:75787199_A_C:75787199:20,35,4,3
chr3	75787304	.	AC	TT	.	.	DP=63;ECNT=32;MBQ=28,31;MFRL=154,129;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=59.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,17:0.281:62:23,4:18,9:0|1:75787240_A_G:75787240:21,24,4,13
chr3	75787313	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=32;MBQ=29,33;MFRL=150,186;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,5:0.105:55:20,0:21,5:0|1:75787199_A_C:75787199:21,29,2,3
chr3	75787317	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=32;MBQ=29,27;MFRL=153,140;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,10:0.203:52:21,1:19,8:0|1:75787317_T_A:75787317:20,22,2,8
chr3	75787321	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=32;MBQ=33,27;MFRL=150,186;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,5:0.113:51:22,0:19,5:0|1:75787199_A_C:75787199:21,25,2,3
chr3	75787347	.	TCCC	T	.	.	DP=49;ECNT=32;MBQ=30,29;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=C;STR;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,15:0.313:49:13,8:20,6:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:15,19,9,6
chr3	75787348	.	CCCCTG	C	.	.	DP=54;ECNT=32;MBQ=34,33;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,20:0.385:50:11,7:15,9:0|1:75787317_T_A:75787317:12,18,12,8
chr3	75787352	.	T	TA	.	.	DP=53;ECNT=32;MBQ=30,29;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,22:0.421:51:11,11:16,8:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:11,18,12,10
chr3	75787353	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=32;MBQ=34,31;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,22:0.413:52:11,11:17,8:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:12,18,12,10
chr3	75787372	.	A	T	.	.	DP=55;ECNT=32;MBQ=27,28;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=120.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,32:0.588:54:7,11:12,19:9,13,18,14
chr3	75787382	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=32;MBQ=30,30;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,10:0.190:56:18,4:26,6:26,20,3,7
chr3	75787405	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=32;MBQ=32,28;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=106.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,28:0.439:64:14,10:20,18:0|1:75787405_C_T:75787405:21,15,16,12
chr3	75787416	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=32;MBQ=33,26;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,9:0.155:62:21,2:27,7:31,22,5,4
chr3	75787424	.	C	G	.	.	DP=61;ECNT=32;MBQ=32,32;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,24:0.397:61:15,7:17,15:0|1:75787405_C_T:75787405:24,13,15,9
chr3	75787427	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=32;MBQ=27,32;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,22:0.377:59:18,6:16,16:0|1:75787405_C_T:75787405:23,14,15,7
chr3	75787455	.	A	G	.	.	DP=90;ECNT=14;MBQ=29,32;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,5:0.066:89:36,2:41,3:0|1:75787455_A_G:75787455:46,38,3,2
chr3	75787458	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=14;MBQ=32,30;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,17:0.198:87:34,6:34,9:34,36,11,6
chr3	75787462	.	GC	AT	.	.	DP=93;ECNT=14;MBQ=32,28;MFRL=149,132;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:89,4:0.053:93:37,2:43,2:0|1:75787455_A_G:75787455:45,44,2,2
chr3	75787464	.	C	T	.	.	DP=93;ECNT=14;MBQ=32,29;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=158.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,43:0.479:90:22,19:19,20:21,26,23,20
chr3	75787474	.	G	A	.	.	DP=96;ECNT=14;MBQ=33,27;MFRL=148,132;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,4:0.051:96:40,2:42,2:0|1:75787455_A_G:75787455:40,52,2,2
chr3	75787476	.	C	T,A	.	.	DP=95;ECNT=14;MBQ=32,32,27;MFRL=141,159,132;MMQ=60,60,53;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=73.44,9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:69,22,4:0.235,0.051:95:34,9,2:29,12,2:31,38,10,16
chr3	75787486	.	C	T	.	.	DP=88;ECNT=14;MBQ=32,31;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=157.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,43:0.489:88:22,20:20,22:15,30,18,25
chr3	75787490	.	A	T	.	.	DP=85;ECNT=14;MBQ=29,25;MFRL=149,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,4:0.057:85:39,2:40,2:0|1:75787455_A_G:75787455:27,54,1,3
chr3	75787511	.	C	A	.	.	DP=99;ECNT=14;MBQ=32,20;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:95,4:0.050:99:43,0:41,3:0|1:75787455_A_G:75787455:32,63,1,3
chr3	75787516	.	C	G	.	.	DP=99;ECNT=14;MBQ=32,34;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=157.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,43:0.465:94:23,22:27,18:0|1:75787516_C_G:75787516:22,29,13,30
chr3	75787519	.	CT	AG	.	.	DP=98;ECNT=14;MBQ=32,29;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=155.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,43:0.463:94:22,23:27,19:0|1:75787516_C_G:75787516:22,29,13,30
chr3	75787520	.	T	G	.	.	DP=98;ECNT=14;MBQ=30,31;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,8:0.142:58:23,2:25,6:0|1:75787455_A_G:75787455:21,29,1,7
chr3	75787576	.	A	G	.	.	DP=71;ECNT=14;MBQ=29,31;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,5:0.072:69:28,4:32,1:0|1:75787576_A_G:75787576:31,33,3,2
chr3	75787583	.	AC	GA	.	.	DP=61;ECNT=14;MBQ=28,33;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,4:0.081:60:23,3:28,1:0|1:75787576_A_G:75787576:28,28,2,2
chr3	75787620	.	T	C	.	.	DP=73;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,5:0.080:73:33,2:34,3:29,39,5,0
chr3	75787637	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=10;MBQ=33,27;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=147.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,40:0.553:72:12,19:18,15:0|1:75787637_C_T:75787637:13,19,22,18
chr3	75787645	.	GAA	G	.	.	DP=74;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=140.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,37:0.507:73:16,20:15,14:0|1:75787637_C_T:75787637:15,21,21,16
chr3	75787679	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=10;MBQ=27,33;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=113.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,31:0.508:61:13,17:13,13:0|1:75787679_T_C:75787679:14,16,21,10
chr3	75787688	.	T	A	.	.	DP=57;ECNT=10;MBQ=29,30;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=102.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,27:0.511:53:11,15:13,11:0|1:75787679_T_C:75787679:13,13,20,7
chr3	75787702	.	C	G	.	.	DP=61;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=175.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,45:0.745:60:8,26:6,17:8,7,30,15
chr3	75787726	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=10;MBQ=28,29;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=151.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,41:0.569:72:13,17:15,19:17,14,24,17
chr3	75787728	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=10;MBQ=31,28;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,17:0.239:73:28,7:26,9:33,23,8,9
chr3	75787732	.	A	C	.	.	DP=77;ECNT=10;MBQ=30,31;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,17:0.231:74:26,10:28,6:31,26,9,8
chr3	75787739	.	A	T	.	.	DP=81;ECNT=10;MBQ=28,30;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=265.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,68:0.862:78:4,34:6,31:7,3,32,36
chr3	75787770	.	C	T	.	.	DP=111;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,23:0.222:106:45,12:37,11:39,44,10,13
chr3	75787794	.	A	G	.	.	DP=108;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=339.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,88:0.840:104:9,45:6,38:4,12,36,52
chr3	75787801	.	TG	CA	.	.	DP=110;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=126.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,35:0.343:103:34,17:31,17:21,47,18,17
chr3	75787809	.	T	C	.	.	DP=105;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=145.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,42:0.409:103:30,19:29,21:21,40,20,22
chr3	75787812	.	C	CT	.	.	DP=103;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,9:0.098:100:44,6:44,3:37,54,2,7
chr3	75787840	.	C	A	.	.	DP=97;ECNT=10;MBQ=33,26;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,11:0.129:91:35,7:39,4:0|1:75787840_C_A:75787840:32,48,0,11
chr3	75787863	.	AT	TA	.	.	DP=74;ECNT=10;MBQ=28,28;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,5:0.080:73:27,3:35,2:0|1:75787840_C_A:75787840:24,44,0,5
chr3	75787869	.	CA	TG	.	.	DP=69;ECNT=10;MBQ=33,30;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=248.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,58:0.855:67:5,24:4,30:0|1:75787869_CA_TG:75787869:4,5,22,36
chr3	75787876	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=10;MBQ=33,30;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=221.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,52:0.841:61:5,21:4,26:0|1:75787869_CA_TG:75787869:3,6,17,35
chr3	75787880	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=10;MBQ=28,34;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,16:0.293:56:19,6:21,9:13,27,6,10
chr3	75787897	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=10;MBQ=30,29;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,27:0.517:52:15,10:10,14:7,18,5,22
chr3	75787927	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=149.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,38:0.750:50:10,16:2,17:0|1:75787927_A_G:75787927:7,5,14,24
chr3	75787949	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=10;MBQ=32,30;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=146.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,36:0.726:49:10,14:3,18:0|1:75787927_A_G:75787927:8,5,14,22
chr3	75787961	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=10;MBQ=29,32;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=45.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.312:46:22,5:10,7:23,9,3,11
chr3	75787962	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.426:47:13,13:14,6:12,15,15,5
chr3	75787996	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=195,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,24:0.556:44:8,15:12,9:0|1:75787996_C_T:75787996:9,11,19,5
chr3	75788010	.	A	C	.	.	DP=57;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=194.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,48:0.844:56:2,26:6,17:0|1:75787996_C_T:75787996:5,3,27,21
chr3	75788023	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=209.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,53:0.805:65:4,29:8,22:0|1:75787996_C_T:75787996:6,6,27,26
chr3	75788028	.	G	C	.	.	DP=64;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=149,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,11:0.186:60:25,5:23,6:0|1:75787996_C_T:75787996:22,27,5,6
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chr3	75788076	.	A	C	.	.	DP=63;ECNT=26;MBQ=28,32;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=174.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,46:0.784:58:5,23:7,20:6,6,21,25
chr3	75788085	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=26;MBQ=27,32;MFRL=171,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.061:64:26,2:27,1:26,35,3,0
chr3	75788088	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=26;MBQ=32,31;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,11:0.184:63:25,6:24,5:23,29,5,6
chr3	75788105	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=26;MBQ=33,28;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.081:60:26,2:27,1:28,28,4,0
chr3	75788109	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=26;MBQ=33,28;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,6:0.111:61:25,2:27,2:30,25,6,0
chr3	75788114	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=26;MBQ=32,28;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.092:63:26,3:29,1:31,27,5,0
chr3	75788115	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=26;MBQ=31,28;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=124.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,39:0.625:62:10,20:12,19:14,9,21,18
chr3	75788130	.	C	T,A	.	.	DP=65;ECNT=26;MBQ=32,28,29;MFRL=182,147,168;MMQ=60,60,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.04,78.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,5,23:0.088,0.365:63:13,3,11:18,1,12:19,16,20,8
chr3	75788137	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=26;MBQ=33,29;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,5:0.081:72:29,4:31,1:41,26,5,0
chr3	75788150	.	A	AG	.	.	DP=79;ECNT=26;MBQ=30,30;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=113.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,33:0.437:76:22,14:18,18:24,19,19,14
chr3	75788152	.	T	G,C	.	.	DP=79;ECNT=26;MBQ=27,32,32;MFRL=151,184,180;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=70.90,136.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,20,36:0.277,0.500:71:7,10,16:8,10,17:10,5,32,24
chr3	75788156	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=26;MBQ=33,28;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,20:0.269:76:26,10:25,10:36,20,10,10
chr3	75788165	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=26;MBQ=29,32;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=60.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,18:0.224:83:30,10:33,8:40,25,9,9
chr3	75788199	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=26;MBQ=27,30;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=118.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,42:0.537:78:22,20:14,21:15,21,22,20
chr3	75788217	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=26;MBQ=32,25;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,12:0.192:66:26,6:22,5:30,24,3,9
chr3	75788226	.	CA	AG,GG	.	.	DP=72;ECNT=26;MBQ=30,30,32;MFRL=162,160,159;MMQ=60,60,60;MPOS=17,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=185.40,52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,46,16:0.649,0.227:70:4,23,5:2,19,9:5,3,32,30
chr3	75788245	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=26;MBQ=33,28;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,14:0.208:70:27,3:26,11:28,28,5,9
chr3	75788258	.	C	A	.	.	DP=71;ECNT=26;MBQ=32,29;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=271.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,63:0.877:71:2,23:5,33:4,4,33,30
chr3	75788260	.	C	A	.	.	DP=73;ECNT=26;MBQ=33,30;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,7:0.108:72:20,3:35,3:31,34,2,5
chr3	75788270	.	A	T	.	.	DP=76;ECNT=26;MBQ=28,30;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,8:0.115:76:23,5:34,3:36,32,3,5
chr3	75788281	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=26;MBQ=27,31;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=278.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,65:0.857:75:0,25:8,33:3,7,32,33
chr3	75788291	.	AT	GA	.	.	DP=74;ECNT=26;MBQ=29,32;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=213.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,52:0.697:74:9,24:11,24:8,14,25,27
chr3	75788292	.	T	A	.	.	DP=72;ECNT=26;MBQ=30,28;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.388:21:2,6:9,2:3,10,4,4
chr3	75788294	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=26;MBQ=28,31;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,8:0.118:74:26,5:36,2:30,36,4,4
chr3	75788316	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=26;MBQ=32,30;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=163.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,46:0.595:77:15,20:15,24:11,20,21,25
chr3	75788363	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,6:0.088:77:31,1:37,5:29,42,2,4
chr3	75788366	.	C	A	.	.	DP=74;ECNT=13;MBQ=33,26;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,18:0.253:71:19,6:33,9:18,35,8,10
chr3	75788376	.	G	C,GTT	.	.	DP=60;ECNT=13;MBQ=33,30,33;MFRL=154,231,135;MMQ=60,60,60;MPOS=6,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.81,25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:41,3,8:0.063,0.165:52:18,2,3:18,1,5:10,31,3,8
chr3	75788382	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,8:0.160:54:20,3:22,5:0|1:75788382_C_T:75788382:10,36,2,6
chr3	75788390	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=26,34;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,8:0.167:52:25,3:18,5:0|1:75788382_C_T:75788382:7,37,1,7
chr3	75788394	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=13;MBQ=32,32;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,6:0.132:51:24,2:16,3:0|1:75788382_C_T:75788382:7,38,1,5
chr3	75788403	.	G	GT	.	.	DP=46;ECNT=13;MBQ=32,32;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.193:38:18,5:11,2:0,31,1,6
chr3	75788411	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=13;MBQ=32,32;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:21,3:12,1:1,33,0,4
chr3	75788432	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=31,25;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.164:32:12,3:14,1:1,26,0,5
chr3	75788434	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:8,9:8,8:1,15,0,17
chr3	75788484	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=13;MBQ=27,34;MFRL=183,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:1,4,0,2
chr3	75788506	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=36,35;MFRL=135,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr3	75788513	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=174,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	75790370	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=81.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,21:0.687:30:4,15:5,6:0|1:75790370_A_C:75790370:8,1,19,2
chr3	75790376	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=26,34;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,20:0.678:29:4,12:5,6:0|1:75790370_A_C:75790370:8,1,18,2
chr3	75790394	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=12;MBQ=34,33;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,7:0.186:41:22,2:10,3:0|1:75790394_C_G:75790394:27,7,6,1
chr3	75790406	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=12;MBQ=34,33;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=126.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,32:0.600:53:12,21:9,10:18,3,22,10
chr3	75790409	.	TG	CA	.	.	DP=58;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=174.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,42:0.768:54:7,25:5,15:10,2,31,11
chr3	75790419	.	TG	CA	.	.	DP=58;ECNT=12;MBQ=29,33;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,11:0.200:58:29,6:16,4:0|1:75790394_C_G:75790394:34,13,9,2
chr3	75790427	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=12;MBQ=32,29;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,11:0.171:68:29,6:21,5:0|1:75790394_C_G:75790394:36,21,9,2
chr3	75790446	.	GG	TA	.	.	DP=85;ECNT=12;MBQ=32,25;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,25:0.303:84:33,8:22,15:0|1:75790446_GG_TA:75790446:34,25,14,11
chr3	75790448	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,11:0.145:81:32,6:31,5:0|1:75790394_C_G:75790394:38,32,8,3
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chr3	75790527	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,14:0.278:52:23,5:14,9:8,30,2,12
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chr3	75790554	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=9;MBQ=35,30;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.600:38:5,13:10,10:1,14,2,21
chr3	75790583	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=110.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,27:0.769:35:4,10:4,15:0|1:75790583_G_A:75790583:1,7,3,24
chr3	75790585	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=107.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,26:0.741:35:4,10:3,14:0|1:75790583_G_A:75790583:1,8,3,23
chr3	75790607	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=34,28;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=86.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,21:0.759:27:3,7:3,11:0|1:75790583_G_A:75790583:2,4,3,18
chr3	75790668	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=32,24;MFRL=207,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:8,1:4,3:12,1,4,0
chr3	75790704	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=10;MBQ=32,27;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.480:48:11,13:14,9:24,1,22,1
chr3	75790705	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=10;MBQ=33,26;MFRL=195,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.120:48:22,2:19,3:0|1:75790705_C_T:75790705:41,2,5,0
chr3	75790717	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=147.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,37:0.603:61:9,19:11,16:0|1:75790717_G_A:75790717:22,2,35,2
chr3	75790724	.	A	T	.	.	DP=72;ECNT=10;MBQ=31,27;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,25:0.351:72:24,16:19,9:40,7,23,2
chr3	75790726	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=10;MBQ=25,33;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=198.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,49:0.641:76:12,29:12,19:0|1:75790717_G_A:75790717:23,4,43,6
chr3	75790730	.	A	T	.	.	DP=78;ECNT=10;MBQ=31,27;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=202.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,50:0.638:78:12,31:13,19:0|1:75790717_G_A:75790717:24,4,44,6
chr3	75790733	.	C	G	.	.	DP=78;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,15:0.200:78:31,8:25,7:0|1:75790705_C_T:75790705:56,7,12,3
chr3	75790747	.	C	G	.	.	DP=72;ECNT=10;MBQ=32,34;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=172.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,44:0.625:70:13,27:12,16:0|1:75790717_G_A:75790717:22,4,37,7
chr3	75790822	.	A	G	.	.	DP=98;ECNT=10;MBQ=29,28;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,14:0.267:53:18,6:20,7:18,21,9,5
chr3	75790972	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:5,5:17,2:11,12,1,6
chr3	77147112	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:7,0,5,0
chr3	77607070	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,1:1,2:1,0,4,1
chr3	77645946	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=204,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.521:8:0,1:3,2:0,4,0,4
chr3	77645984	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr3	77695058	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:6,3:10,0:17,0,3,0
chr3	78649387	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,3:9,0:8,9,0,3
chr3	78663958	.	GAA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=210,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,0:0,0:1,9,0,2
chr3	78664011	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=191,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr3	78676405	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr3	78676467	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=86.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,17,9
chr3	78695353	.	GA	G,GAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,30,30;MFRL=152,169,167;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=4.14,5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,4,3:0.127,0.116:31:6,1,2:14,3,0:3,21,2,5
chr3	78709044	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	81584268	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	81643271	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	81754629	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.087:54:23,4:27,0:23,27,2,2
chr3	81810702	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=47.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr3	81810725	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=206,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr3	85984830	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=118.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.945:33:1,18:0,14:1,0,32,0
chr3	87027886	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.316:8:2,1:1,0:2,3,1,2
chr3	87313353	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr3	88042990	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,0,14
chr3	88188420	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,12:0,0,20,6
chr3	88189341	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,9,8
chr3	88199179	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=150.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,26:0,19:0,0,24,22
chr3	88199185	.	T	TC	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=107.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,24:0,15:0,0,17,23
chr3	89390289	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,0:0,1:0|1:89390289_G_T:89390289:0,0,0,1
chr3	89390295	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89390289_G_T:89390289:0,0,0,1
chr3	89390296	.	T	TAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89390289_G_T:89390289:0,0,0,1
chr3	89390298	.	T	TCTGCCATA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89390289_G_T:89390289:0,0,0,1
chr3	89456555	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,3,14
chr3	89462238	.	ATTGT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=123,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGT;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr3	89462464	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:2,7,0,2
chr3	89478341	.	A	AATTGCATGTAAAAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	89480265	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr3	89498619	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	89521602	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,10:0,0,9,3
chr3	89528461	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=188,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr3	89528477	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	93605126	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:12,6:10,8:19,3,13,1
chr3	93754080	.	CAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,208;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr3	93754286	.	GT	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.385:18:8,3:1,3:4,7,3,4
chr3	93768347	.	A	C	.	.	DP=95;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,13:0.135:92:40,0:37,0:0|1:93768347_A_C:93768347:2,77,13,0
chr3	93768353	.	A	C	.	.	DP=93;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,12:0.128:92:33,5:38,2:0|1:93768347_A_C:93768347:3,77,12,0
chr3	93768359	.	T	A	.	.	DP=84;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,9:0.112:83:30,0:38,0:0|1:93768347_A_C:93768347:2,72,9,0
chr3	93768362	.	TC	AA	.	.	DP=78;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,4:0.057:77:31,0:37,0:0|1:93768347_A_C:93768347:2,71,4,0
chr3	93768420	.	GA	G,CA	.	.	DP=70;ECNT=5;MBQ=16,16,19;MFRL=154,135,239;MMQ=60,60,60;MPOS=29,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.72,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,5,4:0.102,0.093:40:2,1,0:2,0,1:0,31,0,9
chr3	93813171	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:7,4:10,4:5,12,2,6
chr3	97194270	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=122,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:12,0:9,2:12,10,0,2
chr3	97198112	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=176,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr3	97367230	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr3	97466432	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.458:24:7,5:6,5:3,10,2,9
chr3	97467361	.	ATCTC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=141,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TC;STR;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:3,4:1,4:4,0,8,0
chr3	97666183	.	TCTC	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTC;STR;TLOD=137.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.973:32:0,17:0,15:0,0,24,8
chr3	97680422	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:8,1,4,3
chr3	97727727	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr3	97727753	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,15,5
chr3	97731434	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=55.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.916:21:1,7:0,13:0,1,1,19
chr3	97753931	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	97806305	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,22:0.588:37:7,12:8,9:6,9,11,11
chr3	97806999	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	97868174	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=212,199;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,5,1
chr3	97868477	.	TC	AT	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=177.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,45:0.622:72:13,18:13,27:9,18,8,37
chr3	97887495	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=212,243;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:4,0,5,0
chr3	97887843	.	AT	A	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=70.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,29:0.458:64:13,14:21,13:17,18,14,15
chr3	97887865	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,35:0.553:63:10,18:18,16:13,15,17,18
chr3	97983487	.	TTGTAACCAC	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTAACCAC;STR;TLOD=154.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.976:35:0,18:0,17:0,0,15,20
chr3	97983602	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,202;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,2:6,1:11,7,2,1
chr3	98073591	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr3	98110406	.	G	GA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=86.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.945:33:0,14:1,18:1,0,18,14
chr3	98235553	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=119.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,43:0.639:67:11,18:12,24:16,8,23,20
chr3	98251485	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.077:63:27,0:29,4:27,32,0,4
chr3	98309955	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,4:0.060:81:38,4:38,0:29,48,1,3
chr3	98489686	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.337:25:6,3:9,5:13,4,6,2
chr3	98491619	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.461:50:15,9:12,14:22,5,21,2
chr3	98503776	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,16:0.361:45:10,7:19,9:20,9,11,5
chr3	98503941	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,3:10,2:0,16,0,5
chr3	98510625	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:4,9:5,4:10,0,11,2
chr3	98518160	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=170,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:1,0,9,0
chr3	98518691	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.433:30:9,5:8,7:3,14,5,8
chr3	98520387	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr3	98520602	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=210,191;MMQ=40,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,2:3,0:0,7,0,2
chr3	98520603	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=200,228;MMQ=40,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr3	98531342	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:5,5:9,5:3,11,1,9
chr3	98536571	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=188,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,3:4,4:9,1,7,0
chr3	98538066	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=158,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,33:0.608:54:9,17:12,16:16,5,26,7
chr3	98541012	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr3	98544123	.	CAAAA	C,CA,CAA,CAAA,CAAAAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,31,33,32,33,32;MFRL=146,167,175,240,133,0;MMQ=60,60,60,60,60,60;MPOS=8,25,32,22,10;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,12,13,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=5.27,11.20,3.39,21.05,4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4/5:15,4,6,3,12,5:0.081,0.128,0.071,0.249,0.116:45:8,3,4,2,5,3:6,1,2,1,6,2:15,0,29,1
chr3	99536937	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr3	100015146	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,12:0.366:33:10,8:11,3:0|1:100015146_G_T:100015146:1,20,1,11
chr3	100015166	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:5,8:8,2:0|1:100015146_G_T:100015146:0,14,0,10
chr3	100016726	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,4:4,1:8,1,5,0
chr3	100034849	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=184,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr3	100053684	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr3	100086861	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=91.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,12:0,13:0,0,19,7
chr3	100092526	.	A	AG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=87.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,24:0.927:25:1,10:0,13:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,1,0,24
chr3	100092528	.	T	TGCA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,10:0,12:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,0,0,27
chr3	100105214	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,100;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,0:13,2:3,26,0,2
chr3	100170600	.	A	ATCCTAGAAGGCATTCTCATGAGGACCAGGAATTCCGATGCCGATCGTCTGACCGTCT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.530:20:7,0:5,2:8,5,3,4
chr3	100170825	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,1:1,4:0,4,0,5
chr3	100352043	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.518:31:6,6:8,10:15,0,16,0
chr3	100354683	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:6,4:6,2:1,12,0,6
chr3	100354698	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr3	100368475	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,2:5,2:13,1,3,1
chr3	100368692	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr3	100378512	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:1,0:7,0,2,0
chr3	100387709	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr3	100432752	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr3	100438784	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,23:0.332:70:25,12:21,11:45,2,23,0
chr3	100438797	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=32,32,34,35;MFRL=155,212,128,154;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,14,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.81,7.91,11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:54,4,9,9:0.058,0.099,0.128:76:26,2,5,6:28,2,3,2:45,9,20,2
chr3	100455401	.	CT	C	.	.	DP=145;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:121,6:0.044:127:50,5:69,1:76,45,4,2
chr3	100455609	.	TG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:4,3:10,11:0,14,0,14
chr3	100463651	.	TTG	T	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,4:0.066:72:30,2:23,2:55,13,4,0
chr3	100470579	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,0:6,4:0,9,0,4
chr3	100515197	.	A	AT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:16,1:18,2:31,4,3,0
chr3	100569452	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,1:8,3:13,2,3,1
chr3	100570787	.	TAA	T,TA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28,29;MFRL=207,195,144;MMQ=60,60,60;MPOS=15,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.13,4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.245,0.462:4:0,1,2:1,0,0:0,1,1,2
chr3	100570887	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100570887_A_T:100570887:0,0,0,1
chr3	100570888	.	G	GAAACACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100570887_A_T:100570887:0,0,0,1
chr3	100581261	.	AT	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.319:26:4,3:5,3:5,13,1,7
chr3	100583651	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.754:18:0,8:1,5:1,3,11,3
chr3	100585694	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:2,5:11,9:11,3,12,2
chr3	100594326	.	CGGCATA	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.501:30:9,7:6,8:6,9,9,6
chr3	100605043	.	C	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.096:60:29,5:25,0:35,20,5,0
chr3	100605206	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:0,7:2,6:0,2,0,13
chr3	100621426	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr3	100948150	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=13,13;MFRL=64,264;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:100948150_A_C:100948150:2,0,2,0
chr3	100948154	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=149,264;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:2,0:0|1:100948150_A_C:100948150:4,0,2,0
chr3	100948157	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=169,264;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:1,0:0|1:100948150_A_C:100948150:3,0,2,0
chr3	100948162	.	C	CCCGG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=169,183;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:100948150_A_C:100948150:3,0,1,0
chr3	100948163	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,17;MFRL=169,183;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:100948150_A_C:100948150:3,0,1,0
chr3	100948166	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=194,183;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:100948150_A_C:100948150:4,0,1,0
chr3	100972490	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:12,3,3,0
chr3	101038363	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:1,2:3,0,2,0
chr3	101039107	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=129.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,40:0.651:61:11,24:10,16:17,4,33,7
chr3	101046671	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.517:29:10,8:4,7:1,13,4,11
chr3	101051794	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,25:0.744:33:5,15:3,10:0,8,2,23
chr3	101060716	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.634:17:1,6:5,4:1,5,2,9
chr3	101066964	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.374:12:6,2:1,2:0,8,0,4
chr3	101083680	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.522:36:6,12:11,5:12,5,16,3
chr3	101085208	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,2:8,0:9,0,2,0
chr3	101136340	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=200,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	101136385	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,5,1
chr3	101177901	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.364:17:5,4:6,2:1,10,0,6
chr3	101212889	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:0,8,0,4
chr3	101219818	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.584:27:7,7:4,8:11,0,16,0
chr3	101219889	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,29:0.534:54:11,16:14,12:15,10,14,15
chr3	101231871	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:5,6:10,3:13,2,10,1
chr3	101232057	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.655:9:2,0:0,5:3,0,2,4
chr3	101232093	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	101284735	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:12,3:17,0:10,19,3,0
chr3	101285163	.	A	ACGTGTCTGGCTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=221,277;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr3	101370545	.	A	AAGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=219,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.337:4:3,0:0,1:1,2,0,1
chr3	101371433	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=145,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.059:48:21,1:25,1:16,30,0,2
chr3	101373480	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:9,1:3,3:12,0,4,0
chr3	101383321	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,8:5,7:10,0,15,0
chr3	101383562	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.523:46:14,15:7,9:6,16,3,21
chr3	101383800	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,27:0.518:52:10,18:15,9:18,7,18,9
chr3	101399910	.	GAA	G,GA	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=32,33,35;MFRL=145,174,158;MMQ=60,60,60;MPOS=10,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=4.40,10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:40,3,8:0.066,0.163:51:21,2,5:13,1,3:36,4,11,0
chr3	101400167	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:7,12:10,13:2,15,0,25
chr3	101443461	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=124.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,18:0,0,34,0
chr3	101446207	.	AAT	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=133.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,36:0.699:51:7,17:7,18:13,2,31,5
chr3	101504624	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr3	101540149	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,1:3,9:8,0,10,0
chr3	101573345	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.376:11:4,3:3,1:0|1:101573345_A_AT:101573345:7,0,4,0
chr3	101573361	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=17,28;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.267:16:3,1:1,1:0|1:101573345_A_AT:101573345:10,2,4,0
chr3	101574503	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr3	101574742	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.064:45:22,1:17,0:10,33,1,1
chr3	101575882	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr3	101576029	.	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=230.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,20:0,18:0,0,16,36
chr3	101576404	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	102189236	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:12,4:7,0:20,0,4,0
chr3	105238890	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=106.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.970:30:0,15:0,11:0|1:105238890_CT_C:105238890:0,0,21,9
chr3	105238901	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,24:0.649:36:8,11:4,7:0|1:105238890_CT_C:105238890:9,3,15,9
chr3	105252377	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:7,0,6,0
chr3	105252639	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr3	105412286	.	C	CTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=121.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,13:0,12:0,0,28,0
chr3	105423088	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,7:0,12:0,0,0,19
chr3	105438806	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	105452751	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr3	105453034	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,3,17
chr3	105455955	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,13:0,0,18,3
chr3	105495432	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr3	105572324	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=153,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,5:0.081:71:31,0:33,5:26,40,0,5
chr3	105588069	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,10:0,0,16,0
chr3	107451907	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,5:0,19:0,0,3,21
chr3	107510032	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,1:11,1:18,2,2,0
chr3	107510197	.	A	ATAAG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAG;STR;TLOD=64.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.620:27:5,7:5,9:1,9,0,17
chr3	107519843	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	107770938	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,0,27
chr3	107776511	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=98.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,1,27
chr3	107882643	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=121.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,22:0,18:0,0,1,39
chr3	107884211	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=53.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,10:0,4:0,0,14,0
chr3	107910327	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33,35;MFRL=182,128,138;MMQ=60,60,60;MPOS=10,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,16;RU=T;STR;TLOD=3.10,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,2:0.224,0.189:12:3,3,1:4,0,0:6,1,4,1
chr3	107937286	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	107937571	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,0,25
chr3	107938240	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=135.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,13:0,25:0,0,32,7
chr3	108070556	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr3	108072243	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr3	108072288	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:6,0,6,0
chr3	108072298	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,3:0,0,11,0
chr3	108072704	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr3	108096227	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=155.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,19:0,23:0,0,1,41
chr3	108102585	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=74,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr3	108103433	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr3	108135606	.	TAA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=81.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,19:0.912:20:0,8:0,11:0|1:108135606_TAA_T:108135606:0,1,18,1
chr3	108135609	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,19:0.913:20:0,8:1,11:0|1:108135606_TAA_T:108135606:0,1,18,1
chr3	108135799	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:5,11:10,10:2,13,5,16
chr3	108147295	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,4:0,0,16,1
chr3	108156633	.	A	AAAAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=200,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAG;STR;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr3	108158574	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:5,5:5,1:7,3,5,1
chr3	108172817	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.358:17:5,3:6,2:9,2,5,1
chr3	108174537	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=122,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.379:35:11,9:11,4:18,4,11,2
chr3	108175734	.	GA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:6,2:9,1:8,11,1,2
chr3	108179063	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,3:6,7:12,0,10,0
chr3	108179219	.	CAA	C,CA	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=33,34,33;MFRL=149,136,144;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=11.46,60.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,8,29:0.175,0.626:46:5,2,9:1,5,13:1,8,4,33
chr3	108189627	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.382:40:12,8:12,7:13,12,9,6
chr3	108189750	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr3	108211869	.	A	AAAGG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAGG;STR;TLOD=85.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.961:20:0,7:0,8:0,0,20,0
chr3	108214537	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr3	108216807	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:4,2:4,2:8,0,5,0
chr3	108224685	.	CA	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.456:22:0,3:9,4:0,12,2,8
chr3	108272414	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,1:1,0,4,0
chr3	108276264	.	C	CA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:7,1:12,2:2,20,0,3
chr3	108285518	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:3,2:6,6:0,10,1,7
chr3	108295067	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.524:36:11,10:6,8:15,2,18,1
chr3	108324337	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=162,179;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:0,15,0,2
chr3	108324365	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:2,3:3,2:0,5,0,6
chr3	108324394	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=217,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr3	108327050	.	T	TAAC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=91.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,1,20
chr3	108330036	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,109;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.059:65:32,3:30,0:34,28,3,0
chr3	108343275	.	AT	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.074:51:25,1:20,2:27,21,2,1
chr3	108344636	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr3	108347811	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:5,0,5,0
chr3	108355423	.	AT	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=116.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,17:0,20:0,0,37,1
chr3	108355575	.	CTT	C,CT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,35,32;MFRL=133,170,176;MMQ=60,60,60;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=5.42,70.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,28:0.130,0.788:36:2,1,14:1,3,12:1,2,5,28
chr3	108356501	.	T	TTTAAGGTAGTA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,8:0,9:0,0,0,17
chr3	108366978	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.751:26:3,9:3,11:1,5,2,18
chr3	108394771	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,5:6,3:1,11,0,8
chr3	108403019	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.427:19:6,2:4,5:8,3,8,0
chr3	108474524	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.251:26:13,2:6,4:19,1,6,0
chr3	108475974	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=122,155;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,30:0.690:43:7,16:6,14:11,2,23,7
chr3	108475993	.	G	GGGGGATTA	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGATTA;STR;TLOD=71.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.472:40:10,8:10,8:13,8,14,5
chr3	108565815	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	108634973	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.362:23:9,3:5,5:9,6,6,2
chr3	108672336	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.392:13:4,3:2,2:7,1,5,0
chr3	108705702	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,22:0.590:37:6,14:9,8:15,0,20,2
chr3	108705715	.	A	AT	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=202,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=107.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,40:0.934:42:2,21:0,17:2,0,35,5
chr3	108754320	.	T	TAA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,8:0,2:0,0,0,13
chr3	108754346	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,5:0,3:0,1,0,8
chr3	108776343	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,12:0,0,4,25
chr3	108788461	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:0,2:9,3:9,0,5,0
chr3	108836816	.	GA	CC	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.176:30:11,0:9,0:0|1:108836816_GA_CC:108836816:14,11,5,0
chr3	108836822	.	GA	CC	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.120:36:12,0:7,0:0|1:108836816_GA_CC:108836816:17,15,4,0
chr3	108836828	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.097:44:17,0:14,0:0|1:108836816_GA_CC:108836816:21,19,4,0
chr3	109019410	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=155,193;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,0:1,2:0,5,0,2
chr3	109027157	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,3,10
chr3	109027820	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:0,4:2,4:1,1,7,1
chr3	109049720	.	C	CTAAGGGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=128,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,1:0,2,0,5
chr3	109052732	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:4,4:3,10:6,1,10,4
chr3	109052934	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=108,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr3	110791113	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	111260975	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	111261045	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,6:3,6:6,1,9,3
chr3	111261242	.	G	GCTGCTGAAATTGATCACCA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGCTGAAATTGATCACCA;STR;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,0:0,6:0,0,0,8
chr3	111263826	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,5:5,2:10,0,7,0
chr3	111313717	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,34:0.468:73:17,15:20,19:19,20,15,19
chr3	111316886	.	C	CTTATG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=199,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,3:0,0:3,0,4,0
chr3	111602828	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=203,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr3	111637904	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=154.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.980:49:0,28:0,19:0,0,38,11
chr3	111638132	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.959:20:0,8:0,11:0,0,0,20
chr3	111639353	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	111651285	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:9,7:11,9:3,17,3,13
chr3	111658486	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr3	111659377	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=152.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,18:0,23:0,0,33,8
chr3	111692693	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,26:0.381:69:23,12:19,13:10,33,7,19
chr3	111697867	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:7,1,3,1
chr3	111705275	.	G	GTTTGT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTGT;STR;TLOD=42.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.938:11:0,6:0,2:0,0,0,11
chr3	111710140	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=208,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr3	111710201	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,9:5,6:9,1,15,0
chr3	111710206	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.409:27:9,6:7,4:16,0,9,2
chr3	111710398	.	A	G	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,26:0.334:79:22,9:30,17:23,30,10,16
chr3	111718507	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.610:19:3,4:4,5:0,7,0,12
chr3	111719879	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	111760771	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=97.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,16:0,11:0,0,24,3
chr3	111763278	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	111766559	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,15,2
chr3	111785208	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=197,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,1:1,7:3,0,8,0
chr3	111793316	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:8,11:7,9:0,15,1,19
chr3	111794365	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=129.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,40:0.789:50:3,24:7,16:2,8,6,34
chr3	111805438	.	G	GT	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=332.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,90:0.990:90:0,44:0,46:0,0,2,88
chr3	111828384	.	G	GT	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,23:0.323:71:19,16:27,6:29,19,10,13
chr3	111828476	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,15:0.296:52:21,8:16,7:2,35,1,14
chr3	111831723	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.334:27:5,4:8,4:9,9,8,1
chr3	111849219	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,3:9,0:19,0,3,0
chr3	111851817	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,5:6,5:10,0,8,2
chr3	111851890	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=88.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,28:0.604:46:9,10:9,17:7,11,18,10
chr3	111860222	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=185,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:4,6:5,8:0,9,0,14
chr3	111873902	.	TA	T,TAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28,27;MFRL=164,184,128;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.32,21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,10:0.175,0.649:14:0,2,2:2,0,4:0,2,1,11
chr3	111887792	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:9,10:3,7:8,4,6,11
chr3	111923047	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,14,3
chr3	111936200	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr3	111936491	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	111950367	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,1:7,4:1,9,0,5
chr3	111958679	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:3,8:5,4:7,1,10,2
chr3	111958862	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:7,5:5,6:0,12,2,9
chr3	111962774	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,3:1,5:3,0,8,0
chr3	111981696	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=210,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:0|1:111981696_CA_C:111981696:3,0,4,0
chr3	111981704	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=210,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:0|1:111981696_CA_C:111981696:3,0,7,0
chr3	111983197	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=123.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,44:0.642:68:9,15:15,28:4,20,6,38
chr3	111985048	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=107.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,37:0.576:64:16,20:10,17:21,6,28,9
chr3	111988992	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:1,1,0,5
chr3	111993716	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,26,1
chr3	111993915	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.516:31:8,6:7,10:3,12,1,15
chr3	111996726	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.382:37:9,7:13,6:4,19,1,13
chr3	112005691	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,1:8,5:1,13,1,5
chr3	112052173	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr3	112054727	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=167,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:11,0,2,0
chr3	112066360	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:9,0,5,0
chr3	112184927	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,16,2
chr3	112198491	.	A	C	.	.	DP=126;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,3:0.034:114:49,0:62,3:66,45,0,3
chr3	112253058	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.490:22:6,7:5,4:8,3,10,1
chr3	112253193	.	C	CA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=127,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.307:25:5,2:10,2:4,14,0,7
chr3	112255507	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,5:4,5:0,7,1,9
chr3	112260571	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	112262859	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,26:0.483:54:15,13:13,13:16,12,19,7
chr3	112267345	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=59.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.796:23:2,9:1,10:2,2,14,5
chr3	112267523	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:3,1:7,7:0,10,0,9
chr3	112280218	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=203,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr3	112289320	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,2:5,1:10,1,3,0
chr3	112289372	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:7,6:6,5:10,4,10,1
chr3	112289576	.	A	ATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:0,2:6,2:0,6,0,5
chr3	112299710	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:3,3:11,8:4,10,3,8
chr3	112300191	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,2:3,4:1,8,0,6
chr3	112301458	.	C	CCTTAGTAAT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=124.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,14:0,9:0,0,25,3
chr3	112338027	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	112349216	.	CTGCA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr3	112538571	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.611:21:4,6:3,7:8,0,11,2
chr3	112538760	.	G	GAGGGAGAGAGAGAAACAAACAGGGAGGGAGAGAGAGAGA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.096:32:14,2:11,0:0|1:112538760_G_GAGGGAGAGAGAGAAACAAACAGGGAGGGAGAGAGAGAGA:112538760:1,29,0,2
chr3	112538762	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=149,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.096:32:14,2:10,0:0|1:112538760_G_GAGGGAGAGAGAGAAACAAACAGGGAGGGAGAGAGAGAGA:112538760:1,29,0,2
chr3	112545910	.	GT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,6:7,3:1,13,7,3
chr3	112546107	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=173,249;MMQ=56,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr3	112647944	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=183,174;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:4,1:9,1:9,4,1,1
chr3	112693652	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:6,5:9,8:9,6,8,5
chr3	112693753	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:3,5:1,3,0,6
chr3	112709828	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:6,6:0,4:6,0,10,1
chr3	112710242	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,26:0.565:46:7,16:12,10:0,20,0,26
chr3	112719791	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.515:10:2,0:2,2:1,4,0,5
chr3	112729804	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:17,1,2,0
chr3	112732309	.	GT	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.743:21:0,4:2,9:0,5,0,16
chr3	112738288	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=26,13;MFRL=181,231;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:1,0:0|1:112738288_G_C:112738288:5,0,2,0
chr3	112738296	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,18;MFRL=181,231;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,0:2,0:0|1:112738288_G_C:112738288:7,0,2,0
chr3	112738299	.	TC	GG	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=25,16;MFRL=192,231;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:2,0:0|1:112738288_G_C:112738288:8,0,2,0
chr3	112738305	.	TA	GT	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=25,18;MFRL=183,231;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,0:4,0:0|1:112738288_G_C:112738288:10,0,2,0
chr3	112738309	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=28,13;MFRL=202,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.425:12:2,0:2,0:7,0,5,0
chr3	112738318	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,3:1,4:4,0,11,0
chr3	112987112	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,5:4,0:9,3,5,0
chr3	112991196	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=235,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr3	112993525	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.132:20:13,0:5,2:3,15,1,1
chr3	113119301	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=197,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr3	113138763	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=198,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr3	113164077	.	AT	GG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=162,141;MMQ=60,51;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:3,3:15,0:18,0,3,0
chr3	113164109	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:7,5:14,3:18,3,8,0
chr3	113169372	.	GAAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=16,25;MFRL=185,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=A;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:1,0:0,1:0,10,0,2
chr3	113175944	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:6,1:2,2:7,1,3,0
chr3	113207758	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=190,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:2,1:8,2:9,1,4,0
chr3	113211957	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=164,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,1:5,3:5,2,4,0
chr3	113212041	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=138,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:9,1:12,8:16,5,9,0
chr3	113218206	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr3	113222099	.	T	TA	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.168:32:17,3:10,0:1,26,0,5
chr3	113285185	.	TTG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=TG;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.339:10:0,1:4,2:7,0,3,0
chr3	113300183	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=153,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:4,3,2,0
chr3	113375077	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,6:8,2:9,7,4,4
chr3	113376110	.	TTGCTGCTGC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=184,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=TGC;STR;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.496:16:4,4:2,4:5,3,2,6
chr3	113380332	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=198,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr3	113442198	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,1:2,6:3,0,7,0
chr3	113442784	.	CA	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:16,1:15,5:27,4,5,1
chr3	113464859	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.486:27:9,8:4,5:6,8,2,11
chr3	113497507	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=204,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,5:3,7:6,0,12,0
chr3	113503354	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=206,248;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:1,3,0,4
chr3	113507478	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr3	113508499	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.664:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr3	113513680	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=185,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:9,0,2,0
chr3	113513890	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:22,2:19,1:25,18,2,1
chr3	113522544	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,27:0.596:45:6,14:12,13:6,12,4,23
chr3	113557787	.	AGCC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,0:0,6:0,0,3,4
chr3	113595156	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=151.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,18:0,22:0,0,0,40
chr3	113619872	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=72.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,14:0,9:0,0,20,3
chr3	113620056	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:2,0:12,4:0,14,0,4
chr3	113656833	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,221;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr3	113664183	.	CAG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:11,1:2,4:13,0,5,0
chr3	113667735	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:33,0:19,3:20,32,0,3
chr3	113720624	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.926:11:0,5:0,4:0,0,0,11
chr3	113784007	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=268,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr3	113795834	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,1:9,3:1,14,0,4
chr3	113858350	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,11,5
chr3	113955055	.	GAA	G,GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29,27;MFRL=174,195,138;MMQ=60,60,60;MPOS=7,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=7.25,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,3:0.425,0.330:9:2,1,1:0,2,1:2,0,5,2
chr3	113955164	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.590:22:6,7:2,6:5,4,0,13
chr3	114014726	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,1:7,1:1,10,0,2
chr3	115529068	.	ATC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=197,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TC;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,1:5,1:13,0,2,0
chr3	116163634	.	GAC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.736:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	118621833	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.468:24:4,8:7,3:0,13,0,11
chr3	118623414	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.636:36:7,12:5,11:11,2,22,1
chr3	118624631	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:0,0:3,3:1,3,0,3
chr3	118645113	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=78,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0|1:118645113_G_C:118645113:2,3,1,3
chr3	118645118	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=78,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:4,2:1,1:0|1:118645113_G_C:118645113:2,4,1,3
chr3	118648879	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.792:17:1,6:2,8:3,0,14,0
chr3	118753542	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=196,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr3	118864997	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,10;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:1,1:3,2:3,1,6,1
chr3	118866515	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	118870025	.	A	AC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,8:0,0,12,6
chr3	118906556	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,0:0,0:0|1:118906556_C_G:118906556:0,0,2,0
chr3	118906560	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,19;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.611:3:0,0:1,1:0|1:118906556_C_G:118906556:0,1,2,0
chr3	118909962	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,12:0,0,6,19
chr3	118909987	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,9:0,4:0,0,1,12
chr3	118913054	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.364:34:8,7:12,5:12,10,9,3
chr3	118922654	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=62,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,5:0,3:2,0,8,0
chr3	118931389	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,5:7,7:10,4,10,2
chr3	118935284	.	CACGCACAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	118948647	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:12,0,2,0
chr3	119013928	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr3	119120577	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.495:23:8,6:3,5:12,0,11,0
chr3	119128398	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,26:0.397:66:17,12:23,13:21,19,11,15
chr3	119128628	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=83.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,26:0.599:43:7,11:10,14:3,14,1,25
chr3	119128634	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=114.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,29:0.667:43:5,13:9,14:3,11,1,28
chr3	119128712	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr3	119133122	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:7,2:0|1:119133122_A_T:119133122:10,7,0,2
chr3	119133128	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:119133122_A_T:119133122:11,7,0,2
chr3	119150836	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,19:0.351:55:12,12:23,7:25,11,16,3
chr3	119171280	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=180.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,26:0,23:0,0,31,19
chr3	119196233	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:17,3:22,0:12,28,2,1
chr3	119196334	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,0,13
chr3	119198873	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=114.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,20:0,14:0,0,24,11
chr3	119204063	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=237,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:1,4:4,4:5,0,8,0
chr3	119222456	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:8,4:9,7:4,13,5,6
chr3	119235977	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,0:0,3:1,0,4,0
chr3	119236017	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:3,4:1,8:4,0,9,3
chr3	119256056	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,10:0.344:30:13,6:7,4:0|1:119256056_T_C:119256056:10,10,5,5
chr3	119256058	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,2:0.091:31:20,0:8,2:1|0:119256056_T_C:119256056:14,15,1,1
chr3	119256059	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=151,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,2:0.094:30:20,0:8,2:1|0:119256056_T_C:119256056:14,14,1,1
chr3	119305075	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.496:48:18,11:6,11:20,4,21,3
chr3	119348130	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,3:1,0,4,2
chr3	119361250	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,18,3
chr3	119373257	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr3	119373301	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr3	119373315	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr3	119394168	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	119501580	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,4:9,4:14,4,7,1
chr3	119501780	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,1,15
chr3	119501798	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr3	119528812	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,0:13,2:23,0,2,0
chr3	119529113	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=270,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,1:1,2:0,2,0,4
chr3	119533733	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=181,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr3	119533773	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,2:1,4:3,0,6,0
chr3	119666266	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	119900212	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.502:18:3,5:6,4:3,6,2,7
chr3	119900260	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr3	119904125	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,5:0,0,13,2
chr3	119904315	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	119905641	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr3	119912297	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:9,8:9,8:3,15,3,13
chr3	119962797	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.307:16:1,1:6,0:8,3,5,0
chr3	120050209	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,176;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,5:0.079:74:40,0:27,4:0|1:120050209_G_A:120050209:18,51,0,5
chr3	120050213	.	TC	GT	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=147,176;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,5:0.079:74:39,0:28,5:0|1:120050209_G_A:120050209:17,52,0,5
chr3	120114637	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=107,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:2,4:3,4:1,5,2,6
chr3	120130899	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.473:12:3,2:3,4:0,6,0,6
chr3	120320939	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=200,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,7:2,6:5,0,13,0
chr3	120369575	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr3	120371414	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=56.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,12,5
chr3	120389243	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=133,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:5,3,1,1
chr3	120394604	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.809:19:2,8:1,8:1,2,11,5
chr3	120413158	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=133.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,22:0,22:0,0,1,43
chr3	120495536	.	G	GCTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:3,0:2,1:0,5,0,1
chr3	120673735	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=162,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,2:10,0:16,1,2,0
chr3	120833993	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.364:25:5,4:10,4:0|1:120833993_C_T:120833993:0,16,0,9
chr3	120833994	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,16:0.630:25:4,6:4,10:1|0:120833993_C_T:120833993:0,9,0,16
chr3	120924763	.	TC	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,6:0.130:50:21,4:22,2:0|1:120924763_TC_T:120924763:32,12,6,0
chr3	120924764	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,26:0.478:53:12,16:15,9:1|0:120924763_TC_T:120924763:20,7,19,7
chr3	120969682	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.106:54:24,0:25,5:0,49,0,5
chr3	121100116	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr3	121100414	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:1,5:4,6:1,4,2,9
chr3	121132268	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	121137976	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr3	121138015	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,1,15
chr3	121155198	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr3	121186543	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr3	121195302	.	TACAC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=AC;STR;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.855:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	121202131	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=52.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	121202433	.	TA	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.298:33:7,3:10,5:4,19,1,9
chr3	121212277	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=42.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:1,10:0,6:1,0,16,0
chr3	121228833	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr3	121239027	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr3	121289499	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.526:36:9,9:8,10:16,1,17,2
chr3	121289584	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=-1073741809;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,2:0.031:94:38,1:49,1:54,38,1,1
chr3	121304933	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=103,109;MMQ=60,58;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:12,9:8,10:11,9,8,11
chr3	121339354	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr3	121339520	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=125,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:4,3:7,2:1,10,0,5
chr3	121345533	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:10,3:16,0:23,4,3,0
chr3	121351315	.	G	GGGCTCAGGCTCA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,144;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=GGCTCA;STR;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.204:17:10,3:4,0:4,10,2,1
chr3	121352068	.	CT	C,CTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32,19;MFRL=156,165,156;MMQ=60,60,60;MPOS=12,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.38,5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,3,4:0.163,0.227:19:8,3,0:3,0,1:3,9,2,5
chr3	121353254	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:4,8:4,6:4,4,4,10
chr3	121383297	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:5,8:12,9:12,5,15,2
chr3	121400725	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,2:7,1:2,7,0,3
chr3	121400759	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=199,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:1,0:2,1:0|1:121400759_A_C:121400759:0,3,0,1
chr3	121400762	.	T	TCTTCCTGTCTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=199,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:121400759_A_C:121400759:0,3,0,1
chr3	121410778	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:25,3:14,0:24,15,3,0
chr3	121414277	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=148,534;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.058:50:25,1:23,1:32,16,2,0
chr3	121417535	.	GCTATTCCCTCACCCTCCAT	G	.	.	DP=68;ECNT=8;MBQ=34,23;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=-80;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,7:0.048:67:24,3:18,4:0|1:121417535_GCTATTCCCTCACCCTCCAT_G:121417535:39,21,4,3
chr3	121417557	.	GTTTCATT	G	.	.	DP=67;ECNT=8;MBQ=33,23;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=-81;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,7:0.049:66:27,3:23,4:0|1:121417535_GCTATTCCCTCACCCTCCAT_G:121417535:40,19,4,3
chr3	121417565	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=8;MBQ=29,23;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=-81;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,7:0.056:58:24,3:22,4:0|1:121417535_GCTATTCCCTCACCCTCCAT_G:121417535:35,16,4,3
chr3	121417569	.	T	TG	.	.	DP=56;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=-81;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,7:0.060:55:24,3:21,4:0|1:121417535_GCTATTCCCTCACCCTCCAT_G:121417535:32,16,4,3
chr3	121417570	.	CTGGTCA	C	.	.	DP=62;ECNT=8;MBQ=34,23;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=-81;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,7:0.053:61:24,3:21,4:0|1:121417535_GCTATTCCCTCACCCTCCAT_G:121417535:33,21,4,3
chr3	121417578	.	GGACCTCATGATCT	G	.	.	DP=75;ECNT=8;MBQ=32,23;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=-81;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,7:0.043:74:25,3:24,4:0|1:121417535_GCTATTCCCTCACCCTCCAT_G:121417535:36,31,4,3
chr3	121417595	.	TCCTCAGCC	T	.	.	DP=79;ECNT=8;MBQ=29,23;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=-81;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,7:0.041:78:25,3:29,4:0|1:121417535_GCTATTCCCTCACCCTCCAT_G:121417535:40,31,4,3
chr3	121417606	.	TTTTCCCTGGAGCTGTA	T	.	.	DP=94;ECNT=8;MBQ=26,23;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=-81;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,11:0.036:93:19,3:35,4:0|1:121417535_GCTATTCCCTCACCCTCCAT_G:121417535:40,42,4,7
chr3	121448066	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,29:0.600:48:10,18:9,11:10,9,15,14
chr3	121489439	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:121489439_T_TG:121489439:0,4,0,1
chr3	121489441	.	A	ATTCATCATAACC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:121489439_T_TG:121489439:0,4,0,1
chr3	121489444	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:121489439_T_TG:121489439:0,3,0,1
chr3	121508830	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=183,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,5:2,4:3,0,8,1
chr3	121514458	.	TA	T,TAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,30,28;MFRL=166,169,224;MMQ=60,60,60;MPOS=25,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=28.15,4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,19,3:0.628,0.135:28:4,9,1:1,10,2:0,6,3,19
chr3	121515940	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr3	121526099	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.648:32:6,8:5,13:11,0,21,0
chr3	121527894	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.172:43:12,2:14,1:8,27,0,8
chr3	121527903	.	CT	C,CTT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,33,20;MFRL=191,173,163;MMQ=60,60,60;MPOS=21,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.36,3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,4:0.350,0.135:18:4,1,1:2,4,1:0,8,0,10
chr3	121563350	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,23:0.453:51:17,8:11,15:17,11,20,3
chr3	121576099	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=199,192;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.211:15:10,1:1,2:0,12,0,3
chr3	121631841	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:8,7:10,6:15,3,12,1
chr3	121659197	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,3:6,1:7,0,4,0
chr3	121720494	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=246,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,4:2,3:2,0,5,2
chr3	121720514	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	121720542	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=175,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:6,2:8,0:10,5,1,1
chr3	121724038	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:4,2:7,5:10,1,7,1
chr3	121724046	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=13,13;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.247:16:1,0:1,1:0|1:121724046_A_C:121724046:10,2,4,0
chr3	121724047	.	C	CCGGG	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.247:16:1,2:5,0:0|1:121724046_A_C:121724046:10,2,4,0
chr3	121724049	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.269:16:1,0:1,0:0|1:121724046_A_C:121724046:9,3,4,0
chr3	121724056	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,0:4,2:1,5,2,0
chr3	121725833	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:12,0:19,3:29,2,3,0
chr3	121810427	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=100.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,15:0,18:0,0,24,11
chr3	121836966	.	TGA	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=150.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,20:0,17:0,0,5,32
chr3	121976253	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0,0,0,10
chr3	122000871	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,20,0
chr3	122004098	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr3	122086960	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,14,2
chr3	122121563	.	T	TTTTC	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTC;STR;TLOD=64.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.370:49:15,13:16,3:26,5,15,3
chr3	122128519	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,9:6,2:12,0,10,1
chr3	122134889	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=106.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,18:0,0,10,25
chr3	122145810	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=90.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,17:0,0,23,4
chr3	122168341	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=127.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,18:0,0,37,0
chr3	122247606	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:2,6:4,6:0,6,2,10
chr3	122255708	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=184,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,5:3,2:9,0,7,0
chr3	122259745	.	G	T,GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31,32;MFRL=0,170,156;MMQ=60,40,60;MPOS=20,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.42,12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.364,0.535:7:0,2,2:0,1,1:0,0,0,7
chr3	122259782	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr3	122269380	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr3	122274996	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=98,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:122274996_A_T:122274996:1,1,0,1
chr3	122274997	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=101,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:122274996_A_T:122274996:1,1,0,1
chr3	122274998	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=98,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:122274996_A_T:122274996:1,1,0,1
chr3	122275000	.	A	ACTTAACATACTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.394:3:2,0:0,1:1|0:122274996_A_T:122274996:0,2,0,1
chr3	122285005	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=160,256;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chr3	122437834	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:1,16:0,6:0,1,3,19
chr3	122447175	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.645:43:8,12:7,16:7,8,18,10
chr3	122471407	.	TAA	T,TA	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=27,28,27;MFRL=122,132,146;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=12.10,29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,10,17:0.242,0.477:37:5,5,9:4,4,7:9,1,23,4
chr3	122471428	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=136,188;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.056:63:16,0:20,0:41,18,4,0
chr3	122474284	.	T	TA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.423:14:2,3:3,1:0|1:122474284_T_TA:122474284:1,7,2,4
chr3	122474305	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,11:0,10:0|1:122474284_T_TA:122474284:0,0,2,21
chr3	122512631	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr3	122598291	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=146,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:0,6,0,6
chr3	122629009	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:29,3:26,0:36,21,1,2
chr3	122640855	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=161,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr3	122642401	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr3	122642415	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr3	122658417	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,5:2,8:0,6,1,12
chr3	122821385	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,14:0,0,2,27
chr3	122821413	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=-1073741807;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:1,14,0,2
chr3	122821478	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr3	122821671	.	AT	GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,10:0,19:0,0,10,19
chr3	122829926	.	G	GAGAGTGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=174,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:122829926_G_GAGAGTGT:122829926:1,2,0,1
chr3	122829928	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=174,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:122829926_G_GAGAGTGT:122829926:1,2,0,1
chr3	122829930	.	G	GCATTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=174,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:122829926_G_GAGAGTGT:122829926:1,2,0,1
chr3	122829933	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,21;MFRL=180,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:122829926_G_GAGAGTGT:122829926:1,1,0,1
chr3	122835210	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	122835232	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	122843212	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=76.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,6:0,17:0,0,9,16
chr3	122865136	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=121,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,6:3,1:0,5,0,7
chr3	122873923	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=157,55;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:1,8,0,2
chr3	122880118	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.679:17:3,8:2,2:5,0,11,1
chr3	122880696	.	TTCTC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=TC;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:11,1:4,1:15,1,2,0
chr3	122942358	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr3	122942402	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.709:29:3,10:5,10:6,2,17,4
chr3	122964900	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:2,9:11,7:1,12,2,14
chr3	122978486	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=82.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,28:0.727:38:5,14:5,14:1,9,6,22
chr3	122990291	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,4,0
chr3	123008519	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr3	123010276	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.406:32:9,8:10,4:4,15,3,10
chr3	123014840	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr3	123014877	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:5,1,2,1
chr3	123015094	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,1,12
chr3	123018963	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,4:6,1:9,0,5,0
chr3	123021838	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	123021870	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,12,6
chr3	123037047	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	123046447	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.225:18:2,1:7,0:8,6,4,0
chr3	123047478	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=193,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,0:4,4:8,0,4,0
chr3	123047666	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:3,8,1,4
chr3	123049707	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.324:43:10,6:19,5:20,9,11,3
chr3	123049938	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr3	123066555	.	A	AAAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGG;STR;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr3	123366001	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,2:5,0:12,1,2,0
chr3	123440967	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=181.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,31:0,26:0,0,41,19
chr3	123441179	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	123444785	.	A	T	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=131,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=135.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,52:0.544:96:20,25:21,26:23,21,30,22
chr3	123453086	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123453086_G_C:123453086:0,0,0,1
chr3	123453088	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123453086_G_C:123453086:0,0,0,1
chr3	123453092	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123453086_G_C:123453086:0,0,0,1
chr3	123453094	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123453086_G_C:123453086:0,0,0,1
chr3	123453096	.	G	GGAACCA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123453086_G_C:123453086:0,0,0,1
chr3	123456432	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	123457711	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,12:0,0,21,5
chr3	123457987	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=201,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:123457987_C_T:123457987:0,3,0,1
chr3	123457989	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=201,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:123457987_C_T:123457987:0,3,0,1
chr3	123457992	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=201,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:123457987_C_T:123457987:0,3,0,1
chr3	123457993	.	G	GGCGACATA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=201,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:123457987_C_T:123457987:0,3,0,1
chr3	123633612	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,18,5
chr3	123634046	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,10:0,0,10,18
chr3	123634077	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=120,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,2:9,0:5,16,2,0
chr3	123650432	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr3	123650447	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=176,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,2:1,0:0,1,0,3
chr3	123652476	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr3	123666192	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	123667717	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:11,0:10,2:8,13,2,0
chr3	123947017	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=161,30576219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.193:14:3,1:4,0:0,12,0,2
chr3	123983604	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,0,5
chr3	124113929	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,13,1
chr3	124195987	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr3	124201715	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,76;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.109:33:12,2:16,0:14,16,3,0
chr3	124209750	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,32;MFRL=244,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:124209750_G_GC:124209750:0,1,0,1
chr3	124209752	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=266,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:124209750_G_GC:124209750:0,2,0,1
chr3	124209755	.	AC	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=266,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:124209750_G_GC:124209750:0,2,0,1
chr3	124210098	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,14;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.662:4:0,0:1,0:0|1:124210098_T_A:124210098:0,1,3,0
chr3	124210103	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.485:6:0,1:2,0:0|1:124210098_T_A:124210098:1,2,3,0
chr3	124210108	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=193,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.428:7:0,1:3,0:0|1:124210098_T_A:124210098:2,2,3,0
chr3	124210113	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.307:7:1,0:3,0:0|1:124210098_T_A:124210098:2,3,2,0
chr3	124210344	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=215,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,4:2,2:0,3,1,6
chr3	124281980	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:8,8:6,10:2,12,3,15
chr3	124303786	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=96,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.893:17:0,6:1,9:0,1,2,14
chr3	124351229	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=117.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,15:0,0,29,3
chr3	124369640	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0|1:124369640_T_TA:124369640:0,0,8,4
chr3	124369650	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0|1:124369640_T_TA:124369640:0,0,9,6
chr3	124374405	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,8:0,0,19,3
chr3	124376726	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=185,198;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0,8,0,2
chr3	124377430	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,5:1,5:0,3,2,9
chr3	124380793	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,6:5,7:3,5,8,5
chr3	124390796	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.522:44:8,16:12,7:2,19,0,23
chr3	124436291	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=180,295;MMQ=58,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.315:5:4,0:0,1:0|1:124436291_T_C:124436291:0,4,0,1
chr3	124436293	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=217,156;MMQ=48,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr3	124436297	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=217,154;MMQ=58,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.315:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr3	124436300	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=203,225;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.481:5:3,1:0,1:0|1:124436300_A_G:124436300:0,3,0,2
chr3	124436304	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=187,295;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:0,1:0|1:124436291_T_C:124436291:0,3,0,1
chr3	124436308	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=209,225;MMQ=48,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:124436300_A_G:124436300:0,2,0,2
chr3	124437747	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=117,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.502:16:3,5:5,3:6,2,5,3
chr3	124449252	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=183,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.487:35:6,9:11,8:18,0,17,0
chr3	124449291	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.474:49:11,12:13,11:25,1,22,1
chr3	124453883	.	T	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=145,161;MMQ=60,43;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,3:0.052:75:26,3:45,0:56,16,3,0
chr3	124454174	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=210,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr3	124458816	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=172,204;MMQ=50,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,3:1,2:6,0,5,0
chr3	124462710	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,2:5,3:6,2,5,0
chr3	124483420	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,8:3,2:0,8,1,9
chr3	124629222	.	TAA	T,TA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28,25;MFRL=211,204,158;MMQ=60,60,60;MPOS=24,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.87,21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,9:0.186,0.682:12:1,2,3:0,0,6:1,0,10,1
chr3	124629245	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=158,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.101:32:9,0:17,1:21,8,3,0
chr3	124631116	.	C	CAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,0:9,2:0,11,0,2
chr3	124631119	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,0:8,2:0,11,0,2
chr3	124646705	.	A	AAAG	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=220.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,28:0,17:0,0,11,39
chr3	124692785	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.588:20:5,4:3,7:0,8,1,11
chr3	124728472	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:7,0,4,0
chr3	124729193	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:10,0,4,0
chr3	124732177	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,221;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,0:9,2:14,8,1,1
chr3	124732842	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=251,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	124828995	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:2,3:2,0:5,0,3,0
chr3	124829235	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=185,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.309:14:6,2:4,1:0,10,1,3
chr3	124854425	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr3	124854636	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.646:29:8,7:2,12:0,10,2,17
chr3	124896861	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,1,17
chr3	124930044	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:0,4:1,0,4,0
chr3	124951171	.	CTTTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=109,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=T;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	124998098	.	C	CA,CAAA,CAAAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,30,25,19;MFRL=185,169,169,129;MMQ=60,60,60,56;MPOS=29,15,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,12,14,15;RU=A;STR;TLOD=6.56,12.35,4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,4,8,4:0.182,0.281,0.168:27:6,1,0,0:4,2,4,1:3,8,3,13
chr3	125179592	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:13,3:6,0:15,4,3,0
chr3	125179732	.	C	CATAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:6,5:6,6:1,11,0,12
chr3	125223456	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:8,4:9,3:9,8,4,3
chr3	125282683	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:11,1:6,1:8,9,1,1
chr3	125297786	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,127;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:21,3:16,0:26,12,3,0
chr3	125313710	.	C	CT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=175,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:10,1:8,2:1,20,0,3
chr3	125651602	.	CT	C,CTT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=23,32,28;MFRL=155,169,160;MMQ=60,45,42;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=6.35,17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,4,10:0.155,0.362:27:7,3,4:2,1,5:1,12,3,11
chr3	125727482	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,34;MFRL=116,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:0,1:1,0:0|1:125727482_A_C:125727482:3,0,1,0
chr3	125727486	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,12;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:0,0:2,0:0|1:125727482_A_C:125727482:4,0,1,0
chr3	125735679	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:4,7,0,5
chr3	125769757	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,4:4,0:8,1,3,1
chr3	125775428	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,1,13
chr3	125786695	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr3	125786760	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=115.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,12:0,21:0,0,30,7
chr3	125787110	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=206,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:125787110_T_C:125787110:1,2,0,1
chr3	125787113	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:125787110_T_C:125787110:1,1,0,1
chr3	125787114	.	AGGGC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:125787110_T_C:125787110:1,1,0,1
chr3	125787121	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:125787110_T_C:125787110:1,1,0,1
chr3	125787123	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=278,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:125787110_T_C:125787110:0,1,0,1
chr3	125856784	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.133:34:17,0:13,4:12,18,1,3
chr3	125874388	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr3	126137883	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0|1:126137883_G_GAC:126137883:0,3,2,0
chr3	126137888	.	CAT	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=35,12;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:3,0:0|1:126137883_G_GAC:126137883:0,7,2,0
chr3	126137894	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:3,0:0|1:126137883_G_GAC:126137883:1,8,2,0
chr3	126137897	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=30,13;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:5,0:0|1:126137883_G_GAC:126137883:3,9,2,0
chr3	126137903	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=32,24;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:5,0:0|1:126137883_G_GAC:126137883:4,10,2,0
chr3	126137906	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,1:4,1:0|1:126137883_G_GAC:126137883:4,10,2,0
chr3	126137909	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,1:5,1:0|1:126137883_G_GAC:126137883:4,11,2,0
chr3	126138778	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,9:0,4:1,0,12,1
chr3	126142268	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.210:21:7,0:8,0:0|1:126142268_C_G:126142268:5,12,4,0
chr3	126142273	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:7,0:5,0:0|1:126142268_C_G:126142268:5,11,2,0
chr3	126142278	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.211:21:8,0:6,1:0|1:126142268_C_G:126142268:6,11,4,0
chr3	126142433	.	CGGA	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.401:33:13,3:6,9:8,12,5,8
chr3	126152980	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:4,6:6,11:8,2,13,4
chr3	126154319	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.662:19:2,5:4,6:6,0,13,0
chr3	126154339	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=168,98;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:11,2:15,0:26,1,2,0
chr3	126158622	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr3	126160884	.	CATTA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=240,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	126178390	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,2:2,5:8,0,7,0
chr3	126178648	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:7,2:1,9,0,3
chr3	126184941	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.320:13:6,3:3,0:0|1:126184941_C_T:126184941:8,1,4,0
chr3	126184948	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,10:0.689:14:2,7:1,3:1|0:126184941_C_T:126184941:4,0,9,1
chr3	126185238	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr3	126189919	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=135.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,20:0,0,2,34
chr3	126207222	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	126208185	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,2:9,0:0|1:126208185_C_T:126208185:6,13,0,2
chr3	126208193	.	T	TGCCTGGACAAAGTTTCTGCAGAGGGAAAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,1:7,0:0|1:126208185_C_T:126208185:5,13,0,2
chr3	126208249	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr3	126219973	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr3	126224480	.	A	AAGGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AGGG;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr3	126224719	.	CACT	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.145:25:11,1:8,2:0|1:126224719_CACT_C:126224719:1,21,3,0
chr3	126224725	.	CAG	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=146,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.151:24:10,0:9,0:0|1:126224719_CACT_C:126224719:1,20,3,0
chr3	126224730	.	CG	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.157:23:8,1:9,2:0|1:126224719_CACT_C:126224719:1,19,3,0
chr3	126226518	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	126226945	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.161:33:9,0:17,4:12,16,0,5
chr3	126227185	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:7,0,5,0
chr3	126228410	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.639:28:1,9:8,9:8,2,10,8
chr3	126236348	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,5:0,0,12,0
chr3	126260608	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr3	126268918	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,3:6,5:3,9,0,8
chr3	126268953	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=219,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,5:3,6:0,8,1,10
chr3	126270757	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	126271056	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=185,249;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.320:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr3	126633419	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	126724881	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,16:0,4:0,0,22,0
chr3	126739012	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr3	126739095	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:14,7,2,0
chr3	126751689	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr3	127294041	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=146,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:21,2:34,1:31,26,1,2
chr3	127336934	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=104.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,13:0,17:0,0,7,23
chr3	127390189	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=137,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,0:2,0:0|1:127390189_A_C:127390189:3,0,2,0
chr3	127390190	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=21,19;MFRL=213,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:0,0:1,0:0|1:127390189_A_C:127390189:3,0,2,0
chr3	127390195	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=13,34;MFRL=213,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:0,1:1,1:0|1:127390189_A_C:127390189:3,0,2,0
chr3	127391018	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	127396220	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr3	127410959	.	GGC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,18;MFRL=178,180;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.404:3:2,0:0,0:0|1:127410959_GGC_G:127410959:2,0,1,0
chr3	127410964	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=178,180;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:127410959_GGC_G:127410959:2,0,1,0
chr3	127410966	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=178,180;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:127410959_GGC_G:127410959:2,0,1,0
chr3	127642153	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:23,1:14,2:8,29,0,3
chr3	127646587	.	ACT	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=163,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:17,0:17,2:33,5,1,1
chr3	127649059	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.436:41:13,6:10,10:11,12,10,8
chr3	127703144	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=108,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,2:1,7:1,3,2,7
chr3	127775480	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,10:6,3:9,1,13,0
chr3	127775499	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,10:4,3:9,1,11,2
chr3	127779306	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:12,16:6,4:13,5,17,3
chr3	127783698	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:6,9:8,6:9,5,11,4
chr3	127786551	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=214,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,1:2,6:0,2,1,6
chr3	127800071	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.560:25:7,8:3,4:6,5,11,3
chr3	127816433	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=166,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr3	127872506	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:0,3:3,5:3,0,5,4
chr3	127872602	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,5:3,2:0,3,2,5
chr3	128204675	.	CCG	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,172;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:17,5:17,0:27,10,5,0
chr3	128204951	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:3,4:10,2:8,5,2,4
chr3	128292318	.	ATC	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.154:36:15,3:13,2:10,21,1,4
chr3	128356852	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:7,4:11,0:10,9,1,3
chr3	128618393	.	GTG	CAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	128621506	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.297:25:5,0:6,1:8,9,8,0
chr3	128781258	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,1:1,2:0,5,1,3
chr3	128840034	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,21,0
chr3	128853622	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr3	128859202	.	C	CTTAG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,4:0,11:0,0,12,3
chr3	128864520	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,6,1
chr3	128864540	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,1:0,10:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,10,1
chr3	128877521	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	128971495	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:29,2:24,1:30,24,3,0
chr3	128974022	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:1,0:0,4,0,2
chr3	129020778	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=178,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:9,2:4,3:11,2,5,0
chr3	129123342	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=151,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:129123342_A_T:129123342:0,3,0,1
chr3	129123344	.	TTCA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=151,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:129123342_A_T:129123342:0,3,0,1
chr3	129130287	.	C	CCTGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:129130287_C_CCTGA:129130287:0,2,0,1
chr3	129130289	.	G	GTGCAATGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:129130287_C_CCTGA:129130287:0,2,0,1
chr3	129147418	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,27:0.652:41:6,12:8,15:2,12,2,25
chr3	129152144	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,2,16
chr3	129155547	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:10,2:14,1:8,16,0,3
chr3	129168854	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,2:2,2:0,6,0,6
chr3	129185661	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr3	129197115	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr3	129275551	.	TGGGGAG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:3,5:4,3:1,6,0,8
chr3	129275870	.	GA	CC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr3	129284127	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:4,4:0,2:4,0,6,1
chr3	129290326	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.399:20:6,2:3,0:5,7,8,0
chr3	129293106	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	129294568	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,2:4,5:10,1,5,2
chr3	129303029	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:19,2:15,1:13,21,2,1
chr3	129303087	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=25,12;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.329:13:2,0:4,0:2,7,0,4
chr3	129303097	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=25,13;MFRL=161,251;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,0:6,0:0|1:129303097_A_T:129303097:3,8,0,3
chr3	129303101	.	GA	TC	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=30,11;MFRL=161,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,0:6,0:0|1:129303097_A_T:129303097:3,8,0,3
chr3	129303104	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,18;MFRL=163,251;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:2,0:5,0:0|1:129303097_A_T:129303097:3,7,0,3
chr3	129303107	.	AT	TG	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=27,13;MFRL=161,251;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:4,0:3,6,0,3
chr3	129303197	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr3	129303436	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.419:20:5,4:4,4:0,12,0,8
chr3	129308096	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,3:3,9:4,0,12,0
chr3	129308209	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,14:0.295:48:14,8:20,5:13,21,10,4
chr3	129546679	.	TGCA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCA;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:16,2:5,1:19,4,1,2
chr3	129694934	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,6:0,0,0,15
chr3	129695538	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr3	129800783	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=138,143;MMQ=60,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,12:0.277:45:18,8:14,4:28,5,9,3
chr3	129811073	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.293:39:14,4:13,7:0,28,0,11
chr3	129812049	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=124,184;MMQ=52,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.310:10:2,1:5,0:5,2,1,2
chr3	129814806	.	CG	C	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=173,186;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=52.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,21:0.460:46:13,12:12,9:24,1,20,1
chr3	129814847	.	CG	C	.	.	DP=65;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=162,171;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,16:0.277:59:22,7:20,9:31,12,14,2
chr3	129814862	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=159,173;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,24:0.340:71:25,10:21,10:0|1:129814862_C_T:129814862:32,15,20,4
chr3	129814869	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=158,173;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=69.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,22:0.335:66:23,7:21,12:0|1:129814862_C_T:129814862:28,16,16,6
chr3	129814934	.	GC	G	.	.	DP=86;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=52.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,21:0.274:78:27,13:28,8:18,39,3,18
chr3	129815035	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.649:18:4,4:2,7:0,6,1,11
chr3	130095031	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,6:5,2:8,0,8,0
chr3	130098608	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.144:26:7,3:13,0:14,9,3,0
chr3	130104306	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:0,7,0,5
chr3	130107975	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,5:6,3:3,9,1,7
chr3	130108063	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:0,5,0,6
chr3	130109993	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.725:27:3,9:4,11:5,2,18,2
chr3	130113635	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	130114408	.	AC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=76.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,8:0,13:0,0,0,21
chr3	130116972	.	G	GTTTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=13,13;MFRL=174,167;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=20,35;RU=T;STR;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.767:12:1,2:0,0:1,2,0,9
chr3	130122409	.	TG	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.489:35:7,9:7,7:16,2,14,3
chr3	130122552	.	TACACAC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=AC;STR;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.584:12:1,3:3,4:1,4,1,6
chr3	130124564	.	C	CTT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,114;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,0:11,3:2,22,0,3
chr3	130129322	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,32:0.611:52:9,19:9,13:10,10,21,11
chr3	130129337	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.072:54:26,3:17,0:28,23,3,0
chr3	130132302	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,2:2,2:0|1:130132302_T_A:130132302:5,0,4,0
chr3	130132304	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,2:3,2:0|1:130132302_T_A:130132302:5,0,4,0
chr3	130132498	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:18,0:13,3:7,24,0,3
chr3	130132509	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:6,8:7,3:4,9,2,9
chr3	130132851	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr3	130134453	.	CA	TG	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=170.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,43:0.603:71:12,15:16,26:20,8,28,15
chr3	130134492	.	T	C	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,31:0.332:95:32,18:27,12:28,36,17,14
chr3	130135575	.	A	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=165.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,27:0,26:0,0,39,14
chr3	130137866	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr3	130139884	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	130141452	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=203,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr3	130142584	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=195,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0|1:130142584_A_T:130142584:2,0,3,0
chr3	130142587	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=198,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,3:0.444:7:2,0:2,3:1|0:130142584_A_T:130142584:4,0,3,0
chr3	130142843	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=261,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr3	130144984	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,8:0,0,21,1
chr3	130145175	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,34:0.582:58:18,17:6,16:12,12,19,15
chr3	130148510	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:0,4:2,5:1,3,2,7
chr3	130158343	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,6:3,1:3,3,5,2
chr3	130282567	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=290,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,7:1,2:0,1,0,9
chr3	130286886	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:8,2:5,2:10,3,2,2
chr3	130289617	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	130305605	.	G	GAAAAGTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=184,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	130313017	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	130317341	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=82.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,14:0,0,3,26
chr3	130360600	.	TA	T,TAA	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=28,28,30;MFRL=141,178,102;MMQ=60,60,60;MPOS=20,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=13.40,4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,8,4:0.209,0.114:40:15,2,3:13,6,1:6,22,5,7
chr3	130363960	.	T	TTAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:130363960_T_TTAG:130363960:0,3,0,1
chr3	130363964	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:130363960_T_TTAG:130363960:0,3,0,1
chr3	130367860	.	CT	C,CTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32,34;MFRL=161,176,173;MMQ=60,60,60;MPOS=14,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=11.65,7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,4:0.328,0.276:16:4,3,3:2,3,1:6,0,10,0
chr3	130383973	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,28:0.616:45:8,15:9,12:2,15,4,24
chr3	130393973	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,5:3,2:9,0,7,0
chr3	130405235	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,4:0.060:81:25,0:51,4:34,43,0,4
chr3	130424390	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,14:0.455:31:3,5:12,9:0|1:130424390_C_A:130424390:12,5,10,4
chr3	130424393	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,14:0.454:31:5,5:11,8:0|1:130424390_C_A:130424390:12,5,10,4
chr3	130447535	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=183,200;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:0|1:130447535_A_T:130447535:0,8,0,3
chr3	130447537	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=183,200;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:0|1:130447535_A_T:130447535:0,8,0,3
chr3	130454884	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=188,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:0,5,0,7
chr3	130660469	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,3:0.048:81:45,3:32,0:40,38,1,2
chr3	130674022	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	130686091	.	A	AT	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=165,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,4:0.068:69:31,2:34,2:23,42,3,1
chr3	130711966	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=337,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr3	130733046	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.204:26:9,2:9,3:9,12,3,2
chr3	130737632	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr3	130748733	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,5:5,3:1,5,0,8
chr3	130828790	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=160.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,53:0.965:54:0,22:1,30:0,1,12,41
chr3	130881409	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=140.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,19:0,0,2,35
chr3	130887626	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:11,4:9,5:19,1,9,0
chr3	130992515	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=206,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr3	131186906	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.182:30:11,0:13,3:0|1:131186906_G_A:131186906:25,0,5,0
chr3	131186907	.	GA	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,10:0.343:29:8,4:4,3:1|0:131186906_G_A:131186906:19,0,10,0
chr3	131186908	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,31:0.636:46:7,14:8,11:0|1:131186906_G_A:131186906:15,0,28,3
chr3	131217208	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,4:1,4:0,1,1,7
chr3	131261662	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=19,23;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.640:7:0,1:1,3:0|1:131261662_TG_T:131261662:1,1,1,4
chr3	131261683	.	G	GAGGTGTCAATCCCCAGGGTTTGTTGGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:131261662_TG_T:131261662:0,1,0,1
chr3	131388468	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:10,0,2,0
chr3	131404625	.	A	AAC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AC;STR;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.893:16:0,6:1,8:1,0,15,0
chr3	131624385	.	GAC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.912:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	132047029	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=219,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:4,2:9,0,3,0
chr3	132047248	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.058:52:26,0:16,3:13,36,1,2
chr3	132063914	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0,0,2,16
chr3	132068876	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr3	132068925	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,1,7
chr3	132075746	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,1,16
chr3	132166148	.	AT	A,ATT	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=31,31,33;MFRL=145,137,139;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=12.77,6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:62,11,7:0.131,0.090:80:33,5,5:28,6,1:56,6,18,0
chr3	132169705	.	T	TA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.423:36:14,4:5,10:0,21,2,13
chr3	132173004	.	AT	A	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=147,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,14:0.228:64:12,7:21,6:9,41,3,11
chr3	132179072	.	GT	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.243:38:10,4:16,5:24,5,8,1
chr3	132179280	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.260:13:3,0:2,2:0,10,0,3
chr3	132192113	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:1,17,0,2
chr3	132209655	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	132221076	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=95,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,5:0,5:2,0,10,1
chr3	132280106	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:1,1:4,2:0,5,1,3
chr3	132321036	.	TA	T,TAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=27,28,27;MFRL=160,133,159;MMQ=60,60,60;MPOS=25,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.47,8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,3,7:0.080,0.155:46:10,3,2:24,0,3:15,21,4,6
chr3	132390859	.	C	CT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=181,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:19,1:13,2:22,10,1,2
chr3	132435766	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=189,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:132435766_AG_A:132435766:0,6,1,1
chr3	132435769	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=189,79;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:132435766_AG_A:132435766:0,6,1,1
chr3	133108978	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=128,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,6:3,3:7,1,8,1
chr3	133114893	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,1,15
chr3	133327907	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:1,13,0,2
chr3	133335787	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr3	133343019	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:6,0:10,2:4,13,0,2
chr3	133347521	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,256;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,4:0.049:99:44,4:47,0:55,40,2,2
chr3	133347616	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,248;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.134:43:14,0:19,5:4,34,0,5
chr3	133375785	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,557;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr3	133474256	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:12,1:16,1:14,14,1,1
chr3	133476852	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:0,8,0,5
chr3	133560423	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=120,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,1:1,2:2,1,3,1
chr3	133583577	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,1:3,6:0,6,0,7
chr3	133661684	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.726:20:3,6:2,8:0,5,0,15
chr3	133673711	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	133692497	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:8,7:4,5:10,3,11,1
chr3	133692743	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=216,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,3:2,0:0,3,0,4
chr3	133698280	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:6,0,7,2
chr3	133901733	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,16,0
chr3	133930488	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,34967355;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr3	134080661	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,4,11
chr3	134214042	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,12:0,2:0,0,14,0
chr3	134226159	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=152.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,29:0,19:0,0,9,39
chr3	134256159	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=95.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,10:0,0,0,27
chr3	134266148	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr3	134280395	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=139.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,19:0,24:0,0,5,39
chr3	134514579	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,13:0,3:0,0,4,12
chr3	134644547	.	GTAGTACTGTCA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,37;MFRL=148,335;MMQ=35,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:134644547_GTAGTACTGTCA_G:134644547:1,0,1,0
chr3	134644563	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=0,335;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:134644547_GTAGTACTGTCA_G:134644547:0,1,1,0
chr3	134644565	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,31;MFRL=0,335;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:134644547_GTAGTACTGTCA_G:134644547:0,1,1,0
chr3	134644636	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.471:29:5,7:10,7:12,3,14,0
chr3	134825512	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,3:0,0,0,16
chr3	135720617	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:13,0:11,3:7,17,0,3
chr3	135742057	.	G	GTGTTTTGTTT	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=182,136;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TGTTT;STR;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.515:18:3,5:5,4:1,7,0,10
chr3	135759669	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.360:20:8,2:5,5:10,3,3,4
chr3	135809443	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:14,3:14,0:13,16,3,0
chr3	135822011	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr3	136035737	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:11,0,5,0
chr3	136057142	.	AATT	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATT;STR;TLOD=82.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,22:0.426:52:11,8:14,14:11,19,10,12
chr3	136059239	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=194,177;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:17,0,2,0
chr3	136059243	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=189,225;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:17,0,2,0
chr3	136059537	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr3	136087968	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:15,1:22,2:27,11,1,2
chr3	136139878	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=222,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,4:6,8:7,1,12,0
chr3	136196071	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr3	136573289	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,30:0.562:53:10,14:12,15:19,4,29,1
chr3	136573485	.	GA	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.109:45:20,2:17,2:18,22,1,4
chr3	136574578	.	T	TTAA	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=162.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,44:0.528:83:16,26:22,18:20,19,24,20
chr3	136728886	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:9,6:8,2:17,0,7,1
chr3	137484494	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=211,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr3	137750079	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=202,115;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr3	137781912	.	G	GGTTTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137781912_G_GGTTTC:137781912:0,0,0,1
chr3	137781914	.	AA	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137781912_G_GGTTTC:137781912:0,0,0,1
chr3	137781919	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137781912_G_GGTTTC:137781912:0,0,0,1
chr3	137783517	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:17,3:34,0:28,24,3,0
chr3	137783700	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,3:0,0,0,7
chr3	137787282	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	137799291	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,1:0,0,6,0
chr3	137799498	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=123.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,14:0,0,10,24
chr3	137800656	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,5:0,15:0,0,2,19
chr3	137843006	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,10;MFRL=245,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,0:0,0:0|1:137843006_T_G:137843006:2,0,1,0
chr3	137843013	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,13;MFRL=215,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,0:0|1:137843006_T_G:137843006:3,0,1,0
chr3	137843018	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	137843021	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,13;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:137843006_T_G:137843006:3,0,1,0
chr3	137843024	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,11;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:137843006_T_G:137843006:3,0,1,0
chr3	137843026	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,17;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:137843006_T_G:137843006:3,0,1,0
chr3	137843106	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,29:0,13:0,0,38,6
chr3	137880629	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=192,163;MMQ=50,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:5,0:22,2:27,0,2,0
chr3	137880695	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=57,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=141.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.976:41:0,14:0,26:1,0,33,7
chr3	137880743	.	G	A	.	.	DP=115;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=350.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,109:0.991:109:0,36:0,71:0,0,48,61
chr3	137882377	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0,0,0,12
chr3	137882752	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr3	137892531	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr3	137893398	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.301:14:4,0:4,0:0|1:137893398_C_G:137893398:3,7,4,0
chr3	137893401	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.300:14:4,0:4,1:3,7,4,0
chr3	137893409	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,0:0|1:137893398_C_G:137893398:5,10,2,0
chr3	137907220	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=19,35;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.545:7:1,1:0,1:0|1:137907220_GT_G:137907220:3,0,4,0
chr3	137907234	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.439:9:2,1:1,2:0|1:137907220_GT_G:137907220:5,0,4,0
chr3	137981439	.	TA	T,TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27,29;MFRL=120,176,189;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=5.02,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,3:0.389,0.245:13:1,0,2:4,5,1:1,4,3,5
chr3	137982718	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,3:8,2:3,11,1,4
chr3	138025136	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:8,1,5,0
chr3	138025396	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0,6,1,3
chr3	138091701	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,3:4,11:9,1,14,0
chr3	138170788	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr3	138171042	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	138174032	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:10,0:10,2:13,11,0,2
chr3	138176515	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.250:13:4,0:5,0:3,7,0,3
chr3	138176533	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr3	138184198	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,2:10,0:16,6,1,2
chr3	138189031	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,2,12
chr3	138189658	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,19,1
chr3	138195529	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr3	138248009	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.449:11:2,3:1,1:3,3,5,0
chr3	138341284	.	CTT	C,CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35,19;MFRL=0,233,139;MMQ=60,60,60;MPOS=20,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.35,4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.336,0.558:5:0,0,1:0,2,0:0,0,0,5
chr3	138348081	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.365:17:5,3:6,3:0,11,1,5
chr3	138400782	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:6,2:3,1:9,1,3,0
chr3	138403390	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,17,1
chr3	138417989	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr3	138433380	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=163,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:23,0:26,3:24,26,0,3
chr3	138433568	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,16:0,0,5,22
chr3	138666309	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:7,0:8,0:9,9,0,3
chr3	138666316	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.184:20:5,0:7,0:8,9,0,3
chr3	138763444	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,0;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:138763444_T_G:138763444:0,0,0,1
chr3	138763460	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138763444_T_G:138763444:0,0,0,1
chr3	138763627	.	GTGC	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGC;STR;TLOD=47.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.937:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr3	139065642	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,208;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:11,3:12,0:22,1,3,0
chr3	139066902	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr3	139068963	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,3:2,0:0|1:139068963_A_C:139068963:9,2,3,0
chr3	139068969	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:5,3:5,0:0|1:139068963_A_C:139068963:9,2,3,0
chr3	139069246	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=101,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:139069246_G_T:139069246:0,2,0,1
chr3	139069248	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=19,28;MFRL=101,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:139069246_G_T:139069246:0,2,0,1
chr3	139069255	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=101,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:139069246_G_T:139069246:0,2,0,1
chr3	139074657	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.075:51:18,0:27,3:0|1:139074657_T_G:139074657:11,37,0,3
chr3	139074662	.	T	TAAAAAATA	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=30,37;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:15,0:24,3:0|1:139074657_T_G:139074657:9,36,0,3
chr3	139074663	.	G	GAATTTATATA	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:14,0:24,1:0|1:139074657_T_G:139074657:8,35,0,3
chr3	139075938	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=209,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,8:2,4:0,6,2,10
chr3	139081416	.	TTA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=58,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,0,4
chr3	139088481	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=210,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr3	139090736	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:3,5:6,13:1,8,0,18
chr3	139096811	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:3,4:7,2:10,0,7,0
chr3	139098195	.	G	A	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,36:0.468:77:21,20:20,16:33,8,27,9
chr3	139102120	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,25:0.564:44:15,14:4,10:17,2,23,2
chr3	139108250	.	C	CTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=203,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,5:4,5:8,0,11,0
chr3	139173565	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,19:0.416:46:17,10:10,9:17,10,10,9
chr3	139180919	.	ATG	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.399:38:8,9:14,5:19,4,10,5
chr3	139244590	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,5:6,2:9,0,7,0
chr3	139244603	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,6:7,5:12,0,11,0
chr3	139257545	.	GC	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,6:6,7:12,1,12,1
chr3	139257603	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,13:0.304:44:15,9:16,4:21,10,10,3
chr3	139894697	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	140140213	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=190,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,6:2,1:0,4,0,7
chr3	140167636	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr3	140178279	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:3,1,3,0
chr3	140178638	.	CCCT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=108.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,16:0,8:0,0,3,23
chr3	140282084	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr3	140284942	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,115;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:27,0:23,3:35,15,3,0
chr3	140285115	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,2,25
chr3	140419715	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.481:21:5,5:4,4:3,8,7,3
chr3	140678384	.	T	TA,TAA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,20,28;MFRL=159,148,164;MMQ=60,60,60;MPOS=21,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=11.79,5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,9,4:0.345,0.176:26:6,3,2:7,3,1:1,12,2,11
chr3	140692486	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	140978921	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr3	140979184	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	140998214	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,9:0,17:0,0,22,8
chr3	141006396	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=234,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr3	141277651	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,32:0.661:48:9,18:7,14:15,1,32,0
chr3	141299397	.	T	TACACAC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=AC;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.626:9:1,2:2,1:0,3,0,6
chr3	141305594	.	G	T	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=141,130;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,3:0.049:80:34,0:41,3:0|1:141305594_G_T:141305594:33,44,0,3
chr3	141305597	.	A	T	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=142,130;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,3:0.048:81:36,0:40,3:0|1:141305594_G_T:141305594:33,45,0,3
chr3	141326507	.	T	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,5:0.086:67:36,5:26,0:53,9,5,0
chr3	141327593	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=171,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,5:4,7:0,8,1,11
chr3	141331222	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=111.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,44:0.584:75:20,20:11,24:4,27,8,36
chr3	141682825	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:10,6:2,7:0,13,2,11
chr3	141904977	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,2:9,3:15,6,4,1
chr3	141905253	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,13:0.325:41:12,5:15,6:0|1:141905253_C_A:141905253:28,0,13,0
chr3	141905259	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=164,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,16:0.347:47:15,10:14,6:0|1:141905253_C_A:141905253:30,1,16,0
chr3	141905261	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=164,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,16:0.347:47:15,10:15,5:0|1:141905253_C_A:141905253:30,1,16,0
chr3	141905414	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:19,0:21,3:0,40,0,3
chr3	141917810	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:5,10:8,5:0,13,0,15
chr3	141923506	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=129.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,18:0,22:0,0,37,8
chr3	141932531	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr3	141932551	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=207,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr3	141934393	.	CA	C	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,11:0.121:97:45,4:39,7:73,13,10,1
chr3	142051147	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=174,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	142076059	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=69,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr3	142094816	.	G	GCACA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=173,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=CA;STR;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.688:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr3	142098982	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.073:65:33,2:28,2:32,29,2,2
chr3	142119307	.	G	C	.	.	DP=106;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,8:0.097:89:29,2:36,3:62,19,0,8
chr3	142122451	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,28:0.591:47:12,17:7,10:19,0,27,1
chr3	142145649	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=144,124;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.102:47:23,0:19,4:22,21,0,4
chr3	142145664	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=141,124;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.108:44:21,0:19,4:0|1:142145664_C_T:142145664:16,24,0,4
chr3	142145669	.	G	GTTTTATACTTCATTTGTTTCTTTTTT	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=34,37;MFRL=141,124;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.113:42:19,0:19,4:0|1:142145664_C_T:142145664:15,23,0,4
chr3	142188461	.	G	GCTGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr3	142215178	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=154,135;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.671:16:4,3:2,4:9,0,5,2
chr3	142241692	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:2,0:2,0:2,8,0,3
chr3	142259706	.	CAA	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:9,1:10,1:25,1,2,0
chr3	142272275	.	A	AAC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=17,26;MFRL=227,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=AC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.680:4:0,1:0,1:0,1,0,3
chr3	142272314	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=217,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr3	142277365	.	AAAAT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,129;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AAAT;STR;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.707:11:1,7:2,1:3,0,8,0
chr3	142284916	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:23,3:10,0:29,4,3,0
chr3	142389909	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.527:36:9,11:8,8:13,4,9,10
chr3	142521224	.	CT	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.232:27:7,1:9,5:3,18,1,5
chr3	142607835	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	142720348	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,11:0,0,24,0
chr3	142740061	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=275,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,4:0,0:2,0,3,1
chr3	142752293	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	142756907	.	A	G	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=110.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,44:0.462:95:29,22:21,20:32,19,36,8
chr3	142773738	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=241.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,31:0,47:0,0,67,11
chr3	142774026	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.170:32:11,0:14,1:0,26,0,6
chr3	142774047	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,16;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.290:17:2,0:6,0:0,12,0,5
chr3	142841059	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:12,2:16,1:9,20,0,3
chr3	142987912	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,6:5,2:0,9,0,8
chr3	143412221	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,0:15,2:0,26,0,2
chr3	143551065	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:4,1:7,1:2,13,0,3
chr3	143567207	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=121.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.953:39:0,18:1,17:0,1,3,35
chr3	145788467	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=109.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,14:0,16:0,0,26,5
chr3	145788803	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,17,6
chr3	145794776	.	CTTTA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr3	145795559	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	145803138	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=203,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=144.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,34:0.947:35:1,17:0,16:0|1:145803138_T_C:145803138:0,1,0,34
chr3	145803142	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=203,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=141.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,33:0.944:34:1,13:0,17:0|1:145803138_T_C:145803138:0,1,0,33
chr3	145804524	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=128.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,24:0,11:0,0,35,0
chr3	145809750	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,2,14
chr3	145820684	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,7:0,0,3,19
chr3	145824478	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,6:0,13:0,0,0,19
chr3	145824504	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr3	145828256	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=57.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,6:0,9:0,0,1,15
chr3	145838895	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,13,3
chr3	145841854	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr3	145912299	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:5,4:6,3:1,10,1,7
chr3	145918879	.	C	T	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,4:0.057:85:42,0:39,4:38,43,0,4
chr3	145924591	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:8,5:2,7:0,10,0,12
chr3	145924632	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	145938528	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr3	145938782	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,4:3,9:0,6,0,13
chr3	145939755	.	C	CA	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=54.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.558:43:10,12:6,10:14,5,21,3
chr3	145939776	.	T	G	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=129.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,36:0.609:59:11,21:11,13:15,8,27,9
chr3	146167163	.	CA	C,CAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=154,181,160;MMQ=60,60,60;MPOS=30,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.14,4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.221,0.233:14:4,1,2:4,1,1:0,8,0,6
chr3	146176075	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.517:33:8,8:7,9:16,0,17,0
chr3	146251441	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.303:5:1,0:3,1:0|1:146251441_CT_C:146251441:0,4,0,1
chr3	146251444	.	T	TTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:146251441_CT_C:146251441:0,4,0,1
chr3	146251446	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:146251441_CT_C:146251441:0,4,0,1
chr3	146303750	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:7,6:10,1:17,0,5,2
chr3	146307339	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,235;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,0:0,3:3,2,3,0
chr3	146307635	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=37,26;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr3	146307649	.	G	GGGCTCAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr3	146311937	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=182,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,1:10,3:1,15,0,4
chr3	146312941	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,26:0.435:60:12,10:21,16:8,26,6,20
chr3	146322901	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.372:41:8,4:18,11:25,1,11,4
chr3	147108756	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:1,3,3,2
chr3	148459855	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:17,2:11,3:5,23,4,1
chr3	148562425	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:7,8:9,5:9,7,6,7
chr3	148562620	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:5,4:3,3:0,9,0,7
chr3	148563493	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=153,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,5:2,0:0,4,0,5
chr3	148575156	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:3,1,3,1
chr3	148583231	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.229:15:4,1:7,1:8,4,1,2
chr3	148597482	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:0,4:3,5:3,0,9,0
chr3	148601439	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:6,2,5,1
chr3	148711906	.	GT	G	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=155,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.081:59:28,2:21,2:49,6,4,0
chr3	148714025	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,23,0
chr3	148756825	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr3	148757290	.	GT	G,GTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=164,161,156;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.47,5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,3:0.166,0.166:21:5,1,1:10,2,2:14,1,6,0
chr3	148773009	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,222;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,2:9,0:14,0,2,0
chr3	148858987	.	CT	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.227:33:10,4:11,2:11,15,2,5
chr3	148885851	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,0,27
chr3	148885870	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,0:7,2:0,17,0,2
chr3	148897523	.	A	AAATAACCGGTTTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=172,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr3	148902929	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.327:7:3,1:2,1:0|1:148902929_CT_C:148902929:4,1,2,0
chr3	148902942	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=18,13;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:1,0:2,0:0|1:148902929_CT_C:148902929:5,1,2,0
chr3	148903016	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,2:13,0:18,6,1,1
chr3	148924177	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:9,5:8,3:1,16,1,7
chr3	148925418	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:0,5:8,5:3,6,4,6
chr3	149039324	.	G	A	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=112.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,45:0.490:92:28,14:16,30:14,33,8,37
chr3	149050925	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	149087714	.	T	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=244.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.987:75:0,32:0,43:0,0,12,63
chr3	149192564	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,7:0,11:0,0,19,1
chr3	149192851	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr3	149485901	.	T	TG	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,17:0.328:52:17,4:16,9:12,23,5,12
chr3	149613232	.	ATTTT	A,AT,ATT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=26,33,31,33;MFRL=138,161,185,143;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,13,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,14,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.95,15.09,47.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,4,10,19:0.113,0.265,0.571:34:0,3,3,14:1,1,7,4:0,1,29,4
chr3	149639117	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,163;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:0,22,0,2
chr3	149686076	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=88.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.927:25:1,14:0,10:1,0,24,0
chr3	149686366	.	AAC	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AC;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.266:17:6,2:7,2:0|1:149686366_AAC_A:149686366:0,13,0,4
chr3	149686367	.	AC	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,20:0.956:20:0,10:0,10:1|0:149686366_AAC_A:149686366:0,0,0,20
chr3	149688692	.	AGCG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCG;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:7,1:7,1:1,14,0,2
chr3	150129171	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=181,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	150262318	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=127.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,45:0.580:77:16,25:16,18:7,25,10,35
chr3	150270077	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=208,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:7,0,5,0
chr3	150276151	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.247:16:5,1:6,3:11,1,2,2
chr3	150276153	.	C	CT,T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32,23;MFRL=143,158,163;MMQ=60,60,60;MPOS=15,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.08,4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,9,4:0.500,0.267:16:1,3,1:2,5,3:3,0,10,3
chr3	150282061	.	CT	C,CTT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,32,34;MFRL=154,167,166;MMQ=60,60,60;MPOS=21,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.61,6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,7,4:0.178,0.127:36:8,4,1:16,3,3:21,4,9,2
chr3	150282211	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.487:45:11,11:11,9:1,22,1,21
chr3	150285664	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.420:48:11,8:17,12:10,18,10,10
chr3	150286088	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.535:41:12,10:7,12:6,13,5,17
chr3	150340114	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:10,9:12,5:22,0,14,0
chr3	150384807	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr3	150387059	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.741:21:2,6:3,10:2,3,16,0
chr3	150398144	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=177,244;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:150398144_T_C:150398144:3,0,1,0
chr3	150398147	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=177,244;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:150398144_T_C:150398144:3,0,1,0
chr3	150398150	.	TG	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=173,244;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:150398144_T_C:150398144:4,0,1,0
chr3	150398155	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=173,244;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:150398144_T_C:150398144:4,0,1,0
chr3	150661472	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,20,0
chr3	150661495	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,20,1
chr3	150690566	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,5:0,0,0,7
chr3	150690593	.	GAA	TCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr3	150804908	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	150876464	.	TG	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,15:0.320:48:20,9:13,5:27,6,15,0
chr3	150883777	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:6,6:3,2:0,10,2,6
chr3	150916131	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.893:8:0,2:1,5:1,0,7,0
chr3	150917251	.	GG	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=333,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150917251_GG_AC:150917251:0,1,0,1
chr3	150917253	.	T	TTCCTTAATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=333,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150917251_GG_AC:150917251:0,1,0,1
chr3	150932075	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,6:5,5:4,5,6,6
chr3	151056158	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:17,2:22,0:31,8,2,0
chr3	151075156	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=153,204;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.152:37:10,0:21,5:7,25,0,5
chr3	151078216	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,34:0.582:58:11,14:13,19:20,4,30,4
chr3	151085842	.	AAAT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=248,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:0,7:4,3:4,0,10,0
chr3	151090604	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,5:2,4:0,4,0,9
chr3	151094995	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,1:2,2:0,5,0,3
chr3	151101691	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:6,10:9,6:3,12,4,12
chr3	151101746	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,4:5,2:5,8,0,6
chr3	151102790	.	ACT	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.135:34:14,2:14,2:25,5,4,0
chr3	151103070	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,0,18
chr3	151131183	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:7,4:9,4:0,16,0,8
chr3	151134105	.	GCAGCCCCAGCAGCCC	G	.	.	DP=101;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=164,181;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,2:0.037:98:36,2:38,0:47,49,1,1
chr3	151134120	.	CCAGCCCCAGCAGCCTCCCCAGCCCCAGCAGTCCTCGCAGTCCCAGAGTCAGACCCT	C	.	.	DP=195;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=148,169;MMQ=60,60;MPOS=-77;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:148,42:0.035:190:13,22:32,16:0|1:151134120_CCAGCCCCAGCAGCCTCCCCAGCCCCAGCAGTCCTCGCAGTCCCAGAGTCAGACCCT_C:151134120:59,89,32,10
chr3	151134122	.	AG	CC	.	.	DP=106;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,13:0.202:63:14,1:27,1:0|1:151134122_AG_CC:151134122:7,43,13,0
chr3	151134127	.	CAGCAG	C	.	.	DP=116;ECNT=6;MBQ=33,17;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,13:0.171:74:17,5:33,1:0|1:151134122_AG_CC:151134122:14,47,13,0
chr3	151134135	.	T	C	.	.	DP=117;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,12:0.163:72:26,6:31,4:0|1:151134122_AG_CC:151134122:14,46,12,0
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chr3	151531894	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,27:0.528:51:18,13:5,14:18,6,22,5
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chr3	151542362	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	151542408	.	AAAAC	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=166,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:3,2:6,0,4,2
chr3	151545318	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:5,4:2,6:0|1:151545318_A_T:151545318:7,0,10,0
chr3	151545321	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:5,4:2,7:0|1:151545318_A_T:151545318:7,0,11,0
chr3	151545323	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.601:18:5,4:2,7:0|1:151545318_A_T:151545318:7,0,11,0
chr3	151546041	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr3	151597768	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,0:12,4:1,22,0,4
chr3	152176974	.	T	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,4:0.073:66:42,0:18,4:53,9,4,0
chr3	152881457	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=181,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.622:5:1,1:1,1:0,2,1,2
chr3	152881852	.	AT	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=124,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.252:42:15,4:12,3:24,8,7,3
chr3	152883395	.	CT	C,CTT	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=33,33,32;MFRL=149,139,151;MMQ=60,60,60;MPOS=22,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=17.00,6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:44,13,7:0.189,0.113:64:26,5,1:16,8,4:42,2,17,3
chr3	152883481	.	AT	A	.	.	DP=161;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:110,6:0.056:116:45,2:58,4:32,78,1,5
chr3	153203988	.	C	CCTTCCCTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:153203988_C_CCTTCCCTT:153203988:0,1,0,1
chr3	153203989	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:153203988_C_CCTTCCCTT:153203988:0,1,0,1
chr3	153203992	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=88,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:153203988_C_CCTTCCCTT:153203988:0,2,0,1
chr3	153203994	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=88,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:153203988_C_CCTTCCCTT:153203988:0,2,0,1
chr3	153840162	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=181,252;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,2:4,4:9,1,6,0
chr3	153842161	.	CT	C,CTTTTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32,22;MFRL=147,176,147;MMQ=40,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,22;RU=T;STR;TLOD=10.33,4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,2:0.608,0.226:9:1,2,0:0,3,1:1,0,7,1
chr3	153842181	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.338:11:2,0:4,0:3,4,4,0
chr3	153847582	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=226,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,7:1,5:0,3,1,11
chr3	153870511	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,29:0.697:41:5,15:7,13:12,0,28,1
chr3	153970796	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=141.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,18:0,15:0|1:153970796_A_G:153970796:0,0,36,0
chr3	153970802	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,13:0.335:40:12,7:14,6:0|1:153970796_A_G:153970796:26,1,13,0
chr3	153972500	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,11:0,0,18,5
chr3	153994502	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.716:26:3,11:4,8:7,0,19,0
chr3	153995307	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:2,4:0,9:2,0,13,0
chr3	154002357	.	AT	A,ATT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,34,31;MFRL=144,151,155;MMQ=60,60,60;MPOS=26,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.27,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,6,3:0.214,0.135:27:10,5,0:8,1,3:15,3,7,2
chr3	154007682	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=206,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:3,3:0,8,0,4
chr3	154021063	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=92.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,34:0.461:74:24,20:16,14:29,11,27,7
chr3	154024165	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=235,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr3	154055835	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=175,245;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:29,0:20,3:38,12,0,3
chr3	154138872	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:15,3:12,2:16,12,1,4
chr3	154802091	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:22,3:19,0:4,38,0,3
chr3	154834379	.	G	GTATA,GTATATA,GTATATATA,GTATATATATA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34,32,32,32;MFRL=0,132,123,183,167;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=23,27,15,20;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=8,10,11,12,13;RU=TA;STR;TLOD=3.61,6.17,21.00,18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:0,2,3,8,7:0.114,0.160,0.367,0.324:20:0,2,3,6,4:0,0,0,2,3:0,0,10,10
chr3	155198866	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,132;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.120:48:26,0:15,5:35,8,5,0
chr3	155212325	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=149,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:1,6,1,7
chr3	155215282	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=152,246;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155215282_T_C:155215282:0,1,0,1
chr3	155215284	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=152,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:155215282_T_C:155215282:0,1,0,1
chr3	155215290	.	GA	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155215282_T_C:155215282:0,0,0,1
chr3	155241593	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:4,0,6,0
chr3	155271825	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,17,2
chr3	155393873	.	TC	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,10:0.167:64:24,0:28,10:17,37,0,10
chr3	155551919	.	TTTA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:155551919_TTTA_T:155551919:0,2,0,1
chr3	155551927	.	TG	AA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:155551919_TTTA_T:155551919:0,2,0,1
chr3	155551930	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:155551919_TTTA_T:155551919:0,2,0,1
chr3	155611557	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr3	155628381	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,10;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155628381_G_A:155628381:0,0,1,0
chr3	155628385	.	CC	AA	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155628381_G_A:155628381:0,0,1,0
chr3	155628388	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155628381_G_A:155628381:0,0,1,0
chr3	155628390	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155628381_G_A:155628381:0,0,1,0
chr3	155628393	.	GC	CA	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,11;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155628381_G_A:155628381:0,0,1,0
chr3	155628396	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155628381_G_A:155628381:0,0,1,0
chr3	155628398	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155628381_G_A:155628381:0,0,1,0
chr3	155628402	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=21,26;MFRL=129,181;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155628381_G_A:155628381:1,0,1,0
chr3	155628404	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=35,15;MFRL=129,181;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:155628381_G_A:155628381:1,0,1,0
chr3	155628406	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=34,24;MFRL=129,181;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155628381_G_A:155628381:1,0,1,0
chr3	155628877	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=65.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:10,13:5,7:10,5,15,5
chr3	155637190	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,1:3,6:0,6,1,6
chr3	155639959	.	A	G	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=182.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,55:0.652:84:14,31:15,23:20,9,47,8
chr3	155643189	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=21,20,28,31;MFRL=176,115,170,135;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,25,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.30,8.08,6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:28,4,6,6:0.088,0.144,0.144:44:10,1,0,4:10,1,6,0:3,25,4,12
chr3	155655279	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.536:13:1,5:4,1:6,0,7,0
chr3	156009614	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,14,0
chr3	156009925	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=288,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=123.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.950:37:1,16:0,19:0,1,2,34
chr3	156177696	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:8,2:23,1:8,25,0,3
chr3	156233027	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=214,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:3,1:2,6:0,5,0,8
chr3	156266642	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,17,4
chr3	156266880	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,0:0,0,2,3
chr3	156413615	.	C	CTTTTTTT,CTTTTTTTTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,0,28;MFRL=43,163,165;MMQ=60,60,60;MPOS=50,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,24,26;RU=T;STR;TLOD=4.51,7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,6:0.254,0.556:10:0,0,2:1,0,3:0,2,6,2
chr3	156413633	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=97,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.320:17:4,2:7,3:4,7,6,0
chr3	156421525	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=175,233;MMQ=40,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr3	156423000	.	G	GCT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.636:2:0,1:1,0:0|1:156423000_G_GCT:156423000:0,1,0,1
chr3	156423002	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.636:2:0,1:1,0:0|1:156423000_G_GCT:156423000:0,1,0,1
chr3	156423006	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.636:2:0,1:0,0:0|1:156423000_G_GCT:156423000:0,1,0,1
chr3	156423007	.	A	AAT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156423000_G_GCT:156423000:0,0,0,1
chr3	156423009	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156423000_G_GCT:156423000:0,0,0,1
chr3	156423011	.	T	TATTC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156423000_G_GCT:156423000:0,0,0,1
chr3	156423013	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156423000_G_GCT:156423000:0,0,0,1
chr3	156742775	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,4:0,11:0,0,1,15
chr3	156867776	.	G	GAA	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=A;STR;TLOD=83.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,32:0.601:53:6,16:13,12:6,15,10,22
chr3	156870059	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=151.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,56:0.564:99:22,30:20,25:11,32,11,45
chr3	156870816	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.546:44:9,13:10,10:16,4,21,3
chr3	156876555	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=192,169;MMQ=60,57;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:10,0,2,0
chr3	156876574	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,7:1,6:2,0,13,0
chr3	156876803	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.829:19:0,6:2,9:1,2,1,15
chr3	156877276	.	CAA	C	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=155.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,43:0.587:73:15,17:13,26:4,26,8,35
chr3	156877357	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=205,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.540:22:8,8:2,4:0,10,1,11
chr3	156877530	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=219,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,8:3,4:6,0,12,0
chr3	156978919	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.616:19:1,7:6,4:6,1,9,3
chr3	156983273	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,8:3,4:5,0,12,0
chr3	157004323	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:2,4:9,7:6,6,5,6
chr3	157081226	.	GT	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:19,1:14,2:22,12,2,1
chr3	157081604	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=191,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	157082082	.	C	CAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:7,1:1,6:8,0,8,0
chr3	157082362	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:2,0:4,2:0|1:157082362_A_T:157082362:0,6,0,2
chr3	157082368	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,1:0|1:157082362_A_T:157082362:0,6,0,2
chr3	157099227	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:1,11,0,2
chr3	157188045	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr3	157188378	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=214,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr3	157289936	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=258,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	157318257	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=159,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr3	157820423	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=196,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.815:25:2,11:2,10:4,0,21,0
chr3	158072623	.	AT	A,ATT	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=29,33,31;MFRL=136,166,102;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=10.80,11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:50,10,12:0.131,0.146:72:26,7,7:23,2,5:26,24,15,7
chr3	158072734	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=167,225;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.094:51:24,0:21,4:9,38,0,4
chr3	158072776	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,6:3,7:0,9,0,13
chr3	158178856	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.473:36:14,8:5,9:1,18,1,16
chr3	158254806	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,18:0.380:48:19,8:11,10:27,3,16,2
chr3	158261296	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:10,3:31,0:4,37,0,3
chr3	158310391	.	CAGTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr3	158314810	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,2:6,5:0,9,0,7
chr3	158318015	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=122.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,14:0,20:0,0,0,36
chr3	158318027	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:12,2:14,1:0,27,0,3
chr3	158320597	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.422:29:6,6:10,6:13,4,10,2
chr3	158378847	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,1:5,6:0,12,0,7
chr3	158384883	.	C	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,36:0.500:72:14,15:22,21:9,27,5,31
chr3	158384979	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=182,240;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:6,3:1,12,0,3
chr3	158407930	.	CTT	C,CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=137,177,199;MMQ=60,60,60;MPOS=14,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.52,6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.228,0.318:10:1,1,1:4,1,2:4,1,5,0
chr3	158415402	.	TAGA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=220,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,7:3,0:6,0,7,0
chr3	158422506	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,2:0,0:3,0,2,0
chr3	158428809	.	A	AAGGC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=77,249;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AGGC;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.385:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr3	158526958	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,10;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.603:14:1,0:4,0:2,3,9,0
chr3	158537415	.	CTTTTT	C,CTTTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32,33;MFRL=188,141,189;MMQ=60,60,60;MPOS=8,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,15;RU=T;STR;TLOD=20.10,5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,4:0.504,0.354:11:1,3,2:0,2,1:1,0,7,3
chr3	158537443	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=181,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:2,4:2,2:6,2,4,4
chr3	158538056	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:11,6:10,4:11,10,3,7
chr3	158539294	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:8,8:14,6:22,0,10,4
chr3	158539496	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,24:0.441:55:9,10:20,13:14,17,8,16
chr3	158980279	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	158991724	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,9:0,13:0,0,2,22
chr3	159482412	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:5,6:14,3:10,9,4,5
chr3	159995335	.	C	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,4:0.061:69:36,3:29,0:46,19,4,0
chr3	159998667	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:5,0:5,3:0,11,0,3
chr3	160003677	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.675:41:5,13:8,14:0,13,3,25
chr3	160021681	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,36:0.578:62:9,20:17,16:15,11,25,11
chr3	160025460	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=163,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:14,2,2,0
chr3	160074038	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=233,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	160130110	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,32:0.662:48:11,18:4,12:15,1,29,3
chr3	160131236	.	CTTT	C,CT,CTT,CTTTT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,31,35,30,30;MFRL=154,170,153,192,192;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=17,14,15,21;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=13,10,11,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.35,4.39,11.46,3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:22,2,3,7,4:0.062,0.084,0.170,0.112:38:11,0,2,1,0:10,2,1,4,2:21,1,13,3
chr3	160134208	.	GT	G,GTT	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=32,15,33;MFRL=139,136,159;MMQ=60,60,60;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.78,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,7,4:0.172,0.100:41:6,1,1:12,2,2:6,24,4,7
chr3	160134241	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.244:27:4,1:8,2:0,21,0,6
chr3	160135428	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=252,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	160137363	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=32,32,32,33;MFRL=167,149,152,126;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,21,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.74,80.97,5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:21,5,41,6:0.067,0.569,0.086:73:10,3,22,1:10,2,17,4:2,19,15,37
chr3	160141146	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.431:20:3,3:8,6:11,0,7,2
chr3	160141166	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:8,0:13,0:25,4,6,0
chr3	160141656	.	CT	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.191:31:9,1:10,2:4,21,0,6
chr3	160142559	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=190,195;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,3:9,0:25,0,3,0
chr3	160142618	.	A	C	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,29:0.472:61:18,11:13,15:25,7,23,6
chr3	160148756	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,29:0.468:62:14,16:19,13:30,3,23,6
chr3	160149970	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=189,158;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:10,2:21,0:32,0,2,0
chr3	160149983	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=180,131;MMQ=60,41;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:8,2:20,0:30,0,2,0
chr3	160219837	.	CAT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:10,2:10,3:21,2,4,1
chr3	160233406	.	CTT	CT,C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=21,32,32;MFRL=173,215,172;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,12;RU=T;STR;TLOD=8.56,5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,4:0.263,0.213:20:5,2,2:2,2,1:1,10,0,9
chr3	160233449	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=183,251;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:6,0:0|1:160233449_G_C:160233449:0,17,0,2
chr3	160233451	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=183,251;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:0|1:160233449_G_C:160233449:0,17,0,2
chr3	160233463	.	TG	CA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=197,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:0,14,0,2
chr3	160248732	.	C	CA	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.088:54:26,1:22,3:17,33,3,1
chr3	160249220	.	TA	T,TAA	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=27,27,28;MFRL=148,157,176;MMQ=60,60,60;MPOS=12,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=7.15,4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,7,4:0.154,0.107:44:15,4,2:16,3,2:29,4,10,1
chr3	160283126	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.473:34:9,4:9,12:0,18,0,16
chr3	160395093	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,26:0.804:33:3,10:4,15:7,0,23,3
chr3	160679422	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=188,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr3	160679744	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,1,13
chr3	160951279	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.413:44:13,10:13,8:6,20,0,18
chr3	160952813	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:22,0,2,0
chr3	160955879	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.526:16:2,5:6,3:0|1:160955879_G_T:160955879:8,0,8,0
chr3	160955882	.	CTT	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.539:19:2,5:5,4:0|1:160955879_G_T:160955879:9,0,10,0
chr3	160955906	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=17,18;MFRL=153,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.180:26:3,0:5,0:20,2,4,0
chr3	160964271	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=215,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,4:5,8:0,9,0,12
chr3	160967354	.	G	A	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,41:0.442:93:26,24:26,17:18,34,3,38
chr3	161064193	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:1,14:9,4:0,10,0,18
chr3	161216860	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:4,1:11,0,2,0
chr3	161216912	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.335:40:14,6:12,7:24,3,12,1
chr3	163889183	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.132:51:23,6:20,0:42,3,6,0
chr3	163889384	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:2,7:10,7:2,10,2,13
chr3	164059086	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=166,0;MMQ=60,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:164059086_C_T:164059086:3,0,1,0
chr3	164059095	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=166,0;MMQ=60,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:164059086_C_T:164059086:3,0,1,0
chr3	164059123	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	164697082	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:5,0,6,0
chr3	164699998	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:3,7:4,7:5,2,12,2
chr3	164700734	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.562:23:2,6:7,5:6,4,9,4
chr3	164714296	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:6,9:6,8:11,1,17,0
chr3	164724567	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,27:0.701:38:6,10:5,17:10,1,22,5
chr3	164733721	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:6,1,5,0
chr3	164748665	.	CA	C,CAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,17,36;MFRL=49,196,0;MMQ=60,60,60;MPOS=10,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.32,9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,7:0.255,0.462:15:1,0,5:2,1,0:3,1,4,7
chr3	164751319	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:4,5:0,4:0,4,1,8
chr3	164755664	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.619:27:7,7:3,9:7,3,17,0
chr3	164756779	.	GTTAAGTTTCTATGGAA	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,2:0.045:65:17,0:25,2:51,12,2,0
chr3	164758630	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	164766816	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=189,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr3	164766835	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:6,0,6,0
chr3	164767508	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=165,162;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:17,1,2,0
chr3	164772957	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:5,3:3,1:8,1,2,2
chr3	164776913	.	C	CAT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:9,4:6,6:4,12,4,7
chr3	164777677	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:4,1:8,4:7,5,4,1
chr3	164781368	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:15,12:7,2:0,22,0,14
chr3	164783252	.	AAT	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=83,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=AT;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.360:9:0,2:3,1:0|1:164783252_AAT_A:164783252:0,6,0,3
chr3	164783260	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,0:1,5:0,4,0,5
chr3	164783262	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=83,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:0|1:164783252_AAT_A:164783252:0,6,0,3
chr3	164785338	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=184,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr3	164786629	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.252:26:9,1:9,5:1,19,1,5
chr3	164793648	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,24:0.695:34:7,12:2,12:10,0,17,7
chr3	164905648	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:14,2:2,1:17,0,3,0
chr3	164905688	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,24:0.735:32:5,18:3,6:6,2,16,8
chr3	166960278	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,4:2,5:6,0,8,1
chr3	167023645	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=177,195;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.063:46:24,0:19,2:30,14,0,2
chr3	167183414	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:5,5:6,7:2,10,1,11
chr3	167508062	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr3	167745703	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr3	167754573	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:8,6:3,3:10,1,8,1
chr3	167762678	.	CAA	C,CA,CAAA,CAAAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,34,36,27,19;MFRL=158,178,209,148,140;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=24,11,23,17;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.32,4.07,12.04,4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:17,2,3,8,3:0.074,0.102,0.239,0.105:33:6,0,0,3,0:7,2,3,4,1:0,17,3,13
chr3	168269756	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:4,3:6,10:2,8,2,11
chr3	168818560	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	168819788	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,13,4
chr3	168834703	.	GGC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,339;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	168840571	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,9:0,6:0,0,2,13
chr3	168840607	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr3	169525517	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0|1:169525517_A_AG:169525517:0,5,0,1
chr3	169525523	.	A	ATATAAGAAC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:2,1:0|1:169525517_A_AG:169525517:0,5,0,1
chr3	169525526	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	169540142	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=186,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:8,2:13,7,2,0
chr3	169555328	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=137,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,2:0.048:60:24,0:31,2:24,34,1,1
chr3	169684706	.	G	C	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,6:0.093:72:23,0:28,1:21,45,0,6
chr3	169710434	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,0:7,3:11,5,3,0
chr3	169846567	.	CTTCTGCAGCTGGAAGTTCCTCTTCTGACACCAAAGCA	C	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,6:0.084:82:27,5:22,1:31,45,0,6
chr3	169988364	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.841:3:0,0:0,1:0,0,1,2
chr3	169992975	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=178,112;MMQ=56,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.688:7:0,3:2,2:1,1,5,0
chr3	169998127	.	T	TA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.078:48:21,2:24,1:18,27,1,2
chr3	170002157	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,16,0
chr3	170013604	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:8,3:19,0:29,0,3,0
chr3	170013846	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,9:0,15:0,0,0,24
chr3	170108313	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:10,0:3,2:1,12,0,2
chr3	170198967	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,8:0,18:0,0,4,22
chr3	170720299	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.378:9:0,1:2,0:6,0,3,0
chr3	170723276	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:0,5,0,7
chr3	170723664	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:1,4:3,5:0|1:170723664_A_G:170723664:4,0,8,1
chr3	170723668	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:1,4:3,5:0|1:170723664_A_G:170723664:4,0,8,1
chr3	170724883	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:9,11:0,4:8,1,13,2
chr3	170724955	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.527:32:7,5:7,10:8,7,8,9
chr3	170727739	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:2,2:4,1:4,3,0,3
chr3	170732599	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr3	170797252	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:5,1,7,0
chr3	170800202	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.335:31:10,6:10,3:8,13,0,10
chr3	170801912	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=86,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.356:9:0,1:3,2:4,2,1,2
chr3	170801933	.	CA	AC	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=133,173;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:8,0:0|1:170801933_CA_AC:170801933:10,12,2,0
chr3	170801939	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=119,173;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,0:10,1:0|1:170801933_CA_AC:170801933:13,16,2,0
chr3	170801941	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=119,173;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,0:11,1:0|1:170801933_CA_AC:170801933:13,16,2,0
chr3	170802836	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=166,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,1:7,5:9,1,6,0
chr3	170803095	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:7,5:0,1:0,8,0,6
chr3	170805336	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:8,5:1,3:2,7,1,7
chr3	170811531	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:6,0,5,0
chr3	170844016	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=190,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:0,0:1,3:0,3,1,4
chr3	170846676	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=15,19;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.427:8:0,0:0,1:2,3,0,3
chr3	170885097	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr3	170912469	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,8:3,4:0,10,0,12
chr3	170928820	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr3	171177708	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:171177708_T_C:171177708:3,0,1,0
chr3	171177709	.	G	GGCCCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,10;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:171177708_T_C:171177708:3,0,1,0
chr3	171405384	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:8,3:6,2:2,12,0,5
chr3	171405424	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=153,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,3:2,1:0,5,0,4
chr3	171406737	.	G	GGCAATACATTAGAAAACAGTCAGC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,1:5,1:0,11,0,2
chr3	171442387	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=157,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:0,3:3,0:4,0,3,0
chr3	171442635	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=208,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr3	171443955	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=185,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr3	172046695	.	GT	G,GTTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=167,159,185;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=3.68,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,2:0.132,0.094:25:6,2,1:12,1,1:17,3,5,0
chr3	172055101	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:7,11:4,4:7,4,10,5
chr3	172060700	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr3	172064091	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.290:36:13,3:12,7:24,2,9,1
chr3	172224769	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:172224769_GC_G:172224769:0,0,0,10
chr3	172224771	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:172224769_GC_G:172224769:0,0,0,10
chr3	172227199	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,1,12
chr3	172240999	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.373:46:10,9:18,7:25,4,16,1
chr3	172365619	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.451:31:11,7:6,6:16,1,13,1
chr3	172428619	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,4:0.064:75:32,0:38,4:48,23,1,3
chr3	172480173	.	A	ATT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=183.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,18:0,23:0|1:172480173_A_ATT:172480173:0,0,36,6
chr3	172480174	.	AC	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=183.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,16:0,23:0|1:172480173_A_ATT:172480173:0,0,36,6
chr3	172520818	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	172520860	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=183,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	172534428	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=102.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,14:0,18:0,0,31,5
chr3	172537850	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,15,0
chr3	172634027	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	173998955	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,5:4,8:2,4,5,8
chr3	174814920	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.342:33:11,4:11,7:16,6,7,4
chr3	174951631	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=196,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	174974177	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.347:47:18,10:13,6:26,5,12,4
chr3	175165201	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:5,3:1,5:0,6,0,9
chr3	175189406	.	CT	C	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=66,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=163.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,64:0.965:67:3,34:0,29:1,2,50,14
chr3	175345277	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	176744294	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,218;MMQ=60,46;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:9,1:14,1:3,20,0,2
chr3	176765253	.	G	A	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=368.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,112:0.991:112:0,54:0,57:0,0,71,41
chr3	176767710	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr3	176769608	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.368:28:5,4:12,6:0,18,1,9
chr3	178742995	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=172,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,1:13,1:4,13,0,2
chr3	178785549	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.474:38:10,7:10,11:10,10,4,14
chr3	178919057	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=183,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:11,2,2,0
chr3	178919370	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=32,13;MFRL=156,213;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.130:45:15,1:19,0:6,33,0,6
chr3	178919395	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=27,13;MFRL=171,214;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:2,0:6,0:0,15,0,2
chr3	178919397	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=15,28;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:2,0:0,2:0,10,0,2
chr3	178919416	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=177,196;MMQ=52,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,0:6,2:0,14,0,2
chr3	178919418	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=178,195;MMQ=54,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,0:5,3:0|1:178919418_C_T:178919418:0,13,0,3
chr3	178919422	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=177,195;MMQ=52,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,0:4,3:0|1:178919418_C_T:178919418:0,12,0,3
chr3	178922274	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.594:42:10,12:6,13:12,5,17,8
chr3	178938735	.	CTA	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=158,138;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.070:54:20,3:25,0:43,8,3,0
chr3	178942431	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:3,6:9,7:12,0,13,0
chr3	178962491	.	G	GA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,18;MFRL=168,164;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.486:27:4,3:3,3:3,11,3,10
chr3	178976591	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,9:0,0,25,0
chr3	178976821	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=222.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,29:0,39:0,0,19,49
chr3	179069907	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:6,0:7,3:0,13,0,3
chr3	179083024	.	AT	A,ATT	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=27,26,28;MFRL=156,176,171;MMQ=60,60,60;MPOS=17,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=11.84,5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:49,10,5:0.146,0.088:64:20,5,1:25,4,3:9,40,3,12
chr3	179085722	.	GTA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TA;STR;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:9,2:11,4:21,0,6,0
chr3	179092989	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.626:27:3,9:6,8:9,1,16,1
chr3	179095162	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.054:71:36,2:32,1:34,34,2,1
chr3	179096508	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=148.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,22:0,23:0,0,29,17
chr3	179103342	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=199,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.553:16:5,5:2,4:7,0,7,2
chr3	179103542	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=155,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:13,0:1,23,0,2
chr3	179104188	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=232,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:6,0,2,0
chr3	179109735	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.607:23:3,7:5,7:9,0,12,2
chr3	179122918	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	179131385	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=126,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,1:14,1:11,16,0,2
chr3	179291308	.	CT	C,TC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32,30;MFRL=212,203,164;MMQ=40,60,60;MPOS=30,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.05,6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,4:0.615,0.238:13:1,5,3:0,3,1:0,1,0,12
chr3	179298584	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.269:21:2,2:13,3:7,8,4,2
chr3	179301051	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,4:5,0,8,1
chr3	179304254	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr3	179305654	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,5:0,0,15,2
chr3	179320386	.	CG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.346:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr3	179399570	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr3	179447924	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:14,4,2,0
chr3	179448066	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=110,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.850:12:1,5:0,5:1,1,2,8
chr3	179448383	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,10:0,9:0,0,16,4
chr3	179463059	.	G	GTAAGAAGTGAGACTCCATATCTAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179463059_G_GTAAGAAGTGAGACTCCATATCTAC:179463059:0,0,0,1
chr3	179463061	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179463059_G_GTAAGAAGTGAGACTCCATATCTAC:179463059:0,0,0,1
chr3	179469995	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr3	179472674	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,4:2,6,0,6
chr3	179481971	.	CTG	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=201,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=TG;STR;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:1,1:2,4:0,7,0,5
chr3	179501981	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:4,1:7,1:0,14,0,4
chr3	179526234	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,15;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:1,1:0,5,0,3
chr3	179592053	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	179592240	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,3:7,7:1,9,1,9
chr3	179593072	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,4:3,5:5,1,7,2
chr3	179689365	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,1:7,4:10,4,4,1
chr3	180319981	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,7:3,5:6,1,11,1
chr3	180322248	.	CT	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.128:36:10,3:20,1:27,5,2,2
chr3	180322260	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.378:37:5,0:8,0:12,9,16,0
chr3	180323585	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,18:0.316:58:21,9:19,9:18,22,12,6
chr3	180365935	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:9,2,2,0
chr3	180365956	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=193,160;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,4:3,6:5,2,8,2
chr3	180379569	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:5,0:8,3:12,1,3,0
chr3	180630565	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,30:0.401:75:19,12:25,17:21,24,14,16
chr3	180665635	.	A	AT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.132:40:18,1:17,3:28,7,2,3
chr3	180666060	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,8:5,6:7,1,13,1
chr3	180666067	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:6,2:6,5:12,1,7,0
chr3	180680889	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.308:14:4,1:5,1:1,9,0,4
chr3	180693215	.	GTT	G,GT,GTTT,GTTTT	.	.	DP=116;ECNT=1;MBQ=33,32,35,35,36;MFRL=143,108,183,131,128;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=27,21,24,18;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=8.13,11.08,23.85,8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:31,8,8,20,8:0.095,0.117,0.279,0.106:75:16,6,3,9,2:13,1,5,10,5:5,26,13,31
chr3	181431226	.	GA	GAA,G	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=33,29,32;MFRL=141,110,159;MMQ=60,60,60;MPOS=12,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,10;RU=A;STR;TLOD=3.90,13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:49,4,11:0.060,0.151:64:30,2,3:15,1,7:34,15,9,6
chr3	182546017	.	C	A	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=266.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,90:0.990:90:0,45:0,44:0,0,14,76
chr3	182575631	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,17:0,0,29,4
chr3	182576923	.	T	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=217.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,43:0,24:0,0,56,12
chr3	182590354	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=134.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,16:0,22:0,0,3,35
chr3	182598568	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=210,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:12,0,0,4
chr3	182598863	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,5:0,17:0,0,0,22
chr3	182681835	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=163,169;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.181:18:4,0:11,2:1,14,0,3
chr3	182681853	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,1,13
chr3	182735182	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	182757013	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=226,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:0,5:3,2:0,3,1,6
chr3	182788702	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=175,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,1:2,1:10,0,2,0
chr3	182804385	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr3	182810144	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr3	182812349	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:26,4:25,0:26,26,3,1
chr3	182817328	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	182858287	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,12:0,0,13,14
chr3	182858461	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr3	182870082	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,5:0,3:0,0,10,0
chr3	182871962	.	C	T	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=278.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,85:0.989:85:0,44:0,38:0,0,34,51
chr3	182913092	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,4:0,12,0,9
chr3	182946002	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,7,1
chr3	182947413	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:4,4:6,2:10,1,5,1
chr3	182987515	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr3	183107668	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:183107668_A_G:183107668:0,0,0,1
chr3	183107670	.	TT	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:183107668_A_G:183107668:0,0,0,1
chr3	183493991	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=249,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr3	183558497	.	CTT	C,CT,CTTT,CTTTT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=18,22,19,19,24;MFRL=127,171,167,156,184;MMQ=60,60,51,40,60;MPOS=20,21,23,21;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=3.05,9.63,15.36,6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:4,2,6,8,5:0.097,0.238,0.315,0.179:25:1,1,0,0,0:1,1,2,2,4:1,3,0,21
chr3	183558514	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:10,3:10,4:0,20,0,7
chr3	183585883	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,3:4,6:0,7,0,9
chr3	183677635	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:6,3:16,1:1,23,0,4
chr3	183703218	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=185,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,0:11,2:4,15,0,2
chr3	183731953	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=192,213;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:2,1:5,2:8,0,3,0
chr3	183753964	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=179,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,0:7,3:0,11,0,3
chr3	183756808	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.654:27:6,10:3,7:3,6,1,17
chr3	183774718	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:7,2:8,0:5,11,2,0
chr3	183776469	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=203,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:3,0:0,8,0,2
chr3	183777919	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,185;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:3,6:3,4:5,1,7,4
chr3	183818511	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr3	183819155	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=153,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr3	183819214	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=126,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,2:9,0:20,4,2,0
chr3	183823863	.	G	GAAGA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGA;STR;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:6,4:2,4:6,2,9,2
chr3	183881466	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.088:37:13,2:20,0:16,18,3,0
chr3	183884550	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:4,1,3,1
chr3	183896641	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,16:0.334:49:16,7:16,9:23,10,11,5
chr3	183900095	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,2:6,0:1,15,2,0
chr3	183900680	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.412:42:10,9:12,8:2,23,1,16
chr3	183900729	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,0,16
chr3	183903935	.	C	CG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=187,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,12:0.415:29:9,6:7,5:0|1:183903935_C_CG:183903935:17,0,12,0
chr3	183903937	.	G	GC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=195,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,17:0.585:29:6,9:5,8:1|0:183903935_C_CG:183903935:12,0,17,0
chr3	183904226	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.667:16:2,3:3,8:0|1:183904226_C_T:183904226:4,1,7,4
chr3	183904232	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,4:0,10:0|1:183904226_C_T:183904226:0,0,12,5
chr3	183904520	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=92.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,27:0.758:35:4,14:4,13:4,4,20,7
chr3	183905103	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,4:4,1:10,1,4,1
chr3	183906515	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,13:0,12:0,0,17,8
chr3	183909143	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=228,225;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr3	183955109	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:4,5:2,3:2,4,5,4
chr3	183957095	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=128,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr3	183957467	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:5,8:2,7:5,2,5,10
chr3	183960252	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.618:32:6,10:6,10:10,2,18,2
chr3	183963134	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=119.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,44:0.727:60:9,15:6,24:3,13,14,30
chr3	183966500	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=156,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:1,0:0|1:183966500_T_C:183966500:2,0,1,0
chr3	183966504	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,12;MFRL=156,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:183966500_T_C:183966500:3,1,1,0
chr3	183975287	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:12,2:7,0:13,6,1,1
chr3	183994536	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	183996005	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:18,1:7,1:14,13,1,1
chr3	183996213	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:3,2,1,2
chr3	184010048	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,26:0.549:47:11,13:10,12:7,14,8,18
chr3	184020100	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=196,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:7,9:3,6:10,0,16,0
chr3	184020568	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=99.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,31:0.653:47:9,12:7,19:0,16,9,22
chr3	184020871	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=67.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,22:0.676:32:4,4:6,17:1,9,5,17
chr3	184026703	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=160,143;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,5:2,0:0,3,0,5
chr3	184039524	.	A	C	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,8:0.078:75:25,0:28,1:30,37,8,0
chr3	184039743	.	GGAA	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAA;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.054:63:26,1:21,2:34,26,2,1
chr3	184046355	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr3	184046612	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.410:29:7,6:10,4:13,4,5,7
chr3	184070534	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=159,338;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.238:22:11,0:5,4:12,5,5,0
chr3	184070675	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,3:1,4:1,2,1,6
chr3	184071017	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=91.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,23:0.616:37:7,13:7,9:0|1:184071017_G_A:184071017:7,7,12,11
chr3	184071019	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=90.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,23:0.616:37:7,13:7,10:0|1:184071017_G_A:184071017:7,7,12,11
chr3	184072459	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=121,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,5:2,9:5,0,3,11
chr3	184074927	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,0:0|1:184074927_A_C:184074927:0,8,2,0
chr3	184074929	.	C	CGGGGGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,0:0|1:184074927_A_C:184074927:0,8,2,0
chr3	184075958	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.634:25:2,9:6,6:7,2,13,3
chr3	184090266	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,31:0.640:48:12,13:5,18:14,3,28,3
chr3	184091149	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=181,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:2,3:3,5:4,1,9,0
chr3	184094183	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr3	184099206	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1,2,0,3
chr3	184100338	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=168,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:2,2,2,7
chr3	184100961	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=240,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,3:1,6:1,1,5,4
chr3	184102396	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.440:12:2,3:3,2:6,1,5,0
chr3	184102579	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr3	184297502	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:16,1:25,2:22,21,0,3
chr3	184429133	.	A	ATCC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TCC;STR;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:3,4:2,3:7,0,9,1
chr3	184567039	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:5,3:1,7:1,5,1,9
chr3	184577917	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:7,6:3,4:0,10,0,10
chr3	184580917	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=201,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:2,3:4,3:0,7,1,5
chr3	184588420	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=209,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:3,3:3,10:6,0,12,1
chr3	184616504	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:1,8,0,6
chr3	184642587	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr3	184654166	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,7:0,0,0,13
chr3	184658058	.	T	TTA,TTATA,TTATATA	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=31,20,31,23;MFRL=147,151,152,131;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,18,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,10,11,12;RU=TA;STR;TLOD=32.63,74.01,4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,14,25,4:0.261,0.593,0.102:45:2,3,10,1:0,5,12,1:0,2,4,39
chr3	184675095	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,4:3,7:3,1,11,0
chr3	184675147	.	CTTTTA	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=79.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.601:33:3,13:8,7:11,2,17,3
chr3	184675359	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=166.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,22:0,22:0,0,1,45
chr3	184682214	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:3,1,3,2
chr3	184689597	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,190;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:0,23,0,2
chr3	184700356	.	A	C	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=237.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,73:0.987:73:0,27:0,39:0,0,41,32
chr3	184717703	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,5:0,0,1,8
chr3	184766186	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:4,0,5,0
chr3	184766249	.	TC	CT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,5:6,7:6,3,11,2
chr3	184766392	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=78,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:0,4,1,8
chr3	185155430	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.657:15:3,8:2,2:0,5,2,8
chr3	185212593	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr3	185213038	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:0,2:10,0:4,6,2,0
chr3	185232169	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr3	185324097	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:12,0,3,0
chr3	185330304	.	TTGA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,3:7,6:9,0,9,0
chr3	185339575	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:5,1:1,3:6,1,4,0
chr3	185341970	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=199,174;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	185540911	.	C	CA	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,5:0.058:95:46,3:41,2:44,46,4,1
chr3	185879296	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	185882643	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	185960414	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=244,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:0,4,1,1
chr3	185975789	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=182,36;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr3	185998596	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:3,10:2,5:0,5,0,15
chr3	186006566	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=304.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,82:0.988:82:0,36:0,46:0,0,61,21
chr3	186006618	.	G	C	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,42:0.621:68:10,16:13,25:17,9,15,27
chr3	186015283	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr3	186015303	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0,7,0,2
chr3	186015315	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr3	186276393	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=193,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:0,6,0,5
chr3	186293820	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	186295417	.	A	AT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.411:29:4,3:5,5:16,1,11,1
chr3	186299393	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=237,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:0,12,0,3
chr3	186302391	.	A	ATTGTGT,AGTGTGTGT,AGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,27,28,28;MFRL=0,139,185,164;MMQ=60,60,42,40;MPOS=9,20,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=25.13,6.68,10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,10,2,3:0.425,0.226,0.303:15:0,5,1,1:0,2,1,2:0,0,7,8
chr3	186302412	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:4,1:3,7,2,0
chr3	186331102	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,128;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:18,0:22,3:16,25,0,3
chr3	186335221	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,1:15,1:0,22,0,2
chr3	186337827	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	186363968	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,1:8,1:14,0,2,0
chr3	186386664	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,3:0,5:0,0,9,0
chr3	186395180	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=13,32;MFRL=186,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=141.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,44:0.977:45:0,14:0,22:0,1,33,11
chr3	186435350	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,1:11,1:10,6,1,1
chr3	186435370	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.381:29:7,2:11,8:14,4,5,6
chr3	186442833	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr3	186459227	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=228,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,1:3,0,5,0
chr3	186522293	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.321:13:5,2:3,2:9,0,4,0
chr3	186938956	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,4:4,7:0,6,1,10
chr3	186961478	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr3	186965268	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,4:0,5,1,6
chr3	186967942	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,1:1,6:3,0,7,0
chr3	186969371	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,2:0,3:4,1,5,0
chr3	186969634	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	186978629	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,352;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,2:0.045:64:33,0:29,2:20,42,1,1
chr3	186980264	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=174,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:14,5:10,6:23,1,10,1
chr3	186980285	.	GGA	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GA;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:15,0:14,3:24,9,3,0
chr3	187386804	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:3,1:7,2,2,0
chr3	187416253	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,4:1,5:5,1,9,0
chr3	187419661	.	G	GCCTGCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,2:0,5:0,0,9,0
chr3	187419728	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:6,6:10,6:13,3,10,2
chr3	187446430	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=236,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	188123819	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,21,0
chr3	188202550	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,2,9
chr3	188202582	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,2,4
chr3	188406582	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=168,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:14,0:23,2:11,26,0,2
chr3	188426256	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,2:3,7:0,6,0,9
chr3	188590358	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,26:0.779:33:3,15:2,10:7,0,26,0
chr3	188933213	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:1,1:8,1:0,10,0,2
chr3	189028117	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.445:23:9,3:4,6:13,0,9,1
chr3	189507469	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=174,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:22,3:23,0:47,1,3,0
chr3	189507518	.	C	CAGAG	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=185.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,48:0.636:75:14,17:13,25:27,0,48,0
chr3	189525985	.	CC	AT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=116,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.638:31:6,6:4,12:10,1,19,1
chr3	189547652	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,10:0,19:0,0,26,3
chr3	189547697	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,18:0.367:50:15,7:16,11:25,7,12,6
chr3	189582150	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.073:52:26,2:21,1:21,28,0,3
chr3	189582241	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,8:0,0,0,20
chr3	189587274	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr3	189590824	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=164.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,25:0,25:0,0,4,48
chr3	189604149	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr3	189604160	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,17,2
chr3	189688569	.	C	A	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,21:0.293:73:23,13:29,8:39,13,15,6
chr3	189689723	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:27,0:34,3:26,35,2,1
chr3	189690816	.	G	GA	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=20,16;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.402:22:4,3:3,0:1,12,1,8
chr3	189690826	.	A	AC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.535:22:5,6:5,6:1,9,1,11
chr3	189690861	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=14,25;MFRL=178,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.917:14:0,7:0,6:0,1,0,13
chr3	189692565	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,4:0,0,0,15
chr3	189702395	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,8:0,0,0,16
chr3	189705268	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28,27;MFRL=0,88,169;MMQ=60,46,40;MPOS=16,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,20;RU=A;STR;TLOD=5.70,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.380,0.485:4:0,2,0:0,0,2:0,0,4,0
chr3	189705294	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=131,175;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:9,0:8,9,3,0
chr3	189705542	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr3	189712089	.	GG	AA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr3	190282197	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=76.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,11:0,0,1,24
chr3	190322271	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=183,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:3,4:3,3:0|1:190322271_T_C:190322271:0,6,0,8
chr3	190322277	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=189,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:0|1:190322271_T_C:190322271:0,7,0,7
chr3	190337992	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=187,226;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr3	190338039	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	190341241	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,3,11
chr3	190341292	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	190345043	.	TTTTTG	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTTG;STR;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.922:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr3	190345098	.	GT	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=66.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,11:0,12:0,0,6,19
chr3	190347391	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,16:0,7:0,0,0,23
chr3	190578487	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,3:14,0:13,16,3,0
chr3	190578743	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=188,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.585:5:0,0:1,3:0,2,0,3
chr3	190936482	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=221,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	190967718	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=230,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr3	190986110	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=163.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,28:0,24:0,0,48,5
chr3	190993205	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=171,139;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr3	190993235	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:190993235_C_T:190993235:0,3,0,1
chr3	190993238	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:190993235_C_T:190993235:0,3,0,1
chr3	190995847	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=254.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,41:0,29:0,0,60,10
chr3	190999790	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=78.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,21,0
chr3	190999872	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=149.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,28:0,18:0,0,25,21
chr3	190999917	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=154.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,30:0,19:0,0,23,26
chr3	190999990	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,13:0,0,6,24
chr3	191074796	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,1:4,3:11,0,4,0
chr3	191075012	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,5:6,4:0,9,0,9
chr3	191093053	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=217.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,34:0,24:0,0,29,30
chr3	191093080	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,23:0.387:60:19,12:16,10:11,26,7,16
chr3	191093384	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=120.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,23:0,9:0,0,8,25
chr3	191093434	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=227,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=78.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.920:23:1,16:0,6:0,1,0,22
chr3	191093475	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	191097908	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=120.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,17:0,21:0,0,38,2
chr3	191097928	.	G	GT,GTT	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=32,32,32;MFRL=148,158,156;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=T;STR;TLOD=34.81,5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,21,8:0.535,0.200:40:2,11,2:7,10,6:9,2,28,1
chr3	191097966	.	T	C	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=15,31;MFRL=209,147;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=246.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,77:0.987:78:0,37:0,33:1,0,48,29
chr3	191098121	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=154.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,27:0,17:0,0,2,42
chr3	191098731	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=178.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,28:0,31:0,0,15,44
chr3	191100448	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,19:0,15:0,0,33,1
chr3	191100642	.	A	T	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=96.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,39:0.400:97:24,17:34,19:18,40,9,30
chr3	191179303	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	192125768	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	192444899	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:3,5:9,3:12,0,7,1
chr3	192635348	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,1:4,5:7,0,6,0
chr3	192973391	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=164,156;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,5:0.150:38:11,5:20,0:0|1:192973391_C_A:192973391:26,7,5,0
chr3	192973398	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=162,156;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.139:41:13,5:22,0:0|1:192973391_C_A:192973391:29,7,5,0
chr3	193002963	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,0:1,2:0,6,0,2
chr3	193016895	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=166.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,22:0,24:0,0,36,11
chr3	193044923	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,4:0,13:0,0,0,17
chr3	193051605	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=147,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.097:49:15,1:28,1:0|1:193051605_G_A:193051605:26,19,3,1
chr3	193051615	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=151,68;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.086:44:17,3:20,0:0|1:193051605_G_A:193051605:19,22,2,1
chr3	193062906	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,1,15
chr3	193068800	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=98.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,29,0
chr3	193071888	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,3:0,0,2,5
chr3	193081206	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	193081830	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0,0,18,0
chr3	193081866	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=132.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,20:0,17:0,0,38,0
chr3	193082039	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,5:0.075:77:41,3:30,2:18,54,1,4
chr3	193082138	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:2,3:6,4:0,9,1,6
chr3	193153562	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,12:0,0,4,17
chr3	193159449	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr3	193166184	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=184,134;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:193166184_G_A:193166184:0,3,0,1
chr3	193166191	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=184,134;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:193166184_G_A:193166184:0,3,0,1
chr3	193166194	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=175,134;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:193166184_G_A:193166184:0,2,0,1
chr3	193166195	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=169,147;MMQ=50,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:193166195_C_G:193166195:0,2,0,1
chr3	193166198	.	T	TGA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=169,147;MMQ=50,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:193166195_C_G:193166195:0,2,0,1
chr3	193166200	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=169,147;MMQ=50,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:193166195_C_G:193166195:0,2,0,1
chr3	193166201	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=203,134;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:193166184_G_A:193166184:0,1,0,1
chr3	193174782	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr3	193180732	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=203,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr3	193182715	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:3,1,3,0
chr3	193182998	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0|1:193182998_C_CA:193182998:0,4,0,2
chr3	193183001	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:193182998_C_CA:193182998:0,4,0,2
chr3	193183004	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:193182998_C_CA:193182998:0,4,0,2
chr3	193183008	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:193182998_C_CA:193182998:0,3,0,2
chr3	193183014	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:193182998_C_CA:193182998:0,2,0,2
chr3	193272417	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,10:2,1:5,0,11,0
chr3	193272442	.	CGTGTGTGTGTGT	C,CGTGTGT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34,34;MFRL=0,174,201;MMQ=60,60,60;MPOS=16,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,11,14;RU=GT;STR;TLOD=25.11,3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,2:0.539,0.358:11:0,8,1:0,1,0:0,0,8,3
chr3	193332420	.	C	CTGTG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TG;STR;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,6:2,5:4,0,11,0
chr3	193336639	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.591:32:4,9:8,9:10,3,13,6
chr3	193353358	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0,15,0,2
chr3	193355074	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=213.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,35:0,28:0,0,17,46
chr3	193355102	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.589:39:8,9:7,14:2,14,3,20
chr3	193363695	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:6,3:3,8:0,9,0,11
chr3	193365974	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:2,5:5,9:1,6,0,14
chr3	193377173	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,10:1,3:4,0,13,0
chr3	193384203	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.589:30:6,7:6,9:1,11,5,13
chr3	193385250	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=178,154;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:193385250_A_G:193385250:0,5,0,2
chr3	193385256	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=198,153;MMQ=50,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:193385250_A_G:193385250:0,4,0,1
chr3	193385275	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=153,178;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	193385276	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.768:2:0,2:0,0:0|1:193385250_A_G:193385250:0,0,0,2
chr3	193854148	.	TAAA	T,TA,TAA,TAAAA	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=26,26,25,27,25;MFRL=130,157,143,140,156;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=16,22,19,21;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=7.73,9.25,21.07,7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:29,6,8,15,8:0.082,0.113,0.227,0.129:66:15,3,2,8,3:5,3,6,4,3:19,10,32,5
chr3	194063390	.	G	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=117.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,38:0.582:65:10,23:17,15:18,9,23,15
chr3	194080983	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,24:0.381:63:23,8:12,13:19,20,11,13
chr3	194083948	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=193,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr3	194083963	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=193,216;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:7,0,2,0
chr3	194118424	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,1:18,1:4,27,1,1
chr3	194119108	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=72.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.658:36:2,9:10,14:5,7,5,19
chr3	194146099	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:17,4:20,0:18,19,4,0
chr3	194146219	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.393:39:10,5:12,10:14,10,8,7
chr3	194148003	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.538:35:9,10:7,8:0,16,1,18
chr3	194158010	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.697:37:5,13:5,12:7,4,15,11
chr3	194158105	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,237;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.113:51:18,0:28,5:30,16,0,5
chr3	194168500	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:7,4:4,3:11,0,7,1
chr3	194168811	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:4,1:4,1:0,13,0,3
chr3	194176712	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,29:0.515:56:12,14:15,14:7,20,7,22
chr3	194180743	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,8:2,3:3,5,0,11
chr3	194181470	.	AGAG	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAG;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:12,1:21,2:6,27,0,3
chr3	194313832	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,12:0,18:0,0,13,17
chr3	194324939	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,7:8,4:12,1,11,0
chr3	194324982	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,27:0.521:51:13,16:11,7:18,6,22,5
chr3	194325010	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,30:0.479:63:16,22:16,8:18,15,19,11
chr3	194337866	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:15,2:20,0:22,14,2,0
chr3	194337901	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,15:0,18:0,0,16,20
chr3	194346544	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,1:2,1:0|1:194346544_T_A:194346544:7,1,2,0
chr3	194346553	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,2:3,1:0|1:194346544_T_A:194346544:7,1,3,0
chr3	194346803	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:0,8,1,4
chr3	194346822	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:0,2,0,6
chr3	194349027	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,3:6,6:9,1,10,0
chr3	194353772	.	C	CCCGCCCGACAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCGCCCGACAG;STR;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.420:14:3,2:5,2:8,0,6,0
chr3	194362721	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,17,0
chr3	194369579	.	CC	AA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:2,3:0,6,1,3
chr3	194371955	.	A	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=157,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,3:0.071:53:29,0:17,3:0|1:194371955_A_C:194371955:13,37,0,3
chr3	194371960	.	G	GGTGCAGTGTCCAGGGGGAAATGGC	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,37;MFRL=157,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,3:0.076:50:29,0:16,3:0|1:194371955_A_C:194371955:12,35,0,3
chr3	194379596	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:10,5:1,6:11,0,11,0
chr3	194379646	.	T	TC	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,20:0.404:50:15,9:14,11:24,6,15,5
chr3	194379905	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,2:5,6:0,7,0,8
chr3	194379959	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr3	194386881	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:13,6:11,5:23,1,10,1
chr3	194390713	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.491:41:6,10:12,9:15,6,13,7
chr3	194390869	.	G	GA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=122,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.360:37:15,5:9,8:9,15,4,9
chr3	194409257	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.346:20:5,3:5,3:5,8,4,3
chr3	194790434	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	194877355	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,8:3,6:1,7,1,13
chr3	194947597	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=160,51;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:16,0:6,2:0|1:194947597_G_A:194947597:3,19,1,1
chr3	194947612	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=175,51;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:8,2:0|1:194947597_G_A:194947597:2,19,1,1
chr3	194947614	.	T	TC	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=175,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:7,2:0|1:194947597_G_A:194947597:2,17,1,1
chr3	194947617	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=182,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:194947597_G_A:194947597:2,17,1,1
chr3	194947619	.	A	ATCCAG	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=182,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:194947597_G_A:194947597:2,17,1,1
chr3	194947621	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=183,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:194947597_G_A:194947597:1,17,1,1
chr3	194947624	.	A	AGGC	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=175,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,1:0|1:194947597_G_A:194947597:1,16,1,1
chr3	194991220	.	AA	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	194999996	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=88.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,8:0,0,25,1
chr3	195010023	.	TA	T,TAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28,32;MFRL=126,162,189;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.28,6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,5:0.186,0.394:12:2,1,1:3,1,4:0,5,0,7
chr3	195022931	.	TA	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:15,3:16,2:2,32,1,4
chr3	195245771	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,36:0.710:50:6,19:8,15:14,0,32,4
chr3	195245805	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=247.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.987:75:0,43:0,30:0,0,53,22
chr3	195295704	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:6,1:1,3:7,0,5,0
chr3	195295708	.	G	GGGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.502:14:6,2:1,4:7,0,7,0
chr3	195300676	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:3,6:10,5:11,3,11,1
chr3	195447795	.	CCCT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:14,2:9,2:21,2,4,0
chr3	195448056	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=192,197;MMQ=52,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,1:13,2:0,23,0,3
chr3	195452783	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=172,168;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.178:43:16,2:18,5:33,3,7,0
chr3	195452805	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=157,171;MMQ=40,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,16:0.362:45:16,10:13,6:28,1,16,0
chr3	195453243	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=162,170;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,15:0.302:51:17,7:18,8:21,15,8,7
chr3	195453244	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=164,169;MMQ=59,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,12:0.250:50:15,8:21,4:17,21,11,1
chr3	195453249	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=163,184;MMQ=59,39;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.073:53:22,2:23,0:28,22,3,0
chr3	195453257	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=167,164;MMQ=60,48;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,26:0.482:54:11,13:14,9:12,16,17,9
chr3	195453288	.	A	C	.	.	DP=60;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=168,159;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,11:0.196:58:16,3:27,7:26,21,8,3
chr3	195453310	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,6:0.100:68:23,4:34,2:34,28,5,1
chr3	195453329	.	C	A	.	.	DP=83;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,18:0.231:80:34,7:28,11:41,21,8,10
chr3	195453417	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,8:0.134:62:25,2:28,5:0|1:195453417_C_T:195453417:21,33,2,6
chr3	195453434	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=153,181;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:45,7:0.147:52:20,3:24,4:1|0:195453417_C_T:195453417:9,36,1,6
chr3	195453526	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=190,194;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:11,1:1,2:0,14,0,3
chr3	195456478	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:6,4:16,3:14,8,6,1
chr3	195456623	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,2:7,2:2,10,2,2
chr3	195456708	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=173,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr3	195475989	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,7:3,3:0,7,0,10
chr3	195477713	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=230,176;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.571:19:5,5:3,4:0|1:195477713_G_A:195477713:8,0,11,0
chr3	195477715	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=230,176;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.571:19:5,3:2,3:0|1:195477713_G_A:195477713:8,0,11,0
chr3	195477969	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,1:11,1:9,13,0,2
chr3	195478001	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,0:5,2:11,3,2,0
chr3	195478012	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=178,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:7,1,5,1
chr3	195479226	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.447:17:5,1:4,2:9,0,7,1
chr3	195479256	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:6,4,3,2
chr3	195484244	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,18:0.341:54:21,4:13,14:9,27,4,14
chr3	195492027	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.454:16:3,3:4,4:1,8,2,5
chr3	195501021	.	GC	AT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=89.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.742:29:4,13:3,7:7,0,20,2
chr3	195501258	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	195505072	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:195505072_C_T:195505072:0,0,7,0
chr3	195505091	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0|1:195505072_C_T:195505072:0,0,11,0
chr3	195505417	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,2,20
chr3	195506037	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,102;MMQ=24,43;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:3,4:0,5:0,3,2,7
chr3	195507166	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=101,147;MMQ=24,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,11:1,7:1,0,8,12
chr3	195507226	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=14,32;MFRL=160,158;MMQ=37,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.678:16:0,5:0,5:3,2,5,6
chr3	195507242	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=102,125;MMQ=40,41;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.646:33:5,14:4,5:7,5,12,9
chr3	195507684	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:195507684_G_A:195507684:0,0,0,1
chr3	195507687	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:195507684_G_A:195507684:0,0,0,1
chr3	195508046	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,147;MMQ=40,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.611:19:4,7:1,4:5,1,8,5
chr3	195508449	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=54,153;MMQ=20,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0|1:195508449_AG_A:195508449:0,1,2,3
chr3	195508452	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=54,153;MMQ=20,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0|1:195508449_AG_A:195508449:0,1,2,3
chr3	195508454	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=54,153;MMQ=20,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,1:0,2:0|1:195508449_AG_A:195508449:0,1,2,3
chr3	195508462	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=14,23;MFRL=54,132;MMQ=20,45;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:0,1:0|1:195508449_AG_A:195508449:0,1,2,2
chr3	195510762	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=108,146;MMQ=34,37;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.518:32:8,3:5,4:10,6,13,3
chr3	195510827	.	C	T	.	.	DP=178;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=133,110;MMQ=53,39;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,57:0.339:174:50,30:43,20:70,47,35,22
chr3	195511043	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=156,108;MMQ=50,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.157:38:17,3:8,1:23,9,3,3
chr3	195512186	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr3	195512555	.	CGTGACCTGTGGGTACTGAGGAAGCGTCGGTGACAGGAAGAGGGGTGGT	C	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=130,172;MMQ=43,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,5:0.091:66:17,2:10,1:32,29,3,2
chr3	195513102	.	A	G	.	.	DP=124;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,162;MMQ=60,50;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,22:0.187:121:49,11:41,10:53,46,13,9
chr3	195513175	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=158,175;MMQ=44,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.193:14:7,1:5,0:0|1:195513175_G_A:195513175:5,7,1,1
chr3	195513207	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=0,173;MMQ=37,41;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.788:13:0,4:1,6:0|1:195513175_G_A:195513175:1,2,6,4
chr3	195513468	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=106,90;MMQ=40,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:7,2:1,0:0|1:195513468_G_A:195513468:9,4,1,1
chr3	195513476	.	TG	AA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,17;MFRL=106,90;MMQ=40,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,1:3,0:0|1:195513468_G_A:195513468:9,4,1,1
chr3	195513502	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=19,20;MFRL=91,132;MMQ=42,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:0,2:4,0:4,4,1,2
chr3	195515338	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=126,220;MMQ=38,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.267:17:4,3:6,1:9,4,4,0
chr3	195515340	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=178,93;MMQ=40,33;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.284:17:8,1:4,2:10,2,3,2
chr3	195515566	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=147,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,2:0.042:69:34,2:31,0:42,25,1,1
chr3	195515568	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,31:0.445:70:22,17:16,14:28,11,16,15
chr3	195515594	.	C	G	.	.	DP=85;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=335.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,81:0.988:81:0,40:0,35:0|1:195515594_C_G:195515594:0,0,50,31
chr3	195515617	.	G	C	.	.	DP=98;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=376.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,95:0.990:95:0,56:0,33:0|1:195515594_C_G:195515594:0,0,49,46
chr3	195516630	.	G	T	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=358.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,114:0.991:114:0,54:0,59:0,0,65,49
chr3	195518112	.	T	TGTCTCCTGCGTAACA	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=242.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,24:0,24:0,0,21,34
chr3	195538501	.	TTC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=208,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:2,1:7,0,3,0
chr3	195596501	.	T	TAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AG;STR;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.466:15:3,5:3,1:0,8,0,7
chr3	195596907	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:5,3:4,6:9,0,9,1
chr3	195599085	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.404:18:9,5:1,2:8,3,5,2
chr3	195789414	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=162.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,14:0,29:0,0,36,9
chr3	195789428	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=171.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,17:0,33:0,0,35,18
chr3	195789708	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,16,4
chr3	195792288	.	CGGGG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=110,117;MMQ=35,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=G;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:195792288_CGGGG_C:195792288:1,0,1,0
chr3	195792308	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=78,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:195792288_CGGGG_C:195792288:2,2,1,0
chr3	195798258	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=125.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,19:0,0,31,4
chr3	195925103	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,19,0
chr3	195935207	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.623:14:3,3:2,5:5,0,8,1
chr3	195936446	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:0,6,0,7
chr3	195937678	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:1,2:4,4:0,6,0,7
chr3	195937977	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:3,2:7,6:8,3,7,1
chr3	195953775	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,2:5,4:4,3,5,1
chr3	195954646	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=169,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:2,11,0,2
chr3	195956726	.	AAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=172,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.450:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr3	195959924	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,5:4,5:5,6,7,3
chr3	195974181	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=192,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:9,8:9,3:16,2,11,0
chr3	196018261	.	AAC	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.075:36:20,1:13,1:8,26,0,2
chr3	196051403	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:10,3:8,8:0,19,0,11
chr3	196054488	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.353:35:9,4:13,8:3,20,0,12
chr3	196096451	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=200,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,1:3,1:0,4,0,4
chr3	196134361	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	196210590	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=149,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.214:15:5,1:7,1:10,2,2,1
chr3	196210808	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=164,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr3	196215451	.	CA	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.381:29:4,6:10,5:15,3,10,1
chr3	196215660	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=223,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr3	196295871	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=217,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:1,2:1,1:3,0,4,0
chr3	196387120	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=175,71;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:8,2:9,1:8,9,1,2
chr3	196388625	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	196435331	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:6,1,5,0
chr3	196443803	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,12:0,0,7,24
chr3	196443826	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:6,8:7,3:3,10,0,11
chr3	196532148	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:11,3:11,0:22,0,3,0
chr3	196554009	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.501:32:8,9:8,7:13,3,15,1
chr3	196554020	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=117.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,20:0,18:0,0,33,5
chr3	196612749	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=202,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:8,9,2,0
chr3	196626689	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.430:33:5,6:13,8:2,17,2,12
chr3	196627335	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.521:31:8,8:5,8:0,15,2,14
chr3	196627356	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.314:17:8,2:3,3:0|1:196627356_C_T:196627356:0,12,0,5
chr3	196627361	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,2:4,4:0|1:196627356_C_T:196627356:0,12,0,6
chr3	196657670	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=121,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.670:31:5,9:5,12:6,4,13,8
chr3	196666059	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=202,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr3	196674972	.	CT	TC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,1:1,7:5,0,5,6
chr3	196675625	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	196742395	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:4,5:11,5:9,7,3,7
chr3	196744214	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=16,14;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.401:15:1,1:1,1:2,7,0,6
chr3	196749798	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,15,5
chr3	196750016	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=106,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,1:1,8:0,1,0,9
chr3	196846437	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.384:32:8,4:11,8:4,16,1,11
chr3	196857533	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:3,14,0,2
chr3	196869688	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,4,23
chr3	196876600	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,35:0.468:75:22,17:17,18:24,16,22,13
chr3	196876775	.	T	TTA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TA;STR;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,5:6,5:0,12,0,10
chr3	197023445	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=188,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,2:3,1:0,9,0,3
chr3	197238819	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,3:0.061:64:37,3:22,0:0|1:197238819_G_A:197238819:33,28,3,0
chr3	197238823	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.058:67:39,3:23,0:0|1:197238819_G_A:197238819:33,31,3,0
chr3	197238853	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.059:54:26,2:24,0:20,31,3,0
chr3	197249693	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.739:17:3,6:1,7:2,2,0,13
chr3	197409526	.	T	C	.	.	DP=117;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=261.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,70:0.627:112:15,30:12,36:0|1:197409526_T_C:197409526:13,29,43,27
chr3	197409542	.	T	C	.	.	DP=105;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=249.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,67:0.644:104:14,27:15,33:0|1:197409526_T_C:197409526:14,23,37,30
chr3	197411127	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,24:0.673:35:4,7:7,14:6,5,7,17
chr3	197427557	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,24:0.621:38:7,5:7,16:6,8,15,9
chr3	197431649	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=205,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,7:6,4:1,8,0,11
chr3	197432029	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.538:24:8,10:3,3:0|1:197432029_C_A:197432029:5,6,5,8
chr3	197432036	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=166,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:8,9:2,3:0|1:197432029_C_A:197432029:3,8,4,8
chr3	197432063	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:9,7:3,3:2,10,2,9
chr3	197432124	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr3	197483279	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=193.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,27:0,25:0,0,45,8
chr3	197483405	.	G	A	.	.	DP=133;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:126,4:0.037:130:60,0:66,4:48,78,1,3
chr3	197496984	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=134.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,19:0,0,34,2
chr3	197500394	.	T	TTTTG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTG;STR;TLOD=70.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.955:17:0,7:0,9:0,0,2,15
chr3	197544200	.	C	CGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=175,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=122.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,32:0.951:33:1,22:0,8:0|1:197544200_C_CGTGTGTGTGTGT:197544200:0,1,15,17
chr3	197544202	.	T	TTTTGTGTGTGTGTGCGG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=175,124;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=122.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,32:0.951:33:1,16:0,3:0|1:197544200_C_CGTGTGTGTGTGT:197544200:0,1,15,17
chr3	197557635	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=100.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,30,2
chr3	197574936	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.559:41:7,15:10,8:3,15,1,22
chr3	197581147	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=193,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:2,5:1,9:3,0,14,0
chr3	197670974	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:0,8,0,3
chr3	197765410	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:11,9:9,2:18,2,10,1
chr3	197880130	.	GGCAGCAGCA	G	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=GCA;STR;TLOD=113.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,31:0.527:60:13,14:12,16:14,15,18,13
chr3	197894633	.	G	A	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,201;MMQ=40,23;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,4:0.061:79:36,1:38,2:70,5,4,0
chr3	197894798	.	T	C	.	.	DP=138;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=157,141;MMQ=48,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:120,4:0.039:124:56,2:63,2:0|1:197894798_T_C:197894798:26,94,4,0
chr3	197894800	.	C	G	.	.	DP=132;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,136;MMQ=48,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:110,11:0.097:121:52,5:57,6:1|0:197894798_T_C:197894798:21,89,5,6
chr4	53498	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=113.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.970:30:0,16:0,13:0|1:53498_A_C:53498:0,0,1,29
chr4	53503	.	AG	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:14,2:11,1:0|1:53498_A_C:53498:0,25,0,3
chr4	59299	.	C	G	.	.	DP=133;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,7:0.062:127:59,4:57,3:94,26,6,1
chr4	59513	.	G	T	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,8:0.107:82:36,6:37,2:6,68,0,8
chr4	86101	.	G	GC	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=106.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,20:0,12:0,0,19,13
chr4	87277	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=12,32;MFRL=0,140;MMQ=59,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.960:28:0,10:0,17:0,1,18,9
chr4	87313	.	G	GA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=124.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,8:0,25:0,0,14,22
chr4	331658	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=185,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,4:3,4:0|1:331658_T_C:331658:5,0,9,0
chr4	331666	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=169,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:3,6:3,3:0|1:331658_T_C:331658:6,0,10,0
chr4	331693	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=64.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,8:0,0,17,1
chr4	337474	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=196,171;MMQ=48,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:2,3:10,14:12,0,17,0
chr4	338129	.	GC	AG	.	.	DP=35;ECNT=12;MBQ=33,27;MFRL=154,113;MMQ=60,41;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:11,1:20,1:25,6,2,0
chr4	338156	.	T	A	.	.	DP=61;ECNT=12;MBQ=26,30;MFRL=147,104;MMQ=60,40;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.069:55:21,1:31,2:38,14,3,0
chr4	338186	.	G	T	.	.	DP=90;ECNT=12;MBQ=33,27;MFRL=141,103;MMQ=60,37;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,4:0.056:86:36,2:45,2:57,25,4,0
chr4	338197	.	T	TGA	.	.	DP=88;ECNT=12;MBQ=27,25;MFRL=141,40;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,4:0.056:88:35,1:40,2:0|1:338197_T_TGA:338197:53,31,4,0
chr4	338200	.	G	C	.	.	DP=91;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=142,40;MMQ=60,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,4:0.054:91:42,1:39,3:0|1:338197_T_TGA:338197:55,32,4,0
chr4	338201	.	ATC	A	.	.	DP=93;ECNT=12;MBQ=29,30;MFRL=141,0;MMQ=60,38;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:88,5:0.063:93:42,1:39,3:0|1:338197_T_TGA:338197:55,33,5,0
chr4	338205	.	T	C	.	.	DP=91;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=141,0;MMQ=60,38;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,5:0.066:89:40,1:36,4:0|1:338197_T_TGA:338197:52,32,5,0
chr4	338246	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,5:0.100:58:30,0:19,5:0|1:338246_G_A:338246:15,38,3,2
chr4	338252	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=12;MBQ=32,20;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,5:0.103:56:32,0:14,4:0|1:338246_G_A:338246:13,38,3,2
chr4	338258	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=12;MBQ=32,25;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,4:0.094:51:26,0:12,4:0|1:338246_G_A:338246:9,38,2,2
chr4	338260	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=12;MBQ=25,26;MFRL=148,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:27,0:14,4:0|1:338246_G_A:338246:9,34,2,2
chr4	338266	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=12;MBQ=32,24;MFRL=150,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.108:44:22,0:13,4:0|1:338246_G_A:338246:9,31,2,2
chr4	344138	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=193,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:0,1:5,2:0,5,0,3
chr4	501210	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:20,3:20,0:27,14,3,0
chr4	501473	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,1,12
chr4	521068	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,6:0,0,1,14
chr4	661762	.	AAGG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=68,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AGG;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:2,2,1,1
chr4	666385	.	ATTTTTTT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,13;RU=T;STR;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:0,0:2,1,1,3
chr4	759733	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	759883	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.349:17:6,1:5,3:3,8,3,3
chr4	780286	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=178,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,7:8,5:11,1,10,2
chr4	843613	.	C	CGGGGGCGGGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=18,22;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.325:9:3,1:0,0:0,6,1,2
chr4	843622	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=C;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,0:0,0:0,3,0,4
chr4	845772	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,8:0,16:0,0,3,22
chr4	858874	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	860146	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,3:0,13:0,0,16,1
chr4	871624	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.543:31:7,9:7,7:2,12,5,12
chr4	871675	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=69.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,0,20
chr4	875632	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=212,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:3,2:1,2:5,0,4,0
chr4	875887	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	877709	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	906647	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=124,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr4	942006	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr4	946974	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr4	951982	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=80,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,1,2
chr4	954311	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	955084	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr4	955688	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,0,2
chr4	959201	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=210,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:5,0:1,3:6,1,2,1
chr4	959905	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:2,10,0,2
chr4	960713	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	962607	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,5:3,4:6,0,7,2
chr4	982852	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr4	982982	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,11;MFRL=137,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:1,0:0|1:982982_A_C:982982:1,2,1,0
chr4	982987	.	C	CGGGGCG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=155,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,0:0|1:982982_A_C:982982:2,1,1,0
chr4	983060	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,13:0,0,18,10
chr4	985003	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=181,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:9,1:5,1:11,3,1,1
chr4	1015938	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:1015938_G_C:1015938:1,0,1,0
chr4	1015941	.	TC	GG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,10;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:1015938_G_C:1015938:1,0,1,0
chr4	1015946	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,18;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:1015938_G_C:1015938:1,0,1,0
chr4	1015950	.	CAAG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:1015938_G_C:1015938:1,0,1,0
chr4	1017903	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	1019054	.	CCACA	C,CCA,CCACACA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,34,32,32;MFRL=162,175,154,66;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,25,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,8,9,11;RU=CA;STR;TLOD=4.30,13.22,4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:16,2,7,4:0.073,0.196,0.136:29:8,1,3,0:7,1,4,2:9,7,11,2
chr4	1067267	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	1079689	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,7:3,1:4,4,2,6
chr4	1084710	.	G	GAGAAGAACAACCTGGGAAGGGTGTGAAGCAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=186,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.385:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr4	1084723	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	1102050	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:6,10:4,6:8,3,15,1
chr4	1107278	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=203,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,0:2,4:0,2,0,4
chr4	1161190	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr4	1164132	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:5,10:6,5:10,1,9,6
chr4	1164378	.	AGAG	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=45.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,7:5,5:7,5,4,8
chr4	1164461	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:8,2:2,2:0,10,0,4
chr4	1244267	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=184,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr4	1244682	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.574:10:2,1:2,4:1,3,1,5
chr4	1245830	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:13,3:19,0:18,17,1,2
chr4	1245982	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=196,164;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1245982_T_C:1245982:0,1,0,1
chr4	1245986	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=196,164;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1245982_T_C:1245982:0,1,0,1
chr4	1245989	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=196,164;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1245982_T_C:1245982:0,1,0,1
chr4	1245991	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=196,164;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1245982_T_C:1245982:0,1,0,1
chr4	1246000	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,29;MFRL=196,164;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1245982_T_C:1245982:0,1,0,1
chr4	1332175	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=144,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr4	1345457	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:11,3:10,0:22,2,2,1
chr4	1348806	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,29;MFRL=222,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.528:6:1,3:0,0:3,0,3,0
chr4	1369093	.	CT	GG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,7,2
chr4	1369389	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	1373751	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=197,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:3,0,7,0
chr4	1374774	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,8:0,0,1,21
chr4	1374787	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,6:5,3:0,11,1,8
chr4	1374789	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=78.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,8:0,0,1,19
chr4	1388359	.	TGGAGTGCCCGCCTGCTCATGTGCCCATGTGGAGTGCCCGCCTGCTCACACATGTCGATGC	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=118,169;MMQ=55,60;MPOS=-90;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,40:0.801:45:1,21:0,15:2,3,13,27
chr4	1659128	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=220,173;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr4	1701673	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:9,0,4,1
chr4	1732573	.	GGGGT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:3,6:4,10:6,2,14,2
chr4	1737108	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:0,7,1,6
chr4	1737404	.	C	CCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:2,5:3,1,5,0
chr4	1737585	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=138,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,0,4
chr4	1742779	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,6:3,2:0,6,0,8
chr4	1746229	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=108,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,5:3,5:4,1,6,4
chr4	1807894	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,10,15
chr4	1807922	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:3,6:7,5:1,9,1,11
chr4	1821097	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,75;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.190:17:2,0:12,2:9,5,2,1
chr4	1918706	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=159,135;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,4:0.072:67:25,4:35,0:0|1:1918706_T_G:1918706:29,34,4,0
chr4	1918709	.	A	C	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=159,135;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,4:0.072:67:24,4:38,0:0|1:1918706_T_G:1918706:28,35,4,0
chr4	1918786	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:39,2:0.069:41:16,1:23,1:1|0:1918706_T_G:1918706:5,34,0,2
chr4	1961137	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=121,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,2:6,7:6,6,7,2
chr4	1985257	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:6,5:7,3:5,9,4,4
chr4	1988188	.	C	CCT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:5,4:6,6:0|1:1988188_C_CCT:1988188:6,5,1,10
chr4	1988193	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=135,187;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.500:20:4,4:5,5:0|1:1988188_C_CCT:1988188:6,4,1,9
chr4	1988257	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr4	2065946	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	2083520	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=195,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr4	2160894	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,8:3,4:3,3,3,9
chr4	2176351	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:2,7:6,8:8,0,14,1
chr4	2176506	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:4,4:9,8:3,11,2,11
chr4	2176551	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.560:7:0,2:2,1:0,3,0,4
chr4	2177929	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=206,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:1,2:4,4:5,0,6,1
chr4	2178108	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,2:6,2:1,7,0,4
chr4	2178127	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr4	2181016	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:5,3:9,7:14,1,7,3
chr4	2194901	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=108,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:11,6:5,3:12,4,9,0
chr4	2195089	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr4	2252980	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.451:25:3,2:9,9:2,12,3,8
chr4	2275718	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:2,1:3,2:7,0,4,0
chr4	2306197	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:12,6,1,1
chr4	2822289	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:4,3:3,2,2,4
chr4	2822307	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=127,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:2,4,4,3
chr4	2824848	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr4	2828867	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	2829077	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:1,6:0,8:0,1,5,9
chr4	2829478	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	2833226	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,22,0
chr4	2833500	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=189,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:1,8,0,2
chr4	2834230	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=174,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr4	2911245	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=222,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.387:4:2,1:0,0:0|1:2911245_C_G:2911245:0,3,0,1
chr4	2911247	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=193,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:2911245_C_G:2911245:0,2,0,1
chr4	2911249	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=193,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:2911245_C_G:2911245:0,2,0,1
chr4	2933031	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=234,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,2,0
chr4	2933271	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,3:6,7:9,1,9,1
chr4	2933409	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:5,3:5,9:3,7,4,8
chr4	2934308	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,5:0,16:0,0,6,16
chr4	2935251	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=90.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,11:0,0,18,11
chr4	2941418	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:0,4,3,5
chr4	2955192	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,6:7,5:7,4,8,3
chr4	2965676	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,1:0,3:0|1:2965676_C_T:2965676:2,0,4,0
chr4	2965695	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:2965676_C_T:2965676:3,0,3,0
chr4	2965857	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=109,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,0:0,1,0,4
chr4	2990375	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=206,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr4	2990640	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=142,134;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:2990640_CA_TG:2990640:0,4,0,1
chr4	2990644	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=131,134;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:2990640_CA_TG:2990640:0,3,0,1
chr4	2990650	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=221,134;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:2990640_CA_TG:2990640:0,3,0,1
chr4	2990651	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=221,134;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:2990640_CA_TG:2990640:0,3,0,1
chr4	2993980	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:4,8:7,5:4,7,7,6
chr4	2994013	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:3,5:8,3:3,8,4,4
chr4	3005964	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:3,3:10,2:11,2,2,3
chr4	3009610	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,0:8,3:1,15,1,2
chr4	3024074	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,176;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.073:53:24,3:23,0:33,17,3,0
chr4	3024255	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:4,4:12,8:0,16,0,12
chr4	3029623	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,9:5,2:6,2,10,1
chr4	3039310	.	CCG	C,CTGCG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,32,32;MFRL=151,181,160;MMQ=60,60,60;MPOS=27,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.89,19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,7:0.149,0.486:14:2,1,3:3,1,3:0,5,0,9
chr4	3039311	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=114,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.904:19:1,7:0,10:0,1,0,18
chr4	3040279	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,16;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.858:9:0,1:1,0:0,1,0,8
chr4	3117168	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:7,5:3,3:5,6,2,6
chr4	3133284	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=196,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:8,1,2,0
chr4	3144441	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:0,4:6,4:6,0,8,0
chr4	3155974	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:4,3:1,5:6,0,8,0
chr4	3156168	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:4,14,0,2
chr4	3180021	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=107.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,17:0,0,16,13
chr4	3184229	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,5:5,0:1,8,2,3
chr4	3188265	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,3:4,3:4,0,5,1
chr4	3188329	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=149,52;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:10,0:18,2:0|1:3188329_C_T:3188329:16,13,1,1
chr4	3188349	.	T	TGTCTCTACTAAAAA	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=144,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:10,0:23,2:0|1:3188329_C_T:3188329:17,19,1,1
chr4	3189714	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	3210456	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr4	3213875	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,8:3,6:1,8,1,13
chr4	3216815	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,5:5,1:10,2,5,1
chr4	3221872	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,4:2,0:5,2,4,0
chr4	3221878	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:10,1:1,1:8,3,1,1
chr4	3230324	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,39;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:12,3,1,1
chr4	3230804	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr4	3234828	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	3240159	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:8,5:1,3:7,2,6,2
chr4	3240526	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,2,2
chr4	3255148	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=216,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:1,3,3,7
chr4	3344713	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.069:42:18,2:18,0:19,21,0,2
chr4	3416000	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr4	3424720	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:2,4,0,4
chr4	3425444	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3425444_C_CT:3425444:0,0,0,1
chr4	3425448	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3425444_C_CT:3425444:0,0,0,1
chr4	3445745	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,1:5,3:4,1,3,1
chr4	3446132	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,1:6,3:3,7,4,1
chr4	3449781	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=219,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:3,3,0,4
chr4	3475107	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=213,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr4	3475122	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=209,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,3,1
chr4	3478323	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr4	3487237	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.487:21:3,3:6,7:8,3,9,1
chr4	3487450	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	3491560	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=189,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr4	3494884	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:1,2,4,0
chr4	3516689	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr4	3769789	.	G	GGGGGAGCTTTCCCAGAGACCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGAGCTTTCCCAGAGACCC;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.758:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr4	4190576	.	CG	GC	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,140;MMQ=52,27;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,7:0.145:53:20,2:25,5:0|1:4190576_CG_GC:4190576:23,23,4,3
chr4	4190595	.	G	C	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=145,141;MMQ=52,27;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,7:0.119:65:27,2:27,5:0|1:4190576_CG_GC:4190576:33,25,3,4
chr4	4190723	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=137,164;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.180:42:25,3:10,3:7,28,0,7
chr4	4190792	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=185,193;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.583:24:5,7:4,7:0,10,0,14
chr4	4199879	.	G	GGGTGCACAGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr4	4199885	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr4	4239516	.	C	T	.	.	DP=109;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=146,163;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=115.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,40:0.377:107:27,20:38,17:0|1:4239516_C_T:4239516:53,14,19,21
chr4	4239539	.	C	T	.	.	DP=112;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,161;MMQ=60,33;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=73.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,25:0.235:109:39,10:40,12:0|1:4239516_C_T:4239516:62,22,2,23
chr4	4249483	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr4	4275280	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,12:0.464:26:6,7:8,4:0|1:4275280_C_T:4275280:8,6,10,2
chr4	4275287	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,12:0.464:26:4,7:9,5:0|1:4275280_C_T:4275280:8,6,9,3
chr4	4276021	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,1:4,4:5,1,4,1
chr4	4276189	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:14,0:27,3:21,21,0,3
chr4	4276333	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:17,2:25,0:15,31,0,2
chr4	4276475	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=128,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.465:24:5,4:7,7:1,12,0,11
chr4	4281195	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,173;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.054:71:31,3:35,0:27,41,3,0
chr4	4283686	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=173,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:0|1:4283686_G_T:4283686:0,7,0,2
chr4	4283690	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,1:0|1:4283686_G_T:4283686:0,6,0,2
chr4	4283718	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=223,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:4283718_GT_G:4283718:1,2,0,1
chr4	4283722	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=223,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:4283718_GT_G:4283718:1,2,0,1
chr4	4304337	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,7,11
chr4	4317752	.	TC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,1:9,1:0,23,0,2
chr4	4322430	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:20,0:14,3:17,19,0,3
chr4	5016841	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,4:0,0,9,1
chr4	5018702	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,12:0,0,7,22
chr4	5053674	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.609:26:2,8:7,6:3,7,4,12
chr4	5170143	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,1:12,1:9,12,0,2
chr4	5418485	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=201,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr4	5418539	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	5469876	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.315:5:1,0:2,1:0|1:5469876_TG_CA:5469876:0,4,0,1
chr4	5469878	.	C	CAGAATTTCATTCACTA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	5469885	.	A	ACTCCTGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:5469876_TG_CA:5469876:0,1,0,1
chr4	5469887	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:5469876_TG_CA:5469876:0,1,0,1
chr4	5527008	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,5:6,4:8,2,7,2
chr4	5527115	.	AT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.134:33:10,1:17,3:19,10,1,3
chr4	5527249	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:5,5:6,12:2,9,4,14
chr4	5528115	.	ATTT	A,AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25,26;MFRL=0,169,193;MMQ=60,60,60;MPOS=6,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.29,15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,8:0.235,0.703:11:0,2,3:0,1,3:0,0,0,11
chr4	5570104	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	5577884	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr4	5617140	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=210,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:3,2:4,3:4,3,4,2
chr4	5617295	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:2,5:2,1:0,5,0,6
chr4	5617369	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	5642141	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,1:2,3:0|1:5642141_C_T:5642141:4,0,5,0
chr4	5642161	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:3,3:1,3:0|1:5642141_C_T:5642141:4,0,7,0
chr4	5687257	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:5,6:4,4:0|1:5687257_G_A:5687257:0,9,0,10
chr4	5687263	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,9:0,7:0|1:5687257_G_A:5687257:0,0,0,17
chr4	5693112	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,1:6,5:2,13,0,6
chr4	5746915	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,2:2,2:0|1:5746915_TC_T:5746915:6,2,4,1
chr4	5746916	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.924:9:0,5:0,4:0,0,8,1
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chr4	5812778	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=189,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,3:6,3:4,4,1,5
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chr4	5830437	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:6,6:3,9:2,7,1,14
chr4	5857850	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:9,8:5,10:12,2,16,2
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chr4	5966905	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,1:2,3:1,2,1,4
chr4	5966943	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	5969113	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164651124,223;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr4	5969235	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:2,1,4,3
chr4	5969252	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=154,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,1,2
chr4	5969292	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=126,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr4	5969303	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr4	5982108	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:7,6:3,7:1,9,0,13
chr4	5982135	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:5,3:3,2:0,9,0,5
chr4	5982158	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,3:1,1:0,4,0,5
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chr4	6042551	.	C	CCCTATAACACTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=235,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6042549_C_CT:6042549:0,1,0,1
chr4	6042554	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=235,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6042549_C_CT:6042549:0,1,0,1
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chr4	6055971	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr4	6062061	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr4	6062117	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,3:3,4:10,1,5,2
chr4	6279504	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=207,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	6289006	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=208,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr4	6292909	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:6292909_C_T:6292909:2,0,2,0
chr4	6292915	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=168,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0|1:6292909_C_T:6292909:2,0,3,0
chr4	6303354	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:6,9:6,4:8,4,8,5
chr4	6304186	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:6,1:3,11,1,1
chr4	6304242	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:4,0:1,2:1,4,0,3
chr4	6304286	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,1:0,2:0,0,0,5
chr4	6325018	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:9,2,3,4
chr4	6374189	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr4	6374230	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr4	6377530	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.957:20:0,7:0,11:0|1:6377530_C_G:6377530:0,0,17,3
chr4	6377534	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=101.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0|1:6377530_C_G:6377530:0,0,18,6
chr4	6377713	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	6578487	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	6580283	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,5:2,3:0,7,0,8
chr4	6594827	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr4	6596476	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,5:0,0,4,8
chr4	6596515	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	6602255	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	6602516	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,2,6
chr4	6619052	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,5:0,0,14,1
chr4	6623032	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr4	6698850	.	GGCTGAGCCT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=208,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.512:2:1,0:0,1:0|1:6698850_GGCTGAGCCT_G:6698850:0,1,0,1
chr4	6698864	.	ATGTACCTCT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=208,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6698850_GGCTGAGCCT_G:6698850:0,1,0,1
chr4	6718775	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,5:3,2:4,6,1,6
chr4	6719092	.	TAGTC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:6,9:12,1:7,12,2,8
chr4	6882600	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,250;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:29,2:16,1:37,10,3,0
chr4	6955922	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=287,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	6956134	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,14:0,8:0,0,4,20
chr4	7002803	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=106.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,19:0,16:0,0,33,2
chr4	7027035	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:5,0:2,12,0,2
chr4	7027041	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,1,14
chr4	7043283	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:28,0:21,3:20,30,0,3
chr4	7043369	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:10,0:18,3:7,21,0,3
chr4	7044357	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7044357_A_G:7044357:0,0,0,1
chr4	7044380	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:7044357_A_G:7044357:0,0,1,1
chr4	7064214	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr4	7064218	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=151,170;MMQ=56,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.697:8:0,3:1,2:0|1:7064218_TA_T:7064218:0,2,0,6
chr4	7064219	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.928:12:0,6:0,4:0|1:7064219_A_T:7064219:0,0,1,11
chr4	7064220	.	TATATA	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=151,170;MMQ=56,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.696:8:0,4:1,2:0|1:7064218_TA_T:7064218:0,2,0,6
chr4	7064236	.	TATATATC	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=170,151;MMQ=44,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.306:8:3,1:2,1:0|1:7064219_A_T:7064219:0,6,0,2
chr4	7064243	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0|1:7064218_TA_T:7064218:0,0,0,8
chr4	7064277	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr4	7069606	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=100.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,12:0,17:0,0,33,0
chr4	7069804	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,14:0,0,0,30
chr4	7398194	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:4,2:8,9:0,12,0,11
chr4	7434988	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=217,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	7435009	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=154,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	7678039	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	7684641	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.537:24:4,5:7,8:2,9,3,10
chr4	7684661	.	CT	AC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=179,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,3:5,5:2,8,0,8
chr4	7691193	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr4	7691240	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=168,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:5,3,1,1
chr4	7705107	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.407:15:4,2:4,3:4,5,2,4
chr4	7725693	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	7726847	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,3:6,4:5,2,6,1
chr4	7728472	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=211,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:1,5:2,3:3,0,8,1
chr4	7728658	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,3,12
chr4	7735990	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=199,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:4,1,6,0
chr4	7738701	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=218,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr4	7742088	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7742088_C_CA:7742088:0,1,0,1
chr4	7742091	.	C	CACATTTCATTATTAATTTCATTATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7742088_C_CA:7742088:0,1,0,1
chr4	7774610	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:3,8:6,4:5,4,6,7
chr4	7783099	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=96,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:1,8:5,4:4,2,9,3
chr4	7787899	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:5,8:7,5:11,1,13,0
chr4	7820727	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr4	7845123	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr4	8006928	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=182,287;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:4,0,3,0
chr4	8009759	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr4	8021478	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=189,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:4,1:0,7,0,2
chr4	8031313	.	TA	T,TAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29,30;MFRL=0,185,173;MMQ=60,60,60;MPOS=27,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,19,22;RU=A;STR;TLOD=3.01,5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.313,0.561:6:0,2,3:0,0,0:0,0,5,1
chr4	8031590	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	8034497	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=202,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,1,4
chr4	8062638	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,13,2
chr4	8090028	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=188,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.465:28:7,5:7,7:3,12,2,11
chr4	8207154	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=205,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,5:2,4:0,6,1,8
chr4	8207188	.	T	TGTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=203,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr4	8211624	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,6:0,0,0,9
chr4	8214636	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr4	8221058	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=124.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,20:0,18:0,0,16,26
chr4	8228627	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.562:21:6,5:3,6:0|1:8228627_G_C:8228627:9,0,12,0
chr4	8228632	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,8:0|1:8228627_G_C:8228627:0,0,20,0
chr4	8228794	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:18,0:7,2:9,16,0,2
chr4	8237096	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr4	8284084	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=228,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	8288521	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=247,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.649:7:2,1:0,1:0,2,0,5
chr4	8288581	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=162,274;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	8293379	.	CT	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	8293974	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=121,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:4,3,4,1
chr4	8304097	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr4	8306028	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:1,3,1,3
chr4	8306091	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	8368604	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=238,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr4	8383167	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,4,0
chr4	8390859	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:5,2,4,3
chr4	8391049	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.586:8:1,2:2,1:0,3,0,5
chr4	8407722	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,2:14,1:13,16,1,2
chr4	8415982	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:9,6:4,9:11,2,13,3
chr4	8469637	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:13,1:13,1:18,8,0,2
chr4	8469943	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,0:12,2:14,13,1,1
chr4	8588685	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	8601298	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:0,6,0,4
chr4	8602793	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:8602793_T_C:8602793:0,0,10,0
chr4	8602798	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=201,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0|1:8602793_T_C:8602793:4,0,6,0
chr4	8602816	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0|1:8602793_T_C:8602793:0,0,15,0
chr4	8608634	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=200,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,3:1,1:0,4,0,5
chr4	8608934	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=186,272;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr4	8608979	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=197,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr4	8613908	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr4	8620325	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	9446325	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:1,10,1,2
chr4	9485841	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=154,206;MMQ=54,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,1:4,4:1,3,1,4
chr4	9486060	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=176,118;MMQ=60,55;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,18:0.559:32:6,10:7,8:0|1:9486060_G_T:9486060:5,9,10,8
chr4	9486066	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=176,118;MMQ=60,55;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,18:0.559:32:7,10:7,8:0|1:9486060_G_T:9486060:5,9,10,8
chr4	9557815	.	TAGAAGG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=237,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:1,2:1,2:2,1,1,3
chr4	9785354	.	TA	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.206:45:16,6:20,3:23,13,7,2
chr4	9909850	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,4:8,7:10,5,10,2
chr4	9921931	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,18,3
chr4	9943700	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:6,5:1,4:0,7,3,7
chr4	9998605	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.366:25:5,4:10,4:1,15,2,7
chr4	10027444	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=214,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr4	10027486	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:12,0,2,0
chr4	10027509	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=74.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,9:0,18:0,0,23,4
chr4	10027542	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,18:0,0,24,12
chr4	10027643	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=73.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,12:0,0,1,20
chr4	10077133	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:10,1:17,1:4,26,0,2
chr4	10079525	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=160,103;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:19,0:16,3:0|1:10079525_A_C:10079525:13,22,0,3
chr4	10079530	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=162,103;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:18,0:15,3:0|1:10079525_A_C:10079525:13,22,0,3
chr4	10090178	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,12,0
chr4	10099500	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,142;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:28,0:15,3:21,24,0,3
chr4	10100801	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	10117728	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=269.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,82:0.988:82:0,47:0,34:0,0,39,43
chr4	10118350	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	10118377	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	10444650	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr4	10447985	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=103.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,13:0,0,12,16
chr4	10509699	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr4	10527612	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:1,17,0,2
chr4	10542058	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,18,4
chr4	10566404	.	A	AGTATTTCACAG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=147,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.150:17:10,2:5,0:0,15,0,2
chr4	10599638	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:0|1:10599638_T_A:10599638:9,8,1,1
chr4	10599654	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:10599638_T_A:10599638:6,8,1,1
chr4	10599656	.	GTTGT	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:7,0:0|1:10599638_T_A:10599638:6,8,1,1
chr4	10599661	.	CTTTCT	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:6,0:0|1:10599638_T_A:10599638:5,8,1,1
chr4	10599670	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=131,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:10599638_T_A:10599638:3,8,1,1
chr4	10599673	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,25;MFRL=131,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:5,0:0|1:10599638_T_A:10599638:3,8,1,1
chr4	13371629	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,10;MFRL=87,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.433:13:1,0:3,1:2,5,0,6
chr4	13462516	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr4	13578405	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr4	13582680	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.247:17:2,2:6,2:3,10,1,3
chr4	13583838	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=107,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,3:3,2:3,4,3,2
chr4	13589212	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	13589495	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:6,3:7,5:0,14,0,8
chr4	13600993	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=53.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.526:38:10,11:6,6:6,12,12,8
chr4	13605534	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=170,444;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:12,3:17,0:24,8,0,3
chr4	13612486	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.313:11:2,2:4,1:8,0,3,0
chr4	13615293	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,8:0,18:0,0,6,20
chr4	15482477	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=95,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=172.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,47:0.961:48:1,17:0,30:0,1,8,39
chr4	15513147	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr4	15538586	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,84;MMQ=60,20;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.093:40:21,3:15,0:24,13,3,0
chr4	15538744	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,0,17
chr4	15539498	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=101.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,25,3
chr4	15552423	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=64.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,12:0,0,15,8
chr4	15560750	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=129.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,22:0,21:0,0,37,6
chr4	15562342	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr4	15565208	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr4	15568992	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=201.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,58:0.968:59:0,33:1,22:1,0,35,23
chr4	15569146	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=151.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,22:0,23:0,0,7,39
chr4	15575718	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr4	15587897	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=99.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,13:0,0,5,25
chr4	15602773	.	C	CTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	15603069	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=104.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,3,26
chr4	15632228	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,27,0
chr4	15656728	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=196,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,6:3,2:11,0,8,0
chr4	15691259	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr4	15692058	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr4	15692136	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	15706466	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	15706502	.	G	GTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,6,2
chr4	15835983	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:0,8,0,4
chr4	15842186	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,68;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,2:12,0:1,19,0,2
chr4	15937526	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:8,0,5,0
chr4	15964040	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr4	15972549	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	15982166	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.793:8:1,4:0,2:0,1,0,7
chr4	15985984	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.605:18:3,4:3,6:1,6,4,7
chr4	15986042	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr4	15987509	.	T	TTTAAG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.817:3:0,0:0,1:0|1:15987509_T_TTTAAG:15987509:0,0,2,1
chr4	15987512	.	T	TGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGATAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.950:17:0,3:0,2:0|1:15987509_T_TTTAAG:15987509:1,0,10,6
chr4	15989191	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	15991275	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=183,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.598:15:2,4:3,5:6,0,9,0
chr4	16002050	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr4	16024885	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,11,2
chr4	16025837	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr4	16026983	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:1,2,0,3
chr4	16035209	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=201,167;MMQ=48,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr4	16172181	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr4	16189980	.	TA	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.227:31:13,4:9,3:6,18,0,7
chr4	16189991	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.588:32:7,10:6,9:2,11,4,15
chr4	16190073	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr4	16215537	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:2,8:4,1:1,5,3,7
chr4	16504184	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:4,6:0,4:4,0,10,0
chr4	16510131	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,5:4,5:10,0,8,2
chr4	16513748	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:1,6,1,3
chr4	16597280	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,11,4
chr4	17488948	.	G	GAGTCAACACCACA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17488948_G_GAGTCAACACCACA:17488948:0,0,0,1
chr4	17488950	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17488948_G_GAGTCAACACCACA:17488948:0,0,0,1
chr4	17488952	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17488948_G_GAGTCAACACCACA:17488948:0,0,0,1
chr4	17494054	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	17503544	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	17513724	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	17513757	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	17517242	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr4	17581617	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:9,2:4,9:1,12,2,9
chr4	17581641	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=158,138;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,1:5,2:0,14,0,3
chr4	17581643	.	CAG	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.575:12:5,2:0,4:0,5,0,7
chr4	17585014	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=202,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr4	17608620	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=198,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr4	17616214	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:5,7:5,2:11,0,10,0
chr4	17625209	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.471:51:14,14:12,9:15,12,15,9
chr4	17634213	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,18,8
chr4	17634255	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:4,4:7,4:0|1:17634255_G_A:17634255:2,9,2,6
chr4	17634256	.	C	CAA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:3,4:7,4:0|1:17634255_G_A:17634255:2,9,2,6
chr4	17635556	.	CAAAAT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=126,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:3,1:2,4:0,5,0,5
chr4	17640858	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:4,2,3,2
chr4	17649233	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,4:2,4,5,2
chr4	17654648	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,6:3,3:1,6,0,9
chr4	17659936	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,4:2,3:7,1,5,2
chr4	17666297	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=43,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.481:4:0,0:1,0:2,0,0,2
chr4	17689974	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr4	17694880	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:6,0,4,1
chr4	17694916	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:9,8:6,3:11,4,9,2
chr4	17694943	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.569:33:8,11:6,7:9,5,12,7
chr4	17707361	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:2,6:3,1:3,2,8,1
chr4	17812615	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,13:0,12:0,0,24,1
chr4	17885296	.	A	AAC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AC;STR;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.633:12:1,1:3,5:3,1,7,1
chr4	17964528	.	TA	T,TAA	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=25,26,28;MFRL=145,138,154;MMQ=60,60,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.88,5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:63,4,5:0.062,0.079:72:22,2,3:39,2,2:52,11,9,0
chr4	20533674	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=135,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:24,3:15,2:15,27,4,1
chr4	20541005	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:1,2:6,6:0|1:20541005_AG_A:20541005:9,1,6,2
chr4	20541008	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:3,2:7,6:0|1:20541005_AG_A:20541005:9,1,6,2
chr4	20547838	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	20570708	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	20618805	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:0|1:20618805_C_T:20618805:9,14,1,1
chr4	20618817	.	A	ACACGTATCTCC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=130,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:20618805_C_T:20618805:7,11,1,1
chr4	20620683	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=82.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,0,27
chr4	20706067	.	CT	C,CTT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,31,28;MFRL=160,171,158;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.97,5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,8,4:0.210,0.142:32:9,3,1:11,5,3:16,4,9,3
chr4	20709411	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.511:33:10,9:5,7:13,3,13,4
chr4	20733708	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,6:4,3:1,6,3,6
chr4	20760617	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	22389331	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:27,0:31,3:30,29,0,3
chr4	22389344	.	T	TA	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:25,0:28,3:25,30,0,3
chr4	22414708	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=228,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0|1:22414708_A_C:22414708:1,0,4,1
chr4	22414715	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,3:0.400:8:1,0:3,3:1|0:22414708_A_C:22414708:4,1,3,0
chr4	22444251	.	CA	C,CAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,33,34;MFRL=163,166,188;MMQ=60,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=11.39,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,8,6:0.235,0.182:33:11,5,4:8,3,1:19,0,14,0
chr4	22449028	.	CA	C,CAA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=152,141,217;MMQ=60,60,60;MPOS=12,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=11.19,4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,7,4:0.172,0.090:44:19,3,1:12,4,3:26,7,9,2
chr4	22749783	.	GTA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,16;MFRL=179,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TA;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:1,0:0,4,0,2
chr4	23816242	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=18,10;MFRL=136,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.692:10:0,0:1,2:0,3,0,7
chr4	23886323	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr4	24534687	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=124.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,24:0,16:0,0,5,38
chr4	24538573	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	24556519	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,3:6,0:6,6,2,1
chr4	24557937	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.433:39:8,9:14,6:12,10,10,7
chr4	24801354	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr4	24824076	.	GA	G,GAA	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=149,144,134;MMQ=60,60,60;MPOS=12,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=12.14,5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:38,8,5:0.157,0.114:51:17,5,2:11,2,3:28,10,11,2
chr4	24854648	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr4	25014191	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr4	25125854	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,129;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:1,5,2,0
chr4	25146307	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:8,0,5,0
chr4	25262249	.	TATATATATATATATAC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,181;MMQ=60,44;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:8,2:5,2:3,11,0,4
chr4	25316886	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,6:8,5:10,4,11,0
chr4	25335527	.	T	G	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,159;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,4:0.062:79:38,4:36,0:39,36,4,0
chr4	25370627	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr4	25379226	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.522:13:1,3:4,1:0,6,0,7
chr4	25382008	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:15,6,1,1
chr4	25382101	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:13,1:3,1:4,12,1,1
chr4	25392728	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0,4,0,4
chr4	25393889	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=222,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:4,4:6,1:9,2,4,1
chr4	25394078	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:6,6:15,6:3,18,1,11
chr4	25396001	.	TAAACTC	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=150.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,39:0.520:75:13,17:19,21:12,24,14,25
chr4	25404553	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=110.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,16:0,19:0,0,28,8
chr4	25408724	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,0:5,0,3,0
chr4	25417244	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:1,1,0,7
chr4	25419792	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:5,6,0,2
chr4	25665798	.	T	TCGGGCGGG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=172,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.235:10:2,0:4,2:3,5,2,0
chr4	25665800	.	TC	GG,GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,9,10;MFRL=152,239,61;MMQ=60,60,60;MPOS=4,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.41,5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,2:0.329,0.239:10:1,0,0:4,0,0:0,5,5,0
chr4	25674905	.	TCACA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,1,11
chr4	25674911	.	G	GAGGGA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,1,12
chr4	25674913	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,4:0,5:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,1,12
chr4	25759078	.	CCAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	25767133	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=203,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr4	25769135	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.383:42:12,4:14,11:16,10,14,2
chr4	25780599	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:4,1,4,0
chr4	25780891	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=194,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:0,8,0,3
chr4	25792260	.	GG	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25792260_GG_AC:25792260:0,0,0,1
chr4	25792264	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25792260_GG_AC:25792260:0,0,0,1
chr4	25792267	.	AGG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25792260_GG_AC:25792260:0,0,0,1
chr4	25803972	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:15,0:28,3:17,26,2,1
chr4	26321563	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.158:45:17,0:9,1:18,18,0,9
chr4	26322759	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr4	26364300	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,11:0,0,1,16
chr4	26387959	.	AT	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=253,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=126.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,48:0.981:49:1,26:0,19:0,1,24,24
chr4	26417068	.	GT	G,GTT	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=33,36,27;MFRL=151,178,115;MMQ=60,60,60;MPOS=18,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.07,5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,4,8:0.107,0.168:43:17,3,3:12,1,3:22,9,10,2
chr4	26417136	.	T	C	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=225.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,68:0.972:69:1,33:0,31:0,1,40,28
chr4	26483844	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:2,2:0,5,0,2
chr4	26491117	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=156,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.451:13:5,1:2,3:0,7,0,6
chr4	26585765	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:10,2:16,0:26,0,2,0
chr4	26615982	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr4	26721578	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=207,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:6,0:2,3:8,0,3,0
chr4	26737033	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.082:47:21,3:20,0:30,14,3,0
chr4	26737063	.	C	CT,CTT	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=34,34,32;MFRL=176,164,165;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=74.46,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,34,4:0.747,0.094:45:5,18,2:2,14,2:2,5,23,15
chr4	27004490	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	27019669	.	G	GAATCCTGTGCAGACTTTGCTATTGCCCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.651:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	30921781	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:18,3:14,0:22,10,2,1
chr4	36109409	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	36122737	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.526:21:6,4:3,7:10,0,11,0
chr4	36123024	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=208,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,3:1,4:0,3,0,7
chr4	36126393	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,5:6,1:12,0,7,0
chr4	36130099	.	T	TACACAC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=120,158;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=AC;STR;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.755:9:1,2:0,4:2,0,7,0
chr4	36130127	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.370:35:10,4:10,6:15,7,11,2
chr4	36130375	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=59.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,18:0.911:19:1,4:0,13:0|1:36130375_TA_T:36130375:0,1,1,17
chr4	36130393	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.416:22:3,2:9,7:0|1:36130375_TA_T:36130375:0,13,0,9
chr4	36148837	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:9,7:6,7:14,1,14,0
chr4	36149025	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,9:0,18:0,0,2,26
chr4	36149113	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,17,7
chr4	36160340	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=140.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,26:0,20:0,0,42,4
chr4	36162273	.	C	CA,CAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,33,24;MFRL=113,149,188;MMQ=60,60,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=23.26,9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,11,8:0.488,0.325:24:2,5,4:3,4,2:3,2,1,18
chr4	36168706	.	CAAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=210,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=A;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:0,3:0,2,0,4
chr4	36211914	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	36340755	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:8,7:8,7:9,8,8,7
chr4	36345377	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,2:4,6:1,6,0,8
chr4	37246689	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	37432416	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=94,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr4	37590570	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr4	37592674	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr4	37688015	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	37831850	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	37836294	.	G	A	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,3:0.042:92:43,0:45,3:46,43,1,2
chr4	37850312	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	37857166	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	37863045	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=173,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr4	38016257	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:18,3:25,0:9,34,0,3
chr4	38045951	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.543:44:13,10:7,14:18,2,20,4
chr4	38053761	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=214,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38053761_G_T:38053761:0,3,0,1
chr4	38053763	.	AA	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=214,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38053761_G_T:38053761:0,3,0,1
chr4	38053769	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=203,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38053761_G_T:38053761:0,2,0,1
chr4	38119885	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr4	38134423	.	GTTT	G,GT,GTT,GTTTT,GTTTTT	.	.	DP=143;ECNT=3;MBQ=34,33,31,32,35,33;MFRL=153,159,134,159,128,104;MMQ=60,60,60,60,60,60;MPOS=23,15,20,23,13;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15,17,18;RU=T;STR;TLOD=6.14,7.50,34.74,10.89,7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4/5:44,4,6,23,12,10:0.038,0.056,0.218,0.134,0.108:99:25,0,4,10,9,4:14,4,2,11,3,3:26,18,41,14
chr4	38134442	.	C	G	.	.	DP=152;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,31:0.167:143:40,0:30,0:46,66,30,1
chr4	38134521	.	C	T	.	.	DP=90;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,3:0.045:86:46,0:37,3:7,76,0,3
chr4	38690183	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=104,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:4,0,8,0
chr4	38776742	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,191;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,0:8,5:13,2,0,5
chr4	38930995	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	38937316	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.329:22:9,2:6,4:13,2,6,1
chr4	39064126	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,13:0,4:0,0,14,4
chr4	39064162	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,22:0,11:0,0,21,13
chr4	39077567	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:4,7:2,3:6,0,12,1
chr4	39088270	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,163;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:19,0:19,2:15,23,0,2
chr4	39104837	.	CTG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:2,0,4,1
chr4	39109399	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:5,2:6,6:2,11,0,8
chr4	39109428	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=191,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,2:1,5:0,2,0,8
chr4	39114559	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr4	39114929	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=171,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr4	39116775	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,7:5,4:9,1,9,2
chr4	39116911	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:9,11:7,8:6,10,7,13
chr4	39122577	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.402:20:9,3:3,4:9,3,5,3
chr4	39187521	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=191,194;MMQ=59,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.563:7:2,2:1,2:0|1:39187521_TG_T:39187521:0,3,0,4
chr4	39187522	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,5:0.865:5:0,2:0,3:1|0:39187521_TG_T:39187521:0,0,0,5
chr4	39205365	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,5:0,11:0,0,4,13
chr4	39216393	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,1:4,3:0,5,0,6
chr4	39226486	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.341:21:6,5:5,1:14,0,5,2
chr4	39226495	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=136,71;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:17,3:7,0:21,3,2,1
chr4	39233701	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=200,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:3,1,0,1
chr4	39233719	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=200,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr4	39279907	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	39308187	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0,0,14,5
chr4	39318706	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:0,5,0,9
chr4	39321969	.	CAAA	C,CA,CAAAAAA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,18,33,32;MFRL=0,153,161,141;MMQ=60,60,54,52;MPOS=11,12,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=21,18,19,24;RU=A;STR;TLOD=3.92,5.73,8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,6,6,6:0.222,0.417,0.312:18:0,1,3,1:0,0,1,5:0,0,10,8
chr4	39329102	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:7,4:2,3:8,2,6,1
chr4	39343940	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:12,9:3,5:12,3,12,2
chr4	39352905	.	ACTT	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=157,192;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:1,0:2,1:0|1:39352905_ACTT_A:39352905:5,0,2,0
chr4	39352910	.	T	A,C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,32,33;MFRL=169,192,157;MMQ=60,40,60;MPOS=-2147483648,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.96,9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.300,0.400:7:1,1,1:1,1,2:2,0,5,0
chr4	39352913	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=141,192;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:3,1:0|1:39352905_ACTT_A:39352905:5,1,2,0
chr4	39352915	.	ACTG	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=177,192;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,1:2,1:0|1:39352905_ACTT_A:39352905:8,3,2,0
chr4	39353122	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	39439264	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=205,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:5,0,6,0
chr4	39439521	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.471:30:9,9:6,5:5,11,6,8
chr4	39448529	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	39448542	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=209,159;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	39449824	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:7,4:4,3:10,1,7,0
chr4	39456392	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:9,7:9,7:18,0,13,1
chr4	39459154	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:5,5:7,11:8,4,14,2
chr4	39459724	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr4	39460797	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.468:18:3,3:3,5:0,10,1,7
chr4	39478832	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=191,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	39501722	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32,32,31;MFRL=155,148,180,187;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,13,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,15,16,17;RU=A;STR;TLOD=13.95,4.73,5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,13,4,4:0.467,0.166,0.183:25:2,5,0,2:2,6,4,1:3,1,13,8
chr4	39510235	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:6,1:15,1:12,9,1,1
chr4	39574165	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=151,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:39574165_C_T:39574165:0,2,0,1
chr4	39574169	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,29;MFRL=151,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:39574165_C_T:39574165:0,2,0,1
chr4	39747536	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,1,25
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chr4	39847528	.	AAAGAAACAC	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:10,2:0|1:39847513_AAAAAG_A:39847513:1,23,0,2
chr4	39881543	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=236,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:39881543_A_T:39881543:0,3,0,1
chr4	39881549	.	A	ACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=236,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:1,1:0|1:39881543_A_T:39881543:0,3,0,1
chr4	39881550	.	A	AGAGTGCTGTGTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=241,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:39881543_A_T:39881543:0,2,0,1
chr4	39881554	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=236,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:39881543_A_T:39881543:0,1,0,1
chr4	39900086	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:22,3:32,0:22,34,0,3
chr4	39910172	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr4	39924372	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=15,15;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.399:10:0,2:2,0:0,6,1,3
chr4	39924464	.	C	CCACAAAATTTTATAGTTTTCAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	39928379	.	GT	G,GTT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=158,147,124;MMQ=60,60,60;MPOS=17,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=12.02,9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,9,9:0.178,0.167:51:15,5,3:16,4,2:28,5,13,5
chr4	39929853	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr4	40108543	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,79;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.100:48:23,4:21,0:23,21,3,1
chr4	40123790	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,29:0.587:49:12,10:8,15:13,7,17,12
chr4	40337968	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:15,6:6,4:3,18,4,6
chr4	40338079	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=196,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr4	40440761	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr4	40818349	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40818349_T_C:40818349:0,2,0,1
chr4	40818351	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:40818349_T_C:40818349:0,2,0,1
chr4	40895504	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=210,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:40895504_CG_C:40895504:0,2,0,1
chr4	40895507	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=210,206;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:40895504_CG_C:40895504:0,2,0,1
chr4	41015553	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=197,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,0:9,3:17,0,3,0
chr4	41015899	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.444:32:8,7:9,7:4,14,8,6
chr4	41016484	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,3:5,2:0,10,0,6
chr4	41259240	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,2:2,6:0,6,0,8
chr4	41615249	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=179,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr4	41615690	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.965:24:0,8:0,15:0,0,5,19
chr4	41621110	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=150,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr4	41646651	.	G	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=97.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,34:0.482:71:18,19:16,15:19,18,11,23
chr4	41648692	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,405;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.083:63:32,0:24,4:30,28,0,5
chr4	41652346	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=167,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:6,1,5,0
chr4	41652415	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:4,4:8,9:7,5,11,2
chr4	41691709	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:0,4:2,2:0,3,0,6
chr4	41985272	.	CT	C,CTT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,23,28;MFRL=166,114,154;MMQ=60,60,60;MPOS=3,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.34,9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,10:0.124,0.527:19:1,1,3:5,1,5:3,3,5,8
chr4	41985867	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:3,1:4,4:2,5,1,5
chr4	41987758	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:4,4:4,10:5,3,11,3
chr4	41988385	.	TAC	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:10,5:11,8:5,16,2,11
chr4	41992752	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:6,10:7,5:4,9,3,12
chr4	42003835	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=70.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,22:0.590:37:7,12:8,10:2,13,1,21
chr4	42024982	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=217,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:0,7,1,4
chr4	42025049	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	42025284	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.549:49:9,11:13,15:17,5,22,5
chr4	42040947	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:8,10:11,5:19,0,15,0
chr4	42069029	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=165,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr4	42122289	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,7:4,1:6,4,1,7
chr4	42402992	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,5:6,0,9,0
chr4	42446528	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=165,123;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:9,1,0,2
chr4	42466641	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=123,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:2,7:3,4:4,2,10,1
chr4	42571074	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=164.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,30:0,23:0,0,51,4
chr4	42582047	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,15:0,7:0,0,2,20
chr4	42592935	.	CA	C,CAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26,18;MFRL=156,194,157;MMQ=60,60,60;MPOS=18,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.23,16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,9:0.156,0.523:16:3,1,2:1,0,2:0,5,0,11
chr4	42596461	.	TAC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,249;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	42602606	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.969:26:0,13:0,13:0,0,3,23
chr4	42617935	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr4	42618021	.	T	TA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.514:37:12,12:6,7:11,7,14,5
chr4	42618138	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:0,11,0,8
chr4	42626532	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,95;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:20,3:36,0:44,15,3,0
chr4	42626659	.	GAA	G,GA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=16,16,16;MFRL=152,169,169;MMQ=60,60,60;MPOS=24,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=8.08,15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,7,15:0.177,0.338:43:1,0,1:4,3,5:6,15,4,18
chr4	42627805	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,11:0,6:0,0,0,17
chr4	42895715	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=213,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	42965159	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,5:4,8:3,5,1,12
chr4	43032612	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,6:3,4:0,4,0,10
chr4	44450588	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr4	44651968	.	CA	C,CAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30,27;MFRL=146,141,145;MMQ=60,60,60;MPOS=17,0;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.29,4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,6,3:0.262,0.204:18:5,3,3:4,3,0:9,0,8,1
chr4	44652187	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr4	44682661	.	CT	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.111:51:25,3:18,2:30,16,3,2
chr4	44684455	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,20:0,9:0,0,4,25
chr4	44684507	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,13:0,2:0,0,0,16
chr4	44685224	.	T	TA	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=197.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,45:0.979:45:0,21:0,22:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,44,1
chr4	44685225	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=197.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,45:0.979:45:0,21:0,22:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,44,1
chr4	44685236	.	AT	A	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.126:45:20,1:20,4:0|1:44685224_T_TA:44685224:39,1,3,2
chr4	44691206	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	44691795	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.840:10:0,5:0,4:1,0,9,0
chr4	44696538	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=204.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,30:0,25:0,0,12,43
chr4	44699344	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,0:14,2:26,2,0,2
chr4	44699484	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=151.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,20:0,22:0,0,7,35
chr4	44699506	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=93.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,9:0,16:0,0,0,29
chr4	44709695	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	44712908	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	44713235	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,4:0,0,0,9
chr4	44719048	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,16,0
chr4	44720248	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=109.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,17:0,17:0,0,34,0
chr4	46042945	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	46043271	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.589:10:1,2:2,3:1,3,0,6
chr4	46060320	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.091:53:19,4:29,0:28,21,4,0
chr4	46066356	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr4	46263862	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:46263862_A_AG:46263862:3,0,3,0
chr4	46263864	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:46263862_A_AG:46263862:3,0,3,0
chr4	46334810	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0,4,0,6
chr4	46966887	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:3,3:6,0,6,0
chr4	46979268	.	GG	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	46994972	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=126,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,0:0,0:0,3,0,2
chr4	47033770	.	TCG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,6:6,5:3,10,5,7
chr4	47163234	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=225,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr4	47514685	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,25:0.490:51:14,13:12,12:13,13,11,14
chr4	47524932	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=245,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.720:9:0,3:2,4:2,0,6,1
chr4	47524961	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=166,231;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:6,0:3,5:9,1,5,0
chr4	47524997	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.621:16:3,5:2,4:6,0,9,1
chr4	47525009	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,11:0,0,17,5
chr4	47527537	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.591:25:3,5:7,9:9,1,14,1
chr4	47538360	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr4	47538911	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:18,0:24,3:29,13,2,1
chr4	47574092	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:11,1,2,0
chr4	47746602	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=12,28;MFRL=205,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.301:11:3,1:0,1:0,8,0,3
chr4	47853843	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:3,4:6,6:9,0,11,0
chr4	47856983	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.094:50:20,0:14,1:45,0,5,0
chr4	47857040	.	T	C	.	.	DP=113;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=174.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,56:0.521:108:29,17:21,39:28,24,35,21
chr4	47886329	.	GT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:15,4:14,2:26,7,6,0
chr4	47898491	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=145,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,3,1
chr4	47901155	.	CAAAAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=22,15;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.407:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr4	47905158	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,27:0.599:45:3,10:14,17:17,1,22,5
chr4	47945386	.	A	G	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,2:0.042:69:37,1:26,1:18,49,1,1
chr4	47945455	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,4:5,9:1,12,1,12
chr4	47951945	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:7,4:6,13:5,8,6,11
chr4	47953515	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=136,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:1,5,0,4
chr4	48073501	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr4	48076091	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.479:42:8,14:13,6:2,20,1,19
chr4	48078593	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	48081896	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:2,2:5,0,5,0
chr4	48082095	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,7:4,3:4,6,1,9
chr4	48082208	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	48088419	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:4,4:5,1:6,3,5,1
chr4	48088446	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=72.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,9:0,0,15,7
chr4	48139565	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr4	48140815	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,6:4,4:7,3,5,5
chr4	48147612	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	48152854	.	TA	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:23,1:17,2:32,9,2,1
chr4	48165834	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:48165834_T_C:48165834:0,0,0,12
chr4	48165835	.	T	TGAAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GAAA;STR;TLOD=50.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:48165834_T_C:48165834:0,0,0,12
chr4	48165888	.	CTTA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	48169769	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=141.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,17:0,22:0,0,30,11
chr4	48172218	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr4	48173547	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	48178003	.	A	AAATCAGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	48372085	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,3:2,1:0,7,0,4
chr4	48381690	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.260:14:5,1:5,2:11,0,3,0
chr4	48486999	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=147,63;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:21,2:15,0:24,12,2,0
chr4	48492434	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	48496243	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:3,2,3,3
chr4	48504748	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=138,237;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:6,2:10,3,2,0
chr4	48507474	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=174,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:8,1,2,0
chr4	48516970	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr4	48529683	.	TAA	T,TA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,28,30;MFRL=209,175,178;MMQ=60,60,60;MPOS=29,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.52,19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,10:0.227,0.614:16:0,3,4:2,1,6:0,2,0,14
chr4	48529733	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr4	48533148	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,19:0,16:0,0,28,7
chr4	48537603	.	T	TACAC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=142,234;MMQ=55,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=AC;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,1:1,3:1,0,6,0
chr4	48537633	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.965:24:0,6:0,10:0,0,21,3
chr4	48541973	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=59.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,14,4
chr4	48542602	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=153,71;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:8,0:13,3:7,15,1,2
chr4	48559130	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:22,0:12,3:2,32,0,3
chr4	48573028	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	48577121	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,21,5
chr4	48582836	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr4	48588835	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=190,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:48588835_G_T:48588835:0,4,0,2
chr4	48588842	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=188,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:48588835_G_T:48588835:0,3,0,2
chr4	48596036	.	TA	T,TAA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=160,147,180;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=16.11,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,10,3:0.289,0.115:32:9,7,2:9,3,1:2,17,5,8
chr4	48597576	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:25,3:13,0:32,6,3,0
chr4	48607938	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	48610961	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.413:44:9,8:16,10:16,10,14,4
chr4	48611057	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:28,0:26,3:25,30,0,3
chr4	48611153	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0,0,0,27
chr4	48611929	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:8,5:5,5:1,12,0,10
chr4	48625204	.	T	TA	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=174,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,8:0.158:48:17,5:20,3:7,33,3,5
chr4	48625212	.	AC	A	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=160,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,6:0.123:54:22,5:26,1:0|1:48625212_AC_A:48625212:10,38,2,4
chr4	48625213	.	C	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,63:0.985:63:0,31:0,32:1|0:48625212_AC_A:48625212:0,0,15,48
chr4	48894980	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=181,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:9,3:12,0:0,21,1,2
chr4	48990476	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.512:10:2,3:2,1:4,1,3,2
chr4	48994138	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,8:3,0:1,5,2,6
chr4	49005840	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,2:10,0:5,10,1,1
chr4	49019232	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,10:0,15:0,0,24,3
chr4	49039958	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,2:6,2:7,0,4,0
chr4	52709515	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	52709545	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52709545_C_T:52709545:0,1,0,1
chr4	52709548	.	G	GCTACCCCAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52709545_C_T:52709545:0,1,0,1
chr4	52861978	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:4,4:11,12:8,7,8,8
chr4	52894796	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,155;MMQ=40,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr4	52896050	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,7:0,0,4,15
chr4	52927113	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr4	52946161	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	52946176	.	G	GGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=205,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:52946176_G_GGA:52946176:0,3,0,1
chr4	52946179	.	G	GGGTCCTGCCCTGGAGTACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=205,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:52946176_G_GGA:52946176:0,3,0,1
chr4	52951213	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34,26;MFRL=0,185,175;MMQ=60,60,60;MPOS=18,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.88,25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,10:0.233,0.714:13:0,0,2:0,3,4:0,0,0,13
chr4	52960908	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr4	53464006	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=208,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	53729578	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=166,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	53786861	.	TAGA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:2,3:4,1,5,2
chr4	54218719	.	AGGG	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=192,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,1:8,1:0|1:54218719_AGGG_A:54218719:11,4,2,0
chr4	54218725	.	AGAC	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=184,193;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,1:9,1:0|1:54218719_AGGG_A:54218719:12,4,2,0
chr4	54243905	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	54245476	.	A	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=218.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,36:0,32:0,0,23,46
chr4	54265883	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:7,3:6,1:13,0,4,0
chr4	54280705	.	GAA	G,GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=0,191,182;MMQ=60,60,60;MPOS=6,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=8.13,20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,10:0.282,0.528:18:0,1,2:3,4,8:3,0,15,0
chr4	54310188	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,10:0,2:0,0,9,3
chr4	54310340	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr4	54319011	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr4	54327235	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,0,21
chr4	54327584	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,24,1
chr4	54362150	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr4	54373564	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=168,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:11,0:22,3:12,22,1,2
chr4	54423948	.	A	ATTCCTCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=200,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:3,2:5,0,6,0
chr4	54852693	.	CTTTTA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TTTTA;STR;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.837:9:0,6:0,2:1,0,7,1
chr4	54852801	.	T	C	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=199.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,66:0.609:108:19,34:23,32:25,17,31,35
chr4	54915527	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:0,5,0,6
chr4	54915556	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=165,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:54915556_TA_T:54915556:0,4,0,1
chr4	54915559	.	AA	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=165,247;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:54915556_TA_T:54915556:0,4,0,1
chr4	54915562	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=165,247;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:54915556_TA_T:54915556:0,4,0,1
chr4	54930269	.	CAG	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=198,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,5:3,7:10,0,11,1
chr4	54930317	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=15,25;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.215:33:6,3:4,1:25,1,7,0
chr4	54966919	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr4	54967709	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr4	55139978	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	55144447	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	55146406	.	T	TTGTAGGTCCCCCAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,8:0,0,17,0
chr4	55151711	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr4	55151958	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr4	55156380	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	55156400	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	55161254	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr4	55161517	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	55569859	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:13,1:6,2:19,2,3,0
chr4	55594386	.	A	ATCAGTTTCTGTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr4	55599159	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=174,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr4	55599441	.	A	AACAAAGATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55599441_A_AACAAAGATT:55599441:0,0,0,1
chr4	55599443	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55599441_A_AACAAAGATT:55599441:0,0,0,1
chr4	55946081	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.970:32:0,16:0,14:0,0,28,4
chr4	55948108	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=115.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,14:0,16:0,0,23,7
chr4	55955232	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	55961159	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr4	55962545	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr4	55962598	.	A	AAACTAACTCAAAATAGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=216,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	55976626	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:23,0:16,5:17,22,1,4
chr4	55976947	.	T	TA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=11,10;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.695:27:2,1:1,3:1,7,3,16
chr4	55980239	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,6:6,4:7,4,6,4
chr4	55980456	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr4	56235897	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=158,228;MMQ=55,55;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.420:10:1,1:5,3:0|1:56235897_CA_C:56235897:6,0,4,0
chr4	56235917	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=16,13;MFRL=228,149;MMQ=58,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,3:0.364:9:0,0:1,1:1|0:56235897_CA_C:56235897:6,0,3,0
chr4	56235919	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=19,15;MFRL=228,149;MMQ=58,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,3:0.365:9:1,0:0,0:1|0:56235897_CA_C:56235897:6,0,3,0
chr4	56322567	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=199,261;MMQ=60,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:56322567_CA_TG:56322567:0,12,0,2
chr4	56322568	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=202,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,3:0.243:13:4,0:6,3:1|0:56322567_CA_TG:56322567:0,10,0,3
chr4	56435849	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,19:0,10:0,0,26,3
chr4	56447146	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr4	56465418	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=123.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,15:0,23:0,0,4,34
chr4	56724653	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,3:7,9:1,11,0,12
chr4	56734701	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.500:42:9,9:12,12:5,16,8,13
chr4	56736794	.	T	TTTTG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTTG;STR;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:2,5:6,4:8,0,10,0
chr4	56770741	.	T	TATAGGCTCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=155,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56770741_T_TATAGGCTCTC:56770741:0,1,0,1
chr4	56770743	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=155,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56770741_T_TATAGGCTCTC:56770741:0,1,0,1
chr4	56770745	.	G	GAAGAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=155,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56770741_T_TATAGGCTCTC:56770741:0,1,0,1
chr4	56835114	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=244,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr4	56858007	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,2:3,6:8,0,8,0
chr4	57176965	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	57179268	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	57180576	.	C	CGGAGCGGAGGGAGCGGAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=GGAGCGGAG;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr4	57180616	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=226,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,0,2
chr4	57189498	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:2,3:10,1:9,3,3,1
chr4	57193762	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=207,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:5,0,7,0
chr4	57204476	.	C	CTTCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTCT;STR;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:1,3:2,1:4,0,4,0
chr4	57208955	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.538:28:6,8:4,6:12,1,15,0
chr4	57219523	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:3,0,5,0
chr4	57244544	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:10,0:10,6,3,0
chr4	57267406	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=212,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:1,2:2,0:3,0,2,1
chr4	57269363	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=48.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.655:24:5,5:3,11:2,6,7,9
chr4	57269591	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=215,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:5,2:1,4:0,7,0,6
chr4	57269646	.	A	AAAAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=237,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr4	57316935	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,16;MFRL=176,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:1,0:5,1:0,9,0,3
chr4	57342992	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,1595;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,0:1,3:0,6,3,0
chr4	57357558	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:18,2:7,0:21,4,2,0
chr4	57514962	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:12,1:20,1:6,29,0,2
chr4	57521972	.	GGCTCAGCC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.604:8:3,4:0,1:3,0,5,0
chr4	57522220	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr4	57523869	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.623:30:3,4:8,13:7,4,14,5
chr4	57677780	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	57686657	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:2,1,5,1
chr4	57687711	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=136,100;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:57687711_T_C:57687711:1,0,2,1
chr4	57687719	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=169,100;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:57687711_T_C:57687711:1,1,2,1
chr4	57796900	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.410:29:10,6:7,4:11,6,5,7
chr4	57798174	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,29:0.682:42:5,13:8,15:7,6,19,10
chr4	57830663	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.403:33:11,7:7,6:3,17,6,7
chr4	57861117	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	57861358	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr4	57871400	.	AT	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=70.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.520:46:10,10:12,14:16,6,16,8
chr4	57871750	.	T	TTC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=175,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.389:18:4,3:6,4:9,2,6,1
chr4	57883175	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=206.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,22:0,33:0,0,49,6
chr4	57888510	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=235,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.637:12:2,3:2,5:0,4,0,8
chr4	57891238	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=180,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:57891238_T_TA:57891238:0,3,0,1
chr4	57891239	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=108,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1|0:57891238_T_TA:57891238:0,1,0,3
chr4	57891240	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=180,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:57891238_T_TA:57891238:0,3,0,1
chr4	57891242	.	A	ACTGCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=180,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:57891238_T_TA:57891238:0,3,0,1
chr4	57897508	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28,31;MFRL=194,131,162;MMQ=60,60,60;MPOS=24,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.46,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,2:0.280,0.237:10:1,2,0:4,0,2:0,5,0,5
chr4	57897570	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr4	62453209	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=150,196;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	62599289	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:3,4:11,6:3,11,1,9
chr4	62800554	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,12,7
chr4	62845461	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,0:7,5:0,13,1,4
chr4	62845490	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr4	62910364	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.284:12:3,0:6,3:0|1:62910364_C_A:62910364:0,9,3,0
chr4	62910368	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:0|1:62910364_C_A:62910364:0,8,3,0
chr4	62936494	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=162,260;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:16,1:19,2:8,27,2,1
chr4	65145955	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,5
chr4	65145966	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,4
chr4	65146700	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=136.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,36,1
chr4	65146711	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=151.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,20:0,21:0,0,40,1
chr4	65165661	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=147.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,21:0,24:0,0,31,14
chr4	65165849	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,0,24
chr4	65240805	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0|1:65240805_A_T:65240805:0,0,15,0
chr4	65240807	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0|1:65240805_A_T:65240805:0,0,15,0
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chr4	66233029	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:5,0,5,0
chr4	66242649	.	A	G	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,6:0.090:75:36,6:30,0:58,11,5,1
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chr4	66286100	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr4	66468014	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	66509194	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=123.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,16:0,17:0,0,4,29
chr4	68357814	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr4	68360955	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr4	68379719	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=290,640;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:68379719_G_GT:68379719:1,0,1,0
chr4	68379720	.	CTAAG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=145,640;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:68379719_G_GT:68379719:2,0,1,0
chr4	68379729	.	G	GTAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=0,640;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:68379719_G_GT:68379719:3,0,1,0
chr4	68384861	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,10:0,19:0,0,27,2
chr4	68396525	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr4	68406626	.	TATTA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=203,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,5:3,4:12,0,9,0
chr4	68447249	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.631:25:5,10:4,6:0,9,0,16
chr4	68456767	.	A	ACTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=89,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr4	68490019	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.572:28:7,5:4,11:1,11,2,14
chr4	68490044	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=181,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:9,4:6,5:1,14,0,9
chr4	68490650	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:7,2:0,3:6,1,5,0
chr4	68492060	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,6:4,0:6,0,4,2
chr4	68492244	.	T	TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:4,3:4,1:0,8,0,5
chr4	68496080	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr4	68497333	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:3,7:8,4:11,0,10,1
chr4	68514739	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:4,10:9,6:11,2,17,0
chr4	68528744	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=214,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,0:5,8:9,0,7,1
chr4	68539539	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:3,4:1,6,0,5
chr4	68543240	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=154,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,2:1,3:1,0,6,0
chr4	68544318	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.513:29:8,7:6,7:0,14,0,15
chr4	68547165	.	T	TA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.367:36:12,5:10,7:23,0,11,2
chr4	68547809	.	A	ATAC	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=145.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,38:0.513:74:18,20:18,16:30,6,32,6
chr4	68700956	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr4	68777054	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=127.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,22:0,18:0,0,31,10
chr4	68780253	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,10:0,20:0,0,29,2
chr4	68780512	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr4	68788694	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	68788719	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr4	68789778	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=60.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,19,1
chr4	68795815	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,0,13
chr4	68829207	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr4	68919617	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=126.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,23:0,13:0,0,32,5
chr4	68928440	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,111;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:10,3:15,0:10,15,3,0
chr4	68934252	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr4	68934306	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr4	69057073	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr4	69083563	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=129.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,21:0,20:0,0,33,8
chr4	69094926	.	TTAAA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=129.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,19:0,11:0,0,22,8
chr4	69097150	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	69179759	.	C	CA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:21,1:12,2:32,1,3,0
chr4	69179906	.	G	T	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,3:0.057:70:33,3:26,0:0|1:69179906_G_T:69179906:37,30,0,3
chr4	69179913	.	G	C	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,3:0.055:72:37,3:27,0:0|1:69179906_G_T:69179906:38,31,0,3
chr4	69179917	.	CG	C	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.059:67:38,2:24,0:0|1:69179906_G_T:69179906:32,32,0,3
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chr4	69693316	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.561:39:3,13:14,9:1,16,1,21
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chr4	69696430	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=149,169;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,20:0.375:54:22,12:11,8:24,10,14,6
chr4	69696451	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=147,154;MMQ=60,45;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,23:0.375:62:23,14:13,8:28,11,17,6
chr4	69696648	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,142;MMQ=59,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,3:8,7:0,14,0,10
chr4	69795582	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,8:0.154:58:18,8:29,0:28,22,8,0
chr4	69795871	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,240;MMQ=55,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr4	69796548	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr4	69796838	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,20,2
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chr4	69817505	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=83,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,1:8,2:2,8,0,3
chr4	69962330	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,0:13,2:5,17,0,2
chr4	69964180	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=215,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:1,1:3,2:5,0,3,0
chr4	69964209	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,6:1,5:2,0,11,0
chr4	69964234	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.737:20:5,7:0,8:5,0,15,0
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chr4	69973889	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=147,125;MMQ=60,22;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,7:0.129:59:32,7:19,0:44,8,7,0
chr4	69973921	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,29:0.435:67:23,10:14,19:29,9,20,9
chr4	69978554	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr4	70066319	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,166;MMQ=41,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.381:40:13,4:12,11:11,14,7,8
chr4	70160338	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,39;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,7:0,7:0|1:70160338_G_C:70160338:0,0,9,6
chr4	70160342	.	TG	CC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,7:0,7:0|1:70160338_G_C:70160338:0,0,10,6
chr4	70346711	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=226,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:3,0:2,2:0,5,0,3
chr4	70355380	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=235,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,4:2,5:0,3,0,9
chr4	70359569	.	GA	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:8,2:10,1:0|1:70359569_GA_G:70359569:2,19,0,3
chr4	70359582	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,2:11,0:0|1:70359569_GA_G:70359569:2,20,0,2
chr4	70359586	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:10,0:0|1:70359569_GA_G:70359569:2,18,0,2
chr4	70465153	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=141,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:4,3:1,4,0,6
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chr4	70709970	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=144,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:14,2:22,1:10,29,2,1
chr4	70713520	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,5:3,1:3,7,1,5
chr4	70719915	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,0:15,2:18,7,2,0
chr4	70723196	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:11,11:7,9:15,3,17,3
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chr4	70803380	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,20,1
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chr4	70807690	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,4:0.064:66:32,3:29,0:43,19,4,0
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chr4	70824865	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr4	70896355	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,13,0
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chr4	70899040	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:70899037_T_A:70899037:0,3,0,1
chr4	70899046	.	G	GAGGA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:70899037_T_A:70899037:0,3,0,1
chr4	70899047	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:70899037_T_A:70899037:0,3,0,1
chr4	70899049	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:70899037_T_A:70899037:0,3,0,1
chr4	70899052	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:70899037_T_A:70899037:0,3,0,1
chr4	70921164	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,5:0,0,6,3
chr4	70921337	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr4	71020205	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr4	71021888	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=70.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,0,20
chr4	71024010	.	T	TACAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,2:0,0,5,0
chr4	71024171	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,5:6,5:9,2,8,2
chr4	71067317	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:1,7,0,9
chr4	71114956	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:7,10:5,5:7,5,6,9
chr4	71201943	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:1,8:7,3:4,4,7,4
chr4	71201961	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:1,10:8,2:6,3,8,5
chr4	71227802	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,171;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.523:38:11,10:7,9:14,4,18,2
chr4	71228001	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr4	71250308	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr4	71250399	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr4	71255370	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=65.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,9:0,0,18,3
chr4	71255593	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=86,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=110.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.946:35:1,14:0,19:0,1,14,20
chr4	71265172	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	71275012	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=109.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,13:0,0,29,1
chr4	71384579	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,1:7,6:1,12,2,5
chr4	71388379	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:5,6:7,9:12,0,13,2
chr4	71388394	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:5,6:5,7:11,0,13,0
chr4	71394320	.	CCA	TTG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=174,150;MMQ=47,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.117:24:7,0:12,2:22,0,2,0
chr4	71398064	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:9,9:11,4:16,4,12,1
chr4	71468345	.	CAGG	C	.	.	DP=148;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=209.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,58:0.447:130:35,30:34,26:41,31,31,27
chr4	71468541	.	A	G	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,4:0.068:71:34,1:32,3:26,41,4,0
chr4	71468583	.	AT	A	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=70.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,29:0.507:57:12,13:15,16:11,17,13,16
chr4	71469529	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	71469556	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr4	71469604	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:1,2,3,2
chr4	71508298	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:19,0:21,3:23,19,0,3
chr4	71554619	.	CGAG	C	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GAG;STR;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,5:0.081:71:22,3:31,2:21,45,3,2
chr4	71554690	.	GGGA	G	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGA;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.088:42:18,1:15,2:16,23,2,1
chr4	71629196	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.090:46:20,3:22,0:37,5,4,0
chr4	71640825	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,228;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:18,3:12,0:30,0,3,0
chr4	71655383	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,1:4,1:0,14,0,2
chr4	71691743	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	71698183	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr4	71891541	.	A	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,3:0.058:66:37,3:26,0:43,20,3,0
chr4	71892513	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=106.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,1,31
chr4	72316822	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	72397710	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	72397805	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=133,100;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:4,2:12,2,0,2
chr4	72397964	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr4	72411967	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr4	72423624	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	72425736	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	72426020	.	G	GGGGGTAATTTTGCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	72429409	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	72429452	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr4	72433481	.	C	CT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:12,1:12,1:24,0,3,0
chr4	72433642	.	TG	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:7,10:11,7:0,19,2,16
chr4	72433663	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=167,150;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.158:36:19,0:11,5:0|1:72433663_T_A:72433663:0,31,0,5
chr4	72433667	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=167,150;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.158:36:19,0:11,5:0|1:72433663_T_A:72433663:0,31,0,5
chr4	72618334	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,9,14
chr4	72620865	.	C	CTATTTATT,CTATTTATTTATTTATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32,36;MFRL=0,166,157;MMQ=60,27,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,9,11;RU=TATT;STR;TLOD=3.27,10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.288,0.581:4:0,1,0:0,0,3:0,0,0,4
chr4	72622403	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr4	72634975	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	72934632	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,16,1
chr4	73175093	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,13:0,0,27,2
chr4	73178202	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:0,4,0,7
chr4	73414286	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,7,15
chr4	73433122	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=62.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,12:0,0,10,11
chr4	73434379	.	GT	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=82.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,15:0,0,23,8
chr4	73434535	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.513:19:5,2:4,8:0,9,0,10
chr4	73930427	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,24,0
chr4	73930889	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=19,36;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=24,23;RU=T;STR;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.768:7:0,5:0,1:0|1:73930889_CT_C:73930889:0,1,6,0
chr4	73930894	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=98,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.714:9:0,4:2,1:0|1:73930889_CT_C:73930889:0,2,7,0
chr4	73930918	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:4,0:3,0:0|1:73930889_CT_C:73930889:2,5,2,0
chr4	73933667	.	ATGTATG	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=196,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.446:16:5,3:4,4:9,0,7,0
chr4	73933671	.	ATG	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=TG;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:8,0,3,0
chr4	73941877	.	AT	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.073:52:19,3:27,0:37,12,3,0
chr4	74010555	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=209,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.509:8:2,1:2,3:0,4,1,3
chr4	74017201	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.362:23:8,5:6,3:7,8,5,3
chr4	74124011	.	CTCG	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,263;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCG;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.059:48:28,2:14,0:22,24,0,2
chr4	74304118	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	74310768	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=84.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,9:0,0,17,6
chr4	74313169	.	T	C	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=281.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,34:0,43:0,0,35,42
chr4	74351605	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,137;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:10,0:14,5,2,0
chr4	74357851	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,10:0,0,1,14
chr4	74357888	.	A	AATCAATTGGTCTTACCACCCACATACT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=208,224;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr4	74447452	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:3,10:2,6:5,0,16,0
chr4	74448078	.	ATCT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,3:3,4:0,9,0,7
chr4	74450830	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,5:3,2:9,0,7,0
chr4	74451073	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,18:0.594:30:3,5:9,10:0|1:74451073_A_G:74451073:4,8,7,11
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chr4	74453656	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.595:40:7,12:9,12:5,11,6,18
chr4	74453691	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.540:26:3,6:8,8:1,11,0,14
chr4	74464285	.	T	TTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.864:12:1,4:0,6:1,0,10,1
chr4	74464443	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.946:14:0,5:0,9:0,0,1,13
chr4	74486052	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,17,0
chr4	74486264	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	74703248	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:10,6:7,6:16,2,11,1
chr4	74703487	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,0:13,2:1,27,0,2
chr4	74719925	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	74735524	.	G	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=11,32;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=243.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,73:0.986:74:0,36:0,33:0,1,28,45
chr4	74847111	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.529:40:5,8:12,13:9,10,9,12
chr4	74847292	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,10:0,0,2,16
chr4	74903134	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=213,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr4	75040944	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr4	75147041	.	CGT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=GT;STR;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,0:8,0,4,0
chr4	75174151	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:10,0,2,0
chr4	75245343	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=181,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.387:19:4,3:6,4:0,12,0,7
chr4	75248544	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=221,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:2,4,1,7
chr4	75481971	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,205;MMQ=27,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.194:39:10,7:21,0:27,5,7,0
chr4	75482263	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr4	75484775	.	A	ATAAAACATTATTTAAAAGTTCATTG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,85019;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.116:23:8,0:13,2:3,18,0,2
chr4	75485813	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=95.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,18:0,0,30,2
chr4	75673363	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr4	75675706	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=175,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,6:7,1:9,0,7,0
chr4	75675841	.	A	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,25:0.388:65:22,10:18,15:20,20,12,13
chr4	76415693	.	G	GTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=215,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TA;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr4	76415985	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr4	76416779	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=101.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,38:0.493:77:15,13:23,24:30,9,27,11
chr4	76434352	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:5,11:4,4:9,0,9,6
chr4	76439347	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.249:27:7,0:1,1:16,4,7,0
chr4	76441992	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:15,1,2,0
chr4	76442226	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=141,168;MMQ=42,47;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.675:7:0,1:1,2:0,2,0,5
chr4	76521414	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=85,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,1:1,1:7,2,2,0
chr4	76571732	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.720:15:2,7:1,4:0,4,0,11
chr4	76572191	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:3,2:5,4:4,4,7,0
chr4	76580894	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr4	76649924	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.313:35:7,6:17,3:23,1,10,1
chr4	76650106	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=20,11;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,12:0.144:59:16,1:10,0:18,29,0,12
chr4	76650176	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:9,12:9,8:0,18,0,20
chr4	76678576	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,4:4,7:12,0,11,0
chr4	76695810	.	TTCTC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.606:31:7,8:5,11:11,1,17,2
chr4	76721414	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,3:8,0,6,0
chr4	76721459	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,24:0.695:34:5,5:5,19:8,2,18,6
chr4	76721705	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:3,1,2,5
chr4	76722041	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	76722422	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:10,4:9,4:0,19,0,8
chr4	76725245	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.964:23:0,12:0,11:0,0,22,1
chr4	76727576	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.627:25:5,5:4,11:9,0,14,2
chr4	76730004	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,21:0,7:0,0,28,0
chr4	76730061	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=113.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,22:0,11:0,0,26,7
chr4	76730247	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.126:42:16,0:20,4:0,37,0,5
chr4	76730258	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=132.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,19:0,15:0,0,0,35
chr4	76785716	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,2,8
chr4	76785723	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,1,7
chr4	76785736	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	76804067	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr4	76805692	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	76805962	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	76805978	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:76805978_C_T:76805978:0,1,0,2
chr4	76805982	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:76805978_C_T:76805978:0,1,0,2
chr4	76809319	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=97426482,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,8:1,3:0,1,9,2
chr4	76811371	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=190,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr4	76811384	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76811384_A_AT:76811384:0,0,0,1
chr4	76811386	.	C	CAGTCTGTGATTCGGCTCATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76811384_A_AT:76811384:0,0,0,1
chr4	76857388	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.332:16:6,4:5,1:0|1:76857388_C_T:76857388:3,8,1,4
chr4	76857395	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=131,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,3:4,1:0|1:76857388_C_T:76857388:3,7,1,4
chr4	76861137	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,13:0,0,17,4
chr4	76861834	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	76881392	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:1,6,0,5
chr4	76881401	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,5:2,0:1,5,0,6
chr4	76882543	.	T	TGAGAGCAGCATCCCGTCTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.671:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	76885216	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,1:0,3:5,0,4,0
chr4	76885423	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:3,3:10,2:4,9,2,3
chr4	76903036	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr4	76912041	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:9,0:5,1:3,15,0,3
chr4	76924933	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	76928428	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	76942943	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	76943235	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr4	76943677	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,1,10
chr4	76943764	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr4	76944491	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,9:0,0,16,3
chr4	76956179	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:6,5:5,4:0|1:76956179_G_A:76956179:6,5,5,4
chr4	76956188	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0|1:76956179_G_A:76956179:0,0,11,11
chr4	76956289	.	C	CAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=76.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,7,13
chr4	76956528	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,5:0,0,2,12
chr4	76957043	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=93,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,3:5,1:5,1,4,0
chr4	76957171	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,12:0,7:0,0,7,14
chr4	76996958	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,9:0,10:0,0,17,3
chr4	76997157	.	G	GT	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,27:0.803:33:1,11:2,9:0,6,6,21
chr4	77003755	.	G	GCTTGAAGCAAGATGGGCTGGTATGGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77003755_G_GCTTGAAGCAAGATGGGCTGGTATGGC:77003755:0,0,0,1
chr4	77003757	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77003755_G_GCTTGAAGCAAGATGGGCTGGTATGGC:77003755:0,0,0,1
chr4	77022286	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=209,283;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr4	77039352	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,3:2,0:0,5,1,3
chr4	77052530	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:1,5,0,5
chr4	77065264	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:11,8:6,7:16,1,13,2
chr4	77065476	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,26,28,29;MFRL=174,172,174,157;MMQ=60,60,60,60;MPOS=29,29,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.18,23.34,9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,3,12,6:0.119,0.397,0.212:29:3,1,6,1:5,2,6,5:3,5,8,13
chr4	77065518	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.401:40:11,6:13,9:14,10,11,5
chr4	77100814	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:7,5,1,1
chr4	77134786	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr4	77177570	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:12,2,2,0
chr4	77201332	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=79,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:3,5:1,7:4,0,12,0
chr4	77204500	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.346:38:6,8:19,4:17,8,7,6
chr4	77253463	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:10,0,2,0
chr4	77272202	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:15,2:9,1:12,14,1,2
chr4	77274242	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,15,0
chr4	77283234	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=182,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,0:3,2:8,0,2,0
chr4	77283337	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,0:13,2:20,8,0,2
chr4	77290561	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.443:20:5,2:6,5:11,0,8,1
chr4	77303898	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,1,11
chr4	77317673	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,159;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.113:51:26,0:19,5:13,33,0,5
chr4	77317698	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:18,1:9,2:0|1:77317698_G_C:77317698:0,27,0,3
chr4	77317701	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:18,0:8,2:0|1:77317698_G_C:77317698:0,27,0,3
chr4	77662248	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	77662309	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr4	77871016	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr4	77871187	.	C	CGCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCG;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	77969825	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=148,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:0,2:3,2:0,7,0,4
chr4	77987351	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:4,1,5,0
chr4	78666109	.	TGC	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	78666114	.	AAG	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78666114_AAG_A:78666114:0,0,0,1
chr4	78666123	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78666114_AAG_A:78666114:0,0,0,1
chr4	78666127	.	T	TCAAATTGAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78666114_AAG_A:78666114:0,0,0,1
chr4	78666129	.	C	CTATG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78666114_AAG_A:78666114:0,0,0,1
chr4	78694327	.	TA	T,TAA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,28,28;MFRL=150,158,167;MMQ=60,60,60;MPOS=25,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.95,6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,4,6:0.163,0.215:28:5,3,4:12,1,2:0,18,0,10
chr4	78697552	.	T	TA,TAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30,28;MFRL=145,157,156;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=25.57,4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,13,3:0.595,0.160:21:2,4,1:3,7,2:0,5,1,15
chr4	78815272	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.288:25:7,2:8,4:15,3,7,0
chr4	78873605	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=125,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.435:35:9,10:10,5:14,6,9,6
chr4	78873629	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=43.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.425:43:9,11:14,7:15,10,10,8
chr4	78987157	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.524:53:8,16:17,10:5,20,12,16
chr4	78987284	.	AC	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:0,9,0,9
chr4	79158805	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr4	79173521	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr4	79176325	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	79176361	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr4	79187900	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	79188160	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr4	79204209	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	79207784	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	79238496	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,10,1
chr4	79240196	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr4	79258862	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:8,4:2,7:6,4,5,6
chr4	79258875	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=158,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,4:9,0:9,14,4,0
chr4	79295322	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.401:20:8,4:4,2:6,6,2,6
chr4	79295378	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=132,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,2:2,1:3,2,1,3
chr4	79295418	.	C	CTG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr4	79305148	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.336:31:7,5:12,5:21,0,9,1
chr4	79305177	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,15:0.348:44:16,9:12,6:19,10,13,2
chr4	79328729	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=103,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	79345650	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr4	79345669	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	79350200	.	C	CTGTGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,12;RU=TG;STR;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	79359885	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:0,4,1,5
chr4	79366655	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.418:29:11,5:5,6:11,6,10,2
chr4	79371579	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=171,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:0,3,0,3
chr4	79372856	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,3:0,0,6,0
chr4	79372930	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr4	79373254	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr4	79385803	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr4	79387278	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:0|1:79387278_C_A:79387278:8,0,5,0
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chr4	79387412	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:23,3:23,0:28,18,3,0
chr4	79387442	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,24:0.456:53:14,10:14,14:10,19,15,9
chr4	79391036	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	79391256	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=100.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,14:0,0,7,22
chr4	79393572	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=200,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,3:1,4:0,3,1,6
chr4	79394836	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr4	79400868	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.451:27:4,7:10,5:4,11,2,10
chr4	79403146	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:4,7:11,7:1,14,3,11
chr4	79409997	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr4	79420787	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr4	79420864	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,21:0.550:38:10,11:6,8:0|1:79420864_T_C:79420864:8,9,17,4
chr4	79420869	.	CC	TG	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,21:0.537:39:8,11:6,7:0|1:79420864_T_C:79420864:9,9,17,4
chr4	79440425	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,2:2,1:6,0,2,1
chr4	79442873	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr4	79443774	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr4	79455858	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	79503230	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	79512800	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,19:0,0,4,27
chr4	79531186	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=90.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,22,6
chr4	79531308	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,3,11
chr4	79847634	.	G	GA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:13,1:9,2:21,2,3,0
chr4	80828668	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=125,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.602:10:1,4:2,2:1,3,0,6
chr4	80828740	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	80905930	.	GA	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=128,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:23,2:15,2:36,6,4,0
chr4	80957195	.	GAA	G,GA,TAA	.	.	DP=61;ECNT=5;MBQ=18,36,16,10;MFRL=142,166,139,155;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,21,18;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.55,9.15,4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:23,3,6,13:0.079,0.146,0.203:45:2,2,0,0:7,1,1,0:6,17,1,21
chr4	80957205	.	A	AGC	.	.	DP=62;ECNT=5;MBQ=26,23;MFRL=150,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.050:57:20,2:29,0:0|1:80957205_A_AGC:80957205:7,48,0,2
chr4	80957206	.	AAGAT	A	.	.	DP=60;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=150,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.049:59:23,2:31,0:0|1:80957205_A_AGC:80957205:7,50,0,2
chr4	80957212	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=150,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:20,2:21,0:0|1:80957205_A_AGC:80957205:3,44,0,2
chr4	80957215	.	AA	TT	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=151,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:18,2:20,0:0|1:80957205_A_AGC:80957205:1,43,0,2
chr4	80975372	.	A	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,22:0.450:49:15,11:11,10:18,9,15,7
chr4	80976420	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,3:5,5:6,7,4,4
chr4	81123013	.	CGT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.166:18:9,3:4,0:15,0,3,0
chr4	81884610	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr4	82013619	.	A	AAAGG,AAAGGAAGG	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,25,25;MFRL=0,187,149;MMQ=60,40,40;MPOS=4,2;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=AAGG;STR;TLOD=3.26,7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.386,0.508:3:0,1,1:0,0,1:0,0,0,3
chr4	82073246	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,4:9,3:1,14,2,5
chr4	82369160	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.709:18:4,8:0,4:5,0,13,0
chr4	82369205	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:8,9:4,5:11,1,14,0
chr4	82369494	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.521:19:3,4:4,4:1,8,0,10
chr4	83294836	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,13;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:83294836_C_G:83294836:0,1,0,1
chr4	83294849	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,13;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:83294836_C_G:83294836:0,1,0,1
chr4	83294851	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,13;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:83294836_C_G:83294836:0,1,0,1
chr4	83294858	.	CG	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:83294836_C_G:83294836:0,1,0,1
chr4	83294861	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,10;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:83294836_C_G:83294836:0,1,0,1
chr4	83376098	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=183,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr4	83424089	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,30,24,28;MFRL=174,176,173,138;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,7,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.04,8.06,8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:15,2,5,6:0.087,0.188,0.210:28:4,1,1,5:9,1,4,1:12,3,10,3
chr4	83425918	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,183;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr4	83602150	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	83626382	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,21,1
chr4	83763690	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr4	83765691	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:2,3:6,8:1,8,1,10
chr4	83774687	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,5:5,7:9,0,11,1
chr4	83787875	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.504:30:7,7:7,8:15,0,15,0
chr4	83787965	.	A	G	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,6:0.076:90:35,6:48,0:55,29,0,6
chr4	83788139	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.431:49:16,9:12,12:5,23,3,18
chr4	83788170	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:14,0:15,2:7,23,1,1
chr4	83788562	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	83791649	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=209,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr4	83793243	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,6:7,5:4,9,3,10
chr4	83800181	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=111.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,2,26
chr4	83827822	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,2:3,7:1,4,1,8
chr4	83828963	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:34,3:25,0:37,23,2,1
chr4	83852065	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,16,0
chr4	83857108	.	AT	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:5,4:9,2,6,1
chr4	83857402	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=123.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,21:0,13:0,0,24,10
chr4	83867576	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:14,0:15,5:9,20,0,5
chr4	83900260	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	83989516	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	83989571	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,3:5,3:3,5,6,1
chr4	84189012	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	84193366	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=88.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,9:0,16:0,0,3,23
chr4	84205618	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,19,5
chr4	84205872	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	84223461	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=55.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,1,15
chr4	84229897	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,9,0
chr4	84232104	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:0,1,1,6
chr4	84234190	.	A	G,AAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,25,34;MFRL=0,175,207;MMQ=60,56,45;MPOS=7,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,0,1:0,1,0:0,0,3,0
chr4	84234196	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,16;MFRL=164,207;MMQ=60,45;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:84234196_A_T:84234196:3,0,1,0
chr4	84234201	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=175,207;MMQ=60,45;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:84234196_A_T:84234196:4,0,1,0
chr4	84234229	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr4	84240654	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	84240680	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	84338076	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,2:7,3:0,10,0,5
chr4	84362443	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:7,9:9,5:10,6,11,3
chr4	84364604	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr4	84364808	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:1,4,0,6
chr4	84367286	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=197,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr4	84368060	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:17,1:16,1:25,8,0,2
chr4	84368225	.	GCATTGTGGCCAATGCCTGTAATCC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.419:10:2,1:2,2:0,6,1,3
chr4	84370124	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.707:11:3,1:0,7:0,3,1,7
chr4	84380858	.	CT	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,3:0.057:67:31,0:30,3:49,15,2,1
chr4	84390088	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,4:5,1:9,0,5,0
chr4	84393475	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,14:0.416:34:5,12:15,2:0|1:84393475_C_T:84393475:3,17,2,12
chr4	84393485	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,17:0.486:35:5,12:12,4:0|1:84393475_C_T:84393475:3,15,2,15
chr4	84403491	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=247,249;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr4	84457989	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,11;MFRL=210,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:0,0:2,0:0|1:84457989_T_G:84457989:0,3,0,1
chr4	84457996	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,36;MFRL=186,247;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:84457989_T_G:84457989:0,2,0,1
chr4	84458001	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	84458010	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	84465613	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:5,6:5,8:6,4,14,1
chr4	84465855	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr4	84509465	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,2,14
chr4	84519775	.	A	AT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.172:31:12,1:14,3:22,4,4,1
chr4	84525973	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=115,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,6:4,5:3,4,2,9
chr4	85419315	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	85552882	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.649:38:5,15:8,9:13,0,24,1
chr4	85555196	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=196,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:0,3,0,3
chr4	85560000	.	TTA	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=165,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TA;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,0:6,2:14,1,2,0
chr4	85560024	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.346:17:3,4:5,2:9,2,6,0
chr4	85598639	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=250,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85598639_T_TC:85598639:0,1,0,1
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chr4	85598644	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=250,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85598639_T_TC:85598639:0,1,0,1
chr4	85629962	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=188,168;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:4,2:12,0:16,0,2,0
chr4	85672854	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,0:12,3:7,17,0,3
chr4	85686879	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=65075184,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	85710824	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,9:0,0,12,2
chr4	85715915	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,254;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.109:43:25,3:14,1:20,19,4,0
chr4	86852207	.	AT	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,31:0.578:53:12,14:10,17:8,14,9,22
chr4	86863467	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=209,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr4	86921612	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr4	87028315	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:4,1,3,0
chr4	87607862	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,25:0.404:62:20,13:17,11:21,16,21,4
chr4	87638334	.	TAA	GTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	87643296	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=99,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr4	87662703	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,15186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr4	87666334	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.415:39:14,12:9,4:2,21,2,14
chr4	87672108	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.422:43:10,13:15,5:22,3,18,0
chr4	87674200	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:11,3:19,0:16,15,3,0
chr4	87695455	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:7,0,3,0
chr4	87701517	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:3,1,3,2
chr4	87703242	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:1,4:8,2:9,0,6,0
chr4	87703430	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.415:32:6,9:11,4:1,18,3,10
chr4	87705788	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,2:4,4:0,4,0,6
chr4	87705804	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=166,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr4	87706506	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=193.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,23:0,28:0,0,16,37
chr4	87706532	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:8,7:10,11:2,17,4,14
chr4	87706617	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=208,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr4	87718116	.	T	TTCTATCTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.802:8:0,2:1,5:0,1,0,7
chr4	87725101	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr4	87726619	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:0,9,0,2
chr4	87728676	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:6,1,4,0
chr4	87729115	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:3,0:11,2:0,14,0,2
chr4	87730821	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=177,171;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:10,0,2,0
chr4	87730831	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,3:4,4:8,0,7,0
chr4	87731238	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr4	87732329	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr4	87735508	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=175,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr4	87745099	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:0|1:87745099_G_T:87745099:1,20,0,2
chr4	87745100	.	A	AAG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:0|1:87745099_G_T:87745099:1,20,0,2
chr4	87752909	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=119,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:6,6:3,8:7,2,11,3
chr4	87754419	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.384:21:4,4:9,3:12,1,7,1
chr4	87812564	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:5,0,6,0
chr4	87812586	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.932:18:1,11:0,4:1,0,14,3
chr4	87968798	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=214,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr4	88029482	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:1,4,0,4
chr4	88048163	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:5,4:3,2:8,0,5,1
chr4	88048315	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=12,29;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.758:6:0,2:0,1:0|1:88048315_GC_G:88048315:0,1,0,5
chr4	88048327	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.569:3:0,1:1,1:0|1:88048315_GC_G:88048315:0,1,0,2
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chr4	88056925	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,9:0,0,1,18
chr4	88091427	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=205,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:2,2:12,0:2,12,0,2
chr4	88099765	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:12,3:4,16,0,3
chr4	88231338	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=151,175;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:4,0:5,1:12,2,1,1
chr4	88231339	.	CA	C,AA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34,30;MFRL=0,167,175;MMQ=60,60,60;MPOS=10,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=30.97,23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,11,8:0.582,0.374:19:0,5,1:0,3,7:0,0,15,4
chr4	88234874	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr4	88238448	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,9:0,0,0,14
chr4	88261828	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,37;MFRL=208,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr4	88293992	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,2:5,6:0,6,2,6
chr4	88295786	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:8,0,7,0
chr4	88296051	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,15;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr4	88312293	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=205,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:1,3:2,3:0,3,0,7
chr4	88356051	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=212,172;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:88356051_G_A:88356051:4,0,2,0
chr4	88356053	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,36;MFRL=212,172;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:88356051_G_A:88356051:4,0,2,0
chr4	88356062	.	CAC	TGT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=184,205;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:88356062_CAC_TGT:88356062:4,0,1,0
chr4	88356066	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=184,205;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:88356062_CAC_TGT:88356062:4,0,1,0
chr4	88356111	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,6:4,5:8,0,10,1
chr4	88362904	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:6,6:10,7:16,0,13,0
chr4	88379085	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:10,0:19,4:11,18,1,3
chr4	88532182	.	A	AGTGT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=19,23;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=GT;STR;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.489:10:2,1:0,1:0,5,0,5
chr4	88533163	.	TTGTGTGTG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=TG;STR;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.846:10:1,4:0,5:1,0,9,0
chr4	88533441	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=202,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,15:0.457:33:6,9:12,5:0|1:88533441_T_C:88533441:14,4,14,1
chr4	88533445	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=202,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,15:0.457:33:5,10:12,5:0|1:88533441_T_C:88533441:14,4,14,1
chr4	88535826	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=113,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,14:0.229:61:23,5:17,6:31,16,8,6
chr4	88536316	.	TAGC	T	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGC;STR;TLOD=102.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,29:0.423:69:9,14:14,8:21,19,18,11
chr4	88536520	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=106,122;MMQ=60,55;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,31:0.662:46:8,14:7,11:10,5,16,15
chr4	88536868	.	TAGTGACAGCAGCAATAGC	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=18,27;MFRL=32,130;MMQ=39,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=110.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,31:0.868:36:0,17:1,5:0|1:88536868_TAGTGACAGCAGCAATAGC_T:88536868:3,2,17,14
chr4	88536937	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,14;MFRL=113,186;MMQ=40,29;MPOS=-10;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.258:21:6,0:3,0:0|1:88536868_TAGTGACAGCAGCAATAGC_T:88536868:12,4,5,0
chr4	88536943	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,16;MFRL=113,187;MMQ=40,36;MPOS=-16;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.223:20:7,0:5,0:0|1:88536868_TAGTGACAGCAGCAATAGC_T:88536868:12,4,4,0
chr4	88537420	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=134,147;MMQ=60,58;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,26:0.510:51:9,16:13,7:11,14,16,10
chr4	88537737	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,16:0,13:0,0,0,30
chr4	88577573	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=216,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr4	88577754	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=216,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,7:3,0:0,5,1,6
chr4	88578310	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,4:3,7:0,7,0,11
chr4	88732453	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=109.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,19:0,17:0,0,32,4
chr4	88732531	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=159.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,20:0,21:0,0,27,17
chr4	88755828	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=94.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,18:0,8:0,0,25,2
chr4	88755967	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:8,7:4,7:0,12,1,13
chr4	88759690	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,4:0,2:5,1,6,0
chr4	88957562	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	88959381	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr4	88973406	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	88996915	.	A	ATCTCTGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	89015857	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,8:0,0,2,15
chr4	89016782	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=114.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,19:0,12:0,0,0,32
chr4	89018565	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:7,8:2,11:7,2,17,2
chr4	89022362	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,14,4
chr4	89028478	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=189,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:1,2,0,2
chr4	89034789	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,238;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:89034789_G_GT:89034789:0,3,0,1
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chr4	89306793	.	C	CCT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:25,2:10,0:1,34,0,2
chr4	89314635	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,2:6,3:9,3,5,0
chr4	89702564	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr4	89708850	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,4:4,1:8,0,5,0
chr4	89711690	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=154,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,0:2,2:9,3,2,1
chr4	89711849	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:0|1:89711849_T_C:89711849:0,4,0,7
chr4	89711854	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,4:2,2:0|1:89711849_T_C:89711849:0,3,0,7
chr4	89726073	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.441:45:12,10:13,8:23,2,18,2
chr4	89726283	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:6,6:6,6:1,12,1,11
chr4	89827492	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.332:31:8,3:13,7:14,7,4,6
chr4	89941921	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr4	90034030	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr4	90168882	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.347:30:13,6:5,4:19,1,10,0
chr4	90171478	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=80,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr4	90743317	.	T	TC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=96.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,11:0,10:0|1:90743317_T_TC:90743317:0,0,23,0
chr4	90743331	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=106.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0|1:90743317_T_TC:90743317:0,0,26,1
chr4	90816023	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	90816790	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,5:0,14:0,0,0,19
chr4	90855932	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,4:1,5:1,0,9,0
chr4	90874095	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	91234250	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	91549156	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:8,4:4,8:12,0,11,1
chr4	93225752	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=181,32690168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:1,1:4,0,2,0
chr4	93511464	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:4,18,0,2
chr4	93511481	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,2,13
chr4	94032125	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:2,7,1,6
chr4	94751674	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=126,160;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,6:7,3:5,4,2,7
chr4	94751710	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:4,2,2,2
chr4	94751827	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:4,3:8,1:11,1,3,2
chr4	95161996	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.631:36:6,14:7,9:13,0,20,3
chr4	95170839	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,41:0.524:78:18,21:19,19:25,12,29,12
chr4	95170845	.	G	A	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,118;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,3:0.049:79:36,3:39,0:47,29,3,0
chr4	95185854	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.530:49:9,15:14,11:16,7,19,7
chr4	95199479	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=184,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:10,0,6,0
chr4	95201723	.	G	GTGTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=196,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TGTTT;STR;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:2,2:3,2:5,0,3,2
chr4	95206252	.	TTATC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0,0,4,16
chr4	95255637	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=114.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,12:0,0,24,7
chr4	95500628	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,25:0.473:53:8,10:20,15:15,13,14,11
chr4	95506214	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,31:0.464:67:22,14:14,17:4,32,6,25
chr4	95506245	.	G	T	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=186,220;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.092:52:28,0:18,4:0|1:95506245_G_T:95506245:1,47,0,4
chr4	95506250	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=187,220;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.098:49:27,0:17,4:0|1:95506245_G_T:95506245:0,45,0,4
chr4	95508108	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.731:5:0,2:1,2:0|1:95508108_C_CT:95508108:1,0,4,0
chr4	95508128	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=86,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.241:19:7,0:8,1:0|1:95508108_C_CT:95508108:5,10,4,0
chr4	95508281	.	C	CT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.112:35:7,2:19,2:4,27,0,4
chr4	95561625	.	T	TCCCTAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=208,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:95561625_T_TCCCTAG:95561625:0,3,0,1
chr4	95561628	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=208,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:95561625_T_TCCCTAG:95561625:0,3,0,1
chr4	95585038	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr4	95585225	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:0,6,3,4
chr4	96035796	.	G	GAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=AC;STR;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,1:4,1,3,0
chr4	96073956	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:7,2:5,8:0,12,0,10
chr4	96091250	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,4:0,4:3,0,7,1
chr4	96091524	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.421:20:5,3:6,5:1,11,0,8
chr4	96137458	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:96137458_CA_TC:96137458:0,1,0,1
chr4	96137466	.	C	CATTCTCCCATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:96137458_CA_TC:96137458:0,1,0,1
chr4	96256673	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,22:0,15:0,0,22,15
chr4	96762629	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=208,253;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,1:2,1:0,4,0,3
chr4	98761900	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:5,8:6,5:8,3,10,3
chr4	98893334	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=217,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr4	98902278	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=187,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,2:5,2,6,1
chr4	99027184	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:8,5:1,3:5,4,2,6
chr4	99027218	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:3,3:0,1:0,3,1,4
chr4	99055406	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=221,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:7,0,7,0
chr4	99055480	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.503:32:8,10:7,5:15,1,15,1
chr4	99064307	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,7:0.131:52:16,1:12,0:9,36,0,7
chr4	99064313	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=16,12;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.153:43:9,0:8,0:4,32,0,7
chr4	99064316	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.205:40:10,1:7,0:3,28,0,9
chr4	99064379	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=202,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,1:6,2:0,9,0,3
chr4	99339794	.	G	GT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.091:53:28,1:20,3:34,15,4,0
chr4	99341156	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:10,4:6,6:13,3,9,1
chr4	99355017	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr4	99358083	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,5:3,5:2,2,4,6
chr4	99397318	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,82;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,3:12,0:17,2,3,0
chr4	99399748	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=222,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr4	99408106	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr4	99802300	.	GA	G	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=144,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,7:0.130:54:7,2:6,2:9,38,0,7
chr4	99808136	.	CTTAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	99850010	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.706:5:0,0:1,0:0|1:99850010_T_C:99850010:1,0,4,0
chr4	99850015	.	CACA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.706:5:0,0:1,2:0|1:99850010_T_C:99850010:1,0,4,0
chr4	99850020	.	CGCT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=231,184;MMQ=60,60;MPOS=-1073741835;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.613:6:0,0:1,2:0|1:99850010_T_C:99850010:2,0,4,0
chr4	99969801	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=207,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:16,0,3,0
chr4	99993869	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=149.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,17:0,28:0,0,7,40
chr4	99996252	.	GAAC	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=97.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.962:22:0,8:0,13:0|1:99996252_GAAC_G:99996252:0,0,0,22
chr4	99996266	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:6,1:12,1:0|1:99996252_GAAC_G:99996252:0,18,0,2
chr4	100002644	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,9:0,13:0,0,3,19
chr4	100003333	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=116.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,2,30
chr4	100048327	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.960:20:0,8:0,12:0,0,19,1
chr4	100048506	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=130.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.970:30:0,12:0,17:0|1:100048506_G_A:100048506:0,0,3,27
chr4	100048509	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=130.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,11:0,17:0|1:100048506_G_A:100048506:0,0,3,27
chr4	100052963	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	100057858	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	100062675	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=111.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,19:0,15:0,0,22,12
chr4	100128530	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr4	100128753	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.424:26:5,4:10,6:6,9,1,10
chr4	100131163	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	100131746	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr4	100134713	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr4	100137292	.	ATTT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=78,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=T;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.540:4:0,1:1,0:1,1,1,1
chr4	100200509	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:7,5:7,3:13,1,8,0
chr4	100200571	.	T	TA	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=147,170;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=54.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,25:0.605:41:5,13:9,10:9,7,18,7
chr4	100201477	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:4,4:4,4:1,7,1,7
chr4	100205819	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,15:0.500:30:5,9:7,6:0|1:100205819_C_A:100205819:12,3,11,4
chr4	100205829	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.514:33:7,11:9,6:0|1:100205819_C_A:100205819:13,3,13,4
chr4	100212173	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=203,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.543:21:8,6:2,5:0|1:100212173_A_T:100212173:0,10,0,11
chr4	100212197	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=204,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.434:15:7,2:2,4:0|1:100212173_A_T:100212173:0,9,0,6
chr4	100232624	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,5:3,5:5,1,10,0
chr4	100239112	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,13,1
chr4	100239156	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=176,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:15,3:9,0:21,3,3,0
chr4	100239379	.	A	ATTTTATTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=161,15788;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:9,0:10,2:0|1:100239379_A_ATTTTATTT:100239379:2,17,0,2
chr4	100239382	.	G	GCATTGTCTCCTGCTTC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=161,15788;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:100239379_A_ATTTTATTT:100239379:2,17,0,2
chr4	100258054	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	100260669	.	GCCCC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=224,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=C;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:2,1:0,0:0|1:100260669_GCCCC_G:100260669:2,0,2,0
chr4	100260679	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=191,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:3,0,2,0
chr4	100260681	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:3,1:0,0:0|1:100260669_GCCCC_G:100260669:4,0,2,0
chr4	100266478	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.462:24:6,5:7,6:0|1:100266478_CA_C:100266478:0,13,1,10
chr4	100266483	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.462:24:6,5:7,6:0|1:100266478_CA_C:100266478:0,13,1,10
chr4	100341643	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr4	100356337	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=149.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,24:0,20:0,0,36,8
chr4	100477326	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,93;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:12,0:18,3:15,15,0,3
chr4	100479456	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,28;MFRL=289,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:100479456_C_T:100479456:0,2,0,1
chr4	100479457	.	A	AATACTGGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=289,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:100479456_C_T:100479456:0,2,0,1
chr4	100480339	.	G	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,107;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.094:61:28,5:28,0:39,17,5,0
chr4	100761572	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=149,136;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.216:23:7,3:10,0:8,10,0,5
chr4	100784142	.	TTG	T	.	.	DP=163;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,11:0.090:129:51,6:54,5:84,34,7,4
chr4	100827622	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,18,2
chr4	100869755	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:9,7:4,7:0,13,0,14
chr4	101331582	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,210;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:3,13,0,2
chr4	101337150	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:0,6,0,8
chr4	101338217	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.721:15:1,7:2,4:2,2,10,1
chr4	101344137	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:11,2:7,0:12,6,2,0
chr4	101368837	.	T	TGATTACTTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=221,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101368837_T_TGATTACTTTG:101368837:0,1,0,1
chr4	101368844	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=221,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101368837_T_TGATTACTTTG:101368837:0,1,0,1
chr4	101368846	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=221,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101368837_T_TGATTACTTTG:101368837:0,1,0,1
chr4	101953322	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=213,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr4	101961705	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.089:42:21,1:17,2:17,22,3,0
chr4	102014919	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:10,5:9,4:10,9,4,5
chr4	102015143	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=37,35;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:0,3,1,4
chr4	102020924	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=37,29;MFRL=198,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr4	102267821	.	AA	CG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,20,0
chr4	102268034	.	ACGC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=203,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CGC;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,1:6,1:0,11,0,2
chr4	102839362	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,8:0,0,1,18
chr4	102942765	.	TTA	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.068:41:17,1:22,1:8,31,0,2
chr4	103505784	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.571:13:2,4:1,2:4,2,5,2
chr4	103514658	.	T	C	.	.	DP=114;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=127,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=320.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,101:0.982:102:0,49:1,49:1,0,60,41
chr4	103514741	.	T	C	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=144.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,46:0.501:92:24,14:21,32:5,41,5,41
chr4	103534560	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,26:0.600:43:9,12:8,14:16,1,22,4
chr4	103534740	.	TA	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:22,2:20,1:1,44,0,3
chr4	103553447	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=15,18;MFRL=151,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.369:13:0,1:0,1:0,8,0,5
chr4	103557192	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:2,8,2,6
chr4	103557219	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=158,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:1,4,0,4
chr4	103557251	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	103610872	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=122.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,14:0,18:0,0,4,30
chr4	103612018	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	103647651	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:4,1,2,0
chr4	103731067	.	CAAAT	C	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=124.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,34:0.432:79:21,17:21,17:10,35,4,30
chr4	103747541	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.710:29:3,13:5,8:6,2,19,2
chr4	103789782	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.559:39:4,13:13,8:15,2,19,3
chr4	103789810	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=72.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.640:43:5,14:9,11:10,5,22,6
chr4	103790186	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:5,0,7,0
chr4	103806308	.	CTA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:5,7:6,4:13,0,11,0
chr4	103822540	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,184;MMQ=49,22;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,6:0.106:63:32,2:25,4:15,42,0,6
chr4	103826625	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=133,250;MMQ=52,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:9,0:16,2:19,7,0,2
chr4	103826635	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=171,164;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.411:32:7,2:12,10:12,7,7,6
chr4	103866480	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,35:0.484:72:16,17:21,18:12,25,14,21
chr4	103870377	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=153,146;MMQ=40,26;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:15,1:26,1:0|1:103870377_T_A:103870377:27,15,1,1
chr4	103870402	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=161,175;MMQ=40,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.075:51:16,2:29,1:0|1:103870377_T_A:103870377:29,19,2,1
chr4	103870560	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=157,148;MMQ=51,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.134:35:19,1:10,2:0|1:103870560_C_T:103870560:11,20,2,2
chr4	103870574	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=180,148;MMQ=52,25;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,1:9,2:0|1:103870560_C_T:103870560:5,20,1,2
chr4	103911159	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,2:1,5:0,5,0,7
chr4	104000796	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:5,2:13,0:19,1,1,1
chr4	104017293	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:5,2:3,2:4,4,3,1
chr4	104027380	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:15,1:17,3:26,6,4,0
chr4	104035733	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=162,104;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr4	104054117	.	T	TTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,14;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=TA;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,0:0,2,0,4
chr4	104061403	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,271;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,2:10,0:16,7,0,2
chr4	104066176	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:7,1:6,2:13,0,3,0
chr4	104084765	.	CA	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=76,64;MMQ=46,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.688:8:0,4:0,1:0,2,4,2
chr4	105393361	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,5:0,4:0,0,10,1
chr4	106160231	.	GT	G,GTTTTTTTGTTT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,35,33;MFRL=181,169,139;MMQ=60,60,42;MPOS=13,12;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.79,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,7:0.141,0.258:25:5,2,1:5,1,5:6,9,7,3
chr4	106163095	.	CTT	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,1:7,2:3,10,0,3
chr4	106163109	.	TTC	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:1,3:5,5:1,6,0,8
chr4	106163111	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.443:14:4,0:5,5:0,9,1,4
chr4	106190970	.	TG	CC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,2:8,1:0,16,0,3
chr4	106292121	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,22:0.639:34:6,7:6,14:2,10,3,19
chr4	106317370	.	T	TATAAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:8,7:4,8:11,2,15,0
chr4	106317498	.	CCAAA	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAAA;STR;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.347:24:8,3:8,5:1,15,0,8
chr4	106359209	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,4:1,4,0,7
chr4	106616926	.	T	TGAGGCCGGAGTTTGAGACCAGTGTGGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=98,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr4	106819053	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,25:0.504:49:15,9:8,13:12,12,18,7
chr4	106879584	.	TCA	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=155,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.110:36:16,1:13,3:28,4,4,0
chr4	106879597	.	C	A	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,4:0.070:69:39,4:25,0:52,13,4,0
chr4	106888252	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=215,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr4	107037630	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=205,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:1,1,0,3
chr4	107092169	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:6,0,3,0
chr4	107114947	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.459:35:8,10:11,6:3,16,0,16
chr4	107115960	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,13:0.274:49:19,6:17,7:7,29,2,11
chr4	107133861	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:10,2:12,3:22,0,5,0
chr4	107154273	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=216,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,2:1,3,0,5
chr4	107156365	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,3:7,2:9,0,5,0
chr4	107157699	.	TAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,10;MFRL=132,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:0,1:0,6,0,3
chr4	107165685	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:2,2:5,2,4,0
chr4	107168318	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,0:14,2:18,3,0,2
chr4	107168520	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr4	107171637	.	TAAATA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.372:33:7,5:14,7:6,15,0,12
chr4	107246136	.	C	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,28:0.461:61:21,14:11,14:25,8,15,13
chr4	107248770	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.116:34:19,2:10,0:0|1:107248770_C_CA:107248770:1,30,1,2
chr4	107248772	.	G	GTTGCCTAGATACAGATTCTTACTTCTTTCC	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=171,123;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.116:34:18,3:10,0:0|1:107248770_C_CA:107248770:1,30,1,2
chr4	107257975	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:5,1,8,0
chr4	107268949	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=182,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	108566270	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=215,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,3:0,4:0,2,1,6
chr4	108575955	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.463:39:15,6:6,12:11,10,7,11
chr4	108608100	.	CTCTAACACT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.843:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	108622241	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr4	108622475	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:0,6,0,6
chr4	108641169	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr4	108641437	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=230,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr4	108866058	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr4	108868515	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,4:3,3:12,0,4,3
chr4	108931119	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=165,268;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:14,1:14,0:0|1:108931119_G_T:108931119:0,31,0,2
chr4	108931124	.	TC	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=166,259;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.113:29:10,1:13,0:0|1:108931119_G_T:108931119:0,26,0,3
chr4	108931133	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=19,20;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.441:11:1,0:2,4:0,6,0,5
chr4	108935770	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,3:0,8:0,0,6,9
chr4	108944579	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr4	108944821	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr4	108985388	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr4	108991979	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr4	108999300	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	108999366	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr4	109002686	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=172,53;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:12,0,1,1
chr4	109010207	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	109576622	.	C	CAAAAA,CAAAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32,34;MFRL=0,153,200;MMQ=60,60,40;MPOS=13,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,12,13;RU=A;STR;TLOD=14.08,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,2:0.671,0.252:9:0,2,1:0,5,1:0,0,9,0
chr4	109576843	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,6:0,9:0,0,0,16
chr4	109578572	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr4	109667885	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:12,4,3,0
chr4	109735133	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,17:0,14:0|1:109735133_T_C:109735133:0,0,3,29
chr4	109735146	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=119.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,14:0,12:0|1:109735133_T_C:109735133:0,0,2,26
chr4	109735209	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr4	109748227	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr4	109762918	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,5,10
chr4	109766290	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=102,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:2,6:0,7:2,0,8,5
chr4	109766397	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:8,0:14,2:8,14,1,1
chr4	109767453	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr4	109769844	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr4	109782249	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109782249_C_T:109782249:0,1,0,1
chr4	109782251	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:109782249_C_T:109782249:0,1,0,1
chr4	109783755	.	ACAG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=174,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:0,6,1,5
chr4	109790346	.	C	CAATAAATA	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=116,151;MMQ=60,58;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=AATA;STR;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.393:22:2,4:10,3:1,12,0,9
chr4	109790377	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=167,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.435:28:7,2:8,10:1,15,1,11
chr4	109811003	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=197,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr4	109817962	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:0,4,0,7
chr4	109820195	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:3,5:3,1:0|1:109820195_C_A:109820195:7,1,6,1
chr4	109820202	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:3,3:5,2:0|1:109820195_C_A:109820195:7,2,5,1
chr4	109820446	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,243;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr4	109895718	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	109969183	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:5,2:5,5:10,0,7,1
chr4	109969337	.	G	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=114,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,30:0.395:76:24,14:19,14:28,18,12,18
chr4	109971378	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:11,9:10,7:3,18,5,11
chr4	110433282	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.252:15:7,2:4,1:3,8,0,4
chr4	110446454	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=80.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,16,7
chr4	110451371	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:1,0,5,0
chr4	110580084	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr4	110581324	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,4:3,7:8,1,9,2
chr4	110581363	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.474:36:9,5:10,12:13,6,12,5
chr4	110585645	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=151,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:0,1,0,6
chr4	110615913	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	110619534	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,3:5,4:3,8,1,6
chr4	110635488	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=98,172;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=46.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:3,9:2,5:5,0,14,0
chr4	110670807	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr4	110678925	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=132.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,22:0,15:0,0,17,23
chr4	110678979	.	T	TTTTAA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,0,18
chr4	110679002	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=50.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,0,12
chr4	110681618	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,9,6
chr4	110682865	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	110737549	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.947:16:0,8:0,7:0|1:110737549_G_A:110737549:0,0,2,14
chr4	110737574	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=188,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.305:11:3,1:5,2:0|1:110737549_G_A:110737549:0,8,0,3
chr4	110745095	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,39:0.470:83:27,25:16,13:38,6,32,7
chr4	110754499	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,1:6,3:1,9,0,4
chr4	110758551	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:7,1,6,0
chr4	110758769	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,4:4,3:1,4,4,4
chr4	110765361	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,3:0,0,1,12
chr4	110765372	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,5:3,1:0,5,1,5
chr4	110773067	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,4:7,6:7,3,4,6
chr4	110786290	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.629:25:1,9:8,7:9,0,16,0
chr4	110786517	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,9:6,5:0,11,1,13
chr4	110788739	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,2,2
chr4	110865271	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	110866178	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr4	110866442	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,3,8
chr4	110866498	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr4	110866508	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	110896050	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	110904795	.	A	AGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	110929468	.	CCA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=209,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CA;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr4	110932524	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:12,2:14,1:13,14,1,2
chr4	111409925	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	111412390	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,15;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,0:1,1:0,6,0,6
chr4	111431315	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=204,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:6,1,6,0
chr4	111781650	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,11:0,7:0,0,16,2
chr4	113066831	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr4	113176004	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,1:4,4:2,7,0,5
chr4	113178894	.	ATTTGT	A	.	.	DP=138;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=549.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,123:0.992:123:0,65:0,54:0,0,72,51
chr4	113178966	.	T	TA	.	.	DP=109;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,12:0.165:75:27,6:31,4:16,47,4,8
chr4	113179077	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0|1:113179077_C_T:113179077:0,0,1,14
chr4	113179080	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0|1:113179077_C_T:113179077:0,0,1,13
chr4	113199691	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	113298908	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,1:15,1:16,9,0,2
chr4	113346714	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,14,1
chr4	113346969	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:15,0:8,2:2,22,0,2
chr4	113347609	.	C	CT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.841:23:3,4:0,5:2,1,16,4
chr4	113353790	.	C	CCTTTGTGCTGTGTCATCCCCAAATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr4	113356495	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:5,5:3,6:0,9,1,10
chr4	113362463	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,3:4,4:0,8,0,7
chr4	113460927	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=197,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:2,3,0,4
chr4	113483446	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,1:2,5:5,0,6,0
chr4	113505317	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:2,1:7,0:0|1:113505317_T_A:113505317:8,2,0,3
chr4	113505323	.	AG	CC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:2,1:7,0:0|1:113505317_T_A:113505317:8,1,0,3
chr4	113527306	.	T	TGCAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:113527306_T_TGCAA:113527306:0,3,0,1
chr4	113527310	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:113527306_T_TGCAA:113527306:0,3,0,1
chr4	113527312	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:113527306_T_TGCAA:113527306:0,3,0,1
chr4	113527314	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:113527306_T_TGCAA:113527306:0,3,0,1
chr4	113533796	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=62.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.600:33:4,11:9,9:1,12,2,18
chr4	113554385	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:10,9:6,11:2,14,2,18
chr4	113566101	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=130,198;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:4,2:6,0:0,10,0,2
chr4	113568126	.	TA	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:9,5:6,5:15,9,8,3
chr4	113568328	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.515:46:14,8:7,12:7,15,4,20
chr4	113569135	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.548:40:12,8:6,14:12,6,13,9
chr4	113570639	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:6,12:11,13:16,1,17,8
chr4	113578326	.	TTG	T,TTGTG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,26,28;MFRL=168,149,174;MMQ=60,60,60;MPOS=9,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=TG;STR;TLOD=6.42,4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,3:0.211,0.221:15:6,1,2:2,2,0:8,1,6,0
chr4	113578482	.	G	GA	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.073:64:21,0:24,1:21,39,1,3
chr4	114028149	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,2:0,5,1,6
chr4	114028168	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:1,3,0,5
chr4	114120284	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,0:0,5:0,3,1,4
chr4	114171076	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,3:5,5:0,11,0,8
chr4	114176848	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=198,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr4	114186005	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=204,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,5:4,3:9,0,8,0
chr4	114267023	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,10:0,0,15,6
chr4	114278637	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,119;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,0:13,2:14,15,0,2
chr4	114530230	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=200,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.564:37:8,8:8,13:14,2,19,2
chr4	114582860	.	C	T	.	.	DP=101;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,38:0.391:98:31,21:26,17:48,12,31,7
chr4	114582933	.	TA	T,TAA	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=28,28,29;MFRL=147,156,179;MMQ=60,60,60;MPOS=27,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=5.64,4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,5,5:0.127,0.133:39:16,3,3:10,2,2:2,27,1,9
chr4	115544654	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:7,4:5,5:7,6,2,7
chr4	115586972	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.435:5:0,1:1,1:0,3,0,2
chr4	115589159	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr4	115898522	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=142,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,0,2
chr4	119035948	.	T	TC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,11:0,4:0,0,13,3
chr4	119064666	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,0:3,2:11,0,3,0
chr4	119064668	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.745:14:0,7:3,1:3,0,11,0
chr4	119161619	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr4	119174563	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	119174640	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=65.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.936:28:1,16:0,9:0,1,22,5
chr4	119217114	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=98.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,12:0,0,0,28
chr4	119609039	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=134.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,20:0,17:0,0,35,4
chr4	119609182	.	CTT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.324:7:0,2:1,0:1,4,0,2
chr4	119609246	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=191,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:3,1:4,3:0,8,0,4
chr4	119610606	.	A	G	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=102.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,35:0.507:69:16,21:18,14:12,22,10,25
chr4	119625273	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:0,7,1,7
chr4	119644815	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=108,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.717:18:1,6:3,0:0,5,3,10
chr4	119666217	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=18,29;MFRL=171,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:2,1:0,2:1,4,0,4
chr4	119674051	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,1136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:7,0:10,2:1,16,1,1
chr4	119718988	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:8,7:3,9:3,8,6,10
chr4	119726949	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=185,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:1,3:2,3:4,0,6,0
chr4	119727202	.	T	TCTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=199,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:119727202_T_TCTC:119727202:0,3,0,1
chr4	119727206	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=225,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:119727202_T_TCTC:119727202:0,2,0,1
chr4	119727210	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=225,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:119727202_T_TCTC:119727202:0,2,0,1
chr4	119736598	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,17:0,0,24,7
chr4	119944566	.	C	CT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=48.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.530:38:9,7:9,13:17,1,15,5
chr4	119950975	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=229,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,3:1,0:1,0,4,0
chr4	119979128	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:8,2:8,5:2,17,1,7
chr4	120071926	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr4	120072233	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=283,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:120072233_G_C:120072233:0,2,0,2
chr4	120072238	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=283,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:120072233_G_C:120072233:0,2,0,1
chr4	120079159	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:5,8:5,3:7,3,8,4
chr4	120079387	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.760:19:1,7:3,7:0,4,0,15
chr4	120107098	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr4	120192436	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:2,0:7,4:9,0,4,0
chr4	120194718	.	G	GT,GTT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=182,154,129;MMQ=60,60,60;MPOS=19,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=T;STR;TLOD=83.84,4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,32,4:0.796,0.117:39:2,19,0:1,13,2:3,0,31,5
chr4	120212425	.	AT	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.441:28:7,4:9,8:4,12,0,12
chr4	120212514	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=216,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:0,7,0,4
chr4	120240131	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,25:0.553:45:11,15:9,10:17,3,20,5
chr4	120243336	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=201,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:2,2:0,6,0,5
chr4	120422497	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=185,131;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:11,0:2,3:0,14,0,3
chr4	120422504	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=185,131;MMQ=54,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.224:15:10,0:2,3:0,12,0,3
chr4	120422506	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=188,141;MMQ=57,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.270:15:10,0:1,4:0,11,0,4
chr4	120423719	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:2,4:6,4:0|1:120423719_C_T:120423719:9,1,7,1
chr4	120423729	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:3,4:7,4:0|1:120423719_C_T:120423719:9,1,7,1
chr4	120425777	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=142,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,3:7,7:3,7,3,7
chr4	120446868	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,1:1,4:1,7,0,8
chr4	120463561	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:16,2:12,1:25,4,3,0
chr4	120463856	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr4	120474859	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.596:40:8,11:8,13:7,9,8,16
chr4	120481431	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,9:5,4:8,5,7,6
chr4	120486402	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:4,8:8,8:12,0,15,2
chr4	120981214	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=177,168;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,4:4,1:9,0,5,0
chr4	120983086	.	GA	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=56.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.511:45:9,13:12,10:19,3,22,1
chr4	120983259	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,29:0.364:80:27,15:24,12:17,34,8,21
chr4	121631379	.	CACACACACACACACAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=205,243;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.407:3:0,1:1,0:2,0,1,0
chr4	121737767	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,2:3,7:0,4,2,7
chr4	121739411	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CA;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr4	121774515	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr4	121957984	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=175,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:7,7,2,0
chr4	121958691	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:1,3:7,1:0|1:121958691_T_C:121958691:0,8,0,4
chr4	121958697	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,7:0.668:10:2,1:1,6:1|0:121958691_T_C:121958691:0,3,0,7
chr4	121961031	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=204,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr4	121961295	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	122082376	.	G	GA,GAA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=16,20,21;MFRL=164,93,125;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.02,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.217,0.316:6:0,0,0:1,1,1:1,2,1,2
chr4	122082399	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,26;MFRL=161,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:122082399_G_T:122082399:1,3,1,0
chr4	122082403	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=161,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:122082399_G_T:122082399:1,3,1,0
chr4	122082407	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=161,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:122082399_G_T:122082399:1,3,1,0
chr4	122082481	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=209,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	122258063	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=91.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,12:0,14:0,0,3,24
chr4	122599755	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	122602859	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.067:42:18,0:22,2:20,20,0,2
chr4	122617631	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.465:39:10,10:10,8:20,1,15,3
chr4	122617654	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:13,11:11,9:23,1,13,7
chr4	122617688	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,27:0.476:57:11,12:17,14:20,10,14,13
chr4	122617718	.	G	C	.	.	DP=79;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,32:0.413:78:23,18:21,12:28,18,18,14
chr4	122681373	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	122722693	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=179.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,48:0.961:49:1,23:0,25:0,1,5,43
chr4	122724052	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:17,3:17,0:27,8,2,1
chr4	122732899	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=139.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,24:0,14:0,0,1,37
chr4	122735225	.	C	CTTA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr4	122737487	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.314:30:10,5:8,3:20,1,8,1
chr4	122739183	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,17,1
chr4	122749436	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,13:0,0,8,19
chr4	122756386	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:20,0:22,3:20,22,0,3
chr4	122760968	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	122770183	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:122770183_C_G:122770183:0,1,0,1
chr4	122770188	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:122770183_C_G:122770183:0,1,0,1
chr4	122770189	.	T	TTGTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:122770183_C_G:122770183:0,1,0,1
chr4	122776067	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	122780432	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=184,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,3:6,2:0,7,0,5
chr4	122791601	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=84.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,0,23
chr4	122831249	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:6,0,2,0
chr4	123108762	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr4	123109335	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=212,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	123113352	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=63.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.611:34:8,17:5,4:11,2,18,3
chr4	123130886	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=225,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr4	123140739	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,9:0,0,2,23
chr4	123141725	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=191,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	123170756	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.278:41:15,4:15,7:14,16,7,4
chr4	123178630	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,194;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:21,3:15,0:10,26,3,0
chr4	123187869	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=208,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr4	123222417	.	TAA	T,TA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,26,26;MFRL=165,139,150;MMQ=60,60,60;MPOS=29,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=4.77,14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,3,8:0.110,0.277:30:8,1,3:10,2,5:19,0,11,0
chr4	123246971	.	GT	G,GTT,GTTT	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=32,32,34,34;MFRL=156,166,159,148;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,20,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=11.16,3.92,7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:37,9,5,5:0.141,0.093,0.099:56:13,2,4,2:19,6,0,1:29,8,12,7
chr4	123255552	.	A	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,27:0.425:64:19,13:17,14:22,15,13,14
chr4	123264485	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr4	123270703	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=149,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,6:0.106:64:37,0:21,6:25,33,0,6
chr4	123270721	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=148,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.122:55:27,0:21,6:19,30,0,6
chr4	123274402	.	T	TTTAGATAGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:123274402_T_TTTAGATAGG:123274402:0,0,0,1
chr4	123274405	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:123274402_T_TTTAGATAGG:123274402:0,0,0,1
chr4	123274407	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:123274402_T_TTTAGATAGG:123274402:0,0,0,1
chr4	123283163	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr4	123314732	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=154,109;MMQ=60,21;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,3:5,0:7,1,3,0
chr4	123314744	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=152,109;MMQ=60,21;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,3:7,0:8,2,3,0
chr4	123329125	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,3:10,0:10,15,1,2
chr4	123333671	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=241,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr4	123342616	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,15336;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	123854495	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr4	123949556	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.959:20:0,14:0,5:0,0,6,14
chr4	124323738	.	T	C	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=320.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,91:0.989:91:0,55:0,33:0,0,39,52
chr4	124324242	.	CCTT	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=190.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,28:0,14:0,0,27,18
chr4	125592065	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,6:3,4:4,3,4,6
chr4	126241253	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=201,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:3,4,5,1
chr4	126315034	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr4	126335978	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr4	126336990	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=103.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,20:0,9:0,0,0,29
chr4	126337555	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr4	126355609	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,3,20
chr4	126367527	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.109:35:14,3:15,0:22,10,3,0
chr4	126384905	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr4	126389627	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,11,2
chr4	126390010	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:2,2:2,4:1,4,2,4
chr4	126390022	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=80,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	126400825	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr4	126402618	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=217,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr4	126411964	.	TC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=148,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:9,2:9,1:19,1,2,1
chr4	126412198	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=204,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:0|1:126412198_G_GT:126412198:6,3,0,2
chr4	126412199	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=204,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:126412198_G_GT:126412198:6,3,0,2
chr4	126412201	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=204,234;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:126412198_G_GT:126412198:6,3,0,2
chr4	128554404	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:3,1:1,5:0,5,0,6
chr4	128565276	.	G	GTAAGTGAATCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=502,246;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr4	128621144	.	CTT	C,CT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=139,137,105;MMQ=60,60,60;MPOS=19,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.56,7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,4,7:0.094,0.164:43:16,1,3:12,3,4:28,4,8,3
chr4	128621272	.	A	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,26:0.500:52:13,6:12,19:0|1:128621272_A_C:128621272:0,26,2,24
chr4	128621274	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,23:0.461:50:5,13:19,10:1|0:128621272_A_C:128621272:2,25,0,23
chr4	128627050	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr4	128632023	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=237,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,1:3,0,3,0
chr4	128635022	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr4	128665981	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:0,6:2,5:0,2,1,11
chr4	128739604	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=157,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,4:0.070:69:30,0:35,4:17,48,0,4
chr4	128744139	.	ATGT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr4	128803159	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=200,227;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr4	128808549	.	A	T	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=123,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,4:0.049:98:57,4:37,0:65,29,4,0
chr4	128812230	.	GTTTTT	G,GTTTTTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20,35;MFRL=162,115,194;MMQ=60,60,60;MPOS=13,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,9,15;RU=T;STR;TLOD=5.79,4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,5:0.131,0.265:17:7,0,4:3,2,1:8,2,5,2
chr4	128814425	.	AT	A,ATT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30,20;MFRL=158,172,127;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.48,4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,7,5:0.229,0.165:29:10,2,1:7,5,2:16,1,10,2
chr4	128861133	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.336:19:6,4:6,2:5,8,3,3
chr4	128923001	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.630:8:1,2:1,2:0,3,0,5
chr4	128995989	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr4	129120708	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.402:25:7,4:7,5:6,9,6,4
chr4	129193739	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=9,31;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,0:0,2:0,3,0,3
chr4	129805716	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr4	129809801	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:4,0,4,2
chr4	129867280	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,8,14
chr4	129878342	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,1,16
chr4	138449812	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,5:7,4:3,11,2,7
chr4	139093228	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=195,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,6:1,3:0,4,0,9
chr4	139103366	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr4	139140388	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=44.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr4	139153538	.	TA	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:14,2:17,1:2,31,0,3
chr4	139966663	.	A	ATTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=25,28;RU=T;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.864:4:0,1:0,0:0,0,0,4
chr4	140283102	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.522:28:8,5:4,9:5,8,5,10
chr4	140308984	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:7,3:5,4:12,1,7,0
chr4	140450204	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,17:0.327:53:17,5:19,12:20,16,10,7
chr4	140450455	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr4	140599645	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,109;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,2:16,0:22,4,2,0
chr4	140625323	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=106.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,9:0,19:0,0,1,27
chr4	140651584	.	TCTG	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CTG;STR;TLOD=98.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,12:0,10:0,0,23,0
chr4	140811120	.	CTGT	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=196,159;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.206:25:13,1:6,4:6,14,2,3
chr4	140811137	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=183,193;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,2:8,1:11,14,0,3
chr4	141074495	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:4,0:18,2:0,22,0,2
chr4	141311960	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	141321425	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	141448595	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=23,22,25,32;MFRL=157,109,182,118;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,15,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.97,17.70,6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:45,5,12,8:0.075,0.167,0.113:70:20,3,7,3:14,2,3,4:18,27,11,14
chr4	141448705	.	TA	T,TAA	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=28,28,30;MFRL=151,141,139;MMQ=60,60,60;MPOS=21,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.49,3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:49,5,5:0.089,0.086:59:23,4,1:21,1,3:9,40,1,9
chr4	141458485	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	141484371	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=219,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:1,0:1,2:0,3,2,0
chr4	141543997	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	141545564	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,5:0,7:0,0,0,13
chr4	141545653	.	GCAAA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAAA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	141578155	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	141598290	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr4	141607679	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:0,4,0,7
chr4	141677006	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,1:0,0,5,1
chr4	141868736	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=144.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,20:0,26:0,0,42,4
chr4	142053925	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=161,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:2,17,0,2
chr4	142153856	.	CT	C,CTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,32,20;MFRL=169,169,142;MMQ=60,60,60;MPOS=22,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.74,3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,5,3:0.211,0.150:23:7,2,1:5,2,1:0,15,0,8
chr4	142155214	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	142640538	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.489:18:4,5:5,2:6,3,6,3
chr4	142650901	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=202,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	143003155	.	G	GA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=76.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.969:27:0,15:0,9:0,0,22,5
chr4	143007197	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	143007419	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:1,5,3,4
chr4	143007460	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	143043404	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:7,6:6,4:5,8,4,7
chr4	143044666	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	143094924	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:19,0:16,4:11,24,0,4
chr4	143129490	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=193,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr4	143130034	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr4	143130219	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:1,8,0,7
chr4	143181746	.	AAT	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.173:32:12,3:15,2:4,23,0,5
chr4	143181747	.	AT	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.613:27:6,8:4,9:1,9,2,15
chr4	143181748	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.969:37:1,18:0,17:0,1,3,33
chr4	143226512	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.567:35:8,10:7,10:15,0,20,0
chr4	143226768	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:2,4:8,4:0,10,0,8
chr4	143226784	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=194,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:1,5:6,4:0,7,0,9
chr4	143324036	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,4:4,0:5,0,4,0
chr4	143326271	.	T	TGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=65,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=G;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.489:4:1,1:0,0:2,0,2,0
chr4	143326312	.	AAG	A,AAGAGAG,AAGAGAGAG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,29,31,30;MFRL=132,166,137,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,6,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,9,12,13;RU=AG;STR;TLOD=4.85,4.83,14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,2,5:0.135,0.222,0.391:13:0,1,1,2:3,1,1,3:3,1,9,0
chr4	144108895	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:3,1:5,2:8,0,4,0
chr4	144124492	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:7,0,8,0
chr4	144446519	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=213,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr4	144447472	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,2:14,0:18,5,2,0
chr4	144447630	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,1:8,3:2,16,0,4
chr4	144456124	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,8:0,11:0,1,2,18
chr4	144466050	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=188,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr4	144469383	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr4	144471312	.	GTATT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:2,1:0,5,0,3
chr4	144917514	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,8:0,16:0,0,7,17
chr4	144918674	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,144;MMQ=55,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.442:50:15,11:13,11:18,10,16,6
chr4	144918867	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:1,5:5,5:0,7,0,10
chr4	144920480	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=176,142;MMQ=55,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:9,6:11,6:13,7,9,3
chr4	144920638	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=175,159;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.400:38:10,6:13,9:4,19,2,13
chr4	144922492	.	TAA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,120041;MMQ=60,35;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:10,2:17,0:0,28,0,2
chr4	145035788	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,8:0,0,8,3
chr4	145037980	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=105.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,20,8
chr4	145040015	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=172,190;MMQ=44,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr4	145040962	.	CA	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr4	145061822	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=61.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,10:0,11:0,0,12,10
chr4	145579907	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:7,3,3,1
chr4	146031650	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,141;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,3:0.033:89:51,0:32,3:10,76,1,2
chr4	146046123	.	AT	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,10:0.225:45:16,1:18,7:0|1:146046123_AT_A:146046123:29,6,8,2
chr4	146046138	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=154.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,51:0.963:52:0,15:1,23:0|1:146046123_AT_A:146046123:1,0,40,11
chr4	146048554	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,4:4,0:6,0,4,0
chr4	146048583	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,14,1
chr4	146059883	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=114,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:146059883_G_C:146059883:0,2,0,1
chr4	146059886	.	TC	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=114,241;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:146059883_G_C:146059883:0,2,0,1
chr4	146065006	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr4	146067653	.	CAA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=155,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:1,1:1,12,0,2
chr4	146076632	.	TA	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.127:49:27,3:13,2:17,26,4,2
chr4	146077122	.	TCAG	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CAG;STR;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.067:56:16,2:30,1:19,34,2,1
chr4	146080577	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,4:6,6:11,0,9,1
chr4	146080832	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr4	146086269	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,25:0.490:51:17,14:8,11:22,4,19,6
chr4	146475243	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=167,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:0,1:2,1:0,3,0,3
chr4	146478983	.	C	CA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,82;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:21,0:15,2:20,17,0,2
chr4	146572140	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,2:0,4:3,0,6,0
chr4	146601680	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr4	146697205	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=238,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr4	146806762	.	CAGAGAGAGAGAG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=224,151;MMQ=40,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=23,17;RU=AG;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.545:5:1,1:0,2:2,0,3,0
chr4	147213975	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=119,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:4,1,7,0
chr4	147364052	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=192,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:1,9,0,8
chr4	147425114	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:4,3:4,5:0,9,0,8
chr4	147560457	.	T	TGGC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=158,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GGC;STR;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.727:5:1,3:0,0:1,0,3,1
chr4	147560529	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=154,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,1:4,1:8,4,1,1
chr4	147860991	.	T	G	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=138,153;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,3:0.055:70:38,0:24,3:35,32,0,3
chr4	147861029	.	GTGGGGGC	G	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=152,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.056:67:32,1:27,2:0|1:147861029_GTGGGGGC_G:147861029:25,39,1,2
chr4	147861037	.	AG	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,3:0.060:62:31,1:27,2:0|1:147861029_GTGGGGGC_G:147861029:24,35,1,2
chr4	148457005	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.314:19:8,2:3,4:11,2,5,1
chr4	148457019	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,10;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.271:21:7,0:3,0:10,5,6,0
chr4	148457021	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=13,14;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.185:21:4,0:1,0:12,5,4,0
chr4	148457025	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.168:23:10,0:2,0:13,6,4,0
chr4	148463840	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr4	148559704	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=156,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:13,7,0,2
chr4	148564160	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=205,215;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:0,1:5,0:0,5,0,1
chr4	148564173	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=201,215;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr4	148575572	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=199,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:148575572_C_T:148575572:5,7,1,1
chr4	148575577	.	A	AGAATGT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=198,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:148575572_C_T:148575572:5,8,1,1
chr4	148575578	.	C	CAACTTATCAGAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=198,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:0|1:148575572_C_T:148575572:5,8,1,1
chr4	148578917	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:9,1,3,1
chr4	148589677	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	148591769	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr4	148604884	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=16,18;MFRL=101,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,15:0.386:38:4,0:3,0:0|1:148604884_C_G:148604884:11,12,15,0
chr4	148604886	.	G	A,T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=0,14,15;MFRL=0,101,166;MMQ=60,60,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=25.54,18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,17,15:0.638,0.331:32:0,2,1:0,3,1:0,0,26,6
chr4	148604904	.	AC	TG	.	.	DP=78;ECNT=3;MBQ=25,9;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,4:0.053:78:23,0:24,0:0|1:148604884_C_G:148604884:38,36,4,0
chr4	148778685	.	G	GT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=84.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,39:0.811:48:8,17:1,18:7,2,31,8
chr4	148800299	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,15,1
chr4	148827697	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.853:11:0,5:1,3:1,0,10,0
chr4	148827716	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=181,155;MMQ=60,58;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,2:12,0:16,2,2,0
chr4	148827747	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,14:0,0,18,9
chr4	148886159	.	AT	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.115:55:27,2:20,2:38,11,2,4
chr4	148985720	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr4	149035449	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:1,7,0,5
chr4	149073555	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:5,1,4,0
chr4	151000419	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.539:37:9,10:8,10:9,8,12,8
chr4	151161490	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=98.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,10:0,0,23,3
chr4	151161502	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=85.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,10:0,0,25,4
chr4	151168929	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	151177432	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	151231371	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:6,0,6,0
chr4	151231466	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=164,83;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,0:12,2:12,15,0,2
chr4	151408800	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr4	151505624	.	TC	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=82,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.892:25:1,9:1,11:0,2,2,21
chr4	151505646	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:18,0:17,1:9,28,2,0
chr4	151656589	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr4	151683003	.	TA	T	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,8:0.094:83:26,2:39,5:11,64,2,6
chr4	151765243	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=120.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,28,9
chr4	151765383	.	GTA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:0,15,0,2
chr4	151770174	.	TTA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:9,2:13,1:8,14,0,3
chr4	151773136	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.478:40:9,12:11,7:8,13,15,4
chr4	151774041	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=194,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:4,0:18,2:0|1:151774041_C_T:151774041:4,18,1,1
chr4	151774048	.	T	TACTTGTTAATGTCACAAGATTTAGAA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=199,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:4,0:19,2:0|1:151774041_C_T:151774041:4,20,1,1
chr4	151829466	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:8,8:14,4:19,3,11,1
chr4	151829659	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,2,16
chr4	152020736	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=197,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.178:40:5,2:15,0:27,6,7,0
chr4	152025273	.	G	GCTTAT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTAT;STR;TLOD=130.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.972:30:0,11:0,14:0,0,29,1
chr4	152048936	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,5:0,6:1,0,0,11
chr4	152053408	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0,0,13,0
chr4	152069406	.	TACACACACACACACAC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=165,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,9;RU=AC;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:1,1:0,1:0,2,0,3
chr4	152201018	.	G	GCAGGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGGT;STR;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.426:19:6,4:5,4:4,7,6,2
chr4	152201053	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=146,183;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:7,3:7,5:7,7,3,5
chr4	152201204	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	152203664	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=171,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr4	152499284	.	C	CTTTCTGAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:152499284_C_CTTTCTGAAA:152499284:0,1,0,1
chr4	152499287	.	G	GAGGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152499284_C_CTTTCTGAAA:152499284:0,1,0,1
chr4	152510130	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.599:30:10,5:1,13:4,8,2,16
chr4	152550853	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:14,4,2,0
chr4	152583907	.	CT	C,CTT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=19,26,34;MFRL=162,197,181;MMQ=60,60,60;MPOS=24,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=6.32,14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,10:0.242,0.524:18:0,1,5:1,1,5:1,3,7,7
chr4	152592469	.	A	ATTAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTAC;STR;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.384:16:7,1:3,5:1,9,0,6
chr4	152601146	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	152609694	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=164,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:0|1:152609694_A_G:152609694:5,1,3,0
chr4	152609700	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=164,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:0|1:152609694_A_G:152609694:5,1,3,0
chr4	152609920	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.498:14:4,1:3,5:0,7,0,7
chr4	152609998	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=189,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr4	152610011	.	T	TGGTTCAAGCGATCCTCCCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.384:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr4	152626513	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=13,14;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:0,0:0|1:152626513_G_T:152626513:0,3,0,1
chr4	152626529	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:152626513_G_T:152626513:0,2,0,1
chr4	152681952	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.510:47:11,11:12,13:22,1,20,4
chr4	153245269	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:5,1:4,5:9,0,7,0
chr4	153268227	.	CAA	C,CA,AAA,CAAA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=26,22,32,16,18;MFRL=159,165,165,173,108;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=11,25,20,17;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=8.28,5.64,5.37,6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:9,6,5,9,6:0.167,0.161,0.181,0.188:35:2,3,1,1,1:4,0,3,1,1:1,8,4,22
chr4	153549717	.	T	TA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=27,28;RU=A;STR;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.885:4:0,2:0,2:0|1:153549717_T_TA:153549717:0,0,3,1
chr4	153549745	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,44;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0|1:153549717_T_TA:153549717:0,0,3,14
chr4	153549852	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	153565641	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=145.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,19:0,16:0|1:153565641_A_G:153565641:0,0,6,30
chr4	153565645	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,18:0.501:36:11,8:7,10:0|1:153565641_A_G:153565641:4,14,2,16
chr4	153691409	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=203,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:8,4:8,0:0|1:153691409_C_G:153691409:8,9,4,0
chr4	153691413	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=197,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:7,4:9,0:0|1:153691409_C_G:153691409:7,10,4,0
chr4	153692222	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:5,7:10,9:4,11,5,11
chr4	153750918	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr4	153802060	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,14:0,11:0,0,24,1
chr4	153881835	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.455:37:9,8:8,6:4,16,6,11
chr4	153882057	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	153889265	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:2,5,3,5
chr4	154330064	.	GTATA	G,GTA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,36,33;MFRL=166,159,180;MMQ=60,60,60;MPOS=21,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=TA;STR;TLOD=6.66,31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,3,12:0.096,0.326:37:10,3,6:10,0,6:22,0,15,0
chr4	154471113	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr4	154476924	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=15,34;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=157.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.977:46:0,30:0,14:1,0,37,8
chr4	154502741	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,1:1,1:0,6,0,2
chr4	154541936	.	T	C	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,3:0.047:83:52,3:27,0:50,30,3,0
chr4	154542814	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=176,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:7,6:9,3:15,1,9,0
chr4	154556798	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,0,19
chr4	154557383	.	ATG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=68.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,16,0
chr4	154557405	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=49.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,17,2
chr4	154633580	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,1:2,4:10,0,5,0
chr4	154641489	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,3:6,3:0,13,0,6
chr4	154644454	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,7:0,3:0,1,9,1
chr4	154709480	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr4	155156406	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:7,11,1,1
chr4	155158392	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	155161666	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=113.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,18:0,17:0,0,26,9
chr4	155218915	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=190,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:13,0,2,0
chr4	155219516	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:13,0:9,15,2,0
chr4	155225784	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.925:12:0,2:0,8:0,0,10,2
chr4	155226421	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	155241438	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	155242383	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr4	155244401	.	TTTTG	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTG;STR;TLOD=68.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.958:17:0,9:0,8:0,0,14,3
chr4	155244475	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,14:0,0,13,12
chr4	155244486	.	C	CAA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.581:15:0,3:3,3:0,6,5,4
chr4	155264670	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=153,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:3,7,2,0
chr4	155287317	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	155287535	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.280:16:7,1:4,3:5,7,3,1
chr4	155305491	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:6,0,6,1
chr4	155407569	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr4	155410407	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr4	155457781	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.289:18:5,4:8,1:13,0,5,0
chr4	155458728	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,16;MFRL=223,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.559:5:0,0:2,1:0,2,0,3
chr4	155461687	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,2:5,8:9,0,10,0
chr4	155462148	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=165,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr4	155465535	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=199,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,6:5,4:12,0,10,0
chr4	155466935	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:8,10:12,8:18,2,16,2
chr4	155467187	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.673:31:3,12:6,8:7,3,15,6
chr4	155468065	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:20,3:15,1:35,0,4,0
chr4	155469959	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.643:15:4,6:0,2:4,1,8,2
chr4	155487633	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,9:9,3:12,3,9,3
chr4	155488846	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,108;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:17,0:9,4:13,15,0,4
chr4	155506587	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,3:9,0:20,2,3,0
chr4	155508627	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:0,3:0,2:1,0,4,1
chr4	155510224	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,5:0,0,1,17
chr4	155511897	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=150,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:1,1:4,2:0,6,0,3
chr4	155525970	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:8,3:4,4:12,0,6,1
chr4	155719919	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	156268929	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.084:34:19,2:11,0:19,13,2,0
chr4	156269147	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=224,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr4	156274189	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,148;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.127:53:26,5:21,1:2,45,0,6
chr4	156617994	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:9,7:5,6:11,3,10,3
chr4	156638547	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=250,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GA;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	156643176	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=122.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,20:0,17:0,0,23,15
chr4	156725681	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=184,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr4	156757789	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=194,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.873:13:0,6:1,5:1,0,11,1
chr4	156757818	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=103.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,13:0,15:0,0,22,8
chr4	156787214	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	156826166	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,11:0,0,19,4
chr4	156832841	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,0,18
chr4	156839462	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	156847230	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.976:38:0,18:0,20:0|1:156847230_A_G:156847230:0,0,8,30
chr4	156847237	.	AG	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=123.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,18:0,21:0|1:156847230_A_G:156847230:0,0,8,31
chr4	156850598	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	158242540	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,17,0
chr4	158281394	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:158281394_A_T:158281394:0,2,0,1
chr4	158281395	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:158281394_A_T:158281394:0,2,0,1
chr4	159076679	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,2:3,1:4,0,4,0
chr4	159076826	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.500:42:6,13:15,8:9,12,11,10
chr4	159076856	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=155,153;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:22,0:19,3:0|1:159076856_C_A:159076856:16,25,0,3
chr4	159076859	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=155,153;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:23,0:19,3:0|1:159076856_C_A:159076856:16,26,0,3
chr4	159092605	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=211,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:0,5,0,7
chr4	159165604	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,178;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:15,1:11,1:0,27,0,2
chr4	159568154	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:17,0:12,2:0|1:159568154_A_T:159568154:10,20,0,2
chr4	159568156	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:17,0:10,2:0|1:159568154_A_T:159568154:10,20,0,2
chr4	159568383	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	159572945	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:12,4,0,2
chr4	159573282	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	159590922	.	TA	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:11,3:12,3:3,24,1,5
chr4	159780830	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:25,0:16,4:11,31,0,4
chr4	159894199	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	160225430	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,0:4,5:7,0,4,1
chr4	160253030	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:8,1:14,3:20,2,3,1
chr4	160259442	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:5,1,6,0
chr4	160259713	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr4	160260209	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:7,0,4,0
chr4	160264080	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,1:4,0,6,0
chr4	160271268	.	GT	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=65.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,33:0.682:48:4,15:9,17:13,2,29,4
chr4	160274602	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:7,3:4,1:10,1,4,0
chr4	160277029	.	A	AGCC	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCC;STR;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,8:0.240:35:13,1:13,3:0|1:160277029_A_AGCC:160277029:0,27,8,0
chr4	160277036	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.230:37:14,1:14,3:0|1:160277029_A_AGCC:160277029:0,29,8,0
chr4	160277040	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,7:0.205:37:14,3:14,3:0|1:160277029_A_AGCC:160277029:2,28,7,0
chr4	160277045	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,7:0.205:37:15,1:15,2:0|1:160277029_A_AGCC:160277029:3,27,7,0
chr4	160277388	.	T	TTGTTTGTTGGTTTTTTGTTAAATTGAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.308:6:1,1:3,0:0,5,0,1
chr4	162459299	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,15,1
chr4	162463771	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:28,0:32,3:31,29,0,3
chr4	162577430	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	162841814	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr4	162954926	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr4	164058512	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=129,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr4	164087954	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:6,6:10,7:0,16,0,13
chr4	164435370	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	164438523	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=37,28;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:4,0,4,1
chr4	164440461	.	CT	C,CTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=158,143,158;MMQ=60,60,60;MPOS=13,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.38,3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,8,3:0.281,0.127:28:6,3,0:9,5,3:15,2,9,2
chr4	164440743	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,5:4,7:0,9,0,12
chr4	164450255	.	A	AT,ATT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,25,25;MFRL=166,207,168;MMQ=60,60,60;MPOS=21,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=9.37,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,3:0.323,0.198:16:4,3,1:4,2,1:0,8,0,8
chr4	164466970	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr4	164507104	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:10,8:4,2:3,11,2,8
chr4	165118066	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,211;MMQ=59,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:2,5:4,3:6,0,9,0
chr4	165118094	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,133;MMQ=50,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,4:4,3:8,0,6,1
chr4	165118253	.	T	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=90.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,33:0.470:70:21,16:16,16:12,25,13,20
chr4	165961910	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=168,206;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:12,2,0,2
chr4	165981377	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.129:33:14,3:15,0:11,18,0,4
chr4	165981783	.	AAG	TTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	166024199	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:18,3:7,0:12,13,2,1
chr4	166150086	.	A	G	.	.	DP=141;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=144,157;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:105,28:0.214:133:56,15:49,13:28,77,1,27
chr4	166215662	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr4	166243082	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:5,3:3,2:8,0,6,0
chr4	166307302	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:5,3:10,6:16,0,8,1
chr4	166388825	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:2,3:9,0:11,1,3,0
chr4	166403574	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,3:4,5:1,9,0,8
chr4	166929276	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr4	166978539	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr4	166981408	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.446:14:2,0:5,4:0,8,0,6
chr4	166996164	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:5,19,0,2
chr4	167012241	.	GTTT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=T;STR;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:167012241_GTTT_G:167012241:0,0,9,2
chr4	167012250	.	T	TAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=50.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:167012241_GTTT_G:167012241:0,0,9,3
chr4	167012480	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,2,20
chr4	167012506	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr4	167012543	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	167656073	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.550:36:7,12:9,7:16,0,20,0
chr4	167656278	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.417:34:12,5:8,9:1,19,0,14
chr4	167658800	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,320;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:167658800_A_C:167658800:0,0,0,1
chr4	167658802	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,320;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:167658800_A_C:167658800:0,0,0,1
chr4	167833973	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=203,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:0,2,0,2
chr4	169086540	.	CAAA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,14;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,0:0,3,0,2
chr4	169086554	.	AAAAT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr4	169183789	.	A	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=92.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,32:0.446:72:15,15:25,16:33,7,27,5
chr4	169188927	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.531:34:7,7:8,11:9,7,10,8
chr4	169189151	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,9:5,1:0,9,1,9
chr4	169190129	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=19,33,32,19;MFRL=159,146,135,151;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,17,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=7.86,20.25,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,4,11,3:0.149,0.366,0.129:27:1,2,2,0:2,2,6,0:0,9,2,16
chr4	169194984	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	169213139	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	169227913	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=205,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr4	169279517	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=219,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	169282232	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,10:0,0,23,1
chr4	169282355	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=135.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,25:0,12:0,0,12,25
chr4	169292759	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=144.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,21:0,19:0,0,32,9
chr4	169292883	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,3:0.051:76:36,0:37,3:34,39,3,0
chr4	169296472	.	TAACC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:5,7:5,5:11,0,10,2
chr4	169299676	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=101.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,12:0,0,2,26
chr4	169300451	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=208,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:5,5:0,6:5,0,10,1
chr4	169301044	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,5:2,0:0,6,0,5
chr4	169301059	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,0,11
chr4	169315571	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr4	169317081	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,5:3,6:7,0,11,0
chr4	169317279	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.314:31:7,3:10,5:3,18,0,10
chr4	169317284	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.154:28:6,2:13,2:0,24,0,4
chr4	169322163	.	CTA	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,2:0,5,0,5
chr4	169322206	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:169322206_G_T:169322206:0,1,0,1
chr4	169322211	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:169322206_G_T:169322206:0,1,0,1
chr4	169322213	.	AATCAT	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:169322206_G_T:169322206:0,0,0,1
chr4	169325282	.	TA	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:8,1:16,2:4,25,0,3
chr4	169337741	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr4	169340639	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	169348562	.	G	GATTTGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:169348562_G_GATTTGT:169348562:0,1,0,1
chr4	169348565	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169348562_G_GATTTGT:169348562:0,1,0,1
chr4	169348567	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169348562_G_GATTTGT:169348562:0,1,0,1
chr4	169374487	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=167,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:0,8,0,7
chr4	169392803	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	169393179	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=190,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	169393972	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=84,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:2,3:0,4,0,5
chr4	169433444	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,26:0.484:54:16,15:11,11:12,16,14,12
chr4	169589454	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:18,1:13,1:16,15,1,1
chr4	169604080	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=193,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr4	169612461	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=34,33,35,35;MFRL=139,74,164,169;MMQ=60,44,60,60;MPOS=19,25,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.63,7.29,7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:29,2,5,7:0.061,0.126,0.157:43:12,1,0,4:14,1,4,3:5,24,3,11
chr4	169612528	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.329:12:3,2:5,0:1,7,0,4
chr4	169835048	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=88.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,8:0,0,20,5
chr4	169842976	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr4	169846255	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=122.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,18:0,15:0,0,10,23
chr4	169846359	.	GCT	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=143.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.977:37:0,15:0,21:0,0,26,11
chr4	169923363	.	CAAAAA	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=197,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=A;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.376:9:1,0:1,1:2,4,0,3
chr4	169931268	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=227.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,52:0.983:52:0,25:0,25:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,12,40
chr4	169931274	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=218.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,49:0.980:49:0,25:0,21:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,11,38
chr4	169931288	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=168.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,17:0,20:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,6,33
chr4	169931326	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=19,23;MFRL=279,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,1:0,2:0,3,0,6
chr4	170017860	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0,0,6,17
chr4	170028360	.	GA	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.136:34:10,2:16,2:4,26,0,4
chr4	170354675	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,2:12,0:16,9,2,0
chr4	170354836	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr4	170354873	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	170398367	.	A	AAACTTTGTTCTCAATGATTCCTCTCTCAC	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.073:40:22,2:15,0:17,21,0,2
chr4	170428344	.	T	TAGTACGGAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	170483153	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.409:11:3,3:4,1:4,3,3,1
chr4	170506703	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:3,8:4,4:0,7,2,10
chr4	170523576	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:5,4:5,0:11,0,4,0
chr4	170601172	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.657:30:6,9:4,11:8,2,16,4
chr4	170616918	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr4	170628474	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,4:3,0:0,3,1,3
chr4	170650699	.	AAT	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,20:0.438:46:12,12:14,8:18,8,14,6
chr4	170658731	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,5:6,2:8,0,7,0
chr4	170663321	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr4	170669793	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=177,179;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:5,2:15,0:19,1,2,0
chr4	170669805	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=173,179;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,2:17,0:22,3,2,0
chr4	170669824	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,10:0,14:0,0,24,4
chr4	170989830	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=146,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,4:12,0:2,19,0,4
chr4	172735897	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,1,12
chr4	173232679	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr4	173232944	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=90.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,35:0.974:36:0,14:1,21:0,1,8,27
chr4	173873170	.	TG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,17:0,12:0,0,22,7
chr4	173930479	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr4	174294990	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=50.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,11:0,5:0,0,16,0
chr4	174537063	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,8:0,0,17,2
chr4	175184155	.	CT	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,178;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:36,0:25,3:30,31,0,3
chr4	175414202	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	175429808	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:6,0,5,1
chr4	175443424	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr4	175649861	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=146,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.314:13:2,1:4,1:0,9,1,3
chr4	176733450	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,0:0,1:0|1:176733450_G_T:176733450:0,0,0,2
chr4	176733452	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,1:0,1:0|1:176733450_G_T:176733450:0,0,0,2
chr4	177082058	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=165,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:6,0,2,0
chr4	177083166	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=192,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:9,0,10,0
chr4	177083333	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.425:33:10,8:9,5:6,13,2,12
chr4	177093505	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.539:39:7,12:10,9:13,5,15,6
chr4	177095908	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:6,5:13,4:3,16,2,7
chr4	177113764	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr4	177113779	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:4,5:5,7:6,3,8,5
chr4	177116463	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=214,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr4	177116622	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,11:0.214:54:24,5:19,6:14,29,5,6
chr4	177116779	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.550:13:1,4:2,2:0,6,0,7
chr4	177142568	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:14,5,0,2
chr4	177142776	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr4	177143664	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	177243227	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:5,1:3,2:10,0,3,0
chr4	177245488	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:3,6:8,8:0,11,0,14
chr4	177605081	.	CTCA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCA;STR;TLOD=51.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,7:0,0,5,8
chr4	177608775	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	177608875	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	177650614	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	178260841	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr4	178272748	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr4	178274377	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=141,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:11,0,7,0
chr4	178274565	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,3:0,0,3,11
chr4	178274835	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=21,33;MFRL=201,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=195.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,54:0.975:55:1,28:0,26:0,1,25,29
chr4	178274919	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=59,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.455:7:1,0:2,2:2,2,2,1
chr4	178353046	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr4	178355668	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,0,21
chr4	178361634	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:178361634_C_G:178361634:1,3,0,2
chr4	178361636	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:178361634_C_G:178361634:1,3,0,2
chr4	178361638	.	A	ATACTATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=197,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:178361634_C_G:178361634:1,2,0,2
chr4	178363378	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=142.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,24:0,15:0,0,46,4
chr4	178882120	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,0,18
chr4	178897192	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=151,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	183090436	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,9:0,2:0,1,3,8
chr4	183267728	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	183268148	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.780:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr4	183268174	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	183522021	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,7,0
chr4	183600752	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=193,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,3:0,7:1,1,10,1
chr4	183601590	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=192,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:7,3,3,0
chr4	183601594	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,5:2,4:4,1,6,3
chr4	183601601	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=197,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.341:15:6,2:3,2:7,3,4,1
chr4	183650026	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=210,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.794:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr4	183659722	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=123,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:6,6:2,7:3,5,3,12
chr4	183664593	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:10,6:6,11:0,16,2,15
chr4	183673226	.	TA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=20,29,10,10;MFRL=175,144,123,163;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,22,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,14,16,17;RU=A;STR;TLOD=9.77,36.57,8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,8,24,7:0.161,0.522,0.167:46:2,2,4,0:2,5,6,3:1,6,5,34
chr4	183673247	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=197.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,24:0,24:0,0,5,46
chr4	183674577	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr4	183720850	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:3,1,7,2
chr4	183814156	.	TC	GG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:3,0:2,1:3,6,3,0
chr4	183814185	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=136,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:9,0:19,2:14,16,0,2
chr4	184170025	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr4	184180920	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,4,21
chr4	184182001	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,6:0,0,14,2
chr4	184190355	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr4	184190535	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,13,5
chr4	184201909	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,4:6,4:8,0,6,2
chr4	184202148	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr4	184207065	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=193,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr4	184366629	.	T	TGCACA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCACA;STR;TLOD=66.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,6:0,0,15,1
chr4	184367558	.	TCTG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,10:0,8:0,0,11,7
chr4	184426526	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=124.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,19:0,16:0,0,9,28
chr4	184427580	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,6:5,5:0,10,0,11
chr4	184567431	.	TA	T,TAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,26,28;MFRL=140,201,0;MMQ=60,60,45;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=12.99,3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,7,3:0.270,0.128:25:7,3,2:7,4,1:11,4,10,0
chr4	184570715	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,4:1,5:0,3,0,10
chr4	184572036	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr4	184572341	.	GA	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=56.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,21:0.415:51:12,13:14,7:18,12,17,4
chr4	184577177	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr4	184585286	.	T	TTTTTTAATTATAAATTCCAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=193,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:0,1:3,0:0|1:184585286_T_TTTTTTAATTATAAATTCCAAC:184585286:1,2,0,1
chr4	184585292	.	G	GTCAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=193,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:184585286_T_TTTTTTAATTATAAATTCCAAC:184585286:1,2,0,1
chr4	184585300	.	G	GGTGGTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=193,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	184587658	.	G	GTACC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TACC;STR;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,2:8,1:0,10,0,3
chr4	184588121	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.299:38:17,6:10,5:27,0,11,0
chr4	184588305	.	A	T	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=131.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,48:0.512:94:29,27:16,21:12,34,3,45
chr4	184596309	.	CT	C	.	.	DP=121;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=137.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,54:0.478:113:29,26:30,28:39,20,32,22
chr4	184596446	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.527:53:18,15:7,13:0,25,1,27
chr4	184601195	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=212,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr4	184607970	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	184619017	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:3,3:8,5:0|1:184619017_C_G:184619017:0,11,0,8
chr4	184619029	.	TGC	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=155,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GC;STR;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:3,2:6,3:0|1:184619017_C_G:184619017:0,11,0,5
chr4	184619034	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=178,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,2:3,2:0|1:184619017_C_G:184619017:0,6,0,5
chr4	184619070	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	184922669	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:1,7,0,4
chr4	184931555	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.132:21:8,1:9,1:4,15,2,0
chr4	184932609	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,2,14
chr4	185038274	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=189,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr4	185074686	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,4:7,6:8,5,8,2
chr4	185552135	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr4	185552345	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.386:11:0,4:7,0:1,6,2,2
chr4	185553098	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=9115,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=117.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.954:41:0,20:1,13:1,0,13,27
chr4	185553353	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=203,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,4,1
chr4	185556618	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.541:35:9,8:7,11:0,16,0,19
chr4	185559487	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr4	185578229	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr4	185582992	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=133,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:8,4:16,0:13,11,4,0
chr4	185583092	.	C	CTATT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr4	185587165	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr4	185612627	.	CTT	C,CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33,32;MFRL=187,177,166;MMQ=60,60,60;MPOS=13,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=14.44,34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,9,16:0.307,0.593:27:1,6,5:0,2,9:1,1,19,6
chr4	185622046	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,7:0,0,4,12
chr4	185634171	.	CA	C,AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35,26;MFRL=0,144,136;MMQ=60,60,60;MPOS=28,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.21,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.553,0.284:3:0,1,1:0,1,0:0,0,0,3
chr4	185652201	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=125.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,7:0,11:0,0,2,31
chr4	185652223	.	AAC	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.170:25:8,1:13,3:0,21,0,4
chr4	185652224	.	AC	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.746:25:2,7:4,12:0,6,0,19
chr4	185652225	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.967:29:0,11:0,18:0,0,0,29
chr4	185681475	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,13,2
chr4	185686011	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.498:40:9,9:11,10:19,1,15,5
chr4	185694697	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,13,0
chr4	185694877	.	TA	T,TAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,29,28;MFRL=178,163,145;MMQ=60,60,60;MPOS=21,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=7.72,15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,5,8:0.193,0.303:27:4,3,4:7,2,3:6,8,6,7
chr4	185701595	.	G	GTGGCCTGGAGCCTCCTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr4	185701620	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	185940461	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,3:8,3:12,0,6,0
chr4	185940952	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,2:4,3:8,2,4,1
chr4	186065817	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=265,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	186065844	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=215,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr4	186085430	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=215,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr4	186085434	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=215,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr4	186272773	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	186291747	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,3:7,5:8,0,7,1
chr4	186299164	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:3,1:10,0,2,0
chr4	186320079	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.333:34:12,6:11,5:16,7,9,2
chr4	186324841	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=260,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr4	186324862	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=208,147;MMQ=60,45;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr4	186336583	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:1,4,0,5
chr4	186346870	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=194,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.414:37:10,10:10,5:22,0,15,0
chr4	186347092	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=202.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,28:0,33:0,0,0,65
chr4	186361876	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:0,4,0,7
chr4	186366101	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:9,12:5,5:12,2,15,2
chr4	186366181	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.454:44:11,8:13,11:11,13,10,10
chr4	186366315	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,3:8,5:1,12,1,7
chr4	186366382	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr4	186370676	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.259:28:7,2:14,5:19,2,7,0
chr4	186380295	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,3:8,4:5,5,5,2
chr4	186380515	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:8,5:10,3:7,11,3,5
chr4	186423677	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr4	186427735	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:6,5:2,7:3,6,0,12
chr4	186427841	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	186435562	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:1,12,0,2
chr4	186444698	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	186456617	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,0,25
chr4	186510778	.	A	AAACTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=115,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AACTC;STR;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,0:1,1,3,0
chr4	186541367	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:5,8:2,3:1,6,1,10
chr4	186544435	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:0,1:8,3:3,5,1,3
chr4	186544452	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,0:6,2:4,4,0,2
chr4	186545242	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:18,2:11,0:15,15,2,0
chr4	186545719	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	186545728	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	186570521	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=220,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:9,0,7,0
chr4	186570855	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:8,10:10,7:0,18,1,16
chr4	186611663	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,11,1
chr4	186997767	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,2:6,2:9,0,2,2
chr4	187000256	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:3,4:0,6:0,3,0,10
chr4	187000274	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=206,115;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr4	187003378	.	CAAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=27,22;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	187005376	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,4:0,0,2,10
chr4	187073030	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:8,0,4,0
chr4	187078785	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,20:0.481:42:15,11:5,9:0|1:187078785_A_G:187078785:18,4,15,5
chr4	187078787	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:40,2:0.068:42:23,2:15,0:1|0:187078785_A_G:187078785:30,10,2,0
chr4	187078922	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,4:5,2:0,12,0,6
chr4	187078959	.	GAG	TCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=89,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0,2,0,1
chr4	187088345	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:11,4:17,0:14,14,3,1
chr4	187115632	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:5,0,4,0
chr4	187115841	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=189,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr4	187118662	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:7,5:5,6:7,5,10,1
chr4	187122304	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,8:5,3:5,4,9,2
chr4	187122319	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:4,9:7,6:6,5,11,4
chr4	187130198	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,6:5,4:7,4,7,3
chr4	187158034	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:7,6:5,7:8,5,7,6
chr4	187171355	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:3,1,5,0
chr4	187172280	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=300,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr4	187172353	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,4:4,3:7,0,7,0
chr4	187175722	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:9,1,3,1
chr4	187178300	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:5,3:3,9:8,0,13,0
chr4	187178599	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:6,3:0,8:0,6,0,11
chr4	187178613	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.605:13:5,2:0,6:0,5,0,8
chr4	187208745	.	AAT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=191,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	187209562	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,2:12,0:19,4,0,2
chr4	187530313	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr4	187540816	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=176,90;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:6,1:12,2,0,2
chr4	187542993	.	GAGAAA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=196,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:187542993_GAGAAA_G:187542993:0,1,0,1
chr4	187543000	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=196,251;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:187542993_GAGAAA_G:187542993:0,1,0,1
chr4	187543003	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=196,251;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:187542993_GAGAAA_G:187542993:0,1,0,1
chr4	187584771	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	187627659	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr4	187628398	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,3:8,5:7,5,3,5
chr4	188924808	.	A	AGCATCTAGAGGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr4	189013000	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,0:4,5:1,8,0,5
chr4	189020348	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:6,2:11,4:3,14,0,6
chr4	189025972	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,7,5
chr4	189061818	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:3,6:4,4:0|1:189061818_A_G:189061818:1,6,2,8
chr4	189061823	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:2,6:3,3:0|1:189061818_A_G:189061818:1,6,1,8
chr4	189063361	.	CGTGTGT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=164,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=GT;STR;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:0,3:0,1:1,0,4,0
chr4	189063392	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:6,1:2,2:7,1,3,0
chr4	189065055	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,2:5,7:3,6,4,5
chr4	189065104	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,7,5
chr4	189065128	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,6:5,3:4,2,4,5
chr4	189067987	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.605:24:5,7:4,4:7,2,9,6
chr4	190862239	.	G	C	.	.	DP=115;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=170,166;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,10:0.097:111:48,6:50,4:0|1:190862239_G_C:190862239:39,62,9,1
chr4	190862242	.	TG	CC	.	.	DP=109;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=170,166;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,10:0.099:109:46,5:45,3:0|1:190862239_G_C:190862239:38,61,9,1
chr4	190862259	.	C	A	.	.	DP=92;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=170,160;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,9:0.107:92:40,5:36,3:0|1:190862239_G_C:190862239:23,60,8,1
chr4	190862341	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=182,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.262:40:12,8:17,2:0,30,1,9
chr4	190873513	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=186,123;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.128:31:11,1:15,3:3,23,3,2
chr4	190873529	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=175,163;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:10,3:13,1:3,21,2,2
chr4	190873543	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=183,168;MMQ=40,23;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:10,2:13,1:1,22,1,2
chr4	190874147	.	AT	A	.	.	DP=133;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=149,139;MMQ=48,23;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:109,12:0.105:121:45,6:50,6:0|1:190874147_AT_A:190874147:80,29,12,0
chr4	190874157	.	A	G	.	.	DP=151;ECNT=11;MBQ=30,32;MFRL=151,136;MMQ=47,23;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:133,17:0.119:150:56,7:61,6:0|1:190874147_AT_A:190874147:90,43,16,1
chr4	190874160	.	A	T	.	.	DP=158;ECNT=11;MBQ=31,28;MFRL=150,148;MMQ=47,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:148,5:0.038:153:69,4:67,1:103,45,4,1
chr4	190874167	.	G	A	.	.	DP=209;ECNT=11;MBQ=33,27;MFRL=156,135;MMQ=48,35;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=107.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:146,45:0.238:191:74,18:65,24:110,36,21,24
chr4	190874175	.	A	G	.	.	DP=246;ECNT=11;MBQ=28,33;MFRL=160,135;MMQ=43,35;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:196,32:0.144:228:101,18:90,14:0|1:190874147_AT_A:190874147:117,79,30,2
chr4	190874183	.	C	A	.	.	DP=281;ECNT=11;MBQ=33,26;MFRL=158,132;MMQ=43,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:255,21:0.078:276:120,13:128,7:161,94,9,12
chr4	190874190	.	C	CAA	.	.	DP=300;ECNT=11;MBQ=33,35;MFRL=152,162;MMQ=42,45;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:280,9:0.034:289:132,5:140,4:171,109,7,2
chr4	190874199	.	T	A	.	.	DP=339;ECNT=11;MBQ=28,28;MFRL=151,155;MMQ=43,31;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:313,23:0.071:336:150,9:142,14:0|1:190874199_T_A:190874199:184,129,19,4
chr4	190874206	.	T	A	.	.	DP=356;ECNT=11;MBQ=27,31;MFRL=150,155;MMQ=43,31;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:324,23:0.068:347:169,9:148,14:0|1:190874199_T_A:190874199:189,135,19,4
chr4	190874234	.	C	T	.	.	DP=376;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=148,132;MMQ=43,39;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:344,16:0.042:360:165,7:158,8:182,162,9,7
chr4	190874255	.	A	T	.	.	DP=309;ECNT=11;MBQ=27,30;MFRL=141,127;MMQ=49,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:253,41:0.123:294:119,27:126,13:123,130,26,15
chr4	190874281	.	G	T	.	.	DP=302;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=142,166;MMQ=40,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:279,5:0.021:284:140,3:134,2:94,185,0,5
chr4	190874290	.	T	A	.	.	DP=281;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=148,127;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:212,53:0.201:265:103,28:107,24:63,149,12,41
chr4	190874315	.	TA	GA,GT	.	.	DP=215;ECNT=7;MBQ=28,32,32;MFRL=148,127,149;MMQ=40,40,40;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=44.78,95.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:136,25,36:0.132,0.189:197:71,12,21:65,12,15:19,117,6,55
chr4	190874346	.	A	T	.	.	DP=117;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=165,118;MMQ=40,29;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:104,7:0.071:111:45,5:54,2:0|1:190874346_A_T:190874346:5,99,0,7
chr4	190874365	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=7;MBQ=32,21;MFRL=174,123;MMQ=60,35;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,6:0.093:73:33,5:30,1:0|1:190874346_A_T:190874346:2,65,0,6
chr4	190874367	.	CCA	C	.	.	DP=72;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=175,123;MMQ=60,35;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,6:0.095:72:30,2:30,1:0|1:190874346_A_T:190874346:2,64,0,6
chr4	190874372	.	G	T	.	.	DP=58;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=176,127;MMQ=60,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.051:57:24,0:25,1:0|1:190874346_A_T:190874346:2,53,0,2
chr4	190876242	.	G	A	.	.	DP=193;ECNT=15;MBQ=32,30;MFRL=175,138;MMQ=60,33;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=377.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,129:0.684:188:25,63:34,64:38,21,112,17
chr4	190876256	.	C	T	.	.	DP=221;ECNT=15;MBQ=32,25;MFRL=138,149;MMQ=43,30;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:202,19:0.089:221:95,7:98,10:0|1:190876256_C_T:190876256:146,56,13,6
chr4	190876263	.	A	T	.	.	DP=228;ECNT=15;MBQ=29,23;MFRL=137,108;MMQ=42,41;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:218,8:0.036:226:103,7:105,1:148,70,6,2
chr4	190876269	.	T	C	.	.	DP=231;ECNT=15;MBQ=25,32;MFRL=140,129;MMQ=40,35;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:192,25:0.118:217:95,11:93,14:119,73,17,8
chr4	190876277	.	A	T	.	.	DP=195;ECNT=15;MBQ=29,20;MFRL=135,106;MMQ=40,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:185,7:0.039:192:92,5:91,2:103,82,5,2
chr4	190876278	.	G	A	.	.	DP=193;ECNT=15;MBQ=32,29;MFRL=135,134;MMQ=40,28;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:179,14:0.077:193:89,6:84,7:0|1:190876256_C_T:190876256:100,79,8,6
chr4	190876293	.	C	A	.	.	DP=166;ECNT=15;MBQ=33,28;MFRL=129,119;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:152,9:0.061:161:78,2:66,7:0|1:190876256_C_T:190876256:62,90,3,6
chr4	190876301	.	C	A	.	.	DP=156;ECNT=15;MBQ=33,26;MFRL=133,113;MMQ=40,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:133,14:0.100:147:61,9:61,5:0|1:190876301_C_A:190876301:30,103,5,9
chr4	190876305	.	A	T	.	.	DP=151;ECNT=15;MBQ=25,30;MFRL=135,113;MMQ=40,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:136,12:0.086:148:65,6:62,3:0|1:190876301_C_A:190876301:29,107,4,8
chr4	190876319	.	A	T	.	.	DP=123;ECNT=15;MBQ=27,31;MFRL=149,136;MMQ=40,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=174.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,62:0.538:115:25,31:27,29:12,41,2,60
chr4	190876335	.	T	C	.	.	DP=101;ECNT=15;MBQ=30,32;MFRL=149,156;MMQ=40,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,7:0.080:98:41,4:47,3:0|1:190876335_T_C:190876335:4,87,2,5
chr4	190876343	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=157,162;MMQ=30,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,6:0.074:92:43,3:41,3:0|1:190876335_T_C:190876335:2,84,2,4
chr4	190876349	.	C	T	.	.	DP=92;ECNT=15;MBQ=33,28;MFRL=171,154;MMQ=43,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=110.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,43:0.478:90:21,23:25,20:4,43,0,43
chr4	190876359	.	GT	G	.	.	DP=83;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=176,161;MMQ=60,25;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=196.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,51:0.627:81:11,26:19,22:2,28,1,50
chr4	190876406	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=29,26;MFRL=192,177;MMQ=60,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,3:14,0:1,22,0,3
chr4	190878452	.	TG	CA	.	.	DP=99;ECNT=20;MBQ=27,32;MFRL=191,194;MMQ=47,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=53.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,17:0.178:99:50,10:30,4:66,16,14,3
chr4	190878463	.	T	G	.	.	DP=104;ECNT=20;MBQ=28,34;MFRL=183,198;MMQ=49,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=139.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,39:0.377:104:36,28:26,10:0|1:190878463_T_G:190878463:52,13,33,6
chr4	190878485	.	G	A	.	.	DP=101;ECNT=20;MBQ=32,34;MFRL=182,198;MMQ=52,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=116.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,33:0.330:101:31,20:34,9:0|1:190878463_T_G:190878463:56,12,28,5
chr4	190878504	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=20;MBQ=32,29;MFRL=170,211;MMQ=57,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,8:0.108:81:34,6:39,2:0|1:190878504_C_T:190878504:57,16,8,0
chr4	190878506	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=20;MBQ=32,28;MFRL=149,212;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=117.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,34:0.433:79:18,19:25,13:32,13,32,2
chr4	190878512	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=20;MBQ=31,34;MFRL=162,211;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,7:0.119:65:22,3:32,1:0|1:190878504_C_T:190878504:43,15,7,0
chr4	190878567	.	G	C	.	.	DP=149;ECNT=20;MBQ=33,32;MFRL=162,139;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:140,7:0.054:147:72,2:62,5:0|1:190878567_G_C:190878567:88,52,7,0
chr4	190878569	.	T	C	.	.	DP=154;ECNT=20;MBQ=28,32;MFRL=161,139;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:147,7:0.051:154:74,2:60,5:0|1:190878567_G_C:190878567:93,54,7,0
chr4	190878580	.	A	G	.	.	DP=180;ECNT=20;MBQ=28,33;MFRL=159,169;MMQ=40,40;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:158,14:0.086:172:84,8:71,6:104,54,9,5
chr4	190878583	.	T	C	.	.	DP=185;ECNT=20;MBQ=29,32;MFRL=159,132;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:175,10:0.059:185:94,3:70,7:0|1:190878567_G_C:190878567:113,62,9,1
chr4	190878589	.	A	G	.	.	DP=188;ECNT=20;MBQ=28,33;MFRL=156,179;MMQ=40,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:176,7:0.043:183:92,6:80,1:121,55,3,4
chr4	190878597	.	C	T	.	.	DP=201;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=153,166;MMQ=40,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=216.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,80:0.405:198:58,45:56,35:74,44,54,26
chr4	190878599	.	A	G	.	.	DP=203;ECNT=20;MBQ=31,32;MFRL=159,124;MMQ=40,31;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:188,15:0.078:203:102,4:82,10:0|1:190878567_G_C:190878567:120,68,11,4
chr4	190878600	.	TGAAGCAGGGGACATAGAA	T	.	.	DP=267;ECNT=20;MBQ=29,25;MFRL=156,124;MMQ=40,31;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:245,15:0.061:260:103,5:81,9:0|1:190878567_G_C:190878567:144,101,11,4
chr4	190878604	.	G	A	.	.	DP=216;ECNT=20;MBQ=32,28;MFRL=159,151;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:193,9:0.048:202:104,4:81,4:0|1:190878604_G_A:190878604:121,72,6,3
chr4	190878625	.	A	G	.	.	DP=242;ECNT=20;MBQ=29,32;MFRL=148,144;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:227,6:0.030:233:118,2:92,4:0|1:190878604_G_A:190878604:122,105,4,2
chr4	190878654	.	C	G	.	.	DP=278;ECNT=20;MBQ=33,32;MFRL=151,139;MMQ=40,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:236,40:0.147:276:117,23:111,17:77,159,11,29
chr4	190878658	.	G	A	.	.	DP=280;ECNT=20;MBQ=32,29;MFRL=150,133;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:263,14:0.052:277:136,6:120,8:78,185,5,9
chr4	190878661	.	A	T	.	.	DP=278;ECNT=20;MBQ=26,31;MFRL=148,151;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=219.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:176,96:0.352:272:92,52:83,42:53,123,27,69
chr4	190878662	.	T	C	.	.	DP=279;ECNT=20;MBQ=30,28;MFRL=147,152;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=101.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:223,46:0.173:269:116,26:103,20:64,159,15,31
chr4	190878700	.	G	A	.	.	DP=155;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=156,148;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,23:0.160:140:65,9:51,14:19,98,0,23
chr4	190878703	.	G	A	.	.	DP=139;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=154,153;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:126,12:0.086:138:65,6:52,5:17,109,0,12
chr4	190878707	.	CTG	C	.	.	DP=124;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=158,117;MMQ=40,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:118,4:0.041:122:57,1:49,3:0|1:190878707_CTG_C:190878707:12,106,0,4
chr4	190878728	.	AATG	A	.	.	DP=51;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=174,146;MMQ=52,31;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.177:44:19,3:11,4:0,37,0,7
chr4	190878729	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=172,167;MMQ=60,37;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,11:0.279:41:15,5:9,2:0|1:190878707_CTG_C:190878707:1,29,0,11
chr4	190878731	.	GG	CA	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=179,168;MMQ=60,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=40.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,12:0.333:37:14,7:9,4:0|1:190878707_CTG_C:190878707:0,25,0,12
chr4	190881826	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=172,228;MMQ=40,26;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,3:6,1:4,6,3,1
chr4	190881933	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=163,144;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.266:43:14,7:18,4:29,3,11,0
chr4	190881969	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=158,152;MMQ=29,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,14:0.202:72:30,8:27,6:38,20,5,9
chr4	190881992	.	T	C	.	.	DP=92;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=162,138;MMQ=34,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,23:0.264:89:35,14:30,8:0|1:190881992_T_C:190881992:35,31,5,18
chr4	190881997	.	A	G	.	.	DP=97;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=162,138;MMQ=34,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=91.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,29:0.309:95:35,16:27,10:0|1:190881992_T_C:190881992:33,33,6,23
chr4	190882909	.	T	C	.	.	DP=116;ECNT=21;MBQ=25,34;MFRL=165,160;MMQ=40,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:102,11:0.104:113:47,6:52,5:87,15,5,6
chr4	190882911	.	A	T	.	.	DP=117;ECNT=21;MBQ=31,25;MFRL=165,163;MMQ=40,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,11:0.102:116:51,4:50,7:0|1:190882911_A_T:190882911:82,23,11,0
chr4	190882917	.	A	G	.	.	DP=125;ECNT=21;MBQ=31,32;MFRL=164,163;MMQ=40,31;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:113,11:0.095:124:56,4:56,7:0|1:190882911_A_T:190882911:89,24,11,0
chr4	190882928	.	G	A	.	.	DP=143;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=163,158;MMQ=40,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,22:0.165:137:55,13:60,9:82,33,20,2
chr4	190882949	.	T	C	.	.	DP=148;ECNT=21;MBQ=29,32;MFRL=163,164;MMQ=40,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:126,18:0.127:144:62,6:61,11:86,40,18,0
chr4	190882973	.	A	G	.	.	DP=96;ECNT=21;MBQ=28,35;MFRL=168,141;MMQ=55,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,23:0.280:84:29,11:31,12:34,27,9,14
chr4	190882998	.	A	G	.	.	DP=129;ECNT=21;MBQ=29,32;MFRL=156,154;MMQ=52,43;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,7:0.052:125:49,3:67,4:39,79,1,6
chr4	190883001	.	C	G	.	.	DP=134;ECNT=21;MBQ=32,32;MFRL=156,146;MMQ=52,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,10:0.073:130:51,4:65,6:33,87,2,8
chr4	190883026	.	G	T	.	.	DP=172;ECNT=21;MBQ=32,29;MFRL=156,173;MMQ=48,29;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:152,14:0.089:166:66,6:81,8:47,105,1,13
chr4	190883030	.	G	T	.	.	DP=171;ECNT=21;MBQ=32,31;MFRL=159,153;MMQ=44,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:162,8:0.046:170:71,4:87,4:46,116,3,5
chr4	190883039	.	T	C	.	.	DP=172;ECNT=21;MBQ=31,34;MFRL=156,173;MMQ=49,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:166,5:0.034:171:78,2:84,3:49,117,0,5
chr4	190883046	.	G	A	.	.	DP=166;ECNT=21;MBQ=32,24;MFRL=163,161;MMQ=52,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:150,13:0.081:163:64,6:76,7:48,102,1,12
chr4	190883051	.	G	A	.	.	DP=148;ECNT=21;MBQ=30,28;MFRL=153,177;MMQ=60,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=161.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,51:0.367:142:47,18:38,29:38,53,4,47
chr4	190883073	.	G	A	.	.	DP=112;ECNT=21;MBQ=32,27;MFRL=167,201;MMQ=52,32;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,4:0.044:110:49,2:54,2:41,65,0,4
chr4	190883075	.	C	T	.	.	DP=109;ECNT=21;MBQ=29,30;MFRL=167,179;MMQ=52,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,7:0.073:108:47,4:51,2:0|1:190883075_C_T:190883075:40,61,0,7
chr4	190883080	.	CT	AG	.	.	DP=102;ECNT=21;MBQ=32,26;MFRL=166,178;MMQ=52,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,8:0.087:102:41,5:48,3:0|1:190883075_C_T:190883075:38,56,0,8
chr4	190883085	.	C	T	.	.	DP=96;ECNT=21;MBQ=33,25;MFRL=167,173;MMQ=52,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:90,6:0.071:96:36,5:46,0:0|1:190883075_C_T:190883075:33,57,0,6
chr4	190883092	.	CTATT	C	.	.	DP=76;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=165,164;MMQ=52,26;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,4:0.064:76:25,2:37,1:0|1:190883075_C_T:190883075:26,46,0,4
chr4	190883100	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=21;MBQ=30,33;MFRL=166,168;MMQ=52,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.096:60:21,1:30,4:17,38,3,2
chr4	190883110	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=21;MBQ=32,30;MFRL=167,160;MMQ=52,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.098:49:14,2:31,1:15,30,0,4
chr4	190883125	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=21;MBQ=32,25;MFRL=170,161;MMQ=52,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.089:43:12,2:24,1:0|1:190883075_C_T:190883075:12,28,0,3
chr4	190884313	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,203;MMQ=60,25;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:30,1:18,3:15,33,1,3
chr4	190906025	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=168,151;MMQ=60,39;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,25:0.603:41:7,16:9,8:8,8,9,16
chr4	190906052	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=165,147;MMQ=40,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:11,5:12,2:4,19,3,4
chr4	190906057	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=32,25;MFRL=167,161;MMQ=52,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,11:0.386:29:8,6:9,3:0|1:190906057_G_A:190906057:5,13,2,9
chr4	190906060	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=27,28;MFRL=170,168;MMQ=52,38;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.392:26:7,6:8,3:0|1:190906057_G_A:190906057:3,13,2,8
chr4	190906074	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=170,140;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,1:9,1:0|1:190906074_A_T:190906074:0,17,0,2
chr4	190906077	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=168,140;MMQ=51,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,1:7,1:0|1:190906074_A_T:190906074:0,18,0,2
chr4	190906080	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=25,32;MFRL=174,143;MMQ=52,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,4:6,1:0,11,0,5
chr4	190906142	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=158,194;MMQ=25,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.889:8:1,3:0,3:0,1,0,7
chr4	190947451	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,7:0,11:0,0,19,0
chr5	140788	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:1,6,0,5
chr5	140813	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,1:2,1:0,4,0,3
chr5	155137	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:0,3,1,5
chr5	156180	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,1:4,7:4,2,4,4
chr5	169361	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	169763	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	171564	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171564_G_A:171564:0,0,0,1
chr5	171569	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171564_G_A:171564:0,0,0,1
chr5	171643	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	172971	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,15,1
chr5	173200	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,1,15
chr5	173258	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr5	174240	.	GC	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:174240_GC_AA:174240:0,0,1,3
chr5	174251	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:174240_GC_AA:174240:0,0,0,1
chr5	182077	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=157,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:8,1,6,1
chr5	205360	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.656:12:3,5:0,3:3,1,6,2
chr5	224418	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,179;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,6:7,6:10,4,10,2
chr5	224692	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=205,174;MMQ=49,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:9,5:6,6:2,13,1,10
chr5	225768	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=226,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0|1:225768_G_C:225768:0,2,0,5
chr5	225774	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=209,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.331:7:2,2:3,0:1|0:225768_G_C:225768:0,5,0,2
chr5	225941	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:5,0,5,0
chr5	226222	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=202,166;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.650:17:0,5:4,6:0,6,0,11
chr5	228278	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,106;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.417:12:4,1:3,4:6,1,5,0
chr5	228362	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=164,133;MMQ=60,51;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:9,6:8,14:8,9,10,10
chr5	230980	.	A	G	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=276.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,75:0.976:76:1,42:0,33:0,1,57,18
chr5	231111	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,43;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=208.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.985:59:0,28:0,29:0,0,14,45
chr5	231143	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,28:0.570:49:13,12:7,15:2,19,1,27
chr5	233517	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=195,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr5	233572	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,6:2,5:6,2,11,0
chr5	235548	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,5:7,3:0,8,0,8
chr5	236753	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=182,194;MMQ=52,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:2,3:5,3:0|1:236753_C_T:236753:0,8,0,8
chr5	236760	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=182,194;MMQ=52,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:0|1:236753_C_T:236753:0,8,0,8
chr5	240663	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,184;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:1,5,0,3
chr5	251419	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,203;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:7,5:8,3:14,1,5,3
chr5	254442	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,11:0,3:0,0,14,0
chr5	254706	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,165;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,1:11,1:1,22,1,1
chr5	256374	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=182,145;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,2:8,1:0|1:256374_T_A:256374:17,0,3,0
chr5	256379	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=180,145;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,2:9,1:0|1:256374_T_A:256374:18,0,3,0
chr5	256434	.	ACT	A	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=160,145;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.117:49:22,4:17,0:35,9,5,0
chr5	256472	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=149,159;MMQ=60,57;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,41:0.561:73:13,22:18,18:21,11,23,18
chr5	256509	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,24:0.373:65:15,15:26,9:15,26,6,18
chr5	256514	.	G	C	.	.	DP=65;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=156,147;MMQ=60,36;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,5:0.093:62:25,2:29,3:18,39,1,4
chr5	256548	.	TG	CA	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=157,159;MMQ=60,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:18,2:20,1:7,31,0,3
chr5	256573	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=162,159;MMQ=47,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,2:12,1:0,24,0,3
chr5	311562	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:1,11,2,7
chr5	314518	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:2,3,5,1
chr5	343986	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,5:0,1:3,0,6,0
chr5	376854	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:1,7,0,2
chr5	413428	.	AT	A,ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31,28;MFRL=170,185,198;MMQ=60,60,60;MPOS=19,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=18.56,3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,8,2:0.503,0.164:15:1,5,1:4,3,1:5,0,10,0
chr5	413591	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.514:33:6,7:10,8:0|1:413591_G_A:413591:0,16,1,16
chr5	413594	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,17:0.529:32:6,9:9,7:0|1:413591_G_A:413591:0,15,1,16
chr5	413639	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=207,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr5	423906	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr5	428166	.	GC	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=46.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:5,12:6,4:3,8,2,15
chr5	433952	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:4,6:5,4:6,3,6,4
chr5	434981	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	435001	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	435021	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=186,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr5	456915	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:1,4:6,3:7,0,8,0
chr5	457955	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:3,1:2,2:6,0,3,1
chr5	462465	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,4:6,4:2,9,2,6
chr5	466811	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,3:0,0,12,1
chr5	475621	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=217,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:475621_T_TG:475621:3,0,4,0
chr5	475626	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=217,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0|1:475621_T_TG:475621:3,0,5,0
chr5	476530	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr5	476848	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	477634	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=16,26;MFRL=145,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.672:9:0,5:1,1:0,3,0,6
chr5	477639	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=223,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr5	479879	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	479905	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	481610	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr5	482653	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,11:0,0,14,8
chr5	483493	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=164,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:13,0:1,3:0|1:483493_G_C:483493:6,8,0,3
chr5	483495	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=164,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:12,0:1,2:0|1:483493_G_C:483493:6,8,0,3
chr5	491826	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	619022	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	619333	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr5	635732	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=165,124;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,3:11,0:2,20,0,3
chr5	640728	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=229,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr5	640746	.	T	TCTCCCAGGCTGGAGTACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr5	644552	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:8,11:5,6:3,10,6,11
chr5	665148	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=274,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	666270	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr5	666323	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr5	801172	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=116,183;MMQ=45,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.257:37:10,4:17,5:18,10,5,4
chr5	801362	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=207,155;MMQ=52,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:0,7,1,2
chr5	825209	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,2:3,5:10,0,7,0
chr5	825280	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.280:30:11,3:10,5:15,7,5,3
chr5	825443	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,214;MMQ=52,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.253:24:6,2:11,4:0,18,0,6
chr5	834012	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=161,60;MMQ=27,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:7,0:12,2:0|1:834012_G_T:834012:0,19,1,1
chr5	834015	.	T	TTTTTCACAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=161,60;MMQ=27,55;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:0|1:834012_G_T:834012:0,17,1,1
chr5	837447	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=153,159;MMQ=35,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.222:36:15,4:12,2:19,9,4,4
chr5	837507	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=160,164;MMQ=51,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:25,0:18,3:26,19,1,2
chr5	843702	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=155,150;MMQ=27,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:20,2:12,2:27,5,4,0
chr5	843723	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=145,145;MMQ=27,27;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,9:0.185:50:24,4:17,4:26,15,6,3
chr5	843879	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=171,184;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr5	848731	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,133;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:14,0:22,3:36,0,3,0
chr5	870740	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=218,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,3:2,4:0,2,2,5
chr5	893079	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,2:3,0:2,1,2,1
chr5	904374	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=94,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.472:28:5,5:7,7:4,11,3,10
chr5	1034246	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	1035482	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=148.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,17:0,22:0,0,32,8
chr5	1036521	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:10,4:0,5:3,8,2,7
chr5	1053396	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=189,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,2:3,1,5,1
chr5	1057782	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	1060366	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	1060379	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr5	1060400	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr5	1060634	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	1060654	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	1065683	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr5	1065689	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr5	1073689	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	1076245	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=138,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:4,4:3,1:6,1,2,4
chr5	1078898	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,7,10
chr5	1081668	.	GG	AA,AG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29,32;MFRL=156,113,224;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.03,19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,7:0.124,0.368:19:5,2,5:5,0,2:9,1,8,1
chr5	1081702	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=110,183;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.517:35:5,13:10,5:11,6,10,8
chr5	1085312	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=146,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,0:3,0:0|1:1085312_A_C:1085312:3,3,2,0
chr5	1085314	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,19;MFRL=146,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:1,1:3,0:0|1:1085312_A_C:1085312:3,3,2,0
chr5	1085318	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=150,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:1,0:5,0:0|1:1085312_A_C:1085312:4,3,2,0
chr5	1085604	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=117,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,2:1,3:1,1,0,5
chr5	1093609	.	G	GGGGCGGGGACT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCGGGGACT;STR;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr5	1093860	.	CC	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr5	1094389	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:2,10,1,4
chr5	1209063	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	1214264	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr5	1216900	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:10,2,2,0
chr5	1216931	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:7,1:13,4,1,1
chr5	1221199	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	1225564	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	1232491	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,2:2,6:1,4,3,5
chr5	1235790	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.566:23:1,8:8,5:5,5,2,11
chr5	1240792	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:1,8,3,6
chr5	1240848	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr5	1243009	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr5	1244954	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,0:0,4:0,5,0,4
chr5	1279009	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=269,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	1279439	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.339:24:5,5:11,2:8,8,2,6
chr5	1320722	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:7,8:8,5:14,1,10,3
chr5	1321873	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=112.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,44:0.528:83:18,18:21,25:13,26,23,21
chr5	1325767	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr5	1325803	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,13,5
chr5	1335385	.	CTG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.643:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr5	1344458	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=122.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,16:0,21:0,0,26,12
chr5	1409127	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr5	1416142	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr5	1420588	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=192,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	1432825	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:1,5:7,3:3,5,1,7
chr5	1432876	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0|1:1432876_G_A:1432876:0,5,0,3
chr5	1432881	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0|1:1432876_G_A:1432876:0,5,0,3
chr5	1442974	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr5	1464028	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr5	1466813	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr5	1471109	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=180,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,1:2,5:0,4,0,6
chr5	1473977	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=212,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr5	1479678	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,1:3,6:3,3,6,1
chr5	1501790	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:3,1:3,3:0,7,0,4
chr5	1801432	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	1801689	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	1814395	.	TTGTA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTA;STR;TLOD=90.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,20,1
chr5	1881916	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.525:40:8,8:9,11:12,7,16,5
chr5	1882665	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=169,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.226:15:5,1:2,0:10,2,3,0
chr5	2755031	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr5	3599320	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=235,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:2,2:0,5:2,0,7,1
chr5	5146200	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr5	5146223	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr5	5186396	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.288:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr5	5186414	.	GGTGT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,13;MFRL=129,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=GT;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr5	5200234	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=82,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr5	5223073	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=213,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr5	5235096	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:10,2,8,0
chr5	5242147	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=174,83;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.090:42:21,3:16,0:0|1:5242147_C_T:5242147:29,10,3,0
chr5	5242149	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=174,83;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:20,3:17,0:0|1:5242147_C_T:5242147:29,10,3,0
chr5	5262766	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:6,3,7,2
chr5	5303349	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.582:17:4,3:2,6:4,3,7,3
chr5	5443179	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	6337241	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=123,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,5:5,3:6,5,4,4
chr5	6372585	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,22:0.644:34:7,13:4,9:8,4,15,7
chr5	6378614	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,11:0,0,9,13
chr5	6600409	.	T	TCTATAATGTTAGAAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=175,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr5	6602668	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:9,0:5,6:3,12,0,6
chr5	6605532	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:4,3:5,4:1,9,2,5
chr5	6607125	.	GAAC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.785:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr5	6617011	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,2:3,6:2,7,2,6
chr5	6618186	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr5	6620459	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:0,7,0,7
chr5	6623405	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,3:5,2:1,6,0,5
chr5	6623421	.	G	GTGCTCA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:1,2:5,0:1,9,0,2
chr5	6623431	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=21,24;MFRL=177,78;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,0:1,1:0|1:6623431_G_GT:6623431:0,4,0,2
chr5	6623432	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=177,78;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,0:2,2:0|1:6623431_G_GT:6623431:0,4,0,2
chr5	6623444	.	A	ATCAGGCCTTT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,1:4,0:0,5,0,1
chr5	6632909	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr5	6632942	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr5	6632981	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=199,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr5	6633741	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,308;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	6656161	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,10:6,4:9,5,9,5
chr5	6656262	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,132;MMQ=52,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:9,2:17,0:7,19,1,1
chr5	6737571	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,1:0,5:0|1:6737571_A_G:6737571:0,0,8,0
chr5	6737576	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0|1:6737571_A_G:6737571:0,0,9,0
chr5	6739791	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,15,5
chr5	6748518	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr5	6754762	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr5	7396650	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=162,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7396650_C_T:7396650:0,1,0,1
chr5	7396651	.	GCCTTCCCC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=162,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:7396650_C_T:7396650:0,1,0,1
chr5	7521083	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=204,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr5	7690707	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	7690754	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=192,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:5,0,4,1
chr5	7695845	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:10,2:4,7:10,4,8,1
chr5	7696028	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=223,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:0,1:0,3,0,4
chr5	7717396	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,0:11,2:1,24,0,2
chr5	7782231	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,8,2
chr5	7835685	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	7859523	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=78.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,21,3
chr5	7861619	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr5	7861638	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr5	7862926	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,19,2
chr5	7866106	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,12:0,0,7,17
chr5	7875307	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=189,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:6,8:5,4:12,0,12,0
chr5	7885794	.	T	TC,TTC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27,29;MFRL=0,162,163;MMQ=60,60,60;MPOS=16,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.84,18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,10:0.447,0.514:19:0,4,8:0,3,2:0,0,18,1
chr5	7893121	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr5	7896957	.	CT	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,9:0.153:63:28,4:21,5:42,12,8,1
chr5	7900254	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=196,276;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr5	9043142	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr5	9044570	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.248:27:9,0:7,0:15,5,0,7
chr5	9050410	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	9066464	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr5	9066802	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,0,10
chr5	9197423	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:1,7,0,3
chr5	9197434	.	A	AGAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=205,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0,4,1,5
chr5	9201973	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr5	9202419	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=187,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:0,6,0,5
chr5	9227108	.	AAT	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.161:22:12,2:7,1:0,19,0,3
chr5	10227548	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr5	10250430	.	G	A	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=257.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,79:0.988:79:0,36:0,41:0,0,52,27
chr5	10250443	.	T	C	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=327.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,90:0.990:90:0,42:0,46:0,0,56,34
chr5	10255021	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr5	10256365	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	10258125	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,14,2
chr5	10262740	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr5	10263453	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,13
chr5	10263457	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=259,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.859:12:1,4:0,7:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,1,0,11
chr5	10263461	.	GGGA	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=259,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.869:13:1,4:0,8:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,1,0,12
chr5	10264962	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=40.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr5	10280650	.	T	TGACCTTAGTGAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=180,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:3,6,1,1
chr5	10282267	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,122;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:6,2:16,0:18,4,2,0
chr5	10282478	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:2,1:1,0:0|1:10282478_C_CT:10282478:0,3,0,1
chr5	10282479	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=187,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,3:0.678:4:1,2:0,1:1|0:10282478_C_CT:10282478:0,1,0,3
chr5	10282480	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0|1:10282478_C_CT:10282478:0,3,0,1
chr5	10282488	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:10282478_C_CT:10282478:0,3,0,1
chr5	10394911	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=14,28;MFRL=167,160;MMQ=50,54;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.692:7:0,1:0,4:0,2,1,4
chr5	10395011	.	A	AAG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=198,188;MMQ=60,44;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:5,3:3,0:0|1:10395011_A_AAG:10395011:0,9,0,3
chr5	10395013	.	GCC	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=198,188;MMQ=60,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:5,1:4,0:0|1:10395011_A_AAG:10395011:0,9,0,3
chr5	10397473	.	CT	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.252:42:13,2:14,7:4,28,0,10
chr5	10417589	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	10417597	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=163,229;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0,4,0,1
chr5	10442496	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	10748231	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,19:0,10:0,0,28,2
chr5	10748462	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr5	10761009	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,8:4,4:8,0,12,0
chr5	10988172	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=155,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:8,0,4,0
chr5	11018239	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=160,47;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:0,18,0,2
chr5	11082762	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr5	11412302	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	11564995	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,14:0,0,27,1
chr5	13701617	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=211,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:1,2:0,3,1,2
chr5	13729714	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr5	13735147	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	13735892	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr5	13737670	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	13737700	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	13754394	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=117,166;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.425:33:11,6:8,7:6,13,6,8
chr5	13769257	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=140,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,3:1,5:1,2,4,4
chr5	13770757	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	13810149	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=132,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:3,6:10,8:7,6,12,2
chr5	13810441	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr5	13810451	.	CAT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr5	13814976	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=131,70;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr5	13817881	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=166,248;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	13829608	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,7:4,7:7,0,13,1
chr5	13830827	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=146,115;MMQ=60,32;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:11,13,2,0
chr5	13839695	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr5	13842037	.	A	ATGCCCAGGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr5	13842087	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=197,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:13842087_T_G:13842087:0,3,0,1
chr5	13842089	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=197,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:13842087_T_G:13842087:0,3,0,1
chr5	13845107	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=163,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,2:6,4:1,6,0,6
chr5	13845151	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=163,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr5	13850739	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,5:5,7:7,3,8,4
chr5	13850750	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,5:7,7:8,4,8,4
chr5	13859743	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,7:1,1:0,4,1,7
chr5	13859807	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	13862600	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	13862616	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=190,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:2,0,5,1
chr5	13865717	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:6,1:6,2:12,1,2,1
chr5	13866450	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=190,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,2:4,6:0,4,0,8
chr5	13867819	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=212,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr5	13868103	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.505:16:4,3:4,5:6,2,1,7
chr5	13871925	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:1,7,0,3
chr5	13882958	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=139,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.477:25:6,5:7,6:7,6,7,5
chr5	13883262	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=250,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	13885023	.	GCA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.591:8:0,1:3,4:3,0,5,0
chr5	13886244	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=71,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:0,0:0,2,1,1
chr5	13911405	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr5	13914120	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr5	13914556	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	13914775	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=112,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:4,3:1,4:2,3,0,7
chr5	13914796	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,6:1,3:1,4,0,9
chr5	13914819	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,0,5
chr5	13919255	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,3:2,4:8,1,7,0
chr5	13931205	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,21,2
chr5	14290808	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,242;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr5	14330859	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:13,0,3,0
chr5	14363830	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=187,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,6:1,3:5,0,5,4
chr5	14369690	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr5	14378068	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	14381174	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr5	14387489	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr5	14390989	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.265:32:15,3:8,5:20,4,7,1
chr5	14394283	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr5	14398902	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.921:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	14405895	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,9:0,0,19,0
chr5	14462816	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=143.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,21:0,25:0,0,39,8
chr5	14472626	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,15,1
chr5	14476915	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAAG;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:0,1:2,1:0|1:14476915_AAAAAAG_A:14476915:5,2,2,0
chr5	14476940	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,1:0|1:14476915_AAAAAAG_A:14476915:7,5,2,0
chr5	14476942	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:6,0:0|1:14476915_AAAAAAG_A:14476915:7,5,2,0
chr5	14476968	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,8:4,4:4,2,8,4
chr5	14479323	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,4:5,5:4,4,8,1
chr5	14479938	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:4,0,9,0
chr5	14485161	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.344:18:5,5:3,0:10,2,3,3
chr5	14485386	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=199,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:2,5:5,5:1,7,0,10
chr5	14493004	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:0,14,0,2
chr5	14610184	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:3,0,6,0
chr5	14678762	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=33,32,32,32;MFRL=158,189,136,160;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,27,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.39,6.60,4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:44,3,7,5:0.059,0.117,0.091:59:23,0,2,2:19,3,4,3:38,6,14,1
chr5	14711275	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,3:1,4:4,2,5,2
chr5	14751399	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:3,3:1,4:0,4,0,8
chr5	15928351	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,1:0|1:15928351_G_A:15928351:2,6,0,2
chr5	15928355	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:0|1:15928351_G_A:15928351:2,6,0,2
chr5	16067735	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:15,0:18,4:20,15,2,2
chr5	16091242	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,17;MFRL=168,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:0,1:0,0:0,1,0,5
chr5	16177807	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=95,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,6:1,10:1,0,13,3
chr5	16477751	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.383:42:16,7:10,8:21,5,14,2
chr5	16478120	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.541:35:8,4:8,15:8,8,14,5
chr5	16479151	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:4,3:9,5:0,14,0,8
chr5	16566031	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	16617077	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16617077_C_T:16617077:0,0,1,0
chr5	16617099	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16617077_C_T:16617077:0,0,1,0
chr5	16667003	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	16670618	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:7,2:8,1:10,5,4,0
chr5	16679966	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr5	16681551	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:19,0:13,3:11,22,2,1
chr5	16681563	.	T	TTCATTCCTTCCTCCTGAAGCACCTCTTATCCCCA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.104:38:18,0:15,2:11,24,2,1
chr5	16684143	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:0,3,0,4
chr5	16711365	.	CA	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=59.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.950:25:0,7:1,16:0,1,5,19
chr5	16711451	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	16762646	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:1,10:0,9:1,0,12,7
chr5	16763908	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:6,6:3,7:1,9,0,13
chr5	16764334	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:7,5:4,2:6,5,5,3
chr5	16766093	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	16795027	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	16818363	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=188,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	16877701	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:2,3:3,2,5,2
chr5	17276053	.	CCT	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=203,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=CT;STR;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.834:13:0,5:2,5:0,2,4,7
chr5	17276224	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:1,0,0,1
chr5	17276848	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.853:18:1,7:1,9:2,0,13,3
chr5	17276986	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr5	19520932	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr5	21755648	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=149,149;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,5:5,0:6,1,5,0
chr5	23510203	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.910:8:0,6:0,0:0,0,0,8
chr5	23523348	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,6:0,0,9,0
chr5	23527919	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,0,19
chr5	24509947	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,2,14
chr5	24511368	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr5	26889902	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,18,0
chr5	31302215	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:6,9:10,2:11,5,7,4
chr5	31313337	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	31322851	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	31401447	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=64.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,21,0
chr5	31405944	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr5	31431749	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=141,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:8,7,2,0
chr5	31435975	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,1:3,1:0,8,0,3
chr5	31472087	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,18,0
chr5	31472117	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=103.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,27,1
chr5	31483596	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=162.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,22:0,24:0,0,41,7
chr5	31483753	.	GA	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,18;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.810:17:2,4:0,0:2,2,4,9
chr5	31486540	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,14,0
chr5	31508933	.	G	GTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr5	31508945	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.882:6:0,2:0,2:0,0,0,6
chr5	31515373	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,2,6
chr5	31521294	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:17,0:13,3:13,18,2,1
chr5	31529299	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,2
chr5	31529306	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,2
chr5	31532429	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=126.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,22:0,19:0,0,37,5
chr5	31541142	.	G	T	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=213,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=216.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,69:0.973:70:1,27:0,38:0,1,27,42
chr5	31541212	.	AGTGT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=201,180;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=GT;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.513:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	32000450	.	CCA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=169,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CA;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,1:9,2:0,14,0,3
chr5	32057651	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:6,0,5,0
chr5	32057910	.	GTT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.144:25:7,3:11,0:11,11,1,2
chr5	32058205	.	C	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.088:54:26,0:24,4:22,28,0,4
chr5	32087228	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=103,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:6,9:6,6:6,6,13,2
chr5	32087253	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.635:31:7,13:4,6:4,7,12,8
chr5	32101168	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=159,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.306:24:5,3:12,4:15,2,6,1
chr5	32135599	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,0:3,3:5,0,4,0
chr5	32243776	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=180,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32243776_C_A:32243776:0,1,0,1
chr5	32243780	.	T	TTATCATGGGCTCTTGTGATCTAACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=180,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32243776_C_A:32243776:0,1,0,1
chr5	32248077	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=143,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:3,1,3,0
chr5	32379210	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=262.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,83:0.989:83:0,43:0,38:0,0,49,34
chr5	32387558	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,5:5,5:9,0,9,1
chr5	32388485	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:4,4:4,5:8,0,10,0
chr5	32395502	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	32404160	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:15,1:19,1:14,20,1,1
chr5	32415360	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=50.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr5	32417694	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	32444286	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=212,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,3:3,8:4,0,11,0
chr5	32444349	.	AGCC	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=171,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCC;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:12,2:3,0:17,4,2,0
chr5	32775047	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	33441124	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.511:35:7,7:10,10:14,3,17,1
chr5	33457535	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:4,5:4,4:1,8,4,5
chr5	33458636	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,4:2,6:6,0,10,0
chr5	33458833	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:1,3:0,5,0,5
chr5	33462034	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.369:36:13,8:9,5:10,13,7,6
chr5	33535060	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:1,4,3,0
chr5	33546113	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.418:11:2,3:4,1:5,1,5,0
chr5	33595996	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=107,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,2:6,3:1,6,4,1
chr5	33596193	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:3,4:0,7:0,3,2,9
chr5	33596224	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=190,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,2:0,4,0,3
chr5	33615904	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:4,1,5,1
chr5	33630839	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,3:8,3:9,2,6,0
chr5	33637594	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0|1:33637594_G_A:33637594:5,0,3,0
chr5	33637596	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,5:0.601:8:1,2:2,3:1|0:33637594_G_A:33637594:3,0,5,0
chr5	33637891	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=146,238;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:0|1:33637891_C_A:33637891:0,4,0,5
chr5	33637899	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=157,252;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0|1:33637891_C_A:33637891:0,6,0,4
chr5	33643395	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=224,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr5	33643617	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,5:1,5:0,5,2,8
chr5	33648842	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=149,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:2,0,2,0
chr5	33648906	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:3,3:4,6:7,0,6,4
chr5	33649637	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,6:4,3:8,2,9,0
chr5	33649807	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,1:1,2:0,4,1,3
chr5	33751454	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,21,3
chr5	33963731	.	AAAC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAC;STR;TLOD=67.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.953:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr5	33964210	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	34687911	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.380:27:8,5:8,5:1,16,1,9
chr5	34688210	.	CGACAAA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.446:25:8,5:4,6:14,0,10,1
chr5	34757505	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=218,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	34812341	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,155;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,0:12,3:13,16,0,3
chr5	34818976	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=15,32,33,29;MFRL=145,132,161,135;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,24,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.81,52.64,19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,3,22,13:0.077,0.475,0.298:44:2,2,9,3:0,1,12,5:0,6,7,31
chr5	34821825	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,7:0,0,18,2
chr5	34830716	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34830716_C_T:34830716:0,0,1,0
chr5	34830720	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34830716_C_T:34830716:0,0,1,0
chr5	34863220	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:0,8,0,8
chr5	34918393	.	GT	TA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=192,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,2:13,0:22,0,2,0
chr5	34918415	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:7,9:7,7:13,1,16,0
chr5	34923435	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=199,175;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.704:15:3,9:1,1:0,4,0,11
chr5	34929916	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.230:22:3,0:7,2:17,0,5,0
chr5	34945797	.	CT	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.167:40:13,2:14,4:21,13,3,3
chr5	34945812	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,22:0.439:49:12,4:14,15:14,13,14,8
chr5	34945944	.	A	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,42:0.518:81:17,28:22,14:14,25,20,22
chr5	34949839	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:8,3:7,0:0,15,0,3
chr5	34954588	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,7:0,13:0,0,21,0
chr5	34998778	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	35025770	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=206,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:4,0,3,0
chr5	35026683	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=231,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.831:10:1,3:0,4:0,1,0,9
chr5	35026699	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=16,25;MFRL=194,239;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,1:1,0:0,3,0,2
chr5	35032769	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,3:7,3:7,3,4,2
chr5	35033706	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,6:3,2:2,6,1,7
chr5	35036997	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:4,1,2,0
chr5	35037006	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,5:0,0:4,0,4,1
chr5	35037230	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr5	35068499	.	G	GAGCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=210,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	35068814	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=127,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:4,0:0,1:5,0,2,0
chr5	35646875	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,135;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:21,0:28,3:9,41,0,3
chr5	35700940	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	35704584	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	35704769	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,1:14,2:6,21,0,3
chr5	35705844	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.490:29:8,6:5,8:7,8,2,12
chr5	35713007	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr5	35728002	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=253,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35728002_A_G:35728002:0,1,0,1
chr5	35728006	.	CCTG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=253,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35728002_A_G:35728002:0,1,0,1
chr5	35728010	.	A	ACAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=253,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35728002_A_G:35728002:0,1,0,1
chr5	35728013	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=253,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35728002_A_G:35728002:0,1,0,1
chr5	35728017	.	T	TTCTCCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=253,176;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0|1:35728002_A_G:35728002:0,1,0,1
chr5	35739960	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr5	35753715	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,18,6
chr5	35753924	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr5	35759787	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,6:5,6:5,6,3,9
chr5	35763877	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr5	35763895	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	35792356	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	35795738	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	35800158	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:16,3:15,0:13,19,3,0
chr5	35807070	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=98.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,12:0,0,7,20
chr5	35807455	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	35857177	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,12:0,0,4,14
chr5	35857235	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,6:0,0,0,8
chr5	35857262	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr5	35875593	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,19,5
chr5	35904614	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,9:0,0,18,1
chr5	35921069	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr5	35921266	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr5	35954228	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr5	35957202	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0,0,4,0
chr5	35957614	.	TCC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:35957614_TCC_T:35957614:0,1,0,1
chr5	35957617	.	C	CAGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35957614_TCC_T:35957614:0,1,0,1
chr5	35966115	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,569;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	36039816	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr5	36111167	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=192,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:4,0,5,0
chr5	36123065	.	TA	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=18,15;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.309:36:4,3:7,3:7,17,1,11
chr5	36136349	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,4:8,4:14,2,6,2
chr5	36137620	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	36141297	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.067:58:20,0:34,3:18,37,0,3
chr5	36166827	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,36;MFRL=203,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:0,2:0,2,0,2
chr5	36168582	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.417:17:3,4:6,2:3,7,1,6
chr5	36195448	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:5,5:7,8:0,12,0,13
chr5	36201336	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,1:0,6:0,0,1,8
chr5	36207424	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr5	36217764	.	G	GTTAATCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=50.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr5	36217997	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.515:29:9,10:5,5:4,10,3,12
chr5	36253937	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,1,16
chr5	36260976	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=127.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,15:0,25:0,0,12,28
chr5	36268218	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=99,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.827:15:2,4:0,9:2,0,12,1
chr5	36271491	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr5	36301362	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,4:2,2:0|1:36301362_T_A:36301362:4,0,6,1
chr5	36301369	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:0|1:36301362_T_A:36301362:4,0,6,1
chr5	36301420	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=163,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,8:2,6:4,0,6,8
chr5	36629529	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.506:11:4,2:0,3:4,2,5,0
chr5	36683903	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,16,5
chr5	36986453	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36986453_T_TGC:36986453:0,0,0,1
chr5	36986454	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36986453_T_TGC:36986453:0,0,0,1
chr5	36986456	.	A	AATATGCAAAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36986453_T_TGC:36986453:0,0,0,1
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chr5	37026515	.	T	TAATCTGCAAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=181,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,1:7,0:0|1:37026511_A_ATCGCCCAAGGG:37026511:1,20,0,2
chr5	37027576	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,32,32;MFRL=139,115,81;MMQ=60,60,60;MPOS=25,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=T;STR;TLOD=7.47,6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,7:0.144,0.256:24:2,1,2:8,1,4:0,14,1,9
chr5	37036449	.	GTA	G,GTATA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=148,145,167;MMQ=60,60,60;MPOS=13,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=TA;STR;TLOD=20.84,13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,9,6:0.223,0.168:39:12,3,1:8,5,5:21,3,14,1
chr5	37051861	.	AT	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.173:46:20,5:16,3:32,6,8,0
chr5	37107817	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,13:0.177:75:30,6:30,6:34,28,5,8
chr5	37107938	.	A	AC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:8,0:8,2:0,16,0,2
chr5	37115000	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:4,2:3,1:6,2,2,1
chr5	37158386	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:27,3:14,0:0|1:37158386_A_G:37158386:16,27,3,0
chr5	37158391	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:20,3:13,0:0|1:37158386_A_G:37158386:9,26,3,0
chr5	37180351	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.214:16:8,1:3,0:0,13,0,3
chr5	37199052	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=199,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:37199052_A_AG:37199052:0,4,0,1
chr5	37199057	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=210,208;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:37199052_A_AG:37199052:0,2,0,1
chr5	37224915	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=232,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.451:7:2,0:2,3:0,4,1,2
chr5	37238940	.	C	G	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,132;MMQ=60,31;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,6:0.101:67:28,6:33,0:33,28,6,0
chr5	37247700	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,6:0,18:0,0,20,4
chr5	37247900	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,17;MFRL=195,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr5	37302969	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:10,0:7,12,0,2
chr5	37342846	.	CT	C,CTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=181,187,179;MMQ=60,60,60;MPOS=15,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.17,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.197,0.196:12:5,1,1:3,1,1:0,8,0,4
chr5	37349360	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:8,2:1,1:2,13,1,3
chr5	37358315	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=172,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:37358315_T_C:37358315:0,4,0,1
chr5	37358320	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=172,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:37358315_T_C:37358315:0,4,0,1
chr5	37358323	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:37358315_T_C:37358315:0,3,0,1
chr5	37392279	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=13,17;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.563:9:1,1:0,1:0,4,0,5
chr5	37605123	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,11;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.315:15:3,0:4,0:0|1:37605123_T_G:37605123:9,1,5,0
chr5	37605133	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.247:16:6,2:4,1:0|1:37605123_T_G:37605123:9,3,4,0
chr5	37605136	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=126,186;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:3,0:0|1:37605123_T_G:37605123:9,3,2,0
chr5	37605138	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=126,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,1:5,0:0|1:37605123_T_G:37605123:9,3,2,0
chr5	37724990	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr5	37752497	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	37816292	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	38412535	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr5	38418123	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=202,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr5	38496779	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr5	38502999	.	A	ATGTTCTGAGAAAAAACATGTCCCAATAGGTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=235,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	38504303	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr5	38512154	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr5	38528967	.	CACACACACACACAG	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.494:12:4,2:2,4:0,6,0,6
chr5	38528969	.	CACACACACACAG	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=108,153;MMQ=50,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.779:11:2,3:0,6:0,2,0,9
chr5	38876573	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,2:1,6:0,6,0,8
chr5	38933131	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.127:45:18,0:22,5:0|1:38933131_C_A:38933131:18,22,0,5
chr5	38933136	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.127:45:18,0:22,5:0|1:38933131_C_A:38933131:19,21,0,5
chr5	38942554	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:3,2:0,6,0,4
chr5	38952616	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=198,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr5	38953665	.	G	GA	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=97.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,38:0.947:40:0,12:2,14:0,2,12,26
chr5	38954994	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=97.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,8:0,17:0,0,1,25
chr5	38958750	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=104.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,20,7
chr5	38958968	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr5	38959431	.	GA	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:8,1:13,2:3,32,0,3
chr5	38959794	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=122,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,4:1,6:1,0,10,0
chr5	38960485	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:21,4:23,0:34,10,4,0
chr5	38962543	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=160.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,21:0,23:0,0,17,27
chr5	38971912	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr5	38978600	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr5	39002731	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:17,2:25,1:12,31,0,3
chr5	39110463	.	C	T	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=136.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,52:0.530:98:24,27:22,25:27,19,33,19
chr5	39119222	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr5	39119561	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=202.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,27:0,27:0,0,55,1
chr5	39153529	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.549:49:15,16:7,11:19,3,25,2
chr5	39342308	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,3,14
chr5	39375082	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.454:40:10,11:11,7:18,4,13,5
chr5	39376988	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=225,169;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:5,5:1,7:4,2,7,5
chr5	39377418	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:4,5:6,5:2,9,0,10
chr5	39382921	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=154,49;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:9,2:12,1:6,16,1,2
chr5	39389322	.	A	AAATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:39389322_A_AAATG:39389322:0,0,0,1
chr5	39389327	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39389322_A_AAATG:39389322:0,0,0,1
chr5	39390061	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=138.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,26:0,18:0,0,8,36
chr5	39394493	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,5:4,7:1,7,1,11
chr5	40692284	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.102:46:18,0:24,4:20,22,2,2
chr5	40716153	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,1:7,2:8,0,3,0
chr5	40746885	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.465:30:5,3:10,9:11,5,11,3
chr5	40747213	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=194,118;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:40747213_TAC_T:40747213:0,2,0,1
chr5	40747216	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=194,118;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:40747213_TAC_T:40747213:0,2,0,1
chr5	40747221	.	CAC	TGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=205,118;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:40747213_TAC_T:40747213:0,3,0,1
chr5	40777531	.	T	TTA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:5,4:10,9:9,6,11,2
chr5	40934471	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.534:39:11,8:7,12:13,5,13,8
chr5	40949997	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,9,2
chr5	40980086	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,8:0,0,0,12
chr5	40981689	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=119,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.920:23:1,10:0,10:1,0,5,17
chr5	40998851	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr5	41001023	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr5	41004396	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr5	41004807	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=209,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.497:10:1,3:3,1:5,0,3,2
chr5	41005655	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,1:10,1:8,7,1,1
chr5	41008650	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:5,2,5,0
chr5	41009282	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr5	41017989	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:9,10,0,2
chr5	41032998	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,10:0,3:0,0,9,4
chr5	41033112	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.402:47:14,7:14,10:20,8,14,5
chr5	41033909	.	ATCTATCTATCTATC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=124,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,3:2,8:5,2,9,2
chr5	41033931	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=165,106;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.420:19:3,4:8,3:8,3,5,3
chr5	41039000	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,1,6
chr5	41045768	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	41045835	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:5,3,5,4
chr5	41048388	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:6,1,6,0
chr5	41050999	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	41057562	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	41061871	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,11:0,0,2,16
chr5	41069734	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=154,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,4:3,3:8,1,6,1
chr5	41069952	.	CCTCT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=CT;STR;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr5	41070840	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,3:1,5:5,0,7,1
chr5	41154150	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:1,4,0,5
chr5	41158863	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,8:0,0,5,12
chr5	41199959	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.523:34:7,8:9,8:7,9,8,10
chr5	41381901	.	T	TC	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=94.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,17:0,15:0,0,25,7
chr5	41382681	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41382681_G_T:41382681:0,0,0,1
chr5	41382691	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41382681_G_T:41382681:0,0,0,1
chr5	41731895	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.098:39:14,3:21,0:0,36,0,3
chr5	41739684	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr5	41805575	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	41842746	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=84.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,13:0,0,18,6
chr5	41862862	.	T	TA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.190:29:11,2:10,1:1,23,0,5
chr5	41909830	.	CT	C,CTT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,34,33;MFRL=134,169,151;MMQ=60,60,60;MPOS=17,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=22.01,7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,14,10:0.363,0.237:39:9,8,4:2,6,5:11,4,21,3
chr5	41927423	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	42700044	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.533:26:3,7:9,5:7,5,5,9
chr5	42713472	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr5	42718335	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,2:4,5:0,9,1,6
chr5	42719523	.	T	TAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=275,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	42769844	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:2,7:4,4:0,7,0,11
chr5	42779686	.	G	GA	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.399:35:6,5:13,7:1,20,2,12
chr5	42779734	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.167:34:13,0:15,5:1,28,0,5
chr5	42779736	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.325:29:4,5:13,4:1,19,0,9
chr5	42799719	.	T	TTTA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,4:5,4:10,0,7,1
chr5	42800724	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr5	42801369	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,201;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:0,10,0,2
chr5	43161351	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=186,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:6,3,5,2
chr5	43292483	.	C	CTTACTATGAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr5	43292908	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=83.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,23,1
chr5	43294357	.	TAAGTAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	43297032	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr5	43298557	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr5	43492265	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=222,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=91.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.933:27:1,9:0,16:1,0,26,0
chr5	43492285	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=163,124;MMQ=60,35;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:19,3:20,0:38,1,3,0
chr5	43493592	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=125.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,22:0,11:0,0,32,1
chr5	43509462	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr5	43527398	.	G	GAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr5	43527673	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,0,21
chr5	43530035	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr5	43533992	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr5	43535754	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:7,4:4,9:2,9,2,11
chr5	43536855	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=105.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,15:1,14:1,0,29,0
chr5	43536904	.	T	TA,TAA	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=26,28,27;MFRL=174,162,116;MMQ=60,60,60;MPOS=16,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=42.03,5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,20,5:0.470,0.107:44:6,11,3:13,8,2:16,3,20,5
chr5	43556159	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:0,8,0,5
chr5	43609269	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=150,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:0|1:43609269_G_A:43609269:20,3,2,0
chr5	43609272	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,7:0.313:23:9,3:6,3:1|0:43609269_G_A:43609269:14,2,5,2
chr5	43612984	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:3,4:2,1:5,0,5,0
chr5	43704542	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr5	43704579	.	A	AGAATTGGTAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=152,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr5	44305309	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,5:7,5:3,10,1,9
chr5	44310492	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,4:3,4:7,3,5,3
chr5	45267096	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr5	49698986	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,3:4,2:12,0,5,0
chr5	50045967	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,6:2,4:7,1,7,3
chr5	50046131	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:0|1:50046131_G_A:50046131:0,5,0,6
chr5	50046139	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=74,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:0|1:50046131_G_A:50046131:0,4,0,6
chr5	50055456	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,32,32,30;MFRL=142,191,175,92;MMQ=60,60,60,60;MPOS=27,16,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,15,17,18;RU=T;STR;TLOD=11.64,17.13,4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,8,13,11:0.168,0.317,0.248:43:4,3,6,1:5,4,2,5:9,2,20,12
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chr5	52204943	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:0,5,0,6
chr5	52214827	.	TG	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr5	52366138	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.582:39:8,9:8,12:0,16,1,22
chr5	52367666	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr5	52404312	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.328:28:3,3:15,5:13,6,8,1
chr5	52776729	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:2,5,0,2
chr5	52781902	.	CAAAA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=105,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.589:16:1,2:3,2:4,3,1,8
chr5	52942197	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=207.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.983:58:0,32:0,23:0,0,10,48
chr5	52954280	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr5	52954514	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:6,3:8,4:1,13,0,7
chr5	53606295	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=235.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,33:0,28:0,0,22,42
chr5	53814052	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,1,3
chr5	53815219	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.399:38:11,9:12,6:9,14,3,12
chr5	53815240	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.549:31:8,8:5,9:2,12,8,9
chr5	54275119	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:3,9:8,5:10,1,11,3
chr5	54277878	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:15,2:9,0:16,10,2,0
chr5	54423032	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr5	54423075	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,5:3,1:6,2,5,1
chr5	54439466	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:9,7:4,9:4,10,7,9
chr5	54439513	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,1:4,6:0,7,0,8
chr5	54442472	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,23:0.443:52:14,9:15,13:16,13,13,10
chr5	54456734	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	54460121	.	TTG	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=166,193;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:54460121_TTG_T:54460121:0,3,0,1
chr5	54460124	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=166,193;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:54460121_TTG_T:54460121:0,3,0,1
chr5	54460131	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=166,193;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:54460121_TTG_T:54460121:0,3,0,1
chr5	54460134	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=166,193;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:54460121_TTG_T:54460121:0,3,0,1
chr5	54460137	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=166,193;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:54460121_TTG_T:54460121:0,3,0,1
chr5	54460145	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=241,193;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54460121_TTG_T:54460121:0,1,0,1
chr5	54466544	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,6:3,6:1,9,5,7
chr5	54528393	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:6,4:9,3:0,15,1,7
chr5	54557146	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=212,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:3,4:3,7:6,1,9,2
chr5	54565435	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,35;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:7,8,1,1
chr5	54566178	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:16,2:5,1:20,4,3,0
chr5	54569062	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:3,6:7,8:7,3,12,2
chr5	54594596	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=184,161;MMQ=40,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:4,9:4,3:0,8,0,13
chr5	54603822	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=284.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,79:0.976:80:0,41:1,37:1,0,74,5
chr5	54635738	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=203,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr5	54635810	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,3:7,3:14,3,5,1
chr5	54635826	.	T	TC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:12,1:9,4:18,4,5,1
chr5	54640496	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=106.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,34:0.647:52:8,18:10,14:0,18,1,33
chr5	54683977	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=201,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr5	54693374	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=176,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:2,5:9,6:2,9,0,11
chr5	54693402	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:0,3:8,3:0,8,0,6
chr5	54706325	.	T	TTTTAAA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.443:34:10,9:9,6:17,2,14,1
chr5	54706405	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=146,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.098:48:28,0:16,4:21,23,0,4
chr5	54709943	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.259:29:9,2:12,5:19,3,6,1
chr5	54710072	.	GT	G,GTT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,24,34;MFRL=162,145,141;MMQ=60,60,60;MPOS=18,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,19;RU=T;STR;TLOD=4.40,3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,2:0.345,0.152:16:1,1,1:4,2,1:0,8,2,6
chr5	54718618	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr5	54721610	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=192,158;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,3:7,0:17,1,3,0
chr5	54721619	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=195,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.346:21:7,3:6,4:13,1,7,0
chr5	54721642	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.484:26:8,2:4,5:12,1,12,1
chr5	54737791	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,3:3,0:0,7,0,3
chr5	54786854	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,3:14,0:16,15,3,0
chr5	54830295	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=209,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr5	54948588	.	A	AAAAAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=214,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAAC;STR;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr5	54952688	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=226,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr5	55056119	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:12,0:21,3:10,23,0,3
chr5	55080998	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr5	55081485	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:8,1,2,0
chr5	55112262	.	C	CT,CTT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,32,32;MFRL=171,167,152;MMQ=60,60,60;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=T;STR;TLOD=13.77,30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,10,21:0.284,0.560:37:4,2,10:2,6,7:4,2,24,7
chr5	55155402	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.597:23:8,6:1,7:5,4,6,8
chr5	55164590	.	TTG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,0:4,2:12,1,2,0
chr5	55179052	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,4:2,2:0,9,1,5
chr5	55196023	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=213,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:1,3:2,4:0,3,2,5
chr5	55196054	.	A	ATGTTCTTGTGCTGATGATTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=185,265;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.320:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	55212379	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=240,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr5	55398217	.	CAA	C,CA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32,34;MFRL=142,151,135;MMQ=60,58,60;MPOS=24,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=5.17,14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,7:0.235,0.527:13:1,1,5:2,2,2:3,0,10,0
chr5	55398269	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.940:30:0,11:0,15:1,0,24,5
chr5	55407542	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:3,8:6,7:4,5,11,4
chr5	55422681	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=187,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:9,4:0,5:9,0,9,0
chr5	55466689	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:0|1:55466689_C_A:55466689:0,3,1,6
chr5	55466693	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:1,2:2,4:0|1:55466689_C_A:55466689:0,3,1,6
chr5	55829003	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.318:27:6,0:7,2:12,7,0,8
chr5	55830865	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=201,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr5	55851872	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:8,8:4,6:10,2,13,1
chr5	56152416	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=197,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:1,13:0,10:1,0,22,2
chr5	56160837	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56160837_C_A:56160837:0,2,0,1
chr5	56160838	.	T	TGGAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56160837_C_A:56160837:0,2,0,1
chr5	56160839	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56160837_C_A:56160837:0,2,0,1
chr5	56171173	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,0:2,2:0,12,0,2
chr5	56177848	.	TCAACAA	T,TCAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23,28;MFRL=0,132,166;MMQ=60,60,60;MPOS=23,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=CAA;STR;TLOD=8.59,46.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,11:0.208,0.743:14:0,3,7:0,0,4:0,0,8,6
chr5	56178217	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr5	56205643	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=156.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.975:38:0,15:0,23:0|1:56205643_A_G:56205643:0,0,0,38
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chr5	56206073	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr5	56212595	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,6:0,13:0,0,21,0
chr5	56224714	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,1,19
chr5	56226410	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr5	56229288	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr5	56231361	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.165:26:10,1:11,2:5,17,0,4
chr5	56510139	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=197,189;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr5	56526783	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,29:0,22:0,0,14,40
chr5	56526819	.	GT	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=53.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.408:47:9,12:17,6:3,25,2,17
chr5	56527224	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr5	56527247	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=161,153;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	56543078	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:0,4,1,5
chr5	56547059	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:0,2,0,7
chr5	57750350	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.632:22:7,9:0,5:8,0,14,0
chr5	57753456	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:8,3:9,8:0,18,0,11
chr5	57754132	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,3:0,12:0,0,14,1
chr5	57754808	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.384:34:11,6:10,6:14,7,9,4
chr5	57755843	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	57790337	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.366:36:6,8:16,4:19,4,7,6
chr5	57790983	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=244,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57790983_A_G:57790983:0,1,0,1
chr5	57790986	.	CG	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=9,27;MFRL=244,261;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:57790983_A_G:57790983:0,1,0,1
chr5	57790991	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=244,261;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57790983_A_G:57790983:0,1,0,1
chr5	57913591	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:16,2:18,0:13,21,0,2
chr5	58147156	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:6,0:5,2:7,7,0,2
chr5	58270457	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=219,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.691:11:1,2:2,6:3,0,8,0
chr5	58271696	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:8,1:6,7:0|1:58271696_C_T:58271696:1,13,0,8
chr5	58271713	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.334:22:7,2:7,3:0|1:58271696_C_T:58271696:0,15,0,7
chr5	58271725	.	C	CAA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=177,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=A;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.297:18:7,2:5,2:0|1:58271696_C_T:58271696:0,13,0,5
chr5	58272116	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.428:28:10,8:6,3:16,0,11,1
chr5	58272139	.	GAC	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.120:40:19,3:14,0:27,9,3,1
chr5	58272361	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.616:21:4,6:3,7:0,8,0,13
chr5	58284283	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,2:4,8:9,1,8,2
chr5	58285813	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.451:11:2,3:3,2:1,5,0,5
chr5	58286625	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,4:2,1:6,5,3,2
chr5	58289334	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:5,7:2,3:1,7,0,10
chr5	58489218	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr5	58511501	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=17,32;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:0,3:1,1:0|1:58511501_G_A:58511501:4,0,4,0
chr5	58511506	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,4:0.489:8:3,2:1,1:1|0:58511501_G_A:58511501:4,0,4,0
chr5	58882102	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:4,3:3,5:5,2,5,4
chr5	59894838	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=121,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.692:18:1,6:4,4:5,0,10,3
chr5	59899390	.	ACCATCT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=197,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:2,1,0,1
chr5	59899413	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	59940502	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,6:5,6:10,0,11,1
chr5	59941486	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,5:2,3:1,8,0,8
chr5	59982754	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.675:19:3,4:2,8:5,1,11,2
chr5	59995820	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=167,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,1,1
chr5	60063576	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.665:19:2,8:4,4:6,0,13,0
chr5	60083275	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.691:11:0,3:3,4:1,2,0,8
chr5	60170337	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,5:8,4:11,0,9,0
chr5	60170512	.	TA	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.237:37:10,2:6,4:4,24,1,8
chr5	60170605	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=194,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,5:2,6:0,6,0,11
chr5	60186618	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	60199363	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:6,0,5,1
chr5	60240986	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=191,176;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.453:27:8,5:4,6:15,0,11,1
chr5	60369083	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.403:23:5,5:8,4:1,13,1,8
chr5	60768591	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=180,239;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:18,1:19,2:23,16,3,0
chr5	61648394	.	AT	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.121:44:20,3:16,2:32,7,5,0
chr5	61661082	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,138;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:16,2:13,0:23,8,2,0
chr5	61662408	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=196,163;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr5	61684897	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=156,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:26,0:31,3:18,39,0,3
chr5	61745737	.	CTT	C,CT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=133,153,144;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=14.93,81.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,10,36:0.192,0.723:50:1,6,17:3,4,16:4,0,40,6
chr5	61762880	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	61772668	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,1:6,1:1,18,1,1
chr5	61781127	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr5	61785936	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=120.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,17:0,0,22,11
chr5	61826663	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr5	61874619	.	TAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=9,21;MFRL=143,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.324:7:1,0:0,1:0,5,0,2
chr5	62073118	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,14:0.353:40:16,7:10,6:0,26,1,13
chr5	63257465	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=86.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,28:0.560:50:12,19:9,9:8,14,16,12
chr5	63513099	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:5,0,6,0
chr5	63802636	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:4,4:1,2:3,3,4,2
chr5	63803508	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:10,0,3,0
chr5	63871528	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr5	64070617	.	A	AAATTATGAC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.283:19:7,3:7,2:8,6,4,1
chr5	64077647	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=250,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,2:1,3:2,0,6,0
chr5	64077735	.	A	AT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:18,2:15,1:30,3,3,0
chr5	64084746	.	CT	C,CTT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,34,34;MFRL=136,157,159;MMQ=60,60,60;MPOS=17,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=33.96,3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,15,3:0.424,0.102:36:10,9,1:7,6,2:16,2,17,1
chr5	64096046	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:3,3:6,6:11,1,8,1
chr5	64096170	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:7,3:6,5:4,10,2,7
chr5	64272914	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.539:39:12,9:4,12:15,3,18,3
chr5	64447777	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr5	64483759	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=283,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr5	64509787	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=191,149;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr5	64629986	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=57.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.606:31:7,8:5,11:0,12,0,19
chr5	64747918	.	T	TG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,4:6,7:8,2,13,0
chr5	64766518	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=196,232;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr5	64825102	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr5	64838584	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,5:5,5:10,2,10,0
chr5	64838758	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=238,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr5	64847494	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:5,5:11,12:0,16,3,14
chr5	64847543	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr5	64848412	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr5	64848442	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	64863285	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.513:47:12,9:9,13:21,2,23,1
chr5	64863484	.	TA	T,TAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31,30;MFRL=154,184,151;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.70,28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,14:0.150,0.512:27:4,1,4:5,3,8:0,9,0,18
chr5	64865405	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,1:3,6:5,0,7,0
chr5	64865658	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=76.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,27:0.534:50:8,12:15,12:17,6,16,11
chr5	64890479	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:0,3:0,3,1,3
chr5	64906617	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=211,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,2:1,7:3,0,9,0
chr5	64907696	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=178,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:5,13,1,1
chr5	64919991	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:6,6:12,8:10,8,5,9
chr5	64920803	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=183,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:6,6:3,6:9,0,12,0
chr5	64933457	.	CA	C,CAA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,33,32;MFRL=146,171,136;MMQ=60,44,40;MPOS=10,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=4.24,13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,8:0.158,0.389:20:1,2,2:7,1,5:8,1,11,0
chr5	64933473	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=143,140;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.152:47:14,1:19,1:20,19,7,1
chr5	64933505	.	A	G	.	.	DP=81;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=92.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,32:0.417:77:19,10:26,18:21,24,13,19
chr5	64942799	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=248,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,4:1,0,7,0
chr5	64942852	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=160,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.394:16:6,2:3,2:8,2,3,3
chr5	64956557	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.542:46:10,16:11,9:10,11,16,9
chr5	64957927	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:9,9,1,1
chr5	64960311	.	A	ATCTC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=189,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TC;STR;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,4:2,2:2,1,3,3
chr5	64968170	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,9:5,4:0,8,3,11
chr5	64976687	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr5	65008946	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	65016452	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:5,0,6,0
chr5	65054731	.	T	TCCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:65054731_T_TCCA:65054731:0,2,0,1
chr5	65054732	.	T	TTGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,240;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:65054731_T_TCCA:65054731:0,2,0,1
chr5	65073224	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=87.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,9:0,15:0,0,25,1
chr5	65081777	.	C	CCAATTACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:1,1:0|1:65081777_C_CCAATTACA:65081777:0,2,0,1
chr5	65081782	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:65081777_C_CCAATTACA:65081777:0,2,0,1
chr5	65288560	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:16,6,0,2
chr5	65288791	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr5	65308055	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,1,20
chr5	65310477	.	AT	A	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,5:0.086:67:28,3:30,2:48,14,5,0
chr5	65317332	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,2,12
chr5	65346599	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=192,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:2,1:6,8:8,0,8,2
chr5	65372793	.	CT	C	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,10:0.095:87:29,4:43,5:22,55,2,8
chr5	65466358	.	T	TGTGTGTGTGTTTGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=174,400;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr5	65892594	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,3:6,1:6,1,2,2
chr5	66084419	.	A	AGGGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=204,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,0:1,0:2,0,1,0
chr5	66195701	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.541:35:11,11:5,8:14,2,17,2
chr5	66282447	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=188,177;MMQ=60,41;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.310:15:6,0:5,4:1,10,0,4
chr5	66282448	.	T	TATA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=191,182;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.226:15:7,0:5,3:1,11,0,3
chr5	66414489	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,1:11,2:18,1,3,0
chr5	66416764	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=225,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr5	66426325	.	GC	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:66426325_GC_TG:66426325:0,1,0,1
chr5	66426329	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:66426325_GC_TG:66426325:0,1,0,1
chr5	66429329	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,14:0,0,18,5
chr5	66448511	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,0:12,3:16,14,1,2
chr5	66479691	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,135;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:11,4:17,0:22,7,4,0
chr5	67576330	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:3,1:1,2:7,0,3,0
chr5	67584512	.	AT	A,ATT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32,30;MFRL=151,149,173;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.83,10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,5:0.181,0.230:23:8,3,1:5,1,4:12,2,8,1
chr5	67587994	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.954:19:0,8:0,10:0|1:67587994_C_T:67587994:0,0,19,0
chr5	67588000	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.440:23:5,4:8,6:0|1:67587994_C_T:67587994:13,0,10,0
chr5	68390203	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr5	68396764	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.911:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	68408964	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:16,2,0,2
chr5	68409094	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,14:0,9:0,0,1,24
chr5	68411010	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr5	68412048	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=70.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,7,15
chr5	68413042	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=223,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,3:1,6:1,0,8,1
chr5	68417755	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=250,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=123.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.949:37:0,18:1,16:0,1,2,34
chr5	68463014	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:5,4:3,2:6,2,3,4
chr5	68464234	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=195,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:6,4:3,6:0,9,0,11
chr5	68467137	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:14,6,2,0
chr5	68491714	.	T	TAGTCAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=123,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTCAAG;STR;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr5	68492942	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:10,1:13,2:1,25,0,3
chr5	68504262	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=172,82;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:13,0:3,2:0,16,1,1
chr5	68504268	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=175,163;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:14,0:3,2:0,17,0,2
chr5	68513572	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=183,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:6,0,4,0
chr5	68513599	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.517:21:5,4:5,6:10,0,11,0
chr5	68524006	.	C	CT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.454:33:8,3:7,8:14,4,12,3
chr5	68548321	.	CTTTTT	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=30,25;RU=T;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:1,3:0,1:0,3,2,2
chr5	68548351	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:1,4:2,1:0,3,2,6
chr5	68550348	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,127;MMQ=56,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.527:9:3,1:1,2:3,1,1,4
chr5	68564985	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.211:23:9,3:9,1:14,4,2,3
chr5	68602746	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:8,5:9,10:6,11,2,14
chr5	68665344	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,12:0.302:41:12,9:17,3:18,11,6,6
chr5	68667263	.	TCCCC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=C;STR;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.939:12:0,1:0,7:0,0,0,12
chr5	68680850	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=161,168;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:68680850_G_T:68680850:0,3,0,1
chr5	68680855	.	CA	GG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,168;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:68680850_G_T:68680850:0,2,0,1
chr5	68692363	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,15;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.145:29:7,0:13,0:0|1:68692363_T_A:68692363:8,17,0,4
chr5	68692367	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,16;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.150:28:7,0:10,0:0|1:68692363_T_A:68692363:7,17,0,4
chr5	68692375	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,19;MFRL=135,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.475:13:2,3:2,0:0,7,0,6
chr5	68696035	.	G	GTTTATTTA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=93,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTA;STR;TLOD=97.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,25:0.921:27:2,15:0,7:0,2,0,25
chr5	68706252	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.965:24:0,14:0,10:0,0,24,0
chr5	68706438	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,11:0,19:0,0,3,27
chr5	68728544	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,5:3,5:0,5,0,10
chr5	68736157	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,179;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:13,2:13,0:25,1,2,0
chr5	68862362	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=164,155;MMQ=43,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,12:0.288:43:18,4:13,8:26,5,10,2
chr5	68862363	.	TGG	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=166,141;MMQ=43,46;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=G;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.100:37:13,3:19,0:30,4,1,2
chr5	68862365	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=164,148;MMQ=43,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,15:0.335:46:18,3:10,8:26,5,10,5
chr5	69717719	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=211,211;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,6:1,1:0,3,0,7
chr5	69730101	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=134,144;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.614:29:9,4:2,14:0,11,1,17
chr5	70398838	.	TG	CA	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=161,132946;MMQ=49,28;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:22,3:16,0:0|1:70398838_TG_CA:70398838:10,31,0,3
chr5	70398843	.	C	CT	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,132946;MMQ=40,28;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.098:39:20,3:15,0:0|1:70398838_TG_CA:70398838:7,29,0,3
chr5	70398847	.	TG	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=161,132946;MMQ=40,28;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:17,3:15,0:0|1:70398838_TG_CA:70398838:6,29,0,3
chr5	70757831	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=203,160;MMQ=47,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:6,0:0|1:70757831_C_T:70757831:0,19,0,2
chr5	70757833	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=203,160;MMQ=47,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:0|1:70757831_C_T:70757831:0,19,0,2
chr5	70757844	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=203,160;MMQ=46,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,1:7,0:0|1:70757831_C_T:70757831:0,21,0,2
chr5	70766415	.	CT	C,CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26,20;MFRL=150,227,176;MMQ=60,60,60;MPOS=28,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.64,5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.300,0.402:7:0,2,0:1,0,2:0,2,0,5
chr5	70786726	.	G	GAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr5	70797521	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,0:12,0:1,18,4,0
chr5	70797525	.	CTC	AAA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=35,13;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.154:23:6,0:13,0:0|1:70797525_CTC_AAA:70797525:1,19,3,0
chr5	70797532	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:13,0:0|1:70797525_CTC_AAA:70797525:0,20,2,0
chr5	70798717	.	CATTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=37,19;MFRL=219,262;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=ATTT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr5	70805272	.	GC	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.241:26:11,4:8,2:17,3,6,0
chr5	70806457	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,28:0.581:48:10,13:8,13:10,10,11,17
chr5	70807991	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.808:24:1,9:3,11:4,0,20,0
chr5	70809269	.	GTT	G,GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=12,31,35;MFRL=194,186,192;MMQ=60,60,60;MPOS=17,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.65,5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,3:0.324,0.356:10:0,2,0:0,1,3:0,3,0,7
chr5	70811821	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,8:4,2:10,0,10,0
chr5	70818329	.	CA	C,CAA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,27,30;MFRL=161,155,151;MMQ=60,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=6.45,9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,6,10:0.165,0.257:36:6,0,4:8,4,3:2,18,1,15
chr5	70818834	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=194,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,3:7,0:0,12,3,0
chr5	70818877	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=199,218;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,2:0,0:0,3,0,2
chr5	70834833	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,41:0.568:72:15,14:16,27:16,15,28,13
chr5	70837295	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:5,6,2,2
chr5	70840433	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=219,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	70852611	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr5	70860493	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:10,10:5,4:14,1,14,0
chr5	70883319	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=164,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,2:0,0:2,1,1,1
chr5	70888665	.	GTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr5	70922616	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,3:5,5:1,5,1,7
chr5	70927856	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:4,1,7,0
chr5	70928083	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,4:4,6:0,12,0,10
chr5	70948654	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=172,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:2,1:5,1:0,7,0,3
chr5	70952506	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,6:1,2:5,0,8,0
chr5	71015061	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=169,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	71016508	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:0,8,0,2
chr5	71411718	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr5	71492601	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:6,7,0,2
chr5	71522125	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,0,10
chr5	71739546	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr5	71743024	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,13,0
chr5	71743322	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,0,19
chr5	72144209	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=95.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,18:0,11:0,0,20,11
chr5	72168584	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=161,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.092:30:13,1:9,1:0|1:72168584_CT_C:72168584:4,24,0,2
chr5	72168600	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=161,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:17,1:10,0:0|1:72168584_CT_C:72168584:3,25,0,2
chr5	72183055	.	CCTAAGTCCAGTTTGAATTATGTAAGTTGGCTTCTTACTACTATTAGGTACTAATAAGGCTAGGCTACTTTAAGG	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=85.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.958:23:0,9:0,12:0,0,7,16
chr5	72185591	.	CT	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.207:29:7,2:10,1:18,5,3,3
chr5	72192434	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,2:8,0:0,23,0,2
chr5	72201058	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr5	72252034	.	G	GGGC	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GGC;STR;TLOD=146.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,19:0,14:0,0,1,34
chr5	72347090	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	72350290	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,11:0,0,16,2
chr5	72370745	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,0,13
chr5	72373411	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=291,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	72378703	.	ATT	A,AT	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=15,18,16;MFRL=169,156,168;MMQ=60,60,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=5.21,17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,10:0.215,0.475:21:2,1,2:0,1,1:1,5,1,14
chr5	72378721	.	AAACAGAGTCTAGC	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.092:31:8,0:14,2:1,28,0,2
chr5	72378738	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:0|1:72378738_G_T:72378738:0,21,0,2
chr5	72378741	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:72378738_G_T:72378738:0,20,0,2
chr5	72795003	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,28:0.412:68:24,12:16,15:24,16,15,13
chr5	72795055	.	GT	G,GTT	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=32,33,32;MFRL=138,173,141;MMQ=60,60,60;MPOS=12,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.94,27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,17:0.095,0.470:35:9,2,6:6,1,11:4,11,8,12
chr5	72798502	.	GTTT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.754:9:0,3:1,4:0,2,0,7
chr5	72798995	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,4:0,2:2,2,0,6
chr5	72800117	.	TG	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,18;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.206:23:8,2:5,0:5,13,5,0
chr5	72800118	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,18;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.275:23:8,2:5,0:3,13,6,1
chr5	72800122	.	AA	TT	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=26,15;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.189:33:11,0:5,0:0|1:72800122_AA_TT:72800122:6,21,6,0
chr5	72800125	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=25,17;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.183:34:16,1:8,1:0|1:72800122_AA_TT:72800122:6,22,6,0
chr5	72800129	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=25,21;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.158:33:16,2:8,0:0|1:72800122_AA_TT:72800122:6,22,5,0
chr5	72800295	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.567:35:8,13:7,6:3,12,4,16
chr5	72850282	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	72853343	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,8:0.170:51:22,8:20,0:42,1,8,0
chr5	72865569	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	72872766	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	72873925	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr5	72874801	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr5	72875635	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr5	73045654	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:12,3,0,2
chr5	73069581	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=220,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr5	73072354	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.375:49:12,7:17,11:15,16,7,11
chr5	73076457	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,3:4,5:8,1,7,1
chr5	73076474	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,1:4,5:7,4,3,3
chr5	73076511	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:7,3:6,6:7,6,2,7
chr5	73090165	.	A	AGTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GTT;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:2,2:2,1:0,4,2,1
chr5	73091126	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:3,4:5,3:8,0,8,0
chr5	73153407	.	CACACAT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=199,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr5	73160730	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:8,9:4,7:5,7,1,15
chr5	73163861	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,14:0,5:0,0,10,9
chr5	73189145	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,5:4,8:1,8,2,11
chr5	73197200	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,5:5,5:0,11,0,10
chr5	73930442	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr5	73930887	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:8,11,0,2
chr5	73931849	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,107;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:16,0:4,2:3,17,0,2
chr5	73932315	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,21:0,19:0,0,7,34
chr5	73992609	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:5,4:3,1:1,7,0,6
chr5	74009500	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:13,0:9,5:4,18,0,5
chr5	74009511	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=170,221;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:12,0:5,2:1,16,0,2
chr5	74009519	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:10,0:3,2:0,14,0,4
chr5	74009521	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=172,177;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,0:1,3:0,11,0,4
chr5	74011284	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,5:6,0,9,0
chr5	74011541	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:5,6:6,7:2,10,7,8
chr5	74021846	.	TACTCAA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTCAA;STR;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:7,6:5,6:5,8,5,7
chr5	74054595	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,3:3,6:5,1,9,0
chr5	74059532	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:7,2:15,6,0,2
chr5	74064951	.	G	T	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=151.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,55:0.554:99:26,32:17,23:22,22,26,29
chr5	74072339	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:4,5:8,6:12,0,11,0
chr5	74100435	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,1:12,2:3,20,0,3
chr5	74325355	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=158,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:0|1:74325355_C_T:74325355:8,11,1,1
chr5	74325372	.	T	TATGACCTACAAACCCAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=158,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:16,2:0|1:74325355_C_T:74325355:13,9,1,1
chr5	74639576	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	74651084	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:11,3:5,3:9,8,2,4
chr5	74652094	.	C	CA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.097:38:9,0:26,2:35,0,3,0
chr5	74655726	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=238,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:9,0,4,0
chr5	74675076	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=201,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:1,0,5,1
chr5	74685520	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=57.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:9,6:4,12:4,9,3,15
chr5	74980950	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=214,176;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr5	74988369	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=112,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,5:4,1:1,4,0,6
chr5	75427518	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=212,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:2,0,7,1
chr5	75427935	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,14:0,0,14,13
chr5	75923141	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,16,0
chr5	75923393	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=143.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,19:0,25:0,0,3,44
chr5	75927595	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr5	75927938	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr5	75932869	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,11:0,0,14,7
chr5	75932955	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,0:15,2:7,14,0,2
chr5	75932965	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,5:0,17:0,0,7,15
chr5	75933097	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	75936944	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr5	75948474	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=160,248;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr5	75948650	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,6:4,5:2,5,3,8
chr5	75948685	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:1,6,1,7
chr5	75948764	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75948764_T_TG:75948764:0,1,0,1
chr5	75948766	.	A	AACACT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75948764_T_TG:75948764:0,1,0,1
chr5	75950193	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=196,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr5	75950707	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=196,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:4,2:1,3:4,1,5,1
chr5	75954537	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=122.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,24:0,13:0,0,3,34
chr5	75954577	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,0,13
chr5	75960818	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.577:17:4,7:3,3:0|1:75960818_T_TA:75960818:7,0,8,2
chr5	75960825	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.598:18:4,6:3,4:0|1:75960818_T_TA:75960818:7,0,9,2
chr5	75964702	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.576:29:6,9:6,6:1,11,0,17
chr5	75967755	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=152,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,5:0.113:51:18,0:26,5:0|1:75967755_A_T:75967755:27,19,0,5
chr5	75967759	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=152,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,5:0.113:51:19,0:23,5:0|1:75967755_A_T:75967755:27,19,0,5
chr5	75967862	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,4:7,3:0,10,1,6
chr5	75969747	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=149,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,4:8,2:7,6,6,0
chr5	75991424	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,14:0.253:57:13,3:30,11:20,23,8,6
chr5	75991452	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:17,3:42,0:26,33,1,2
chr5	75996837	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=170,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:7,0,7,0
chr5	75997063	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,16:0.630:25:3,6:5,9:0|1:75997063_A_G:75997063:1,8,3,13
chr5	75997069	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,15:0.615:24:4,6:5,9:0|1:75997063_A_G:75997063:1,8,2,13
chr5	75998488	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr5	76028124	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=161,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:1,1:4,6:5,0,7,1
chr5	76129014	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.426:24:7,5:6,5:12,2,8,2
chr5	76173727	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr5	76249536	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.681:13:3,4:0,5:0,4,0,9
chr5	76326885	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr5	76335623	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:0,6,0,4
chr5	76351308	.	CT	C	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,6:0.071:96:48,2:41,4:53,37,5,1
chr5	76359090	.	G	GA	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=68.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,29:0.585:50:6,13:15,14:7,14,5,24
chr5	76621612	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr5	76696211	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=194,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr5	76717583	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:6,1,4,1
chr5	76722239	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,8:2,3:4,0,8,3
chr5	76722443	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr5	76729193	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	76732243	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.390:16:6,2:4,4:2,8,0,6
chr5	76734260	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:0,8,0,4
chr5	76736621	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:5,6:6,6:11,0,12,1
chr5	76747087	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=165.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,47:0.961:48:0,23:1,23:1,0,42,5
chr5	76760495	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,22:0,11:0,0,33,0
chr5	76760657	.	G	GA	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=101,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=115.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,48:0.892:53:4,19:1,21:0,5,6,42
chr5	76785405	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,117;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.272:12:5,1:3,2:0,9,0,3
chr5	76787919	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,18,1
chr5	76934363	.	A	G	.	.	DP=146;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=194.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,71:0.530:134:29,33:33,38:25,38,33,38
chr5	77411923	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,89;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:10,0:14,8,2,0
chr5	77524068	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=194,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:1,6,0,6
chr5	77524091	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=200,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:2,4:3,2:1,5,0,6
chr5	77563263	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:4,1:5,4:9,1,5,0
chr5	77717528	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=220,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr5	77745853	.	C	CA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=143.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.957:44:1,18:0,17:0,1,10,33
chr5	77755035	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=156.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,25:0,18:0,0,32,11
chr5	77755247	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=160,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:3,4:6,8:0,9,0,12
chr5	78077805	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:0|1:78077805_G_A:78077805:5,20,0,2
chr5	78077808	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:0|1:78077805_G_A:78077805:5,19,0,2
chr5	78111990	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:3,10,0,2
chr5	78265041	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,10:0,0,0,27
chr5	78324482	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,3:4,2:3,7,4,1
chr5	78325879	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.584:34:7,6:7,14:2,12,2,18
chr5	78326922	.	CGGGCAGCGGGGAGTG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=266,253;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	78340062	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=186,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,6:4,0:8,2,5,1
chr5	78340421	.	C	CCTGCTCTTCTAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=191,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	78373251	.	GAA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:2,2:4,0:7,1,2,0
chr5	78378824	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:4,2:7,6:2,10,0,8
chr5	78407760	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.064:45:21,2:20,0:22,21,2,0
chr5	78407805	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=172,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:7,8:9,6:1,15,6,8
chr5	78411822	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:0,4,0,4
chr5	78416416	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,5:1,3:0,3,0,8
chr5	78421780	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,11,2
chr5	78533584	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,2:4,5:0,10,0,7
chr5	78586914	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=133,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr5	78587135	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=191,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,5:4,0:2,4,0,5
chr5	78608354	.	CTT	C,CT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=20,20,19;MFRL=146,118,122;MMQ=60,60,60;MPOS=28,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=7.28,12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,6,8:0.215,0.328:26:1,1,0:6,3,3:0,12,0,14
chr5	78742980	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:1,6,0,4
chr5	78808733	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=108,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:78808733_G_A:78808733:0,2,0,1
chr5	78808734	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,15;MFRL=108,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:78808733_G_A:78808733:0,2,0,1
chr5	78808736	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=108,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:78808733_G_A:78808733:0,2,0,1
chr5	78915723	.	T	TTGA	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,2:0.041:71:35,1:32,1:0|1:78915723_T_TTGA:78915723:41,28,0,2
chr5	78915726	.	TAC	T	.	.	DP=75;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,2:0.039:75:31,1:33,1:0|1:78915723_T_TTGA:78915723:45,28,0,2
chr5	78915731	.	AT	A	.	.	DP=81;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,2:0.036:81:31,1:34,1:0|1:78915723_T_TTGA:78915723:50,29,0,2
chr5	78915735	.	A	C	.	.	DP=82;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,2:0.037:79:31,1:31,1:0|1:78915723_T_TTGA:78915723:49,28,0,2
chr5	78936847	.	CT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.250:28:7,3:10,4:9,12,5,2
chr5	78944371	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:3,7:2,8:5,0,15,0
chr5	78944784	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=201,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:5,1,3,0
chr5	79026810	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:15,2:8,0:14,9,2,0
chr5	79027734	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:5,6:7,9:8,4,9,6
chr5	79029225	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=153,78;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:7,2,2,0
chr5	79040977	.	C	CAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=221,242;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=A;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr5	79041004	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=188,127;MMQ=60,58;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:7,0:16,2,2,0
chr5	79089528	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr5	79095119	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,1:6,0,5,0
chr5	79095145	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:3,7:2,5:4,1,12,0
chr5	79351544	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:3,3:7,0,5,0
chr5	79351852	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.228:20:6,3:9,1:0|1:79351852_A_T:79351852:5,11,0,4
chr5	79351859	.	GG	AA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,2:7,1:0|1:79351852_A_T:79351852:3,11,0,3
chr5	79354147	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:4,4:1,9,3,1
chr5	79354647	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	79354702	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr5	79355150	.	CAAAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=159,219;MMQ=59,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.412:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr5	79355192	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:3,2:0,0:2,1,3,0
chr5	79355471	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=196,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:1,1:6,9:7,1,7,3
chr5	79361402	.	CATAAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr5	79363897	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=127,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:14,0:18,3:21,12,0,3
chr5	79368016	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr5	79368048	.	TAGA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,1:4,3:7,0,5,0
chr5	79369199	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.662:4:0,0:1,0:0|1:79369199_A_T:79369199:1,0,0,3
chr5	79369212	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.829:4:0,3:0,1:0|1:79369199_A_T:79369199:0,0,0,4
chr5	79373803	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=221,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	79375050	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=176,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.244:14:4,3:7,0:1,10,1,2
chr5	79375146	.	G	GTATTTTTCTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79375146_G_GTATTTTTCTT:79375146:0,0,0,1
chr5	79375149	.	T	TAGAGATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79375146_G_GTATTTTTCTT:79375146:0,0,0,1
chr5	79375724	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,4:8,6:13,1,9,1
chr5	79378447	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr5	79378783	.	TGCGGGGCGTCCTGG	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.398:31:7,4:11,8:18,1,12,0
chr5	79443169	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=186,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,1:1,1:3,3,0,2
chr5	79473059	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=69.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,12:0,8:0,0,19,1
chr5	79551867	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	79617357	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:3,5:3,2:3,4,2,5
chr5	79617656	.	GG	TA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr5	79617751	.	A	AAGGAATGGAGAAATAGACTCCACCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr5	79733079	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,17,9
chr5	79735858	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,2,22
chr5	79741018	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr5	79743821	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,17,2
chr5	79747291	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr5	79773028	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr5	79855876	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr5	79933653	.	T	TGAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAA;STR;TLOD=57.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,9:2,1:6,0,14,0
chr5	79950163	.	C	CTGGCGCGTCCCGCCCAGGT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=116.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,30:0.542:55:7,11:18,12:25,0,29,1
chr5	79950389	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=209,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.581:17:3,5:3,5:0|1:79950389_GC_G:79950389:0,7,0,10
chr5	79950403	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=215,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.530:15:4,4:3,4:0|1:79950389_GC_G:79950389:0,7,0,8
chr5	79950497	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:1,1:2,2:0|1:79950497_C_T:79950497:4,0,3,0
chr5	79950512	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=202,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:1,1:2,2:0|1:79950497_C_T:79950497:4,0,3,0
chr5	79950699	.	TGCAGCGGCTGCAGCGGCC	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=175,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:8,4:0,2:4,8,1,5
chr5	79950741	.	GCCCCCAGCT	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=194,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:6,6:2,1:2,8,1,6
chr5	79950781	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,2,13
chr5	79952154	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=118,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:2,1,5,0
chr5	79952165	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=118,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,1:0,2:2,1,4,0
chr5	79952390	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.447:25:6,4:7,6:1,13,0,11
chr5	79952426	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:5,5:9,7:0,14,0,12
chr5	79960955	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,4:1,6:2,0,10,0
chr5	79961241	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=231,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr5	79966197	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:5,5:1,5:0,6,0,10
chr5	79968258	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:6,4:5,5:0,12,0,9
chr5	79968271	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=199,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,3:7,2:0,12,0,5
chr5	79968496	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,7:4,4:9,0,11,0
chr5	79974646	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	79974983	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr5	80021193	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	80021445	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:0,5,0,5
chr5	80109433	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=123,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:8,1:12,5,2,0
chr5	80160596	.	AAATG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:3,6:7,3:11,0,8,1
chr5	80375872	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr5	80382806	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,2:3,6:5,2,2,6
chr5	80388554	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:1,2:7,0:9,0,2,0
chr5	80390225	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=127,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:4,4:4,4:2,6,1,8
chr5	80404761	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:6,9:1,1:4,3,6,4
chr5	80409799	.	C	CACCG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80409799_C_CACCG:80409799:0,1,0,1
chr5	80409802	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80409799_C_CACCG:80409799:0,1,0,1
chr5	80409804	.	C	CTGG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80409799_C_CACCG:80409799:0,1,0,1
chr5	80409808	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80409799_C_CACCG:80409799:0,1,0,1
chr5	80409809	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80409799_C_CACCG:80409799:0,1,0,1
chr5	80409812	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80409799_C_CACCG:80409799:0,1,0,1
chr5	80946174	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.079:61:32,0:24,4:12,45,0,4
chr5	81474225	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=189,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:0,4:5,3:5,0,7,0
chr5	81571846	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.056:69:32,1:32,2:64,2,3,0
chr5	81571896	.	A	G	.	.	DP=108;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=134,144;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=119.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,44:0.425:104:33,21:26,23:36,24,30,14
chr5	81573992	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:5,3:7,3:12,1,6,0
chr5	82360783	.	T	C	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=160.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,54:0.507:107:24,29:27,24:44,9,42,12
chr5	82360944	.	GAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=16,31,17,16;MFRL=172,177,176,151;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,15,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=A;STR;TLOD=5.19,9.51,8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:25,3,6,6:0.087,0.158,0.157:40:1,1,0,0:1,1,1,1:2,23,1,14
chr5	82407098	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:0,2:5,3:0|1:82407098_G_A:82407098:0,6,0,5
chr5	82407105	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=208,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:0|1:82407098_G_A:82407098:0,5,0,4
chr5	82499307	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr5	82817465	.	G	GCAGACC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:2,2,0,1
chr5	82817687	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,0:13,2:14,8,1,1
chr5	82832989	.	TGAA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAA;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,0:5,2:8,5,0,2
chr5	82833145	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:7,4:9,4:6,10,3,5
chr5	82834299	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,4:6,6:7,4,4,6
chr5	82843711	.	T	TATC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,2:3,4:4,1,7,0
chr5	82849120	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,2:2,0:3,0,2,0
chr5	82868173	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr5	82940510	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:1,8:3,6:0,4,0,14
chr5	82940548	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,5:2,7:0,4,0,12
chr5	83259225	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=230,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	83356338	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=256,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr5	83433004	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,2:0,0,5,0
chr5	83476194	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,17,2
chr5	83550060	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=166,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.264:12:6,0:2,3:1,8,0,3
chr5	86564995	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=183,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:0,6,0,7
chr5	86629061	.	CT	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:17,2:14,3:31,4,5,0
chr5	86633973	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:5,9:8,6:0,13,0,15
chr5	86637164	.	G	GA	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=63.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,31:0.494:64:18,8:12,13:12,21,4,27
chr5	86667856	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr5	86669964	.	AT	A,TT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,28,26;MFRL=188,184,198;MMQ=60,60,60;MPOS=27,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.86,8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,8:0.211,0.343:21:3,2,2:4,3,6:8,0,12,1
chr5	86679495	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.294:24:11,3:3,4:14,3,6,1
chr5	86685129	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=166,174;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:86685129_CA_C:86685129:6,0,2,0
chr5	86685138	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=166,174;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:86685129_CA_C:86685129:6,0,2,0
chr5	86690887	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=170,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:12,0:15,3:9,18,1,2
chr5	86695274	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=133,157;MMQ=60,59;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.308:20:8,4:6,1:7,7,2,4
chr5	86704027	.	G	GATA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=231,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86704027_G_GATA:86704027:0,1,0,1
chr5	86704028	.	G	GAATGTGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=231,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86704027_G_GATA:86704027:0,1,0,1
chr5	86704033	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=231,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86704027_G_GATA:86704027:0,1,0,1
chr5	87494728	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.250:16:7,1:5,2:11,1,4,0
chr5	87502325	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=16,29;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,32:0.858:38:0,10:0,15:0,6,5,27
chr5	87502360	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.323:35:9,3:15,8:0,24,0,11
chr5	87503087	.	GACT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,8:0,0,0,18
chr5	88018388	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:2,2:2,1:4,1,3,0
chr5	88026151	.	CAACAGTTTA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=211,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.263:9:2,1:4,1:0,7,0,2
chr5	88045029	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	89689973	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,4:1,4:0,6,2,6
chr5	89705390	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=198,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:8,2:6,6:13,2,6,2
chr5	89769647	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:9,6:7,5:9,8,6,5
chr5	89781594	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr5	89815108	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:8,9:14,10:19,3,13,6
chr5	89913824	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=85,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr5	89918319	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=162,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr5	89918334	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=161,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr5	89924976	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr5	89930853	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=224,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.534:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr5	89933835	.	TTTTAC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=177,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr5	89933861	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.617:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	89938587	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,12,15
chr5	89954184	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=219,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr5	89968626	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	89971253	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,3:5,5:2,11,2,6
chr5	89977095	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr5	89977366	.	G	GAGAATGGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	89979380	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr5	89985612	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:10,0,2,0
chr5	89988412	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:8,10:5,6:8,6,13,3
chr5	89990545	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:3,7:7,8:1,9,1,14
chr5	89992710	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:1,7:7,6:6,2,11,2
chr5	89993045	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr5	90002220	.	C	CT,CTT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,24,35;MFRL=159,162,150;MMQ=60,60,60;MPOS=20,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=36.29,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,18,3:0.583,0.118:30:3,9,0:6,5,3:0,9,6,15
chr5	90002293	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=175,222;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,5:0,2:0,4,0,7
chr5	90007196	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,1,17
chr5	90012614	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	90015792	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	90016959	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr5	90020868	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=158.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,22:0,0,15,28
chr5	90021498	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.161:23:7,0:13,3:0|1:90021498_G_GT:90021498:2,18,1,2
chr5	90021499	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,20:0.692:29:3,7:6,12:0|1:90021498_G_GT:90021498:1,8,5,15
chr5	90041374	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=166,137;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:7,1,2,0
chr5	90052263	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=397,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:1,1,6,1
chr5	90052289	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,5:5,1,6,3
chr5	90053056	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=216,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr5	90059080	.	G	GTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,12;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:1,0:1,1:2,0,1,2
chr5	90079972	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=207,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr5	90261421	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=189,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	90449031	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,13,1
chr5	90669400	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,17,0
chr5	90671048	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=152,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:90671048_A_C:90671048:1,2,0,1
chr5	90671055	.	GATT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=164,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:90671048_A_C:90671048:0,3,0,1
chr5	90671062	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=164,216;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:90671048_A_C:90671048:0,3,0,1
chr5	90671274	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.513:37:7,10:11,9:15,3,18,1
chr5	90674462	.	G	A	.	.	DP=119;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,91;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:105,7:0.070:112:61,7:43,0:87,18,7,0
chr5	92923558	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=194,11;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,0:6,4:10,0,0,4
chr5	93077366	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	93077405	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	93111788	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,135;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:14,0:27,1,3,0
chr5	93294451	.	C	CA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:5,2:17,3:20,2,3,2
chr5	93388777	.	T	TATAG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=162,160;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=ATAG;STR;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,5:3,1:3,0,8,0
chr5	93788579	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=172,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,4:3,1:10,0,5,0
chr5	93788638	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.599:35:8,13:5,8:12,2,18,3
chr5	93800573	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,43;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:8,0:14,4:16,6,0,4
chr5	93807493	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=204,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,2:2,0:0|1:93807493_T_TG:93807493:0,2,1,1
chr5	93807494	.	T	TAACATAGTGTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=204,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,2:2,0:0|1:93807493_T_TG:93807493:0,2,1,1
chr5	93807498	.	G	GATACAAAATATAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=204,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:93807493_T_TG:93807493:0,2,0,1
chr5	93905243	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=148,96;MMQ=60,32;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,22:0.377:59:17,15:17,7:0|1:93905243_T_C:93905243:21,16,6,16
chr5	93905255	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=151,98;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,13:0.233:58:21,8:22,4:0|1:93905243_T_C:93905243:23,22,1,12
chr5	93905265	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=152,104;MMQ=60,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,9:0.179:54:21,4:22,3:0|1:93905243_T_C:93905243:21,24,0,9
chr5	93905269	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=152,109;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,7:0.154:50:20,3:21,3:0|1:93905243_T_C:93905243:21,22,0,7
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chr5	94006041	.	AT	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.149:24:10,1:10,2:0,21,0,3
chr5	94043353	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:2,4:5,0:0,8,0,4
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chr5	94727137	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,138;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:15,3:20,0:12,23,3,0
chr5	94805685	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=225,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.288:11:3,3:5,0:0,8,0,3
chr5	94826830	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=189,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.177:20:7,3:10,0:0,17,0,3
chr5	94834331	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=175,222;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:2,1:0,4,0,3
chr5	94901674	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr5	94903575	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.286:18:9,3:2,1:9,4,4,1
chr5	94956619	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	94956762	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=167,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr5	94990174	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr5	95011426	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr5	95018382	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.328:28:7,4:11,4:8,11,5,4
chr5	95119408	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	95224700	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.593:9:3,2:1,1:4,0,3,2
chr5	95732986	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr5	96062617	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.404:15:2,1:7,4:2,7,0,6
chr5	96066576	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.388:29:4,4:13,7:7,11,4,7
chr5	96066652	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:0,4,0,8
chr5	96078309	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:9,4:9,16:15,3,19,1
chr5	96078337	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=87.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,28:0.552:51:8,10:13,18:19,4,25,3
chr5	96093391	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:8,0:5,5:9,6,1,4
chr5	96093441	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr5	96097895	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=160,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,7:3,2:7,0,9,0
chr5	96101066	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr5	96101822	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:8,9:6,9:8,6,6,12
chr5	96112005	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=4047,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr5	96112083	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,4:7,6:7,2,8,2
chr5	96112284	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:0|1:96112284_A_T:96112284:0,6,0,4
chr5	96112295	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:2,0:3,2:0|1:96112284_A_T:96112284:0,5,0,3
chr5	96116112	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.442:16:5,7:4,0:9,0,7,0
chr5	96116286	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr5	96116660	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,7:3,3:9,0,10,0
chr5	96117300	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr5	96117555	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:0,2,0,10
chr5	96117579	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr5	96117599	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=192,388;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:96117599_T_C:96117599:0,4,0,1
chr5	96117600	.	AAGTATGT	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,23;MFRL=192,388;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:96117599_T_C:96117599:0,4,0,1
chr5	96117609	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=215,388;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:96117599_T_C:96117599:0,3,0,1
chr5	96119579	.	A	ACT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=79.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,5:0,0,17,2
chr5	96121715	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,242;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr5	96122260	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.523:29:6,6:6,8:5,9,4,11
chr5	96122281	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,4:4,4:2,6,1,8
chr5	96124447	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:96124447_G_C:96124447:0,0,0,1
chr5	96124449	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:96124447_G_C:96124447:0,0,0,1
chr5	96124453	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:96124447_G_C:96124447:0,0,0,1
chr5	96125910	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=85,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr5	96126197	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,1:4,5:9,0,4,2
chr5	96127905	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=96.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,4,22
chr5	96132795	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,4:4,1:9,0,5,0
chr5	96136525	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,3:1,6:5,1,9,0
chr5	96230858	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr5	96230883	.	A	ATT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=T;STR;TLOD=62.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,9:0,0,16,0
chr5	96232222	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=97.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.971:30:0,14:0,16:0,0,2,28
chr5	96232250	.	G	GAAA	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=127.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,11:0,18:0,0,2,28
chr5	96232286	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=72.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,7,14
chr5	96232345	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr5	96232402	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=110.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,15:0,15:0,0,31,2
chr5	96237413	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr5	96239294	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,5,14
chr5	96244585	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr5	96244638	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,12:0,0,21,3
chr5	96245514	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:0|1:96245514_G_A:96245514:2,12,0,2
chr5	96245518	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0|1:96245514_G_A:96245514:0,0,2,12
chr5	96271804	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:0,1:1,2:2,0,0,3
chr5	96321010	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=191,234;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:96321010_G_A:96321010:0,4,0,1
chr5	96321013	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=191,234;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:96321010_G_A:96321010:0,4,0,1
chr5	96321015	.	TGA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=223,234;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:96321010_G_A:96321010:0,3,0,1
chr5	96332085	.	TC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=99.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,18:0,15:0,0,18,15
chr5	96339102	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=121,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.762:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr5	96339273	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr5	96341750	.	T	TTA,TTATA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,28,26;MFRL=144,154,159;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=TA;STR;TLOD=25.94,16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,11,7:0.421,0.279:26:3,5,3:5,6,4:7,1,17,1
chr5	96342077	.	TAA	T,TA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,27,27;MFRL=171,197,160;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.67,47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,20:0.153,0.773:26:1,2,10:1,1,9:2,0,21,3
chr5	96342221	.	T	TAA	.	.	DP=59;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.071:54:22,0:24,3:0|1:96342221_T_TAA:96342221:13,38,0,3
chr5	96342222	.	TTG	T	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,3:0.070:55:25,0:23,3:0|1:96342221_T_TAA:96342221:13,39,0,3
chr5	96342227	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,3:0.073:53:22,0:24,3:0|1:96342221_T_TAA:96342221:13,37,0,3
chr5	96342232	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,3:0.073:53:22,0:24,3:0|1:96342221_T_TAA:96342221:11,39,0,3
chr5	96363407	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr5	96364063	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr5	96506826	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=204,159;MMQ=57,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr5	96508998	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:5,5:10,6:2,13,0,11
chr5	96514982	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	96518731	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:7,1:13,0,2,0
chr5	96518792	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.397:38:10,8:12,6:18,5,12,3
chr5	98115808	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=222,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:98115808_T_C:98115808:0,3,0,1
chr5	98115810	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=222,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:98115808_T_C:98115808:0,3,0,1
chr5	98115828	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=249,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	98199077	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.507:16:3,4:3,3:8,0,7,1
chr5	98210690	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:9,5:3,11:11,1,14,2
chr5	98216978	.	T	TGCGGGGGGGTGTTTTTG	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.110:46:14,2:27,2:14,27,5,0
chr5	98231837	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=195,219;MMQ=60,38;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr5	98236831	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.644:29:7,8:3,9:10,0,12,7
chr5	101574885	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=226,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr5	101574897	.	A	AT,ATT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30,30;MFRL=1858383,147,148;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=4.24,3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.398,0.299:7:1,1,0:1,2,2:2,0,5,0
chr5	101575183	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101575183_G_T:101575183:0,1,0,1
chr5	101575184	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101575183_G_T:101575183:0,1,0,1
chr5	101575186	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101575183_G_T:101575183:0,1,0,1
chr5	101592742	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:4,0,9,0
chr5	101592809	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:5,9:13,9:13,5,10,8
chr5	101595831	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=199,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr5	101595885	.	T	TGA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GA;STR;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:2,4:5,3:7,0,7,1
chr5	101596032	.	AAAAT	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.335:30:9,6:11,4:5,15,2,8
chr5	101596072	.	ATATAT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATAT;STR;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:5,2:6,2:0,12,0,4
chr5	101606518	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.646:18:2,6:4,5:2,4,3,9
chr5	101627027	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=116,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:4,3:5,0,7,0
chr5	101631526	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=228,248;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr5	101631592	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr5	101724307	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:9,0,4,0
chr5	101726648	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.656:30:1,13:9,7:10,0,18,2
chr5	101726851	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,7:5,0:0,7,0,7
chr5	101735313	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=162,139;MMQ=60,44;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:24,3:20,0:0|1:101735313_G_A:101735313:24,21,3,0
chr5	101735318	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,139;MMQ=60,44;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,3:0.078:49:24,3:17,0:0|1:101735313_G_A:101735313:25,21,3,0
chr5	101755430	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:7,0,5,0
chr5	101794275	.	A	ACAACCCCCCTCCTAATAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=140,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:101794275_A_ACAACCCCCCTCCTAATAC:101794275:0,4,0,1
chr5	101794279	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=140,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:101794275_A_ACAACCCCCCTCCTAATAC:101794275:0,4,0,1
chr5	101795490	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.462:17:7,2:1,4:1,8,2,6
chr5	101811346	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr5	101834469	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,1:2,7:0,8,2,7
chr5	101834486	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:3,14,0,2
chr5	102249546	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr5	102282472	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=202,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:4,1,7,0
chr5	102295504	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=186,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:4,1,1,1
chr5	102310166	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=128,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:1,3:1,2:0,2,1,5
chr5	102325878	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,1:1,0,4,0
chr5	102340782	.	GATTA	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=121.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,31:0.553:56:11,17:10,14:22,3,28,3
chr5	102360747	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	102363858	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:6,5:7,9:7,7,13,1
chr5	102364542	.	A	AAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:2,3:7,1,8,0
chr5	102489511	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.536:37:10,9:7,10:15,2,17,3
chr5	102494751	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr5	102537193	.	GT	G,GTT	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,32,32;MFRL=153,154,145;MMQ=60,60,60;MPOS=9,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.27,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:52,5,4:0.082,0.073:61:18,3,2:25,1,2:35,17,7,2
chr5	102537200	.	T	G	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=102.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,34:0.523:65:15,16:16,18:22,9,22,12
chr5	102537379	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,32:0.590:54:12,16:10,16:2,20,4,28
chr5	102613000	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:31,2:22,1:26,29,1,2
chr5	102886512	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr5	102890560	.	G	GA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,22:0.865:25:1,3:1,3:1,2,1,21
chr5	102890585	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,3:11,0:0,15,0,3
chr5	102891695	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,9,12
chr5	107703446	.	CAAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	108203451	.	G	GT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.174:26:10,0:10,2:19,3,2,2
chr5	108294979	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=118,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:8,7:9,4:12,5,7,4
chr5	108436014	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=180,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr5	108516629	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=83.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,27:0.903:29:2,14:0,12:0,2,2,25
chr5	108672863	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=183,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,1:9,1:21,0,2,0
chr5	108679870	.	T	TTTAA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTAA;STR;TLOD=83.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.470:47:6,6:19,14:14,11,12,10
chr5	108691738	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=184,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.753:14:2,4:1,7:0,3,0,11
chr5	108717157	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=200,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:7,0,7,0
chr5	108717488	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=218,280;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:108717488_T_A:108717488:0,1,0,1
chr5	108717495	.	T	TTGTTTTATGCCTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=218,280;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108717488_T_A:108717488:0,1,0,1
chr5	109049507	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.590:20:2,7:4,5:1,7,2,10
chr5	109125072	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr5	109152873	.	ATATATGTATATG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=TATATG;STR;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.898:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	109183341	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=113,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:6,5:8,6:10,4,7,4
chr5	109190935	.	TCTC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=165,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=57.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:6,7:6,10:5,9,7,10
chr5	109978164	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=224,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109978164_T_TAC:109978164:0,1,0,1
chr5	109978166	.	T	TCTGACAAAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=224,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109978164_T_TAC:109978164:0,1,0,1
chr5	110082153	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:4,4:7,3:0,12,0,7
chr5	110092480	.	AT	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=163,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.097:48:19,2:21,2:3,41,0,4
chr5	110407273	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.312:11:2,2:5,1:1,7,1,2
chr5	110430488	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr5	110438000	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,1:4,2:10,1,3,0
chr5	110448751	.	ATT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=51.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,16,0
chr5	111071106	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:5,2,6,1
chr5	111071297	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=253,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr5	111500816	.	C	CTAAAA	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAAA;STR;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.498:28:6,11:7,3:0,14,0,14
chr5	111500822	.	T	TAAA	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=43.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,14:0.484:29:12,7:3,7:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:0,15,0,14
chr5	111500824	.	T	TAC	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,14:0.484:29:12,7:2,7:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:0,15,0,14
chr5	111504479	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:14,7:5,7:7,15,9,6
chr5	111505885	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=226,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:2,0,5,0
chr5	111506751	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=186,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,1:0,4,0,5
chr5	112111309	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.322:20:5,1:9,5:12,2,5,1
chr5	112163779	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=178,153;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.236:10:4,1:4,1:0|1:112163779_T_TG:112163779:0,8,0,2
chr5	112163780	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=178,153;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.237:10:4,1:4,1:0|1:112163779_T_TG:112163779:0,8,0,2
chr5	112163785	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=176,138;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.357:9:4,1:2,1:0|1:112163785_G_T:112163785:0,6,0,3
chr5	112163791	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=182,136;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0|1:112163785_G_T:112163785:0,8,0,2
chr5	112176196	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.556:36:4,12:11,8:3,13,7,13
chr5	112176325	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,13,7
chr5	112196949	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=68.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,7:0,0,19,0
chr5	112200098	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=127.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,22:0,11:0,0,29,4
chr5	112312528	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=201,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.474:19:5,3:4,3:10,0,9,0
chr5	112312736	.	G	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,28:0.509:55:14,11:13,17:0,27,3,25
chr5	112321488	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:7,5:2,6:9,0,10,1
chr5	112343544	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,4:3,3:9,0,6,1
chr5	112346431	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.565:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr5	112364689	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:6,11:5,4:5,6,3,12
chr5	112384725	.	GGTCACTGGGCA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTCACTGGGCA;STR;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.503:24:3,7:4,4:11,1,9,3
chr5	112384868	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:15,0:18,3:18,15,3,0
chr5	112385004	.	CA	GC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.633:28:4,10:6,8:1,9,2,16
chr5	112385035	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.750:17:1,7:2,5:0,4,0,13
chr5	112385080	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=17,15;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:0,0:1,1:0,5,0,3
chr5	112389747	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr5	112399934	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:0,7,0,5
chr5	112406702	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:3,1,2,0
chr5	112406718	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr5	112406785	.	G	GCCTCGCGCTGTCTT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=157,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:3,4:2,3:3,2,5,2
chr5	112419919	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,105;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:4,3:0,9,0,3
chr5	112440142	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=204,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0,5,1,1
chr5	112487137	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.644:43:6,9:9,18:3,12,6,22
chr5	112676191	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,3:3,2:7,0,5,0
chr5	112851088	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.390:32:11,7:6,5:4,16,0,12
chr5	112851121	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:7,8:7,7:0,14,0,15
chr5	112884197	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=207,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,6:1,1:4,0,7,0
chr5	112891822	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:32,1:26,2:18,42,2,1
chr5	112901494	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr5	112903585	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:2,3:5,0:0,7,0,3
chr5	112920246	.	T	TAAAAGGATTATA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:6,1:1,1:0|1:112920246_T_TAAAAGGATTATA:112920246:0,7,0,2
chr5	112920248	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0|1:112920246_T_TAAAAGGATTATA:112920246:0,7,0,2
chr5	112926982	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=193,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:0,7,0,8
chr5	112927686	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,2:6,5:12,1,6,1
chr5	112927888	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.195:24:10,3:9,1:6,14,0,4
chr5	114462589	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr5	114462630	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=90,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,5:1,0:0,2,0,5
chr5	114482900	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,2:0.055:52:24,1:25,1:22,28,1,1
chr5	114515588	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,5:1,7:4,0,12,0
chr5	114611356	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,37;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,4:0,5,0,5
chr5	115167595	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr5	115177668	.	G	GAGGC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=197,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGGC;STR;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:8,9:7,3:14,1,12,0
chr5	115177706	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=26,18;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,12:0.309:37:10,5:11,1:0|1:115177706_A_C:115177706:15,10,12,0
chr5	115177713	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,11:0.252:41:7,4:15,0:0|1:115177706_A_C:115177706:17,13,11,0
chr5	115249078	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,198;MMQ=60,45;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:17,1:24,3:27,14,3,1
chr5	115249271	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,156;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:3,4:8,7:0,11,0,11
chr5	115298311	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=383,269;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr5	115339086	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,5,17
chr5	115351065	.	T	TATATATATATATATGGAACTAAGACTA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.296:18:8,2:4,3:3,10,1,4
chr5	115351150	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	115351224	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=217,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr5	115351498	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,8:0,0,0,16
chr5	115426746	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=173.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,25:0,23:0,0,36,12
chr5	115428439	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=64.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,0,21
chr5	115628133	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,17;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.259:13:4,0:5,0:7,2,4,0
chr5	115803310	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,2:4,8:5,3,7,3
chr5	115814496	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr5	115827356	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,14:0,0,21,0
chr5	115827407	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=124.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,20:0,0,35,2
chr5	115831092	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.492:37:4,9:12,9:12,7,14,4
chr5	115831305	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr5	115838117	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,3:0,2:0,0,0,7
chr5	118465215	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr5	118500980	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:9,3:6,0:10,5,0,3
chr5	118513246	.	C	CTG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:7,7:7,6:0,14,0,13
chr5	118513265	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:6,6:6,4:0,12,0,10
chr5	118532034	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,3:5,3:9,4,5,1
chr5	118552690	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=183,63;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,0:16,2:4,25,0,2
chr5	118556350	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,9:0,9:0,0,1,17
chr5	118576096	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=65,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.458:7:1,2:3,0:3,1,2,1
chr5	118691693	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=192,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,6:5,5:10,0,11,0
chr5	118691737	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,8:6,4:12,2,9,3
chr5	118691888	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=165,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.292:28:7,4:13,3:4,16,1,7
chr5	118691929	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr5	118788196	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.428:49:14,8:14,12:23,5,18,3
chr5	118809533	.	CCA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=196,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:2,3:2,2:7,0,5,0
chr5	118811313	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,7:6,5:13,0,12,0
chr5	118813240	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=91.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,31:0.422:75:15,22:22,9:13,31,8,23
chr5	118832436	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=195,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,0:6,2:0,14,0,2
chr5	118837658	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=171,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,3:6,7:10,0,8,2
chr5	118837834	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,6:4,2:2,4,2,6
chr5	118862971	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.346:38:15,5:9,6:1,24,0,13
chr5	118867173	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr5	118877552	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.219:23:7,0:3,1:16,2,5,0
chr5	118877678	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:24,0:20,3:19,28,0,3
chr5	118965609	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=160,166;MMQ=51,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,1,3
chr5	118965623	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,42;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	118968423	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:0,2:8,5:5,3,6,1
chr5	118968604	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,5:6,2:3,5,4,3
chr5	121187795	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=199,235;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:2,1,1,0
chr5	121310079	.	T	TTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121310079_T_TTG:121310079:0,0,0,1
chr5	121310084	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121310079_T_TTG:121310079:0,0,0,1
chr5	121330223	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,21:0,0,28,4
chr5	121362852	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:11,2:9,1:5,19,0,3
chr5	121726714	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr5	122131082	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,4,21
chr5	122137708	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=158.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,26:0,17:0,0,4,40
chr5	122152520	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,0:0,0,5,0
chr5	122161961	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=42.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr5	122165209	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr5	122281709	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=195,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.513:23:4,4:7,7:11,0,10,2
chr5	122343366	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=153,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.278:20:4,0:5,0:8,7,5,0
chr5	122359502	.	A	AAC,AACACAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30,32;MFRL=115,195,210;MMQ=60,60,42;MPOS=8,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,18;RU=AC;STR;TLOD=5.02,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.409,0.254:5:0,1,1:2,1,0:2,0,3,0
chr5	122372402	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr5	122435293	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	122506394	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,3:3,0:12,0,3,0
chr5	122682154	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,20,0
chr5	122685801	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=89.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,8,20
chr5	122718617	.	T	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,2:0.044:66:22,2:42,0:26,38,1,1
chr5	122720923	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	122728913	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr5	122754293	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.514:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	122888781	.	A	AT	.	.	DP=135;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,5:0.055:103:51,1:47,2:63,35,3,2
chr5	122911673	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:20,1:23,2:13,30,0,3
chr5	122924101	.	AT	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.140:49:21,5:16,2:24,18,5,2
chr5	122940378	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=168,294;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:19,4:17,0:36,0,4,0
chr5	123973701	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=179,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr5	123973735	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=144,212;MMQ=44,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	123984763	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=173.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,26:0,23:0,0,6,43
chr5	123985443	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.357:29:6,4:12,6:1,18,1,9
chr5	123985464	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=212,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:3,3:10,5:0,13,0,8
chr5	123985484	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr5	125802122	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr5	125809072	.	TA	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.170:45:24,4:10,2:3,35,0,7
chr5	125809145	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,3:4,6:0,6,0,9
chr5	125819317	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,16;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:125819317_C_A:125819317:0,4,0,1
chr5	125819318	.	C	CTTTTAGACTTTTTTTTCTTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:125819317_C_A:125819317:0,4,0,1
chr5	125819329	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=181,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:125819329_C_T:125819329:0,3,0,1
chr5	125819331	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=181,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:125819329_C_T:125819329:0,3,0,1
chr5	125819338	.	A	ATGGGC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:125819329_C_T:125819329:0,2,0,1
chr5	125819339	.	A	ATGGGC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	125887685	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr5	125887856	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=129,200;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr5	125896918	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=189,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr5	125898831	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr5	125898834	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr5	125915843	.	AA	TG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=166,198;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,2:5,0:0,16,0,2
chr5	125944219	.	G	GTGTTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TGTTTT;STR;TLOD=39.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,3:0,4:0,0,1,8
chr5	125967404	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,4:4,4:10,1,4,4
chr5	125971699	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:1,2:6,7:5,2,6,3
chr5	126140689	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=198,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr5	126145835	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,215;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:12,3:7,0:14,5,3,0
chr5	126156531	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	126156551	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	126156553	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,15;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:126156553_G_T:126156553:3,0,1,0
chr5	126156559	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:126156553_G_T:126156553:3,0,1,0
chr5	126156761	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:20,0:11,2:12,19,0,2
chr5	126674941	.	GT	AA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,32;MMQ=60,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:10,2:1,20,1,1
chr5	126734267	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	126734295	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	126734365	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,13:0,0,19,4
chr5	126753528	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=173,87;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:1,1:0|1:126753528_A_C:126753528:0,3,0,1
chr5	126753531	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=173,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:126753528_A_C:126753528:0,3,0,1
chr5	126770556	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	126776623	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,2,6
chr5	126792762	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr5	126792771	.	TA	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,10;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:3,1,1,0
chr5	126887310	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=201,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,3:8,0:11,0,0,3
chr5	126994381	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr5	127488339	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=183,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:24,0,2,0
chr5	127488351	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=188,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:21,1,2,0
chr5	127507322	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,181;MMQ=60,43;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:14,1,2,0
chr5	127522153	.	GT	G,GTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,35,33;MFRL=149,197,167;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.69,17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,7:0.230,0.619:10:0,2,4:1,0,3:1,0,8,1
chr5	127522166	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:2,0:7,0:9,2,5,0
chr5	127613791	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	127622983	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr5	127640783	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,7:0,17:0,0,3,23
chr5	127640861	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr5	127680042	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:6,4,2,1
chr5	127680234	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:127680234_C_T:127680234:2,1,0,1
chr5	127680240	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:127680234_C_T:127680234:2,1,0,1
chr5	127680244	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:127680234_C_T:127680234:1,0,0,1
chr5	127855152	.	GTTAAA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.581:17:4,4:3,6:0,7,1,9
chr5	128301742	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:3,2:2,1:5,1,3,0
chr5	128301824	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,7:4,3:6,4,7,3
chr5	128324434	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.109:44:23,0:15,4:18,22,0,4
chr5	128351823	.	TA	CG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=159,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.216:13:5,0:4,3:0,10,1,2
chr5	128351837	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:6,1:1,3:0,8,0,4
chr5	128359247	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	128359297	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=198,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr5	129015668	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr5	129072943	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,2,14
chr5	129244122	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.971:30:0,14:0,14:0,0,1,29
chr5	129244133	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,0,24
chr5	129519874	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,15,1
chr5	130498228	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:6,0,6,0
chr5	130500751	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.416:20:7,3:3,5:7,5,5,3
chr5	130808198	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	130815300	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=165,122;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:21,0:19,2:13,27,0,2
chr5	130815304	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=163,122;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:18,1:19,3:10,27,0,4
chr5	130831365	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=14,35;MFRL=126,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=146.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,39:0.973:40:0,23:0,16:1,0,18,21
chr5	130857217	.	GA	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:20,2:15,1:3,33,0,3
chr5	130928202	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.343:29:8,5:11,3:0,19,0,10
chr5	130939025	.	T	TA	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.081:57:24,2:26,1:9,44,0,4
chr5	130982768	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=146.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,21:0,20:0,0,26,15
chr5	131006082	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	131006356	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=127.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,22:0,17:0,0,9,31
chr5	131006381	.	T	TA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.272:23:7,1:7,2:0,17,0,6
chr5	131014801	.	C	T	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,3:0.042:93:49,0:40,3:43,47,0,3
chr5	131066577	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=106.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0,0,28,2
chr5	131298470	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131298470_G_A:131298470:0,1,0,1
chr5	131298472	.	C	CTGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131298470_G_A:131298470:0,1,0,1
chr5	131309088	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:1,11,1,1
chr5	131312238	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr5	131321159	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,6:3,6:3,3,6,6
chr5	131322585	.	TTC	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.144:18:8,2:6,0:6,10,1,1
chr5	131322666	.	CCACACACTCACACA	C,CCACACACACTCACACA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,35,32;MFRL=0,201,146;MMQ=60,60,24;MPOS=24,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.30,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.523,0.334:3:0,0,1:0,2,0:0,0,0,3
chr5	131322676	.	A	AACTGACCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=175,180;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.605:3:0,2:1,0:0|1:131322676_A_AACTGACCC:131322676:0,1,0,2
chr5	131322678	.	A	ACCTCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=175,180;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.605:3:0,2:1,0:0|1:131322676_A_AACTGACCC:131322676:0,1,0,2
chr5	131322681	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,25;MFRL=201,146;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:0,1:2,0:0|1:131322676_A_AACTGACCC:131322676:0,2,0,1
chr5	131324250	.	C	CTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TG;STR;TLOD=57.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr5	131325888	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,3,5
chr5	131326522	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,4:0,0,3,2
chr5	131330001	.	G	GAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=219,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:3,1:0,0:0|1:131330001_G_GAA:131330001:0,3,0,1
chr5	131330002	.	T	TGAGGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=219,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:0,0:0|1:131330001_G_GAA:131330001:0,3,0,1
chr5	131330003	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=219,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:131330001_G_GAA:131330001:0,3,0,1
chr5	131347520	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	131534499	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,11,3
chr5	131546280	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr5	131553428	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,15:0,0,18,7
chr5	131606747	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:12,0:21,4:12,22,0,4
chr5	131607402	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=105.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,18:0,0,29,1
chr5	131630852	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=14,33;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=112.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.949:32:0,17:0,13:1,0,24,7
chr5	131658085	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr5	131660119	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr5	131671769	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	131719999	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,7:0,11:0,0,4,15
chr5	131729317	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,12431170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.092:31:18,2:8,0:27,2,1,1
chr5	131730052	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr5	131755477	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr5	131792639	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=185,259;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:0,7:1,4:1,0,11,0
chr5	131796163	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	131796573	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	131821520	.	G	GAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=16,32;MFRL=229,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AC;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.726:5:0,4:0,0:0,1,0,4
chr5	131892979	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=132.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,20:0,19:0,0,33,8
chr5	131915213	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:7,2:5,14:4,8,3,13
chr5	131927550	.	AT	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,2:13,1:24,6,3,0
chr5	131930652	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:15,1:17,1:18,14,0,2
chr5	131972916	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=116.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,40:0.473:85:25,22:19,18:16,29,18,22
chr5	131995843	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,6:0,0,12,3
chr5	132009710	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0,0,16,3
chr5	132018132	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr5	132018169	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,10,3
chr5	132036252	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=124.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,18:0,0,31,5
chr5	132042007	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr5	132044738	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	132046590	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,14:0,0,25,2
chr5	132061907	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:15,0:17,4:10,22,0,4
chr5	132069847	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,9:0,0,14,1
chr5	132070242	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr5	132098420	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.921:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr5	132109742	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	132109966	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr5	132149684	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr5	132150769	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=190,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,2:13,1:15,8,2,1
chr5	132159520	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr5	132160057	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:2,2:9,4:7,4,4,3
chr5	132161699	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=126,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:2,1:1,4:2,1,3,2
chr5	132198287	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	132218950	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=155,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr5	132219304	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:5,2:1,3:0,7,1,4
chr5	132224678	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=180,211;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:18,0,2,0
chr5	132232251	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:4,10,0,2
chr5	132234152	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr5	132234702	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:3,7:5,4:9,0,9,2
chr5	132239939	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.474:19:7,5:2,2:10,0,9,0
chr5	132240151	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:5,7:9,9:1,13,3,13
chr5	132267850	.	A	AT	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=94.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,43:0.586:73:15,18:15,22:0|1:132267850_A_AT:132267850:19,11,27,16
chr5	132267859	.	A	T	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=162.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,45:0.554:81:17,22:18,22:0|1:132267850_A_AT:132267850:24,12,27,18
chr5	132334252	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr5	132387979	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=197,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.596:15:4,5:1,4:4,2,5,4
chr5	132388068	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr5	132403057	.	T	TA,TAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26,28;MFRL=136,147,152;MMQ=60,60,60;MPOS=20,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=26.56,6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,12,4:0.624,0.235:18:1,6,3:1,6,1:1,1,14,2
chr5	132403341	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,11:0,0,0,16
chr5	132408905	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=50,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.854:11:1,3:0,6:1,1,9,0
chr5	132409074	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr5	132409650	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,6:0,0,14,3
chr5	132409867	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:0,9,0,5
chr5	132409904	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:1,4:2,0:0,3,0,4
chr5	132412299	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,5,0
chr5	132422448	.	TTTTTG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTG;STR;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,5:2,1:6,0,5,1
chr5	132428498	.	GTTTTTT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=36,13;MFRL=163,146;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=32,26;RU=T;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.717:4:1,0:0,0:1,0,0,3
chr5	132431998	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=134,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,6:2,3:0,5,0,9
chr5	132437613	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,19,19;MFRL=0,166,137;MMQ=60,40,40;MPOS=14,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,21,22;RU=T;STR;TLOD=4.00,6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.458,0.456:6:0,0,0:0,1,1:0,0,0,6
chr5	132545994	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,2:5,1:2,12,0,3
chr5	132648331	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.553:25:3,5:8,8:9,2,9,5
chr5	132902989	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:132902989_T_C:132902989:0,3,0,1
chr5	132902991	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:132902989_T_C:132902989:0,3,0,1
chr5	133327875	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=171,147;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,1:13,1:20,0,2,0
chr5	133327915	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.498:48:7,9:17,14:24,0,24,0
chr5	133328560	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:6,11:2,6:7,1,16,1
chr5	133450964	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=15,11;MFRL=209,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.279:8:0,0:1,0:0|1:133450964_A_C:133450964:6,0,2,0
chr5	133450970	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=207,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.247:9:2,0:3,0:0|1:133450964_A_C:133450964:6,1,2,0
chr5	133450972	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,11;MFRL=207,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.247:9:2,0:5,0:0|1:133450964_A_C:133450964:6,1,2,0
chr5	133477938	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.303:23:8,0:7,1:2,14,7,0
chr5	133477942	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.152:21:9,0:6,0:4,14,3,0
chr5	133537438	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr5	133537479	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,4:0,0,12,0
chr5	133561589	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr5	133657610	.	G	GA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.425:31:10,5:8,8:9,9,4,9
chr5	133707164	.	T	TCGGCGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=244,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=CGG;STR;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr5	133707247	.	CT	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,7:0.145:54:10,3:27,4:42,5,6,1
chr5	133873577	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:5,0,4,1
chr5	133896744	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	133898136	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,241;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,2:5,3:1,6,0,5
chr5	133900111	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,13:0,0,23,0
chr5	133902288	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr5	133909475	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.339:18:9,3:3,2:3,9,1,5
chr5	134011834	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=23,26,31,19;MFRL=162,164,126,160;MMQ=60,60,60,40;MPOS=24,24,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.62,3.84,11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,3,3,7:0.123,0.129,0.286:25:9,3,3,1:1,0,0,2:2,10,0,13
chr5	134033777	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	134033797	.	G	GGTGCAATTGGCAGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	134102588	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:5,3:3,0:9,0,3,0
chr5	134102812	.	CTT	C,CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34,32;MFRL=190,188,191;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.87,5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.273,0.373:8:1,1,3:2,1,0:0,3,0,5
chr5	134106506	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.389:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr5	134109602	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:4,7:9,6:0,13,1,12
chr5	134164284	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=185,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr5	134192176	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=220,237;MMQ=49,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr5	134192330	.	CAAAT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,161;MMQ=54,47;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AAAT;STR;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.634:14:2,4:3,5:4,1,9,0
chr5	134332240	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=194,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr5	134343661	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:8,5:4,7:9,3,8,4
chr5	134344497	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:3,1:4,3:7,0,5,0
chr5	134346304	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=188,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr5	134365070	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.424:17:5,4:4,3:0,10,0,7
chr5	134365091	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:0,10,0,3
chr5	134366873	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=247,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.652:6:1,3:0,1:2,0,4,0
chr5	134688831	.	A	ACAATCCAATTACTGAGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,16;MFRL=156,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0,3,0,1
chr5	134705884	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:1,0:0,9,0,2
chr5	134781992	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=188,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,6:6,5:10,0,9,2
chr5	134782013	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=179,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,7:7,3:11,1,8,2
chr5	134914350	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.683:14:1,4:3,4:1,3,5,5
chr5	135170658	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:7,4:4,13:0,11,1,16
chr5	135178231	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr5	135186075	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:4,4,2,1
chr5	135188214	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr5	135276201	.	AGTT	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=175.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.979:42:0,17:0,25:0,0,26,16
chr5	135276701	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=114.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,20:0,13:0,0,23,10
chr5	135277394	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	135283222	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:7,1:3,5:0,11,0,6
chr5	135369592	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.663:25:7,10:1,5:0,8,2,15
chr5	135396452	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:4,6:7,5:0|1:135396452_A_G:135396452:11,1,10,2
chr5	135396468	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=184,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.486:27:5,7:6,6:0|1:135396452_A_G:135396452:12,2,11,2
chr5	135396635	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=159,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.050:77:31,0:41,3:27,47,1,2
chr5	135396669	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.548:49:5,13:17,13:4,18,6,21
chr5	135398279	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,7:4,4:6,2,8,3
chr5	135489891	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr5	135496820	.	CA	C,CAA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=34,35,33;MFRL=151,172,171;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.71,30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,6,15:0.167,0.456:33:4,2,5:6,4,7:2,10,0,21
chr5	135496895	.	TATA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=157,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATA;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr5	135498944	.	AT	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:8,8:5,8:13,2,16,0
chr5	135508381	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:2,3:8,2:3,9,0,5
chr5	135510033	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.446:25:7,7:7,4:9,5,9,2
chr5	135513085	.	T	TC	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=217.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,31:0,24:0,0,29,28
chr5	135549378	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	135561058	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:6,8:4,5:1,10,6,7
chr5	135561133	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=181,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	135583253	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,141;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:20,4:13,0:17,16,4,0
chr5	135651243	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=35.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:6,8:9,5:11,4,9,4
chr5	135692743	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=205,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:2,2:1,5:1,2,6,2
chr5	136315200	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	136315206	.	C	CAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=78,146;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr5	136320758	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr5	136328367	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	136969637	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,2:0,0:3,0,2,0
chr5	136969953	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=239,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr5	136975687	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:4,3:1,5,0,4
chr5	137027953	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,10:0,0,18,6
chr5	137034169	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=79,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr5	137216524	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:19,1:23,2:18,26,1,2
chr5	137223172	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr5	137241856	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,4:5,0,5,4
chr5	137257288	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr5	137259251	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr5	137261612	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=127,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:9,7,0,2
chr5	137281708	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,7:2,2:0,4,2,7
chr5	137281917	.	C	T	.	.	DP=121;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,6:0.059:115:51,2:55,4:67,42,6,0
chr5	137290115	.	GG	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137290115_GG_AT:137290115:0,0,0,1
chr5	137290123	.	AGTC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137290115_GG_AT:137290115:0,0,0,1
chr5	137290127	.	A	ACT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137290115_GG_AT:137290115:0,0,0,1
chr5	137292095	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=151,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr5	137292133	.	C	CA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,4:6,7:13,1,9,3
chr5	137295823	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,22:0.426:52:14,12:16,10:17,13,14,8
chr5	137323117	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:7,7:6,8:12,1,13,2
chr5	137347396	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=165,189;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:3,1:7,1:11,0,2,0
chr5	137347398	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=167,175;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:2,2:8,1:10,0,3,0
chr5	137347403	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.556:14:4,1:2,5:6,0,8,0
chr5	137354851	.	CA	C,CAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35,20;MFRL=178,164,215;MMQ=60,60,60;MPOS=15,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=19.31,11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,8:0.392,0.417:19:2,2,2:1,6,2:0,3,0,16
chr5	137419725	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=217,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.501:12:1,3:3,3:0|1:137419725_A_G:137419725:6,0,5,1
chr5	137419728	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=174,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,6:0.403:15:5,2:4,3:1|0:137419725_A_G:137419725:8,1,6,0
chr5	137420376	.	TG	CG,CA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,27,34;MFRL=0,160,164;MMQ=60,60,60;MPOS=14,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.99,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.630,0.247:5:0,0,0:0,3,1:0,0,0,5
chr5	137420383	.	TGC	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr5	137420386	.	A	ATT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,28;MFRL=160,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:137420386_A_ATT:137420386:0,2,0,1
chr5	137420389	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=160,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:137420386_A_ATT:137420386:0,2,0,1
chr5	137420393	.	G	GTGTTATTCTTCT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=160,134;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:137420386_A_ATT:137420386:0,2,0,1
chr5	137420409	.	T	TGTAGATGTGTGTATGTGTAG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr5	137423671	.	TGA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=111,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:137423671_TGA_T:137423671:0,2,0,1
chr5	137423676	.	G	GGCCTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=111,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:137423671_TGA_T:137423671:0,2,0,1
chr5	137426768	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,0:2,4:0,5,1,3
chr5	137454451	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:1,3:18,0:0|1:137454451_A_G:137454451:19,0,3,0
chr5	137454461	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:1,3:16,0:0|1:137454451_A_G:137454451:18,0,3,0
chr5	137464110	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,1:7,1:8,3,2,0
chr5	137485292	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,9:0,0,17,2
chr5	137486426	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=271,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.665:7:2,3:0,1:2,0,3,2
chr5	137495345	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=150,261;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.135:28:14,0:7,3:9,16,0,3
chr5	137495363	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=164,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,3:7,0:1,17,0,3
chr5	137498740	.	A	AGGAAGAAAGAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,2:0,0,7,0
chr5	137506862	.	GA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:5,1:7,1:3,15,0,3
chr5	137507104	.	TAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.770:6:0,3:1,2:0,1,1,4
chr5	137517354	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,16:0.354:46:12,8:17,8:17,13,9,7
chr5	137520181	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:7,2:15,0:13,9,1,1
chr5	137527917	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=177,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr5	137600133	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=162,69;MMQ=60,52;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.071:54:22,0:26,3:0|1:137600133_A_G:137600133:14,37,1,2
chr5	137600134	.	AT	A	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=162,69;MMQ=60,52;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.071:54:22,0:27,3:0|1:137600133_A_G:137600133:14,37,1,2
chr5	137622388	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr5	137622413	.	G	GTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr5	137661434	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=234,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr5	137661761	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:18,0:11,4:10,19,0,4
chr5	137680967	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=159,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:19,2:15,0:12,24,1,1
chr5	137708434	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.513:45:12,18:9,5:8,14,18,5
chr5	137733790	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	137735754	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=193,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:2,7:8,5:0,10,0,12
chr5	137763615	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:4,1,5,0
chr5	137763798	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:2,5:9,11:4,7,3,13
chr5	137802404	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.469:28:4,7:10,6:11,4,13,0
chr5	137844274	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=321,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,9:1,7:1,0,16,0
chr5	137846155	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	137847078	.	TACACACACAC	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=201,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,1;RU=AC;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:5,1:4,1:0|1:137847078_TACACACACAC_T:137847078:16,1,2,0
chr5	137847082	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,18:0.950:18:0,11:0,5:1|0:137847078_TACACACACAC_T:137847078:0,0,18,0
chr5	137847086	.	CACACAT	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=216,203;MMQ=56,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.507:10:3,4:2,0:5,0,5,0
chr5	137847088	.	CACAT	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=194,202;MMQ=60,58;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.812:8:2,4:0,0:2,0,6,0
chr5	137897174	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,4,0
chr5	137902868	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:3,4:5,4:0,10,0,9
chr5	137903084	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:13,4:10,4:19,4,8,0
chr5	137909357	.	AGCGC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:0,1:4,0,1,0
chr5	137909674	.	GAGA	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.407:30:9,6:8,6:16,2,11,1
chr5	138147943	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.384:32:11,7:8,5:7,13,4,8
chr5	138160187	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,190;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:2,3:10,0:13,0,3,0
chr5	138283168	.	A	AGTACAGGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=176,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:5,0:3,7,1,1
chr5	138356775	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=98.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,18:0,10:0,0,28,0
chr5	138463538	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.506:43:10,10:11,10:6,15,5,17
chr5	138643062	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=113,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:0,6:1,11:1,0,17,0
chr5	138652881	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.216:15:5,0:7,2:0,12,0,3
chr5	138654813	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=181,196;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:14,0:5,2:0,19,0,2
chr5	138661396	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=178,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:12,0:20,3:0,33,0,3
chr5	138707995	.	C	CTGTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr5	138724126	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=52.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,12,5
chr5	138732558	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,87;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:25,3:28,0:22,32,3,0
chr5	138764329	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:3,12,1,1
chr5	138775173	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.462:42:11,9:8,10:0,23,1,18
chr5	138857919	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0|1:138857919_T_C:138857919:0,0,9,3
chr5	138857925	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:0|1:138857919_T_C:138857919:6,2,4,0
chr5	138941317	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138941317_T_TG:138941317:0,0,1,0
chr5	138941322	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:138941317_T_TG:138941317:0,0,1,0
chr5	138941327	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:138941317_T_TG:138941317:0,0,1,0
chr5	138941328	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,16;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:138941317_T_TG:138941317:0,0,1,0
chr5	138941333	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138941317_T_TG:138941317:0,0,1,0
chr5	138941339	.	GT	CA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=23,12;MFRL=139,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:138941317_T_TG:138941317:1,0,1,0
chr5	138941345	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=143,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:138941317_T_TG:138941317:2,0,1,0
chr5	139201382	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	139202400	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:5,8:4,6:0,9,2,12
chr5	139213452	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	139215386	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,3:4,2:4,4,4,2
chr5	139216901	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,0,12
chr5	139239515	.	C	CG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=123,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=63.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.636:31:5,9:5,8:7,4,15,5
chr5	139245086	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:8,5:9,1:10,8,4,2
chr5	139251469	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:0,9,0,5
chr5	139260428	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:3,5:5,4:5,4,8,1
chr5	139494773	.	TAC	T	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.055:50:22,0:19,2:38,10,2,0
chr5	139494846	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=141;ECNT=2;MBQ=27,29,28,26;MFRL=147,146,144,130;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,9,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=6.34,23.65,21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:58,6,21,20:0.057,0.189,0.187:105:32,4,11,8:25,2,9,10:43,15,25,22
chr5	139496174	.	TC	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=73.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.529:49:9,8:13,18:10,13,15,11
chr5	139496404	.	TAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=102,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:1,1:1,0:2,0,1,1
chr5	139506574	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:11,6:4,7:6,9,6,7
chr5	139742641	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,156;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.096:50:22,0:21,4:11,35,0,4
chr5	139876046	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,25;MFRL=227,156;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr5	139907750	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:2,1:7,2,3,0
chr5	139940323	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,1:6,2:2,8,1,2
chr5	140012531	.	GGCA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCA;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:4,0:8,2:9,4,0,2
chr5	140023076	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=228,25522605;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:8,0,2,0
chr5	140024115	.	TTGTG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:6,4:5,2:16,0,5,1
chr5	140024491	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr5	140027216	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr5	140027623	.	GTGTGTGTATGTA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr5	140037272	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,4:0,12:0,0,1,15
chr5	140041960	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=148,154;MMQ=52,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:2,2:11,7:1,12,2,7
chr5	140051983	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,6,4
chr5	140052271	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,46;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	140054257	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,7:9,3:8,4,7,3
chr5	140054485	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,4:0,0,1,5
chr5	140057216	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.445:34:8,6:11,9:10,9,9,6
chr5	140057657	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,3:4,3:0,6,0,7
chr5	140073883	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.430:33:9,8:9,6:3,16,6,8
chr5	140075011	.	C	CAGTTGATAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,7:0,0,16,0
chr5	140077699	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=105.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,16:0,0,3,27
chr5	140081791	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr5	140174837	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,208;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:24,4:21,0:27,19,4,0
chr5	140181796	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,2:11,0:7,11,1,1
chr5	140182819	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,7:4,5:10,2,9,3
chr5	140230370	.	AA	CC	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=313.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,72:0.974:73:0,38:1,30:0,1,36,36
chr5	140231972	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=191,174;MMQ=44,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,1:4,0:0,17,0,2
chr5	140232470	.	AT	A,ATT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=26,30,31;MFRL=160,126,69;MMQ=60,60,60;MPOS=22,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=6.44,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,6,4:0.158,0.127:36:18,5,2:6,1,1:12,14,7,3
chr5	140233616	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=247,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140233616_A_T:140233616:0,1,0,1
chr5	140233618	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=247,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140233616_A_T:140233616:0,1,0,1
chr5	140237513	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=161,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:8,0:2,14,1,1
chr5	140237548	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,6:0,9:0,0,6,10
chr5	140250212	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,167;MMQ=60,46;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,1:9,2:2,18,1,2
chr5	140261885	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=161,60;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.082:58:24,0:25,4:33,21,1,3
chr5	140474756	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:3,10:6,8:3,6,2,16
chr5	140476060	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=197,198;MMQ=34,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:0,4,0,8
chr5	140476894	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:5,6:4,6:2,7,5,8
chr5	140476905	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,5:4,6:1,7,6,6
chr5	140476939	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.530:19:4,4:4,6:1,8,3,7
chr5	140477040	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	140480179	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr5	140480355	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.419:41:10,12:14,5:6,18,7,10
chr5	140480369	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=148,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:15,2:12,0:8,20,0,2
chr5	140480578	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:9,5:2,4:6,6,5,4
chr5	140481478	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,0:14,2:8,13,1,1
chr5	140481594	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=194,151;MMQ=47,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:2,2,1,3
chr5	140481833	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=151,170;MMQ=56,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:0|1:140481833_A_G:140481833:3,6,0,3
chr5	140481841	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=163,156;MMQ=56,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:4,1:4,1:0|1:140481833_A_G:140481833:2,7,0,2
chr5	140481913	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=170,187;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,1,2
chr5	140482691	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:4,4:2,2:0,6,0,8
chr5	140502486	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,1:9,1:16,7,1,1
chr5	140502717	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,262;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:7,0:8,8,0,3
chr5	140502841	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=170,139;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.569:28:7,9:4,6:9,3,4,12
chr5	140517174	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,48;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,17,2
chr5	140517210	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=166,154;MMQ=49,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:7,6:5,7:8,4,11,2
chr5	140553856	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:5,4,1,2
chr5	140565046	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=183,191;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:1,0:0,5,0,2
chr5	140565974	.	G	GA,A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=17,16,28;MFRL=169,126,66;MMQ=60,60,56;MPOS=20,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.73,3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.359,0.190:7:0,0,1:1,0,1:0,3,0,4
chr5	140568034	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=49.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,9,5
chr5	140568272	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,200;MMQ=46,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,0:15,2:7,21,0,2
chr5	140589457	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,139;MMQ=59,43;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,2:13,0:8,10,2,0
chr5	140591702	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.489:45:9,9:14,13:4,19,5,17
chr5	140595375	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=212,174;MMQ=43,44;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:1,2,0,5
chr5	140595655	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	140598326	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr5	140604715	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=172,129;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:4,2:1,4:0|1:140604715_G_A:140604715:0,5,0,6
chr5	140604721	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=133,172;MMQ=46,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,5:0.461:11:1,4:5,1:1|0:140604715_G_A:140604715:0,6,0,5
chr5	140625062	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	140625085	.	C	CAAGGATCCGTGCCAGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140625085_C_CAAGGATCCGTGCCAGT:140625085:3,0,0,1
chr5	140625089	.	CG	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140625085_C_CAAGGATCCGTGCCAGT:140625085:3,0,0,1
chr5	140625092	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140625085_C_CAAGGATCCGTGCCAGT:140625085:3,0,0,1
chr5	140626767	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=173,139;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.471:31:7,9:7,2:1,15,0,15
chr5	140626790	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=164,141;MMQ=50,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:3,7:9,2:0,13,0,9
chr5	140711895	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:18,2:19,0:0|1:140711895_C_G:140711895:11,28,0,2
chr5	140711897	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:18,2:20,0:0|1:140711895_C_G:140711895:11,28,0,2
chr5	140712459	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=177,8439;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:23,1:18,2:28,16,3,0
chr5	140744686	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:8,12,2,0
chr5	140756050	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:2,2:9,2:3,8,2,2
chr5	140767991	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,6:2,4:2,4,7,3
chr5	140768795	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:8,0:13,2:13,8,2,0
chr5	140772687	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:5,7:6,6:5,6,2,11
chr5	140773019	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.517:47:14,14:6,10:14,9,13,11
chr5	140774975	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140774975_T_G:140774975:0,0,0,1
chr5	140774979	.	T	TTTTAGTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140774975_T_G:140774975:0,0,0,1
chr5	140779354	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:3,5:5,3:7,2,3,5
chr5	140784942	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:15,2:7,1:5,18,3,0
chr5	140785078	.	CCAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:140785078_CCAAA_C:140785078:0,0,0,2
chr5	140785090	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140785078_CCAAA_C:140785078:0,0,0,1
chr5	140803029	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,2:11,1:14,10,1,2
chr5	140866301	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,2:8,0:11,3,1,1
chr5	140890412	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,88;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:9,0,2,0
chr5	140955777	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,30:0.563:53:12,13:11,16:16,7,23,7
chr5	140966854	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=151,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr5	141016075	.	G	GCCCCCCCC	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,15;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,12;RU=C;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.208:29:8,2:14,1:10,13,6,0
chr5	141016087	.	AA	CC	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.117:41:10,1:18,2:18,18,5,0
chr5	141016276	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=207.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,26:0,25:0,0,30,26
chr5	141016288	.	T	G	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=169,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,28:0.469:60:14,16:17,12:13,19,16,12
chr5	141019239	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,10;MFRL=193,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.183:23:7,0:7,0:5,14,0,4
chr5	141019274	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,5:3,2:0,4,1,6
chr5	141020100	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,2:4,1:4,7,0,3
chr5	141023723	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=210,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.499:14:4,5:2,2:0|1:141023723_T_C:141023723:6,1,6,1
chr5	141023733	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=185,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:8,5:3,1:0|1:141023723_T_C:141023723:8,3,4,2
chr5	141024048	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=195,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:0,2:5,1:3,2,2,1
chr5	141024136	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,4:5,11:9,1,13,2
chr5	141024569	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.143:40:14,0:12,0:12,23,5,0
chr5	141026884	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.433:30:12,7:5,5:7,10,7,6
chr5	141027505	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=159,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:15,4:12,0:26,2,4,0
chr5	141029165	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,19;MFRL=211,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:141029165_A_C:141029165:0,1,2,0
chr5	141029171	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=211,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:141029165_A_C:141029165:0,1,2,0
chr5	141029201	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	141035374	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:6,5:7,1:4,10,2,4
chr5	141041435	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=200,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr5	141044472	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.429:45:13,10:11,9:9,17,3,16
chr5	141049407	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:9,10:5,3:5,9,5,8
chr5	141051555	.	GGTGTGAGGGT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=181,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GTGTGAGGGT;STR;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.484:11:1,1:2,4:0,6,1,4
chr5	141051750	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=164,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.114:49:28,1:16,4:31,13,2,3
chr5	141304888	.	ATT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=178,207;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:0|1:141304888_ATT_A:141304888:11,0,2,0
chr5	141304892	.	T	TTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=178,207;MMQ=60,41;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:0|1:141304888_ATT_A:141304888:11,0,2,0
chr5	141313833	.	G	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:26,0:28,3:19,36,0,3
chr5	141314058	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:6,4:6,8:7,5,4,8
chr5	141318178	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,1:10,1:12,11,1,1
chr5	141324955	.	C	CCTGCTGCTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=CTG;STR;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:4,4:0,2:4,1,7,1
chr5	141363151	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=149,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.130:35:17,4:14,0:2,29,1,3
chr5	141364511	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,12:0,0,7,18
chr5	141367202	.	GA	TT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,8:0,0,19,0
chr5	141387520	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=155,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr5	141511525	.	TA	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.204:37:12,0:16,7:1,29,1,6
chr5	141520013	.	CAA	C,CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=168,185,153;MMQ=40,47,49;MPOS=25,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=6.49,8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,4:0.253,0.349:12:1,0,2:4,3,2:5,0,7,0
chr5	141694437	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.298:20:8,1:6,3:12,2,6,0
chr5	141975067	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:8,5:5,4:4,9,2,7
chr5	142393562	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr5	142416741	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=97.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,16:0,0,13,15
chr5	142421218	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=177,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:21,2:13,1:8,27,0,3
chr5	142421287	.	GAA	G,GA,GAAAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,36,37,22;MFRL=0,156,159,183;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,26,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=19,17,18,21;RU=A;STR;TLOD=3.60,5.39,5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,3,3,2:0.307,0.328,0.289:8:0,3,3,1:0,0,0,0:0,0,7,1
chr5	142437636	.	ATTATATGTTCTTATGCTCATCAAGAACAAACAAAAATATGTTGTGGGT	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,8:0.081:54:14,5:21,2:3,43,2,6
chr5	142500579	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:24,4:16,0:15,27,4,0
chr5	142513686	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,3,21
chr5	142586694	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.443:34:13,9:5,5:16,3,13,2
chr5	142593687	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=160,349327;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142593687_G_A:142593687:3,0,1,0
chr5	142593689	.	G	GCAGACAGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,349327;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:142593687_G_A:142593687:3,0,1,0
chr5	142662342	.	CTTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=16,22;MFRL=69,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.457:7:0,0:1,3:1,3,0,3
chr5	143200067	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:16,2:11,0:12,15,2,0
chr5	143853695	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=133,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:1,0:1,1:1,2,0,1
chr5	145144419	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr5	145199430	.	AG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=101.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,24,3
chr5	145199686	.	GTTTTT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,7;RU=T;STR;TLOD=43.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.926:10:0,10:0,0:0,0,0,10
chr5	145483713	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr5	145500157	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr5	145508457	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=219,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:2,0:4,5:0|1:145508457_T_C:145508457:2,4,2,3
chr5	145508471	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=209,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,0:4,5:0|1:145508457_T_C:145508457:3,2,2,3
chr5	145508688	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:0,3:3,4:1,4,1,6
chr5	145509573	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.476:40:13,9:8,10:17,4,12,7
chr5	145512378	.	AAG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0|1:145512378_AAG_A:145512378:7,0,3,0
chr5	145512390	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,1:3,2:0|1:145512378_AAG_A:145512378:9,0,6,0
chr5	145515346	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr5	145522912	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr5	145532859	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:6,1:0,3:0|1:145532859_T_C:145532859:0,6,0,5
chr5	145532876	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0|1:145532859_T_C:145532859:0,4,0,4
chr5	145533418	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,24:0.625:38:3,13:11,11:6,8,11,13
chr5	145538924	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.426:45:10,7:16,12:21,5,16,3
chr5	145539123	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr5	145557046	.	AAT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AT;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.795:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr5	145562143	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:6,8:5,6:1,10,0,14
chr5	145640215	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:5,0,5,2
chr5	145643048	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:7,2,3,0
chr5	145647151	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.485:33:13,9:4,7:16,1,16,0
chr5	145647187	.	CT	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.183:36:16,5:11,1:30,0,4,2
chr5	145647199	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=16,18;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.210:36:7,1:4,0:21,8,7,0
chr5	145648826	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,129;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.060:65:33,3:29,0:31,31,3,0
chr5	145650689	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=176,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,1:12,1:0,25,0,2
chr5	145650701	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=171,126;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:10,2:0,22,0,2
chr5	145650712	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=173,158;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,0:9,3:0,20,0,3
chr5	145838440	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=149.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,22:0,23:0,0,29,18
chr5	145851163	.	AT	A,ATT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,27,25;MFRL=145,143,166;MMQ=60,60,47;MPOS=21,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=14.55,5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,9,4:0.399,0.208:21:6,5,1:1,4,1:2,6,2,11
chr5	145895377	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=160,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:3,2:12,0:8,7,1,1
chr5	145895394	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,3:5,6:3,3,4,5
chr5	146030055	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr5	146435163	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.365:12:2,2:4,2:7,1,4,0
chr5	146657584	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	146657838	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr5	146659056	.	GGT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146659056_GGT_G:146659056:0,1,0,1
chr5	146659059	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146659056_GGT_G:146659056:0,1,0,1
chr5	146728149	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr5	146773714	.	GA	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:11,2:11,1:3,25,0,4
chr5	147012186	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:0,5:6,4:6,0,9,1
chr5	147015704	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=14,26;MFRL=176,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.337:7:2,0:0,2:0|1:147015704_A_T:147015704:5,0,2,0
chr5	147015729	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:0|1:147015704_A_T:147015704:11,1,2,0
chr5	147019114	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=84,244;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	147019335	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:1,6:3,2:0,5,2,7
chr5	147020419	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=189,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr5	147021229	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,1:10,1:11,4,1,1
chr5	147484465	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.189:24:7,2:10,2:17,3,4,0
chr5	147516470	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,14:0,0,22,5
chr5	147554997	.	TTTTTTCC	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.516:33:10,7:4,9:3,13,6,11
chr5	147555029	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:3,8:4,7:1,6,2,13
chr5	147784182	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:7,0,8,0
chr5	147785802	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,29,30,32;MFRL=167,155,188,183;MMQ=60,60,60,60;MPOS=9,15,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.32,6.53,9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:26,4,5,7:0.106,0.130,0.167:42:8,0,0,4:17,4,5,2:19,7,14,2
chr5	148207633	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,27:0.498:54:13,12:12,14:5,22,7,20
chr5	148207667	.	C	CCG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.615:24:4,9:5,6:0,9,0,15
chr5	148521680	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.171:39:17,0:15,6:18,15,0,6
chr5	148521799	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,10:0,0,1,17
chr5	148562981	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:10,8:6,9:14,2,15,2
chr5	148580025	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:3,4:11,3:0,14,0,7
chr5	148590321	.	A	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.094:51:23,4:24,0:29,18,4,0
chr5	148590423	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.392:34:9,6:10,7:3,18,1,12
chr5	148610276	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:5,5:4,9:2,7,4,10
chr5	148618708	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.510:20:4,4:4,6:10,0,10,0
chr5	148618749	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.496:24:8,4:3,5:0|1:148618749_C_T:148618749:9,3,10,2
chr5	148618752	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,12:0.481:25:8,5:4,6:0|1:148618749_C_T:148618749:10,3,10,2
chr5	148618964	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,1:0,1:0,3,0,2
chr5	148620224	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,3:7,1:9,3,4,0
chr5	148625972	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,2:2,8:7,0,9,1
chr5	148627252	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr5	148627503	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.465:19:5,4:5,3:3,7,1,8
chr5	148679301	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	148682188	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr5	148889392	.	TT	CC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=178,142;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:10,5,2,0
chr5	148989312	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=83.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0|1:148989312_A_G:148989312:0,0,2,18
chr5	148989320	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.896:17:1,9:0,7:0|1:148989312_A_G:148989312:0,1,0,16
chr5	148997686	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=191.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.983:58:0,28:0,29:0,0,44,14
chr5	149006837	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,10:0,6:0,0,1,15
chr5	149006879	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr5	149216399	.	ACAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAG;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr5	149247435	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=262,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	149294595	.	CTT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=156,117;MMQ=55,45;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=T;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:2,0:0,1:1,1,0,2
chr5	149324193	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:2,17,0,2
chr5	149384610	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=198,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:1,5,0,9
chr5	149389573	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=257,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:5,0,4,0
chr5	149406733	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=200,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:2,0:1,2:0,4,0,3
chr5	149410448	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,0:13,3:2,23,0,3
chr5	149417138	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.624:11:2,1:1,5:0,4,0,7
chr5	149424966	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr5	149427387	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr5	149431223	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	149431259	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	149433596	.	TG	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,2:4,9:7,4,8,3
chr5	149433857	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=213,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:2,5,2,2
chr5	149437190	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,4:3,2:2,8,0,6
chr5	149439494	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=214,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr5	149449779	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=179,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:10,0:8,7,1,1
chr5	149452793	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr5	149456811	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.478:25:6,3:7,8:9,4,11,1
chr5	149497107	.	G	A,C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=16,30,12;MFRL=95,176,257;MMQ=33,40,60;MPOS=18,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.38,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.298,0.246:4:1,0,0:0,1,0:2,0,2,0
chr5	149497177	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.425:24:7,7:5,2:7,7,5,5
chr5	149509270	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	149513072	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=215,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,2:1,2:2,0,4,0
chr5	149515074	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=205,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr5	149516480	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	149562996	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=193,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:10,0,4,0
chr5	149576233	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=211,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr5	149576273	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:3,2:0,3:3,0,4,2
chr5	149578797	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:10,0,2,0
chr5	149578999	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:0,7,0,2
chr5	149583436	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,14;MFRL=90,219;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:4,0:5,0:3,7,2,0
chr5	149584082	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:21,3:21,0:23,19,1,2
chr5	149584341	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr5	149584506	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr5	149584969	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr5	149584981	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,28;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,2:0,1:0,1,2,1
chr5	149602222	.	GAC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,5:0,2:3,1,5,2
chr5	149602363	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:5,3:0,0:1,5,0,3
chr5	149602425	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:1,1:1,2,0,3
chr5	149602824	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr5	149624901	.	G	GCCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=226,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=CCT;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.478:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	149627423	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=159,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:3,3:3,5,2,2
chr5	149629683	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	149631413	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=126.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,20:0,14:0,0,15,20
chr5	149636073	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr5	149636109	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr5	149676958	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.084:56:26,4:26,0:24,28,2,2
chr5	149737221	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	149901373	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=214,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	149914401	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,12:0,0,20,4
chr5	149914611	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=161,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.274:18:5,0:8,3:1,12,1,4
chr5	149914631	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,1:3,8:0,5,0,9
chr5	149921251	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,6:4,2:2,7,0,8
chr5	149929162	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr5	149929214	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=178,237;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,2:10,0:11,4,2,0
chr5	149931222	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=193,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr5	150036746	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=219,240;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	150051254	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,10;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.218:21:11,0:4,0:6,10,0,5
chr5	150051267	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=19,12;MFRL=207,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.411:14:2,1:2,0:3,5,0,6
chr5	150072693	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,3:0,2:0,4,2,3
chr5	150078956	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=214,172;MMQ=45,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:4,4:0,2:0,4,0,6
chr5	150098028	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=246,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr5	150110683	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.489:35:11,7:6,10:8,10,4,13
chr5	150135952	.	GA	G,GAA	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,33,30;MFRL=157,162,183;MMQ=60,60,60;MPOS=4,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=4.19,4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:50,4,4:0.077,0.081:58:21,1,3:27,3,0:34,16,4,4
chr5	150136068	.	G	GA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=16,18;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.115:40:4,0:6,0:3,33,0,4
chr5	150282674	.	A	AT	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.127:44:19,3:18,1:23,16,3,2
chr5	150407456	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,10,10
chr5	150410219	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,5:6,9:7,3,11,3
chr5	150413406	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,10:0,0,0,19
chr5	150415098	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:6,5:3,0:8,1,3,2
chr5	150415338	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=168,98;MMQ=60,44;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,1:1,0:0,2,1,1
chr5	150416339	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=150,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:25,3:19,0:35,10,2,1
chr5	150429514	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=181,154;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:3,0:8,2:0,11,0,2
chr5	150498981	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,2:0,6:0,3,1,7
chr5	150503784	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.468:24:5,9:6,2:10,3,10,1
chr5	150506104	.	AACACACACAC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,9;RU=AC;STR;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.608:5:1,2:1,0:0,2,0,3
chr5	150512589	.	G	GAAAAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:5,1,8,0
chr5	150518358	.	AG	GA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=72.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,2,15
chr5	150518392	.	G	GGAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=211,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAA;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr5	150518892	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:10,3:4,1:11,3,3,1
chr5	150519670	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,7:7,4:12,0,7,4
chr5	150564975	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,2:5,2:11,1,2,2
chr5	150565008	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:10,5:10,7:16,4,7,5
chr5	150565724	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:0,4,2,6
chr5	150565770	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	150567049	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr5	150581106	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:14,0:10,3:21,3,3,0
chr5	150581210	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:12,0:4,16,0,2
chr5	150632676	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,0:1,1:5,0,2,0
chr5	150639224	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr5	150646780	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=220,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,9:3,1:6,0,10,0
chr5	150660769	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,13:0.424:31:7,6:10,6:0|1:150660769_A_G:150660769:3,15,2,11
chr5	150660794	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=197,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:2,4:8,5:0|1:150660769_A_G:150660769:2,9,0,9
chr5	150663565	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,3:6,4:12,1,6,1
chr5	150663779	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=35,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:3,1:2,8,1,2
chr5	150682975	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr5	150683005	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr5	150696301	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=91,137;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=23,24;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:150696301_C_CA:150696301:1,1,1,0
chr5	150696325	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=36,33;MFRL=94,159;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr5	150696328	.	ATC	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=94,137;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,1:1,0:0|1:150696301_C_CA:150696301:1,1,1,0
chr5	150696333	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,19;MFRL=94,137;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,0:1,0:0|1:150696333_T_G:150696333:1,1,1,0
chr5	150696335	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=94,137;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:150696333_T_G:150696333:1,1,1,0
chr5	150696750	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=223,169;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr5	150704758	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr5	150722573	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,70;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:3,1:11,1:4,10,1,1
chr5	150838293	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=209,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:4,1,3,0
chr5	150843996	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr5	150846935	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr5	150847505	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.408:25:2,5:12,4:0|1:150847505_T_C:150847505:0,15,1,9
chr5	150847509	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=181,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:2,6:10,3:0|1:150847505_T_C:150847505:0,14,1,9
chr5	150847554	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=202,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,1:0,2,0,5
chr5	150853193	.	CTTTTGCTTTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=103,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTGCTTTG;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.679:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr5	150853412	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	150856107	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,4:4,2:7,1,4,2
chr5	150859151	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr5	150887184	.	G	GAGA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.475:19:2,4:7,5:0|1:150887184_G_GAGA:150887184:1,9,1,8
chr5	150887200	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:0|1:150887184_G_GAGA:150887184:0,6,0,6
chr5	150891663	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:4,2,5,0
chr5	150906963	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.458:29:10,8:4,5:3,13,2,11
chr5	150907741	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:0,1,0,7
chr5	150917545	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,2:3,5:0,8,0,7
chr5	150921805	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr5	150923310	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:3,13:9,2:2,10,6,9
chr5	150947162	.	A	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=131.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,45:0.630:71:12,20:14,25:14,12,24,21
chr5	150947719	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=173,126;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.431:19:5,4:5,4:4,7,4,4
chr5	150948537	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr5	151043213	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:3,7,1,3
chr5	151046928	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,5:6,1:11,0,6,0
chr5	151049404	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:0,6,0,8
chr5	151052659	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:4,9:9,1:12,1,8,2
chr5	151054137	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,8:5,4:8,4,8,4
chr5	151180450	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=123,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,8:0.170:38:11,3:6,1:0|1:151180450_G_T:151180450:10,20,0,8
chr5	151180451	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=15,15;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,8:0.365:21:2,1:2,1:1|0:151180450_G_T:151180450:1,12,1,7
chr5	153029852	.	ACTGT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGT;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	153035525	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	153085668	.	T	TTTTGTTTG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TTTG;STR;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.288:11:5,2:3,1:0,8,0,3
chr5	153085694	.	T	TGTCCTCC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:10,0:4,2:0,14,0,2
chr5	153150066	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=153,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr5	153174310	.	GA	G,GAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=18,34,33;MFRL=159,136,116;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=5.15,4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.234,0.234:14:1,1,1:2,1,1:0,8,1,5
chr5	153372502	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:14,7,1,1
chr5	153372525	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:8,5:5,10:9,4,8,7
chr5	153406644	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=209,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr5	153406966	.	A	ATATTTTCTAAAGACTGAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=210,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	153414545	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:0,4,0,6
chr5	153429187	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=162,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr5	153432450	.	A	AT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.430:28:6,8:10,4:15,1,10,2
chr5	153434018	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=146,188;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:9,4:8,9:8,9,6,7
chr5	153436554	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.479:27:8,8:5,4:9,5,5,8
chr5	153674536	.	TTGTGTGTG	T,TTG,TTGTG	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,29,14,32;MFRL=0,179,174,180;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,25,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,12,13,14;RU=TG;STR;TLOD=8.89,23.87,15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,4,9,6:0.219,0.444,0.303:19:0,2,1,1:0,1,3,3:0,0,0,19
chr5	153709043	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr5	153760287	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,0,5
chr5	153789078	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,3:2,7:3,1,5,5
chr5	153792634	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=116,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr5	153795274	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=181,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,5:4,4:8,0,9,0
chr5	154191107	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,239;MMQ=60,35;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:19,0:21,2:19,21,0,2
chr5	154193735	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,0,16
chr5	154242882	.	T	TCA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=161,136;MMQ=60,36;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:14,2:18,0:22,14,2,0
chr5	154271391	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	154275962	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,5:0,3:0,3,0,8
chr5	154278888	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=131.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,19:0,20:0,0,8,31
chr5	154282551	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr5	154287115	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr5	154291219	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	154291496	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,3,13
chr5	154296795	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=147,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:0,2,1,5
chr5	154308282	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr5	154308307	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	154311235	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	154311576	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	155771421	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.250:13:5,1:5,2:8,2,2,1
chr5	155771773	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr5	156074654	.	TAAATTGA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr5	156186326	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,1:8,1:4,7,0,2
chr5	156349309	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:156349309_C_T:156349309:0,3,0,1
chr5	156349312	.	A	ACTTCTCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:156349309_C_T:156349309:0,3,0,1
chr5	156349321	.	A	AAAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156349321_A_AAAAT:156349321:0,1,0,1
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chr5	156381370	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,0:1,3:1,1,3,0
chr5	156390280	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:4,1:1,6,0,2
chr5	156390297	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr5	156464212	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr5	156464468	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=250,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr5	156475962	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:9,0,3,0
chr5	156479323	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=180,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:2,2:4,4:6,0,7,0
chr5	156479424	.	A	C	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=164.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,22:0,25:0,0,35,13
chr5	156479443	.	CTTG	C	.	.	DP=59;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTG;STR;TLOD=79.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,23:0.453:51:11,14:14,9:18,10,16,7
chr5	156479509	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=264.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,34:0,38:0,0,35,42
chr5	156479557	.	GTTGGAACAGTCGTCA	G	.	.	DP=96;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=105.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,30:0.442:69:7,12:16,18:18,21,8,22
chr5	156479568	.	C	CGTT	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.983:48:0,15:0,28:0,0,24,24
chr5	156531836	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.312:6:3,0:0,1:0|1:156531836_A_T:156531836:0,5,0,1
chr5	156531837	.	A	ACTAGTTTGCTCATACTGTGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:156531836_A_T:156531836:0,3,0,1
chr5	156531843	.	AAAT	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156531843_AAAT_A:156531843:0,1,0,1
chr5	156531849	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156531843_AAAT_A:156531843:0,1,0,1
chr5	156531852	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156531843_AAAT_A:156531843:0,1,0,1
chr5	156636096	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=164,184;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:10,0:1,2:0,11,0,2
chr5	156644775	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr5	156679576	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr5	156721863	.	T	TC	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=137.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,43:0.941:45:1,16:1,26:1,1,14,29
chr5	156738830	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,7:4,5:1,11,0,12
chr5	156742186	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr5	156747614	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=188,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:5,2:0,0:5,0,2,0
chr5	156747632	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=179,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:8,3:0,3:7,1,7,0
chr5	156747669	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,5:2,2:5,2,7,0
chr5	156753284	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:0,0:9,3:2,7,3,0
chr5	156765981	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=152,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:5,0,2,0
chr5	156766037	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,8:7,6:11,2,11,3
chr5	156766273	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,2:1,8:2,1,4,6
chr5	156770379	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:14,1:16,1:14,16,2,0
chr5	156786168	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=115,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.786:26:1,11:4,10:2,3,5,16
chr5	156887133	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.391:16:7,3:2,3:8,2,5,1
chr5	156898754	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:7,3:8,13:7,8,9,7
chr5	156898899	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr5	156899290	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	156899869	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,13:0,10:0,0,1,22
chr5	156916037	.	C	CAAAAAGAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAAGAA;STR;TLOD=62.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.606:26:2,4:7,6:7,3,14,2
chr5	156918987	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=210,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr5	156926688	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=190,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.280:24:3,0:7,0:3,14,0,7
chr5	156936549	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,0,18
chr5	156957741	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr5	156991352	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.521:27:7,6:5,8:11,2,12,2
chr5	157053271	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:3,2:8,0,1,1
chr5	157075943	.	TAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=193,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr5	157102063	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=126,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.646:15:3,6:2,3:4,1,8,2
chr5	157106785	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:9,0,7,0
chr5	157106968	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.502:44:11,11:10,11:11,11,10,12
chr5	157158372	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=153,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.487:14:4,2:3,3:7,0,7,0
chr5	157158414	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:11,4:5,4:14,2,7,1
chr5	157158439	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.456:35:14,8:5,6:13,6,11,5
chr5	157164889	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,11:0,0,17,5
chr5	157178592	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=71.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,12:0,8:0,0,1,19
chr5	157180930	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:3,3:5,0,6,0
chr5	157180959	.	AAAT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAT;STR;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.341:13:3,3:5,1:7,2,4,0
chr5	157181779	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr5	157233120	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:16,0:13,3:1,31,0,3
chr5	158126222	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:4,4:6,1:1,16,1,5
chr5	158126230	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,1:14,1:2,25,0,2
chr5	158140222	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr5	158204347	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr5	158511592	.	AAAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:158511592_AAAG_A:158511592:4,0,1,0
chr5	158511596	.	A	ACC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:158511592_AAAG_A:158511592:4,0,1,0
chr5	158522577	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,8:0,0,13,4
chr5	158526269	.	CAGCTG	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:158526269_CAGCTG_C:158526269:0,0,1,0
chr5	158526276	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=158,257;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:158526269_CAGCTG_C:158526269:1,0,1,0
chr5	158526283	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=199,257;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:158526269_CAGCTG_C:158526269:2,0,1,0
chr5	158526285	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,13;MFRL=199,257;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:158526269_CAGCTG_C:158526269:2,0,1,0
chr5	158526289	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=158,257;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:158526269_CAGCTG_C:158526269:3,0,1,0
chr5	158526295	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=158,257;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:158526269_CAGCTG_C:158526269:3,0,1,0
chr5	158526534	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=10,15;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.717:20:1,3:0,4:0,5,2,13
chr5	158588633	.	GAAAAA	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=A;STR;TLOD=141.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.974:32:0,14:0,15:0,0,2,30
chr5	158589858	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,7:5,5:8,0,12,0
chr5	158600921	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:7,8:9,10:16,0,18,0
chr5	158697481	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=127.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,18:0,0,7,28
chr5	158697712	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=209,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:1,1:5,2:0,7,0,3
chr5	158710419	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=125.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,23:0,13:0,0,1,36
chr5	158750387	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	159478089	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.838:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr5	159478112	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=158,99;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:3,4:3,0:6,1,4,0
chr5	159640652	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,3:1,3:1,1,6,0
chr5	159661754	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,68;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr5	159665523	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=97.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,15:0,7:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,22,0
chr5	159665527	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=104.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,15:0,7:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,24,0
chr5	159665534	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=99.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,14:0,8:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,22,1
chr5	159665726	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=176.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,43:0.978:43:0,23:0,18:0|1:159665726_C_T:159665726:0,0,0,43
chr5	159665733	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=166.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,16:0,17:0|1:159665726_C_T:159665726:0,0,0,39
chr5	159682777	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=214,255;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,4:1,0:0,1,0,5
chr5	159686378	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr5	159831664	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=185,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,1,3
chr5	159833437	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=158,175;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:9,5:9,0:15,3,5,0
chr5	159835173	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:3,2,1,5
chr5	159839530	.	T	TAAAAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=18,23;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,19;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:0,0:0,1:0,1,0,4
chr5	159839545	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr5	159840688	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr5	159840700	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=248,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr5	159849991	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=200,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr5	159851211	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=91.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,16:0,8:0,0,23,1
chr5	159912418	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,3:4,3:1,3,3,4
chr5	160031145	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=194,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr5	160043071	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=99,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr5	160044855	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:5,5:5,10:7,3,13,2
chr5	160047265	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr5	160049355	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,2:3,4:5,0,6,0
chr5	160049685	.	T	TCCTTTCCTTAAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160049685_T_TCCTTTCCTTAAC:160049685:0,0,0,1
chr5	160049688	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160049685_T_TCCTTTCCTTAAC:160049685:0,0,0,1
chr5	160049691	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160049685_T_TCCTTTCCTTAAC:160049685:0,0,0,1
chr5	160049693	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=276,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:160049685_T_TCCTTTCCTTAAC:160049685:0,1,0,1
chr5	160063134	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,30;MFRL=165,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr5	160097429	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	160097453	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr5	160753549	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=92,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:160753549_A_T:160753549:0,2,0,1
chr5	160753551	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=92,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:160753549_A_T:160753549:0,2,0,1
chr5	160763821	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,18;MFRL=120,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.476:9:1,0:2,1:0,5,0,4
chr5	161119125	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,16,5
chr5	161128857	.	C	CGGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=213,336;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:161128857_C_CGGGG:161128857:0,1,0,1
chr5	161128858	.	T	TTTCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=213,336;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:161128857_C_CGGGG:161128857:0,1,0,1
chr5	161178532	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:9,2:12,1:10,12,2,1
chr5	161281245	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.622:24:5,7:3,8:6,3,12,3
chr5	161292685	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.597:23:5,7:4,6:7,2,11,3
chr5	161302728	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=206,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.711:11:1,4:1,4:0,3,0,8
chr5	161309752	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:1,1:4,2:0,6,0,3
chr5	161322652	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.291:12:3,3:5,0:9,0,3,0
chr5	161322889	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,4:5,5:1,7,0,9
chr5	161494990	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr5	161576418	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	161580208	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,7:0.154:50:19,7:23,0:28,15,7,0
chr5	162866548	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,5:5,4:1,10,1,8
chr5	162866617	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=210,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	162866620	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=213,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:162866620_T_TAC:162866620:0,2,0,1
chr5	162866623	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=213,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:162866620_T_TAC:162866620:0,2,0,1
chr5	162866624	.	TTC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=213,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:162866620_T_TAC:162866620:0,2,0,1
chr5	162887650	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.411:32:6,9:12,4:14,5,9,4
chr5	162896856	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,3:2,8:2,3,3,9
chr5	162902707	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:6,5:3,8:0,9,0,13
chr5	162909716	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,44:0.567:78:13,17:21,25:16,18,24,20
chr5	162909955	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=232,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,1:1,6:2,1,7,0
chr5	162910199	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.422:38:12,7:10,8:12,10,5,11
chr5	162910438	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.457:31:7,6:9,8:0,17,1,13
chr5	162917425	.	T	TA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:15,1:15,2:19,11,2,1
chr5	162932822	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=190,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,32:0.594:55:9,15:8,17:0,23,0,32
chr5	162938940	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,1:4,5:9,2,5,1
chr5	162940739	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,13:0,0,14,16
chr5	162944709	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:3,7:7,9:2,8,1,15
chr5	162945387	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28,19,19;MFRL=206,197,186,193;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,12,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,11,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.52,3.17,3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,2,2,2:0.231,0.229,0.229:9:1,1,0,0:2,1,0,0:0,3,0,6
chr5	167379580	.	CT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:15,1:11,1:20,10,1,1
chr5	167489049	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:1,2:7,0,5,0
chr5	167517505	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=215,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:6,0,5,0
chr5	167622107	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr5	167625771	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=225,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr5	167630841	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:2,9,0,2
chr5	167653364	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:1,6,0,7
chr5	167824840	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:3,3:3,3:0,7,2,4
chr5	167851168	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,6:4,4:0,7,0,10
chr5	167868930	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:3,3:3,1:0,6,0,4
chr5	167871661	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr5	167891668	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,7:8,5:14,0,10,2
chr5	167913603	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,2:0,6:0,0,0,10
chr5	167919623	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	167921047	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr5	167921720	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=19,37;MFRL=212,161;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:167921720_T_C:167921720:0,3,0,1
chr5	167921722	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,13;MFRL=212,161;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:167921720_T_C:167921720:0,3,0,1
chr5	167921729	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=212,161;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:167921720_T_C:167921720:0,3,0,1
chr5	167921735	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=212,161;MMQ=60,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:167921720_T_C:167921720:0,3,0,1
chr5	167921744	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=225,161;MMQ=60,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:167921720_T_C:167921720:0,4,0,1
chr5	167921755	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=238,187;MMQ=60,35;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	167933673	.	C	CT,CTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33,34;MFRL=195,171,89;MMQ=60,60,59;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.05,4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,2:0.207,0.191:14:4,1,1:2,1,1:7,3,4,0
chr5	167933685	.	C	A,G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,10,19;MFRL=179,171,89;MMQ=60,60,59;MPOS=32,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.49,4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,2:0.169,0.165:17:5,0,0:3,0,0:9,4,4,0
chr5	167984721	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	168111016	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:9,9,0,2
chr5	168112707	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=209,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:6,9:1,2:6,1,7,4
chr5	168123340	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,236;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:20,1:19,2:15,24,3,0
chr5	168149868	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:13,0,2,0
chr5	168175205	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	168187760	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	168188048	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr5	168189501	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.519:26:6,5:5,3:10,2,10,4
chr5	168195356	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:1,1:1,2:0,3,0,4
chr5	168212951	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,10,8
chr5	168216651	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:8,2:6,15,0,2
chr5	168233589	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=151,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:7,2,0,2
chr5	168250350	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,11:0.444:25:6,6:6,5:0|1:168250350_C_G:168250350:6,8,2,9
chr5	168250357	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.120:23:10,0:11,2:1|0:168250350_C_G:168250350:6,15,0,2
chr5	168620435	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.410:22:6,4:7,4:9,4,6,3
chr5	169020337	.	CT	C,CTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=165,125,197;MMQ=60,60,60;MPOS=23,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.37,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,4,3:0.161,0.148:24:9,1,0:7,3,2:16,1,6,1
chr5	169028299	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,3:0.053:73:37,0:33,3:37,33,0,3
chr5	169096207	.	T	TAAAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=115,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAAC;STR;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:4,1,5,1
chr5	169097474	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	169097505	.	T	TTTTTA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTA;STR;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,4:3,4:3,0,9,0
chr5	169098265	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=154,243;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr5	169122803	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:2,4:12,4:7,7,6,2
chr5	169138909	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,8,5
chr5	169139079	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,0:10,2:0|1:169139079_G_A:169139079:9,7,0,2
chr5	169139081	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,0:10,2:0|1:169139079_G_A:169139079:9,7,0,2
chr5	169229995	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr5	169291267	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=117,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:1,3:9,4:7,3,4,3
chr5	169310887	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:0|1:169310887_T_C:169310887:3,5,0,3
chr5	169310891	.	T	TTTTTTTTGCAAAGAAGCAAATAAGTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,37;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:0|1:169310887_T_C:169310887:3,5,0,3
chr5	169454831	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=164,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:4,4:7,3:0|1:169454831_G_A:169454831:9,2,8,0
chr5	169454833	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=164,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:3,4:7,4:0|1:169454831_G_A:169454831:9,2,8,0
chr5	169461399	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.340:13:3,2:4,2:7,2,4,0
chr5	169461547	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,1:2,1:7,6,1,1
chr5	169468243	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr5	169468929	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=229,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,0:5,5:11,0,4,1
chr5	169472765	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr5	169496051	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=230,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr5	169507130	.	TTG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:6,0:12,0,2,0
chr5	169508750	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:169508750_T_C:169508750:0,0,1,0
chr5	169508758	.	T	TGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:169508750_T_C:169508750:0,0,1,0
chr5	169509929	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	169532994	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.310:24:5,0:6,2:8,8,8,0
chr5	169675693	.	AT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.559:41:10,4:7,18:10,8,10,13
chr5	169677676	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,4:4,1:5,2,5,0
chr5	169679354	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr5	169680306	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=214,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,4:1,1,0,8
chr5	169686007	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	169689604	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,7:6,8:10,0,12,3
chr5	169697707	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:9,6:7,7:12,4,12,1
chr5	169715121	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=205,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr5	169805629	.	TG	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	169806001	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:1,4,0,5
chr5	169812303	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=132,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,3:3,5:1,2,6,2
chr5	169812420	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=157,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:3,2:12,0:3,12,2,0
chr5	170148776	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,2:9,0:17,3,1,1
chr5	170149674	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,2:5,5:7,3,6,1
chr5	170160749	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	170162666	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,1:5,2:5,0,3,0
chr5	170221185	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,6:4,3:6,0,9,0
chr5	170221379	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.741:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr5	170341326	.	TTA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TA;STR;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr5	170380523	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr5	170610273	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=196.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,35:0,24:0,0,30,29
chr5	170640827	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	170725801	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.420:15:4,3:3,3:6,3,3,3
chr5	170827745	.	AA	CA,CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32,35;MFRL=206,228,196;MMQ=60,60,53;MPOS=23,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.07,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,1,1:0.200,0.200:7:2,1,1:1,0,0:5,0,2,0
chr5	170847555	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	171318704	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=205,280;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	171384688	.	C	T	.	.	DP=104;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=142,126;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,4:0.048:102:40,4:55,0:0|1:171384688_C_T:171384688:39,59,4,0
chr5	171384693	.	G	A	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=145,126;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,4:0.050:98:40,3:51,0:0|1:171384688_C_T:171384688:36,58,4,0
chr5	171480055	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,1:4,2:1,11,0,3
chr5	171482761	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=171,126;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:14,0:7,2:0|1:171482761_C_T:171482761:9,14,0,2
chr5	171482766	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=170,126;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:7,2:0|1:171482761_C_T:171482761:8,13,0,2
chr5	171482769	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=169,126;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,0:7,2:0|1:171482761_C_T:171482761:8,12,0,2
chr5	171554473	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,1,12
chr5	171800935	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=194,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:4,3:0,12,0,3
chr5	171821490	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:171821490_G_A:171821490:3,0,2,0
chr5	171821497	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:171821490_G_A:171821490:4,0,2,0
chr5	171821724	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,14;MFRL=216,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:171821724_G_T:171821724:0,4,0,1
chr5	171821726	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=216,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:171821724_G_T:171821724:0,4,0,1
chr5	171821728	.	C	CTGCAACAG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=216,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:171821724_G_T:171821724:0,4,0,1
chr5	171821730	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=216,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:171821724_G_T:171821724:0,4,0,1
chr5	171821733	.	GG	TT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=216,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:171821724_G_T:171821724:0,4,0,1
chr5	172110578	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	172197947	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	172315872	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=174,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr5	172324128	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0,4,1,4
chr5	172324808	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,17;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.610:16:3,0:3,1:0|1:172324808_C_G:172324808:2,4,10,0
chr5	172324812	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=24,17;MFRL=147,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.577:17:1,1:4,3:0|1:172324808_C_G:172324808:3,4,10,0
chr5	172324815	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,17;MFRL=147,192;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.577:17:3,0:3,1:0|1:172324808_C_G:172324808:3,4,10,0
chr5	172324818	.	AA	GG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.302:11:2,0:4,2:0|1:172324808_C_G:172324808:3,5,3,0
chr5	172324978	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,2:4,3:0,9,0,5
chr5	172332558	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=203,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr5	172332581	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=246,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	172336616	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:5,1,5,0
chr5	172342029	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:0,3,1,4
chr5	172347440	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:6,10:5,6:4,7,1,15
chr5	172377694	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=121,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.339:18:4,0:5,1:5,7,6,0
chr5	172395408	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr5	172395664	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,0,21
chr5	172396394	.	C	T	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=279.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,89:0.989:89:0,43:0,46:0,0,59,30
chr5	172421760	.	ATTT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,1:9,1:17,11,1,1
chr5	172507872	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:18,0:17,4:1,35,4,0
chr5	172513429	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:172513429_G_A:172513429:3,0,1,0
chr5	172513435	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:172513429_G_A:172513429:4,0,1,0
chr5	172578567	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=120,219;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:5,1:5,1:3,10,3,0
chr5	172585927	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr5	173036161	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=207,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:8,0,5,1
chr5	173316729	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,29:0.399:73:23,15:21,14:31,13,20,9
chr5	173317399	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:24,2:16,1:11,29,1,2
chr5	173380346	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,4:3,3:0,6,0,7
chr5	173383194	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=225,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:0,6,0,6
chr5	173416234	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:2,0,1,1
chr5	173473982	.	CTCTTA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=239,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.511:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	173491300	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.513:29:8,6:6,8:6,8,7,8
chr5	174152100	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr5	174868700	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr5	174943551	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.418:27:9,7:6,4:12,4,9,2
chr5	175110454	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:13,2:9,2:0,22,0,4
chr5	175111402	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:15,3:13,0:12,16,2,1
chr5	175387139	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=164,104;MMQ=51,27;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.123:46:14,3:27,2:4,37,0,5
chr5	175520273	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=162,176;MMQ=25,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:4,0,6,0
chr5	175530166	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,164;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,1:12,2:20,3,2,1
chr5	175530910	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,178;MMQ=40,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,2:10,1:3,15,0,3
chr5	175792605	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	175843461	.	CG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.928:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr5	175923431	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,19,0
chr5	175925991	.	GAGAA	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,81;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AGAA;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:16,1:21,1:38,5,2,0
chr5	175933691	.	TGTGTGTGC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTGTGTGC;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr5	175956271	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=134.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,17:0,24:0,0,29,12
chr5	175956516	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr5	175992258	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,10:0,8:0|1:175992258_A_G:175992258:0,0,16,3
chr5	175992266	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:5,6:6,4:0|1:175992258_A_G:175992258:10,1,7,3
chr5	175992519	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=209,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,2:3,5:5,5,4,3
chr5	176002873	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,4,7
chr5	176002926	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,1:0,5:0,0,7,2
chr5	176004312	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	176004846	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.927:12:0,5:0,4:0,0,3,9
chr5	176004866	.	A	AGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=267,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GT;STR;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.808:8:0,3:1,4:0,1,3,4
chr5	176005175	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0|1:176005175_A_C:176005175:0,0,0,11
chr5	176005184	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0|1:176005175_A_C:176005175:0,0,0,11
chr5	176017549	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,3:6,3:5,3,5,1
chr5	176018545	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0|1:176018545_G_A:176018545:0,0,0,4
chr5	176018561	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:176018545_G_A:176018545:0,1,0,2
chr5	176022608	.	GGC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,107;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:8,0:9,7,2,0
chr5	176026121	.	TCAAAGACCCAGGA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=119,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.368:9:3,1:2,2:0|1:176026121_TCAAAGACCCAGGA_T:176026121:3,3,1,2
chr5	176026135	.	TCCTCCTTCCTC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=105,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,1:2,2:0|1:176026121_TCAAAGACCCAGGA_T:176026121:5,4,1,2
chr5	176053336	.	GGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,91;MMQ=60,58;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=GT;STR;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	176053645	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,6,1
chr5	176056529	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=101.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,7:0,16:0,0,17,11
chr5	176069831	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,23:0,11:0,0,19,15
chr5	176069862	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.366:12:4,2:4,2:1,7,0,4
chr5	176069863	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.455:11:3,3:3,2:0|1:176069863_C_CT:176069863:0,6,0,5
chr5	176069866	.	C	CCGCCCG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.817:13:1,5:0,3:0|1:176069863_C_CT:176069863:0,2,0,11
chr5	176070004	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=155,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,1:5,0,3,1
chr5	176081856	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,2:0,9:0,0,11,0
chr5	176082119	.	G	GCCCAGAGCAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=180,343;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr5	176083076	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,192;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:30,0:25,3:32,27,1,2
chr5	176083175	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=127,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=148.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,44:0.977:45:0,17:0,24:1,0,13,31
chr5	176083997	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,298;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr5	176305466	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,8:0,7:0,0,14,3
chr5	176305678	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=211,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,2:4,5:2,4,1,7
chr5	176305707	.	A	AGAAAGAATTTATTCAACCGCATGCTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:176305707_A_AGAAAGAATTTATTCAACCGCATGCTC:176305707:0,4,0,1
chr5	176305710	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,21;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:176305707_A_AGAAAGAATTTATTCAACCGCATGCTC:176305707:0,4,0,1
chr5	176306676	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr5	176316344	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	176333126	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	176471591	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr5	176520283	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:6,3:3,0:0|1:176520283_G_C:176520283:0,9,5,0
chr5	176520287	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,1:3,0:0|1:176520283_G_C:176520283:1,9,4,0
chr5	176520290	.	C	CCCCCCCCGG	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.265:17:7,4:3,0:0|1:176520283_G_C:176520283:4,9,4,0
chr5	176520292	.	C	CCAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,0;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.262:17:8,0:4,0:0|1:176520283_G_C:176520283:4,9,4,0
chr5	176637883	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:18,0:16,4:17,17,0,4
chr5	176683973	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,1:11,1:14,9,0,2
chr5	176700885	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	176720766	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr5	176729736	.	ACC	A,AC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27,26;MFRL=0,183,174;MMQ=60,60,60;MPOS=20,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=C;STR;TLOD=16.73,16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,8:0.472,0.481:16:0,3,4:0,4,3:0,0,0,16
chr5	176733616	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr5	176778747	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=263,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	176827581	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	176830627	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr5	176831119	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr5	176831177	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,2:0,0,3,2
chr5	176831980	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,5,3
chr5	176857769	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=127.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,13:0,27:0,0,38,2
chr5	176858049	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,0,12
chr5	176859848	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=9,27;MFRL=125,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=147.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,48:0.978:49:0,22:0,23:0,1,13,35
chr5	176868779	.	CA	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.233:31:7,3:12,4:0|1:176868779_CA_C:176868779:3,21,7,0
chr5	176868782	.	CCGCCTCTAG	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,7:0.206:35:11,3:11,3:0|1:176868779_CA_C:176868779:5,23,7,0
chr5	176868797	.	AGCC	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=26,9;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.179:31:13,0:5,0:0|1:176868779_CA_C:176868779:4,22,5,0
chr5	176885029	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=154,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.445:9:1,1:2,1:3,2,4,0
chr5	176886539	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr5	176895817	.	GC	AA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=82.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,17,2
chr5	176917509	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=106,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:3,1:9,2,2,0
chr5	176929974	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:7,0,9,0
chr5	176930135	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,17:0,14:0,0,18,14
chr5	176930171	.	AGAG	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=89.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.556:43:8,13:7,11:10,9,15,9
chr5	176931706	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr5	176931896	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=236,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:1,2,0,5
chr5	176935215	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	176939051	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr5	176939688	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr5	176939735	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr5	176940274	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=165,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr5	176940871	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,5:0,17:0,0,5,17
chr5	176950879	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,3:0,0,10,0
chr5	176963349	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr5	177019688	.	G	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=131.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,34:0,26:0,0,12,48
chr5	177031602	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	177035488	.	GCCC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=C;STR;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:1,4:2,8:2,3,10,2
chr5	177036043	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr5	177151456	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,170;MMQ=26,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:7,9:3,5:3,7,4,10
chr5	177158620	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,122;MMQ=60,33;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr5	177161891	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=148,158;MMQ=46,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:0,6:1,10:0,1,0,16
chr5	177162025	.	TA	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,257;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177162025_TA_AG:177162025:0,0,0,1
chr5	177162028	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,257;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177162025_TA_AG:177162025:0,0,0,1
chr5	177162031	.	G	GATAAACAAACCAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,257;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177162025_TA_AG:177162025:0,0,0,1
chr5	177172035	.	C	CAGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=227,207;MMQ=25,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:177172035_C_CAGA:177172035:0,3,0,1
chr5	177172036	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=227,207;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:177172035_C_CAGA:177172035:0,3,0,1
chr5	177421397	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:5,3:3,2:1,9,2,3
chr5	177422823	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,9:0,0,16,3
chr5	177466530	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=170,183;MMQ=24,23;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.297:25:7,3:8,4:0|1:177466530_G_C:177466530:0,18,0,7
chr5	177466539	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=175,179;MMQ=24,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,8:0.346:24:7,4:9,4:1|0:177466530_G_C:177466530:0,16,0,8
chr5	177547336	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.391:18:5,2:6,4:8,3,1,6
chr5	177547591	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,30;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:177547591_A_C:177547591:0,1,0,1
chr5	177547592	.	CGA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:177547591_A_C:177547591:0,1,0,1
chr5	177547595	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:177547591_A_C:177547591:0,0,0,1
chr5	177570759	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,4,19
chr5	177574901	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:8,6:7,9:7,8,9,6
chr5	177632801	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,26:0.597:43:7,7:10,17:16,1,21,5
chr5	177633632	.	AAC	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,1:4,3:6,0,4,0
chr5	177633636	.	CAT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:2,4:5,0,6,0
chr5	177637447	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr5	177642177	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,0:0,0,8,0
chr5	177642518	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=288,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr5	177651837	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr5	177658883	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr5	177658896	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,0,15
chr5	177665554	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:2,0,6,0
chr5	177666112	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,3:2,4:5,1,3,5
chr5	177668965	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=218,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr5	177673153	.	AGTGCAGGGACCCAGTGAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.510:12:4,3:2,3:6,0,5,1
chr5	177676986	.	GCACA	G,GCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29,29;MFRL=141,154,187;MMQ=60,60,60;MPOS=10,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=CA;STR;TLOD=9.98,10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,4:0.384,0.387:10:0,3,2:2,1,2:2,0,8,0
chr5	177679447	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:5,1,3,0
chr5	177679654	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=197,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr5	177679680	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr5	177686621	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177686621_A_C:177686621:0,0,1,0
chr5	177686622	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177686621_A_C:177686621:0,0,1,0
chr5	177686627	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,18;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:177686621_A_C:177686621:0,0,1,0
chr5	177686632	.	AT	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,12;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:177686621_A_C:177686621:0,1,1,0
chr5	177686638	.	AT	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:177686621_A_C:177686621:1,1,1,0
chr5	177715291	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.564:37:9,12:7,9:10,6,10,11
chr5	177715302	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=54.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.659:33:6,12:5,10:6,5,11,11
chr5	177715452	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:9,7:9,11:14,6,15,6
chr5	177715465	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.519:44:8,8:6,14:13,9,14,8
chr5	177715477	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.424:47:10,9:16,9:14,13,10,10
chr5	177717343	.	GCA	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=175,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=71.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.447:45:7,6:16,14:15,10,9,11
chr5	177733952	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.543:31:5,11:9,5:3,11,8,9
chr5	177987758	.	G	GA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=17,16;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.225:34:6,1:6,0:5,22,1,6
chr5	178039331	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=336,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:178039331_C_T:178039331:1,1,1,0
chr5	178039338	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,26;MFRL=211,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:178039331_C_T:178039331:1,0,1,0
chr5	178040919	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr5	178044425	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.108:43:20,0:18,4:13,26,2,2
chr5	178139736	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,211;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:8,0:11,2:12,7,2,0
chr5	178140618	.	C	CAGCACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=168,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:178140618_C_CAGCACA:178140618:0,1,0,1
chr5	178140620	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=168,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:178140618_C_CAGCACA:178140618:0,1,0,1
chr5	178288214	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,174;MMQ=27,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:1,8,1,1
chr5	178294059	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,156;MMQ=60,43;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,31:0.551:57:11,14:10,16:11,15,14,17
chr5	178358220	.	ATT	A,AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34,33;MFRL=6534,170,140;MMQ=60,60,60;MPOS=21,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=8.83,5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,4:0.389,0.394:10:1,3,2:1,1,2:1,1,8,0
chr5	178373319	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:1,3:3,1,5,1
chr5	178409856	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:4,1,3,1
chr5	178413816	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:0,2:2,1,3,0
chr5	178416203	.	CCCCTCCCCACCCTCACCACCCTCCCCA	C,CCCCTCACCACCCTCCCCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31,34;MFRL=173,198,175;MMQ=60,60,60;MPOS=4,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.20,6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.257,0.460:4:1,1,0:0,0,2:0,1,0,3
chr5	178419151	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=200,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr5	178455198	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,1:2,5:0,4,0,6
chr5	178549791	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:0,2,1,3
chr5	178557142	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=175,190;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,3:5,0:0,6,0,3
chr5	178567054	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=185,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:0,8,1,1
chr5	178567082	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.343:9:2,1:4,1:0,6,1,2
chr5	178579119	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,2:1,7:6,0,7,2
chr5	178581797	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:7,0,1,3
chr5	178581977	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.587:15:2,8:4,1:1,5,2,7
chr5	178770759	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=137,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	178986978	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.666:7:0,1:1,3:0|1:178986978_C_G:178986978:2,0,5,0
chr5	178986987	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1|0:178986978_C_G:178986978:5,0,2,0
chr5	178989473	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr5	178996280	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,1:5,1:13,1,2,0
chr5	178996435	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=115.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,15:0,18:0,0,7,26
chr5	179008023	.	C	CT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:6,7:7,11:8,5,4,14
chr5	179012968	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	179021786	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr5	179021982	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=207,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:1,3,0,4
chr5	179034707	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=187,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr5	179036608	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	179041785	.	GAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=A;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.769:4:1,3:0,0:0,1,3,0
chr5	179043075	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=100,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=166.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,47:0.944:49:2,24:0,23:1,1,40,7
chr5	179044121	.	GA	G	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.054:71:37,0:31,3:9,59,0,3
chr5	179044893	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.479:46:10,7:14,15:10,14,14,8
chr5	179048205	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.447:45:13,15:12,4:18,7,19,1
chr5	179048449	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:6,9:9,5:0,15,0,14
chr5	179069309	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,11,2
chr5	179071724	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=217,273;MMQ=52,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr5	179071925	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=143,143;MMQ=60,31;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.080:60:29,2:25,2:27,29,1,3
chr5	179071947	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=139,169;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,37:0.678:54:6,23:11,13:7,10,15,22
chr5	179072006	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=157,150;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:10,3:11,1:6,15,0,4
chr5	179072040	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=143,186;MMQ=57,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,2:10,2:6,13,0,4
chr5	179132612	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,5:2,1:8,0,6,0
chr5	179136137	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:0,5,0,6
chr5	179136138	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.926:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr5	179146829	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=162,166;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.259:17:5,2:4,0:0,13,1,3
chr5	179146876	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=177,161;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:3,3:3,0:0,7,0,3
chr5	179147641	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:0,8,0,6
chr5	179153577	.	CAA	C,CAAAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34,33;MFRL=173,152,113;MMQ=60,44,50;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,19;RU=A;STR;TLOD=5.33,3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.204,0.205:10:4,1,1:2,1,1:6,0,4,0
chr5	179153797	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,24:0.481:50:15,11:11,13:8,18,3,21
chr5	179227154	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,3:7,4:8,3,6,1
chr5	179228523	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=187,84;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:2,0:0|1:179228523_A_C:179228523:3,3,2,0
chr5	179228529	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,17;MFRL=178,84;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:4,1:0|1:179228523_A_C:179228523:4,3,2,0
chr5	179228533	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=178,84;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,0:4,0:0|1:179228523_A_C:179228523:4,3,2,0
chr5	179229123	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=249,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:179229123_C_T:179229123:0,1,0,1
chr5	179229126	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=249,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:179229123_C_T:179229123:0,1,0,1
chr5	179233663	.	AGGC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGC;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr5	179248024	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	179260009	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:1,9:0,9:1,0,15,3
chr5	179260494	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	179264915	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	179267783	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.837:4:0,2:0,0:0,0,4,0
chr5	179269075	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:0,5,0,9
chr5	179285697	.	CGGA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGA;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:0,0:2,0:3,0,1,0
chr5	179290845	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:1,5:6,3:1,7,3,5
chr5	179299842	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,1:1,0:0|1:179299842_A_C:179299842:3,0,2,0
chr5	179299847	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,0:0|1:179299842_A_C:179299842:3,0,2,0
chr5	179305249	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:3,1:1,1:5,0,2,0
chr5	179321657	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:0,4,0,5
chr5	179334857	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	179405144	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr5	179407229	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:1,7:0,12:0,1,0,19
chr5	179529246	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=304,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:179529246_G_T:179529246:0,1,0,1
chr5	179529248	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=304,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:179529246_G_T:179529246:0,1,0,1
chr5	179554602	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.530:28:9,5:4,9:6,7,11,4
chr5	179555407	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:2,3:5,2:8,0,5,1
chr5	179563359	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr5	179563532	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=156,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,5:3,6:0,4,0,11
chr5	179565071	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr5	179565111	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:179565111_T_G:179565111:0,0,0,1
chr5	179565136	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179565111_T_G:179565111:0,0,0,1
chr5	179728707	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	179729625	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=99,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr5	179734139	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:0|1:179734139_T_C:179734139:6,0,8,0
chr5	179734145	.	GTGGGGGTGGGGGC	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGGGGTGGGGGC;STR;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.528:17:2,5:4,4:0|1:179734139_T_C:179734139:8,0,9,0
chr5	179734200	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=153,114;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.585:19:5,4:1,7:5,3,8,3
chr5	179734312	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:2,6,0,6
chr5	179743731	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,4:0,2:3,1,6,2
chr5	179751111	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:5,0,4,0
chr5	179751390	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	179757675	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:7,4:2,7:7,2,9,2
chr5	179763398	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr5	179765467	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=204,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,4:3,7:6,1,10,1
chr5	179780340	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	179956197	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,154;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:4,1:4,4:8,1,5,0
chr5	179956380	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=152,170;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.069:55:22,0:29,3:17,35,0,3
chr5	179980302	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=255,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	179980527	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=174,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:0,6,1,5
chr5	179991841	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=195,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,3:1,4:0,4,0,7
chr5	179998454	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.385:18:4,2:7,5:1,10,1,6
chr5	180030224	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:11,8,0,2
chr5	180030313	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.434:21:4,5:6,3:0|1:180030313_C_A:180030313:8,4,4,5
chr5	180030322	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,11:0.521:21:6,4:3,6:1|0:180030313_C_A:180030313:5,5,7,4
chr5	180039618	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:8,0:12,3:0|1:180039618_G_C:180039618:2,18,0,3
chr5	180039621	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:6,0:10,3:0|1:180039618_G_C:180039618:2,19,0,3
chr5	180041001	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,10,0
chr5	180041008	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,10,0
chr5	180041208	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,1,13
chr5	180045700	.	G	GGGTTACCCTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.809:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	180046209	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.657:7:1,3:1,0:1,1,2,3
chr5	180046426	.	C	CTGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr5	180046839	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr5	180047739	.	C	CGTGT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=198,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=GT;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.493:10:3,3:2,2:0,5,1,4
chr5	180047793	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=193,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,5:1,5,0,9
chr5	180047863	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr5	180048056	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=159,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:5,1,4,2
chr5	180048986	.	G	GCCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CCTC;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.690:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	180053307	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	180055862	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,2:0,7:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,11,0
chr5	180055864	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,11,0
chr5	180056192	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr5	180057809	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:180057809_G_A:180057809:0,4,0,1
chr5	180057813	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,14;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:4,0:0,0:0|1:180057809_G_A:180057809:0,4,0,1
chr5	180057820	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:180057809_G_A:180057809:0,3,0,1
chr5	180057825	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=220,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:180057809_G_A:180057809:0,2,0,1
chr5	180166461	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,10,8
chr5	180338300	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:5,4:9,2:10,4,5,1
chr5	180338368	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:9,6:7,3:5,11,4,5
chr5	180376860	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	180377018	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=148,165;MMQ=52,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:10,7:3,6:11,2,9,4
chr5	180377050	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=151,142;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:21,0:16,3:26,12,1,2
chr5	180430919	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,27750;MMQ=52,29;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:6,9,2,0
chr5	180431613	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=209,191;MMQ=52,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,7:2,2:8,2,6,4
chr5	180432524	.	A	ATTAT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=163,27838;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:9,0:15,2:0|1:180432524_A_ATTAT:180432524:13,11,0,2
chr5	180432529	.	G	GAATCA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=162,27838;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:180432524_A_ATTAT:180432524:11,10,0,2
chr5	180432530	.	G	GAAAGAA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,27838;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:12,2:0|1:180432524_A_ATTAT:180432524:11,10,0,2
chr5	180477449	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=220,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr5	180477460	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:180477460_T_A:180477460:0,3,0,1
chr5	180477462	.	C	CTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:180477460_T_A:180477460:0,3,0,1
chr5	180481216	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=15,29,32;MFRL=67,152,157;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,18;RU=T;STR;TLOD=6.16,4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,3:0.333,0.388:9:0,1,0:1,3,3:0,2,4,3
chr5	180482522	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=154,158;MMQ=60,32;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:9,1:4,1:2,11,0,2
chr5	180482536	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=155,147;MMQ=50,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:1,1:0,9,0,3
chr5	180486841	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	180650956	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:0,3:0|1:180650956_T_C:180650956:1,0,3,0
chr5	180650958	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0|1:180650956_T_C:180650956:1,0,3,0
chr5	180664145	.	CA	TG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=187,146;MMQ=60,53;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:180664145_CA_TG:180664145:0,19,0,2
chr5	180664150	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=192,146;MMQ=60,53;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:8,2:0|1:180664145_CA_TG:180664145:0,16,0,2
chr5	180668426	.	CAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=134,222;MMQ=27,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr6	292447	.	TC	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,12;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.489:5:1,0:1,0:0|1:292447_TC_AG:292447:3,0,2,0
chr6	292452	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=10,32;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.418:6:0,0:1,2:0|1:292447_TC_AG:292447:4,0,2,0
chr6	292456	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=17,32;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:1,2:0|1:292447_TC_AG:292447:4,0,2,0
chr6	292461	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:1,2:3,0,3,0
chr6	292464	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:1,2:0|1:292447_TC_AG:292447:5,0,2,0
chr6	304560	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:10,1:15,2:20,5,2,1
chr6	311811	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,10;MFRL=197,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:1,0:3,0:6,1,4,0
chr6	312023	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,15:0.334:46:10,4:19,11:4,27,4,11
chr6	312029	.	TAATG	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:8,3:18,7:5,24,0,10
chr6	335069	.	T	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,27:0.377:72:23,15:20,11:45,0,27,0
chr6	335175	.	A	T	.	.	DP=114;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=383.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,113:0.991:113:0,60:0,53:0,0,28,85
chr6	335251	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:15,3:5,7:0|1:335251_T_C:335251:0,20,0,12
chr6	335253	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:13,5:4,7:0|1:335251_T_C:335251:0,20,0,12
chr6	335268	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=218,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.822:26:2,11:2,9:0,4,0,22
chr6	348051	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:8,2,7,1
chr6	348080	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=109.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,20:0,13:0,0,26,7
chr6	348124	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.137:49:19,2:22,4:31,12,3,3
chr6	349016	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:4,3:1,1:0,6,0,4
chr6	350940	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.502:18:3,4:6,5:2,7,0,9
chr6	395093	.	AG	TT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0|1:395093_AG_TT:395093:0,4,0,2
chr6	395099	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:395093_AG_TT:395093:0,5,0,2
chr6	395105	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:0,1:0|1:395093_AG_TT:395093:0,6,0,2
chr6	397261	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:3,3:6,4:0|1:397261_G_A:397261:2,7,2,6
chr6	397269	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:1,1:5,4:0|1:397261_G_A:397261:1,6,1,5
chr6	397290	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:1,6,1,3
chr6	398775	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:8,0,7,0
chr6	407629	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=19,19;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,0:0,0:0,6,0,3
chr6	407656	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.583:12:2,5:1,2:0,5,0,7
chr6	407678	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=188,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:2,0:0,10,0,2
chr6	549364	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,1:1,5:0,3,0,6
chr6	549390	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	556406	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,2:9,1:22,0,3,0
chr6	564515	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,6:5,4:7,0,11,0
chr6	572480	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,4:6,2:7,4,6,0
chr6	572714	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr6	576902	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:6,1:3,3:3,6,1,4
chr6	598206	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:598206_T_TTC:598206:0,1,0,1
chr6	598210	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:598206_T_TTC:598206:0,1,0,1
chr6	599042	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.408:47:15,11:13,8:21,7,15,4
chr6	619600	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:0,6,0,5
chr6	656079	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:9,0,2,0
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chr6	2768905	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,5:6,5:10,0,9,1
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chr6	2834265	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,4:1,0:0,3,0,4
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chr6	2890836	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:6,1:1,7:1,6,1,7
chr6	2895549	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,101;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,2:14,0:22,0,2,0
chr6	2900648	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=161,73;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:14,0:16,2:28,2,2,0
chr6	2953252	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.590:27:3,4:7,11:6,5,10,6
chr6	2953445	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:7,3:4,4:2,10,2,6
chr6	3006807	.	A	G	.	.	DP=79;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,46:0.607:76:11,18:14,20:12,18,19,27
chr6	3006821	.	CT	C,CTT	.	.	DP=71;ECNT=4;MBQ=26,30,34;MFRL=144,148,102;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.72,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,6,5:0.124,0.090:47:18,3,3:11,2,2:6,30,4,7
chr6	3006885	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=191,180;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,2:3,0:0,10,0,2
chr6	3006927	.	T	TGTAAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=246,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	3010459	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=196,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr6	3012725	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=56.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,5:0,0,16,2
chr6	3017310	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:0,4,0,5
chr6	3019654	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr6	3019927	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr6	3077041	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:4,2:1,3:4,1,5,1
chr6	3077244	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:1,1:1,1:2,1,0,5
chr6	3078266	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,0,11
chr6	3106311	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,0:5,4:0,8,0,4
chr6	3118947	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr6	3140743	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:16,1:14,2:3,28,0,3
chr6	3157798	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	3157809	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr6	3225605	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,183;MMQ=25,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:5,2:2,4:7,0,7,0
chr6	3226139	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=176,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,1:10,1:0|1:3226139_G_A:3226139:1,21,0,2
chr6	3226141	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:12,0:10,1:0|1:3226139_G_A:3226139:1,22,0,2
chr6	3263830	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,0:0,4:0,0,5,0
chr6	3264101	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,2,16
chr6	3264502	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,14:0,0,16,11
chr6	3264526	.	CT	TC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,9:0,0,11,13
chr6	3264582	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,0,16
chr6	3723764	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:8,0,8,0
chr6	3737431	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:11,0:6,2:3,14,0,2
chr6	3738391	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:15,0:9,3:1,23,0,3
chr6	3984083	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=235,404;MMQ=60,29;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3984083_A_T:3984083:0,3,0,1
chr6	3984085	.	AAT	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=235,404;MMQ=60,29;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3984083_A_T:3984083:0,3,0,1
chr6	3984090	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=118,404;MMQ=58,29;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3984083_A_T:3984083:0,2,0,1
chr6	3984092	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=118,404;MMQ=58,29;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3984083_A_T:3984083:0,2,0,1
chr6	3984103	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=0,235;MMQ=55,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3984103_G_C:3984103:0,1,0,1
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chr6	4021554	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,15,0
chr6	4031880	.	C	CA	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,5:0.067:85:43,3:36,2:51,29,2,3
chr6	4033065	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	4037582	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr6	4044297	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,13:0,0,5,24
chr6	4044344	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,0,13
chr6	4049218	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:9,1:10,3,0,2
chr6	4052167	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.929:11:0,8:0,3:0|1:4052167_C_A:4052167:0,0,10,1
chr6	4052172	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.238:15:9,2:3,1:0|1:4052167_C_A:4052167:11,1,2,1
chr6	4052383	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=110.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,17:0,18:0,0,4,32
chr6	4057200	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr6	4057233	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,16,7
chr6	4057429	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,1,18
chr6	4069101	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,1:11,1:11,14,2,0
chr6	4069647	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:17,1:19,3:18,18,4,0
chr6	4074612	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=52.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr6	4077696	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:1,12,0,2
chr6	4119516	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:7,2,4,5
chr6	4119553	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.788:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr6	4119612	.	TGGCGC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=191,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr6	4125655	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr6	4936074	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr6	4937728	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=166,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.430:14:3,1:5,5:0|1:4937728_C_CA:4937728:8,0,5,1
chr6	4937742	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=167,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.474:21:5,4:5,1:0|1:4937728_C_CA:4937728:10,1,8,2
chr6	4937747	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=167,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:5,4:6,4:0|1:4937728_C_CA:4937728:10,1,7,2
chr6	4944004	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=230,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.748:6:0,0:1,4:0,1,0,5
chr6	4952413	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	5000027	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,4:6,4:10,4,7,1
chr6	5000721	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.855:5:0,2:0,3:0|1:5000721_T_C:5000721:0,0,4,1
chr6	5000724	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.855:5:0,1:0,0:0|1:5000721_T_C:5000721:0,0,4,1
chr6	5000779	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.388:36:10,3:11,9:12,10,9,5
chr6	5109592	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=196,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.448:14:3,4:3,2:7,1,6,0
chr6	5217010	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr6	5405004	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	5405030	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=216,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:5405030_A_G:5405030:0,2,0,1
chr6	5405031	.	A	AGTATTTGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=216,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:5405030_A_G:5405030:0,2,0,1
chr6	5431960	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,5:6,5:4,9,1,9
chr6	5545619	.	G	GGAGTACTGTCTTTCATTTCTGATTACAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=209,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	5545654	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	5829166	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr6	5831924	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,196;MMQ=55,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:2,2:4,0,3,0
chr6	5832125	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0,0,2,7
chr6	5999464	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	6167621	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,13,3
chr6	6174786	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,9:0,0,15,3
chr6	6174856	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=132,168;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.544:35:10,9:5,10:11,5,14,5
chr6	6175174	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=196,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:0,5:4,3:0,4,0,9
chr6	6318808	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:8,2:15,0:11,12,2,0
chr6	6588881	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr6	6649974	.	A	AAGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGG;STR;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr6	7226959	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:1,3:0,3,1,4
chr6	7232216	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	7240876	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:8,6:7,5:0,15,1,10
chr6	7290215	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr6	7290267	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=245,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7290267_A_C:7290267:0,2,0,1
chr6	7290271	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=245,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7290267_A_C:7290267:0,2,0,1
chr6	7295605	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=175,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.398:18:5,4:6,3:10,1,5,2
chr6	7295755	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr6	7303735	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:5,2,5,0
chr6	7303952	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=190,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,6:1,2:0,2,0,8
chr6	7303972	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=205,180;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr6	7330169	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:1,5,1,5
chr6	7368917	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:6,7:2,6:6,2,9,4
chr6	7373249	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:5,1,7,0
chr6	7378955	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.085:57:28,4:21,0:23,30,4,0
chr6	7387433	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.472:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr6	7390369	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,10:0,0,2,24
chr6	7396836	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr6	7396887	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:6,6:7,4:8,5,6,4
chr6	7398832	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:8,0,4,0
chr6	7401382	.	AAAAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.633:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr6	7410735	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.273:15:5,3:6,1:1,10,1,3
chr6	7413094	.	AT	A,ATT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=163,180,156;MMQ=60,60,60;MPOS=17,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.96,9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,8,7:0.157,0.156:48:9,1,4:21,6,2:27,6,12,3
chr6	7414382	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=214,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr6	7414657	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,0,24
chr6	7558318	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:6,5:6,8:7,5,10,3
chr6	7575506	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:9,0:2,2:10,1,2,0
chr6	7577354	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr6	7578189	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr6	7578819	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:4,4:5,4:0|1:7578819_T_G:7578819:1,8,1,8
chr6	7578823	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:3,2:4,4:0|1:7578819_T_G:7578819:0,8,1,7
chr6	7579412	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	7580386	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.410:47:12,10:15,8:10,18,6,13
chr6	7581636	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,26:0.542:48:13,17:8,9:13,9,8,18
chr6	7590653	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:4,3:0,10,1,7
chr6	7595241	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.216:29:9,2:12,4:22,1,5,1
chr6	7606255	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=150.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,25:0,21:0,0,36,11
chr6	7727419	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:3,2,2,2
chr6	7727525	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:2,2,1,3
chr6	7879407	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr6	7889088	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=69.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,4,16
chr6	7891775	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,1:2,6:9,1,6,1
chr6	8016089	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,1,10
chr6	8041509	.	A	ATATATAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr6	8062882	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:12,0:22,3:2,32,1,2
chr6	8073858	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=195,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,5:3,3:0,5,1,7
chr6	8422879	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:4,5:9,3:4,9,2,6
chr6	9908731	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:16,1,0,2
chr6	9908906	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr6	10430128	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:2,4:7,8:6,3,9,3
chr6	10509367	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:2,9,2,0
chr6	10634396	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,4:4,7:4,5,5,6
chr6	10635018	.	GA	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=265,241;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10635018_GA_AC:10635018:0,1,0,1
chr6	10635021	.	TG	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=265,241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:10635018_GA_AC:10635018:0,1,0,1
chr6	10695156	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	10724943	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,138;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.610:28:3,7:6,9:1,10,2,15
chr6	10729020	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=175,191;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,5:1,3:0,5,0,8
chr6	10756863	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=160,212;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:3,1:0,5,0,2
chr6	10802045	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr6	10802101	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,6:4,2:5,0,7,1
chr6	10802221	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=150,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.101:47:19,0:23,4:20,23,0,4
chr6	10819295	.	ATCCTTATAAG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=236,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr6	10882100	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	10887251	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0|1:10887251_T_C:10887251:0,0,13,0
chr6	10887253	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0|1:10887251_T_C:10887251:0,0,13,0
chr6	10887276	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,14,4
chr6	10891651	.	ATTT	A,AT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33,32;MFRL=0,180,189;MMQ=60,60,60;MPOS=4,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,17,18;RU=T;STR;TLOD=12.45,5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,7:0.550,0.398:15:0,7,6:0,1,1:0,0,15,0
chr6	10891673	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=13,18;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.638:21:3,1:0,0:8,0,13,0
chr6	10891781	.	C	T	.	.	DP=140;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=419.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,137:0.993:137:0,75:0,57:0,0,104,33
chr6	10891846	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=91.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,13:0,0,18,19
chr6	10910473	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=172,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:2,12,0,2
chr6	10927692	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,246;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr6	10931587	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr6	10931701	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=109,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:11,0:0|1:10931701_C_G:10931701:8,12,0,2
chr6	10931703	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=105,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:0|1:10931701_C_G:10931701:8,13,0,2
chr6	10931705	.	G	GCTGGATCAAAGA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=105,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:8,2:12,0:0|1:10931701_C_G:10931701:8,13,0,2
chr6	10961454	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	10961649	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:9,10:10,8:8,11,11,7
chr6	10983971	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,14,0
chr6	10989873	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr6	10990493	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:5,0,6,0
chr6	11005842	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	11011074	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	11094690	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	11185967	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=232,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr6	11192496	.	A	ACCGCCCCCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr6	11192575	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=124.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,17:0,21:0,0,12,27
chr6	11714639	.	G	GA,GAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32,36;MFRL=164,143,102;MMQ=60,60,60;MPOS=27,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=A;STR;TLOD=10.49,6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,4:0.443,0.363:11:0,2,2:2,3,0:2,0,7,2
chr6	11714806	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=98.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.945:34:1,16:0,16:0,1,10,23
chr6	11723538	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=46.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr6	12016009	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	12121235	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=162,189;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:13,3:11,0:0|1:12121235_C_T:12121235:20,8,3,0
chr6	12121240	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=170,189;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:12,3:13,0:0|1:12121235_C_T:12121235:18,8,3,0
chr6	12294137	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,9:0,0,11,5
chr6	12749706	.	T	TCTCTC	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=179,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTCTC;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.244:10:2,2:6,0:0|1:12749706_T_TCTCTC:12749706:1,7,0,2
chr6	12749714	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=179,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,2:5,0:0|1:12749706_T_TCTCTC:12749706:1,7,0,2
chr6	12749774	.	C	CTTCTCTTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr6	12749780	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=205,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:12749780_CCT_C:12749780:0,1,0,1
chr6	12749785	.	CC	AT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12749780_CCT_C:12749780:0,0,0,1
chr6	13182995	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr6	13184930	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr6	13206339	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:25,1:25,2:35,16,1,2
chr6	13230566	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=198,151;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:0,2:4,0:0,5,0,2
chr6	13278648	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.526:42:13,12:6,10:0,20,0,22
chr6	13325279	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr6	13365913	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	13584523	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=64,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr6	13588719	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:2,1:2,4:0,5,1,5
chr6	13592135	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.515:33:8,6:8,11:3,13,3,14
chr6	13617904	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=165,215;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:16,3:10,0:0|1:13617904_A_T:13617904:26,0,3,0
chr6	13617908	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=165,215;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:16,3:9,0:0|1:13617904_A_T:13617904:26,0,3,0
chr6	13620877	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr6	13638243	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=219,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:0,5,1,8
chr6	13652921	.	GA	G	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,4:0.068:71:19,4:28,0:13,54,1,3
chr6	13652974	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,0:15,4:1,29,0,4
chr6	13697191	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr6	13790929	.	CCT	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=192,165;MMQ=41,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,0:6,2:0|1:13790929_CCT_C:13790929:14,0,2,0
chr6	13790932	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=194,165;MMQ=42,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:13790929_CCT_C:13790929:13,0,2,0
chr6	13790955	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=191,163;MMQ=59,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:6,0:14,0,3,0
chr6	13790975	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,1:10,1:21,1,2,0
chr6	13790981	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=173,197;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,2:12,0:22,3,2,0
chr6	13800626	.	TAA	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=A;STR;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.433:35:8,7:12,8:4,16,0,15
chr6	13801672	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=290,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	14134083	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,26;MFRL=218,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr6	15374428	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:6,8:8,5:5,9,2,11
chr6	15374508	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chr6	15374544	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr6	15468722	.	AGGGTGAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr6	15497209	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:17,1:24,2:16,26,1,2
chr6	15497422	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,6,20
chr6	15507560	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=138,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:6,5:10,5:10,6,3,7
chr6	15513399	.	CGT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GT;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr6	15513744	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=202,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:3,1:5,4:0,8,0,6
chr6	15524563	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.571:37:6,10:8,11:16,0,21,0
chr6	15593240	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=278.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.987:75:0,33:0,41:0,0,54,21
chr6	15593319	.	GAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=17,34,24,16;MFRL=144,136,176,162;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,18,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.57,6.19,7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,3,4,15:0.106,0.153,0.467:30:2,0,1,2:1,2,1,3:3,5,5,17
chr6	15615637	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=126,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,4:1,4,0,9
chr6	15627553	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,1:4,5:7,2,5,1
chr6	15627771	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr6	15651641	.	T	TTA	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.090:50:15,2:18,0:13,33,0,4
chr6	15651642	.	GAA	G,GA,TAA,AAA	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=16,16,15,9,26;MFRL=176,181,203,180,136;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=29,20,18,20;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=4.82,9.23,3.42,6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:17,3,6,7,4:0.083,0.174,0.135,0.100:37:0,1,0,0,4:2,0,2,0,0:2,15,1,19
chr6	15652452	.	GT	AC,AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27,25;MFRL=220,188,177;MMQ=60,60,60;MPOS=3,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.35,27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,11:0.159,0.505:21:5,0,10:2,3,1:0,7,0,14
chr6	16290720	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:14,3:18,0:21,12,2,1
chr6	16327749	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=156,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:1,1:1,1,1,1
chr6	16327915	.	ATGC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=0,171;MMQ=55,50;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=TGC;STR;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr6	17283114	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:15,1:24,2:10,31,1,2
chr6	17426722	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:8,0,6,0
chr6	17426734	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,4:8,0:15,0,4,0
chr6	17426745	.	TG	CA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=175,6098979;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:10,0:21,0,1,1
chr6	17426757	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:17,2:10,0:22,5,2,0
chr6	17539418	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,220;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr6	17543036	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,7:0,0,18,1
chr6	17600619	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:6,0,5,0
chr6	17605106	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:4,3,2,1
chr6	17616493	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr6	17616517	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,0:1,1:0|1:17616517_G_GA:17616517:1,0,0,1
chr6	17616518	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,0:1,1:0|1:17616517_G_GA:17616517:1,0,0,1
chr6	17616520	.	G	GAGAGATTGCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:17616517_G_GA:17616517:1,0,0,1
chr6	17628853	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=219,245;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17628853_T_A:17628853:1,0,1,0
chr6	17628856	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=219,245;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:17628853_T_A:17628853:1,0,1,0
chr6	17629825	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=175,232;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	17648108	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:17,0:16,2:16,17,0,2
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chr6	17777614	.	C	CT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:3,3:4,1:4,7,2,4
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chr6	17779731	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=160,166;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.444:27:5,1:10,10:15,0,12,0
chr6	17779761	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=148,140;MMQ=40,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:11,2:21,0:32,1,2,0
chr6	17779922	.	GAA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=15,34;MFRL=169,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:0,1:2,1:0,20,0,2
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chr6	17785948	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr6	17790191	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:6,3:3,5:2,7,2,7
chr6	17796806	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=232,252;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr6	17799766	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	17809199	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	17817235	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,14:0,5:0,0,16,3
chr6	17831396	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=150,136;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.139:41:20,5:13,0:0|1:17831396_T_G:17831396:24,12,5,0
chr6	17831400	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=150,136;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:20,5:15,0:0|1:17831396_T_G:17831396:24,13,5,0
chr6	17831419	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.413:44:14,12:12,6:13,13,11,7
chr6	17831499	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:18,0:14,3:3,29,1,2
chr6	17834316	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,1,3
chr6	17834328	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr6	17855864	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,2,15
chr6	17987229	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,5:3,4:7,0,9,0
chr6	18134008	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.749:20:4,8:0,2:5,0,10,5
chr6	18134021	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=105.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,20:0,9:0,0,20,9
chr6	18139964	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=67.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.967:25:0,7:0,8:0,0,2,23
chr6	18148155	.	GA	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.265:43:8,4:8,7:3,29,1,10
chr6	18201961	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr6	18215147	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,129;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr6	18222100	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,14:0,3:0,0,17,0
chr6	18256497	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=169,201;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.115:37:14,3:19,1:33,0,4,0
chr6	18256507	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=160,201;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:15,2:20,0:35,0,2,0
chr6	18256513	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=160,155;MMQ=60,50;MPOS=-1073741807;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:16,1:19,1:35,0,2,0
chr6	18258299	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:3,1:7,2:0,15,0,3
chr6	18264096	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.129:52:19,2:25,4:24,22,3,3
chr6	18399750	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,18,2
chr6	20102727	.	A	AGCTTGTGGTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=190,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr6	20115611	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr6	20131317	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr6	20144637	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	20153058	.	GTTTGT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,47;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTGT;STR;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.903:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	20546697	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:8,4:11,6:12,8,6,4
chr6	20546788	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=177,177;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:5,0:3,1:0,8,0,2
chr6	20546826	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr6	20548795	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,1:3,1:9,3,3,0
chr6	20739731	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:4,2,3,3
chr6	20739907	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,4:0,2:0,2,1,5
chr6	20758704	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:4,4:3,5:7,0,10,0
chr6	20758943	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,2:7,1:0,9,0,3
chr6	21065449	.	CA	TG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:7,9:7,4:5,9,2,12
chr6	21231007	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=163,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	21595944	.	CTCCTCG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,0:4,2:15,4,1,1
chr6	21597192	.	GA	G,GAA	.	.	DP=93;ECNT=3;MBQ=18,32,34;MFRL=152,110,172;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.00,8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:55,7,6:0.076,0.098:68:12,3,3:14,3,1:19,36,8,5
chr6	21597204	.	G	C	.	.	DP=87;ECNT=3;MBQ=19,18;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,5:0.075:77:15,1:13,0:26,46,0,5
chr6	21597222	.	GA	G	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:11,1:14,2:0,41,0,3
chr6	21597753	.	CTTTTTTTT	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;RPA=19,11;RU=T;STR;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.549:25:4,3:2,6:5,7,6,7
chr6	22569707	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=197,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,0:0,3:2,0,3,0
chr6	22571356	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,245;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:4,3,0,2
chr6	22571939	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=190,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr6	24134744	.	GG	AA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:1,9,0,2
chr6	24178499	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr6	24291356	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr6	24302087	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=107.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,13:0,21:0,0,12,22
chr6	24353742	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=149,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:4,1,5,0
chr6	24412431	.	G	GTT,GTTT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,34,33;MFRL=164,186,157;MMQ=60,60,60;MPOS=19,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,15,16;RU=T;STR;TLOD=14.50,4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,7,3:0.390,0.181:19:5,4,3:4,2,0:9,0,10,0
chr6	24412447	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.161:28:8,1:7,0:23,1,4,0
chr6	24416696	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,27:0.521:52:9,10:15,17:13,12,11,16
chr6	24418502	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=209,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,1,5
chr6	24429249	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,3:5,7:9,1,9,1
chr6	24436760	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr6	24437524	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,6:2,2:0,4,2,6
chr6	24445718	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,9,3
chr6	24445748	.	GCA	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:4,4:4,5:7,2,5,4
chr6	24445808	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=145,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,0:11,2:8,17,1,2
chr6	24445829	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=142,170;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:4,6:7,4:3,9,4,7
chr6	24448061	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.558:16:3,2:3,6:7,0,9,0
chr6	24454196	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=192,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,4,1
chr6	24460679	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	24460707	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	24463055	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:5,4:6,4:2,10,4,4
chr6	24467060	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.460:22:5,6:7,4:3,9,4,6
chr6	24475517	.	TATTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=18,30;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:0,2:0,1,0,4
chr6	24476553	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	24480025	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	24505030	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:5,4:7,5:12,0,10,0
chr6	24505221	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:7,2:6,6:0,14,0,8
chr6	24523249	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24523249_G_C:24523249:0,0,0,1
chr6	24523250	.	AGAGGG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24523249_G_C:24523249:0,0,0,1
chr6	24528131	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr6	24547650	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr6	24551729	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:6,4:6,7:5,7,4,9
chr6	24559433	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=208,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0,4,0,3
chr6	24581283	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr6	24581345	.	A	AAATTCTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=130,272;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	24589034	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.539:22:4,5:6,6:0,10,4,8
chr6	24651357	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=112,141;MMQ=57,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr6	24651388	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=243,112;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr6	24657964	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,8:3,1:8,1,9,0
chr6	24666320	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:8,2:2,2:10,0,3,1
chr6	24667662	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,3:3,2:0,7,0,6
chr6	24687765	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr6	24687933	.	A	ATT	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=204,63;MMQ=57,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=23,25;RU=T;STR;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.799:5:0,0:0,3:0,1,2,2
chr6	24687999	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=65.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,5:0,0,0,18
chr6	24688033	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=204,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:11,2:1,0:0,12,0,2
chr6	24714681	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,3:7,2:0,9,0,6
chr6	24718676	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:11,0,5,0
chr6	24781025	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:0,6,1,9
chr6	24809853	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	24809874	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:24809874_A_C:24809874:0,0,7,0
chr6	24809881	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:24809874_A_C:24809874:0,0,7,0
chr6	24828318	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,10,3
chr6	24828566	.	C	CCATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CATT;STR;TLOD=41.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.928:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr6	24836161	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=90.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,17:0,0,0,29
chr6	24839865	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:8,2:9,0:1,17,0,2
chr6	24852751	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,10:0,0,16,2
chr6	24852962	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	24871021	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	24871032	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr6	25084691	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,17:0,0,17,12
chr6	25084718	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=139.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,18:0,23:0,0,24,19
chr6	25092031	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr6	25097411	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=93,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:6,9:8,8:4,10,9,8
chr6	25097450	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,9:0,0,3,17
chr6	25106745	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.557:32:3,10:11,7:2,12,0,18
chr6	25106783	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:5,4:9,5:0,14,0,9
chr6	25108753	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,225;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:4,5:7,5:12,0,11,0
chr6	25108989	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0|1:25108989_AC_A:25108989:0,3,0,5
chr6	25108991	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0|1:25108989_AC_A:25108989:0,3,0,5
chr6	25108995	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=213,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr6	25109703	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.433:33:8,8:9,6:17,2,7,7
chr6	25110089	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:0,4:5,5:7,0,8,1
chr6	25280119	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,4,28
chr6	25285026	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.129:31:15,1:12,3:25,2,4,0
chr6	25426640	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32,32,31;MFRL=83,0,180,174;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,31,7;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,14,15,16;RU=T;STR;TLOD=6.69,4.36,11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,5,4,6:0.278,0.241,0.341:17:2,3,3,5:0,2,1,0:2,0,14,1
chr6	25435654	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,4:1,0:5,0,4,0
chr6	25450026	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,25,1
chr6	25492296	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr6	25492364	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr6	25510648	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr6	25510696	.	CAT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:3,0:9,1,3,0
chr6	25554148	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=204,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr6	25554180	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,11,0
chr6	25557149	.	T	TAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:1,4:0,4,0,8
chr6	25557166	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=166,147;MMQ=60,35;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr6	25619581	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.611:8:2,1:0,3:3,0,5,0
chr6	25669669	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr6	25682262	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:5,5:1,7:0,6,3,9
chr6	25689487	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,1:7,2:6,8,2,1
chr6	25726213	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,232;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr6	25726329	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=239,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr6	25726343	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr6	25727054	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25727054_A_G:25727054:1,0,1,0
chr6	25727057	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25727054_A_G:25727054:1,0,1,0
chr6	25727714	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727714_A_G:25727714:0,0,0,1
chr6	25727716	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727714_A_G:25727714:0,0,0,1
chr6	25727720	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727714_A_G:25727714:0,0,0,1
chr6	25727721	.	GCCA	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727714_A_G:25727714:0,0,0,1
chr6	25727726	.	TC	GA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727714_A_G:25727714:0,0,0,1
chr6	25727731	.	TGC	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727714_A_G:25727714:0,0,0,1
chr6	25770239	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	25770707	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:4,2:1,6:3,3,2,6
chr6	25778055	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr6	25778291	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=197,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:25778291_GG_CA:25778291:0,3,0,1
chr6	25778296	.	G	GTAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=197,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:25778291_GG_CA:25778291:0,3,0,1
chr6	25778297	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=197,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:25778291_GG_CA:25778291:0,3,0,1
chr6	25798932	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr6	25801057	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,14,0
chr6	25914901	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,4:5,6:3,7,1,9
chr6	25918688	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:9,8:7,8:8,8,13,3
chr6	25924158	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	25983314	.	CAAAAT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr6	26021813	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=262,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,6:0,4:2,0,9,1
chr6	26027135	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,32:0.516:62:14,17:16,15:30,0,31,1
chr6	26031868	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:12,10:4,12:16,0,20,2
chr6	26033809	.	T	TAAG	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=123.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,33:0.514:64:13,17:16,11:5,26,4,29
chr6	26056708	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.426:37:7,3:14,10:3,18,2,14
chr6	26091429	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	26093405	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:26,2:18,1:15,33,1,2
chr6	26123933	.	A	G	.	.	DP=193;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=265.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,88:0.486:181:45,41:47,46:48,45,41,47
chr6	26124243	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=208,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,5:8,2:0,15,0,7
chr6	26124430	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=253.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,79:0.988:79:0,38:0,40:0,0,62,17
chr6	26199524	.	A	G	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=287.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,79:0.988:79:0,42:0,36:0,0,5,74
chr6	26200080	.	C	T	.	.	DP=111;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=167,168;MMQ=46,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=141.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,55:0.501:109:24,22:27,29:24,30,21,34
chr6	26200083	.	A	G	.	.	DP=117;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=170,165;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=158.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,51:0.473:108:19,26:31,25:23,34,22,29
chr6	26217649	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,136;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:21,0:20,3:7,35,0,3
chr6	26234397	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr6	26271241	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,35:0.468:75:22,14:17,21:19,21,20,15
chr6	26271713	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=204,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,4:3,2:0,8,0,6
chr6	26373465	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=153,72;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=25,23;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.541:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr6	26373491	.	GG	TT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.313:11:1,1:3,2:8,0,3,0
chr6	26373495	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=134,138;MMQ=60,51;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:1,2:3,2:4,0,6,0
chr6	26384090	.	CCCT	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCT;STR;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:17,2:9,2:13,14,2,2
chr6	26385679	.	A	AAGAGAAGAGAAAAGCTGTGTTCACCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=169,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr6	26411228	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=23,24;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.798:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	26428842	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr6	26463828	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=190,152;MMQ=60,22;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:26463828_A_C:26463828:0,11,0,2
chr6	26463831	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=194,152;MMQ=60,22;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:26463828_A_C:26463828:0,10,0,2
chr6	26465713	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,178;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,2:6,0:0|1:26465713_C_T:26465713:0,16,0,2
chr6	26465715	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=158,178;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,1:7,0:0|1:26465713_C_T:26465713:0,17,0,2
chr6	26466389	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0|1:26466389_G_A:26466389:0,0,3,14
chr6	26466392	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,5:0,10:0|1:26466389_G_A:26466389:0,0,3,14
chr6	26501471	.	AG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=88.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,8:0,15:0,0,24,2
chr6	26501777	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,7,4
chr6	26505135	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,15,4
chr6	27219511	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	27424960	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,6:0,0,8,1
chr6	27440004	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=103.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0,0,23,4
chr6	27835209	.	AGCGCCG	A	.	.	DP=124;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCGCCG;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,3:0.035:95:35,1:44,1:29,63,1,2
chr6	27880183	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27880183_T_C:27880183:0,0,0,1
chr6	27880192	.	C	CTCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27880183_T_C:27880183:0,0,0,1
chr6	28214646	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	28228644	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:2,1,0,3
chr6	28239932	.	T	TG	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=164.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,21:0,25:0,0,28,19
chr6	28244670	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=140,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:17,2:19,1:18,19,1,2
chr6	28252041	.	GTTTATTTTTAACGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=221,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0,3,0,1
chr6	28265594	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	28334145	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,28;MFRL=235,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:28334145_T_A:28334145:0,1,0,1
chr6	28334147	.	GG	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=235,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28334145_T_A:28334145:0,1,0,1
chr6	28334150	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=235,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28334145_T_A:28334145:0,1,0,1
chr6	28403541	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:3,2,2,0
chr6	28876889	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:5,4:1,2:1,5,0,6
chr6	28876947	.	CC	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=193,165;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr6	28887743	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=203,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:10,0,2,0
chr6	28963338	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:21,0:22,3:29,14,1,2
chr6	29068759	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=130.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,16:0,25:0,0,32,9
chr6	29069016	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=152.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,19:0,27:0,0,22,24
chr6	29069264	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=98.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,15:0,0,17,12
chr6	29069293	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=177,109;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,2:9,0:14,11,2,0
chr6	29069299	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,11:0,0,15,11
chr6	29069337	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=102.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,16:0,0,17,15
chr6	29080349	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=138.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,22:0,0,23,14
chr6	29080450	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,12:0,0,11,19
chr6	29141632	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=132,172;MMQ=49,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,6:7,4:3,7,5,5
chr6	29141743	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,16,6
chr6	29141772	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=134,170;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:7,3:12,7:16,3,9,1
chr6	29142054	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,19:0.625:30:5,11:6,8:0|1:29142054_C_G:29142054:7,4,10,9
chr6	29142064	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,18:0.656:27:3,9:4,6:0|1:29142054_C_G:29142054:7,2,9,9
chr6	29230577	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:6,7:2,6:3,5,6,7
chr6	29230683	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=105,171;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,6:4,5:6,6,7,4
chr6	29274486	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,4:3,6:5,3,8,2
chr6	29323259	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr6	29342825	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:10,4:3,4:5,9,2,6
chr6	29364435	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:0|1:29364435_C_T:29364435:7,2,2,0
chr6	29364441	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,1:0|1:29364435_C_T:29364435:8,2,2,0
chr6	29364615	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,8,9
chr6	29364643	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,18,8
chr6	29364787	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=97.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,14:0,15:0,0,16,14
chr6	29364815	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,12:0,0,14,13
chr6	29364835	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0|1:29364835_T_G:29364835:0,0,8,10
chr6	29364838	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0|1:29364835_T_G:29364835:0,0,8,10
chr6	29364951	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,6,12
chr6	29365078	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,3:9,0:10,8,2,1
chr6	29365241	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,9,13
chr6	29365423	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,1,5
chr6	29394427	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	29407910	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=148,141;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:24,0:15,3:0|1:29407910_G_A:29407910:16,23,0,3
chr6	29407915	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=148,141;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.090:42:22,0:15,3:0|1:29407910_G_A:29407910:16,23,0,3
chr6	29523676	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:8,1:10,6:15,3,7,0
chr6	29555681	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,14,4
chr6	29555778	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=171,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,29:0.682:42:6,14:7,15:6,7,13,16
chr6	29555809	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,23:0.615:37:8,13:6,10:7,7,8,15
chr6	29571577	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	29589124	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:0,4,1,6
chr6	29589158	.	A	AAAAGTGAGACAAATGTGTCATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr6	29589494	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.327:25:2,0:10,0:5,11,9,0
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chr6	29692305	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0,0,1,14
chr6	29693011	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=283.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,86:0.989:86:0,35:0,49:0,0,33,53
chr6	29794860	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,4,11
chr6	29794897	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0|1:29794897_G_C:29794897:0,0,1,9
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chr6	29796152	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr6	29796234	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr6	29796257	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr6	29796306	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,7:0,0,12,4
chr6	29796376	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,19:0,3:0,0,16,6
chr6	29796640	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr6	29796685	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr6	29797173	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=117.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,16:0,0,22,11
chr6	29797553	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=166.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,47:0.967:48:0,17:0,30:1,0,33,14
chr6	29797696	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=146.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,19:0,20:0,0,13,28
chr6	29797782	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,1,18
chr6	29798039	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr6	29798140	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=100.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,14:0,17:0,0,17,14
chr6	29910286	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.968:26:0,13:0,11:0,0,18,8
chr6	29910358	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=156.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,18:0,27:0,0,19,26
chr6	29910402	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,11,17
chr6	29910429	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=104.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,13:0,0,13,17
chr6	29910457	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=107.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,12:0,18:0,0,13,19
chr6	29910473	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=12;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=121.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,12:0,15:0|1:29910473_G_A:29910473:0,0,14,14
chr6	29910478	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=134.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,13:0,14:0|1:29910473_G_A:29910473:0,0,15,16
chr6	29910482	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=12;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=127.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,13:0,15:0|1:29910473_G_A:29910473:0,0,15,14
chr6	29910496	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,15,11
chr6	29910508	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=12;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=111.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,18:0,0,24,12
chr6	29910522	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=176.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,19:0,18:0|1:29910522_G_C:29910522:0,0,32,9
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chr6	29910730	.	T	A	.	.	DP=81;ECNT=13;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=362.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,81:0.988:81:0,37:0,41:0|1:29910716_C_G:29910716:0,0,22,59
chr6	29910742	.	G	C	.	.	DP=63;ECNT=13;MBQ=31,33;MFRL=224,169;MMQ=37,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=204.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,56:0.967:57:0,25:1,30:0,1,10,46
chr6	29910759	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=13;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=177.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,40:0.977:40:0,17:0,23:0|1:29910759_T_A:29910759:0,0,4,36
chr6	29910761	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=13;MBQ=36,27;MFRL=224,160;MMQ=37,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=137.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,38:0.951:39:0,16:1,21:0|1:29910761_G_A:29910761:0,1,3,35
chr6	29910767	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=124.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,9:0,13:0|1:29910759_T_A:29910759:0,0,1,27
chr6	29910770	.	ACCC	A	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=29,25;MFRL=224,145;MMQ=37,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=85.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,21:0.917:22:0,9:1,10:0|1:29910761_G_A:29910761:0,1,0,21
chr6	29910774	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=33,30;MFRL=224,143;MMQ=37,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=73.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.902:18:0,9:1,7:0|1:29910761_G_A:29910761:0,1,0,17
chr6	29910779	.	G	GCTCC	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=72.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,8:0|1:29910761_G_A:29910761:0,0,1,19
chr6	29910820	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=69.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,11:0,0,5,17
chr6	29910834	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,6,18
chr6	29910861	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,9:0,0,6,10
chr6	29910947	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,11:0,0,12,6
chr6	29911000	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=78.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,12:0,9:0,0,18,6
chr6	29911069	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=137.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,18:0,13:0,0,22,11
chr6	29911114	.	GG	AC	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=199.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,19:0,13:0,0,27,19
chr6	29911119	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=238,163;MMQ=25,50;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,47:0.961:48:1,27:0,19:1,0,28,19
chr6	29911154	.	C	A	.	.	DP=78;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=238,159;MMQ=25,54;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=239.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,74:0.975:75:1,42:0,29:1,0,45,29
chr6	29911228	.	A	T	.	.	DP=62;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,42;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=186.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,34:0,23:0,0,28,33
chr6	29911239	.	TT	CA	.	.	DP=52;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=218.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,24:0,23:0,0,16,33
chr6	29911256	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=155.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,22:0,0,15,28
chr6	29911271	.	GT	CG	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=238,159;MMQ=25,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=134.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.943:32:1,13:0,16:0,1,10,21
chr6	29911344	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=102.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,17:0,18:0,0,4,31
chr6	29911360	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=72.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,13:0,0,1,19
chr6	29911419	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	29911837	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=217.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,25:0,40:0,0,52,15
chr6	29912280	.	TG	CA	.	.	DP=108;ECNT=2;MBQ=19,33;MFRL=192,162;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=463.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,106:0.982:107:0,50:0,50:0|1:29912280_TG_CA:29912280:1,0,57,49
chr6	29912297	.	A	G	.	.	DP=113;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=464.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,111:0.991:111:0,56:0,46:0|1:29912280_TG_CA:29912280:0,0,56,55
chr6	29912493	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=76.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,0,26
chr6	29912510	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr6	29912713	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,12,0
chr6	29912830	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=117.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,19:0,14:0,0,22,12
chr6	29912852	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=156.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.974:37:0,17:0,19:0|1:29912852_T_C:29912852:0,0,19,18
chr6	29912856	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=163.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.977:39:0,15:0,18:0|1:29912852_T_C:29912852:0,0,20,19
chr6	29912935	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=197.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.980:46:0,22:0,19:0|1:29912935_C_T:29912935:0,0,25,21
chr6	29912938	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=202.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,47:0.980:47:0,22:0,19:0|1:29912935_C_T:29912935:0,0,26,21
chr6	29912944	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=168.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.976:38:0,20:0,17:0|1:29912935_C_T:29912935:0,0,25,13
chr6	29913042	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=193.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,25:0,32:0,0,25,35
chr6	29913074	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=229.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,53:0.982:53:0,25:0,27:0|1:29913074_A_G:29913074:0,0,25,28
chr6	29913078	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=228.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,52:0.982:52:0,24:0,27:0|1:29913074_A_G:29913074:0,0,23,29
chr6	29913171	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=138.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,15:0,18:0|1:29913171_G_A:29913171:0,0,8,26
chr6	29913191	.	TG	CA	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,14:0,12:0|1:29913171_G_A:29913171:0,0,6,23
chr6	29913201	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=120.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,15:0,11:0|1:29913171_G_A:29913171:0,0,6,21
chr6	29913213	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,11:0,9:0|1:29913171_G_A:29913171:0,0,6,16
chr6	29913344	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,4:0,2:0,0,1,7
chr6	29943336	.	GGT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0|1:29943336_GGT_G:29943336:0,0,0,17
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chr6	30037036	.	CAG	C	.	.	DP=49;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.098:49:19,0:23,4:0|1:30037024_A_C:30037024:2,43,4,0
chr6	30037041	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=30,22;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.082:47:19,0:21,1:0|1:30037024_A_C:30037024:2,42,3,0
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chr6	30037044	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=30,13;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:16,0:22,0:0|1:30037024_A_C:30037024:2,41,2,0
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chr6	30042955	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	30075843	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:5,8:12,9:10,7,13,4
chr6	30076016	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=144,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,1:3,1:0|1:30076016_C_T:30076016:1,6,0,3
chr6	30076018	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=144,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,0:3,2:0|1:30076016_C_T:30076016:1,6,0,3
chr6	30076755	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=121,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.467:17:3,3:5,4:8,1,4,4
chr6	30076828	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:0,2:5,0:1,5,1,1
chr6	30113878	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:6,4:5,4:5,7,0,8
chr6	30121605	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=219,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:1,4,1,5
chr6	30122154	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,10:0,20:0,0,12,19
chr6	30131515	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,3:4,3:8,1,3,3
chr6	30131546	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,5:3,6:3,4,7,4
chr6	30138853	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:3,6,1,8
chr6	30154199	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:2,6:8,5:4,6,7,5
chr6	30157654	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	30166266	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:6,5:10,6:7,9,3,8
chr6	30228230	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=137.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,31,6
chr6	30228379	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=172.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,17:0,29:0,0,7,40
chr6	30228398	.	CG	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=128.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,17:0,24:0,0,3,39
chr6	30228416	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=133.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,19:0,0,3,34
chr6	30228879	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,9:0|1:30228879_C_T:30228879:0,0,10,10
chr6	30228881	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.961:20:0,9:0,10:0|1:30228879_C_T:30228879:0,0,10,10
chr6	30228938	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,17:0,0,17,11
chr6	30229013	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=157,163;MMQ=47,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,32:0.941:35:0,18:1,14:3,0,20,12
chr6	30229034	.	C	CT	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=110.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,19:0,11:0,0,24,7
chr6	30229280	.	CC	AT	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=209.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,22:0,25:0,0,26,22
chr6	30229306	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=155.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,16:0,29:0,0,29,18
chr6	30229457	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=162.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.976:38:0,19:0,17:0|1:30229457_C_T:30229457:0,0,8,30
chr6	30229463	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=156.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,16:0,18:0|1:30229457_C_T:30229457:0,0,6,30
chr6	30229504	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,1,20
chr6	30229990	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,1:0,0,7,1
chr6	30230085	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,11:1,13:1,0,13,12
chr6	30230128	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,7:0,5:1,0,7,5
chr6	30231071	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,13:0,16:0,0,18,11
chr6	30231108	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=101.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,12,19
chr6	30231271	.	CTA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=199,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:30231271_CTA_C:30231271:0,3,0,1
chr6	30231280	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=214,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:30231271_CTA_C:30231271:0,3,0,1
chr6	30297529	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=195,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=109.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,35:0.948:36:1,14:0,18:0,1,9,26
chr6	30308013	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=176,179;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,2:5,0:12,4,2,0
chr6	30309105	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:4,5,2,2
chr6	30309508	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,11,9
chr6	30313227	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:7,8:10,5:7,10,6,8
chr6	30314566	.	TC	GA	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=150.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,15:0,0,15,20
chr6	30314598	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.591:27:6,13:4,3:3,8,5,11
chr6	30314607	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:9,6:5,3:4,11,2,7
chr6	30529587	.	GTC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=206,280;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TC;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,1:6,2:9,0,3,0
chr6	30539438	.	C	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,22:0.371:60:20,12:17,10:0,38,1,21
chr6	30546417	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.696:17:2,5:2,7:0,5,0,12
chr6	30558007	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=128,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:21,3:25,0:22,25,3,0
chr6	30571471	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.391:34:10,4:10,9:13,8,4,9
chr6	30571828	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,1:9,2:13,4,2,1
chr6	30574071	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=221,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:3,1,2,2
chr6	30574154	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=192,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:17,1,2,0
chr6	30574194	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,26:0.515:50:10,11:13,13:18,6,24,2
chr6	30574428	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.463:50:14,15:12,8:12,15,9,14
chr6	30575603	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,12:0,14:0,0,12,14
chr6	30576781	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:5,2:6,6:4,8,4,4
chr6	30577002	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,3:1,6:0,4,0,9
chr6	30594827	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.494:34:8,7:9,8:1,16,4,13
chr6	30594844	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:19,0:14,2:5,28,1,1
chr6	30595882	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:5,7,0,2
chr6	30608273	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:3,2:8,6:7,6,5,4
chr6	30610042	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.432:37:14,7:6,9:2,19,5,11
chr6	30615213	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=244,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr6	30615284	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:6,4:3,3:9,0,8,0
chr6	30615603	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=152,268;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	30620528	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,19:0.432:44:11,9:13,9:14,11,11,8
chr6	30622934	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:9,11:8,7:11,6,12,6
chr6	30624155	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=199,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,8:2,3:5,1,6,5
chr6	30628082	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr6	30629648	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:1,7,2,6
chr6	30633228	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.525:17:3,6:5,3:8,0,7,2
chr6	30633370	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=171,118;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,1:12,2:8,16,0,3
chr6	30640324	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=206,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:5,0,5,0
chr6	30645128	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr6	30647209	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=220,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr6	30653141	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.516:37:8,13:9,5:12,6,5,14
chr6	30656398	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,14:0.521:27:3,5:6,9:0|1:30656398_T_C:30656398:12,1,11,3
chr6	30656407	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=173,210;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,3:0.128:29:8,3:17,0:1|0:30656398_T_C:30656398:22,4,3,0
chr6	30656953	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=254,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr6	30657015	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,17,0
chr6	30658385	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.354:32:6,7:14,4:15,6,5,6
chr6	30668143	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=239,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr6	30668447	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,1:3,7:0,5,0,8
chr6	30668488	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:1,2,0,4
chr6	30670292	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,3:2,5,4,3
chr6	30670700	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=193,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:1,2,1,5
chr6	30671452	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.465:30:7,5:9,8:5,11,4,10
chr6	30671760	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.465:30:9,8:7,5:10,6,7,7
chr6	30671969	.	G	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,26:0.455:57:20,14:9,10:16,15,13,13
chr6	30672718	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=128,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,23:0.382:59:15,5:14,11:17,19,11,12
chr6	30673003	.	G	C	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=121,116;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,5:0.082:69:30,1:29,2:29,35,2,3
chr6	30673113	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=138,137;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,25:0.462:53:9,11:14,10:6,22,13,12
chr6	30675135	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.692:20:2,6:3,8:4,2,11,3
chr6	30675425	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.419:34:10,7:9,7:15,5,9,5
chr6	30676046	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,6:7,3:3,7,2,7
chr6	30679333	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,3:0,4,0,6
chr6	30679628	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=116.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,13:0,22:0,0,22,14
chr6	30680562	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,3:4,5:3,6,3,5
chr6	30680608	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,5:6,7:4,4,6,6
chr6	30681980	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	30681994	.	C	CCATTTAGCAAGGGAGAAGGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=147,238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	30682931	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,183;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:18,0:23,3:14,28,0,3
chr6	30688427	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.689:37:5,12:6,11:0,11,0,26
chr6	30691490	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=92.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,37:0.436:85:21,17:24,20:33,15,22,15
chr6	30692230	.	GC	TT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=195,194;MMQ=51,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:1,5,0,7
chr6	30697740	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=210,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr6	30697931	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=195,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.735:28:4,13:2,8:3,4,11,10
chr6	30698541	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=187,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,5:10,5:5,10,3,7
chr6	30708231	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:5,5:7,4:10,3,7,2
chr6	30711805	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=154.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,16:0,27:0,0,25,18
chr6	30712327	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,27:0.437:62:11,12:24,15:11,24,11,16
chr6	30858723	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=184,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:1,0:0,0:8,0,3,0
chr6	30858727	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=14,31;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.263:12:0,2:0,1:9,0,3,0
chr6	30858735	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=19,18;MFRL=180,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,0:2,0:10,0,2,0
chr6	30858848	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.530:28:9,7:4,7:2,11,2,13
chr6	30859239	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=138,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.172:33:9,4:16,1:19,9,2,3
chr6	30859304	.	C	CTG	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=32,19;MFRL=140,118;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=TG;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:1,0:1,0:0,3,0,1
chr6	30859322	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=129,140;MMQ=46,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr6	30859333	.	TGAGA	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=140,140;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr6	30859335	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,22;MFRL=140,185;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr6	30859340	.	G	GTTTATA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=185,140;MMQ=50,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr6	30859352	.	GGGGGC	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=252,118;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	30861000	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=289,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,2,0
chr6	30862423	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:6,5:9,4:5,10,1,8
chr6	30864700	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=180,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:1,4:5,4:2,4,3,5
chr6	30864829	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.537:28:7,6:5,9:7,6,6,9
chr6	30865058	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=232,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr6	30865279	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,3:5,6:3,5,3,6
chr6	30881031	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,24:0.478:50:12,12:13,10:22,4,19,5
chr6	30882513	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=221,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:5,0,6,0
chr6	30882634	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.418:34:5,8:14,6:12,8,8,6
chr6	30882689	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.450:29:9,5:6,7:8,8,3,10
chr6	30882781	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=193,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:1,6:4,0:1,4,0,7
chr6	30882803	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=208,193;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,3:1,2:1,5,3,2
chr6	30882856	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=186,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:4,1,2,1
chr6	30883878	.	AAAGCAACC	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGCAACC;STR;TLOD=192.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.982:46:0,25:0,21:0,0,23,23
chr6	30883920	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,22:0.410:54:18,14:14,8:19,13,13,9
chr6	30884806	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:6,10:5,4:2,9,4,10
chr6	30885639	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,3:1,2:0,7,0,5
chr6	30886729	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:4,2:1,8:3,3,1,9
chr6	30887465	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,1:2,5:7,2,5,1
chr6	30887780	.	C	CTGGGGCGGTGCAGGTGA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=206,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGGGGCGGTGCAGGTGA;STR;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:10,2:1,2:10,1,5,0
chr6	30887988	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.459:35:10,4:9,12:4,15,6,10
chr6	30888161	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=91.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,24:0.556:43:8,11:10,12:0|1:30888161_T_C:30888161:10,9,7,17
chr6	30888169	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,23:0.558:41:9,11:9,11:0|1:30888161_T_C:30888161:10,8,7,16
chr6	30889120	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,27:0.595:45:7,11:11,15:1,17,1,26
chr6	30890055	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.345:30:12,5:7,5:1,19,0,10
chr6	30890206	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.496:27:7,5:3,7:10,4,7,6
chr6	30890431	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:4,7:9,3:9,4,8,3
chr6	30890483	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.390:28:7,3:10,6:8,9,5,6
chr6	30890569	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:2,6:4,5:3,4,6,5
chr6	30890871	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,2,4
chr6	30892054	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.719:18:3,7:0,4:5,0,13,0
chr6	30892322	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:0,6,1,2
chr6	30893226	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=203,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,4:6,1:3,7,1,4
chr6	30893251	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=195,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,4:5,0:3,6,3,1
chr6	30893428	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=184,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:7,4:4,3:4,7,3,5
chr6	30893728	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.423:26:7,7:8,3:5,10,4,7
chr6	30893831	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=186,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.512:31:8,7:7,8:11,4,13,3
chr6	30893866	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:24,0:16,3:30,11,0,3
chr6	30899163	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,5:5,2:7,0,7,0
chr6	30899377	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:8,8:10,6:6,12,6,8
chr6	30919701	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=135,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.484:35:7,9:11,7:13,5,11,6
chr6	30955681	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	30955929	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:3,3:7,3:6,5,3,3
chr6	30956018	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=198,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,0:3,2:0,6,0,2
chr6	31079074	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=195,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,2:3,3:0|1:31079074_C_T:31079074:5,0,7,0
chr6	31079076	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=195,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,4:3,3:0|1:31079074_C_T:31079074:5,0,7,0
chr6	31079236	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=213,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,4:5,5:2,4,1,8
chr6	31079440	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:2,4,4,4
chr6	31079643	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=189,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.699:28:3,9:5,10:4,4,11,9
chr6	31079889	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.398:31:6,8:11,4:11,8,6,6
chr6	31080016	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.586:32:5,13:7,5:2,11,8,11
chr6	31083729	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=152,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:4,1:3,1:7,1,2,0
chr6	31083797	.	ACTT	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=182.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,17:0,23:0|1:31083797_ACTT_A:31083797:0,0,33,8
chr6	31083813	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=78,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=188.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,45:0.959:46:1,23:0,22:0|1:31083797_ACTT_A:31083797:1,0,33,12
chr6	31084075	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,9,17
chr6	31084163	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,13:0,5:0|1:31084163_A_G:31084163:0,0,5,14
chr6	31084170	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=169,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.318:17:8,4:3,1:0|1:31084163_A_G:31084163:3,9,2,3
chr6	31084288	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=101.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,18:0,9:0,0,24,4
chr6	31084435	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,6:4,3:0,8,2,7
chr6	31084639	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:7,7:7,8:7,7,10,5
chr6	31084684	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,19,9
chr6	31084787	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,18:0.559:32:9,6:5,12:0|1:31084787_A_G:31084787:4,10,9,9
chr6	31084792	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=119.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.971:31:0,12:0,15:0|1:31084787_A_G:31084787:0,0,13,18
chr6	31084964	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,14,11
chr6	31085200	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=148.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,21:0,19:0,0,17,25
chr6	31085269	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=104.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,20:0,9:0,0,7,24
chr6	31085340	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,3:3,1:0,5,0,4
chr6	31088037	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr6	31088202	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,3:4,4:1,7,2,5
chr6	31088232	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:31088232_A_G:31088232:0,0,0,11
chr6	31088241	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=47.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0|1:31088232_A_G:31088232:0,0,0,11
chr6	31097301	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:7,0,3,0
chr6	31097453	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=93.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,10:0,16:0,0,11,16
chr6	31105633	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr6	31105891	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=99.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,14:0,0,7,21
chr6	31106133	.	CAG	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:4,5:5,4:0|1:31106133_CAG_C:31106133:1,10,9,0
chr6	31106140	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:5,4:4,3:0|1:31106133_CAG_C:31106133:3,9,9,0
chr6	31106143	.	CAG	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:6,3:3,4:0|1:31106133_CAG_C:31106133:4,8,9,0
chr6	31106149	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,12;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:6,0:6,1:0|1:31106133_CAG_C:31106133:5,8,6,0
chr6	31106268	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,5:5,4:4,4,0,9
chr6	31106606	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr6	31106643	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr6	31111286	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31111286_C_T:31111286:0,1,0,1
chr6	31111288	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31111286_C_T:31111286:0,1,0,1
chr6	31111290	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31111286_C_T:31111286:0,1,0,1
chr6	31112899	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=194,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr6	31112925	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=179,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr6	31113030	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,7,9
chr6	31113052	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:3,5:2,6:1,5,4,7
chr6	31113106	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.628:25:5,7:4,8:7,2,5,11
chr6	31113149	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=195,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:2,4:4,6:5,1,9,2
chr6	31113275	.	AG	GA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:9,11:6,6:10,5,8,9
chr6	31118565	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,5:4,2:6,2,6,1
chr6	31122502	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=162,205;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,0:1,4:1,3,0,5
chr6	31124491	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.545:18:4,4:4,5:8,0,7,3
chr6	31124680	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:10,1:6,1:7,12,2,0
chr6	31124849	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:4,6:3,8:3,4,10,4
chr6	31125067	.	C	CAACT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AACT;STR;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,6:2,4:6,0,10,0
chr6	31125158	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.398:45:17,6:10,10:20,7,10,8
chr6	31129616	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,4:7,6:11,4,5,5
chr6	31129642	.	A	C,G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34,31;MFRL=0,180,139;MMQ=60,60,60;MPOS=8,22;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.67,22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,8:0.417,0.526:14:0,4,4:0,2,3:0,0,7,7
chr6	31130502	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=223,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,3:2,1:1,4,0,5
chr6	31132414	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=195,181;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.529:36:9,12:7,7:10,7,10,9
chr6	31132649	.	A	C	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,30:0.525:57:12,10:15,18:4,23,5,25
chr6	31132689	.	T	TGA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=54.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:6,8:5,7:0,13,0,15
chr6	31133509	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,3:7,4:2,8,0,7
chr6	31133620	.	T	TAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=230,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr6	31133943	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.394:28:10,4:7,6:5,12,3,8
chr6	31236853	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=171.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,24:0,16:0,0,33,10
chr6	31236862	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=141,142;MMQ=60,58;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,32:0.623:51:11,18:8,14:12,7,25,7
chr6	31236998	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=144.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,18:0,15:0|1:31236998_C_T:31236998:0,0,17,17
chr6	31237014	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=151.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,18:0,15:0|1:31236998_C_T:31236998:0,0,20,14
chr6	31237017	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=155.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,18:0,15:0|1:31236998_C_T:31236998:0,0,20,15
chr6	31237027	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=151.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,17:0,14:0|1:31236998_C_T:31236998:0,0,19,15
chr6	31237040	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=30,26;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:4,8:8,10:8,4,10,8
chr6	31237048	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=164.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.975:38:0,10:0,23:0|1:31236998_C_T:31236998:0,0,25,13
chr6	31237061	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=11;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=166.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.978:42:0,17:0,25:0|1:31236998_C_T:31236998:0,0,28,14
chr6	31237087	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,28:0.516:54:12,6:13,21:15,11,18,10
chr6	31237100	.	TC	T	.	.	DP=57;ECNT=11;MBQ=26,30;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=64.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,25:0.455:55:6,11:23,14:20,10,14,11
chr6	31237124	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=209.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,23:0,34:0,0,37,20
chr6	31237162	.	C	G	.	.	DP=75;ECNT=11;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=259.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,35:0,35:0,0,39,32
chr6	31237230	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=283.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,64:0.985:64:0,22:0,39:0|1:31237230_A_G:31237230:0,0,37,27
chr6	31237233	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=291.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,67:0.985:67:0,24:0,37:0|1:31237230_A_G:31237230:0,0,38,29
chr6	31237254	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=110.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,35:0.480:73:16,21:22,14:20,18,13,22
chr6	31237255	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=125.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,38:0.519:73:21,13:14,20:13,22,20,18
chr6	31237323	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=160.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.975:38:0,15:0,18:0|1:31237323_A_G:31237323:0,0,2,36
chr6	31237333	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=157.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,13:0,19:0|1:31237323_A_G:31237323:0,0,2,34
chr6	31237353	.	TG	CA,CG	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=0,33,27;MFRL=0,188,159;MMQ=60,60,60;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=25.03,35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,10,12:0.441,0.522:22:0,5,7:0,5,5:0,0,1,21
chr6	31237405	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr6	31237437	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=0,23;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	31237660	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0|1:31237660_A_G:31237660:0,0,15,4
chr6	31237664	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,9:0,8:0|1:31237660_A_G:31237660:0,0,15,4
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chr6	31237767	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=240.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,54:0.983:54:0,30:0,24:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,40,14
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chr6	31237771	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=254.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,57:0.983:57:0,26:0,20:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,43,14
chr6	31237773	.	TG	CC	.	.	DP=62;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=277.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,62:0.984:62:0,33:0,20:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,48,14
chr6	31237776	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=10;MBQ=34,27;MFRL=159,178;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,31:0.530:58:20,16:7,13:21,6,24,7
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chr6	31237802	.	A	G	.	.	DP=88;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=350.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,84:0.989:84:0,47:0,34:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,67,17
chr6	31237833	.	T	C	.	.	DP=119;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=368.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,110:0.983:111:1,55:0,51:0,1,78,32
chr6	31237876	.	A	G	.	.	DP=123;ECNT=14;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=386.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,112:0.992:112:0,55:0,54:0,0,45,67
chr6	31237918	.	G	A	.	.	DP=102;ECNT=14;MBQ=32,28;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=114.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,46:0.460:100:26,23:26,21:10,44,11,35
chr6	31237931	.	CAGA	C	.	.	DP=86;ECNT=14;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=358.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,83:0.988:83:0,35:0,38:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,18,65
chr6	31237950	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=14;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=245.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,55:0.982:55:0,22:0,21:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,14,41
chr6	31237955	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=187.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,20:0,20:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,9,33
chr6	31237960	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=14;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=178.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,40:0.976:40:0,16:0,18:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,8,32
chr6	31237962	.	TG	CA	.	.	DP=36;ECNT=14;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=160.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,16:0,19:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,8,28
chr6	31237971	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=14;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=129.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,15:0,12:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,8,21
chr6	31237975	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=14;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=133.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,10:0,7:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,11,19
chr6	31237991	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=14;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=137.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,17:0,9:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,17,14
chr6	31238009	.	TT	CG	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=30,32;MFRL=176,180;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.307:37:14,8:12,2:12,14,6,5
chr6	31238010	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=77.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,22:0,15:0,0,19,23
chr6	31238029	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=14;MBQ=15,33;MFRL=235,186;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=233.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,53:0.964:54:0,24:0,23:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:1,0,22,31
chr6	31238053	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=14;MBQ=32,32;MFRL=235,186;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=195.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,47:0.960:48:0,20:1,21:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:1,0,18,29
chr6	31238135	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=216.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,51:0.981:51:0,21:0,30:0|1:31238135_G_A:31238135:0,0,32,19
chr6	31238138	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=217.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,51:0.981:51:0,16:0,26:0|1:31238135_G_A:31238135:0,0,31,20
chr6	31238147	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=152.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,10:0,20:0|1:31238135_G_A:31238135:0,0,23,13
chr6	31238179	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=174,163;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.603:36:3,8:11,12:9,5,11,11
chr6	31238230	.	G	C	.	.	DP=64;ECNT=9;MBQ=35,30;MFRL=235,182;MMQ=58,47;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=264.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,63:0.970:64:0,31:1,27:0|1:31238230_G_C:31238230:0,1,28,35
chr6	31238234	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=235,181;MMQ=58,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=263.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,63:0.970:64:0,27:1,32:0|1:31238230_G_C:31238230:0,1,30,33
chr6	31238259	.	G	T	.	.	DP=67;ECNT=9;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=200.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.985:66:0,21:0,41:0,0,31,35
chr6	31238297	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=9;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=191.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,17:0,44:0,0,38,25
chr6	31238308	.	G	C	.	.	DP=67;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=282.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,66:0.985:66:0,21:0,43:0|1:31238308_G_C:31238308:0,0,42,24
chr6	31238318	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=264.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,61:0.984:61:0,21:0,37:0|1:31238308_G_C:31238308:0,0,40,21
chr6	31238334	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,31:0.500:62:11,16:18,15:23,8,21,10
chr6	31238372	.	C	G	.	.	DP=74;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=263,181;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=310.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,72:0.973:73:0,26:1,43:0|1:31238372_C_G:31238372:1,0,46,26
chr6	31238377	.	G	C	.	.	DP=75;ECNT=9;MBQ=23,33;MFRL=263,179;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=297.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,68:0.972:69:0,27:1,41:0|1:31238372_C_G:31238372:1,0,41,27
chr6	31238490	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=349.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,80:0.988:80:0,41:0,37:0|1:31238490_T_C:31238490:0,0,22,58
chr6	31238492	.	C	A	.	.	DP=80;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=349.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,80:0.988:80:0,39:0,36:0|1:31238490_T_C:31238490:0,0,22,58
chr6	31238522	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=5;MBQ=36,30;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,28:0.513:54:13,10:13,15:6,20,3,25
chr6	31238524	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=232.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,56:0.983:56:0,23:0,29:0|1:31238524_G_A:31238524:0,0,9,47
chr6	31238535	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=199.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,48:0.980:48:0,15:0,30:0|1:31238524_G_A:31238524:0,0,2,46
chr6	31238754	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=182,213;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:16,1:7,2:21,2,3,0
chr6	31238759	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=111.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0|1:31238759_C_T:31238759:0,0,23,2
chr6	31238762	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=112.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,16:0,8:0|1:31238759_C_T:31238759:0,0,24,2
chr6	31238814	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=172,182;MMQ=43,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.836:22:2,9:1,10:2,1,16,3
chr6	31238851	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=205,184;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=204.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,59:0.968:60:0,30:1,29:1,0,41,18
chr6	31238909	.	GT	AG,TC	.	.	DP=59;ECNT=8;MBQ=30,30,30;MFRL=184,153,176;MMQ=40,40,40;MPOS=20,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=59.30,26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,17,9:0.300,0.175:55:15,8,6:14,8,2:15,14,16,10
chr6	31238930	.	AG	CA	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=159,194;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:11,9:10,7:13,11,9,9
chr6	31238942	.	G	A,T	.	.	DP=38;ECNT=8;MBQ=0,26,27;MFRL=0,152,183;MMQ=60,40,40;MPOS=15,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=75.27,48.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,22,15:0.588,0.387:37:0,10,6:0,11,6:0,0,15,22
chr6	31238957	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=158.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,16:0,18:0,0,14,23
chr6	31238983	.	G	C,T	.	.	DP=44;ECNT=8;MBQ=32,30,27;MFRL=160,188,186;MMQ=44,40,40;MPOS=24,22;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=37.00,43.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,11,17:0.261,0.401:42:6,4,5:7,7,11:4,10,8,20
chr6	31238992	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=186,153;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,17:0.359:48:12,6:19,9:10,21,6,11
chr6	31238995	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=31,29;MFRL=184,184;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.163:47:14,3:23,4:16,24,0,7
chr6	31239006	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=186,175;MMQ=40,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,21:0.418:50:10,7:18,10:11,18,5,16
chr6	31239050	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=32,27;MFRL=189,148;MMQ=60,31;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,13:0.264:51:16,4:21,9:0|1:31239050_G_A:31239050:18,20,4,9
chr6	31239060	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=13;MBQ=28,33;MFRL=186,148;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,15:0.275:56:19,6:22,8:0|1:31239050_G_A:31239050:19,22,4,11
chr6	31239100	.	AG	GT	.	.	DP=48;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=155,151;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,14:0.320:45:11,7:16,7:12,19,3,11
chr6	31239101	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=13;MBQ=20,28;MFRL=142,162;MMQ=51,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=108.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,34:0.915:38:2,14:0,18:1,3,13,21
chr6	31239108	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=13;MBQ=30,27;MFRL=152,159;MMQ=51,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.392:41:11,7:14,7:5,20,7,9
chr6	31239114	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=152,148;MMQ=59,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,9:0.250:38:12,3:11,5:0|1:31239114_G_T:31239114:9,20,2,7
chr6	31239116	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=13;MBQ=33,26;MFRL=151,148;MMQ=56,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,9:0.270:35:12,3:10,4:0|1:31239114_G_T:31239114:8,18,2,7
chr6	31239135	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=149,136;MMQ=53,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:8,3:5,2:0|1:31239114_G_T:31239114:4,12,1,4
chr6	31239141	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=28,30;MFRL=160,154;MMQ=26,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.778:19:1,7:2,6:1,3,2,13
chr6	31239150	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=159,201;MMQ=46,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,3:3,5:1,9,1,7
chr6	31239151	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=13;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,7:0,0,2,14
chr6	31239170	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=27,33;MFRL=184,192;MMQ=24,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:3,8:0,6:0,3,3,13
chr6	31239205	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,6:0,0,6,13
chr6	31239279	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,57;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0|1:31239279_T_C:31239279:0,0,11,4
chr6	31239296	.	GG	CC,CG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32,32;MFRL=0,200,188;MMQ=60,55,59;MPOS=9,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=20.24,25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,10:0.407,0.553:17:0,4,4:0,2,6:0,0,13,4
chr6	31239306	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0|1:31239279_T_C:31239279:0,0,17,4
chr6	31239378	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=156.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,23:0,19:0,0,31,13
chr6	31239407	.	G	T	.	.	DP=72;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=168,178;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=122.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,33:0.466:71:21,14:16,19:0|1:31239407_G_T:31239407:26,12,26,7
chr6	31239417	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=120.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,33:0.441:75:24,13:18,18:0|1:31239407_G_T:31239407:28,14,26,7
chr6	31239430	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,42:0.521:80:21,19:17,20:25,13,30,12
chr6	31239577	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=192.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,20:0,31:0,0,16,35
chr6	31239585	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=9;MBQ=27,27;MFRL=158,167;MMQ=51,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=81.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,26:0.498:52:10,9:12,8:0|1:31239585_C_T:31239585:8,18,7,19
chr6	31239601	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=9;MBQ=30,28;MFRL=157,186;MMQ=52,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,20:0.466:43:11,9:10,9:0|1:31239585_C_T:31239585:6,17,5,15
chr6	31239614	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=32,26;MFRL=178,190;MMQ=51,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,18:0.442:41:9,9:12,6:0|1:31239585_C_T:31239585:7,16,4,14
chr6	31239622	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=143.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,22:0,17:0,0,13,27
chr6	31239653	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=179,193;MMQ=51,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:9,8:8,5:8,9,5,9
chr6	31239681	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,13:0,0,15,15
chr6	31239722	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=88.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,13:0,0,16,10
chr6	31239752	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,9:0,0,12,8
chr6	31239802	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=138.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,25,12
chr6	31239821	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.474:42:11,13:11,6:9,13,14,6
chr6	31239827	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=137.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,21:0,14:0,0,20,19
chr6	31239855	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=117.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,20:0,14:0,0,13,22
chr6	31239868	.	GT	CC	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=160.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,18:0,0,8,28
chr6	31322133	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=177,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:4,6:8,8:0|1:31322133_A_G:31322133:2,12,4,11
chr6	31322144	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=182,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,14:0.536:26:4,5:8,7:0|1:31322133_A_G:31322133:2,10,4,10
chr6	31322153	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=185,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:5,15,0,2
chr6	31322175	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.932:13:0,4:0,8:0,0,5,8
chr6	31322197	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,23;MFRL=200,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.295:5:0,1:2,0:0|1:31322197_T_A:31322197:2,2,0,1
chr6	31322220	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:31322197_T_A:31322197:0,0,5,1
chr6	31322303	.	C	G	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=136.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,44:0.556:79:17,29:17,14:20,15,30,14
chr6	31322367	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,31:0.499:62:15,16:16,14:14,17,9,22
chr6	31322402	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,29:0.525:55:13,17:12,11:7,19,8,21
chr6	31322459	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=184,161;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.449:36:12,6:7,10:5,15,3,13
chr6	31322470	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,15:0,0,3,27
chr6	31322513	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,1,13
chr6	31322559	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr6	31322782	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0,0,12,0
chr6	31322855	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,4:7,5:7,4,6,3
chr6	31322888	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,17:0,0,21,9
chr6	31322911	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.545:38:9,7:8,12:12,5,17,4
chr6	31322980	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,34:0.574:59:11,13:10,16:0|1:31322980_C_T:31322980:12,13,19,15
chr6	31322996	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=9;MBQ=29,28;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=158.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,40:0.631:63:11,17:12,19:0|1:31322980_C_T:31322980:13,10,18,22
chr6	31323012	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.212:45:14,5:19,4:14,22,4,5
chr6	31323020	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=9;MBQ=29,30;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=140.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,36:0.787:45:4,19:5,17:0|1:31322980_C_T:31322980:4,5,14,22
chr6	31323039	.	T	TGAAGGGCTCCA	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=28,30;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=137.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,34:0.729:46:7,13:5,14:8,4,17,17
chr6	31323115	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=9;MBQ=28,34;MFRL=177,182;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,11:0.146:80:33,7:32,3:0|1:31323115_T_C:31323115:38,31,7,4
chr6	31323128	.	A	G	.	.	DP=86;ECNT=9;MBQ=29,27;MFRL=174,168;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,14:0.170:86:29,9:35,4:0|1:31323115_T_C:31323115:42,30,9,5
chr6	31323134	.	T	C	.	.	DP=95;ECNT=9;MBQ=27,33;MFRL=170,161;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,18:0.196:95:36,11:36,7:0|1:31323115_T_C:31323115:47,30,10,8
chr6	31323143	.	T	C	.	.	DP=107;ECNT=9;MBQ=28,30;MFRL=167,157;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=61.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,21:0.209:103:39,13:40,7:0|1:31323115_T_C:31323115:47,35,9,12
chr6	31323202	.	T	C	.	.	DP=123;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=163,161;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,25:0.214:118:44,16:48,8:49,44,7,18
chr6	31323215	.	T	C	.	.	DP=115;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=164,182;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,22:0.211:106:35,13:43,8:44,40,5,17
chr6	31323233	.	A	G	.	.	DP=123;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=166,186;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,29:0.248:119:37,14:51,15:45,45,3,26
chr6	31323258	.	T	TCC	.	.	DP=122;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=57.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,20:0.190:108:42,11:44,8:31,57,7,13
chr6	31323286	.	C	T	.	.	DP=100;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=168,198;MMQ=40,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,6:0.073:93:40,2:46,4:39,48,0,6
chr6	31323296	.	A	G	.	.	DP=92;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=312.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,86:0.989:86:0,43:0,41:0,0,40,46
chr6	31323409	.	T	C	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=345.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,94:0.990:94:0,48:0,46:0,0,29,65
chr6	31323468	.	G	T	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,31:0.436:71:26,19:13,10:22,18,17,14
chr6	31323945	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.884:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr6	31323953	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:31323953_C_G:31323953:0,0,3,2
chr6	31323958	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,1:0,4:0|1:31323953_C_G:31323953:0,0,6,2
chr6	31323960	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,1:0,5:0|1:31323953_C_G:31323953:0,0,5,2
chr6	31324003	.	TC	GT	.	.	DP=49;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=154,143;MMQ=49,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:23,1:22,1:36,10,2,0
chr6	31324024	.	C	A	.	.	DP=66;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=163,168;MMQ=57,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,28:0.433:65:16,15:18,11:28,9,23,5
chr6	31324025	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=168,163;MMQ=40,57;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,37:0.560:65:16,16:12,15:23,5,28,9
chr6	31324036	.	T	A	.	.	DP=72;ECNT=8;MBQ=26,28;MFRL=149,167;MMQ=57,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,29:0.410:69:18,11:21,11:27,13,23,6
chr6	31324077	.	C	G,T	.	.	DP=51;ECNT=15;MBQ=29,25,30;MFRL=145,200,151;MMQ=51,40,40;MPOS=5,18;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.02,45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,5,18:0.112,0.356:50:10,4,6:17,1,10:12,15,7,16
chr6	31324086	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=144,208;MMQ=47,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:16,2:24,1:14,29,2,1
chr6	31324089	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=15;MBQ=30,29;MFRL=147,137;MMQ=43,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.239:44:11,4:14,6:10,24,2,8
chr6	31324100	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=15;MBQ=32,26;MFRL=138,149;MMQ=40,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.463:38:10,5:9,9:1,19,8,10
chr6	31324144	.	T	A,G	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=28,30,32;MFRL=194,177,165;MMQ=40,27,39;MPOS=15,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.76,18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,6,6:0.211,0.212:30:8,3,5:6,3,1:4,14,4,8
chr6	31324145	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=25,33;MFRL=170,194;MMQ=30,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,18:0.594:30:8,9:4,9:0|1:31324145_A_C:31324145:4,8,4,14
chr6	31324151	.	CA	GG	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=33,32;MFRL=173,196;MMQ=27,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,19:0.625:30:7,10:3,8:0|1:31324145_A_C:31324145:4,7,4,15
chr6	31324154	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=32,25;MFRL=177,192;MMQ=27,39;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,23:0.774:29:3,14:3,8:4,2,4,19
chr6	31324176	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=29,29;MFRL=194,191;MMQ=40,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,4:0.250:18:8,1:6,1:1|0:31324145_A_C:31324145:4,10,2,2
chr6	31324184	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=15;MBQ=29,34;MFRL=191,191;MMQ=40,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.214:12:6,1:3,1:1|0:31324145_A_C:31324145:3,7,2,0
chr6	31324194	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0,0,4,4
chr6	31324200	.	GC	AT	.	.	DP=7;ECNT=15;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,1:0,0,2,4
chr6	31324229	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=33,32;MFRL=157,211;MMQ=42,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,1:2,1:2,1,4,1
chr6	31324245	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=15;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr6	31324247	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=15;MBQ=26,29;MFRL=169,223;MMQ=38,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:2,4:2,2,3,3
chr6	31324368	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:3,3:8,5:0|1:31324368_CA_C:31324368:8,3,3,5
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chr6	31324489	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=15;MBQ=31,27;MFRL=150,163;MMQ=60,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=60.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,17:0.367:47:14,8:13,9:0|1:31324489_C_G:31324489:18,12,15,2
chr6	31324491	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=15;MBQ=31,31;MFRL=156,162;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,18:0.365:50:14,7:15,9:0|1:31324489_C_G:31324489:20,12,16,2
chr6	31324497	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=15;MBQ=27,32;MFRL=158,156;MMQ=60,38;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,20:0.375:54:15,8:17,12:0|1:31324489_C_G:31324489:23,11,18,2
chr6	31324506	.	CT	TC	.	.	DP=67;ECNT=15;MBQ=32,25;MFRL=161,154;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,32:0.478:67:16,11:17,18:0|1:31324489_C_G:31324489:25,10,25,7
chr6	31324516	.	C	A	.	.	DP=69;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=152,159;MMQ=45,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,33:0.493:67:13,12:19,16:0|1:31324516_C_A:31324516:28,6,24,9
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chr6	31324528	.	G	GTT,T	.	.	DP=85;ECNT=15;MBQ=0,33,27;MFRL=0,161,151;MMQ=60,60,45;MPOS=-2147483648,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=176.22,153.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,45,40:0.523,0.466:85:0,23,18:0,14,21:0,0,59,26
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chr6	31324536	.	T	A,C	.	.	DP=91;ECNT=15;MBQ=0,30,32;MFRL=0,166,150;MMQ=60,60,45;MPOS=17,20;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=188.73,156.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,48,41:0.542,0.447:89:0,25,17:0,22,23:0,0,61,28
chr6	31324547	.	G	C	.	.	DP=102;ECNT=15;MBQ=35,32;MFRL=161,138;MMQ=60,45;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=174.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,46:0.452:102:29,19:24,27:0|1:31324489_C_G:31324489:37,19,30,16
chr6	31324549	.	T	C	.	.	DP=102;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=161,138;MMQ=60,45;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=175.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,46:0.456:101:29,17:23,26:0|1:31324489_C_G:31324489:37,18,30,16
chr6	31324586	.	C	T	.	.	DP=110;ECNT=15;MBQ=30,29;MFRL=155,155;MMQ=51,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=191.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,54:0.519:104:21,29:26,23:0|1:31324586_C_T:31324586:19,31,28,26
chr6	31324595	.	C	G	.	.	DP=93;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=153,161;MMQ=51,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=170.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,45:0.484:93:20,19:25,23:0|1:31324586_C_T:31324586:16,32,20,25
chr6	31324601	.	C	CG	.	.	DP=83;ECNT=15;MBQ=34,29;MFRL=153,154;MMQ=58,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=166.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,43:0.518:83:18,20:21,21:0|1:31324586_C_T:31324586:13,27,17,26
chr6	31324603	.	CT	C	.	.	DP=81;ECNT=15;MBQ=33,32;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=162.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,42:0.518:81:17,20:21,19:0|1:31324586_C_T:31324586:12,27,17,25
chr6	31324641	.	T	A	.	.	DP=69;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=153,159;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,28:0.433:65:19,11:14,12:0|1:31324641_T_A:31324641:9,28,6,22
chr6	31324643	.	G	C	.	.	DP=67;ECNT=8;MBQ=32,27;MFRL=154,157;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,29:0.435:67:19,12:14,15:0|1:31324641_T_A:31324641:9,29,6,23
chr6	31324664	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=165,169;MMQ=50,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,16:0.315:52:22,8:9,8:0|1:31324641_T_A:31324641:6,30,4,12
chr6	31324666	.	A	T,C	.	.	DP=54;ECNT=8;MBQ=0,27,27;MFRL=0,169,165;MMQ=60,40,49;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=57.46,113.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,16,35:0.309,0.673:51:0,6,22:0,5,13:0,0,9,42
chr6	31324702	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=27,30;MFRL=162,173;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,23:0.571:40:11,17:6,5:0|1:31324702_C_T:31324702:3,14,5,18
chr6	31324705	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=8;MBQ=26,27;MFRL=162,173;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,23:0.571:40:10,15:6,6:0|1:31324702_C_T:31324702:3,14,5,18
chr6	31324711	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=175,168;MMQ=40,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:10,9:6,3:5,15,2,10
chr6	31324742	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,11:0,4:0,0,2,13
chr6	31324788	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=15;MBQ=29,35;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,3:3,4:0|1:31324788_T_C:31324788:2,7,0,7
chr6	31324790	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=28,34;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.445:16:4,3:2,4:0|1:31324788_T_C:31324788:2,7,0,7
chr6	31324829	.	GG	CA	.	.	DP=13;ECNT=15;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,4:0,0,7,4
chr6	31324847	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=35,33;MFRL=213,144;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:4,1,3,0
chr6	31324850	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=29,31;MFRL=150,228;MMQ=40,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0|1:31324850_G_GC:31324850:5,1,2,0
chr6	31324851	.	A	AC,C	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=0,28,36;MFRL=0,150,228;MMQ=60,40,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=23.13,4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.637,0.272:8:0,1,2:0,3,0:0,0,7,1
chr6	31324857	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=15;MBQ=30,13;MFRL=144,228;MMQ=40,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,0:0|1:31324850_G_GC:31324850:4,1,2,0
chr6	31324861	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=15;MBQ=30,12;MFRL=144,228;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:4,0:0|1:31324850_G_GC:31324850:4,1,2,0
chr6	31324864	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=15;MBQ=26,30;MFRL=210,144;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:2,2:2,1,3,0
chr6	31324887	.	GG	CT	.	.	DP=5;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:31324887_GG_CT:31324887:0,0,5,0
chr6	31324892	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=15;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:31324887_GG_CT:31324887:0,0,5,0
chr6	31324895	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,2:0,2:0|1:31324887_GG_CT:31324887:0,0,5,0
chr6	31324925	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=15;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0|1:31324925_A_G:31324925:0,0,10,3
chr6	31324931	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,3:0,8:0|1:31324925_A_G:31324925:0,0,10,3
chr6	31324953	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=15;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,8:0|1:31324925_A_G:31324925:0,0,10,7
chr6	31324996	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0|1:31324996_G_C:31324996:0,0,1,7
chr6	31325004	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,4:0|1:31324996_G_C:31324996:0,0,1,8
chr6	31325028	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:31324996_G_C:31324996:0,0,0,5
chr6	31325030	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,36;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:31324996_G_C:31324996:0,0,0,5
chr6	31325049	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:31324996_G_C:31324996:0,0,0,5
chr6	31371430	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,7,8
chr6	31378227	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=152,197;MMQ=60,41;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.869:13:0,7:1,2:0|1:31378227_C_CT:31378227:1,0,12,0
chr6	31378228	.	C	CCT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=152,197;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.871:13:0,7:1,3:0|1:31378227_C_CT:31378227:1,0,12,0
chr6	31378640	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=123,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:0|1:31378640_A_G:31378640:0,5,1,6
chr6	31378650	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:31378640_A_G:31378640:0,0,1,9
chr6	31378654	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:31378640_A_G:31378640:0,0,1,8
chr6	31378670	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=193,114;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31378640_A_G:31378640:2,2,0,1
chr6	31378671	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=193,114;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31378640_A_G:31378640:2,2,0,1
chr6	31378675	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=193,114;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31378640_A_G:31378640:2,2,0,1
chr6	31378768	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr6	31379109	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,3,15
chr6	31379752	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=29,23;MFRL=165,155;MMQ=59,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.478:27:7,2:7,10:0|1:31379752_C_T:31379752:7,7,8,5
chr6	31379773	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,9:0,16:0|1:31379752_C_T:31379752:0,0,12,13
chr6	31379794	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0|1:31379752_C_T:31379752:0,0,6,8
chr6	31379807	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,6:0|1:31379752_C_T:31379752:0,0,6,9
chr6	31379817	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0|1:31379752_C_T:31379752:0,0,6,8
chr6	31379823	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0|1:31379752_C_T:31379752:0,0,4,7
chr6	31379931	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,6:0,8:0,0,7,9
chr6	31380034	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.363:39:8,7:16,6:15,10,10,4
chr6	31380091	.	C	CT	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=99.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.953:39:1,10:0,27:1,0,22,16
chr6	31380157	.	TGCTG	T	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCTG;STR;TLOD=84.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.549:40:3,9:9,12:7,11,13,9
chr6	31380161	.	G	GCTGCTGCTGCT	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=37,33;MFRL=101,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.967:23:1,7:0,12:1,0,9,13
chr6	31380194	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,16:0.354:46:11,4:18,12:0|1:31380194_T_C:31380194:14,16,10,6
chr6	31380198	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,17:0.353:49:8,4:21,12:0|1:31380194_T_C:31380194:14,18,10,7
chr6	31382690	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,11,0
chr6	31382770	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,15:1,13:1,0,22,7
chr6	31382882	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,3,24
chr6	31382911	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0|1:31382911_A_G:31382911:0,0,0,17
chr6	31382932	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0|1:31382911_A_G:31382911:0,0,0,11
chr6	31382938	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:31382911_A_G:31382911:0,0,0,9
chr6	31382942	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:31382911_A_G:31382911:0,0,0,8
chr6	31382964	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:31382911_A_G:31382911:0,0,0,5
chr6	31382994	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	31430951	.	C	T	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=143.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,55:0.535:103:23,26:23,28:34,14,36,19
chr6	31431082	.	A	G	.	.	DP=122;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=409.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,114:0.992:114:0,63:0,50:0,0,50,64
chr6	31465899	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,6:4,0:7,1,6,0
chr6	31465915	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,13,1
chr6	31466051	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr6	31473546	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=136.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,21:0,16:0,0,20,18
chr6	31473844	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,10,1
chr6	31475002	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=176,176;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:11,4:17,0:15,13,0,4
chr6	31475084	.	C	CTGGGGTGA	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGGGGTGA;STR;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:11,3:8,9:12,7,6,8
chr6	31475127	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=106.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,11:0,18:0,0,13,17
chr6	31477461	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	31477531	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,7:6,3:11,3,8,2
chr6	31477681	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=106.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,11:0,0,5,27
chr6	31477767	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=37.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr6	31496776	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,7:0,0,16,5
chr6	31496925	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,6:0,0,5,13
chr6	31497457	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr6	31497478	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,13,2
chr6	31497706	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=123.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,22:0,15:0,0,17,25
chr6	31497744	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,4,23
chr6	31498497	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	31506624	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,12:0,13:0|1:31506624_T_C:31506624:0,0,17,9
chr6	31506648	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=118.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,15:0,15:0|1:31506624_T_C:31506624:0,0,16,14
chr6	31506691	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:8,3:6,8:6,8,2,9
chr6	31506744	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr6	31506854	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr6	31509043	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.511:27:6,6:6,5:1,12,1,13
chr6	31509355	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=285.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,67:0.986:67:0,31:0,31:0|1:31509355_G_A:31509355:0,0,56,11
chr6	31509372	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=338.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,84:0.989:84:0,44:0,32:0|1:31509355_G_A:31509355:0,0,64,20
chr6	31509432	.	G	A	.	.	DP=123;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=346.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,117:0.992:117:0,62:0,43:0,0,54,63
chr6	31513402	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=209,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:4,6:0,6:0,4,0,12
chr6	31513864	.	A	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=196.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,32:0,29:0,0,42,19
chr6	31514153	.	GCTGT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGT;STR;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.910:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr6	31525319	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr6	31525912	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,11:0,0,10,8
chr6	31540429	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=212,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:3,0,1,1
chr6	31540784	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:8,5:9,4:3,14,3,6
chr6	31545342	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:2,13,0,2
chr6	31548787	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:5,5,1,1
chr6	31555130	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=179,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.427:21:6,3:6,5:3,9,3,6
chr6	31555392	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr6	31556709	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,2:3,4:0,6,0,6
chr6	31583155	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=165,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:7,2:5,3:10,2,3,2
chr6	31583166	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.621:22:3,7:5,6:3,5,11,3
chr6	31583224	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,20:0.464:43:12,8:11,11:13,10,11,9
chr6	31583827	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:6,5:3,6:9,0,9,3
chr6	31590746	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:4,4:3,4:0,7,1,8
chr6	31592064	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.500:44:7,11:15,11:12,10,9,13
chr6	31593476	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=210,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,7:3,1:4,2,5,3
chr6	31594628	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=104.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,18:0,0,18,13
chr6	31595487	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:8,3:4,2:11,1,6,0
chr6	31595772	.	GCCTGCTGCCCCA	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=203,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.386:11:3,2:3,2:3,4,2,2
chr6	31595882	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,11,2
chr6	31596086	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,34;MFRL=227,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31596086_G_C:31596086:0,1,0,1
chr6	31596089	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,27;MFRL=227,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31596086_G_C:31596086:0,1,0,1
chr6	31596092	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,35;MFRL=227,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31596086_G_C:31596086:0,1,0,1
chr6	31596093	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=227,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31596086_G_C:31596086:0,1,0,1
chr6	31596096	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,24;MFRL=227,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31596086_G_C:31596086:0,1,0,1
chr6	31596100	.	A	T,AG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,30,28;MFRL=0,220,227;MMQ=60,60,60;MPOS=0,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr6	31596102	.	A	ATAAAAGTC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,26;MFRL=220,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:31596086_G_C:31596086:0,1,0,1
chr6	31597166	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:1,13,0,2
chr6	31597456	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.528:15:4,0:2,0:0|1:31597456_A_C:31597456:0,7,8,0
chr6	31597462	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.472:17:5,3:3,4:0|1:31597456_A_C:31597456:1,8,8,0
chr6	31597468	.	CAAG	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.344:24:6,1:3,3:0|1:31597456_A_C:31597456:3,13,8,0
chr6	31597472	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.303:21:9,3:6,3:0|1:31597456_A_C:31597456:3,12,6,0
chr6	31599792	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,4:3,6:5,3,4,6
chr6	31601344	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=247.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,30:0,39:0,0,31,38
chr6	31601390	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=168,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:22,2:29,1:5,46,1,2
chr6	31601513	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=202,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:4,1,2,1
chr6	31601520	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=204,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:5,1,1,1
chr6	31602489	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=200,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:4,4:5,2,6,2
chr6	31602967	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,3:6,2:3,8,3,2
chr6	31603591	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,2:6,3:2,6,1,4
chr6	31604044	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr6	31605199	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:11,9:8,5:11,8,8,6
chr6	31607038	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=125,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,4:5,3:0,6,1,6
chr6	31607050	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,2,12
chr6	31610134	.	G	GTAGCAGGGACCAGATAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr6	31610189	.	TAAAG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31610529	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=99,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	31610686	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:4,4:2,2:3,3,4,3
chr6	31611777	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,3:0,12:0,0,11,4
chr6	31611840	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.421:19:2,1:9,6:6,5,3,5
chr6	31614102	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr6	31616366	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=208,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,0:3,0,4,0
chr6	31627449	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=191,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,6:6,3:7,1,9,1
chr6	31627523	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,18:0,0,22,10
chr6	31628216	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,19:0.433:44:11,9:12,9:10,15,9,10
chr6	31629953	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=183,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,0:1,3:4,0,3,0
chr6	31630241	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.535:41:10,9:9,13:7,12,10,12
chr6	31630318	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=178,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.483:35:8,6:10,10:11,7,11,6
chr6	31633165	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,29:0.616:47:6,16:10,11:16,2,24,5
chr6	31633304	.	G	GGCCCC	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,13:0.287:46:16,4:14,5:0|1:31633304_G_GGCCCC:31633304:0,33,13,0
chr6	31633308	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,10:0.229:46:18,5:18,4:0|1:31633304_G_GGCCCC:31633304:0,36,10,0
chr6	31633313	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,8:0.196:44:17,4:18,1:0|1:31633304_G_GGCCCC:31633304:0,36,8,0
chr6	31633318	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,5:0.146:39:16,0:17,1:0|1:31633304_G_GGCCCC:31633304:0,34,5,0
chr6	31634758	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr6	31637807	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr6	31657413	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,11,11
chr6	31657754	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr6	31659565	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,2:11,0:19,1,2,0
chr6	31659731	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.454:36:8,9:9,6:1,19,0,16
chr6	31669149	.	TAC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.877:13:1,4:0,6:1,0,3,9
chr6	31678028	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr6	31685654	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31687008	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,13:0,0,13,17
chr6	31708147	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=138.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,21:0,16:0,0,36,2
chr6	31713124	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,3:0,0,1,13
chr6	31721524	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=180,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr6	31729359	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.929:16:0,6:0,9:0,1,5,10
chr6	31731014	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,6:0,0,2,16
chr6	31731881	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,7:0,0,14,6
chr6	31744528	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:3,2:5,4:2,9,0,7
chr6	31744532	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,13;MFRL=208,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.396:15:1,1:3,0:1,8,0,6
chr6	31744534	.	T	G,TG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,13,13;MFRL=209,214,149;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.00,5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,5:0.337,0.376:12:0,1,1:2,0,0:1,2,0,9
chr6	31745284	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,2:0,7:0,0,10,1
chr6	31749804	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,9:0,0,14,3
chr6	31765861	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=45.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,6:0,9:0,0,2,17
chr6	31765919	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=184,123;MMQ=54,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:1,1:0|1:31765919_T_C:31765919:0,8,0,2
chr6	31765922	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=184,123;MMQ=54,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:1,1:0|1:31765919_T_C:31765919:0,8,0,2
chr6	31778272	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=221.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,41:0,28:0,0,29,42
chr6	31783507	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=184.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,29:0,21:0,0,48,2
chr6	31785228	.	G	C	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=301.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,97:0.990:97:0,39:0,57:0,0,35,62
chr6	31795949	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,264;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	31797587	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=122.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,20:0,14:0,0,27,7
chr6	31797769	.	A	AAAGTT	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGTT;STR;TLOD=364.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,83:0.989:83:0,41:0,36:0,0,25,58
chr6	31807489	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr6	31833217	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=201,199;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,0:13,3:8,11,0,3
chr6	31837489	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:0,17,0,2
chr6	31837501	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=170,149;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:0,15,0,2
chr6	31842860	.	G	GCGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=248,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	31842869	.	A	AATG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31842869_A_AATG:31842869:0,0,0,1
chr6	31842871	.	T	TGACC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31842869_A_AATG:31842869:0,0,0,1
chr6	31842873	.	G	GGACCAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31842869_A_AATG:31842869:0,0,0,1
chr6	31850807	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=147,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,4:6,5:5,5,3,7
chr6	31851234	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.460:41:11,11:11,6:9,13,8,11
chr6	31856070	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:3,2:5,9:7,2,5,6
chr6	31860337	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:2,4:3,1:0,5,1,4
chr6	31864304	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=170,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:7,5:10,8:7,10,7,6
chr6	31864410	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.449:36:11,8:8,8:15,5,10,6
chr6	31868938	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,34:0.647:52:11,18:7,15:7,11,14,20
chr6	31902156	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31902156_C_CA:31902156:0,3,0,1
chr6	31902157	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31902156_C_CA:31902156:0,3,0,1
chr6	31902163	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,26;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31902156_C_CA:31902156:0,3,0,1
chr6	31905003	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,229;MMQ=60,47;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr6	31905009	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,229;MMQ=60,47;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr6	31912411	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=240,186;MMQ=50,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,1:1,1:4,0,2,0
chr6	31912427	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=224,187;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr6	31912433	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=221,187;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr6	31912438	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=195,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:10,0,2,0
chr6	31914935	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,6:5,4:2,9,2,8
chr6	31915144	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.504:28:6,9:7,5:8,6,10,4
chr6	31918903	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,5:2,6:5,2,9,2
chr6	31919578	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,1:1,1:4,0,3,0
chr6	31919830	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=195,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,3:6,3:0,7,0,6
chr6	31922254	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.508:24:9,5:1,7:6,6,7,5
chr6	31928799	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.621:30:4,9:7,8:9,2,16,3
chr6	31929014	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.417:39:14,8:8,8:15,8,7,9
chr6	31930462	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:8,5:2,9:5,5,5,9
chr6	31936668	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.402:30:8,5:10,6:7,11,7,5
chr6	31938107	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.606:23:5,7:3,7:2,7,5,9
chr6	31962582	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=241,218;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr6	31963627	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=161,159;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.522:15:1,2:3,1:3,4,0,8
chr6	31964549	.	GGG	TTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=225,203;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	31965385	.	G	A	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,32912;MMQ=27,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,5:0.059:98:50,5:42,0:87,6,5,0
chr6	31994723	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=230,221;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:4,4:0,1:4,0,6,0
chr6	31997401	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=190,193;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.330:25:9,3:6,4:17,0,8,0
chr6	32006214	.	CCTG	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=196,206;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTG;STR;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,1:4,4:11,0,5,0
chr6	32006317	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=162,179;MMQ=27,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,23:0.375:62:21,13:18,9:0|1:32006317_C_T:32006317:21,18,14,9
chr6	32006337	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=164,173;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,23:0.387:60:21,10:13,8:0|1:32006317_C_T:32006317:12,25,9,14
chr6	32006597	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr6	32006655	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,3:1,0:0,5,1,2
chr6	32006858	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.547:30:5,6:8,5:4,9,11,6
chr6	32006886	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:8,8:13,11:11,11,11,8
chr6	32010272	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=162,168;MMQ=54,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:7,2:8,8:12,4,2,8
chr6	32012997	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,188;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,11:0.190:61:24,6:26,5:0,50,0,11
chr6	32023925	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.232:15:5,1:4,0:0|1:32023925_T_G:32023925:5,7,0,3
chr6	32023931	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.231:15:5,0:4,0:0|1:32023925_T_G:32023925:5,7,0,3
chr6	32026107	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:4,2:7,2:5,7,1,3
chr6	32026257	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	32029226	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=108,137;MMQ=59,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,27:0.906:29:0,13:2,13:1,1,13,14
chr6	32029415	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,4,5
chr6	32030284	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=236,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr6	32032743	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.390:28:8,7:9,2:7,10,6,5
chr6	32049539	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr6	32050067	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.779:10:1,6:0,2:0,2,2,6
chr6	32050181	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32050181_T_A:32050181:0,1,0,1
chr6	32050184	.	G	GAGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:32050181_T_A:32050181:0,1,0,1
chr6	32050190	.	CT	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32050181_T_A:32050181:0,1,0,1
chr6	32063317	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr6	32085617	.	CCT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:10,2:4,1:11,3,3,0
chr6	32088854	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:2,3,2,4
chr6	32088988	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=278,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr6	32119898	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,2,9
chr6	32122386	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=108.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,19:0,11:0,0,23,7
chr6	32123361	.	CTGTGTG	C,CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32,16;MFRL=206,195,195;MMQ=60,51,58;MPOS=16,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=TG;STR;TLOD=3.51,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.336,0.334:3:0,0,0:0,1,0:1,0,2,0
chr6	32123639	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.699:28:4,10:4,9:2,6,11,9
chr6	32137953	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,3:12,0:9,13,3,0
chr6	32147291	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=194,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.215:16:6,2:5,1:7,6,3,0
chr6	32147761	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=218.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.986:66:0,36:0,30:0,0,29,37
chr6	32151222	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=205,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:5,3:7,2:4,8,1,4
chr6	32151457	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.077:61:31,4:26,0:24,33,1,3
chr6	32151994	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=143.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.955:42:1,20:0,21:0,1,4,37
chr6	32156330	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,68;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:13,0:6,2:4,15,0,2
chr6	32163136	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=234,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr6	32164869	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=222,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.786:12:2,7:0,3:0|1:32164869_G_C:32164869:0,2,0,10
chr6	32164874	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=222,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.771:11:2,7:0,2:0|1:32164869_G_C:32164869:0,2,0,9
chr6	32167009	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=206,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,2:4,5:0,8,0,7
chr6	32170464	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=209,263;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	32171683	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:2,5,0,6
chr6	32172065	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=120.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,14:0,20:0,0,11,23
chr6	32178773	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=189,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	32183175	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=122,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.552:16:4,5:3,3:2,5,3,6
chr6	32184705	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,6:8,2:15,3,7,1
chr6	32185922	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:1,1,0,3
chr6	32187605	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:6,6:5,4:2,9,2,9
chr6	32187836	.	G	GCC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=50.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:12,8:4,6:16,0,14,0
chr6	32188099	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:12,5:8,6:7,15,2,9
chr6	32188383	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.314:11:2,1:4,2:0,8,1,2
chr6	32190620	.	TC	CC,CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32,20;MFRL=154,158,81;MMQ=60,60,54;MPOS=18,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=21.45,3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,8,2:0.387,0.128:21:3,3,0:8,4,2:5,6,2,8
chr6	32191658	.	TAGC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=214,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AGC;STR;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:4,4:2,4:1,6,1,7
chr6	32191730	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr6	32261507	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=89.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,31:0.441:70:15,16:24,13:15,24,19,12
chr6	32261771	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=201,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,4:2,2:0,8,0,6
chr6	32268501	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:12,4:5,7:11,6,6,5
chr6	32270283	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:7,9:13,12:18,2,17,4
chr6	32270363	.	A	T	.	.	DP=95;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=127.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,47:0.495:95:24,18:23,27:20,28,14,33
chr6	32270500	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:10,5:9,7:2,17,1,11
chr6	32290927	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,7,15
chr6	32290954	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:2,7,3,5
chr6	32291270	.	CAG	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,5:4,4:10,0,8,1
chr6	32291359	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=202.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.983:58:0,30:0,26:0,0,18,40
chr6	32292392	.	C	CAACT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,10:0,0,18,3
chr6	32292560	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=212,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.442:7:3,2:0,1:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,4,0,3
chr6	32292571	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=212,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,4,0,3
chr6	32298372	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.500:44:9,9:13,13:11,11,8,14
chr6	32299873	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.436:28:12,7:3,5:4,12,6,6
chr6	32299908	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:1,12:3,3:2,2,3,12
chr6	32303236	.	T	TA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.440:29:6,5:9,6:3,13,5,8
chr6	32303848	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	32307260	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=190,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,7:4,3:6,0,10,0
chr6	32307382	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,29:0.470:62:11,16:21,13:16,17,7,22
chr6	32307446	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=109.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,1,29
chr6	32310967	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=133,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.298:24:12,4:5,2:11,6,6,1
chr6	32310986	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.390:34:12,7:8,6:12,9,8,5
chr6	32311148	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=206,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,5:2,0:0,4,0,5
chr6	32317467	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.715:12:1,2:1,7:0|1:32317467_T_C:32317467:2,1,7,2
chr6	32317471	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,3:0.250:14:2,2:9,1:1|0:32317467_T_C:32317467:8,3,2,1
chr6	32317635	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:0,8,0,8
chr6	32333837	.	T	TTTC	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTC;STR;TLOD=146.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,18:0,14:0,0,24,11
chr6	32333955	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:13,6:8,11:9,12,8,9
chr6	32335628	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=119,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:6,5:3,1:6,3,5,1
chr6	32335777	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=54.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,5:0,9:0,0,3,13
chr6	32336495	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=118.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0,0,28,3
chr6	32336517	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.585:39:9,13:7,10:12,4,21,2
chr6	32336520	.	AG	A	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.356:43:14,9:12,6:23,5,11,4
chr6	32336586	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,26:0.391:67:23,16:18,10:21,20,12,14
chr6	32337630	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:5,4:4,7:5,4,9,3
chr6	32337686	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=79.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,10,14
chr6	32337854	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.852:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	32339348	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr6	32361677	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=27,30;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,2:8,2:10,1,2,2
chr6	32361694	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=27,30;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,3:9,3:13,2,3,3
chr6	32361742	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.439:20:6,5:5,3:0|1:32361742_CT_C:32361742:8,3,5,4
chr6	32361749	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.440:20:6,6:5,3:0|1:32361742_CT_C:32361742:8,3,5,4
chr6	32361752	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=10;MBQ=34,26;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.465:21:6,3:5,3:0|1:32361742_CT_C:32361742:8,3,5,5
chr6	32361762	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=35,30;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.473:17:3,5:6,2:0|1:32361742_CT_C:32361742:5,4,4,4
chr6	32361809	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=31,34;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,1:10,1:5,9,1,2
chr6	32361841	.	TG	CA	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=30,35;MFRL=174,88;MMQ=60,58;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,1:5,1:2,14,0,2
chr6	32361858	.	CT	TG	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=32,30;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:0,12,0,3
chr6	32361894	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=25,32;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr6	32362416	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	32362433	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr6	32362453	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,1:2,1:3,0,2,1
chr6	32362669	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:6,4:5,5:3,8,3,7
chr6	32362702	.	TG	CT	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:7,6:7,6:6,8,5,8
chr6	32362741	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:7,5:4,7:0|1:32362741_C_T:32362741:5,6,7,5
chr6	32362745	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:7,5:4,7:0|1:32362741_C_T:32362741:6,6,7,5
chr6	32362832	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:2,3,0,8
chr6	32363774	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,5:2,0:8,0,5,0
chr6	32363816	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,23,1
chr6	32363844	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=201,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.617:32:5,11:7,8:9,3,15,5
chr6	32363955	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=139.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,24:0,14:0,0,21,17
chr6	32369643	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr6	32370616	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	32370684	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=229,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.597:20:0,3:7,9:7,1,10,2
chr6	32370835	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,27:0.519:52:11,13:14,14:14,11,13,14
chr6	32407709	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:5,3,5,1
chr6	32410137	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,1:0,0,5,1
chr6	32410159	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.542:11:3,5:2,1:4,1,6,0
chr6	32410941	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,16,3
chr6	32410987	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=79.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,8:0,0,17,7
chr6	32411035	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,14,10
chr6	32411523	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:8,7:11,11:13,6,13,5
chr6	32411726	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr6	32485643	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=35484,206;MMQ=60,20;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:32485643_A_G:32485643:2,0,0,1
chr6	32485652	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=35484,206;MMQ=60,20;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:32485643_A_G:32485643:2,0,0,1
chr6	32485655	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=35484,206;MMQ=60,20;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:32485643_A_G:32485643:2,0,0,1
chr6	32487058	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=32,32;MFRL=167,170;MMQ=33,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr6	32487059	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=25,34;MFRL=170,167;MMQ=43,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	32487068	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	32487094	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=14;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	32487096	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=14;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr6	32487114	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=14;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	32487172	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=14;MBQ=32,23;MFRL=178,106;MMQ=25,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:2,3:9,5:7,4,6,2
chr6	32487175	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=14;MBQ=24,28;MFRL=106,178;MMQ=27,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.567:19:3,2:5,8:6,2,7,4
chr6	32487214	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=14;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr6	32487229	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=14;MBQ=32,29;MFRL=140,132;MMQ=27,26;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr6	32487256	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=154,210;MMQ=27,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:0,1:7,3:2,5,4,1
chr6	32487268	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=14;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,3,6
chr6	32487277	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=14;MBQ=30,30;MFRL=189,202;MMQ=40,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:3,4,1,6
chr6	32487309	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=14;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,39;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,6:0,0,5,12
chr6	32487353	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr6	32487390	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32487390_T_G:32487390:0,0,0,1
chr6	32487398	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=210,146;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:32487390_T_G:32487390:0,1,0,1
chr6	32487420	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=226,146;MMQ=53,27;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32487390_T_G:32487390:0,2,0,1
chr6	32487424	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=34,25;MFRL=226,146;MMQ=53,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32487390_T_G:32487390:0,2,0,1
chr6	32487425	.	TCAACTA	T	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=33,27;MFRL=226,146;MMQ=53,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32487390_T_G:32487390:0,2,0,1
chr6	32487439	.	GG	AC	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,20;MFRL=0,226;MMQ=60,53;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:32487439_GG_AC:32487439:0,0,0,2
chr6	32487451	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:32487439_GG_AC:32487439:0,0,0,2
chr6	32487458	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:32487439_GG_AC:32487439:0,0,0,2
chr6	32487474	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,24;MFRL=0,241;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32487439_GG_AC:32487439:0,0,0,1
chr6	32487476	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,241;MMQ=60,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32487439_GG_AC:32487439:0,0,0,1
chr6	32489734	.	GG	AT	.	.	DP=11;ECNT=21;MBQ=29,28;MFRL=143,152;MMQ=50,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:1,3:5,1:0|1:32489734_GG_AT:32489734:4,2,2,2
chr6	32489743	.	C	CTG	.	.	DP=7;ECNT=21;MBQ=31,32;MFRL=145,152;MMQ=46,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,3:2,1:0|1:32489734_GG_AT:32489734:2,1,2,2
chr6	32489745	.	CGG	C	.	.	DP=6;ECNT=21;MBQ=31,32;MFRL=112,152;MMQ=50,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0|1:32489734_GG_AT:32489734:1,1,2,2
chr6	32489749	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=21;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,57;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:32489749_G_C:32489749:0,0,3,3
chr6	32489751	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=21;MBQ=29,32;MFRL=112,146;MMQ=50,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,3:2,1:0|1:32489734_GG_AT:32489734:1,1,2,3
chr6	32489753	.	CTG	C	.	.	DP=7;ECNT=21;MBQ=32,34;MFRL=146,112;MMQ=60,50;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:1,1:2,3,1,1
chr6	32489754	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=21;MBQ=0,29;MFRL=145,146;MMQ=54,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.799:6:0,2:0,2:0|1:32489734_GG_AT:32489734:1,0,2,3
chr6	32489758	.	T	TGC	.	.	DP=6;ECNT=21;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,53;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:32489749_G_C:32489749:0,0,2,4
chr6	32489766	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=21;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,41;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:32489749_G_C:32489749:0,0,0,8
chr6	32489791	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=21;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:32489734_GG_AT:32489734:0,0,1,7
chr6	32489794	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=21;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:32489734_GG_AT:32489734:0,0,1,7
chr6	32489813	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=21;MBQ=32,32;MFRL=188,178;MMQ=40,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:3,3:2,1:1,5,0,4
chr6	32489852	.	AA	GC	.	.	DP=5;ECNT=21;MBQ=25,32;MFRL=200,181;MMQ=39,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:32489852_AA_GC:32489852:1,2,0,2
chr6	32489853	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=21;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,39;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.819:3:0,1:0,1:0|1:32489853_A_C:32489853:0,0,1,2
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chr6	32497905	.	G	T	.	.	DP=94;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=150,146;MMQ=51,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=218.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,69:0.747:92:12,31:8,37:12,11,39,30
chr6	32497917	.	C	A	.	.	DP=96;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=136,177;MMQ=39,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,25:0.280:90:31,12:32,12:30,35,14,11
chr6	32497918	.	C	G	.	.	DP=95;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=148,143;MMQ=40,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=87.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,25:0.268:95:29,14:35,9:0|1:32497896_A_T:32497896:36,34,13,12
chr6	32497928	.	G	C	.	.	DP=81;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=148,143;MMQ=40,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,25:0.313:81:22,14:26,8:0|1:32497896_A_T:32497896:28,28,13,12
chr6	32497943	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=13;MBQ=29,30;MFRL=145,140;MMQ=31,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,19:0.435:44:13,12:10,6:0|1:32497943_A_G:32497943:16,9,9,10
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chr6	32497959	.	GCT	G	.	.	DP=45;ECNT=13;MBQ=29,34;MFRL=143,150;MMQ=33,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=105.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,27:0.609:44:4,16:10,9:0|1:32497943_A_G:32497943:10,7,13,14
chr6	32497960	.	CTT	C	.	.	DP=42;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=164,137;MMQ=44,38;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=44.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.826:14:0,4:0,7:0|1:32497958_A_AAC:32497958:1,1,6,6
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chr6	32546743	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=207,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:6,0,3,0
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chr6	32546928	.	CA	C	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=33,32;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.138:34:15,3:14,1:0|1:32546928_CA_C:32546928:8,22,2,2
chr6	32546938	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=28,36;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:11,3:9,1:0|1:32546928_CA_C:32546928:8,16,2,2
chr6	32546940	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=33,26;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.398:23:7,5:6,4:5,9,3,6
chr6	32546941	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.417:22:8,4:5,5:0|1:32546918_G_A:32546918:5,8,2,7
chr6	32546948	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=33,36;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:7,3:6,1:0|1:32546928_CA_C:32546928:4,11,2,2
chr6	32546950	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=27,32;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,4:3,4:0|1:32546918_G_A:32546918:4,6,2,6
chr6	32546953	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=31,27;MFRL=110,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,6:2,3:2,4,4,8
chr6	32546965	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=31,24;MFRL=147,143;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:0|1:32546928_CA_C:32546928:2,9,0,2
chr6	32546978	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=23,32;MFRL=144,146;MMQ=34,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,3:0,1:1,1,0,5
chr6	32546986	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr6	32547947	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=154,141;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:8,6:12,5:17,3,11,0
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chr6	32547982	.	G	A	.	.	DP=90;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=121,141;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,15:0.174:90:37,9:34,6:0|1:32547980_A_G:32547980:45,30,13,2
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chr6	32548520	.	C	T	.	.	DP=132;ECNT=16;MBQ=32,27;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:104,22:0.179:126:45,15:46,7:0|1:32548514_G_A:32548514:90,14,20,2
chr6	32548534	.	C	T	.	.	DP=142;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=159,146;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,20:0.153:135:58,10:46,7:87,28,19,1
chr6	32548554	.	G	C	.	.	DP=142;ECNT=16;MBQ=29,33;MFRL=155,147;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:124,17:0.126:141:59,10:55,6:0|1:32548554_G_C:32548554:85,39,15,2
chr6	32548556	.	C	T	.	.	DP=139;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=155,146;MMQ=59,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:121,16:0.122:137:62,9:51,6:0|1:32548554_G_C:32548554:82,39,14,2
chr6	32548581	.	A	G	.	.	DP=139;ECNT=16;MBQ=28,30;MFRL=158,147;MMQ=52,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=134.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,52:0.397:131:38,26:39,24:42,37,29,23
chr6	32548632	.	T	A	.	.	DP=123;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=154,160;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,36:0.311:117:33,17:44,19:5,76,7,29
chr6	32548646	.	G	T	.	.	DP=115;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,27:0.246:111:41,9:41,17:7,77,1,26
chr6	32548660	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,11:0.136:86:34,6:38,5:5,70,0,11
chr6	32548662	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=11;MBQ=30,32;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=279.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,69:0.854:80:5,30:4,37:0,11,4,65
chr6	32548671	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=11;MBQ=27,32;MFRL=184,160;MMQ=41,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,23:0.393:59:15,11:18,12:2,34,1,22
chr6	32548681	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=225.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,51:0.981:51:0,20:0,23:0|1:32548681_T_C:32548681:0,0,1,50
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chr6	32549236	.	TA	GA,GC	.	.	DP=5;ECNT=17;MBQ=0,37,35;MFRL=0,188,126;MMQ=60,27,40;MPOS=30,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.97,6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.437,0.438:4:0,2,1:0,0,1:0,0,3,1
chr6	32549249	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=17;MBQ=35,36;MFRL=128,181;MMQ=40,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr6	32549259	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=17;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr6	32549284	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=17;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,3,2
chr6	32549296	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=17;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr6	32549313	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=17;MBQ=32,29;MFRL=128,221;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,2:0,1,3,2
chr6	32549356	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=17;MBQ=29,31;MFRL=182,251;MMQ=34,34;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:6,0:8,2:9,5,1,1
chr6	32549362	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=17;MBQ=29,29;MFRL=175,251;MMQ=29,34;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:7,0:9,2:10,6,1,1
chr6	32549401	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=17;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=113.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,11:0,0,24,5
chr6	32549416	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=17;MBQ=33,27;MFRL=174,151;MMQ=37,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.296:35:15,7:10,3:18,7,9,1
chr6	32549443	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=17;MBQ=33,33;MFRL=173,162;MMQ=40,29;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,10:0.215:49:24,8:12,2:30,9,10,0
chr6	32549452	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=17;MBQ=34,35;MFRL=162,167;MMQ=35,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.396:46:18,11:8,7:25,3,12,6
chr6	32549464	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=17;MBQ=29,35;MFRL=166,162;MMQ=40,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.381:40:15,9:9,4:19,6,13,2
chr6	32549475	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=17;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,20:0,9:0,0,29,6
chr6	32549481	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=17;MBQ=32,29;MFRL=162,164;MMQ=39,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:13,7:8,3:19,4,7,3
chr6	32549497	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=17;MBQ=29,29;MFRL=159,161;MMQ=39,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.407:35:11,8:9,4:15,6,9,5
chr6	32549501	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=17;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,37;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=137.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,18:0,14:0,0,23,12
chr6	32549546	.	G	C	.	.	DP=80;ECNT=18;MBQ=32,32;MFRL=162,116;MMQ=50,31;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,3:0.049:79:42,1:28,2:29,47,2,1
chr6	32549548	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=18;MBQ=32,25;MFRL=159,170;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,26:0.337:78:27,16:24,9:24,28,7,19
chr6	32549557	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=18;MBQ=32,33;MFRL=159,169;MMQ=40,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=89.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,25:0.342:74:24,15:23,8:22,27,7,18
chr6	32549564	.	TG	CT	.	.	DP=74;ECNT=18;MBQ=29,20;MFRL=162,105;MMQ=50,32;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,2:0.039:74:38,0:26,2:26,46,2,0
chr6	32549569	.	CT	AG	.	.	DP=72;ECNT=18;MBQ=32,18;MFRL=162,105;MMQ=50,32;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,2:0.041:72:41,0:27,1:24,46,2,0
chr6	32549589	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=18;MBQ=26,35;MFRL=159,149;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,11:0.249:46:21,7:12,4:9,26,2,9
chr6	32549596	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=18;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=184.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,25:0,15:0,0,8,35
chr6	32549607	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=18;MBQ=28,34;MFRL=152,148;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:12,4:9,3:5,17,2,6
chr6	32549611	.	T	A,C	.	.	DP=30;ECNT=18;MBQ=0,25,33;MFRL=0,162,127;MMQ=60,40,40;MPOS=15,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=72.98,25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,19,8:0.671,0.299:27:0,10,4:0,8,4:0,0,6,21
chr6	32549613	.	GG	CA	.	.	DP=26;ECNT=18;MBQ=32,33;MFRL=162,127;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:8,3:5,3:2,16,3,5
chr6	32549626	.	AAC	A	.	.	DP=25;ECNT=18;MBQ=29,26;MFRL=153,192;MMQ=41,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:4,7:8,4:2,11,0,12
chr6	32549627	.	AC	A,CA	.	.	DP=25;ECNT=18;MBQ=0,27,33;MFRL=0,162,153;MMQ=60,41,50;MPOS=30,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.37,36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,11:0.242,0.709:15:0,2,5:0,1,5:0,0,2,13
chr6	32549631	.	C	G,T	.	.	DP=24;ECNT=18;MBQ=0,32,34;MFRL=0,187,159;MMQ=60,40,58;MPOS=-2147483648,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=53.55,36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,10:0.556,0.407:24:0,6,3:0,6,6:0,0,1,23
chr6	32549638	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=18;MBQ=32,29;MFRL=185,164;MMQ=40,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,3:4,8:1,12,1,10
chr6	32549649	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=18;MBQ=34,31;MFRL=164,171;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:4,2:9,4:0,14,1,6
chr6	32549670	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=18;MBQ=34,31;MFRL=174,31294;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,2:9,2:0,13,1,3
chr6	32549681	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=18;MBQ=34,32;MFRL=185,226;MMQ=60,47;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:3,0:9,3:0,12,1,4
chr6	32549711	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=18;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr6	32551935	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=151,196;MMQ=53,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:2,3:5,3:0|1:32551935_G_A:32551935:6,2,3,4
chr6	32551938	.	GG	AT	.	.	DP=17;ECNT=16;MBQ=33,34;MFRL=163,159;MMQ=45,32;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,2:10,0:0|1:32551938_GG_AT:32551938:8,7,2,0
chr6	32551947	.	CG	C	.	.	DP=18;ECNT=16;MBQ=32,34;MFRL=160,152;MMQ=45,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,2:10,1:0|1:32551938_GG_AT:32551938:8,7,3,0
chr6	32551948	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=16;MBQ=28,31;MFRL=150,180;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.530:15:1,3:4,5:0|1:32551935_G_A:32551935:5,2,3,5
chr6	32551949	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=160,152;MMQ=45,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,2:9,1:0|1:32551938_GG_AT:32551938:8,7,3,0
chr6	32551953	.	CCG	C	.	.	DP=20;ECNT=16;MBQ=33,35;MFRL=153,180;MMQ=42,45;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CG;STR;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:5,3:7,5:0|1:32551935_G_A:32551935:10,2,3,5
chr6	32551954	.	CG	C	.	.	DP=20;ECNT=16;MBQ=32,34;MFRL=154,152;MMQ=45,37;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.280:12:3,2:6,1:0|1:32551938_GG_AT:32551938:7,2,3,0
chr6	32551957	.	GC	CT	.	.	DP=22;ECNT=16;MBQ=31,32;MFRL=165,154;MMQ=40,45;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,3:6,5:7,5,7,2
chr6	32551958	.	C	CTT	.	.	DP=22;ECNT=16;MBQ=34,34;MFRL=163,166;MMQ=42,37;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.352:16:5,3:6,1:0|1:32551938_GG_AT:32551938:6,5,4,1
chr6	32551960	.	T	TCC	.	.	DP=22;ECNT=16;MBQ=27,31;MFRL=157,180;MMQ=41,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:7,2:6,5:0|1:32551935_G_A:32551935:11,3,3,5
chr6	32551970	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=16;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,42;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,11:0,0,14,8
chr6	32551991	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=16;MBQ=28,35;MFRL=152,166;MMQ=40,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,1:6,3:10,3,1,3
chr6	32551995	.	A	G,C	.	.	DP=19;ECNT=16;MBQ=0,29,30;MFRL=0,151,166;MMQ=60,40,34;MPOS=13,11;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=58.22,13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,4:0.717,0.238:18:0,8,1:0,5,3:0,0,12,6
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chr6	32552017	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=16;MBQ=32,35;MFRL=154,132;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,2:7,1:5,6,3,0
chr6	32552029	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=16;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,7:0,0,6,7
chr6	32552056	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=26;MBQ=27,32;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:5,4:10,3:7,9,3,6
chr6	32552059	.	G	A,T	.	.	DP=25;ECNT=26;MBQ=32,30,27;MFRL=150,163,145;MMQ=51,60,60;MPOS=22,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.71,22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,7,9:0.288,0.352:25:3,3,5:6,3,4:2,7,8,8
chr6	32552067	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=26;MBQ=32,31;MFRL=163,158;MMQ=60,52;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.308:24:8,2:9,5:0|1:32552067_C_T:32552067:8,9,1,6
chr6	32552075	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=26;MBQ=27,33;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.760:23:2,8:2,9:1,4,9,9
chr6	32552078	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=26;MBQ=29,30;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:9,2:8,2:0|1:32552067_C_T:32552067:9,9,1,3
chr6	32552080	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=26;MBQ=28,33;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:9,2:8,2:0|1:32552067_C_T:32552067:9,9,1,4
chr6	32552081	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=26;MBQ=28,33;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:7,5:6,4:6,7,3,6
chr6	32552085	.	G	T,C	.	.	DP=22;ECNT=26;MBQ=33,31,32;MFRL=182,150,152;MMQ=60,60,60;MPOS=14,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.95,33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,9:0.240,0.400:22:4,3,5:4,2,4:5,3,4,10
chr6	32552091	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=26;MBQ=32,33;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:8,3:8,2:0|1:32552067_C_T:32552067:8,9,1,4
chr6	32552127	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=26;MBQ=34,33;MFRL=192,137;MMQ=56,41;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:3,1,0,2
chr6	32552130	.	CCT	AAA,AGA	.	.	DP=6;ECNT=26;MBQ=0,28,29;MFRL=0,137,192;MMQ=60,41,56;MPOS=25,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.14,14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.333,0.556:6:0,1,2:0,1,2:0,0,3,3
chr6	32552137	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=26;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:32552137_G_A:32552137:0,0,2,3
chr6	32552140	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=26;MBQ=32,30;MFRL=137,167;MMQ=41,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:32552140_T_A:32552140:0,2,2,1
chr6	32552143	.	CA	TC	.	.	DP=5;ECNT=26;MBQ=34,30;MFRL=137,167;MMQ=41,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,2:0|1:32552140_T_A:32552140:0,2,2,1
chr6	32552147	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=26;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:32552137_G_A:32552137:0,0,1,3
chr6	32552170	.	A	ATG	.	.	DP=3;ECNT=26;MBQ=0,28;MFRL=140,175;MMQ=48,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:32552170_A_ATG:32552170:0,1,0,2
chr6	32552171	.	CCA	C	.	.	DP=2;ECNT=26;MBQ=0,36;MFRL=0,175;MMQ=60,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:32552170_A_ATG:32552170:0,0,0,2
chr6	32552183	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=26;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:32552183_A_AC:32552183:0,0,0,3
chr6	32552184	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=26;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:32552183_A_AC:32552183:0,0,0,3
chr6	32552206	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=26;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0|1:32552140_T_A:32552140:0,0,0,4
chr6	32552212	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=26;MBQ=29,33;MFRL=205,222;MMQ=39,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr6	32552219	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=26;MBQ=28,32;MFRL=222,205;MMQ=45,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr6	32552237	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=26;MBQ=0,35;MFRL=0,246;MMQ=60,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0|1:32552140_T_A:32552140:0,0,0,4
chr6	32552247	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=26;MBQ=0,28;MFRL=0,246;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0|1:32552140_T_A:32552140:0,0,0,4
chr6	32552251	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=26;MBQ=0,25;MFRL=0,222;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:32552140_T_A:32552140:0,0,0,3
chr6	32552253	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=26;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:32552140_T_A:32552140:0,0,0,3
chr6	32557319	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=16;MBQ=32,27;MFRL=175,164;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,20:0.362:56:19,15:15,4:0|1:32557319_A_T:32557319:34,2,18,2
chr6	32557339	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=173,194;MMQ=57,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=65.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,20:0.313:65:23,15:22,5:0|1:32557319_A_T:32557319:43,2,17,3
chr6	32557365	.	A	C	.	.	DP=77;ECNT=16;MBQ=31,32;MFRL=163,181;MMQ=52,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,10:0.143:75:36,3:28,7:0|1:32557365_A_C:32557365:46,19,10,0
chr6	32557375	.	T	TA	.	.	DP=74;ECNT=16;MBQ=26,25;MFRL=173,179;MMQ=51,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,10:0.145:74:30,4:30,5:0|1:32557365_A_C:32557365:42,22,10,0
chr6	32557378	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=16;MBQ=27,32;MFRL=173,180;MMQ=48,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,9:0.130:75:33,4:32,5:0|1:32557365_A_C:32557365:42,24,9,0
chr6	32557405	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=16;MBQ=30,30;MFRL=169,159;MMQ=40,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,15:0.207:75:34,7:21,6:31,29,9,6
chr6	32557414	.	A	T	.	.	DP=75;ECNT=16;MBQ=29,30;MFRL=169,161;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,5:0.078:75:38,2:25,3:0|1:32557414_A_T:32557414:38,32,2,3
chr6	32557423	.	G	T	.	.	DP=69;ECNT=16;MBQ=31,26;MFRL=169,179;MMQ=40,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,10:0.159:67:35,5:22,5:29,28,9,1
chr6	32557435	.	AC	CC,CG	.	.	DP=79;ECNT=16;MBQ=22,32,27;MFRL=129,169,180;MMQ=38,40,40;MPOS=14,8;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=234.34,26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,65,9:0.842,0.122:76:0,38,3:2,26,3:2,0,40,34
chr6	32557446	.	G	C	.	.	DP=87;ECNT=16;MBQ=34,28;MFRL=169,182;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,14:0.182:80:37,6:24,8:0|1:32557414_A_T:32557414:40,26,4,10
chr6	32557477	.	G	A	.	.	DP=111;ECNT=16;MBQ=32,27;MFRL=154,182;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,16:0.152:110:47,8:42,7:0|1:32557477_G_A:32557477:51,43,5,11
chr6	32557478	.	CG	AA	.	.	DP=114;ECNT=16;MBQ=31,29;MFRL=159,167;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,25:0.228:112:43,14:37,10:44,43,13,12
chr6	32557483	.	T	C	.	.	DP=115;ECNT=16;MBQ=28,32;MFRL=158,168;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=223.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,58:0.505:115:30,30:21,25:29,28,29,29
chr6	32557486	.	T	A	.	.	DP=119;ECNT=16;MBQ=29,27;MFRL=154,182;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:103,16:0.140:119:54,8:43,7:0|1:32557477_G_A:32557477:54,49,5,11
chr6	32557489	.	A	T	.	.	DP=125;ECNT=16;MBQ=30,30;MFRL=154,182;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,16:0.138:121:56,7:45,8:0|1:32557477_G_A:32557477:55,50,5,11
chr6	32557506	.	T	C	.	.	DP=119;ECNT=16;MBQ=30,32;MFRL=162,142;MMQ=60,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=162.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,47:0.403:117:35,26:34,19:29,41,24,23
chr6	32557529	.	C	G	.	.	DP=101;ECNT=19;MBQ=33,34;MFRL=154,151;MMQ=54,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,5:0.060:97:45,1:38,4:32,60,1,4
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chr6	32557550	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=19;MBQ=27,34;MFRL=150,142;MMQ=52,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,11:0.158:74:26,6:31,4:14,49,1,10
chr6	32557552	.	A	C,T,G	.	.	DP=73;ECNT=19;MBQ=26,33,28,35;MFRL=158,128,136,143;MMQ=52,40,40,37;MPOS=12,22,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=56.51,28.80,7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:34,21,10,3:0.308,0.144,0.053:68:17,8,5,0:16,12,4,3:4,30,7,27
chr6	32557568	.	C	CAT	.	.	DP=64;ECNT=19;MBQ=32,35;MFRL=150,142;MMQ=52,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,9:0.158:61:24,4:25,4:0|1:32557568_C_CAT:32557568:6,46,1,8
chr6	32557572	.	G	C	.	.	DP=62;ECNT=19;MBQ=32,29;MFRL=151,142;MMQ=52,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,9:0.161:60:21,5:24,4:0|1:32557568_C_CAT:32557568:5,46,1,8
chr6	32557584	.	A	AC	.	.	DP=54;ECNT=19;MBQ=26,29;MFRL=154,184;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:22,1:21,2:1,45,0,3
chr6	32557585	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=19;MBQ=26,32;MFRL=164,150;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,11:0.230:50:19,4:19,5:1,38,0,11
chr6	32557586	.	C	CT	.	.	DP=54;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=167,135;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,8:0.166:52:19,4:22,3:0|1:32557586_C_CT:32557586:2,42,0,8
chr6	32557592	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=19;MBQ=33,28;MFRL=167,142;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,7:0.154:50:19,3:23,2:0|1:32557586_C_CT:32557586:2,41,0,7
chr6	32557595	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=19;MBQ=32,30;MFRL=167,142;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,7:0.154:50:18,4:20,2:0|1:32557586_C_CT:32557586:2,41,0,7
chr6	32557600	.	T	TC	.	.	DP=45;ECNT=19;MBQ=31,31;MFRL=171,153;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.128:45:15,3:21,2:0|1:32557586_C_CT:32557586:2,38,0,5
chr6	32557601	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=19;MBQ=30,32;MFRL=171,153;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,5:0.133:43:16,3:22,2:0|1:32557586_C_CT:32557586:2,36,0,5
chr6	32557605	.	AGT	A	.	.	DP=41;ECNT=19;MBQ=28,25;MFRL=171,153;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.140:41:16,3:19,2:0|1:32557586_C_CT:32557586:2,34,0,5
chr6	32557606	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=19;MBQ=32,28;MFRL=167,184;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:15,1:15,4:2,29,0,5
chr6	32557608	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=19;MBQ=29,33;MFRL=171,153;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.140:41:16,3:19,2:0|1:32557586_C_CT:32557586:2,34,0,5
chr6	32557610	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=19;MBQ=28,33;MFRL=172,153;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,5:0.143:40:16,3:16,2:0|1:32557586_C_CT:32557586:2,33,0,5
chr6	32557611	.	AG	A	.	.	DP=39;ECNT=19;MBQ=27,26;MFRL=171,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.342:36:9,9:14,3:1,23,1,11
chr6	32557617	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=19;MBQ=34,28;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:5,11:13,4:1,19,1,14
chr6	32605284	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.571:40:7,16:10,7:8,9,9,14
chr6	32605295	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,26:0.551:47:8,17:13,9:9,12,15,11
chr6	32605309	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.494:49:8,14:14,9:9,16,14,10
chr6	32609061	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.418:38:10,5:12,9:16,6,11,5
chr6	32609371	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr6	32610349	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=331,170;MMQ=28,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:0,11:1,16:1,0,22,5
chr6	32627882	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr6	32627956	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=108.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,7:0,17:0|1:32627956_C_G:32627956:0,0,19,6
chr6	32627958	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=108.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,7:0,18:0|1:32627956_C_G:32627956:0,0,19,6
chr6	32627988	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,14:0,18:0|1:32627988_A_G:32627988:0,0,25,10
chr6	32627991	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,16:0,19:0|1:32627988_A_G:32627988:0,0,25,10
chr6	32628001	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=185.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.979:44:0,19:0,22:0|1:32627988_A_G:32627988:0,0,27,17
chr6	32628543	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,7:5,4:6,1,11,0
chr6	32629022	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	32629240	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=141.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.972:33:0,13:0,17:0|1:32629240_G_A:32629240:0,0,9,24
chr6	32629247	.	A	AC	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=139.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,14:0,15:0|1:32629240_G_A:32629240:0,0,8,24
chr6	32629257	.	T	A,G	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=0,28,30;MFRL=0,149,168;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=33.66,26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,13,10:0.542,0.425:23:0,6,5:0,7,5:0,0,5,18
chr6	32629297	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:4,2:4,3:0,9,0,5
chr6	32629320	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr6	32629708	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=82.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,5:0,11:0|1:32629708_T_TG:32629708:0,0,15,4
chr6	32629718	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=116.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,10:0,13:0|1:32629708_T_TG:32629708:0,0,20,9
chr6	32629737	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=154.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,43:0.957:44:0,19:1,21:0|1:32629708_T_TG:32629708:1,0,30,13
chr6	32630028	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,3,21
chr6	32630055	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=0,35;MFRL=0,206;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,1,19
chr6	32630066	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0|1:32630066_T_C:32630066:0,0,1,18
chr6	32630073	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,6:0,11:0|1:32630066_T_C:32630066:0,0,1,19
chr6	32630080	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0|1:32630066_T_C:32630066:0,0,0,16
chr6	32630083	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=27,30;MFRL=209,194;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:0,7,0,7
chr6	32630087	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=0,35;MFRL=0,206;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0|1:32630066_T_C:32630066:0,0,0,14
chr6	32630096	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=209,192;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr6	32630101	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr6	32630112	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	32632515	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:32632515_G_A:32632515:0,0,3,0
chr6	32632523	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32632515_G_A:32632515:0,0,3,0
chr6	32632527	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32632515_G_A:32632515:0,0,3,0
chr6	32632529	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32632515_G_A:32632515:0,0,3,0
chr6	32632534	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32632515_G_A:32632515:0,0,3,0
chr6	32632542	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32632515_G_A:32632515:0,0,3,0
chr6	32632587	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr6	32632598	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=12;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr6	32632627	.	CG	TC	.	.	DP=12;ECNT=12;MBQ=34,27;MFRL=139,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:3,3,5,1
chr6	32632628	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=12;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.926:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr6	32632635	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=12;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0|1:32632635_A_C:32632635:0,0,9,4
chr6	32632637	.	TC	GA	.	.	DP=13;ECNT=12;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr6	32632647	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,6:0|1:32632635_A_C:32632635:0,0,11,6
chr6	32632687	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=12;MBQ=27,30;MFRL=161,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,5:6,2:11,2,5,2
chr6	32632688	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=12;MBQ=26,29;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:4,6:2,6:5,2,11,2
chr6	32632711	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=32,26;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,5:6,6:8,5,11,1
chr6	32632714	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,19,5
chr6	32632717	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=32,29;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,3:7,8:12,1,8,5
chr6	32632745	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,15:0,0,22,9
chr6	32632770	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=134.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,19:0,16:0,0,22,15
chr6	32632781	.	AGA	CCC	.	.	DP=45;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=183.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,23:0,16:0,0,23,19
chr6	32632818	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=131.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,18:0,0,16,21
chr6	32632832	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=12;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,19:0,14:0,0,14,21
chr6	32632859	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.943:15:0,12:0,3:0|1:32632859_C_G:32632859:0,0,5,10
chr6	32632864	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.942:15:0,10:0,3:0|1:32632859_C_G:32632859:0,0,5,10
chr6	32632878	.	C	CAGCCTGGCCCT	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=82.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.954:19:0,11:0,5:0|1:32632878_C_CAGCCTGGCCCT:32632878:0,0,2,17
chr6	32632886	.	C	CTG	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,6:0|1:32632878_C_CAGCCTGGCCCT:32632878:0,0,1,16
chr6	32632892	.	CCG	C	.	.	DP=15;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0|1:32632878_C_CAGCCTGGCCCT:32632878:0,0,0,15
chr6	32632915	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0|1:32632915_C_A:32632915:0,0,0,18
chr6	32632917	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,8:0,8:0|1:32632915_C_A:32632915:0,0,0,18
chr6	32634188	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,1:0|1:32634188_T_C:32634188:0,0,5,0
chr6	32634192	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:32634188_T_C:32634188:0,0,4,0
chr6	32634226	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr6	32634263	.	GC	TT	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,18,1
chr6	32634302	.	AG	GA	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,11:0,9:0|1:32634302_AG_GA:32634302:0,0,15,6
chr6	32634313	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.965:27:0,14:0,11:0|1:32634302_AG_GA:32634302:0,0,17,10
chr6	32634369	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,12:0,0,5,19
chr6	32634387	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr6	32634405	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr6	32634426	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr6	32634485	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	32709179	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,8:0,0,19,2
chr6	32709309	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=129.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,24:0,12:0,0,15,23
chr6	32709363	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,7:0,8:0|1:32709363_G_A:32709363:0,0,0,16
chr6	32709370	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0|1:32709363_G_A:32709363:0,0,0,18
chr6	32713018	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,15:0,0,18,11
chr6	32713030	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=99.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,15:0,0,17,12
chr6	32713188	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,4,15
chr6	32713487	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	32713854	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=157.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,31:0,20:0,0,16,35
chr6	32713888	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=159.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,30:0,13:0,0,11,32
chr6	32714175	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=133.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,17:0,23:0,0,5,36
chr6	32714182	.	GA	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=98.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,15:0,15:0,0,2,29
chr6	32724143	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr6	32724258	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,12:0,0,6,18
chr6	32724305	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=45.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0|1:32724305_T_C:32724305:0,0,0,11
chr6	32724312	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:32724305_T_C:32724305:0,0,0,9
chr6	32724317	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:32724305_T_C:32724305:0,0,0,6
chr6	32724324	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:32724305_T_C:32724305:0,0,0,5
chr6	32724987	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=135,74;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:4,1:12,0:14,2,1,1
chr6	32725062	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,10:0,12:0,0,5,17
chr6	32725517	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,8:0,0,20,2
chr6	32725523	.	T	TC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=72.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,10:0,0,21,2
chr6	32725619	.	TG	CA	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=124.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,10:0,16:0|1:32725619_TG_CA:32725619:0,0,13,15
chr6	32725625	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=130.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.970:30:0,13:0,14:0|1:32725619_TG_CA:32725619:0,0,13,17
chr6	32725672	.	A	AG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=96.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,11:0,9:0|1:32725672_A_AG:32725672:0,0,3,19
chr6	32725673	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=96.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,12:0,9:0|1:32725672_A_AG:32725672:0,0,3,19
chr6	32726577	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr6	32726803	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,9,12
chr6	32726838	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=239,162;MMQ=40,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,8:1,17:1,0,14,11
chr6	32727002	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=176,216;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:32727002_A_G:32727002:0,3,0,3
chr6	32727004	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:32727002_A_G:32727002:0,0,0,6
chr6	32729335	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	32729381	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	32729412	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	32729459	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr6	32729642	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=160.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,22:0,0,20,25
chr6	32729734	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=79.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,9:0,0,5,19
chr6	32781121	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,3:1,4:4,0,6,1
chr6	32783086	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.579:43:5,11:12,12:3,15,2,23
chr6	32797620	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:6,5:2,2:9,0,7,0
chr6	32797684	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=141,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:7,7:7,10:9,5,10,7
chr6	32797876	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,13:0,12:0,0,5,20
chr6	32800412	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:12,5:9,4:15,7,6,3
chr6	32805307	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=150.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,26:0,21:0,0,33,16
chr6	32805470	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=143.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,21:0,20:0,0,25,21
chr6	32809223	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr6	32810443	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=108.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,14:0,18:0,0,24,9
chr6	32813279	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,3:5,7:8,0,10,0
chr6	32816700	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,2:4,7:4,1,6,3
chr6	32816958	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	32816993	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=205,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	32819865	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.396:31:8,7:10,5:13,6,9,3
chr6	32824995	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=226,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.784:15:0,5:0,5:3,0,5,7
chr6	32825090	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=140,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:6,3:4,3:5,6,2,4
chr6	32844922	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.594:42:9,13:7,12:5,12,9,16
chr6	32844970	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:7,4:3,4:1,9,0,8
chr6	32847309	.	GC	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:6,9:12,4:4,14,3,10
chr6	32904981	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:11,13:9,6:19,1,15,4
chr6	32916540	.	A	ACTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=89.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,6:0,9:0,0,20,1
chr6	32940621	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.309:14:6,2:4,2:10,0,4,0
chr6	32942302	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,28:0.509:55:14,15:13,13:14,13,15,13
chr6	32943151	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.457:31:4,9:12,5:14,3,12,2
chr6	32943303	.	GTT	G	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=91.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,26:0.436:60:17,11:15,14:14,20,5,21
chr6	32943345	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:14,9:6,6:2,18,1,14
chr6	32943979	.	C	CT	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=87.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,29:0.462:63:18,14:16,15:12,22,5,24
chr6	32944094	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=111,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:13,9:4,8:8,9,5,12
chr6	32945530	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=160.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,22:0,0,26,17
chr6	32948426	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.611:34:7,10:6,11:6,7,13,8
chr6	32974551	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=181,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,3:3,2:3,2,4,2
chr6	32974792	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.505:16:3,4:4,3:6,2,8,0
chr6	32974934	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,25:0.500:50:9,7:13,16:14,11,13,12
chr6	32975014	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:14,8:9,11:6,18,6,14
chr6	32975257	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:11,7:6,8:10,8,10,5
chr6	32975381	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.361:23:8,6:7,2:3,12,0,8
chr6	32975720	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr6	32975869	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:9,6:8,5:7,10,3,8
chr6	32977420	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	33037763	.	A	ATATATCTTCGTATTAAAACT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	33048542	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.587:30:3,7:9,8:6,6,6,12
chr6	33048599	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=163,178;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=68.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,18:0.594:30:2,6:9,12:0|1:33048599_C_A:33048599:5,7,10,8
chr6	33048602	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=163,171;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,16:0.567:28:2,5:10,11:0|1:33048599_C_A:33048599:5,7,9,7
chr6	33048640	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,3:4,7:2,3,3,7
chr6	33132338	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr6	33132833	.	T	TGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=238,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr6	33133695	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:1,2:4,0:5,1,2,0
chr6	33134392	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,4:2,3:2,8,2,5
chr6	33135744	.	AG	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=240,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:33135744_AG_GT:33135744:0,1,0,1
chr6	33135747	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=240,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:33135744_AG_GT:33135744:0,1,0,1
chr6	33136575	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:8,5:3,9:5,6,4,10
chr6	33136638	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,5:0,1:0,3,0,6
chr6	33137727	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,4:2,5:2,2,7,2
chr6	33138498	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:1,3,3,2
chr6	33138677	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:4,4:5,1:2,8,0,5
chr6	33138955	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,3:1,6:7,0,6,3
chr6	33139328	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.489:18:5,5:4,2:2,7,5,4
chr6	33139475	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,8:4,5:2,7,0,13
chr6	33140009	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=153,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:4,3:4,1:9,0,4,0
chr6	33140983	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=215,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr6	33141161	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.366:12:1,1:5,3:5,3,2,2
chr6	33141253	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,1:1,1:5,1,1,1
chr6	33141323	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=147,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:4,0:2,4:1,6,2,2
chr6	33141475	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=156,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,4:2,1:6,2,5,0
chr6	33141920	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:5,1:7,1:7,6,0,3
chr6	33142253	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.497:32:9,5:7,10:14,2,13,3
chr6	33144373	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,5:5,3:5,2,8,0
chr6	33145369	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=222,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,3:1,3:2,0,5,2
chr6	33147589	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,2:0,3:0,0,1,6
chr6	33152835	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,24:0.419:58:15,11:15,11:18,16,13,11
chr6	33152887	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=149,63;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:13,2:13,0:6,21,0,2
chr6	33153528	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:12,8:7,10:12,7,6,12
chr6	33156845	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.571:28:5,6:6,10:6,6,8,8
chr6	33163451	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr6	33172905	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=182,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:9,8:5,1:14,0,9,0
chr6	33172932	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.474:40:13,10:8,8:19,2,16,3
chr6	33173748	.	C	CAGAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=AG;STR;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:0,2:1,2:0,2,3,2
chr6	33175780	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.308:18:5,3:4,2:0,13,0,5
chr6	33176510	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=189,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr6	33179689	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,5:2,8:4,1,11,2
chr6	33232055	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:3,4:2,3:6,0,7,0
chr6	33232521	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:6,1,6,2
chr6	33235755	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.552:25:6,6:5,7:5,6,8,6
chr6	33239905	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,17:0.391:44:10,11:17,6:10,17,4,13
chr6	33240506	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=81.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,25:0.605:41:7,16:9,9:4,12,8,17
chr6	33246518	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:5,3:13,7:7,11,6,4
chr6	33248174	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,19:0,11:0,0,28,2
chr6	33254556	.	C	CG	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=67.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.443:50:17,8:11,13:23,5,12,10
chr6	33254665	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=148,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:6,9:12,2:7,11,5,6
chr6	33255103	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.502:46:9,14:12,8:14,9,16,7
chr6	33255369	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,7:3,4:6,2,10,1
chr6	33256096	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:4,7:9,6:9,4,6,7
chr6	33256397	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=96.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,34:0.585:58:13,18:9,15:12,12,18,16
chr6	33256471	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=119.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,19:0,13:0,0,27,6
chr6	33256984	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:4,6:4,4:0,11,1,9
chr6	33258322	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,4:4,1:2,6,0,5
chr6	33258443	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=195,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:7,7:2,4:8,1,10,1
chr6	33260186	.	CTTT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:2,2:7,4:8,3,3,3
chr6	33261804	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:16,1:21,1:22,16,2,0
chr6	33269394	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,3:1,0:3,0,3,0
chr6	33269689	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=220,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr6	33272287	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:0,8,0,2
chr6	33272712	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.529:24:5,7:5,2:8,3,12,1
chr6	33272855	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:6,11:5,6:5,6,11,6
chr6	33283766	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.541:35:9,10:7,9:6,10,9,10
chr6	33290547	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=196,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.642:18:6,6:0,3:6,0,12,0
chr6	33359716	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.482:48:14,14:10,8:14,11,15,8
chr6	33359820	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,7:0,0,4,19
chr6	33366251	.	A	AT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.387:26:12,4:3,5:0,16,0,10
chr6	33377484	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:4,2:0,3:0,5,0,5
chr6	33379941	.	GAAA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,183;MMQ=59,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.223:10:5,0:2,2:7,1,2,0
chr6	33382457	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,6:4,5:7,3,8,3
chr6	33382943	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=112.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,18:0,16:0,0,11,23
chr6	33385526	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=189,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr6	33400427	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.487:6:1,0:1,0:0|1:33400427_T_A:33400427:1,2,3,0
chr6	33400428	.	G	GGCCC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,19;MFRL=129,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.629:6:1,0:1,0:0|1:33400427_T_A:33400427:0,2,4,0
chr6	33400432	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,12;MFRL=132,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,0:0|1:33400432_CAA_C:33400432:0,3,4,0
chr6	33400438	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=151,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,0:1,0:0|1:33400432_CAA_C:33400432:0,4,4,0
chr6	33400444	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,19;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:3,0:2,0:0|1:33400427_T_A:33400427:1,4,2,0
chr6	33406747	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	33408465	.	TTC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,0:5,4:8,2,2,2
chr6	33408504	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.231:19:4,0:10,0:4,10,5,0
chr6	33408680	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.491:22:4,6:7,3:3,8,4,7
chr6	33410139	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr6	33410682	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:5,0:9,5,2,0
chr6	33411707	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.650:4:1,0:0,1:0,1,0,3
chr6	33412407	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:1,13,0,2
chr6	33414626	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,7
chr6	33414637	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,2:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,5
chr6	33422976	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=162.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,25:0,23:0,0,26,22
chr6	33541507	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr6	33541719	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.572:38:9,7:7,13:3,13,5,17
chr6	33555348	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,13,5
chr6	33555632	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=210,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:33555632_T_C:33555632:0,3,0,1
chr6	33555634	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=210,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:33555632_T_C:33555632:0,3,0,1
chr6	33555669	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33555669_A_G:33555669:0,0,0,1
chr6	33555672	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33555669_A_G:33555669:0,0,0,1
chr6	33608379	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,14:0,0,2,24
chr6	33623536	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.240:17:2,1:6,0:7,6,4,0
chr6	33623667	.	ATG	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:13,0:16,2:3,28,2,0
chr6	33626905	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,5:0,4:0,0,2,9
chr6	33630624	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr6	33630816	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,7:0,0,2,15
chr6	33630846	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr6	33631155	.	TGGGAGG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:33631155_TGGGAGG_T:33631155:0,0,8,0
chr6	33631163	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.904:8:0,4:0,4:0|1:33631155_TGGGAGG_T:33631155:0,0,8,0
chr6	33636232	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,8:0,0,15,1
chr6	33638897	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr6	33641379	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,20:0,11:0,0,16,15
chr6	33644768	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=148.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.974:35:0,12:0,21:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,22,13
chr6	33644773	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=139.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.972:32:0,12:0,20:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,21,11
chr6	33646375	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr6	33648097	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,5,6
chr6	33650430	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,2,15
chr6	33653111	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,9:0,3:0,0,10,3
chr6	33654378	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr6	33654897	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr6	33655173	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=145,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr6	33656416	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr6	33658006	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.315:7:1,0:3,1:1,4,0,2
chr6	33658019	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=17,12;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:0,0:1,2,0,2
chr6	33660411	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	33694434	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,168;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:10,0,2,0
chr6	33695815	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	33696131	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	33703289	.	G	GAGATACATTCAAGAAATAATTTACTAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=132,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.487:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr6	33740325	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=192,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:10,0,3,0
chr6	33740382	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:6,4:4,4:10,0,5,3
chr6	33740592	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:4,4:2,3:0,7,1,6
chr6	33748831	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=89.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,14,10
chr6	33748937	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.587:15:5,2:1,5:1,5,3,6
chr6	33752070	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,2:10,0:7,6,2,0
chr6	33752248	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:33752248_G_A:33752248:2,1,0,1
chr6	33752249	.	G	GCACTTTCC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:33752248_G_A:33752248:2,1,0,1
chr6	33752293	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:33752293_A_T:33752293:0,2,0,1
chr6	33752294	.	A	ACACCTGC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:33752293_A_T:33752293:0,2,0,1
chr6	33752296	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr6	33752297	.	C	CTGATTTAGCT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:33752293_A_T:33752293:0,2,0,1
chr6	33754396	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:6,6:4,8:10,0,15,0
chr6	33768726	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=204,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,4:1,2:3,0,6,1
chr6	33768842	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:18,2:16,0:23,11,2,0
chr6	34003929	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:3,1:12,1:10,5,1,1
chr6	34026938	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr6	34211341	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=76.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,4,18
chr6	34212733	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=33,36;MFRL=187,121;MMQ=50,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:10,2:9,1:0|1:34212733_CA_C:34212733:0,21,3,0
chr6	34212736	.	CG	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=187,121;MMQ=50,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:10,2:11,1:0|1:34212733_CA_C:34212733:0,21,3,0
chr6	34212743	.	A	C,G	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=0,36,33;MFRL=0,121,186;MMQ=60,51,49;MPOS=11,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.85,79.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,22:0.133,0.832:25:0,2,9:0,1,12:0,0,3,22
chr6	34212747	.	CTT	C	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=33,12;MFRL=186,121;MMQ=51,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:10,1:12,0:0|1:34212733_CA_C:34212733:0,24,3,0
chr6	34212755	.	GG	CC	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=34,11;MFRL=190,121;MMQ=51,51;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:7,0:13,1:0|1:34212733_CA_C:34212733:0,20,3,0
chr6	34212760	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=27,0;MFRL=190,143;MMQ=51,55;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:11,0:0|1:34212733_CA_C:34212733:0,20,2,0
chr6	34214994	.	G	GTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr6	34215219	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:4,1:3,0:9,0,0,3
chr6	34263313	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=181,69;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr6	34664207	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,9:0,0,9,1
chr6	34725655	.	G	GTCA	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=229.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,53:0.983:53:0,24:0,23:0|1:34725655_G_GTCA:34725655:0,0,13,40
chr6	34725658	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=226.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,52:0.982:52:0,26:0,25:0|1:34725655_G_GTCA:34725655:0,0,12,40
chr6	34737968	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=200,153;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.444:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr6	34737969	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.278:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr6	34737987	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:9,1,2,1
chr6	34737989	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=162,110;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:5,0:11,1,1,1
chr6	34737994	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:7,1:10,4,2,0
chr6	34738203	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=103,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=44.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.888:16:0,9:1,5:0,1,4,11
chr6	34741174	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chr6	34759903	.	T	TGGCGGCGGCGGCGGCGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,11;RU=GGC;STR;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,0:0,0,4,0
chr6	34759954	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr6	34760162	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,1,8
chr6	34789829	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,33;MFRL=107,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:34789829_A_C:34789829:0,1,0,1
chr6	34789835	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:34789829_A_C:34789829:0,2,0,1
chr6	34791027	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=131.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,24:0,11:0,0,25,12
chr6	34802466	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,3:7,0:13,4,2,1
chr6	34802999	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,15,2
chr6	34804204	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr6	34823510	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.303:27:12,2:7,5:3,16,1,7
chr6	34826921	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=95,185;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,3:5,5:7,3,3,5
chr6	34850660	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,22,1
chr6	34855748	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,4,24
chr6	34857311	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=212,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	34962019	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,14,0
chr6	35052046	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=179,153;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,1:4,0:0|1:35052046_T_G:35052046:3,9,0,2
chr6	35052055	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:3,0:4,1:0|1:35052046_T_G:35052046:2,8,0,3
chr6	35056443	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,7:0,0,2,13
chr6	35088855	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:11,5:8,8:1,18,0,13
chr6	35104018	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,1,3
chr6	35107682	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,7:0,0,11,0
chr6	35205881	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr6	35209544	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:4,2,2,2
chr6	35210194	.	A	ACCTCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:35210194_A_ACCTCCC:35210194:0,0,0,1
chr6	35210198	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35210194_A_ACCTCCC:35210194:0,0,0,1
chr6	35258539	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:1,4,1,7
chr6	35260266	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:1,1:2,1,1,1
chr6	35260588	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=185,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,1:11,1:14,2,2,0
chr6	35261437	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr6	35280553	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:5,0:2,14,0,2
chr6	35287201	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,0:1,0:1,0,2,0
chr6	35287233	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	35287811	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=194,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.407:18:5,5:0,1:0,11,0,7
chr6	35378778	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,4:2,5:2,1,9,0
chr6	35393589	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:6,1:0,3:5,1,5,0
chr6	35423489	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr6	35424188	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr6	35425416	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=195,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:2,3,0,6
chr6	35442997	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=245,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.746:14:1,4:2,5:1,2,2,9
chr6	35443573	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr6	35443835	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:4,4:7,5:6,5,6,4
chr6	35447786	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr6	35448189	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,11:1,14:0,1,8,17
chr6	35471246	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	35471669	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	35473678	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:5,3,1,1
chr6	35477152	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:0,1:0,4,0,4
chr6	35479894	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:35479894_T_G:35479894:0,0,1,0
chr6	35479913	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=162,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:35479894_T_G:35479894:2,0,1,0
chr6	35480524	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:6,0:1,5:0|1:35480524_C_CG:35480524:1,7,0,5
chr6	35480525	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:7,0:1,5:0|1:35480524_C_CG:35480524:1,7,0,5
chr6	35480526	.	CTCCCCAT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:7,0:1,5:0|1:35480524_C_CG:35480524:2,7,0,5
chr6	35610681	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	35715303	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=98,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,8:0,7:0,1,5,10
chr6	35745413	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=177,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr6	35749059	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=123,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr6	35761202	.	C	CAAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,135;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,21;RU=A;STR;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,0:0,2:1,0,2,1
chr6	35765068	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:2,0:0,4:1,2,3,1
chr6	35765151	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=136,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr6	35803283	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:2,2:1,4:0,3,0,7
chr6	35836705	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:8,0,4,0
chr6	35840584	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,0:2,2:0,4,0,2
chr6	35911575	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,128;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr6	35927158	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,6:3,2:9,0,8,0
chr6	35987222	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr6	36020404	.	CC	AA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:18,1,3,0
chr6	36075219	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:3,4,9,0
chr6	36098333	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,19,3
chr6	36103921	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr6	36185681	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:4,10:5,3:5,4,6,7
chr6	36189887	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,11:0,0,17,2
chr6	36238351	.	GC	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.074:51:24,1:22,2:11,37,0,3
chr6	36261885	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,7:0,0,6,5
chr6	36269603	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:7,1,5,3
chr6	36290030	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:1,4:2,2:3,1,5,1
chr6	36294915	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:0,6,0,5
chr6	36296514	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,5:3,6:3,5,3,8
chr6	36297762	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,240;MMQ=60,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	36355372	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.395:21:8,0:3,8:5,8,2,6
chr6	36447287	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	36452603	.	TA	T,TAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=10,29,25;MFRL=183,180,189;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.41,4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,4:0.246,0.248:16:1,2,0:2,2,3:0,8,2,6
chr6	36467791	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:4,5:3,3:1,7,1,7
chr6	36475200	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,3:2,2:5,0,5,0
chr6	36483295	.	CCACA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=224,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=CA;STR;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:2,0:0,2:0,2,0,3
chr6	36492269	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:0,7:5,3:0,5,0,11
chr6	36493265	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,2:3,7:4,0,9,0
chr6	36493330	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:3,5:6,11:6,3,13,3
chr6	36508036	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:2,3:2,3:0,4,1,6
chr6	36566575	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,4:0,0:4,0,4,0
chr6	36569712	.	G	GTT	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=T;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.089:43:17,0:22,3:0|1:36569712_G_GTT:36569712:37,3,2,1
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chr6	36652339	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:0,6,1,4
chr6	36695427	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,156;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,3:13,0:19,8,3,0
chr6	36695519	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.527:21:3,6:6,5:1,9,0,11
chr6	36711406	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.368:14:3,0:5,4:7,2,4,1
chr6	36711589	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:1,2,0,3
chr6	36712962	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr6	36714139	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=136,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,3:1,5:4,1,7,1
chr6	36714230	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,0:12,2:13,5,2,0
chr6	36720758	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr6	36720922	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=83,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:7,4:0,9:4,3,5,8
chr6	36733070	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.473:26:4,7:6,4:13,1,11,1
chr6	36746581	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,3:4,4:8,0,6,1
chr6	36759741	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,7:0,0,11,0
chr6	36759768	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=130,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.437:18:5,4:5,2:9,1,7,1
chr6	36767920	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr6	36789940	.	C	CG	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=44.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:10,8:6,9:5,11,6,12
chr6	36842427	.	C	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=185.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,24:0,26:0,0,51,1
chr6	36853685	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	36853786	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr6	36853857	.	T	TCGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGC;STR;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr6	36867191	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:9,5:1,4:10,1,8,1
chr6	36881991	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=136,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	36884121	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=128,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr6	36887308	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,9:5,3:8,2,9,3
chr6	36930687	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:1,2:4,4:3,2,5,2
chr6	36931549	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=231,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr6	36936771	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,0,11
chr6	36940343	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr6	36943573	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr6	36943605	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr6	36944902	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,3:6,4:10,0,4,3
chr6	36945062	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	36945136	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	36945393	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,170;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.622:27:6,9:3,6:6,4,16,1
chr6	36945746	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:0|1:36945746_A_G:36945746:4,0,6,0
chr6	36945754	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,2:1,4:0|1:36945746_A_G:36945746:4,0,6,0
chr6	36945781	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,5:4,5:9,0,7,3
chr6	36945989	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr6	36949527	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	36976901	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=192,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr6	36978879	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,4:4,0:0,7,0,4
chr6	36988566	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:3,0:9,2:1,11,0,2
chr6	36989263	.	GA	CC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,13;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:2,0:1,1:5,2,4,0
chr6	36989268	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.427:12:2,0:2,0:0|1:36989268_T_A:36989268:5,2,5,0
chr6	36989274	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,0:4,0:0|1:36989268_T_A:36989268:6,3,3,0
chr6	36989391	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,13:0,0,10,16
chr6	37140670	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:10,2:4,1:14,0,3,0
chr6	37141962	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=181,241;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	37247212	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:10,1:9,10,1,1
chr6	37252320	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37252320_GG_CT:37252320:0,1,0,1
chr6	37252327	.	C	CTGTTTCTCACTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=37,34;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37252320_GG_CT:37252320:0,1,0,1
chr6	37252331	.	TC	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37252320_GG_CT:37252320:0,1,0,1
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chr6	37443205	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.265:16:3,0:7,1:4,8,1,3
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chr6	37443214	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:0,1:7,0:4,4,0,2
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chr6	38565936	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:7,0:8,4:0,16,0,4
chr6	38691328	.	GCAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAA;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	38702169	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr6	38750806	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:13,0:14,4:21,7,4,0
chr6	38754502	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr6	38773172	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:3,3:1,0:4,1,3,0
chr6	38775336	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,2:4,7:10,3,8,1
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chr6	38820599	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:1,7:9,2:0,10,0,9
chr6	38828424	.	G	GT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,3:5,5:0,11,2,6
chr6	38828453	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,0:3,3:0,10,0,3
chr6	38831630	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:14,0:17,2:24,9,3,0
chr6	38840601	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,2:4,1:2,9,1,2
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chr6	38843426	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.549:31:5,6:8,11:8,6,9,8
chr6	38851308	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=214,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	38867770	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=195,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr6	38882937	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,3:8,0,6,1
chr6	38899485	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr6	38906072	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	38913177	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	38942393	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=213,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr6	38957771	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr6	38979946	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr6	39033420	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:39033420_A_G:39033420:0,0,6,0
chr6	39033427	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:39033420_A_G:39033420:0,0,5,0
chr6	39033898	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr6	39034072	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:2,3,1,4
chr6	39034095	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=224,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr6	39162206	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr6	39196662	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.659:16:2,3:3,5:5,0,8,3
chr6	39278636	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=101,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:39278636_A_C:39278636:0,2,2,0
chr6	39278642	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=101,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:39278636_A_C:39278636:0,2,2,0
chr6	39278649	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=101,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:39278636_A_C:39278636:0,2,2,0
chr6	39278794	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,3:4,5:4,5,1,7
chr6	39278865	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:39278865_C_G:39278865:0,2,0,2
chr6	39278867	.	C	CATG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:39278865_C_G:39278865:0,2,0,2
chr6	39278879	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:39278879_C_T:39278879:0,0,0,2
chr6	39278883	.	C	CCCCACT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39278879_C_T:39278879:0,0,0,1
chr6	39282018	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	39282748	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,8:6,5:8,5,6,7
chr6	39284520	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=14,12;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.446:9:1,0:0,0:5,0,4,0
chr6	39284526	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=18,12;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.487:8:1,0:1,0:4,0,4,0
chr6	39353538	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	39682367	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr6	39828862	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	39832111	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	39832363	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	39839164	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr6	39846137	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,10:0,0,12,11
chr6	39855427	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr6	39866805	.	A	AACAATGGGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr6	39868070	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=209,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39868070_G_C:39868070:0,1,0,1
chr6	39868072	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=209,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39868070_G_C:39868070:0,1,0,1
chr6	39868074	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=209,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39868074_G_GTC:39868074:0,1,0,1
chr6	39868075	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=209,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39868074_G_GTC:39868074:0,1,0,1
chr6	39869066	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr6	40359674	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=18,13;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:1,0:1,0:0|1:40359674_A_C:40359674:2,2,4,0
chr6	40359680	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=141,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:2,0:2,2:0|1:40359674_A_C:40359674:4,4,3,0
chr6	40359683	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=29,10;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:5,0:3,0:0|1:40359674_A_C:40359674:7,4,3,0
chr6	40359686	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,14;MFRL=141,206;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:3,0:0|1:40359674_A_C:40359674:9,5,2,0
chr6	40359694	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,19;MFRL=143,208;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:11,0:4,0:0|1:40359674_A_C:40359674:10,6,2,0
chr6	40399446	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	41036770	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:1,2:3,3:0,5,0,5
chr6	41037778	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,38:0.471:80:14,14:27,21:29,13,24,14
chr6	41038845	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.523:42:11,4:8,17:16,4,18,4
chr6	41052002	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	41059458	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=214,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,3:2,6:0,2,0,9
chr6	41165819	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=156,192;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:4,2:5,2:0|1:41165819_C_T:41165819:9,1,5,0
chr6	41165840	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=156,184;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.405:13:5,2:2,3:0|1:41165819_C_T:41165819:5,3,4,1
chr6	41166149	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=185,142;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:4,1:2,3:0|1:41166149_A_G:41166149:1,5,2,3
chr6	41166151	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=185,142;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:4,1:2,4:0|1:41166149_A_G:41166149:1,5,2,3
chr6	41166154	.	GT	CC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=185,139;MMQ=60,46;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:4,1:2,5:0|1:41166149_A_G:41166149:1,5,2,4
chr6	41169021	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	41196095	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,10,1
chr6	41196104	.	C	CCTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,5:0,7:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,12,2
chr6	41197434	.	TG	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	41204329	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:6,4:5,5:0,11,1,8
chr6	41243991	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:0,3,4,2
chr6	41304202	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,14;MFRL=216,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:41304202_C_T:41304202:0,3,0,1
chr6	41304208	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=216,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:41304202_C_T:41304202:0,3,0,1
chr6	41304231	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,11;MFRL=190,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:41304231_C_G:41304231:0,2,0,1
chr6	41304239	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,11;MFRL=190,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:41304231_C_G:41304231:0,2,0,1
chr6	41304243	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,23;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41304231_C_G:41304231:0,1,0,1
chr6	41304245	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41304231_C_G:41304231:0,1,0,1
chr6	41309698	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,13,6
chr6	41486990	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr6	41552429	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr6	41558952	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,12:0,2:0,0,5,9
chr6	41562530	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr6	41617308	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:8,5:3,7:8,3,12,0
chr6	41617626	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	41617658	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=199,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	41620975	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=13,29;MFRL=263,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,1:0,1:0|1:41620975_A_G:41620975:1,0,2,0
chr6	41620977	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=263,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0|1:41620975_A_G:41620975:1,0,2,0
chr6	41620983	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr6	41655005	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr6	41658829	.	TTGC	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TGC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.124:26:11,2:8,1:4,19,1,2
chr6	41721617	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:10,9:8,4:15,3,13,0
chr6	41740483	.	CGTGTGTGT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=199,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=GT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr6	41744832	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=248,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	41748279	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,1,21
chr6	41754370	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=211,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr6	41754573	.	C	CCTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:6,2:7,10:10,4,4,8
chr6	41773322	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:5,1,3,0
chr6	41774399	.	TC	GG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,0:4,0:0|1:41774399_TC_GG:41774399:11,3,2,0
chr6	41774402	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,1:0|1:41774399_TC_GG:41774399:10,3,2,0
chr6	41888827	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:8,9:14,10:4,18,4,15
chr6	41889223	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.530:28:7,7:6,7:12,1,15,0
chr6	41898096	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	41905174	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr6	42018212	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,13;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:42018212_G_C:42018212:1,0,2,0
chr6	42018217	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0|1:42018212_G_C:42018212:2,0,2,0
chr6	42018222	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,23;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:2,0:0|1:42018212_G_C:42018212:4,0,2,0
chr6	42018227	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:2,0:0|1:42018212_G_C:42018212:7,0,2,0
chr6	42018230	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,11;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:0,0:0|1:42018212_G_C:42018212:7,0,2,0
chr6	42044797	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:11,3:17,0:24,4,3,0
chr6	42075104	.	GGGTGGGGGTTCCAGCAGCAGGGGAGGT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:1,2:1,2:4,0,4,0
chr6	42075377	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=143,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:0,5,1,5
chr6	42077870	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=243,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr6	42078128	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=134,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42078128_A_T:42078128:0,1,0,1
chr6	42078129	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=134,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42078128_A_T:42078128:0,1,0,1
chr6	42078132	.	A	ATGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=134,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42078128_A_T:42078128:0,1,0,1
chr6	42110228	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:5,1:3,6:0,9,0,7
chr6	42110263	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr6	42123317	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.503:34:10,10:6,7:14,3,13,4
chr6	42153609	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr6	42162575	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,4:6,1:2,8,1,4
chr6	42175927	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,165;MMQ=56,56;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr6	42176120	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:2,3:3,5:0,5,1,8
chr6	42176743	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:6,1:6,5:0,12,0,6
chr6	42176749	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,1:4,7:0,9,0,8
chr6	42181773	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,7:7,6:13,0,12,1
chr6	42181960	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,25:0.426:59:13,8:21,17:15,19,11,14
chr6	42196127	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:8,6:3,4:7,4,7,3
chr6	42233655	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=191,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	42559866	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:8,2:7,1:14,2,3,0
chr6	42562102	.	C	CTACCAATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,2:4,0:0,12,0,2
chr6	42600674	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.506:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr6	42608123	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr6	42612312	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr6	42617961	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,4:4,3:7,2,7,0
chr6	42619702	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:11,3:23,1:27,7,4,0
chr6	42626147	.	TACTC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.562:16:5,5:1,4:0,7,1,8
chr6	42629888	.	CTTTTG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTTTG;STR;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:4,3:3,2:8,0,5,0
chr6	42638564	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=176,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,4:7,3:0,9,0,7
chr6	42641704	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	42644623	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.463:28:5,4:10,8:1,14,2,11
chr6	42650766	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=78,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,6:1,3:3,1,9,0
chr6	42650772	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=162,78;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:9,0,3,1
chr6	42652667	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:0,6,2,2
chr6	42672407	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.545:20:4,6:5,5:0|1:42672407_T_C:42672407:1,8,0,11
chr6	42672416	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:2,5:5,4:0|1:42672407_T_C:42672407:0,8,0,10
chr6	42672434	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,5:4,2:0,4,0,7
chr6	42689411	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=240,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr6	42819765	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=184,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr6	42853842	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr6	42905488	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:4,1:12,1:10,6,1,1
chr6	42941899	.	CCGACATGCAGACTA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=203,279;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	42946314	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=233,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42946314_C_CA:42946314:0,1,0,1
chr6	42946315	.	G	GCTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=233,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42946314_C_CA:42946314:0,1,0,1
chr6	42987206	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr6	43014298	.	TT	CC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=132.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,12:0,16:0,0,10,20
chr6	43018629	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr6	43021910	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	43021976	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=145,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=G;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.664:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr6	43034844	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:4,1:8,0:0|1:43034844_A_C:43034844:1,14,2,0
chr6	43034856	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:8,0:0|1:43034844_A_C:43034844:0,16,2,0
chr6	43034858	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,1:8,0:0|1:43034844_A_C:43034844:0,15,2,0
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chr6	43038958	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=140,202;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.290:5:3,0:1,0:1|0:43038938_TAAAAAAAA_T:43038938:4,0,1,0
chr6	43038968	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=120,194;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.373:6:2,0:0,0:1|0:43038938_TAAAAAAAA_T:43038938:4,0,2,0
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chr6	43097901	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=127,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:43097899_G_GA:43097899:2,0,1,0
chr6	43100425	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,2:5,5:3,8,1,6
chr6	43106824	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:2,3:5,1:6,2,3,1
chr6	43111445	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	43112382	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,1:1,2:1,5,0,3
chr6	43153787	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:9,6:10,15:8,11,9,12
chr6	43156160	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=190,237;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr6	43166411	.	TGGG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=G;STR;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,7:2,5:5,4,10,3
chr6	43188716	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=4302885,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:1,0,0,1
chr6	43221264	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=189,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,1,2
chr6	43225791	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	43231163	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr6	43250387	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr6	43251599	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:4,4,0,2
chr6	43251710	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr6	43266323	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:6,2,2,0
chr6	43269029	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr6	43270326	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr6	43276390	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	43305498	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,127;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:15,5:22,0:18,19,5,0
chr6	43307070	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,1:12,1:13,5,2,0
chr6	43337055	.	CT	GG	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,19;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43337055_CT_GG:43337055:0,0,1,0
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chr6	43337062	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,18;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43337055_CT_GG:43337055:0,0,1,0
chr6	43337066	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,18;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43337055_CT_GG:43337055:0,0,1,0
chr6	43337070	.	AA	TT	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,15;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43337055_CT_GG:43337055:0,0,1,0
chr6	43337075	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,17;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43337055_CT_GG:43337055:0,0,1,0
chr6	43337079	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,17;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43337055_CT_GG:43337055:0,0,1,0
chr6	43337082	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,11;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43337055_CT_GG:43337055:0,0,1,0
chr6	43337086	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,11;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43337055_CT_GG:43337055:0,0,1,0
chr6	43399837	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=104.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,13:0,15:0,0,20,8
chr6	43401105	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=182,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:4,7:3,7:0,7,0,14
chr6	43413081	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=216,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.485:12:4,1:2,3:0,6,0,6
chr6	43414216	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	43414234	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	43472943	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:0,12,0,2
chr6	43480730	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=211,392;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:3,4,0,2
chr6	43492249	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:18,3:13,0:15,16,2,1
chr6	43492862	.	A	AAT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:6,1:9,0:0|1:43492862_A_AAT:43492862:12,3,3,0
chr6	43492869	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:6,3:11,0:0|1:43492862_A_AAT:43492862:13,4,3,0
chr6	43494319	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,10:0,0,14,1
chr6	43497019	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=20,34;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:3,0:0,1:0|1:43497019_A_G:43497019:2,2,0,1
chr6	43497029	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=116,103;MMQ=59,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43497019_A_G:43497019:0,2,0,1
chr6	43497062	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=198,103;MMQ=50,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:43497062_C_T:43497062:0,2,0,1
chr6	43497064	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,22;MFRL=198,103;MMQ=50,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:43497062_C_T:43497062:0,2,0,1
chr6	43497105	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=163,233;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43497105_C_T:43497105:0,1,0,1
chr6	43497122	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,25;MFRL=0,233;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43497105_C_T:43497105:0,0,0,1
chr6	43497124	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43497105_C_T:43497105:0,0,0,1
chr6	43501580	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,6,3
chr6	43514527	.	GAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=162,10188355;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.526:4:0,1:0,1:0,2,0,2
chr6	43521276	.	A	AACAACAAGTCGGAGCAGGGGTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=220,185;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	43526372	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=147,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,0:9,2:0,10,0,2
chr6	43533305	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	43541430	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=207,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr6	43593277	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:3,14,0,2
chr6	43594565	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.379:11:3,2:4,2:6,1,4,0
chr6	43745107	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	43746169	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,6:0,23:0,0,19,11
chr6	43748480	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:12,0:13,2:23,3,2,1
chr6	43748643	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr6	44081917	.	T	TC	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=31,32;MFRL=178,82;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:9,0:11,2:0|1:44081917_T_TC:44081917:5,16,0,2
chr6	44081925	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=27,29;MFRL=184,82;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:10,2:0|1:44081917_T_TC:44081917:3,19,0,2
chr6	44081957	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=34,35;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:5,2:0,13,0,3
chr6	44082013	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44082013_G_T:44082013:0,3,0,1
chr6	44082016	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=32,34;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44082013_G_T:44082013:0,3,0,1
chr6	44082019	.	AA	TT	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=26,33;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44082013_G_T:44082013:0,3,0,1
chr6	44082023	.	CT	GC	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=32,34;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:44082013_G_T:44082013:0,3,0,1
chr6	44082027	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44082013_G_T:44082013:0,2,0,1
chr6	44082032	.	A	G,ATATTGTCTTGG	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=0,29,25;MFRL=0,168,193;MMQ=60,60,60;MPOS=3,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.333,0.453:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr6	44082033	.	T	TGA	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=29,32;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:44082013_G_T:44082013:0,2,0,1
chr6	44082036	.	AC	TT	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=0,29;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:44082036_AC_TT:44082036:0,1,0,1
chr6	44082040	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44082036_AC_TT:44082036:0,0,0,1
chr6	44121881	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:2,15,0,2
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chr6	44134610	.	TTCC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=214,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCC;STR;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr6	44140818	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,6:4,3:3,8,3,6
chr6	44144631	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:12,4,1,1
chr6	44145181	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:1,4,0,4
chr6	44148568	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:4,4:3,6:1,6,4,7
chr6	44216544	.	GT	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=59,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=95.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,37:0.933:39:0,16:2,16:1,1,8,29
chr6	44220076	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr6	44221142	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=100.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,8:0,12:0|1:44221142_C_T:44221142:0,0,5,18
chr6	44221145	.	GGAGTTTGT	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=100.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0|1:44221142_C_T:44221142:0,0,5,18
chr6	44228162	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,20,0
chr6	44233504	.	CTCAT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCAT;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:6,1:5,1:0,12,0,2
chr6	44253617	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	44255459	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=218.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,38:0,32:0,0,33,37
chr6	44255500	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:31,0:20,3:24,27,0,3
chr6	44268806	.	T	TTGTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0,0,12,0
chr6	44269023	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr6	44270768	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,9:0,0,14,5
chr6	44270936	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:4,5:7,10:5,6,10,5
chr6	44273546	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,20:0.464:43:14,8:9,9:11,12,8,12
chr6	44274797	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr6	44279111	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,7:3,2:3,3,8,1
chr6	44280812	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:6,4:3,3:8,2,7,0
chr6	44336014	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	44337781	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,2:6,0:8,8,2,0
chr6	44355682	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.621:22:5,5:3,8:1,7,4,10
chr6	44355699	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.736:17:2,4:2,8:0,4,2,11
chr6	44360533	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.545:31:9,11:5,6:3,11,2,15
chr6	44397418	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:14,3:10,0:24,2,3,0
chr6	45296618	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr6	45390414	.	CGCAACAGCAGCA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,203;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAACAGCAGCA;STR;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:2,2:6,2:2,7,2,3
chr6	45390733	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=123,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,3:3,3:0,3,0,6
chr6	45917141	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.360:42:14,4:13,10:5,22,1,14
chr6	45917205	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=170,209;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0,18,0,2
chr6	45922849	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr6	46108202	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=572,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	46108916	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,5:3,4:4,3,4,5
chr6	46128967	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,0:2,0,4,0
chr6	46521602	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:7,4:4,4:5,7,2,6
chr6	46636556	.	GT	G,GTT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,34,33;MFRL=122,156,124;MMQ=60,60,60;MPOS=24,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.90,11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,7:0.114,0.233:30:9,1,0:6,2,6:5,15,3,7
chr6	46638763	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=181,160;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,2:11,0:16,0,2,0
chr6	46661937	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.705:1:0,0:0,1:0|1:46661937_CT_C:46661937:0,0,0,1
chr6	46661963	.	AGG	CAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=236,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:46661937_CT_C:46661937:0,4,0,1
chr6	46672215	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=108,83;MMQ=49,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.587:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr6	46761495	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,15:0,8:0,0,5,19
chr6	46761552	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=179,195;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr6	46794048	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr6	46797329	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=112.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,13:0,21:0,0,14,20
chr6	46803345	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr6	46806801	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=156,187;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,15:0.390:39:12,6:12,9:0|1:46806801_C_T:46806801:9,15,5,10
chr6	46806809	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=147.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,17:0,22:0|1:46806801_C_T:46806801:0,0,12,29
chr6	46806939	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr6	46806948	.	G	GTTTGGGGCAGCT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,4:0,0,0,9
chr6	46806959	.	C	CAAAATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=211,145;MMQ=40,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:0|1:46806959_C_CAAAATT:46806959:0,3,0,1
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chr6	46823695	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=247.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,76:0.987:76:0,37:0,39:0,0,36,40
chr6	46823778	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=149,147;MMQ=47,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=75.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,30:0.578:52:12,13:8,16:4,18,13,17
chr6	46823805	.	A	AG	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=120.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,19:0,0,4,32
chr6	46828670	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=202,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,6:0,4:0,1,1,9
chr6	46832741	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr6	46834906	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr6	46867717	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,10:0,0,18,7
chr6	46867898	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr6	46976924	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=125.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,17:0,22:0,0,10,30
chr6	46977783	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=61.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,14,5
chr6	46988384	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr6	46995508	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=63.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,12:0,8:0,0,0,23
chr6	47202709	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr6	47253631	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=223,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:1,5:1,2:3,0,7,0
chr6	47445927	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,9:0,0,20,8
chr6	47522357	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,16:0,0,21,4
chr6	47548672	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=167.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,31:0,23:0,0,6,48
chr6	47549629	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,9:0,0,24,0
chr6	47549883	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,0,24
chr6	47567210	.	TA	T,TAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,27,27;MFRL=165,140,141;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=7.03,4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,6,4:0.146,0.111:41:15,1,2:15,4,2:7,24,3,7
chr6	47577064	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	47591856	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,7:0,11:0,0,14,4
chr6	47624129	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	47626685	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,14,3
chr6	47641307	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	47653536	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=74.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,14:0,7:0,0,19,2
chr6	47653812	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	47653851	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	47654662	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=121.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,20:0,13:0,0,29,4
chr6	47654817	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=111.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,21:0,15:0,0,11,25
chr6	47654831	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,15:0,5:0,0,6,15
chr6	47654864	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr6	47661387	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=109.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,18:0,0,26,5
chr6	47678455	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=82.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,16:0,10:0,0,23,4
chr6	47678678	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr6	47681494	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=197,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,11:0,12:1,0,23,0
chr6	47749728	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	47847683	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=147,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:0,9,0,2
chr6	49415351	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.299:14:7,1:3,3:10,0,3,1
chr6	49415473	.	A	T	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,3:0.052:74:41,0:30,3:0|1:49415473_A_T:49415473:21,50,0,3
chr6	49415477	.	A	C	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,3:0.053:73:35,0:30,3:0|1:49415473_A_T:49415473:20,50,0,3
chr6	49423818	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.073:52:20,3:29,0:36,13,3,0
chr6	49437853	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.362:12:5,2:3,2:8,0,4,0
chr6	49459978	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr6	49459994	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:2,1:2,0:0,4,0,2
chr6	49489287	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr6	49494611	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=214,260;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:49494611_G_T:49494611:0,2,0,1
chr6	49494618	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=214,260;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:49494611_G_T:49494611:0,2,0,1
chr6	49494619	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=214,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:49494611_G_T:49494611:0,2,0,1
chr6	49494624	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=214,260;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:49494611_G_T:49494611:0,2,0,1
chr6	49585796	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:16,3:8,0:20,5,3,0
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chr6	49660418	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=232,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr6	49705182	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=126,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:1,3,0,5
chr6	49937257	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,2:4,5:5,3,6,1
chr6	50011277	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,3:6,1:5,2,3,1
chr6	50016198	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:3,1:3,2:6,0,4,0
chr6	50016384	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,1:7,1:2,7,1,2
chr6	50681660	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=131,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	50789792	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:11,4:8,6:16,3,10,0
chr6	50811115	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,19:0.417:46:12,12:15,7:5,22,2,17
chr6	51618170	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,2,9
chr6	51619808	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:1,5,0,3
chr6	51640751	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr6	51656236	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr6	51695570	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr6	51695647	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.473:36:9,7:10,10:11,8,11,6
chr6	51771011	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:5,0,4,0
chr6	51799166	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:3,2:5,3:1,8,0,5
chr6	51891011	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:2,2:3,4:0,6,1,6
chr6	51913240	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:3,3:4,1:7,0,5,0
chr6	51914898	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,23,1
chr6	51921514	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,1:12,1:10,15,1,1
chr6	51923409	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,5:2,0:1,5,1,4
chr6	51935357	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=89,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:51935357_G_C:51935357:1,1,0,1
chr6	51935358	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=89,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:51935357_G_C:51935357:1,1,0,1
chr6	51935373	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,35;MFRL=252,0;MMQ=39,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:0,1,1,0
chr6	51935747	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:6,4:4,0:8,3,4,0
chr6	51936846	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,3:4,6:7,0,8,1
chr6	51937036	.	T	TTTATTAAAAGTATTAATTTTCTGGGCCATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	51944847	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:1,7,1,3
chr6	52129667	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr6	52129678	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=162,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:52129678_G_C:52129678:0,4,0,1
chr6	52129680	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=162,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:52129678_G_C:52129678:0,4,0,1
chr6	52130138	.	GC	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	52137313	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:0,8,0,4
chr6	52138441	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	52142092	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr6	52142356	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:23,0:13,3:23,13,0,3
chr6	52142582	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=158,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	52144081	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr6	52147363	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:6,0,6,0
chr6	52147692	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=208,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:0,8,1,5
chr6	52271477	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	52271956	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=195,89;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,3:3,0:6,5,2,1
chr6	52303399	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,3:3,8:0,7,3,8
chr6	52317573	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.504:26:6,4:6,9:6,7,10,3
chr6	52355206	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=202,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:0,7,0,7
chr6	52368139	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:4,0:1,2:3,3,0,3
chr6	52370775	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:3,3:2,4:6,0,7,0
chr6	52617738	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=48.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.553:34:11,9:4,9:7,8,5,14
chr6	52662263	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	52697601	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr6	52697825	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,3,10
chr6	52697834	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,0,13
chr6	52698859	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=192,187;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:5,1,5,0
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chr6	52998834	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=187,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,1:8,5:7,4,5,1
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chr6	53134104	.	C	CACAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,1:2,7:0,3,0,8
chr6	53134164	.	C	CCTTTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=191,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr6	53138203	.	TAA	T,TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32,30;MFRL=189,100,186;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.59,5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.300,0.401:7:0,0,1:1,2,2:0,2,0,5
chr6	53140928	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.523:42:12,7:7,14:19,1,21,1
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chr6	53363487	.	GGGCT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCT;STR;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:6,1,6,0
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chr6	53370752	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=131,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.651:21:4,8:3,5:1,6,0,14
chr6	53379405	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr6	53385475	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,250;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr6	53387365	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:1,8,0,2
chr6	53409451	.	C	CCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CCT;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.692:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	53519137	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,3:0.051:76:47,1:25,2:26,47,3,0
chr6	53520088	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	53520124	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	53707098	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,8:3,3:0,9,1,10
chr6	53778865	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=235,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr6	53784268	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr6	53787351	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=225,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr6	53883980	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,1:3,5:0,7,0,6
chr6	54054837	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	54067088	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr6	54095423	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr6	54130833	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.088:43:13,2:26,1:0|1:54130833_T_G:54130833:8,32,0,3
chr6	54130837	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.094:40:11,2:25,1:0|1:54130833_T_G:54130833:8,29,0,3
chr6	54186024	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	54245305	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,4:1,2:7,0,5,1
chr6	55039654	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0,13,0,2
chr6	55113347	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=216,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.667:16:1,7:3,1:0|1:55113347_T_C:55113347:5,0,11,0
chr6	55113350	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=210,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.650:18:2,8:4,4:0|1:55113347_T_C:55113347:6,0,12,0
chr6	55113411	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=128.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,22:0,16:0,0,30,9
chr6	55113664	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:0,7,0,5
chr6	55142458	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=165,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.755:9:1,4:0,1:0,2,0,7
chr6	55216005	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,12:5,2:8,2,13,1
chr6	55223962	.	G	GTCTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=233,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TCTA;STR;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,1:0,2,0,3
chr6	55263946	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:13,3:15,0:25,3,3,0
chr6	55266722	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:2,3:3,2:0,5,1,5
chr6	55266726	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=151,151;MMQ=60,33;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:1,8,0,2
chr6	55266760	.	CTCTGT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=156,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0|1:55266760_CTCTGT_C:55266760:0,3,0,1
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chr6	55966418	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=144.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,21:0,18:0,0,2,37
chr6	55988837	.	CT	C,CTT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32,27;MFRL=139,140,124;MMQ=60,60,60;MPOS=18,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=12.33,9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,9,8:0.312,0.300:26:7,6,3:1,1,2:9,0,11,6
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chr6	56325147	.	T	TTCTCCCTGGTAGTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=222,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
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chr6	56347430	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,0:10,3:22,2,3,0
chr6	56351952	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.544:44:11,16:9,8:10,10,16,8
chr6	56365814	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr6	56373633	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,19;MFRL=138,264;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr6	56374754	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	56381912	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr6	56394173	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	56417918	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:15,0:9,2:17,7,0,2
chr6	56437081	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,3:5,1:2,4,0,4
chr6	56462574	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:6,13:11,7:7,10,11,9
chr6	56485307	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,3:4,7:6,4,5,5
chr6	56492121	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.191:14:4,2:5,0:0,12,0,2
chr6	56504477	.	T	TA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.115:42:20,2:17,2:26,12,3,1
chr6	56818706	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,1,12
chr6	56882100	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:16,3:13,2:10,20,0,5
chr6	56919133	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,30:0.516:58:13,13:15,17:11,17,12,18
chr6	57190809	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:3,7:6,8:6,3,8,7
chr6	57244672	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.483:29:7,7:8,7:15,0,12,2
chr6	57244830	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:7,5:5,3:2,12,0,9
chr6	57244893	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr6	57246773	.	T	TAGG	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGG;STR;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.404:35:12,10:9,1:16,5,13,1
chr6	57246785	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:13,10:9,3:15,7,12,1
chr6	57246815	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,22:0.411:54:16,13:16,9:12,20,16,6
chr6	57246969	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=106,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:8,7:11,11:3,16,0,18
chr6	57246982	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=106,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:8,5:9,10:3,14,0,15
chr6	57247022	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=106,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.439:14:5,3:3,3:1,7,0,6
chr6	57372199	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.667:31:7,7:3,14:10,0,20,1
chr6	57372361	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,35:0.735:47:7,17:5,18:3,9,6,29
chr6	57372365	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.187:46:19,5:19,3:7,31,2,6
chr6	57372374	.	CT	C	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=50.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.441:41:12,10:10,8:3,20,3,15
chr6	57372435	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.205:20:9,2:7,2:0,16,0,4
chr6	57372436	.	GC	CC,CT	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,32,32;MFRL=166,169,202;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.68,20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,7,7:0.373,0.373:19:3,3,5:2,3,2:0,5,0,14
chr6	57372456	.	AT	A,ATT	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=27,25,25;MFRL=166,217,249;MMQ=60,60,60;MPOS=25,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=T;STR;TLOD=6.87,6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.334,0.333:9:1,2,1:2,1,2:0,3,0,6
chr6	57393029	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=199,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0|1:57393029_T_A:57393029:4,0,2,0
chr6	57393034	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=35,26;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:0,1:0|1:57393029_T_A:57393029:5,0,2,0
chr6	57393040	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:0,1:0|1:57393029_T_A:57393029:7,0,2,0
chr6	57393074	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=28,37;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:8,0:14,1,2,0
chr6	57393092	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,2:12,1:18,2,3,0
chr6	57393125	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:3,6:7,4:7,3,7,3
chr6	57393199	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:14,6:13,3:8,19,3,6
chr6	57393216	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.578:29:3,11:9,4:1,11,5,12
chr6	57393222	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:6,4:9,3:0|1:57393222_A_G:57393222:3,15,2,6
chr6	57393228	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:8,4:9,3:0|1:57393222_A_G:57393222:3,14,2,6
chr6	57393278	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:2,6,0,2
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chr6	57467282	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=197,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,4:2,1:0|1:57467279_T_C:57467279:0,3,0,6
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chr6	57472299	.	A	G	.	.	DP=89;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,26:0.314:84:33,22:24,3:54,4,23,3
chr6	57472315	.	AG	GG,GA	.	.	DP=104;ECNT=4;MBQ=30,32,34;MFRL=158,165,150;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=87.51,81.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,32,30:0.343,0.307:95:19,14,22:14,16,7:28,5,50,12
chr6	57472344	.	A	AT	.	.	DP=102;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=64.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,32:0.336:95:34,15:27,17:41,22,19,13
chr6	57472476	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=180,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,11:0.230:50:23,4:16,7:2,37,0,11
chr6	57472488	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=194,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.232:41:20,4:12,5:2,30,0,9
chr6	57472495	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:9,8:10,5:0,19,2,11
chr6	57472533	.	TT	CC,CT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,32,30;MFRL=217,202,187;MMQ=60,60,60;MPOS=15,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.90,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,2:0.401,0.199:12:3,5,1:2,0,1:0,5,1,6
chr6	57498894	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,2:4,1,7,0
chr6	57498944	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=87.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,27:0.666:40:4,16:9,10:11,2,26,1
chr6	57499042	.	A	AT	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,20:0.351:58:20,14:17,6:17,21,6,14
chr6	57512439	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:12,3:6,4:19,0,7,0
chr6	57512476	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,21:0.424:50:12,12:16,9:23,6,17,4
chr6	57512678	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,39:0.624:62:12,20:11,18:8,15,9,30
chr6	57512711	.	G	A,C	.	.	DP=40;ECNT=7;MBQ=33,27,34;MFRL=130,143,141;MMQ=60,60,60;MPOS=17,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=22.16,44.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,10,13:0.264,0.326:39:9,2,7:7,8,6:3,13,3,20
chr6	57512718	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.342:36:11,4:13,6:2,22,1,11
chr6	57512792	.	T	TTGGGTTTTCTG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=213,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,0:1,1:0|1:57512792_T_TTGGGTTTTCTG:57512792:0,3,0,1
chr6	57512793	.	AA	CT,ATTA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,32,27;MFRL=201,213,137;MMQ=60,60,60;MPOS=5,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.34,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.285,0.281:4:1,0,0:1,1,1:0,2,0,2
chr6	57512794	.	A	AGGGAGGCTCAGT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=201,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:1,0:1,1:0|1:57512792_T_TTGGGTTTTCTG:57512792:0,2,0,1
chr6	57512797	.	G	GTTC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=183,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr6	62611334	.	GAAAA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:62611334_GAAAA_G:62611334:0,0,0,1
chr6	62611343	.	A	AGGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62611334_GAAAA_G:62611334:0,0,0,1
chr6	62611349	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62611334_GAAAA_G:62611334:0,0,0,1
chr6	62611351	.	A	ATTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62611334_GAAAA_G:62611334:0,0,0,1
chr6	62757987	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	62887031	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr6	63921361	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	63921442	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=160,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.515:19:1,3:6,4:0|1:63921442_G_A:63921442:8,1,10,0
chr6	63921456	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,15;MFRL=143,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.438:18:3,0:6,2:0|1:63921442_G_A:63921442:8,2,8,0
chr6	63921870	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=141,232;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:15,1:21,1:12,24,1,1
chr6	63922500	.	ATT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=13,17;MFRL=59,51;MMQ=49,50;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.874:10:0,1:0,1:0,2,1,7
chr6	63922820	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:3,9:7,7:5,5,9,7
chr6	63922929	.	A	AAAATAAATAAATAAAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=6,10;RU=AAAT;STR;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.892:6:0,2:0,2:0,0,0,6
chr6	64289938	.	ATT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr6	64356721	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=89,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0,4,0,1
chr6	64390021	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:14,0:7,3:4,18,0,3
chr6	64394475	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.585:20:5,4:3,6:2,6,5,7
chr6	64421687	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,29:0.638:45:10,14:6,15:11,5,14,15
chr6	64472270	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,6:2,1:7,0,7,0
chr6	64694560	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=207,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,1:1,6:0,2,0,7
chr6	64708907	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,1:5,5:9,0,6,0
chr6	65016977	.	TGA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GA;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr6	65098768	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:0,6,1,7
chr6	65301504	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=214,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,3:1,6:4,3,6,3
chr6	65596549	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,11580879;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:14,0,1,1
chr6	65611952	.	T	TATTA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.537:24:4,6:7,7:11,0,13,0
chr6	65707465	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:8,6:4,11:9,3,14,3
chr6	66005740	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=175,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,2:1,2:2,0,9,1
chr6	66005867	.	T	TCAAGG	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:6,2:7,0:0|1:66005867_T_TCAAGG:66005867:6,10,0,2
chr6	66005870	.	T	TAATTTATTTGATCATTATACA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:0|1:66005867_T_TCAAGG:66005867:6,10,0,2
chr6	66005888	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr6	66005970	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr6	66005986	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:66005986_C_G:66005986:4,5,1,1
chr6	66005991	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,0:0|1:66005986_C_G:66005986:3,4,1,1
chr6	66045077	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	66045118	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	66053835	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr6	66115278	.	C	CAAT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=19,19;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.282:17:1,0:3,2:2,10,0,5
chr6	66115281	.	G	GAAA,A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,16,29;MFRL=0,167,142;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.51,4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,6:0.620,0.331:14:0,1,1:0,0,4:0,0,1,13
chr6	66205120	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:6,9,0,2
chr6	69640636	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:69640636_G_A:69640636:0,2,0,1
chr6	69640640	.	CA	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:69640636_G_A:69640636:0,3,0,1
chr6	69640644	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:69640636_G_A:69640636:0,3,0,1
chr6	69666520	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.422:29:12,9:4,3:15,2,10,2
chr6	69666747	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr6	69724069	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=185.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,27:0,31:0,0,3,56
chr6	69759148	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr6	69785765	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	69785875	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,2:6,1:11,5,3,0
chr6	69786046	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr6	70034982	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:0,3,0,6
chr6	70040500	.	GA	G,GAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=15,15,16;MFRL=50,140,138;MMQ=60,60,60;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.52,5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,3:0.264,0.264:12:0,0,0:0,1,0:0,6,1,5
chr6	70048739	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:5,2:2,6:7,0,8,1
chr6	70386320	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.386:26:5,5:11,4:14,2,8,2
chr6	70423739	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=187,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:0,7,0,5
chr6	70447993	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:0,11,0,2
chr6	70459209	.	TA	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.156:44:17,1:15,5:34,4,5,1
chr6	70490511	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr6	70490528	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr6	70490554	.	A	AATT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=217,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:70490554_A_AATT:70490554:0,2,0,1
chr6	70490558	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,29;MFRL=217,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:70490554_A_AATT:70490554:0,2,0,1
chr6	70500120	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr6	70500451	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=232,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr6	70500463	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	70589630	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,4:0,1:0,3,1,4
chr6	70610283	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,4:7,4:0,12,0,8
chr6	70639637	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:0,4:1,3:0,2,0,7
chr6	70672827	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:8,7:11,6:2,17,0,13
chr6	70840124	.	AT	A,ATT	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=26,29,30;MFRL=166,171,104;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.31,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,6,5:0.165,0.133:35:12,2,2:5,4,2:8,16,7,4
chr6	70840220	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=176,163;MMQ=45,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,4:3,0:0,6,0,4
chr6	70847715	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70847715_CA_C:70847715:0,4,0,1
chr6	70847718	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70847715_CA_C:70847715:0,4,0,1
chr6	70847758	.	A	ACACTGGGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=227,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	70854716	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=172,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:9,0,2,0
chr6	70866358	.	CTA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	70875976	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=163,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr6	70878156	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:9,8:6,2:2,13,3,7
chr6	70894894	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr6	70897967	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.320:38:13,5:13,6:4,22,4,8
chr6	70909252	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=116,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr6	70950281	.	AAT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:8,2:1,1:9,0,3,0
chr6	70950375	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.163:35:15,4:12,1:24,6,4,1
chr6	70950555	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0,16,0,2
chr6	70965125	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=119,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:5,3:1,3:1,5,0,6
chr6	70972887	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=128,133;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,3:14,0:31,0,3,0
chr6	70983644	.	TAATA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AATA;STR;TLOD=53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.645:23:3,8:3,7:7,1,15,0
chr6	70984562	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	70990470	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,4:1,6:4,0,8,2
chr6	70991003	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	71003794	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:6,1,2,0
chr6	71004332	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:3,2:0,7,0,3
chr6	71009776	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,0:13,3:16,13,0,3
chr6	71010101	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:13,11:4,5:2,15,4,12
chr6	71011831	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=185,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:2,3,1,2
chr6	71236453	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.783:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	71246206	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr6	71482975	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:6,1,2,2
chr6	71508369	.	GAA	G	.	.	DP=134;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,4:0.040:117:42,1:38,3:89,24,3,1
chr6	71665473	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:4,0,4,0
chr6	71666146	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr6	71666227	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=123,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr6	72596774	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=156,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,2:8,0:14,3,2,0
chr6	72945492	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr6	72962352	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr6	72968609	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	73023256	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,0:9,2:10,5,0,2
chr6	73108872	.	AAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=196,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0,4,0,4
chr6	73332040	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr6	73904145	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:5,1,2,0
chr6	73905161	.	T	TCTATTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=203,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr6	73951164	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,1:0,5:2,0,5,1
chr6	74063205	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=210,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr6	74072681	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=204,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:3,2:4,2:0,8,0,4
chr6	74104153	.	C	CGAGG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,3:3,0:0,10,0,3
chr6	74104223	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74104223_G_T:74104223:0,0,0,1
chr6	74104225	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74104223_G_T:74104223:0,0,0,1
chr6	74104557	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	74110029	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:25,3:29,0:14,40,2,1
chr6	74111524	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	74111575	.	T	TTG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,2:6,4:5,4,5,1
chr6	74119084	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0,0,2,7
chr6	74124482	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74124482_A_ATC:74124482:0,1,0,1
chr6	74124483	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74124482_A_ATC:74124482:0,1,0,1
chr6	74124484	.	AA	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	74155491	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr6	74171890	.	A	ACTCTTCACTTGGCTGTCTTCCTTCTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=247,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	74189574	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,16,12
chr6	74202160	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	74207438	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:4,2:3,2:7,0,5,0
chr6	74228006	.	A	G	.	.	DP=118;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=144.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,52:0.478:109:26,25:30,27:23,34,26,26
chr6	74228049	.	A	G	.	.	DP=123;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=175.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,56:0.481:117:27,31:32,25:31,30,28,28
chr6	74310231	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=191,143;MMQ=50,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:0,0:3,1:0,4,0,2
chr6	74320306	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.373:19:8,1:4,5:1,11,0,7
chr6	74325257	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=230,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:74325257_T_C:74325257:0,1,0,3
chr6	74325264	.	A	ATCGTTAAAAAATTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=235,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:74325257_T_C:74325257:0,2,0,1
chr6	74446293	.	A	AGCAGGGTTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=151,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr6	74446294	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=183,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:74446294_A_G:74446294:0,4,0,1
chr6	74446297	.	TCTCCAAAGTCATTTATACA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=188,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:74446294_A_G:74446294:0,4,0,1
chr6	74446320	.	AA	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=237,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74446294_A_G:74446294:0,1,0,1
chr6	74490863	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	74491138	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,5:1,3:0,3,0,8
chr6	74493615	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=161,174;MMQ=57,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:0,2:4,2:0,4,0,5
chr6	74495257	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr6	74497237	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=125,213;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	75795122	.	G	GCACA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=CA;STR;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.941:12:0,3:0,6:0,0,0,12
chr6	75796364	.	GTATA	G,GTA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34,21;MFRL=0,189,195;MMQ=60,60,60;MPOS=20,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=TA;STR;TLOD=4.16,37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,12:0.173,0.774:14:0,1,3:0,1,3:0,0,0,14
chr6	75798722	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	75811880	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr6	75830974	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	75833876	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,11,6
chr6	75836265	.	G	GAAGCAAAAACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr6	75844600	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,3:1,5:0,4,0,8
chr6	75890933	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,5:0,3:0,1,1,10
chr6	75893457	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr6	75904455	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	75950109	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=194,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.672:6:2,2:0,1:0,2,0,4
chr6	75968720	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,4,11
chr6	76022082	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0|1:76022082_A_G:76022082:6,0,5,0
chr6	76022090	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0|1:76022082_A_G:76022082:0,0,11,0
chr6	76063451	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.308:8:3,1:1,1:1,5,0,2
chr6	76357593	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:4,10:8,3:0,12,1,12
chr6	76385511	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,1:4,1:0|1:76385511_A_G:76385511:10,0,2,0
chr6	76385514	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,1:7,1:0|1:76385511_A_G:76385511:11,0,2,0
chr6	76386712	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=89,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr6	76405700	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,3:6,6:0,9,0,9
chr6	76421201	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=202,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:1,1:5,2:0,7,0,3
chr6	76538403	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:0,6,0,8
chr6	76550237	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,2:2,1:5,0,3,0
chr6	76550839	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,37;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr6	76554593	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=107.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,35:0.945:39:0,18:1,17:2,2,27,8
chr6	76558260	.	A	AT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.560:34:10,7:4,10:3,12,2,17
chr6	76566734	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr6	76576839	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:7,2:5,1:1,12,0,3
chr6	76595634	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.405:10:2,2:2,1:0|1:76595634_C_A:76595634:6,0,4,0
chr6	76595644	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=175,196;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,2:0.231:11:4,2:5,0:1|0:76595634_C_A:76595634:9,0,2,0
chr6	76599857	.	G	GA	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,9:0.142:65:27,7:25,2:42,14,8,1
chr6	76602328	.	C	CT	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.058:49:22,2:23,0:0|1:76602328_C_CT:76602328:15,32,1,1
chr6	76602329	.	G	GCCATTAGA	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:22,2:23,0:0|1:76602328_C_CT:76602328:15,32,1,1
chr6	76608251	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,4:6,7:0,12,0,11
chr6	76618182	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.214:25:11,1:7,3:18,2,3,2
chr6	76618297	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:33,3:26,0:34,25,3,0
chr6	76631908	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr6	76660271	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=98,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:5,1,4,2
chr6	76715299	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:2,5,0,5
chr6	76720990	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:3,3:1,3,1,8
chr6	76728583	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=177,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,2:1,0:0,5,0,4
chr6	76734836	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:0,2:5,5:4,1,7,0
chr6	76735065	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	76782049	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	78171941	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr6	79577644	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=118.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,16:0,20:0,0,6,31
chr6	79595167	.	A	ACTTAT	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=15,28;MFRL=110,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=236.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,54:0.966:55:0,24:0,26:0,1,19,35
chr6	79608098	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=157,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:79608098_A_AG:79608098:0,4,0,1
chr6	79608099	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=157,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:79608098_A_AG:79608098:0,4,0,1
chr6	79664440	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	79664720	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=162,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:79664720_T_A:79664720:0,4,0,1
chr6	79664723	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=162,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:79664720_T_A:79664720:0,4,0,1
chr6	79664748	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	79665453	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:13,0:10,3:1,22,0,3
chr6	79695003	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.194:29:17,3:7,2:21,3,5,0
chr6	79695029	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=161.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,24:0,26:0,0,43,9
chr6	79707923	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.616:19:3,7:4,4:7,0,11,1
chr6	79752792	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr6	79911513	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:0|1:79911513_C_A:79911513:0,12,0,2
chr6	79911516	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:0|1:79911513_C_A:79911513:0,12,0,2
chr6	79911518	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:4,2:0|1:79911513_C_A:79911513:0,12,0,2
chr6	79911546	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr6	79913379	.	GAA	G,GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=15,32,18;MFRL=243,142,118;MMQ=60,60,60;MPOS=31,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.58,10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,5:0.294,0.544:9:0,1,1:0,1,1:0,1,1,7
chr6	79944355	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,11:0,2:0,0,0,13
chr6	80196783	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:10,2:12,10,0,2
chr6	80203253	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:1,6:6,2:7,0,8,0
chr6	80228673	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr6	80341257	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=14,12;MFRL=195,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.531:6:0,0:0,1:0,3,0,3
chr6	80341320	.	CG	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	80631539	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr6	80720487	.	GCAT	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=142.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.973:33:0,15:0,11:0|1:80720487_GCAT_G:80720487:0,0,26,7
chr6	80720491	.	T	TAAAGA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=142.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.972:33:0,15:0,12:0|1:80720487_GCAT_G:80720487:0,0,26,7
chr6	80720733	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0|1:80720733_G_A:80720733:0,0,1,12
chr6	80720742	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:80720733_G_A:80720733:0,0,1,11
chr6	80724312	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=105.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,16:0,14:0,0,8,22
chr6	80732242	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,0,9
chr6	80741306	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=157,55;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.094:51:16,4:30,0:7,40,0,4
chr6	80741328	.	GT	AT,TC	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=0,25,26;MFRL=0,155,177;MMQ=60,60,60;MPOS=14,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=103.85,4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,40,2:0.912,0.066:42:0,19,1:0,20,1:0,0,0,42
chr6	80741336	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:17,1:18,1:0,36,0,2
chr6	80747582	.	TATAATAATA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=ATA;STR;TLOD=70.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.904:18:0,7:0,9:1,0,17,0
chr6	80750290	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,23,1
chr6	80751780	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=120.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,23:0,14:0,0,33,4
chr6	80751942	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=133.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,21:0,0,4,39
chr6	80837239	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=184,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,4,1
chr6	80837253	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,5:3,3:7,1,6,2
chr6	80912746	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=219,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,1:5,3:6,0,4,0
chr6	82204830	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,0:8,4:8,7,0,4
chr6	82461926	.	GACGCGCGGCGGCGGAGAGC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACGCGCGGCGGCGGAGAGC;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:1,3:4,2,3,1
chr6	82883238	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr6	82906226	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=198,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0|1:82906226_A_C:82906226:0,1,0,1
chr6	82906228	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=15,28;MFRL=99,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:82906226_A_C:82906226:0,2,0,1
chr6	82906237	.	A	AGAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=99,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:82906226_A_C:82906226:0,2,0,1
chr6	82906241	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=99,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:82906226_A_C:82906226:0,2,0,1
chr6	82910247	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=182,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:1,0:0,1:1,0,1,1
chr6	82910278	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:3,2:6,1,3,0
chr6	82912153	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=200,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,2:3,6:4,0,8,0
chr6	82924645	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr6	83080386	.	C	CTTTG	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=73.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.418:48:12,9:15,9:6,22,5,15
chr6	83666936	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=204,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:83666936_T_C:83666936:2,0,2,0
chr6	83666943	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=204,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:83666936_T_C:83666936:2,0,3,0
chr6	83667038	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.486:27:5,7:8,6:11,3,10,3
chr6	83733785	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,16:0.374:43:11,5:15,10:2,25,1,15
chr6	83748021	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	83754094	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,25,0
chr6	83822985	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr6	83828724	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,8,21
chr6	83839321	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	83889574	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:14,0:15,2:17,12,0,2
chr6	84233831	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=146.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,21:0,24:0,0,9,36
chr6	84270571	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=165,187;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.079:61:28,0:29,4:43,14,4,0
chr6	84284664	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr6	84284880	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr6	84290137	.	TAAAGAA	T,TA,TAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29,27,26;MFRL=145,143,132,100;MMQ=60,60,60,60;MPOS=27,14,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.29,4.26,3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,3,2,4:0.194,0.165,0.278:14:3,2,1,0:2,1,1,4:5,0,8,1
chr6	84292139	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr6	84311385	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:2,10,0,2
chr6	84317533	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=141.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,20:0,21:0,0,11,30
chr6	84320433	.	TATATATATATATATATATATATATATATATATAAATATATATGTGA	T	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.077:51:8,3:15,0:2,46,0,3
chr6	84320461	.	TATATAA	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=158,154;MMQ=43,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.328:19:4,2:8,4:0,13,0,6
chr6	84320463	.	TATAA	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,15:0,24:0,0,0,43
chr6	84350982	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=146,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:1,0,0,5
chr6	84366385	.	C	CAAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr6	84375377	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	84563291	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:2,1,1,0
chr6	84649734	.	GT	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=139,232;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:18,0:7,2:0|1:84649734_GT_G:84649734:27,4,2,0
chr6	84649747	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=19,19;MFRL=141,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.061:46:7,0:14,1:0|1:84649734_GT_G:84649734:31,13,2,0
chr6	84649994	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=196,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr6	84650214	.	GT	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.129:33:14,0:13,4:24,5,3,1
chr6	84764982	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:4,3:4,1,7,0
chr6	85454055	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:15,0:13,2:8,20,2,0
chr6	86196990	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:6,1,6,0
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chr6	87969480	.	G	A	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=146.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,55:0.554:99:24,32:20,22:31,13,40,15
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chr6	88049960	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,0:12,2:0|1:88049960_T_C:88049960:11,18,0,2
chr6	88049969	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,0:13,1:0|1:88049960_T_C:88049960:8,19,0,2
chr6	88075122	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:9,8:12,11:6,16,2,17
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chr6	88120416	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,6:3,6:2,8,2,10
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chr6	88126423	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=56,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:2,9:8,3:5,5,10,2
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chr6	88144495	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=213,206;MMQ=60,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:88144486_AA_GG:88144486:2,0,1,0
chr6	88144504	.	CCA	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=213,206;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:88144486_AA_GG:88144486:2,0,1,0
chr6	88144507	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=213,206;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:88144486_AA_GG:88144486:2,0,1,0
chr6	88144512	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=213,206;MMQ=60,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:88144486_AA_GG:88144486:2,0,1,0
chr6	88210467	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.502:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr6	88226641	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr6	88239266	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:6,5:13,12:14,6,14,4
chr6	88300013	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,6:1,2:0,4,0,8
chr6	88315563	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,4:6,6:10,0,10,0
chr6	88315741	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:7,4:7,5:1,13,3,6
chr6	88315795	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=232,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:0,5,0,2
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chr6	88331058	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.407:32:7,8:12,4:18,1,12,1
chr6	88331299	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=88,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	88366771	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:1,3:1,2:0,3,0,5
chr6	88367635	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=190,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:2,3,2,1
chr6	89323961	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,7:5,6:10,0,8,5
chr6	89324180	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=203,848;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:89324180_G_A:89324180:0,2,0,1
chr6	89324184	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=203,848;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:89324180_G_A:89324180:0,2,0,1
chr6	89511252	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.059:48:15,0:31,1:41,5,2,0
chr6	89559425	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.429:47:11,6:16,14:15,12,17,3
chr6	89638988	.	TA	T,TAA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=15,17,21;MFRL=151,142,160;MMQ=60,60,60;MPOS=22,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=13.25,4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,8,5:0.222,0.146:36:3,1,2:4,2,1:3,20,4,9
chr6	89790559	.	CTTCA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCA;STR;TLOD=48.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr6	89814772	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr6	89814830	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=100.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,15,11
chr6	89816919	.	G	GATTTCTGTAGGCAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=167,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.123:21:9,1:10,1:0|1:89816919_G_GATTTCTGTAGGCAA:89816919:9,10,0,2
chr6	89816922	.	T	TATTTTAATCCA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=170,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,1:11,1:0|1:89816919_G_GATTTCTGTAGGCAA:89816919:10,10,0,2
chr6	89862725	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr6	89888443	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	89913108	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=183,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.565:21:5,6:4,5:0|1:89913108_C_G:89913108:8,1,9,3
chr6	89913112	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=182,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,13:0.560:23:6,8:4,5:0|1:89913108_C_G:89913108:8,2,10,3
chr6	89913286	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr6	89967498	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.373:46:15,10:12,6:17,12,14,3
chr6	89974063	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.356:15:5,5:4,0:0|1:89974063_T_C:89974063:8,2,4,1
chr6	89974066	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.356:15:5,5:4,0:0|1:89974063_T_C:89974063:8,2,4,1
chr6	89975245	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=209,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	89977322	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr6	89977848	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,4:5,1:3,5,1,4
chr6	89977906	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=183,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr6	90096972	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=179,160;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:11,2,2,0
chr6	90321955	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=174.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,26:0,27:0,0,46,8
chr6	90323524	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,2:15,0:16,15,2,0
chr6	90361811	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	90362102	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=236,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	90371704	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,13,2
chr6	90371986	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,0,11
chr6	90381849	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	90382315	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:10,2:12,11,0,2
chr6	90385754	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr6	90387233	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	90390406	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:11,2:6,0:8,9,0,2
chr6	90390443	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,5:0,0,5,12
chr6	90398197	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr6	90400292	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	90405306	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,14:0,0,17,3
chr6	90405993	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	90415764	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=171.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,24:0,23:0,0,36,11
chr6	90426270	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr6	90428968	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr6	90432584	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=171,144;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr6	90432662	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,8:0,0,13,3
chr6	90433131	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr6	90434879	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:12,4:4,0:15,2,4,0
chr6	90437699	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr6	90440726	.	CCGGAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0|1:90440726_CCGGAAA_C:90440726:0,5,0,1
chr6	90440733	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:90440726_CCGGAAA_C:90440726:0,4,0,1
chr6	90440736	.	GAGGCC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:90440726_CCGGAAA_C:90440726:0,4,0,1
chr6	90450101	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=142,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:10,3:5,6:2,13,2,7
chr6	90450135	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr6	90452808	.	GA	G,GAA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,34,34;MFRL=139,194,164;MMQ=60,60,60;MPOS=27,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.23,4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,4,4:0.173,0.167:25:7,2,3:7,2,0:14,3,7,1
chr6	90453248	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=182,166;MMQ=59,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:1,12:0,7:1,0,15,4
chr6	90455429	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=195,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,1:1,8:0,1,1,9
chr6	90463149	.	GAA	G,GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35,33;MFRL=0,174,185;MMQ=60,60,60;MPOS=18,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.58,14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.250,0.667:9:0,1,5:0,1,2:0,0,9,0
chr6	90465959	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=188,126;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,3:8,0:11,2,3,0
chr6	90468465	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,12,0
chr6	90468775	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	90471560	.	A	ATCAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=232,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:90471560_A_ATCAG:90471560:0,2,0,1
chr6	90471561	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=219,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:90471560_A_ATCAG:90471560:0,2,0,1
chr6	90471562	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=232,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:90471560_A_ATCAG:90471560:0,2,0,1
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chr6	96655096	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=275,212;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,1:0,4:0|1:96655096_C_G:96655096:1,0,5,0
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chr6	96656129	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,16:0,0,16,15
chr6	96656148	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=62.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,24:0.929:26:1,5:1,18:2,0,15,9
chr6	96656767	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0,0,19,1
chr6	96656775	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.956:18:0,10:0,8:0,0,18,0
chr6	96658260	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0|1:96658260_C_G:96658260:0,0,4,14
chr6	96658262	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0|1:96658260_C_G:96658260:0,0,4,14
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chr6	96999643	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:11,11:4,4:15,0,14,1
chr6	97000637	.	A	AGAAAGGAAAAGAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,26;MFRL=220,277;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr6	97339275	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=194,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.728:5:1,1:0,0:0,1,0,4
chr6	97344809	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=180,195;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.281:5:2,0:2,1:0|1:97344809_A_T:97344809:0,4,0,1
chr6	97344814	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=186,195;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:97344809_A_T:97344809:0,3,0,1
chr6	97562471	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=209,268;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:97562471_G_A:97562471:0,1,0,1
chr6	97562475	.	A	AGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,20;MFRL=209,268;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:97562471_G_A:97562471:0,1,0,1
chr6	97575196	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:1,6:5,4:7,0,10,0
chr6	97575423	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,2:3,3:0,9,0,5
chr6	97578888	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr6	97679540	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,2,8
chr6	97694582	.	A	ATAG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAG;STR;TLOD=116.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,12:0,16:0,0,6,22
chr6	98472564	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=182,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:3,2:0,8:0,3,0,10
chr6	99283376	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	99285519	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,23:0.436:53:16,11:14,12:13,17,10,13
chr6	99285558	.	GA	G	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=16,34;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=105.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.957:42:0,23:0,17:0,1,13,28
chr6	99328340	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:1,0:0|1:99328340_TG_T:99328340:3,0,1,0
chr6	99328346	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:99328340_TG_T:99328340:3,0,1,0
chr6	99328348	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:99328340_TG_T:99328340:3,0,1,0
chr6	99328352	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:99328340_TG_T:99328340:3,0,1,0
chr6	99353272	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.439:39:11,12:11,5:14,8,12,5
chr6	99374888	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=146,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:1,2:2,0:0|1:99374888_A_C:99374888:1,2,1,1
chr6	99374890	.	AAG	TTT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=153,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:99374888_A_C:99374888:1,3,1,1
chr6	99374897	.	GG	TT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=191,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:99374888_A_C:99374888:1,3,0,1
chr6	99374901	.	T	TTTCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=191,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:99374888_A_C:99374888:1,3,0,1
chr6	99729311	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.194:22:13,0:5,3:10,8,0,4
chr6	99781218	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,8:6,1:8,2,7,2
chr6	99796886	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=290,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr6	99817419	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr6	99817699	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=13,16;MFRL=187,253;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,0:0,0:0,4,0,2
chr6	99825225	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,5:3,4:6,1,8,1
chr6	99831542	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=171,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,1:4,6:5,0,7,0
chr6	99831703	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=162,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:3,1:2,4,0,2
chr6	99841868	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=13,13;MFRL=198,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.612:8:1,1:0,1:3,0,5,0
chr6	99841871	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=16,25;MFRL=204,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:1,1:2,1:6,0,3,0
chr6	99841907	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:3,1:2,4:4,2,5,0
chr6	99850350	.	GGTTA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTTA;STR;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,2:5,3:7,0,5,0
chr6	99853849	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:8,1,3,0
chr6	99853866	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,17,1
chr6	99858815	.	T	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,9:0.143:57:17,0:14,2:21,27,0,9
chr6	99883515	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr6	99883986	.	GT	AC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,292;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99883986_GT_AC:99883986:0,0,0,1
chr6	99883990	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,292;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99883986_GT_AC:99883986:0,0,0,1
chr6	99883993	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,292;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99883986_GT_AC:99883986:0,0,0,1
chr6	99883994	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,292;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99883986_GT_AC:99883986:0,0,0,1
chr6	99891391	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:9,4:7,5:0|1:99891391_T_C:99891391:14,2,9,1
chr6	99891395	.	CTG	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.400:28:9,5:6,6:0|1:99891391_T_C:99891391:15,2,9,2
chr6	100006295	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=191,0;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.223:21:12,2:5,2:16,1,4,0
chr6	100368759	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,12:0,1:0,0,11,3
chr6	100395739	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:5,13,0,2
chr6	100895344	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,1,5
chr6	100896289	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr6	100896569	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	100897659	.	GA	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100897659_GA_CC:100897659:0,1,0,1
chr6	100897663	.	A	AGGGGCCTTTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100897659_GA_CC:100897659:0,0,0,1
chr6	100898069	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=67,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:100898069_A_C:100898069:0,2,1,0
chr6	100898074	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=67,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:100898069_A_C:100898069:0,2,1,0
chr6	100957763	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=184,188;MMQ=53,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.776:10:1,4:1,4:2,0,8,0
chr6	100988266	.	GAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=145,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:0,0:3,1:1,7,0,2
chr6	101037718	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,15,3
chr6	101054999	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr6	101090377	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr6	101100528	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr6	101100783	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,1,15
chr6	101163433	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=91.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,12:0,0,4,23
chr6	101215223	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr6	101296373	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,1:5,1:10,5,1,1
chr6	101296389	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,6:4,2:6,3,5,3
chr6	101312097	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0|1:101312097_C_T:101312097:0,0,3,9
chr6	101312104	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.928:12:0,9:0,3:0|1:101312097_C_T:101312097:0,0,3,9
chr6	102124484	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,14;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.165:20:7,0:4,1:11,6,3,0
chr6	102307069	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	102372525	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=142,87;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:11,3:21,0:16,17,2,1
chr6	102503196	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:2,4:4,2:6,1,6,0
chr6	102503317	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,21:0,12:0,0,16,19
chr6	105232204	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,4:5,4:10,0,6,2
chr6	105232460	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=200,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:1,1:0,8,0,2
chr6	105239352	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:0,3:9,5:7,3,8,0
chr6	105244526	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,8:3,1:4,3,7,2
chr6	105259122	.	CATAT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=AT;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr6	105300262	.	C	CAG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.742:29:3,9:4,12:1,6,8,14
chr6	105405220	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr6	105405876	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,10;MFRL=202,247;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:105405876_T_G:105405876:2,0,1,0
chr6	105405886	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=13,12;MFRL=229,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:0,0:0|1:105405876_T_G:105405876:3,0,1,0
chr6	105405891	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=13,32;MFRL=229,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:1,1:0|1:105405876_T_G:105405876:3,0,1,0
chr6	105405899	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=14,12;MFRL=202,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:105405876_T_G:105405876:4,0,1,0
chr6	105577172	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	105577224	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=85.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,11:0,0,20,4
chr6	105577401	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,3,15
chr6	105595261	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr6	105845906	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=192,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr6	106534484	.	AT	A,ATT	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=25,25,28;MFRL=162,185,139;MMQ=60,60,60;MPOS=13,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.66,4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:50,6,5:0.098,0.091:61:29,5,1:19,1,4:5,45,1,10
chr6	106536253	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,30:0.508:59:13,16:16,14:10,19,10,20
chr6	106634569	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,4:4,0:0,8,0,4
chr6	106727719	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=144,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,2:2,4:2,6,1,5
chr6	106975415	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,2:8,5:0,16,0,7
chr6	106992592	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.551:36:8,8:8,11:3,13,8,12
chr6	106992844	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:0,7,1,7
chr6	106999658	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr6	107000188	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,0:5,3:0,12,0,3
chr6	107000198	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,1:7,1:0,11,0,2
chr6	107001456	.	A	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,31:0.433:72:17,14:22,17:8,33,5,26
chr6	107003810	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,3:1,5:0,7,0,8
chr6	107006336	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,6:1,2:3,1,6,2
chr6	107006347	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=180,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:7,2:3,1:9,1,2,1
chr6	107009119	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr6	107019994	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.561:25:6,4:4,10:3,8,3,11
chr6	107039973	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,1:6,1:12,0,2,0
chr6	107050867	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,6:0,16:0,0,0,22
chr6	107050887	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,0:9,3:0,14,0,3
chr6	107069232	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,15,0
chr6	107069273	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,2:3,5:7,3,7,1
chr6	107069410	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=129,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,2:3,6:2,8,2,6
chr6	107077502	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.387:26:6,6:10,3:12,4,10,0
chr6	107096853	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:2,1,4,0
chr6	107097123	.	AAC	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:1,7:9,5:1,9,0,12
chr6	107113953	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=227,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.576:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr6	107351312	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,4:5,3:5,7,4,3
chr6	107351457	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	107361476	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,5,7
chr6	107365411	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr6	107585724	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:16,0:17,3:5,32,0,3
chr6	108026317	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr6	108029020	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:2,3:3,3:4,2,6,1
chr6	108042213	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,11:0,6:0,0,2,15
chr6	108066144	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=117.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,17:0,16:0,0,19,16
chr6	108076672	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	108076855	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=169,62;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,1:4,1:2,5,0,2
chr6	108076858	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=166,115;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.242:10:3,0:2,0:0|1:108076858_G_T:108076858:2,6,0,2
chr6	108076864	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=163,115;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.265:9:3,0:1,0:0|1:108076858_G_T:108076858:2,5,0,2
chr6	108076870	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=166,115;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:2,0:1,1:0|1:108076858_G_T:108076858:2,2,0,2
chr6	108076959	.	A	ATTCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=163,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	108093328	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr6	108093580	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:0,7,0,5
chr6	108193148	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr6	108204429	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr6	108214754	.	GT	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,170;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:19,1:17,2:10,26,1,2
chr6	108222727	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=16,23;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.194:27:6,3:4,0:1,21,0,5
chr6	108225787	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,180;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr6	108243115	.	T	TGGG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=G;STR;TLOD=67.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.949:16:0,4:0,3:0|1:108243115_T_TGGG:108243115:0,0,5,11
chr6	108243120	.	AAAAAC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.947:16:0,4:0,11:0|1:108243115_T_TGGG:108243115:0,0,4,12
chr6	108277287	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr6	108279290	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	108487877	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	108489462	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,8:6,3:1,10,0,11
chr6	108495950	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=190,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,2:0,0:2,0,3,0
chr6	108498014	.	CTG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	108677003	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	108840870	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,3,0
chr6	109175372	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	109190267	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	109294752	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:8,4:8,7:0,16,1,10
chr6	109309656	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=89,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:109309656_T_A:109309656:1,1,1,0
chr6	109309660	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=89,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:109309656_T_A:109309656:1,1,1,0
chr6	109309666	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=89,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:109309656_T_A:109309656:1,1,1,0
chr6	109322477	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.500:40:7,11:13,9:19,1,17,3
chr6	109322701	.	T	TGA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=71.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.524:38:8,10:10,9:6,12,6,14
chr6	109466396	.	C	CTATAT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATAT;STR;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:13,7:6,6:17,2,10,4
chr6	109481678	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr6	109673933	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr6	109689431	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,18,2
chr6	109703307	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	109703391	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr6	109748392	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.405:42:13,7:12,9:8,17,4,13
chr6	109752619	.	C	CTCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109752619_C_CTCT:109752619:0,0,0,1
chr6	109752620	.	A	AGAACTAAGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109752619_C_CTCT:109752619:0,0,0,1
chr6	109762236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr6	109762265	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.418:20:5,4:4,4:12,0,7,1
chr6	109765818	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	109767285	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=123,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,0:3,1:2,1,1,0
chr6	109767290	.	CTCCCACCCTG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCCCACCCTG;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:0,0:2,1:1,2,1,0
chr6	109767295	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=141,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,1:0|1:109767295_A_C:109767295:0,2,1,0
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chr6	109769336	.	TCACACACA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=CA;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	109770999	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,3,8
chr6	109774367	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=80,204;MMQ=58,52;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr6	109774375	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=80,204;MMQ=58,52;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr6	109775436	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr6	109786980	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=55.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,5:0,10:0,0,13,2
chr6	109797304	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,19,0
chr6	109815351	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,0,19
chr6	109818567	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,1:0,0,5,0
chr6	109818569	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.834:3:0,0:0,1:0,0,3,0
chr6	109830298	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	109837859	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr6	109837879	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=185,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:0,1,1,7
chr6	109850155	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:109850155_A_G:109850155:4,0,1,0
chr6	109850159	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:109850155_A_G:109850155:4,0,1,0
chr6	109850199	.	AAC	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:2,1,1,2
chr6	109850201	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr6	109850360	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109850360_T_C:109850360:0,1,1,0
chr6	109850363	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109850360_T_C:109850360:0,1,1,0
chr6	109863238	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,8:0,0,18,4
chr6	109885954	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,117;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:21,5:9,0:25,5,5,0
chr6	109906329	.	GCTT	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTT;STR;TLOD=70.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,28:0.910:30:1,15:1,13:2,0,24,4
chr6	109906341	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.078:48:23,2:22,1:37,8,3,0
chr6	109940498	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr6	109954065	.	C	CATAG,CATAGATAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31,33;MFRL=0,162,159;MMQ=60,50,50;MPOS=7,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=ATAG;STR;TLOD=5.80,11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.337,0.570:6:0,2,1:0,0,1:0,0,6,0
chr6	109962904	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	109993291	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,19:0,7:0,0,16,10
chr6	110048489	.	C	CT,CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32,26;MFRL=207,194,245;MMQ=60,60,60;MPOS=20,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=11.95,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,2:0.494,0.231:10:1,4,1:2,1,0:1,2,0,7
chr6	110059510	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=90.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,10:0,16:0,0,21,6
chr6	110086135	.	T	TTTTTG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0|1:110086135_T_TTTTTG:110086135:6,0,2,0
chr6	110086138	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.293:8:2,1:4,0:0|1:110086135_T_TTTTTG:110086135:6,0,2,0
chr6	110106277	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:2,5,0,6
chr6	110110943	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=212,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,3:3,6:0,4,1,8
chr6	110113763	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.458:11:3,2:2,3:6,0,5,0
chr6	110301446	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=154,223;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.105:36:18,3:12,0:0|1:110301446_A_C:110301446:15,18,3,0
chr6	110301451	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=162,223;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.103:37:18,3:13,0:0|1:110301446_A_C:110301446:16,18,3,0
chr6	110301661	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,2:5,2:6,9,3,2
chr6	110301839	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.428:21:7,3:5,5:5,7,3,6
chr6	110301945	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:2,2,1,2
chr6	110426879	.	A	AGTGCAGCTGAAGCTTATTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	110567409	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.471:9:1,2:1,2:2,3,0,4
chr6	110643956	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr6	110644112	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr6	110644122	.	GG	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	110726236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:0,4,0,7
chr6	110736610	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=123,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:5,2:1,3:5,1,4,1
chr6	110745977	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:4,1:6,1:10,0,3,0
chr6	110746680	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:2,4:0,4,0,6
chr6	110752289	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr6	110797605	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:110797605_G_A:110797605:0,0,3,0
chr6	110797612	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:110797605_G_A:110797605:0,0,3,0
chr6	110797821	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	110942653	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,3:4,4:0,7,0,8
chr6	110988795	.	AC	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,2:10,5:1,16,0,8
chr6	111213927	.	T	TC	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=60.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,32:0.422:75:22,17:21,14:23,20,15,17
chr6	111214065	.	A	AC	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:18,3:23,0:0|1:111214065_A_AC:111214065:21,21,0,3
chr6	111214067	.	TG	T	.	.	DP=52;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.075:51:18,2:24,0:0|1:111214065_A_AC:111214065:25,23,0,3
chr6	111214069	.	T	A	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.075:51:19,3:25,0:0|1:111214065_A_AC:111214065:25,23,0,3
chr6	111214075	.	GTCTTTCC	G	.	.	DP=56;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.069:56:21,3:25,0:0|1:111214065_A_AC:111214065:31,22,0,3
chr6	111214084	.	TTCTTAAC	T	.	.	DP=61;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,3:0.068:57:23,3:24,0:0|1:111214065_A_AC:111214065:34,20,0,3
chr6	111280038	.	C	T	.	.	DP=116;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=114.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,46:0.419:110:30,25:32,20:34,30,26,20
chr6	111280134	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.500:48:11,15:13,9:0,24,0,24
chr6	111280332	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,6:7,4:6,4,7,3
chr6	111280470	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.497:26:6,4:7,9:4,9,4,9
chr6	111281581	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,5:1,8:5,1,11,2
chr6	111281584	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:4,4:2,7:7,1,10,2
chr6	111283592	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.657:33:7,11:4,11:2,9,17,5
chr6	111283718	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=130,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.479:40:8,8:12,11:6,15,10,9
chr6	111321037	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr6	111329221	.	CTT	C,CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,36,35;MFRL=95,143,145;MMQ=60,60,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=7.78,6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,6:0.231,0.278:22:6,3,4:3,2,1:7,4,9,2
chr6	111346806	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:0|1:111346806_C_T:111346806:0,9,0,9
chr6	111346808	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:0|1:111346806_C_T:111346806:0,9,0,9
chr6	111346843	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr6	111493953	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,25:0.469:54:11,14:15,11:20,9,16,9
chr6	111527696	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=238,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr6	111527988	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,5:6,5:1,7,0,10
chr6	111543532	.	A	AATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:111543532_A_AATT:111543532:0,1,0,1
chr6	111543535	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:111543532_A_AATT:111543532:0,1,0,1
chr6	111543537	.	C	CTTGCCCTTTTCCCCTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:111543532_A_AATT:111543532:0,1,0,1
chr6	111587055	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=192,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.498:32:6,7:10,9:15,1,11,5
chr6	111587360	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.195:24:7,2:13,2:6,14,0,4
chr6	111587370	.	GTCTGTTTTT	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.134:28:9,1:13,2:0|1:111587370_GTCTGTTTTT_G:111587370:7,18,0,3
chr6	111587383	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:8,1:10,2:0|1:111587370_GTCTGTTTTT_G:111587370:7,12,0,3
chr6	111685193	.	AAC	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.121:22:10,0:8,2:0|1:111685193_AAC_A:111685193:1,19,0,2
chr6	111685208	.	A	ACACACACAAACAC	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,2:0.112:24:11,2:10,0:1|0:111685193_AAC_A:111685193:1,21,0,2
chr6	111685209	.	G	GTT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,2:0.112:24:10,1:10,0:1|0:111685193_AAC_A:111685193:1,21,0,2
chr6	111695887	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,3:5,4:3,6,4,3
chr6	111711232	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:1,1:6,7:7,0,9,0
chr6	111714245	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,2:0,0:0,3,0,2
chr6	111896790	.	CAAAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.643:9:1,4:0,2:1,2,6,0
chr6	112017435	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=197,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,2:3,2:7,2,2,2
chr6	112375644	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,5:2,1:0,5,0,7
chr6	112381326	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,10;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.355:19:4,0:5,0:4,8,0,7
chr6	112381328	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:5,1:4,11,0,2
chr6	112389668	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,108;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,0:12,2:0,19,0,2
chr6	112397445	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	112401050	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:0,7,0,3
chr6	112420685	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr6	112420703	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=121,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr6	112435264	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:6,3:6,5:0|1:112435264_T_G:112435264:4,9,6,2
chr6	112435273	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:7,3:7,4:0|1:112435264_T_G:112435264:5,9,6,2
chr6	112435444	.	G	GAAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:1,3,1,5
chr6	112435796	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,4:2,0,5,0
chr6	112435807	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,3:3,4:4,0,6,1
chr6	112443134	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,23,1
chr6	112450351	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr6	112454185	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=204,241;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	112457471	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr6	112460541	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:6,9:4,6:1,9,2,13
chr6	112471621	.	GACAA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=135,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAA;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:7,0,3,0
chr6	112471688	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.425:31:9,6:9,7:12,6,12,1
chr6	112476210	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=210,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	112476215	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=193,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:112476215_G_A:112476215:0,4,0,1
chr6	112476222	.	AA	GG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=193,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:112476215_G_A:112476215:0,4,0,1
chr6	112476226	.	A	AGAAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=205,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:112476215_G_A:112476215:0,3,0,1
chr6	112506375	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr6	112506583	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:3,4:4,6:0,7,1,9
chr6	112508769	.	TG	GT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,1,25
chr6	114178831	.	C	CGCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCT;STR;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr6	114181209	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,0:5,0,2,0
chr6	114264568	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=112,111;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:6,0:10,3:8,8,0,3
chr6	114279783	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=181,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:4,3:5,2:9,0,5,1
chr6	114292109	.	C	CCTG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CTG;STR;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.535:11:1,3:4,1:5,0,6,0
chr6	116263524	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr6	116264386	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.211:21:3,2:11,1:2,15,1,3
chr6	116265365	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,5:3,3:4,2,8,0
chr6	116277621	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,0:9,4:10,8,0,4
chr6	116288912	.	TA	T,TAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,31,30;MFRL=152,187,152;MMQ=60,60,60;MPOS=19,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.79,5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,5:0.123,0.182:28:12,1,2:8,2,2:2,18,2,6
chr6	116325108	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.664:19:3,3:3,9:3,3,5,8
chr6	116381539	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,242;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:0,10,2,0
chr6	116427506	.	CTTT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=98,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.537:4:1,0:0,2:1,1,0,2
chr6	116429623	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,6:6,5:3,8,1,10
chr6	116439220	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:6,9:4,3:1,10,0,12
chr6	116441229	.	T	TGGG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:5,2:4,3:6,3,4,2
chr6	116782488	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr6	116783390	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	116836859	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=155,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:15,3:9,0:13,11,3,0
chr6	116864381	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr6	116866754	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:14,0:6,5:3,17,0,5
chr6	116906114	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=204,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:116906114_A_G:116906114:0,2,0,1
chr6	116906121	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:116906114_A_G:116906114:1,2,0,1
chr6	116911413	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:9,2:13,2:22,0,4,1
chr6	116912033	.	CT	C,CTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=156,155,155;MMQ=60,60,60;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=8.46,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,8,4:0.233,0.136:32:13,1,2:6,7,2:19,1,12,0
chr6	116982086	.	AG	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=174,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:4,0:0,16,0,2
chr6	117073894	.	T	TAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.708:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	117073918	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=185,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr6	117127858	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:9,4,2,0
chr6	117198347	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	117215114	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.436:28:6,1:9,10:9,7,9,3
chr6	117237074	.	GTAATAGGATCTTTTAAAAAATCTGTGTTGAACAAATTAACAAGAAAAGGCAGTGT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=156,264;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:2,0:5,3:16,11,3,0
chr6	117237524	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	117239086	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr6	117239141	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,2:7,1,5,3
chr6	117246576	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,3:0,1:3,0,3,1
chr6	117248745	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=164,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117248745_A_T:117248745:0,1,0,1
chr6	117248749	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=164,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117248745_A_T:117248745:0,1,0,1
chr6	117248751	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=164,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117248745_A_T:117248745:0,1,0,1
chr6	117587054	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr6	117587074	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	117591619	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	117631463	.	T	TTAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,62;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TAA;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.358:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	117677833	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,2:5,0:9,8,2,0
chr6	117678083	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,12:0,0,2,22
chr6	117681436	.	G	GACAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=AC;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr6	117683845	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:18,0:6,2:16,8,0,2
chr6	117687004	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:117687004_A_AAG:117687004:0,1,0,1
chr6	117687005	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:117687004_A_AAG:117687004:0,1,0,1
chr6	117687307	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=167,97;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:3,0:11,8,2,0
chr6	117707091	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:0,12,0,2
chr6	117709149	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:7,14,0,2
chr6	117718008	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=205,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr6	117725383	.	CA	C,CAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32,35;MFRL=156,200,177;MMQ=60,40,40;MPOS=22,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=5.79,11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,8:0.188,0.389:21:2,0,5:5,4,1:7,1,11,2
chr6	117735842	.	AAG	TGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	117860058	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=124,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:3,4:0,7,0,5
chr6	117862048	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.311:24:10,4:4,3:11,6,4,3
chr6	117996818	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,112;MMQ=60,21;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr6	118475798	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,5,17
chr6	118556628	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,11,3
chr6	118635122	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,1:2,5:5,0,6,0
chr6	118786486	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=67,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,3,1
chr6	118801174	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:7,4:3,7:0,11,2,10
chr6	118886615	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:4,0,8,0
chr6	118974042	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	119137265	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,31:0.535:57:14,18:12,8:13,13,13,18
chr6	119149245	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:17,3:25,0:21,21,3,0
chr6	119296378	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=201,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,2:0,4:0,2,0,6
chr6	119324120	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,1:11,1:11,9,1,1
chr6	119344020	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr6	119346010	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	119510739	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr6	119510777	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,2:5,2:11,0,3,1
chr6	119511120	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr6	119522353	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=263,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:2,3:1,3:3,0,7,0
chr6	119522553	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:4,5:4,3:0,9,1,7
chr6	119628029	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.536:35:6,9:10,8:11,5,16,3
chr6	119669877	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.543:31:7,7:7,9:1,13,5,12
chr6	121436422	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,1,16
chr6	121482295	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr6	121491472	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	121544598	.	T	TAGGAAAATGAGGCTGGGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr6	121560155	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=203,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:4,1,3,1
chr6	121626079	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,9:0,8:0,0,1,16
chr6	121632084	.	A	ATTACTTTTGAAAGCCTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=179,264;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	121769785	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:14,0:16,3:10,20,0,3
chr6	122720806	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,6:2,2:4,0,8,0
chr6	122733496	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,31,35;MFRL=166,166,152;MMQ=60,60,60;MPOS=9,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,12;RU=T;STR;TLOD=5.85,3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,4,3:0.146,0.113:30:15,0,2:8,4,1:22,1,7,0
chr6	122743502	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=182,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,0:0,5,0,3
chr6	122752550	.	T	TTA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TA;STR;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:9,7:5,4:14,0,12,0
chr6	122772921	.	AATAT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=145,109;MMQ=60,38;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=AT;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.286:12:5,2:1,2:3,5,1,3
chr6	122775195	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.345:30:9,4:7,5:18,2,10,0
chr6	123022496	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	123038887	.	CT	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	123101348	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	123101373	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,3:2,4:6,0,7,0
chr6	123101647	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:0,7,0,3
chr6	123110621	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:8,8:11,7:6,13,5,10
chr6	123318320	.	T	TTCTCCCCTCTCTTTCTGTCTGTTTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,0;MFRL=279,52;MMQ=60,50;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,0:4,0,1,1
chr6	123369910	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,1,16
chr6	123384960	.	C	CTCCATCAGGTCCTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=172,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	123539684	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr6	123580660	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,29,0
chr6	123595917	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=179,172;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:0,15,0,2
chr6	123600100	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	123658680	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr6	123687432	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	123702651	.	AA	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	123702659	.	C	CCGCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=167,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	123786154	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:7,1:8,1:1,14,0,3
chr6	123819847	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	123851538	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr6	123851590	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=101.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0|1:123851590_G_A:123851590:0,0,22,1
chr6	123851610	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=130.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,17:0,14:0|1:123851590_G_A:123851590:0,0,30,2
chr6	123869769	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	123869797	.	G	GAAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=181,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:1,0:0|1:123869797_G_GAAA:123869797:0,2,0,1
chr6	123869799	.	T	TATAAAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=181,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:123869797_G_GAAA:123869797:0,2,0,1
chr6	123869801	.	ATT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=181,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:123869797_G_GAAA:123869797:0,2,0,1
chr6	123892337	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.494:8:0,0:4,4:0,4,0,4
chr6	124604055	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=143,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	124979689	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,0,25
chr6	125139473	.	TG	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,5:0,0,11,3
chr6	125366289	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,2:1,4:4,0,6,0
chr6	125402711	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.677:26:3,16:5,1:0,8,1,17
chr6	125597247	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,5:6,3:11,1,8,0
chr6	125597433	.	AAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,2:3,3:1,4,0,5
chr6	125598199	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:8,0,3,1
chr6	125614100	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:4,3:0,6,1,4
chr6	125614121	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr6	125614135	.	C	CTTTCATTCCAGGCTCAGGCCTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr6	125621618	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:7,7:7,3:14,0,10,1
chr6	125621645	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.407:42:9,13:15,3:22,3,11,6
chr6	126072853	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0|1:126072853_C_G:126072853:5,0,2,1
chr6	126072857	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0|1:126072853_C_G:126072853:5,0,2,1
chr6	126073212	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,28:0.502:56:18,10:8,17:15,13,17,11
chr6	126075709	.	ATTT	ATT,A,AT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=26,25,28,25;MFRL=158,153,173,158;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,27,28;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,14,12,13;RU=T;STR;TLOD=10.34,9.28,23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:13,6,7,12:0.169,0.182,0.320:38:6,3,0,7:7,2,6,4:2,11,1,24
chr6	126176321	.	AAAAGAG	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:6,2:0|1:126176321_AAAAGAG_A:126176321:3,11,0,2
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chr6	127770923	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
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chr6	128306769	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
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chr6	128312114	.	T	TAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,8:0,0,0,12
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chr6	128322437	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr6	128330249	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=212,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=66.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.911:20:1,8:0,11:1,0,13,6
chr6	128383562	.	G	GA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=115.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,15:0,21:0,0,26,14
chr6	128385998	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	128388990	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,0,17
chr6	128403678	.	GA	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.064:44:21,2:16,0:0|1:128403678_GA_G:128403678:20,22,1,1
chr6	128403683	.	A	AG	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:21,1:16,0:19,22,1,1
chr6	128403689	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:21,2:14,0:0|1:128403678_GA_G:128403678:18,20,1,1
chr6	129370971	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,2:2,2:8,0,4,0
chr6	129465020	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:7,2:3,1:9,1,2,2
chr6	129468288	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	129486913	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=245,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:0,2,1,3
chr6	129571330	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:8,2:0,5:3,5,2,5
chr6	129622055	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=54.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,8:0,0,1,15
chr6	129674593	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:0,0:5,1:0,6,0,4
chr6	129724942	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0|1:129724942_T_A:129724942:2,0,4,1
chr6	129724944	.	CT	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0|1:129724942_T_A:129724942:2,0,4,1
chr6	129766950	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,0:7,2:4,13,0,2
chr6	129777382	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr6	129785391	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:1,5:2,9:3,0,11,3
chr6	129796505	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=182,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:2,2,0,2
chr6	129823827	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:18,3:30,0:31,20,3,0
chr6	129835814	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	129905035	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr6	129955117	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=191,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:3,0,5,0
chr6	129955151	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.418:11:3,2:4,2:6,1,3,1
chr6	129955327	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr6	129962931	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,2:1,5:6,2,5,2
chr6	130164764	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,17:0.381:45:14,8:13,8:2,26,2,15
chr6	130164856	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr6	130370404	.	C	CCT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=85.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,6:0,13:0,0,15,8
chr6	130371028	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,1:10,1:0|1:130371028_C_T:130371028:3,16,0,2
chr6	130371037	.	C	CG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,1:6,1:0|1:130371028_C_T:130371028:1,13,0,2
chr6	130371055	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	130387431	.	G	GTATATATATATATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,15;RU=TA;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	130399647	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.639:26:5,7:4,7:7,2,12,5
chr6	130466413	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr6	130505374	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	130530815	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr6	130535420	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr6	130535763	.	A	AAAGGGAGTTAAATAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=231,293;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130535763_A_AAAGGGAGTTAAATAT:130535763:0,1,0,1
chr6	130535765	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=231,293;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130535763_A_AAAGGGAGTTAAATAT:130535763:0,1,0,1
chr6	130536494	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=224,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr6	130761804	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,2,14
chr6	131186578	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:4,3:3,3:8,0,6,0
chr6	131197990	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr6	131199470	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=185,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:131199470_A_T:131199470:0,3,0,1
chr6	131199473	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:131199470_A_T:131199470:0,4,0,1
chr6	131199475	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:131199470_A_T:131199470:0,4,0,1
chr6	131199476	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:131199470_A_T:131199470:0,4,0,1
chr6	131211616	.	GAAAA	G,GAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=16,19,15;MFRL=175,249,190;MMQ=60,60,60;MPOS=17,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,14;RU=A;STR;TLOD=6.57,9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,6:0.200,0.366:16:0,0,0:1,1,0:0,7,0,9
chr6	131481394	.	CA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=89.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,7:0,15:0,0,0,25
chr6	131490472	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=233,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,2:4,6:0,5,0,8
chr6	131540726	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,4:1,5:5,0,9,0
chr6	131904704	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,0:0,11:0,0,0,12
chr6	131904719	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=205,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr6	131912533	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:11,1,2,0
chr6	131924070	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:1,1:4,1:6,0,2,0
chr6	131941944	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=16,26;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,1:1,1:0,3,0,3
chr6	131948469	.	GAA	G,GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=194,192,146;MMQ=60,60,60;MPOS=10,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=3.08,7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.217,0.410:11:2,1,2:3,1,2:3,2,6,0
chr6	131948815	.	G	T	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,6:0.060:95:27,1:23,1:24,65,0,6
chr6	131948816	.	TA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=97;ECNT=2;MBQ=28,31,29,29;MFRL=140,144,126,143;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,17,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,16;RU=A;STR;TLOD=14.06,29.92,7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:28,12,17,7:0.166,0.288,0.116:64:15,5,8,5:10,7,6,2:1,27,5,31
chr6	131958485	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=110.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,19:0,11:0,0,25,5
chr6	131995209	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr6	132006697	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr6	132043349	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr6	132168840	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=175,0;MMQ=60,28;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:132168840_T_A:132168840:3,0,1,0
chr6	132168842	.	TC	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=175,0;MMQ=60,28;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:132168840_T_A:132168840:3,0,1,0
chr6	132169035	.	AT	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=184,142;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:0|1:132169035_AT_GA:132169035:0,3,0,1
chr6	132169039	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=214,142;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.374:4:1,1:2,0:0|1:132169035_AT_GA:132169035:0,3,0,1
chr6	132181673	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,5:4,2:0,8,0,7
chr6	132181710	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	132189082	.	T	TTAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,15;MFRL=86,152;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.311:5:2,0:2,0:3,1,1,0
chr6	132190706	.	TG	CA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=182,199;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,0:5,2:0,15,0,2
chr6	132190717	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=184,199;MMQ=59,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.251:13:6,1:4,2:0,10,0,3
chr6	132195292	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:132195292_T_G:132195292:1,0,1,0
chr6	132195300	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=191,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:132195292_T_G:132195292:2,0,1,0
chr6	132203432	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=206,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:1,1,4,1
chr6	132203470	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=238,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:2,1:4,2,3,1
chr6	132203614	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,1:7,1:5,16,0,2
chr6	132207964	.	C	CTCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	132271777	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.358:6:1,0:1,1:0,4,0,2
chr6	132649279	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=192,137;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,0:7,3:0,12,0,3
chr6	132696016	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	132785071	.	AAC	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=97,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:4,3:18,0:14,9,2,1
chr6	132785224	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,12;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,6:6,3:0,9,2,7
chr6	132860522	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=224,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr6	132892144	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:4,3:3,3:5,2,5,2
chr6	132910958	.	A	ACAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132910958_A_ACAG:132910958:0,0,0,1
chr6	132910961	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132910958_A_ACAG:132910958:0,0,0,1
chr6	132910964	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132910958_A_ACAG:132910958:0,0,0,1
chr6	133048213	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,4:7,1:0,12,0,5
chr6	133055610	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.349:18:5,3:7,3:0|1:133055610_G_T:133055610:7,5,4,2
chr6	133055612	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.349:18:5,3:7,2:0|1:133055610_G_T:133055610:7,5,4,2
chr6	133092046	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:8,8:8,3:7,9,5,6
chr6	133119695	.	C	CAAAATCATGCCAAAATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=192,177;MMQ=60,49;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr6	133135807	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,19,0
chr6	133136029	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.382:50:13,7:18,11:18,13,16,3
chr6	133136041	.	C	G	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,29:0.526:55:12,11:14,16:22,4,17,12
chr6	133138010	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr6	133138067	.	ATTTT	A,ATT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30,30;MFRL=0,150,135;MMQ=60,60,60;MPOS=12,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,10,12;RU=T;STR;TLOD=33.36,16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,11,6:0.606,0.350:17:0,6,5:0,4,0:0,0,12,5
chr6	133138249	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=117.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,10:0,21:0,0,3,29
chr6	133138749	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	133827148	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr6	133827354	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:1,6,1,4
chr6	133844137	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:2,2,4,0
chr6	133849789	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,5:4,4:7,1,9,0
chr6	134210497	.	G	GTCTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=TC;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr6	134212760	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,32;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0|1:134212760_A_C:134212760:1,0,1,0
chr6	134212763	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=9,32;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0|1:134212760_A_C:134212760:1,0,1,0
chr6	134303689	.	A	AT	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=67.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,32:0.486:66:19,19:15,12:23,11,26,6
chr6	134312365	.	GG	TA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:23,0:12,3:19,16,0,3
chr6	134350063	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.413:25:7,6:6,4:10,5,6,4
chr6	134494548	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=184.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,27:0,32:0,0,34,25
chr6	134494708	.	GA	G,TA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,16,9;MFRL=134,123,180;MMQ=60,60,60;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.69,6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,14:0.165,0.335:24:2,0,1:3,0,0:5,2,0,17
chr6	134495291	.	T	TC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,5:7,3:0,11,0,10
chr6	135260303	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	135271291	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=178,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr6	135286505	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	135287413	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr6	135318854	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr6	135324051	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.922:10:0,7:0,3:0|1:135324051_T_C:135324051:0,0,1,9
chr6	135324052	.	TTTAAA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0|1:135324051_T_C:135324051:0,0,1,9
chr6	135511108	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,5,7
chr6	135522939	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr6	135524516	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	135524553	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	135639644	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,14:0,0,17,6
chr6	135754471	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr6	135763866	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,16:0,0,4,26
chr6	135813251	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,21,0
chr6	136268571	.	TAAAA	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.486:31:6,9:7,6:11,5,10,5
chr6	136268769	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr6	136475233	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,0:14,3:19,12,0,3
chr6	136512661	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,189;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:10,0,2,0
chr6	136582113	.	A	C	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=172,152;MMQ=52,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,12:0.232:54:18,3:24,8:42,0,11,1
chr6	136582194	.	T	TAAA	.	.	DP=159;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=A;STR;TLOD=110.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:107,32:0.234:139:51,15:52,12:59,48,19,13
chr6	136582203	.	T	C	.	.	DP=157;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:121,32:0.210:153:57,17:61,14:66,55,19,13
chr6	136590698	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=156,112;MMQ=60,30;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.176:49:19,4:21,4:15,26,2,6
chr6	136590712	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=160,115;MMQ=60,34;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.175:47:21,3:18,4:14,25,1,7
chr6	136593183	.	G	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=164,86;MMQ=60,29;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,9:0.122:80:35,4:33,5:25,46,4,5
chr6	136594292	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,1174;MMQ=60,58;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,15:0.226:69:28,11:24,4:24,30,8,7
chr6	136599459	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=193,148;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:8,12,1,1
chr6	136599822	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.224:29:11,4:11,2:0,23,1,5
chr6	136882616	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:6,0,7,0
chr6	136913670	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:24,2:12,1:16,21,0,3
chr6	136972201	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,87;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:18,0:14,2:10,23,0,2
chr6	136980614	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=229,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	137151010	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	137166682	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.930:26:1,14:0,11:1,0,19,6
chr6	137187739	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:24,3:22,0:32,14,3,0
chr6	137234573	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,148;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:17,0:18,2:30,6,0,2
chr6	137325847	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,6,18
chr6	137325908	.	A	ACAAACAAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr6	137338276	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr6	137477823	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,5:7,2:9,1,7,0
chr6	137482982	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:0,5,0,5
chr6	137519780	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=198,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:0,6,0,4
chr6	137524870	.	GAA	G,GAAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,26,15;MFRL=134,200,174;MMQ=60,60,60;MPOS=24,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=24.65,9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,5:0.506,0.417:14:1,1,0:0,3,0:0,1,0,13
chr6	137536326	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.140:41:22,5:13,0:33,3,5,0
chr6	137540335	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=222,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,4:3,6:5,0,10,0
chr6	137540370	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=104.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,11:0,17:0,0,27,2
chr6	137540520	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=127.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.972:33:0,13:0,18:0|1:137540520_A_G:137540520:0,0,8,25
chr6	137540536	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,19:0.604:31:3,10:9,8:0|1:137540520_A_G:137540520:3,9,2,17
chr6	138195961	.	TCTC	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=142.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,10:0,23:0,0,32,1
chr6	138197331	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=135.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,20:0,17:0,0,6,31
chr6	138620000	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=226,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr6	138628598	.	TAAA	T,TAAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32,21;MFRL=0,172,199;MMQ=60,60,60;MPOS=21,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,9,13;RU=A;STR;TLOD=23.69,4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.545,0.356:8:0,2,0:0,4,1:0,0,0,8
chr6	138632506	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,5:6,3:9,1,7,1
chr6	138632518	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,6:5,5:13,0,9,2
chr6	138634848	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=104,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr6	138644769	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:6,4:14,0:16,5,4,0
chr6	138745896	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,5:3,5:3,3,2,8
chr6	138768408	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr6	138794628	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr6	138820271	.	GAC	G,GACAC	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31,29;MFRL=131,135,115;MMQ=60,60,60;MPOS=17,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=AC;STR;TLOD=8.17,13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,7:0.223,0.271:26:6,1,2:5,5,3:12,1,11,2
chr6	139097174	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=234,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,3,1
chr6	139134558	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	139164440	.	C	CTTGTTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr6	139183725	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,0;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:6,2,0,2
chr6	139183879	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=206,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,0,4
chr6	139186074	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=162,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr6	139202014	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	139204081	.	C	CTTTTTTGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:139204081_C_CTTTTTTGA:139204081:1,3,0,1
chr6	139204082	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:139204081_C_CTTTTTTGA:139204081:1,3,0,1
chr6	139207910	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr6	139229743	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr6	139234163	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	139487394	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=159.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,24:0,21:0,0,36,10
chr6	139581477	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:16,2:17,1:18,16,3,0
chr6	142491463	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr6	142715195	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=190,663;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,3:5,3:0,9,0,6
chr6	142724918	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:0,2:3,2:4,0,4,0
chr6	142738314	.	CTTCTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,0:1,8:4,0,8,0
chr6	143081847	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr6	143093929	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:6,8,0,3
chr6	143382254	.	CGT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,178;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=GT;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,2:3,2:3,4,2,2
chr6	143605427	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr6	143654625	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr6	143754938	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=112,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:6,3,4,1
chr6	143772278	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr6	143784031	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,9:6,3:13,1,10,2
chr6	143789181	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:7,0,8,0
chr6	143828325	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=191,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:3,0,4,2
chr6	144070252	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:10,0:10,2:4,16,0,2
chr6	144086394	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr6	144086436	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:8,2:13,0:16,5,2,0
chr6	144104469	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,8:0,8:0,0,4,13
chr6	144128095	.	TA	T,TAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,29,26;MFRL=180,186,163;MMQ=60,60,60;MPOS=21,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.79,5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,4:0.158,0.186:22:11,2,1:4,1,3:15,0,7,0
chr6	144258670	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	144262792	.	C	CCCTTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=150,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:11,1:5,0:0|1:144262792_C_CCCTTT:144262792:4,12,0,2
chr6	144262794	.	A	AGATCG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=150,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.146:18:11,0:5,1:0|1:144262792_C_CCCTTT:144262792:4,12,0,2
chr6	144262995	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:8,11,1,1
chr6	144508751	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=22,16;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.166:27:8,0:8,0:0|1:144508751_G_A:144508751:9,14,0,4
chr6	144508756	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.166:27:8,0:9,0:0|1:144508751_G_A:144508751:9,14,0,4
chr6	144508758	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:11,0:10,2:11,14,0,4
chr6	144509854	.	T	TTGTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,0:2,1:0|1:144509854_T_TTGTTG:144509854:1,2,0,1
chr6	144509855	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,0:2,1:0|1:144509854_T_TTGTTG:144509854:1,2,0,1
chr6	144510672	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,196;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,3:11,0:7,15,3,0
chr6	144512671	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=199,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.870:21:1,8:1,9:0,2,1,18
chr6	144769660	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:12,3:11,0:0|1:144769660_A_G:144769660:21,2,3,0
chr6	144769661	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,10:0.379:27:12,4:4,6:1|0:144769660_A_G:144769660:15,2,10,0
chr6	144794785	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=269,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,5:1,4:3,0,9,0
chr6	144803547	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.361:28:10,2:8,8:4,14,2,8
chr6	144806691	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.665:22:2,4:5,10:0,7,5,10
chr6	144843089	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=136,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:1,2:3,2,2,1
chr6	144843091	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=18,30;MFRL=73,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.690:7:0,1:1,3:1,1,3,2
chr6	144869785	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:9,5:5,3:7,7,5,3
chr6	144870040	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,2:2,3:0,6,0,6
chr6	144872296	.	C	CAAAAATCAAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:144872296_C_CAAAAATCAAAA:144872296:0,0,0,1
chr6	144872303	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:144872296_C_CAAAAATCAAAA:144872296:0,0,0,1
chr6	144875793	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=185,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,2:3,0,4,1
chr6	144999798	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr6	145021193	.	GTTA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTA;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr6	145148690	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.577:12:2,1:2,5:5,0,7,0
chr6	145822992	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:4,3:6,9:1,9,4,8
chr6	145956419	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:14,7:8,8:10,12,6,9
chr6	146007166	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,2:0,0,9,0
chr6	146007332	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.503:30:3,5:11,10:9,6,7,8
chr6	146007361	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:9,3:16,0:15,11,3,0
chr6	146056476	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	146125466	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr6	146185591	.	G	A	.	.	DP=147;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=157.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,62:0.459:135:35,28:37,34:35,38,31,31
chr6	146207465	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.474:36:7,8:12,9:17,2,16,1
chr6	146207502	.	G	GT	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=70.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,30:0.514:58:15,17:13,12:25,3,16,14
chr6	146207657	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,3:3,2:0,7,1,5
chr6	146216184	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=232,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr6	146244012	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,5:8,3:0,13,2,6
chr6	146244743	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.697:17:1,7:3,5:4,1,12,0
chr6	146256315	.	GAA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:1,0:4,0:5,10,0,2
chr6	146262697	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,9,1
chr6	146268623	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.624:33:6,8:6,10:9,3,15,6
chr6	146276516	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=220,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146276516_G_T:146276516:0,1,0,1
chr6	146276518	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=220,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146276516_G_T:146276516:0,1,0,1
chr6	146276520	.	TAACAA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=220,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146276516_G_T:146276516:0,1,0,1
chr6	146276530	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=220,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146276516_G_T:146276516:0,1,0,1
chr6	146480398	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:10,1,2,0
chr6	146480740	.	TTCTCTCTCTC	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=201,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=TC;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.409:8:2,2:2,1:1,4,0,3
chr6	146480777	.	TCA	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=188,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CA;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	146480798	.	C	CATTGCCTTTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=178,168;MMQ=60,41;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:0|1:146480798_C_CATTGCCTTTA:146480798:0,3,0,1
chr6	146480803	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=174,168;MMQ=60,41;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:146480798_C_CATTGCCTTTA:146480798:0,2,0,1
chr6	146678929	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:1,5,0,6
chr6	146707993	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,2:4,0,4,0
chr6	146755324	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:3,3:3,5:3,4,3,5
chr6	146755515	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,3:6,6:11,5,6,4
chr6	146975204	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,2:3,0:5,0,3,0
chr6	146975456	.	TTA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=185,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TA;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	146987930	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:9,6:3,1:12,1,6,1
chr6	146993392	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=180,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.384:37:10,8:13,5:11,12,7,7
chr6	147007040	.	G	GGATTTTCAATATTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=183,254;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	147022227	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,2:5,4:3,8,0,6
chr6	147042695	.	A	AGGGAACATGCAATAATAAGATTTTTAGAGGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:7,2:0,3:0,7,0,6
chr6	147045374	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=150,128;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,3:4,0:10,7,3,0
chr6	147047341	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,6:4,6:8,4,6,6
chr6	147049641	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr6	147049899	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr6	147054241	.	A	ATTAATGTAC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=56.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.569:26:5,10:5,2:8,3,13,2
chr6	147054410	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:6,7:1,5:0,7,0,14
chr6	147054450	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=193,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:0,7,0,8
chr6	147062220	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=218,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:7,1,4,1
chr6	147073639	.	TATA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,6:1,4:2,4,10,0
chr6	147084985	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=244,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr6	147103358	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=209,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,3:4,3:5,3,0,7
chr6	147103416	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr6	147631201	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr6	147635318	.	T	TAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=222,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=AC;STR;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.790:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr6	147635385	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=234.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.982:55:0,30:0,24:0,0,22,33
chr6	147635547	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr6	147646250	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,106;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:10,0:17,2:5,22,0,2
chr6	148711207	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:9,1,3,0
chr6	148761269	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,163;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:20,0:20,3:30,10,3,0
chr6	148869370	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr6	149208157	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.385:50:13,11:18,8:14,17,7,12
chr6	149275131	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=262,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,3:4,4:0,5,0,7
chr6	149285768	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=181,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr6	149340390	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,16:0,3:0,0,5,14
chr6	149691291	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=229,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:0,8,0,6
chr6	149699333	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=119,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.500:38:11,13:8,6:8,11,6,13
chr6	149718650	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,4:3,2:8,1,6,0
chr6	149730846	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.654:35:4,15:7,8:2,10,5,18
chr6	149780695	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:5,5:4,5:8,2,7,3
chr6	149780737	.	G	GACTA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=176,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTA;STR;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:8,1:4,3:7,5,2,3
chr6	149795692	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=113,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:1,4:8,1:3,6,3,2
chr6	149842170	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,14;MFRL=171,63;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,0:0|1:149842170_C_A:149842170:3,8,2,0
chr6	149842181	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=162,63;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,0:0|1:149842170_C_A:149842170:2,10,2,0
chr6	149846372	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.387:17:4,3:5,3:3,8,0,6
chr6	149855742	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=208,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,2:5,0,8,0
chr6	149862453	.	G	GTAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,80;MMQ=60,46;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TAAA;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.317:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr6	149893811	.	G	GGTTTTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:12,0:2,2:0,14,0,2
chr6	149953823	.	A	ACCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=248,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:149953823_A_ACCCC:149953823:3,0,0,1
chr6	149953824	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=248,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:149953823_A_ACCCC:149953823:3,0,0,1
chr6	149953827	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=248,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,0:2,1:0|1:149953823_A_ACCCC:149953823:3,0,0,1
chr6	149953835	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=13,31;MFRL=254,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,1:0,3:1,0,4,0
chr6	149982882	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:5,2:11,1:8,8,2,1
chr6	149997657	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,3,1
chr6	150023232	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:5,4:5,6:6,4,0,10
chr6	150064733	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:1,0:1,1:1,1,1,2
chr6	150094152	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=0,141;MMQ=52,47;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:150094152_GAA_G:150094152:1,0,1,0
chr6	150094174	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=85,141;MMQ=56,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:150094152_GAA_G:150094152:2,0,1,0
chr6	150094177	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,15;MFRL=85,141;MMQ=56,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:1,0:0|1:150094152_GAA_G:150094152:2,0,1,0
chr6	150114606	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=210,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr6	150123316	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.541:11:1,2:3,4:5,0,6,0
chr6	150163911	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=196,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:4,2:0,1:1,4,1,2
chr6	150209828	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.404:5:2,0:1,1:0,3,0,2
chr6	150209849	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=189,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:0,2:0,3,0,4
chr6	150210802	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,8:5,5:1,9,1,12
chr6	150210994	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,11:0.353:32:9,6:10,5:0|1:150210994_T_C:150210994:18,3,7,4
chr6	150210999	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,11:0.353:32:9,6:10,5:0|1:150210994_T_C:150210994:18,3,7,4
chr6	150240083	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,189;MMQ=53,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,7:0,1:1,1,5,3
chr6	150244216	.	TGTCTGAATGCAGCCC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTCTGAATGCAGCCC;STR;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.370:9:4,2:1,1:0,6,0,3
chr6	150263186	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.462:18:6,4:0,3:7,3,7,1
chr6	150290573	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	150290582	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:150290582_T_TA:150290582:0,2,0,1
chr6	150290583	.	T	TATC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:150290582_T_TA:150290582:0,2,0,1
chr6	150290586	.	AG	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=126,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	150290590	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=126,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	150341260	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,265;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	150341990	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=45.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0|1:150341990_A_G:150341990:0,0,11,0
chr6	150341993	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,6:0,2:0|1:150341990_A_G:150341990:0,0,11,0
chr6	150342317	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,168;MMQ=40,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:1,9,0,2
chr6	150385730	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=142.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,25:0,19:0,0,34,10
chr6	150387302	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,8:0,0:0|1:150387302_A_T:150387302:0,0,3,5
chr6	150387312	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,1:0|1:150387302_A_T:150387302:0,0,2,3
chr6	150390033	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.424:12:3,3:2,1:6,1,5,0
chr6	150464632	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:5,1:5,1:0|1:150464632_G_A:150464632:4,7,0,2
chr6	150464637	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,0:6,1:0|1:150464632_G_A:150464632:4,7,0,2
chr6	150535866	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:7,5:10,6:9,8,7,4
chr6	151055120	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:20,1:25,2:20,25,0,3
chr6	151116876	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,34;MFRL=197,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:0,0:1,0,3,0
chr6	151121760	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	151122094	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=238,201;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	151125724	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:1,8:0,8:1,0,15,2
chr6	151125896	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=100.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,16:0,16:0,0,5,27
chr6	151142261	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,4:3,5:6,1,9,0
chr6	151144807	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,1:14,2:16,11,2,1
chr6	151197152	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,5:2,7:4,1,11,1
chr6	151199071	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:1,7,0,4
chr6	151247439	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,5,14
chr6	151266504	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,19,0
chr6	151266717	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,4:5,4:0,9,0,8
chr6	151270127	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=152,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr6	151270369	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr6	151281567	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=84.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,9,14
chr6	151286224	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,4:5,4:2,8,0,9
chr6	151293277	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:0,6,0,4
chr6	151358011	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=167,179;MMQ=52,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:6,5:4,11:10,0,16,0
chr6	151358299	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=124.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,20:0,19:0,0,0,39
chr6	151358325	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=168,195;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.556:32:5,11:9,6:0,14,0,18
chr6	151362895	.	CTTG	C	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=87.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,24:0.417:58:15,10:17,14:21,13,15,9
chr6	151362942	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,23:0.407:57:21,5:13,18:20,14,14,9
chr6	151413717	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,2:8,9:5,8,2,9
chr6	151671339	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:9,1:6,11,1,1
chr6	151674116	.	T	TGAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=55.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,6:0,3:0,0,11,2
chr6	151742541	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=95.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,16:0,14:0,0,0,30
chr6	151743629	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,26:0.543:48:10,12:11,14:18,4,20,6
chr6	151754273	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=79.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.599:40:9,15:6,9:11,5,14,10
chr6	151779420	.	GAC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:8,1:3,1:10,1,1,1
chr6	151790160	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,2:17,0:0|1:151790160_G_A:151790160:10,20,2,0
chr6	151790165	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:13,2:17,0:0|1:151790160_G_A:151790160:10,21,2,0
chr6	151857370	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr6	151857594	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,7:2,5:5,1,5,7
chr6	151857680	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=199,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:151857680_G_A:151857680:0,4,0,1
chr6	151857682	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=199,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:151857680_G_A:151857680:0,4,0,1
chr6	151859146	.	G	GTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=208,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr6	151859314	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,11:0,18:0,0,14,17
chr6	151869725	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	151894278	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr6	151914421	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,3:2,5:0,7,1,7
chr6	151939181	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.940:31:1,17:0,11:1,0,15,15
chr6	151939350	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,4:0,2:0,3,1,5
chr6	152202007	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=180,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr6	152265282	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,4:11,1,9,0
chr6	152382089	.	TTTTA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTA;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:4,2:15,1,1,1
chr6	152415795	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=284,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
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chr6	152466582	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,9:0,0,11,7
chr6	152476952	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,18,1
chr6	152497500	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.428:42:9,9:15,8:17,7,15,3
chr6	152523143	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=198,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr6	152534946	.	TT	AA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,5:0,0,0,11
chr6	152560919	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=208,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:152560919_TG_CA:152560919:0,4,0,1
chr6	152560922	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=208,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:152560919_TG_CA:152560919:0,4,0,1
chr6	152629586	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=89.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,23,4
chr6	152629617	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=94.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,16:0,0,22,8
chr6	152629772	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.846:4:0,0:0,0:0,0,0,4
chr6	152629815	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	152638209	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	152640248	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	152646993	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr6	152647681	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,9,10
chr6	152653037	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	152658191	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr6	152660310	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=110,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr6	152668272	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.532:32:7,9:7,8:4,11,9,8
chr6	152671475	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:1,7:4,3:1,4,2,8
chr6	152671553	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=202,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr6	152671919	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.386:11:4,0:3,2:3,4,0,4
chr6	152671975	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=198,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr6	152673147	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,2:5,8:4,2,8,2
chr6	152673519	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:4,4:6,8:1,9,0,13
chr6	152673561	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=192,241;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:152673561_G_GA:152673561:0,4,0,1
chr6	152673565	.	TTTCA	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=192,241;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:152673561_G_GA:152673561:0,4,0,1
chr6	152673572	.	T	TGCTC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=191,241;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:152673561_G_GA:152673561:0,3,0,1
chr6	152673577	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=191,241;MMQ=60,40;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:152673561_G_GA:152673561:0,3,0,1
chr6	152679729	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:0,6,0,5
chr6	152688567	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr6	152690559	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:9,4:3,1:12,1,5,0
chr6	152697706	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:5,4:1,4:1,5,2,6
chr6	152712715	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,16;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.614:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr6	152786676	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152786676_G_A:152786676:0,0,0,1
chr6	152786679	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152786676_G_A:152786676:0,0,0,1
chr6	152793412	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,3:4,6:7,3,9,0
chr6	152809626	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=173,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr6	152847335	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:5,3:2,6:1,7,1,8
chr6	153311001	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,294;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	153316476	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=159,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:25,0:15,4:4,36,0,4
chr6	153332926	.	AATAAT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.440:14:2,1:5,5:0,8,0,6
chr6	153345309	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:4,1,2,0
chr6	154412004	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=282,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:0,4:1,0,4,0
chr6	154414375	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr6	154414573	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,10:0,0,4,18
chr6	154429085	.	AT	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.351:38:12,7:11,6:23,2,12,1
chr6	154429088	.	T	TTTTA	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=74.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.631:39:8,12:6,12:13,1,23,2
chr6	154429296	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=222,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.230:15:4,0:6,3:1,11,0,3
chr6	154431393	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,13,0
chr6	154521249	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	154567666	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0,0,17,2
chr6	154727408	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:0,2:7,4:7,0,6,0
chr6	154727825	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.602:17:3,5:1,5:2,5,1,9
chr6	154735973	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=199,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:1,1:1,7,1,3
chr6	154749225	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:5,8:10,7:14,1,9,6
chr6	154762376	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:154762376_CAAA_C:154762376:0,0,5,1
chr6	154762394	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,3:0,2:0|1:154762376_CAAA_C:154762376:0,0,5,2
chr6	154771192	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=150,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:20,3:15,1:31,5,4,0
chr6	154771449	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=113,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.654:7:0,2:2,2:0|1:154771449_T_C:154771449:0,2,1,4
chr6	154771461	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=198,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1|0:154771449_T_C:154771449:0,4,0,1
chr6	154771463	.	ATG	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=198,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1|0:154771449_T_C:154771449:0,4,0,1
chr6	154771467	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=198,226;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:2,1:1|0:154771449_T_C:154771449:0,4,0,1
chr6	155143561	.	GT	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.090:47:23,4:17,0:8,35,0,4
chr6	155148326	.	CC	GG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:14,1:12,0:3,26,2,0
chr6	155152311	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,0:0,9:0,0,0,9
chr6	155153865	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=133,219;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:9,5,1,1
chr6	155470190	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,5:0,0,18,0
chr6	155485535	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,8:0,0,15,2
chr6	155485554	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,17,5
chr6	155561564	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=33824447,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	155565089	.	TC	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=215,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:0,3:3,0,6,0
chr6	155565744	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,3:4,7:8,0,9,1
chr6	155566889	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0|1:155566889_G_GTT:155566889:0,0,0,2
chr6	155566907	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.723:2:0,1:0,1:0|1:155566889_G_GTT:155566889:0,0,0,2
chr6	155569378	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr6	155571113	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,10:0,6:0,0,5,11
chr6	155572986	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	155574198	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:0|1:155574198_C_T:155574198:0,6,1,5
chr6	155574207	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=185,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:0|1:155574198_C_T:155574198:0,5,1,5
chr6	155575546	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.440:25:8,2:6,8:2,12,5,6
chr6	155578324	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	155578340	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:155578340_A_AC:155578340:1,3,0,2
chr6	155578344	.	A	AAACAAAACACAC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,0:0|1:155578340_A_AC:155578340:0,4,0,2
chr6	155579246	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,1:5,6:0,6,0,7
chr6	155581619	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr6	155597686	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:1,2:0,3,0,3
chr6	155635585	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.484:42:10,9:9,11:5,17,4,16
chr6	155635624	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=183,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.494:32:8,6:8,8:1,15,0,16
chr6	155635637	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:5,6:8,9:1,12,0,15
chr6	155750219	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,1,9
chr6	155774645	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:13,2:3,22,0,2
chr6	157099312	.	GCAC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAC;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	157405761	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr6	157495951	.	ATT	A,AT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,30,30;MFRL=136,200,147;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.65,20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,12:0.094,0.347:35:10,2,5:8,1,7:18,2,14,1
chr6	157517383	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:30,3:21,0:27,25,2,1
chr6	157744588	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.562:39:6,11:11,11:2,15,2,20
chr6	158013725	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr6	158014255	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,3:3,3:0,8,0,6
chr6	158049365	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=16,10;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:2,0:0,0:4,1,8,0
chr6	158066690	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=193,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:3,0,5,0
chr6	158068481	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr6	158074504	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr6	158093661	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:158093661_A_C:158093661:0,0,4,0
chr6	158093665	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:158093661_A_C:158093661:0,0,4,0
chr6	158093670	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0|1:158093661_A_C:158093661:0,0,4,0
chr6	158093673	.	CGTG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:158093661_A_C:158093661:0,0,4,0
chr6	158322886	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=143,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:6,2:1,1:0|1:158322886_CT_C:158322886:9,0,4,0
chr6	158322911	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,19;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.158:17:1,0:7,0:1|0:158322886_CT_C:158322886:10,5,2,0
chr6	158330884	.	TTCTTCATTTTCTAGAGTTGGCATTGGTAACCTTTTC	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=187,199;MMQ=60,52;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:2,2:11,0:24,5,0,2
chr6	158348331	.	C	CTCCCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=210,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	158361899	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,16,4
chr6	158403171	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	158438933	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:1,3:4,4:0,6,0,7
chr6	158484922	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,7:5,4:5,6,4,7
chr6	158486110	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:0,2,0,3
chr6	158489863	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:5,2:1,7:0,7,0,10
chr6	158492839	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:6,2:1,15,0,2
chr6	158499097	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr6	158499413	.	C	CCAAGTCCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.337:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr6	158502137	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=94.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,12:0,17:0,0,18,11
chr6	158502590	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,1,17
chr6	158504981	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,14,1
chr6	158517451	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	158532604	.	GGCC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:158532604_GGCC_G:158532604:0,2,0,1
chr6	158532614	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=160,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:158532604_GGCC_G:158532604:0,2,0,1
chr6	158535720	.	T	TTATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=96,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA;STR;TLOD=90.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.916:22:1,2:0,8:1,0,8,13
chr6	158541618	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:1,5:7,6:2,6,0,11
chr6	158549339	.	G	GCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=168,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,2:4,0:0|1:158549339_G_GCC:158549339:2,7,1,1
chr6	158549341	.	A	AATCTTTCTTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=171,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,2:5,0:0|1:158549339_G_GCC:158549339:2,8,1,1
chr6	158571655	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr6	158571706	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr6	158870278	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=198,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr6	158882652	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=169,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:16,2:23,1:20,19,1,2
chr6	158910543	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	158925267	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,3:6,5:0,9,0,8
chr6	158994577	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,3,20
chr6	159028203	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr6	159029342	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.437:32:8,8:9,5:9,9,7,7
chr6	159029868	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=81,172;MMQ=50,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:0,6:2,2:0,2,0,8
chr6	159046076	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,9:0,0,12,6
chr6	159052471	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr6	159058589	.	ACCT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:3,8:10,5:8,6,5,8
chr6	159146698	.	GT	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.083:33:16,2:11,0:2,29,0,2
chr6	159166486	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=236,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr6	159178345	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:5,8:5,4:11,1,9,4
chr6	159185427	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	159187877	.	GAC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=92.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,9:0,12:0,0,21,0
chr6	159188128	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,5,25
chr6	159188282	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=185,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,7:6,3:6,4,8,2
chr6	159191788	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=116.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,21:0,17:0,0,26,13
chr6	159192214	.	T	TGG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=76.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,10:0,0,16,2
chr6	159197371	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr6	159204786	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr6	159205632	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=128.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,24:0,18:0,0,42,2
chr6	159205668	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=193.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,31:0,24:0,0,43,13
chr6	159206251	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0,0,11,0
chr6	159316430	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr6	159415064	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=244,255;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	159456868	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,2:9,1:17,1,3,0
chr6	159647669	.	T	TCTGATCATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=209,270;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr6	159653533	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:0,14,0,2
chr6	159653544	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:5,6:1,4:0,7,0,10
chr6	159655084	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=230,157;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.931:27:0,10:1,15:1,0,13,13
chr6	159655102	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=116.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,13:0,20:0,0,14,19
chr6	159655481	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:23,0:25,3:17,31,0,3
chr6	159655593	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	159657195	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	159659523	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	159660779	.	GCCACCACCCGCCGCACGA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCACCACCCGCCGCACGA;STR;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.898:7:0,3:0,3:0,0,4,3
chr6	159660879	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr6	159670276	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr6	159670303	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr6	159677498	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,6,6
chr6	159682206	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,11,3
chr6	159692321	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,13:0,6:0,0,14,5
chr6	159692559	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,7:0,0,1,15
chr6	160106088	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=168,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.428:21:3,4:9,4:0,12,0,9
chr6	160106125	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:0,9,1,4
chr6	160114360	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=11,29;MFRL=220,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:0,1:0,1,0,3
chr6	160157277	.	CT	C,CTT	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=128,144,114;MMQ=60,60,60;MPOS=27,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=4.35,6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:54,4,7:0.069,0.104:65:25,2,3:29,2,4:44,10,10,1
chr6	160164677	.	AT	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.083:58:25,1:27,3:43,11,3,1
chr6	160174456	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.446:27:9,5:4,5:13,2,10,2
chr6	160198508	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,202134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,0:13,2:6,17,2,0
chr6	160199687	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.421:34:7,5:11,9:14,6,9,5
chr6	160201677	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:4,2:1,3:0,6,0,5
chr6	160202167	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,4:7,8:0,13,0,12
chr6	160205012	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=159,112;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:21,2:20,0:17,25,2,0
chr6	160205625	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:3,0:8,1,2,0
chr6	160207049	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:2,7,0,7
chr6	160210418	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,13:0.267:46:9,1:13,2:25,8,13,0
chr6	160211554	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.539:37:10,10:7,10:16,1,19,1
chr6	160211636	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,32:0.445:72:21,18:17,13:19,21,14,18
chr6	160211645	.	GGTT	G	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=99.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,29:0.411:71:23,14:16,15:15,27,8,21
chr6	160211728	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.298:25:7,6:10,1:0,18,0,7
chr6	160218605	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=188,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr6	160221475	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:0,3,2,5
chr6	160221690	.	GCTT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,2:5,5:6,0,6,1
chr6	160224203	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,2:2,2:8,1,4,0
chr6	160224427	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0|1:160224427_C_CA:160224427:0,5,0,1
chr6	160224438	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=198,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:160224427_C_CA:160224427:0,4,0,1
chr6	160224440	.	C	CCACCACAGCCCACTCAAGACCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=172,250;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr6	160225559	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,5:5,7:9,1,7,5
chr6	160229889	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.457:42:14,11:8,8:4,19,4,15
chr6	160232921	.	GTTTTGT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=234,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:0,6,0,4
chr6	160234796	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:2,4:6,5:0,8,0,9
chr6	160236976	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr6	160237489	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	160237662	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.666:5:2,1:0,1:1,1,1,2
chr6	160239712	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,3,11
chr6	160430199	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:4,4:5,0:1,10,0,4
chr6	160465486	.	TTGTC	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.434:28:5,6:9,6:16,0,11,1
chr6	160465753	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=213,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:0,7,0,4
chr6	160468383	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	160479882	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:7,2:2,3:9,1,5,1
chr6	160481537	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:6,5:6,8:9,3,9,4
chr6	160489215	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:5,2,4,1
chr6	160495055	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=166,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,0:1,3:1,5,2,1
chr6	160509083	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,2:2,0:6,7,0,2
chr6	160523584	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,7:0.126:61:24,7:30,0:25,29,3,4
chr6	160524671	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=213,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr6	160553238	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:5,3:6,2:9,3,4,1
chr6	160557569	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.453:20:7,3:4,6:6,5,7,2
chr6	160560897	.	CTGGTAAGT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGTAAGT;STR;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.402:13:2,1:5,3:1,7,1,4
chr6	160560933	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:1,3,0,4
chr6	160663230	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=198,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr6	160670494	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=202,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr6	160671500	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr6	160829732	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:10,0,2,0
chr6	160857808	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.384:14:2,3:2,1:8,1,5,0
chr6	160863999	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	160868654	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:3,2:5,3:7,2,4,1
chr6	160868668	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:5,1,4,1
chr6	160868687	.	GC	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,5:6,3:7,2,8,1
chr6	160868701	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:6,4:3,7:9,1,8,3
chr6	160872151	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:4,5:1,4,0,6
chr6	160961299	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:1,6,0,2
chr6	160969738	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,2:2,9:0,5,1,10
chr6	160998148	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:14,9:7,5:18,3,12,2
chr6	160999786	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=184,216;MMQ=52,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:4,0:9,4:0,13,0,4
chr6	160999837	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=206,117;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:0,5,3,0
chr6	161007496	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:4,5:9,3:11,2,7,1
chr6	161007538	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:5,3:8,5:12,2,8,0
chr6	161010554	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:1,1:6,3:6,1,2,2
chr6	161010766	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.503:28:7,6:6,8:1,13,4,10
chr6	161021873	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr6	161026218	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=47,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:2,7,0,2
chr6	161139480	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,7:0,13:0,0,8,13
chr6	161139502	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,5,14
chr6	161160050	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=152,199;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:12,2,2,0
chr6	161160083	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=160,176;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.429:21:7,4:5,4:11,1,7,2
chr6	161162290	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,4:4,6:7,0,8,2
chr6	161502094	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,5,15
chr6	161509003	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr6	161519350	.	CCTGCTG	C,CCTG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,136,162;MMQ=60,60,60;MPOS=30,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=CTG;STR;TLOD=9.19,69.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,18:0.165,0.800:21:0,3,9:0,0,9:0,0,8,13
chr6	161531006	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,0,17
chr6	161532855	.	CT	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=135.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,23:0,20:0,0,29,15
chr6	161557703	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr6	161565305	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:0,6,2,2
chr6	161565398	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=221,265;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	161586754	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=140,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,0:3,0:1,5,1,2
chr6	161990339	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr6	161990483	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:3,3:0,2:2,1,1,4
chr6	161990516	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr6	162475207	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:8,1:4,15,0,2
chr6	162622304	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr6	162683876	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr6	162864317	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:6,1,6,0
chr6	163149497	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	163235167	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=163,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.442:11:2,5:4,0:4,2,5,0
chr6	163836376	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,2,12
chr6	163876552	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=226,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr6	163899807	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=162,312;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.105:27:6,0:6,0:16,9,2,0
chr6	165693624	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	165703633	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr6	165711540	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:2,1:11,1:8,5,2,0
chr6	165715646	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:7,9,2,0
chr6	165792881	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=184,215;MMQ=60,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,0:7,3:0,13,0,3
chr6	165808630	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,10:0.314:33:14,6:8,4:0|1:165808630_A_C:165808630:19,4,8,2
chr6	165808634	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,12:0.342:36:15,7:9,5:0|1:165808630_A_C:165808630:20,4,10,2
chr6	165827194	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:6,6:11,2:4,13,1,7
chr6	165845069	.	CTATA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=202,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=TA;STR;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,1:7,4:0,8,0,6
chr6	165846658	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:2,7:5,6:0,7,1,12
chr6	165863695	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,3:0,0,10,1
chr6	165989776	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	166075362	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr6	166574246	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:2,4:0,2:2,0,7,0
chr6	166579270	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,3:5,1:3,8,1,3
chr6	166579273	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=155,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:3,9,0,2
chr6	166721424	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=158,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,2:1,2:2,0,5,0
chr6	166736235	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=192,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:2,5:1,0:4,0,6,0
chr6	166737980	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=83.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,29:0.638:45:9,10:7,18:14,2,23,6
chr6	166739663	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=160,50;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:19,4:31,0:21,31,0,4
chr6	166739684	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.459:50:11,11:16,11:9,18,7,16
chr6	166743160	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.701:28:4,11:4,9:0,8,0,20
chr6	166796433	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr6	166827436	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,2:6,2:1,7,1,3
chr6	166844138	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,1:2,4:0,7,0,5
chr6	166862136	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	166862431	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=205,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr6	166889160	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	166889331	.	CAG	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=100.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,11:0,0,2,21
chr6	166922813	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,1:6,9:5,4,9,1
chr6	167275624	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,50;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:16,0:8,2:12,12,1,1
chr6	167352560	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=225,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:167352560_G_A:167352560:0,1,0,1
chr6	167352564	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=225,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:167352560_G_A:167352560:0,1,0,1
chr6	167352573	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=225,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:167352560_G_A:167352560:0,1,0,1
chr6	167365862	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:6,5:7,10:13,0,16,0
chr6	167436159	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.698:13:0,3:2,5:0,4,0,9
chr6	167440128	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,5:2,2:2,5,0,7
chr6	167453519	.	A	AT,ATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27,27;MFRL=162,158,167;MMQ=60,60,60;MPOS=17,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=11.76,7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,4:0.471,0.333:12:1,1,2:1,4,2:0,2,0,10
chr6	167549477	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr6	167587493	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,155;MMQ=55,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,13:0.202:67:32,3:22,10:6,48,1,12
chr6	167590454	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=158,138;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.467:17:4,4:4,2:5,4,8,0
chr6	167591956	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,142;MMQ=27,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.349:41:12,5:14,9:22,5,11,3
chr6	167592464	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr6	167592656	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr6	167704944	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr6	167709667	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,147;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:11,0:20,3:12,20,0,3
chr6	167711418	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr6	167721253	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr6	167738538	.	TT	GG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr6	167754184	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,254;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:10,11,2,0
chr6	167772761	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:6,9:2,4:8,0,13,0
chr6	167789615	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,177;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr6	167796182	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.711:11:1,5:1,3:3,0,8,0
chr6	167796415	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,5,17
chr6	168227080	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.520:4:1,0:0,2:0,2,0,2
chr6	168272817	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:2,6:5,3:8,0,9,0
chr6	168298875	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.542:46:11,10:10,15:13,8,15,10
chr6	168314997	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:0,7,2,5
chr6	168315045	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:8,2:0,11,0,2
chr6	168316118	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,5:5,7:2,7,2,10
chr6	168317994	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,1,4
chr6	168319356	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=193,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:10,1,1,1
chr6	168323664	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.665:22:4,7:3,7:2,5,2,13
chr6	168325673	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:5,6:5,7:9,1,10,3
chr6	168347682	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=195,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,0:3,3:0,10,0,3
chr6	168348504	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr6	168366717	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:168366717_G_T:168366717:0,1,1,0
chr6	168366720	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:168366717_G_T:168366717:0,2,1,0
chr6	168434794	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr6	168439454	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:8,5:2,10:1,9,1,14
chr6	168440826	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,4:2,3:3,5,2,5
chr6	168442629	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.519:40:7,11:12,8:15,4,12,9
chr6	168443190	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr6	168445769	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	168457729	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=181,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	168462744	.	ATGGCCC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:168462744_ATGGCCC_A:168462744:0,1,0,1
chr6	168462751	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:168462744_ATGGCCC_A:168462744:0,1,0,1
chr6	168466504	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr6	168466661	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=175,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:3,3,0,2
chr6	168468186	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,5,13
chr6	168475822	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr6	168479790	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	168708045	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr6	168711170	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:7,6:3,3:1,10,0,10
chr6	168927213	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=237,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr6	168928225	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr6	168928251	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,7:2,1:6,0,6,2
chr6	169008945	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=95.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,34:0.584:58:15,15:9,19:6,18,6,28
chr6	169051326	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr6	169617840	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.502:46:11,12:11,11:15,8,19,4
chr6	169617934	.	GA	G	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=161.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,29:0,30:0,0,36,25
chr6	169620247	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr6	169620450	.	AAAG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAG;STR;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,5:5,1:1,9,0,6
chr6	169622638	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:0,9,0,5
chr6	169626244	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=210,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,5:3,3:5,1,5,3
chr6	169628169	.	CAA	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=125,156;MMQ=37,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:0,1:0,1:3,1,2,2
chr6	169628176	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=163,125;MMQ=60,37;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,3:3,0:5,4,3,0
chr6	169628204	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,2:9,0:17,8,0,2
chr6	169629783	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,3,12
chr6	169631994	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr6	169632305	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:3,2:0,5,1,3
chr6	169632728	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,5:6,3:8,2,7,1
chr6	169634809	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:11,8:8,5:15,4,12,1
chr6	169635010	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.339:10:3,2:3,1:2,5,0,3
chr6	169635020	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,18;MFRL=122,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:1,0:1,3,0,2
chr6	169637456	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=160,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr6	169637469	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:0,5,0,4
chr6	169637519	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=206,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr6	169637701	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=153,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:8,1,3,1
chr6	169637911	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,1,3
chr6	169637929	.	C	CCTCTAGGTTGGCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr6	169646409	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.408:12:4,1:3,2:2,5,0,5
chr6	170089170	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	170103880	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,26:0.464:56:20,14:10,11:10,20,11,15
chr6	170112526	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.049:77:39,2:32,1:41,33,1,2
chr6	170115957	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:19,3:11,0:18,12,2,1
chr6	170118085	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,0,23
chr6	170592293	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:1,2,1,4
chr6	170592912	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,1,1
chr6	170594819	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr6	170595430	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr6	170597276	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.628:17:3,7:3,3:5,1,10,1
chr6	170846520	.	C	CTTCCTCTAGGATACAATACTTCTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=211,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr6	170858045	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,0:7,6:9,4,5,1
chr6	170880430	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=177,204;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:13,3:8,0:17,4,3,0
chr6	170892100	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=189,185;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,3:2,5:4,1,8,0
chr6	170892848	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=159,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,5:1,2:0,6,1,6
chr6	170892919	.	T	TACTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=128,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr6	170893364	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr7	197535	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr7	538277	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,15:0.640:23:6,8:1,7:0|1:538277_G_C:538277:2,6,3,12
chr7	538284	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,14:0.652:21:4,8:1,5:0|1:538277_G_C:538277:1,6,2,12
chr7	540741	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:6,3,4,1
chr7	551946	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr7	590007	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr7	590148	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:3,6:5,3:5,4,1,9
chr7	590199	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:1,6,0,3
chr7	591125	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr7	618855	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr7	618869	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr7	716832	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,4:8,0:8,4,4,0
chr7	731075	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr7	766420	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	780459	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:11,2:2,0:5,8,2,0
chr7	780980	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,2:4,6:4,1,7,1
chr7	790462	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=51,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,7:4,3:10,0,9,2
chr7	790473	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=101,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:6,7:3,2:8,1,7,3
chr7	794471	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,7,10
chr7	796353	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr7	810064	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,4,0
chr7	813618	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=167,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,3:0,2:4,0,4,1
chr7	825114	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,26:0.677:38:8,17:4,9:11,1,23,3
chr7	878431	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:7,5:2,5:6,3,10,1
chr7	881795	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:10,1:0,19,0,2
chr7	882829	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,37;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.463:13:3,4:4,2:5,2,6,0
chr7	890978	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=204,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:3,2:5,3:7,2,5,0
chr7	891100	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.437:32:8,5:10,8:6,12,4,10
chr7	891184	.	C	CGAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:4,2:3,3:0,7,0,5
chr7	891496	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,4:4,2:8,0,7,0
chr7	899710	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,1:3,1:4,0,3,0
chr7	905786	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:0,2:4,3:0,4,0,6
chr7	909048	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,7:5,6:6,3,13,0
chr7	909251	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=179,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	912755	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,181;MMQ=56,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr7	923855	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.313:26:7,2:11,5:8,10,6,2
chr7	924061	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:3,7:6,4:1,8,4,8
chr7	925796	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,2:0,5:1,1,1,6
chr7	926663	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=124,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr7	926827	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,3,3
chr7	932053	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=198,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.711:19:1,7:4,5:1,4,9,5
chr7	933292	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=124,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:1,1:4,2:5,1,3,1
chr7	940258	.	G	GGGCAAAGGCA	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,13:0.496:26:6,3:6,6:0|1:940258_G_GGGCAAAGGCA:940258:5,8,5,8
chr7	940267	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,12:0.438:28:7,4:6,6:0|1:940258_G_GGGCAAAGGCA:940258:5,11,5,7
chr7	940298	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.330:25:8,3:6,4:3,14,1,7
chr7	940501	.	AGAAGGGCC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGGGCC;STR;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,3:0,2:1,0,5,0
chr7	940724	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr7	943711	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr7	943998	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.906:9:0,2:0,2:0,0,0,9
chr7	944683	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,3:0,0,6,0
chr7	1023995	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:1023995_A_AG:1023995:1,0,2,0
chr7	1024002	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,32;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:0,1:0,1:0|1:1023995_A_AG:1023995:1,0,2,0
chr7	1026713	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=117,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:1026713_T_C:1026713:2,0,1,0
chr7	1026720	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=117,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:1026713_T_C:1026713:2,0,1,0
chr7	1131356	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.442:39:10,8:9,8:14,8,10,7
chr7	1276224	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,5125762;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	1474342	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr7	1474414	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=256,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr7	1476520	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	1476572	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	1477113	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	1477322	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=9,28;MFRL=180,276;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:0,2:0,0:0,1,1,1
chr7	1479764	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=260,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr7	1482101	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.572:14:3,2:2,5:1,5,4,4
chr7	1482134	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr7	1486451	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:1,5,0,4
chr7	1510514	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,2:5,0:12,5,0,2
chr7	1510946	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=211,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1510946_G_T:1510946:0,1,0,1
chr7	1510948	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=211,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1510946_G_T:1510946:0,1,0,1
chr7	1517639	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=194,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	1517971	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:7,7:7,6:14,0,12,1
chr7	1519361	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	1519892	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=202,236;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr7	1519946	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:2,2:6,3:8,1,5,0
chr7	1522157	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr7	1522175	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr7	1523734	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=170,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr7	1523804	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=153,82;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,1,1
chr7	1526181	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=189,183;MMQ=57,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:4,0,5,0
chr7	1527687	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr7	1528947	.	T	TCCCGGGCCCGCCGAGGGGACGTGCGCACTCACTTCAGGCCCTGCTCCCAGC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.956:23:2,3:0,3:3,0,17,3
chr7	1529201	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,4:3,6:4,3,7,3
chr7	1532631	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.352:18:6,2:5,4:11,1,5,1
chr7	1533556	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.571:21:2,5:3,7:0|1:1533556_T_C:1533556:4,5,3,9
chr7	1533566	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:0|1:1533556_T_C:1533556:3,6,2,7
chr7	1534425	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.343:7:2,1:1,1:5,0,1,1
chr7	1535051	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=144,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr7	1538432	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:10,3,1,1
chr7	1538539	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr7	1538595	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0|1:1538595_C_A:1538595:1,1,2,1
chr7	1538614	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0|1:1538595_C_A:1538595:1,0,4,1
chr7	1539799	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.451:11:3,1:3,3:5,1,5,0
chr7	1542490	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:5,7:14,11:12,7,16,2
chr7	1543435	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.645:29:6,11:4,8:9,1,19,0
chr7	1586653	.	A	AGCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GCC;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,0:0|1:1586653_A_AGCC:1586653:0,0,3,0
chr7	1586662	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:1586653_A_AGCC:1586653:0,0,3,0
chr7	1586866	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	1588391	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,0,16
chr7	1589083	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr7	1589165	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=183,90;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:10,3,2,0
chr7	1589417	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,5:0,0,15,2
chr7	1590368	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:1590368_A_G:1590368:0,0,1,0
chr7	1590376	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:1590368_A_G:1590368:0,0,2,0
chr7	1590443	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr7	1787519	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27,25;MFRL=0,152,139;MMQ=60,60,60;MPOS=23,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,18;RU=A;STR;TLOD=11.31,4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,4:0.573,0.357:10:0,3,3:0,3,0:0,0,8,2
chr7	1787574	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=115,124;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=139.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.957:44:0,24:1,18:0,1,17,26
chr7	1886805	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr7	1886865	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=181,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.405:10:5,1:0,1:0|1:1886865_C_A:1886865:5,1,3,1
chr7	1886872	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.390:13:5,2:3,2:0|1:1886865_C_A:1886865:7,1,4,1
chr7	1976556	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,0,3
chr7	2041638	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=177,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:4,2,3,0
chr7	2054314	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=248,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	2258899	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=175,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	2258942	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,0:0|1:2258942_G_C:2258942:0,0,4,0
chr7	2258948	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,19;MFRL=202,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:0,1:0|1:2258942_G_C:2258942:1,0,4,0
chr7	2258950	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=202,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,0:0,1:0|1:2258942_G_C:2258942:1,0,4,0
chr7	2258954	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=23,13;MFRL=202,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,0:0,0:0|1:2258942_G_C:2258942:1,0,4,0
chr7	2279310	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,2:10,1:8,9,1,2
chr7	2289658	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:4,7,1,1
chr7	2290372	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=162,194;MMQ=41,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,3:1,0:2,0,4,0
chr7	2290382	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=170,148;MMQ=42,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr7	2290384	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=181,124;MMQ=51,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr7	2296493	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:2,4:6,5:6,2,6,4
chr7	2349366	.	CA	C,CAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=146,177,172;MMQ=60,60,60;MPOS=21,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=6.56,3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,5,3:0.196,0.149:24:9,1,2:7,4,1:11,5,6,2
chr7	2349608	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:0,5,0,7
chr7	2406734	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,11;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.444:11:2,0:4,0:0|1:2406734_T_A:2406734:5,1,1,4
chr7	2406737	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=18,33;MFRL=117,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.787:7:0,0:0,5:0|1:2406734_T_A:2406734:0,1,2,4
chr7	2409035	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,17,0
chr7	2412493	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,0:0,3:0,0,0,5
chr7	2414142	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=43.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,7:0,0,14,1
chr7	2473747	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.361:12:1,1:6,3:0|1:2473747_A_G:2473747:1,7,0,4
chr7	2473761	.	T	TCGCCCGCC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=16,29;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=CGCC;STR;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:1,3:2,3:0|1:2473747_A_G:2473747:0,7,3,5
chr7	2473804	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:2,6,3,2
chr7	2473834	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,3:6,1:4,2,0,4
chr7	2474205	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=224,156;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:2474205_TG_CA:2474205:0,2,0,2
chr7	2474220	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,11;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:2474205_TG_CA:2474205:0,0,0,1
chr7	2474222	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2474205_TG_CA:2474205:0,0,0,1
chr7	2552459	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=180,164;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:0,15,0,2
chr7	2552881	.	A	AGATG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GATG;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.489:6:1,1:2,1:2,1,2,1
chr7	2552986	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=130,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:10,6:2,4:2,10,1,9
chr7	2564849	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.423:22:5,4:6,5:11,2,9,0
chr7	2565268	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,9,8
chr7	2583602	.	T	TGGAGTACAATGGTGCGATCTCAGTTCACTGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=14216666,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,0,1
chr7	2611241	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=170,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr7	2613008	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,4:4,2:8,2,5,1
chr7	2613042	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,4:9,4:9,5,7,1
chr7	2621567	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=183,195;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:5,0,9,0
chr7	2626038	.	CCAGGGAATGG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAGGGAATGG;STR;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.505:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr7	2627521	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:2,9,1,1
chr7	2638347	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=188,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,0:1,5:0,4,0,5
chr7	2640985	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=37,31;MFRL=240,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,1:1,0,2,2
chr7	2641059	.	C	CT,CTT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,32,26;MFRL=143,165,55;MMQ=60,60,60;MPOS=26,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=6.77,4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,2:0.296,0.174:15:6,2,1:3,2,1:9,0,4,2
chr7	2649673	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,8:7,2:11,3,8,2
chr7	2649704	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:10,8:8,1:15,4,7,2
chr7	2649819	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.263:20:8,3:6,1:2,13,1,4
chr7	2686761	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr7	2689472	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=185,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:7,0,5,0
chr7	2691736	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	2697881	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:5,3:1,3:4,2,5,2
chr7	2699687	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=49.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,6:0,8:0,0,8,6
chr7	2740015	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2740015_T_G:2740015:0,0,0,1
chr7	2740018	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,0;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:2740015_T_G:2740015:0,0,0,1
chr7	2748903	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=253,178;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2748903_A_G:2748903:0,1,0,1
chr7	2748905	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=253,178;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2748903_A_G:2748903:0,1,0,1
chr7	2748911	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=253,178;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2748903_A_G:2748903:0,1,0,1
chr7	2752395	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:3,3:2,6:3,3,8,1
chr7	2771449	.	AA	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	2773035	.	C	CAT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.718:23:2,10:4,5:6,0,15,2
chr7	2834833	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=202,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr7	2834869	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=208,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr7	2946552	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=223,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr7	2954801	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr7	2962753	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.858:5:0,2:0,0:0,0,3,2
chr7	2966419	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,0:10,4:16,7,2,2
chr7	2966445	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.353:21:7,5:5,2:7,7,2,5
chr7	2968361	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=215,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,2:0,1:0,3,0,3
chr7	3179764	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:3,1,5,0
chr7	3179968	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,1:0,10:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,3,8
chr7	3179973	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,0:0,9:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,3,7
chr7	3179991	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr7	3180657	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0,0,10,8
chr7	4119285	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:3,3:10,8:0,14,0,11
chr7	4150203	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=197,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,4:0,3:3,0,7,0
chr7	4150312	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:10,4:4,4:10,4,3,6
chr7	4152863	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=204,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr7	4166959	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:3,1:9,3:12,0,4,0
chr7	4185592	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,2,16
chr7	4185636	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,5:6,3:0,8,0,8
chr7	4189123	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	4213877	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=27,33;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:4,6,6,1
chr7	4213940	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=33,27;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,3:5,7:1,4,4,6
chr7	4213969	.	CTTT	C	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=34,20;MFRL=156,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:4,0:9,2:0|1:4213969_CTTT_C:4213969:5,8,2,1
chr7	4213973	.	ACATGCTGAGCTCAC	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=28,20;MFRL=162,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:3,0:7,3:0|1:4213969_CTTT_C:4213969:5,11,2,1
chr7	4213975	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,3:0,9:0,0,5,7
chr7	4213992	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=161,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:3,0:9,1:0|1:4213969_CTTT_C:4213969:4,10,2,1
chr7	4213993	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=161,64;MMQ=60,58;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:9,1:0|1:4213969_CTTT_C:4213969:4,10,1,1
chr7	4214046	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr7	4215498	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:0,1:2,2:0,2,0,4
chr7	4259708	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,20,4
chr7	4259953	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr7	4259985	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=209,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:4259985_C_CA:4259985:1,2,0,1
chr7	4259988	.	G	GCCCTTTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=209,210;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0|1:4259985_C_CA:4259985:1,2,0,1
chr7	4259989	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr7	4266898	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	4304727	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	4308205	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:4308205_T_A:4308205:2,0,4,0
chr7	4308215	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.570:7:0,1:2,1:0|1:4308205_T_A:4308205:2,1,4,0
chr7	4308220	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=189,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:0,1:2,1:2,2,2,0
chr7	4946973	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr7	4959789	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,2:0,3:0|1:4959789_G_A:4959789:0,0,5,2
chr7	4959807	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0|1:4959789_G_A:4959789:0,0,6,4
chr7	4965023	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=17,12;MFRL=205,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:4965023_A_C:4965023:1,0,1,0
chr7	4965030	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=185,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:4965023_A_C:4965023:2,0,1,0
chr7	4965032	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,19;MFRL=185,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:4965023_A_C:4965023:2,0,1,0
chr7	4998564	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,12;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:0,0:2,0:0|1:4998564_T_C:4998564:3,3,2,0
chr7	4998568	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=23,13;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:2,0:2,0:0|1:4998564_T_C:4998564:3,3,2,0
chr7	4998570	.	C	CCAA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,1:0|1:4998564_T_C:4998564:3,3,2,0
chr7	4998572	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,12;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,0:1,0:0|1:4998564_T_C:4998564:3,3,2,0
chr7	4998578	.	CGGA	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,0;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,0:3,0:0|1:4998564_T_C:4998564:4,3,2,0
chr7	5026128	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=195,235;MMQ=27,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr7	5026170	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=287,175;MMQ=37,27;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.764:11:1,3:1,6:2,0,9,0
chr7	5026171	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=162,190;MMQ=21,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.852:10:1,3:1,5:2,0,8,0
chr7	5096958	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=144,137;MMQ=53,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,25:0.447:56:17,10:14,14:22,9,18,7
chr7	5104211	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=148,807;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:5,10,0,3
chr7	5232881	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,12:0,14:0,0,0,26
chr7	5239319	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:0,1:3,1:0,3,0,3
chr7	5239396	.	C	CCCACCCCCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=95,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr7	5256185	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,7:7,2:5,7,7,2
chr7	5257490	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=124.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,17:0,0,29,7
chr7	5262385	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.505:14:3,2:3,5:0,7,1,6
chr7	5269424	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr7	5270631	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.588:20:5,5:3,6:0,8,0,12
chr7	5327680	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=142,166;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=120.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.947:35:0,13:1,21:0,1,0,34
chr7	5331307	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=12,35;MFRL=158,186;MMQ=50,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.713:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr7	5334469	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=109.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,12:0|1:5334469_G_T:5334469:0,0,25,2
chr7	5334472	.	C	CCT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=202,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=74.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,21:0.920:22:1,9:0,10:0|1:5334469_G_T:5334469:1,0,18,3
chr7	5334636	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:0,14:1,8:0,1,0,28
chr7	5342413	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,14:0,0,13,13
chr7	5363803	.	CCAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=229,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr7	5364943	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	5369522	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,1:5,4:9,4,4,1
chr7	5396955	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr7	5415874	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5415874_T_C:5415874:0,0,0,1
chr7	5415877	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5415874_T_C:5415874:0,0,0,1
chr7	5416941	.	G	GCCCCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,37;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,6;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5416941_G_GCCCCC:5416941:0,0,1,0
chr7	5416943	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:5416941_G_GCCCCC:5416941:0,0,1,0
chr7	5416953	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:5416941_G_GCCCCC:5416941:1,3,1,0
chr7	5416957	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:5416941_G_GCCCCC:5416941:1,3,1,0
chr7	5433997	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:8,0,7,0
chr7	5530782	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,1:6,2:6,0,3,0
chr7	5545355	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	5567277	.	C	A	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=152,148;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,23:0.305:73:12,1:19,6:43,7,23,0
chr7	5567282	.	C	A	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=152,148;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,27:0.314:82:14,3:21,10:48,7,27,0
chr7	5567596	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,26:0.443:59:17,15:16,11:22,11,21,5
chr7	5568366	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=77.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.596:40:11,13:5,11:0,16,2,22
chr7	5569327	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=182,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:7,7:6,4:6,7,8,3
chr7	5642987	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:0,4:4,4:1,3,5,3
chr7	5800769	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	5922056	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=210,192;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:7,0,4,0
chr7	5922100	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=149,81;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:6,2:2,2:6,2,4,0
chr7	5940581	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=236,227;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr7	5942269	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,213;MMQ=39,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.227:42:18,4:15,5:24,9,5,4
chr7	5949830	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=171,171;MMQ=53,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:0,8,0,5
chr7	5958650	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,179;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:5,6:3,6:1,7,1,11
chr7	5968086	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,174;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:0,5,1,5
chr7	5983195	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	6000544	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=144,128;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:6000544_G_T:6000544:2,2,0,1
chr7	6000551	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=109,128;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:6000544_G_T:6000544:1,1,0,1
chr7	6000552	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=109,128;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:6000544_G_T:6000544:1,1,0,1
chr7	6000556	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=109,128;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:6000544_G_T:6000544:1,1,0,1
chr7	6004123	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=259,246;MMQ=27,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6004123_T_C:6004123:0,1,0,1
chr7	6004130	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=259,246;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6004123_T_C:6004123:0,1,0,1
chr7	6004135	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=259,246;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6004123_T_C:6004123:0,1,0,1
chr7	6004138	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=259,246;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6004123_T_C:6004123:0,1,0,1
chr7	6036895	.	TA	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:16,3:18,0:32,4,2,1
chr7	6037057	.	GAA	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=14,16;MFRL=140,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.343:21:3,0:2,2:4,10,1,6
chr7	6038722	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,2:2,0:7,1,1,1
chr7	6048556	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,29:0.452:64:14,13:20,14:25,10,19,10
chr7	6048973	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,31:0.476:64:20,11:13,14:18,15,23,8
chr7	6054987	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.428:47:16,9:11,11:12,15,8,12
chr7	6055084	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:0,8,0,5
chr7	6057777	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,186;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr7	6064330	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:10,0:22,3:20,14,3,0
chr7	6064470	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=167,165;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.685:4:0,0:1,1:0,1,0,3
chr7	6064519	.	G	GCCTCAAACTCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=137,165;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	6066005	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:5,0,3,3
chr7	6066057	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:9,5:6,6:8,7,5,6
chr7	6071277	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	6072458	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:8,2:15,6,2,0
chr7	6075948	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,1:0,7,0,2
chr7	6078376	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:1,0,0,5
chr7	6080853	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=15,16;MFRL=180,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.592:8:0,2:0,0:0,3,1,4
chr7	6084310	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,3:5,1:1,4,0,4
chr7	6088339	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:7,2:5,5:0|1:6088339_T_C:6088339:10,2,7,0
chr7	6088349	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0|1:6088339_T_C:6088339:0,0,16,3
chr7	6088533	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,2:4,6:0,10,0,8
chr7	6155037	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,3:12,0:20,5,2,1
chr7	6175424	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.215:15:6,2:6,0:9,3,3,0
chr7	6175644	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=99,156;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:6175644_T_C:6175644:1,3,0,1
chr7	6175653	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=208,156;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:6175644_T_C:6175644:0,4,0,1
chr7	6185968	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	6189919	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=187,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:7,5,0,2
chr7	6193521	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:1,1,0,3
chr7	6194800	.	A	ACATAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:6194800_A_ACATAAC:6194800:0,3,0,1
chr7	6194801	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,32;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:6194800_A_ACATAAC:6194800:0,3,0,1
chr7	6194806	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:6194800_A_ACATAAC:6194800:0,3,0,1
chr7	6199018	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=167,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:7,5,2,0
chr7	6210616	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,498;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,4:5,0:3,6,0,4
chr7	6213396	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,4:3,4,3,4
chr7	6229992	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6229992_T_A:6229992:0,1,1,0
chr7	6229994	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,13;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:6229992_T_A:6229992:0,1,1,0
chr7	6431523	.	C	CT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=71.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.581:41:8,10:9,11:13,4,19,5
chr7	6438388	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:1,4,1,4
chr7	6441993	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,150;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,25:0.565:44:8,13:11,12:7,12,16,9
chr7	6456655	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,2,0
chr7	6485740	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.380:9:5,0:1,1:1,5,1,2
chr7	6485775	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,0:3,3:0,8,0,3
chr7	6487293	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr7	6505901	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=134.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,13:0,23:0,0,10,26
chr7	6537655	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr7	6542871	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.366:8:0,0:3,0:1,4,0,3
chr7	6542878	.	G	GGGGGGGGGGGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,0:3,1:1,4,0,3
chr7	6545619	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	6547902	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:5,4:4,2:9,0,7,0
chr7	6550375	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr7	6550494	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,8:0,0,10,9
chr7	6560462	.	T	TAATGGCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.474:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	6561018	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:8,0:7,2:12,6,0,2
chr7	6566442	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.815:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr7	6579574	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=190,183;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:2,1:0|1:6579574_T_C:6579574:0,3,0,1
chr7	6579576	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,34;MFRL=190,183;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:6579574_T_C:6579574:0,3,0,1
chr7	6579582	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=190,183;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:6579574_T_C:6579574:0,3,0,1
chr7	6579586	.	T	TCCTCCTTTC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=190,183;MMQ=60,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:6579574_T_C:6579574:0,3,0,1
chr7	6579588	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=190,183;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:6579574_T_C:6579574:0,3,0,1
chr7	6591041	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0|1:6591041_C_G:6591041:0,0,10,5
chr7	6591051	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:0|1:6591041_C_G:6591041:5,3,4,2
chr7	6641635	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	6798843	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6798843_G_T:6798843:0,0,0,1
chr7	6798846	.	C	CTTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6798843_G_T:6798843:0,0,0,1
chr7	6798848	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6798843_G_T:6798843:0,0,0,1
chr7	6803513	.	A	AC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=168,189;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,3:7,1:6,5,0,4
chr7	6820332	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=232,233;MMQ=52,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	6859617	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=122,200;MMQ=39,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:6859617_A_G:6859617:4,16,0,2
chr7	6859618	.	ATATAATGCTCC	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=122,200;MMQ=39,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:6859617_A_G:6859617:4,16,0,2
chr7	6859635	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=116,200;MMQ=36,39;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:6,2:0|1:6859617_A_G:6859617:1,11,0,2
chr7	6859638	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=127,200;MMQ=33,39;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:6859617_A_G:6859617:1,8,0,2
chr7	7277807	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:2,4:4,0,6,0
chr7	7278497	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:11,3:19,0:9,21,3,0
chr7	7398457	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=13,32;MFRL=124,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=114.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.969:34:0,19:0,14:0,1,6,27
chr7	7400239	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr7	7415217	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	7415245	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=195,249;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7415245_G_A:7415245:0,1,0,1
chr7	7415253	.	T	TAGGGTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=195,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7415245_G_A:7415245:0,1,0,1
chr7	7421310	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	7484224	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7484224_A_C:7484224:0,2,0,1
chr7	7484227	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7484224_A_C:7484224:0,2,0,1
chr7	7491873	.	AG	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	7528951	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,15:0,0,27,6
chr7	7529116	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:6,1:9,2:0|1:7529116_G_T:7529116:0,15,0,3
chr7	7529123	.	A	AGAAC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,1:8,2:0|1:7529116_G_T:7529116:0,17,0,3
chr7	7529126	.	T	TGCGCTATGTTTATTC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=198,149;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,1:8,2:0|1:7529116_G_T:7529116:0,16,0,3
chr7	7529164	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,0:7,2:5,15,2,0
chr7	7557297	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr7	7622696	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,4:0,0,10,0
chr7	7628275	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr7	7645535	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr7	8043504	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,0:0,3:3,0,3,1
chr7	8062303	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=108,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr7	8095094	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:12,0:5,2:9,8,2,0
chr7	8110475	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr7	8110780	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:0,9,1,2
chr7	8126194	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=61,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,1,3
chr7	8181555	.	C	CCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=108,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CA;STR;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.842:10:0,3:1,4:0,1,0,9
chr7	8196529	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,15,19
chr7	8196566	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.263:28:10,3:10,4:10,11,3,4
chr7	8196567	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=95,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,24:0.868:27:0,11:2,13:2,1,10,14
chr7	8790982	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=146,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:3,4:7,5:2,8,3,7
chr7	8791103	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=151,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:6,1:9,4,1,1
chr7	10973362	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr7	10977630	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:8,7:2,7:9,1,13,1
chr7	11021956	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=155,111;MMQ=60,58;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.073:58:21,3:32,0:53,1,4,0
chr7	11022230	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr7	11053282	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr7	11091425	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,4:3,3:1,7,1,6
chr7	11101394	.	GT	G,GTT	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=33,34,33;MFRL=161,167,161;MMQ=60,60,60;MPOS=14,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.82,3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:55,6,5:0.088,0.074:66:27,4,3:24,2,2:49,6,9,2
chr7	11418931	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,4:0,2:0,4,0,7
chr7	11419378	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,2:4,4:0,7,0,6
chr7	11441358	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr7	11441373	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr7	11446902	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr7	11452204	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,1:3,5:5,0,6,0
chr7	11464297	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=171,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr7	11464342	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,8:3,3:5,1,7,4
chr7	11487100	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=42981894,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr7	11509438	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:2,0,5,0
chr7	11581003	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,5:6,4:7,2,9,0
chr7	11630007	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:12,0,2,0
chr7	11633193	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,1,4
chr7	12258066	.	T	TA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.426:33:10,5:9,9:16,3,10,4
chr7	12263799	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=79.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,11:0,0,18,0
chr7	12269260	.	A	ATGTT	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=261.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,35:0,19:0,0,45,16
chr7	12270565	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	12270583	.	CTTA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr7	12270625	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,9:0,0,18,3
chr7	12270770	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,11:0,11:0,0,5,17
chr7	12270791	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:8,4:3,6:1,10,1,9
chr7	12270815	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,1,18
chr7	12271452	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,16:0,16:0,0,23,9
chr7	12370702	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=213,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr7	12370952	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	12372999	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=122,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr7	12373082	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.396:25:8,3:7,5:14,1,9,1
chr7	12376811	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,3:5,3:7,4,4,2
chr7	12382637	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=174,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr7	12383967	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.567:37:12,8:3,13:8,8,10,11
chr7	12391268	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:9,7:7,4:7,9,6,6
chr7	12391400	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=231,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:12391400_A_T:12391400:0,3,0,1
chr7	12391401	.	AAT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=231,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:12391400_A_T:12391400:0,3,0,1
chr7	12409352	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:0|1:12409352_A_T:12409352:8,14,1,1
chr7	12409357	.	C	CATATAACCACCACCAA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:10,0:10,2:0|1:12409352_A_T:12409352:8,13,1,1
chr7	12419039	.	TCA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,0:3,4:3,2,3,1
chr7	12420092	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=121,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,3:0,0:3,0,2,2
chr7	12420447	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr7	12428741	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,6:7,6:7,6,11,1
chr7	12428803	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,6:2,6:2,6,3,9
chr7	12433445	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr7	12644334	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr7	12675649	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:6,1,2,2
chr7	12684340	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr7	12727826	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=109.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,19:0,9:0,0,29,1
chr7	12729925	.	GT	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.575:33:5,6:5,8:9,5,7,12
chr7	12730250	.	G	GTT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=178,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,1:1,1,0,2
chr7	12730260	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=190,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:12730260_T_A:12730260:1,2,0,1
chr7	12730262	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=190,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:12730260_T_A:12730260:1,2,0,1
chr7	12730362	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,9:0,0,16,4
chr7	13935443	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,1:7,1:12,11,2,0
chr7	13950838	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.436:30:9,6:7,6:12,5,9,4
chr7	13978645	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0|1:13978645_C_T:13978645:5,0,4,0
chr7	13978648	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,1:2,2:0|1:13978645_C_T:13978645:5,0,4,0
chr7	14016939	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.322:20:8,3:4,3:14,0,6,0
chr7	14017007	.	CC	TG	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=102.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,28:0.420:67:17,15:18,11:31,8,21,7
chr7	14017126	.	T	TA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.561:39:10,11:6,10:1,16,3,19
chr7	14025640	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	14026357	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.462:50:9,11:18,12:3,24,5,18
chr7	14027898	.	A	ACACACATCCCTGTAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr7	14028220	.	GA	G,GAA,GAAA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,34,33,33;MFRL=137,162,172,150;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,22,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,16;RU=A;STR;TLOD=10.34,4.59,3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,6,4,3:0.260,0.204,0.163:22:6,3,1,1:1,2,3,1:9,0,13,0
chr7	14028245	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.445:40:10,5:6,3:16,6,13,5
chr7	14028707	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.475:17:3,4:6,4:3,6,2,6
chr7	14028794	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	14188873	.	AAG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=138,6926185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AG;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:1,2:1,6,0,2
chr7	14378185	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=181,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,1:16,1:12,10,2,0
chr7	14622870	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	14646986	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,20,0
chr7	14653054	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=142.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,16:0,21:0,0,11,26
chr7	14737622	.	AAAAG	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=118,162;MMQ=54,46;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAAG;STR;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.764:16:0,5:2,7:3,1,12,0
chr7	14737638	.	GAAAGAGAA	G	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=147,82;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:12,0:20,2:37,10,1,1
chr7	14775821	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=45.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.904:18:1,6:0,8:0|1:14775821_TG_T:14775821:0,1,2,15
chr7	14775824	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=45.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.904:18:1,8:0,9:0|1:14775821_TG_T:14775821:0,1,2,15
chr7	14797180	.	TAC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:5,1:9,2:13,2,3,0
chr7	15346196	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr7	15427176	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:15427176_T_C:15427176:1,2,0,1
chr7	15427182	.	A	ACTACCTCAGGCTAAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:15427176_T_C:15427176:1,2,0,1
chr7	15433667	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=188,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr7	15651994	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,42;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:16,2,2,0
chr7	15725797	.	ATGG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=161,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TGG;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr7	15726066	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,2,18
chr7	15726117	.	A	AT,ATT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,22,29;MFRL=0,188,238;MMQ=60,60,60;MPOS=17,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.68,4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.445,0.443:4:0,0,0:0,1,2:0,0,0,4
chr7	16131260	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr7	16255602	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr7	16505341	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr7	16572051	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr7	16572376	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:3,4:1,1:0,4,0,6
chr7	16577376	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=120.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,18:0,22:0,0,6,34
chr7	16598655	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,9:0,0,2,20
chr7	16605861	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	16606084	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,1,4
chr7	16607177	.	TA	T,TAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,31,28;MFRL=0,205,143;MMQ=60,60,60;MPOS=9,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=6.70,13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,9:0.245,0.468:19:2,1,4:1,3,1:2,3,2,12
chr7	16620928	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.456:24:7,5:6,5:8,5,8,3
chr7	16640300	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=202,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:6,0,4,0
chr7	16640358	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr7	16650427	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr7	16666725	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:8,3:12,0:8,12,2,1
chr7	16676082	.	T	TA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.800:21:2,5:0,5:1,3,4,13
chr7	16684247	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr7	16705132	.	TTG	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=14,13;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:2,1:3,0:0,13,0,3
chr7	16722392	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:7,1:11,2:7,12,1,2
chr7	16745589	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:9,3:1,4:10,0,5,2
chr7	16823021	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:3,3:4,5:5,2,9,0
chr7	16823117	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=96,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.334:28:9,2:9,7:8,11,4,5
chr7	16823169	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,5:2,9:2,5,0,14
chr7	16834393	.	A	AAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=145,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr7	16834444	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.607:18:3,5:3,6:7,0,9,2
chr7	16837404	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:16837404_C_T:16837404:0,0,0,4
chr7	16837409	.	A	ATCACTCTGCTGTTTAAAAGTCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:16837404_C_T:16837404:0,3,0,1
chr7	16901185	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	16913520	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	16913557	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr7	16913580	.	G	GATGAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=107,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:16913580_G_GATGAC:16913580:0,2,0,1
chr7	16913584	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=107,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:16913580_G_GATGAC:16913580:0,2,0,1
chr7	17373771	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,3:7,6:2,8,0,9
chr7	17854532	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:5,4:4,9:5,5,5,8
chr7	17869617	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,231;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,4:0.073:66:31,0:30,4:40,22,4,0
chr7	17874300	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:7,0,4,0
chr7	17879484	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:7,8:8,6:11,4,8,7
chr7	17890413	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr7	17908130	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=199,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,23:0.616:37:8,10:6,13:2,12,5,18
chr7	17913083	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,2:0,0,9,1
chr7	17922622	.	C	CGGAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17922622_C_CGGAA:17922622:0,0,0,1
chr7	17922624	.	G	GATGTTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17922622_C_CGGAA:17922622:0,0,0,1
chr7	17979793	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:3,4:7,3:9,1,8,0
chr7	18630208	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,7:0,0,0,15
chr7	18631098	.	ATG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=TG;STR;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr7	18674435	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr7	18875457	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.160:17:6,2:7,0:12,3,0,2
chr7	18914251	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=217,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:2,4,0,2
chr7	18975650	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,4:0,3:0,3,0,7
chr7	19769165	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	19813301	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,1:1,6,0,2
chr7	20180507	.	G	GAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=AC;STR;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.868:9:0,4:0,3:1,0,8,0
chr7	20371395	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=105.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,14:0,15:0,0,27,2
chr7	20403353	.	AT	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.477:24:1,4:11,6:4,9,1,10
chr7	20406542	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr7	20418926	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=78.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,14:0,0,7,15
chr7	20430960	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,14:0,0,28,0
chr7	20444402	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.074:52:24,3:23,0:20,29,2,1
chr7	20444532	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:0,8,0,6
chr7	20663070	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=179,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,4:2,9:0,4,0,13
chr7	20668236	.	T	TTG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.432:7:3,0:1,2:4,0,3,0
chr7	20668277	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=123,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:8,5:7,4:12,4,6,3
chr7	20668295	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,3:11,0:13,10,3,0
chr7	20685508	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:6,7:3,10:7,2,12,5
chr7	20685786	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=233,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr7	20687332	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr7	20690984	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr7	20691219	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.536:39:9,7:9,14:10,8,8,13
chr7	20698077	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:4,2:1,4:4,1,6,1
chr7	20698804	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:4,0:3,3:0,7,0,4
chr7	20739465	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=82,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:2,5:0,7:1,1,7,5
chr7	20739632	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=129.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,17:0,18:0,0,29,6
chr7	20739774	.	AT	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=60.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.965:22:0,13:0,9:0,0,2,20
chr7	20739839	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr7	20762543	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	20762609	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=124,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:9,1,3,0
chr7	20762646	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=137,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:7,5,1,1
chr7	20778773	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	20782474	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=210,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,4:1,2:2,0,4,2
chr7	20824940	.	AGCC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=185,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCC;STR;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:3,2:1,6,0,3
chr7	20826270	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:1,2:7,0,3,0
chr7	21467785	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,11;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.243:16:4,0:2,0:11,1,4,0
chr7	21468579	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,3:4,4:1,7,0,7
chr7	21468869	.	TCC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=C;STR;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr7	21468885	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,10;MFRL=56,160;MMQ=60,47;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:2,0:2,0:4,0,2,0
chr7	21516627	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=195,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr7	21584820	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:1,2:4,1:0,5,0,4
chr7	21603750	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=132,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.562:7:2,0:0,4:2,1,4,0
chr7	21609625	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:5,6:4,4:9,0,9,1
chr7	21611399	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:4,3:3,3:6,1,5,2
chr7	21627909	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr7	21639818	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	21654653	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=115,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr7	21658855	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:6,2:7,4:2,11,2,4
chr7	21659554	.	A	ATTAAT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:11,5:6,8:15,2,14,0
chr7	21659645	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,25:0.530:47:9,12:13,13:12,10,10,15
chr7	21695416	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,7:4,2:5,2,9,0
chr7	21695649	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=188,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:0,4,0,4
chr7	21722330	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=144,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.808:24:2,13:2,7:3,1,13,7
chr7	21723573	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,4:6,2:3,7,2,4
chr7	21765636	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr7	21765665	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=227,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr7	21775210	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr7	21775420	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=109,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.501:22:7,1:4,10:4,7,1,10
chr7	21775443	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,11:0,0,5,11
chr7	21789442	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=37,29;MFRL=84,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,6:1,7:0,1,3,10
chr7	21813318	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,3:0,0,9,0
chr7	21818486	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr7	21826199	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:6,1:3,2:10,1,3,0
chr7	21847457	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=164,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,2,1
chr7	21856390	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:0,9,0,3
chr7	21858043	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=198,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	21892023	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=191,273;MMQ=55,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.514:2:0,0:1,1:0|1:21892023_T_TAA:21892023:1,0,1,0
chr7	21892042	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=174,232;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,0:3,0,2,0
chr7	21892045	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=183,273;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:21892023_T_TAA:21892023:4,0,1,0
chr7	21892200	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,1:11,1:10,12,1,1
chr7	21907375	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=18,29;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr7	21907427	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:6,0,5,0
chr7	21907452	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,7:0,5:0|1:21907452_G_GT:21907452:0,0,14,2
chr7	21907458	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0|1:21907452_G_GT:21907452:0,0,14,2
chr7	21907696	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,0,13
chr7	21907722	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=170,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:3,0:0,0:0,4,0,2
chr7	21923867	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,140;MMQ=52,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:9,1,2,0
chr7	21939089	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.578:29:4,8:8,8:2,10,2,15
chr7	21939827	.	C	CTGTCTTCTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr7	21939839	.	AGTAAC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	21940557	.	AACTT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTT;STR;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr7	21940960	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:1,4,0,4
chr7	21941861	.	ATCTT	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=183.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,19:0,22:0,0,31,11
chr7	21943722	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:3,2:5,3,3,1
chr7	21945840	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,7:5,3:10,0,10,0
chr7	21951389	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=95,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:2,4,0,2
chr7	21985347	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=145.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,21:0,0,23,22
chr7	22190130	.	TGA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:2,1:0,3:0|1:22190130_TGA_T:22190130:2,1,0,4
chr7	22190133	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,10;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:2,0:1,0:0|1:22190130_TGA_T:22190130:2,1,0,4
chr7	22201956	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr7	22206774	.	G	GA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:8,2:8,0:3,21,2,1
chr7	22259724	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:1,15,0,2
chr7	22349503	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr7	22357488	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,6:2,2:8,0,7,1
chr7	22357716	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:10,0:4,8:4,10,2,6
chr7	22459324	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	22857589	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=165.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,26:0,17:0,0,32,13
chr7	22861739	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	22985868	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=214,254;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	23000783	.	G	GCTCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=CT;STR;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:6,0:1,2:7,0,5,0
chr7	23145837	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=76.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,8:0,15:0,0,0,24
chr7	23191625	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr7	23191636	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	23191664	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr7	23191899	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr7	23195555	.	CTTTAT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=82.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,6:0,13:0,0,11,8
chr7	23221870	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,2,11
chr7	23227632	.	AT	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.166:32:13,2:11,3:21,6,4,1
chr7	23293098	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,4,11
chr7	23293746	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,19,5
chr7	23296533	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,20:0,8:0,0,21,7
chr7	23300049	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,3:0,13:0,0,15,2
chr7	23306020	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr7	23307408	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr7	23307634	.	ATGGG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGG;STR;TLOD=75.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,6:0,0,1,16
chr7	23352512	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,0,23
chr7	23357343	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:1,14,0,2
chr7	23357380	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=181,167;MMQ=60,37;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr7	23545119	.	TA	T,TAA	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=27,26,28;MFRL=145,0,87;MMQ=60,60,60;MPOS=13,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,19,21;RU=A;STR;TLOD=6.71,11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,8,11:0.249,0.372:29:4,2,7:3,3,2:6,4,12,7
chr7	23724364	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr7	23794139	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=69.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,3,17
chr7	23802579	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr7	23810605	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr7	23823355	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr7	23826066	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr7	23854717	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,11:0,8:0,0,15,4
chr7	23854838	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:11,4:6,7:9,8,3,8
chr7	23872024	.	C	CTTTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr7	24324759	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,4:2,1:2,0,6,0
chr7	24324808	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,0:3,5:6,1,3,3
chr7	24324876	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=136,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,1:6,1:5,11,1,1
chr7	24708364	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=132,149;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0|1:24708364_T_G:24708364:1,5,0,2
chr7	24708368	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=141,149;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.338:7:4,0:1,2:0|1:24708364_T_G:24708364:1,4,0,2
chr7	24839985	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:24839985_C_T:24839985:0,2,0,1
chr7	24839987	.	C	CTTACTTCTCAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:2,1:0,0:0|1:24839985_C_T:24839985:0,2,0,1
chr7	24905912	.	A	AGCAAATGTGCACC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	25182172	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:5,0,3,1
chr7	25194618	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=152.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,22:0,23:0,0,38,7
chr7	25194753	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=145,114;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,30:0.435:69:18,20:19,8:14,25,10,20
chr7	25194857	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,16:0,0,3,25
chr7	25200976	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=193,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,2:2,6:0,6,0,8
chr7	25207849	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=178,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,3:2,6:5,1,9,0
chr7	25264847	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:1,2,0,4
chr7	25989520	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr7	26232802	.	CCCTTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,3:3,11:8,0,14,0
chr7	26247984	.	CTT	C,CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32,26;MFRL=179,157,140;MMQ=60,60,60;MPOS=19,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.90,4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,3:0.157,0.214:16:8,1,1:2,1,1:10,1,4,1
chr7	26251417	.	CT	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:11,1:12,2:2,23,0,4
chr7	26251843	.	C	T	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,146;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,38:0.361:106:32,18:35,20:18,50,13,25
chr7	26386122	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,5,7
chr7	26386154	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr7	26404071	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,2:2,4:4,0,7,0
chr7	26576535	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.948:35:0,19:1,15:1,0,10,24
chr7	26678856	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr7	26724279	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr7	26883761	.	TAA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:5,1:0,1:1,5,0,2
chr7	27135313	.	GCGA	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=157,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.112:24:12,1:10,1:0|1:27135313_GCGA_G:27135313:10,12,0,2
chr7	27135319	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=169,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.125:24:8,2:10,0:0|1:27135313_GCGA_G:27135313:9,12,1,2
chr7	27142086	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:1,0:10,2:0,12,0,2
chr7	27170145	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:27170145_T_G:27170145:0,0,2,1
chr7	27170160	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=252,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:27170145_T_G:27170145:2,0,1,1
chr7	27196069	.	A	C	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,29:0.433:67:19,13:19,15:11,27,15,14
chr7	27196113	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,33:0.466:71:22,12:16,21:15,23,9,24
chr7	27203139	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,2:0,4:3,0,6,0
chr7	27282775	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr7	27282894	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr7	27582818	.	GCCTCC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,19;MFRL=325,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr7	27671901	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,6:0,1:1,0,7,0
chr7	27833853	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,11,0
chr7	27872675	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,0:2,4:0,3,0,4
chr7	27880427	.	T	TCC	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=175,48;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:0|1:27880427_T_TCC:27880427:12,8,1,1
chr7	27880432	.	G	GCA	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=175,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:10,2:0|1:27880427_T_TCC:27880427:12,9,1,1
chr7	27880436	.	CATCG	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=175,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:11,2:0|1:27880427_T_TCC:27880427:12,11,1,1
chr7	27880442	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=176,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:0|1:27880427_T_TCC:27880427:12,10,1,1
chr7	27880446	.	CGA	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=175,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:11,2:0|1:27880427_T_TCC:27880427:12,11,1,1
chr7	27880449	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=172,48;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:0|1:27880427_T_TCC:27880427:12,10,1,1
chr7	27934921	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.143:34:10,1:15,0:24,5,0,5
chr7	28031704	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=215,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:3,4:8,8:8,3,9,4
chr7	28534501	.	C	CT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=113,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=89.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,36:0.934:39:0,17:3,17:2,1,25,11
chr7	28997497	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr7	29103867	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr7	29103877	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr7	29103944	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	29132178	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=164,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr7	29132212	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,5:6,5:10,1,9,1
chr7	29160453	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:29160453_AAG_A:29160453:2,0,1,0
chr7	29160463	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,15;MFRL=106,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:29160453_AAG_A:29160453:2,1,1,0
chr7	29186576	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,3,11
chr7	29407518	.	TTC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,1:5,1:6,2,0,2
chr7	29438110	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:1,8,1,1
chr7	29440511	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=77,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	29544298	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	29546763	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr7	29546785	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:4,0:5,0,2,0
chr7	29552140	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=199,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr7	29606390	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=186,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:5,0:7,0:5,10,2,0
chr7	29606597	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=211,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:0,4:1,8:1,0,5,7
chr7	29606976	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	29874355	.	G	C	.	.	DP=57;ECNT=5;MBQ=32,11;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,14:0.288:49:17,0:14,3:0|1:29874355_G_C:29874355:2,33,14,0
chr7	29874358	.	A	C	.	.	DP=57;ECNT=5;MBQ=26,13;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,14:0.261:55:18,2:15,3:0|1:29874355_G_C:29874355:2,39,14,0
chr7	29874364	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,14:0.260:54:21,6:16,6:0|1:29874355_G_C:29874355:0,40,14,0
chr7	29874367	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,10:0.194:53:21,0:18,1:0|1:29874355_G_C:29874355:0,43,10,0
chr7	29874369	.	CTCT	C	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.057:51:22,1:18,0:0|1:29874355_G_C:29874355:0,49,2,0
chr7	29915593	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,25:0.464:54:16,5:12,20:8,21,3,22
chr7	29923974	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:2,1:4,0,0,4
chr7	29928851	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=230,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,4,0
chr7	30092256	.	CAAAAAAAAA	C,CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33,35;MFRL=218,178,186;MMQ=59,60,60;MPOS=20,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,11,12;RU=A;STR;TLOD=6.54,7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.399,0.399:8:2,2,2:0,1,1:2,0,6,0
chr7	30113862	.	T	TTG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=TG;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.437:9:1,1:0,2:0,4,0,5
chr7	30465200	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:11,0:18,3,2,0
chr7	30485702	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=204,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr7	30485741	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,12:0,0,13,6
chr7	30490760	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=239,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr7	30491081	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr7	30496309	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.623:14:2,4:3,4:5,0,7,2
chr7	30536611	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=192,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30536611_T_C:30536611:1,0,1,0
chr7	30536619	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=232,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:30536611_T_C:30536611:2,0,1,0
chr7	30536874	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:4,9:7,8:2,9,3,14
chr7	30538399	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:6,9:11,2:15,2,11,0
chr7	30538651	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	30544360	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,4,25
chr7	30634661	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	30643069	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr7	30651938	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	30655454	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,216;MMQ=60,38;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,2:14,0:18,2,2,0
chr7	30656650	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=214,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr7	30660938	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:4,0,6,0
chr7	30672148	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:4,0:0,9,0,2
chr7	30673345	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr7	30673512	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,9;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr7	30695646	.	A	ATTC	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=17,20;MFRL=135,41;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,2:1,0:0|1:30695646_A_ATTC:30695646:3,3,1,1
chr7	30695651	.	AA	TG	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=152,41;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:1,0:0|1:30695646_A_ATTC:30695646:3,7,1,1
chr7	30695654	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=151,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,2:1,1:0|1:30695654_G_C:30695654:2,6,1,2
chr7	30695656	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=151,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,2:1,1:0|1:30695654_G_C:30695654:2,6,1,2
chr7	30695658	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=151,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:7,2:1,0:0|1:30695646_A_ATTC:30695646:2,6,1,1
chr7	30695660	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=151,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,2:1,0:0|1:30695646_A_ATTC:30695646:2,6,1,1
chr7	30705105	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=114.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,14:0,20:0,0,27,8
chr7	30728908	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,8:0,13:0,0,5,22
chr7	30739525	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=297,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.844:11:0,2:1,6:1,0,10,0
chr7	30739691	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	30795547	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	30878906	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.129:22:10,2:8,0:0|1:30878906_T_G:30878906:10,10,0,2
chr7	30878909	.	A	ACC	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.123:23:11,2:7,0:0|1:30878906_T_G:30878906:10,11,0,2
chr7	30878910	.	A	AAAAAAACTTCCTTGG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:7,0:0|1:30878906_T_G:30878906:9,11,0,2
chr7	30878954	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.415:15:7,5:1,1:3,6,1,5
chr7	30963298	.	G	GTCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:2,1,0,1
chr7	31015565	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.660:18:2,4:3,8:1,5,0,12
chr7	31016018	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=207,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,4:0,1:2,0,5,0
chr7	31102966	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,4:6,0:1,9,0,4
chr7	31102978	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:2,4:5,0:1,7,0,4
chr7	31104564	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:2,4,0,5
chr7	31125082	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr7	31126732	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=226,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31126732_G_T:31126732:0,1,0,1
chr7	31126734	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=226,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31126732_G_T:31126732:0,1,0,1
chr7	31132235	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr7	31135471	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	31378068	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:2,11,0,2
chr7	31594166	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=132,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.698:18:3,6:2,6:1,4,1,12
chr7	31609317	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:5,7:5,6:6,4,9,4
chr7	31681765	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=128.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,26:0,17:0,0,29,14
chr7	31681957	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=193,1355;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,3:6,0:2,7,0,3
chr7	31683610	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	31691697	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=179.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,23:0,26:0,0,9,41
chr7	31735263	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,1:6,4:0,8,0,5
chr7	31815194	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=175,362;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr7	31868064	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=103,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr7	31876766	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.575:19:4,6:3,4:8,0,9,2
chr7	31918879	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31918879_C_T:31918879:0,0,0,1
chr7	31918885	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31918879_C_T:31918879:0,0,0,1
chr7	31920395	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:6,0,7,3
chr7	32209376	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:7,1,5,2
chr7	32526993	.	G	GCT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=156,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:9,0:14,1:2,22,1,1
chr7	32527009	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0,0,0,17
chr7	32530198	.	AA	TC	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=196.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,24:0,20:0,0,15,29
chr7	32593234	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.649:12:2,6:2,2:4,0,8,0
chr7	32593271	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:4,7:7,1:10,3,7,1
chr7	32594278	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,28:0.537:52:12,18:12,9:3,21,4,24
chr7	32598138	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=187,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:6,9:7,7:11,2,11,5
chr7	32598524	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,4:3,1:5,5,3,2
chr7	32609565	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=168,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,2:3,0:7,2,2,0
chr7	32615553	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=67,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,4:3,7:5,1,8,3
chr7	32620325	.	T	TTG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TG;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:6,2:7,1:13,0,3,0
chr7	32908945	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.554:16:3,4:4,5:7,0,7,2
chr7	32910506	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,19;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr7	32910532	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32910532_A_T:32910532:0,0,0,1
chr7	32910534	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32910532_A_T:32910532:0,0,0,1
chr7	32910536	.	CAGA	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32910532_A_T:32910532:0,0,0,1
chr7	32910548	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32910532_A_T:32910532:0,0,0,1
chr7	32910552	.	TT	AC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32910532_A_T:32910532:0,0,0,1
chr7	33014404	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=175,124;MMQ=52,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr7	33016120	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,167;MMQ=52,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:8,3:7,3:4,11,1,5
chr7	33059407	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	33060875	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,31:0.486:64:20,12:12,19:22,11,20,11
chr7	33102462	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr7	33136983	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr7	33388618	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr7	34085820	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=10,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:34085820_A_G:34085820:1,0,1,0
chr7	34085823	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34085820_A_G:34085820:1,0,1,0
chr7	34697982	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr7	34698210	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,9:7,3:3,9,3,9
chr7	34698234	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:1,5:7,4:0,9,1,8
chr7	34698251	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,3:6,3:0,9,0,6
chr7	34724373	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=244,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,0:1,3:0,1,0,6
chr7	34888010	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=163,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr7	34917664	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,156;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:6,0,4,2
chr7	34981591	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:0,6,1,7
chr7	35009183	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,143;MMQ=40,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:9,8:8,8:6,12,2,15
chr7	35050217	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=152,152;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,22:0.434:51:15,11:14,11:4,25,2,20
chr7	35289889	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr7	35673870	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.698:27:5,11:2,8:8,0,16,3
chr7	35709772	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=199,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:6,0,7,2
chr7	35840898	.	G	GC	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=146.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,26:0,16:0,0,16,27
chr7	35930260	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr7	35930437	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	36320933	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr7	36324436	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=185,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:1,7:3,2:0,4,3,6
chr7	36327410	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.613:26:7,11:2,4:2,8,4,12
chr7	36338841	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:1,3:3,10:0,4,2,11
chr7	36366360	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,0:9,2:12,0,1,1
chr7	36370499	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	36370555	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,15,2
chr7	36374799	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:2,6,3,5
chr7	36396480	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:6,0,6,0
chr7	36447287	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=235,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:7,0,7,0
chr7	36447349	.	A	ACTT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=191,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:8,8:5,4:11,2,6,6
chr7	36447600	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:0,7,0,5
chr7	36456613	.	AC	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.497:28:12,7:1,7:14,0,14,0
chr7	36465570	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.474:49:13,11:11,9:18,8,19,4
chr7	36465606	.	CT	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.137:31:14,1:7,3:16,11,3,1
chr7	36552790	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr7	36588955	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=178,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:6,0,5,0
chr7	36656126	.	TG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=179,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:1,3,0,1
chr7	36656147	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	36661423	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,6:3,3:1,7,0,9
chr7	36671720	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=18,10;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.254:18:0,0:3,0:2,11,0,5
chr7	36698684	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=132,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr7	36726502	.	T	TGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr7	36910157	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=190,199;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0,8,0,2
chr7	36927078	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,4:2,2:6,0,6,0
chr7	36934448	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,12:0,0,21,5
chr7	37252929	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.633:28:6,12:4,6:8,2,12,6
chr7	37253093	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,5:1,0:0,5,0,5
chr7	37256392	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,253;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:0,5,0,5
chr7	37262140	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,3:5,4:8,0,6,1
chr7	37299056	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr7	37355590	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr7	37889786	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=202,247;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr7	37890081	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,1:0,2:0,3,1,3
chr7	37901581	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,6:0,16:0,0,17,5
chr7	37903853	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:9,0,5,0
chr7	37903904	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,3:5,6:9,1,8,1
chr7	37904065	.	TAAC	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.565:14:1,4:5,3:0,6,0,8
chr7	37904099	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=156,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr7	37923849	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=191,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:5,0,4,2
chr7	37924737	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=87,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:1,5:5,5:5,2,6,4
chr7	37924879	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=214,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,6:5,3:0,7,0,9
chr7	37927779	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,37;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr7	37936384	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	37947164	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,121;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,20:0.388:51:15,7:15,10:14,17,10,10
chr7	38247387	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,129;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0,13,0,2
chr7	38254140	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr7	38256519	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:6,0,2,1
chr7	38256938	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr7	38301741	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=137,158;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:4,3:3,1:6,2,4,0
chr7	38304926	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,150;MMQ=52,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:1,7:2,7:2,1,13,1
chr7	38305340	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	38431644	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=194,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	38471748	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=132.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,18:0,21:0,0,31,8
chr7	38471937	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,4:0,0,0,5
chr7	38543371	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr7	38725682	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.456:35:8,8:10,7:8,11,5,11
chr7	38765883	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:4,6:4,4:2,7,3,7
chr7	38782905	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	38782951	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr7	38783101	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,0:9,2:8,14,1,1
chr7	38813711	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,8,4
chr7	38829347	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,22,3
chr7	38835035	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,17,2
chr7	38948614	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0|1:38948614_A_C:38948614:0,0,2,0
chr7	38948619	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38948614_A_C:38948614:0,0,1,0
chr7	39125413	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr7	39243750	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr7	39243963	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=133,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,2:7,5:1,9,0,7
chr7	39243978	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:3,3:9,2:1,11,0,5
chr7	39379698	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CA;STR;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	39472669	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:4,4:6,4:9,1,8,1
chr7	39500352	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=79.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,1,21
chr7	39610177	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.487:35:10,8:8,9:8,10,9,8
chr7	39610241	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:9,3:5,9:1,13,1,11
chr7	39611819	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=121,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,6:6,7:7,3,11,2
chr7	39726325	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=124,87;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,3:0.066:59:27,0:21,2:0|1:39726325_T_C:39726325:31,25,0,3
chr7	39726332	.	T	G	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=129,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.069:56:28,0:18,3:0|1:39726325_T_C:39726325:27,26,0,3
chr7	39990947	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	39991312	.	T	TAC	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,20;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991316	.	CGA	C	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,13;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991323	.	C	CAAA	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991324	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,13;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991326	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,13;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991329	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991331	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991334	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991336	.	CG	AA	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,13;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991339	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991346	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991348	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,14;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:39991312_T_TAC:39991312:0,0,1,0
chr7	39991528	.	G	GCTGTAGCAAACGTCCGCGACCTCTCAGGTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	40127643	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:0,3:7,0:5,2,3,0
chr7	40134678	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr7	40220507	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:6,3,4,0
chr7	40228033	.	C	CCA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=167,180;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.263:12:4,1:5,1:9,0,1,2
chr7	40228034	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=177,160;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.376:13:3,3:5,2:5,3,5,0
chr7	40229072	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,0:2,6:4,2,6,0
chr7	40229112	.	AAT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:7,2:4,0:11,1,3,0
chr7	40234742	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:0,1:2,1:0,4,0,3
chr7	40314165	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,12:0,0,12,14
chr7	42003898	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:7,6:1,8:7,1,12,2
chr7	42005007	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,6:1,1:0,1,1,6
chr7	42017103	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.739:20:3,4:1,11:5,0,15,0
chr7	42018336	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,5:4,7:0,12,4,8
chr7	42018391	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,1,4
chr7	42064852	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr7	42262935	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:0,2:0,2:0,1,0,7
chr7	42957465	.	ATT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=97.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,0,22
chr7	42974827	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr7	42977195	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr7	42977243	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr7	43482258	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=152,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:5,2:16,0:3,18,0,2
chr7	43484630	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=152,88;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr7	43485248	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:1,1:0,3,0,3
chr7	43495878	.	C	CT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=220,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=105.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.951:37:1,10:0,20:0,1,26,10
chr7	43506015	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr7	43531843	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=160,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,2:16,0:1,25,0,2
chr7	43540782	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,19;MFRL=108,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=T;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.589:5:2,1:0,0:2,0,1,2
chr7	43622806	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=86.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,29:0.561:52:8,16:13,13:12,11,19,10
chr7	43664477	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=221,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:0,5,0,4
chr7	43684803	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=93.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,24,0
chr7	43684847	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=175,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:8,6:9,11:12,5,14,3
chr7	43687296	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:8,6:8,7:0,16,0,13
chr7	43810695	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=95.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,19:0,9:0,0,17,11
chr7	43827414	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,14:0,0,23,0
chr7	43843423	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,3:3,3:1,5,0,7
chr7	43908847	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=213,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:43908847_T_G:43908847:2,0,0,1
chr7	43908855	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=11,28;MFRL=213,246;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:43908847_T_G:43908847:2,0,0,1
chr7	43908858	.	C	CTCTCCGAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=12,32;MFRL=202,246;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:43908847_T_G:43908847:1,0,0,1
chr7	43918637	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=158,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:19,0:14,3:10,23,0,3
chr7	44044907	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=191,180;MMQ=40,35;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:3,1:2,3:0,6,0,4
chr7	44046844	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=197,175;MMQ=48,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.547:22:6,3:3,9:9,1,11,1
chr7	44047066	.	T	C	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=160,151;MMQ=51,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,47:0.590:78:17,14:13,16:15,16,17,30
chr7	44084483	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,11;MFRL=115,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:44084483_G_T:44084483:0,3,0,1
chr7	44084497	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44084483_G_T:44084483:0,0,0,1
chr7	44097696	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=209,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.652:29:5,10:4,9:8,2,14,5
chr7	44147567	.	C	CG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr7	44147599	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.287:11:3,0:4,0:5,3,3,0
chr7	44148388	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr7	44151009	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,1:1,5:4,0,6,0
chr7	44152119	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr7	44152259	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:5,10,1,1
chr7	44152549	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:3,2,3,1
chr7	44154865	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr7	44156146	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr7	44157566	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:5,0:9,1,2,0
chr7	44178626	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,3:9,5:5,12,0,8
chr7	44180079	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.921:11:0,4:0,5:0,0,1,10
chr7	44180226	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:6,4:2,2:6,2,7,0
chr7	44189321	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.287:21:5,2:9,2:13,2,5,1
chr7	44198654	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr7	44228501	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=166,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:10,0:7,4:11,8,2,2
chr7	44240932	.	G	GTTAAAAGAGGTATGCAGGTTAGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	44260399	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:4,2:3,0:1,7,0,2
chr7	44266077	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:5,1,1,2
chr7	44266184	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.612:34:8,11:4,8:6,7,14,7
chr7	44270492	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr7	44270653	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:5,7,0,2
chr7	44272314	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	44272413	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.477:42:8,14:12,5:20,2,14,6
chr7	44281801	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=152,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.207:16:3,2:7,0:13,0,3,0
chr7	44283188	.	TT	CG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=216,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:44283188_TT_CG:44283188:0,3,0,1
chr7	44283191	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=216,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:44283188_TT_CG:44283188:0,3,0,1
chr7	44283196	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=216,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:44283188_TT_CG:44283188:0,3,0,1
chr7	44294052	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr7	44302579	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,0:4,2:6,2,2,0
chr7	44364862	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr7	44524800	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.074:52:27,0:21,3:19,30,0,3
chr7	44576369	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=223,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.564:5:1,0:0,1:2,0,3,0
chr7	44606098	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,11:0,0,10,15
chr7	44606217	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr7	44606229	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=252,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	44606233	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=232,223;MMQ=60,60;MPOS=-1073741810;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr7	44610490	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,7,12
chr7	44611077	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr7	44612347	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=126.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,18:0,14:0,0,9,25
chr7	44612454	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=125.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,39:0.953:40:0,17:1,21:0,1,29,10
chr7	44613103	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr7	44613611	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=43.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr7	44619302	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr7	44663900	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:6,2,2,0
chr7	44687396	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:6,2:2,19,0,2
chr7	44713923	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=164,158;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.269:15:4,4:5,0:10,1,4,0
chr7	44713931	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=164,158;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.255:17:5,3:6,0:12,1,4,0
chr7	44713934	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=164,158;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.235:17:6,4:6,0:12,1,4,0
chr7	44801390	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:5,12,1,1
chr7	44802401	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44802401_A_C:44802401:0,0,1,0
chr7	44802407	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44802401_A_C:44802401:0,0,1,0
chr7	44802410	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:44802401_A_C:44802401:2,0,1,0
chr7	44802412	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:44802401_A_C:44802401:2,0,1,0
chr7	44805802	.	T	TGC	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=33,16;MFRL=129,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:1,2:5,0:0|1:44805802_T_TGC:44805802:0,6,5,0
chr7	44805806	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=28,34;MFRL=129,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:1,4:5,1:0|1:44805802_T_TGC:44805802:1,7,5,0
chr7	44805810	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=9;MBQ=27,36;MFRL=132,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:2,4:5,1:0|1:44805802_T_TGC:44805802:4,7,5,0
chr7	44805813	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=9;MBQ=28,12;MFRL=132,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:3,0:6,0:0|1:44805802_T_TGC:44805802:4,7,5,0
chr7	44805815	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=34,35;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:4,3:7,1:0|1:44805802_T_TGC:44805802:5,7,5,0
chr7	44805818	.	CAG	C	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=33,12;MFRL=140,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,1:8,0:0|1:44805802_T_TGC:44805802:6,7,5,0
chr7	44805822	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=29,18;MFRL=140,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,1:8,0:0|1:44805802_T_TGC:44805802:6,9,3,0
chr7	44805827	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=27,22;MFRL=136,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,1:0|1:44805802_T_TGC:44805802:6,10,2,0
chr7	44805832	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=31,12;MFRL=130,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,0:0|1:44805802_T_TGC:44805802:8,10,2,0
chr7	44836431	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,0:10,0:0,12,0,2
chr7	44836438	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=175,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:2,3:8,0:0,11,0,4
chr7	44840864	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,12,10
chr7	44875043	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	44880684	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=62.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,1,16
chr7	45009762	.	G	GCTAATTCTCTCTCCTTCGCTTGTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=179,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.313:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr7	45010673	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45010673_A_AGT:45010673:0,1,0,1
chr7	45010674	.	C	CCCAAGCCGCCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45010673_A_AGT:45010673:0,1,0,1
chr7	45011221	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:2,1,5,0
chr7	45077978	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.479:27:8,5:5,7:4,10,8,5
chr7	45120658	.	T	TGGCGGGCGGGGGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0,6,2,0
chr7	45123919	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,13;MFRL=169,217;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,0:0,0:0|1:45123919_C_A:45123919:1,0,1,0
chr7	45123929	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=169,217;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,0:1,0:0|1:45123919_C_A:45123919:1,0,1,0
chr7	45123932	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=11,11;MFRL=169,217;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,0:0,0:0|1:45123919_C_A:45123919:1,0,1,0
chr7	45139892	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=210,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:2,5:3,0:5,0,4,1
chr7	45140965	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.324:22:9,3:6,3:3,12,2,5
chr7	45142145	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr7	45142834	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=200,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.609:10:0,1:2,5:4,0,6,0
chr7	45143090	.	G	GGACAGCC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:4,5:7,9:0|1:45143090_G_GGACAGCC:45143090:4,7,1,15
chr7	45143093	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.555:25:4,4:6,10:0|1:45143090_G_GGACAGCC:45143090:4,7,1,13
chr7	45143108	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:3,4:5,7:1,8,0,11
chr7	45144403	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=194,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr7	45148836	.	TG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.537:26:6,8:6,4:5,7,4,10
chr7	45697295	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=110,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0|1:45697295_C_G:45697295:3,1,4,1
chr7	45697297	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=110,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0|1:45697295_C_G:45697295:3,1,4,1
chr7	45697499	.	GGGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=213,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:45697499_GGGT_G:45697499:1,1,0,1
chr7	45697503	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,26;MFRL=213,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:45697499_GGGT_G:45697499:1,1,0,1
chr7	45719352	.	TGGTGGCCTGTGTCCTGTACCTGCACATCACCCGGGTCCAGGTATGTG	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.096:44:6,1:15,2:10,31,1,2
chr7	45725485	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=160,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr7	45743310	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,0:12,2:11,17,0,2
chr7	45743403	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr7	45744055	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr7	45747933	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.692:21:3,7:3,6:4,2,8,7
chr7	47331594	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.319:26:12,4:6,4:7,11,4,4
chr7	47408299	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=234,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr7	47436558	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,2,7
chr7	47451295	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,20,2
chr7	47467864	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr7	47479335	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr7	47835814	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	47840510	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr7	47853498	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr7	47859239	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:1,3:3,4,1,7
chr7	47869271	.	C	CACCCCCATCAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=175,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:47869271_C_CACCCCCATCAG:47869271:0,2,0,1
chr7	47869273	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=175,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:47869271_C_CACCCCCATCAG:47869271:0,2,0,1
chr7	47869751	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:0,7,2,5
chr7	47878993	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,11:4,2:8,0,13,0
chr7	47882843	.	T	TGCTCC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:0,1:0|1:47882843_T_TGCTCC:47882843:0,3,0,1
chr7	47882844	.	A	ACTGG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:47882843_T_TGCTCC:47882843:0,3,0,1
chr7	47882849	.	C	CATG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,1:0,0:0|1:47882849_C_CATG:47882849:0,1,0,1
chr7	47882851	.	T	TGTGTCTG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,14;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:47882849_C_CATG:47882849:0,1,0,1
chr7	47882854	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=21,29;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47882849_C_CATG:47882849:0,1,0,1
chr7	47882857	.	CAA	GTG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:47882849_C_CATG:47882849:0,1,0,1
chr7	47884555	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=154,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,2:9,3:12,3,4,1
chr7	47886707	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,5:2,4:0,6,0,9
chr7	47894810	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=153,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:6,16,0,2
chr7	47897511	.	A	ACAGGGTTTGAAGTGAATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=168,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	47904737	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,17,1
chr7	47943953	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr7	47947863	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr7	47976608	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,1:2,6:0,4,0,7
chr7	47979922	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=119,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.822:15:0,3:2,6:0,2,1,12
chr7	47988166	.	T	TAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=230,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	48005122	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	48017965	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,15,2
chr7	48017989	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr7	48018455	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=104.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,1,33
chr7	48028512	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr7	48089394	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr7	48237802	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,7,7
chr7	48266842	.	A	AT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,21:0.442:47:6,7:20,12:20,6,12,9
chr7	48312674	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,12,8
chr7	48314842	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:12,0:7,2:0|1:48314842_A_G:48314842:10,12,0,2
chr7	48314845	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:12,0:8,2:0|1:48314842_A_G:48314842:10,12,0,2
chr7	48317667	.	GTA	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:11,2:18,1:28,4,2,1
chr7	48335265	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr7	48412112	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.787:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr7	48431762	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,8:1,5:0,1,0,13
chr7	48443570	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	48450097	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr7	48450289	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=86.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,12:0,0,3,21
chr7	48451939	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,9,1
chr7	48452200	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,4,14
chr7	48467355	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.937:12:0,4:0,6:0,0,8,4
chr7	48506707	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,1:1,6:0,2,0,7
chr7	48506727	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,0:1,6:0,2,0,6
chr7	48511297	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	48520780	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.512:43:9,10:12,12:6,15,5,17
chr7	48520821	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:0,16,2,0
chr7	48522769	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.450:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr7	48522845	.	CA	GG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	48528732	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:5,0,6,0
chr7	48545879	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,8:1,2:3,1,8,2
chr7	48545976	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,16:0,0,13,15
chr7	48546011	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.475:30:9,6:5,8:6,10,5,9
chr7	48563752	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr7	48682996	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=212,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.606:31:9,9:3,10:1,11,6,13
chr7	48683028	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:7,1:11,2:0,18,0,3
chr7	48684185	.	CTTT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.236:17:8,2:4,2:12,1,4,0
chr7	50023122	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr7	50070921	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=203,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr7	50144059	.	T	TTA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=93,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.824:9:0,2:1,6:0,1,0,8
chr7	50191216	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,0,17
chr7	50198626	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,9:1,8:1,0,13,5
chr7	50537677	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:0,2:5,1:5,0,3,0
chr7	50537913	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=195,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50537913_A_C:50537913:0,1,0,1
chr7	50537915	.	A	ATTATTGATATATTAGGTATAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=195,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50537913_A_C:50537913:0,1,0,1
chr7	50595761	.	ATTTT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=T;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr7	50596864	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=124.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,20:0,20:0,0,35,6
chr7	50597056	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=132.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,23:0,18:0,0,5,37
chr7	50737384	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,8:0,0,9,3
chr7	50742118	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	50778698	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr7	50799889	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr7	51085127	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr7	51095669	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,1:5,1:3,12,1,1
chr7	51097063	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:9,9:6,8:6,9,5,12
chr7	51098567	.	GTCT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,5:5,6:5,6,3,8
chr7	51153024	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=211,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,1:4,4:0|1:51153024_GT_G:51153024:1,8,2,3
chr7	51153027	.	CAATCAAAGTACTTTGTACCTATGAAGTACAAAGA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=211,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,1:4,4:0|1:51153024_GT_G:51153024:1,8,2,3
chr7	51251900	.	G	GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:6,1:13,2:1,19,1,2
chr7	51258766	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,124;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:5,0:6,2:3,10,0,2
chr7	53103946	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:8,1:2,4:6,5,3,2
chr7	54614585	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=257,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	54614698	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr7	54618010	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	54621526	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,8:0,0,16,1
chr7	54819993	.	GA	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.439:36:12,6:6,9:19,1,15,1
chr7	54820186	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.552:16:4,3:3,5:1,6,0,9
chr7	55218903	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:2,4:2,1:4,0,5,1
chr7	55219159	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr7	55220177	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:11,2:5,3:16,0,5,0
chr7	55228053	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	55238268	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:0,8,1,5
chr7	55242609	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr7	55248926	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr7	55540791	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,6:6,7:0,13,2,11
chr7	55560207	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=195,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.533:11:1,2:4,4:0,5,0,6
chr7	55565264	.	CA	GG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=61,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:2,1:0|1:55565264_CA_GG:55565264:2,0,1,0
chr7	55565267	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,17;MFRL=173,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:55565264_CA_GG:55565264:4,0,1,0
chr7	55565268	.	GCTCT	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=173,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:55565264_CA_GG:55565264:4,0,1,0
chr7	55565273	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,17;MFRL=173,210;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:55565264_CA_GG:55565264:4,0,1,0
chr7	55910600	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,179;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr7	55914209	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:8,1,1,1
chr7	55991292	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,5,5
chr7	56021108	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=216,346;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56021108_G_A:56021108:0,1,0,1
chr7	56021110	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=216,346;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56021108_G_A:56021108:0,1,0,1
chr7	56022544	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr7	56052410	.	CAAA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56052410_CAAA_C:56052410:0,0,1,0
chr7	56052430	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,15;MFRL=221,222;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:56052410_CAAA_C:56052410:2,0,1,0
chr7	56079622	.	G	GAGACA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=243,210;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:56079622_G_GAGACA:56079622:0,4,0,1
chr7	56079637	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=211,210;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:56079622_G_GAGACA:56079622:0,3,0,1
chr7	56079657	.	GA	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=206,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.509:2:1,1:0,0:0|1:56079657_GA_AG:56079657:0,1,0,1
chr7	56079661	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=242,211;MMQ=47,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:56079657_GA_AG:56079657:0,1,0,1
chr7	56079662	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=242,211;MMQ=47,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56079657_GA_AG:56079657:0,1,0,1
chr7	56084856	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr7	56119730	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,7:0,0,0,16
chr7	56122058	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,13,8
chr7	56132122	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.953:20:0,7:0,5:0,0,2,18
chr7	56136393	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.714:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	56140633	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:4,0,1,0
chr7	56142519	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,0,19
chr7	56144699	.	A	ACACCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=210,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	56147589	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,1,16
chr7	56151526	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	56155219	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr7	56169419	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,11:0,0,10,8
chr7	56174115	.	A	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=190.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,26:0,31:0,0,21,36
chr7	56174140	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=135.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,22:0,19:0,0,9,34
chr7	57187502	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,147;MMQ=25,32;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,20:0.404:50:13,10:17,10:20,10,12,8
chr7	57188016	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,153;MMQ=60,25;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,28:0.507:55:11,14:15,12:16,11,19,9
chr7	57188362	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,185;MMQ=55,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:7,7:12,6:12,8,12,1
chr7	57188889	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=199,180;MMQ=31,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,8:5,3:1,10,0,11
chr7	57199906	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=85,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,2:8,6:10,3,8,0
chr7	63529807	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,15;MFRL=244,203;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:3,0,1,0
chr7	63537638	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=217,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.894:17:1,7:0,7:1,0,13,3
chr7	63538924	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:13,10:11,7:5,19,8,9
chr7	63673455	.	CT	C,CTT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,34,35;MFRL=140,171,139;MMQ=60,60,55;MPOS=22,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=11.48,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,7,4:0.183,0.099:40:11,3,3:17,4,1:21,8,9,2
chr7	63673608	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.513:43:12,11:8,11:2,19,1,21
chr7	63680401	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=141,210;MMQ=53,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,4:3,1:4,4,3,2
chr7	63720784	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=163,163;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=42.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:6,4:2,8:0|1:63720784_GT_G:63720784:1,7,0,12
chr7	63720786	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=163,163;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:6,4:2,8:0|1:63720784_GT_G:63720784:1,7,0,12
chr7	63726645	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.316:36:8,6:17,5:10,15,7,4
chr7	63726678	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:5,6:14,4:9,10,8,2
chr7	63726693	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=152,3098797;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:10,0:15,2:0|1:63726693_T_A:63726693:16,11,2,0
chr7	63726698	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=152,3098797;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:15,2:0|1:63726693_T_A:63726693:15,11,2,0
chr7	63726701	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=152,3098797;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:11,0:16,2:0|1:63726693_T_A:63726693:17,12,2,0
chr7	63726704	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=154,3098797;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:12,0:12,2:0|1:63726693_T_A:63726693:17,10,2,0
chr7	63982909	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=184,133;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.208:12:4,0:6,2:0|1:63982909_A_C:63982909:1,9,0,2
chr7	63982915	.	T	TTACACTACATACAAAAATCAACTCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=181,133;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,0:6,2:0|1:63982909_A_C:63982909:1,8,0,2
chr7	64004644	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.460:48:11,9:15,13:19,7,17,5
chr7	64004817	.	AACAC	A,AAC,AACACAC	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30,26,27;MFRL=167,135,153,146;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,29,3;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=AC;STR;TLOD=11.94,9.58,3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,6,5,4:0.250,0.252,0.204:21:2,2,3,1:4,4,2,3:0,6,1,14
chr7	64023371	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.503:34:6,9:10,8:5,12,1,16
chr7	64023437	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=158,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr7	64166642	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=211,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,1:6,7:12,0,7,1
chr7	64169016	.	T	TAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=142,101;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:64169016_T_TAAA:64169016:1,3,0,1
chr7	64169019	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=142,101;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:64169016_T_TAAA:64169016:1,3,0,1
chr7	64169021	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=101,101;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:64169016_T_TAAA:64169016:1,2,0,1
chr7	64275284	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr7	64275470	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:1,0:0,2:1,3,0,2
chr7	64275851	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr7	64276089	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,4,22
chr7	64291225	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr7	64291244	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=187,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr7	64291267	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr7	64438403	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,4,3
chr7	64439938	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr7	64441632	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=220,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:5,3,9,0
chr7	64852790	.	TTG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,2:11,1:19,3,3,0
chr7	65432943	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	65445166	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.696:8:1,1:1,0:0|1:65445166_A_C:65445166:1,1,6,0
chr7	65445171	.	T	TGGGGGGGGGGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,12;RU=G;STR;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.696:8:1,5:0,0:0|1:65445166_A_C:65445166:1,1,6,0
chr7	65445385	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.489:43:13,12:9,8:10,12,8,13
chr7	65541185	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,12:0,0,0,24
chr7	65552497	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr7	65552614	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr7	65554352	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,7,13
chr7	65554385	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr7	65556936	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	65599246	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,5:0,5:1,1,9,3
chr7	65599446	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr7	66094008	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr7	66098482	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	66147697	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,9,3
chr7	66262309	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=228,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.825:16:2,5:1,8:3,0,8,5
chr7	66416137	.	TTG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.344:10:2,2:5,1:4,3,1,2
chr7	66459145	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=171,191;MMQ=40,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr7	66474559	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:5,1:1,5:6,0,5,2
chr7	66474695	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,203;MMQ=52,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:7,3:1,3:3,5,3,3
chr7	66489794	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=184,212;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:4,0,1,0
chr7	66489798	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=184,206;MMQ=60,44;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:2,0:2,0:4,0,2,0
chr7	66520726	.	CA	C,CAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,33,33;MFRL=150,156,151;MMQ=60,60,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=8.16,12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,7:0.224,0.367:20:5,3,4:3,2,3:8,0,12,0
chr7	66532235	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=179,144;MMQ=51,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:6,2:0,2:6,0,3,1
chr7	66582460	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.428:28:7,5:8,7:15,1,9,3
chr7	66582700	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=194,192;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	66648030	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,180;MMQ=52,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	66660078	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=177,161;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,2:2,2:5,0,4,0
chr7	66703238	.	A	G,AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31,30;MFRL=0,182,152;MMQ=60,39,39;MPOS=12,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=27.68,30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,12:0.400,0.558:21:0,8,5:0,1,7:0,0,19,2
chr7	66773822	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=221,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr7	66773866	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,1:2,4:7,1,5,0
chr7	66774157	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,0,14
chr7	66774515	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=242,160;MMQ=58,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:2,3:0,2:3,0,6,0
chr7	66785029	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,9:0,18:0,0,11,17
chr7	69583231	.	TAAAA	T,TAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,28,10;MFRL=0,0,165;MMQ=60,60,60;MPOS=29,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,18,21;RU=A;STR;TLOD=6.33,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,5:0.259,0.511:11:1,2,2:1,1,0:1,2,5,3
chr7	70229685	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:7,10:5,6:12,0,16,0
chr7	70252185	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.420:39:14,8:6,8:19,4,11,5
chr7	70255594	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=173,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:1,1:1,0:2,1,2,1
chr7	70255597	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=173,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:2,0:3,2,2,0
chr7	70255600	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,1:2,0:2,2,3,0
chr7	70885883	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,8:0,2:0,0,8,2
chr7	70886107	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,3:0,0,2,5
chr7	71036473	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0|1:71036473_C_T:71036473:0,0,0,7
chr7	71036483	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:71036473_C_T:71036473:0,3,0,1
chr7	71036484	.	A	ATTTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:71036473_C_T:71036473:0,3,0,1
chr7	71036487	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:71036473_C_T:71036473:0,3,0,1
chr7	71142219	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,2:7,2:4,5,3,1
chr7	71142312	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=104,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:5,3:0,4:1,4,0,7
chr7	71176919	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr7	71177177	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	72081604	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=156,145;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,1:8,2:13,0,3,0
chr7	72081634	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=156,144;MMQ=60,37;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.219:21:7,1:8,3:15,2,4,0
chr7	72178842	.	G	GAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=192,240;MMQ=57,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:72178842_G_GAAA:72178842:0,4,0,1
chr7	72178845	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=192,240;MMQ=57,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:72178842_G_GAAA:72178842:0,4,0,1
chr7	72267637	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=218,218;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr7	72399048	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=156,189;MMQ=52,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.481:48:14,11:10,12:7,18,3,20
chr7	72412622	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=158,161;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.148:36:11,1:14,0:9,22,5,0
chr7	72413592	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,23:0.545:42:12,9:7,14:7,12,8,15
chr7	72413593	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=165,163;MMQ=60,33;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:19,2:20,1:14,25,1,2
chr7	72416333	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,2,16
chr7	72730669	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:2,0:2,6,0,2
chr7	72738350	.	C	CG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=100.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,13:0,0,25,4
chr7	72738749	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=178.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,45:0.979:45:0,19:0,22:0|1:72738749_A_G:72738749:0,0,24,21
chr7	72738762	.	CA	TG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,12:0,19:0|1:72738749_A_G:72738749:0,0,14,20
chr7	72742181	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr7	72755446	.	ACCCC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,4;RU=C;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	72891712	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:5,13,1,1
chr7	72891754	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,11:0,5:0,0,4,12
chr7	72922561	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=154,1002498;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:72922561_T_A:72922561:3,0,2,0
chr7	72922564	.	C	CGCTTACTTACCAAAGGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=154,1002498;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:72922561_T_A:72922561:3,0,2,0
chr7	72936066	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=179,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr7	73020447	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=162,22421681;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:3,6,0,2
chr7	73084309	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr7	73097082	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.267:27:6,2:14,4:15,5,5,2
chr7	73097713	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:2,5,5,4
chr7	73097919	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,3:7,10:10,3,7,6
chr7	73101137	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=220,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=116.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.949:37:1,22:0,14:1,0,9,27
chr7	73105144	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=207,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr7	73107003	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,4:3,7:0,7,4,8
chr7	73108205	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=220,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:4,2:3,2:5,2,5,0
chr7	73114645	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:3,0:4,3:7,0,4,0
chr7	73118196	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr7	73123529	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	73152796	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.633:28:7,4:3,14:1,9,1,17
chr7	73245519	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr7	73247066	.	T	TGACCAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=119,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:73247066_T_TGACCAG:73247066:1,1,0,1
chr7	73247071	.	GC	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73247066_T_TGACCAG:73247066:0,1,0,1
chr7	73254459	.	GTGT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,0:0,1:0,0,3,1
chr7	73254910	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,3:0,0,1,12
chr7	73275501	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,1:0,7:0,0,6,4
chr7	73275613	.	G	GAGCAGCCACTATTGCTCCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=90,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:1,2:3,0:0|1:73275613_G_GAGCAGCCACTATTGCTCCT:73275613:2,2,1,1
chr7	73275615	.	T	TTTCTAGG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=21,31;MFRL=90,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:2,0:0|1:73275613_G_GAGCAGCCACTATTGCTCCT:73275613:2,2,1,1
chr7	73275624	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=179,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.591:3:0,0:1,1:1,0,0,2
chr7	73279233	.	CAA	C,CAAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=145,144,182;MMQ=57,40,57;MPOS=31,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,16;RU=A;STR;TLOD=3.17,5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.225,0.472:4:0,0,2:1,1,0:1,0,3,0
chr7	73456850	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:3,1:4,0,2,0
chr7	73460923	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:73460923_G_A:73460923:3,0,1,0
chr7	73460929	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=37,31;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:73460923_G_A:73460923:3,0,1,0
chr7	73460930	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,0:0,1:1|0:73460923_G_A:73460923:3,0,1,0
chr7	73470782	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=99.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,17:0,12:0,0,6,25
chr7	73472050	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.418:43:13,7:12,10:10,15,7,11
chr7	73498254	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=25,17;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.315:7:2,0:2,0:0|1:73498254_T_G:73498254:5,0,2,0
chr7	73498260	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=15,12;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.315:7:2,0:0,0:0|1:73498254_T_G:73498254:5,0,2,0
chr7	73498270	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,17;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.315:7:1,0:2,0:0|1:73498254_T_G:73498254:5,0,2,0
chr7	73498282	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.599:8:1,2:0,2:0|1:73498282_CAG_C:73498282:2,1,5,0
chr7	73498288	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=35,12;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.599:8:2,1:1,1:0|1:73498282_CAG_C:73498282:2,1,5,0
chr7	73498294	.	CGCCGGG	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:1,1:0|1:73498282_CAG_C:73498282:3,3,4,0
chr7	73520550	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,1:9,1:12,11,0,2
chr7	73530046	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr7	73638550	.	AGGGTGGTCC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=180,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.505:2:0,1:1,0:0|1:73638550_AGGGTGGTCC_A:73638550:0,1,0,1
chr7	73638563	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,29;MFRL=180,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:73638550_AGGGTGGTCC_A:73638550:0,1,0,1
chr7	73654523	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr7	73666736	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,126;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,1:2,2:4,0,2,1
chr7	73752699	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr7	73774416	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	73790146	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	73803644	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=231,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,4:2,1:0,2,0,5
chr7	73922408	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=169,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,1:1,0:4,0,2,0
chr7	73973096	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,238;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	73974032	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:6,1:12,1:11,7,1,2
chr7	74015486	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,1:5,1:6,9,0,2
chr7	74016623	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,7:3,5:5,1,9,3
chr7	74105219	.	ATGT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.652:15:3,5:2,5:5,0,10,0
chr7	74114847	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:12,4:14,3:10,16,3,4
chr7	74115086	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=163,439734;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,0:14,3:3,25,3,0
chr7	74119495	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:8,2:1,0:8,1,1,1
chr7	74148250	.	A	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,479514;MMQ=25,22;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:26,4:22,0:27,21,4,0
chr7	74191707	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=194,156;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,1:11,3:9,11,0,4
chr7	74251390	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr7	74299790	.	C	CAAGAATAAACCAAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=198,212;MMQ=25,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:74299790_C_CAAGAATAAACCAAAT:74299790:1,1,0,1
chr7	74299792	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=198,212;MMQ=25,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:74299790_C_CAAGAATAAACCAAAT:74299790:1,1,0,1
chr7	74300240	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=237,220;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr7	74470190	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=196,191;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:3,3,0,5
chr7	74489486	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr7	74536855	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=158,171;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.563:4:2,0:0,0:2,0,2,0
chr7	74538878	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=178,156;MMQ=39,34;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.135:28:10,3:15,0:24,1,3,0
chr7	74554663	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=15,10;MFRL=180,202;MMQ=45,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.487:6:0,0:0,0:0|1:74554663_C_A:74554663:3,0,3,0
chr7	74554667	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=15,19;MFRL=180,183;MMQ=45,55;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.338:4:0,0:0,0:0|1:74554663_C_A:74554663:3,0,1,0
chr7	74554675	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=15,18;MFRL=195,183;MMQ=45,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.410:3:0,0:0,0:0|1:74554663_C_A:74554663:2,0,1,0
chr7	75048564	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=173,168;MMQ=52,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.624:27:6,7:3,9:10,0,16,1
chr7	75048750	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=146,170;MMQ=56,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:9,4:10,1:6,14,0,5
chr7	75048804	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=161,176;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,2:7,2:0,14,0,4
chr7	75052355	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=132,228;MMQ=27,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.348:12:3,1:0,0:0,8,0,4
chr7	75053572	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=181,189;MMQ=40,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:2,6:9,4:0,12,0,10
chr7	75055097	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,170;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,7:6,4:2,8,0,11
chr7	75070642	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=175,176;MMQ=52,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,4:8,1:11,3,4,1
chr7	75145411	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,22,4
chr7	75155143	.	GA	G,GAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33,34;MFRL=138,181,186;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=A;STR;TLOD=6.40,7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,4:0.216,0.260:17:5,2,1:3,2,1:9,0,8,0
chr7	75155300	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=155,180;MMQ=49,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,3:6,4:0,12,0,8
chr7	75168562	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:7,2:1,2:8,0,4,0
chr7	75172110	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	75174349	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:2,4,0,2
chr7	75176196	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,3:5,1:5,1,4,0
chr7	75176385	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:0,2:2,1:0,3,0,3
chr7	75182968	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=168,149;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75182968_C_A:75182968:0,1,0,1
chr7	75182974	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75182968_C_A:75182968:0,0,0,1
chr7	75183394	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:5,1:6,4:0|1:75183394_T_A:75183394:11,2,6,0
chr7	75183403	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:2,1:8,6:0|1:75183394_T_A:75183394:11,2,7,0
chr7	75185985	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,10,0
chr7	75191534	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.487:2:0,1:1,0:0|1:75191534_G_GC:75191534:0,1,0,1
chr7	75191535	.	T	TGGCCTGAAGAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.487:2:0,1:1,0:0|1:75191534_G_GC:75191534:0,1,0,1
chr7	75441108	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.549:18:5,8:1,2:0|1:75441108_C_T:75441108:4,4,7,3
chr7	75441111	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:7,5:1,2:0|1:75441108_C_T:75441108:4,4,5,3
chr7	75442759	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=19,29;MFRL=142,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:75442759_G_A:75442759:1,0,0,1
chr7	75442775	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=204,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:75442759_G_A:75442759:3,0,0,1
chr7	75442855	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=147,39775726;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.345:7:2,1:1,1:4,1,1,1
chr7	75513218	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=182,179;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:2,1:1,3:0,6,0,4
chr7	75608674	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	75608986	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,0:0,0,0,4
chr7	75610763	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,9,3
chr7	75612770	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0|1:75612770_C_G:75612770:0,0,13,1
chr7	75612783	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,6:0,12:0|1:75612770_C_G:75612770:0,0,16,3
chr7	75613998	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr7	75614029	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr7	75614082	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,19:0,9:0,0,22,6
chr7	75614863	.	TG	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr7	75616778	.	AC	TA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=80.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,12,7
chr7	75616817	.	GGACA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GACA;STR;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,7:0,2:0,0,8,2
chr7	75621661	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr7	75633209	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	75677430	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	75694345	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=61.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,0,18
chr7	75889376	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,0:0|1:75889376_T_G:75889376:0,0,1,0
chr7	75889382	.	GCGCGC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75889376_T_G:75889376:0,0,1,0
chr7	75890615	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75890615_C_CTG:75890615:0,0,0,1
chr7	75890618	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:75890615_C_CTG:75890615:0,0,0,1
chr7	75891018	.	T	TACCTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75891018_T_TACCTG:75891018:0,0,0,1
chr7	75891020	.	C	CTCGGCGATGCTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75891018_T_TACCTG:75891018:0,0,0,1
chr7	75891025	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75891018_T_TACCTG:75891018:0,0,0,1
chr7	75914934	.	G	GC	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=164.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,23:0,23:0,0,25,24
chr7	75915024	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:0,16,1,1
chr7	76023088	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr7	76023131	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,9,1
chr7	76058767	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=219,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:0,3:5,1:5,0,5,0
chr7	76069481	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=200,233;MMQ=57,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,1:15,1:0|1:76069481_G_A:76069481:21,2,2,0
chr7	76069486	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=201,233;MMQ=57,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,1:14,1:0|1:76069481_G_A:76069481:20,2,2,0
chr7	76069902	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=154,131;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.280:37:13,5:13,5:11,16,3,7
chr7	76069937	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=154,128;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.241:30:13,2:10,4:7,16,1,6
chr7	76071412	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,323;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	76112245	.	C	CTGGTA	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,55;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,2:0.045:65:27,2:26,0:0|1:76112245_C_CTGGTA:76112245:34,29,1,1
chr7	76112248	.	C	CCT	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=150,55;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,2:0.042:68:33,2:29,0:0|1:76112245_C_CTGGTA:76112245:36,30,1,1
chr7	76131517	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	76131586	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=211,213;MMQ=40,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:3,1,6,0
chr7	76131812	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:7,1:3,3:0,10,0,4
chr7	76132962	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,210;MMQ=46,21;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr7	76133863	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=215,216;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.357:11:3,1:4,1:0,7,0,4
chr7	76140449	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,151;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:5,0:8,4:0,14,0,4
chr7	76142536	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.600:21:1,5:7,5:2,6,3,10
chr7	76239480	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=162,149;MMQ=27,27;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:5,2:3,7:8,0,10,0
chr7	76239503	.	G	GC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=156,147;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.688:24:5,6:2,11:4,3,12,5
chr7	76241211	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=182,181;MMQ=57,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,2:5,1:1,11,0,5
chr7	76241216	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=176,199;MMQ=57,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,4:5,2:0,14,0,6
chr7	76254810	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,159;MMQ=52,30;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,20:0.436:46:15,8:9,10:17,9,16,4
chr7	76255032	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:5,3:9,12:1,13,1,14
chr7	76255452	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=157,147;MMQ=40,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:5,2:10,7:2,13,0,9
chr7	76255491	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=157,162;MMQ=40,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,2:7,3:1,8,0,5
chr7	76796958	.	T	G	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,247;MMQ=55,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,4:0.058:84:44,2:36,2:64,16,4,0
chr7	76828664	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,45;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:13,0:18,2:14,18,2,0
chr7	76883989	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=215,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr7	76916046	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr7	76922547	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	76922575	.	GCAA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:76922575_GCAA_G:76922575:0,0,0,3
chr7	76922581	.	CA	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:76922575_GCAA_G:76922575:0,0,0,3
chr7	76924216	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=227,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr7	76941289	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.554:23:3,5:7,5:2,8,2,11
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chr7	76942959	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=213,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr7	76958730	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=144.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,26:0,15:0,0,18,24
chr7	76984752	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.543:19:3,2:4,7:3,6,1,9
chr7	76990126	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:10,1:8,5:14,4,5,1
chr7	76992013	.	A	G,T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34,30;MFRL=169,154,154;MMQ=60,60,60;MPOS=4,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=27.84,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,9,2:0.417,0.125:21:5,3,1:5,6,1:1,9,0,11
chr7	77006717	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr7	77010709	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,1:2,6:0,6,0,7
chr7	77026460	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=179,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:1,1,3,4
chr7	77035392	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=165.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.981:47:0,19:0,27:0,0,34,13
chr7	77261820	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr7	77469472	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,5:2,3:6,0,8,0
chr7	77539744	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,1,14
chr7	77558586	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:24,0:23,3:20,27,0,3
chr7	77567008	.	AT	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,1:9,2:20,4,3,0
chr7	77584159	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:8,1:9,2:13,10,0,3
chr7	77755197	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=127,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:0|1:77755197_A_G:77755197:0,3,0,7
chr7	77755231	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=198,236;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:77755197_A_G:77755197:0,4,0,1
chr7	77756580	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,9:0,10:0,0,4,17
chr7	77762457	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	77764591	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,1:0,7:0,0,0,9
chr7	78118982	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,2:2,2:6,1,4,0
chr7	78119199	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:3,2:2,8:2,4,1,10
chr7	78119221	.	G	GA,GAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,19,16;MFRL=0,141,159;MMQ=60,60,60;MPOS=19,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=A;STR;TLOD=13.08,5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,4:0.513,0.408:9:0,2,0:0,0,0:0,0,0,9
chr7	78130801	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:78130801_C_CT:78130801:3,0,4,0
chr7	78130811	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.251:10:5,0:3,2:1|0:78130801_C_CT:78130801:8,0,2,0
chr7	78130823	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=23,18;MFRL=183,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:0,0:3,0:0|1:78130801_C_CT:78130801:6,0,3,0
chr7	78130827	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=23,13;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:0,0:3,0:0|1:78130801_C_CT:78130801:8,0,3,0
chr7	78130834	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=186,176;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:5,0:0|1:78130801_C_CT:78130801:8,1,2,0
chr7	78256342	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	78256643	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	79828450	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr7	79840212	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,1:1,3:3,1,5,0
chr7	79841954	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr7	80118004	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:0,7,1,6
chr7	80123999	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:8,11:4,6:6,6,6,11
chr7	80124051	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.493:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr7	80141069	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	80290369	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:1,7:0,7:0,1,9,5
chr7	80378148	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=59.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,16,0
chr7	80378175	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=104.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,18:0,11:0,0,26,4
chr7	80387630	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,0:6,2:18,3,1,1
chr7	80456708	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:4,5:3,2:7,0,6,2
chr7	80456716	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,5:3,2:7,0,7,2
chr7	80456841	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.502:42:7,13:12,8:6,15,5,16
chr7	81346685	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,3,12
chr7	81350208	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=60.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr7	81350223	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr7	81359116	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,36;MFRL=267,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,2:0,4:0,1,0,6
chr7	81372156	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	81374500	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.860:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr7	81381326	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	81591409	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=193,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,5:5,4:0,6,1,8
chr7	81591826	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:10,1:9,2:1,25,1,2
chr7	81593454	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,6:7,4:5,9,3,7
chr7	81596813	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr7	81612686	.	CA	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:11,0:12,3:7,22,0,3
chr7	81634822	.	GAA	G,GA,CAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,16,16,19;MFRL=144,156,147,136;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,23,21;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.79,5.23,4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,6,5:0.118,0.190,0.181:24:5,0,0,1:1,0,0,0:6,4,0,14
chr7	81641570	.	GA	G,GAAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=16,32,26;MFRL=181,182,67;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,16;RU=A;STR;TLOD=3.50,11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.250,0.405:9:0,2,0:1,0,1:0,3,0,6
chr7	81642949	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,0,18
chr7	81964578	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=197,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.589:9:1,0:1,1:1,3,0,5
chr7	82072605	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=15,12;MFRL=240,219;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:0,0:0,0:0|1:82072605_A_C:82072605:3,0,1,0
chr7	82072612	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=240,219;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,0:1,0:0|1:82072605_A_C:82072605:3,0,1,0
chr7	82072617	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=12,12;MFRL=240,219;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:0,0:0,0:0|1:82072605_A_C:82072605:3,0,1,0
chr7	82390034	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=133,223;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:34,0:19,3:24,29,0,3
chr7	82475786	.	TTA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr7	82545468	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:13,1:5,1:14,4,2,0
chr7	82579645	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:7,3,1,1
chr7	82581488	.	T	TTCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCA;STR;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr7	82583707	.	CA	TT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:15,0:23,4:22,19,0,4
chr7	82763534	.	AATAT	A,AATATAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29,28;MFRL=194,311,192;MMQ=60,60,60;MPOS=9,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=AT;STR;TLOD=3.08,8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,3:0.222,0.522:5:0,1,1:1,0,2:1,0,4,0
chr7	82784017	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr7	82784460	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=192,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.195:13:4,0:4,0:0|1:82784460_G_A:82784460:10,1,2,0
chr7	82784468	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=191,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:4,0:6,0:0|1:82784460_G_A:82784460:11,1,2,0
chr7	82784471	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=15,11;MFRL=191,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:2,0:3,0:0|1:82784460_G_A:82784460:11,1,2,0
chr7	82996831	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr7	82997353	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=163,261;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,0:10,3:1,15,0,3
chr7	83021799	.	TAAAA	T,TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27,28;MFRL=0,196,170;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.12,6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.299,0.578:5:0,1,3:0,1,0:0,0,5,0
chr7	83023587	.	TAC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,3:0,4:0,0,4,5
chr7	83026100	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	83026140	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=196,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	83029280	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,22,2
chr7	83029639	.	A	C,T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28,30;MFRL=0,171,166;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=22.24,10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,4:0.600,0.333:12:0,3,2:0,5,2:0,0,0,12
chr7	83031907	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=57.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,13,3
chr7	83032187	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	83034899	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr7	83035177	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr7	83036367	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr7	83036602	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	83047666	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,17,5
chr7	83096015	.	T	TCATTTTCTTATAAATCCTTTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=250,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	83098696	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr7	83098714	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.808:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	83277699	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=139,191,161;MMQ=60,60,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.96,8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,5:0.248,0.375:13:2,1,3:3,1,2:5,0,8,0
chr7	83590763	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=134,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:21,0:17,2:14,27,1,1
chr7	83606353	.	T	TGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GA;STR;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr7	83614801	.	AG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:2,7:7,10:6,4,8,9
chr7	83739762	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:1,4:3,6:3,1,8,2
chr7	83823737	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:1,3:5,1:0|1:83823737_AG_A:83823737:6,2,5,0
chr7	83823739	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,8:0.562:14:5,2:1,6:1|0:83823737_AG_A:83823737:6,0,6,2
chr7	84644346	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:7,0,3,2
chr7	84647477	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.415:15:3,3:5,3:7,2,5,1
chr7	84751259	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=192,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:3,2:0,7,0,2
chr7	86544248	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=192,222;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr7	86556231	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=185,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:0,1:0|1:86556231_G_C:86556231:0,1,0,1
chr7	86556243	.	A	ATTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=185,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:86556231_G_C:86556231:0,2,0,1
chr7	86571235	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	86594379	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=85.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0,0,7,16
chr7	86594383	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,5:5,6:3,5,3,8
chr7	86594423	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr7	86795739	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=172,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,3:5,0:14,0,3,0
chr7	86795947	.	TAG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=51.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.557:25:2,5:9,8:3,8,2,12
chr7	86800440	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,5:4,5:1,8,3,7
chr7	86803994	.	T	TG	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=40.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:12,2:9,13:4,18,0,15
chr7	86811525	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.449:27:6,6:9,6:12,3,11,1
chr7	86823474	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=37,35;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86823474_CAG_C:86823474:0,1,0,1
chr7	86823478	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86823474_CAG_C:86823474:0,1,0,1
chr7	86823479	.	TGGGA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86823474_CAG_C:86823474:0,1,0,1
chr7	86823484	.	A	ATTGTCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86823474_CAG_C:86823474:0,1,0,1
chr7	86823495	.	GAA	TCT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	86978347	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.593:35:7,12:7,8:14,0,19,2
chr7	86998842	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:9,4:6,0:1,14,0,4
chr7	87005287	.	C	CT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.533:19:3,5:4,4:2,7,2,8
chr7	87006567	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=212,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.612:11:1,4:3,2:4,0,7,0
chr7	87006852	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=240,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,4:2,4:0,3,0,9
chr7	87011349	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.465:30:3,6:13,7:9,7,8,6
chr7	87022024	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,7:2,4:4,4,5,6
chr7	87032613	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:4,4:5,5:0,9,1,9
chr7	87049216	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,112;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:9,1,2,0
chr7	87053150	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	87053206	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr7	87069758	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	87082511	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=146,131;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr7	87138511	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	87138623	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,2:12,0:18,4,2,0
chr7	87138645	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.549:31:8,10:5,7:8,6,11,6
chr7	87168749	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr7	87174066	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=170,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr7	87178626	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,6:2,6:6,0,13,0
chr7	87179086	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=22861495,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr7	87179143	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:3,4:2,6:5,0,10,1
chr7	87180198	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr7	87195366	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,3:10,0:17,3,3,0
chr7	87516629	.	CT	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.126:39:15,1:17,4:31,3,4,1
chr7	87517319	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,5:0.093:62:21,5:35,0:36,21,5,0
chr7	87533792	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,0:3,2:0,7,0,3
chr7	87533820	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=184,161;MMQ=40,35;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:0,1:0|1:87533820_T_C:87533820:0,4,0,2
chr7	87533822	.	A	AGAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=184,161;MMQ=40,35;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,1:0,0:0|1:87533820_T_C:87533820:0,4,0,2
chr7	87564277	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:2,3:3,4:5,0,6,2
chr7	87746231	.	T	TTTCCAAACTCATCTGTGAGGACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	87757916	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:9,1:18,1:14,13,2,0
chr7	87765342	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=168,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:16,0:3,3:5,14,0,3
chr7	87780704	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:4,2:2,2:1,5,1,4
chr7	87785405	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	87800808	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.525:21:7,6:3,5:4,6,5,6
chr7	87810955	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:7,6:2,4:1,8,0,10
chr7	87825689	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,3:5,5:8,1,8,0
chr7	87840158	.	G	GA	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=59.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,29:0.532:54:14,17:11,12:18,7,22,7
chr7	87911901	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,4:0,2:1,2,6,0
chr7	87912580	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=221,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	88389420	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,1:5,7:0,6,1,7
chr7	88423414	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr7	88424365	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=149,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,1:2,5:1,6,0,6
chr7	88424426	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=218,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr7	88847369	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,2:1,5:3,0,7,0
chr7	88847450	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:2,3:1,3,7,2
chr7	88847451	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.924:12:0,7:0,4:0,0,7,5
chr7	88847453	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:1,3,7,2
chr7	88965287	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:13,0:14,3:6,21,0,3
chr7	89792250	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,11:0,0,19,4
chr7	89861942	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr7	89867369	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,30:0.705:42:4,16:8,14:11,1,25,5
chr7	89887524	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:7,5:1,2:0,8,0,8
chr7	89897703	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,5:2,4:2,6,1,8
chr7	89901039	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,7:0,0,13,8
chr7	89903247	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:17,0:11,2:23,7,2,0
chr7	89903250	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.618:32:5,13:7,7:9,3,16,4
chr7	89927191	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,11:0,0,6,12
chr7	89929110	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,6:3,1:5,0,7,0
chr7	89937027	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.697:8:1,2:1,3:2,0,6,0
chr7	89937210	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=210,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr7	89976137	.	GTTC	G	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTC;STR;TLOD=95.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,28:0.377:75:16,14:27,13:11,36,9,19
chr7	89982116	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,1:5,2:13,0,3,0
chr7	89982132	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,6:5,5:10,0,8,3
chr7	90003510	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=207,166;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:14,2:3,0:16,1,2,0
chr7	90014111	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=232,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr7	90043684	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,0:9,2:3,13,1,1
chr7	90225928	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,4:0,0,11,3
chr7	90233618	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=46.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,3:0,11:0,0,4,11
chr7	90339084	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,2:4,1:11,1,3,0
chr7	90356175	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:0,4,1,7
chr7	90547119	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr7	90747315	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr7	90896831	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.335:43:14,8:14,6:11,18,8,6
chr7	90898289	.	CAA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:3,6:9,4:4,9,1,9
chr7	90899358	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:41,0:18,3:29,30,3,0
chr7	91570290	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:6,0,6,0
chr7	91622238	.	GGAGCACAAGACAGTCCGACTCATCTAGAGATGATGGAAAGTGAGTTGGCTGGGAAGCAGCATGAGATTGAAGAGCTAAACAGA	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.079:40:8,2:6,0:18,17,4,1
chr7	91622464	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:1,7,0,2
chr7	91624823	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=224,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr7	91652178	.	A	AAAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,6:5,0:7,1,4,2
chr7	91659150	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:7,7:1,4:8,0,11,0
chr7	91667692	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:7,7:1,3:7,1,10,1
chr7	91669979	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:6,2:1,0:8,3,2,0
chr7	91674302	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:3,6:1,2:4,1,8,0
chr7	91700120	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=169,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.763:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr7	91700143	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=184,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.332:9:5,0:0,0:6,0,3,0
chr7	91700153	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=170,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.247:17:8,1:4,0:13,0,4,0
chr7	91707197	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,1:1,2:1,6,0,3
chr7	91711791	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.623:14:1,5:4,4:5,0,9,0
chr7	91713016	.	TA	T,AA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31,28;MFRL=0,167,185;MMQ=60,60,60;MPOS=13,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.51,18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,6:0.250,0.660:8:0,1,3:0,1,3:0,0,0,8
chr7	91713018	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:4,1:0,7,0,2
chr7	91714092	.	AT	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.180:38:11,2:11,4:17,14,2,5
chr7	91725931	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=197,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,1:7,2:10,0,3,0
chr7	91726927	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.489:43:11,8:10,13:10,12,12,9
chr7	91727385	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:5,3,2,1
chr7	91735145	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr7	91736794	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr7	91748026	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=179,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:91748026_T_C:91748026:0,1,0,2
chr7	91748032	.	C	CCTGGGCAACACGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=195,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:91748026_T_C:91748026:0,2,0,2
chr7	91752690	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:9,6:7,8:0,16,0,14
chr7	91756965	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:20,1:18,2:9,30,0,3
chr7	91758111	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,6:4,6:8,1,12,0
chr7	91758422	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=192,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,3:2,2:0,10,0,5
chr7	91761050	.	GT	G,GTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35,33;MFRL=215,184,161;MMQ=60,60,60;MPOS=15,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.42,9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,6:0.183,0.332:18:4,1,2:3,2,3:7,2,8,1
chr7	91779971	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:1,5,1,4
chr7	91779999	.	C	CATCTTCA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=175,107;MMQ=60,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.277:7:3,1:1,1:1,4,1,1
chr7	91842532	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,2:7,0:12,8,2,0
chr7	91855923	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.346:47:15,8:16,8:23,8,11,5
chr7	91863700	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,6:4,4:8,0,10,0
chr7	91864325	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=180,241;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:91864325_A_G:91864325:0,2,0,1
chr7	91864328	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=180,241;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:91864325_A_G:91864325:0,2,0,1
chr7	91864336	.	AT	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=190,241;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:91864325_A_G:91864325:0,1,0,1
chr7	91937044	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=193,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr7	92020452	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,0:12,4:17,2,4,0
chr7	92020670	.	G	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.075:65:32,0:27,4:25,36,0,4
chr7	92027187	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=190,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr7	92028028	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:8,6:7,3:9,6,7,2
chr7	92028039	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=124,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.411:22:8,6:5,2:8,5,6,3
chr7	92099837	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,4;MMQ=60,29;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	92119284	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr7	92129161	.	CAA	C,CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26,33;MFRL=0,164,120;MMQ=60,60,60;MPOS=25,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=5.13,9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.271,0.626:6:0,1,1:0,0,2:0,0,1,5
chr7	92140455	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.314:10:2,1:3,2:0,7,0,3
chr7	92147584	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=190.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,24:0,33:0,0,10,48
chr7	92166146	.	CT	C,CTT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,29,28;MFRL=160,137,164;MMQ=60,60,60;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=12.26,6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,7,4:0.186,0.119:38:7,3,1:18,4,2:24,3,10,1
chr7	92166306	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.130:44:23,0:14,5:0|1:92166306_G_T:92166306:6,33,0,5
chr7	92166307	.	C	CTT	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.130:44:24,0:14,5:0|1:92166306_G_T:92166306:6,33,0,5
chr7	92166308	.	C	CTATT	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.130:44:24,0:15,2:0|1:92166306_G_T:92166306:6,33,0,5
chr7	92166310	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:21,0:14,2:0|1:92166306_G_T:92166306:6,33,0,2
chr7	92166313	.	A	ATCTCACT	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=25,22;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:18,0:12,1:0|1:92166306_G_T:92166306:2,29,0,2
chr7	92166318	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:17,0:13,2:0|1:92166306_G_T:92166306:1,29,0,2
chr7	92733679	.	C	CTGTTAGAGAAGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=188,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,2:7,0:0|1:92733679_C_CTGTTAGAGAAGG:92733679:4,12,0,2
chr7	92733681	.	C	CAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=188,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,1:7,0:0|1:92733679_C_CTGTTAGAGAAGG:92733679:4,12,0,2
chr7	92760954	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:12,2:11,0:11,12,2,0
chr7	92761545	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:15,0:14,4:17,12,0,4
chr7	92826772	.	A	AT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.125:50:25,1:19,4:23,21,3,3
chr7	92845058	.	T	TTGTGTCCTCAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=205,237;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	92900512	.	GT	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:9,3:9,3:20,2,6,0
chr7	92938116	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:8,2,6,1
chr7	92978194	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92978194_G_A:92978194:0,1,0,1
chr7	92978198	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92978194_G_A:92978194:0,1,0,1
chr7	92978202	.	TA	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92978194_G_A:92978194:0,1,0,1
chr7	92978207	.	G	GTCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=184,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:92978194_G_A:92978194:0,2,0,1
chr7	93067334	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,0:7,5:9,2,2,3
chr7	93073147	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=223,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:1,4,0,3
chr7	93540255	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.606:23:0,4:8,10:0,9,2,12
chr7	93551428	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:8,13:12,7:15,6,15,7
chr7	93551606	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,6:5,6:0,12,0,12
chr7	93555311	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr7	94027043	.	C	CT	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,5:0.085:67:24,2:36,3:15,47,3,2
chr7	94030856	.	AT	A,ATT	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=31,33,31;MFRL=173,124,171;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.03,6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:38,9,6:0.158,0.125:53:15,7,3:21,2,3:34,4,13,2
chr7	94039032	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=151.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,47:0.980:47:0,27:0,20:0|1:94039032_C_T:94039032:0,0,34,13
chr7	94039043	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=162,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:22,3:20,0:0|1:94039032_C_T:94039032:34,9,2,1
chr7	94039187	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=117.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,18:0,16:0,0,9,26
chr7	94039900	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,8:0,0,0,17
chr7	94040133	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,16,2
chr7	94041298	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr7	94047903	.	AT	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=67.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.967:24:0,13:0,10:0,0,2,22
chr7	94055885	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,16:0,0,1,24
chr7	94056216	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr7	94056244	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,4:0,0,14,1
chr7	94056251	.	GAA	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,4:0,0,10,1
chr7	94058410	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:94058410_C_CT:94058410:0,0,5,2
chr7	94058420	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,15;MFRL=844,166;MMQ=32,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.669:4:0,0:1,1:0|1:94058410_C_CT:94058410:0,1,2,1
chr7	94146975	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,11,15
chr7	94157585	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,4:0,6:0,0,0,11
chr7	94174854	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:0,13:1,9:1,0,14,8
chr7	94175061	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=174,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr7	94175073	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	94178749	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0|1:94178749_T_C:94178749:0,0,10,0
chr7	94178761	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0|1:94178749_T_C:94178749:0,0,11,0
chr7	94217190	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,2,13
chr7	94247971	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr7	94252752	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=83.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,14:0,0,3,21
chr7	94292784	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:94292784_A_C:94292784:1,0,1,0
chr7	94292790	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,10;MFRL=90,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:94292784_A_C:94292784:2,0,1,0
chr7	94292793	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,10;MFRL=90,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:94292784_A_C:94292784:2,0,1,0
chr7	94292796	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,10;MFRL=90,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:94292784_A_C:94292784:2,0,1,0
chr7	94293474	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,5:0,0,10,12
chr7	94293521	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=186,144;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:1,11,3,0
chr7	94297293	.	GT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=58.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,7:0,12:0,0,16,4
chr7	94298237	.	TACAG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAG;STR;TLOD=60.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr7	95054007	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	95125050	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	95165847	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr7	95216262	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=60.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr7	95216421	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,7:0,0,6,15
chr7	95217194	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:1,3:3,7:0,5,0,11
chr7	95221269	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=181.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,27:0,31:0,0,39,20
chr7	95221927	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr7	95442690	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.457:11:2,5:1,0:0,6,1,4
chr7	95616309	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr7	95625189	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr7	95657456	.	ATC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.259:17:4,3:7,1:11,2,3,1
chr7	95709602	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr7	95709666	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,24,4
chr7	95818835	.	C	CCCTCTCCTCGTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:5,1,0,2
chr7	95864108	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=133.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,12:0,24:0,0,30,6
chr7	96338929	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,18,1
chr7	96635363	.	GGCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCA;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1,2,2,0
chr7	96651406	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr7	97483918	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=124,0;MMQ=60,43;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:18,1:19,2:17,20,1,2
chr7	97488146	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=221,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=93.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,33:0.938:35:0,14:1,17:1,1,28,5
chr7	97498535	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr7	97617793	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=157,133;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:9,15,0,2
chr7	97784061	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:8,3:9,0:15,3,3,0
chr7	97816327	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,5:3,5:1,5,1,9
chr7	97834704	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=201,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr7	97846856	.	CGAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,1:3,3:1,4,2,3
chr7	97851109	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,1,30
chr7	97852899	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr7	97853144	.	G	GTCTGGAAAACTGTCAGAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	97874143	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,259;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr7	97911618	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,2:5,9:8,1,9,2
chr7	97920623	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,13:0,6:0,0,1,18
chr7	97921834	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:9,0,6,1
chr7	97922773	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:6,7:9,7:13,2,11,4
chr7	97935671	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=221,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr7	97937258	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,5:2,0:0,2,1,4
chr7	97939971	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=193,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:97939971_G_T:97939971:0,3,0,1
chr7	97939989	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=214,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:97939971_G_T:97939971:0,2,0,1
chr7	97939992	.	A	ATTCCCCTTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=235,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97939971_G_T:97939971:0,1,0,1
chr7	97939994	.	T	TTCG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=235,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97939971_G_T:97939971:0,1,0,1
chr7	97944744	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.487:21:2,5:7,5:8,3,6,4
chr7	97944933	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:3,2:3,5:0|1:97944933_A_AT:97944933:1,5,1,7
chr7	97944935	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:1,2:3,6:0|1:97944933_A_AT:97944933:1,6,1,7
chr7	97944937	.	A	ATAAT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:3,1:4,6:0|1:97944933_A_AT:97944933:1,6,1,8
chr7	97944986	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=193,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr7	97946450	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,1:1,7:7,0,8,0
chr7	97991792	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.420:22:2,5:10,4:0,13,0,9
chr7	98460824	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr7	98495299	.	G	GTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=T;STR;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.889:6:0,5:0,1:0|1:98495299_G_GTT:98495299:0,0,6,0
chr7	98495304	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0|1:98495299_G_GTT:98495299:0,0,9,1
chr7	98500956	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr7	98503707	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr7	98513300	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr7	98535485	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:98535485_A_G:98535485:0,0,0,1
chr7	98535488	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:98535485_A_G:98535485:0,0,0,1
chr7	98548682	.	C	CTGTGTGTGTG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,22;RU=TG;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.735:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	98553739	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr7	98558880	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr7	98574459	.	A	AAGTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=238,260;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	98586508	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:14,0:21,2:17,18,0,2
chr7	98592528	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:98592528_C_A:98592528:0,1,0,1
chr7	98592530	.	G	GACTGTATCTTTGGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:98592528_C_A:98592528:0,1,0,1
chr7	98608606	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=133,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,7:6,2:11,1,8,1
chr7	98630675	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:19,2:26,1:26,19,1,2
chr7	98645517	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:3,4:0,7,1,4
chr7	98645565	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr7	98648517	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=116,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.691:17:3,6:2,6:5,0,12,0
chr7	98650099	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=197,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:1,7,0,6
chr7	98658130	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0|1:98658130_CT_C:98658130:2,0,3,0
chr7	98658144	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,0:2,0:1,1,4,0
chr7	98658146	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=16,19;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:0,0:2,0:1|0:98658130_CT_C:98658130:4,1,2,0
chr7	98779406	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=147,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:98779406_C_T:98779406:4,0,1,0
chr7	98779408	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=147,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:98779406_C_T:98779406:4,0,1,0
chr7	98931105	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=207,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr7	98961068	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr7	98961298	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	98961312	.	TT	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr7	98984213	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr7	98984354	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,1:4,4:4,3,3,2
chr7	98990236	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	98991944	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=117,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr7	98995724	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	99014984	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,2:4,6:4,1,6,2
chr7	99017737	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:4,5:3,3:0,7,1,8
chr7	99023246	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,3:2,6,1,6
chr7	99026684	.	AC	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=213,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:4,0,1,0
chr7	99032517	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.603:30:6,11:4,7:6,6,10,8
chr7	99032604	.	TCTC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=193,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTC;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:2,10,1,1
chr7	99047978	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.437:26:7,3:5,8:5,10,4,7
chr7	99048011	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:6,2:10,1:5,12,1,2
chr7	99048432	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=206,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:0,4,0,6
chr7	99050039	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:5,2:5,6:6,4,1,8
chr7	99055940	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=131,181;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.420:22:6,3:6,6:9,4,9,0
chr7	99056099	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=206,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr7	99057701	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:8,5:10,8:14,4,10,3
chr7	99081595	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:8,0,6,2
chr7	99091599	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.386:39:16,8:6,5:9,15,9,6
chr7	99097225	.	C	CCG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=224,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr7	99128659	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=190,181;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:4,1:3,1:8,0,1,1
chr7	99217424	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.488:47:12,10:11,11:14,10,14,9
chr7	99227172	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.406:25:9,5:6,5:6,9,5,5
chr7	99245914	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:8,6:10,10:9,9,11,5
chr7	99272310	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:0,4,0,6
chr7	99303094	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,6:2,2:6,3,6,2
chr7	99306566	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=230,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr7	99314986	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,8:4,3:2,7,0,11
chr7	99315276	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.686:23:3,11:3,4:2,5,7,9
chr7	99328756	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,87;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:22,0:19,5:20,22,0,5
chr7	99361466	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:14,5:2,1:10,6,4,2
chr7	99365943	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,20,2
chr7	99447359	.	C	CTCTCTCTCTCTCTGTCTTTGTCTTTCT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:0|1:99447359_C_CTCTCTCTCTCTCTGTCTTTGTCTTTCT:99447359:0,6,0,3
chr7	99447360	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:1,1:5,0:0|1:99447359_C_CTCTCTCTCTCTCTGTCTTTGTCTTTCT:99447359:0,6,0,3
chr7	99459144	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	99473624	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	99501313	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr7	99507339	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=157,235;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:3,0:4,0:0,8,0,4
chr7	99507351	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=208,256;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.403:8:2,2:3,1:0|1:99507351_TG_T:99507351:0,5,0,3
chr7	99507354	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=174,256;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.447:7:0,1:2,0:0|1:99507351_TG_T:99507351:0,4,0,3
chr7	99507355	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=256,176;MMQ=40,50;MPOS=-1073741810;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr7	99507376	.	G	GGTGACTTATACTTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=168,256;MMQ=40,24;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr7	99514417	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=112.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,17:0,0,7,25
chr7	99521195	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=155,71;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:18,0:15,4:20,15,1,3
chr7	99631809	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99631809_A_AG:99631809:0,0,0,1
chr7	99631817	.	GT	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99631809_A_AG:99631809:0,0,0,1
chr7	99662511	.	GTAGT	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.488:35:9,11:6,5:5,13,5,12
chr7	99687972	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:3,1:4,1:6,2,2,1
chr7	99691740	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,8:2,2:3,1,9,1
chr7	99693337	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	99694835	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr7	99696370	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr7	99699626	.	T	C	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,41:0.510:84:12,26:12,15:10,33,10,31
chr7	99701176	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,0:7,9:6,7,6,3
chr7	99701640	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,4:5,2:6,1,6,0
chr7	99703958	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:2,2,1,3
chr7	99704796	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.352:9:4,2:1,0:6,0,3,0
chr7	99704827	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:3,1,7,0
chr7	99706262	.	G	GTCCCAGTGATTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=277,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	99707712	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=137,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.326:22:6,3:8,3:9,6,3,4
chr7	99707950	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,1:6,2:0,6,0,3
chr7	99709952	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,229;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:1,9,0,2
chr7	99710584	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr7	99710619	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=169,251;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:2,0:3,1:0,5,0,1
chr7	99711461	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:1,0:1,1,2,2
chr7	99722266	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:4,3:4,4:6,4,3,4
chr7	99751521	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.480:29:8,8:7,5:10,5,9,5
chr7	99752934	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,1:5,1:7,6,0,2
chr7	99753121	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:1,1:6,3:1,7,1,3
chr7	99767773	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=199,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:7,0,7,0
chr7	99779880	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=173,150;MMQ=53,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:99779880_G_A:99779880:0,4,0,1
chr7	99779886	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=150,173;MMQ=40,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr7	99779887	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=173,150;MMQ=53,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:99779880_G_A:99779880:0,4,0,1
chr7	99779893	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=173,150;MMQ=53,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:99779880_G_A:99779880:0,4,0,1
chr7	99779896	.	GG	TG,CA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,32,33;MFRL=173,150,139;MMQ=60,40,46;MPOS=1,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,1:2,1,0:0,2,0,2
chr7	99779899	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,30;MFRL=171,139;MMQ=60,46;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr7	99780282	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,6:3,3:9,1,9,0
chr7	99796072	.	T	C	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=121,170;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=158.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,51:0.473:108:30,25:27,26:37,20,42,9
chr7	99796831	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=175,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,2:8,1:14,4,3,0
chr7	99797031	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.544:46:14,13:6,12:3,18,6,19
chr7	99797792	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr7	99802812	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,5:4,5:1,4,5,5
chr7	99811313	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=188,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:5,0,4,0
chr7	99811464	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.512:33:10,6:6,10:8,8,11,6
chr7	99818137	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=190,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,0:6,8:3,5,2,6
chr7	99821381	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.559:43:9,15:9,9:6,13,10,14
chr7	99821470	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=144,169;MMQ=60,41;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,31:0.526:59:12,18:15,13:18,10,20,11
chr7	99956666	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=192,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,1:12,1:1,18,0,2
chr7	99996919	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=102,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:5,2:6,5:3,8,1,7
chr7	100004446	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr7	100006965	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,4,1
chr7	100082918	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,13;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.324:12:4,0:1,0:4,4,4,0
chr7	100146572	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:4,4,2,6
chr7	100147928	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=192,176;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=25,27;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr7	100160094	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=235,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:0,3:1,2,3,2
chr7	100160119	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=235,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,3:0,2:1,2,5,1
chr7	100173481	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=205,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr7	100180060	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=208,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr7	100192034	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=160,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:3,2:0|1:100192034_G_C:100192034:7,1,1,1
chr7	100192036	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=144,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:100192034_G_C:100192034:8,1,1,1
chr7	100192040	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=143,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:100192034_G_C:100192034:9,1,1,1
chr7	100202687	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=142,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:1,2:1,0:0,2,2,0
chr7	100204350	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=147,204;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:1,1,0,2
chr7	100225823	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:3,1,0,2
chr7	100240771	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr7	100243874	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.122:23:11,1:9,1:0|1:100243874_G_C:100243874:9,12,0,2
chr7	100243876	.	G	GGT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.123:23:10,1:10,1:0|1:100243874_G_C:100243874:9,12,0,2
chr7	100243953	.	C	CTGTGATACCCGA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:5,10,0,2
chr7	100244967	.	CGCTCCCCCTCCCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.647:12:1,2:2,6:3,1,6,2
chr7	100252814	.	GAGAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=201,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:100252814_GAGAA_G:100252814:0,3,0,1
chr7	100252819	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=201,211;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:100252814_GAGAA_G:100252814:0,3,0,1
chr7	100275968	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=187,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,4:5,1:5,3,2,3
chr7	100280896	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,8,2
chr7	100281685	.	AGCT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=101,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCT;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr7	100284510	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=57.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,7:0,0,6,13
chr7	100284913	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,4:0,0,13,1
chr7	100285974	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	100319701	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=255,0;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0,2,1,0
chr7	100348384	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:7,6:4,7:4,7,6,7
chr7	100353013	.	TACA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=200,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACA;STR;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:2,4:3,1:0,5,0,6
chr7	100355984	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:9,3:4,15,0,3
chr7	100359797	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.665:13:2,2:2,6:3,1,5,4
chr7	100361391	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=140,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,8:3,6:5,1,10,5
chr7	100361580	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,1:0,6:1,4,3,4
chr7	100364105	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,245;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr7	100366203	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:1,4:4,4:5,1,6,2
chr7	100369706	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,33;MFRL=201,109;MMQ=41,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:100369706_T_C:100369706:0,1,0,1
chr7	100369707	.	C	CTAGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,32;MFRL=201,109;MMQ=41,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:100369706_T_C:100369706:0,1,0,1
chr7	100371474	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,12:0.406:30:8,10:9,2:0|1:100371474_G_A:100371474:8,10,6,6
chr7	100371476	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,12:0.406:30:8,9:7,2:0|1:100371474_G_A:100371474:8,10,6,6
chr7	100373271	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=75,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.656:12:1,4:2,4:4,0,4,4
chr7	100376978	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	100377082	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	100382545	.	C	CGGGAGGCTCCCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	100388501	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=104,199;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.308:4:0,0:1,1:1,2,1,0
chr7	100391644	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr7	100392741	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,12;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:0,0:3,0,3,0
chr7	100401270	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr7	100410272	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	100410657	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=190,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:1,0:6,3:4,4,1,2
chr7	100416052	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=142,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr7	100416320	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=129,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100416320_A_T:100416320:0,1,0,1
chr7	100416323	.	T	TTTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=129,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100416320_A_T:100416320:0,1,0,1
chr7	100421781	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=98,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:7,5,9,0
chr7	100451732	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:3,3:0,1:3,0,5,0
chr7	100456611	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,1:2,3:3,2,2,2
chr7	100467975	.	C	CCT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,15,4
chr7	100468103	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,7:1,4:3,0,2,10
chr7	100468398	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr7	100481658	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,3:7,8:8,6,9,2
chr7	100482026	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,19:0,16:0,0,35,0
chr7	100482339	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:3,7:10,5:8,5,11,1
chr7	100482526	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.380:35:8,4:13,8:9,13,8,5
chr7	100483083	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=213,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:0,2,0,6
chr7	100484917	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,8:4,1:7,0,5,4
chr7	100486088	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,22:0.409:54:13,8:19,12:21,11,15,7
chr7	100486110	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=66.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,26:0.563:46:11,10:8,15:13,7,17,9
chr7	100486656	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=158.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,24:0,21:0,0,18,28
chr7	100490077	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.321:23:5,3:10,4:7,9,2,5
chr7	100490797	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,12:0.541:22:7,8:3,4:0|1:100490797_G_T:100490797:7,3,7,5
chr7	100490807	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:7,0:0|1:100490797_G_T:100490797:11,9,2,0
chr7	100663606	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=252,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	100674888	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:3,1:5,2,2,0
chr7	100677378	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=143,179;MMQ=52,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:13,1:15,6:8,22,5,2
chr7	100677405	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=147,165;MMQ=52,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:12,1:15,2:14,15,3,1
chr7	100677409	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=151,165;MMQ=52,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:9,6:15,2:14,10,3,5
chr7	100677415	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=158,128;MMQ=52,51;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,1:12,2:14,12,2,1
chr7	100677422	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=161,118;MMQ=52,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,1:13,0:15,11,0,2
chr7	100677502	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=160,156;MMQ=60,57;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,19:0.257:76:24,7:26,11:30,27,7,12
chr7	100677516	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=158,186;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,9:0.161:60:21,5:29,4:0|1:100677516_A_G:100677516:26,25,7,2
chr7	100677519	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=158,186;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,9:0.161:60:21,4:26,3:0|1:100677516_A_G:100677516:25,26,7,2
chr7	100677523	.	A	C	.	.	DP=54;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=161,150;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,19:0.357:54:16,6:14,10:0|1:100677523_A_C:100677523:17,18,10,9
chr7	100677526	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=161,154;MMQ=60,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,18:0.365:50:17,6:15,9:0|1:100677523_A_C:100677523:17,15,10,8
chr7	100677556	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=156,157;MMQ=40,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.128:45:21,2:14,3:20,20,1,4
chr7	100678372	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=15;MBQ=29,30;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.145:46:25,2:15,4:31,9,2,4
chr7	100678405	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=15;MBQ=29,33;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,5:0.133:43:22,2:16,3:0|1:100678405_T_C:100678405:24,14,1,4
chr7	100678407	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=15;MBQ=34,27;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,5:0.133:43:22,2:16,3:0|1:100678405_T_C:100678405:24,14,1,4
chr7	100678417	.	AA	CC	.	.	DP=42;ECNT=15;MBQ=30,31;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:11,2:16,3:0|1:100678405_T_C:100678405:23,14,2,3
chr7	100678421	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=15;MBQ=28,28;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.646:35:7,6:5,15:8,4,12,11
chr7	100678426	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=30,30;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:12,1:13,2:0|1:100678405_T_C:100678405:16,14,1,2
chr7	100678433	.	AC	TA	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=28,28;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:8,1:11,2:0|1:100678405_T_C:100678405:12,13,2,2
chr7	100678442	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=32,31;MFRL=154,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.225:29:9,1:13,4:0|1:100678405_T_C:100678405:9,14,3,3
chr7	100678481	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=28,33;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.194:29:8,1:14,4:0|1:100678481_A_T:100678481:7,17,2,3
chr7	100678483	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=30,33;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:7,1:15,4:0|1:100678481_A_T:100678481:7,17,2,3
chr7	100678508	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=15;MBQ=30,35;MFRL=151,1181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:15,2:0|1:100678508_T_C:100678508:7,17,0,2
chr7	100678511	.	A	ACCCCATTCCTGCACAAGCC	.	.	DP=26;ECNT=15;MBQ=28,27;MFRL=151,1181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:13,2:0|1:100678508_T_C:100678508:7,17,0,2
chr7	100678527	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=32,31;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.297:25:8,3:9,4:10,8,2,5
chr7	100678560	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=32,30;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.219:30:12,2:12,4:0|1:100678560_C_A:100678560:12,12,3,3
chr7	100678568	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=15;MBQ=28,30;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.206:32:11,2:9,4:0|1:100678560_C_A:100678560:15,11,3,3
chr7	100679240	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=167,166;MMQ=52,38;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:18,1:13,1:0|1:100679240_G_C:100679240:16,15,2,0
chr7	100679254	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=166,145;MMQ=45,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:15,1:12,2:0|1:100679240_G_C:100679240:17,13,3,0
chr7	100679366	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,14:0.349:41:10,9:16,5:0|1:100679366_A_G:100679366:13,14,6,8
chr7	100679388	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=144,177;MMQ=60,31;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:36,2:0.075:38:20,1:15,1:1|0:100679366_A_G:100679366:15,21,0,2
chr7	100679390	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=144,177;MMQ=60,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:36,2:0.075:38:20,1:14,1:1|0:100679366_A_G:100679366:15,21,0,2
chr7	100679752	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=141,138;MMQ=51,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:12,1:8,4:0|1:100679752_T_C:100679752:9,13,5,0
chr7	100679754	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=141,138;MMQ=51,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.206:27:11,1:10,4:0|1:100679752_T_C:100679752:9,13,5,0
chr7	100679760	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=140,243;MMQ=50,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.152:24:9,1:12,1:0|1:100679760_G_A:100679760:12,9,0,3
chr7	100679782	.	AA	GC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=140,243;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,0:10,1:0|1:100679760_G_A:100679760:11,9,0,3
chr7	100679809	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.281:22:8,3:8,2:8,8,5,1
chr7	100680204	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=166,131;MMQ=40,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:16,1:9,1:0|1:100680204_A_G:100680204:16,9,2,0
chr7	100680226	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=159,131;MMQ=40,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,1:11,1:0|1:100680204_A_G:100680204:14,10,2,0
chr7	100680228	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=156,131;MMQ=40,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,1:13,1:0|1:100680204_A_G:100680204:14,9,2,0
chr7	100680231	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=161,131;MMQ=40,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,1:12,0:0|1:100680204_A_G:100680204:13,10,2,0
chr7	100681172	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=146,155;MMQ=60,59;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.401:35:9,8:12,5:12,9,7,7
chr7	100681211	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,181;MMQ=60,32;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.541:35:10,8:5,11:8,8,10,9
chr7	100681580	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=158,150;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:20,2:16,1:21,15,1,2
chr7	100687131	.	TAAA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=134,99;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:2,2:11,0:0|1:100687131_TAAA_T:100687131:4,11,1,1
chr7	100687143	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=132,99;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,2:8,0:0|1:100687131_TAAA_T:100687131:0,11,1,1
chr7	100692553	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,3,1
chr7	100695058	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr7	100731829	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr7	100733691	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=172,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:100733691_A_G:100733691:0,2,0,1
chr7	100733693	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=172,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:100733691_A_G:100733691:0,2,0,1
chr7	100733699	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=179,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100733691_A_G:100733691:0,1,0,1
chr7	100775087	.	A	AAAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAC;STR;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:0,3:1,6:1,0,10,1
chr7	100776931	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,3:6,3:4,2,5,1
chr7	100777267	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,2:2,1:1,3,0,3
chr7	100778892	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:3,12,0,2
chr7	100780176	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr7	100800131	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:100800131_T_C:100800131:0,0,0,1
chr7	100800138	.	C	CTCAGAGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100800131_T_C:100800131:0,0,0,1
chr7	100800635	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:1,2,5,0
chr7	100802316	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:4,1,3,1
chr7	100803729	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=188,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr7	100815279	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr7	100816527	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,5:0,0,15,3
chr7	100817676	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	100817951	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=146,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr7	100818089	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100818089_G_A:100818089:0,0,0,1
chr7	100818101	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100818089_G_A:100818089:0,0,0,1
chr7	100839401	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,4:4,3:4,2,5,2
chr7	100839501	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=153,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:11,2:14,9,0,2
chr7	100839640	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,155;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:7,12,0,3
chr7	100843689	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:16,5:6,0:18,5,5,0
chr7	100850184	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:1,9,0,2
chr7	100855107	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,1:2,1:4,3,2,0
chr7	100856119	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=161,202;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:100856119_T_A:100856119:2,0,1,0
chr7	100856121	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=161,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:100856119_T_A:100856119:2,0,1,0
chr7	100858551	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=180,168;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,1:2,1:0,10,0,2
chr7	100860636	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	100865847	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,10:0,4:0,0,11,3
chr7	100867295	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:0,5,2,4
chr7	100877816	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:100877816_T_C:100877816:0,3,0,1
chr7	100877820	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:100877816_T_C:100877816:0,2,0,1
chr7	100965096	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,5:0,0,0,14
chr7	101006488	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	101063403	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.718:15:2,3:1,7:0,4,0,11
chr7	101091166	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr7	101183108	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr7	101192542	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,31:0.506:61:18,16:12,14:20,10,13,18
chr7	101194424	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,8,14
chr7	101194461	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:1,3:5,3:1,5,1,6
chr7	101196488	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	101196688	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr7	101199257	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	101200550	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=264,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr7	101200669	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,4:0,9:0,0,10,5
chr7	101200835	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr7	101257075	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=13,24;MFRL=243,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:0,1:0|1:101257075_T_C:101257075:0,2,0,2
chr7	101257078	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,14;MFRL=215,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:1,0:0|1:101257075_T_C:101257075:0,3,0,1
chr7	101257081	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=215,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,0:0|1:101257075_T_C:101257075:0,3,0,1
chr7	101265350	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,3:0,0,11,4
chr7	101266379	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:0,3,1,3
chr7	101267435	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.592:12:1,4:2,3:2,3,3,4
chr7	101713567	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	101713590	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr7	101747621	.	AC	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,15;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr7	101837051	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=144,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr7	101848404	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=186,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,3:4,5:6,5,5,3
chr7	101870599	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,13:0,2:0,0,14,1
chr7	101916773	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=163,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.233:17:8,0:5,2:0,13,4,0
chr7	101917609	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:3,6,1,1
chr7	101989023	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,153;MMQ=24,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,22:0.322:67:23,10:19,8:21,24,8,14
chr7	102036769	.	CGGAGACTGCGTATGCG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr7	102038153	.	CTGTG	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=TG;STR;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.946:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr7	102045170	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,3:3,2:1,6,0,5
chr7	102046359	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	102087163	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,6:3,2:5,4,7,1
chr7	102087172	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=157,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:12,2:5,0:11,6,1,1
chr7	102107697	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:4,0,3,0
chr7	102109604	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=282,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:1,0:0,1:0|1:102109604_T_C:102109604:0,1,0,2
chr7	102109606	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=219,282;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:102109604_T_C:102109604:0,2,0,1
chr7	102109609	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:102109604_T_C:102109604:0,0,0,3
chr7	102110366	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=238,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,5:2,0:0,2,1,4
chr7	102112912	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	102113093	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.656:27:4,11:4,7:5,4,14,4
chr7	102113323	.	GCCCAGCCCA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=212,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.172:19:8,2:4,1:0|1:102113323_GCCCAGCCCA_G:102113323:4,12,3,0
chr7	102113337	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=200,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.216:15:8,0:4,0:0|1:102113323_GCCCAGCCCA_G:102113323:4,8,3,0
chr7	102116770	.	CCT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=260,195;MMQ=24,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1,2,1,0
chr7	102136550	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,178;MMQ=50,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,3:8,4:12,3,7,0
chr7	102137273	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,252;MMQ=60,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:102137273_A_C:102137273:0,0,1,0
chr7	102137277	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,14;MFRL=254,252;MMQ=25,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:102137273_A_C:102137273:1,0,1,0
chr7	102137282	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=27,25;MFRL=254,252;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102137273_A_C:102137273:1,0,1,0
chr7	102137290	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=26,13;MFRL=254,252;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:102137273_A_C:102137273:1,0,1,0
chr7	102137295	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=20,13;MFRL=254,252;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:102137273_A_C:102137273:1,0,1,0
chr7	102137299	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,13;MFRL=254,252;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:102137273_A_C:102137273:1,0,1,0
chr7	102137301	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,17;MFRL=254,252;MMQ=25,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:102137273_A_C:102137273:1,0,1,0
chr7	102137305	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,14;MFRL=232,252;MMQ=26,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:102137273_A_C:102137273:2,0,1,0
chr7	102137504	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,222;MMQ=27,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	102147062	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,213;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr7	102147284	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,143;MMQ=27,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr7	102213012	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=179,175;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,22:0.257:83:31,6:27,11:3,58,3,19
chr7	102213065	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=189,176;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,17:0.315:55:22,6:16,11:0,38,1,16
chr7	102235850	.	G	GACTTCGACTCCAGTGTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,148;MMQ=34,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	102246447	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=136,110;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,4:6,2:4,7,2,4
chr7	102246500	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=121,165;MMQ=27,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:0,2,0,4
chr7	102246527	.	G	GGGTTCTCACCATTGTCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=184,166;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:102246527_G_GGGTTCTCACCATTGTCT:102246527:0,3,0,1
chr7	102246531	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,28;MFRL=184,166;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:102246527_G_GGGTTCTCACCATTGTCT:102246527:0,3,0,1
chr7	102257171	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=167,182;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:0,8,0,3
chr7	102398410	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=32,31,32,24;MFRL=140,171,163,130;MMQ=57,33,27,21;MPOS=11,22,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.56,27.05,15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:27,5,17,13:0.079,0.278,0.203:62:13,3,4,5:12,2,9,7:9,18,11,24
chr7	102495168	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.089:31:15,2:14,0:26,3,2,0
chr7	102518996	.	A	ACATATGGCAGGCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=197,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	102572238	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=151,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr7	102572433	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,0:1,6:1,2,1,5
chr7	102574999	.	TGAA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=107.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,11:0,14:0,0,19,6
chr7	102665751	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102665751_G_A:102665751:0,1,0,1
chr7	102665752	.	T	TTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102665751_G_A:102665751:0,1,0,1
chr7	102665753	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102665751_G_A:102665751:0,1,0,1
chr7	102716415	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=226,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr7	102724372	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	102727051	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,54;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.382:15:2,3:6,3:8,1,4,2
chr7	102739043	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,29;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr7	102739085	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=177,200;MMQ=57,31;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:12,2:11,1:0,24,0,3
chr7	102760722	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	102944812	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:10,0:2,2:12,1,3,0
chr7	102948040	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,9:0,0,11,4
chr7	102963232	.	C	CTTCCTCTTCCTCTTCCTCT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=161,248;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:102963232_C_CTTCCTCTTCCTCTTCCTCT:102963232:0,4,0,1
chr7	102963233	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,17;MFRL=198,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:102963233_TC_T:102963233:0,4,0,1
chr7	102963235	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,28;MFRL=161,248;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:102963232_C_CTTCCTCTTCCTCTTCCTCT:102963232:0,4,0,1
chr7	102963237	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=198,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:102963233_TC_T:102963233:0,4,0,1
chr7	102963240	.	GA	TT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=223,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:102963233_TC_T:102963233:0,1,0,1
chr7	102963244	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102963233_TC_T:102963233:0,0,0,1
chr7	103003241	.	CT	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.340:16:4,1:2,0:3,8,1,4
chr7	103018016	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr7	103019613	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr7	103033573	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	103136106	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=161,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	103138517	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr7	103175965	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr7	103191428	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	103206001	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=123,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.476:6:1,2:1,1:0,3,0,3
chr7	103216062	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,125;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:5,11,3,0
chr7	103251983	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:2,1:3,5:5,0,6,0
chr7	103280896	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr7	103292285	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,0:2,2:0,6,0,2
chr7	103393773	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=174,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr7	103417134	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=192,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:0|1:103417134_G_T:103417134:0,8,0,6
chr7	103417139	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:5,2:2,3:0|1:103417134_G_T:103417134:0,7,0,6
chr7	103557648	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=154,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:6,0:6,0:3,12,0,3
chr7	103557697	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,3:0,0,0,12
chr7	103807202	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:1,6:3,7:4,0,12,1
chr7	103835732	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=193,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.522:19:6,4:3,6:0,9,2,8
chr7	103838120	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:7,7:3,7:10,0,14,0
chr7	103844557	.	T	G	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=84.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,30:0.484:62:20,17:12,12:24,8,24,6
chr7	103848413	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=107.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,31:0.728:42:9,14:2,17:1,10,2,29
chr7	104717319	.	TTGTGTGTGTGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=23,17;RU=TG;STR;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.823:3:0,1:0,2:0|1:104717319_TTGTGTGTGTGTG_T:104717319:0,0,3,0
chr7	104717372	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.150:25:10,0:10,0:0|1:104717319_TTGTGTGTGTGTG_T:104717319:14,8,3,0
chr7	104741842	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	104745818	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	104753240	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.281:15:6,1:5,0:0|1:104753240_A_C:104753240:0,11,4,0
chr7	104753246	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,2:9,1:0|1:104753240_A_C:104753240:0,16,3,0
chr7	104753252	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=164,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,1:9,1:0|1:104753240_A_C:104753240:2,18,2,0
chr7	104753254	.	CTGGT	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=165,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:11,1:9,1:0|1:104753240_A_C:104753240:3,18,2,0
chr7	104800939	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,15:0,0,22,4
chr7	104844328	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr7	105111324	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=173,190;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:15,2:0|1:105111324_G_A:105111324:3,22,0,2
chr7	105111328	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=173,190;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,0:15,2:0|1:105111324_G_A:105111324:3,22,0,2
chr7	105146359	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.424:26:8,3:7,7:10,5,9,2
chr7	105146593	.	A	AT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=88.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0,0,19,11
chr7	105182834	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:1,1:2,6:3,0,8,0
chr7	105183170	.	CATTAA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.506:2:0,1:1,0:0|1:105183170_CATTAA_C:105183170:0,1,0,1
chr7	105183178	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:105183170_CATTAA_C:105183170:0,1,0,1
chr7	105250904	.	AG	GA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:7,2:5,3:10,2,6,0
chr7	105250905	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,17,2
chr7	105250954	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.232:24:6,1:10,3:5,14,4,1
chr7	105254801	.	AGAG	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GAG;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:12,0:9,2:21,4,2,0
chr7	105283478	.	AG	A	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=152,64;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,3:0.049:79:37,3:38,0:0|1:105283478_AG_A:105283478:27,49,3,0
chr7	105283480	.	T	A	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=152,64;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,3:0.049:79:38,3:38,0:0|1:105283478_AG_A:105283478:27,49,3,0
chr7	105621512	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr7	105672826	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=152,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:3,5:6,4:7,2,8,1
chr7	105733619	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr7	105739732	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,27:0.570:47:9,12:9,14:7,13,4,23
chr7	105752555	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:6,2:5,3:10,1,6,0
chr7	105752691	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,1:4,3:0,10,0,5
chr7	105752820	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr7	105894944	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:22,0:33,3:12,43,0,3
chr7	105904150	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,0,19
chr7	105909828	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.408:8:2,1:2,1:0,5,0,3
chr7	105910666	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,21:0.408:52:17,14:11,6:0|1:105910666_C_T:105910666:26,5,19,2
chr7	105910669	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,21:0.400:53:18,14:12,7:0|1:105910666_C_T:105910666:27,5,19,2
chr7	105925210	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.693:8:2,2:0,2:1,1,6,0
chr7	106510076	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=63,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:1,5:2,2:0,3,0,7
chr7	106519943	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=86.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,13:1,9:1,0,15,10
chr7	106545927	.	G	GTCTAGCAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=198,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr7	106786952	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=142,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:2,5,2,5
chr7	106826439	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:0,5,0,9
chr7	106898870	.	TTC	T,TTCTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30,31;MFRL=0,109,235;MMQ=60,51,58;MPOS=24,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=TC;STR;TLOD=5.95,5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.446,0.432:4:0,0,2:0,2,0:0,0,1,3
chr7	106965009	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=88.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,28:0.558:50:9,14:13,14:0,22,3,25
chr7	106965039	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=129.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,20:0,0,0,36
chr7	107002573	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:8,5:7,5:6,9,3,7
chr7	107053157	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,26;MFRL=206,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr7	107115984	.	T	A	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,5:0.061:96:36,0:53,5:47,44,5,0
chr7	107167661	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29,26;MFRL=179,138,0;MMQ=60,60,60;MPOS=17,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=7.11,7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.308,0.308:10:3,3,1:1,0,1:3,1,6,0
chr7	107214329	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,0:7,2:0,12,0,2
chr7	107216738	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr7	107217068	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,8:0,2:0,0,0,11
chr7	107218033	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr7	107221113	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=198,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr7	107269414	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=199,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr7	107329706	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=165,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:107329706_T_A:107329706:0,9,1,1
chr7	107329713	.	G	GCAAAAGGAAGACAC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:107329706_T_A:107329706:0,8,1,1
chr7	107329716	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=174,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:107329706_T_A:107329706:0,7,1,1
chr7	107335239	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=293,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.551:2:1,1:0,0:0|1:107335239_C_CA:107335239:0,1,0,1
chr7	107335241	.	C	CACATTAAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=293,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.551:2:1,1:0,0:0|1:107335239_C_CA:107335239:0,1,0,1
chr7	107531832	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=54.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,0,15
chr7	107542662	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:3,0,5,0
chr7	107545586	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr7	107545799	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,9:5,5:7,1,10,4
chr7	107564366	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,4:6,5:8,2,9,0
chr7	107564539	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:4,6:2,4:0|1:107564539_G_A:107564539:2,4,6,4
chr7	107564542	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.612:16:4,6:2,4:0|1:107564539_G_A:107564539:2,4,6,4
chr7	107575792	.	GTTTTTTTTTTTTTT	G,GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,35,32;MFRL=176,239,173;MMQ=60,60,60;MPOS=24,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=26,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.14,8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,4:0.274,0.309:14:5,2,2:1,2,2:6,0,8,0
chr7	107577448	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,12:0.542:22:6,4:3,8:0|1:107577448_CT_C:107577448:10,0,12,0
chr7	107577456	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.592:25:6,4:3,11:0|1:107577448_CT_C:107577448:10,0,15,0
chr7	107577812	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=298,291;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	107580839	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=260,276;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr7	107613379	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,7:0,0,19,1
chr7	107615506	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:5,3,2,2
chr7	107615934	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:107615934_T_C:107615934:0,2,0,1
chr7	107615939	.	CC	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=212,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:107615934_T_C:107615934:0,1,0,1
chr7	107616049	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr7	107616068	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:107616068_T_C:107616068:3,0,4,0
chr7	107616078	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:107616068_T_C:107616068:3,0,4,0
chr7	107616420	.	GTTC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=112,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	107618420	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:7,0,2,0
chr7	107635472	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:3,2:0,5,0,5
chr7	107688603	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=223,243;MMQ=40,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=24,21;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.508:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr7	107738817	.	A	ACGCCCCC	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,1:9,1:0|1:107738817_A_ACGCCCCC:107738817:8,6,2,0
chr7	107738819	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,16;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,1:0|1:107738817_A_ACGCCCCC:107738817:9,6,2,0
chr7	107738821	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:8,1:0|1:107738817_A_ACGCCCCC:107738817:9,6,2,0
chr7	107738827	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:9,0:0|1:107738817_A_ACGCCCCC:107738817:10,7,2,0
chr7	107738836	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,4:5,6:6,4,6,4
chr7	107743409	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=226,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,2:2,7:5,0,9,0
chr7	107746214	.	TG	GC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=187,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,2:5,3:6,0,5,0
chr7	107746246	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:1,5:4,4:0|1:107746246_T_C:107746246:5,1,8,1
chr7	107746253	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=207,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:4,6:4,3:0|1:107746246_T_C:107746246:6,2,8,1
chr7	107746865	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=201,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.527:17:2,4:5,5:0|1:107746865_GA_G:107746865:8,0,8,1
chr7	107746878	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=155,191;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,2:0.114:24:5,0:10,1:1|0:107746865_GA_G:107746865:17,5,2,0
chr7	107747081	.	C	CT,CTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20,20;MFRL=174,170,159;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=9.33,3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,2:0.421,0.245:9:2,3,1:1,0,0:0,3,0,6
chr7	107748337	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr7	107752470	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=136,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:0|1:107752470_A_T:107752470:1,2,0,6
chr7	107752477	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=172,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:107752470_A_T:107752470:1,0,0,4
chr7	107791018	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr7	107800953	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=113.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,14:0,19:0,0,14,20
chr7	107808639	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr7	107815858	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr7	107820911	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr7	107822198	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,15,2
chr7	107822396	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=96.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,12:0,0,6,25
chr7	107823431	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=224,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:2,1:0,0:0|1:107823431_GC_G:107823431:0,2,0,1
chr7	107823435	.	ATTCAATTCCCAG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=224,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:107823431_GC_G:107823431:0,2,0,1
chr7	107823445	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=340,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:107823445_CAG_C:107823445:0,1,0,1
chr7	107823449	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=234,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:107823445_CAG_C:107823445:0,2,0,1
chr7	107825108	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr7	107834613	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,13:0,14:0,0,13,15
chr7	107834624	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=95.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,14:0,0,11,16
chr7	107836117	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	107871379	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=171,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr7	107875170	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	107875205	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:107875205_A_G:107875205:0,2,0,1
chr7	107875212	.	TCA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:107875205_A_G:107875205:0,2,0,1
chr7	108137253	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr7	108206475	.	TA	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:10,1:12,2:5,21,0,3
chr7	108212110	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,7:6,3:11,0,9,1
chr7	108524003	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	108524444	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr7	110764996	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.278:9:4,2:3,0:5,2,2,0
chr7	110765028	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=178,117;MMQ=60,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,3:7,0:12,1,3,0
chr7	111379582	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=55.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr7	111379634	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	111382272	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	111386365	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,15,7
chr7	111386511	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr7	111400449	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=65,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:111400449_GA_G:111400449:1,3,0,1
chr7	111400452	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,21;MFRL=65,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:111400449_GA_G:111400449:1,3,0,1
chr7	111400464	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:111400464_TG_CA:111400464:1,1,0,1
chr7	111400466	.	A	AGTATC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:111400464_TG_CA:111400464:1,1,0,1
chr7	111423079	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:111423079_A_C:111423079:0,0,0,1
chr7	111423081	.	AA	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:111423079_A_C:111423079:0,0,0,1
chr7	111617088	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr7	111629054	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.566:35:9,10:6,9:13,2,18,2
chr7	111629089	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.059:49:24,0:20,2:32,15,1,1
chr7	111634368	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	111936435	.	GT	G,GTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=35,35,35;MFRL=162,147,151;MMQ=60,60,60;MPOS=29,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.84,10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,8,7:0.281,0.268:27:2,2,1:9,6,5:0,12,0,15
chr7	111970215	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:5,12,1,1
chr7	112101907	.	AT	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,11:0.181:63:28,4:21,7:43,9,9,2
chr7	112125089	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=163,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,3:5,1:0|1:112125089_A_C:112125089:0,8,0,5
chr7	112125099	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=162,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,4:2,0:0|1:112125089_A_C:112125089:0,5,0,4
chr7	112130009	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=105,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:2,3,2,4
chr7	112555294	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=195,173;MMQ=59,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:4,0:1,4:6,0,4,0
chr7	112724941	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.220:19:7,0:8,0:10,5,0,4
chr7	113519796	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr7	113520262	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=187,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr7	113522258	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,1:8,1:9,13,0,2
chr7	114210814	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=177,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:4,8:2,5:5,1,9,4
chr7	114269937	.	GCAGCAGCAACAACAGCAGCAACAA	G	.	.	DP=60;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=112,125;MMQ=60,60;MPOS=-67;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,19:0.090:59:19,12:14,6:0|1:114269937_GCAGCAGCAACAACAGCAGCAACAA_G:114269937:21,19,15,4
chr7	114269976	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=-73;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,19:0.174:42:7,12:8,6:0|1:114269937_GCAGCAGCAACAACAGCAGCAACAA_G:114269937:8,15,15,4
chr7	114269979	.	ACAACAACAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGC	A	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=142,125;MMQ=60,60;MPOS=-73;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,19:0.105:54:7,11:6,6:0|1:114269937_GCAGCAGCAACAACAGCAGCAACAA_G:114269937:9,26,15,4
chr7	114270039	.	TCCTGGAAA	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=177,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,1:8,0:0|1:114269937_GCAGCAGCAACAACAGCAGCAACAA_G:114269937:3,16,1,1
chr7	114303491	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=55.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.827:27:1,16:3,5:4,0,23,0
chr7	114303617	.	CTT	C,CT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25,20;MFRL=151,152,150;MMQ=60,60,60;MPOS=26,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=9.05,13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,8:0.356,0.541:14:0,1,3:1,2,2:1,0,1,12
chr7	114304563	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	115624288	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,14:0,12:0,0,23,4
chr7	115874560	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.666:22:5,8:2,7:6,1,13,2
chr7	115890157	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:7,5:4,11:11,0,15,1
chr7	115897287	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:0,2:7,1:6,1,3,0
chr7	116140076	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=203,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,4:3,5:0,9,0,9
chr7	116140275	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr7	116165233	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,20:0.500:40:12,8:7,11:0|1:116165233_C_T:116165233:9,11,8,12
chr7	116165237	.	G	GCC	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=C;STR;TLOD=72.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,19:0.488:39:12,7:8,11:0|1:116165233_C_T:116165233:9,11,8,11
chr7	116166734	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:19,0:10,3:11,19,2,1
chr7	116409675	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.618:10:3,2:1,3:4,0,3,3
chr7	116550456	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	116556097	.	GT	G,GTT	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,35,33;MFRL=155,145,156;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.93,6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,8,7:0.131,0.134:54:17,3,2:17,5,3:32,7,10,5
chr7	116596795	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=183,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:2,10,0,2
chr7	116598784	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.621:16:1,2:4,8:0,6,3,7
chr7	116606241	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,36:0.485:74:18,17:20,18:14,24,14,22
chr7	116606301	.	CTTT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=209,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.516:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr7	116607501	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.918:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr7	116660614	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.659:16:2,5:3,3:4,1,8,3
chr7	116778443	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=200,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.342:15:5,0:4,5:9,1,5,0
chr7	116862192	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=243,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:116862192_T_A:116862192:0,1,0,1
chr7	116862196	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=243,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:116862192_T_A:116862192:0,1,0,1
chr7	116862197	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,30;MFRL=243,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:116862192_T_A:116862192:0,1,0,1
chr7	116862199	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=243,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:116862192_T_A:116862192:0,1,0,1
chr7	116862204	.	AC	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=243,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:116862192_T_A:116862192:0,1,0,1
chr7	116937980	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=189,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,1:3,0:0|1:116937980_A_ATC:116937980:0,3,0,1
chr7	116937981	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=125,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:1,0:0,2:0|1:116937981_TG_T:116937981:0,1,0,3
chr7	116937982	.	G	GAGCAGA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0|1:116937980_A_ATC:116937980:0,0,0,1
chr7	116937983	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=125,189;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,2:0|1:116937981_TG_T:116937981:0,1,0,3
chr7	116937997	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,22;MFRL=215,189;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.487:2:1,0:0,1:0|1:116937997_A_T:116937997:0,1,0,1
chr7	116938001	.	C	CAGGTAGGGTCTATT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,35;MFRL=218,189;MMQ=60,44;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:116937997_A_T:116937997:0,2,0,1
chr7	116938003	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=218,189;MMQ=60,44;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:116937997_A_T:116937997:0,2,0,1
chr7	116962933	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=191,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:3,2:6,1,3,0
chr7	117023237	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr7	117062217	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=83,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.693:7:0,4:1,1:2,0,5,0
chr7	117067040	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:3,4:4,8:0,7,0,13
chr7	117120268	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=188,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr7	117176738	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:2,1:1,4,0,2
chr7	117188682	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,19,1
chr7	117188797	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=170,151;MMQ=40,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,7:0.108:72:30,4:32,3:44,21,1,6
chr7	117188840	.	AGTT	A	.	.	DP=98;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=151,169;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,4:0.055:89:33,2:46,2:52,33,1,3
chr7	117188850	.	G	T	.	.	DP=92;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=150,151;MMQ=40,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,9:0.109:90:33,5:46,4:50,31,2,7
chr7	117199457	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr7	117243020	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:0,10,0,2
chr7	117250479	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	117417476	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=180,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr7	117426484	.	AAAAC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAC;STR;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.503:14:2,2:3,5:0,7,0,7
chr7	117431142	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:11,0,8,0
chr7	117450792	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,17,2
chr7	117451124	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr7	117511779	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,0:0|1:117511779_G_C:117511779:0,3,0,1
chr7	117511782	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:2,1:0|1:117511779_G_C:117511779:0,3,0,1
chr7	117824239	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.441:43:12,7:11,10:8,16,3,16
chr7	117825834	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:6,12:5,4:0,11,4,12
chr7	117832138	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=226,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:0,4,0,6
chr7	117865028	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:7,6:3,3:4,6,3,7
chr7	117867945	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr7	117867960	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:0,1:2,2,2,0
chr7	117874476	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.407:30:10,7:8,5:10,8,8,4
chr7	117874610	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.306:30:16,4:5,4:8,13,3,6
chr7	117876264	.	A	ATG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=15,20;MFRL=146,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=TG;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.563:7:0,2:0,0:0,3,0,4
chr7	120428607	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,8:0,0,13,2
chr7	120428969	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr7	120450658	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,4:0,0,4,9
chr7	120591120	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,4:5,5:9,2,9,0
chr7	120613419	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	120655676	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,6:3,4:5,2,10,0
chr7	120739962	.	GTT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	120740050	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,2:10,0:18,7,2,0
chr7	120740225	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr7	120764573	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	120765954	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,11:0,27:0,0,17,21
chr7	120770374	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:120770374_T_C:120770374:0,1,0,1
chr7	120770378	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:120770374_T_C:120770374:0,1,0,1
chr7	120776080	.	CT	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,7:0.187:37:19,3:10,4:0|1:120776080_CT_C:120776080:30,0,7,0
chr7	120776097	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=146.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.979:44:0,22:0,15:0|1:120776080_CT_C:120776080:0,0,40,4
chr7	120972089	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=194,139;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:0,8,0,3
chr7	121012196	.	GA	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.129:50:14,3:22,3:9,35,1,5
chr7	121513578	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,0:9,3:12,9,0,3
chr7	121617017	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,5:4,4:0,5,0,9
chr7	121653374	.	GTGA	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGA;STR;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.469:13:5,1:2,5:0|1:121653374_GTGA_G:121653374:2,5,2,4
chr7	121653398	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,14:0.522:27:3,3:8,11:0|1:121653374_GTGA_G:121653374:4,9,5,9
chr7	121684718	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr7	121698827	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,1:8,5:11,0,5,1
chr7	121719586	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,7:2,2:5,0,9,0
chr7	121719823	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:2,6:9,5:0,11,1,10
chr7	121721558	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.591:27:6,9:4,7:6,5,8,8
chr7	121731978	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr7	121942832	.	G	GACA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=89.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,9:0,0,20,1
chr7	121942847	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:7,5:4,9:9,2,14,0
chr7	121944527	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr7	121965437	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	122026334	.	A	G	.	.	DP=112;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,5:0.056:104:47,5:52,0:80,19,5,0
chr7	122026383	.	G	GA	.	.	DP=119;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,4:0.052:92:37,2:37,1:46,42,1,3
chr7	122194726	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=154,232;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:4,0:16,3:5,15,0,3
chr7	122194751	.	G	GA,GAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33,34;MFRL=106,159,181;MMQ=60,60,60;MPOS=25,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=A;STR;TLOD=21.30,5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,9,3:0.631,0.248:13:0,2,2:1,7,1:0,1,2,10
chr7	122261818	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr7	122757505	.	A	AT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.369:38:11,4:13,10:15,9,11,3
chr7	122769380	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	122769616	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=178,1352285;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:122769616_T_C:122769616:0,4,0,2
chr7	122769628	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=178,2704418;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:122769616_T_C:122769616:0,4,0,1
chr7	122808313	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,0:3,9:7,0,9,0
chr7	122809111	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	123120070	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:0,8,0,8
chr7	123143031	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:3,2:5,6:5,3,3,5
chr7	123190493	.	A	ACTGGATACCACAAATC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=64.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.620:27:7,7:3,6:6,4,14,3
chr7	123256643	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr7	123269976	.	G	GGC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,6:3,4:5,1,9,1
chr7	123295964	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	123324546	.	AAT	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,14:0.235:62:19,7:25,7:44,4,14,0
chr7	123336804	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,4:6,6:3,10,0,10
chr7	123610348	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=147.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.959:46:0,20:1,25:0,1,5,40
chr7	123610388	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,0,21
chr7	123672456	.	CGCTGCT	C,CGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32,33;MFRL=190,145,200;MMQ=60,60,60;MPOS=32,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,8;RU=GCT;STR;TLOD=3.34,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.285,0.285:4:0,0,1:1,1,0:1,1,2,0
chr7	123673568	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	124469267	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.496:26:4,3:9,9:12,1,12,1
chr7	124475296	.	TAAACA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAACA;STR;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.541:11:2,1:2,5:4,1,6,0
chr7	124481245	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:1,9:5,6:1,5,2,13
chr7	124492038	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:0,5,0,5
chr7	124499002	.	AT	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,5:6,6:4,5,9,2
chr7	126079144	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,5:4,3:7,2,6,2
chr7	126544012	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,6:0,0,7,1
chr7	126544242	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr7	126746850	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=238,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr7	126883221	.	CAAGGGCAAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=207,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr7	127013351	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:11,1,2,0
chr7	127224193	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:7,3:3,4:10,1,7,1
chr7	127228728	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,1:3,6:1,7,0,7
chr7	127230276	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr7	127251792	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=205,268;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr7	127253714	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=206,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,5:4,4:5,4,6,4
chr7	127254457	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:8,1,4,0
chr7	127347733	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:5,6:4,4:2,7,4,7
chr7	127361269	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr7	127447499	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,7:5,4:9,0,9,2
chr7	127670663	.	G	GGT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=163,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:14,4,2,0
chr7	127714491	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,14;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.465:8:3,0:1,1:4,0,4,0
chr7	127725711	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.299:14:8,3:2,0:10,0,4,0
chr7	127892215	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:2,8,0,2
chr7	127894498	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:10,4,0,3
chr7	127957893	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,3,1
chr7	127979348	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:5,14,0,2
chr7	128000091	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr7	128038555	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.476:40:10,11:11,8:6,15,5,14
chr7	128097706	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128097706_C_A:128097706:0,0,0,1
chr7	128097711	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128097706_C_A:128097706:0,0,0,1
chr7	128097714	.	CT	TC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128097706_C_A:128097706:0,0,0,1
chr7	128097718	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128097706_C_A:128097706:0,0,0,1
chr7	128097723	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128097706_C_A:128097706:0,0,0,1
chr7	128098198	.	AT	A	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,29:0.454:64:23,15:11,13:18,17,19,10
chr7	128098268	.	GT	G	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=212.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.985:60:0,31:0,29:0,0,28,32
chr7	128117010	.	G	GCCGGCCACGAGTCAAGCTGCCCTAC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=177,152;MMQ=40,37;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCGGCCACGAGTCAAGCTGCCCTAC;STR;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.316:12:3,0:4,1:2,6,2,2
chr7	128128286	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=181,236;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,1,3
chr7	128133984	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,18:0,0,20,11
chr7	128134012	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=161,175;MMQ=40,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:14,0:17,4:15,17,0,4
chr7	128142023	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.351:13:6,2:3,2:1,8,0,4
chr7	128369870	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr7	128370193	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=256,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	128371246	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=129,195;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr7	128371274	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=209,116;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.321:5:0,1:3,0:0|1:128371274_C_CA:128371274:0,4,0,1
chr7	128371275	.	C	CTATTTTGTTTTATTTTTCTTATTAATATAAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=209,116;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.321:5:0,1:3,0:0|1:128371274_C_CA:128371274:0,4,0,1
chr7	128388541	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=142,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr7	128409225	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,5:5,1:1,9,2,4
chr7	128414484	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr7	128415860	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,3:8,6:2,10,2,7
chr7	128432347	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:128432347_CAG_C:128432347:1,0,2,0
chr7	128432354	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:128432347_CAG_C:128432347:1,0,2,0
chr7	128434900	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,4:7,2:0,8,0,6
chr7	128444820	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,6:4,8:4,4,2,12
chr7	128445370	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr7	128449405	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.593:18:4,5:3,4:7,0,11,0
chr7	128454657	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,190;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:11,4,2,0
chr7	128477620	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=200,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:3,3,2,5
chr7	128481102	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr7	128483227	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr7	128484007	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:7,6,2,0
chr7	128488563	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=161,108;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:2,0:0|1:128488563_A_C:128488563:3,2,2,0
chr7	128488566	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,19;MFRL=161,108;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,0:0|1:128488563_A_C:128488563:3,2,2,0
chr7	128488571	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=161,108;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:0|1:128488563_A_C:128488563:3,2,2,0
chr7	128489154	.	G	GGC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,19;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GC;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr7	128489160	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:128489160_T_C:128489160:0,0,1,0
chr7	128489164	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:128489160_T_C:128489160:0,0,1,0
chr7	128489168	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:128489160_T_C:128489160:0,0,1,0
chr7	128489176	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,36;MFRL=248,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128489160_T_C:128489160:1,0,1,0
chr7	128490351	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=169,121;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:1,2:7,0:8,0,2,0
chr7	128490553	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.409:13:2,2:4,3:0,8,0,5
chr7	128493915	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=198,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,1:1,2:2,1,0,5
chr7	128493920	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.499:12:1,0:1,0:0|1:128493920_C_G:128493920:3,3,0,6
chr7	128493927	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.499:12:2,0:3,1:0|1:128493920_C_G:128493920:4,2,0,6
chr7	128496853	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:21,1:10,1:18,14,2,0
chr7	128498630	.	TACACAC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=207,236;MMQ=59,59;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=AC;STR;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:2,1:2,2:0,4,0,4
chr7	128517476	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:3,2,2,0
chr7	128527093	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:1,6,1,3
chr7	128533514	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,2:0,5:0,0,4,6
chr7	128542982	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr7	128547512	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,26;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:1,2:0,3:0,3,2,3
chr7	128548463	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:8,0,4,0
chr7	128587351	.	CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.965:19:0,7:0,10:0,0,7,12
chr7	128587547	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=278,145;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:128587547_C_T:128587547:0,1,0,1
chr7	128587550	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=278,145;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:128587547_C_T:128587547:0,1,0,1
chr7	128630227	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,0,17
chr7	128645292	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=212,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.877:10:0,3:0,6:0,1,0,9
chr7	128784723	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	128804218	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr7	128843169	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	128845018	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,27,2
chr7	128845277	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr7	128845325	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	128845907	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr7	128846469	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr7	129028857	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.729:12:0,5:3,4:3,0,9,0
chr7	129029093	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,3:6,3:0,10,0,6
chr7	129029391	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=215,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	129037029	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:4,0,5,1
chr7	129049273	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,2:8,1:19,2,3,0
chr7	129091615	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:10,5:5,2:5,10,2,6
chr7	129094195	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.905:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr7	129096534	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:0,7,0,6
chr7	129098313	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=215,258;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr7	129098665	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=184,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.537:18:3,3:5,3:3,5,2,8
chr7	129125352	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=231,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr7	129297447	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.793:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	129297500	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=169,144;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	129349101	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.560:25:1,4:9,10:1,10,4,10
chr7	129350170	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:5,1,6,1
chr7	129351444	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,1:8,4:1,9,1,4
chr7	129357298	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=181,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.455:24:8,5:4,4:1,12,0,11
chr7	129410144	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr7	129410195	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr7	129519555	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:5,7:0,2:0,5,0,9
chr7	129761818	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=148,208;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr7	129806441	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	129818356	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,7:7,0:2,9,2,5
chr7	129843689	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=113.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,23:0,16:0,0,15,26
chr7	129853474	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:8,2:2,0:0|1:129853474_G_A:129853474:0,10,0,2
chr7	129853477	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:0|1:129853474_G_A:129853474:0,10,0,2
chr7	129938711	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.331:18:3,2:8,2:1,11,2,4
chr7	129950857	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:129950857_G_T:129950857:2,2,0,1
chr7	129950859	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:129950857_G_T:129950857:2,2,0,1
chr7	129950862	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,35;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,0:1,1:0|1:129950857_G_T:129950857:0,3,0,1
chr7	129950863	.	G	GGAAGAAGAGAGTC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0|1:129950857_G_T:129950857:0,3,0,1
chr7	129950879	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=314,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr7	129986521	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:0,4,1,6
chr7	129987722	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:3,7:5,4:2,7,2,10
chr7	129987764	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr7	130002627	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,28624275;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	130052198	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:130052198_A_T:130052198:0,1,0,1
chr7	130052200	.	T	TACACTCCTTTTGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130052198_A_T:130052198:0,1,0,1
chr7	130132265	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	130135278	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.108:40:13,2:15,0:8,27,5,0
chr7	130136107	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	130136902	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr7	130137177	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=181,258;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr7	130137692	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr7	130138155	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,9:0,16:0,0,16,10
chr7	130140665	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:9,2:17,8,1,1
chr7	130140766	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=86.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,12:0,15:0,0,2,25
chr7	130144943	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr7	130147307	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	130147427	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:1,3:9,0:11,0,3,0
chr7	130148507	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0,0,7,13
chr7	130148562	.	T	TTCTTAGGAAGTG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,3:0,0,0,9
chr7	130297119	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,3:1,1:1,0,1,10
chr7	130298550	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr7	130354106	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	130357542	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,126;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:11,0,2,0
chr7	131060277	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.376:46:17,7:10,10:6,23,1,16
chr7	131155586	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0|1:131155586_G_C:131155586:4,1,2,1
chr7	131155588	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0|1:131155586_G_C:131155586:0,0,6,2
chr7	131155764	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=95,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr7	131155788	.	G	GGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	131190554	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=194,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr7	131191536	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,7:2,1:0,3,0,8
chr7	131191538	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:7,1:1,2:0,8,0,3
chr7	131191554	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=168,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:0,4,0,6
chr7	131193695	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.409:27:7,4:9,6:11,5,10,1
chr7	131193739	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.401:40:13,7:10,8:11,13,8,8
chr7	131195506	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=163,209;MMQ=60,38;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:23,0,2,0
chr7	131195535	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,5:6,7:9,2,9,3
chr7	131241029	.	GGGCGAC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=168,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGCGAC;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,2:0,0:0,1,1,1
chr7	131241085	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr7	131815220	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,5:6,4:7,4,5,4
chr7	131815310	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,13:0,0,12,12
chr7	131815343	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.369:30:8,5:11,5:9,10,3,8
chr7	131832627	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,9:0,0,17,1
chr7	131859496	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:5,0:2,5:6,1,3,2
chr7	131866972	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:2,5,0,3
chr7	131895740	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=138,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:11,2,2,0
chr7	131895754	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=168,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,3:7,0:12,2,2,1
chr7	131908468	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=168,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,3:6,2:1,8,0,5
chr7	132192231	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr7	132193111	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,59;MMQ=60,35;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:22,3:19,0:23,19,2,1
chr7	132523126	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,2:7,5:13,1,7,0
chr7	132570358	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr7	132709293	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=111,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,12:0.290:42:14,4:16,7:19,11,10,2
chr7	132766584	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.472:38:14,12:6,4:18,2,16,2
chr7	132938039	.	C	CCCTT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.522:42:11,10:9,10:0,20,0,22
chr7	132990536	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	133502387	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=244,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,2:1,4:0,2,1,6
chr7	133580545	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=210,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr7	133682181	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,12:0,3:0,0,15,0
chr7	133824117	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,7:5,4:8,0,11,0
chr7	133861905	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr7	133868439	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,4:5,4:5,5,6,2
chr7	133876314	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:9,0,2,0
chr7	133881919	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,25,28;MFRL=136,133,181;MMQ=60,60,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=TG;STR;TLOD=5.41,15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,5:0.238,0.529:10:2,2,1:0,1,4:0,2,0,8
chr7	133886356	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:2,2:1,4,1,1
chr7	133979545	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,2:3,7:12,0,8,2
chr7	133979548	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=171,106;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,3:10,0:17,3,3,0
chr7	133979552	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,5:4,8:9,1,12,2
chr7	133979578	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:12,8:5,8:14,3,13,3
chr7	133984432	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr7	133984878	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,6:5,1:10,2,7,0
chr7	133989543	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=125,177;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:1,10:6,9:4,3,11,8
chr7	134131955	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr7	134135751	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	134136584	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr7	134217729	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=202,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=118.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,39:0.931:41:0,19:2,19:2,0,26,13
chr7	134217899	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=150,144;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:7,5:3,4:0|1:134217899_G_T:134217899:0,11,0,9
chr7	134217908	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=165,144;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:5,4:3,3:0|1:134217899_G_T:134217899:0,9,0,7
chr7	134223127	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr7	134250150	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=188,82;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,0:8,2:20,0,1,1
chr7	134264233	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.356:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr7	134552634	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:0,8,0,6
chr7	134576441	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=237.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,31:0,34:0,0,13,55
chr7	134576547	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=228,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:0,2,0,7
chr7	134678463	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.346:30:6,4:13,6:3,17,0,10
chr7	134678523	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=176,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.413:15:5,2:4,4:0,9,0,6
chr7	134701856	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,13:0,3:0,0,8,8
chr7	134719551	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,12:0,0,11,6
chr7	134730151	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	134744060	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr7	134852399	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=181,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr7	134852420	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr7	134852432	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr7	134871913	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,0:15,2:4,25,0,2
chr7	134872003	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr7	134873355	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	134877935	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,18,1
chr7	134880884	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,9,8
chr7	134882680	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,14,0
chr7	134882693	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,10:0,0,17,3
chr7	134890585	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:3,3:4,1:7,0,5,0
chr7	134890855	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,2,20
chr7	134916872	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=201,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:0|1:134916872_G_GAA:134916872:0,2,0,1
chr7	134916873	.	G	GGAGAGTTATTATTTCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=201,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:0|1:134916872_G_GAA:134916872:0,2,0,1
chr7	134916881	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0|1:134916881_G_GA:134916881:0,0,0,1
chr7	134916882	.	G	GGGAGAGAGAGAAAGTCATTCATTCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134916881_G_GA:134916881:0,0,0,1
chr7	134930169	.	A	AGAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,212;MMQ=60,37;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GAG;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr7	134936517	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:7,0,5,0
chr7	135047703	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr7	135048033	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	135095270	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=93.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,13:0,0,23,5
chr7	135099901	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.496:26:7,5:6,7:8,5,10,3
chr7	135256027	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=16,25,15,19;MFRL=171,219,203,156;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,23,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.16,7.00,8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:24,3,5,5:0.091,0.147,0.142:37:4,3,0,0:3,0,2,2:0,24,0,13
chr7	135282250	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,2:4,0:0,14,0,2
chr7	135285579	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.503:38:8,14:8,3:17,2,16,3
chr7	135285788	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=115.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,18:0,0,0,31
chr7	135291001	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=207,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=140.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.955:42:0,20:1,21:0,1,3,38
chr7	135304082	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,1:5,1:8,0,2,0
chr7	135307773	.	CT	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,205;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr7	135309923	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=122,151;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:2,3:17,0:14,5,3,0
chr7	135311120	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,7,19
chr7	135311164	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=57.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0|1:135311164_G_GA:135311164:0,0,1,13
chr7	135311167	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0|1:135311164_G_GA:135311164:0,0,1,13
chr7	135315054	.	C	CCT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,3:1,5:6,0,7,1
chr7	135322853	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=185,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr7	135328110	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=140,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.391:10:5,2:1,0:4,2,1,3
chr7	135328168	.	A	ACTGGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr7	135330410	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:1,3,0,4
chr7	135330829	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:3,1:5,2:8,1,4,0
chr7	135375921	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:3,5:15,5:17,4,10,2
chr7	135375925	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.478:36:4,9:14,5:15,4,14,3
chr7	135378854	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:3,3:6,4:6,3,4,3
chr7	135387473	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr7	135387495	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr7	135412273	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr7	135418626	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr7	135421790	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	135433208	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:7,0,0,2
chr7	135636199	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=229,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr7	135661680	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=168,71;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,2,0
chr7	136588109	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=203,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:0,3,0,4
chr7	136939582	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,3,3
chr7	137080244	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=156,235;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,2:5,3:7,0,5,0
chr7	137082039	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=150,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,5:4,1:6,0,6,0
chr7	137092745	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,7:0,0,1,10
chr7	137092781	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr7	137096886	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,1:5,1:9,5,2,0
chr7	137151781	.	C	CACCCTGCTGTGTTCCCCAAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=176,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,1,1
chr7	137261899	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:6,2,6,1
chr7	137266720	.	C	CTGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=108,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:3,1:0,0:0|1:137266720_C_CTGG:137266720:0,3,0,1
chr7	137266722	.	G	GTGCAGTGGCAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=108,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:137266720_C_CTGG:137266720:0,3,0,1
chr7	137266738	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	137284608	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:18,0:10,2:16,12,0,2
chr7	137374777	.	A	AACAAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAAAG;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr7	137531147	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr7	137586073	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=29621352,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:1,1,4,2
chr7	137586256	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	137612883	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,6:0.095:71:27,0:37,6:47,18,1,5
chr7	137773291	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr7	137773546	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=125,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,0:0|1:137773546_C_G:137773546:0,3,0,1
chr7	137773563	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=137,170;MMQ=53,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:137773546_C_G:137773546:0,2,0,2
chr7	137798593	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	137801413	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:5,6:3,6:0,8,0,13
chr7	137801444	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,5:1,1:0,3,0,7
chr7	138200117	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=72.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,13:0,0,2,19
chr7	138203940	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.143:61:17,8:35,0:26,27,8,0
chr7	138255813	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=176,163;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0,11,0,2
chr7	138261014	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=212,243;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,2:4,0:0|1:138261014_T_C:138261014:12,1,2,0
chr7	138261019	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=212,243;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:6,0:0|1:138261014_T_C:138261014:13,1,2,0
chr7	138268563	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr7	138268731	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:6,0:7,2:5,9,0,2
chr7	138268745	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,0:5,2:0|1:138268745_GT_G:138268745:3,7,0,2
chr7	138268754	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:138268745_GT_G:138268745:3,7,0,2
chr7	138279228	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	138281355	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr7	138305743	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:6,3,4,1
chr7	138305782	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.471:19:5,5:5,2:0|1:138305782_T_C:138305782:5,5,6,3
chr7	138305806	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.532:17:5,6:1,2:0|1:138305782_T_C:138305782:4,4,5,4
chr7	138310629	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,2:1,0:1,1,3,0
chr7	138312288	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138312288_G_C:138312288:0,0,0,1
chr7	138312291	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138312288_G_C:138312288:0,0,0,1
chr7	138312292	.	T	TCAACATTTACAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138312288_G_C:138312288:0,0,0,1
chr7	138333933	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,2:0,1:0,0,0,6
chr7	138341329	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=239,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:138341329_T_C:138341329:0,3,0,1
chr7	138341337	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,18;MFRL=239,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:138341329_T_C:138341329:0,3,0,1
chr7	138341339	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=239,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:138341329_T_C:138341329:0,3,0,1
chr7	138356662	.	GG	AC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:138356662_GG_AC:138356662:0,0,8,0
chr7	138356664	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:138356662_GG_AC:138356662:0,0,8,0
chr7	138356730	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=56.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,8:0,3:0|1:138356730_T_TG:138356730:0,0,11,2
chr7	138356733	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0|1:138356730_T_TG:138356730:0,0,11,2
chr7	138363896	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr7	138406746	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,7:6,2:4,6,4,5
chr7	138417538	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=355,160;MMQ=40,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.650:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	138417596	.	TA	T,TAA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,25,27;MFRL=160,200,0;MMQ=60,60,60;MPOS=31,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.34,11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,7:0.166,0.365:19:5,0,4:4,3,3:9,0,9,1
chr7	138419074	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:138419074_C_T:138419074:0,4,0,1
chr7	138419079	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:138419074_C_T:138419074:0,4,0,1
chr7	138419085	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:138419074_C_T:138419074:0,0,0,4
chr7	138429823	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,4,0
chr7	138432199	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,1:11,1:14,3,2,0
chr7	138434066	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=171,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0,4,0,1
chr7	138440607	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,0:0,2:0,3,0,2
chr7	138555816	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=187,268;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:2,1:3,0,3,0
chr7	138595835	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:5,3:5,2:10,0,4,2
chr7	138595847	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:7,2:0|1:138595847_G_T:138595847:16,5,2,0
chr7	138595849	.	A	AGG	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,0:10,2:0|1:138595847_G_T:138595847:16,5,2,0
chr7	138711474	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=149,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,1:9,1:10,5,0,2
chr7	138713715	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr7	138719194	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	138719231	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,5:0,3:0,0,10,0
chr7	138732274	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr7	138738282	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=176,209;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,1:10,1:5,19,0,2
chr7	138749582	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:1,7:4,5:3,2,9,3
chr7	138849845	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,2:13,0:22,1,2,0
chr7	138853973	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:2,1:8,0,2,0
chr7	138865998	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=151,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr7	138866020	.	A	AGTGCGCAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr7	138950992	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,14;MFRL=174,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.364:13:5,0:3,1:8,0,5,0
chr7	138951165	.	TA	T,AA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,30,26;MFRL=161,196,164;MMQ=60,60,60;MPOS=29,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.50,4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,3,3:0.106,0.090:35:12,1,3:11,2,0:5,24,1,5
chr7	138957240	.	T	TTATG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=TATG;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.704:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	139045089	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:6,1:4,2:7,5,0,6
chr7	139056284	.	GA	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=130,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:139056284_GA_TT:139056284:0,3,0,1
chr7	139056290	.	G	GCAGAACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=130,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:139056284_GA_TT:139056284:0,3,0,1
chr7	139094364	.	AAG	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.103:26:10,2:11,0:2,22,0,2
chr7	139102490	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,24:0.624:38:4,13:10,10:1,13,4,20
chr7	139138551	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	139164606	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chr7	139224992	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr7	139311441	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,198;MMQ=60,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:18,0:10,4:14,17,0,4
chr7	139572219	.	CGA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=202,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:139572219_CGA_C:139572219:0,4,0,1
chr7	139572224	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=202,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:139572219_CGA_C:139572219:0,4,0,1
chr7	139724742	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=237,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:3,1:3,4:1,6,0,6
chr7	139727113	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:9,7,1,1
chr7	139727135	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,4:6,5:6,6,3,6
chr7	139728584	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr7	139754451	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.633:36:7,11:6,12:8,5,17,6
chr7	139762273	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:139762273_A_G:139762273:0,0,2,0
chr7	139762282	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:139762273_A_G:139762273:0,0,3,0
chr7	139820354	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr7	139826652	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.226:15:5,1:6,1:0,12,0,3
chr7	140036999	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,17,0
chr7	140037053	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.175:36:16,3:14,3:29,1,6,0
chr7	140044979	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=62.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,15:0,5:0,0,18,2
chr7	140051063	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,5:8,1:10,4,5,1
chr7	140051091	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,4:7,1:5,7,4,1
chr7	140051848	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.432:28:4,7:11,4:12,4,6,6
chr7	140052025	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=214,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,0:0,1:0|1:140052025_G_T:140052025:0,1,0,1
chr7	140052028	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=214,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:140052025_G_T:140052025:0,1,0,1
chr7	140052033	.	G	GTGCCAGCAACAGGTTCAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=214,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:140052025_G_T:140052025:0,1,0,1
chr7	140069455	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=128,154;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:2,3,0,2
chr7	140080121	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=126,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.172:25:10,0:10,3:13,8,0,4
chr7	140110677	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	140159798	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.934:13:0,10:0,1:0|1:140159798_A_G:140159798:0,0,0,13
chr7	140159809	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=213,170;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:2,0:0|1:140159798_A_G:140159798:0,11,0,2
chr7	140159812	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=213,170;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,1:2,0:0|1:140159798_A_G:140159798:0,11,0,2
chr7	140179033	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,17;MFRL=160,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,0:1,0:4,0,1,0
chr7	140218464	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:12,6:10,6:12,11,6,6
chr7	140223030	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=194,89;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,0:1,4:4,0,4,0
chr7	140244627	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=195,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr7	140255623	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=164,230;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	140257841	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,0:0,0,5,0
chr7	140267104	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=220,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,2:0,0:0|1:140267104_A_G:140267104:0,4,0,2
chr7	140267106	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=220,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.366:6:2,2:1,0:0|1:140267104_A_G:140267104:0,4,0,2
chr7	140379029	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:7,0:6,1:3,12,5,0
chr7	140390656	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=9,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.833:7:0,2:0,4:1,0,3,3
chr7	140394587	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:3,7:2,4:0,5,2,9
chr7	140396472	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr7	140402856	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=205,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.286:16:5,0:2,0:0,12,0,4
chr7	140434620	.	A	AAAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=196,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AAAG;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr7	140449071	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=58.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.604:33:6,5:6,15:9,4,12,8
chr7	140508817	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:3,6,0,2
chr7	140549970	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:10,2:9,0:11,9,2,0
chr7	140706157	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr7	141362431	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr7	141374115	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr7	141386264	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	141463914	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr7	141490107	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr7	141536322	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:6,0:6,2:3,10,0,2
chr7	141537942	.	T	TCAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.809:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr7	141537968	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr7	141635533	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=102,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.289:5:3,0:1,0:4,0,1,0
chr7	141635534	.	T	TC,A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23,18;MFRL=0,102,194;MMQ=60,60,60;MPOS=21,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.58,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.632,0.256:6:0,2,0:0,0,1:0,0,6,0
chr7	141730645	.	T	TGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=148,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr7	141733994	.	T	TTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TG;STR;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,2:2,0,4,0
chr7	141734265	.	T	TGTGGGATCTTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:141734265_T_TGTGGGATCTTA:141734265:0,1,0,1
chr7	141734268	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:141734265_T_TGTGGGATCTTA:141734265:0,1,0,1
chr7	141734280	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=231,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	141736798	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=104,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:2,5:5,7:1,6,2,10
chr7	141738504	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	141747499	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,36;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr7	141750203	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	141750472	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=105.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,15:0,18:0,0,21,12
chr7	141755795	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr7	141755987	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,13362;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	141756581	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:8,0,4,0
chr7	141759787	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,6:5,2:2,10,1,7
chr7	141759806	.	GGGTGGGTCACTGTT	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=174,193;MMQ=60,33;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTGGGTCACTGTT;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.362:12:4,3:2,1:0,8,0,4
chr7	141759846	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr7	141759859	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=157,193;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,2:1,2:0,4,0,4
chr7	141759994	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,13,0
chr7	141760008	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,4:3,5:3,0,10,0
chr7	141760228	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.351:26:7,2:10,6:3,14,1,8
chr7	141764164	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=67,186;MMQ=45,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,5:1,6:2,0,9,2
chr7	141794763	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	141796048	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=201,140;MMQ=54,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:5,1,5,0
chr7	141796081	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=166,158;MMQ=27,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,0:3,8:3,2,4,4
chr7	141796244	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=144,149;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:6,3:5,5:1,10,3,6
chr7	141796250	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=71.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,4,16
chr7	141796289	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=154,154;MMQ=51,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,1,5
chr7	141797360	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:10,6,2,0
chr7	141797564	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,258;MMQ=50,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	141799396	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=114,144;MMQ=52,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:6,2,7,2
chr7	141805522	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:2,0:4,0,3,0
chr7	141957504	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.408:35:6,5:14,9:7,14,6,8
chr7	141957653	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=249,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	142457343	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=133,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:11,1:11,1:0|1:142457343_C_T:142457343:16,11,2,0
chr7	142457347	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=134,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,1:12,1:0|1:142457343_C_T:142457343:16,13,2,0
chr7	142457365	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=161,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,1:14,1:0|1:142457365_G_T:142457365:9,12,2,0
chr7	142457375	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=29,35;MFRL=161,217;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,1:14,1:0|1:142457365_G_T:142457365:8,13,2,0
chr7	142457382	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,1:11,1:0|1:142457365_G_T:142457365:7,12,2,0
chr7	142457386	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=169,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:0|1:142457365_G_T:142457365:7,11,2,0
chr7	142457402	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=34,27;MFRL=193,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:3,11,2,0
chr7	142458313	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=175,222;MMQ=60,33;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:142458313_AG_A:142458313:9,0,2,0
chr7	142458316	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,22;MFRL=175,222;MMQ=60,33;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:4,0:0|1:142458313_AG_A:142458313:9,0,2,0
chr7	142458331	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=30,36;MFRL=162,222;MMQ=60,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:142458313_AG_A:142458313:9,1,2,0
chr7	142458338	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=26,36;MFRL=158,222;MMQ=60,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:142458313_AG_A:142458313:10,1,2,0
chr7	142458340	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=165,222;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:5,0:0|1:142458313_AG_A:142458313:11,2,2,0
chr7	142458352	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=167,222;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,2:13,0:0|1:142458313_AG_A:142458313:14,8,2,0
chr7	142458371	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=168,164;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:5,3:15,5:13,7,3,5
chr7	142458486	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=165,199;MMQ=60,39;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:20,2:23,1:18,25,0,3
chr7	142458511	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=156,217;MMQ=60,39;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:16,3:23,1:17,23,2,2
chr7	142458523	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=156,217;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.119:40:16,3:19,1:0|1:142458523_T_A:142458523:14,22,2,2
chr7	142458526	.	AC	GG	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=156,217;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:11,3:21,1:0|1:142458523_T_A:142458523:14,23,2,2
chr7	142458531	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=34,24;MFRL=156,232;MMQ=60,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.105:36:13,2:19,0:0|1:142458523_T_A:142458523:13,20,2,1
chr7	142458542	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=159,217;MMQ=60,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:9,1:17,1:10,16,2,0
chr7	142460187	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=11;MBQ=28,30;MFRL=154,177;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:0,2:2,5:1,1,6,1
chr7	142460200	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=189,170;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:5,2:9,1,2,1
chr7	142460201	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=177,215;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,1:7,1:8,2,2,0
chr7	142460203	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=26,32;MFRL=189,177;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,0:4,3:6,2,4,1
chr7	142460207	.	C	T,A	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=32,26,14;MFRL=189,170,215;MMQ=60,40,40;MPOS=26,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.02,6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,2:0.239,0.189:13:3,0,0:4,3,0:6,2,4,1
chr7	142460212	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=180,147;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.338:16:4,1:7,4:9,2,4,1
chr7	142460226	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=32,26;MFRL=181,160;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,3:9,5:16,1,7,1
chr7	142460238	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=34,28;MFRL=181,160;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:11,3:12,6:22,1,8,2
chr7	142460250	.	TAC	T	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=28,28;MFRL=181,160;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,12:0.351:35:11,6:12,5:0|1:142460250_TAC_T:142460250:22,1,10,2
chr7	142460254	.	TC	T	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=28,28;MFRL=181,160;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,11:0.324:35:11,6:12,5:0|1:142460250_TAC_T:142460250:23,1,9,2
chr7	142460261	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=11;MBQ=27,30;MFRL=160,169;MMQ=40,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,28:0.603:46:10,14:8,13:15,3,25,3
chr7	142460335	.	A	G	.	.	DP=103;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=118.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,41:0.406:101:28,22:30,17:30,30,16,25
chr7	142460339	.	G	A	.	.	DP=103;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=151,139;MMQ=60,59;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,7:0.081:96:48,3:39,4:40,49,2,5
chr7	142460482	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=160,236;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:9,0:0|1:142460482_G_T:142460482:0,22,0,2
chr7	142460494	.	AA	CC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=169,239;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:12,2:6,1:0|1:142460482_G_T:142460482:0,19,0,3
chr7	142460503	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=177,239;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.176:21:9,2:2,0:0|1:142460482_G_T:142460482:0,18,0,3
chr7	142460642	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=185,178;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,1:8,3:15,2,4,0
chr7	142460660	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=158,130;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:10,2:5,2:0|1:142460660_T_C:142460660:14,2,4,0
chr7	142460669	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=9;MBQ=34,33;MFRL=154,130;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:12,2:4,2:0|1:142460660_T_C:142460660:16,2,4,0
chr7	142460671	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=29,35;MFRL=152,130;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:12,2:5,1:0|1:142460660_T_C:142460660:15,2,4,0
chr7	142460690	.	C	CTCTT	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=32,36;MFRL=152,155;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:16,3:14,1:22,9,4,2
chr7	142460744	.	G	C	.	.	DP=73;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=152,163;MMQ=60,57;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,20:0.283:72:27,9:24,11:0|1:142460744_G_C:142460744:29,23,8,12
chr7	142460752	.	C	G	.	.	DP=74;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=152,163;MMQ=60,57;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,20:0.291:70:25,9:22,11:0|1:142460744_G_C:142460744:30,20,8,12
chr7	142460764	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.111:52:23,3:23,2:25,22,2,3
chr7	142460778	.	TG	CT	.	.	DP=54;ECNT=9;MBQ=27,30;MFRL=148,104;MMQ=60,31;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.080:47:22,1:21,2:23,21,0,3
chr7	142565513	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr7	142565543	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=295,207;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,0,2
chr7	142565547	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=217,52690682;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,1,0
chr7	142565576	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=217,295;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,1,0
chr7	142566163	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:4,9:0,6:0,4,9,6
chr7	142572463	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:0,7,0,6
chr7	142583330	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=58.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,0,16
chr7	142626575	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,133;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:11,0:16,7,2,0
chr7	142651070	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,0:3,4:0|1:142651070_G_A:142651070:1,12,0,4
chr7	142651072	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:6,0:2,4:0|1:142651070_G_A:142651070:1,12,0,4
chr7	142749417	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,5:6,7:4,6,9,3
chr7	142750053	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,54;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,0:15,2:7,15,0,2
chr7	142836066	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=16,19;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.623:3:0,1:0,0:1,0,2,0
chr7	142836081	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=63,85;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr7	142881606	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr7	143016995	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,3,11
chr7	143017960	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr7	143036318	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=61.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,15,3
chr7	143036337	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,12:0,8:0,0,15,6
chr7	143036548	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,19,2
chr7	143039310	.	G	GGGGTTATAATACATT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.311:6:5,1:0,0:0|1:143039310_G_GGGGTTATAATACATT:143039310:0,5,0,1
chr7	143039311	.	A	G,T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,32,30;MFRL=184,211,164;MMQ=60,60,60;MPOS=22,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.30,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.438,0.277:4:1,2,1:0,0,0:0,1,0,3
chr7	143039312	.	G	GCTAATTTTGTGTGC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.311:6:3,1:0,0:0|1:143039310_G_GGGGTTATAATACATT:143039310:0,5,0,1
chr7	143039314	.	T	TGTTTTAGTCTATTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=204,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr7	143042551	.	CG	AA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:7,0:0|1:143042551_CG_AA:143042551:18,1,2,0
chr7	143042552	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,6:0,11:0,0,19,1
chr7	143042557	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:6,2:0|1:143042551_CG_AA:143042551:16,1,2,0
chr7	143043377	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	143043607	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr7	143047518	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:11,0:18,3:9,20,0,3
chr7	143054585	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	143078928	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	143079806	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=206,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:7,8:4,6:1,10,2,12
chr7	143085008	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=224,234;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	143085819	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:4,4,3,4
chr7	143088867	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,5:0,0,10,8
chr7	143088897	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=152,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:6,4,2,3
chr7	143091537	.	CAA	TGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=218,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	143092269	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=108,260;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:2,4,0,2
chr7	143095378	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,4:3,4:5,2,7,1
chr7	143174892	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr7	143421878	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=180,207;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.230:14:6,2:5,0:0,11,1,2
chr7	143554451	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,166;MMQ=27,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr7	143632618	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,167;MMQ=40,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:9,1:2,4:7,4,3,2
chr7	143633157	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:1,5:3,7:3,1,3,9
chr7	143633297	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	143701884	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,2:5,3:1,7,2,3
chr7	143792653	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:16,0:17,2:10,23,0,2
chr7	143885264	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=228,289;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	144068163	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=164,164;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr7	144068214	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=148,161;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:6,3:4,2:11,0,5,0
chr7	144068361	.	GGA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=166,121;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,0:15,2:0,27,0,2
chr7	144070212	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,197;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,3:5,5:9,0,6,2
chr7	144096598	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:0,5,2,7
chr7	144096839	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:2,2:3,2,5,1
chr7	144320214	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,3:6,8:7,4,11,0
chr7	144379925	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr7	144462951	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.473:36:11,9:8,8:14,5,12,5
chr7	144532718	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.255:14:6,3:5,0:1,10,0,3
chr7	146471559	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=16,31;MFRL=259,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:146471559_A_T:146471559:0,2,0,1
chr7	146471561	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=259,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:146471559_A_T:146471559:0,2,0,1
chr7	146471566	.	G	GTCCTCTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=259,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:146471559_A_T:146471559:0,2,0,1
chr7	146471570	.	GC	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=248,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146471559_A_T:146471559:0,1,0,1
chr7	146818044	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:10,1,3,0
chr7	146997203	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:9,0,6,1
chr7	147075202	.	A	AGTAATACAAAGTAACACCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=210,120;MMQ=60,24;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	147183143	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.679:23:2,8:5,7:1,6,6,10
chr7	147259374	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr7	147259438	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	147335933	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,27,29,35;MFRL=121,171,146,152;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,19,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,12,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.17,16.41,6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,2,9,6:0.120,0.464,0.269:20:1,1,0,3:2,1,5,3:1,2,4,13
chr7	147600604	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,2:2,2:3,0,3,1
chr7	147674912	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr7	147844860	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,16;MFRL=220,53459988;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:0,0:0,2,0,2
chr7	147844862	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:1,0:0,2:0,1,0,3
chr7	147964091	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,19,3
chr7	148080647	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:4,1:4,3:8,0,4,1
chr7	148106475	.	C	CTT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=63.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,4:0,10:0|1:148106475_C_CTT:148106475:0,0,10,5
chr7	148106477	.	C	CTG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,4:0,9:0|1:148106475_C_CTT:148106475:0,0,10,5
chr7	148106490	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:148106475_C_CTT:148106475:0,0,7,3
chr7	148106654	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	148312382	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:5,2,6,0
chr7	148312520	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=160,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:8,3:4,3:3,9,1,5
chr7	148463860	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,2,20
chr7	148464675	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr7	148480990	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,30:0.453:66:19,16:15,11:19,17,14,16
chr7	148483760	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:4,5:4,4:0,10,0,10
chr7	148485603	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:2,1:8,0,2,0
chr7	148487395	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:11,4:3,4:10,4,8,0
chr7	148494794	.	ATTTT	A,AT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33,30;MFRL=157,140,224;MMQ=60,60,60;MPOS=33,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.37,6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,4:0.159,0.253:16:8,2,1:2,0,3:10,0,6,0
chr7	148494820	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.207:19:10,0:4,0:13,2,4,0
chr7	148495860	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,6:3,8:0,6,2,12
chr7	148496276	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,2:1,2:3,0,4,0
chr7	148504716	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.880:14:1,9:0,4:1,0,4,9
chr7	148504854	.	A	AGACTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTT;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:1,6,0,2
chr7	148506064	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:8,1,2,0
chr7	148506363	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,9:7,1:6,5,6,4
chr7	148506396	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=123,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.504:26:8,5:4,8:11,2,8,5
chr7	148508833	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,1,4
chr7	148529922	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,2:5,1:0,5,0,3
chr7	148543525	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,21,1
chr7	148543693	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,7:0,7:0,0,1,18
chr7	148705221	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr7	148809451	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	148823366	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr7	148863414	.	CAGCTCCA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=107.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,6,19
chr7	148873497	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr7	148903984	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	148904343	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr7	148904624	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr7	148907849	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,15:0,0,5,20
chr7	148936762	.	A	ACGGCGGCGG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=CGG;STR;TLOD=109.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,6:0,15:0,0,23,2
chr7	148947999	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=293,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	149152813	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,0:8,2:10,1,2,0
chr7	149152906	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.519:42:9,8:11,12:12,8,13,9
chr7	149190098	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:6,4:5,6:2,10,1,9
chr7	149191027	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.372:33:9,4:12,8:19,2,10,2
chr7	149317216	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:0,1,0,10
chr7	149318703	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,185;MMQ=59,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:0,6,0,6
chr7	149321505	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	149420820	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.309:17:5,3:7,2:8,4,4,1
chr7	149426232	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=151,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:0,1:2,1:3,0,2,0
chr7	149426305	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,4:0,0,9,3
chr7	149476666	.	G	GC	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=92.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,10:0,20:0,0,13,18
chr7	149481006	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:13,4,2,0
chr7	149483366	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	149495033	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	149499318	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:149499318_C_T:149499318:0,0,0,2
chr7	149499323	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:149499318_C_T:149499318:0,0,0,2
chr7	149500013	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,2,2
chr7	149500472	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	149506211	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=57.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,8:0,0,10,8
chr7	149520413	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	149521106	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.381:8:4,1:0,0:3,2,2,1
chr7	149522130	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149522130_G_A:149522130:1,0,1,0
chr7	149522135	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:149522130_G_A:149522130:1,0,1,0
chr7	149522366	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=208,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:4,1,2,1
chr7	149543219	.	CT	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.186:38:13,3:13,5:26,4,5,3
chr7	149559465	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,2:0,0,6,3
chr7	149572842	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr7	149575747	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	149575884	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr7	149576818	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,1,14
chr7	150033882	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=142,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	150066900	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.452:40:11,7:10,11:14,8,8,10
chr7	150069288	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=193,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.488:8:1,0:1,0:0,4,0,4
chr7	150070180	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:15,1:5,1:10,16,2,0
chr7	150070333	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.512:33:8,8:7,8:5,11,7,10
chr7	150071156	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,2:2,2:0,8,1,3
chr7	150085436	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,7:6,1:11,0,8,0
chr7	150218002	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:10,4:5,5:0|1:150218002_C_T:150218002:2,14,0,9
chr7	150218007	.	ATAGT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,13:0.584:22:4,9:5,4:1|0:150218002_C_T:150218002:0,9,2,11
chr7	150324723	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=198,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,2,1
chr7	150327249	.	A	ATCAATG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:150327249_A_ATCAATG:150327249:0,2,0,1
chr7	150327252	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:150327249_A_ATCAATG:150327249:0,2,0,1
chr7	150384031	.	C	CAAAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=20,24;RU=A;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.819:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	150384060	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=140,155;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.081:41:19,1:15,1:0|1:150384060_G_A:150384060:30,8,3,0
chr7	150384066	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=140,155;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,3:0.062:53:22,0:20,1:0|1:150384060_G_A:150384060:39,11,3,0
chr7	150500455	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.434:28:6,7:10,5:12,4,10,2
chr7	150500576	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.559:34:3,9:11,10:4,11,7,12
chr7	150501635	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr7	150501646	.	G	GGTCACCAGTAGATTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr7	150553605	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,4:2,1:7,1,5,0
chr7	150556055	.	CG	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr7	150557748	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr7	150644916	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	150647569	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	150647969	.	CC	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=155,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:4,2:11,0,4,1
chr7	150648439	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	150648505	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=169,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:5,1,2,0
chr7	150654622	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr7	150656582	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=209,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,2:2,0:3,0,3,0
chr7	150656916	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=188,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,2:1,0:0,2,0,3
chr7	150691088	.	G	GAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=214,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	150693709	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150693709_C_CA:150693709:0,0,0,1
chr7	150693710	.	C	CAATTGGAAGATATTGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150693709_C_CA:150693709:0,0,0,1
chr7	150696008	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.548:9:1,2:2,3:3,1,5,0
chr7	150698879	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr7	150703915	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr7	150706177	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.546:16:4,7:3,0:3,4,4,5
chr7	150706383	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=12,26;MFRL=90,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.733:11:0,4:1,4:3,0,1,7
chr7	150706436	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	150708089	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=68.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.919:23:0,10:1,9:0,1,8,14
chr7	150709571	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,1:1,6:3,0,3,4
chr7	150709624	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=13,18;MFRL=167,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.317:11:2,0:1,1:1,7,0,3
chr7	150710760	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=137,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.585:3:1,0:0,1:0|1:150710760_C_CG:150710760:0,1,2,0
chr7	150710766	.	C	CCG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,18;MFRL=137,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:150710760_C_CG:150710760:0,1,2,0
chr7	150710773	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=137,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150710760_C_CG:150710760:0,1,1,0
chr7	150710779	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,24;MFRL=152,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,0:0,1:0|1:150710760_C_CG:150710760:1,1,1,0
chr7	150713636	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=203,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr7	150713655	.	C	CCCCCTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr7	150713902	.	G	GC	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=198,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=128.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.955:41:1,26:0,14:1,0,21,19
chr7	150714919	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=14,13;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.377:16:2,0:1,2:8,2,6,0
chr7	150714923	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.504:16:4,0:1,1:5,3,8,0
chr7	150720071	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:5,1,4,0
chr7	150720308	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:5,2:1,2:1,5,0,5
chr7	150720902	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,10:0,0,20,4
chr7	150725722	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,4:4,4:0,9,0,8
chr7	150731338	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr7	150738380	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	150747746	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,7:0,0,1,11
chr7	150752066	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,16,4
chr7	150761880	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,7:4,4:2,5,5,6
chr7	150763555	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	150773072	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,3,1
chr7	150773807	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,25,0
chr7	150773940	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:5,7:6,8:0,11,2,13
chr7	150777704	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	150814895	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=213,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr7	150825567	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	150825839	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	150864526	.	CGCG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCG;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:1,2,1,1
chr7	150916114	.	CAGG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=60.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr7	150937377	.	C	CG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=91.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,6,22
chr7	150939193	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:5,6:6,6:10,2,5,7
chr7	150939359	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.519:21:5,2:3,6:4,6,7,4
chr7	150939396	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:0,4,0,5
chr7	150939734	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,14;MFRL=157,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.145:23:12,0:4,1:5,15,3,0
chr7	150940657	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:4,1,5,0
chr7	150945674	.	ACT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CT;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,2:8,2:0,19,0,4
chr7	151048484	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,23:0.447:52:15,15:12,8:18,11,14,9
chr7	151049818	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:5,4:7,4:12,1,9,0
chr7	151053032	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=202,172;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:1,11,0,2
chr7	151053043	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=160,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:0,4,3,6
chr7	151057396	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=215,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	151064305	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	151164348	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,2,16
chr7	151168415	.	CAAT	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=138.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.973:32:0,11:0,21:0,0,29,3
chr7	151254175	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,1:6,5:10,0,6,0
chr7	151254445	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:0,9,1,6
chr7	151262305	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=223,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,2:4,0:6,0,3,0
chr7	151265714	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr7	151292395	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr7	151372744	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.405:28:3,7:12,4:3,14,3,8
chr7	151372798	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=195,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.513:14:2,5:3,2:1,6,0,7
chr7	151478602	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	151483445	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=220,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	151668225	.	A	AGAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.652:9:2,2:1,4:0,3,0,6
chr7	151684168	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	151818777	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=107.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,13:0,19:0,0,8,24
chr7	151836703	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:3,1:13,1:17,0,2,0
chr7	151879380	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:2,2:9,0:10,1,1,1
chr7	151882564	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=221,171;MMQ=58,33;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:5,3:1,1:5,1,4,0
chr7	151882622	.	TAG	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=168,118;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:9,3:10,3:16,5,4,2
chr7	151882806	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,188;MMQ=40,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr7	151884279	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=158,228;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.254:6:2,1:3,0:5,0,1,0
chr7	151884702	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=193,256;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,2:8,0:9,2,0,2
chr7	151921099	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,166;MMQ=48,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.141:61:25,4:27,4:35,18,7,1
chr7	151926935	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=190,170;MMQ=24,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:10,9:11,5:20,1,16,0
chr7	151926945	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=33,29;MFRL=187,167;MMQ=24,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.131:51:24,4:21,2:44,1,6,0
chr7	151926977	.	A	G	.	.	DP=139;ECNT=10;MBQ=30,29;MFRL=160,162;MMQ=24,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:105,29:0.220:134:53,18:52,11:100,5,29,0
chr7	151927016	.	T	C	.	.	DP=161;ECNT=10;MBQ=27,33;MFRL=142,139;MMQ=24,24;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:140,16:0.106:156:70,11:65,5:123,17,13,3
chr7	151927021	.	C	A	.	.	DP=167;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=143,137;MMQ=24,24;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=327.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,87:0.533:163:33,44:37,38:63,13,72,15
chr7	151927023	.	G	C	.	.	DP=166;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=139,138;MMQ=24,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=124.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:126,38:0.235:164:59,22:65,16:104,22,31,7
chr7	151927025	.	A	G	.	.	DP=170;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=139,129;MMQ=24,24;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:144,21:0.130:165:70,7:63,13:120,24,17,4
chr7	151927026	.	T	C	.	.	DP=165;ECNT=10;MBQ=25,32;MFRL=139,136;MMQ=24,24;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=167.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,50:0.311:162:56,24:54,23:93,19,41,9
chr7	151927067	.	T	C	.	.	DP=213;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=136,133;MMQ=24,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:160,50:0.239:210:83,28:77,22:77,83,23,27
chr7	151927127	.	A	G	.	.	DP=138;ECNT=10;MBQ=25,32;MFRL=142,141;MMQ=24,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,37:0.284:132:55,18:37,19:12,83,2,35
chr7	151932808	.	TTA	T	.	.	DP=157;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=171,238;MMQ=42,25;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:151,6:0.044:157:75,3:69,2:137,14,6,0
chr7	151932819	.	T	A	.	.	DP=159;ECNT=11;MBQ=28,31;MFRL=186,149;MMQ=48,31;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=152.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:105,53:0.338:158:53,29:51,24:94,11,50,3
chr7	151932824	.	A	T	.	.	DP=159;ECNT=11;MBQ=30,28;MFRL=154,208;MMQ=46,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=91.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:116,36:0.240:152:59,20:55,16:107,9,32,4
chr7	151932830	.	A	T	.	.	DP=158;ECNT=11;MBQ=31,28;MFRL=172,149;MMQ=40,28;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:147,11:0.075:158:72,7:67,4:0|1:151932830_A_T:151932830:129,18,10,1
chr7	151932846	.	T	C	.	.	DP=152;ECNT=11;MBQ=26,35;MFRL=158,149;MMQ=40,28;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:138,9:0.067:147:68,5:60,4:0|1:151932830_A_T:151932830:114,24,8,1
chr7	151932848	.	T	G	.	.	DP=149;ECNT=11;MBQ=26,37;MFRL=149,203;MMQ=40,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:136,9:0.064:145:66,7:62,2:110,26,9,0
chr7	151932876	.	G	T	.	.	DP=148;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=145,185;MMQ=48,31;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:133,4:0.035:137:69,1:61,3:79,54,3,1
chr7	151932897	.	C	A	.	.	DP=182;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=156,105;MMQ=49,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:165,10:0.061:175:82,6:80,4:95,70,8,2
chr7	151932908	.	T	C	.	.	DP=195;ECNT=11;MBQ=27,34;MFRL=162,149;MMQ=49,30;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:170,16:0.090:186:85,8:82,8:104,66,0,16
chr7	151932916	.	C	G	.	.	DP=207;ECNT=11;MBQ=33,34;MFRL=162,154;MMQ=49,30;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:190,11:0.055:201:92,3:93,7:112,78,0,11
chr7	151932923	.	G	A	.	.	DP=212;ECNT=11;MBQ=30,25;MFRL=162,131;MMQ=46,47;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:191,7:0.039:198:92,1:92,6:105,86,2,5
chr7	151932990	.	C	T	.	.	DP=156;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=167,198;MMQ=42,25;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:147,5:0.038:152:72,2:67,3:46,101,0,5
chr7	151932997	.	C	T	.	.	DP=151;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=167,229;MMQ=50,33;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:133,8:0.063:141:65,5:62,3:38,95,0,8
chr7	151933015	.	G	A	.	.	DP=150;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=173,224;MMQ=60,31;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:139,6:0.041:145:64,3:67,2:34,105,1,5
chr7	151933033	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=170,253;MMQ=60,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,8:0.079:111:51,4:46,4:24,79,0,8
chr7	151935730	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=153,173;MMQ=46,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,5:0.090:64:33,5:25,0:56,3,5,0
chr7	151935798	.	GA	TG	.	.	DP=105;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=165,126;MMQ=31,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,17:0.178:99:34,9:47,6:45,37,13,4
chr7	151935831	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=156,161;MMQ=35,25;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:90,3:0.042:93:48,2:38,1:0|1:151935831_G_A:151935831:42,48,0,3
chr7	151935853	.	T	C	.	.	DP=92;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=154,179;MMQ=49,25;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:89,2:0.032:91:49,2:34,0:0|1:151935831_G_A:151935831:38,51,0,2
chr7	151935910	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=169,216;MMQ=50,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,5:0.076:75:42,1:25,3:30,40,1,4
chr7	151935916	.	G	T	.	.	DP=77;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=170,215;MMQ=50,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,4:0.062:76:42,1:28,3:28,44,1,3
chr7	151935962	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=178,158;MMQ=45,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:25,2:15,3:12,28,0,5
chr7	151944981	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=157,199;MMQ=40,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.100:52:34,2:13,2:47,0,5,0
chr7	151945007	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=154,167;MMQ=40,39;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,18:0.264:70:30,8:21,10:33,19,14,4
chr7	151945071	.	G	GT	.	.	DP=127;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=100.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,37:0.311:120:48,19:34,17:50,33,21,16
chr7	151945078	.	G	T	.	.	DP=122;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=157,152;MMQ=52,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,3:0.033:118:60,3:52,0:69,46,3,0
chr7	151945101	.	G	C	.	.	DP=114;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=158,186;MMQ=49,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,10:0.095:108:54,6:43,3:62,36,7,3
chr7	151945204	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=164,217;MMQ=52,39;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.156:49:18,4:21,3:14,28,0,7
chr7	151945215	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=166,185;MMQ=52,27;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,7:0.134:54:22,3:24,3:12,35,0,7
chr7	151945228	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=173,200;MMQ=39,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.099:58:27,1:26,4:13,40,0,5
chr7	151962068	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=157,183;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,1:0|1:151962068_T_C:151962068:11,0,2,0
chr7	151962077	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,174;MMQ=31,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,0:7,4:0|1:151962068_T_C:151962068:15,0,4,0
chr7	151970695	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=166,179;MMQ=40,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:14,4:20,1:32,2,5,0
chr7	151970714	.	C	A	.	.	DP=77;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=168,175;MMQ=48,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.055:69:29,2:36,1:63,3,3,0
chr7	151970775	.	C	G	.	.	DP=136;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=152,163;MMQ=53,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,14:0.115:127:50,10:63,4:85,28,13,1
chr7	151970777	.	G	A	.	.	DP=135;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=153,151;MMQ=52,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,19:0.149:132:52,9:58,10:83,30,16,3
chr7	151970797	.	A	T	.	.	DP=136;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=144,150;MMQ=40,35;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,12:0.099:127:44,4:70,7:73,42,8,4
chr7	151970969	.	A	C	.	.	DP=62;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=180,175;MMQ=27,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.063:61:27,3:31,0:9,49,0,3
chr7	151970977	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=185,165;MMQ=27,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,13:0.244:54:22,5:19,7:3,38,3,10
chr7	151970982	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=182,174;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:22,1:23,3:6,39,1,3
chr7	151971043	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=170,189;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.624:22:3,4:5,10:1,7,3,11
chr7	151971052	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=165,204;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:3,5:1,6,0,8
chr7	152055766	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,19;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.546:6:0,0:0,0:0,3,0,3
chr7	152498667	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=161,135;MMQ=40,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:8,4:9,4:9,8,6,2
chr7	152511598	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr7	152550499	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,15,2
chr7	152550763	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	154002658	.	CGT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=66,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GT;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:4,1:6,1:4,6,1,1
chr7	154143443	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,4:3,4:1,3,1,7
chr7	154461248	.	TTGTGTG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,253;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=TG;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.508:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	154587494	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr7	154595754	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=105,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:154595754_G_T:154595754:1,2,0,1
chr7	154595764	.	CC	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154595754_G_T:154595754:0,1,0,1
chr7	154595767	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:154595754_G_T:154595754:0,1,0,1
chr7	154645406	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:7,2:2,1:0|1:154645406_A_G:154645406:6,3,2,1
chr7	154645419	.	G	GTTTTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,37;MFRL=134,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTTC;STR;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:8,3:1,1:0|1:154645406_A_G:154645406:5,4,2,2
chr7	154645639	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr7	154672551	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:5,1,6,0
chr7	154672646	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:5,2:6,3:5,7,2,3
chr7	154672679	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:2,1:6,3:2,6,1,3
chr7	154672717	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,1:4,2:0,5,0,4
chr7	154679447	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,11:0,0,7,10
chr7	154720259	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr7	154735950	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,3:2,7:1,9,1,9
chr7	154745910	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,1:7,2:12,0,3,0
chr7	154748908	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr7	154753409	.	A	AGAAAATC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=189,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:154753409_A_AGAAAATC:154753409:0,3,0,1
chr7	154753412	.	C	CTTCACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=189,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:154753409_A_AGAAAATC:154753409:0,3,0,1
chr7	154759671	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr7	154760540	.	TTGC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGC;STR;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:8,0:7,3:5,12,1,2
chr7	154760889	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	154774858	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:6,0,5,0
chr7	154785362	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,7:0,0,17,3
chr7	154862591	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr7	154875780	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	155094172	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:4,1:2,4:0,6,0,6
chr7	155095686	.	CTTTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=166,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=T;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.507:4:1,0:0,1:0,2,0,2
chr7	155099855	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	155150602	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=215,204;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,2:2,3,1,5
chr7	155187691	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,6:4,6:7,0,12,0
chr7	155295804	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=16,25;MFRL=189,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr7	155295854	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	155301781	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,1:2,1:0,4,0,3
chr7	155465438	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=208,277;MMQ=50,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr7	155499799	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,4:6,2:0,12,1,5
chr7	155500084	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,2,2
chr7	155503844	.	GT	G,GTT	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=33,36,35;MFRL=166,183,135;MMQ=60,60,60;MPOS=14,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=7.03,8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,5,7:0.115,0.162:45:15,2,5:15,3,2:29,4,10,2
chr7	155503920	.	A	T	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,30:0.452:68:18,15:11,12:19,19,16,14
chr7	155530201	.	CTGT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGT;STR;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:15,1:9,3:23,3,3,1
chr7	155530319	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,8:0.164:48:21,2:17,1:0|1:155530319_A_C:155530319:1,39,8,0
chr7	155530325	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.113:50:25,2:16,0:0|1:155530319_A_C:155530319:3,42,5,0
chr7	155530328	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.113:50:25,1:19,0:0|1:155530319_A_C:155530319:3,42,5,0
chr7	155530363	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.513:39:10,11:9,9:4,15,0,20
chr7	155531080	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.456:33:5,7:12,7:3,15,2,13
chr7	155532361	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=58,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,0:2,4:2,0,4,0
chr7	155534733	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:16,4:22,0:15,26,2,2
chr7	155559110	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=222,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr7	155559403	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:6,3:2,7,0,8
chr7	155567956	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=209,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr7	155599300	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=120,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr7	156439046	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,6:4,1:6,2,6,1
chr7	156468636	.	G	GAACACA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156468636_G_GAACACA:156468636:0,0,0,1
chr7	156468637	.	G	GCTATATTAACAAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156468636_G_GAACACA:156468636:0,0,0,1
chr7	156468640	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156468636_G_GAACACA:156468636:0,0,0,1
chr7	156685592	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=208,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr7	156759597	.	ATATAT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,1:2,5:5,0,6,0
chr7	156761751	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.496:26:7,8:6,4:11,2,11,2
chr7	156761913	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=135,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,5:9,3:3,11,0,8
chr7	156762446	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=241,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	156971581	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,1:4,7:0,6,0,8
chr7	156974127	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=247,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr7	156974284	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.073:53:29,2:20,1:29,21,3,0
chr7	156994311	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=211,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	156994331	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=226,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=T;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.643:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	157000157	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:12,0:11,3:9,14,1,2
chr7	157000176	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.469:25:7,4:6,5:4,9,3,9
chr7	157018308	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr7	157023721	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,1:4,8:7,0,7,2
chr7	157024080	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=188,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:157024080_T_TTC:157024080:0,1,0,1
chr7	157024084	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=188,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:157024080_T_TTC:157024080:0,1,0,1
chr7	157024087	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=188,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:157024080_T_TTC:157024080:0,1,0,1
chr7	157047091	.	T	TATTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.910:9:0,1:0,4:0,0,0,9
chr7	157049530	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr7	157151234	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.622:22:5,7:3,6:7,1,11,3
chr7	157208617	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.440:12:3,4:2,1:7,0,5,0
chr7	157333542	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:4,6:6,6:3,8,1,11
chr7	157341556	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr7	157361564	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,4:1,5:5,1,4,5
chr7	157361734	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	157361771	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,31;MFRL=232,330;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0,2,0,1
chr7	157367205	.	T	TGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GA;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.493:6:2,1:1,1:0,3,0,3
chr7	157369564	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	157370645	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=156,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:157370645_G_A:157370645:3,0,4,0
chr7	157370688	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0|1:157370645_G_A:157370645:0,0,12,5
chr7	157370783	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,1:10,1:8,8,1,1
chr7	157387984	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.439:41:12,11:11,6:14,9,8,10
chr7	157406819	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=104,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:1,12:0,14:0,1,17,10
chr7	157406848	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,26;MFRL=96,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:157406848_G_A:157406848:2,0,0,1
chr7	157406849	.	G	GAAAGAGAAGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=96,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:157406848_G_A:157406848:2,0,0,1
chr7	157406852	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=96,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:157406848_G_A:157406848:2,0,0,1
chr7	157691523	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=246,259;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr7	157873975	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=118.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,20:0,14:0,0,16,20
chr7	157874062	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=152,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:14,2:6,1:2,19,1,2
chr7	157903478	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr7	157929223	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	157929246	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr7	157929294	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,4:6,2:9,1,5,1
chr7	157930974	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0|1:157930974_C_T:157930974:3,0,4,0
chr7	157930979	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,1:1,2:0|1:157930974_C_T:157930974:3,0,4,0
chr7	157959620	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr7	157959636	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,8,3
chr7	158325310	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=211,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=A;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr7	158325316	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=211,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr7	158325338	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:5,0,5,0
chr7	158325572	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=195,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,3:4,5:0,10,0,8
chr7	158424508	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	158438186	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,15,3
chr7	158444975	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,12,2
chr7	158445267	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	158450965	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr7	158455089	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr7	158473339	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr7	158476148	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	158483185	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=189,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:1,0:8,1:0|1:158483185_T_C:158483185:9,0,2,0
chr7	158483187	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=189,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,0:8,2:0|1:158483185_T_C:158483185:9,0,2,0
chr7	158527218	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:0,13,0,2
chr7	158528158	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr7	158528170	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr7	158534163	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	158552331	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr7	158555706	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	158566138	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,13:0,5:0,0,1,17
chr7	158590547	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,211;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.859:9:0,3:1,5:1,0,8,0
chr7	158591851	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	158672476	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=229.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.985:66:0,28:0,36:0,0,44,22
chr7	158711584	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,4:5,3:0,8,0,7
chr7	158715264	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:2,3:6,4:1,8,2,5
chr7	158716377	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.197:38:12,7:19,0:17,14,3,4
chr7	158718793	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=185,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr7	158726798	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr7	158727015	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr7	158727276	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=162,174;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.485:6:0,0:2,1:0,3,0,3
chr7	158727283	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=174,170;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr7	158727316	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=209,185;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr7	158727321	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=209,208;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr7	158727330	.	G	GGCACA,GGAGCT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,30,30;MFRL=245,174,208;MMQ=60,40,40;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,1,0:1,0,1:0,4,0,2
chr7	158827401	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	158827414	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr7	158835631	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	158889770	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,89;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.190:14:7,2:2,0:6,6,2,0
chr7	158896624	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=305,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	158902425	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=177,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:2,1,5,0
chr7	158935333	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	381266	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,165;MMQ=49,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,6:4,3:10,1,9,0
chr8	401493	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,1:3,8:0,7,2,8
chr8	442389	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:8,5:3,2:9,3,3,5
chr8	442579	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.419:41:13,11:11,6:18,6,10,7
chr8	494804	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	623400	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.063:51:23,0:15,0:24,24,3,0
chr8	623593	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.976:34:0,16:0,10:0,0,15,19
chr8	665858	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=87.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,14:0,0,21,8
chr8	681206	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	1496767	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	1581226	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr8	1581299	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	1616875	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=211,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr8	1791638	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:3,3,1,4
chr8	1791663	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:1791663_G_A:1791663:3,2,0,2
chr8	1791672	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,1:0|1:1791663_G_A:1791663:1,2,0,3
chr8	1791685	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr8	1806332	.	G	GGGTCCCC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=173,145;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.237:18:7,3:7,1:0|1:1806332_G_GGGTCCCC:1806332:0,14,0,4
chr8	1806333	.	A	AGGTGG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.526:28:6,10:7,5:0|1:1806332_G_GGGTCCCC:1806332:0,13,0,15
chr8	1808439	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,1:1,2:0,3,0,3
chr8	1812475	.	ACAT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=218,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,5:2,1:5,1,6,0
chr8	1814588	.	GACAC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	1817286	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.410:22:4,6:9,2:9,4,6,3
chr8	1828131	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,177;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:11,1,3,0
chr8	1830928	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:7,5:6,6:1,12,2,9
chr8	1846562	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,6:4,2:5,0,7,1
chr8	1857366	.	GT	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	1857548	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.402:23:5,5:8,4:7,7,3,6
chr8	1857649	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,3:8,6:6,8,4,5
chr8	1857701	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=112,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr8	1871105	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=135,161;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:8,2,2,0
chr8	1871896	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,0:8,6:9,5,3,3
chr8	1900855	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0,0,12,6
chr8	1952228	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:13,2:12,2:16,9,1,3
chr8	1953642	.	CAG	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=82.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,4:0,14:0,0,4,15
chr8	1954977	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:6,10,0,2
chr8	2005414	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,5:2,3:2,0,8,0
chr8	2005624	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:4,4:2,4:4,3,4,4
chr8	2005675	.	CA	TG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:4,6:6,3:6,5,5,4
chr8	2005676	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,11,9
chr8	2020366	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr8	2020377	.	G	GATGCTCTCTGCCCTTCGGCCATGAAAGCCTCCATCGTTTC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,4:0,1:0,0,11,9
chr8	2024207	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,25,3
chr8	2024405	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,2:4,5:1,11,1,6
chr8	2024437	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,0,12
chr8	2024446	.	CG	TA,TG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30,30;MFRL=0,201,170;MMQ=60,60,60;MPOS=7,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.90,23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,7:0.286,0.638:10:0,1,4:0,2,3:0,0,0,10
chr8	2033579	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=182,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:0,5,0,5
chr8	2033614	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	2037747	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:5,0,8,0
chr8	2038052	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:0,5,0,7
chr8	2040447	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=214,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr8	2042001	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=177,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr8	2044363	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=132,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr8	2046820	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.143:23:10,2:10,0:2,18,0,3
chr8	2046880	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr8	2048640	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:5,2:2,1:7,0,3,1
chr8	2048896	.	GAGGTAA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=159,198;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:2048896_GAGGTAA_G:2048896:0,4,0,1
chr8	2048907	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=87,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1|0:2048896_GAGGTAA_G:2048896:0,2,0,2
chr8	2048908	.	GGCCA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=87,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:1,1:1,0:1|0:2048896_GAGGTAA_G:2048896:0,2,0,2
chr8	2048917	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.502:2:1,1:0,0:1|0:2048896_GAGGTAA_G:2048896:0,1,0,1
chr8	2048925	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=204,198;MMQ=60,51;MPOS=-17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2048896_GAGGTAA_G:2048896:0,3,0,1
chr8	2050383	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:2,5:1,1:3,0,6,0
chr8	2053938	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=163,221;MMQ=60,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr8	2053942	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr8	2054012	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,12:0,0,18,7
chr8	2054171	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:1,3:3,1:3,1,1,4
chr8	2054195	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=185,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:2,3,4,1
chr8	2054476	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,0:0,7:0,0,0,7
chr8	2056569	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.324:29:11,7:8,2:5,15,2,7
chr8	2057090	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr8	2063920	.	CAT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:4,5:3,6,1,6
chr8	2064121	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,4:5,1:1,9,0,5
chr8	2071261	.	A	AGAC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.932:11:0,4:0,5:0,0,2,9
chr8	2071306	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0|1:2071306_A_G:2071306:0,0,9,5
chr8	2071309	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0|1:2071306_A_G:2071306:0,0,9,5
chr8	2796277	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,4,13
chr8	2799981	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:4,2,7,0
chr8	2806920	.	G	GAAAGAAAAGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=AAAGA;STR;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.852:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	2808860	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr8	2811876	.	C	CTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=241,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2811876_C_CTAT:2811876:0,1,0,1
chr8	2811877	.	C	CTAAAATCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=19,32;MFRL=241,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:2811876_C_CTAT:2811876:0,1,0,1
chr8	2813083	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,4:4,6:6,2,7,3
chr8	2836102	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,3:0,0,9,5
chr8	2855733	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=183,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:0,2:7,0:0,7,0,2
chr8	2857426	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,128;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:9,0,2,0
chr8	2876264	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,23;MFRL=199,189;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:2876264_C_A:2876264:0,4,0,1
chr8	2876266	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=199,189;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:2876264_C_A:2876264:0,4,0,1
chr8	2887070	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,109;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr8	2910223	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr8	2954348	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:6,10:1,1:8,0,9,2
chr8	2964003	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,1:1,4:5,1,4,1
chr8	2964206	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr8	2965209	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,12,5
chr8	2965244	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.483:21:5,4:5,6:6,5,6,4
chr8	2966072	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr8	2966358	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=208,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.515:12:2,5:2,1:1,5,0,6
chr8	2967639	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=123,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,3:4,0,5,0
chr8	2967905	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
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chr8	6272481	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0|1:6272477_A_G:6272477:0,0,0,7
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chr8	6299532	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr8	6357307	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr8	6360830	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=211,303;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
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chr8	6371114	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	6371129	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:6371129_C_T:6371129:0,0,4,0
chr8	6371133	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0|1:6371129_C_T:6371129:0,0,4,0
chr8	6372112	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr8	6372172	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,10:0,0,14,3
chr8	6378763	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,10:0,0,14,11
chr8	6420490	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=183,250;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.427:7:3,1:1,1:0,4,0,3
chr8	6420534	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=250,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr8	6478956	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=134,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:1,5:2,1:0|1:6478956_A_G:6478956:5,0,6,0
chr8	6478960	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=134,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:0|1:6478956_A_G:6478956:6,1,6,0
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chr8	6690215	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:5,0,7,1
chr8	6728116	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=191,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr8	6735423	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0|1:6735423_C_G:6735423:0,0,2,8
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chr8	6783597	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=197,132;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,3:2,5,0,4
chr8	6783636	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=226,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:1,2,1,2
chr8	6794207	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,12,1
chr8	7308798	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr8	7340278	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,172;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,1:7,4:11,2,5,0
chr8	7343806	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,151;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.764:19:2,7:2,8:0,4,3,12
chr8	7686323	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,128;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,2:1,6:0,5,0,8
chr8	7694034	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=224,200;MMQ=27,27;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr8	7718266	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr8	8234714	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=213,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr8	8234868	.	C	CGCCGCT	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=187,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCCGCT;STR;TLOD=75.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.593:35:4,6:10,10:12,2,17,4
chr8	8234904	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,33:0.629:52:5,5:13,25:15,4,21,12
chr8	8235297	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:3,3,4,4
chr8	8235641	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=279,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:8235641_A_T:8235641:0,1,0,1
chr8	8235650	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,14;MFRL=279,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:8235641_A_T:8235641:0,1,0,1
chr8	8559832	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr8	8747537	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=112.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,18:0,0,24,6
chr8	8869277	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,5:2,2:0,8,0,7
chr8	8875764	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,6:7,5:8,3,9,2
chr8	8887542	.	TAAC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:5,4:1,4:3,3,2,6
chr8	8998262	.	CT	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=179,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr8	8999187	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:3,3:4,6:3,4,3,7
chr8	9563797	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=25,33,34,32;MFRL=95,150,144,145;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,17,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,10,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.48,13.65,52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,3,9,25:0.075,0.202,0.611:42:1,1,4,14:3,2,4,8:3,2,24,13
chr8	9564600	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	9567806	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=181,203;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:11,0:19,4:1,29,0,4
chr8	9567820	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=206,203;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:9,0:13,4:1,21,0,4
chr8	9577794	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0|1:9577794_A_AT:9577794:1,0,3,0
chr8	9577804	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:9577794_A_AT:9577794:0,0,6,0
chr8	9593081	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	9619159	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:1,0:0,3,0,3
chr8	9761049	.	A	AGTGTCTGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=103,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:9761049_A_AGTGTCTGGG:9761049:0,3,0,1
chr8	9761051	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=103,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:9761049_A_AGTGTCTGGG:9761049:0,3,0,1
chr8	9761057	.	A	AAGGTTTGACCAACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	10065325	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=159,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10065325_C_CTT:10065325:2,0,1,0
chr8	10065339	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=13,10;MFRL=159,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:10065325_C_CTT:10065325:2,0,1,0
chr8	10102709	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.588:32:5,8:8,11:3,10,3,16
chr8	10285825	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,8:0,0,4,19
chr8	10388749	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr8	10464755	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.571:24:7,4:2,8:3,7,7,7
chr8	10465097	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.617:20:2,2:4,4:4,3,6,7
chr8	10467652	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=132,40;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,31:0.893:35:1,6:1,23:0,4,5,26
chr8	10469292	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.430:25:9,3:5,5:5,9,3,8
chr8	10480798	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	10532355	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr8	10532384	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:0,12,0,2
chr8	10532401	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr8	10583203	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=195,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:9,0,7,0
chr8	10677601	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr8	10692158	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,5:6,7:8,6,10,2
chr8	10692359	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,10;MFRL=238,236;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:10692359_C_T:10692359:0,1,0,1
chr8	10692362	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=238,236;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10692359_C_T:10692359:0,1,0,1
chr8	10755659	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,1:6,1:5,12,0,2
chr8	11142389	.	C	CG	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.459:48:14,13:9,9:25,1,18,4
chr8	11142625	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=213,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:0,7,0,7
chr8	11157460	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=197,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:3,0,5,0
chr8	11162602	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=130,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0|1:11162602_C_A:11162602:0,1,0,3
chr8	11162609	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=130,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.674:4:0,1:0,1:0|1:11162602_C_A:11162602:0,1,0,3
chr8	11177126	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr8	11177410	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr8	11180057	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:11,0,2,0
chr8	11188532	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr8	11188540	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=178,161;MMQ=25,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:4,1:1,3:5,0,2,3
chr8	11188586	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=175,151;MMQ=40,37;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:4,2,4,2
chr8	11189488	.	T	C,G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=0,30,35;MFRL=0,169,194;MMQ=60,40,25;MPOS=20,3;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=88.61,4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,29,3:0.859,0.114:32:0,14,3:0,13,0:0,0,15,17
chr8	11189533	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=187,161;MMQ=24,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.681:20:3,7:2,6:5,1,7,7
chr8	11189535	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=161,187;MMQ=51,24;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,2:7,3:7,8,5,1
chr8	11189695	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.194:22:6,3:6,1:0|1:11189695_CA_C:11189695:2,16,0,4
chr8	11189706	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,17:0.674:25:4,8:3,8:0|1:11189695_CA_C:11189695:1,7,1,16
chr8	11400680	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr8	11400944	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr8	11405437	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	11418766	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=177,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:4,1,5,0
chr8	11418773	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=129,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:6,0,3,1
chr8	11421384	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	11612698	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	11629119	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=199,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.503:26:6,2:6,11:0,13,2,11
chr8	11637537	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=224,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11637537_G_A:11637537:0,1,0,1
chr8	11637539	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=224,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11637537_G_A:11637537:0,1,0,1
chr8	11640611	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=182,188;MMQ=52,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.517:21:8,6:2,4:10,0,10,1
chr8	11643459	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,8:3,5:6,0,12,1
chr8	11643803	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.333:31:12,3:9,6:0|1:11643803_C_T:11643803:5,16,1,9
chr8	11643808	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,9:0.312:30:10,4:8,4:0|1:11643803_C_T:11643803:5,16,1,8
chr8	11643815	.	GC	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:9,4:9,5:0|1:11643803_C_T:11643803:3,16,0,9
chr8	11666451	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr8	11687938	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,14:0,0,1,21
chr8	11689228	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr8	11695872	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=159,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:5,8:4,7:8,1,13,2
chr8	11702542	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=234,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:3,0,5,0
chr8	11702594	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=195,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,6:4,4:7,0,10,0
chr8	11704518	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=160,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:0,0:0|1:11704518_T_C:11704518:3,1,3,0
chr8	11704521	.	CGA	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=160,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,0:2,3:0|1:11704518_T_C:11704518:4,2,3,0
chr8	11704529	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,0:3,3:0|1:11704518_T_C:11704518:6,2,3,0
chr8	11704532	.	C	CCCCCCAAA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.304:11:4,0:4,2:0|1:11704518_T_C:11704518:6,2,3,0
chr8	11704719	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:1,7:2,7:0,3,1,13
chr8	11705342	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,25:0.508:49:10,12:14,12:8,16,7,18
chr8	11705380	.	A	AAGCCCCAGCTGGGCGAGGC	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=187,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=74.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.569:33:8,8:6,8:2,12,0,19
chr8	11706513	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,2:4,3:9,1,5,0
chr8	11710301	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=181,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr8	11831661	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:0,6,0,6
chr8	11831948	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=228,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr8	11853596	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=228,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr8	11994797	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,141;MMQ=40,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.517:39:5,7:12,13:11,8,8,12
chr8	11995248	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=140,167;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:9,8:8,6:5,12,3,11
chr8	11995274	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=149,157;MMQ=40,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:6,1:5,3:1,11,0,4
chr8	12044217	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=269,276;MMQ=27,26;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	12589179	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,10:0,13:0,0,23,0
chr8	12592956	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr8	12600622	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr8	12870438	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	12878556	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:8,1:14,1:13,9,2,0
chr8	12879694	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=97.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.964:24:0,11:0,12:0|1:12879694_G_GT:12879694:0,0,9,15
chr8	12879707	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,8:0,11:0|1:12879694_G_GT:12879694:0,0,10,13
chr8	12880266	.	CA	TG	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=33,27;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr8	12880277	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr8	12880297	.	T	TTGAGA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=212,155;MMQ=56,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr8	12880312	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12880312_G_C:12880312:0,0,0,1
chr8	12880317	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=20,32;MFRL=241,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12880312_G_C:12880312:0,1,0,1
chr8	12880319	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,31;MFRL=241,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12880312_G_C:12880312:0,1,0,1
chr8	12880321	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,14;MFRL=241,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:12880312_G_C:12880312:0,1,0,1
chr8	12880324	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,22;MFRL=241,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12880312_G_C:12880312:0,1,0,1
chr8	12880521	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=183.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.981:50:0,18:0,31:0|1:12880521_G_A:12880521:0,0,31,19
chr8	12880534	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,20:0.354:57:20,7:16,12:0|1:12880521_G_A:12880521:18,19,7,13
chr8	12881642	.	TC	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=194,189;MMQ=60,46;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,6:0,3:0,1,0,9
chr8	12881754	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=225,214;MMQ=47,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12881754_G_A:12881754:1,0,1,0
chr8	12881759	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=225,214;MMQ=47,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12881754_G_A:12881754:1,0,1,0
chr8	12882982	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=285,168;MMQ=50,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr8	12885809	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,35;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,2,2
chr8	12886078	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=13,34;MFRL=133,145;MMQ=30,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=T;STR;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:0,2:0,2,1,3
chr8	12886084	.	T	TTTTCTTTTC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=133,159;MMQ=30,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,2:0,2,1,4
chr8	12886137	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=187,120;MMQ=43,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:12886137_G_T:12886137:0,4,0,1
chr8	12886139	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,22;MFRL=187,120;MMQ=43,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:12886137_G_T:12886137:0,4,0,1
chr8	12886175	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=225,207;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:12886175_C_T:12886175:1,1,0,1
chr8	12886183	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=225,207;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:12886175_C_T:12886175:1,1,0,1
chr8	12886195	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=225,207;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:12886175_C_T:12886175:1,1,0,1
chr8	12944061	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,0:0,1:0|1:12944061_G_A:12944061:0,1,0,1
chr8	12944063	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12944061_G_A:12944061:0,1,0,1
chr8	12944066	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:12944061_G_A:12944061:0,2,0,1
chr8	12944070	.	T	TGTCAATATGTTGCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,30;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:12944061_G_A:12944061:0,2,0,1
chr8	12948951	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,0,15
chr8	12950110	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr8	12952174	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=182,171;MMQ=58,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr8	12952230	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,11,10
chr8	12958144	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.195:22:11,0:4,0:9,9,4,0
chr8	12958150	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,17;MFRL=129,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:10,0:6,0:9,11,3,0
chr8	12958158	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.230:23:7,1:9,0:8,10,5,0
chr8	12972981	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.875:12:0,8:0,3:1,0,11,0
chr8	12973078	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=139.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.957:44:1,21:0,21:0,1,24,19
chr8	13258927	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:3,2:3,6:0|1:13258927_G_C:13258927:6,0,7,1
chr8	13258936	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,5:0,13:0|1:13258927_G_C:13258927:0,0,17,1
chr8	13357587	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,1,10
chr8	13424583	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,4:7,5:8,3,6,3
chr8	13425580	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:2,7,0,2
chr8	13965581	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr8	14095199	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=116,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:9,2:1,9:0,10,1,10
chr8	14095250	.	A	T,AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29,26;MFRL=0,151,172;MMQ=60,60,60;MPOS=6,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.38,5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.447,0.426:5:0,2,0:0,1,2:0,0,0,5
chr8	15978063	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr8	16007649	.	GTA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=TA;STR;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr8	16859398	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr8	16859460	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:6,4,1,1
chr8	17042416	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr8	17063335	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,4:5,7:3,7,1,10
chr8	17067574	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.692:24:2,9:5,8:2,5,4,13
chr8	17068013	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:12,4:4,3:1,15,1,6
chr8	17088376	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:4,2:7,2:1,26,0,4
chr8	17090145	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr8	17092164	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr8	17100456	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.269:19:5,3:5,2:10,4,4,1
chr8	17100745	.	T	TA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:15,0:12,3:1,27,0,3
chr8	17137687	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,28:0.589:47:9,12:10,14:13,6,15,13
chr8	17137758	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=158,205;MMQ=60,29;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.078:61:29,0:28,4:24,33,4,0
chr8	17159812	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:0,2,0,8
chr8	17188875	.	AAT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17188875_AAT_A:17188875:0,0,0,1
chr8	17188878	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17188875_AAT_A:17188875:0,0,0,1
chr8	17199033	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.279:9:4,0:1,2:2,5,1,1
chr8	17230579	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,4,0
chr8	17401878	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	17406183	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,14,3
chr8	17406367	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.942:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr8	17421279	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,0,24
chr8	17434641	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr8	17478525	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=186,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:4,1:6,8:10,1,8,1
chr8	17491730	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:8,10:7,6:5,10,5,11
chr8	17503431	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.389:21:8,3:5,5:11,2,6,2
chr8	17503684	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=213,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr8	17504616	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:3,0:9,2:0|1:17504616_T_A:17504616:7,8,0,2
chr8	17504617	.	A	AAGAG	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,0:8,2:0|1:17504617_A_AAGAG:17504617:7,8,0,2
chr8	17504618	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:7,2:0|1:17504616_T_A:17504616:7,8,0,2
chr8	17504623	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=25,28;MFRL=115,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:7,2:0|1:17504617_A_AAGAG:17504617:6,8,0,2
chr8	17504625	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=26,23;MFRL=115,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:7,1:0|1:17504617_A_AAGAG:17504617:5,7,0,2
chr8	17504626	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=20,27;MFRL=105,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,3:0.398:8:2,0:1,3:1|0:17504616_T_A:17504616:0,5,2,1
chr8	17510891	.	A	AT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:17,4:14,0:22,9,4,1
chr8	17532619	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=181,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:1,1:2,4:4,0,5,0
chr8	17573216	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=198,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr8	17579135	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr8	17612518	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.745:25:3,9:3,10:2,4,3,16
chr8	17726019	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr8	17726069	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=129,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,2:8,5:9,7,7,0
chr8	17731876	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,5:7,1:9,4,3,3
chr8	17732084	.	GC	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr8	17742953	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,5:0,1:2,1,4,2
chr8	17793093	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:5,4:4,6:8,1,9,1
chr8	17797409	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	17804665	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.271:34:14,2:11,6:18,7,6,3
chr8	17812926	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:1,4:3,2,5,1
chr8	17814915	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,8:0,0,4,15
chr8	17819743	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr8	17819761	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr8	17820780	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=128,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.165:23:6,0:10,3:0|1:17820780_T_C:17820780:6,14,0,3
chr8	17820786	.	A	AAAGTAGTTTTTTCTACAGTGTACATCTCTTG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,37;MFRL=128,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:8,0:12,3:0|1:17820780_T_C:17820780:5,15,0,3
chr8	17824750	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=262,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	17827260	.	A	AC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=102.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,14:0,0,5,23
chr8	17829756	.	C	CAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,8:0,0,18,0
chr8	17867275	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,2:1,6:0,4,1,7
chr8	17868029	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,13,2
chr8	17868245	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,4:0,0,1,14
chr8	17868273	.	C	CTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=180,162;MMQ=60,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,2:1,0:0,8,0,2
chr8	17871563	.	G	C	.	.	DP=60;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=93,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,23:0.409:57:16,12:15,10:18,16,11,12
chr8	17871598	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:6,6:9,3:2,14,2,8
chr8	17871604	.	TAA	T,TA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=19,14,23;MFRL=161,179,167;MMQ=60,60,60;MPOS=31,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=5.46,9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,6:0.212,0.289:20:2,0,2:3,1,1:0,10,0,10
chr8	17871619	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.418:25:6,7:8,3:0,14,0,11
chr8	17882845	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,3:6,1:11,1,4,0
chr8	17885091	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.472:51:15,11:12,13:21,6,19,5
chr8	17915190	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr8	17916224	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=217,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr8	17919898	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,216;MMQ=60,55;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:4,18,0,2
chr8	17920623	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,180;MMQ=46,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:7,0,4,0
chr8	17920807	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:2,4,0,4
chr8	17921921	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=120,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:8,5:2,8:5,5,9,4
chr8	17924645	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.208:42:19,4:13,4:34,0,8,0
chr8	17924696	.	CT	C	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.070:68:34,2:25,2:55,9,3,1
chr8	17924849	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:9,6:13,8:1,21,0,14
chr8	17927248	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	17928762	.	T	TATA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr8	17928920	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr8	17928999	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	17933146	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr8	18074322	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr8	18074536	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr8	18081197	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=171,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr8	18081223	.	C	CTCTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=180,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:18081223_C_CTCTT:18081223:0,4,0,1
chr8	18081226	.	G	GTGAAATACTATCCTGCCATA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=180,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:18081223_C_CTCTT:18081223:0,4,0,1
chr8	18081244	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=188,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18081244_T_TC:18081244:0,1,0,1
chr8	18081245	.	A	AGGTAGTTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=15,26;MFRL=188,188;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:18081244_T_TC:18081244:0,1,0,1
chr8	18393159	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=213,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,9:1,1:2,0,9,1
chr8	18413875	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=68.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,5,15
chr8	18432578	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr8	18656875	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,5:7,8:3,10,0,13
chr8	18656888	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,6:5,5:2,8,0,11
chr8	18658750	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.637:39:12,13:1,11:10,4,19,6
chr8	18658929	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr8	18661932	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.815:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr8	18662204	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.571:28:7,11:4,5:5,7,12,4
chr8	18666210	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:6,9:8,11:14,0,17,3
chr8	18793697	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr8	19192119	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=252,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr8	19218625	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	19230955	.	GTA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=161,85;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TA;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0|1:19230955_GTA_G:19230955:2,0,2,0
chr8	19230959	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=161,85;MMQ=60,43;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0|1:19230955_GTA_G:19230955:2,0,2,0
chr8	19277817	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,5,3
chr8	19363425	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	19680105	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=147,247;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:19680105_G_T:19680105:0,1,0,1
chr8	19680115	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=147,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:19680105_G_T:19680105:0,1,0,1
chr8	19680736	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr8	19680979	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr8	19681647	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr8	19682545	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr8	19689633	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr8	19694727	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=214,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:3,2:4,1:0,8,0,3
chr8	20003431	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr8	20003482	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=221,189;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr8	20005439	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,3:6,3:11,1,5,1
chr8	20007112	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=207,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0|1:20007112_T_C:20007112:2,0,3,0
chr8	20007125	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1|0:20007112_T_C:20007112:4,0,5,0
chr8	20008155	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.544:20:3,8:6,3:4,5,7,4
chr8	20022486	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.454:42:7,11:16,8:9,14,10,9
chr8	20028553	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:5,1,5,0
chr8	20028750	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,2:0,3,0,4
chr8	20028895	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=135,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:5,1,4,0
chr8	20030558	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=147,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:2,0:7,1:7,3,2,1
chr8	20036018	.	GA	TG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=120,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.857:18:1,9:0,7:0,2,1,15
chr8	20036713	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,19:0,0,13,23
chr8	20069789	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0,7,1,1
chr8	20110844	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:2,3,0,2
chr8	21550768	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:0,4:4,5:4,0,9,1
chr8	21550987	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr8	21640422	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=45420085,188;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21640422_G_A:21640422:1,0,0,1
chr8	21640427	.	G	GGTCATCGTTTGTGGTCAGATATTTGAGAAGCTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=45420085,188;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:21640422_G_A:21640422:1,0,0,1
chr8	21645753	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0,5,0,2
chr8	21847951	.	CTACCA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:0,9,0,2
chr8	21848313	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,4:6,0:8,2,4,0
chr8	21856989	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:4,3,2,0
chr8	21890581	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,23,0
chr8	21891626	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=133,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,2:4,0:11,3,1,1
chr8	21891691	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=138,49;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,2:6,0:14,4,2,0
chr8	21891939	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,13:0,0,16,13
chr8	21891968	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=113.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,14:0,0,15,15
chr8	21900757	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	21904212	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr8	21924743	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr8	21924778	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr8	21924944	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,10:0,0,18,0
chr8	21925214	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr8	21930007	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=130,142;MMQ=48,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:0,4:1,6:0,1,1,10
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chr8	21978072	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:21978072_A_G:21978072:0,1,0,1
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chr8	22103050	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=27,18;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:9,0:4,0:0|1:22103050_C_G:22103050:7,7,2,0
chr8	22103053	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,17;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:4,0:0|1:22103050_C_G:22103050:7,6,2,0
chr8	22103055	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:3,0:0|1:22103050_C_G:22103050:7,5,2,0
chr8	22103058	.	G	GGC	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,10;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:3,0:0|1:22103050_C_G:22103050:7,5,2,0
chr8	22103061	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:4,0:0|1:22103050_C_G:22103050:6,6,2,0
chr8	22104691	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.398:35:5,7:16,5:13,8,9,5
chr8	22106539	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=166,143;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:14,3:9,0:15,10,3,0
chr8	22136913	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.339:30:9,7:10,2:15,5,7,3
chr8	22145248	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=194,156;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr8	22147333	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.460:22:5,4:7,5:6,6,9,1
chr8	22172702	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.481:31:5,6:11,8:2,14,5,10
chr8	22211756	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:6,1,10,1
chr8	22266054	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	22267385	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr8	22389807	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:15,0:13,3:5,23,0,3
chr8	22389900	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	22398414	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	22419532	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr8	22421395	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr8	22428658	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr8	22438314	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=232,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.466:17:3,1:4,5:8,1,1,7
chr8	22458301	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	22459730	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.511:47:13,8:9,16:13,10,16,8
chr8	22460204	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=220,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,1:3,6:0,5,0,7
chr8	22463697	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,4:4,3:1,10,2,6
chr8	22464064	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.483:21:7,7:3,3:10,1,8,2
chr8	22464390	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:3,8:4,4:7,0,10,2
chr8	22465385	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=202,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:3,4:2,3:5,0,8,0
chr8	22465427	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.574:31:8,8:5,9:10,3,15,3
chr8	22470710	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=231,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,0,4
chr8	22472255	.	C	CTGCTGCCTTCATCCTGATGGGT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,4:2,4:4,0,10,0
chr8	22473158	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=209,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:0,5,1,5
chr8	22473465	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:5,7:10,2:5,11,4,5
chr8	22477131	.	ACAT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAT;STR;TLOD=58.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:6,8:6,7:9,4,10,6
chr8	22487388	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr8	22487422	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,13:0,6:0,0,15,4
chr8	22502207	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr8	22570846	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,200;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,2:7,0:12,1,2,0
chr8	22582274	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,1:5,0,5,0
chr8	22777653	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,11;MFRL=63,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.663:5:0,0:1,0:0|1:22777653_A_C:22777653:1,1,3,0
chr8	22777659	.	AA	CC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=129,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:1,0:2,0:0|1:22777653_A_C:22777653:1,3,3,0
chr8	22777662	.	T	TGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=129,208;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,32;RU=G;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:2,0:2,1:0|1:22777653_A_C:22777653:1,3,3,0
chr8	22785013	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr8	22880162	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:5,0,4,3
chr8	22881852	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,0:0,3,0,2
chr8	22885109	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,1:0,2:4,0,3,0
chr8	22885154	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=153,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr8	22885331	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=114,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.442:13:6,2:1,1:0,7,2,4
chr8	22886130	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:3,4:2,2:2,4,0,6
chr8	22888407	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.396:16:5,5:3,1:3,7,1,5
chr8	22960704	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,7,18
chr8	22974523	.	G	GAT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,1:7,1:0|1:22974523_G_GAT:22974523:0,17,0,2
chr8	22974527	.	CT	TA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,1:6,1:0|1:22974523_G_GAT:22974523:0,17,0,2
chr8	22974606	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22974606_G_A:22974606:1,0,0,1
chr8	22974613	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22974606_G_A:22974606:1,0,0,1
chr8	22974615	.	GC	TG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22974606_G_A:22974606:1,0,0,1
chr8	22974620	.	GGACA	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:22974606_G_A:22974606:1,0,0,1
chr8	22974627	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22974606_G_A:22974606:0,0,0,1
chr8	22974632	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22974606_G_A:22974606:0,0,0,1
chr8	23002208	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,1,3
chr8	23004629	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.607:16:2,4:4,5:1,5,0,10
chr8	23054779	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,1,16
chr8	23060213	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:12,13:6,5:10,8,9,9
chr8	23069574	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=104.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,15:0,0,25,4
chr8	23104195	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,5:7,2:10,2,6,1
chr8	23106665	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=195,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:4,5:3,3:8,0,8,0
chr8	23112662	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=99,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr8	23113908	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.717:8:0,2:1,1:2,0,5,1
chr8	23116431	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr8	23148003	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=171,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:2,4,1,4
chr8	23149089	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,2:0,6:0,4,1,7
chr8	23151000	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,279;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr8	23155644	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,1:8,7:2,11,2,6
chr8	23156281	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:4,0,5,1
chr8	23174425	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr8	23174525	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,14:0.340:42:12,7:16,7:21,7,10,4
chr8	23177619	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr8	23292044	.	GCA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CA;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:3,1:8,1:1,10,0,3
chr8	23299532	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,261;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:7,8,1,1
chr8	23301340	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,25:0.565:44:12,14:7,11:15,4,20,5
chr8	23302164	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=201,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,0:3,3:0,7,0,3
chr8	23429448	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr8	23540417	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	23560648	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr8	23563908	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=57,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr8	23712066	.	GT	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:3,1:7,4:3,11,1,4
chr8	24193264	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr8	24208649	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.929:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr8	24208847	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=122.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,21:0,18:0,0,16,23
chr8	24211884	.	A	ATGTC	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTC;STR;TLOD=220.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.983:52:0,25:0,22:0,0,32,20
chr8	24211993	.	ACTAT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTAT;STR;TLOD=111.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.967:26:0,14:0,12:0,0,5,21
chr8	24253182	.	TAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:3,4,1,1
chr8	24255306	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=173,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,2:0,7,1,6
chr8	24256074	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,3:6,5:3,7,2,6
chr8	24262767	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:6,10:9,5:11,5,14,2
chr8	24333848	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=129,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,6:1,2:1,0,4,4
chr8	24339896	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr8	24348221	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr8	24348425	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,1:4,2:3,10,0,3
chr8	24350188	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.967:26:0,12:0,14:0,0,0,26
chr8	24365157	.	TCA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=70.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,6:0,0,0,16
chr8	24775940	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.344:36:13,7:9,5:7,17,2,10
chr8	24810423	.	CCTT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTT;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.100:27:9,0:16,1:6,19,0,2
chr8	24811064	.	AG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=76.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,13:0,0,15,10
chr8	24811842	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=151,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,1:4,3:0,14,0,4
chr8	24811855	.	C	CAT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=163,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,1:6,1:0|1:24811855_C_CAT:24811855:0,16,0,2
chr8	24811858	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=163,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,1:6,1:0|1:24811855_C_CAT:24811855:0,16,0,2
chr8	25126493	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:25126493_T_TA:25126493:0,2,0,1
chr8	25126494	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:25126493_T_TA:25126493:0,2,0,1
chr8	25126496	.	C	CCCAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:25126493_T_TA:25126493:0,2,0,1
chr8	25158026	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr8	25158072	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr8	25174495	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr8	25174710	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:25174710_C_T:25174710:0,0,0,9
chr8	25174723	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,2:0|1:25174710_C_T:25174710:0,0,0,11
chr8	25178678	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	25181307	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:10,0,2,0
chr8	25181356	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,8:0,12:0,0,16,5
chr8	25202915	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr8	25216569	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,2:14,0:10,18,2,0
chr8	25216620	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:0,9,1,5
chr8	25220713	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:25220713_T_C:25220713:0,9,0,2
chr8	25220715	.	TGA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.232:11:6,0:2,2:0|1:25220713_T_C:25220713:0,9,0,2
chr8	25226261	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:3,3:5,1:3,6,1,3
chr8	25227229	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:25227229_T_G:25227229:0,0,0,8
chr8	25227234	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:25227229_T_G:25227229:0,0,0,8
chr8	25227255	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr8	25230267	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,4,13
chr8	25231044	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr8	25231117	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.939:12:0,7:0,4:0,0,6,6
chr8	25232351	.	TCA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25232351_TCA_T:25232351:0,0,0,1
chr8	25232354	.	GTTA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25232351_TCA_T:25232351:0,0,0,1
chr8	25232359	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25232351_TCA_T:25232351:0,0,0,1
chr8	25237801	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,0:4,2:5,4,2,0
chr8	25237963	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr8	25257531	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr8	25265400	.	AAAT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,0:0|1:25265400_AAAT_A:25265400:0,0,1,0
chr8	25265413	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:25265400_AAAT_A:25265400:0,0,1,0
chr8	25280666	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr8	25287556	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,2,17
chr8	25301759	.	C	CT,CTTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=192,168,127;MMQ=60,60,60;MPOS=13,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,17,19;RU=T;STR;TLOD=9.51,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,3:0.413,0.229:15:3,2,1:3,3,1:6,0,7,2
chr8	25315587	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	25315607	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=203,284;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:3,0,1,0
chr8	25315837	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,152;MMQ=52,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.367:22:10,6:4,1:0,14,0,8
chr8	25317691	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,10:0,0,20,1
chr8	25327571	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:3,0:2,2:0,5,0,3
chr8	25343361	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:6,13,1,1
chr8	25360795	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	25365278	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr8	25744257	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.418:24:6,3:8,6:7,7,7,3
chr8	25765980	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.410:36:10,7:11,5:11,10,12,3
chr8	25766097	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,0:2,6:0,6,0,6
chr8	25898565	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr8	26227939	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,2:3,7:0,6,0,9
chr8	26240646	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,3:5,4:7,3,5,2
chr8	26240683	.	CACA	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=ACA;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,1:10,1:15,5,2,0
chr8	26249018	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=207,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr8	26265907	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:5,7:13,1:3,15,3,6
chr8	26484274	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:1,10,0,2
chr8	26614434	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=236,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr8	26906309	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr8	26906433	.	TTAAAG	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,4:1,0:4,4,1,3
chr8	27094242	.	TT	AG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,14;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:27094242_TT_AG:27094242:2,0,1,0
chr8	27094245	.	G	GGCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,18;MFRL=262,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:27094242_TT_AG:27094242:1,0,1,0
chr8	27094248	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,12;MFRL=262,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:27094242_TT_AG:27094242:1,0,1,0
chr8	27094255	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,12;MFRL=262,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:27094242_TT_AG:27094242:1,0,1,0
chr8	27094261	.	CAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=262,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:27094242_TT_AG:27094242:1,0,1,0
chr8	27097746	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=232,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr8	27099100	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr8	27099121	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=180,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.256:9:0,0:3,0:0|1:27099121_A_C:27099121:7,0,2,0
chr8	27099128	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.233:10:2,0:2,0:0|1:27099121_A_C:27099121:8,0,2,0
chr8	27100014	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=178,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:3,4:13,6:8,9,3,7
chr8	27101124	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:4,1:3,1:9,0,0,2
chr8	27101279	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,4:6,3:1,12,3,4
chr8	27101312	.	C	CAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=152,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0,10,0,2
chr8	27145633	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0,4,0,1
chr8	27156149	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:13,0:10,3:0,23,0,3
chr8	27168820	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=187,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr8	27255003	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=209,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:2,2:6,0,4,0
chr8	27255080	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:11,6:7,5:16,2,11,0
chr8	27255325	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,6:6,2:6,8,1,7
chr8	27255368	.	AGCAGCTCTCCTGCAGCCTC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,3:7,4:1,8,0,7
chr8	27287997	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,6:1,1:0,5,1,6
chr8	27291557	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.678:23:5,7:2,8:6,1,13,3
chr8	27294532	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	27294823	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,5:4,3:5,1,6,2
chr8	27297696	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=192,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr8	27303278	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,1:2,1:4,2,2,0
chr8	27308961	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:4,6:2,1:6,1,7,0
chr8	27310546	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,3:2,4:8,0,6,1
chr8	27315726	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:6,0,4,0
chr8	27319200	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:16,4:17,0:13,20,4,0
chr8	27319292	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.404:15:6,2:3,3:1,8,0,6
chr8	27321597	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=202,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:0,6,0,7
chr8	27326838	.	AGG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=G;STR;TLOD=92.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,10,13
chr8	27348697	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=169,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr8	27361267	.	G	GATAGGTATAAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.320:4:1,1:2,0:2,1,0,1
chr8	27369334	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:1,4:5,5:4,4,5,4
chr8	27394257	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:8,10:10,3:11,7,10,3
chr8	27401920	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=201,84;MMQ=60,52;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:16,3:4,0:15,5,3,0
chr8	27401929	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=189,84;MMQ=60,52;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:16,3:5,0:18,5,2,1
chr8	27456220	.	A	ATAAAAGCCATGTGAGGACAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=207,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27456220_A_ATAAAAGCCATGTGAGGACAG:27456220:0,1,0,1
chr8	27456224	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=207,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27456220_A_ATAAAAGCCATGTGAGGACAG:27456220:0,1,0,1
chr8	27462461	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.116:28:14,0:11,2:11,14,2,1
chr8	27462481	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,11:0,0,14,15
chr8	27593650	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=91.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,17:0,8:0,0,21,4
chr8	27598042	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,5:5,3:1,5,1,7
chr8	27605635	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,1:12,0:22,8,0,2
chr8	27614138	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr8	27630152	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:10,12:7,8:0,17,2,18
chr8	27634274	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:6,7,1,1
chr8	27641609	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=98.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,20:0,13:0,0,8,26
chr8	27649426	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.513:17:5,6:3,3:6,2,7,2
chr8	27650428	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=290,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr8	27667793	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:1,3:8,4:9,0,7,0
chr8	27668077	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27668077_T_C:27668077:0,0,0,1
chr8	27668081	.	AG	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27668077_T_C:27668077:0,0,0,1
chr8	27668726	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr8	27678292	.	T	TCCTTTGCTGTAGTCTGCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,292;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	27680576	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.421:48:12,11:15,9:18,10,13,7
chr8	27729406	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,6:5,6:7,4,10,2
chr8	27762235	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,6:0,9:0,0,14,2
chr8	27764627	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr8	27767305	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr8	27767339	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	27779068	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,1:6,1:10,1,2,0
chr8	27779811	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.482:10:4,0:1,3:0,5,0,5
chr8	27880826	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,4:3,7:4,3,8,3
chr8	27886700	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=205,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:5,0,5,0
chr8	27887813	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:3,5:7,0,4,3
chr8	27888911	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,2,0
chr8	27925162	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:22,0:16,3:20,19,0,3
chr8	27925679	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.165:26:9,0:11,5:20,1,5,0
chr8	27927129	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.573:19:2,5:6,6:4,4,5,6
chr8	27957529	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,4:5,4:0,7,2,6
chr8	27957556	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:3,3:5,2:0,8,0,6
chr8	27967856	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,6:3,4:5,1,8,2
chr8	28013579	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.454:11:5,1:1,3:0,6,0,5
chr8	28016002	.	AAATAAAG	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=113,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr8	28016043	.	C	CGGG	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,13;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.541:11:2,1:3,1:1,4,6,0
chr8	28016044	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,14;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.542:11:2,0:2,0:1,4,6,0
chr8	28016048	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=22,12;MFRL=170,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.390:16:2,0:2,1:0|1:28016048_A_C:28016048:6,4,6,0
chr8	28016054	.	CAA	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.270:20:4,1:8,0:0|1:28016048_A_C:28016048:8,7,5,0
chr8	28016061	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=170,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.258:21:4,0:10,0:0|1:28016048_A_C:28016048:8,8,5,0
chr8	28186606	.	CT	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr8	28210613	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,18,0
chr8	28341058	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=205,175;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr8	28384712	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.947:35:1,16:0,16:0,1,27,7
chr8	28588904	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:3,5:10,10:3,10,5,10
chr8	28600572	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:6,2,6,2
chr8	28645271	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=143,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,8:0,3:1,0,9,2
chr8	28651298	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.446:20:7,2:4,4:0|1:28651298_A_C:28651298:9,2,8,1
chr8	28651300	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.446:20:7,3:4,6:0|1:28651298_A_C:28651298:9,2,8,1
chr8	28651557	.	TATAAAG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr8	28692783	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=116,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:1,4:8,4:7,2,7,1
chr8	28695361	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	28707622	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,245;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr8	28906633	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=198,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,0:4,0:1,5,0,3
chr8	28906643	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=21,24;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:0,0:1,2:1,1,0,3
chr8	28906646	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=224,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:28906646_C_G:28906646:1,3,0,1
chr8	28906649	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=224,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:28906646_C_G:28906646:1,3,0,1
chr8	28906655	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,14;MFRL=213,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.419:5:0,0:2,0:1,2,0,2
chr8	28929131	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,16;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:28929131_A_C:28929131:1,1,1,0
chr8	28929135	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,12;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:28929131_A_C:28929131:2,1,1,0
chr8	28929137	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,13;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:28929131_A_C:28929131:2,1,1,0
chr8	28929139	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,15;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:28929131_A_C:28929131:2,1,1,0
chr8	28929143	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,11;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:28929131_A_C:28929131:2,1,1,0
chr8	28929145	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,12;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:28929131_A_C:28929131:3,1,1,0
chr8	28929148	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,14;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:28929131_A_C:28929131:3,1,1,0
chr8	28967679	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr8	28984572	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,3:3,3:10,1,5,1
chr8	28989896	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:17,1:20,2:14,23,0,3
chr8	28998180	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=169,136;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:0,11,0,3
chr8	29005093	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:1,3,2,3
chr8	29005128	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,1,3
chr8	29035156	.	TG	CC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=176,210;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:5,2:0,12,0,2
chr8	29039618	.	AA	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=223,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr8	29053761	.	TA	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.546:32:9,5:5,12:1,13,2,16
chr8	29195764	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,10;MFRL=148,179;MMQ=60,47;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:1,0:2,1,2,0
chr8	29197529	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr8	29203137	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr8	29207845	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr8	29207872	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=131,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr8	29923732	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,13:0,0,0,29
chr8	29927665	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=168,166;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29927665_C_A:29927665:0,1,0,1
chr8	29927674	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=168,166;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29927665_C_A:29927665:0,1,0,1
chr8	29931375	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=149.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,23:0,17:0,0,33,7
chr8	29940271	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=95.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,13:0,0,26,0
chr8	29996294	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,1:4,6:0,8,0,7
chr8	29996313	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr8	30001915	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr8	30037997	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:10,2:20,0:21,11,2,0
chr8	30335478	.	G	GTAAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=222,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:30335478_G_GTAAC:30335478:0,2,0,1
chr8	30335480	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=222,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:30335478_G_GTAAC:30335478:0,2,0,1
chr8	30335482	.	G	GTAATACCATCTTGTTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=222,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:30335478_G_GTAAC:30335478:0,2,0,1
chr8	30336790	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=167,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,3:7,0:17,0,3,0
chr8	30404953	.	GCTA	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:20,0:23,2:0|1:30404953_GCTA_G:30404953:13,35,1,1
chr8	30404959	.	T	TG	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:24,0:19,2:0|1:30404953_GCTA_G:30404953:12,33,1,1
chr8	30407106	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:13,1:18,1:12,23,2,0
chr8	30464719	.	CA	C,CAA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,35,33;MFRL=134,187,132;MMQ=60,60,60;MPOS=13,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=7.29,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,6,3:0.210,0.131:27:8,2,0:3,3,2:0,18,0,9
chr8	30469714	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=182,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr8	30469805	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:6,5:8,6:10,5,10,1
chr8	30537223	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=17,19;MFRL=65,142;MMQ=51,43;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:0,0:0,2:0,2,0,6
chr8	30539452	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,172;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.111:29:14,0:12,2:18,8,3,0
chr8	30539623	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,3:6,4:1,9,0,7
chr8	30546636	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:6,3:0,6:6,0,8,1
chr8	30567426	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:30567426_A_T:30567426:2,1,0,1
chr8	30567428	.	AA	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:30567426_A_T:30567426:2,1,0,1
chr8	30569609	.	GA	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:6,4:11,1:5,17,1,6
chr8	30601610	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=205,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:5,4:3,6:0|1:30601610_TC_T:30601610:9,0,10,0
chr8	30601617	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=193,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,10:0.458:22:5,6:6,4:1|0:30601610_TC_T:30601610:12,0,10,0
chr8	30601805	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=83.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,31:0.506:61:20,19:10,11:7,23,7,24
chr8	30608976	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,19:0,13:0,0,14,18
chr8	30609061	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:2,5:4,6:0|1:30609061_T_G:30609061:0,6,1,10
chr8	30609078	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:1,3:5,2:0|1:30609061_T_G:30609061:0,7,0,6
chr8	30620840	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr8	30620964	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr8	30623996	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	30651335	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.429:28:9,6:7,5:16,0,12,0
chr8	30694415	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=163,216;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:11,0:6,3:10,7,0,3
chr8	30695570	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,0:9,2:7,16,0,2
chr8	30854033	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,2:0,4:5,0,6,0
chr8	30916085	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,4,20
chr8	30922346	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr8	30933816	.	CT	C,CTT	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,36,34;MFRL=177,151,158;MMQ=60,60,60;MPOS=20,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.03,5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,6,3:0.290,0.169:20:7,3,1:4,3,2:1,10,4,5
chr8	30933859	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:2,5:5,3:0,7,0,9
chr8	30938288	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=242,294;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr8	30941317	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,222;MMQ=33,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,0:12,3:1,19,3,0
chr8	30949319	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:17,4:18,0:20,16,4,0
chr8	30954258	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=16,16;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.323:10:1,0:1,0:0|1:30954258_C_T:30954258:6,1,3,0
chr8	30954265	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.298:11:4,0:1,0:0|1:30954258_C_T:30954258:6,2,3,0
chr8	30958353	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=45.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,7:0,0,10,5
chr8	30973811	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr8	30981971	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,16:0,0,27,1
chr8	30999122	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=92.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,12:0,16:0,0,17,12
chr8	31004465	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,4:2,3:5,0,6,1
chr8	31005017	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr8	31012157	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:17,0:20,0:0|1:31012157_T_A:31012157:25,16,0,2
chr8	31012166	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:16,0:17,0:0|1:31012157_T_A:31012157:24,17,0,2
chr8	31012170	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=34,19;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:16,0:15,0:0|1:31012157_T_A:31012157:23,18,0,2
chr8	31012173	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=33,19;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:19,0:16,0:0|1:31012157_T_A:31012157:22,19,0,2
chr8	31024443	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=209,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr8	32406382	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	32463201	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:5,10,0,2
chr8	32505909	.	TAG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,1:4,1:1,4,0,3
chr8	32579686	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr8	32585423	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:8,0,6,1
chr8	32585434	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:3,7:6,3:9,1,9,1
chr8	32599491	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,2:11,1:16,4,3,0
chr8	33247178	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,3:14,0:11,20,1,2
chr8	33310687	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr8	33311091	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr8	33347907	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr8	33354235	.	A	AGAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GAT;STR;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:3,1:2,5:0,5,0,6
chr8	33354873	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr8	33355886	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr8	33356191	.	GTT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.786:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	33356827	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.566:19:2,4:5,5:2,6,0,11
chr8	33357818	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr8	33364856	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,2:6,0:0,21,0,2
chr8	33367497	.	CAAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,19;MFRL=85,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,0:0,0:1,1,0,1
chr8	33369460	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.387:21:6,3:6,3:12,1,6,2
chr8	33416303	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr8	33451026	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.776:16:3,5:0,7:3,0,10,3
chr8	35542262	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,2:10,0:4,17,0,2
chr8	35579667	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,1:5,1:9,0,2,0
chr8	36664834	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr8	36746407	.	TTC	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=152,158;MMQ=60,58;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.089:42:25,0:13,3:12,27,1,2
chr8	36746420	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=158,159;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:21,0:11,2:4,28,0,2
chr8	36746428	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=157,159;MMQ=60,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:16,0:9,2:1,24,0,2
chr8	36746436	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=158,159;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.207:22:10,1:7,2:0|1:36746436_A_G:36746436:0,18,0,4
chr8	36746443	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=158,182;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:8,1:0|1:36746436_A_G:36746436:0,18,0,2
chr8	36767145	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=255,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr8	36768524	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=149,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,1:6,0:3,17,2,0
chr8	36768530	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=147,82;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:5,0:2,19,2,0
chr8	36768535	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=146,82;MMQ=60,51;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:8,1:3,18,2,0
chr8	36776267	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:3,2:3,0,5,1
chr8	36780209	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=206,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,1:4,3:0,9,1,3
chr8	36788693	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.543:22:6,6:4,6:3,7,2,10
chr8	37686749	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr8	37687282	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=174,271;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:37687282_CAG_C:37687282:2,0,0,1
chr8	37687289	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=198,271;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:37687282_CAG_C:37687282:3,0,0,1
chr8	37687291	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=198,271;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:37687282_CAG_C:37687282:3,0,0,1
chr8	37689101	.	T	TAACAGTGACCAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=174,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:37689101_T_TAACAGTGACCAG:37689101:2,4,1,1
chr8	37689104	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=174,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:37689101_T_TAACAGTGACCAG:37689101:2,4,1,1
chr8	37689106	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=174,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:37689101_T_TAACAGTGACCAG:37689101:2,4,1,1
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chr8	37699743	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,1:4,1:8,1,2,0
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chr8	37728019	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,13:0.583:22:2,6:7,6:0|1:37728017_A_G:37728017:3,6,6,7
chr8	37797556	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:5,2:4,0:2,8,0,2
chr8	37888017	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	37917286	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=142,175;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr8	37964027	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:5,1:0,5,0,2
chr8	37986560	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:37986560_AG_CC:37986560:0,4,0,1
chr8	37986561	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,4:0.841:4:0,2:0,2:1|0:37986560_AG_CC:37986560:0,0,0,4
chr8	38003787	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60